View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16915_low_2 (Length: 537)

Name: NF16915_low_2
Description: NF16915
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16915_low_2
NF16915_low_2
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (1-387)||(6311097-6311490)
chr8 (12-385)||(7289831-7290211)
chr8 (1-384)||(36979184-36979569)
chr8 (1-384)||(4759980-4760366)
chr8 (1-384)||(30655448-30655838)
chr8 (1-384)||(18870466-18870849)
chr8 (12-363)||(25328184-25328540)
chr8 (1-384)||(18853072-18853457)
chr8 (13-348)||(33037724-33038063)
chr8 (1-393)||(10689047-10689442)
chr8 (17-363)||(39784734-39785086)
chr8 (384-530)||(38613611-38613757)
chr8 (1-384)||(1261860-1262238)
chr8 (17-363)||(35745213-35745566)
chr8 (67-363)||(10684224-10684528)
chr8 (6-224)||(31071140-31071362)
chr8 (109-224)||(26287866-26287985)
chr8 (109-224)||(26301123-26301242)
chr8 (109-224)||(26313117-26313236)
chr8 (106-189)||(26403240-26403327)
chr8 (108-189)||(4456028-4456113)
chr8 (108-223)||(7412305-7412426)
chr8 (106-189)||(23799587-23799674)
chr8 (108-189)||(19175766-19175851)
chr8 (109-189)||(4696609-4696693)
chr8 (106-186)||(6127224-6127308)
chr8 (128-187)||(9765852-9765914)
chr8 (109-189)||(19752407-19752491)
chr8 (6-63)||(26288020-26288076)
chr8 (6-63)||(26301277-26301333)
chr8 (6-63)||(26313271-26313327)
chr8 (106-189)||(5702493-5702580)
chr8 (310-386)||(19752609-19752683)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (12-385)||(1457067-1457446)
chr5 (12-384)||(43592080-43592459)
chr5 (12-384)||(27444771-27445150)
chr5 (12-384)||(27449615-27449994)
chr5 (1-367)||(30631227-30631597)
chr5 (12-384)||(43598525-43598904)
chr5 (12-384)||(43604017-43604396)
chr5 (12-384)||(43609509-43609888)
chr5 (12-363)||(15044512-15044865)
chr5 (1-265)||(31180138-31180405)
chr5 (17-363)||(28807485-28807837)
chr5 (17-363)||(37556533-37556887)
chr5 (17-363)||(37561355-37561709)
chr5 (6-384)||(38191983-38192359)
chr5 (6-384)||(38219208-38219584)
chr5 (17-363)||(2785197-2785550)
chr5 (1-384)||(24135659-24136039)
chr5 (67-363)||(31396953-31397256)
chr5 (67-363)||(31401810-31402113)
chr5 (17-345)||(33791158-33791491)
chr5 (1-227)||(35387624-35387853)
chr5 (72-345)||(33768021-33768299)
chr5 (108-189)||(9353344-9353429)
chr5 (108-189)||(36932362-36932447)
chr5 (106-189)||(10281751-10281838)
chr5 (108-189)||(15464532-15464617)
chr5 (319-384)||(31180079-31180142)
chr5 (106-189)||(19588746-19588833)
chr5 (106-188)||(11916982-11917068)
chr5 (108-189)||(14520230-14520315)
chr5 (106-189)||(3880299-3880386)
chr5 (106-189)||(17003970-17004057)
chr5 (108-186)||(12084187-12084269)
chr5 (109-189)||(28832259-28832343)
chr5 (328-384)||(35387474-35387527)
chr5 (109-189)||(42127423-42127507)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (12-385)||(51520257-51520637)
chr4 (12-363)||(9224312-9224668)
chr4 (1-384)||(24741748-24742132)
chr4 (12-363)||(9229099-9229455)
chr4 (12-363)||(3813846-3814202)
chr4 (72-385)||(56146677-56146996)
chr4 (13-363)||(45357203-45357558)
chr4 (17-363)||(18855549-18855900)
chr4 (14-384)||(29760449-29760821)
chr4 (13-363)||(45347723-45348079)
chr4 (27-363)||(5732486-5732828)
chr4 (109-224)||(28468542-28468660)
chr4 (6-223)||(31985546-31985764)
chr4 (106-189)||(10047379-10047466)
chr4 (106-189)||(16623303-16623390)
chr4 (106-189)||(39245994-39246081)
chr4 (108-189)||(5396683-5396768)
chr4 (108-189)||(36315241-36315326)
chr4 (108-189)||(36329450-36329535)
chr4 (6-63)||(28468449-28468506)
chr4 (106-189)||(38152449-38152536)
chr4 (106-184)||(6743425-6743507)
chr4 (107-188)||(5143260-5143345)
chr4 (109-189)||(5269204-5269288)
chr4 (106-189)||(3796529-3796616)
chr4 (107-188)||(5147678-5147763)
chr4 (108-188)||(3777550-3777634)
chr4 (106-185)||(16630690-16630773)
chr4 (106-189)||(24333809-24333896)
chr4 (107-189)||(54867184-54867269)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (1-386)||(7167049-7167436)
chr3 (12-363)||(22173100-22173456)
chr3 (1-384)||(28503769-28504145)
chr3 (1-384)||(2671491-2671876)
chr3 (1-384)||(8738968-8739354)
chr3 (1-384)||(9091206-9091592)
chr3 (27-363)||(18656256-18656598)
chr3 (1-385)||(8477170-8477556)
chr3 (1-227)||(40372701-40372929)
chr3 (13-363)||(2676993-2677351)
chr3 (1-148)||(28501602-28501750)
chr3 (13-363)||(2672837-2673195)
chr3 (67-363)||(8512037-8512342)
chr3 (67-363)||(8516917-8517222)
chr3 (6-223)||(26928501-26928721)
chr3 (13-337)||(24967957-24968286)
chr3 (6-224)||(1305914-1306134)
chr3 (6-223)||(32143287-32143507)
chr3 (67-363)||(32475306-32475608)
chr3 (143-363)||(10207755-10207981)
chr3 (67-363)||(32480163-32480466)
chr3 (6-223)||(27452924-27453144)
chr3 (281-384)||(40372986-40373085)
chr3 (109-223)||(27986449-27986567)
chr3 (108-189)||(8370488-8370573)
chr3 (108-189)||(27974954-27975039)
chr3 (106-189)||(18552883-18552970)
chr3 (106-188)||(36029094-36029180)
chr3 (108-189)||(16264350-16264435)
chr3 (108-189)||(21711223-21711308)
chr3 (106-186)||(1736305-1736389)
chr3 (109-189)||(33386669-33386753)
chr3 (165-224)||(1309819-1309878)
chr3 (106-189)||(3716002-3716089)
chr3 (106-189)||(30709790-30709877)
chr3 (106-189)||(40592782-40592869)
chr3 (106-189)||(48438214-48438301)
chr3 (108-189)||(6794715-6794800)
chr3 (106-189)||(40844652-40844738)
chr3 (109-189)||(1417493-1417577)
chr3 (109-189)||(39039995-39040079)
chr3 (106-189)||(25795781-25795868)
chr3 (106-189)||(26298988-26299075)
chr3 (106-189)||(47923906-47923993)
chr3 (109-189)||(3328359-3328443)
chr3 (109-189)||(37466291-37466375)
chr3 (106-189)||(24695164-24695251)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (12-363)||(22010602-22010958)
chr6 (12-363)||(11856795-11857154)
chr6 (12-363)||(14737482-14737838)
chr6 (12-363)||(14742342-14742697)
chr6 (12-363)||(28184325-28184684)
chr6 (17-363)||(6438324-6438674)
chr6 (13-363)||(28155477-28155832)
chr6 (1-384)||(5674674-5675057)
chr6 (17-363)||(6005239-6005592)
chr6 (13-363)||(16838566-16838923)
chr6 (13-345)||(33330351-33330690)
chr6 (13-363)||(33335848-33336207)
chr6 (152-345)||(5343322-5343519)
chr6 (239-384)||(30125940-30126084)
chr6 (108-189)||(5757490-5757575)
chr6 (6-223)||(22708984-22709194)
chr6 (111-189)||(21356036-21356118)
chr6 (108-189)||(31086485-31086570)
chr6 (106-189)||(5572251-5572338)
chr6 (107-189)||(4629954-4630040)
chr6 (107-189)||(10077176-10077262)
chr6 (106-189)||(22963700-22963786)
chr6 (106-189)||(23824607-23824693)
chr6 (106-189)||(31979513-31979600)
chr6 (109-189)||(5017482-5017566)
chr6 (128-189)||(31936587-31936651)
chr6 (106-177)||(21801354-21801429)
chr6 (309-384)||(31936398-31936470)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (12-363)||(24024232-24024589)
chr7 (11-363)||(12406155-12406512)
chr7 (12-363)||(12396735-12397091)
chr7 (1-384)||(20357452-20357837)
chr7 (12-363)||(31109489-31109844)
chr7 (17-363)||(19992135-19992487)
chr7 (1-386)||(2057763-2058158)
chr7 (103-363)||(4866553-4866819)
chr7 (1-384)||(1533348-1533730)
chr7 (17-363)||(21812149-21812501)
chr7 (1-384)||(21645818-21646197)
chr7 (1-227)||(21639770-21639999)
chr7 (67-363)||(24266162-24266466)
chr7 (11-227)||(18408726-18408944)
chr7 (11-224)||(18413606-18413820)
chr7 (67-363)||(24261283-24261587)
chr7 (67-363)||(16879894-16880197)
chr7 (67-363)||(16884750-16885053)
chr7 (106-189)||(29159803-29159890)
chr7 (107-188)||(21983285-21983370)
chr7 (106-189)||(46516320-46516407)
chr7 (106-189)||(49091661-49091748)
chr7 (112-189)||(47263678-47263757)
chr7 (106-189)||(55948-56034)
chr7 (107-188)||(21988909-21988992)
chr7 (108-189)||(44848696-44848781)
chr7 (109-189)||(9190021-9190105)
chr7 (109-189)||(20284089-20284173)
chr7 (108-189)||(2479337-2479421)
chr7 (106-189)||(2647706-2647793)
chr7 (106-189)||(33332460-33332547)
chr7 (109-189)||(2580390-2580474)
chr7 (108-189)||(35960816-35960901)
chr7 (309-384)||(2479148-2479221)
chr7 (109-189)||(9185178-9185262)
chr7 (309-388)||(47263485-47263562)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (1-386)||(11098832-11099219)
chr2 (46-363)||(44312563-44312885)
chr2 (1-384)||(14291295-14291680)
chr2 (13-363)||(32246607-32246966)
chr2 (12-363)||(39811894-39812250)
chr2 (1-384)||(9296306-9296691)
chr2 (17-363)||(19344243-19344596)
chr2 (17-363)||(19349101-19349454)
chr2 (6-384)||(25398305-25398681)
chr2 (6-384)||(25403443-25403819)
chr2 (6-224)||(3491716-3491936)
chr2 (109-223)||(40738810-40738926)
chr2 (106-189)||(21629944-21630030)
chr2 (106-189)||(8040060-8040147)
chr2 (6-151)||(25407663-25407808)
chr2 (106-186)||(13569331-13569415)
chr2 (108-189)||(28259189-28259274)
chr2 (105-189)||(20522220-20522308)
chr2 (106-189)||(10445454-10445541)
chr2 (106-189)||(17865203-17865290)
chr2 (106-189)||(34682344-34682431)
chr2 (106-188)||(34388859-34388945)
chr2 (6-61)||(40738963-40739018)
chr2 (106-189)||(14699018-14699104)
chr2 (106-189)||(31056044-31056131)
chr2 (106-189)||(33528631-33528718)
chr2 (106-188)||(10707262-10707348)
chr2 (106-186)||(8390160-8390244)
chr2 (111-189)||(42039684-42039766)
chr2 (106-189)||(16940219-16940306)
chr2 (106-189)||(17010884-17010971)
chr2 (106-189)||(39482931-39483018)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (12-363)||(9549-9902)
scaffold0355 (215-363)||(1-143)
scaffold0355 (12-94)||(3754-3836)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (12-363)||(34967-35323)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (13-363)||(25444996-25445352)
chr1 (12-363)||(41398060-41398415)
chr1 (17-363)||(39445322-39445673)
chr1 (17-363)||(44023785-44024135)
chr1 (1-348)||(24787269-24787624)
chr1 (17-363)||(1054923-1055274)
chr1 (12-287)||(41390488-41390760)
chr1 (1-384)||(24202675-24203054)
chr1 (67-345)||(43988424-43988709)
chr1 (6-224)||(19358754-19358975)
chr1 (6-224)||(19361343-19361564)
chr1 (6-224)||(19379983-19380204)
chr1 (285-363)||(41386571-41386650)
chr1 (106-189)||(47703946-47704033)
chr1 (108-189)||(26644909-26644994)
chr1 (106-189)||(9476261-9476348)
chr1 (106-189)||(19072928-19073015)
chr1 (106-189)||(19120818-19120905)
chr1 (6-63)||(19366219-19366276)
chr1 (106-189)||(13598398-13598485)
chr1 (106-189)||(16124526-16124613)
chr1 (106-189)||(27104382-27104469)
chr1 (106-189)||(29651811-29651898)
chr1 (108-189)||(3281708-3281793)
chr1 (108-189)||(37069770-37069855)
chr1 (106-189)||(775672-775759)
chr1 (109-189)||(47098837-47098921)
chr1 (13-87)||(25439803-25439877)
chr1 (108-189)||(13604635-13604720)
chr1 (328-384)||(19359079-19359132)
chr1 (108-189)||(21536581-21536666)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (17-363)||(185-536)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (67-363)||(148916-149219)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (6-384)||(23956-24331)
scaffold0188 (6-384)||(17863-18238)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (67-363)||(2211-2514)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (44-363)||(19102-19428)
scaffold0197 (67-363)||(14269-14573)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (157-385)||(300-528)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (123-363)||(181980-182228)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (285-363)||(34132-34211)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (108-189)||(8431-8516)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (302-363)||(13171-13233)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (108-188)||(85684-85768)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (106-189)||(5683-5770)
scaffold0006 (106-189)||(2492-2579)
scaffold0006 (108-189)||(133292-133377)
[»] scaffold0087 (3 HSPs)
scaffold0087 (108-189)||(43973-44058)
scaffold0087 (108-189)||(36844-36929)
scaffold0087 (309-384)||(44174-44247)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (106-189)||(10729-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (109-189)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (106-186)||(17266-17350)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6311490 - 6311097
Alignment:
Q  1 agtgacttctctttt--agggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgatagctagagcttc 98  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  6311490 agtgacttctcttttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttc 6311391  T
Q  99 ttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311390 ttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 6311291  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  6311290 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttg 6311191  T
Q  294 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacagaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6311190 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacagaa 6311097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Original strand, 7289831 - 7290211
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  7289831 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 7289929  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289930 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 7290029  T
Q  209 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||  |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  7290030 ttttatcacttatcttgtttatggtttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttg 7290129  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaacag 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  7290130 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcaatgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacag 7290211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36979569 - 36979184
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  36979569 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttct 36979471  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36979470 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 36979371  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  36979370 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttg 36979272  T
Q  294 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36979271 gaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 36979184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 4759980 - 4760366
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  4759980 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttct 4760078  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4760079 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttgatg 4760178  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  4760179 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttg 4760278  T
Q  294 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4760279 gaaaccattt-tgctcattgattaccactatctctagctccacacatctttgtt--tttcattgatgtgagtttcaaccggattcacaaca 4760366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30655838 - 30655448
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||  | ||||    
T  30655838 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaaggctattgtttct 30655740  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30655739 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 30655640  T
Q  197 ----ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg-gttttgttgt--tt 288  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||    
T  30655639 ttttttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgttgtt 30655540  T
Q  289 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30655539 gcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 30655448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 18870466 - 18870849
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  18870466 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttct 18870564  T
Q  100 tgcaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggt 195  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  18870565 tgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttcttggt 18870664  T
Q  196 gttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtttgcttgg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18870665 gttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgttttttgttgtttgcttgg 18870763  T
Q  295 aaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||||||   ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18870764 aaaccattt-aactcatagattaccattatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 18870849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 25328184 - 25328540
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  25328184 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 25328281  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc--tt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25328282 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttt 25328381  T
Q  207 cctttcttgcttatcttgtttatg-cttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 303  Q
    |||||   | |||||| |||||||  ||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  25328382 cctttaccgtttatctcgtttatgttttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggttgttttgttgttgttggcttggagaccattt 25328479  T
Q  304 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25328480 gttctcattgattatcactatcacttgctccgcacatcattgatttatttcattgttgtga 25328540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 18853072 - 18853457
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  18853072 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttct 18853170  T
Q  100 tgcaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggt 195  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18853171 tgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggt 18853270  T
Q  196 gttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggc---tggttttgttgtttgct 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || ||||||||||   |  ||||||||||||||    
T  18853271 gttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtttgct 18853369  T
Q  292 tggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18853370 tggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc----tttgtttcgttggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 18853457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 348
Target Start/End: Original strand, 33037724 - 33038063
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| ||||    
T  33037724 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 33037822  T
Q  112 taacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33037823 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttctt 33037922  T
Q  210 ttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgt--ttgcttggaaaccatttgt 305  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  33037923 ttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttgttgcttggaaaccattt-t 33038020  T
Q  306 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgttt 348  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33038021 gttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgttt 33038063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Original strand, 10689047 - 10689442
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaa-gggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||    
T  10689047 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttc 10689145  T
Q  99 ttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggt 195  Q
    ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10689146 ttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggt 10689245  T
Q  196 gttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgctt 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||  |||||| || |||||||||  ||||||    
T  10689246 gttttgttcttcctttcttacttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttgttgctt 10689344  T
Q  293 ggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacagaagcaaa 392  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||    
T  10689345 ggaaaccattag-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccgaaaacacaacacaatcaaa 10689441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Original strand, 39784734 - 39785086
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  39784734 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 39784830  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 209  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  39784831 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 39784929  T
Q  210 ttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgtt 306  Q
    ||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  39784930 ttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgtt 39785028  T
Q  307 ctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39785029 ctcattgattatcactatcacttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 39785086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 384 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 38613757 - 38613611
Alignment:
Q  384 agaagcaaaattcagcagattcaaaccttggcaacggtgtttgtgcaatgtatttaagaccctgcaggtgaaaacggagattacaatgagtatcaagttt 483  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38613757 agaagcaaaatcgagctgattcaaaccttggcaacggtgtttgtgcaatgtatttaagaccctgcaggtgaaaacggagattacaatgagtatcaagttt 38613658  T
Q  484 aaaattactcataattttgaaacctgggaccagagatgatgatgatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38613657 aaaattactcataattttgaaagctgggaccagagaagatgatgatg 38613611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 1261860 - 1262238
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    ||||    
T  1261860 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttct 1261957  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  1261958 tgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctttttggtg 1262057  T
Q  197 t-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttg 293  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||   ||||   |||| | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  1262058 tgtttgttcttcctttctatcttatcttgtt--tgcttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttg 1262152  T
Q  294 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    || ||  ||  | ||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1262153 gagacactt--tactcatagattaccactcccttttactccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 1262238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35745566 - 35745213
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 113  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  35745566 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 35745470  T
Q  114 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 207  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  35745469 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 35745371  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 305  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  35745370 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 35745273  T
Q  306 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35745272 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 35745213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 10684224 - 10684528
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10684224 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 10684321  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  10684322 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 10684418  T
Q  259 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 353  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  10684419 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 10684518  T
Q  354 attggtgtga 363  Q
    ||||||||||    
T  10684519 attggtgtga 10684528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 31071140 - 31071362
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  31071140 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 31071237  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tt 199  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||| ||    
T  31071238 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctttttggtgtgtt 31071337  T
Q  200 tgttcttcctttcttgcttatcttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31071338 tgttcttcctttcttgcttatcttg 31071362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287866
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttc 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 26287886  T
Q  205 ttcctttcttgcttatcttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26287885 ttcctttcttgcttatcttg 26287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301123
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttc 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 26301143  T
Q  205 ttcctttcttgcttatcttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26301142 ttcctttcttgcttatcttg 26301123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313117
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttc 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 26313137  T
Q  205 ttcctttcttgcttatcttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26313136 ttcctttcttgcttatcttg 26313117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403327
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26403327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4456113 - 4456028
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456113 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7412426 - 7412305
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgt 202  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  7412426 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttcatggtgtgtttgt 7412327  T
Q  203 tcttcctttc-ttgcttatctt 223  Q
    || | ||||| |||||||||||    
T  7412326 tccttctttcattgcttatctt 7412305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 23799587 - 23799674
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23799587 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 23799674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 19175766 - 19175851
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19175766 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696693
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 4696693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6127308 - 6127224
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 186  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  6127308 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  128 tggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatc 187  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752491
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19752491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26288076 - 26288020
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  26288076 cttctcttttagggttcatattgtgagagtgggg-aacacaaatgggtagaaactagg 26288020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26301333 - 26301277
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  26301333 cttctcttttagggttcatattgtgagagtgggg-aacacaaatgggtagaaactagg 26301277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26313327 - 26313271
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  26313327 cttctcttttagggttcatattgtgagagtgggg-aacacaaatgggtagaaactagg 26313271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 5702493 - 5702580
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5702493 cttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5702580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 386
Target Start/End: Original strand, 19752609 - 19752683
Alignment:
Q  310 attgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 386  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  19752609 attgattaccacttccttttgctccacacatctttgttt-tttcattggtgtga-tttttaccggattcacaacaga 19752683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Original strand, 1457067 - 1457446
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  1457067 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 1457165  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457166 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 1457265  T
Q  209 tttcttgcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgt 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  1457266 tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 1457365  T
Q  306 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaacag 385  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  1457366 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacag 1457446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43592459 - 43592080
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43592459 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43592361  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592360 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43592261  T
Q  209 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  43592260 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 43592161  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43592160 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattgatgtgactttggaaccggattcacaaca 43592080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27445150 - 27444771
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  27445150 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 27445052  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445051 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 27444952  T
Q  209 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  27444951 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttg 27444852  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 384  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27444851 tactcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 27444771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27449994 - 27449615
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  27449994 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 27449896  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449895 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 27449796  T
Q  209 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  27449795 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttg 27449696  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 384  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27449695 tactcattgattaccactatctcttgctccacatatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 27449615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30631597 - 30631227
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  30631597 agtgacttctcttt-agggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtttct 30631499  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt 197  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30631498 tgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatcttcttggtgt 30631399  T
Q  198 tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttgg 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||     
T  30631398 tttgttcttcctttcttacttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggct-gttttgttgttgttgcttga 30631300  T
Q  295 aaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30631299 aaaccatttgttctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcatttgtgtgagttt 30631227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43598904 - 43598525
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43598904 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43598806  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598805 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43598706  T
Q  209 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  43598705 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43598606  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43598605 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaaca 43598525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43604396 - 43604017
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43604396 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43604298  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604297 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43604198  T
Q  209 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  43604197 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43604098  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43604097 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaaca 43604017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43609888 - 43609509
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43609888 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43609790  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609789 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43609690  T
Q  209 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  43609689 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43609590  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43609589 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaaca 43609509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15044865 - 15044512
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  15044865 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaacctttt 15044768  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15044767 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcc 15044668  T
Q  209 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||| ||||||||    
T  15044667 ttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttg 15044569  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  15044568 ttctcattgattaccactatcacttgctctacacgtcattg--tatttcattggtgtga 15044512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31180405 - 31180138
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgatagctagagcttctt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  31180405 agtgtcttctcttttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttctt 31180306  T
Q  101 gcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtt 198  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31180305 gtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 31180206  T
Q  199 ttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 265  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31180205 ttgttctttctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Original strand, 28807485 - 28807837
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaac 115  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  28807485 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaga--ttcttgtaaccttttgtaac 28807581  T
Q  116 actttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctt 210  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||    
T  28807582 actt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttt 28807680  T
Q  211 tcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 307  Q
    |   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28807681 taccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgagtggttttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttc 28807780  T
Q  308 tcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28807781 tcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 28807837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Original strand, 37556533 - 37556887
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||    
T  37556533 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaa 37556629  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  37556630 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccat 37556729  T
Q  210 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 307  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| ||    
T  37556730 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctc 37556829  T
Q  308 tcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  37556830 tcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtttattatcattggtgtga 37556887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Original strand, 37561355 - 37561709
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||    
T  37561355 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaa 37561451  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  37561452 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccat 37561551  T
Q  210 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 307  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| ||    
T  37561552 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctc 37561651  T
Q  308 tcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  37561652 tcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtttattatcattggtgtga 37561709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38192359 - 38191983
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  38192359 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 38192262  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  38192261 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgttt 38192162  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  38192161 gttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaga 38192065  T
Q  298 ccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38192064 cactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38191983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38219584 - 38219208
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  38219584 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 38219487  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  38219486 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgttt 38219387  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  38219386 gttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaga 38219290  T
Q  298 ccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38219289 cactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38219208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2785550 - 2785197
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 113  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | || ||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  2785550 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 2785454  T
Q  114 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 207  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  2785453 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 2785355  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 305  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  2785354 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 2785257  T
Q  306 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2785256 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 2785197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24136039 - 24135659
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    ||||    
T  24136039 agtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttct 24135942  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24135941 tgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 24135842  T
Q  197 t-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgctt 292  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||  |  |  |||| | ||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  24135841 tgtttgttcttccttttctagcttatcttgtt--tgctttgta--ttatcttgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgtttgctt 24135746  T
Q  293 ggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||| ||  | | | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| || |   |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  24135745 ggagac--tctttactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttat---tttcattggtgtgagttttatccggattcacaaca 24135659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 31396953 - 31397256
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31396953 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 31397050  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgt---tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  31397051 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgtt-ttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctt 31397147  T
Q  259 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 354  Q
    |||| ||| ||  || || ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31397148 tacattaggcttaggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctca 31397247  T
Q  355 ttggtgtga 363  Q
    |||||||||    
T  31397248 ttggtgtga 31397256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 31401810 - 31402113
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31401810 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccatattaggcca 31401907  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  31401908 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctt 31402004  T
Q  259 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 354  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31402005 tacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctca 31402104  T
Q  355 ttggtgtga 363  Q
    |||||||||    
T  31402105 ttggtgtga 31402113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33791491 - 33791158
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 113  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  33791491 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 33791395  T
Q  114 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 207  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  33791394 acacattcacatattggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 33791296  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 305  Q
     ||| | | ||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  33791295 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctctatatgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 33791198  T
Q  306 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 345  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33791197 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33791158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35387853 - 35387624
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   | | ||||||||| |||||  |||||    ||||    
T  35387853 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttct 35387756  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  35387755 tgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctttttggtg 35387656  T
Q  197 t-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387655 tgtttgttcttcctttcttgcttatctcgttt 35387624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33768299 - 33768021
Alignment:
Q  72 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg 167  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  33768299 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccacattg 33768202  T
Q  168 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacac 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| | | ||||| ||  |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||     
T  33768201 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctg--tatgcttgttagctctatatgtggttttgctatacat 33768105  T
Q  264 tagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 345  Q
    ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||   ||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33768104 taggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33768021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 9353344 - 9353429
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353344 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 36932362 - 36932447
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932362 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10281838 - 10281751
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281838 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15464617 - 15464532
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15464617 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31180142 - 31180079
Alignment:
Q  319 cactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31180142 cactatctcttgctccacacatcattgtta--ttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 31180079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19588833 - 19588746
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588833 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Original strand, 11916982 - 11917068
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916982 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14520315 - 14520230
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520315 tttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3880386 - 3880299
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  3880386 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatctt 3880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004057
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 17004057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 186
Target Start/End: Original strand, 12084187 - 12084269
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12084187 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832259
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatctt 28832259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35387527 - 35387474
Alignment:
Q  328 ttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35387527 ttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 35387474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127507
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 42127507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 51520637 - 51520257
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  51520637 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 51520539  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520538 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 51520439  T
Q  209 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  51520438 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 51520339  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaacag 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  51520338 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacag 51520257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 9224312 - 9224668
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  9224312 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaacctttt 9224410  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224411 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9224510  T
Q  209 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  9224511 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 9224609  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224610 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 9224668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24742132 - 24741748
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  24742132 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttct 24742034  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24742033 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 24741934  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  24741933 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttg 24741835  T
Q  294 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24741834 gaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 24741748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 9229099 - 9229455
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  9229099 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaacctttt 9229197  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229198 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9229297  T
Q  209 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  9229298 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 9229396  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229397 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 9229455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3814202 - 3813846
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  3814202 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaacctttt 3814106  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttc 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  3814105 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttcttc 3814006  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgctttt-gttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  3814005 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 3813906  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3813905 ctctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 3813846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 72 - 385
Target Start/End: Original strand, 56146677 - 56146996
Alignment:
Q  72 tgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggc 169  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  56146677 tgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggc 56146775  T
Q  170 tgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagt 267  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  56146776 tgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagt 56146875  T
Q  268 ctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagt 365  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56146876 ctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaat 56146975  T
Q  366 tt-caaccggaatcacaacag 385  Q
    ||  ||||||| |||||||||    
T  56146976 ttggaaccggattcacaacag 56146996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 45357203 - 45357558
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 111  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  45357203 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttg 45357300  T
Q  112 taacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--c 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45357301 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcc 45357400  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
     |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  45357401 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 45357499  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357500 ttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 45357558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18855900 - 18855549
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  18855900 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 18855804  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttt 211  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  18855803 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 18855705  T
Q  212 cttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 308  Q
     |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18855704 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttct 18855605  T
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18855604 cattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 18855549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29760821 - 29760449
Alignment:
Q  14 ttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 111  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||   ||||  | |||||| |||| ||||    
T  29760821 ttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaggctattgtttcttgtaaccctttg 29760723  T
Q  112 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29760722 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcc 29760623  T
Q  209 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  29760622 tttcttgcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctaggg-ttgttttgttgttgttgcttggaaaccattt-t 29760526  T
Q  306 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
      | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29760525 gtttattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 29760449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 45347723 - 45348079
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 111  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||    
T  45347723 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggt-cttgtaaccttttg 45347821  T
Q  112 taacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--c 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45347822 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcc 45347921  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
     |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  45347922 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 45348020  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45348021 ttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 45348079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5732828 - 5732486
Alignment:
Q  27 tgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcat 125  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5732828 tgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcat 5732732  T
Q  126 attggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-ttcctttcttgct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| |||||||   | |    
T  5732731 attggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtt 5732632  T
Q  218 tatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattga 314  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5732631 tatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattga 5732534  T
Q  315 ttaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5732533 ttaccaccatcacttgctccacacatcattgtat-tttcattggtgtga 5732486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468660
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttc 204  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgttc 28468640  T
Q  205 ttcctttcttgcttatcttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28468641 ttcctttcttgcttatcttg 28468660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 31985546 - 31985764
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  31985546 cttctcttttagggttcacattgtgagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 31985642  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  31985643 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgttt 31985741  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31985742 gttcttcctttcttgcttatctt 31985764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10047466 - 10047379
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10047466 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10047379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 16623303 - 16623390
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  16623303 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 16623390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39246081 - 39245994
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39246081 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 39245994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 5396683 - 5396768
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396683 tttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 36315241 - 36315326
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36315241 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36315326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 36329450 - 36329535
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36329450 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36329535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Original strand, 28468449 - 28468506
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 63  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28468449 cttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctagg 28468506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152536
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttctc-atattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 38152536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 184  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  107 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269288
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 5269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 3796529 - 3796616
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3796529 cttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5147763 - 5147678
Alignment:
Q  107 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5147763 ttttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3777634 - 3777550
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3777634 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 185
Target Start/End: Original strand, 16630690 - 16630773
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 185  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||    
T  16630690 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333809
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 24333809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54867269 - 54867184
Alignment:
Q  107 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54867269 ttttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 54867184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7167436 - 7167049
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  7167436 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttct 7167338  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7167337 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 7167238  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  7167237 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggct-gttttgttgttgttgcttg 7167139  T
Q  294 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 386  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7167138 gaaaccattt-tgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaga 7167049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 22173100 - 22173456
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  22173100 ttttagggttcatattaggagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 22173198  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173199 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 22173298  T
Q  209 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
     |||   ||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22173299 ttttaccgcttatcttattt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 22173397  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173398 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 22173456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 28503769 - 28504145
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  28503769 agtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttct 28503868  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt 197  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503869 tgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt 28503968  T
Q  198 tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttgg 294  Q
    |||||||||||||         |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  28503969 tttgttcttcctt---------tcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggct-gttttgttgttgttgcttgg 28504058  T
Q  295 aaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  28504059 aaaccattt-ttctcatagattatcactaccttttgctccacacatcattgtt--attcattggtgtgagttaagaccggattcacaaca 28504145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 2671491 - 2671876
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || |||||||||| |||||  | |||  | ||||    
T  2671491 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttggtcttgtgtaa-gcttgcaatctattgtttct 2671589  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2671590 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 2671689  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgtttgctt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||    
T  2671690 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgctt 2671788  T
Q  293 ggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2671789 ggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 2671876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 8738968 - 8739354
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  8738968 agtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttct 8739066  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8739067 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 8739166  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggttttgttg---tttgct 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| | ||||||| || || |||||||||| | ||||||||   ||||||    
T  8739167 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgct 8739265  T
Q  292 tggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8739266 tggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 8739354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 9091206 - 9091592
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  9091206 agtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttct 9091304  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9091305 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 9091404  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggttttgttg---tttgct 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| | ||||||| || || |||||||||| | ||||||||   ||||||    
T  9091405 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgct 9091503  T
Q  292 tggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  9091504 tggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 9091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18656598 - 18656256
Alignment:
Q  27 tgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcat 125  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18656598 tgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcat 18656502  T
Q  126 attggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-ttcctttcttgct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| |||||||   | |    
T  18656501 attggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtt 18656402  T
Q  218 tatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattga 314  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18656401 tatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattga 18656304  T
Q  315 ttaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18656303 ttaccaccatcacttgctccacacatcattgtat-tttcattggtgtga 18656256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8477556 - 8477170
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtgggg-aaacaccaaagggtagaatctagggtctgtct--tgtgtaaagcttgatagctagagctt 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |  ||||||| |||||  |||||  | ||    
T  8477556 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgtaa-gcttgcaagctattgttt 8477458  T
Q  98 cttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcgg 194  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8477457 cttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttgg 8477358  T
Q  195 tgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgct 291  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||  | | | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  8477357 tgtgtttgttctttctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttatctttgtggtgttgttctacactagtctagggctggttttgttgttgttgct 8477261  T
Q  292 tggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttca-accggaatcacaacag 385  Q
    ||| || | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  8477260 tgggaaac-tttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttataccggattcacaacag 8477170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 40372701 - 40372929
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||    ||||    
T  40372701 agtgtcttctcttttagggttcatattatgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttct 40372798  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40372799 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 40372898  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40372899 ttttgttcttcctatcttgcttatcttgttt 40372929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 2676993 - 2677351
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 109  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  2676993 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 2677089  T
Q  110 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 204  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  2677090 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 2677188  T
Q  205 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 301  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||    
T  2677189 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 2677287  T
Q  302 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2677288 ttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 2677351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 28501602 - 28501750
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  28501602 agtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttct 28501701  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 148  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501702 tgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 2672837 - 2673195
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 109  Q
    |||| |||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  2672837 tttaaggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 2672933  T
Q  110 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 204  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  2672934 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 2673032  T
Q  205 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 301  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||    
T  2673033 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 2673131  T
Q  302 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
    ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2673132 ttactctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 2673195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8512342 - 8512037
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8512342 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 8512245  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttg-cttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtt 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| | |  ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  8512244 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgcttgttaactcttagtgtggttgtgct 8512147  T
Q  258 atacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 353  Q
    | ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8512146 acacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctc 8512047  T
Q  354 attggtgtga 363  Q
    ||||||||||    
T  8512046 attggtgtga 8512037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8517222 - 8516917
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8517222 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 8517125  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttg-cttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtt 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| | |  ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  8517124 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgcttgttaactcttagtgtggttgtgct 8517027  T
Q  258 atacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 353  Q
    | ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8517026 acacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctc 8516927  T
Q  354 attggtgtga 363  Q
    ||||||||||    
T  8516926 attggtgtga 8516917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 26928501 - 26928721
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  26928501 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttttcttgtaa 26928599  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  26928600 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgttt 26928698  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatctt 223  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  26928699 gttctttctttctagcttatctt 26928721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24968286 - 24967957
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttt 109  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||    
T  24968286 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaagtaccaaagggtaga-tctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 24968190  T
Q  110 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 204  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  24968189 tgtaacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 24968091  T
Q  205 -ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 301  Q
     ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||    
T  24968090 tttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 24967993  T
Q  302 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 337  Q
    |||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  24967992 ttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1306134 - 1305914
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  | |||    |||||| ||    
T  1306134 cttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactattt-ttcttgtaa 1306037  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  1306036 ccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgttt 1305938  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatcttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1305937 gttcttcctttcttgcttatcttg 1305914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32143507 - 32143287
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  32143507 cttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 32143410  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tt 199  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||| ||    
T  32143409 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttt-ggtgtgtt 32143311  T
Q  200 tgttcttcctttcttgcttatctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32143310 tgttcttcctttcttgcttatctt 32143287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32475608 - 32475306
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  32475608 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 32475512  T
Q  164 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  32475511 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 32475415  T
Q  260 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 354  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || | |||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  32475414 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctca 32475315  T
Q  355 ttggtgtga 363  Q
    |||||||||    
T  32475314 ttggtgtga 32475306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10207981 - 10207755
Alignment:
Q  143 ctctctcccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgctt-atcttgtttatgcttgttag 238  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  | |||| || || |||||||| |||||||||||    
T  10207981 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt-gttcttttcttttcatggtttatcttgtt-atgcttgttag 10207884  T
Q  239 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccac 336  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  10207883 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 10207784  T
Q  337 acatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10207783 acatcattggtttattctcattggtgtga 10207755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32480466 - 32480163
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  32480466 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 32480370  T
Q  164 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  32480369 attggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 32480273  T
Q  260 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg--tttatt-tc 353  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || | |||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||| ||    
T  32480272 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttggatttattctc 32480173  T
Q  354 attggtgtga 363  Q
    ||||||||||    
T  32480172 attggtgtga 32480163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27453144 - 27452924
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  27453144 cttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaaataggaattgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 27453047  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tt 199  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  27453046 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt-ttggtgtgtt 27452948  T
Q  200 tgttcttcctttcttgcttatctt 223  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  27452947 tgttccttctttcttgcttatctt 27452924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 384
Target Start/End: Original strand, 40372986 - 40373085
Alignment:
Q  281 tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcac 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40372986 tgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcac 40373081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986567
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgtt 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgtt 27986547  T
Q  204 cttcctttcttgcttatctt 223  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  27986548 cattctttcttgcttatctt 27986567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 8370488 - 8370573
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370488 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 27974954 - 27975039
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974954 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 18552883 - 18552970
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18552883 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 18552970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36029180 - 36029094
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgc--tctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36029180 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16264435 - 16264350
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16264435 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21711308 - 21711223
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21711308 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21711223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Original strand, 1736305 - 1736389
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 186  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1736305 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1309878 - 1309819
Alignment:
Q  165 ttggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1309878 ttggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 1309819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 3716002 - 3716089
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3716002 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 3716089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 30709790 - 30709877
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709790 cttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 40592782 - 40592869
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40592782 cttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 40592869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48438301 - 48438214
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  48438301 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatctt 48438214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 6794715 - 6794800
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  6794715 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatctt 6794800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40844738 - 40844652
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  40844738 cttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatctt 40844652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 1417493 - 1417577
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1417493 ttgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 1417577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25795868 - 25795781
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795868 ctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26299075 - 26298988
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26299075 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 26298988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 47923906 - 47923993
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47923906 cttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 47923993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328443
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggc-tgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatctt 3328443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466291
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 37466291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 24695164 - 24695251
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  24695164 cttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 24695251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 22010602 - 22010958
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  22010602 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 22010700  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010701 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 22010800  T
Q  209 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||  | ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  22010801 ttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 22010899  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010900 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 22010958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11857154 - 11856795
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  11857154 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 11857056  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt---gttct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  11857055 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtttttttgttct 11856956  T
Q  206 tcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccat 301  Q
    ||||||  | |||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  11856955 tccttttatcgcttgtcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccat 11856857  T
Q  302 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856856 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 11856795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 14737482 - 14737838
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  14737482 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 14737579  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc-ttc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14737580 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 14737679  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctc-tttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 303  Q
     |||   ||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  14737680 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctcttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 14737778  T
Q  304 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737779 gttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 14737838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 14742342 - 14742697
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  14742342 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 14742439  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14742440 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 14742539  T
Q  209 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  14742540 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttgatatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttg 14742638  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742639 ttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 14742697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28184684 - 28184325
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  | ||| ||||||||    
T  28184684 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tgttgtaacctttt 28184587  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28184586 gtaacactttctcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 28184487  T
Q  209 tttct--tgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaacca--t 301  Q
    ||| |   ||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  |    
T  28184486 tttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 28184388  T
Q  302 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28184387 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 28184325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6438674 - 6438324
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  6438674 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 6438578  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttt 211  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  6438577 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 6438479  T
Q  212 cttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 308  Q
     |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6438478 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccattggttct 6438379  T
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438378 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 6438324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 28155477 - 28155832
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 111  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||    
T  28155477 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaa--ttcttgtaaccttttg 28155573  T
Q  112 taacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt-- 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      
T  28155574 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 28155673  T
Q  207 cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  28155674 catttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 28155773  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28155774 ctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttattgcattggtgtga 28155832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 5674674 - 5675057
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttgatagctagagcttc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||  |||||  | |||    
T  5674674 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttc 5674772  T
Q  99 ttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggt 195  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  5674773 ttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctctttggt 5674872  T
Q  196 gt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgctt 292  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  5674873 gtgtttgttctttctttcttgcttatattgtt--tgctttgta-ttctctttgtggtgttgctctacactagactagggctggttttgttgttgttgctt 5674969  T
Q  293 ggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    || || | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5674970 gggaaac-tttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 5675057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6005592 - 6005239
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 113  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  6005592 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 6005496  T
Q  114 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 207  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  6005495 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 6005397  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 305  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  6005396 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 6005299  T
Q  306 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6005298 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 6005239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16838923 - 16838566
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttt 109  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||    
T  16838923 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 16838827  T
Q  110 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 204  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  16838826 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 16838728  T
Q  205 -ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 301  Q
     ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| ||||| |  ||||    
T  16838727 tttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttgaaggccat 16838630  T
Q  302 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
    |||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16838629 ttgcactcatagattatctctatcacttgctccacatatcattggtttattctcattggtgtga 16838566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Original strand, 33330351 - 33330690
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 109  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  33330351 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 33330447  T
Q  110 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 204  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  33330448 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 33330546  T
Q  205 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaacca 300  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||    
T  33330547 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggtttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggcca 33330645  T
Q  301 tttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 345  Q
    ||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33330646 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33330690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 33335848 - 33336207
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 109  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  33335848 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 33335944  T
Q  110 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 204  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  33335945 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 33336043  T
Q  205 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaacca 300  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| | |||||  |||    
T  33336044 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggtttttactatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagtttggaggcca 33336142  T
Q  301 tttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 363  Q
    ||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33336143 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 33336207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5343519 - 5343322
Alignment:
Q  152 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtg 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  5343519 agattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtg 5343423  T
Q  248 t-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 344  Q
    | | ||||| |||||  ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5343422 tggtttttgctatactttaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 5343323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 239 - 384
Target Start/End: Original strand, 30125940 - 30126084
Alignment:
Q  239 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgtt---gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcca 335  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  30125940 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttg-gctcatagattatcactacctcttgctcca 30126038  T
Q  336 cacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30126039 cacatctttgt---tttcattggtgtgattttcaaccggattcacaaca 30126084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 5757490 - 5757575
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5757490 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22709194 - 22708984
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||     | || |      
T  22709194 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagcta-----tttttc-- 22709103  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tt 199  Q
        ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  | ||||| |||||||||| || | ||||| ||    
T  22709102 ----ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaatttttt-ggtgtgtt 22709008  T
Q  200 tgttcttcctttcttgcttatctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22709007 tgttcttcctttcttgcttatctt 22708984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21356118 - 21356036
Alignment:
Q  111 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356118 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086570
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatctt 31086570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 5572251 - 5572338
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  5572251 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 5572338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  107 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 189
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077262
Alignment:
Q  107 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 10077262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22963786 - 22963700
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22963786 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 22963700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 23824607 - 23824693
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  23824607 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 23824693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31979600 - 31979513
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31979600 cttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31979513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017566
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatctt 5017566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936587
Alignment:
Q  128 tggattggagagctgctc--tctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 31936587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 177
Target Start/End: Original strand, 21801354 - 21801429
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgct--ctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgg 177  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21801354 cttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 309 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31936470 - 31936398
Alignment:
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31936470 cattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtga-ttttaaccggattcacaaca 31936398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 24024232 - 24024589
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||    
T  24024232 ttttagggttcatcgtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacatttt 24024329  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgtttt-gttctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  24024330 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttctt 24024429  T
Q  207 ccttt-cttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccattt 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||   ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  24024430 ccttttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatatactagtcataggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 24024529  T
Q  304 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024530 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 24024589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12406512 - 12406155
Alignment:
Q  11 cttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttt 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  12406512 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttt 12406414  T
Q  110 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12406413 tgtaacactttctcatattggattggagagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttt 12406314  T
Q  208 ctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccattt 303  Q
    ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  12406313 cttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccattt 12406215  T
Q  304 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406214 gttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 12406155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12397091 - 12396735
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||    
T  12397091 ttttagggttcatattgtgatagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagag-ttcttgtaacctttt 12396993  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396992 gtaacactttctcatattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 12396893  T
Q  209 -tttcttgcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
     |||   ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  12396892 ctttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 12396794  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396793 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 12396735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 20357452 - 20357837
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||  | ||||    
T  20357452 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggctattgtttct 20357551  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt 197  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20357552 tgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtat 20357651  T
Q  198 tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgtttgctt 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||    
T  20357652 tttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttagctt 20357749  T
Q  293 ggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20357750 ggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 20357837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 31109489 - 31109844
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  31109489 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 31109586  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31109587 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttc 31109686  T
Q  208 c-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 303  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  31109687 cttttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 31109784  T
Q  304 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109785 gttctcattgattatcactatcacttgctgcacacatcattgtttatttcattggtgtga 31109844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19992487 - 19992135
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19992487 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 19992391  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  19992390 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 19992291  T
Q  210 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 308  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19992290 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagccatttgttct 19992191  T
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19992190 cattgattatcactatcacctgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 19992135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2058158 - 2057763
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaa-gggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||    
T  2058158 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttc 2058060  T
Q  99 ttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggt 195  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2058059 ttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggt 2057960  T
Q  196 gttttgttcttcc-tttcttgcttatcttg----tttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgt 286  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||    ||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || |||||||||| | ||   |||||||    
T  2057959 gttttgttcttccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgttgt 2057860  T
Q  287 ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 386  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2057859 ttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaga 2057763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 103 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4866819 - 4866553
Alignment:
Q  103 aaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866819 aaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt 4866720  T
Q  201 gttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgctttt-gttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttgga 295  Q
    |||||||||||    ||||||||||||| ||||| | || || |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  4866719 gttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttgga 4866621  T
Q  296 aaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866620 gaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 4866553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 1533348 - 1533730
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttgatagctagagcttc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||  |||||  | |||    
T  1533348 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttc 1533446  T
Q  99 ttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggt 195  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1533447 ttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttattggt 1533546  T
Q  196 gt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgctt 292  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||    
T  1533547 gtgtttgttctttctttcttgcttatattgtt--tgctttgta-ttctctttgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttgttgctt 1533643  T
Q  293 ggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1533644 ggaaac--ttttttctcattgattaccactatattttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 1533730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Original strand, 21812149 - 21812501
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagctt-gata-gctagagcttcttgcaaccttttgta 113  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||||||||    
T  21812149 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagag--tcttggaaccttttgta 21812245  T
Q  114 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cc 208  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |     
T  21812246 agactt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttct 21812344  T
Q  209 tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 307  Q
    |||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  21812345 tttaccgtttatcttgtttatgcttgttaactctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgttagcttggaagccatttgctc 21812444  T
Q  308 tcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21812445 tcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 21812501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21646197 - 21645818
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    ||||    
T  21646197 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttct 21646100  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21646099 tgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtg 21646000  T
Q  197 t-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttg 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||   |||| | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  21645999 tgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtttgt-tttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttg 21645904  T
Q  294 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    || ||  ||  | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21645903 gagacactt--tactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 21645818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21639999 - 21639770
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    ||||    
T  21639999 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttct 21639902  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21639901 tgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtg 21639802  T
Q  197 t-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639801 tgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 21639770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 24266162 - 24266466
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24266162 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 24266259  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  24266260 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 24266356  T
Q  259 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 353  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  24266357 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 24266456  T
Q  354 attggtgtga 363  Q
    ||||||||||    
T  24266457 attggtgtga 24266466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18408944 - 18408726
Alignment:
Q  11 cttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttt 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  || ||    |||||| |||| ||    
T  18408944 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttattt-ttcttgtaaccctt 18408847  T
Q  110 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 205  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  18408846 tgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgttct 18408748  T
Q  206 tcctttcttgcttatcttgttt 227  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  18408747 ttctttcttgcttatcttgttt 18408726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18413820 - 18413606
Alignment:
Q  11 cttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttt 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  | |||    |||||| |||| ||    
T  18413820 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaatctattt-ttcttgtaaccctt 18413723  T
Q  110 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttctt 206  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  18413722 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgttctt 18413624  T
Q  207 cctttcttgcttatcttg 224  Q
     |||||||||||||||||    
T  18413623 tctttcttgcttatcttg 18413606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 24261283 - 24261587
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24261283 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 24261380  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  24261381 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 24261477  T
Q  259 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 353  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  24261478 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 24261577  T
Q  354 attggtgtga 363  Q
    ||||||||||    
T  24261578 attggtgtga 24261587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16880197 - 16879894
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  16880197 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 16880100  T
Q  164 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  16880099 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 16880003  T
Q  260 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 354  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  16880002 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctca 16879903  T
Q  355 ttggtgtga 363  Q
    |||||||||    
T  16879902 ttggtgtga 16879894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16885053 - 16884750
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  16885053 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 16884956  T
Q  164 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  16884955 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 16884859  T
Q  260 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 354  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  16884858 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctca 16884759  T
Q  355 ttggtgtga 363  Q
    |||||||||    
T  16884758 ttggtgtga 16884750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29159890 - 29159803
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29159890 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 29159803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21983370 - 21983285
Alignment:
Q  107 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983370 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 46516320 - 46516407
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46516320 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 46516407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 49091748 - 49091661
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49091748 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatctt 49091661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  112 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 56034 - 55948
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  56034 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 55948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21988992 - 21988909
Alignment:
Q  107 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21988992 ttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 44848696 - 44848781
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  44848696 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190105
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9190105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284089
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20284089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2479421 - 2479337
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479421 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctccccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 2647706 - 2647793
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2647706 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatctt 2647793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 33332460 - 33332547
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  33332460 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 33332547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2580474 - 2580390
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  2580474 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 2580390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960816
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatctt 35960816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2479221 - 2479148
Alignment:
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaa-tcacaaca 384  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  2479221 cattgattaccact-tcctttgctccacacatctttgttt--ttcattggtgtgattatcaaccggaactcacaaca 2479148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185262
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9185262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 47263562 - 47263485
Alignment:
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaa-tcacaacagaag 388  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  47263562 cattgattaccact-tcctttgctccacgcatctttgttt--ttcattggtgtgattatcaaccggaactcacaacagaag 47263485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 11098832 - 11099219
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||||  | ||||    
T  11098832 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttct 11098930  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11098931 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 11099030  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttg 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  11099031 ttttgttcttcctttcttccttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttg 11099129  T
Q  294 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 386  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11099130 gaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaga 11099219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 46 - 363
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312885
Alignment:
Q  46 caaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 44312661  T
Q  145 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagct 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | || ||    
T  44312662 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatct 44312760  T
Q  241 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 338  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312761 ctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 44312860  T
Q  339 atcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44312861 atcattgtttatttcattggtgtga 44312885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14291680 - 14291295
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  14291680 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttct 14291582  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14291581 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 14291482  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgtttgctt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  14291481 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgtttgctt 14291383  T
Q  293 ggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14291382 ggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 14291295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32246966 - 32246607
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 111  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  32246966 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttg 32246869  T
Q  112 taacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32246868 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcc 32246769  T
Q  209 ----tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 301  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||| |||||    
T  32246768 tttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccat 32246670  T
Q  302 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32246669 ttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 32246607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 39811894 - 39812250
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  39811894 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 39811991  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc-ttc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39811992 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 39812091  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
     |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  39812092 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 39812190  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39812191 ttctcattgattatcactatcacttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 39812250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 9296306 - 9296691
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||  ||||  | ||||    
T  9296306 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtataa-gcttgaaggctattgtttct 9296404  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9296405 tgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtg 9296504  T
Q  197 ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgtttgctt 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||    
T  9296505 ttttgttcttcctttcttgcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgctt 9296603  T
Q  293 ggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9296604 ggaaaccattt-tgctcatagattaccactaccttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 9296691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19344596 - 19344243
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 113  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  19344596 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 19344500  T
Q  114 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 207  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19344499 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcc 19344400  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 305  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  19344399 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 19344302  T
Q  306 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19344301 tctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 19344243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19349454 - 19349101
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 113  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  19349454 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 19349358  T
Q  114 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 207  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19349357 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcc 19349258  T
Q  208 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 305  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  19349257 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 19349160  T
Q  306 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19349159 tctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 19349101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25398681 - 25398305
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  25398681 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 25398584  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  25398583 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgttt 25398484  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  25398483 gttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaga 25398387  T
Q  298 ccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25398386 cactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 25398305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25403819 - 25403443
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  25403819 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 25403722  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  25403721 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctttttggtgtgttt 25403622  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  25403621 gttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaga 25403525  T
Q  298 ccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25403524 cactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 25403443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3491936 - 3491716
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  3491936 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 3491839  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  3491838 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgttt 3491740  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatcttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3491739 gttcttcctttcttgcttatcttg 3491716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738810
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 205  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctccccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgttct 40738828  T
Q  206 tcctttcttgcttatctt 223  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40738827 tcctttctagcttatctt 40738810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21630030 - 21629944
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21630030 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 21629944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040060
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 8040060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25407808 - 25407663
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   || |||||||| |||||||  |||||    |||||| ||    
T  25407808 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgt-aagcttgcaagcta-tttttcttgtaa 25407711  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 151  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25407710 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccc 25407663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13569415 - 13569331
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 186  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13569415 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 28259189 - 28259274
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259189 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20522308 - 20522220
Alignment:
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20522308 ccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20522220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 10445454 - 10445541
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  10445454 cttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 10445541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17865290 - 17865203
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17865290 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatctt 17865203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 34682344 - 34682431
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34682344 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 34682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34388945 - 34388859
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  34388945 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40739018 - 40738963
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatcta 61  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  40739018 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaacta 40738963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 14699018 - 14699104
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14699018 cttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14699104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056044
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctt 31056044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 33528631 - 33528718
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33528631 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 33528718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Original strand, 10707262 - 10707348
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707262 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Original strand, 8390160 - 8390244
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 186  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8390160 cttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 189
Target Start/End: Original strand, 42039684 - 42039766
Alignment:
Q  111 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039684 gtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940306
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  || || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 16940306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010971
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  || || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 17010971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39483018 - 39482931
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39483018 cttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39482931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9902
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  9549 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 9645  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9745  T
Q  209 tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgtt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  9746 tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctc-ttgtgtggttttgctatatactagcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgct 9844  T
Q  307 ctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9845 ctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 9902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 363
Target Start/End: Original strand, 1 - 143
Alignment:
Q  215 gcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  1 gcttatcttgtttatgcttgttagctc---gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcatt 97  T
Q  313 gattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||      ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  98 gat------tatcacttgctccacacatcattggtttatttaattggtgtga 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Original strand, 3754 - 3836
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 94  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||    
T  3754 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag 3836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Original strand, 34967 - 35323
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  34967 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaacctttt 35065  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35066 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 35165  T
Q  209 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  35166 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 35264  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35265 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 35323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 25444996 - 25445352
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  25444996 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagc-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaacctttt 25445092  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt- 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25445093 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttt 25445192  T
Q  207 -cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttg 304  Q
     | |||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  25445193 ccttttaccgtttatcttgtttacgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttg 25445292  T
Q  305 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25445293 ttctcattgattatcactatcgcttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 25445352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41398415 - 41398060
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  41398415 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 41398318  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398317 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 41398218  T
Q  209 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggtt-----ttgttgtttgcttggaaacca 300  Q
    ||     |||||||||||||||| ||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||| ||||    
T  41398217 tt-----cttatcttgtttatgctttggtatctctttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagacca 41398124  T
Q  301 tttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41398123 tatgttctcattgattatcactatcacttgctccacacataattggtttatttcattggtgtga 41398060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39445673 - 39445322
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  39445673 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 39445577  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttt 211  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  39445576 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 39445478  T
Q  212 cttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 308  Q
     |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39445477 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttca 39445378  T
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39445377 cattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 39445322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Original strand, 44023785 - 44024135
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44023785 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 44023881  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt-cctt 210  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44023882 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 44023980  T
Q  211 tcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctc 309  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44023981 taccatttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctc 44024080  T
Q  310 attgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44024081 attgattatcactatcagttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 44024135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 24787269 - 24787624
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  24787269 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggctattgtttct 24787368  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt 197  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24787369 tgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt 24787468  T
Q  198 tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg-gttttgttgt-----ttg 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||  |||||||||     |||    
T  24787469 tttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgttgttg 24787566  T
Q  290 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgttt 348  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24787567 cttggaaaccattt-tgctcatttattaccactatctcttgctccacacatctttgttt 24787624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Original strand, 1054923 - 1055274
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  1054923 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 1055019  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 209  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  1055020 cactt-cacatattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 1055118  T
Q  210 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 308  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||  ||||||||  |||||||||     
T  1055119 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagacatttgttca 1055218  T
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1055219 cattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 1055274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41390760 - 41390488
Alignment:
Q  12 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  41390760 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 41390663  T
Q  111 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41390662 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatcttctcgatgttttgttcttcc 41390563  T
Q  209 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 287  Q
    ||     |||||||||||||||| ||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41390562 tt-----cttatcttgtttatgctttgatatctctttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggct-gttttgttgtt 41390488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 24202675 - 24203054
Alignment:
Q  1 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    ||||    
T  24202675 agtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttct 24202772  T
Q  100 tgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg 196  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24202773 tgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtg 24202872  T
Q  197 t-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttg 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  24202873 tgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttctct-tgtggtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgtttgcttg 24202968  T
Q  294 gaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    || ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24202969 gagacactt--tacacatagattaccactcccttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 24203054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 345
Target Start/End: Original strand, 43988424 - 43988709
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43988424 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 43988521  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 259  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||| |||| || || | |  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  43988522 cattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttgtatgcttgttagctcttagtgtggttgtgctat 43988621  T
Q  260 acactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 345  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43988622 acattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 43988709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 19358754 - 19358975
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  19358754 cttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 19358851  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||    
T  19358852 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-ttgatgtgttt 19358950  T
Q  201 gttcttcc-tttcttgcttatcttg 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  19358951 gttcttccttttcttgcttatcttg 19358975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 19361343 - 19361564
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  | |||    |||||| ||    
T  19361343 cttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactattt-ttcttgtaa 19361440  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  19361441 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgttt 19361539  T
Q  201 gttcttcc-tttcttgcttatcttg 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  19361540 gttcttccttttcttgcttatcttg 19361564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 19379983 - 19380204
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  | |||    |||||| ||    
T  19379983 cttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactattt-ttcttgtaa 19380080  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  19380081 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgttt 19380179  T
Q  201 gttcttcc-tttcttgcttatcttg 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  19380180 gttcttccttttcttgcttatcttg 19380204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41386650 - 41386571
Alignment:
Q  285 gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41386650 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 41386571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704033
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47704033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 26644909 - 26644994
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644909 tttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476261
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9476261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19073015 - 19072928
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073015 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19120905 - 19120818
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120905 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Original strand, 19366219 - 19366276
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 63  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19366219 cttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctagg 19366276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598398
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 13598398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 16124526 - 16124613
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16124526 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 16124613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 27104382 - 27104469
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  27104382 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 27104469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651811
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatctt 29651811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3281793 - 3281708
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281793 tttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37069855 - 37069770
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069855 tttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775672
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 775672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098921
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47098921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Original strand, 25439803 - 25439877
Alignment:
Q  13 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgata 87  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  25439803 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-ctctagggtttgttcatgtgtaaagcttgata 25439877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 13604635 - 13604720
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604635 tttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 384
Target Start/End: Original strand, 19359079 - 19359132
Alignment:
Q  328 ttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19359079 ttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 19359132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 21536581 - 21536666
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca-tattggctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||    
T  21536581 tttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatctt 21536666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 185
Alignment:
Q  17 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  536 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 440  T
Q  115 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttt 211  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  439 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 341  T
Q  212 cttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 308  Q
     |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttct 241  T
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  240 cattgattatcaccatcacttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 148916 - 149219
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  148916 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggcca 149013  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  149014 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgcta 149110  T
Q  259 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 354  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  149111 tacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctca 149210  T
Q  355 ttggtgtga 363  Q
    |||||||||    
T  149211 ttggtgtga 149219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 384
Target Start/End: Original strand, 23956 - 24331
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  23956 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 24053  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  24054 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgttt 24153  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctgg-ttttgttgt--ttgcttggaaa 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||   ||||   |||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  24154 gttcttcctttctttcttatcttgttt-tctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgttgcttggaga 24249  T
Q  298 ccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24250 cactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 24331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 384
Target Start/End: Original strand, 17863 - 18238
Alignment:
Q  6 cttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| ||    
T  17863 cttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaa 17960  T
Q  105 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-ttt 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  17961 ccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgttt 18060  T
Q  201 gttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctgg-ttttgttgt--ttgcttggaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  18061 gttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttctct-tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgttgcttggaga 18156  T
Q  298 ccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 384  Q
    |  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18157 cactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtttgagttttaaccggattcacaaca 18238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2514
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  2211 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggcca 2308  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2309 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgcta 2405  T
Q  259 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 354  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2406 tacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgctccacacatcattgatttattctca 2505  T
Q  355 ttggtgtga 363  Q
    |||||||||    
T  2506 ttggtgtga 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 363
Target Start/End: Original strand, 19102 - 19428
Alignment:
Q  44 accaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagc 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  19102 accaaagggtaga-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagc 19198  T
Q  141 tgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttg 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||    
T  19199 tgctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttg 19295  T
Q  235 ttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgct 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19296 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 19395  T
Q  333 ccacacatcattg-tttatt-tcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19396 ccacacatcattgatttattctcattggtgtga 19428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 14269 - 14573
Alignment:
Q  67 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14269 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 14366  T
Q  163 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  14367 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 14463  T
Q  259 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 353  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  14464 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 14563  T
Q  354 attggtgtga 363  Q
    ||||||||||    
T  14564 attggtgtga 14573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 385
Target Start/End: Original strand, 300 - 528
Alignment:
Q  157 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttg 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttcttggtgttttgttctttctttctagcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggttttg 398  T
Q  256 ttatacactagtctagggctg-gttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttattt 352  Q
     |   ||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||    
T  399 ctcctcactagtttagggctgttttttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt---ttt 495  T
Q  353 cattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacag 385  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  496 cattggtgtgagttttaaatggattcacaacag 528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 363
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182228
Alignment:
Q  123 catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | |     
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgt 182079  T
Q  217 ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattg 313  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| |    
T  182080 ttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatag 182176  T
Q  314 attaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tcattggtgtga 363  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  182177 attacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtga 182228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 363
Target Start/End: Original strand, 34132 - 34211
Alignment:
Q  285 gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34132 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 34211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 8431 - 8516
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8431 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13171
Alignment:
Q  302 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  13233 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacatatctttggtttatttcattggtgtga 13171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 85768 - 85684
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 188  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85768 tttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5683
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2492
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatctt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 133292 - 133377
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133292 tttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 43973 - 44058
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43973 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 36844 - 36929
Alignment:
Q  108 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36844 tttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 384
Target Start/End: Original strand, 44174 - 44247
Alignment:
Q  309 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaa-tcacaaca 384  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  44174 cattgattaccact-tcctttgctccacacatctttgttt--ttcattggtgtgattatcaaccggaactcacaaca 44247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10816 - 10729
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  10816 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 10729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45253
Alignment:
Q  109 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 189  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17350 - 17266
Alignment:
Q  106 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 186  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  17350 cttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University