View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16915_low_7 (Length: 308)

Name: NF16915_low_7
Description: NF16915
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16915_low_7
NF16915_low_7
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (18-308)||(2640-2930)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (18-308)||(34568-34858)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (18-308)||(8421868-8422158)
chr8 (18-308)||(32430877-32431167)
chr8 (18-308)||(7341838-7342128)
chr8 (18-308)||(32376920-32377210)
chr8 (18-308)||(30303622-30303912)
chr8 (25-308)||(43371523-43371806)
chr8 (22-308)||(2145018-2145304)
chr8 (22-308)||(35964765-35965050)
chr8 (22-258)||(43683256-43683492)
chr8 (22-290)||(7169661-7169922)
chr8 (22-230)||(22581991-22582199)
chr8 (22-232)||(22585851-22586062)
chr8 (116-168)||(17317379-17317431)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (18-308)||(30788298-30788588)
chr7 (18-308)||(43622147-43622437)
chr7 (18-308)||(45765138-45765428)
chr7 (22-308)||(18107147-18107433)
chr7 (20-308)||(616763-617051)
chr7 (22-308)||(15067648-15067934)
chr7 (22-308)||(42501166-42501452)
chr7 (22-308)||(47062640-47062926)
chr7 (22-308)||(10707697-10707984)
chr7 (52-308)||(12116418-12116674)
chr7 (22-308)||(8401260-8401546)
chr7 (94-308)||(43826697-43826911)
chr7 (22-162)||(3762832-3762971)
chr7 (22-56)||(12113572-12113606)
chr7 (107-168)||(25569735-25569796)
chr7 (107-168)||(46792245-46792306)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (18-308)||(19071669-19071959)
chr4 (22-308)||(3405549-3405835)
chr4 (22-308)||(4977977-4978263)
chr4 (22-308)||(38462856-38463142)
chr4 (26-294)||(4769904-4770172)
chr4 (22-294)||(4977524-4977796)
chr4 (22-197)||(51643023-51643198)
chr4 (25-189)||(17238850-17239014)
chr4 (22-126)||(9891813-9891917)
chr4 (187-308)||(11503262-11503383)
chr4 (22-104)||(11503387-11503470)
chr4 (104-168)||(13896850-13896914)
chr4 (22-167)||(6183584-6183728)
chr4 (110-167)||(20970619-20970675)
chr4 (104-156)||(17497455-17497507)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (18-308)||(211453-211743)
chr2 (18-308)||(5348926-5349216)
chr2 (18-308)||(10622466-10622756)
chr2 (18-308)||(41561771-41562061)
chr2 (18-308)||(38947522-38947812)
chr2 (22-308)||(7264739-7265025)
chr2 (22-308)||(39795729-39796015)
chr2 (22-308)||(24751418-24751704)
chr2 (22-308)||(27274376-27274662)
chr2 (22-308)||(9655911-9656197)
chr2 (22-308)||(28347416-28347702)
chr2 (22-308)||(24604108-24604394)
chr2 (22-308)||(24940669-24940955)
chr2 (22-308)||(12906511-12906797)
chr2 (22-308)||(45477114-45477400)
chr2 (22-308)||(11691849-11692135)
chr2 (25-308)||(43948305-43948587)
chr2 (25-308)||(41006998-41007281)
chr2 (22-308)||(34919801-34920087)
chr2 (66-308)||(1097889-1098131)
chr2 (22-308)||(437068-437362)
chr2 (22-189)||(3797817-3797984)
chr2 (22-308)||(17996206-17996477)
chr2 (185-308)||(3801745-3801868)
chr2 (22-168)||(25618105-25618251)
chr2 (104-171)||(28422550-28422617)
chr2 (22-168)||(24683970-24684115)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (18-308)||(3991364-3991654)
chr1 (18-308)||(38774126-38774416)
chr1 (18-308)||(44467341-44467631)
chr1 (18-308)||(20351215-20351505)
chr1 (18-308)||(3946473-3946763)
chr1 (22-308)||(29354704-29354990)
chr1 (22-308)||(13631175-13631461)
chr1 (22-308)||(5079694-5079980)
chr1 (22-308)||(12648595-12648881)
chr1 (22-308)||(50115782-50116068)
chr1 (28-308)||(37016670-37016950)
chr1 (25-308)||(51664014-51664297)
chr1 (22-308)||(13175537-13175823)
chr1 (22-308)||(38690958-38691244)
chr1 (25-308)||(36074820-36075104)
chr1 (22-308)||(19497483-19497769)
chr1 (116-308)||(46974920-46975112)
chr1 (22-108)||(46976765-46976851)
chr1 (223-308)||(41455596-41455681)
chr1 (22-168)||(32105687-32105833)
chr1 (104-168)||(27283960-27284024)
chr1 (229-279)||(32105897-32105947)
chr1 (110-168)||(36359603-36359661)
chr1 (22-80)||(25232218-25232273)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (18-308)||(1610763-1611053)
chr6 (22-308)||(28358077-28358363)
chr6 (22-308)||(31148078-31148364)
chr6 (22-308)||(18607752-18608031)
chr6 (22-308)||(21357369-21357655)
chr6 (22-308)||(23961351-23961637)
chr6 (22-308)||(254427-254713)
chr6 (104-168)||(26684103-26684167)
chr6 (22-81)||(34110720-34110779)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (18-308)||(3950502-3950792)
chr3 (18-308)||(30945654-30945944)
chr3 (22-308)||(8158999-8159285)
chr3 (18-308)||(6742646-6742936)
chr3 (22-308)||(13745737-13746023)
chr3 (22-308)||(36815532-36815818)
chr3 (22-308)||(16446379-16446665)
chr3 (22-308)||(14400316-14400602)
chr3 (22-308)||(48248885-48249171)
chr3 (22-308)||(46991264-46991551)
chr3 (22-308)||(21954258-21954544)
chr3 (22-306)||(29949742-29950026)
chr3 (22-306)||(29998896-29999180)
chr3 (22-292)||(6503974-6504244)
chr3 (22-308)||(77039-77325)
chr3 (203-306)||(7839353-7839456)
chr3 (107-171)||(4511042-4511106)
chr3 (112-168)||(40467293-40467349)
chr3 (105-168)||(8118509-8118572)
chr3 (123-170)||(24148288-24148335)
chr3 (107-168)||(2284136-2284197)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (26-308)||(28884458-28884740)
chr5 (18-306)||(37818889-37819177)
chr5 (22-308)||(27865861-27866147)
chr5 (22-308)||(38858206-38858492)
chr5 (22-308)||(11031468-11031754)
chr5 (25-307)||(13566126-13566408)
chr5 (22-308)||(7019982-7020268)
chr5 (22-308)||(25895113-25895399)
chr5 (14-308)||(1037110-1037404)
chr5 (22-294)||(7799034-7799306)
chr5 (22-304)||(4198922-4199204)
chr5 (98-308)||(34079539-34079749)
chr5 (61-308)||(18536395-18536641)
chr5 (24-270)||(20288065-20288311)
chr5 (106-171)||(25054192-25054257)
chr5 (107-168)||(27012749-27012810)
chr5 (107-168)||(11820136-11820197)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (22-308)||(15373-15659)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (105-170)||(2101-2166)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (104-162)||(1168-1226)


Alignment Details
Target: scaffold0494 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2930 - 2640
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2930 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 2831  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 2731  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2730 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34858 - 34568
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34858 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 34759  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34758 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 34659  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34658 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 34568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 8421868 - 8422158
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8421868 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 8421967  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8421968 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 8422067  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8422068 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 8422158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 32430877 - 32431167
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32430877 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 32430976  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32430977 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 32431076  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32431077 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 32431167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7342128 - 7341838
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7342128 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcct 7342029  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7342028 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 7341929  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7341928 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 7341838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 32376920 - 32377210
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32376920 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 32377019  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377020 gcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 32377119  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32377120 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 32377210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 30303622 - 30303912
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30303622 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttttggtcct 30303721  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30303722 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 30303821  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30303822 ctacatgaatctttgaactccactaatacatttgcatataattgttgattgggagattcaaccataactttccatgcgttcattatcttct 30303912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43371806 - 43371523
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43371806 tattttcttccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctattggtggtcctgcaacca 43371707  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||    
T  43371706 agatgcatcacatggtctctccatgccctcacaattttttccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactacatg 43371607  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  43371606 aatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 43371523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 2145018 - 2145304
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2145018 atgtattttctcccaacaagtacctaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttggtggtcctgcaa 2145117  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  2145118 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcactgcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactac 2145217  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  2145218 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttaagtgggcaattcaaccatagctttccattccctcattatcttct 2145304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 35964765 - 35965050
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  35964765 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaagtatttcttcaataaagcatgagctgattcgacc-tgttcgtggtcctgaaa 35964863  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |   |||||||| ||||||||||    
T  35964864 tcaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgatcatgacataatttttgaaaattggaaaatcactac 35964963  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  35964964 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataattgttgagtggacgattcaaccatagcttttcatgccctcattatcttct 35965050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 258
Target Start/End: Original strand, 43683256 - 43683492
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||    
T  43683256 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcataagcagattcgaccctgttggttgtcatgcaa 43683355  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |   |||| ||||||||||||||    
T  43683356 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacttaatttttgaaaagtgggaaatcactac 43683455  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataa 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43683456 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataa 43683492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7169922 - 7169661
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  7169922 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaa 7169823  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||| || |||      |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  7169822 ccaagatgcaaccca-ggt------atgccctcactattttctccttcacttcttccaaggtggtcatggcataatttaagaaaattgggaaatcattac 7169730  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttcc 290  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||    
T  7169729 atgtatcttggaactccactaatgcatttgcatataattattgagtgtgcgattcaaccatagctttcc 7169661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22582199 - 22581991
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  22582199 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtgattctgcaa 22582100  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22582099 acaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtagtcatggcataatttaggaaaattgggaaatcactac 22582000  T
Q  222 atgaatctt 230  Q
    |||||||||    
T  22581999 atgaatctt 22581991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22586062 - 22585851
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaa-gtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgca 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  22586062 atgtattttctcccaacaaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtgattctgca 22585963  T
Q  121 accaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcacta 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  22585962 accaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtagtcatggcataatttaggaaaattgggaaatcacta 22585863  T
Q  221 catgaatctttg 232  Q
    ||||||||||||    
T  22585862 catgaatctttg 22585851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17317431 - 17317379
Alignment:
Q  116 ctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17317431 ctgcacccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttttcctt 17317379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30788588 - 30788298
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788588 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 30788489  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788488 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 30788389  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30788388 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 30788298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 43622147 - 43622437
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622147 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 43622246  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622247 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 43622346  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43622347 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 43622437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45765428 - 45765138
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765428 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 45765329  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765328 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 45765229  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45765228 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 45765138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18107433 - 18107147
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107433 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 18107334  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107333 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 18107234  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18107233 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 18107147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 308
Target Start/End: Original strand, 616763 - 617051
Alignment:
Q  20 tgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  616763 tgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctatttgtggtcctgc 616862  T
Q  120 aaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcact 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  616863 aaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcact 616962  T
Q  220 acatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  616963 acatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttaagtgggcgattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 617051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15067934 - 15067648
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067934 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcatccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 15067835  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15067834 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctaaaaaaattgggaaatcactac 15067735  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15067734 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 15067648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42501452 - 42501166
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42501452 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccatgtttgtggtcatgcaa 42501353  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42501352 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggtataatctacaaaaattgggaaatcactac 42501253  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42501252 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 42501166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47062926 - 47062640
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47062926 atgtattttcttccaacaagtacccaaatcacctacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 47062827  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     |||| ||||||||||||||    
T  47062826 ccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacataattattgaaaagtgggaaatcactac 47062727  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  47062726 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccataccctcattatcttct 47062640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 10707697 - 10707984
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcga-ccctgtttgtggtcctgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  10707697 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattttatccctgttggtggtcctgca 10707796  T
Q  121 accaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcacta 220  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||    
T  10707797 acatagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgggaaatcacta 10707896  T
Q  221 catgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  10707897 catgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagcattccatgccttcattatcttct 10707984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 52 - 308
Target Start/End: Original strand, 12116418 - 12116674
Alignment:
Q  52 acccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgcc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12116418 acccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattctaccctgttagtggtcctgcaaccaagatgcagcacatggtctgtccatgcc 12116517  T
Q  152 ctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttg 251  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12116518 ctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatgtttgaaaagtgggaaatcaccacatgaatcttggaactccactaatgcatttg 12116617  T
Q  252 catataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    || |||| | |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||    
T  12116618 caaataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttctatgccctcattatcttct 12116674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8401546 - 8401260
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  8401546 atgtattttctcccaacaagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagctgattctaccatgttggtggttctgcaa 8401447  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||  |||| ||| ||||||||||    
T  8401446 ctaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcatttcattcaaggtggtcatgacatactttaggaaaagtggaaaatcactac 8401347  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  8401346 aaaaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 8401260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 308
Target Start/End: Original strand, 43826697 - 43826911
Alignment:
Q  94 cgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggca 193  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43826697 cgattctaccctgttggtagttctacaaccaagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcgctattttctccttcacttcattcaaggcggtcatggca 43826796  T
Q  194 taatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatg 293  Q
    || | ||  ||||  ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  43826797 tactttaggaaaagcgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatg 43826896  T
Q  294 cgttcattatcttct 308  Q
    | |||||||||||||    
T  43826897 cattcattatcttct 43826911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3762971 - 3762832
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||  | |||| |||  | | ||  |||| ||||| |||||     
T  3762971 atgtattttatcccaacaagtacc-aagtcatccacactagtgctcaaatatttcttcaacctaccatgagcccctacaactgtgttggtggttctgcag 3762873  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatttt 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  3762872 ccaagatgcaagacatggtctgaccatgcccccactatttt 3762832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Original strand, 12113572 - 12113606
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcaccca 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12113572 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcaccca 12113606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 25569735 - 25569796
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  25569735 tttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 25569796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46792306 - 46792245
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  46792306 tttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 46792245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 19071669 - 19071959
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071669 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 19071768  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071769 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 19071868  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19071869 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 19071959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3405835 - 3405549
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3405835 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctatttgtggtcctgcaa 3405736  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405735 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtagtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 3405636  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3405635 atgaatctttgaactccactaatgcatttggatataactgtcgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 3405549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 4977977 - 4978263
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4977977 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgaccaaatacttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgctggtggtcctgcaa 4978076  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  4978077 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcaaaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgtcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 4978176  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  4978177 atgaatcttgaaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 4978263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 38462856 - 38463142
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  38462856 atgtattttctcccaaaaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttgctggtcctgcaa 38462955  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| || |||||||||||    
T  38462956 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgagaaatcactac 38463055  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||  |||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  38463056 atgaattttggaactccactgatgcatttgcatataactcttgagtgggcaattcgaccatagcttttcatgccctcattatcttct 38463142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4770172 - 4769904
Alignment:
Q  26 attttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaa 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4770172 attttctcccaacaagtatccaaatcacccacactgttgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattcgaccttgttggtggtcctgcaaccaa 4770073  T
Q  126 gatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatga 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||||||| |    
T  4770072 gatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacataattttggaaaagtgggaaatcactacatta 4769973  T
Q  226 atctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgc 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4769972 atcttggaactccactaatgcatttgcatataaatcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 4769904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4977796 - 4977524
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4977796 atgtattttctcccaacaagtacacaaatcacccatactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 4977697  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| || |||||||||||    
T  4977696 ccaagatgcatcacacagtctgtccatgccctcacaattttgtcattcacttcattcaaggtggtcatgacataattttttaaaagtgagaaatcactac 4977597  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgc 294  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  4977596 atgaatattggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtggccgattcaaccatagctttccatgc 4977524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 197
Target Start/End: Original strand, 51643023 - 51643198
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  51643023 atgtattttctcccaacaagtacacaaatcacctacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagtcgattctactctgttggtggtcctgcaa 51643122  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  51643123 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcatttcatttaaggtggtcatggcataat 51643198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 17238850 - 17239014
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17238850 tattttctcccaacaagtacccaaaacacccacgctattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaacca 17238949  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  17238950 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttctttcaaggtggtcat 17239014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9891917 - 9891813
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891917 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 9891818  T
Q  122 ccaag 126  Q
    |||||    
T  9891817 ccaag 9891813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11503383 - 11503262
Alignment:
Q  187 catggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagtt 286  Q
    ||||||||||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |    
T  11503383 catggcataatttttgaaaagtgggaaatcgctacatgaatcttggaactccactaatgcattttcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagct 11503284  T
Q  287 ttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  11503283 ttccatgccctcattatcttct 11503262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11503470 - 11503387
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaa-caagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccc 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  11503470 atgtattttctcccaaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagctgattcgaccc 11503387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Original strand, 13896850 - 13896914
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  13896850 ctgttggtggttctgcagccaagatgcaacacacggtatgtccatgccttcacaattttttcctt 13896914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6183728 - 6183584
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||  | | |||| |||  ||| || ||||| ||||| ||| ||    
T  6183728 atgtattttctcccaacaagcatccaaatcaccagcactattgctcaaatatttcttcactataccatgagcc-tttcaactctgttagtggttctgtaa 6183630  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcct 167  Q
    ||||||||||| |||  || ||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  6183629 ccaagatgcaagacacagtttgttcatgccgtcactattttctcct 6183584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 20970619 - 20970675
Alignment:
Q  110 gtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcct 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  20970619 gtggtcctgcacccaagatgcaacacaaggtatgtccatg-cctcactattttgtcct 20970675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17497507 - 17497455
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcac 156  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  17497507 ctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtatgtccatgccctcac 17497455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 211453 - 211743
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211453 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 211552  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211553 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 211652  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  211653 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 211743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5349216 - 5348926
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349216 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 5349117  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 5349017  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5349016 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 5348926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 10622466 - 10622756
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622466 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 10622565  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622566 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 10622665  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10622666 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 10622756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41562061 - 41561771
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41562061 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 41561962  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561961 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 41561862  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41561861 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 41561771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38947812 - 38947522
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947812 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 38947713  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947712 gcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgttcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 38947613  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38947612 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgattgggcgattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 38947522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7265025 - 7264739
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7265025 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaa 7264926  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7264925 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgagaaatcactac 7264826  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7264825 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 7264739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39796015 - 39795729
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39796015 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctacaa 39795916  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795915 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgctctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 39795816  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39795815 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactattgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 39795729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24751704 - 24751418
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24751704 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 24751605  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24751604 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 24751505  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24751504 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 24751418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 27274376 - 27274662
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27274376 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 27274475  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27274476 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 27274575  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27274576 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 27274662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9656197 - 9655911
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9656197 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctacaa 9656098  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  9656097 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtctttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 9655998  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  9655997 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccgtcattatcttct 9655911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 28347416 - 28347702
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28347416 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctattggtggtcctgcaa 28347515  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  28347516 ccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcaattcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactac 28347615  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  28347616 atgaatcttggaactccactaattcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 28347702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 24604108 - 24604394
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24604108 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtagtcctgcaa 24604207  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  24604208 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat-tttgaaaagtgggaaataactac 24604306  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcg-ttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  24604307 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaatcatagctttgcatgcgcctcattatcttct 24604394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 24940669 - 24940955
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24940669 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtagtcctgcaa 24940768  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  24940769 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat-tttgaaaagtgggaaataactac 24940867  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcg-ttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  24940868 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaatcatagctttgcatgcgcctcattatcttct 24940955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 12906511 - 12906797
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12906511 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaaacatgagccgattcaaccctgttggtggtcctgcaa 12906610  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  12906611 ccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgggaaatcactac 12906710  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  12906711 atgaatcttggaactccaccaatgcatttgcatataactcttgagtaggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 12906797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45477400 - 45477114
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45477400 atgtattttctccaaacaagtacccaaatcacccacactattttccaaatatttattcactaaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 45477301  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| || |||||||||||    
T  45477300 ccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcgctattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgagaaatcactac 45477201  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  45477200 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagttttccatgcccttattatcttct 45477114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 11691849 - 11692135
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11691849 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggtcctgcaa 11691948  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||    
T  11691949 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctaactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaagtgggaaatcactac 11692048  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |   ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  11692049 aaacatcttggagctccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgctctcattatcttct 11692135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Original strand, 43948305 - 43948587
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43948305 tattttctcctaacaagtacccaaatcacccacactattgcccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaacca 43948404  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||  |||||||| |||    
T  43948405 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat-tttgaaaagtggagaatcactatatg 43948503  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||   |||||||||||    
T  43948504 aatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgcccccattatcttct 43948587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Original strand, 41006998 - 41007281
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  41006998 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtgatcctgcaacca 41007097  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |   |||| ||||||| |||  ||||    
T  41007098 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtgattatggcataatttttgaaaagtgggaaaacacatcatg 41007197  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  41007198 aatcttggaactccactaatgcatttacatataactcttgagtgggcgattcaaccatagtttttcatgtcctcattatcttct 41007281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 34919801 - 34920087
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34919801 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggtcctgcaa 34919900  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |   |||| ||| |||||||| |    
T  34919901 ccaagatgcaacgcatggtctgtccatgctctcactattttctccttcacttcattcaatatggtcatgacataattttggaaaagtggaaaatcactgc 34920000  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  34920001 atgaatcttggaactccactaatacatttgcatataacttttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 34920087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 66 - 308
Target Start/End: Original strand, 1097889 - 1098131
Alignment:
Q  66 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 165  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1097889 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctaccaattttgtc 1097988  T
Q  166 cttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttga 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1097989 cttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaattgggaaatcactacatgaatcttggaactccattaatgcatttgcatataactgttga 1098088  T
Q  266 ttgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1098089 gtgggcgattcaaccatagttttccatgccctcattatcttct 1098131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 437362 - 437068
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |  ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  437362 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaaacatgagaagattcaaccatgttggtggtcctgcaa 437263  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  437262 ccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactac 437163  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcattt--------gcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  437162 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcattattgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 437068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 3797817 - 3797984
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3797817 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgactctgtttgtggtcctgcaa 3797916  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcat 189  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3797917 cctagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcat 3797984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 17996206 - 17996477
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||    
T  17996206 atgtattttctcccaaaaagtacccaaatcacccacattattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctacccggttggtcgttctgcaa 17996305  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||    
T  17996306 tcaagatgcaacacatggtctgtccatg---------------ccttcacttcatccaaggtggtcatggcataggttaggaaaattgggaaatcactac 17996390  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |   ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | || |||||||||    
T  17996391 aaacatcttggaactccaataatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaacaatagttttccatgtgctcgttatcttct 17996477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 185 - 308
Target Start/End: Original strand, 3801745 - 3801868
Alignment:
Q  185 gtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatag 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  3801745 gtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatag 3801844  T
Q  285 ttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
     ||||||||| |||||||||||||    
T  3801845 atttccatgccttcattatcttct 3801868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Original strand, 25618105 - 25618251
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| |||| |  |||| ||| || ||||| || ||||| |||||  ||||     
T  25618105 atgtattttctcccaacaagtacccagatcacccacactattactcaaatatatctttactaaagtatgagctgattcaactctgttggtggttatgcag 25618204  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  25618205 ccaagatgcaacacatggtctttccatgccctcactattttatcctt 25618251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 28422550 - 28422617
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcac 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28422550 ctgtttgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtctatccatgccctcactattttgtccttcac 28422617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24684115 - 24683970
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||   | |||| |||  ||| ||  |||||||||| ||||||    
T  24684115 atgtattttatcctaacaa-tacttaaatcatccacactattgctcaaatatttcttcaatttaccatgagccccttcaactttgtttgtggttctgcaa 24684017  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    | ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24684016 ctaagatgcaagacacggtgtgtccatgccctcactattttttcctt 24683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3991654 - 3991364
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991654 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 3991555  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991554 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 3991455  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3991454 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 3991364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 38774126 - 38774416
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774126 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 38774225  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774226 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 38774325  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38774326 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 38774416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44467631 - 44467341
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467631 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 44467532  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467531 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 44467432  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44467431 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 44467341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20351505 - 20351215
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351505 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 20351406  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351405 gcaaccaagatgcaatacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 20351306  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20351305 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatattct 20351215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 3946473 - 3946763
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946473 tgtgatgtattttctctcaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 3946572  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3946573 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtctatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgagaaatca 3946672  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3946673 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 3946763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 29354704 - 29354990
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354704 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 29354803  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354804 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 29354903  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29354904 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 29354990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13631461 - 13631175
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13631461 atgtattttctcccagcaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctgcaa 13631362  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13631361 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 13631262  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13631261 atgaatctttgaactccactaatgcatttgaatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 13631175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5079980 - 5079694
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5079980 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaattatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaa 5079881  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079880 cctagatgcaacacatggtctgtccatgccttcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 5079781  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5079780 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 5079694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 12648595 - 12648881
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12648595 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 12648694  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12648695 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcataattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 12648794  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  12648795 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 12648881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 50115782 - 50116068
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  50115782 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaaaaaagcatgagacaaatcgaccctgttagtggtcctgcaa 50115881  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||     
T  50115882 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatataaaaaaattgggaaatcactaa 50115981  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  50115982 atgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 50116068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37016950 - 37016670
Alignment:
Q  28 tttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaaga 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37016950 tttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaaga 37016851  T
Q  128 tgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||||||| |||| ||| |||||||    
T  37016850 tgcaacacatggtctgtccatgccctaacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaattggaaaattactgcatgaat 37016751  T
Q  228 ctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  37016750 cttggaactccactaatgcatttgcatataactgctgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 37016670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51664297 - 51664014
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51664297 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttatccaataaagcatgagccgattcgaccctgttagtggtcctgcaacca 51664198  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||    
T  51664197 agatgcaacatatggtttgtccatgccttcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactacatg 51664098  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  51664097 aatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccatcattatcttct 51664014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13175823 - 13175537
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||  ||||| |||||    
T  13175823 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacaccattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagctagttcgaccctgttgatggtcttgcaa 13175724  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  13175723 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcattgcataattttggaaaagtgggaaatcactac 13175624  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13175623 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagttttccatgccctcattatcttct 13175537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 38690958 - 38691244
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | | |||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  38690958 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaaatatttcttccatagaacatgagcctattctactctgttggtggtcctgcaa 38691057  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||||     
T  38691058 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttttccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactaa 38691157  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  38691158 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcaaataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 38691244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Original strand, 36074820 - 36075104
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcga-ccctgtttgtggtcctgcaacc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||     
T  36074820 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattttatccctgttggtggtcctgcaaca 36074919  T
Q  124 aagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacat 223  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||| || ||||    
T  36074920 tagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgggaaattaccacat 36075019  T
Q  224 gaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  36075020 gaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcaattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 36075104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 19497483 - 19497769
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||| |    
T  19497483 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaaaatttctttactaaagcatgagcctattctaccctgttggtggttctgcca 19497582  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  19497583 ccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttctttcaaggtggtcatggcataatttaggaaaagtgggaaatcactac 19497682  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || | ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||    
T  19497683 atgcatctaggaactccactaatgcatttccatataactcttgagtgtgcgattcaaccataacttttcatgccctcattatcttct 19497769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 116 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 46975112 - 46974920
Alignment:
Q  116 ctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||    
T  46975112 ctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcactattttcttcttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaat 46975013  T
Q  216 cactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | ||||||||||  |||||||||  || |||||||||    
T  46975012 cactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcaaataactcttgagtgggcgtttcaaccataactttccatgccctcgttatcttct 46974920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 46976851 - 46976765
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  46976851 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattctaccttgtt 46976765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41455681 - 41455596
Alignment:
Q  223 tgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41455681 tgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 41455596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Original strand, 32105687 - 32105833
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||| |  | |||||| |||  ||| || ||||| ||||| ||| |     
T  32105687 atgtattttctctcagcaagtacccaaatcacccacattattgctcgaatatttctttattatagcatgagccccttcaactctgttggtggttctgtat 32105786  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32105787 ccaagatgcaagacatgatatgtccatgccctcactatttcgtcctt 32105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27284024 - 27283960
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  27284024 ctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactaatttgtcctt 27283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 279
Target Start/End: Original strand, 32105897 - 32105947
Alignment:
Q  229 tttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaac 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  32105897 tttgaactccactaatgcaattgcatataattcttgtgtgggtgattcaac 32105947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 168
Target Start/End: Original strand, 36359603 - 36359661
Alignment:
Q  110 gtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  36359603 gtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 36359661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25232273 - 25232218
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttca 80  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  25232273 atgtattttctcccaa---gtacccaaatcatccacactattgctcaaatatttcttca 25232218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 1610763 - 1611053
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1610763 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 1610862  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1610863 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 1610962  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1610963 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 1611053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28358363 - 28358077
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358363 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagtcgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 28358264  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358263 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 28358164  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28358163 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtggacgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 28358077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31148364 - 31148078
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  31148364 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaatcgtgagctgattcgaccctcttggtggtcctgcaa 31148265  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |   |||||||| ||||||||||    
T  31148264 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacatattttttgaaaattggaaaatcactac 31148165  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  31148164 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgtcgagtgggcgattcaactatagctttccatgccctcaatatcttct 31148078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18608031 - 18607752
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18608031 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgacccagttggtggtcctgcaa 18607932  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  18607931 ccaagatgcaacacatggtctgttcatgccctcac-------tccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 18607839  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  18607838 atgaatcttctaactccactaatgcatttccatataactcttgattgggtgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 18607752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 21357369 - 21357655
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  21357369 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacattattgtccaaatatttctttcctaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcag 21357468  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  21357469 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctctttcacttctttcaaggtggtcatggcataatttaggaaaagtgggaaatcactac 21357568  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  21357569 atgcatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgtgcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 21357655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 23961351 - 23961637
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  23961351 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacattattgtccaaatatttctttcctaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcag 23961450  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  23961451 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctctttcacttctttcaaggtggtcatggcataatttaggaaaagtgggaaatcactac 23961550  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  23961551 atgcatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgtgcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 23961637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 254427 - 254713
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || |  | |||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||     
T  254427 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgctcaaatatttatttactatagcatgagccaattctaccttgttggtggttctgcat 254526  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||| ||   || |||  |||| ||||||  ||    
T  254527 ccaagatgcaacacatagtctgtccatgctctcattattttctccttaacaacatccaaggtggccatggcctaggttataaactttggaaaatcatgac 254626  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |   || || |||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||| |||||||| |||  || ||||||  ||||||||||||    
T  254627 aaacattttggaactccactaatgcactttcatttaatttttgaatgggtgattcaacaataacttcccatgctctcattatcttct 254713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Original strand, 26684103 - 26684167
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26684103 ctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccatgccctcattattttgtcctt 26684167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 81
Target Start/End: Original strand, 34110720 - 34110779
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  34110720 atgtattttctcccaacaagtatccaaatcatccacactattgctcaaatatttcttcaa 34110779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3950792 - 3950502
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3950792 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcct 3950693  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950692 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 3950593  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3950592 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 3950502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 30945654 - 30945944
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945654 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 30945753  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945754 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 30945853  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30945854 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 30945944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 8158999 - 8159285
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8158999 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 8159098  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8159099 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgagaaatcactac 8159198  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8159199 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttct 8159285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6742936 - 6742646
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742936 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 6742837  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742836 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaagatggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 6742737  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6742736 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattattgattaggagattcaaccataattttccatgcgttcattatcttct 6742646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 13745737 - 13746023
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745737 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 13745836  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745837 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 13745936  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13745937 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 13746023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 36815532 - 36815818
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815532 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 36815631  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815632 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 36815731  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36815732 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 36815818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16446665 - 16446379
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16446665 atgtattttctcccagcaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctgcaa 16446566  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446565 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 16446466  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16446465 atgaatctttgaactccactaatgcatttgaatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 16446379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14400602 - 14400316
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14400602 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 14400503  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14400502 ccaagatgcaacacatggtctttctatgccctcataattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 14400403  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14400402 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggtgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 14400316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 48248885 - 48249171
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48248885 atgtattttctcccaacaagtatccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccttgttcgtggtcctgcaa 48248984  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  48248985 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaattgggaaatcactac 48249084  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  48249085 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggtgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 48249171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 46991264 - 46991551
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46991264 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 46991363  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataa-tctacaaaaattgggaaatcacta 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||    
T  46991364 ccaagatgcaacacatggcctgtccatgccctcacaattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttttaaaattgggaaatcacta 46991463  T
Q  221 catgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  46991464 catgaatcttggaactccattaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 46991551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 21954258 - 21954544
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21954258 atgtattttctcccaacaagtacccaaattactcacattattgtccaattatttcttcaataaagcatgtgccgattcgactctgtttgtggtccttcaa 21954357  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||    
T  21954358 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggtataatttttgaaaattgggaaatcactac 21954457  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  21954458 atgaatcttggaactccactaatgcaattgcatataaatgttgagtgggcgattcaacaatagctttccatgctctcattatgttct 21954544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29950026 - 29949742
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  29950026 atgtattttctcccaacaagtgcccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtggccctacaa 29949927  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  29949926 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 29949827  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatctt 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  29949826 atgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagatttccatgccctcattatctt 29949742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29999180 - 29998896
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  29999180 atgtattttctcccaacaagtgcccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtggccctacaa 29999081  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  29999080 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 29998981  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatctt 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  29998980 atgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagatttccatgccctcattatctt 29998896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 6503974 - 6504244
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||||  |||||||||||    
T  6503974 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccactctattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccaatttgaacctgttgttggtcctgcaa 6504073  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||    
T  6504074 ccaagatgcaacacatggtatgtctatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttttaaaattaggaaatcactac 6504173  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccat 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  6504174 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagatttccat 6504244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 77039 - 77325
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  77039 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccgcactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaa 77138  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||  ||||||||||||||    
T  77139 ccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtgggaaatcactac 77238  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||    
T  77239 aagcatcttggaactccactaatgcatttacatataactcttgagtgggagattcaaccatagctttccatgccctcatgatcttct 77325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7839456 - 7839353
Alignment:
Q  203 aaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcatta 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  7839456 aaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcataaaactcttgactgggcgattcaaccatagctttccatgccctcatta 7839357  T
Q  303 tctt 306  Q
    ||||    
T  7839356 tctt 7839353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4511106 - 4511042
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcac 171  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4511106 tttgtggtcctgcacccaagatgtaacagaaagtctgtccatgctctcactattttgtccttcac 4511042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 168
Target Start/End: Original strand, 40467293 - 40467349
Alignment:
Q  112 ggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    |||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40467293 ggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactattttgtcctt 40467349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8118572 - 8118509
Alignment:
Q  105 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  8118572 tgttggtggtcctgcatccaagatgcaatacaaggtatgcccatgccctcactattttttcctt 8118509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24148335 - 24148288
Alignment:
Q  123 caagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 170  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24148335 caagatgcatcacatggtatgtccatgctctcacaattttttccttca 24148288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 2284136 - 2284197
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  2284136 tttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 2284197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 308
Target Start/End: Original strand, 28884458 - 28884740
Alignment:
Q  26 attttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884458 attttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaa 28884557  T
Q  126 gatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28884558 gatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcaatacatga 28884657  T
Q  226 atctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28884658 atctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgagtgggcgattcaaccatagttttccatgccttcattatcttct 28884740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Original strand, 37818889 - 37819177
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37818889 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattttccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcct 37818988  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37818989 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgttcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 37819088  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  37819089 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgtcttcattatctt 37819177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 27865861 - 27866147
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27865861 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgatttgaccctgtttgtggtcctgcaa 27865960  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27865961 ctaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 27866060  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27866061 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 27866147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 38858206 - 38858492
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  38858206 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctacaa 38858305  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858306 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 38858405  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  38858406 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagcttttcatgccttcattatcttct 38858492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 11031468 - 11031754
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  11031468 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgatttgactctgtttgtggtcctacaa 11031567  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031568 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttttccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 11031667  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  11031668 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgtcttcattatcttct 11031754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 307
Target Start/End: Original strand, 13566126 - 13566408
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566126 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 13566225  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13566226 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaaatgggaaatcactacatg 13566325  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13566326 aatctttgaactccactaatgcattttcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttc 13566408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 7019982 - 7020268
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7019982 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataatgcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 7020081  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7020082 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctaccgaaattgggaaatcactac 7020181  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7020182 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataaccgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 7020268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 25895113 - 25895399
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25895113 atgtattttctcccaacaactacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttcgtggtcctgcaa 25895212  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25895213 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtagtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 25895312  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25895313 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataaatgttgagtggccgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 25895399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1037404 - 1037110
Alignment:
Q  14 aacctgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtgg 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1037404 aacctgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattatccaagtatgtcttcaataaagtatgagccgattcgaccctgttcgtgg 1037305  T
Q  114 tcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  1037304 tcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaattgggaa 1037205  T
Q  214 atcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  1037204 atcactacaggaatctttgaactccactaatgcatttgcatataacttttgagtgggtgattcaaccatagcttttcatgcctacattatcttct 1037110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 7799034 - 7799306
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7799034 atgtattttctcccaacaagtacccaaattacccacaatattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 7799133  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   |||| || |||||||||||    
T  7799134 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcattgcataatttttgaaaagtgagaaatcactac 7799233  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgc 294  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7799234 ttgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 7799306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Original strand, 4198922 - 4199204
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4198922 atgtattttctctcaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 4199021  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| || |||||||||||    
T  4199022 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttttaaaagtgagaaatcactac 4199121  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||   |||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  4199122 atgaatcttggaactccactaatgtatttgcatataactcttgaatggacaattcaaccatagctttccatgctctcattatc 4199204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 98 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34079749 - 34079539
Alignment:
Q  98 tcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34079749 tcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat 34079650  T
Q  198 ctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgtt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  34079649 ctacaaaaattggaaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgcctt 34079550  T
Q  298 cattatcttct 308  Q
    |||||||||||    
T  34079549 cattatcttct 34079539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 308
Target Start/End: Original strand, 18536395 - 18536641
Alignment:
Q  61 attgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatt 160  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  18536395 attgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgtttctacctcgtt-gtggtcctgcaaccaagatgcaacatatggtctgttcatgccctcactatt 18536493  T
Q  161 ttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataatt 260  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  18536494 ttctccttcacttcattcaatgtggtcatggcataatttttggaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatacatttgcaaataact 18536593  T
Q  261 gttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
     |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  18536594 cttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttct 18536641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20288311 - 20288065
Alignment:
Q  24 gtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattg-tccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  20288311 gtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgctccaa-tatttatttactaaatcatgagccgattctaccctattggtggttctgcaac 20288213  T
Q  123 caagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactaca 222  Q
    ||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||||   ||  |||||||| |||||| ||||    
T  20288212 caagatataacacatggtttatccatgccctcactattttctccttaacaacatccaaggtagacatggcataggttaggaaaattggaaaatcattaca 20288113  T
Q  223 tgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattggg 270  Q
       || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20288112 aacatttttgaactccactaatgcatttgaatataattcttgagtggg 20288065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25054257 - 25054192
Alignment:
Q  106 gtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcac 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25054257 gtttgtggtcctgcacccaagatgtaacacaagctctgtccatgctctcactattttgtcattcac 25054192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 27012749 - 27012810
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27012749 tttgtggtcctacacccaagatgtaacactaggtccgtccatgccctcactattttgtcctt 27012810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11820197 - 11820136
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  11820197 tttgtggtactacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 11820136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 15373 - 15659
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 15472  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15473 cctagatgcaacacatggtctgtccattccctcacaattttgtctttcacttcattcaaggtggtcatggcacaatctacaaaaattgggaaatcactac 15572  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttct 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15573 atgaatctttgaactccagtaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttct 15659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 170
Target Start/End: Original strand, 2101 - 2166
Alignment:
Q  105 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 170  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2101 tgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccataccctcactattttgtccttca 2166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 162
Target Start/End: Original strand, 1168 - 1226
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatttt 162  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1168 ctgttggtggttcggcagccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcactatttt 1226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University