View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1692-Insertion-5 (Length: 659)

Name: NF1692-Insertion-5
Description: NF1692
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1692-Insertion-5
NF1692-Insertion-5
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (8-659)||(27717649-27718299)
chr6 (8-659)||(27610270-27610922)
chr6 (8-520)||(28786758-28787270)
chr6 (8-520)||(28792879-28793391)
chr6 (9-520)||(27603855-27604366)
chr6 (8-520)||(28781621-28782133)
chr6 (8-520)||(27592171-27592683)
chr6 (38-520)||(27676800-27677282)
chr6 (3-520)||(27426757-27427276)
chr6 (8-520)||(27679470-27679982)
chr6 (8-520)||(26802963-26803478)
chr6 (11-520)||(27705557-27706066)
chr6 (38-493)||(27530481-27530936)
chr6 (8-491)||(31285108-31285591)
chr6 (8-520)||(27697736-27698248)
chr6 (8-476)||(26623835-26624303)
chr6 (8-476)||(26729812-26730280)
chr6 (8-489)||(26884621-26885102)
chr6 (43-492)||(26647027-26647476)
chr6 (43-492)||(26752995-26753444)
chr6 (8-492)||(26656514-26656997)
chr6 (8-492)||(26762485-26762968)
chr6 (40-492)||(27337277-27337728)
chr6 (40-492)||(27398017-27398468)
chr6 (8-490)||(25483609-25484091)
chr6 (8-490)||(26143418-26143900)
chr6 (8-490)||(25539093-25539575)
chr6 (8-490)||(25580272-25580754)
chr6 (38-481)||(26862142-26862582)
chr6 (8-490)||(26056472-26056954)
chr6 (8-490)||(26076442-26076924)
chr6 (8-489)||(26824370-26824851)
chr6 (8-491)||(27215001-27215484)
chr6 (39-399)||(25492500-25492860)
chr6 (8-281)||(25511651-25511924)
chr6 (578-659)||(27677453-27677534)
chr6 (578-659)||(27698333-27698414)
chr6 (578-659)||(27706241-27706322)
chr6 (578-659)||(27592859-27592940)
chr6 (578-659)||(27679213-27679294)
chr6 (587-659)||(26802709-26802781)
chr6 (587-655)||(27604553-27604621)
chr6 (338-490)||(25511488-25511640)
chr6 (211-420)||(26937649-26937858)
chr6 (187-280)||(28140295-28140388)
chr6 (211-338)||(29843340-29843467)
chr6 (588-659)||(26861880-26861951)
chr6 (594-659)||(27427461-27427526)
chr6 (189-272)||(26950511-26950594)
chr6 (597-659)||(26884432-26884494)
chr6 (374-488)||(28297256-28297370)
chr6 (374-488)||(28514703-28514817)
chr6 (188-272)||(28097773-28097857)
chr6 (428-488)||(28098013-28098073)
chr6 (588-659)||(28781406-28781477)
chr6 (588-659)||(28786545-28786616)
chr6 (588-659)||(28792666-28792737)
chr6 (588-633)||(26646772-26646817)
chr6 (588-633)||(26752740-26752785)
chr6 (226-291)||(26849461-26849526)
chr6 (607-656)||(27531065-27531114)
chr6 (8-93)||(28326425-28326510)
chr6 (8-93)||(28504061-28504146)
chr6 (248-325)||(29845854-29845931)
chr6 (38-86)||(27576145-27576193)
chr6 (41-93)||(28140482-28140534)
chr6 (374-462)||(28227530-28227618)
chr6 (38-74)||(29843162-29843198)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (8-659)||(2689-3340)
scaffold0349 (467-659)||(14082-14276)
[»] scaffold0419 (2 HSPs)
scaffold0419 (8-520)||(8007-8519)
scaffold0419 (597-633)||(7818-7854)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (8-520)||(12825-13337)
scaffold0277 (9-520)||(3863-4374)
scaffold0277 (597-659)||(4529-4591)
scaffold0277 (597-633)||(13490-13526)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (8-520)||(18678706-18679218)
chr4 (8-520)||(18698546-18699058)
chr4 (8-520)||(18730650-18731162)
chr4 (8-518)||(18723231-18723741)
chr4 (8-518)||(18654623-18655133)
chr4 (3-520)||(18074279-18074798)
chr4 (9-297)||(5090101-5090392)
chr4 (594-659)||(18074029-18074094)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (3-520)||(60087-60606)
scaffold0003 (594-659)||(59837-59902)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (8-492)||(29272988-29273472)
chr8 (350-399)||(16440694-16440743)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (8-480)||(267490-267962)
chr1 (8-491)||(28126825-28127308)
chr1 (8-399)||(28163526-28163916)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (188-289)||(3280410-3280511)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (41-289)||(16691618-16691866)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (248-325)||(2059-2136)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (8-93)||(57444-57529)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (374-462)||(28028-28116)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 659
Target Start/End: Original strand, 27717649 - 27718299
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717649 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 27717748  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27717749 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctccttctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacatt 27717848  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717849 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 27717948  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717949 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 27718048  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718049 gactggtcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccagtaagataagttagtatgtgacaacatcaca 27718148  T
Q  508 atcacatccatgttattctttaagatgagattattgtgaaatttaaattaaagagagaaaatataaaaaaggtacccgagaggactatcatggtagccgg 607  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27718149 atcacat-catgttattctttaagatgagattattgtgaaatttaaattaaagagagaaaatataaaaaaggtacccaggaggactatcatggtagccgg 27718247  T
Q  608 acaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27718248 acaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccat 27718299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 659
Target Start/End: Original strand, 27610270 - 27610922
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610270 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 27610369  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27610370 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacatt 27610469  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610470 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 27610569  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610570 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttcttgtacttgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 27610669  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610670 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccagtaaactcgtattcatatctattcatgcccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 27610769  T
Q  508 atcacatccatgttattctttaagatgagattattgtgaaatttaaattaaagagagaaaatat-aaaaaaggtacccgagaggactatcatggtagccg 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27610770 atcacatccatgttattctttaagatgagattattgtgaaatttaaattaaagagagaaaatataaaaaaaggtacccaggaggactatcatggtagccg 27610869  T
Q  607 gacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27610870 gaaaagtttgcagcctggctcagagccactttccatccctgcaacctctccat 27610922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28787270 - 28786758
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28787270 cctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccct 28787171  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28787170 cactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 28787071  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28787070 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctacc 28786971  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28786970 atgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgac 28786871  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28786870 gactgatcttgttggagatgtatttgactatatctccaataaacttgtattcatatctattcatgtcatataagataagttagtatgtaacaacatcaca 28786771  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
    |||||||||||||    
T  28786770 atcacatccatgt 28786758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28793391 - 28792879
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28793391 cctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccct 28793292  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28793291 cactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatctatttgaagctgaactctctctcacatt 28793192  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28793191 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctacc 28793092  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28793091 atgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgac 28792992  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28792991 gactgatcttgttggagatgtatttgactatatctccaataaacttgtattcatatctattaatgtccgataagataagttagtatgtaacaacatcaca 28792892  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
    |||||||||||||    
T  28792891 atcacatccatgt 28792879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 520
Target Start/End: Original strand, 27603855 - 27604366
Alignment:
Q  9 ctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctc 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  27603855 ctcctgccaaagcctgtagttgccccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctc 27603954  T
Q  109 actaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603955 actaacacctcctaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattt 27604054  T
Q  209 tcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacca 308  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604055 tcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacca 27604154  T
Q  309 tgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27604155 tgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagagatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaataggataattggcaacatgtaagggctgacg 27604254  T
Q  409 actgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcacaa 508  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27604255 actgatcttgttggagatttctttcactatctttccaataagctcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtaacaacatcataa 27604354  T
Q  509 tcacatccatgt 520  Q
    ||||||||||||    
T  27604355 tcacatccatgt 27604366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28782133 - 28781621
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28782133 cctcctgccaaagcatgtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccct 28782034  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28782033 cactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtgcttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 28781934  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28781933 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaattaagttataaactgcttttacaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctacc 28781834  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||   |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28781833 atcctgactccattatcatatccttcaccaagaagcgatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagtgctgac 28781734  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28781733 gactgatcttgttggagatgtatttgactatatcgccaataaacttgtattcatatctattcatgtcatataagataagttagtatgtaacaacatcaca 28781634  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
    |||||||||||||    
T  28781633 atcacatccatgt 28781621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Original strand, 27592171 - 27592683
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||||| ||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  27592171 cctccagccaaagcatctagctgatccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattcctt 27592270  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27592271 cgctaacacttcctaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacatt 27592370  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| |||    
T  27592371 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaagttataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaacc 27592470  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  27592471 atatggaccccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatttaagggctgtc 27592570  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  27592571 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaataagataagttagtgtctaacaacatcaca 27592670  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
    |||||||||||||    
T  27592671 atcacatccatgt 27592683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 520
Target Start/End: Original strand, 27676800 - 27677282
Alignment:
Q  38 ttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagtt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27676800 ttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaacttaatttcaagtt 27676899  T
Q  138 gaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatc 237  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27676900 gaagtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatc 27676999  T
Q  238 agcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatca 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||    
T  27677000 agcaataaaattataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatca 27677099  T
Q  338 agaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgacta 437  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677100 agaagcgatttcatttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggttgttgactgatcttgttggagatgtatttgacta 27677199  T
Q  438 tctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcacaatcacatccatgt 520  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  27677200 tctttccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaataagataagttagtgtctaacaacatcacaatcacatccatgt 27677282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 520
Target Start/End: Original strand, 27426757 - 27427276
Alignment:
Q  3 caacacctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaat 102  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||    |  ||    
T  27426757 caactcctccagccaaagcattcagttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagat 27426856  T
Q  103 tccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctc 202  Q
    ||||||||| ||| || | ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  27426857 tccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctg 27426956  T
Q  203 acattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtc 302  Q
    || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||| ||    
T  27426957 acttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattc 27427056  T
Q  303 ctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 402  Q
    | ||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27427057 caaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagga 27427156  T
Q  403 ttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaaca 502  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27427157 ctgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagctcgtattcatatctattcatgtccaataatataagttagtatgtaacaaca 27427256  T
Q  503 t--cacaatcacatccatgt 520  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  27427257 tcacacaatcacatccatgt 27427276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27679982 - 27679470
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||    ||||||||||    
T  27679982 cctccagccaaagcatgcagttgcttcaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacataatctttcctttatgactggaattccct 27679883  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||    | ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||     
T  27679882 cactaacatggtctaacttaatttccaaacctgttgtttttaaaaggagcttctcttggagatatttcaagttattttgagctgaattctctctcacatc 27679783  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| |||  | |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| |||    
T  27679782 atgaagaaaacatgaaccttcgaattgatctgcaacaaaattatagatttgtcttgcaagtgttgatttccccaaacctccaatgccataaattccaacc 27679683  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  27679682 atatggaccccatcatcggatccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggctgtc 27679583  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  27679582 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaataagataagttagtgtctaacaacatcaca 27679483  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
    |||||||||||||    
T  27679482 atcacatccatgt 27679470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26803478 - 26802963
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||   || ||||||||||||   ||||| ||||    
T  26803478 cctccagccaaagcatgtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttatttctacacagtctttcctttataattggaatcccct 26803379  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||| ||||    | ||||| ||||  | |  |  |||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||     
T  26803378 cacaaacatgatctaacttgattttcaatccagttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatc 26803279  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||    
T  26803278 atgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgctgatttacccaagcctccaatcccataaattccaacc 26803179  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    || ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26803178 atatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttcttgtactcgagagtgcaatccaacagggtaattagcaacatgtaagggctgac 26803079  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatg---tgacaacatc 504  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||    
T  26803078 gattgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaatcaacttgtattcatatctattcatgtccaacaagataagttagtatgtactaacaacatc 26802979  T
Q  505 acaatcacatccatgt 520  Q
    ||||||||||||||||    
T  26802978 acaatcacatccatgt 26802963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Original strand, 27705557 - 27706066
Alignment:
Q  11 ccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  27705557 ccagccaaagcatgcagttgcttcctatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacagcctttcctttatgaatggaatcccctcac 27705656  T
Q  111 taacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttc 210  Q
     ||||    | ||||| ||||    |  |  |||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||  |     
T  27705657 aaacatgatctaactttattttcgatccagttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagtcattttgagctgaattctctctcacatcatg 27705756  T
Q  211 aagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatg 310  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||| |||||     
T  27705757 aagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctccaatgccaaaaattccaaccata 27705856  T
Q  311 tggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgac 410  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  27705857 tggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagtgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggatgtcgac 27705956  T
Q  411 tgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcacaatc 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  27705957 tgatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaataagataagttagtgtctaacaacatcccaatc 27706056  T
Q  511 acatccatgt 520  Q
    ||||||||||    
T  27706057 acatccatgt 27706066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 38 - 493
Target Start/End: Original strand, 27530481 - 27530936
Alignment:
Q  38 ttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagtt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||    |||||||||| |||||||||||| |||||||| || | |     
T  27530481 ttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttgcttaatgattggaattccctgactaacacctcctaacttaatgtccaatc 27530580  T
Q  138 gaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatc 237  Q
     || ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  27530581 taactgtttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatctgaagtcgaattcactctcacattttctagaaaacataaaacttcaaattgatc 27530680  T
Q  238 agcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatca 337  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  27530681 agcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacctatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcagatttttcatca 27530780  T
Q  338 agaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgacta 437  Q
    ||| ||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||| ||| ||||||| |||| || |||||    
T  27530781 agatgccctttcacatgttgtactcgggactgtaatccaacaggatatttggcaacatctaagggctcacgactaatcctgttggaaatgtcttcgacta 27530880  T
Q  438 tctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtat 493  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530881 tctttccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtat 27530936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 31285591 - 31285108
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||    ||||||||||    
T  31285591 cctccagccaaagcatgcagttgattcatattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccct 31285492  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||    | ||||||||||| | |  || |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||     
T  31285491 cactaacatggtctaacttaatttccaatccaattgttttcaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatc 31285392  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | |||||||||| | |  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  31285391 atgaagaaaacataatccgtcaaattgatcaccaataaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctcctatcccataaagtcctacc 31285292  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||||| || || | || || |   | |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  31285291 atgtgtacccctttattagtttccttatcaagaagcaatttcacttgttgtattcgaaacttaaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggcacac 31285192  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagt 491  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||    
T  31285191 gattgatcttgttggagatgtatttgactatgtctccaataaaatcatattcatatctgttcatgttcaactagatatgttagt 31285108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Original strand, 27697736 - 27698248
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| ||||| || | ||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||    |||||||| |    
T  27697736 cctccagccaaagcctgtagctgatccagtttgtcaacatcgtcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccgt 27697835  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||    | || ||||||||   |  |  |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  27697836 cactaacatggtctaaattaatttccgatccagttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgttccaagttatttttagctgaattcattctcacatt 27697935  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | |||||||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| ||| ||| |||    
T  27697936 atgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaaccaaattatagattgctcttgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccaaaaattccaacc 27698035  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    || ||||| |||||||||||||  | ||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27698036 atatggaccccatcatcagatccattatcaagaattgatttcactctttgtacttgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgac 27698135  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  27698136 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctcttcaataaacttgtattcatatctactcgtgtcgagtaagaaaagttagtatgaaacaacatcaca 27698235  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
    |||||||| ||||    
T  27698236 atcacatctatgt 27698248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26624303 - 26623835
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||    | ||||||||    
T  26624303 cctccagccaaagcatccagttgccttatactgtctacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccct 26624204  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||    | ||||||||||| | |  |  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||     
T  26624203 cactaacatggtccaacttaatttccaatccagttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatc 26624104  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||| |||    
T  26624103 atgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaacc 26624004  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||   ||    
T  26624003 atatggaccccatcatcagatccattatcaagaagtgatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacac 26623904  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtcca 476  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26623903 gattgatcttgttggagatgtatttgactatcttttcaataaaatcatattcatatctgttcatgtcca 26623835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26730280 - 26729812
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||    | ||||||||    
T  26730280 cctccagccaaagcatccagttgccttatactgtctacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccct 26730181  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||    | ||||||||||| | |  |  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||     
T  26730180 cactaacatggtccaacttaatttccaatccagttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatc 26730081  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||| |||    
T  26730080 atgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaacc 26729981  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||   ||    
T  26729980 atatggaccccatcatcagatccattatcaagaagtgatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacac 26729881  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtcca 476  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26729880 gattgatcttgttggagatgtatttgactatcttttcaataaaatcatattcatatctgttcatgtcca 26729812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 26885102 - 26884621
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||    
T  26885102 cctccagccaaagcctctagctgctccattttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctatgtagtctttcctttatgagtggaattccct 26885003  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  | || || ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||   || ||||||||| || || ||    
T  26885002 cactaacatctcctaacttaatgtttaatttaattgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaagttattatgagttgaattctccctgacttt 26884903  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     |  |||||||||  || ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26884902 atgcagaaaacatacacattcaaattgatcagcaacataattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaattcctacc 26884803  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||||| || || || | ||||   | |||||||||| |||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||      ||    
T  26884802 atgtgtaccccttcgttagattccttatcaagaagcaattttaattgttgtactcggtactgtaatccaacagggtatttggctacatgtaaaacaacac 26884703  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagtta 489  Q
    || |||| |||| |||||| | || ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884702 gattgattttgtcggagatatcttcgactatcttcccgataaactcgtattcgtatctattcatgtccaataagataagtta 26884621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26647476 - 26647027
Alignment:
Q  43 aacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagt 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||    ||||||||||||| || |  |||||||||||| |  | || || |    
T  26647476 aacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaact 26647377  T
Q  143 gtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaa 242  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  26647376 gtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaa 26647277  T
Q  243 taaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 342  Q
     ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  || |||||||||    
T  26647276 caaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaag 26647177  T
Q  343 cgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctct 442  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||      |||| |||||||||||||||||| || ||||||||      
T  26647176 caatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttc 26647077  T
Q  443 ccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagta 492  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26647076 ccaataaacttgtattcatatctattcatgtcccacaagataagttagta 26647027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26753444 - 26752995
Alignment:
Q  43 aacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagt 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||    ||||||||||||| || |  |||||||||||| |  | || || |    
T  26753444 aacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaact 26753345  T
Q  143 gtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaa 242  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  26753344 gtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaa 26753245  T
Q  243 taaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 342  Q
     ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  || |||||||||    
T  26753244 caaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaag 26753145  T
Q  343 cgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctct 442  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||      |||| |||||||||||||||||| || ||||||||      
T  26753144 caatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttc 26753045  T
Q  443 ccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagta 492  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26753044 ccaataaacttgtattcatatctattcatgtcccacaagataagttagta 26752995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26656997 - 26656514
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    ||||||||||    
T  26656997 cctcctgccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccct 26656898  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  | |  ||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||    
T  26656897 cactaacatctcctaacttaatattcactctaacagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacatt 26656798  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | ||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26656797 gtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgacaaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctacc 26656698  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| | ||  |||| | |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||      ||    
T  26656697 atgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacac 26656598  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagta 492  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  26656597 gattgatcttgtcggagatgtctttgactatattctcaataaacttgtattcatatctattcatgtacaa-gagataagttagta 26656514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26762968 - 26762485
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    ||||||||||    
T  26762968 cctcctgccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccct 26762869  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  | |  ||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||    
T  26762868 cactaacatctcctaacttaatattcactctaacagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacatt 26762769  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | ||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26762768 gtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgacaaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctacc 26762669  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| | ||  |||| | |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||      ||    
T  26762668 atgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacac 26762569  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagta 492  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  26762568 gattgatcttgtcggagatgtctttgactatattctcaataaacttgtattcatatctattcatgtacaa-gagataagttagta 26762485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Original strand, 27337277 - 27337728
Alignment:
Q  40 gtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||    ||||||||||||  |||| |||  |||||||| |  ||||||    
T  27337277 gtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttga 27337376  T
Q  140 agtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcag 239  Q
    | ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||   | ||||||||||||||    
T  27337377 actgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcag 27337476  T
Q  240 caataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaag 339  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||   ||||||||    
T  27337477 caatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaag 27337576  T
Q  340 aagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatc 439  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||       |||| ||||| | | ||| |||| || ||||||     
T  27337577 aagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggcaacgtgtagaaaaacacgattgatcctatcggaaatgtgttcgactata 27337676  T
Q  440 tctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagta 492  Q
    |   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27337677 ttctcaataagctcgtactcatatctattcatgtccaat-agataagttagta 27337728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Original strand, 27398017 - 27398468
Alignment:
Q  40 gtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||    ||||||||||||  |||| |||  |||||||| |  ||||||    
T  27398017 gtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttga 27398116  T
Q  140 agtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcag 239  Q
    | ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||   | ||||||||||||||    
T  27398117 actgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcag 27398216  T
Q  240 caataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaag 339  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||   ||||||||    
T  27398217 caatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaag 27398316  T
Q  340 aagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatc 439  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||       |||| ||||| | | ||| |||| || ||||||     
T  27398317 aagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggcaacgtgtagaaaaacacgattgatcctatcggaaatgtgttcgactata 27398416  T
Q  440 tctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagta 492  Q
    |   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27398417 ttctcaataagctcgtactcatatctattcatgtccaat-agataagttagta 27398468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25484091 - 25483609
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    || |||||||    
T  25484091 cctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaacaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccct 25483992  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    |||||||| || | ||||||   |||| || || | ||||| |||||||| |||  || ||||||||||  |||||   |  |||||||||||| |||||    
T  25483991 cactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcatcttttggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacatt 25483892  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  25483891 atgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaagaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctacc 25483792  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | |||    | |     
T  25483791 atgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaatcat 25483692  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttag 490  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483691 gattgatattgttggagatgtattggactatcttctcaataaacttgtgttcatatctattcatgtccaataagataagttag 25483609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26143900 - 26143418
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    | ||||||||    
T  26143900 cctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccct 26143801  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacat 206  Q
    |||||||| |||| ||||||   ||||| || || |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||  |||||   |  |||||||||||| ||||    
T  26143800 cactaacatctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacat 26143702  T
Q  207 tttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctac 306  Q
    | | ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  26143701 tatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctac 26143602  T
Q  307 catgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttga 406  Q
    |||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||| ||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||      |    
T  26143601 catgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttcttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaaaca 26143502  T
Q  407 cgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttag 490  Q
     || |||| ||||||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26143501 tgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttctcaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataaattag 26143418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25539575 - 25539093
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||    |  |||||||    
T  25539575 cctccagccaaagcctctagctgctctagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttttagatagtctttcctttatgattgttattccct 25539476  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    |||||||| || | ||||||   |||| || || | ||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||    
T  25539475 cactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttttggagatgtttcaagttattatgacttgaattctctctgacatt 25539376  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | ||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25539375 atgaagaaaacatacaacttcaaattgatcagcaacaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctacc 25539276  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||| |||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||      |     
T  25539275 atgcggacctcatcctcagagcccaagtcaagaagcaatttcacttgttctattggggactgtaatccaacagggtatttggccacatataaaaaaacat 25539176  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttag 490  Q
    || |||| ||||||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539175 gattgatattgttggagatgtcttcgactatcttctcaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataagttag 25539093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25580754 - 25580272
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    | ||||||||    
T  25580754 cctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaaaaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccct 25580655  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    |||||||| || | |||||||  | || || || | || |||||||||| |  |  || ||||||||||| |||||   |  |||| ||||||| |||||    
T  25580654 cactaacatctactaacttaaagtaaaatttaactattattaaaaggagataataatggagatgtttcaagttattaagaattgaaatctctctgacatt 25580555  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25580554 atgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctacc 25580455  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||||||||  |||| ||||| |     ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | |||      |     
T  25580454 atgtggaccacatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacat 25580355  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttag 490  Q
    || |||| ||||||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25580354 gattgatattgttggagatgtcttcgactatcttctcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaataagataagttag 25580272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 26862582 - 26862142
Alignment:
Q  38 ttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagt 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| |    
T  26862582 ttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatt 26862483  T
Q  137 tgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgat 236  Q
    | || |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  ||||   || |||||||||||| || || | ||||||||||  || |||||||||||    
T  26862482 t-aactgtttttaaaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgat 26862384  T
Q  237 cagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatc 336  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||     |||    
T  26862383 cggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatc 26862284  T
Q  337 aagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgact 436  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || || ||      |||   | ||||||   |||||| | |||||    
T  26862283 aagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacgtgcaa---aacacgttcggtcttgtccaagatgtctctgact 26862187  T
Q  437 atctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataag 481  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26862186 atcttcccaataaactcatattcatatctattcacgtccaataag 26862142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26056954 - 26056472
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||   || |||||||    
T  26056954 cctccagccaaagcgtctagctgctccagtttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccct 26056855  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    |||||||| || | |||| |   |||| || || | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||   || |||||||||||| |||||    
T  26056854 cactaacatcttctaactgaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacatt 26056755  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | ||||||||||  || ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||    
T  26056754 atgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctacc 26056655  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| ||||  |||  ||||| |     ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||      |     
T  26056654 atgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacat 26056555  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttag 490  Q
    || |||||||||||||||||  || ||||||||   ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26056554 gattgatcttgttggagatgccttcgactatcttctcaataaacttgcattcagatctattcatgtccaataaggtaagttag 26056472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26076924 - 26076442
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||   || |||||||    
T  26076924 cctccagccaaagcgtctagctgctccagtttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccct 26076825  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    |||||||| || | | || |   |||| || || | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||   || |||||||||||| |||||    
T  26076824 cactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacatt 26076725  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | ||||||||||  || ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||    
T  26076724 atgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctacc 26076625  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| ||||  |||  ||||| |     ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||      |     
T  26076624 atgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacat 26076525  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttag 490  Q
    || |||||||||||||||||  || ||||||||   ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26076524 gattgatcttgttggagatgccttcgactatcttctcaataaacttgcattcagatctattcatgtccaataaggtaagttag 26076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 26824851 - 26824370
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||| || || |||||     |||| || |    
T  26824851 cctccagccaaagcatctagttgctccagtttgtcaatgtcatcgagaatcagaagaactttctttctgcgtagtctatcttttatgatttgaatacctt 26824752  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
     |||||||||||| |||||||||||   |  || ||||||||||||||| | ||| || |||| || |||   ||    |||||||||||||||||| ||    
T  26824751 gactaacacctcctaacttaatttcttctccaattgtttttaaaaggagttgctcttggagattttccaagccatgcttagctgaattctctctcacgtt 26824652  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     |||||||||||  ||  |||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  26824651 ctcaagaaaacaaaaaacttcaaatttatcagcaatagaattaaaagttgcttttgcaagtgttgatttacctaaacctccaataccgtaaagtcctacc 26824552  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    || |||||  |||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||      ||    
T  26824551 atatggaccacatcatcagattcgttatcaagaagagatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaaccgggtatttggcaacatgtaaactaacac 26824452  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagtta 489  Q
    || |||||| ||||| || || | ||| |||||| ||||||  || ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  26824451 gattgatctggttggtgacgtttctgattatctcaccaatacgcttgtattcatatccattcctgcccaataagataagtta 26824370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 27215484 - 27215001
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||| |||  ||||| |  | ||| ||||    
T  27215484 cctccagccaaagcctctagctgctctagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttttgacatagcattttttttatctttgtaatcccct 27215385  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||   || | |  ||  ||||| | ||||| ||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||     
T  27215384 cactaacacctcctaacttatcgtctaatctaaccgttttcataaggatcttttcctgcaggtgtttcaagttatttaaagttgaattctctttcacatc 27215285  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||    
T  27215284 ttctagaaaatatgaaccttcaaactgatcagcaatgaaattaaaaattgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagctccatgaagtcctacc 27215185  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||||||||  | || | |||||  |  ||||||||| |||| |||||||||| | | |  || |||||||||||||  ||||||||||||||    | ||    
T  27215184 atgtggacctcttccttagatcccttgtcaagaagcaattttacttgttgtatttgggtatgtaatccaacagggtgtttggcaacatgtaaaaaatcac 27215085  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagt 491  Q
    || |  ||||||| ||||||| ||  |||||||   ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27215084 gattcgtcttgtttgagatgtcttcaactatcttctcaataaacttgtattcatatctgttaatgtccaataagataagttagt 27215001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 399
Target Start/End: Original strand, 25492500 - 25492860
Alignment:
Q  39 tgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttg 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||| | ||  |||||    | ||||||||||||||||| ||  |||||||| || | |      
T  25492500 tgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctctctacatagtccttgttttatgattgcaattccctcactaacacttcttaacttaatgtctaatct 25492599  T
Q  139 aagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatca 238  Q
    ||   ||||  ||||||| || ||||| |||| |||||| ||  ||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25492600 aaccattttcgaaaggagtttttcctggagatctttcaagtttcttggagttgaattctctctcacatctcctagaaaacataaaccttcaaattgatca 25492699  T
Q  239 gcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaa 338  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||   ||||| |    
T  25492700 gcaatgaagttatagattgattttgcaagtgttgatttacctaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaactcatcctcagatacctcatcta 25492799  T
Q  339 gaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaa 399  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25492800 gaagcaatttcacgtgttgtactcgggattgtaatccaacagggtatttggcaacatgtaa 25492860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25511924 - 25511651
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||   || |||||||    
T  25511924 cctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccct 25511825  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    |||||||| || | | || |   |||| || || | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||   || |||||||||||| |||||    
T  25511824 cactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacatt 25511725  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttaccca 281  Q
     | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25511724 atgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttaccca 25511651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 659
Target Start/End: Original strand, 27677453 - 27677534
Alignment:
Q  578 ggtacccgagaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677453 ggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 27677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 659
Target Start/End: Original strand, 27698333 - 27698414
Alignment:
Q  578 ggtacccgagaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698333 ggtacctgggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 27698414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 659
Target Start/End: Original strand, 27706241 - 27706322
Alignment:
Q  578 ggtacccgagaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706241 ggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 27706322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 578 - 659
Target Start/End: Original strand, 27592859 - 27592940
Alignment:
Q  578 ggtacccgagaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27592859 ggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcgtctttccatccctgcaacctctccat 27592940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 578 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 27679294 - 27679213
Alignment:
Q  578 ggtacccgagaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27679294 ggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctttttccatccttgcaacctctccat 27679213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 587 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 26802781 - 26802709
Alignment:
Q  587 gaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  26802781 gaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctccaacctctccat 26802709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 587 - 655
Target Start/End: Original strand, 27604553 - 27604621
Alignment:
Q  587 gaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctct 655  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27604553 gaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctct 27604621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25511640 - 25511488
Alignment:
Q  338 agaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgacta 437  Q
    |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |  ||      | || |||||||||||||||||| || |||||    
T  25511640 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgttcaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgtcttcgacta 25511541  T
Q  438 tctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttag 490  Q
    |||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25511540 tcttctcaataaacttgtattcagatctattcatgtccaataaggtaagttag 25511488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 26937858 - 26937649
Alignment:
Q  211 aagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatg 310  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| |  ||||||||     
T  26937858 aagaaaacacaaactttcaaattgatcaccaatcaaattataaattgctcgtgcaagtgttgatttaccaattccgccaatcccatagatccctaccata 26937759  T
Q  311 tggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgac 410  Q
       |||||||||||| |||    ||  ||||| || || |||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||  |||||     
T  26937758 catactccatcatcatatccaatattcagaagagaatttacttgtagcaatcgagactgcagtccaacggggtaatccgcaacatgtaaaggaggacgat 26937659  T
Q  411 tgatcttgtt 420  Q
    ||||||||||    
T  26937658 tgatcttgtt 26937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28140388 - 28140295
Alignment:
Q  187 agctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttaccc 280  Q
    ||||||| | ||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28140388 agctgaaatttctctcacattatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcggcaataaaattataaattgcttgtgcaagtgttgttttaccc 28140295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 338
Target Start/End: Original strand, 29843340 - 29843467
Alignment:
Q  211 aagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatg 310  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||  || |||||     
T  29843340 aagaaaacacaaacattcaaatttatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttacccaatccaccaattccataaatccccaccatc 29843439  T
Q  311 tggactccatcatcagatctttcatcaa 338  Q
    ||||||| ||||||| || || ||||||    
T  29843440 tggactcgatcatcaaattttgcatcaa 29843467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 26861951 - 26861880
Alignment:
Q  588 aggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  26861951 aggactaaaatggtagcctgacaagttagcagcttggttcagagcaactttccatctctgcaacctctccat 26861880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 594 - 659
Target Start/End: Original strand, 27427461 - 27427526
Alignment:
Q  594 atcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  27427461 atcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccat 27427526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26950594 - 26950511
Alignment:
Q  189 ctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttg 272  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||   | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  26950594 ctgaattttctctcacattgtgaagaaaacatttgcattcaaattgattagcaatcaagttataaactgcttgagcaagtgttg 26950511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 597 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 26884494 - 26884432
Alignment:
Q  597 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  26884494 atggtagccggacaagttagcaacttgcctcatagccattttccatcgctgcaacctctccat 26884432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 488
Target Start/End: Original strand, 28297256 - 28297370
Alignment:
Q  374 ccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgt 473  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| ||   |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||| | |    
T  28297256 ccaacggggtaatcggcaacatataaaggaacacgattgatcttgctggatacgtatttgactatcttctcaataaactcatattcatatccattcctat 28297355  T
Q  474 ccaataagataagtt 488  Q
    ||||| | |||||||    
T  28297356 ccaatcaaataagtt 28297370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28514817 - 28514703
Alignment:
Q  374 ccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgt 473  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| ||   |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||| | |    
T  28514817 ccaacggggtaatcggcaacatataaaggaacacgattgatcttgctggatacgtatttgactatcttctcaataaactcatattcatatccattcctat 28514718  T
Q  474 ccaataagataagtt 488  Q
    ||||| | |||||||    
T  28514717 ccaatcaaataagtt 28514703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Original strand, 28097773 - 28097857
Alignment:
Q  188 gctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttg 272  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||   || |||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  28097773 gctgaattttctctcacattgtgaaggaaacagacacattcaaattgaccagcaatgaaattataaaccgcttttgcaagtgttg 28097857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 428 - 488
Target Start/End: Original strand, 28098013 - 28098073
Alignment:
Q  428 tatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagtt 488  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  28098013 tatttgactatttcccgaataaactcgaattcatatccattcctggccaataagataagtt 28098073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 28781477 - 28781406
Alignment:
Q  588 aggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||||||||||||    
T  28781477 aggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccat 28781406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 28786616 - 28786545
Alignment:
Q  588 aggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||||||||||||    
T  28786616 aggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccat 28786545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 28792737 - 28792666
Alignment:
Q  588 aggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||||||||||||    
T  28792737 aggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccat 28792666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 26646817 - 26646772
Alignment:
Q  588 aggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcc 633  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26646817 aggactataatggtatccggacaagttagcagcttgggtcagagcc 26646772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 26752785 - 26752740
Alignment:
Q  588 aggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcc 633  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26752785 aggactataatggtatccggacaagttagcagcttgggtcagagcc 26752740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26849526 - 26849461
Alignment:
Q  226 ttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagt 291  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  26849526 ttcaaattgatcagcaatcgaattataaactgcttgagcaagtgttgtttttcccattcctccagt 26849461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 656
Target Start/End: Original strand, 27531065 - 27531114
Alignment:
Q  607 gacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctc 656  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  27531065 gacaagttagccgcttggctcagagcttctttccattgctgcaacctctc 27531114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28326510 - 28326425
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttat 93  Q
    |||||||||||| | || | ||||||||  | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  28326510 cctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatcgagaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttat 28326425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28504146 - 28504061
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttat 93  Q
    |||||||||||| | || | ||||||||  | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  28504146 cctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatcgagaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttat 28504061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 29845854 - 29845931
Alignment:
Q  248 ttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatca 325  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||  || ||||| ||||||| |||||||    
T  29845854 ttataaattgctcgagcaagtgttgttttacccaatccaccaattccataaatccccaccatctggactcgatcatca 29845931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 86
Target Start/End: Original strand, 27576145 - 27576193
Alignment:
Q  38 ttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagccttt 86  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||    
T  27576145 ttgtcaacatcatcgagaatcaacaaaactttctttgtatgtagccttt 27576193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28140534 - 28140482
Alignment:
Q  41 tcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttat 93  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  28140534 tcaacgtcatcgagaatcaaaagaaccttctttagtcgtagcctttcctttat 28140482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28227618 - 28227530
Alignment:
Q  374 ccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcata 462  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||   | || |||||||||| || || |||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  28227618 ccaacagggtaatcggcaacatgtaaaggaacatgattgatcttgttagatatatatttgactatcttctcgataaactcgcattcata 28227530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 29843162 - 29843198
Alignment:
Q  38 ttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttc 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29843162 ttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaactttctttc 29843198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 577; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 659
Target Start/End: Original strand, 2689 - 3340
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2689 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 2788  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2789 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctccaactgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 2888  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2889 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 2988  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2989 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagacttcattccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 3088  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3089 gactggtcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccagtaagataagttagtatgtgacaacatcaca 3188  T
Q  508 atcacatccatgttattctttaagatgagattattgtgaaatttaaattaaagagagaaaat-ataaaaaaggtacccgagaggactatcatggtagccg 606  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3189 atcacat-catgttattctttaagatgagattatagtgaaatttaaattaaagagagaaaataataaaaaaggtacccaggaggactatcatggtagccg 3287  T
Q  607 gacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3288 gacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccat 3340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 467 - 659
Target Start/End: Original strand, 14082 - 14276
Alignment:
Q  467 ttcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcacaatcacatccatgttattctttaagatgagattattgtgaaatttaaattaaagagagaa 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14082 ttcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcacaatcacatccatgttattctttaagatgagattattgtgaaatttaaattaaagagaaaa 14181  T
Q  567 aatat--aaaaaaggtacccgagaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14182 aatataaaaaaaaggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 14276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8519 - 8007
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8519 cctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccct 8420  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419 cactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 8320  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8319 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctacc 8220  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8219 atgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgac 8120  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8119 gactgatcttgttggagatgtatttgactatatcgccaataaacttgtattcatatctattcatgtcatataagataagttagtatgtaacaacatcaca 8020  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
    |||||||||||||    
T  8019 atcacatccatgt 8007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 597 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 7854 - 7818
Alignment:
Q  597 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcc 633  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7854 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagcc 7818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Original strand, 12825 - 13337
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12825 cctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccct 12924  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12925 cactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 13024  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13025 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctacc 13124  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13125 atgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgac 13224  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13225 gactgatcttgttggagatgtatttgactatatcgccaataaacttgtattcatatctattcatgtcatataagataagttagtatgtaacaacatcaca 13324  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
    |||||||||||||    
T  13325 atcacatccatgt 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 520
Target Start/End: Original strand, 3863 - 4374
Alignment:
Q  9 ctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctc 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  3863 ctcctgccaaagcctgtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctc 3962  T
Q  109 actaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3963 actaacacctcctaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattt 4062  T
Q  209 tcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacca 308  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4063 tcaagaaaacatgagcattcaaattcatcagcaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctacca 4162  T
Q  309 tgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacg 408  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4163 tgtgggctccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgatg 4262  T
Q  409 actgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcacaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4263 actgatcttgttggagatgttcttgactatctctccaataaacttgtattcatatctattaatgtccgataagataagttagtatgtaacaacatcacaa 4362  T
Q  509 tcacatccatgt 520  Q
    ||||||||||||    
T  4363 tcacatccatgt 4374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 597 - 659
Target Start/End: Original strand, 4529 - 4591
Alignment:
Q  597 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||||||||||||    
T  4529 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccat 4591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 597 - 633
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13526
Alignment:
Q  597 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcc 633  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13490 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagcc 13526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Original strand, 18678706 - 18679218
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | || |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678706 cctccggccaaagcatgcagttgttccaaattgtgcacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccct 18678805  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18678806 cactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacatt 18678905  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  18678906 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttaatttacccatgcctccaatgccataaagtcctacc 18679005  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18679006 atgcggactccatcataagatcattcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgcc 18679105  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18679106 gactgatcttgttagagacgtatttgactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataagtcagtatgtaacaacatcaca 18679205  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
     ||||| ||||||    
T  18679206 gtcacacccatgt 18679218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Original strand, 18698546 - 18699058
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18698546 cctccagccaaagcatgcagttgttccaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccct 18698645  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||   ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18698646 cactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacatt 18698745  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |    
T  18698746 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgctttcgcaagtgttgatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaac 18698845  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18698846 atgcggactccatcatcagatcctttatcaagaagcgctttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgac 18698945  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  18698946 gactgatcttgttggagacgtatttgactatatctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataaatcagtgtgtaacaacatcaca 18699045  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
     ||||||||||||    
T  18699046 gtcacatccatgt 18699058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Original strand, 18730650 - 18731162
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18730650 cctccagccaaagcatgcagttgttccaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatatagggaattccct 18730749  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||   ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18730750 cactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacatt 18730849  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |    
T  18730850 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattactttagcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatc 18730949  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18730950 atgcggactccaccataagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaaatggcaacatgtaagggctgac 18731049  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18731050 gactgatcttgttggagacatatttgactatcttttcaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataagtcagtatgtaacaacatcaca 18731149  T
Q  508 atcacatccatgt 520  Q
     ||||||||||||    
T  18731150 gtcacatccatgt 18731162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 518
Target Start/End: Original strand, 18723231 - 18723741
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18723231 cctccagccaaagcatgcagttgtttcaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagccttttctttatataaggaattctct 18723330  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18723331 cactaacacctcctaagttaattttcagtgaaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacgtt 18723430  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |    
T  18723431 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattccttttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatc 18723530  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18723531 atgcggactccaccattagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaagtggcaacatgtaagggctgac 18723630  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18723631 gactgatcttgttgttgacatatttgactatctttccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataagtcagtatgtaacaacatcaca 18723730  T
Q  508 atcacatccat 518  Q
     ||||||||||    
T  18723731 gtcacatccat 18723741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 518
Target Start/End: Original strand, 18654623 - 18655133
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654623 cctccagccaaagcatgcagtggttccaaattgtccacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccct 18654722  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  18654723 cactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagatgaattttctctcacatt 18654822  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |    
T  18654823 ttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaatacaattattaattgattttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatc 18654922  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  18654923 atgcggactccaccatcagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaactggcagcatgtaagggctgac 18655022  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcaca 507  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  18655023 gactgatcttgttggagacatatttgactatctttccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataaatcagtgtgtaacaacatcaca 18655122  T
Q  508 atcacatccat 518  Q
     ||||||||||    
T  18655123 gtcacatccat 18655133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18074798 - 18074279
Alignment:
Q  3 caacacctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaat 102  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||    |  ||    
T  18074798 caactcctccagccaaagcattcagttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagat 18074699  T
Q  103 tccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctc 202  Q
    ||||||||| ||| || | ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  18074698 tccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctg 18074599  T
Q  203 acattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtc 302  Q
    || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||| ||    
T  18074598 acttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattc 18074499  T
Q  303 ctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 402  Q
    | ||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18074498 caaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagga 18074399  T
Q  403 ttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaaca 502  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18074398 ctgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagctcgtattcatatctattcatgtccaataatataagttagtatgtaacaaca 18074299  T
Q  503 t--cacaatcacatccatgt 520  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  18074298 tcacacaatcacatccatgt 18074279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 5090101 - 5090392
Alignment:
Q  9 ctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctc 108  Q
    |||| |||||| | |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||    
T  5090101 ctccggccaaaacctgtagttgtttcagtttgtcaatatcatcgagaatcaaaagaactttctttctttgtagccttttctttatgattggaattccctc 5090200  T
Q  109 actaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttat---ttgaagctgaattctctctcaca 205  Q
    ||| | | |||||||| ||||||| | |  || |||||| ||||||| |||   ||||||||  |  ||   ||    |  || |||||| |||||||||    
T  5090201 actgatatctccaaacctaatttccaatccaattgttttaaaaaggaccttactctgaagatactctaaaccatccactttagttgaattttctctcaca 5090300  T
Q  206 ttttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccata 297  Q
    ||   |||||||||   || ||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| |||||    
T  5090301 ttgggaagaaaacaaagacattcaaattgatgagcaatgaaattgtaaattgcttttccaagtgtggttttacccattcctccagtcccata 5090392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 594 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 18074094 - 18074029
Alignment:
Q  594 atcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  18074094 atcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccat 18074029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 60606 - 60087
Alignment:
Q  3 caacacctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaat 102  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||    |  ||    
T  60606 caactcctccagccaaagcattcagttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagat 60507  T
Q  103 tccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctc 202  Q
    ||||||||| ||| || | ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  60506 tccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctg 60407  T
Q  203 acattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtc 302  Q
    || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||| ||    
T  60406 acttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattc 60307  T
Q  303 ctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 402  Q
    | ||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  60306 caaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagga 60207  T
Q  403 ttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtgacaaca 502  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  60206 ctgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagctcgtattcatatctattcatgtccaataatataagttagtatgtaacaaca 60107  T
Q  503 t--cacaatcacatccatgt 520  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  60106 tcacacaatcacatccatgt 60087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 594 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 59902 - 59837
Alignment:
Q  594 atcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccat 659  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  59902 atcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccat 59837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 492
Target Start/End: Original strand, 29272988 - 29273472
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  29272988 cctccagccaaagcatgtagttgcttcaaattatcaacatcatcgagaatcaaaagaattttctttctacttagcctctcctttataattggaatcccct 29273087  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||    | ||||||||||| | |  |  ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||     
T  29273088 cactaacatgatctaacttaatttccaatccagttgtttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatc 29273187  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||| ||| |||    
T  29273188 atgaagaaaacataaatcttcaaattgatcagcaaaaaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagccaccaatcccataaattccaacc 29273287  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    || ||||  |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |    
T  29273288 atatggatcccatcatcagatccattatcaagaagcgatttgacttgttgtacttgagactgtaatccaacagggtatttggcaacatgtaagggcacgc 29273387  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagta 492  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  29273388 ggctgatcttgttggagatgtatttgactatctctccgataaacttgtattcatatctattcatgtcaaataatacaagttagta 29273472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16440743 - 16440694
Alignment:
Q  350 acttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaa 399  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16440743 acttggtgcactcgagactccaatccaacagggtaattagcaacatgtaa 16440694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 480
Target Start/End: Original strand, 267490 - 267962
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||    ||||| ||||    
T  267490 cctccagccaaagcatgcaattgttttatatcgttaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaatgccct 267589  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||    | ||||||||||| | |  |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||     
T  267590 cactaacatggtctaacttaatttccaatccagttgtttttaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttacttatagctgaattttctctcacatc 267689  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
     | |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||    
T  267690 atgaagaaaacataatccttcaaattgatcagcaataaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagcctccaatcccataaattccaacc 267789  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    || ||||| |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  267790 atatggaccccatcatcagatccattatcaagaagcaatttcacttgttgtacttgagaccataatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctcac 267889  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  267890 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtcaaataa 267962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 491
Target Start/End: Original strand, 28126825 - 28127308
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  |||||    | ||||||||    
T  28126825 cctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcgacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctgcatagcctttgttttatgattgcaattccct 28126924  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |  || |||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||| || || |||| ||||||||||||     
T  28126925 cactaacacctcctaacttaatgtccaatccaactgttttcaaaaggagcttttcttggagatgtttcaaattatatggagttgaaatctctctcacatc 28127024  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28127025 ttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccaataccataaagtcctacc 28127124  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgac 407  Q
    ||||||||  |||||||| |||  | ||| |||||| | ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||     ||    
T  28127125 atgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaagcaaattcacttgttgtacttggtcctgtaatccaacaggatatttggcaacatgtaagaaaacac 28127224  T
Q  408 gactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagt 491  Q
    || ||||| ||| ||| |||| ||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28127225 gattgatcctgtcggatatgtctttgattatcttctgaataaacttgtattcatatctattaatctccaataagataagttagt 28127308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 399
Target Start/End: Original strand, 28163526 - 28163916
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccct 107  Q
    |||||||||||||| |  || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||    | ||||||||    
T  28163526 cctccagccaaagcctccagctgctccagtttgtcgacatcatcaagaatcaaaagaattttatttctatgtagcctttgttttatgattgtaattccct 28163625  T
Q  108 cactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacatt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||   |  || |||||  ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||   || || |||||||||||||||||     
T  28163626 cactaacacctcctaacttaatgtccgatctaactgtttcaaaaag-agctcttcctggagatgtttcaagttggatggagttgaattctctctcacatc 28163724  T
Q  208 ttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctacc 307  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28163725 ttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtatcataaagtcctacc 28163824  T
Q  308 atgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaa 399  Q
    ||||||||  |||||||| |||  | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  28163825 atgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaagcaatttcacttgttgtacttgagattgtaatccaacaggatattttgcaacatgtaa 28163916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3280511 - 3280410
Alignment:
Q  188 gctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagcaataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctc 287  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  3280511 gctgaattttctctcacattgtgaagaaaacatacacattcaaattgattagcaatgaaattataaactgctcttgcaagagttgtcttacccattcctc 3280412  T
Q  288 ca 289  Q
    ||    
T  3280411 ca 3280410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16691866 - 16691618
Alignment:
Q  41 tcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaa 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||  |||||    |||||||| |||||||||  ||| |||||||| || | |  ||    
T  16691866 tcaacatcatcgagaatcaaaagaacctttttttgttgtagcctttgttttattattggaattccttcactaacatgtcctaacttaatgtctaatccaa 16691767  T
Q  141 gtgtttttaaaaggagcttctcctgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgaactttcaaattgatcagc 240  Q
      |||||  |||||||| | || ||||||||||  ||   || |  || |||||| |||||||| |  | |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  16691766 tggttttggaaaggagcctttcttgaagatgttctaagccatgtttagatgaattttctctcacgtcatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcagc 16691667  T
Q  241 aataaagttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctcca 289  Q
    ||| || ||||||||||||   |||||||||| |||||| | |||||||    
T  16691666 aatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccgattcctcca 16691618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 2059 - 2136
Alignment:
Q  248 ttataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatca 325  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||  || ||||| ||||||| |||||||    
T  2059 ttataaattgctcgagcaagtgttgttttacccaatccaccaattccataaatccccaccatctggactcgatcatca 2136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Original strand, 57444 - 57529
Alignment:
Q  8 cctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttat 93  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||  | || ||||||||| |||||||| | |||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  57444 cctccagccaaaacctgtaattgcttcagctcgtgaacatcatcgagaatcaacaaaaccttctttcggtgaagcctttgctttat 57529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28116 - 28028
Alignment:
Q  374 ccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcata 462  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||   | || |||||||||| || || |||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  28116 ccaacagggtaatcggcaacatgtaaaggaacatgattgatcttgttagatatatatttgactatcttctcgataaactcgcattcata 28028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University