View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16920_low_3 (Length: 256)

Name: NF16920_low_3
Description: NF16920
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16920_low_3
NF16920_low_3
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (1-255)||(4-258)
scaffold0310 (1-255)||(6298-6552)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (1-245)||(1494-1738)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-255)||(7283950-7284204)
chr7 (7-255)||(3895128-3895376)
chr7 (7-255)||(11287520-11287768)
chr7 (7-255)||(15822327-15822575)
chr7 (7-239)||(45452063-45452296)
chr7 (7-255)||(44865333-44865582)
chr7 (7-255)||(35094919-35095166)
chr7 (7-255)||(143742-143991)
chr7 (7-255)||(12369735-12369984)
chr7 (3-255)||(47289884-47290138)
chr7 (7-255)||(12759090-12759340)
chr7 (7-255)||(13862828-13863074)
chr7 (7-255)||(39046523-39046767)
chr7 (7-255)||(26070161-26070408)
chr7 (7-255)||(26093948-26094195)
chr7 (7-255)||(12248015-12248265)
chr7 (8-255)||(16569902-16570150)
chr7 (8-255)||(16595512-16595760)
chr7 (1-255)||(17223824-17224082)
chr7 (7-255)||(49047569-49047818)
chr7 (7-216)||(13274919-13275129)
chr7 (1-221)||(13377666-13377889)
chr7 (48-221)||(16914866-16915038)
chr7 (3-221)||(48356781-48357001)
chr7 (3-221)||(9611445-9611665)
chr7 (3-221)||(9839016-9839236)
chr7 (1-221)||(14271787-14272009)
chr7 (1-38)||(111163-111200)
chr7 (109-201)||(28722267-28722359)
chr7 (7-80)||(25124407-25124482)
chr7 (7-173)||(31501358-31501526)
chr7 (1-38)||(126739-126776)
chr7 (1-38)||(32493940-32493977)
chr7 (7-221)||(34241101-34241317)
chr7 (109-201)||(14935517-14935609)
chr7 (109-201)||(15363110-15363202)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-255)||(20275-20530)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (7-255)||(18570382-18570630)
chr6 (7-255)||(32898893-32899142)
chr6 (7-255)||(22441037-22441285)
chr6 (7-255)||(16086120-16086369)
chr6 (7-255)||(16106619-16106868)
chr6 (7-255)||(18432746-18432994)
chr6 (74-255)||(31628371-31628552)
chr6 (7-255)||(13014603-13014853)
chr6 (7-255)||(18777249-18777481)
chr6 (7-255)||(18399041-18399290)
chr6 (7-253)||(21410944-21411191)
chr6 (1-255)||(22361654-22361909)
chr6 (1-255)||(21623271-21623528)
chr6 (7-232)||(25367130-25367357)
chr6 (3-221)||(17556909-17557127)
chr6 (7-176)||(33324874-33325046)
chr6 (7-215)||(18629502-18629712)
chr6 (126-246)||(28195108-28195228)
chr6 (7-176)||(35135906-35136078)
chr6 (112-255)||(18381684-18381827)
chr6 (67-201)||(29605607-29605739)
chr6 (7-221)||(17083093-17083307)
chr6 (1-38)||(18583641-18583678)
chr6 (7-176)||(16887685-16887857)
chr6 (7-176)||(15079606-15079774)
chr6 (1-38)||(19983186-19983223)
chr6 (1-38)||(35015051-35015088)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (7-255)||(4666-4913)
scaffold0447 (7-255)||(9280-9527)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (7-255)||(7275-7522)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (7-255)||(8631893-8632142)
chr3 (7-255)||(12349434-12349683)
chr3 (7-255)||(54424115-54424364)
chr3 (7-255)||(50111946-50112195)
chr3 (7-255)||(317405-317652)
chr3 (7-255)||(16995956-16996203)
chr3 (7-255)||(13817615-13817862)
chr3 (7-255)||(17100756-17101004)
chr3 (7-255)||(17101441-17101689)
chr3 (7-251)||(16181842-16182085)
chr3 (7-255)||(19570586-19570832)
chr3 (7-255)||(34439237-34439487)
chr3 (7-255)||(22144167-22144416)
chr3 (7-255)||(14298524-14298773)
chr3 (7-255)||(14304151-14304400)
chr3 (7-246)||(38527841-38528079)
chr3 (7-255)||(17938677-17938925)
chr3 (7-255)||(14295541-14295790)
chr3 (7-255)||(14301168-14301417)
chr3 (7-252)||(6154226-6154472)
chr3 (7-256)||(35123798-35124047)
chr3 (2-252)||(17522780-17523030)
chr3 (66-254)||(55440803-55440992)
chr3 (7-254)||(3578192-3578440)
chr3 (111-244)||(19260839-19260972)
chr3 (7-255)||(11060902-11061150)
chr3 (106-255)||(53898450-53898599)
chr3 (7-111)||(6146664-6146769)
chr3 (129-255)||(6146764-6146890)
chr3 (83-255)||(11196291-11196456)
chr3 (7-255)||(11328859-11329105)
chr3 (7-141)||(14527975-14528110)
chr3 (7-255)||(17139611-17139861)
chr3 (7-255)||(16880226-16880477)
chr3 (7-255)||(12560131-12560380)
chr3 (11-255)||(14059112-14059357)
chr3 (1-221)||(17204818-17205041)
chr3 (66-255)||(39656629-39656817)
chr3 (1-255)||(17191644-17191901)
chr3 (112-221)||(47784767-47784876)
chr3 (1-255)||(3576325-3576582)
chr3 (85-176)||(15876250-15876341)
chr3 (7-221)||(30207353-30207570)
chr3 (112-255)||(12488727-12488870)
chr3 (1-38)||(7854306-7854343)
chr3 (1-38)||(15857157-15857194)
chr3 (7-201)||(14814658-14814855)
chr3 (7-80)||(51961031-51961106)
chr3 (1-38)||(2844515-2844552)
chr3 (1-38)||(3992874-3992911)
chr3 (7-201)||(9590648-9590844)
chr3 (1-38)||(17955878-17955915)
chr3 (1-38)||(54038018-54038055)
chr3 (1-38)||(55513194-55513231)
chr3 (7-133)||(11882113-11882240)
chr3 (1-41)||(15550919-15550959)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (7-255)||(9783959-9784208)
chr1 (7-255)||(22403005-22403254)
chr1 (7-255)||(49967753-49968002)
chr1 (48-255)||(21718331-21718537)
chr1 (7-247)||(35054867-35055108)
chr1 (14-255)||(41212175-41212415)
chr1 (7-191)||(35522247-35522432)
chr1 (1-255)||(20177278-20177535)
chr1 (1-221)||(13376746-13376969)
chr1 (112-255)||(27329757-27329899)
chr1 (7-221)||(16646049-16646266)
chr1 (7-255)||(16656741-16656992)
chr1 (7-245)||(51627558-51627798)
chr1 (7-201)||(22143256-22143451)
chr1 (7-176)||(19603279-19603449)
chr1 (7-176)||(21195196-21195368)
chr1 (3-254)||(37233750-37234003)
chr1 (7-201)||(8537803-8538000)
chr1 (7-201)||(8603042-8603239)
chr1 (224-255)||(35522432-35522463)
chr1 (1-38)||(21860335-21860372)
chr1 (1-38)||(41218729-41218766)
chr1 (1-38)||(41394528-41394565)
chr1 (1-38)||(44034865-44034902)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (7-255)||(22794-23043)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (7-255)||(55376494-55376741)
chr4 (7-255)||(12837096-12837344)
chr4 (7-255)||(44346930-44347177)
chr4 (7-255)||(53704629-53704877)
chr4 (11-255)||(8872372-8872615)
chr4 (7-255)||(16732272-16732520)
chr4 (7-255)||(30458006-30458255)
chr4 (7-255)||(44056018-44056266)
chr4 (7-255)||(23269829-23270078)
chr4 (26-255)||(45458769-45458999)
chr4 (7-222)||(20813442-20813658)
chr4 (7-255)||(34395360-34395609)
chr4 (7-255)||(53907604-53907843)
chr4 (7-255)||(21959359-21959607)
chr4 (7-176)||(819826-819996)
chr4 (7-255)||(52265403-52265652)
chr4 (7-245)||(27961084-27961324)
chr4 (7-255)||(13809405-13809654)
chr4 (7-255)||(30232391-30232640)
chr4 (7-255)||(15044931-15045181)
chr4 (7-237)||(18494224-18494453)
chr4 (88-255)||(47535042-47535209)
chr4 (3-221)||(7185735-7185954)
chr4 (7-221)||(15109243-15109459)
chr4 (148-255)||(41165983-41166090)
chr4 (7-201)||(41256263-41256459)
chr4 (7-201)||(15013177-15013372)
chr4 (210-255)||(820015-820060)
chr4 (7-232)||(14901359-14901584)
chr4 (1-38)||(54118162-54118199)
chr4 (48-221)||(18276571-18276743)
chr4 (7-221)||(7964606-7964821)
chr4 (109-201)||(40904932-40905024)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-255)||(15361-15615)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (7-252)||(717-963)
scaffold0673 (16-255)||(6749-6989)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (1-255)||(11584157-11584411)
chr5 (7-255)||(21397195-21397444)
chr5 (7-255)||(28261624-28261867)
chr5 (7-251)||(4865370-4865613)
chr5 (7-255)||(24183027-24183276)
chr5 (7-255)||(20712179-20712428)
chr5 (7-255)||(11337081-11337330)
chr5 (7-255)||(1168100-1168348)
chr5 (7-255)||(19405640-19405891)
chr5 (7-245)||(21646636-21646873)
chr5 (46-202)||(21906855-21907011)
chr5 (74-255)||(24475681-24475861)
chr5 (29-201)||(23981433-23981606)
chr5 (1-255)||(19862312-19862569)
chr5 (7-255)||(3673965-3674215)
chr5 (7-245)||(16595621-16595860)
chr5 (2-255)||(5450731-5450987)
chr5 (7-237)||(23466558-23466787)
chr5 (7-255)||(23494022-23494272)
chr5 (7-221)||(21310603-21310819)
chr5 (7-255)||(28902294-28902545)
chr5 (7-255)||(28938689-28938940)
chr5 (7-255)||(432566-432815)
chr5 (7-255)||(7728523-7728774)
chr5 (1-221)||(21222497-21222718)
chr5 (7-221)||(21297069-21297285)
chr5 (3-221)||(21617153-21617374)
chr5 (67-201)||(22885799-22885932)
chr5 (7-201)||(37983521-37983717)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (7-255)||(11603-11852)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-198)||(19844-20041)
scaffold0122 (1-198)||(24148-24345)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (7-255)||(117857-118107)
scaffold0035 (7-247)||(109356-109598)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (7-255)||(9090-9339)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (7-255)||(48250-48496)
scaffold0068 (7-255)||(61698-61944)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (7-247)||(132-370)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (7-255)||(25875816-25876063)
chr2 (7-255)||(36890581-36890829)
chr2 (7-255)||(23836601-23836849)
chr2 (7-255)||(271273-271521)
chr2 (7-255)||(4448028-4448277)
chr2 (7-252)||(32465964-32466207)
chr2 (7-247)||(25602135-25602377)
chr2 (7-255)||(28974152-28974400)
chr2 (7-247)||(27261915-27262156)
chr2 (7-252)||(24571188-24571433)
chr2 (7-255)||(22579758-22580006)
chr2 (2-255)||(68095-68351)
chr2 (7-247)||(31146073-31146317)
chr2 (1-255)||(43645996-43646254)
chr2 (3-173)||(19666713-19666884)
chr2 (7-176)||(23821534-23821704)
chr2 (7-176)||(23830613-23830783)
chr2 (1-38)||(19794623-19794660)
chr2 (1-140)||(19660098-19660238)
chr2 (7-201)||(19669003-19669199)
chr2 (1-38)||(22284279-22284316)
chr2 (112-221)||(22775206-22775315)
chr2 (112-221)||(22780584-22780693)
chr2 (1-41)||(15633535-15633575)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (7-255)||(20561526-20561775)
chr8 (7-255)||(37611771-37612020)
chr8 (7-255)||(20573087-20573336)
chr8 (7-255)||(22234700-22234947)
chr8 (7-255)||(41246761-41247009)
chr8 (7-255)||(20481708-20481955)
chr8 (7-255)||(19992952-19993198)
chr8 (7-182)||(25122618-25122793)
chr8 (7-255)||(21681105-21681356)
chr8 (11-111)||(7000524-7000624)
chr8 (1-255)||(21198040-21198296)
chr8 (150-247)||(20653944-20654041)
chr8 (7-255)||(22981376-22981622)
chr8 (1-255)||(23837301-23837558)
chr8 (7-255)||(39446660-39446910)
chr8 (164-255)||(20647882-20647973)
chr8 (1-221)||(17285341-17285565)
chr8 (7-97)||(20529748-20529839)
chr8 (112-255)||(38533752-38533895)
chr8 (3-221)||(26011631-26011848)
chr8 (3-221)||(5854751-5854971)
chr8 (3-201)||(15933455-15933655)
chr8 (7-176)||(33528607-33528778)
chr8 (1-38)||(16404894-16404931)
chr8 (3-201)||(22742921-22743122)
chr8 (3-176)||(29306599-29306776)
chr8 (1-38)||(274767-274804)
chr8 (1-38)||(641045-641082)
chr8 (1-38)||(826851-826888)
chr8 (1-38)||(24716756-24716793)
chr8 (7-43)||(31194217-31194253)
chr8 (2-38)||(39115599-39115635)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (7-255)||(14977-15224)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (7-255)||(25314-25563)
scaffold0158 (106-255)||(25061-25210)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (7-255)||(24623-24872)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (7-255)||(11548-11798)
scaffold0359 (7-255)||(1420-1667)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (7-255)||(7672-7922)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (26-255)||(252903-253133)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (7-255)||(10040-10289)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (7-255)||(11464-11712)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (7-247)||(112441-112681)
scaffold0022 (7-255)||(102815-103066)
scaffold0022 (127-255)||(109693-109821)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (7-247)||(85443-85683)
scaffold0014 (7-253)||(159404-159651)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (7-255)||(4388-4635)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (7-255)||(5143-5390)
scaffold0480 (7-255)||(8776-9026)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (7-255)||(164318-164565)
scaffold0016 (1-38)||(162072-162109)
scaffold0016 (1-38)||(166158-166195)
scaffold0016 (1-43)||(116445-116487)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (7-255)||(132144-132394)
scaffold0021 (3-255)||(88378-88631)
scaffold0021 (7-255)||(11790-12041)
scaffold0021 (7-235)||(16022-16253)
scaffold0021 (7-235)||(25553-25784)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (7-255)||(60909-61159)
scaffold0001 (42-255)||(70552-70766)
scaffold0001 (7-146)||(79785-79925)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (7-255)||(33765-34014)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (7-255)||(247-496)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (7-255)||(38401-38650)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (7-255)||(254710-254958)
scaffold0011 (7-255)||(261316-261564)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (68-255)||(5044-5231)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (7-255)||(21615-21862)
scaffold0120 (7-255)||(31314-31561)
scaffold0120 (7-116)||(47445-47554)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (7-255)||(70716-70964)
scaffold0031 (48-234)||(31168-31352)
scaffold0031 (3-253)||(97088-97340)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (7-255)||(471-720)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (11-247)||(2026-2263)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (7-158)||(2961-3112)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (3-255)||(46268-46521)
scaffold0034 (7-247)||(40769-41010)
scaffold0034 (1-38)||(80188-80225)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-131)||(1-131)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (48-237)||(6062-6251)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (111-247)||(146712-146848)
scaffold0025 (3-221)||(53483-53703)
scaffold0025 (71-201)||(85690-85818)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (7-237)||(7927-8157)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (7-254)||(3423-3671)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-255)||(76734-76991)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (7-255)||(33622-33872)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (7-255)||(2211-2460)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (3-201)||(197143-197343)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (7-176)||(1440-1611)
scaffold0456 (7-176)||(8585-8756)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (7-201)||(8167-8363)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (111-221)||(7025-7135)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (112-221)||(35615-35724)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (66-232)||(93728-93893)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (112-221)||(6798-6907)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (7-176)||(89760-89929)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (88-255)||(2628-2795)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (7-175)||(10845-11014)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (7-141)||(1242-1378)
scaffold0409 (7-141)||(9497-9633)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (113-255)||(28639-28781)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-221)||(69594-69814)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (3-221)||(31157-31377)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (211-255)||(618-662)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (7-103)||(70201-70298)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (7-176)||(22323-22494)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-38)||(5771-5808)
scaffold0686 (1-38)||(5977-6014)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (3-176)||(23562-23737)
scaffold0080 (3-221)||(43688-43908)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (7-201)||(855-1052)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (217-255)||(32306-32344)
scaffold0091 (217-255)||(41959-41997)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-38)||(30418-30455)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (226-255)||(89584-89613)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (3-201)||(27654-27856)


Alignment Details
Target: scaffold0310 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 4 - 258
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaaatgtta 103  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 200  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  104 ataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagtat 203  T
Q  201 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  204 gagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgtt 258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 6298 - 6552
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6298 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaactgttc 6397  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 200  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6398 ataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagtat 6497  T
Q  201 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  6498 gagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgtt 6552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1738 - 1494
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1738 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttggatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttc 1639  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  1638 ctatgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattatatgttcaaagtat 1539  T
Q  201 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1538 gagaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgttgaattatg 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 7283950 - 7284204
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7283950 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttatatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 7284049  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 200  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  7284050 ataagtggtgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtgtgaagttatggatgattgaattgttattagttgaattgtatgttcaaagtat 7284149  T
Q  201 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7284150 gagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatcctttgttgtt 7284204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3895376 - 3895128
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  3895376 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataatt 3895277  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||     
T  3895276 gatgaaattcatgctctaattctgatgaaatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgaaaaa 3895177  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3895176 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 3895128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11287768 - 11287520
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  11287768 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 11287670  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11287669 tgatgaaattagtgctctgattatgttgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 11287570  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11287569 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 11287520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 15822327 - 15822575
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  15822327 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcagttatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 15822426  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |  |||    
T  15822427 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatg-ttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaaatgtatgaa 15822525  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15822526 aatggtatatgttgaaaatatgctcaaatggtgaattatgctttgttgtt 15822575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 45452063 - 45452296
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  45452063 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 45452162  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  45452163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 45452262  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtga 239  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45452263 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaatttgtga 45452296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44865582 - 44865333
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44865582 taaggtaagggggttaga-ttcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 44865484  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||     
T  44865483 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtgtatga- 44865385  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44865384 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgtt 44865333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35095166 - 35094919
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35095166 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 35095067  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag-aa 205  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  35095066 gatgaaattcatgctctaattgtgataacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtatatgaaa 35094968  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35094967 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgtt 35094919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 143991 - 143742
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  143991 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtataaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 143892  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  143891 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 143794  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143793 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 143742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 12369735 - 12369984
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  12369735 taaggtaagggggttagatttcatcattatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 12369834  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12369835 tgattaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttacggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 12369934  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12369935 atgggtatctgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgccttgttgtt 12369984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 47290138 - 47289884
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47290138 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaaatgcttaattggatgaattgattaattgttc 47290039  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gt 198  Q
    |||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||    
T  47290038 ataaatgatgaaattcgagctctaattatgatgccatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgt 47289940  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47289939 atga-aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 47289884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12759340 - 12759090
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  12759340 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataa 12759241  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |    
T  12759240 atgatgaaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaaatgtgaaa 12759141  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12759140 aaggggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 12759090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 13862828 - 13863074
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||  ||||      
T  13862828 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaa----gcttaattgggtgaatagattaattgtccataaa 13862923  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13862924 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 13863023  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13863024 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 13863074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 39046523 - 39046767
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39046523 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 39046622  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||   ||||||||    ||| ||    
T  39046623 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattattgttagttgaattgtatgttcaa---ttgaaaa 39046719  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39046720 atgagtatatg-tgaaaatat-ctcaattggtgaattatgcattgttgtt 39046767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 26070161 - 26070408
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  26070161 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26070257  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26070258 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26070357  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  26070358 aaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgtt 26070408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 26093948 - 26094195
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  26093948 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26094044  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26094045 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26094144  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  26094145 aaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgtt 26094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 12248015 - 12248265
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  12248015 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattacttgttcata 12248112  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  12248113 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgtttaaagtatgag 12248212  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12248213 aaaatagtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 12248265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Original strand, 16569902 - 16570150
Alignment:
Q  8 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16569902 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16569999  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16570000 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16570099  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16570100 aatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 16570150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16595760 - 16595512
Alignment:
Q  8 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16595760 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16595663  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16595662 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16595563  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16595562 aatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 16595512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 17223824 - 17224082
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||  |||||    
T  17223824 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaatttttcaattattt-tatgattaagtgcttaattgagtaaata-attaa 17223921  T
Q  95 ttggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttca 194  Q
    ||| ||| |  || |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||    
T  17223922 ttgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttca 17224021  T
Q  195 aagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17224022 aagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatactcaaattgttgaattatgctatgttgtt 17224082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 49047569 - 49047818
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |    
T  49047569 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtta-tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcaga 49047666  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || |  |||| |||||| | |||| |||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||    
T  49047667 attgttagaatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 49047766  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  49047767 agagtggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgttatgttgtt 49047818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13275129 - 13274919
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  13275129 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 13275032  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| | |||||| | | |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  13275031 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatgag 13274932  T
Q  204 aagttggtatatg 216  Q
    ||  |||||||||    
T  13274931 aaagtggtatatg 13274919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13377889 - 13377666
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| |||||| || ||||  | ||| |||||||    
T  13377889 gataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgattcattgagt-aatcgattaat 13377792  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||    
T  13377791 tgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 13377692  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||||||||||  || |||||||||||    
T  13377691 agtatgagaaagtgatatatgttgaa 13377666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Original strand, 16914866 - 16915038
Alignment:
Q  48 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatg 146  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  16914866 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatg 16914963  T
Q  147 tatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
     ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  16914964 catgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaa 16915038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48357001 - 48356781
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 99  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||  | || |||||||||| |    
T  48357001 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagt-aagtgattaattgtt 48356903  T
Q  100 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta 199  Q
    ||||  || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||    
T  48356902 catagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 48356803  T
Q  200 tgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    || |||  || |||||||||||    
T  48356802 tgtgaaagtgttatatgttgaa 48356781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9611665 - 9611445
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  ||||||||||     
T  9611665 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9611568  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  9611567 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9611468  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  9611467 atgtgaaagtgttatatgttgaa 9611445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9839236 - 9839016
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  ||||||||||     
T  9839236 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9839139  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  9839138 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9839039  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  9839038 atgtgaaagtgttatatgttgaa 9839016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14271787 - 14272009
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  14271787 gataattaaggtaagggaattagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaat 14271884  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || |||||  || | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||| |||||||||| ||  |||  |||||||||    
T  14271885 tgttcatagttg-tcaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 14271983  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    |||||| |||  || |||||||||||    
T  14271984 agtatgtgaaaatgatatatgttgaa 14272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 111163 - 111200
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  111163 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 111200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28722359 - 28722267
Alignment:
Q  109 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  28722359 tgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 28722267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124407
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 80  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 25124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31501526 - 31501358
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  31501526 taaggtaagggggttagaattcaacaataatcaattagttgtaattttc-attaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcat 31501429  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtt 173  Q
    |  |||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||| ||  ||||| ||   |||||||||||||||    
T  31501428 agttgatgaaattagtgatctaattatgaagatatgtttaaatacatgaaattggtgataattgaattgtt 31501358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 126776 - 126739
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  126776 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 126739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 32493940 - 32493977
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32493940 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 32493977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 34241101 - 34241317
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||    
T  34241101 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgattaattgagt-aagtgattaattgttcata 34241199  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      |||| ||||||||| | || ||||||||  ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||| |||||||| |    
T  34241200 gttgataaaattcgtgttataattatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtg 34241299  T
Q  204 aagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||  |  |||||||||||    
T  34241300 aaagtaatatatgttgaa 34241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14935609 - 14935517
Alignment:
Q  109 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  14935609 tgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 14935517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15363202 - 15363110
Alignment:
Q  109 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  15363202 tgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 15363110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20530 - 20275
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20530 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 20431  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt-- 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||      
T  20430 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgt 20331  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20330 atgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggttaattatgctttgttgtt 20275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18570630 - 18570382
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18570630 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 18570531  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||     
T  18570530 gatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgatgttatggataattgaattgttattagttaaattacatgttcaaagtatgaaaaa 18570431  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18570430 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 18570382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32899142 - 32898893
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||      
T  32899142 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 32899043  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  32899042 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 32898943  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32898942 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgtt 32898893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22441285 - 22441037
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  22441285 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcatatat 22441186  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  | ||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  22441185 gatgaaattcgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtgatggggtgaattacatgttaaaagtatgaaaaa 22441086  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22441085 tgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 22441037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16086369 - 16086120
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  16086369 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 16086270  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16086269 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattacatgttcaaagtacgaaaa 16086170  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  16086169 atgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgtt 16086120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16106868 - 16106619
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| || ||      
T  16106868 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattaattaattgttcgtaaa 16106769  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16106768 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 16106669  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  16106668 atgagtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgtt 16106619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18432994 - 18432746
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||      
T  18432994 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaaattttcaattatt-gtatgaaaagagcttaattgggtgaattgattatttgttcataaa 18432896  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  18432895 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatacttgaattgttgttgattgaattacatgttaaaagtatgaaaa 18432796  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18432795 atgggtgtatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 18432746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31628552 - 31628371
Alignment:
Q  74 ttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtt 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31628552 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtattcgaattatgattacatgtttagatgtatgaagttattgataattgaattgtt 31628453  T
Q  174 gttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31628452 gttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 31628371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 13014603 - 13014853
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat--ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13014603 taaggtaagggggttagaatttatcataatcacttattgtaattttcaattatgtttgtatgaaaagtgctaaattgggtgaattgattaattgttcata 13014702  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||     
T  13014703 agtgatgaaattcgtgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgtt-gaagtatgaa 13014801  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13014802 aaatgggtatgagttggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 13014853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18777481 - 18777249
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |||||      
T  18777481 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattggaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgt-----------------tcataaa 18777399  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18777398 agatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 18777299  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18777298 atgggtatgtgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgtt 18777249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18399290 - 18399041
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||    
T  18399290 taaggtaagggggttagaattcttcataatcattttagtgtaaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcata 18399193  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  18399192 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 18399093  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18399092 aaaatagtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 18399041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Original strand, 21410944 - 21411191
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  21410944 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattg-aggaattgactaattgttcat 21411041  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |   | |  |||| |||||| | ||||||||  |||| |  ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||  | |||  ||||||||||||||||    
T  21411042 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgttatgtatgaatgcatgaagttgttgataattgaatggttgttaaataaatttcatgttcaaagtatga 21411141  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttg 253  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  21411142 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgctatgttg 21411191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 22361654 - 22361909
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  22361654 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattg-agcaaatgattaattg 22361751  T
Q  98 gtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaag 197  Q
     |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||    
T  22361752 ttcatagatgataaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaag 22361851  T
Q  198 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||  ||  ||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  22361852 tatgagaaagtgacataagttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgtt 22361909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21623528 - 21623271
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattt-tcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  21623528 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaat 21623431  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||    
T  21623430 tgttcataaatgttagaattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaa 21623331  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21623330 agtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 21623271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Original strand, 25367130 - 25367357
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  25367130 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagcaattgattaattgttcat 25367227  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaag-ttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  |||||||||| || | |||||| |||||||||||||   |||  |||||||||||||||    
T  25367228 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaagttttttgataatggaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatg 25367327  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa 232  Q
    ||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  25367328 agaaagtggtttatgttg-aaatatgctcaa 25367357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 17556909 - 17557127
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatca-cttttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 99  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| || || ||||||||||||| || ||||||||| ||| |    
T  17556909 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatctagtgtaatttttcattaattgcattattaagtgcttaattgaat-aattgattatttgtt 17557007  T
Q  100 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta 199  Q
    ||||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||    
T  17557008 catagttgtt-aaattcgtgctctaattatgatgatatgttt-gatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 17557105  T
Q  200 tgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    || |||  || |||||||||||    
T  17557106 tgtgaaagtgttatatgttgaa 17557127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33325046 - 33324874
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatt--ttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||  |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33325046 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattatttcaattaat-gtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttca 33324949  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    ||  || | ||||||||||||||  || ||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  33324948 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt 33324874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Original strand, 18629502 - 18629712
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||| ||||||| || || |||||||||| |||||    
T  18629502 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaattttttatttgttgtatgattaagtgtttaattgaat-aagtgattaattgttcata 18629600  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||| |    
T  18629601 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtg 18629700  T
Q  204 aagttggtatat 215  Q
    ||  ||||||||    
T  18629701 aaagtggtatat 18629712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 246
Target Start/End: Original strand, 28195108 - 28195228
Alignment:
Q  126 ttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaata 225  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||     
T  28195108 ttatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaatggtatatgatg-aaatg 28195206  T
Q  226 tgctcaatt-ggtgaattatgc 246  Q
    ||||||||| | ||||||||||    
T  28195207 tgctcaattagttgaattatgc 28195228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 35135906 - 35136078
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  35135906 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattagat-aattgattaattgttca 35136003  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    ||  || | ||||||||||||||  || ||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  35136004 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgtt 35136078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Original strand, 18381684 - 18381827
Alignment:
Q  112 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 211  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || |||  ||  |||||||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||||||||  || |    
T  18381684 aatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 18381783  T
Q  212 atatgttgaaaatatgc-tcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  18381784 atatgttg-aattatgcttaaattgttgaattatgctttgttgtt 18381827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29605739 - 29605607
Alignment:
Q  67 taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattg 166  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||  || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||    
T  29605739 taagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaa-ttagtgataattg 29605642  T
Q  167 aattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||    
T  29605641 aattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatg 29605607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 17083093 - 17083307
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| |||||     
T  17083093 taaggtaagggggttagaattcattttaatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatag 17083191  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     || | | |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||   ||||||| |||||| ||    
T  17083192 ttgttaatattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa-ttggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtga 17083290  T
Q  205 agttggtatatgttgaa 221  Q
    |  || |||||||||||    
T  17083291 aaatgatatatgttgaa 17083307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 18583678 - 18583641
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18583678 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 18583641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 16887685 - 16887857
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||| |||    
T  16887685 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgaat-aaatgattaattgttca 16887782  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    ||  || | ||||||||||||||  |||||| | ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||| |||||||    
T  16887783 tagatgttaaaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgtt 16887857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 15079606 - 15079774
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  15079606 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattattt-tatgaataagggattaattggat-aattgattaattattcat 15079702  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    |  || | ||||||||||||||  || ||||| |||||   ||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15079703 agatgtt-aaattcgtgctctaactaggatgatatgttgt-atgcatgaagttgaggataattgaattgttgtt 15079774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 19983186 - 19983223
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19983186 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 35015051 - 35015088
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35015051 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 35015088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4913 - 4666
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4913 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 4816  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  4815 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 4716  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4715 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9527 - 9280
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  9527 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 9430  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  9429 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 9330  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9329 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 9280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7275
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7522 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 7425  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  7424 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 7325  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7324 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8632142 - 8631893
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  8632142 taaggtaagggggttaggattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattaattaattgttcttaag 8632043  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8632042 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtttgagaa 8631943  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  8631942 gttggtatatgttgaaaatatgcttatttagtgaattatgctttgttgtt 8631893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 12349434 - 12349683
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||      
T  12349434 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgtccataaa 12349533  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12349534 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtataaatttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtgagaa 12349633  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349634 gttgttatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 12349683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 54424364 - 54424115
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt-aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  54424364 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 54424265  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54424264 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 54424165  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54424164 attgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 54424115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 50111946 - 50112195
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  50111946 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 50112045  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  50112046 tgatgaaattcatgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 50112145  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50112146 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 50112195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 317405 - 317652
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  317405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 317504  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  317505 gatgaaattcgtgctctaagtatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 317604  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  317605 tgggtatgtg-tgaaaatatgctaaattggtgaattatgcattgttgtt 317652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 16995956 - 16996203
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  16995956 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattattcataagt 16996055  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||     
T  16996056 ggtgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttacttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 16996155  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16996156 tgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 16996203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13817862 - 13817615
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13817862 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgtacatatgt 13817763  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  13817762 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 13817665  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13817664 aatgggtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 13817615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17101004 - 17100756
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  17101004 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17100906  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  17100905 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaac 17100806  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17100805 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 17100756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17101689 - 17101441
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  17101689 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17101591  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  17101590 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaac 17101491  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17101490 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 17101441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Original strand, 16181842 - 16182085
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16181842 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 16181941  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||| |    
T  16181942 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttaaattacatgttcaaagtgtatga-a 16182039  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgt 251  Q
    | | ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  16182040 aatgggtatgtg-tgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgt 16182085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 19570586 - 19570832
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19570586 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaatttttcatatgt 19570684  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||     
T  19570685 gatgaaatttgtgctctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 19570783  T
Q  207 ttg-gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19570784 atgagtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 19570832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 34439237 - 34439487
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34439237 taaggtaaggagattagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 34439336  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttta-gatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |    
T  34439337 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttatgaggtatgaagttatggataaatgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaa 34439436  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34439437 aatgggtatgtgtttaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 34439487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 22144167 - 22144416
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||      
T  22144167 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactttttgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaactgttcataac 22144266  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  22144267 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 22144364  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22144365 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgtt 22144416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14298773 - 14298524
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  14298773 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14298674  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||     
T  14298673 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgat 14298574  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14298573 atggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 14298524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14304400 - 14304151
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  14304400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14304301  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||     
T  14304300 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgat 14304201  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14304200 atggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 14304151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38528079 - 38527841
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  38528079 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaactatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 38527980  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  38527979 gatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 38527882  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 246  Q
    | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527881 aatgggtatgtg-ggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17938925 - 17938677
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || |  |    
T  17938925 taagataagggggttagggttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcttgag 17938826  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||  |||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17938825 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttggatgtataaagc-atggttaagcgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgagaa 17938727  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17938726 gttgatatatgttgaaaatatgcttaattgatgaattatgctttgttgtt 17938677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14295790 - 14295541
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||      
T  14295790 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14295692  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14295691 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14295592  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14295591 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 14295541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14301417 - 14301168
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||      
T  14301417 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14301319  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14301318 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14301219  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14301218 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 14301168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 6154226 - 6154472
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6154226 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttctatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6154325  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaag--tatgag 203  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||     
T  6154326 tcatgaaattcgtcctctaattataatgacatgtttagatgtatgaaattatgaatagttgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtttatga- 6154423  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgtt 252  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6154424 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 6154472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35124047 - 35123798
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  35124047 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35123948  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa-agtatgaga 204  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||| |    
T  35123947 tgatgaaattcgtactttaattatgatgacgtgtttggatgtatgaaattatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttaaagtgtatgaaa 35123848  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtta 256  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35123847 ag--ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtta 35123798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 252
Target Start/End: Original strand, 17522780 - 17523030
Alignment:
Q  2 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||    
T  17522780 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgagaagtgcttatttgggtgaattgattatttgttc 17522878  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 200  Q
    |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17522879 ataaatgatgaacttcgtgctctaattatgatgacagttttggatgtatgaagatgtggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 17522978  T
Q  201 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgtt 252  Q
     | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17522979 aacaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtt 17523030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 254
Target Start/End: Original strand, 55440803 - 55440992
Alignment:
Q  66 ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataatt 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  55440803 ataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatt 55440902  T
Q  166 gaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgt 254  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  55440903 gaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgatgaaaatatgctcaactggttgaattatactatgttgt 55440992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3578440 - 3578192
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||     
T  3578440 taaggtaagcgggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtaggaataagtgcttaattgggtaaattgattaattgttcataa 3578342  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3578341 atgatgatattcattctctaattatgatgacatgttga-atgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgttcaaagtatgaga 3578243  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgt 254  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  3578242 aaatagtatatgttgaaaatatgctcaactggttgaattacgctatgttgt 3578192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 244
Target Start/End: Original strand, 19260839 - 19260972
Alignment:
Q  111 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttgg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  19260839 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 19260938  T
Q  211 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattat 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19260939 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattat 19260972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 11060902 - 11061150
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||      
T  11060902 taaggtaagggggttggaattcatcataatcataattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattaattatttgttaatgg 11060999  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  11061000 atgatgaaattcgtgctctaattatgatca-atttttaaatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagttgaatttcaggttcaaagtatgaga 11061098  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11061099 aaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 11061150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 255
Target Start/End: Original strand, 53898450 - 53898599
Alignment:
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||  ||||||     
T  53898450 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatctatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgcattaaatgttcaaagtgtatga- 53898547  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53898548 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 53898599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Original strand, 6146664 - 6146769
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6146664 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6146763  T
Q  106 tgatga 111  Q
    ||||||    
T  6146764 tgatga 6146769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 6146764 - 6146890
Alignment:
Q  129 tgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgagaagttggtatatgttgaaaatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  6146764 tgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tattagttgaattacatgttcaaagtgtatga-aaatgggtatgtgttgaaaatat 6146861  T
Q  227 gctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6146862 gctcaattggtgaatcatgcattgttgtt 6146890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 255
Target Start/End: Original strand, 11196291 - 11196456
Alignment:
Q  83 tgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 182  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11196291 tgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgctctaataatgatgatatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 11196390  T
Q  183 atcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||   ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  11196391 attttatgt--------tgagaaaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgatttgttgtt 11196456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 11328859 - 11329105
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  11328859 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 11328956  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||  || |  ||||||||||| | |||||||||||||||     | || ||||| |  ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  11328957 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtt-----gcataaagttgttaataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 11329051  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  11329052 agaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 11329105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 14527975 - 14528110
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||     
T  14527975 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgttcataa 14528073  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttt 141  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14528074 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 14528110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17139861 - 17139611
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || ||||    
T  17139861 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattcttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaagtgttcat 17139764  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||  |||  |||||||||| |||||    
T  17139763 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatga 17139664  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  17139663 gaaaatggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgtt 17139611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16880477 - 16880226
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16880477 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaacaagtgtttaattgagt-aattgattaattgttca 16880380  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  16880379 taattgtttgaattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatg 16880280  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtg-aattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  16880279 agaaagtggtatatgtt-agaatatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgtt 16880226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 12560131 - 12560380
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  12560131 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 12560228  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||  ||| ||  |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  12560229 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgattgaatgcttgaagttattgatacttgaatttttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 12560328  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  12560329 aaagtggtatatg-tgaaaatatgcccaactggttgaattatgctatgttgtt 12560380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Original strand, 14059112 - 14059357
Alignment:
Q  11 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtg 107  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||   ||    
T  14059112 gtaagggggttataattcatcataatcattttagtgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgact-aattgactaattgttcatgattg 14059209  T
Q  108 atgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagt 207  Q
     |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||   |||  |||||||||||||||||||      
T  14059210 ttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaa 14059309  T
Q  208 tggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  14059310 tgacatatgttg-aaatatgctcaatttgatgaattatgctatgttgtt 14059357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17205041 - 17204818
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||||||||  | ||| |||||||    
T  17205041 gataattaaggtaagggggttagaattccatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtg-gtacgaacaagtgcttaattgagtaaat-gattaat 17204944  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||    
T  17204943 tgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 17204844  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||||||||||  || |||||||||||    
T  17204843 agtatgagaaagtgatatatgttgaa 17204818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39656817 - 39656629
Alignment:
Q  66 ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataatt 165  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||  || | |||| ||||||| | ||||||||  ||||||  || |||||| ||   |||||||    
T  39656817 ataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataatt 39656719  T
Q  166 gaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  39656718 gaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 39656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17191901 - 17191644
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||  | ||| |||||||    
T  17191901 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcacaatcattttagtgtaatttttcaattgtt-gtatgaacaattgcttaattgagtaaat-gattaat 17191804  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||    
T  17191803 tgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 17191704  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||  || | ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  17191703 agtatgagaaagtgatttatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgttatgttgtt 17191644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784876
Alignment:
Q  112 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||  || |    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 47784866  T
Q  212 atatgttgaa 221  Q
    ||||||||||    
T  47784867 atatgttgaa 47784876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 3576325 - 3576582
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  3576325 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtt-gtacgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaat 3576422  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || ||| |  || |  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||    
T  3576423 tgttcaaagttgttataattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 3576522  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     |||||||||  || ||||| ||| || ||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  3576523 tgtatgagaaagtgatatatattg-aattatgctcaaattgatggattatgctatgttgtt 3576582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15876341 - 15876250
Alignment:
Q  85 aattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  15876341 aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgtt 15876250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30207570 - 30207353
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||    
T  30207570 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattca 30207473  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||   | |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||    
T  30207472 tactggttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatg 30207373  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||||  || |||||||||||    
T  30207372 agaaagtgatatatgttgaa 30207353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Original strand, 12488727 - 12488870
Alignment:
Q  112 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 211  Q
    ||||| ||||||| |||||||    ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||  || |    
T  12488727 aattcatgctctaattatgatattgtgtttggatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 12488826  T
Q  212 atatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  12488827 atatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgttatgttgtt 12488870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 7854343 - 7854306
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7854343 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7854306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 15857157 - 15857194
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15857157 gataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 15857194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 14814658 - 14814855
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  14814658 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgctcat 14814756  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |  || ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  14814757 agttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 14814855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961106
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 80  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 51961106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 2844552 - 2844515
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2844552 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 2844515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 3992911 - 3992874
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3992911 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 3992874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 9590648 - 9590844
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||| |||||    
T  9590648 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaaattgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtggttaattgttcata 9590746  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
      || | |||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||    
T  9590747 gttgttaaaatccgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcattaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatg 9590844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 17955878 - 17955915
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17955878 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 17955915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 54038018 - 54038055
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54038018 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 54038055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 55513231 - 55513194
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  55513231 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 55513194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 11882113 - 11882240
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||| ||| || ||     
T  11882113 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcttag 11882211  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatg 133  Q
     || |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11882212 atgttgaatttcatgctctaattatgatg 11882240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 15550959 - 15550919
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 41  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15550959 gataattaagataagggggttagaattcatcataatcactt 15550919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 9783959 - 9784208
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  9783959 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttactgcaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgataaattgttcataag 9784058  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9784059 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgagaa 9784158  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9784159 gttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 9784208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 22403005 - 22403254
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  22403005 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 22403104  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  22403105 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtctagatgtatgaagttatgaataattaaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 22403202  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22403203 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 22403254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 49968002 - 49967753
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      
T  49968002 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcacttattgtaattttcaattatttgcatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcaaaaa 49967903  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  49967902 tcatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaattataaaaa 49967803  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49967802 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgtt 49967753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21718537 - 21718331
Alignment:
Q  48 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgt 147  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21718537 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgt 21718439  T
Q  148 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21718438 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatgtgttcaaaatatgctcaattggtgaattatgct 21718339  T
Q  248 ttgttgtt 255  Q
     |||||||    
T  21718338 atgttgtt 21718331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35055108 - 35054867
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta-attttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||      
T  35055108 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttatttctattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattggttaattgttcataaa 35055009  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  35055008 tgatttaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 35054909  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35054908 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 35054867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41212415 - 41212175
Alignment:
Q  14 agggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaa 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  41212415 agggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaa 41212316  T
Q  114 ttcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtat 213  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || | |||||    
T  41212315 ttcgtgctctaattatgatgacctgtttagaggtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaactgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtat 41212216  T
Q  214 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     || | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  41212215 gtg-taaaaatatgctcaattagtgaattatgcactgttgtt 41212175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Original strand, 35522247 - 35522432
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  35522247 taaggtaagggagttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagggcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35522346  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgt 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35522347 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 35522432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20177535 - 20177278
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||    
T  20177535 gataattaaggtaatggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgtttaagtgcttaattgagt-aattgattaat 20177438  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||    
T  20177437 tgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 20177338  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  20177337 agtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 20177278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 13376746 - 13376969
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   | |||||||||||    
T  13376746 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaatttagt-aattgattaat 13376843  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaa-tcacatgttca 194  Q
    || |||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | ||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||    
T  13376844 tgttcatagatgatgagaatcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattaaattgttgtc-gttgaaatttcatgttca 13376942  T
Q  195 aagtatg-agaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13376943 aagtatgaagaag-tggtatatgttgaa 13376969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Original strand, 27329757 - 27329899
Alignment:
Q  112 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta--tgagaagttg 209  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||  ||| |||| |    
T  27329757 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttat-gataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgg 27329855  T
Q  210 gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27329856 gt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 27329899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16646266 - 16646049
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16646266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16646169  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||| ||||| |||| ||  |||  |||||||||||||||    
T  16646168 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgttggtaaaatttcatgttcaaagtatg 16646069  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||||  || |||||||||||    
T  16646068 agaaagtgatatatgttgaa 16646049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16656992 - 16656741
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16656992 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16656895  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||||||||||    
T  16656894 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 16656795  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||    
T  16656794 agaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatcaattatgctatgttgtt 16656741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 51627558 - 51627798
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  51627558 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagt-aattgattatttgttcat 51627655  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |   | |  |||| |||||| | ||||||||| ||| ||  ||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||    
T  51627656 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttgttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatga 51627755  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatg 245  Q
    |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  51627756 gaaaatggtatatgttg-aaatatgttcaattggttgaattatg 51627798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 22143256 - 22143451
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22143256 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 22143352  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |  || | ||||||||||||||  ||||||||  |||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||    
T  22143353 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 22143451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19603449 - 19603279
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  19603449 taaggtaagggggctagaattcatcataatca-tttagtgcaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 19603353  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    |  || | |||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||||||||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  19603352 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgtt 19603279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21195368 - 21195196
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  21195368 taaggtaaggggtttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 21195270  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    |  || | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  21195269 agttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgtt 21195196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 254
Target Start/End: Original strand, 37233750 - 37234003
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | || ||| ||||||     
T  37233750 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtattattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgt 37233847  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    | |||  || |  |||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  37233848 taatagttgttagaattcgtgctttagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaagt 37233947  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgt 254  Q
    ||  |||  || ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  37233948 atatgaaagtgatatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgt 37234003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 8537803 - 8538000
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | | ||||    
T  8537803 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8537901  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
       || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  8537902 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 8538000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 8603042 - 8603239
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | | ||||    
T  8603042 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8603140  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
       || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  8603141 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 8603239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 255
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522463
Alignment:
Q  224 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 35522463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 21860372 - 21860335
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21860372 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 21860335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 41218766 - 41218729
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41218766 gataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatca 41218729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 41394565 - 41394528
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41394565 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 41394528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 44034865 - 44034902
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44034865 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 44034902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23043 - 22794
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  23043 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatcaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 22944  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22943 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttttgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 22844  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22843 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgtt 22794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 55376494 - 55376741
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55376494 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttttgaaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 55376593  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||     
T  55376594 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttctaagtatgaaaaa 55376693  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  55376694 tgggtatgtg-tgaaaatatactcaattggtgaattatacattgttgtt 55376741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 12837096 - 12837344
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  12837096 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgaatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 12837194  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12837195 tgatgatattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 12837294  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12837295 attggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 12837344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44347177 - 44346930
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44347177 taaggtaagggagttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 44347078  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag-aa 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | || ||    
T  44347077 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtaagaaa 44346979  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44346978 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgtt 44346930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 53704629 - 53704877
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53704629 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 53704728  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  53704729 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaa 53704828  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  53704829 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatggttgtt 53704877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Original strand, 8872372 - 8872615
Alignment:
Q  11 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatg 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  8872372 gtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtg 8872471  T
Q  111 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttgg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| || | ||    
T  8872472 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagctatgaatgattgaagtgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatggg 8872571  T
Q  211 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8872572 tatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcgttgttgtt 8872615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16732520 - 16732272
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttc-aattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  16732520 taaggtaaagaggttagaattcatcataatcattattgcaattttttaattagt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 16732422  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16732421 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 16732322  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16732321 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 16732272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30458255 - 30458006
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  30458255 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttgaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 30458156  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  30458155 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatggataattaaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaaa 30458056  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30458055 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattacgcattgttgtt 30458006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44056266 - 44056018
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  44056266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 44056167  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44056166 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat-tttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 44056068  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44056067 atgaatatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgtt 44056018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 23269829 - 23270078
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23269829 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 23269928  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  23269929 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 23270026  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23270027 aaatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgtt 23270078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 255
Target Start/End: Original strand, 45458769 - 45458999
Alignment:
Q  26 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctcta 124  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45458769 ttcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaatttgtgctcta 45458868  T
Q  125 tttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaat 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||    
T  45458869 attatgatgacatgtttagatgtatgaagtgatagataattgaattgttgttagttgaattacatgctcaaaatatgagaagtttgtatatgttaaagat 45458968  T
Q  225 atgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  45458969 atgttcaattggtgaattatgctttgctgtt 45458999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813658
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  20813442 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttaaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20813541  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20813542 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 20813641  T
Q  206 gttggtatatgttgaaa 222  Q
     | ||||| ||||||||    
T  20813642 atgggtatgtgttgaaa 20813658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34395609 - 34395360
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||      
T  34395609 taaggtaagggggttagaattcatcattatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaactgattaattgttcataaa 34395510  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  34395509 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtaatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 34395412  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34395411 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 34395360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 53907604 - 53907843
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||    
T  53907604 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtagttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggat--------taattgttcatatgt 53907695  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||| ||     
T  53907696 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttattagttggattgtatgttcaaagtatgaaaaa 53907795  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53907796 tgggtatgtg-tgaaaatatgcccaattggtgaattatgcattgttgtt 53907843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 21959359 - 21959607
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||      
T  21959359 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattaattgattgttcataaa 21959458  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  21959459 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaaatgtatgaagttatggatatttgaattgttgttgattgaattacat-ctcaaagtatgaaaa 21959557  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21959558 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 21959607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 819826 - 819996
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  819826 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 819925  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  819926 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 819996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 52265403 - 52265652
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  52265403 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgtttaattgggt-aattgattaattgttcata 52265500  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||   ||||||||||||||||    
T  52265501 gatgatgaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgag 52265600  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  52265601 aaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgtt 52265652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27961324 - 27961084
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  27961324 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattgttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 27961227  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |  || |  ||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  27961226 aattgttagaatccgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttatgaataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatga 27961127  T
Q  203 -gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatg 245  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  27961126 agaagt-ggtatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatg 27961084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 13809405 - 13809654
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  13809405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 13809502  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||   ||  |||||||||||||||||    
T  13809503 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgag 13809602  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  13809603 aaaatggtatatgttg-aaatatgctcaattagttgaattatgctatgttgtt 13809654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 30232391 - 30232640
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  30232391 taaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgcaattttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcat 30232488  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta--t 200  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||  |    
T  30232489 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttat-gataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgt 30232587  T
Q  201 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30232588 gaaaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 30232640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15045181 - 15044931
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  15045181 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 15045084  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||    
T  15045083 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15044984  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  15044983 gaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgtt 15044931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Original strand, 18494224 - 18494453
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||  | ||||||| ||||| |||||     
T  18494224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatg-gtatgaataggtgcttaattgtgt-aattgatcaattgttcataa 18494321  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag- 203  Q
     || |  ||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||||     
T  18494322 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagttat-gataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 18494420  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 237  Q
    ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18494421 aaaatggtatatgttg-aaatgtgctcaattggt 18494453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 255
Target Start/End: Original strand, 47535042 - 47535209
Alignment:
Q  88 tgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcac 187  Q
    |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |    
T  47535042 tgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 47535141  T
Q  188 atgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  47535142 aagttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgatgaattatgctatgttgtt 47535209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 7185735 - 7185954
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||    
T  7185735 taattaaggtaaggaggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttc 7185833  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 200  Q
    |||  || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||   ||||||| |||||    
T  7185834 atagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtat 7185933  T
Q  201 gagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    | |||  || |||||||||||    
T  7185934 gtgaaaatgatatatgttgaa 7185954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 15109243 - 15109459
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||    
T  15109243 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattcat 15109340  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |   | |  ||||| ||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||    
T  15109341 aatagttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15109440  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaa 221  Q
    |||  || |||||||||||    
T  15109441 gaaagtgatatatgttgaa 15109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 255
Target Start/End: Original strand, 41165983 - 41166090
Alignment:
Q  148 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgc 246  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  41165983 atgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgc 41166081  T
Q  247 tttgttgtt 255  Q
    | |||||||    
T  41166082 tatgttgtt 41166090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 41256263 - 41256459
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  41256263 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 41256361  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  41256362 agttgttgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgttga-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 41256459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 15013177 - 15013372
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  15013177 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttcatttgtt-gtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 15013274  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  15013275 agttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgttga-atgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 15013372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 255
Target Start/End: Original strand, 820015 - 820060
Alignment:
Q  210 gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  820015 gtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 820060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14901584 - 14901359
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||    
T  14901584 taaggtaagggggttaaatttcatcataatcattttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 14901487  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    || || |  ||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||||||||| || | || ||||| ||||||||| ||  |||  ||||||  ||||||||    
T  14901486 atttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaaattgttgaaaattg-attgttgttggtgaaatttcatgtttgaagtatga 14901388  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa 232  Q
    |||  || ||||||||  ||||||||||||    
T  14901387 gaaagtgatatatgtt-taaatatgctcaa 14901359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 54118162 - 54118199
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54118162 gataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 54118199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18276743 - 18276571
Alignment:
Q  48 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatg 146  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | |  |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||    
T  18276743 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-atgtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatg 18276646  T
Q  147 tatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
     ||||| ||   ||||||| |||||||||| ||  |||  ||||||||||| ||| |||  || |||||||||||    
T  18276645 catgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagcatgtgaaagtgttatatgttgaa 18276571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 7964606 - 7964821
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||| |||||| |||||    
T  7964606 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgttcata 7964704  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||| |    
T  7964705 gttgttaaaatccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc-aagtatgtg 7964803  T
Q  204 aagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||  || |||||||||||    
T  7964804 aaagtgttatatgttgaa 7964821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Original strand, 40904932 - 40905024
Alignment:
Q  109 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  40904932 tgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 40905024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 15361 - 15615
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15361 gataattaaggtaagggggttagcattcatcataatcacttttgtaattttaaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 15460  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15461 ataagtggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggacaattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtat 15560  T
Q  201 -gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
      | || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15561 aaaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 15615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 717 - 963
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  717 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattgattgttcatatg 816  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  817 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagatgaattacatgttcaaagtatgaaaa 916  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgtt 252  Q
     | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  917 atgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 6749 - 6989
Alignment:
Q  16 ggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaat 114  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6749 ggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgatcagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 6848  T
Q  115 tcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgagaagttggta 212  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||| || | ||||    
T  6849 tcgtgctctaattacgaggacatgtttagatgtatgaagttatgaatagttgaattgttgttggttgaattacatgttcagagtgtatga-aaatgggta 6947  T
Q  213 tatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6948 tgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 6989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11584411 - 11584157
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11584411 gataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattaattaattgttc 11584312  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 200  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |    
T  11584311 atgagtggtgaaattcgtgctctatttatgatgacatatttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgt 11584212  T
Q  201 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
      |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584211 atgaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 11584157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21397444 - 21397195
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21397444 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 21397345  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  21397344 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 21397247  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21397246 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 21397195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28261867 - 28261624
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28261867 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 28261768  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  28261767 ggtgaaattcgtgctctagttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaa- 28261669  T
Q  207 ttggtatatgt-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28261668 -----atatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 28261624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4865613 - 4865370
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  4865613 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 4865514  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  4865513 ggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 4865414  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgt 251  Q
    | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4865413 tgggtat-gggtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgt 4865370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 24183027 - 24183276
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  24183027 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 24183126  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||    
T  24183127 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtcatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttcaaagtgtatgaa 24183226  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24183227 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 24183276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20712428 - 20712179
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  20712428 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttgcaattttcaattacttgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataa 20712329  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  20712328 -tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataactgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaa 20712230  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20712229 aatgggtatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 20712179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 11337081 - 11337330
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  11337081 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattggttaattgttcataa 11337179  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11337180 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 11337279  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11337280 atatggtaaatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgttatgttgtt 11337330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 1168100 - 1168348
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||||||||||| |||||      
T  1168100 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaaatgcttattttggtgaattgattaattgttcataaa 1168198  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1168199 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataatagaatggttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 1168298  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1168299 aatgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcaatgttgtt 1168348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19405891 - 19405640
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19405891 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 19405793  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19405792 aatgatgaaatttatgctctaattatgatgacatatttgaatgtatgaagttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 19405693  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  19405692 aaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattagttgaattatgattcgttgtt 19405640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 21646636 - 21646873
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||    
T  21646636 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttattgcaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaaatgttcatatg 21646734  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  |||    
T  21646735 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttaaaagtgtatgaa 21646833  T
Q  206 gttggtatatgt-tgaaaatatgctcaattggtgaattatg 245  Q
      |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21646834 aatgg-gtatgtatgaaaatatgttcaattggtgaattatg 21646873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21907011 - 21906855
Alignment:
Q  46 aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagat 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21907011 aattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagac 21906912  T
Q  146 gtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21906911 atatgaagttatggataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagtatga 21906855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24475861 - 24475681
Alignment:
Q  74 ttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtt 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24475861 ttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-t 24475763  T
Q  174 gttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24475762 gttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-aaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 24475681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 201
Target Start/End: Original strand, 23981433 - 23981606
Alignment:
Q  29 atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctattt 127  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23981433 atcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaatttagtgcattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaatt 23981532  T
Q  128 atgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||    
T  23981533 atgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 23981606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19862569 - 19862312
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaatt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||    
T  19862569 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aagtgattaatt 19862471  T
Q  97 ggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa 196  Q
    | |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||    
T  19862470 gttcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 19862371  T
Q  197 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19862370 gtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 19862312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3674215 - 3673965
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  3674215 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 3674118  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||  || ||||| | ||||||||||||||||||||   |||  |||| |||||||||||    
T  3674117 aattgttagaattcgtgctcaaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatga 3674018  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  3674017 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 3673965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16595860 - 16595621
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||    
T  16595860 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcat 16595763  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||| |||   |||  ||||||||||||||||    
T  16595762 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaagtatga 16595663  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 245  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16595662 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatg 16595621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Original strand, 5450731 - 5450987
Alignment:
Q  2 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaatt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || | || | ||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  5450731 ataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gcataaataaatgcttaattgagt-aattgattaatt 5450828  T
Q  97 ggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa 196  Q
    | |||||  || |  ||||| ||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||    
T  5450829 gttcataattgttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T
Q  197 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  5450929 gtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgtt 5450987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23466787 - 23466558
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  23466787 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattattgcaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgtgt-aattgattaattgttcataa 23466690  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag- 203  Q
     |  |  ||||||||||| | |||||   ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||||     
T  23466689 ttattagaattcgtgctccaattatggcaacatgtttgtatgtaagaagttat-gataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 23466591  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 237  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23466590 aaaatggtgtatgttg-aaatatgctcaattggt 23466558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23494272 - 23494022
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||  |||||||| ||||    
T  23494272 taaggtaagggggttagaaatcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aatcaattaattgttcat 23494175  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |  || |  ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||    
T  23494174 aattgttagaattcgtgctccaactatgatgacatgttcgaatgcatgaagttgtggaaaattgaattgttattagtggaattttatgttcaaagtatga 23494075  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
      | | ||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  23494074 agaataggtatatgttg-agatatgcgaaattggttgaattatgctatgttgtt 23494022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 21310603 - 21310819
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  21310603 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21310701  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||| || |    
T  21310702 aatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21310801  T
Q  204 aagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||  || |||||||||||    
T  21310802 aaaatgatatatgttgaa 21310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28902545 - 28902294
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  28902545 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28902448  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||||||||||    
T  28902447 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28902348  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||    
T  28902347 agaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatcaattatgctatgttgtt 28902294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28938940 - 28938689
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  28938940 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28938843  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||||||||||    
T  28938842 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28938743  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||    
T  28938742 agaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatcaattatgctatgttgtt 28938689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 432815 - 432566
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||    
T  432815 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttactgcaatttttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgatcata 432718  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || | ||||||| |||| | ||||||||| ||||||  ||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||||    
T  432717 attgttaaaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgag 432618  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  || ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  432617 aaaatgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatactatgttgtt 432566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7728774 - 7728523
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||| |||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  7728774 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgtaaattttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 7728676  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |  || |  ||||||| ||| | |||||| |  || |||  ||| ||||| ||   ||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||    
T  7728675 aattgttagaattcgtactccaattatgaagttatatttgaatggatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 7728576  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  7728575 gaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 7728523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21222497 - 21222718
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||    
T  21222497 gataattaaggtatgggggttagagttcaatcataattatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt--attgattaatt 21222593  T
Q  97 ggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa 196  Q
    | |||||  || |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||| |||||||||| ||  |||  ||||||||||    
T  21222594 gttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21222693  T
Q  197 gtatgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||||  |||  || |||||||||||    
T  21222694 gtatatgaaagtgttatatgttgaa 21222718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 21297069 - 21297285
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  21297069 taaggtaagggggttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21297167  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || | |||||||| |||||  |||||||| ||||||  | | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||| || |    
T  21297168 aatgttaaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21297267  T
Q  204 aagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||  || |||||||||||    
T  21297268 aaaatgatatatgttgaa 21297285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21617374 - 21617153
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||  |||||||||     
T  21617374 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagggattaattgt 21617277  T
Q  99 tcatatgtgatga-aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaag 197  Q
    ||||  ||  | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||| ||||||||||||  |||  ||||||| |||    
T  21617276 tcattagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttccaag 21617177  T
Q  198 tatgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    |||  |||  || |||||||||||    
T  21617176 tatatgaaagtgttatatgttgaa 21617153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22885932 - 22885799
Alignment:
Q  67 taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattg 166  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||   || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||    
T  22885932 taagtgcttaattgaat-aattgataatttgttcatggttgttgaaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattg 22885834  T
Q  167 aattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  22885833 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 22885799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37983717 - 37983521
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  37983717 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 37983619  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
      || | ||||| ||||||||| |||| ||| || |||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||    
T  37983618 gttgttaaaatttgtgctctatctatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatattcaaagtatg 37983521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11852
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11603 taagctaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 11702  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11703 tgatgaaatttgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggatgaattacatgttcaaagtatgaaaa 11802  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11803 atgggtattagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 11852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19844 - 20041
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19844 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 19943  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  19944 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 20041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24148 - 24345
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24148 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 24247  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  24248 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 24345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 117857 - 118107
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  117857 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 117955  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  117956 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 118055  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  118056 aagttggtatatgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgtt 118107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Original strand, 109356 - 109598
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  109356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 109454  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  109455 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 109554  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
    || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  109555 aaattggtatatattgaaaatatgataaattggtgaattatgct 109598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9339 - 9090
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt--caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||     
T  9339 taaggtaagggggttagaatttatcataatcattattgcaattttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaatttttcataa 9241  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9240 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 9141  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9140 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 9090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48496 - 48250
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48496 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 48398  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  48397 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaa 48298  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48297 tgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 48250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 61944 - 61698
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  61944 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 61846  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  61845 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaa 61746  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  61745 tgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 61698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 132
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 271  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  270 tgatgaaattcgtgctcta---atgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaagtatgagaa 174  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  173 attggtatatgttgaaaatatgctcaattcgtgaattatgct 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 25875816 - 25876063
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25875816 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagt 25875915  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  25875916 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 25876013  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25876014 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 25876063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 36890581 - 36890829
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||      
T  36890581 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgttattttcaattatg-gtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 36890679  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36890680 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatggcatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 36890779  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36890780 aatggaatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctatgttgtt 36890829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 23836601 - 23836849
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23836601 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgaatgataagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataagt 23836700  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt--atgaga 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  |||| |    
T  23836701 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgt-gttagtggaattacatgttcaaagtgtatgaaa 23836799  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23836800 a-tgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 23836849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 271521 - 271273
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||      
T  271521 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattattcataaa 271423  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  271422 tgaagaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 271323  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  271322 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 271273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 4448028 - 4448277
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||      
T  4448028 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttatatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataaa 4448127  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  4448128 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 4448227  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4448228 atgggtttgtgttgaaaatatgttcaattggtgaatgatgctttgttgtt 4448277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 32466207 - 32465964
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32466207 taaggtaagggg-ttagtcttcatcataatcacttttgaaaattttaattatttgtacgataagtgcttatttgaatgaattgattaattgttcatatgt 32466109  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 206  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  32466108 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 32466009  T
Q  207 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgtt 252  Q
    | | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32466008 tggatatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 32465964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25602377 - 25602135
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  25602377 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatg 25602279  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25602278 gatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgag 25602179  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25602178 aaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgagttatgct 25602135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28974400 - 28974152
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||      
T  28974400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattatttcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 28974302  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28974301 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaa 28974202  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  28974201 aatggtatatgttgaaaatatgctcatttggcgaattatgctatgttgtt 28974152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27262156 - 27261915
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27262156 taaggtaagggagttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatg 27262058  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27262057 gatgatgaaatttgtgccctaattatgatgacatgtttggatgtataaagttatggataattgaattgttgttagttcaattacatgttcaaagtatgag 27261958  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27261957 aaattggtatatgttgaaaatatgctc-attggtgaattatgct 27261915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 24571188 - 24571433
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaat-tttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||     
T  24571188 taaggttagggggttagaattcatcataatcattattgcaatgtttcaattatt-gtatgaataaatgcttaattgggt-aattgattaattgttcatag 24571285  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||   |||  ||||||||| ||||||||    
T  24571286 atgatgaaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttgtggatacttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgaga 24571385  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgtt 252  Q
    |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24571386 aaatgatatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctatgtt 24571433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 22579758 - 22580006
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  22579758 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 22579855  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag- 203  Q
     || |  ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||    ||| |||| |||||||     
T  22579856 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttat-gataattgaattgttgttggtgaaactttatgatcaaggtatgaga 22579954  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22579955 aaaatgttatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctttgttgtt 22580006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 68351 - 68095
Alignment:
Q  2 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaatt 96  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  68351 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaatagattaatt 68254  T
Q  97 ggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa 196  Q
    | |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||    
T  68253 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T
Q  197 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  68153 gtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 68095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146317
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||  ||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatcttttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaataagtgcttaactgagt-aattgattaattgtcca 31146171  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||  || |  |||||||| || | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||   ||||||||||||||    
T  31146172 taattgttagaattcgtgttccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatg 31146271  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgct 247  Q
    ||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31146272 agaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgct 31146317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43646254 - 43645996
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| |||| | |  |||||||| |||||| |||||||  | ||| |||||||    
T  43646254 gataattaaggtaagggggttagaattcagtcataatcatttttagtgtaaatttccaattgttgtatgaataagtgtttaattgagtaaat-gattaat 43646156  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || ||| |  || |  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||  |||  |||||| ||    
T  43646155 tgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaa 43646056  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  43646055 agtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 43645996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19666884 - 19666713
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggt 99  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || || |||||||||| |    
T  19666884 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataaatgcttaattgaat-aagtgattaattgtt 19666787  T
Q  100 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtt 173  Q
    ||||  || | |||||| |||||||  ||| |||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||    
T  19666786 catagttgttaaaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtt 19666713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 23821534 - 23821704
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  23821534 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23821631  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
      || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23821632 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgtt 23821704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 23830613 - 23830783
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  23830613 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23830710  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
      || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23830711 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgtt 23830783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 19794623 - 19794660
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19794623 gataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 19794660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19660238 - 19660098
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattg 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||| ||||| | || || |||||| |||    
T  19660238 gataattaaggtaagggg-ttagaattcatcataatcactttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgtttaatggaat-aagtgattatttg 19660141  T
Q  98 gtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtt 140  Q
     || ||  || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19660140 ttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgatatgtt 19660098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 19669003 - 19669199
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  19669003 taaggtaacggggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaatgattaattgttcat 19669100  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |  || | |||| | |||||||  |||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||    
T  19669101 agatgttaaaatccatgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttctaagtatg 19669199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 22284316 - 22284279
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22284316 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 22284279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775315
Alignment:
Q  112 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 211  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||||||  |  |    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttat 22775305  T
Q  212 atatgttgaa 221  Q
    ||||||||||    
T  22775306 atatgttgaa 22775315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780693
Alignment:
Q  112 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 211  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||||||  |  |    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttat 22780683  T
Q  212 atatgttgaa 221  Q
    ||||||||||    
T  22780684 atatgttgaa 22780693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 15633575 - 15633535
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 41  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15633575 gataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcactt 15633535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 20561526 - 20561775
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  20561526 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20561625  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20561626 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 20561725  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  20561726 attggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgtt 20561775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37612020 - 37611771
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  37612020 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataag 37611921  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  37611920 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 37611823  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37611822 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 37611771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 20573087 - 20573336
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  20573087 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20573186  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  20573187 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 20573286  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20573287 aagggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatcctttgttgtt 20573336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 22234700 - 22234947
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  22234700 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgaatgaattgattaattgttcataagt 22234799  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||| |    
T  22234800 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacgtgtttagatgtatgaagttatgaataatttaattg-tgttagttgaattacatgctcaaagtgtatga-a 22234897  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22234898 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 22234947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41247009 - 41246761
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||      
T  41247009 taaggtaagggggttagagttcatcataatcacttattgtaattttcaattagttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataaa 41246910  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  41246909 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaattgttgttggttgaattacatgttaaaagtaggaaaa 41246810  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41246809 atgggtatatgatg-aaatatgcttaattggtgaattatgcattgttgtt 41246761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20481955 - 20481708
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||       
T  20481955 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaat-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgttcatgga 20481858  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20481857 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 20481758  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20481757 atggatatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatactttgttgtt 20481708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 19992952 - 19993198
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  19992952 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttttgtaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 19993050  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||| |    
T  19993051 gatgaaatccgtactctaattatgatgacatgtttagatgtacgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacttgttcaaagtgtatga-a 19993148  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19993149 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 19993198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25122793 - 25122618
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  25122793 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 25122694  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 182  Q
    ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25122693 gatcaaattcgtgctccaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgctagttga 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21681356 - 21681105
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  21681356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaatttgttgaattgattaattgttcata 21681258  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21681257 aatgataaaattcgtgatctaattatgatgacatatttgaatgtataagtttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgtttaaagtatgag 21681158  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21681157 agaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatgctttgttgtt 21681105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Original strand, 7000524 - 7000624
Alignment:
Q  11 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7000524 gtaagggggttagttttcatcataatcacttttttaattttcaattatttgtatgataagtgcttaataggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 7000623  T
Q  111 a 111  Q
    |    
T  7000624 a 7000624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 21198040 - 21198296
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  21198040 gataattaagataagggggttagaattcattataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aattgattaatt 21198137  T
Q  97 ggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa 196  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||    
T  21198138 gttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 21198237  T
Q  197 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  21198238 gtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgttatgttgtt 21198296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Original strand, 20653944 - 20654041
Alignment:
Q  150 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20653944 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgct 20654041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22981622 - 22981376
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |    
T  22981622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatt--ttgtatgaataagtgcttaattgggt-aattgattaattgttcaga 22981526  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
    ||  |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  22981525 tg--atgaaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 22981428  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  22981427 aaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 22981376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23837558 - 23837301
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgta---attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||   |||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  23837558 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttaatatagattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaat 23837461  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||    
T  23837460 tgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgttcaa 23837361  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  23837360 agtatgagaaagtgatatatgttg-aactatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 23837301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 39446660 - 39446910
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  39446660 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 39446757  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg- 201  Q
    |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||     
T  39446758 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatga 39446857  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  39446858 agaag-tgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgtt 39446910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Original strand, 20647882 - 20647973
Alignment:
Q  164 ttgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  20647882 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgtt 20647973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17285565 - 17285341
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||    
T  17285565 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgattaagtgcttaattgaat-aattgaataa 17285468  T
Q  95 ttggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttca 194  Q
    ||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||    
T  17285467 ttgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 17285368  T
Q  195 aagtatgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    |||||||||||  || |||||||||||    
T  17285367 aagtatgagaaagtgatatatgttgaa 17285341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Original strand, 20529748 - 20529839
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattg 97  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20529748 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattg 20529839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38533895 - 38533752
Alignment:
Q  112 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 211  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  38533895 aattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatctcatgttcaaagtatgagaaaatggt 38533796  T
Q  212 atatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  38533795 atatgttg-aaatatgctcaaattattgaattatgctatgttgtt 38533752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26011848 - 26011631
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||  | || ||||||||||     
T  26011848 taattaaggtaagggggtta---ttcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgtttaattgagt-aagtgattaattgt 26011754  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  26011753 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagt 26011654  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  26011653 atgtgaaagtgttatatgttgaa 26011631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5854971 - 5854751
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||     
T  5854971 taattaaggtaaggaggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 5854874  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  5854873 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagt 5854774  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||  |||  || |||||||||||    
T  5854773 atatgaaagtgttatatgttgaa 5854751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15933655 - 15933455
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgtt-catcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||     
T  15933655 taattaaggtaagggggttagaattaaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 15933558  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  15933557 tcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 15933458  T
Q  199 atg 201  Q
    |||    
T  15933457 atg 15933455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33528778 - 33528607
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| || ||    
T  33528778 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttctta 33528680  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
      || |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  33528679 gatgttgaattccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt 33528607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 16404894 - 16404931
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16404894 gataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 16404931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22743122 - 22742921
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||     
T  22743122 taattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgt 22743024  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || ||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||   || ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| |||    
T  22743023 tcatagttgttgaaattcgtgctttgattatggtgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 22742924  T
Q  199 atg 201  Q
    |||    
T  22742923 atg 22742921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29306776 - 29306599
Alignment:
Q  3 taattaaggtaag-ggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattg 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  29306776 taattaaggtaagaggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattgattg 29306678  T
Q  98 gtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
     |||||  || | | ||||||||||||  |||||||| |||||   ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  29306677 ttcatagatgttaatattcgtgctctaactatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 29306599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 274804 - 274767
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  274804 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 274767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 641045 - 641082
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  641045 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 641082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 826851 - 826888
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  826851 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 826888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 24716756 - 24716793
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24716756 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 24716793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 43
Target Start/End: Original strand, 31194217 - 31194253
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 43  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31194217 taaggtaagggggttagttttcatcataatcattttt 31194253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 39115635 - 39115599
Alignment:
Q  2 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39115635 ataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatca 39115599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15224 - 14977
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatatgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 15125  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||  |||||| |    
T  15124 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttagattacatgttcaaagtgtatga-a 15027  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15026 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 14977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25563 - 25314
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  25563 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 25464  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |  |||    
T  25463 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25364  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25363 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 25314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25210 - 25061
Alignment:
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |  |||    
T  25210 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25111  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25110 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgtt 25061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 24623 - 24872
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||      
T  24623 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgaaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgtccataaa 24722  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24723 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttattgataattaaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 24822  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24823 atgggtatgtgttgaacatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 24872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 11548 - 11798
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  11548 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 11647  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||     
T  11648 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttcttggttgaattacatgttcaaagtgtatga- 11746  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11747 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgtt 11798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1667 - 1420
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||      
T  1667 taaggcaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatt--caattatttgtatgaaaagtggttaattgaatgaattgattaattgtgtataaa 1570  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1569 tgatgaaattcgtgctctaatcatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttggtggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 1470  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1469 atgggtatgtgatgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 1420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7922 - 7672
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  7922 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 7823  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgac-atgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  7822 tgatgaaattcatgatctaattatgatgcctatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaa 7723  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7722 aatgggtatatgatgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 7672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 255
Target Start/End: Original strand, 252903 - 253133
Alignment:
Q  26 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctcta 124  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||| |     
T  252903 ttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtgcataaatgataaaattcgtgctttg 253002  T
Q  125 tttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaat 224  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  253003 attatgatgacatgtttggatgtatgaagttagggataattgaattgttgttagttgaattacattttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaat 253102  T
Q  225 atgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  253103 atgctcaattggtgaatcatgctttgttgtt 253133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 10040
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  10289 taaggtaagggggttagaattcataataatcattattgcaaattttcaattctttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 10190  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa--agtatgag 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||     
T  10189 tgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagagtatgaa 10090  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10089 aag--ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11712
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||      
T  11464 taaggtatgggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaagtgtttaattgt-tgaattgattaattgttcataaa 11562  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11563 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaaa 11662  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11663 atgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 11712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Original strand, 112441 - 112681
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||      
T  112441 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtacttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 112539  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  112540 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaacaattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 112639  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  112640 attggtatatgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgct 112681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 102815 - 103066
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  102815 taaggtaaggggtttataattcatcataatcattttttgtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 102912  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  102913 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 103012  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||  ||||||||| ||  |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  103013 agaaagtggtatatggtg-gaatatgctaaatttgttgaattatgctatgttgtt 103066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 109821 - 109693
Alignment:
Q  127 tatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatat 226  Q
    |||||||| ||||||  ||  |||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  109821 tatgatgatatgtttgaatccatgaagttgttgataattgaattgttgttaatgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtggtatatgttg-aaatat 109723  T
Q  227 gctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  109722 gctcaaattgttgaattttgctatgttgtt 109693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 85683 - 85443
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||      
T  85683 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtttataaa 85585  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85584 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 85485  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  85484 attggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgct 85443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 159651 - 159404
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  159651 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtacgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 159553  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  159552 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatggcattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 159453  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttg 253  Q
      || |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  159452 aatgatatgagttgaaattatgctcaattggttgaattatgctatgttg 159404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4635 - 4388
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4635 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacgtttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 4536  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  4535 gatgaaattcgtgctctaattataatgacatgtttagatgtatcaaattatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 4438  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4437 aatgggtatgtg-tgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgtt 4388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 5143 - 5390
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5143 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttctaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 5242  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  5243 gatgaaattcgtgctcttattatgatgagatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 5340  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5341 aataggtatgtg-cgaaaatatgctcaattggtgaattaggcattgttgtt 5390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 8776 - 9026
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  8776 taaggtaagggggttagagttcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggaaaattgattaattgttcata 8874  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8875 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 8974  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8975 aaaatgatatatgttg-atatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 9026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 164565 - 164318
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  164565 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaattgtatggtaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataagt 164466  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 204  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  164465 gatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 164368  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  164367 aatgggtatgtg-tgaagatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 164318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 162072 - 162109
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  162072 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 162109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 166158 - 166195
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  166158 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 166195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 116445 - 116487
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 43  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  116445 gataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattttt 116487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 132144 - 132394
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  132144 taaggtaagggggttggaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttctatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 132243  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  132244 atgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattatatgttcaaagtatgaaa 132343  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  132344 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatcgttgtt 132394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 88631 - 88378
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||    
T  88631 taataaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgtcca 88532  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  88531 taaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaaatgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 88432  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | || | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  88431 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgatcaattggtgaattatgctatgttgtt 88378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12041 - 11790
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  12041 taaggtaaggtggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtcaattgattaattgttcata 11943  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11942 aatgatgaatttcgtgctctaattatgatgacatgtttcaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 11843  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||   | |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11842 aaaaagatatgagttgaaaacatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 11790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16253 - 16022
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt-cat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  16253 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 16155  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16154 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 16055  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattg 235  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  16054 gaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 16022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25784 - 25553
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt-cat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  25784 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 25686  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 202  Q
    |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25685 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgttttaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 25586  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattg 235  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25585 gaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 25553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 61159 - 60909
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  61159 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 61060  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  61059 atgatgaaattcgtgctctaattatgataacatgtttagatgtatgatgttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaa 60960  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | | ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  60959 aatgggtatgtgttaaaaatatacttaattggtgaattatgctttgttgtt 60909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Original strand, 70552 - 70766
Alignment:
Q  42 ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttt 141  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70552 ttgtaattttcaattatttgtaagaaaagtgcttatttggatgagttgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 70651  T
Q  142 agatgtatgaagtt-atggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa 240  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70652 agatgtatgaagttaatgaataattgatttattgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaagtaggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaa 70751  T
Q  241 ttatgctttgttgtt 255  Q
    |||||| || |||||    
T  70752 ttatgcattattgtt 70766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Original strand, 79785 - 79925
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  79785 taagctaagggggttagaattgatcataatcactcattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 79884  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatg 146  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  79885 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatg 79925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34014 - 33765
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 104  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  34014 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattact-gtatgattaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcgtaa 33916  T
Q  105 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 204  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33915 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 33816  T
Q  205 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  33815 aattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgtt 33765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 247
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  496 taaggtaagggggttagaattaatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 397  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||  |||| |  |||    
T  396 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaaattcatgtttcaagtgtatgaa 297  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38650 - 38401
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  38650 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 38551  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||    
T  38550 tgatgaaatacgcgctctaattatgatgacatgtttagatttatgaatttatgaataattgaatttttgttggttgaattacatgttcaaaggaagagaa 38451  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38450 atgggtatatgttgaaaatatgctcaattggcgaattatgcattgttgtt 38401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 254710 - 254958
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  254710 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 254808  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  254809 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg-tagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 254906  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  254907 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 254958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 261316 - 261564
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  261316 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 261414  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 203  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  261415 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtag-tagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 261512  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  261513 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 261564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 68 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5231 - 5044
Alignment:
Q  68 aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 167  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5231 aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 5132  T
Q  168 attgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5131 attgttgttagttgaattacatgttcacagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgtt 5044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21862 - 21615
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||      
T  21862 taaggtaagggggttataattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaaaggcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 21764  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21763 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 21665  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21664 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 21615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31561 - 31314
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||      
T  31561 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 31463  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31462 tgatgaaattcatgatctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattaaatgttcaaagtatgagaa 31364  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  31363 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtaaattatactatgttgtt 31314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 47445 - 47554
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||      
T  47445 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 47543  T
Q  106 tgatgaaattc 116  Q
    |||||||||||    
T  47544 tgatgaaattc 47554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 70964 - 70716
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | | |||      
T  70964 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgtaattttcagttatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaatagtttataaa 70866  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  70865 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaat-tcatgttcaaagtatgagaa 70767  T
Q  206 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
      ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  70766 aatggaatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgctttgttgtt 70716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31352 - 31168
Alignment:
Q  48 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgt 147  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31352 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattatttgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgt 31254  T
Q  148 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31253 atgaagttatggataattgaattgtggttagttgaat-tcatgttcaaagtataagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaatt 31168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Original strand, 97088 - 97340
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||  || | ||||||||||     
T  97088 taatgaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgatttagtgtttaattgagtg-agtgattaattgt 97185  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || | | |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  97186 tcatagttgttaagattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagt 97285  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttg 253  Q
    ||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  97286 atgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttg 97340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 471 - 720
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  471 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcatttattgctatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 568  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  569 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaattatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgag 668  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  669 aaaatggtatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgtt 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2263 - 2026
Alignment:
Q  11 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgat 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  2263 gtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgctcataaatgat 2165  T
Q  110 gaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttg 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||    
T  2164 gaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaatg 2065  T
Q  210 gtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgct 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2064 gtatatgatgaaaatatgctcaattggttgaattatgct 2026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 2961 - 3112
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2961 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataaatgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 3060  T
Q  107 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 158  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3061 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 3112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 46521 - 46268
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  46521 taattaaggtaagagggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 46423  T
Q  102 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatc-acatgttcaaagta- 199  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||     
T  46422 taaatgatgaaattcgtactctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtat 46323  T
Q  200 -tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
     ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46322 gtgaaaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgtt 46268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41010 - 40769
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 105  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  41010 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaatagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 40912  T
Q  106 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatc-acatgttcaaagta--tga 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||    
T  40911 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtatgtga 40812  T
Q  203 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
     |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40811 aaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 40769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 80225 - 80188
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  80225 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 80188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 1
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  131 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 32  T
Q  101 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatga 131  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31 ataaatgatgaaattcgtgctctatttatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6251 - 6062
Alignment:
Q  48 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgt 147  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  6251 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgacgacatgtttgaatgt 6153  T
Q  148 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag-aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6152 atgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 6062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 146848 - 146712
Alignment:
Q  111 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttgg 210  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  146848 aaattcatgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 146749  T
Q  211 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 247  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146748 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct 146712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53703 - 53483
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||     
T  53703 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 53606  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || |  ||||| ||||||| | ||||||| ||||||  ||| ||||  ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  53605 tcatagttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 53506  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||| |||| || |||||||||||    
T  53505 atgtgaaggtgttatatgttgaa 53483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 85818 - 85690
Alignment:
Q  71 tgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaatt 170  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  85818 tgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaatt 85721  T
Q  171 gttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  85720 gttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 85690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8157 - 7927
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  8157 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 8060  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
    | || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  8059 tttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 7960  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 237  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7959 aaagtggtatatg-tgaaaatatgctcaattggt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3671 - 3423
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  3671 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 3574  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   |||   ||||||||||||||||    
T  3573 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgag 3474  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctttgttgt 254  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  3473 aaagtggtatatg-tgaaaatatgctcaattggtccaattatgctatgttgt 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 76734 - 76991
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||    
T  76734 gataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtacttaattgagt-aattgagtaat 76831  T
Q  96 tggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 195  Q
    || |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||    
T  76832 tgttcatagatgatgaaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 76931  T
Q  196 agtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||  || ||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  76932 agtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgttcaaattgttgaattatgctatgttgtt 76991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 33622 - 33872
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  33622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 33719  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg- 201  Q
    |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||     
T  33720 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatga 33819  T
Q  202 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  33820 agaag-tgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgtt 33872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2460
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  2211 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgcaatttttaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattaatcata 2308  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 203  Q
      |  |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||    
T  2309 attattagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 2408  T
Q  204 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||  ||  |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  2409 aaagtgacatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgtt 2460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 197143 - 197343
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 99  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  197143 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattggat-aagtgattaattgtt 197241  T
Q  100 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta 199  Q
    | ||  || |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||    
T  197242 cttagatgttgaatttcgggctctaattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagta 197341  T
Q  200 tg 201  Q
    ||    
T  197342 tg 197343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 1440 - 1611
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  1440 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1537  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  1538 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 8585 - 8756
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  8585 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 8682  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  8683 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 8167
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  8363 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttaatgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 8266  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||    
T  8265 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 7025 - 7135
Alignment:
Q  111 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttgg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||  ||     
T  7025 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttaatgttcaaagtatgagaaagtga 7124  T
Q  211 tatatgttgaa 221  Q
    |||||||||||    
T  7125 tatatgttgaa 7135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35724 - 35615
Alignment:
Q  112 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 211  Q
    ||||||||||| | | ||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  || |    
T  35724 aattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 35625  T
Q  212 atatgttgaa 221  Q
    ||||||||||    
T  35624 atatgttgaa 35615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 232
Target Start/End: Original strand, 93728 - 93893
Alignment:
Q  66 ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgat-gaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataat 164  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||  || | ||||||||||||| | ||||||||| |||| |  ||| |||||||| | ||||||    
T  93728 ataagtgcttaattgggtaaatt-attaattgttcataactgttagaaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataat 93826  T
Q  165 tgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa 232  Q
    ||||| ||||||||   |||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  93827 tgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatttgttg-aaatatgctcaa 93893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6798
Alignment:
Q  112 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 211  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||  || |    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 6808  T
Q  212 atatgttgaa 221  Q
    ||||||||||    
T  6807 atatgttgaa 6798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 89760 - 89929
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  89760 taaggtaagggggttagaattcatcataatctttttagtgtaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttcata 89857  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
      || | |||||||||||| |  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||| |||||||||||||    
T  89858 gatg-ttaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgatacttgaattgttgtt 89929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2628
Alignment:
Q  88 tgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcac 187  Q
    |||||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |    
T  2795 tgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 2696  T
Q  188 atgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||||||  |||  || ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  2695 atgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgtt 2628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11014 - 10845
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||| |||||    
T  11014 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtataattttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaata-attaattgttcata 10917  T
Q  104 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgt 175  Q
      || |  |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||| |||||||    
T  10916 gatgttataattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgt 10845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 1242 - 1378
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  1242 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aaatgattaattgttcat 1339  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttt 141  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  1340 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgttt 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9633
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  9497 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aaatgattaattgttcat 9594  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttt 141  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  9595 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgttt 9633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28781 - 28639
Alignment:
Q  113 attcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggta 212  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||| |||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||  || ||    
T  28781 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagtgata 28682  T
Q  213 tatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  28681 tatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatggtatgttgtt 28639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 69814 - 69594
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||     
T  69814 taattaagataagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattg-agaaagtgattaattgt 69717  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||    ||||||||||||||||  ||  |||  |||||| |||||    
T  69716 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgtttaaagt 69617  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  69616 atgtgaaagtgttatatgttgaa 69594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31377 - 31157
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||     
T  31377 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 31280  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || |  ||||||||||||| ||||||||| || |||  ||| ||||| ||   |||||||| ||||||||| ||  |||  |||||||| |||    
T  31279 tcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 31180  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  31179 atgtgaaagtgttatatgttgaa 31157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 255
Target Start/End: Original strand, 618 - 662
Alignment:
Q  211 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  618 tatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgtt 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Original strand, 70201 - 70298
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||| |||||    
T  70201 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttgtgaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaaatgtat-aattgattaattgttcata 70298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 22323 - 22494
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22323 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgttattttttaatta-ttgtatgaataagtgattaattggatg-attgattgattgttcat 22420  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    |  || | ||||||||||||||  || ||| | ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  22421 agatgttaaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgtt 22494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 5771 - 5808
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5771 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 5808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6014
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5977 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 23562 - 23737
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| | |  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||| |    
T  23562 taattaagataagggggttagaattcaatcataatgattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgtt 23660  T
Q  100 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 176  Q
    ||||  || ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||  ||  ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  23661 catagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgtt 23737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 43688 - 43908
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||     
T  43688 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattgtt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 43785  T
Q  99 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 198  Q
    |||||  || | |||||  ||||||| ||||||||  ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||     
T  43786 tcatagttgttaaaattaatgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagg 43885  T
Q  199 atgagaagttggtatatgttgaa 221  Q
    ||  |||  || |||||||||||    
T  43886 atatgaaagtgatatatgttgaa 43908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 855 - 1052
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 102  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||  || || |||||| ||| ||||    
T  855 taaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattaaat-aagtgattatttgttcat 953  T
Q  103 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 201  Q
    |  || | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  954 agttgttaaaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32344 - 32306
Alignment:
Q  217 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32344 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgtt 32306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Original strand, 41959 - 41997
Alignment:
Q  217 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41959 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgtt 41997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 30455 - 30418
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30455 gataattaaggtaagggggttatttttcatcataatca 30418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 255
Target Start/End: Original strand, 89584 - 89613
Alignment:
Q  226 tgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89584 tgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 89613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27856 - 27654
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgatta-attg 97  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| |||  |||||||||||||| || || ||||||  |||    
T  27856 taattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaat-aaatgattattttg 27758  T
Q  98 gtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaag 197  Q
     |||||  || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||    
T  27757 ctcatagttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatag 27658  T
Q  198 tatg 201  Q
    ||||    
T  27657 tatg 27654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University