View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16921_high_14 (Length: 418)

Name: NF16921_high_14
Description: NF16921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16921_high_14
NF16921_high_14
[»] chr4 (136 HSPs)
chr4 (1-400)||(11006248-11006646)
chr4 (1-400)||(11434883-11435276)
chr4 (1-400)||(38409127-38409526)
chr4 (1-400)||(22046697-22047089)
chr4 (1-400)||(22044402-22044794)
chr4 (1-400)||(37089383-37089779)
chr4 (1-400)||(51015174-51015567)
chr4 (1-358)||(11008579-11008933)
chr4 (1-400)||(31849610-31850004)
chr4 (1-400)||(5198348-5198742)
chr4 (1-400)||(24888724-24889118)
chr4 (1-400)||(7941247-7941645)
chr4 (1-379)||(9148201-9148574)
chr4 (1-400)||(22802745-22803138)
chr4 (1-288)||(8631430-8631718)
chr4 (1-331)||(22132403-22132735)
chr4 (1-400)||(22800873-22801266)
chr4 (1-331)||(24348211-24348540)
chr4 (1-400)||(36919595-36919992)
chr4 (1-399)||(48486248-48486641)
chr4 (49-400)||(5637524-5637873)
chr4 (1-400)||(47274655-47275047)
chr4 (1-400)||(9174157-9174551)
chr4 (1-400)||(36921504-36921900)
chr4 (1-400)||(40091426-40091820)
chr4 (1-277)||(2484884-2485160)
chr4 (47-400)||(3824627-3824978)
chr4 (1-400)||(24880379-24880774)
chr4 (1-331)||(18709175-18709507)
chr4 (1-358)||(18847123-18847474)
chr4 (1-331)||(22134629-22134966)
chr4 (1-358)||(22782749-22783109)
chr4 (1-400)||(24878917-24879312)
chr4 (1-331)||(47210763-47211082)
chr4 (1-358)||(22780384-22780744)
chr4 (1-284)||(40637112-40637396)
chr4 (1-284)||(44599849-44600133)
chr4 (1-358)||(9176485-9176837)
chr4 (1-331)||(17662256-17662574)
chr4 (1-358)||(16934154-16934506)
chr4 (1-284)||(6764877-6765166)
chr4 (1-284)||(47868439-47868723)
chr4 (1-399)||(619459-619851)
chr4 (1-358)||(16931800-16932152)
chr4 (1-274)||(14633367-14633640)
chr4 (1-284)||(38928188-38928473)
chr4 (1-284)||(12395856-12396140)
chr4 (1-249)||(26085988-26086236)
chr4 (1-286)||(16453345-16453632)
chr4 (5-331)||(14787444-14787769)
chr4 (1-284)||(12400818-12401102)
chr4 (1-284)||(33415499-33415782)
chr4 (1-331)||(53405124-53405455)
chr4 (1-284)||(36378330-36378615)
chr4 (5-284)||(19095920-19096201)
chr4 (5-284)||(37313080-37313361)
chr4 (10-329)||(13543953-13544272)
chr4 (1-284)||(56030482-56030763)
chr4 (72-400)||(52942542-52942852)
chr4 (1-284)||(19322735-19323017)
chr4 (7-273)||(18409364-18409631)
chr4 (1-246)||(36380425-36380672)
chr4 (1-284)||(41997530-41997814)
chr4 (94-284)||(3937314-3937504)
chr4 (15-398)||(8756276-8756653)
chr4 (1-209)||(16455354-16455564)
chr4 (26-284)||(18537510-18537766)
chr4 (104-284)||(6132911-6133090)
chr4 (1-128)||(11437557-11437684)
chr4 (1-242)||(38890235-38890476)
chr4 (16-284)||(18534858-18535124)
chr4 (1-127)||(5635487-5635614)
chr4 (1-174)||(13547302-13547476)
chr4 (1-180)||(2891433-2891614)
chr4 (1-145)||(4215483-4215628)
chr4 (5-239)||(27499128-27499360)
chr4 (161-284)||(38270158-38270281)
chr4 (1-284)||(15032558-15032831)
chr4 (161-284)||(24446756-24446874)
chr4 (2-234)||(30136640-30136871)
chr4 (1-187)||(12102221-12102411)
chr4 (16-268)||(28453742-28453990)
chr4 (1-171)||(16185845-16186018)
chr4 (205-283)||(2891356-2891434)
chr4 (26-268)||(9863765-9864007)
chr4 (2-186)||(47150904-47151092)
chr4 (186-284)||(5101035-5101133)
chr4 (16-268)||(10112927-10113177)
chr4 (26-268)||(9022362-9022603)
chr4 (14-186)||(25357772-25357951)
chr4 (27-187)||(31983564-31983727)
chr4 (1-121)||(5101130-5101250)
chr4 (31-268)||(40998990-40999226)
chr4 (1-183)||(3982186-3982374)
chr4 (14-171)||(7050282-7050439)
chr4 (14-171)||(11853549-11853705)
chr4 (335-400)||(9176836-9176901)
chr4 (14-168)||(15316961-15317114)
chr4 (109-168)||(16689061-16689119)
chr4 (14-168)||(8529270-8529424)
chr4 (14-168)||(18586969-18587123)
chr4 (14-168)||(31300427-31300580)
chr4 (1-74)||(47563010-47563083)
chr4 (109-168)||(4556180-4556238)
chr4 (109-168)||(4558314-4558372)
chr4 (14-168)||(16489352-16489505)
chr4 (109-171)||(55822265-55822326)
chr4 (335-400)||(11008932-11008997)
chr4 (14-168)||(15831144-15831298)
chr4 (144-242)||(10114412-10114505)
chr4 (348-400)||(18847059-18847111)
chr4 (109-168)||(25699752-25699810)
chr4 (109-168)||(47566496-47566554)
chr4 (109-171)||(4570094-4570155)
chr4 (12-171)||(5336803-5336964)
chr4 (59-186)||(54906722-54906852)
chr4 (27-102)||(24446678-24446754)
chr4 (14-171)||(36769479-36769636)
chr4 (14-171)||(36771396-36771553)
chr4 (109-168)||(13072102-13072160)
chr4 (301-356)||(52043736-52043791)
chr4 (301-383)||(40999253-40999335)
chr4 (123-168)||(4884877-4884922)
chr4 (14-168)||(15312319-15312473)
chr4 (1-84)||(26557823-26557908)
chr4 (302-379)||(25357585-25357663)
chr4 (304-383)||(26557535-26557614)
chr4 (1-100)||(49088791-49088893)
chr4 (301-379)||(4569902-4569979)
chr4 (1-35)||(14789439-14789473)
chr4 (133-171)||(16638827-16638865)
chr4 (253-286)||(16455323-16455356)
chr4 (301-366)||(16638646-16638711)
chr4 (17-104)||(3578699-3578786)
chr4 (301-329)||(28453686-28453714)
chr4 (99-127)||(38270120-38270148)
[»] chr1 (121 HSPs)
chr1 (1-400)||(28840552-28840947)
chr1 (1-396)||(51749917-51750307)
chr1 (1-400)||(28842367-28842762)
chr1 (1-400)||(15823420-15823814)
chr1 (1-400)||(20302333-20302726)
chr1 (1-400)||(13761711-13762104)
chr1 (1-400)||(10399841-10400235)
chr1 (1-331)||(27336953-27337280)
chr1 (1-331)||(31735534-31735863)
chr1 (1-400)||(51752239-51752631)
chr1 (1-331)||(9463257-9463588)
chr1 (1-331)||(27339144-27339472)
chr1 (1-331)||(47906207-47906538)
chr1 (1-400)||(6822889-6823282)
chr1 (1-400)||(13214955-13215354)
chr1 (1-331)||(9459430-9459761)
chr1 (1-331)||(46431719-46432066)
chr1 (1-400)||(41646794-41647188)
chr1 (26-328)||(21948226-21948526)
chr1 (1-290)||(15294847-15295137)
chr1 (1-331)||(24325599-24325931)
chr1 (1-356)||(47179627-47179980)
chr1 (1-284)||(2617500-2617784)
chr1 (1-400)||(38925494-38925885)
chr1 (1-356)||(16226085-16226435)
chr1 (1-341)||(20291390-20291724)
chr1 (1-356)||(47177276-47177629)
chr1 (1-331)||(2510338-2510666)
chr1 (1-400)||(28207081-28207473)
chr1 (1-400)||(39462392-39462787)
chr1 (1-331)||(12302518-12302848)
chr1 (2-328)||(39932017-39932341)
chr1 (1-400)||(3579630-3580025)
chr1 (1-283)||(17324649-17324932)
chr1 (1-400)||(14097982-14098376)
chr1 (1-286)||(4131388-4131678)
chr1 (72-400)||(6823758-6824088)
chr1 (1-284)||(50307559-50307844)
chr1 (47-331)||(48665114-48665400)
chr1 (1-284)||(18839571-18839856)
chr1 (1-283)||(16428638-16428922)
chr1 (2-284)||(17186141-17186425)
chr1 (2-284)||(50078834-50079118)
chr1 (1-284)||(18307093-18307377)
chr1 (1-284)||(6995713-6995997)
chr1 (1-284)||(2949245-2949528)
chr1 (1-284)||(28998266-28998550)
chr1 (1-284)||(29003982-29004266)
chr1 (1-400)||(47451522-47451910)
chr1 (1-276)||(9241098-9241374)
chr1 (1-292)||(25127848-25128141)
chr1 (1-284)||(25251287-25251572)
chr1 (1-284)||(50076685-50076969)
chr1 (1-284)||(11457488-11457772)
chr1 (2-284)||(50248584-50248869)
chr1 (1-284)||(31425028-31425316)
chr1 (1-281)||(6756514-6756796)
chr1 (1-284)||(31489899-31490180)
chr1 (55-284)||(31422940-31423171)
chr1 (1-284)||(17318877-17319155)
chr1 (1-284)||(17324049-17324332)
chr1 (4-275)||(40133937-40134210)
chr1 (1-201)||(16231630-16231831)
chr1 (1-176)||(51757623-51757798)
chr1 (1-172)||(23785935-23786107)
chr1 (1-284)||(8347284-8347566)
chr1 (1-283)||(42922219-42922500)
chr1 (14-244)||(15669419-15669648)
chr1 (1-284)||(14183603-14183883)
chr1 (1-201)||(25248564-25248766)
chr1 (1-277)||(16432396-16432664)
chr1 (2-183)||(16429042-16429225)
chr1 (1-188)||(6115115-6115304)
chr1 (14-284)||(8349077-8349345)
chr1 (16-331)||(18800600-18800907)
chr1 (1-127)||(23816027-23816154)
chr1 (1-284)||(49495223-49495496)
chr1 (47-400)||(30790459-30790801)
chr1 (26-277)||(13125495-13125746)
chr1 (2-268)||(27916500-27916765)
chr1 (80-284)||(26520206-26520415)
chr1 (14-186)||(26613265-26613440)
chr1 (53-186)||(30738695-30738830)
chr1 (1-190)||(16561544-16561737)
chr1 (12-186)||(155788-155963)
chr1 (14-168)||(21353373-21353525)
chr1 (228-358)||(16231517-16231641)
chr1 (229-284)||(25248756-25248811)
chr1 (318-400)||(49687414-49687496)
chr1 (14-168)||(2401246-2401400)
chr1 (47-245)||(28279292-28279489)
chr1 (14-171)||(2232597-2232747)
chr1 (1-64)||(13358778-13358841)
chr1 (144-268)||(26332719-26332836)
chr1 (109-168)||(9526469-9526527)
chr1 (109-168)||(25134074-25134132)
chr1 (109-171)||(4144804-4144865)
chr1 (1-96)||(15916562-15916660)
chr1 (109-168)||(9521718-9521776)
chr1 (111-186)||(26332613-26332688)
chr1 (47-182)||(43104245-43104384)
chr1 (47-186)||(14353047-14353187)
chr1 (301-381)||(43104051-43104132)
chr1 (144-275)||(13127790-13127917)
chr1 (276-331)||(13449833-13449886)
chr1 (302-358)||(23783467-23783523)
chr1 (110-168)||(2393404-2393461)
chr1 (109-171)||(14997040-14997101)
chr1 (252-284)||(6115344-6115376)
chr1 (301-375)||(2401493-2401568)
chr1 (301-356)||(26613548-26613603)
chr1 (144-186)||(49959129-49959172)
chr1 (302-356)||(27916415-27916469)
chr1 (3-45)||(31422875-31422917)
chr1 (316-382)||(46782944-46783010)
chr1 (301-355)||(49958963-49959017)
chr1 (1-54)||(9476276-9476329)
chr1 (335-400)||(16231454-16231518)
chr1 (1-54)||(29651826-29651879)
chr1 (301-356)||(42922151-42922207)
chr1 (36-126)||(46783189-46783281)
[»] chr2 (101 HSPs)
chr2 (1-400)||(27104649-27105041)
chr2 (1-400)||(13910056-13910449)
chr2 (1-400)||(42064365-42064759)
chr2 (1-400)||(19504357-19504750)
chr2 (1-400)||(21520704-21521100)
chr2 (1-400)||(19502022-19502416)
chr2 (1-331)||(23452248-23452577)
chr2 (1-400)||(40032064-40032463)
chr2 (2-376)||(24162235-24162593)
chr2 (1-331)||(35215597-35215932)
chr2 (1-284)||(42452743-42453024)
chr2 (5-284)||(45279999-45280280)
chr2 (1-400)||(6258828-6259220)
chr2 (1-331)||(35217974-35218313)
chr2 (1-399)||(22287347-22287740)
chr2 (1-379)||(6264159-6264529)
chr2 (1-400)||(43623591-43623972)
chr2 (1-284)||(19007600-19007884)
chr2 (1-286)||(42923520-42923806)
chr2 (1-284)||(11739570-11739855)
chr2 (11-284)||(28196597-28196871)
chr2 (13-288)||(45239000-45239275)
chr2 (1-284)||(17848403-17848684)
chr2 (3-284)||(31732789-31733060)
chr2 (1-284)||(34979588-34979874)
chr2 (6-284)||(17849077-17849356)
chr2 (1-284)||(3022123-3022416)
chr2 (80-284)||(15539566-15539770)
chr2 (26-381)||(18800349-18800688)
chr2 (1-284)||(14837233-14837512)
chr2 (1-281)||(44289078-44289360)
chr2 (1-194)||(5375357-5375550)
chr2 (18-330)||(11578136-11578439)
chr2 (171-400)||(22407591-22407814)
chr2 (1-172)||(36558875-36559047)
chr2 (1-172)||(36561152-36561324)
chr2 (87-285)||(38020161-38020349)
chr2 (2-284)||(22874102-22874374)
chr2 (1-172)||(45332192-45332364)
chr2 (1-268)||(20146618-20146884)
chr2 (1-234)||(28459201-28459435)
chr2 (147-284)||(22163106-22163242)
chr2 (14-267)||(17897270-17897519)
chr2 (1-130)||(22407465-22407595)
chr2 (191-288)||(5377631-5377728)
chr2 (14-188)||(40699429-40699606)
chr2 (1-118)||(7462958-7463077)
chr2 (14-168)||(17943540-17943692)
chr2 (14-268)||(43139356-43139606)
chr2 (110-369)||(35107181-35107427)
chr2 (1-108)||(22707762-22707872)
chr2 (60-234)||(27136195-27136368)
chr2 (102-201)||(38414194-38414291)
chr2 (1-284)||(37962952-37963222)
chr2 (14-171)||(2736205-2736361)
chr2 (55-171)||(20589763-20589881)
chr2 (109-186)||(17921754-17921833)
chr2 (7-109)||(23870951-23871054)
chr2 (14-171)||(17462436-17462592)
chr2 (14-171)||(39686983-39687139)
chr2 (1-74)||(22163033-22163106)
chr2 (14-168)||(27517664-27517818)
chr2 (55-187)||(15693958-15694094)
chr2 (14-171)||(20054790-20054947)
chr2 (301-381)||(28462592-28462671)
chr2 (14-171)||(2740941-2741097)
chr2 (109-171)||(22712637-22712698)
chr2 (109-171)||(22717346-22717407)
chr2 (230-284)||(38020103-38020157)
chr2 (109-171)||(45567409-45567470)
chr2 (109-168)||(12781342-12781400)
chr2 (109-168)||(17932637-17932695)
chr2 (133-185)||(27583483-27583535)
chr2 (109-168)||(37170873-37170931)
chr2 (109-171)||(28458949-28459011)
chr2 (109-171)||(39680045-39680106)
chr2 (111-187)||(26345661-26345738)
chr2 (14-168)||(30478997-30479151)
chr2 (302-358)||(36559082-36559138)
chr2 (302-358)||(36561359-36561415)
chr2 (123-171)||(38190997-38191045)
chr2 (301-356)||(35028473-35028528)
chr2 (1-104)||(13828352-13828458)
chr2 (14-171)||(20050046-20050204)
chr2 (302-355)||(45156946-45156999)
chr2 (304-383)||(33603791-33603870)
chr2 (229-284)||(38414281-38414330)
chr2 (144-186)||(34575265-34575308)
chr2 (301-379)||(40699180-40699259)
chr2 (111-165)||(41303155-41303210)
chr2 (111-172)||(10942634-10942696)
chr2 (111-172)||(10948503-10948565)
chr2 (301-331)||(17897548-17897578)
chr2 (111-186)||(7502975-7503052)
chr2 (1-34)||(17490159-17490192)
chr2 (301-330)||(20589581-20589610)
chr2 (14-55)||(33670992-33671033)
chr2 (227-268)||(41304627-41304667)
chr2 (302-331)||(45332399-45332428)
chr2 (14-55)||(45679838-45679879)
chr2 (147-186)||(30720771-30720811)
[»] chr3 (150 HSPs)
chr3 (1-400)||(5191507-5191899)
chr3 (1-400)||(10084398-10084796)
chr3 (1-400)||(18099179-18099573)
chr3 (1-400)||(10191319-10191716)
chr3 (1-400)||(3859382-3859775)
chr3 (1-331)||(4103905-4104233)
chr3 (1-396)||(11170262-11170652)
chr3 (1-379)||(18096909-18097283)
chr3 (1-358)||(38889935-38890288)
chr3 (1-400)||(5522636-5523018)
chr3 (1-331)||(25533357-25533690)
chr3 (1-331)||(746674-747005)
chr3 (1-358)||(25388794-25389153)
chr3 (1-400)||(22114314-22114708)
chr3 (1-400)||(45882793-45883188)
chr3 (1-284)||(4308290-4308574)
chr3 (1-400)||(10956036-10956430)
chr3 (1-400)||(26720402-26720795)
chr3 (5-400)||(32264050-32264446)
chr3 (1-400)||(10958332-10958726)
chr3 (1-331)||(458203-458532)
chr3 (1-284)||(43226050-43226333)
chr3 (1-284)||(43228255-43228539)
chr3 (1-357)||(38210265-38210618)
chr3 (1-293)||(42990259-42990552)
chr3 (1-331)||(455826-456155)
chr3 (1-290)||(30005799-30006089)
chr3 (1-358)||(6063455-6063809)
chr3 (1-331)||(10621539-10621876)
chr3 (6-400)||(18162518-18162907)
chr3 (1-369)||(6065805-6066169)
chr3 (1-331)||(27101190-27101519)
chr3 (1-331)||(9604616-9604946)
chr3 (1-358)||(50493895-50494247)
chr3 (1-284)||(51727016-51727299)
chr3 (1-244)||(1321483-1321727)
chr3 (1-284)||(43423472-43423756)
chr3 (1-284)||(1313374-1313657)
chr3 (5-284)||(28102015-28102295)
chr3 (83-400)||(35777276-35777587)
chr3 (1-400)||(24979561-24979956)
chr3 (2-258)||(28413042-28413299)
chr3 (1-400)||(48361680-48362073)
chr3 (1-284)||(1626692-1626976)
chr3 (1-284)||(53917673-53917957)
chr3 (28-290)||(29956644-29956907)
chr3 (1-284)||(3314648-3314933)
chr3 (1-284)||(43421424-43421708)
chr3 (1-379)||(12267984-12268348)
chr3 (1-226)||(7606597-7606822)
chr3 (1-330)||(47148904-47149233)
chr3 (1-284)||(51943335-51943618)
chr3 (33-284)||(6561774-6562028)
chr3 (1-283)||(53915505-53915788)
chr3 (1-284)||(5926773-5927057)
chr3 (3-284)||(880462-880745)
chr3 (1-284)||(35917953-35918242)
chr3 (1-367)||(15780747-15781127)
chr3 (1-284)||(36011791-36012075)
chr3 (1-400)||(32218949-32219333)
chr3 (1-331)||(42992205-42992518)
chr3 (10-284)||(28761446-28761721)
chr3 (54-284)||(39715434-39715664)
chr3 (1-283)||(53468462-53468747)
chr3 (93-284)||(28100143-28100334)
chr3 (1-284)||(889782-890064)
chr3 (9-283)||(54691591-54691865)
chr3 (1-197)||(25688169-25688367)
chr3 (1-284)||(51674775-51675048)
chr3 (1-235)||(6484372-6484608)
chr3 (1-187)||(5886261-5886446)
chr3 (1-187)||(5899734-5899919)
chr3 (180-400)||(11163004-11163218)
chr3 (5-184)||(11168165-11168345)
chr3 (14-284)||(31151312-31151579)
chr3 (1-284)||(53591159-53591431)
chr3 (2-379)||(23633334-23633700)
chr3 (88-284)||(28180988-28181182)
chr3 (156-331)||(41849065-41849244)
chr3 (72-284)||(23636991-23637199)
chr3 (2-241)||(13420195-13420432)
chr3 (47-284)||(54884121-54884357)
chr3 (1-284)||(4666489-4666762)
chr3 (2-241)||(17795269-17795506)
chr3 (2-241)||(19103709-19103946)
chr3 (5-241)||(25635391-25635626)
chr3 (100-284)||(28137415-28137588)
chr3 (1-284)||(27635667-27635920)
chr3 (1-276)||(36871309-36871583)
chr3 (1-277)||(561783-562058)
chr3 (1-200)||(6231849-6232048)
chr3 (144-400)||(24177133-24177380)
chr3 (248-400)||(1321295-1321441)
chr3 (2-331)||(53597164-53597485)
chr3 (80-248)||(1673975-1674140)
chr3 (1-121)||(47701680-47701801)
chr3 (1-170)||(3306839-3307008)
chr3 (14-186)||(1620483-1620657)
chr3 (194-284)||(47701798-47701888)
chr3 (195-284)||(6231413-6231502)
chr3 (108-284)||(4560401-4560558)
chr3 (14-168)||(29913980-29914132)
chr3 (205-285)||(3306762-3306842)
chr3 (2-130)||(24181498-24181629)
chr3 (14-171)||(10094100-10094256)
chr3 (301-383)||(46966939-46967021)
chr3 (144-269)||(13419864-13419983)
chr3 (14-171)||(10100117-10100273)
chr3 (14-171)||(10200980-10201136)
chr3 (54-186)||(14634504-14634638)
chr3 (144-241)||(25633930-25634024)
chr3 (14-171)||(5858546-5858701)
chr3 (14-168)||(10897008-10897162)
chr3 (14-168)||(54193229-54193383)
chr3 (1-65)||(41849243-41849307)
chr3 (302-381)||(13893267-13893345)
chr3 (14-171)||(6303310-6303466)
chr3 (251-358)||(6719357-6719472)
chr3 (14-171)||(10208026-10208182)
chr3 (109-171)||(16462203-16462264)
chr3 (109-171)||(22626105-22626166)
chr3 (109-171)||(47883003-47883064)
chr3 (301-358)||(5899656-5899713)
chr3 (14-168)||(47878196-47878350)
chr3 (14-168)||(54188512-54188665)
chr3 (301-358)||(5886181-5886238)
chr3 (14-171)||(11079517-11079674)
chr3 (109-168)||(20031439-20031497)
chr3 (109-168)||(27762107-27762165)
chr3 (1-56)||(35919124-35919179)
chr3 (1-105)||(25634030-25634136)
chr3 (14-171)||(27544273-27544429)
chr3 (14-163)||(4535622-4535772)
chr3 (335-400)||(6719471-6719536)
chr3 (14-168)||(10612803-10612957)
chr3 (133-208)||(31021287-31021361)
chr3 (146-186)||(7768632-7768672)
chr3 (14-167)||(10949285-10949438)
chr3 (111-171)||(38002869-38002928)
chr3 (302-358)||(53896501-53896557)
chr3 (109-168)||(10595155-10595213)
chr3 (14-159)||(11007545-11007683)
chr3 (109-186)||(11066652-11066731)
chr3 (12-129)||(46966671-46966789)
chr3 (1-56)||(53894066-53894121)
chr3 (301-383)||(16996677-16996759)
chr3 (159-204)||(7606828-7606873)
chr3 (301-356)||(26762863-26762918)
chr3 (335-400)||(25388731-25388795)
chr3 (302-331)||(42990205-42990234)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-400)||(69303-69699)
scaffold0025 (173-400)||(73207-73431)
scaffold0025 (162-210)||(73160-73208)
[»] chr8 (87 HSPs)
chr8 (1-400)||(27826916-27827309)
chr8 (1-400)||(27829227-27829620)
chr8 (1-400)||(4423948-4424342)
chr8 (26-398)||(14807684-14808050)
chr8 (1-400)||(28251578-28251971)
chr8 (1-400)||(15072640-15073035)
chr8 (1-331)||(3874005-3874334)
chr8 (1-331)||(32339304-32339633)
chr8 (1-331)||(15809214-15809542)
chr8 (1-331)||(28283232-28283561)
chr8 (1-400)||(15067911-15068305)
chr8 (1-358)||(18810680-18811031)
chr8 (1-358)||(44720815-44721167)
chr8 (2-331)||(24873193-24873523)
chr8 (1-290)||(608768-609058)
chr8 (1-358)||(43079558-43079926)
chr8 (1-358)||(43081930-43082297)
chr8 (1-290)||(22684664-22684957)
chr8 (1-358)||(18812865-18813205)
chr8 (5-284)||(27106912-27107192)
chr8 (1-284)||(27911055-27911337)
chr8 (1-284)||(27957474-27957756)
chr8 (1-379)||(14419201-14419576)
chr8 (1-284)||(30480514-30480798)
chr8 (1-284)||(1225206-1225491)
chr8 (1-331)||(43530123-43530439)
chr8 (1-284)||(13858495-13858779)
chr8 (1-283)||(36865579-36865861)
chr8 (1-284)||(41384785-41385068)
chr8 (80-284)||(14477316-14477520)
chr8 (1-284)||(5372187-5372472)
chr8 (1-284)||(25952561-25952845)
chr8 (1-284)||(41382713-41382986)
chr8 (108-284)||(33541507-33541683)
chr8 (1-284)||(21480554-21480827)
chr8 (213-400)||(12517248-12517431)
chr8 (1-284)||(15185725-15186005)
chr8 (1-241)||(21482397-21482635)
chr8 (133-284)||(5622882-5623033)
chr8 (1-234)||(15956051-15956282)
chr8 (147-284)||(26775241-26775378)
chr8 (1-377)||(31162165-31162537)
chr8 (1-284)||(3005641-3005922)
chr8 (54-201)||(181622-181772)
chr8 (224-400)||(3886153-3886326)
chr8 (161-284)||(35872555-35872673)
chr8 (19-189)||(31035252-31035424)
chr8 (144-400)||(2468261-2468503)
chr8 (14-186)||(31578301-31578476)
chr8 (106-284)||(37214317-37214505)
chr8 (58-268)||(31573794-31574000)
chr8 (152-268)||(31035126-31035238)
chr8 (1-118)||(2468140-2468259)
chr8 (14-171)||(16757293-16757449)
chr8 (1-171)||(6376141-6376314)
chr8 (14-171)||(28895502-28895659)
chr8 (14-171)||(28327908-28328064)
chr8 (14-171)||(9021132-9021289)
chr8 (229-331)||(181536-181632)
chr8 (17-168)||(590797-590948)
chr8 (14-171)||(4812513-4812669)
chr8 (86-171)||(13985176-13985262)
chr8 (109-171)||(16752643-16752704)
chr8 (301-383)||(17847475-17847557)
chr8 (14-168)||(29554810-29554964)
chr8 (14-168)||(33032657-33032811)
chr8 (2-86)||(33541422-33541507)
chr8 (109-171)||(28332631-28332692)
chr8 (335-400)||(44720752-44720816)
chr8 (109-168)||(3276347-3276405)
chr8 (14-168)||(25684646-25684799)
chr8 (109-171)||(21033870-21033930)
chr8 (14-168)||(23179586-23179740)
chr8 (123-171)||(17799558-17799606)
chr8 (109-186)||(17847661-17847740)
chr8 (27-102)||(35872477-35872553)
chr8 (305-353)||(31574054-31574100)
chr8 (1-53)||(19752424-19752476)
chr8 (301-357)||(31035041-31035096)
chr8 (109-186)||(33839043-33839120)
chr8 (109-171)||(2267144-2267205)
chr8 (301-331)||(6375988-6376018)
chr8 (110-186)||(13985933-13986011)
chr8 (109-171)||(30423212-30423274)
chr8 (1-39)||(37214275-37214313)
chr8 (14-55)||(28890881-28890922)
chr8 (301-353)||(13858790-13858842)
[»] chr5 (113 HSPs)
chr5 (1-400)||(2174793-2175186)
chr5 (1-400)||(21684463-21684866)
chr5 (1-400)||(38881979-38882373)
chr5 (1-400)||(4236504-4236897)
chr5 (1-400)||(25921484-25921878)
chr5 (1-400)||(16776031-16776425)
chr5 (1-390)||(21947911-21948294)
chr5 (1-331)||(27912473-27912804)
chr5 (1-358)||(34479429-34479796)
chr5 (1-358)||(34477064-34477435)
chr5 (1-329)||(18466625-18466952)
chr5 (1-331)||(25803959-25804292)
chr5 (1-331)||(27910388-27910718)
chr5 (1-358)||(31544996-31545348)
chr5 (1-331)||(18468950-18469277)
chr5 (1-390)||(2818346-2818731)
chr5 (1-358)||(31542651-31543002)
chr5 (1-331)||(15552178-15552513)
chr5 (1-290)||(6745047-6745336)
chr5 (1-328)||(18511223-18511547)
chr5 (1-284)||(10529110-10529394)
chr5 (1-284)||(31179382-31179666)
chr5 (1-284)||(39854468-39854751)
chr5 (1-290)||(6747284-6747572)
chr5 (1-284)||(40221506-40221791)
chr5 (1-328)||(18509329-18509652)
chr5 (1-330)||(1189618-1189949)
chr5 (1-400)||(6756368-6756760)
chr5 (1-400)||(36402339-36402732)
chr5 (1-284)||(25904087-25904371)
chr5 (1-284)||(26097717-26097999)
chr5 (1-286)||(16092210-16092497)
chr5 (1-281)||(10474334-10474615)
chr5 (51-400)||(31466040-31466383)
chr5 (1-284)||(17072867-17073152)
chr5 (1-331)||(10586782-10587100)
chr5 (1-284)||(31472623-31472908)
chr5 (1-284)||(24126840-24127124)
chr5 (1-246)||(658367-658610)
chr5 (1-275)||(17818503-17818776)
chr5 (1-282)||(18596633-18596914)
chr5 (1-400)||(12555934-12556328)
chr5 (1-284)||(39398004-39398287)
chr5 (1-201)||(4410090-4410290)
chr5 (1-284)||(37705791-37706075)
chr5 (1-284)||(2954400-2954684)
chr5 (1-284)||(695873-696146)
chr5 (47-284)||(34530722-34530961)
chr5 (110-284)||(20043034-20043208)
chr5 (106-284)||(20044994-20045172)
chr5 (1-172)||(10749796-10749968)
chr5 (1-192)||(39798123-39798315)
chr5 (1-189)||(20505854-20506041)
chr5 (1-284)||(21288748-21289029)
chr5 (1-201)||(41585755-41585956)
chr5 (1-172)||(10757273-10757444)
chr5 (1-172)||(3373148-3373320)
chr5 (1-172)||(15354586-15354757)
chr5 (1-172)||(23665140-23665311)
chr5 (1-172)||(23793276-23793447)
chr5 (1-284)||(6661195-6661477)
chr5 (1-172)||(15356862-15357033)
chr5 (1-172)||(38960143-38960314)
chr5 (141-284)||(26098403-26098546)
chr5 (192-397)||(20507665-20507864)
chr5 (1-206)||(2723964-2724161)
chr5 (1-165)||(23741870-23742034)
chr5 (28-280)||(9020211-9020460)
chr5 (1-281)||(20053834-20054105)
chr5 (1-268)||(17413176-17413441)
chr5 (1-187)||(36208656-36208844)
chr5 (304-400)||(39797962-39798058)
chr5 (14-186)||(15143547-15143722)
chr5 (228-331)||(4410000-4410101)
chr5 (1-172)||(23667415-23667586)
chr5 (27-290)||(2144599-2144862)
chr5 (14-171)||(1170811-1170967)
chr5 (14-171)||(35385477-35385634)
chr5 (54-127)||(42770951-42771025)
chr5 (14-168)||(4897828-4897985)
chr5 (14-168)||(25452498-25452652)
chr5 (45-268)||(4754159-4754379)
chr5 (14-166)||(25445501-25445653)
chr5 (100-284)||(42770757-42770934)
chr5 (14-168)||(17841274-17841428)
chr5 (14-168)||(22672837-22672991)
chr5 (109-171)||(2298122-2298183)
chr5 (109-168)||(28786407-28786465)
chr5 (114-268)||(29748352-29748502)
chr5 (109-171)||(1240428-1240489)
chr5 (1-74)||(26098299-26098373)
chr5 (301-355)||(29748260-29748314)
chr5 (302-358)||(10757180-10757236)
chr5 (302-358)||(15354789-15354845)
chr5 (302-358)||(15357065-15357121)
chr5 (302-358)||(23665054-23665110)
chr5 (302-358)||(23793477-23793533)
chr5 (348-400)||(31542576-31542628)
chr5 (302-358)||(38960349-38960405)
chr5 (109-168)||(11962554-11962612)
chr5 (229-284)||(41585946-41586001)
chr5 (14-171)||(15445291-15445453)
chr5 (110-171)||(16093413-16093473)
chr5 (301-356)||(2144898-2144954)
chr5 (302-358)||(23667329-23667385)
chr5 (302-358)||(31179678-31179734)
chr5 (302-357)||(10749704-10749759)
chr5 (144-186)||(34033725-34033768)
chr5 (109-171)||(31782578-31782639)
chr5 (111-165)||(40222769-40222822)
chr5 (302-331)||(3373348-3373377)
chr5 (301-330)||(36208524-36208553)
chr5 (1-37)||(20043222-20043258)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-400)||(29044-29447)
[»] chr7 (119 HSPs)
chr7 (1-400)||(40836754-40837148)
chr7 (1-397)||(1049307-1049697)
chr7 (1-331)||(38393935-38394264)
chr7 (1-400)||(25542414-25542806)
chr7 (5-400)||(27306245-27306634)
chr7 (1-358)||(1046936-1047295)
chr7 (1-396)||(35517-35907)
chr7 (1-331)||(48457602-48457931)
chr7 (1-400)||(3878456-3878855)
chr7 (1-328)||(7470033-7470359)
chr7 (1-331)||(3035670-3036002)
chr7 (1-328)||(7471991-7472317)
chr7 (2-331)||(7349285-7349615)
chr7 (1-331)||(20299407-20299738)
chr7 (1-400)||(44448-44842)
chr7 (1-331)||(7351663-7351994)
chr7 (1-328)||(20625990-20626316)
chr7 (1-328)||(20629881-20630207)
chr7 (1-328)||(20642300-20642626)
chr7 (1-331)||(28487502-28487831)
chr7 (1-290)||(1849969-1850259)
chr7 (3-331)||(18345490-18345817)
chr7 (1-284)||(44724573-44724857)
chr7 (1-331)||(20297311-20297640)
chr7 (1-400)||(31435057-31435452)
chr7 (1-331)||(43253528-43253860)
chr7 (1-288)||(40946318-40946606)
chr7 (45-331)||(11757177-11757464)
chr7 (1-284)||(11355252-11355536)
chr7 (1-331)||(28485515-28485843)
chr7 (1-354)||(31155922-31156271)
chr7 (1-284)||(21680021-21680305)
chr7 (1-284)||(37412136-37412423)
chr7 (1-284)||(4295945-4296230)
chr7 (1-284)||(20137120-20137404)
chr7 (1-284)||(21678060-21678344)
chr7 (1-284)||(13099485-13099771)
chr7 (1-331)||(42331008-42331335)
chr7 (85-400)||(26804458-26804765)
chr7 (1-284)||(21990145-21990428)
chr7 (1-330)||(9680768-9681098)
chr7 (1-284)||(443589-443874)
chr7 (1-280)||(24748592-24748873)
chr7 (1-284)||(21592154-21592438)
chr7 (5-329)||(9679009-9679333)
chr7 (1-284)||(39145997-39146282)
chr7 (2-284)||(24258457-24258744)
chr7 (9-272)||(27832651-27832916)
chr7 (47-284)||(25276135-25276374)
chr7 (1-200)||(38396713-38396912)
chr7 (1-270)||(42223165-42223436)
chr7 (1-208)||(7092224-7092431)
chr7 (1-208)||(7094471-7094678)
chr7 (30-284)||(22828672-22828928)
chr7 (47-346)||(22251602-22251893)
chr7 (1-284)||(24817363-24817643)
chr7 (160-400)||(18567497-18567731)
chr7 (1-172)||(2935374-2935546)
chr7 (1-249)||(24813508-24813755)
chr7 (26-284)||(20091583-20091836)
chr7 (1-172)||(1606486-1606657)
chr7 (1-172)||(22137184-22137355)
chr7 (1-172)||(40552211-40552382)
chr7 (30-284)||(7188537-7188789)
chr7 (1-172)||(9027205-9027376)
chr7 (1-172)||(22108173-22108344)
chr7 (1-172)||(40549933-40550104)
chr7 (133-400)||(22392357-22392606)
chr7 (80-284)||(24465543-24465735)
chr7 (5-124)||(22393876-22393997)
chr7 (1-145)||(26295580-26295726)
chr7 (1-186)||(6332311-6332500)
chr7 (1-268)||(11081522-11081789)
chr7 (14-171)||(25351353-25351508)
chr7 (217-290)||(38396304-38396377)
chr7 (14-187)||(2120881-2121056)
chr7 (1-186)||(16297032-16297222)
chr7 (55-268)||(6048885-6049094)
chr7 (304-383)||(45366447-45366526)
chr7 (14-171)||(3320076-3320232)
chr7 (14-171)||(3324824-3324980)
chr7 (14-171)||(25405393-25405549)
chr7 (14-171)||(25357047-25357202)
chr7 (14-171)||(25410130-25410287)
chr7 (2-130)||(6046641-6046772)
chr7 (14-171)||(7069780-7069936)
chr7 (14-171)||(7074787-7074943)
chr7 (55-127)||(6348933-6349006)
chr7 (229-328)||(7094662-7094759)
chr7 (1-241)||(13290484-13290723)
chr7 (109-171)||(42006663-42006724)
chr7 (229-328)||(7092414-7092512)
chr7 (14-171)||(8378529-8378686)
chr7 (109-168)||(30246973-30247031)
chr7 (276-331)||(38396239-38396294)
chr7 (109-168)||(44512646-44512704)
chr7 (109-171)||(15541116-15541177)
chr7 (78-183)||(40281466-40281572)
chr7 (109-186)||(11084467-11084544)
chr7 (120-168)||(44143997-44144045)
chr7 (109-168)||(34546984-34547042)
chr7 (302-358)||(2935279-2935335)
chr7 (302-358)||(9027411-9027467)
chr7 (302-358)||(22108087-22108143)
chr7 (302-358)||(22137098-22137154)
chr7 (302-358)||(40549847-40549903)
chr7 (302-358)||(40552125-40552181)
chr7 (109-186)||(26210631-26210710)
chr7 (109-171)||(21369642-21369703)
chr7 (133-208)||(12310160-12310234)
chr7 (1-37)||(11759369-11759405)
chr7 (304-366)||(42006483-42006545)
chr7 (302-331)||(1606423-1606452)
chr7 (123-168)||(7464652-7464697)
chr7 (1-54)||(29159818-29159871)
chr7 (1-54)||(46516339-46516392)
chr7 (193-284)||(6348813-6348903)
chr7 (301-356)||(7188470-7188526)
chr7 (1-53)||(9190038-9190090)
[»] chr6 (105 HSPs)
chr6 (1-400)||(14507187-14507580)
chr6 (1-400)||(11983040-11983434)
chr6 (1-358)||(4816242-4816608)
chr6 (1-358)||(20915367-20915721)
chr6 (1-331)||(30967176-30967504)
chr6 (1-331)||(30034614-30034943)
chr6 (2-331)||(2628898-2629226)
chr6 (1-400)||(9019836-9020229)
chr6 (1-285)||(28241332-28241617)
chr6 (1-284)||(14458778-14459060)
chr6 (1-325)||(19704578-19704905)
chr6 (1-331)||(26064959-26065284)
chr6 (1-331)||(26084928-26085253)
chr6 (1-284)||(1230260-1230544)
chr6 (1-400)||(15541151-15541545)
chr6 (33-400)||(15530166-15530527)
chr6 (1-399)||(15532693-15533085)
chr6 (5-396)||(30728839-30729229)
chr6 (1-400)||(32279906-32280300)
chr6 (1-284)||(12195526-12195810)
chr6 (1-284)||(13057213-13057498)
chr6 (1-290)||(26932573-26932863)
chr6 (5-284)||(3390398-3390679)
chr6 (95-400)||(19227514-19227814)
chr6 (2-284)||(25477293-25477584)
chr6 (1-284)||(3629876-3630159)
chr6 (1-284)||(13039773-13040058)
chr6 (1-284)||(3631950-3632233)
chr6 (1-283)||(3233741-3234025)
chr6 (1-204)||(5273227-5273431)
chr6 (1-284)||(24338459-24338743)
chr6 (1-275)||(12161569-12161841)
chr6 (55-284)||(22490658-22490889)
chr6 (1-172)||(26066135-26066307)
chr6 (1-284)||(15719673-15719947)
chr6 (1-172)||(26068406-26068578)
chr6 (1-172)||(33308988-33309159)
chr6 (1-183)||(1069729-1069913)
chr6 (1-172)||(29754720-29754892)
chr6 (1-172)||(33311257-33311428)
chr6 (179-389)||(1072067-1072271)
chr6 (14-284)||(3027876-3028145)
chr6 (1-268)||(16455435-16455701)
chr6 (204-400)||(8995389-8995578)
chr6 (1-226)||(14466399-14466627)
chr6 (1-237)||(15367101-15367335)
chr6 (1-187)||(12186082-12186271)
chr6 (176-284)||(32447502-32447611)
chr6 (57-284)||(17012063-17012287)
chr6 (175-284)||(13870608-13870716)
chr6 (1-268)||(22857963-22858228)
chr6 (1-268)||(19696479-19696745)
chr6 (195-284)||(17852561-17852650)
chr6 (1-128)||(15346522-15346650)
chr6 (55-188)||(26945258-26945393)
chr6 (29-186)||(20526922-20527081)
chr6 (14-171)||(13878727-13878883)
chr6 (14-171)||(16785919-16786075)
chr6 (14-168)||(17694877-17695030)
chr6 (14-171)||(13883475-13883631)
chr6 (14-171)||(31248740-31248896)
chr6 (14-168)||(22342826-22342980)
chr6 (109-171)||(26887345-26887406)
chr6 (109-171)||(35201447-35201508)
chr6 (335-400)||(24191538-24191603)
chr6 (335-400)||(24192635-24192700)
chr6 (88-168)||(26643179-26643259)
chr6 (88-168)||(26749145-26749225)
chr6 (54-185)||(28037794-28037927)
chr6 (109-171)||(3577636-3577696)
chr6 (109-168)||(17036058-17036116)
chr6 (59-186)||(7542452-7542581)
chr6 (212-269)||(10584155-10584212)
chr6 (14-164)||(12166171-12166321)
chr6 (158-241)||(15346445-15346524)
chr6 (1-108)||(25465601-25465710)
chr6 (111-186)||(11138423-11138499)
chr6 (15-98)||(12911471-12911555)
chr6 (302-358)||(26068606-26068662)
chr6 (109-168)||(22351973-22352031)
chr6 (15-171)||(12937219-12937376)
chr6 (302-356)||(26066335-26066389)
chr6 (111-168)||(19701985-19702041)
chr6 (109-165)||(25941650-25941704)
chr6 (1-72)||(10584227-10584299)
chr6 (109-168)||(13467585-13467642)
chr6 (302-358)||(29755003-29755059)
chr6 (14-127)||(30445699-30445815)
chr6 (302-358)||(33308905-33308961)
chr6 (302-358)||(33311174-33311230)
chr6 (109-168)||(33215830-33215888)
chr6 (302-356)||(12186376-12186431)
chr6 (301-379)||(15346320-15346399)
chr6 (17-165)||(25465927-25466075)
chr6 (109-163)||(5165936-5165989)
chr6 (303-357)||(16455732-16455786)
chr6 (302-331)||(3028157-3028186)
chr6 (302-331)||(12195822-12195851)
chr6 (14-55)||(35201352-35201393)
chr6 (193-252)||(4595046-4595102)
chr6 (2-54)||(5572270-5572322)
chr6 (301-353)||(15366992-15367044)
chr6 (304-356)||(19696394-19696446)
chr6 (1-53)||(24436001-24436053)
chr6 (10-104)||(28078215-28078310)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-400)||(2763-3156)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-400)||(3880-4272)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-285)||(41494-41779)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (1-400)||(14902-15296)
scaffold0131 (1-286)||(14393-14679)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (1-358)||(6124-6476)
scaffold0472 (335-400)||(6061-6125)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (5-284)||(79178-79458)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (1-293)||(25-318)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-284)||(11484-11768)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-274)||(183652-183925)
scaffold0005 (5-331)||(51961-52286)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (26-331)||(1988-2293)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (1-210)||(1464-1673)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (7-284)||(79852-80130)
scaffold0004 (109-171)||(188363-188424)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (97-272)||(35644-35819)
scaffold0011 (2-55)||(35817-35870)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (9-269)||(85238-85500)
[»] scaffold0224 (2 HSPs)
scaffold0224 (1-283)||(15831-16112)
scaffold0224 (301-356)||(16124-16180)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (14-285)||(1666-1927)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (1-172)||(22221-22392)
scaffold0140 (1-172)||(24496-24667)
scaffold0140 (302-358)||(22135-22191)
scaffold0140 (302-358)||(24410-24466)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (55-284)||(16716-16942)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (156-284)||(993-1126)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (2-186)||(4901-5089)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (14-168)||(16328-16482)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (109-171)||(224819-224880)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (14-171)||(57452-57613)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (14-168)||(17011-17165)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (1-39)||(4690-4728)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (14-55)||(3095-3136)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 136)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 11006248 - 11006646
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006248 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccattacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11006347  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006348 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 11006447  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11006448 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaat--ag 11006545  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11006546 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttttttgctgccagcgcaccat 11006645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11435276 - 11434883
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435276 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11435177  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435176 gtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 11435077  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  11435076 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 11434983  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11434982 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatc 11434883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38409526 - 38409127
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409526 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38409427  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409426 gtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 38409327  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |         
T  38409326 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccattgtttcagccccctctatctccctctcaaagtttgct 38409227  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  38409226 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgccgccaacgcaccatc 38409127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22046697 - 22047089
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046697 gttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22046796  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046797 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 22046896  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |  |    
T  22046897 tgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttgctc 22046991  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22046992 c-gatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcact-aaaaatatgtttctgtttttccctgccagcacaccatc 22047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22044402 - 22044794
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22044402 gttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaaaaataa 22044501  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22044502 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggggaatcaacccacaaaccctag 22044601  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  22044602 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 22044695  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22044696 ctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcact-aaaaatatgtttctgtttttccctgccagcacaccatc 22044794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 37089383 - 37089779
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089383 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 37089482  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37089483 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 37089582  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |  |||    
T  37089583 tgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc---aagtttagc 37089679  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  37089680 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatc 37089779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51015567 - 51015174
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015567 gttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51015468  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015467 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 51015368  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  51015367 tgtttgttccgaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 51015274  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51015273 ctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactgaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgcaccatc 51015174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 11008579 - 11008933
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11008579 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccattacaaaga--aatcaatgggttacaagaataa 11008676  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008677 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 11008776  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11008777 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaat--ag 11008874  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  11008875 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 11008933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 31849610 - 31850004
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849610 gttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 31849709  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaacccta 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31849710 gtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctta 31849809  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     | |        
T  31849810 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-ct-----agtttgc 31849903  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31849904 tctgatacaagacctatatttctagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccat 31850003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5198742 - 5198348
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5198742 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 5198643  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  5198642 agtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaaaccta 5198543  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  5198542 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 5198449  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5198448 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccat 5198349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24889118 - 24888724
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  24889118 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacatgaata 24889019  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24889018 agtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaagccta 24888919  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |        
T  24888918 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct------aagtttgc 24888825  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24888824 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccat 24888725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7941645 - 7941247
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7941645 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 7941546  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941545 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 7941446  T
Q  200 gtg--tttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatag 297  Q
    |||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      |      
T  7941445 gtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctccc----ggttt 7941350  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacc 397  Q
       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    ||||||||||    
T  7941349 gctctgatacaacgtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgtcaccagcgcacc 7941250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9148574 - 9148201
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148574 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9148475  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9148474 gtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 9148375  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||| |         
T  9148374 tgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttcagccccctctatc----tctcaaagtttgct 9148279  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  9148278 ctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaatacgtttctgtt 9148201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22802745 - 22803138
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22802745 gttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 22802844  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22802845 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 22802944  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |     
T  22802945 atgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttac 22803038  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  22803039 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtttttgttattcgctgccagcgcaccat 22803137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 8631430 - 8631718
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8631430 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 8631529  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631530 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 8631629  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631630 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 8631718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 22132403 - 22132735
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132403 gttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22132502  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132503 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 22132602  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc---tctatctctctctcaaaatag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||| |      
T  22132603 tgtttgttc-gaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctctctctcaaagttt 22132701  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132702 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22132735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22800873 - 22801266
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22800873 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 22800972  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22800973 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 22801072  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |     
T  22801073 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttac 22801166  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  22801167 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgaaacaaatctgcactc-aaaatacgtttctgttatttgctgccggcgcaccat 22801265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24348540 - 24348211
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24348540 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 24348441  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348440 agtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 24348341  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  24348340 gtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 24348243  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348242 cttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24348211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 36919595 - 36919992
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  36919595 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactatatgatgaataacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaata 36919694  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36919695 agtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 36919794  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| ||||| |  |    
T  36919795 gtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctata----tctatcaaagttta 36919890  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36919891 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctactattcgctgccagcgcacca 36919990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 48486641 - 48486248
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  48486641 gttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatttcaatgtgttacaagaata 48486542  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48486541 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 48486442  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |     
T  48486441 gtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttac 48486348  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48486347 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcaccat 48486248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 49 - 400
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637873
Alignment:
Q  49 cactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaacca 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 5637623  T
Q  148 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637624 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 5637723  T
Q  248 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttgg 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |     || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5637724 tgcctttctaaactcttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttgctcttatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgg 5637821  T
Q  348 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5637822 aacaaatctgcac-ccaaaatacgtttctgtttttcgctgccagctcaccatc 5637873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47275047 - 47274655
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47275047 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 47274949  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47274948 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaacccta 47274849  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  ||    
T  47274848 gtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttag 47274756  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||    
T  47274755 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgccatcgcaccat 47274656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 9174157 - 9174551
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9174157 gttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 9174256  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9174257 gtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacgaacccta 9174356  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |      
T  9174357 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-c 9174450  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174451 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaaactgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 9174550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 36921504 - 36921900
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  36921504 gttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaata 36921603  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36921604 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 36921703  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    ||||||||| |  |    
T  36921704 gtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttca-ccccctcta----tctctcaaagttta 36921798  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||    
T  36921799 ctctgatacaaggtctatatttattgtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatacgtttctgttattcgctgccaatgcacca 36921898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 40091426 - 40091820
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40091426 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 40091525  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  40091526 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccata 40091625  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |     
T  40091626 gtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttac 40091719  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||| ||| ||| ||| |||||||    
T  40091720 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcactgaaaaatacgtttacgttattcgctgtcagtgcaccat 40091819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 2484884 - 2485160
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2484884 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2484983  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2484984 gtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccagaaaccctag 2485083  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2485084 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccct 2485160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 47 - 400
Target Start/End: Original strand, 3824627 - 3824978
Alignment:
Q  47 tccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaac 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3824627 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaac 3824726  T
Q  146 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 245  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824727 caatagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 3824826  T
Q  246 gttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaattt 345  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3824827 gttgcttttctaaacc--tgtttcagccccctctatctctctc-aaagaaatactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaattt 3824923  T
Q  346 ggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||    
T  3824924 ggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgtcgccaacgcaccatc 3824978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24880774 - 24880379
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24880774 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 24880675  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24880674 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaaccctcaaaccct 24880575  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||      |||| || |  |    
T  24880574 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagtttacgccccctcta------tctccaagttta 24880481  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24880480 ctccgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcacca 24880381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 18709175 - 18709507
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709175 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18709274  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18709275 gtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacaaaccctag 18709374  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctctcaaaataga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  |    
T  18709375 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagttta 18709474  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709475 gcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18709507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18847474 - 18847123
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847474 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18847376  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18847375 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactcta 18847276  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||| |        
T  18847275 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctcta------tctcaaagtttgt 18847182  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  18847181 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 18847123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 22134629 - 22134966
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134629 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22134727  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134728 gtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 22134827  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc---------ctctatctctctctca 291  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||    
T  22134828 tgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctctctctctctctca 22134926  T
Q  292 aaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134927 aagtttagcttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22134966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 22782749 - 22783109
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782749 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22782848  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782849 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 22782948  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc---aaaata 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    | ||     
T  22782949 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctctcttagat- 22783047  T
Q  297 gagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  22783048 tagcttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 22783109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24879312 - 24878917
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24879312 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 24879213  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24879212 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 24879113  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||      |||| || |  |    
T  24879112 ggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagtttcagccccctcta------tctccaagttta 24879019  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||    
T  24879018 ctcggatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcacccaaaaatacgtttctgttattcgatgccagcgtacca 24878919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 47210763 - 47211082
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47210763 gttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 47210862  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||    
T  47210863 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa------------cacaaacccta 47210950  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  47210951 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccctctcaaagtttag 47211050  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211051 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 47211082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 22780384 - 22780744
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780384 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22780483  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780484 gtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 22780583  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc---aaaata 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    | ||     
T  22780584 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctctcttagat- 22780682  T
Q  297 gagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  22780683 tagcttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 22780744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40637396 - 40637112
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40637396 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 40637297  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40637296 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 40637197  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637196 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 40637112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 44599849 - 44600133
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44599849 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 44599948  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599949 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 44600048  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600049 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 44600133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 9176485 - 9176837
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176485 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9176584  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176585 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 9176684  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |      
T  9176685 gtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-c 9176778  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||    
T  9176779 tttgatacaaggtctatatttatagtaaatgtcttgcttaaaaactgtaacaaatctgc 9176837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 17662256 - 17662574
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17662256 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 17662355  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17662356 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 17662455  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||| | |||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |        
T  17662456 gtgtttgtttcaaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttgc 17662542  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662543 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17662574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 16934154 - 16934506
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934154 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16934253  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16934254 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaacccta 16934353  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||      ||||||| |        
T  16934354 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctcta------tctcaaagtttgc 16934447  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  16934448 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 16934506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6765166 - 6764877
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6765166 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 6765067  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6765066 agtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 6764967  T
Q  200 gtgtttgttcc-----gaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6764966 gtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctc 6764877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 47868723 - 47868439
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47868723 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 47868624  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47868623 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 47868524  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  47868523 gtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccctctctatctc 47868439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 619459 - 619851
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  619459 gttcggtccaaattgacctagt-taggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttataagaata 619557  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  619558 attttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccctcaaacccta 619657  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |     
T  619658 gtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgttgtctttataaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttac 619751  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  619752 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgtttaaaatttggaaaaaatctctacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccat 619851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 16931800 - 16932152
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931800 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16931899  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16931900 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaacccta 16931999  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||      ||||||| |        
T  16932000 gtgtttgctcctaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctcta------tctcaaagtttgc 16932093  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  16932094 tttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 16932152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14633640 - 14633367
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14633640 gttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 14633541  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14633540 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 14633442  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14633441 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccc 14633367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 38928188 - 38928473
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  38928188 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaata 38928287  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38928288 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 38928387  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38928388 gtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctc 38928473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 12395856 - 12396140
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  12395856 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaata 12395955  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12395956 agtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 12396055  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12396056 gtgtttgttggctagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatctc 12396140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 26085988 - 26086236
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26085988 gttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaaacaatgggttacaagaataa 26086087  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26086088 gtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 26086187  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086188 tgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 26086236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16453632 - 16453345
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16453632 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 16453533  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16453532 aagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 16453433  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453432 agtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaactctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctc 16453345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 14787444 - 14787769
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagag--cagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||    
T  14787444 ggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaag 14787543  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14787544 tctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagt 14787643  T
Q  202 gtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcc 301  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |  ||      
T  14787644 gtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta----tctctcaaagtttagta 14787739  T
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787740 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 14787769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 12400818 - 12401102
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  12400818 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaata 12400917  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12400918 agtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 12401017  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12401018 gtgtttgttggccagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatctc 12401102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 33415499 - 33415782
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33415499 gttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 33415598  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33415599 agtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacctta 33415698  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33415699 gtgtttgttcc-aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 33415782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 53405455 - 53405124
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53405455 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagctctctgttccactatatgatgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 53405358  T
Q  100 ag------tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaa 193  Q
    ||      |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  53405357 agaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaa 53405258  T
Q  194 accctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaa 293  Q
    | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  53405257 aacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctcta--tctctctcaaa 53405162  T
Q  294 atagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405161 gtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 53405124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36378615 - 36378330
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  36378615 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatgagttacaagaat 36378516  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  36378515 aagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccct 36378416  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36378415 agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtctatctc 36378330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19096201 - 19095920
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19096201 ggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaattagtc 19096102  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19096101 tcccgcctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 19096002  T
Q  204 ttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19096001 ttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 19095920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 284
Target Start/End: Original strand, 37313080 - 37313361
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagt 102  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37313080 ggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagt 37313179  T
Q  103 ctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37313180 ctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaactctcaaaccctagtg 37313279  T
Q  203 tttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313280 tttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 37313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13543953
Alignment:
Q  10 aaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg 108  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 13544173  T
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  13544172 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgtt 13544074  T
Q  209 -ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatac 307  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |   || |  |||||||    
T  13544073 gccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttaca-tctgatac 13543975  T
Q  308 aaggtctatatttatagtaaaa 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  13543974 aagatctatatttatagtaaaa 13543953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 56030763 - 56030482
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaat--caatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||   |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||     
T  56030763 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaa-agaaatgtcaatgagttacaagaaa 56030668  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56030667 aagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 56030568  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56030567 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccttctatctc 56030482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 52942542 - 52942852
Alignment:
Q  72 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942542 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 52942628  T
Q  172 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 271  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942629 cccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 52942728  T
Q  272 ccccctctatctctctctcaaaatagagcctg--atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaata 369  Q
    |||       |||| ||||||| |  || |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  52942729 ccc-------ctctatctcaaagtttagtctgatatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcaccaaaaaata 52942821  T
Q  370 tgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  52942822 tgtttatgttattcgctgccagcgcatcatc 52942852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19323017 - 19322735
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  19323017 gttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaa 19322918  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19322917 taagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--caaaccc 19322820  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19322819 tagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcatccccctctatctc 19322735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Original strand, 18409364 - 18409631
Alignment:
Q  7 tccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtct 104  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  18409364 tccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatct 18409462  T
Q  105 cccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18409463 cccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcccgaaggttaatcaaccctcaaaccctagtgtt 18409562  T
Q  205 tgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 273  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409563 tgttgccaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 18409631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36380672 - 36380425
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||| |||||||||||    
T  36380672 gttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaat 36380573  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36380572 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 36380473  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 246  Q
    | || || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380472 aatggtttttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 36380425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41997814 - 41997530
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  41997814 gttcggtccaaattaacctagtct-ggggagagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaat 41997716  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41997715 aagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 41997616  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41997615 agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgtttcctttctgaacacttgtttcagccccctttatctc 41997530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 284
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937504
Alignment:
Q  94 agaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaa 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  194 accctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3937414 accctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctc 3937504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 398
Target Start/End: Original strand, 8756276 - 8756653
Alignment:
Q  15 gacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgccta 112  Q
    |||||||||| | |||||||||| |  || | ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  8756276 gacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtcta 8756375  T
Q  113 attctacccaaagtcccagcctcttcctgtaacc-aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |     
T  8756376 attctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgcc 8756473  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaag 310  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||      ||||||  |  |  ||||||||||    
T  8756474 aagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgttttcagccccttcta------tctcaaggtttactctgatacaag 8756565  T
Q  311 gtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  8756566 gtctatatttatagtaaaagtatcgtttataatttggaacaaatctgcaccgagaaatatgtttctgttattcgcctccagcgcacca 8756653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16455564 - 16455354
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | | ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  16455564 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 16455465  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16455464 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccct 16455365  T
Q  199 agtgtttgttc 209  Q
    |||||||||||    
T  16455364 agtgtttgttc 16455354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 284
Target Start/End: Original strand, 18537510 - 18537766
Alignment:
Q  26 ggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 123  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18537510 ggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaa 18537609  T
Q  124 agtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaact 223  Q
    |||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  18537610 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaact 18537706  T
Q  224 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18537707 ctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccccctctatctc 18537766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132911
Alignment:
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6132990 ttgttgccaatagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaacccttg-ttcagcctcctctatctc 6132911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11437684 - 11437557
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437684 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11437585  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437584 gtctcccgcctaattctacccaaagtcc 11437557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 38890235 - 38890476
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38890235 gttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 38890334  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||    
T  38890335 taagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatatgaatcaacc--ccaaccc 38890432  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 242  Q
    || |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38890433 taatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttt 38890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Original strand, 18534858 - 18535124
Alignment:
Q  16 acctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaa 113  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||| | ||||||||| | |||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534858 acctagtctgggggggagagcacccctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaa 18534957  T
Q  114 ttctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaa 213  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||    
T  18534958 ttctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaa 18535055  T
Q  214 gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18535056 gag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttttaaacacttgttttcagccccctctatctc 18535124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 5635487 - 5635614
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635487 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 5635586  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635587 agtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13547476 - 13547302
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||    
T  13547476 gttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaata 13547377  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547376 agtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2891614 - 2891433
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  2891614 gttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaac 2891515  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 180  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891514 aagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4215628 - 4215483
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4215628 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 4215529  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaac 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  4215528 agtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27499360 - 27499128
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  | | || |||| ||||||||||| ||||||| ||| || | | |||||||| ||||||||    
T  27499360 ggtccaaattgacctagtct-ggggaaagagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaa-agagat-attaggttacaaaaataagtc 27499264  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||  |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  27499263 tcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctcaggatgaatcaaccctcaaaccctagtgt 27499164  T
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagt 239  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499163 ttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 27499128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270281
Alignment:
Q  161 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 38270257  T
Q  261 ccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  38270258 ccttgtttcagcctcttctatctc 38270281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 15032558 - 15032831
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||  | |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15032558 gttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 15032657  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||         
T  15032658 taaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaatatgaatcaa-cctca----- 15032751  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
         |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15032752 -----tttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccccctttatctc 15032831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446874
Alignment:
Q  161 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaacccta-----gttgttgcctttctaaac 24446850  T
Q  261 ccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24446851 ccttgtttcagccccctctatctc 24446874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30136871 - 30136640
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||| | ||||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||| ||| || |||||||||    
T  30136871 ttcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttacaaaagagatatcgatgagtcacaagaata 30136772  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||  || |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  30136771 agtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaacccta 30136674  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaacc 234  Q
    ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  30136673 gtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12102411 - 12102221
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  12102411 gttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaa 12102312  T
Q  98 taagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 187  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||| |||  || ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12102311 taagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28453990 - 28453742
Alignment:
Q  16 acctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaa 113  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||||| ||||| |  |||||    
T  28453990 acctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaagtttacaagaattagtcttcaacctaa 28453891  T
Q  114 ttctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaa 213  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| || | ||    
T  28453890 ttctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttcttgccaa 28453793  T
Q  214 gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  28453792 gag-caaactc--tgcaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgttt 28453742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 16185845 - 16186018
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  16185845 gttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaagatatatcaaagggttgcaagaat 16185944  T
Q  99 aagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||| |   |||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16185945 aagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2891434 - 2891356
Alignment:
Q  205 tgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891434 tgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 2891356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9864007 - 9863765
Alignment:
Q  26 ggggagagagcagcactctgatccactata----tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctacc 120  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||    ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |   || |||||||||    
T  9864007 ggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagtaactttacaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctacc 9863908  T
Q  121 caaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaa 220  Q
    ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||| | |||| ||||    
T  9863907 caaagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggtgaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgccaaga-acaa 9863811  T
Q  221 actctatacaaaccctag-ttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  9863810 actc--tacaaaccctagtttttgtttttggc-ttctaaacccttgttt 9863765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 47150904 - 47151092
Alignment:
Q  2 ttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |  |||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  47150904 ttcggtccaatattgacctagtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaat 47151003  T
Q  99 aagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||| |   |||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47151004 aagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 47151092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5101035
Alignment:
Q  186 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctctatctc 5101035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10113177 - 10112927
Alignment:
Q  16 acctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatg-ggttacaagaataagtctcccgc-cta 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||| |    |||    
T  10113177 acctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattacaaagagatatcaaaaaggttacaagaattagtcttcaaatcta 10113078  T
Q  113 attctacccaaagtcccagcctcttcct-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    |||||||||||||||| |     
T  10113077 attctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttgcc 10112980  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  10112979 aagag-caaactc--tacaaaccctagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgttt 10112927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9022603 - 9022362
Alignment:
Q  26 ggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaat--gggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctaccc 121  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||| ||   |||||||| ||||    
T  9022603 ggggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaatagaggttacaagaattagtcttcaaacctaattcaaccc 9022504  T
Q  122 aaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaa 220  Q
    |||||| ||  ||||||| || ||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | |||| ||||||||||| | |||||   |    
T  9022503 aaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaagag---a 9022409  T
Q  221 actctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  9022408 attctctacaaaccctagttttgatgttgac-ttctaaacccttgttt 9022362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25357951 - 25357772
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||   |     
T  25357951 tgacctagtctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaact 25357852  T
Q  111 taattc----tacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||    || |||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25357851 taattctatatatccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaa 25357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 187
Target Start/End: Original strand, 31983564 - 31983727
Alignment:
Q  27 gggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaga-gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaa 123  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||    
T  31983564 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaa 31983663  T
Q  124 agtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 187  Q
    |||| ||  |||||||  | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31983664 agtctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5101250 - 5101130
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |  ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  5101250 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagatagcagccctccgttttactatatgatgagtaaatttacaaaagacatatcaatgggttacaagaata 5101152  T
Q  100 agtctcccgcctaattctaccc 121  Q
    ||||||| |||||| |||||||    
T  5101151 agtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 268
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999226
Alignment:
Q  31 gagagcagcactctgatccactatat-gatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtc 127  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| |   |||||||   |||||||||||||||||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtc 40999089  T
Q  128 ccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctat 227  Q
     |   ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    || |||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  40999090 tcgatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaatc--tcaatcctagtgtttgttgtcaagag-caaactctat 40999186  T
Q  228 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    |||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  40999187 acaacccctagttttcttgttgac-gtctaaacccttgttt 40999226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 3982186 - 3982374
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  3982186 gttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagtgttacaagaa 3982285  T
Q  98 taagtctcccgcct-aattctacccaaagtcccagc-ctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaat 183  Q
    | ||||| |   || |||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3982286 tcagtcttcaaacttaattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaat 3982374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 7050282 - 7050439
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  7050282 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 7050378  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050379 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11853705 - 11853549
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  11853705 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 11853609  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11853608 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Original strand, 9176836 - 9176901
Alignment:
Q  335 gcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176836 gctttaaatttataacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 9176901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15317114 - 15316961
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  15317114 tgacctagtct-ggggagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaattagtcttcaaac 15317019  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15317018 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15316961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 16689061 - 16689119
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16689061 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8529424 - 8529270
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||| ||||||| ||||| |   |    
T  8529424 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagtttcaagaatcagtcttcaaac 8529328  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8529327 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18587123 - 18586969
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || || |||||||  ||||| |   |    
T  18587123 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagtaacaagaaccagtcttcaaac 18587027  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18587026 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 18586969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31300580 - 31300427
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  31300580 tgacctagtct-ggggagagagcagccctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 31300485  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31300484 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 47563083 - 47563010
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  47563083 gttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaaccttacaaa 47563010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 4556180 - 4556238
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4556180 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4556238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4558372 - 4558314
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4558372 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16489505 - 16489352
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatg---atgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||    ||||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  16489505 tgacctagtctaggg-agagagcagctctccgttccactatattgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 16489410  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16489409 ctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 55822326 - 55822265
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55822326 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Original strand, 11008932 - 11008997
Alignment:
Q  335 gcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  11008932 gcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttttttgctgccagtgcaccatc 11008997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15831298 - 15831144
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||| ||||||| ||||| |   |    
T  15831298 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttccaagaatcagtcttcaaac 15831202  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15831201 ctaattctacgcaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15831144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10114505 - 10114412
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  10114505 accaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactc--tacaaaccctagtttt 10114412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18847111 - 18847059
Alignment:
Q  348 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18847111 aacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccccgcgagcgcaccatc 18847059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25699810 - 25699752
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25699810 cctaattctacc-aaagtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47566554 - 47566496
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47566554 cctaattctacccaaattcc-agtctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47566496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4570155 - 4570094
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4570155 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcgatcctaatagtgttt 4570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 171
Target Start/End: Original strand, 5336803 - 5336964
Alignment:
Q  12 attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgtt-acaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg- 108  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |  | || ||||||||| || |  || |||||||||| ||||| |       
T  5336803 attgacctactataggggagagagcagctctccgttccactataatgatgaatttcttttacaaagagatataagaggattacaagaattagtcttcaaa 5336902  T
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5336903 cctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54906852 - 54906722
Alignment:
Q  59 tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactca 156  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||   |  ||||||| || |||||||||||||    
T  54906852 tgagtaactttacaaagagatatcaaagagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacctaaagtcttgaatctcttccagtgaccaagagactca 54906753  T
Q  157 atcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54906752 attctaatagtgtttctccatggtgaatcaa 54906722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 24446678 - 24446754
Alignment:
Q  27 gggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagt 102  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24446678 gggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 24446754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 36769636 - 36769479
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  36769636 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 36769540  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36769539 ctaattttacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagaaactcgatcctaatagtgttt 36769479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 36771553 - 36771396
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  36771553 tgacctagtctggcgtagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 36771457  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36771456 ctaattctacccaa-gtcacagcctcttcccatgaccaagagactcaatcataatagtgttt 36771396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 13072102 - 13072160
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  13072102 cctaattctacccaaa-tcacagcctcttccagtgaccaagagactcaatcataatagtg 13072160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Original strand, 52043736 - 52043791
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||    
T  52043736 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctaaaaaattggaacaaatct 52043791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Original strand, 40999253 - 40999335
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttc 383  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||   || ||| ||| |||||||||||||    
T  40999253 ctgatataaggtttatatttatagtaaaaataacccttaaaatttggaacaaatctatcctgaaagatacgtttctgtttttc 40999335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4884922 - 4884877
Alignment:
Q  123 aagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4884922 aagtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15312473 - 15312319
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  15312473 tgacctagtctgggggagagaccagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 15312377  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  15312376 ctaattctacccaa-gtcacagcatcttcccgtgaccaagcgactcaatcctaatagtg 15312319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26557908 - 26557823
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttacaaagagaaatcaa 84  Q
    ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26557908 gttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttacaaagagatatcaa 26557823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25357663 - 25357585
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgct--taaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||  | |||||||| | |||||||    
T  25357663 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcgtaaaa-ttggaacaaatctgagcccaaaaatacgattctgtt 25357585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 26557614 - 26557535
Alignment:
Q  304 atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttc 383  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | || || |||| ||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||    
T  26557614 atacaaggtttatatttatagtaaaattatccctcaaaaattggaacaaatccatgcttaaaaatatgtttctatttttc 26557535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 49088893 - 49088791
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa--gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||   |||  |||||| ||||||||||    
T  49088893 gttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactatatgatgactaacattacaaaagaagatgtcaatgagttacaagaa 49088794  T
Q  98 taa 100  Q
    |||    
T  49088793 taa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4569979 - 4569902
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  4569979 ctgatacaaggcttatatttatagtgaaagtaacccttaaaatatggaacaaatcttcact-gaaaatacgtttctgtt 4569902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 14789439 - 14789473
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagag 35  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14789439 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 14789473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16638865 - 16638827
Alignment:
Q  133 ctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16638865 ctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16638827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16455356 - 16455323
Alignment:
Q  253 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16455356 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctctc 16455323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16638711 - 16638646
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaa 366  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| || |||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16638711 ctgatacaaggtttatatttttagaaagagtaacccttaaaatttggaacaaacctgcactgaaaa 16638646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 3578699 - 3578786
Alignment:
Q  17 cctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtct 104  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||    
T  3578699 cctagtctgggggagaga-cagctctccattccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaaatgttacaagaattagtct 3578786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28453714 - 28453686
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453714 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 28453686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 127
Target Start/End: Original strand, 38270120 - 38270148
Alignment:
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270120 aagtctcccgcctaattctacccaaagtc 38270148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 121)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28840947 - 28840552
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840947 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28840848  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840847 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 28840748  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    ||||||||| |         
T  28840747 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttcctttctaaacccttgtttcatccccctgta----tctctcaaagtttgct 28840652  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28840651 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatc 28840552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 51750307 - 51749917
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51750307 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 51750208  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750207 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 51750108  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |      
T  51750107 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-c 51750014  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcac 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  51750013 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcac 51749917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28842762 - 28842367
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842762 gttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28842663  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28842662 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacccacaaaccctag 28842563  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |         
T  28842562 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc----tctcaaagtttgct 28842467  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  28842466 ctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccaggacaccatc 28842367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15823814 - 15823420
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15823814 gttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgggttacaagaata 15823715  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823714 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 15823615  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      || |  |     
T  15823614 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctct------aagtttac 15823521  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  15823520 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatatgtttctgttatttgctgctagcgcaccat 15823421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20302726 - 20302333
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302726 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatctgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20302627  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20302626 gtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctag 20302527  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |         
T  20302526 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgct 20302433  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  20302432 ctgatacaaggtctatatttataataaaagtttcacttaaaatttggaacaaatatgcacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccatc 20302333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13762104 - 13761711
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13762104 gttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 13762005  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13762004 gtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagttgaatcaacccccaaaccctag 13761905  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||  | |       
T  13761904 tgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctctatctc-----caagtttg-ct 13761811  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  13761810 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcacaccatc 13761711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 10399841 - 10400235
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10399841 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 10399940  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10399941 agtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaacccta 10400040  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |      | |        
T  10400041 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctccc------agtttgc 10400134  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  10400135 tctgatacaaggtctatatttatagaaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttatttgctgccagcgcaccat 10400234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 27336953 - 27337280
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336953 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27337052  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337053 gtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 27337152  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  27337153 tgtttgttcctaagagacaaa-tctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttagc 27337249  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337250 ctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27337280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 31735534 - 31735863
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31735534 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaata 31735633  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735634 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 31735733  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||| |  ||    
T  31735734 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcattc--aaagtttag 31735831  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735832 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31735863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51752631 - 51752239
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752631 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51752532  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  51752531 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaat-ctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaacctag 51752433  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  51752432 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaagccctaattttgttgttacctttctaaactcttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 51752339  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||    
T  51752338 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgccgccagcgcaccatc 51752239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 9463257 - 9463588
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9463257 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaaggataa 9463356  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463357 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 9463456  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  9463457 gtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttag 9463556  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463557 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 9463588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 27339144 - 27339472
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339144 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27339243  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339244 gtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 27339343  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  27339344 tgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaagcccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttagc 27339441  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339442 ctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27339472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47906538 - 47906207
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47906538 gttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 47906439  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  47906438 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 47906339  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  47906338 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttag 47906239  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906238 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 47906207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6823282 - 6822889
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6823282 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaata 6823183  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823182 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 6823083  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  6823082 gt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 6822990  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||    
T  6822989 tctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacatttctattattcgccgccagcgcaccat 6822890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13215354 - 13214955
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaa----tcaatgggttacaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||    ||||||||||||||    
T  13215354 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatcaatgggttacaa 13215255  T
Q  95 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13215254 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 13215155  T
Q  195 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaa 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  13215154 ccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaaa 13215061  T
Q  295 tagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgc 394  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||  |||||| | |    
T  13215060 tttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttttgttatttgctgccaacac 13214961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 9459430 - 9459761
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9459430 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaaggataa 9459529  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459530 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 9459629  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  9459630 gtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttag 9459729  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459730 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 9459761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 46431719 - 46432066
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg--agagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431719 gttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat 46431818  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431819 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 46431918  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc---------------ctctatct 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||| |||    
T  46431919 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctacttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccatctctctctctctctctctct 46432018  T
Q  284 ctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432019 ctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 46432066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41647188 - 41646794
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  41647188 gttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaata 41647089  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |    
T  41647088 agtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccataaaaaccaa 41646989  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||| |  |     
T  41646988 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctcta------tctcaaagtttac 41646895  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  41646894 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatatgtttctgttattcgctgccagtgcaccat 41646795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 328
Target Start/End: Original strand, 21948226 - 21948526
Alignment:
Q  26 ggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 124  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948226 ggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 21948325  T
Q  125 gtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactc 224  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21948326 gtcccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc-aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactc 21948424  T
Q  225 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  21948425 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc--aaagtttagtatgatacaaggtctatatttatag 21948522  T
Q  325 taaa 328  Q
    ||||    
T  21948523 taaa 21948526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 15294847 - 15295137
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15294847 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 15294946  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15294947 aatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 15295046  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15295047 gtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctctatctctctctc 15295137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24325931 - 24325599
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24325931 gttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 24325832  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24325831 agtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacccacaaacccta 24325732  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctctcaaaatag 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |      
T  24325731 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttct-aacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagttt 24325633  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325632 gctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24325599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47179980 - 47179627
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179980 gttcggtccaatctgacctagtct-ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47179882  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179881 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 47179782  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |        
T  47179781 gtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttgc 47179684  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  47179683 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatct 47179627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2617784 - 2617500
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2617784 gttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 2617685  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2617684 agtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 2617585  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2617584 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctc 2617500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 38925494 - 38925885
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |  ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38925494 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgttttac--tatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 38925590  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38925591 agtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 38925690  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      ||||||| |  |     
T  38925691 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaactcttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttac 38925784  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  38925785 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaataaatctgcacccaaaaatacacttctgttgttcgctgccaacgccccat 38925884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16226435 - 16226085
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226435 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16226336  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226335 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 16226236  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||      ||||||| |        
T  16226235 gtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttttagacccctcta------tctcaaagtttgc 16226142  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  16226141 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatct 16226085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20291724 - 20291390
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || | ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291724 gttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactatatgatgagaatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20291625  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  20291624 gtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacttag 20291525  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||      |||||||||         
T  20291524 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatctccctcta------tctcaaaatttgct 20291431  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaa 341  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20291430 ctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaa 20291390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47177629 - 47177276
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177629 gttcgatccaatctgacctagtct-ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47177531  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactca-atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177530 gtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 47177431  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |        
T  47177430 gtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttgc 47177333  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  47177332 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatct 47177276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 2510338 - 2510666
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2510338 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaactttacaagagagaaatcaatgggttacaagaata 2510437  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  2510438 agtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 2510536  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  2510537 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttag 2510634  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510635 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2510666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 28207081 - 28207473
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  28207081 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat--gatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 28207178  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  28207179 agtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaactctcaaacccta 28207278  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  ||    
T  28207279 gtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttag 28207372  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  28207373 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaaaacgtttatgttattcgccgccagcgcaccat 28207472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39462787 - 39462392
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  39462787 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgaataacttttcaaaagagatatcaaagggttacaagaata 39462688  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  39462687 attctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaaccta 39462588  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||       ||||| ||||||| |  |     
T  39462587 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcatttctaaacctttgtttcagcc------ttctctatctcaaagtttac 39462494  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  39462493 tctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaaatacgtttctgttattcactgcaagcgcacca 39462394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 12302518 - 12302848
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||    
T  12302518 gttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttataagaata 12302617  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12302618 agtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 12302717  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |     
T  12302718 gtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttaca- 12302816  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302817 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 12302848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39932341 - 39932017
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctagggga-gagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39932341 ttcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaatt 39932242  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  39932241 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggttaatcaaccctcaaaaccta 39932142  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |   |    
T  39932141 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc----tctcaaagttttg 39932046  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
     || |||||||||||||||||||||||||    
T  39932045 tctcatacaaggtctatatttatagtaaa 39932017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 3579630 - 3580025
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | | ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3579630 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 3579728  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3579729 agtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaacccta 3579828  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     |||| ||||||| |  |     
T  3579829 gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgctgcctttctgaacccttgtttcagccccc----cctctatctcaaattttac 3579924  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || | ||| | |||||||||||||    
T  3579925 gctgatacaaggtctatatttaaagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactctaaaatacgtttatgatattcgccgccagcgcaccat 3580024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 17324649 - 17324932
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  17324649 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaata 17324748  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17324749 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 17324848  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17324849 gtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgttttagccccctgtatct 17324932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 14097982 - 14098376
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14097982 gttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 14098081  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14098082 aagtctcccgtctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactct 14098181  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||      ||||||| |  |    
T  14098182 agtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgtttcagtcccctcta------tctcaaagttta 14098275  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14098276 gtttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaac-aatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcacca 14098374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 4131388 - 4131678
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaa----tcaatgggttacaa 94  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||    
T  4131388 gttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaa 4131487  T
Q  95 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 194  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4131488 gaataagtttctcgcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccctcaaa 4131586  T
Q  195 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4131587 ccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaatccttgtttcagccccctctatctctc 4131678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6824088 - 6823758
Alignment:
Q  72 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaacc-------aagagactcaatcctaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||       |||||| |||||| ||||    
T  6824088 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgtaat 6823989  T
Q  165 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823988 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 6823889  T
Q  265 gtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaa 364  Q
    ||||||||||||     |||| ||||||| |     ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6823888 gtttcagccccc-----ctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaa 6823794  T
Q  365 aaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||    
T  6823793 aaatacgtttatgttattcgccgccagcgcaccatc 6823758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 50307559 - 50307844
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  50307559 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaata 50307658  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50307659 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 50307758  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  50307759 gtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttttttcagccccatatatctc 50307844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48665400 - 48665114
Alignment:
Q  47 tccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctg-taa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  48665400 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaa 48665301  T
Q  145 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48665300 ccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgt 48665201  T
Q  245 tgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||| ||  |  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48665200 tgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 48665114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18839856 - 18839571
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18839856 gttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 18839757  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18839756 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaccct 18839657  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839656 actgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctatctaaacccttgtttcagccccctctatctc 18839571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16428922 - 16428638
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16428922 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 16428823  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  16428822 aagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacctt 16428723  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428722 agtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 16428638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Original strand, 17186141 - 17186425
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  17186141 ttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaata 17186240  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17186241 agtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 17186340  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17186341 gtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctc 17186425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Original strand, 50078834 - 50079118
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50078834 ttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 50078933  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50078934 agtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 50079033  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50079034 gtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 50079118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18307377 - 18307093
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  18307377 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgcgtcacaagaat 18307279  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18307278 aagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccct 18307179  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307178 agtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 18307093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 6995713 - 6995997
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  6995713 gttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 6995812  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6995813 agtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaacccta 6995912  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6995913 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcggccccctctatctc 6995997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 2949245 - 2949528
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  2949245 gttcggtccaaattgacctagtcg-ggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 2949343  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  2949344 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaccccta 2949443  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949444 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 2949528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 28998266 - 28998550
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| | | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  28998266 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 28998365  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28998366 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 28998465  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28998466 gtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctctatctc 28998550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 29003982 - 29004266
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| | | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  29003982 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 29004081  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29004082 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 29004181  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29004182 gtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctctatctc 29004266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47451910 - 47451522
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag-cactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||     
T  47451910 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattc-gtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaa 47451812  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||         | || |||||||||||| ||||||||    
T  47451811 aagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaaaca------ctaatgtgaatcaaccctcaaaccct 47451718  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||      ||||||| |  |    
T  47451717 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattccaaacccttgtttaagccccctcta------tctcaaagttta 47451624  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  47451623 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaatatttggaacaaatctgcaccaaaaaatacgtttctgttattcgctgtcagcgcacca 47451524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 9241098 - 9241374
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  9241098 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 9241197  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9241198 aagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 9241297  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 276  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9241298 agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagccccc 9241374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25128141 - 25127848
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||| | | || |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||    
T  25128141 gttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgaattacaagaat 25128042  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25128041 aagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccct 25127942  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaa 292  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25127941 agtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaggcccctctatctctctctcaa 25127848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 25251287 - 25251572
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  25251287 gttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaat 25251386  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25251387 aagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccct 25251486  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25251487 agtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacctttgtttcagccccctctatctc 25251572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 50076685 - 50076969
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  50076685 gttcggtccaaattgacatagtct-ggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaat 50076783  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50076784 aagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 50076883  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  50076884 agtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccctttctatctc 50076969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 11457488 - 11457772
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11457488 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 11457587  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11457588 agtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 11457687  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||  ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11457688 gtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcagccccctctatctc 11457772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Original strand, 50248584 - 50248869
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcac--tctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  50248584 ttcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaat 50248683  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  50248684 aagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccct 50248783  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  50248784 agtgtttgttccaaagagacaaactctatataaatcatagttttgttgttgtctttttaaacctttgtttcagctccctctatctc 50248869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 31425028 - 31425316
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  31425028 gttcggtccaaattgacctagtat-ggggagagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 31425126  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagaga---ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31425127 aagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaac 31425226  T
Q  196 cctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31425227 cctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctc 31425316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6756796 - 6756514
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||   || | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6756796 gttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaa 6756697  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6756696 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaaga--ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 6756599  T
Q  198 tagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 281  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6756598 tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttcagtcccctctat 6756514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31490180 - 31489899
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | | ||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  31490180 gttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagccctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaata 31490082  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31490081 agtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacccta 31489982  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31489981 gtgtttgttccaaagagacaaa--ctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctc 31489899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Original strand, 31422940 - 31423171
Alignment:
Q  55 atgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagac 153  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  31422940 atgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 31423039  T
Q  154 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt-gttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31423040 tcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcct 31423139  T
Q  253 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423140 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 31423171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17319155 - 17318877
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  17319155 gttcggtccaaattgacctagtctaggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaataagttacaagaat 17319057  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  17319056 aagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatcct------gtttcccaaggtgaatcaaccttccaaccct 17318963  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318962 agtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 17318877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17324332 - 17324049
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17324332 gttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 17324233  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17324232 aagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 17324133  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17324132 agtgtttgttgccaagagacaaactctataaaaatc--agttttgttgtggcctttctgaacccttgttttagccctctctatctc 17324049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40134210 - 40133937
Alignment:
Q  4 cggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40134210 cggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataag 40134111  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||  ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40134110 tctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 40134011  T
Q  202 gtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 275  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40134010 gtttgttgccaagagacaaattctatacaaaccttcgttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccc 40133937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16231831 - 16231630
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231831 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16231732  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231731 gtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 16231632  T
Q  200 gt 201  Q
    ||    
T  16231631 gt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51757798 - 51757623
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51757798 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaagagaaatcgataggttacaagaataa 51757699  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757698 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23786107 - 23785935
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23786107 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23786008  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23786007 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 8347284 - 8347566
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8347284 gttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 8347383  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||     
T  8347384 taagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaacc--ctaacct 8347481  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    | ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8347482 tggtgtttgttgccaagag-caatctctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccccctctatctc 8347566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42922500 - 42922219
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||  ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42922500 gttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 42922401  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    |||||    
T  42922400 taagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaacc--tcaaccc 42922303  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42922302 tagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaaccccctctatct 42922219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 15669419 - 15669648
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669419 tgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 15669518  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |     
T  15669519 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgcc 15669616  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 244  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15669617 aagag-caaactttatacaaaccctacttttgt 15669648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 14183603 - 14183883
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  14183603 gttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaa 14183702  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | | |  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||    
T  14183703 taagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccc 14183800  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14183801 tagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagttt--gtgttg-cattctaaacccttgtttcagccctctctatctc 14183883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 25248564 - 25248766
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25248564 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 25248663  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25248664 aagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 25248763  T
Q  199 agt 201  Q
    |||    
T  25248764 agt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16432664 - 16432396
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16432664 gttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 16432565  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16432564 taattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 16432465  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 277  Q
    ||||||||||  | |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16432464 tagtgtttgtcgccaagagac-----------aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttctgccccct 16432396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16429225 - 16429042
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16429225 ttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 16429126  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16429125 agtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaagttgaat 16429042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 6115115 - 6115304
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  6115115 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaattggttacaagaat 6115214  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6115215 aagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttttcaaggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 8349077 - 8349345
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 111  Q
    |||| |||||| ||||||||| || | ||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8349077 tgacatagtcttggggagagaacaaccctctattccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcct 8349176  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| |     
T  8349177 aattctacctaaagtcctaatctcttcccgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgttgcc 8349274  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8349275 aagag-caaactctatacaaaccttaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccctctctatctc 8349345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Original strand, 18800600 - 18800907
Alignment:
Q  16 acctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaa 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18800600 acctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaa 18800699  T
Q  114 ttctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaa 213  Q
    ||||||||||||| | |  |||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| |||||  | ||    
T  18800700 ttctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaacccc--aaccctagtatttgtggccaa 18800797  T
Q  214 gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtc 313  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||      ||  |  |  |||||||||||||    
T  18800798 gag-caaactctatacaaaccgtagttttcttgttgactt-ctaaacctttgtttcagccccttgtatctc------aaggtttactctgatacaaggtc 18800889  T
Q  314 tatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18800890 tatatttatagtaaaagt 18800907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23816154 - 23816027
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23816154 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 23816055  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816054 agtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 49495223 - 49495496
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||| ||  | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49495223 gttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 49495322  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | || ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |   |||| |    
T  49495323 gagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtgaatcaactc---aaccat 49495419  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49495420 agtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaaccctagttt--------gatttataaacccttgtttcagccccctctatctc 49495496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 400
Target Start/End: Original strand, 30790459 - 30790801
Alignment:
Q  47 tccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgta 143  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |   ||||||  |||    
T  30790459 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgta 30790558  T
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttg 243  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |    |  ||||| || |||||   ||||||||||||      
T  30790559 accaaaagactca-tcctaacagtgtttcccaaggtaaatcaacc-acaa-ccctagtgtctccctcttagaga-aatctcta---aaaccctagtttat 30790651  T
Q  244 ttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaa 342  Q
    |  |||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||      ||  |  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30790652 tgtttg--tttctaaactcttgttttcagctccctctatctc------aaggtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaa 30790743  T
Q  343 tttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  30790744 tttggaacaaatctgcactgaaaaatacgtttatgtttttcccctccagcgcaccatc 30790801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 13125495 - 13125746
Alignment:
Q  26 ggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctaccca 122  Q
    |||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  13125495 ggggggagagcaactctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctaccca 13125594  T
Q  123 aagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaac 222  Q
    ||||||||  |||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  13125595 aagtcccaatctcttcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgtcgccaagag-caaac 13125691  T
Q  223 tctata-caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 277  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  13125692 tctataccaaaccctagtttccttgttggc-ttcttaacccttgtttcagccccct 13125746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27916765 - 27916500
Alignment:
Q  2 ttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatat-gatgagtaacgttacaaagagaaatcaatg--ggttacaagaa 97  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||    
T  27916765 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttacaaagagatatcaaagaaggttaaaagaa 27916666  T
Q  98 taagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    | ||||| |   |||||||| |||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    | ||||    
T  27916665 ttagtcttcaaacctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaatcaa--ttccaacc 27916568  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  27916567 ctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagttttcttgctggc-ttctaaacccttgttt 27916500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Original strand, 26520206 - 26520415
Alignment:
Q  80 atcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcc------tgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||  |||||||      ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26520206 atcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 26520305  T
Q  173 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 271  Q
    ||||||||||||||||    || | ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  26520306 ccaaggtgaatcaacc--tcaatcttagtgtttgttgccaagag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaaccgttgttttcag 26520401  T
Q  272 -ccccctctatctc 284  Q
     |||||||||||||    
T  26520402 cccccctctatctc 26520415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 26613265 - 26613440
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||    
T  26613265 tgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacc 26613364  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26613365 taattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 186
Target Start/End: Original strand, 30738695 - 30738830
Alignment:
Q  53 atatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaaga 150  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||    
T  30738695 atatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaaga 30738794  T
Q  151 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30738795 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16561737 - 16561544
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | || || |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  16561737 gttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 16561638  T
Q  98 taagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 190  Q
    ||||||| |   |||| |||||||||||||| ||  || || | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561637 taagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 16561544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155788
Alignment:
Q  12 attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||| | ||| |   |    
T  155963 attgacctagttt-ggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaac 155865  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155864 ctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 21353373 - 21353525
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cct 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |||    
T  21353373 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacct 21353469  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21353470 aattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16231641 - 16231517
Alignment:
Q  228 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaa 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||| |      ||||||||||||||||||||||||||    
T  16231641 acaaaccctagttttcttgttgcttttctagacccttgtttcagccccctctatctc------aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaa 16231548  T
Q  328 aagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  16231547 aagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 16231517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 284
Target Start/End: Original strand, 25248756 - 25248811
Alignment:
Q  229 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248756 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 25248811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 49687496 - 49687414
Alignment:
Q  318 tttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  49687496 tttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgtcagcgcaccatc 49687414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 2401246 - 2401400
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  2401246 tgacctagtctgggggagagagaagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 2401342  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2401343 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2401400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28279489 - 28279292
Alignment:
Q  47 tccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgta 143  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||     
T  28279489 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtg 28279390  T
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 242  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||   ||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  28279389 accaagaagctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgtcaagag-caaactc--tacaaaccctaatttt 28279295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2232747 - 2232597
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-ccta 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    ||||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||||    
T  2232747 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccacga----atgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaaccta 2232655  T
Q  113 attctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2232654 attctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13358841 - 13358778
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagta 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  13358841 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgaagagta 13358778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 268
Target Start/End: Original strand, 26332719 - 26332836
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttg 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  26332719 accaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaacc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctatttttg 26332813  T
Q  244 ttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  26332814 -tgttggc-ttctaaacccttgttt 26332836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9526527 - 9526469
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9526527 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 9526469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25134132 - 25134074
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25134132 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 4144804 - 4144865
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4144804 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15916660 - 15916562
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaa-ttgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgtta-caaagagaaatcaatgggttacaaga 96  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15916660 gttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaatgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9521776 - 9521718
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  9521776 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 9521718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Original strand, 26332613 - 26332688
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26332613 taattctacacaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43104384 - 43104245
Alignment:
Q  47 tccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataag-tctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgt 142  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||  ||| |   ||||||||||||||||||  ||   |||||||||    
T  43104384 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaaaaaaatcttcaaacctaattctacccaaagtttcaatgtcttcctgt 43104285  T
Q  143 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 182  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43104284 gaccaaaagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 43104245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14353187 - 14353047
Alignment:
Q  47 tccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaa 144  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||| | |  ||||| | || |    
T  14353187 tccactataatgatgaataactttacaaa-agatttcaaagggttacaagaata-gtttcaaacctaattctacccaaagtctcgaatctctttccgtga 14353090  T
Q  145 ccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353089 ccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43104132 - 43104051
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgct-taaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  43104132 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcaaaaaactggaacaaatctaagcccaaaaatatgtttctgtttt 43104051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 13127790 - 13127917
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttg 243  Q
    ||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| | || ||  |||||||||| |||||||| ||||     
T  13127790 accaagagacttaattccaacaatgtttcccaaggtgaatctatc--ccaaccctagtgtttgttgccaaaag-gaaactctatataaaccctacttttc 13127886  T
Q  244 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 275  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  13127887 ttgttggc-ttctaaacccttgtttcaacccc 13127917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 331
Target Start/End: Original strand, 13449833 - 13449886
Alignment:
Q  276 ctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13449833 ctctctctctctctcaaaatag--cctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 13449886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23783523 - 23783467
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  23783523 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 23783467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 168
Target Start/End: Original strand, 2393404 - 2393461
Alignment:
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2393404 ctaattctacccaa-gtcccagactattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2393461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14997101 - 14997040
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14997101 cctaattctacccaa-gtctcaatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 284
Target Start/End: Original strand, 6115344 - 6115376
Alignment:
Q  252 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115344 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 6115376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Original strand, 2401493 - 2401568
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagta-aaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttc 375  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  2401493 ctgatacaaggcttatatttatagtggaaagtatcccttaaaatatggaacaaatcttcactgaaaaatacgtttc 2401568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Original strand, 26613548 - 26613603
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||| |||||||||||||    
T  26613548 ctgatacaaggtctatatttatagcaaaagaatccctcaaaaattggaacaaatct 26613603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 49959172 - 49959129
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49959172 accaagagactcattcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 49959129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27916469 - 27916415
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||    
T  27916469 tgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctccaaaattggaacaaatct 27916415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Original strand, 31422875 - 31422917
Alignment:
Q  3 tcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctg 45  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  31422875 tcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctg 31422917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 46783010 - 46782944
Alignment:
Q  316 tatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgttttt 382  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||| |   |||||||||||    
T  46783010 tatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatatgcacttaaaagtgcatttctgttttt 46782944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 49959017 - 49958963
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||||||||||||||    
T  49959017 ctgatacaaggtctatatttatagcaaaagcatcccacaaaatttggaacaaatc 49958963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 9476276 - 9476329
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat 54  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  9476276 gttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 9476329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16231518 - 16231454
Alignment:
Q  335 gcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||    
T  16231518 gcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttt-tatttttatccgccagcgcaccatc 16231454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 29651826 - 29651879
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat 54  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29651826 gttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactat 29651879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42922207 - 42922151
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgctta-aaatttggaacaaatct 356  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  42922207 ctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaatct 42922151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 46783281 - 46783189
Alignment:
Q  36 cagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagt 126  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||    
T  46783281 cagctctctgttccactataatgatgagtttctttacaaaaagatatcaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagt 46783189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 101)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27105041 - 27104649
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105041 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaatgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27104942  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104941 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 27104842  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||| |         
T  27104841 t-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagttttct 27104749  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27104748 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttatgtttttccctgccagcgcaccatc 27104649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 13910056 - 13910449
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910056 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 13910155  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13910156 gtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaacccataaaccctag 13910255  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  13910256 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 13910349  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13910350 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatc 13910449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42064759 - 42064365
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaatt-gacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064759 gttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata 42064660  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064659 agtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 42064560  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||  | |      
T  42064559 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctc-----caagtttg-c 42064466  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42064465 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactaaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccat 42064366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 19504357 - 19504750
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19504357 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 19504456  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19504457 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccaacaaaccctt 19504555  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |      
T  19504556 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-c 19504649  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||   |||||||||||||    
T  19504650 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatgtgtttctgttattcgtcgccagcgcaccat 19504749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 21520704 - 21521100
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  21520704 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaatt 21520803  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21520804 agtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaacccta 21520903  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |  ||    
T  21520904 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccatctatctctc----aaagtttag 21520999  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  21521000 tctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaattttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcaccat 21521099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 19502022 - 19502416
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19502022 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 19502121  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502122 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 19502221  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     |||  | |      
T  19502222 gtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatctc-----caagtttg-c 19502315  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  19502316 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaattttcccttaaaatttggatcaaatctgcaaccaaaaatatgtttctgttattcgtcgccagcgcaccat 19502415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 23452248 - 23452577
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23452248 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 23452347  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23452348 agtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaacccta 23452447  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |  ||    
T  23452448 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc--tgtctctctcaaagtttag 23452545  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452546 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 23452577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 40032064 - 40032463
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaa----tcaatgggttacaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| | | ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||    ||||||||||||||    
T  40032064 gttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatcaatgggttacaa 40032163  T
Q  95 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40032164 gaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 40032263  T
Q  195 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaa 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||     
T  40032264 ccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaag 40032357  T
Q  295 tagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgc 394  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  40032358 tttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaacttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgc 40032457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 376
Target Start/End: Original strand, 24162235 - 24162593
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162235 ttcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtagcattacaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 24162334  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162335 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagc----------aaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 24162424  T
Q  202 gtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |     |    
T  24162425 gtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctc 24162518  T
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttct 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24162519 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 24162593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 35215597 - 35215932
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35215597 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 35215696  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215697 gtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 35215796  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----tctctcaaaat 295  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |    
T  35215797 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagt 35215896  T
Q  296 agagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215897 ttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 35215932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42453024 - 42452743
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42453024 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 42452926  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42452925 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactcta 42452826  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452825 gtgtttgttac--agagacaaactttatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 42452743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 284
Target Start/End: Original strand, 45279999 - 45280280
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45279999 ggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc 45280098  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  45280099 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggtgaatcaaccctctaaacctagtgt 45280198  T
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc-ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280199 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 45280280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 6258828 - 6259220
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6258828 gttcggtccaaattgacctagtat-ggggagagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 6258926  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6258927 aagtctcccacctaattctacccaaagccccaa--tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 6259024  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||      ||||||| |  |    
T  6259025 agtgtttattccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaaactcttgtttcatcctcctcta------tctcaaagttta 6259118  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  6259119 gtctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaagtctgcacccaaaaatatgtttctgttattcaccgccagcgcacca 6259218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 35217974 - 35218313
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35217974 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaacgggttacaagaataa 35218073  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218074 gtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 35218173  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--------tctctctctca 291  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  35218174 gtgtttgctcctaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctctctca 35218273  T
Q  292 aaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218274 aagtttagccttatacaaggtctatatttatagtaaaagt 35218313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 22287347 - 22287740
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  22287347 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacgggttacaagaata 22287446  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22287447 agtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 22287546  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||| |  |     
T  22287547 atgtttgttccaaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctata------tctcaaagtttac 22287640  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  22287641 tttaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcacccaaacatacatttttgttattcgctgccagcgcaccat 22287740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 6264159 - 6264529
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6264159 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 6264258  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||  || ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6264259 aagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 6264358  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      ||||||| |  |    
T  6264359 agtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaaccc----tttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctcta------tctcaaagttta 6264448  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6264449 gtctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtt 6264529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 43623591 - 43623972
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43623591 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 43623690  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43623691 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 43623790  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |      | |  |     
T  43623791 gt------------gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcacccccctctatctccc------agtttac 43623872  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  43623873 tctgatacaaggtctatttttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaatacgtttatgttatttgctgccagcgcaccat 43623971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19007884 - 19007600
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19007884 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 19007785  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19007784 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaacccta 19007685  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007684 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccataattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 19007600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 42923520 - 42923806
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  42923520 gttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactatatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaata 42923619  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42923620 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 42923719  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42923720 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcctcctctatctctc 42923806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 11739570 - 11739855
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||| || |||||||    
T  11739570 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatggattccaagaat 11739669  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11739670 aattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 11739769  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11739770 agcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtctttctaaacccttgttccagccccctctatctc 11739855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28196871 - 28196597
Alignment:
Q  11 aattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgc 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |  | | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28196871 aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgc 28196772  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 209  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||     
T  28196771 ctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgttg 28196672  T
Q  210 cgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28196671 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctctatctc 28196597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239275
Alignment:
Q  13 ttgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgctt 45239099  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    ||||||||| |||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  45239100 aattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc 45239199  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 288  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  45239200 aa-agagaaagtctatacaaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttcagccccctctatctctctc 45239275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17848684 - 17848403
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||   || | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  17848684 gttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaata 17848586  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  17848585 agtctcccgcct---tctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaacccaa 17848489  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17848488 gtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctcgtttgagccccctctatctc 17848403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 284
Target Start/End: Original strand, 31732789 - 31733060
Alignment:
Q  3 tcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | | ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31732789 tcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 31732888  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  31732889 gtctcccacctaattctacccaaagtccca------------aaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccttag 31732976  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732977 tgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 31733060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 34979588 - 34979874
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggag-agagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| | |||| ||| ||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  34979588 gttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttacaaaagagatataaatggattacaagaa 34979687  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34979688 taagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 34979787  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34979788 tagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttcagccccctctatctc 34979874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17849356 - 17849077
Alignment:
Q  6 gtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | | | | |||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17849356 gtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagc-ccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtc 17849258  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17849257 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 17849158  T
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    || |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849157 ttcttccaaagaggcaaactctatacgaactctagttttgttgttatctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 17849077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3022416 - 3022123
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata----------tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggtt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | || ||||          ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  3022416 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattataacgatgataatgatgagtaactttataaagagatattaatgggtt 3022317  T
Q  91 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3022316 acaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccct 3022217  T
Q  191 caaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3022216 caaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttataaacccttgtttcagcctcctatatctc 3022123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Original strand, 15539566 - 15539770
Alignment:
Q  80 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15539566 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggt 15539665  T
Q  180 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |    
T  15539666 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcaaccccctat 15539765  T
Q  280 atctc 284  Q
    |||||    
T  15539766 atctc 15539770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 381
Target Start/End: Original strand, 18800349 - 18800688
Alignment:
Q  26 ggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 123  Q
    |||||||||| ||| ||| | | ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18800349 ggggagagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaa 18800448  T
Q  124 agtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaact 223  Q
    || ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  18800449 agccccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caacct 18800544  T
Q  224 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttata 323  Q
    ||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||||||| ||      |||| |  |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  18800545 ctatacaaaccctagctt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctata------tctccatgtttaccctgatacaaggtctatatttata 18800630  T
Q  324 gtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttt 381  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18800631 gtaaaagtatcgtttaaaatttggaacaaatctgcacttaaaaatatgtttctgtttt 18800688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14837512 - 14837233
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  14837512 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 14837413  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||  |||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14837412 aagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttcc------caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 14837319  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14837318 agtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaaccctagttttgttgttgtcttttttaacccttgtttcagctccctctatctc 14837233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 44289078 - 44289360
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |  |||| | ||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  44289078 gttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacgggttacaagaat 44289177  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||| | || | ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44289178 aagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 44289277  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 281  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||    
T  44289278 agtgtttgttgccaagagacagactctatacaaactctagttttgttgttgccttcctaaacctttgttttagtcccctctat 44289360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 5375357 - 5375550
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5375357 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 5375456  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5375457 agtctcc-gcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 330
Target Start/End: Original strand, 11578136 - 11578439
Alignment:
Q  18 ctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatt 115  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11578136 ctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaatt 11578235  T
Q  116 ctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaga 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||  ||||||| | ||||    
T  11578236 ctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaacc--ccaacccta--gtttgttgccaaga 11578331  T
Q  216 gacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtcta 315  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||      |||||| ||  | ||||||| ||||||||    
T  11578332 gaaaaattctatacaaaccctagtttttttgttgac-ttctaaacccttgtttcagcccactcta------tctcaagatttaccctgatataaggtcta 11578424  T
Q  316 tatttatagtaaaag 330  Q
    |||||||||||||||    
T  11578425 tatttatagtaaaag 11578439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 171 - 400
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407814
Alignment:
Q  171 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 22407690  T
Q  271 gccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatat 370  Q
    || |||| ||      ||||| | |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  22407691 gcaccctata------tctcacagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaattttgaacaaatctgcacccaaaaatac 22407784  T
Q  371 gtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  22407785 gtttctgttattcgctgccaacgcaccatc 22407814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 36558875 - 36559047
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36558875 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 36558974  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36558975 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 36561152 - 36561324
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561152 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 36561251  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36561252 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38020349 - 38020161
Alignment:
Q  87 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||         |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38020349 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccc---------caata-ccaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaa 38020260  T
Q  187 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 285  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020259 ccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 38020161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22874374 - 22874102
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  22874374 ttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaata 22874275  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| ||    
T  22874274 agtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgttttccaaggtgaatcaaccc---aaccata 22874178  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22874177 gtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 22874102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 45332192 - 45332364
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45332192 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactatatgatgagtacctttacaaagagaaatcaatgggttacaataataa 45332291  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45332292 gtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20146618 - 20146884
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  20146618 gttcggtccaatactgacttagtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttacaagaa 20146717  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  | ||||     
T  20146718 taagtctcccgcctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaacca 20146815  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  20146816 tagtgtttgttgccaag-ggcaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttt 20146884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 28459201 - 28459435
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28459201 gttcgatccaaattgacctagtctaggt-agagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaat 28459299  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||    
T  28459300 aagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttgccaaggtgaatccaccctcaaatcct 28459399  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaacc 234  Q
    ||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  28459400 agtttttgttgccaagagacaagctctatacaaacc 28459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 147 - 284
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163242
Alignment:
Q  147 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22163106 aagagactcaa-cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttg 22163204  T
Q  247 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22163205 ttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatctc 22163242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 267
Target Start/End: Original strand, 17897270 - 17897519
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaag-agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || | || |||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17897270 tgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaataagtctcccgcct 17897368  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    |||||||| |||| || ||  || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||| ||    
T  17897369 aattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-tctcaa--cctagtgtttgttgcg 17897465  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  17897466 aagag-caaactctatacaaaccctagttttattgttgac-ttctaaacccttgtt 17897519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 22407465 - 22407595
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22407465 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 22407564  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtccca 130  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22407565 agtctcccccctaattctaccaaaagtccca 22407595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Original strand, 5377631 - 5377728
Alignment:
Q  191 caaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 288  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5377631 caaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctctctc 5377728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40699606 - 40699429
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||| |   ||    
T  40699606 tgacctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataagtcttcaaacc 40699507  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 188  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40699506 taattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 7462958 - 7463077
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaa-ttgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7462958 gttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaat 7463057  T
Q  99 aagtctcccgcctaattcta 118  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7463058 aagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17943692 - 17943540
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cct 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |||    
T  17943692 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaattagtcttcaaacct 17943596  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17943595 aattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43139606 - 43139356
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cct 111  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||  |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||   | |||    
T  43139606 tgacctagtatagggaaaagaacagtcctctgtaccactataatgatgagtaactttacaaagagaaatcaaaaggttacaataattagtctttagacct 43139507  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    ||||||||| |||||| ||   |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||| |     
T  43139506 aattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttgcc 43139409  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  43139408 aagag-caaactc--tacaaacccaagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgttt 43139356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35107427 - 35107181
Alignment:
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 209  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||    ||||||||     
T  35107427 ctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaatcaatcc-caaccc----tgtttgttg 35107333  T
Q  210 cgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt-gtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgataca 308  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||| || |       |||||  |||||  |  |   |||||||    
T  35107332 ccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaactcttggttttagac-------tctctacctcaaggtttactatgataca 35107242  T
Q  309 aggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaata 369  Q
    | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35107241 atgtctatatttatagtaaaagtatcccttaaaatttggaacaaatctgcattgaaaaata 35107181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 22707762 - 22707872
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtct--aggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22707762 gttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 22707861  T
Q  98 taagtctcccg 108  Q
    |||||||||||    
T  22707862 taagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136368
Alignment:
Q  60 gagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaa 157  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||   |||| | || ||||||||| ||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaa 27136294  T
Q  158 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaacc 234  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||    
T  27136295 tcctaatagtgttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caagctctatataaacc 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 201
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414291
Alignment:
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttcc-gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 37962952 - 37963222
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||||| |||  | ||| | ||||||| |||||| |||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  37962952 gttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaaa--aatcaatggattacaagaata 37963049  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||  ||||||  || ||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||| |   |||| |     
T  37963050 agtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaaggggaatcaacac---aaccatg 37963146  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||   ||||| |||||| || ||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37963147 gtgtttgttgtcaagag-caaactatacacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 37963222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2736361 - 2736205
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  2736361 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 2736265  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2736264 taattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20589881 - 20589763
Alignment:
Q  55 atgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagaga 152  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||    
T  20589881 atgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaga 20589782  T
Q  153 ctcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  20589781 ctcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17921833 - 17921754
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17921833 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 17921754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23871054 - 23870951
Alignment:
Q  7 tccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctc 105  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  23871054 tccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaagaataagtctg 23870955  T
Q  106 ccgc 109  Q
    ||||    
T  23870954 ccgc 23870951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17462592 - 17462436
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  17462592 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---aggagtttcaagaatcagtcttcaaacc 17462496  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462495 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39687139 - 39686983
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  39687139 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 39687043  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39687042 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 22163033 - 22163106
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 74  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22163033 gttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 27517664 - 27517818
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  27517664 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 27517760  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27517761 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15694094 - 15693958
Alignment:
Q  55 atgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagc-ctcttcctgtaaccaagag 151  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  15694094 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctcttcctgtgaccaagag 15693995  T
Q  152 actcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaac 187  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15693994 actttatcctaatagtgtttctccacggtgaatcaac 15693958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 20054790 - 20054947
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  20054790 tgacctagtctggtggagagagcagctctccgatctactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 20054886  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054887 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 381
Target Start/End: Original strand, 28462592 - 28462671
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttt 381  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  28462592 ctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcact-gaaaatatgtttctatttt 28462671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2741097 - 2740941
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| |||||     ||    
T  2741097 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtctttaaacc 2741001  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741000 taattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 22712637 - 22712698
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22712637 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 22717346 - 22717407
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22717346 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38020157 - 38020103
Alignment:
Q  230 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38020157 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttccaaccccctctatctc 38020103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 45567470 - 45567409
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45567470 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 12781342 - 12781400
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12781342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 12781400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17932695 - 17932637
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17932695 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Original strand, 27583483 - 27583535
Alignment:
Q  133 ctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 185  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27583483 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 27583535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 37170873 - 37170931
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  37170873 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 37170931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39680106 - 39680045
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39680106 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26345738 - 26345661
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 187  Q
    ||||||||||||||||| | |  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26345738 taattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30479151 - 30478997
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||| ||||||| ||||| |   |    
T  30479151 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatctactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagtttcaagaatcagtcttcaaac 30479055  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  30479054 ctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 30478997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 36559082 - 36559138
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  36559082 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 36559138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 36561359 - 36561415
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  36561359 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 36561415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38191045 - 38190997
Alignment:
Q  123 aagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191045 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35028528 - 35028473
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||    
T  35028528 ctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctaaaaaattggaacaaatct 35028473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 13828352 - 13828458
Alignment:
Q  1 gttcggtcca-aattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||| || ||||||||  |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  13828352 gttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatcaaagggctacaagaa 13828451  T
Q  98 taagtct 104  Q
    |||||||    
T  13828452 taagtct 13828458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 20050046 - 20050204
Alignment:
Q  14 tgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg- 108  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |       
T  20050046 tgacctagtctggggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 20050142  T
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||| || |||| |||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20050143 cctaattatatccaa-gtcctagcctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20050204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45156999 - 45156946
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatc 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||    
T  45156999 tgatataaggtctatatttatagtaaaagcatccctcaaaatttggaacaaatc 45156946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 33603870 - 33603791
Alignment:
Q  304 atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaaatatgtttctgtttttc 383  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || | || ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  33603870 atacaaggtttatatttatagtaaaagtatccctaacaaattggaacaaatct-cacgctgaaaatatgtttctgtttttc 33603791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 284
Target Start/End: Original strand, 38414281 - 38414330
Alignment:
Q  229 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  38414281 caaaccctagttttgttgttgcctttctaa------gtttcagccccctctatctc 38414330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 186
Target Start/End: Original strand, 34575265 - 34575308
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34575265 accaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 34575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40699259 - 40699180
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgctta-aaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  40699259 ctgatgcaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcagaaaattggaacaaatctcagcccaaaaatatgattctgtt 40699180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 165
Target Start/End: Original strand, 41303155 - 41303210
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaata 165  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41303155 taattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagacttaatcctaata 41303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 172
Target Start/End: Original strand, 10942634 - 10942696
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10942634 taattctacccaaagtcccgaatttcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgtttc 10942696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 172
Target Start/End: Original strand, 10948503 - 10948565
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10948503 taattctacccaaagtcccgaatttcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgtttc 10948565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 331
Target Start/End: Original strand, 17897548 - 17897578
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897548 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17897578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7503052 - 7502975
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtcccagc-ctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7503052 taattctacccaaagtctcaaatctcttcccttgaccaagatactcaatcctaatagtgtttctccaaggtggatcaa 7502975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 17490159 - 17490192
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 34  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17490159 gttcggtccaaattgacctactctaggggagaga 17490192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20589610 - 20589581
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589610 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 20589581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Original strand, 33670992 - 33671033
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata 55  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33670992 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 33671033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 41304627 - 41304667
Alignment:
Q  227 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41304627 tacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgttt 41304667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 331
Target Start/End: Original strand, 45332399 - 45332428
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45332399 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 45332428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 45679879 - 45679838
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata 55  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  45679879 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 45679838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Original strand, 30720771 - 30720811
Alignment:
Q  147 aagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30720771 aagagactcaatcctaatagtgtttctccaagatgaatcaa 30720811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 150)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5191899 - 5191507
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5191899 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagaacagccctctgatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaatga 5191801  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191800 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 5191701  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  |   ||    
T  5191700 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtt--tgc 5191608  T
Q  301 ct-gatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5191607 ttagatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccat 5191508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 10084398 - 10084796
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10084398 gttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgggttacaagaata 10084497  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084498 agtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 10084597  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |        
T  10084598 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctcta--tctctctcaaagtttgc 10084695  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10084696 tccgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccat 10084795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 18099179 - 18099573
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18099179 gttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 18099278  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18099279 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 18099378  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |  |     
T  18099379 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctc-----aagtttac 18099473  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| | |||||||||||||    
T  18099474 tctgatacaaggtctata-ttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctattgttcgccgccagcgcaccat 18099572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 10191319 - 10191716
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  10191319 gttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgggttacaagaata 10191418  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191419 agtctccctcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 10191517  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |        
T  10191518 gtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagcccccttta--tctctctcaaagtttgc 10191615  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10191616 tccgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccat 10191715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3859775 - 3859382
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3859775 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgtgttacaagaataa 3859676  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859675 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 3859576  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  3859575 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 3859482  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | || ||| | ||||||||||||||    
T  3859481 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatattattcgccgccagcgcaccatc 3859382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 4103905 - 4104233
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103905 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4104004  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104005 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 4104104  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||    
T  4104105 tgtttgttccgaagagacaagctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttagc 4104202  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104203 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 4104233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11170652 - 11170262
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11170652 gttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 11170553  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11170552 agtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatccgcaaacccta 11170453  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  11170452 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 11170359  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcac 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  11170358 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcac 11170262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18096909 - 18097283
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  18096909 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaata 18097008  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18097009 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 18097108  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     || |  |     
T  18097109 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagccccctctatctctc-----aagtttac 18097203  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18097204 tatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 18097283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38890288 - 38889935
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38890288 gttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 38890189  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890188 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 38890089  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    |    
T  38890088 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc---aaagtttg 38889992  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38889991 c--tatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 38889935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 5522636 - 5523018
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522636 gttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5522735  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5522736 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaacccacaaacccgag 5522835  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  5522836 tgtttgttccgaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 5522918  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5522919 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatc 5523018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25533690 - 25533357
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25533690 gttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 25533591  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25533590 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 25533491  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc--tctcaaaatag 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |      
T  25533490 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagttt 25533391  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533390 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25533357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 747005 - 746674
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  747005 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 746906  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746905 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 746806  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  746805 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttag 746706  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746705 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 746674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25389153 - 25388794
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25389153 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaatat 25389054  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25389053 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacccacaaacccta 25388955  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag----ccccctctatctctctctcaaaat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    | | |||| |||||||||||||||    
T  25388954 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagctctctctctctctctctctctcaaaat 25388855  T
Q  296 agagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  25388854 --agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 25388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22114314 - 22114708
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| || | || | ||||||||| || | ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22114314 gttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 22114413  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22114414 agtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaaccta 22114513  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||  | |      
T  22114514 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctc-----caagtttg-c 22114607  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  22114608 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccatcgcaccat 22114707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45883188 - 45882793
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  45883188 gttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 45883089  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45883088 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacctt 45882989  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| | |  |    
T  45882988 attgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcatagttta 45882895  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||    
T  45882894 ctatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaattttcaacaaatctgcacccaaaaataggtttctgttattcgttgtcagcgcacca 45882795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 4308290 - 4308574
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4308290 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 4308389  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4308390 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 4308489  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308490 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 4308574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 10956036 - 10956430
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10956036 gttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaata 10956135  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10956136 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaacccta 10956235  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |  |  |     
T  10956236 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatct-tc-----atgtttac 10956329  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  10956330 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattgcttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcaccat 10956429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26720795 - 26720402
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  26720795 gttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaaagggttaaaagaata 26720696  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26720695 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-taacccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 26720597  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |||  | |      
T  26720596 gtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctc-----caagtttg-c 26720503  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26720502 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcactaaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccat 26720403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 400
Target Start/End: Original strand, 32264050 - 32264446
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa--gagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32264050 ggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataag 32264149  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32264150 tctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 32264249  T
Q  202 gtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcc 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |   |||  |  |    
T  32264250 gtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctctatctcaaagt--taatttactc 32264347  T
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32264348 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgcaccatc 32264446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 10958332 - 10958726
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10958332 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaata 10958431  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10958432 agtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaacccta 10958531  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |      |  |  |     
T  10958532 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatcttt------atgtttac 10958625  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  10958626 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattgcttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatacgtttctgttattggctgccagcgcaccat 10958725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 458532 - 458203
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458532 gttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 458433  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458432 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 458333  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |  ||    
T  458332 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc--aaggtttag 458235  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458234 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 458203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43226333 - 43226050
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43226333 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 43226234  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226233 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 43226134  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226133 gtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaa-cgtagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 43226050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43228539 - 43228255
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43228539 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 43228440  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228439 agtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 43228340  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43228339 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctc 43228255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38210618 - 38210265
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38210618 gttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 38210519  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210518 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 38210419  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||    
T  38210418 gtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaaat--ag 38210323  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctg 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  38210322 cctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctg 38210265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42990552 - 42990259
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42990552 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaata 42990453  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42990452 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 42990353  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaa 293  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990352 atgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaa 42990259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 456155 - 455826
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456155 gttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 456056  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456055 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 455956  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |  ||    
T  455955 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc--aaggtttag 455858  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455857 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 455826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30006089 - 30005799
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30006089 gttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaata 30005990  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30005989 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 30005890  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005889 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 30005799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 6063455 - 6063809
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063455 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6063554  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063555 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 6063654  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |        
T  6063655 gtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctctcaaagtttgc 6063750  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  6063751 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 6063809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 10621539 - 10621876
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621539 gttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10621638  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621639 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 10621738  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctctctctcaaa 293  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||    
T  10621739 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagcaccctctatctctctctctctctcaaa 10621838  T
Q  294 atagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621839 gtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10621876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18162907 - 18162518
Alignment:
Q  6 gtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaagagaa-atcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  18162907 gtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataagtc 18162808  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18162807 tcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgt 18162708  T
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctg 303  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||     |||  |    | ||    
T  18162707 ttgttcaaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca--tccctctatctc-----caagtttactcatg 18162615  T
Q  304 atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18162614 atacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcaccatc 18162518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 6065805 - 6066169
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065805 gttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6065904  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065905 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 6066004  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||| |        
T  6066005 gtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc-----ctctatctcaaagtttgc 6066099  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaata 369  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  6066100 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctgtaacaaatctgctcccaaaaata 6066169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 27101190 - 27101519
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27101190 gttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgggttacaagaata 27101289  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27101290 agtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 27101389  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |   |    
T  27101390 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctctatctcaattt---g 27101486  T
Q  300 c-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27101487 ctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 27101519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 9604616 - 9604946
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9604616 gttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 9604715  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9604716 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 9604815  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |        
T  9604816 gtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagccccctctatctctctctcagagttttc 9604914  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9604915 tctaatacaaggtctatatttatagtgaaagt 9604946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50494247 - 50493895
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494247 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 50494148  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494147 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 50494048  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      | |        
T  50494047 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc------agtttgc 50493954  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  50493953 tttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 50493895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 51727016 - 51727299
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51727016 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 51727115  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  51727116 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc-a 51727214  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51727215 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacataccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctc 51727299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1321727 - 1321483
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1321727 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 1321628  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321627 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 1321528  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 244  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1321527 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccgagttttgt 1321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 43423472 - 43423756
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  43423472 gttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaata 43423571  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43423572 agtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 43423671  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43423672 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctttctc 43423756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1313657 - 1313374
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  1313657 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaata 1313558  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1313557 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 1313458  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1313457 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattgtaaa-ccttgtttcagccccctctatctc 1313374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 284
Target Start/End: Original strand, 28102015 - 28102295
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28102015 ggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactatatgataagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtc 28102114  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28102115 tcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 28102214  T
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102215 ttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 28102295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 83 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777276
Alignment:
Q  83 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 181  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  182 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  35777487 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctcta- 35777389  T
Q  282 ctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttt 381  Q
         ||||||| |      |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35777388 -----tctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttatgtttt 35777294  T
Q  382 tccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  35777293 t-gctgccagcgcaccatc 35777276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24979956 - 24979561
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaga-gaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||  |||||||||||    
T  24979956 gttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaatttgttacaagaat 24979857  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24979856 aagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 24979757  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |    
T  24979756 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagttta 24979663  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
      |||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||    
T  24979662 ctctgatacaaggtatatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcaccaaaaaatatgtttatgttattcgctaccagcgtacca 24979563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 28413042 - 28413299
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413042 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 28413141  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413142 tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 28413241  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28413242 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaa 28413299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 48361680 - 48362073
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |  ||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  48361680 gttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 48361779  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  48361780 agtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaacccta 48361879  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||      ||||||| |  |     
T  48361880 gtttttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaa-ccttgtttcagccccctgta------tctcaaagtttac 48361972  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  48361973 tatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatacgtttctgctattcgctgccagcgcaccat 48362072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 1626692 - 1626976
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1626692 gttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 1626791  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  1626792 agtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaacccta 1626891  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1626892 gtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 1626976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 53917673 - 53917957
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  53917673 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 53917772  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53917773 agtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 53917872  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  53917873 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccattgtttcagccccctccatctc 53917957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956644
Alignment:
Q  28 ggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 126  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 29956808  T
Q  127 cccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 226  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29956807 cccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactcta 29956708  T
Q  227 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956707 tacaaaccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 29956644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3314933 - 3314648
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3314933 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 3314834  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3314833 aagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 3314734  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3314733 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttatttcagccccctctatctc 3314648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 43421424 - 43421708
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43421424 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 43421523  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43421524 agtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 43421623  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43421624 gtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctc 43421708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 12267984 - 12268348
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||    
T  12267984 gttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa-aga---------gttacaagaataa 12268073  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12268074 gtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 12268173  T
Q  201 tgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctag-ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||      ||||||| |  |    
T  12268174 tgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagctccctcta------tctcaaagttta 12268267  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  12268268 ctctgatacaagttctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactgaaaaatacgtctctgtt 12268348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 7606597 - 7606822
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7606597 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaatagaaatcaatgtgttacaagaataa 7606696  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7606697 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctag 7606796  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactcta 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7606797 tgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 47148904 - 47149233
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47148904 gttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 47149003  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |    
T  47149004 agtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt-ccaaggtgaatcaaccatcaaatccca 47149102  T
Q  200 gtgtttg-ttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      || |    
T  47149103 gtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccctcaaggcctaca 47149202  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 330  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149203 -tctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 47149233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51943618 - 51943335
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  51943618 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagacgtcaatgagttacaagaa-a 51943520  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51943519 agtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 51943420  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  51943419 gtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagcaccctctatctc 51943335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 33 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561774
Alignment:
Q  33 gagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa--gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 129  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||| || |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 6561929  T
Q  130 agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatac 229  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6561928 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatac 6561829  T
Q  230 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561828 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 6561774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 53915505 - 53915788
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  53915505 gttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 53915604  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  |||||||||    
T  53915605 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcacaaggtaaatcaaccatcaaacccta 53915704  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915705 gtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgtcatcctaaacccttgtttcagccccctctatct 53915788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 5926773 - 5927057
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   || | | || ||||||||||||||| ||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  5926773 gttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggttacaagaata 5926872  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5926873 agtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcgaatcaaccctcaaacccta 5926972  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5926973 gtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccctctctatctc 5927057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 284
Target Start/End: Original strand, 880462 - 880745
Alignment:
Q  3 tcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  880462 tcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataac 880561  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  880562 tctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 880661  T
Q  202 gtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  880662 gtttgttgccaaagagacgaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaactcttgtttcagacccctctatctc 880745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 35917953 - 35918242
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35917953 gttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 35918051  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  35918052 agtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccctcaaactcta 35918151  T
Q  200 ------gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
          ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918152 gtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 35918242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15781127 - 15780747
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag---cactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaat----caatgggtta 91  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | ||  | ||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||||    ||||||||||    
T  15781127 gttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataactttacaaaagagaaatatatcaatgggtta 15781028  T
Q  92 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15781027 caagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 15780928  T
Q  192 aaaccctagtgtttgttccgaagagaca-----------aactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780927 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta 15780828  T
Q  281 tctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaa 367  Q
          |||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15780827 ------tctccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 15780747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36012075 - 36011791
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36012075 gttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 36011976  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  36011975 agtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccata 36011876  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36011875 gtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccttagtttcgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctttatctc 36011791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32219333 - 32218949
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaga-gaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||    
T  32219333 gttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaaaaat 32219234  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32219233 aagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccct 32219134  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||| | ||||||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |    
T  32219133 agtgtttgttacaaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagttta 32219051  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
    | | ||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  32219050 gtcagatacaaggtctatatttatactgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctcttattcgctgccagcgcacca 32218951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42992518 - 42992205
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42992518 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaata 42992419  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |               ||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  42992418 a---------------ctacccaaagtcc-actctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 42992335  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |  ||    
T  42992334 gtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctctt--aaagtttag 42992237  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42992236 catgatacaaggtatatatttatagtaaaagt 42992205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 284
Target Start/End: Original strand, 28761446 - 28761721
Alignment:
Q  10 aaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccc 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28761446 aaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatccc 28761545  T
Q  108 gcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 207  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  28761546 gcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaactctcaaacccttgtgtttgt 28761645  T
Q  208 tccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28761646 tgccaagag-caaactatatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctc 28761721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39715664 - 39715434
Alignment:
Q  54 tatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagaga 152  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  39715664 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 39715565  T
Q  153 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39715564 ctcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaaccctagttttggtgttgcct 39715465  T
Q  253 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39715464 ctctaaacccttatttcag-cccctctatctc 39715434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 53468462 - 53468747
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagt--ctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  53468462 gttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 53468561  T
Q  97 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  53468562 ataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatgctcaaacc 53468661  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53468662 ctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaa-cctggttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctttatct 53468747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 93 - 284
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100334
Alignment:
Q  93 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  193 aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100243 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 28100334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 889782 - 890064
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  889782 gttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaata 889881  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  889882 actctcctgcctaattctacccaaagccccaac-tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacccca 889980  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  889981 gtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaaccctaggtt--ttgttgccattctaaacccttgtttcagcttcctctatctc 890064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Original strand, 54691591 - 54691865
Alignment:
Q  9 caaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccc 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  54691591 caaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaagagatatcaatgaaatacaagaataagtctccc 54691690  T
Q  108 gcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 207  Q
    ||||||||| || ||||| || |  |||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54691691 gcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 54691790  T
Q  208 tccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  54691791 tgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtcgcctttctaaaaccttgtttta-ccccctctatct 54691865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 25688169 - 25688367
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25688169 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 25688268  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25688269 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 51674775 - 51675048
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||   | || ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  51674775 gttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatggattacaagaata 51674874  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  51674875 agtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 51674974  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||| |           ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674975 gtgtttgttccaaaggg-----------acaaaccttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 51675048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6484608 - 6484372
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaga-gaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  6484608 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttacaagaata 6484509  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  6484508 agtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccg 6484409  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccc 235  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6484408 gtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaaccc 6484372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5886446 - 5886261
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5886446 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtttcaaagacaaatcaatgggttacaagaataa 5886347  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5886346 gtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5899919 - 5899734
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899919 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttgcaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5899820  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5899819 gtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11163004
Alignment:
Q  180 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 11163119  T
Q  280 atctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
    |      ||||||| |     |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11163118 a------tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatcgtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 11163025  T
Q  380 tttccctgccagcgcaccatc 400  Q
     ||| | ||||||||||||||    
T  11163024 attcgccgccagcgcaccatc 11163004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11168345 - 11168165
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168345 ggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc 11168246  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 184  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168245 tctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31151579 - 31151312
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatga-tgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||  | |||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  31151579 tgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatatca--gggttacaagaataagtcacccgcct 31151482  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |     
T  31151481 aattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctggtgtttgttgcc 31151384  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31151383 aagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttctaaacccttgttttcagccccctctatctc 31151312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 53591431 - 53591159
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  53591431 gttcgatccaaattgacctagtct-ggggagagagcatcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatggattagaagaata 53591333  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53591332 agtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 53591233  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||  |||||||           |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53591232 gtgtttgttctaaagagac-----------aaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctc 53591159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23633700 - 23633334
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  23633700 ttcggtctaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaagagatatcatcgggttacaagaataa 23633602  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  | ||||||||    
T  23633601 gtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc--ggtaaatcaacc--ccaaccctag 23633506  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||||      ||||| ||||||  |  |      
T  23633505 tgtttgttgccaagag-caaacactatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaatccttgttttagccc------tctctatctcaaggtttact 23633414  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgctta-aaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   ||| |||||| |||||||||    
T  23633413 ctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctaggctcgaaaatacgtttctgtt 23633334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28180988
Alignment:
Q  88 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaac 28181083  T
Q  188 ccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  28181082 cctcaaatcccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc--tatttcagccccctctatctc 28180988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849065
Alignment:
Q  156 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttattc 41849145  T
Q  256 taaacccttgtttcagccccctct----atctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41849144 taaacccttgtttcagccccctctatctatctctctctcaaagtttagcctgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 41849065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23637199 - 23636991
Alignment:
Q  72 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23637199 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgttt 23637100  T
Q  172 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 271  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||    
T  23637099 ctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgttttag 23637004  T
Q  272 ccccctctatctc 284  Q
    || ||||||||||    
T  23637003 cctcctctatctc 23636991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Original strand, 13420195 - 13420432
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||| |||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  13420195 ttcggtccaaaactgacctagtct-ggtgagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 13420293  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  13420294 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactc---aaccct 13420390  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttt 241  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13420391 agtgtttgttgcctagaga-aaactctatacaaaccctagttt 13420432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54884357 - 54884121
Alignment:
Q  47 tccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  ||||| ||||||    
T  54884357 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatctctttctgtaa 54884259  T
Q  145 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  54884258 ccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactc--tacaaattctagttttgt 54884161  T
Q  245 tgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  54884160 tgttgcctttctaaacccttgttcgagctccctctatctc 54884121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4666762 - 4666489
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  4666762 gttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaat 4666666  T
Q  99 aag--tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4666665 aaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaacc 4666566  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||| ||||   |||||||           |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4666565 ctagtgtctgttgtcaagagac-----------aaaccctatttttgttgttgtcttactagacccttctttcagccccctctatctc 4666489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17795506 - 17795269
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | | || ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17795506 ttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 17795407  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||    
T  17795406 agtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaaccc---aacccta 17795310  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttt 241  Q
    ||||||||| | || || ||||||||||||| || |||||||    
T  17795309 gtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 17795269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19103946 - 19103709
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | | || ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19103946 ttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 19103847  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||    
T  19103846 agtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaaccc---aacccta 19103750  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttt 241  Q
    ||||||||| | || || ||||||||||||| || |||||||    
T  19103749 gtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 19103709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25635626 - 25635391
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaag-agaaatcaatgggttacaagaataagt 102  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25635626 ggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaataagt 25635527  T
Q  103 ctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtg 202  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||    
T  25635526 cttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaatc--ccaaccctagtg 25635429  T
Q  203 tttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttt 241  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25635428 tttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttt 25635391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 284
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137588
Alignment:
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137515 gtgtttgttcccaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 28137588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 27635667 - 27635920
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| |    
T  27635667 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 27635766  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||            || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||                   ||||||    
T  27635767 agtctcccgcctaattttacccaaag------------cccgtaaccaagagactcaatcttaatattgtttccc-------------------acccta 27635835  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635836 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 27635920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 36871309 - 36871583
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  36871309 gttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaactttacaaagagataacaaagggttgcaagaat 36871408  T
Q  99 aagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |  | |||||    
T  36871409 aagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaatc--ctaaccc 36871506  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 276  Q
    | ||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  36871507 tggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaagccctagttttcttgttggc-ttgtaaacccttgtttcagccccc 36871583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 561783 - 562058
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctag-gggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaga-gaaatcaatgggttacaaga 96  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||  ||||||||    
T  561783 gttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgacttacaaga 561882  T
Q  97 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||    
T  561883 ataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacc--tgaacc 561980  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 277  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  561981 ctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaaccctag-tttcatgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccccct 562058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6232048 - 6231849
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||| | | |||| | |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6232048 gttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccg-ttcactgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 6231950  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6231949 aagtctcccgcctaattctacccaaa-tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 6231851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177133
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttc 24177284  T
Q  244 ttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaa 342  Q
    |||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||       |||||  |  |   |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  24177283 ttgttgac-atctaaactcttgttttcagccccctcta------gctcaatgtttactatgatacaaggtctatatttataataaaagtatcccttaaaa 24177191  T
Q  343 tttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |  ||| |||||||||    
T  24177190 tttggaacaaatctgcacttaaaaatacgtttatgtttttcgcctccaacgcaccatc 24177133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 248 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1321441 - 1321295
Alignment:
Q  248 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttgg 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1321441 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc------aaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgg 1321348  T
Q  348 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1321347 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatc 1321295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 53597485 - 53597164
Alignment:
Q  2 ttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||| | |||   ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  53597485 ttcggtccaatactgacctagtttgtgggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaat 53597386  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| || ||  || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||    
T  53597385 aagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa--cttcaaccct 53597288  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||       |||| ||||||  |  |    
T  53597287 agtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaacccctagttttcttgttgac-ttataaacccttgtttcatccc-------ctctatctcaaggttta 53597197  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53597196 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 53597164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1674140 - 1673975
Alignment:
Q  80 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 179  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1674140 atcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggt 1674041  T
Q  180 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtt 248  Q
    ||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  1674040 gaatcaatc--ctaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaacactagttttcttgtt 1673975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 47701680 - 47701801
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47701680 gttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 47701779  T
Q  100 agtctcccgcctaattctaccc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47701780 agtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3307008 - 3306839
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||   | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3307008 gttcggtccaaattgacctagtctagg--agagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 3306911  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 170  Q
    || |||||||||||||||||||||||   |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306910 aactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 1620483 - 1620657
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || | ||   |||    
T  1620483 tgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttacaaagagatatcaaagggttacaagaactagccttcaaacct 1620582  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1620583 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 284
Target Start/End: Original strand, 47701798 - 47701888
Alignment:
Q  194 accctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47701798 accctggtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctc 47701888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231413
Alignment:
Q  195 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctc 6231413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 284
Target Start/End: Original strand, 4560401 - 4560558
Alignment:
Q  108 gcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 207  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  4560401 gcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt--- 4560497  T
Q  208 tccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
         |||||||||||           |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4560498 -----agagacaaact-----------ctagttttgttgttacctttataaaccattgtttcagccccctctatctc 4560558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 29913980 - 29914132
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cct 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |||    
T  29913980 tgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacct 29914076  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29914077 aattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3306842 - 3306762
Alignment:
Q  205 tgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3306842 tgttccaaagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgtttcagccccctatatctct 3306762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24181629 - 24181498
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||   || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  24181629 ttcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaatgggttacaagaat 24181530  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24181529 aagtctcccgtctaattctacccaaagtccca 24181498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 10094100 - 10094256
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  10094100 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 10094196  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10094197 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Original strand, 46966939 - 46967021
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttc 383  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46966939 ctgatacaatgtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcattgaaaaatatgtttctgtttttc 46967021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13419983 - 13419864
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttg 243  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  13419983 accaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagttttc 13419889  T
Q  244 ttgttgcctttctaaacccttgtttc 269  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||    
T  13419888 ttgttggcttt-taaacctttgtttc 13419864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 10100117 - 10100273
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  10100117 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 10100213  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100214 taattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 10200980 - 10201136
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | || |||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  10200980 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttccaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 10201076  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201077 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 186
Target Start/End: Original strand, 14634504 - 14634638
Alignment:
Q  54 tatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagag 151  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||||  || || |||||    
T  14634504 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatctcttctcgtgactaagag 14634603  T
Q  152 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634604 acacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14634638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25634024 - 25633930
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  | | |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25634024 accaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatc--ccagccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt 25633930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5858701 - 5858546
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  5858701 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 5858605  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  5858604 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaga--ctcaatcctaatagtgttt 5858546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10897162 - 10897008
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  10897162 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 10897066  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  10897065 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagaatcaatcctaatagtg 10897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 54193383 - 54193229
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  54193383 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgggtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 54193287  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54193286 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 54193229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41849307 - 41849243
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  41849307 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13893345 - 13893267
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttt 381  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  13893345 tgatacaatgtctatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcact-gaaaatacgtttctgtttt 13893267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6303466 - 6303310
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  6303466 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 6303370  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6303369 taactatacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 6719357 - 6719472
Alignment:
Q  251 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc--------aaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaa 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6719357 ctttctaaacccttatttcagccccctctatctctctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaa 6719456  T
Q  343 tttggaacaaatctgc 358  Q
    | || |||||||||||    
T  6719457 tctgtaacaaatctgc 6719472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 10208026 - 10208182
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  10208026 tgacctagtctgcgggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 10208122  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10208123 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16462264 - 16462203
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462264 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 22626105 - 22626166
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626105 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 47883003 - 47883064
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47883003 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5899713 - 5899656
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5899713 ctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 5899656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 47878196 - 47878350
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  47878196 tgacctagtctggaggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 47878292  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47878293 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 54188665 - 54188512
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  54188665 tgacctagtct-ggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 54188570  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  54188569 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaattctaatagtg 54188512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5886238 - 5886181
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5886238 ctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 5886181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11079674 - 11079517
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  11079674 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 11079578  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11079577 ctaattctacctaa-gtcccagccttttcccgtgaccaagagactcaatcctgatagtgttt 11079517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 20031439 - 20031497
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20031439 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 20031497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 27762107 - 27762165
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27762107 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27762165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 35919124 - 35919179
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatat 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  35919124 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatat 35919179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25634136 - 25634030
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||  |  | | |||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25634136 gttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaat 25634037  T
Q  99 aagtctc 105  Q
    |||||||    
T  25634036 aagtctc 25634030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27544429 - 27544273
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  27544429 tgacctagtctgagggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 27544333  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27544332 taattctacccaa-gttccacgctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4535772 - 4535622
Alignment:
Q  14 tgacctagtctagg-ggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg- 108  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |       
T  4535772 tgacctagtctgggaggagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 4535676  T
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaa 163  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4535675 cctaattctacccaat-tcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 4535622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Original strand, 6719471 - 6719536
Alignment:
Q  335 gcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  6719471 gcttaaaatctgtatcaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccatc 6719536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 10612803 - 10612957
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || |||| |||||| ||||| |   |    
T  10612803 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttataagaatcagtcttcaaac 10612899  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  10612900 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtg 10612957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 208
Target Start/End: Original strand, 31021287 - 31021361
Alignment:
Q  133 ctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 208  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  31021287 ctcttcatgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgtt 31021361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7768672 - 7768632
Alignment:
Q  146 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7768672 caagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 7768632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 10949285 - 10949438
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  10949285 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 10949381  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagt 167  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10949382 ctaattcaacccaa-gttccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagt 10949438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38002928 - 38002869
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38002928 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaaacctaatggtgttt 38002869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 53896501 - 53896557
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  53896501 tgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 53896557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 10595155 - 10595213
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  10595155 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtg 10595213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007683
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||| | |||||||||| |         |||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaaagagttacaagaaaa---------cct 11007635  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatc 159  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11007636 aattctacccaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatc 11007683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11066731 - 11066652
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11066731 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcccgtgatcaaaagattcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11066652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 46966671 - 46966789
Alignment:
Q  12 attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||  |||||||| ||| ||||| |   |    
T  46966671 attgacctactct-ggggagagggcagctctctgttccactataatgatgagtttctttacaaagagatatcaaatggttacaataattagtcttcaaac 46966769  T
Q  110 ctaattctacccaaagtccc 129  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  46966770 ctaattctacccaaagtccc 46966789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 53894066 - 53894121
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatat 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  53894066 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatatat 53894121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16996759 - 16996677
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttc 383  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||   || || |||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||    
T  16996759 ctgatacaaggtttatatttatattaaaaccatccctaaaaatttggaacaaatccaggcccaaaaatatgtttctgtttttc 16996677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Original strand, 7606828 - 7606873
Alignment:
Q  159 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  7606828 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctactgtt 7606873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26762918 - 26762863
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||    
T  26762918 ctgatacaaggtttatatttatagtaaaagcatccctaaaaaattggaacaaatct 26762863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25388795 - 25388731
Alignment:
Q  335 gcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  25388795 gcttaaaatctgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttt-tatttttatctgccagcgcaccatc 25388731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42990234 - 42990205
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990234 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 42990205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 69303 - 69699
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69303 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 69402  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  69403 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 69502  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |         
T  69503 tgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttgct 69600  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  69601 ctgatataaggtctatatttattgtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatc 69699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 173 - 400
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73431
Alignment:
Q  173 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 73306  T
Q  273 cccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgt 372  Q
    ||||||||  ||||||||||| |      ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  73307 cccctcta--tctctctcaaagtttcctttgatacacggtctatatttatagtaaaagtatctcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaatatgt 73403  T
Q  373 ttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  73404 ttctgtttttcgctgccagcacaccatc 73431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 210
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73208
Alignment:
Q  162 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttttttcc 73208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 87)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27827309 - 27826916
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827309 gttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27827210  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827209 gtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 27827110  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  27827109 tgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 27827016  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27827015 ctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttttgtttttcgctgccagcgcaccatc 27826916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27829620 - 27829227
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829620 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27829521  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829520 gtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 27829421  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  27829420 tgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 27829327  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27829326 ctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttttgtttttcgctgccagcgcaccatc 27829227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4424342 - 4423948
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4424342 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaagaata 4424243  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4424242 agtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccacggtgaatcaacccacaaacccta 4424143  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  4424142 gtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 4424049  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4424048 tctgatacaaggtctgtatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctatttttcgctgccagcgcaccat 4423949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14808050 - 14807684
Alignment:
Q  26 ggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 124  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808050 ggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 14807951  T
Q  125 gtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactc 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14807950 gtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactc 14807851  T
Q  225 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |     ||||||||||||||||||||||||    
T  14807850 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatag 14807757  T
Q  325 taaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14807756 taaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtttatgtttttcgctgccagcgcacca 14807684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 28251578 - 28251971
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28251578 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttataagaata 28251677  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28251678 agtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaaccta 28251777  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||      ||||||| |  |     
T  28251778 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaacccactcta------tctcaaagtttac 28251871  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28251872 tatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtttctgtttttcgctgccaacgcaccat 28251970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15073035 - 15072640
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15073035 gttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15072936  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc-tcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  15072935 aatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctaaaaccct 15072836  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |    
T  15072835 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagttta 15072742  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15072741 gtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcacca 15072642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3874334 - 3874005
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3874334 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 3874235  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874234 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 3874135  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |  ||    
T  3874134 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcccccgctatctc--tctcaaagtttag 3874037  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3874036 cctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 3874005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32339633 - 32339304
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32339633 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 32339534  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32339533 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaaacccta 32339434  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  32339433 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 32339336  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339335 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 32339304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15809542 - 15809214
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15809542 gttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 15809443  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15809442 agtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaacccta 15809343  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |  ||    
T  15809342 gtgtttgttcc-aaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccttta--tctctctcaaagtttag 15809246  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809245 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15809214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 28283232 - 28283561
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28283232 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttgcaagaataa 28283330  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28283331 gtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctag 28283430  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  28283431 tgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagc 28283530  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283531 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 28283561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15068305 - 15067911
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15068305 gttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15068206  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15068205 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaattaaccctcaaacccta 15068106  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||| |  ||    
T  15068105 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttcta------tctcaaagtttag 15068012  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  15068011 gttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttttgttattcgctgccagcgcaccat 15067912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18811031 - 18810680
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811031 gttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18810932  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810931 gtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 18810832  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  18810831 tgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 18810738  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  18810737 ctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttgtaacaaatctgc 18810680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44721167 - 44720815
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44721167 gttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 44721068  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg-tttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44721067 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 44720968  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  44720967 gtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 44720874  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  44720873 tttgatataaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 44720815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 331
Target Start/End: Original strand, 24873193 - 24873523
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24873193 ttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatcggttacaagaataag 24873292  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24873293 tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacaaaccctag 24873392  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  24873393 tgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagc 24873492  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873493 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24873523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 609058 - 608768
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  609058 gttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 608959  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  608958 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaacccta 608859  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608858 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 608768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43079926 - 43079558
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079926 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43079827  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079826 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 43079727  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc---------ctctatctctctctc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  43079726 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagcccccctatctctctctatctctctctc 43079627  T
Q  291 ---aaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
       |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  43079626 tctaaaat--agcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 43079558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43082297 - 43081930
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082297 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43082198  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082197 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 43082098  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctct---------- 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  43082097 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctatctctctct 43081998  T
Q  290 -caaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  43081997 ccaaaat--agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 43081930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 22684664 - 22684957
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaat---gggttacaaga 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  22684664 gttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagaaatcaatattgggttacaaga 22684763  T
Q  97 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22684764 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaacc 22684863  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22684864 ctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctctctctc 22684957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18813205 - 18812865
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813205 gttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18813106  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813105 gtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 18813006  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||  | |       
T  18813005 tgtttgttccgaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctc-----caagtttg-ct 18812923  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  18812922 ctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttgtaacaaatctgc 18812865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 284
Target Start/End: Original strand, 27106912 - 27107192
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27106912 ggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaagagatatctatgggttacaagaataagtc 27107011  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27107012 tcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgt 27107111  T
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107112 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 27107192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27911337 - 27911055
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27911337 gttcggtccaaattgacttagtct-ggggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagttacaagaata 27911239  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27911238 actctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 27911139  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911138 gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 27911055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27957756 - 27957474
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27957756 gttcggtccaaattgacttagtct-ggggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagttacaagaata 27957658  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27957657 actctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 27957558  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957557 gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 27957474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 14419201 - 14419576
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  14419201 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatgggttacaagaat 14419300  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14419301 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccc 14419400  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||  |  |    
T  14419401 aatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaggttta 14419494  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaac-aaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | || ||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||    
T  14419495 cactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcactcataaattggaacaaaatctcagcccaaaaatatgtttctgtt 14419576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 30480514 - 30480798
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||   | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30480514 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 30480613  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30480614 agtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 30480713  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30480714 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctc 30480798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1225491 - 1225206
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaat--caatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||  || | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||    
T  1225491 gttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaat 1225392  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1225391 aagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccgt 1225292  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225291 agtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 1225206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43530439 - 43530123
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43530439 gttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaggaata 43530340  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43530339 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaaccta 43530240  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |        
T  43530239 gtgtttgttccaaagagacaaactctacac-------------gttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttgc 43530155  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530154 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43530123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 13858495 - 13858779
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||| | |||||||    
T  13858495 gttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat-aatgggctgcaagaat 13858593  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13858594 aagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 13858693  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13858694 agtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctctatctc 13858779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36865861 - 36865579
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  36865861 gttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaa 36865762  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36865761 taagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtga---agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 36865665  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865664 taatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 36865579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41385068 - 41384785
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  41385068 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 41384969  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41384968 attctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaacccta 41384869  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41384868 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 41384785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14477520 - 14477316
Alignment:
Q  80 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14477520 atcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggt 14477421  T
Q  180 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477420 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctct 14477321  T
Q  280 atctc 284  Q
    |||||    
T  14477320 atctc 14477316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 5372187 - 5372472
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaga-gaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  5372187 gttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaa 5372286  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5372287 taagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaattaaccctcaaaccc 5372386  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5372387 tagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 5372472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25952845 - 25952561
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  25952845 gttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 25952746  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25952745 aagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 25952646  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25952645 agtgtttgttgccaagagacaaactatatac-aaccctaattttattgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 25952561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41382986 - 41382713
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  41382986 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 41382887  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||           ||||||| |||||| |||||||||    
T  41382886 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataat-----------aggtgaaacaaccctcaaacccta 41382798  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41382797 gtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttttagccccatctatctc 41382713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 284
Target Start/End: Original strand, 33541507 - 33541683
Alignment:
Q  108 gcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33541507 gcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 33541606  T
Q  208 tccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541607 tccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 33541683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21480827 - 21480554
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21480827 gttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 21480728  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||    
T  21480727 aagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaacct 21480631  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21480630 agtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccatctatctc 21480554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 213 - 400
Target Start/End: Original strand, 12517248 - 12517431
Alignment:
Q  213 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |     ||||||||||||    
T  12517248 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc----aaagtttgctctgatacaaggt 12517343  T
Q  313 ctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12517344 atatatatatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatc 12517431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 15185725 - 15186005
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | | ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15185725 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaat 15185824  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagag--actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  15185825 aggtctctcgcctaattctacccaaat-------ctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgttttacaaggtgaatcaaccctcaaacc 15185917  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  15185918 ctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccatagttttgttattttctttctaaacccttgtttcagtcacctttatctc 15186005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21482635 - 21482397
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21482635 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 21482536  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||    
T  21482535 aagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactcaaccc---aaccct 21482439  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttt 241  Q
    |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21482438 agtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctagttt 21482397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Original strand, 5622882 - 5623033
Alignment:
Q  133 ctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 232  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5622882 ctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctatacaaa 5622981  T
Q  233 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5622982 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 5623033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15956282 - 15956051
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| | | ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15956282 gttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 15956183  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  15956182 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccct 15956086  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaacc 234  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  15956085 agtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 147 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775241
Alignment:
Q  147 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgttg 26775279  T
Q  247 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26775278 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 26775241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31162537 - 31162165
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctagggg--agagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaag 95  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31162537 gttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaag 31162438  T
Q  96 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 195  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  31162437 aataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ctaac 31162340  T
Q  196 cctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg-ttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctctcaaa 293  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||      |||| ||||||     
T  31162339 gttagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacacta-atttgttgcttg--tttctaaacctttgtttttagcccc------ctctttctcaag 31162250  T
Q  294 atagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgctta-aaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctg 377  Q
     |  |   |||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  31162249 gtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctcagctcaaaaatatgtttctg 31162165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 3005641 - 3005922
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  3005641 gttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 3005740  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||    
T  3005741 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgttttccaaagtgaatcaatcca---accc 3005837  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctc 284  Q
    || ||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||  |  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3005838 tattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaactctagtttgttatttg--tttctaaacccttgtttccagccccctctatctc 3005922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 181772 - 181622
Alignment:
Q  54 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc--tgtaaccaagag 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| |||||    
T  181772 tatgatgagtaactttacaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccattctcttcccgcgtaactaagag 181673  T
Q  152 actcaatcct-aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  181672 acttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 400
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886326
Alignment:
Q  224 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttata 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |     ||||||||| |||||||||||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttata 3886246  T
Q  324 gtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc---aaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3886247 gtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcacccaaaaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcacaccatc 3886326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872673
Alignment:
Q  161 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaacccta-----gttgttgcctttctaaac 35872649  T
Q  261 ccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  35872650 ccttgtttcagccccctctatctc 35872673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31035424 - 31035252
Alignment:
Q  19 tagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattc 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  31035424 tagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattc 31035325  T
Q  117 tacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 189  Q
    |||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31035324 tacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtgaatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 400
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468503
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctata----caaaccctagt 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||    |||||| ||||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca---accctagtatttgttgccaagag-caaactctatatatacaaaccgtagt 2468356  T
Q  240 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgctta 339  Q
    ||  ||        |||||| |||||||||||| |||||||||||      ||| |  |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2468357 ttgatt--------tctaaatccttgtttcagctccctctatctc------aaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgctta 2468442  T
Q  340 aaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  2468443 acatttggaacaaatctgcactaaaaaatacgtttctgttattcgcatccagcgcaccatc 2468503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 31578301 - 31578476
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||| |   ||    
T  31578301 tgacctagtctaggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacc 31578400  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31578401 taattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaatcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 284
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214505
Alignment:
Q  106 ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 37214407  T
Q  206 gttccgaagagacaaactctatacaaaccct-------------------agttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214408 gttccaaagagacaaactctatacaaaccctcaatctcttcccgtaaccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 37214505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 268
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31574000
Alignment:
Q  58 atgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc 155  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 31573893  T
Q  156 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||| | |||||| ||||||  |||||| |||||||||  ||||| | |||    
T  31573894 aatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaagaga-aaactc--tacaaatcctagttttcgtgttggc-ttc 31573987  T
Q  256 taaacccttgttt 268  Q
    |||||| ||||||    
T  31573988 taaacctttgttt 31574000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31035238 - 31035126
Alignment:
Q  152 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31035238 actcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac 31035142  T
Q  252 tttctaaacccttgttt 268  Q
     ||||||||| ||||||    
T  31035141 -ttctaaaccattgttt 31035126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 2468140 - 2468259
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  2468140 gttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggctacaagaat 2468239  T
Q  99 aagtctcccgcctaattcta 118  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  2468240 aagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 16757293 - 16757449
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  16757293 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 16757389  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757390 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6376314 - 6376141
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  6376314 gttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaaaggtaacaagaat 6376215  T
Q  99 aagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
     ||||| |   |||||||||||  |||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6376214 tagtcttcaaacctaattctacataaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttt 6376141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28895659 - 28895502
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || || |||||||| ||||| |   |    
T  28895659 tgacctagtctagaggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagtaacaagaatcagtcttcaaac 28895563  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28895562 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28328064 - 28327908
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  28328064 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 28327968  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28327967 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 9021132 - 9021289
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  9021132 tgacctagtctggtggagagagcagctctccgatctactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 9021228  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9021229 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 181632 - 181536
Alignment:
Q  229 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||      ||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  181632 caaaccctagttttattgttgccattctaagcccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaa 181539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 590948 - 590797
Alignment:
Q  17 cctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-ccta 112  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||||    
T  590948 cctagtctgggggagagaacagctctctgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaaccta 590852  T
Q  113 attctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  590851 attctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 590797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 4812513 - 4812669
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  4812513 tgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgattttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 4812609  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4812610 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagtgttt 4812669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 171
Target Start/End: Original strand, 13985176 - 13985262
Alignment:
Q  86 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13985176 gggttacaagaatcagtttcaaacctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 16752643 - 16752704
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752643 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17847557 - 17847475
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |    ||||||||||||| ||||||    
T  17847557 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcaaaatttggaacaaatctgaagctgaaaatatgtttctatttttc 17847475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 29554810 - 29554964
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||| ||||||||||| | |   |    
T  29554810 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttccaagaataagtattcaaac 29554906  T
Q  111 -taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29554907 ataattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29554964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33032811 - 33032657
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  33032811 tgacctagtctaggagagagagcagctctccattccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 33032715  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33032714 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 33541422 - 33541507
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  33541422 ttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28332692 - 28332631
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28332692 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44720816 - 44720752
Alignment:
Q  335 gcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44720816 gcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttttt-gctgccagcgcaccatc 44720752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3276405 - 3276347
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  3276405 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 3276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25684799 - 25684646
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  25684799 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 25684703  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  25684702 taattctacccaa-gtccctgtctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtg 25684646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21033930 - 21033870
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033930 cctatttctacccaa-gtcccagcc-cttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21033870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 23179586 - 23179740
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  23179586 tgacctagtctgggggagagagcagctatccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 23179682  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23179683 ctaattttacc-aaagtcacagcctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtg 23179740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 171
Target Start/End: Original strand, 17799558 - 17799606
Alignment:
Q  123 aagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17799558 aagtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17847740 - 17847661
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc--ccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  17847740 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttcgttcaaggtgaatcaa 17847661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 35872477 - 35872553
Alignment:
Q  27 gggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagt 102  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  35872477 gggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 35872553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 353
Target Start/End: Original strand, 31574054 - 31574100
Alignment:
Q  305 tacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  31574054 tacaaggtctatatttatagtaaaagtct--ctcaaaatttggaacaaa 31574100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19752476 - 19752424
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccacta 53  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  19752476 gttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccacta 19752424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31035096 - 31035041
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||| ||||||||||||||    
T  31035096 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc-ctaaaaaattggaacaaatctg 31035041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 33839043 - 33839120
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||   |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33839043 cctaattctacccaaagtcttgaatctcttcctg--accaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 33839120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 2267144 - 2267205
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2267144 cctaattctacccaa-gtcctaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 2267205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6376018 - 6375988
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6376018 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6375988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 186
Target Start/End: Original strand, 13985933 - 13986011
Alignment:
Q  110 ctaattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13985933 ctaattatacccaaagtcccgaatctcttcccgtgattaagagtctcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 13986011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30423274 - 30423212
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30423274 cctaattctatccaaagttccaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaaaagtgttt 30423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 37214275 - 37214313
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37214275 gttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagc 37214313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 28890922 - 28890881
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata 55  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28890922 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 28890881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 353
Target Start/End: Original strand, 13858790 - 13858842
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaa 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | || ||||||||||    
T  13858790 ctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaa 13858842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 113)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2175186 - 2174793
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175186 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2175087  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175086 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 2174987  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  | |       
T  2174986 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-ct 2174893  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2174892 ctgatacaaggcctgtatttatagtaaaagcatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagtgcaccatc 2174793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 21684463 - 21684866
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21684463 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 21684562  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21684563 gtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctag 21684662  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----tctctcaaaata 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |     
T  21684663 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagtt 21684762  T
Q  297 gagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcac 396  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21684763 tagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttgtaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcac 21684862  T
Q  397 catc 400  Q
    ||||    
T  21684863 catc 21684866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38882373 - 38881979
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882373 gttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38882274  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882273 gtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 38882174  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||| || |         
T  38882173 tgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc-----ctctatctccaagtttgct 38882079  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  38882078 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatc 38881979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4236897 - 4236504
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4236897 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 4236798  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4236797 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaacccta 4236698  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     |||  | |      
T  4236697 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatctc-----caagtttg-c 4236604  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236603 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 4236505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 25921484 - 25921878
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25921484 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 25921583  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25921584 agtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaacccta 25921683  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  25921684 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 25921777  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  25921778 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgtcagcgcaccat 25921877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16776425 - 16776031
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16776425 gttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg-ttacaagaata 16776327  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776326 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 16776227  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  16776226 gtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 16776133  T
Q  300 cctgatacaaggtctata-tttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16776132 tcagatacaaggtctatattttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatcttcactcaaaaatatgtttctgtttttcgatgccagcgcacca 16776033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21948294 - 21947911
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  21948294 gttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaaggggttacaagaata 21948195  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21948194 agtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 21948095  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||  |     
T  21948094 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccc-------ctctatctcaaaatttac 21948002  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgcca 390  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21948001 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgctgcca 21947911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27912804 - 27912473
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27912804 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 27912705  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27912704 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 27912605  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||    
T  27912604 ttatttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcaccctctatctctctctcaaagtttag 27912505  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912504 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27912473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 34479429 - 34479796
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479429 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 34479528  T
Q  101 gtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479529 gtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 34479628  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----------tctctctc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||    
T  34479629 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctctctc 34479728  T
Q  289 tcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  34479729 tctaaat--agcctgatacaaggtctatttttatagtaaaggtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 34479796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 34477064 - 34477435
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477064 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 34477163  T
Q  101 gtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477164 gtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 34477263  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--------------tctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||    
T  34477264 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctctctc 34477363  T
Q  285 tctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34477364 tctctctaaat--agcctgatacaaggtctatttttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 34477435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18466952 - 18466625
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18466952 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 18466853  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18466852 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 18466753  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  18466752 gtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 18466655  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466654 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 18466625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25804292 - 25803959
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25804292 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 25804194  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25804193 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 25804094  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctca---aaata 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||     
T  25804093 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagccccctctatctctctctctctcaaatt 25803994  T
Q  297 gagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803993 tagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25803959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27910718 - 27910388
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27910718 gttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 27910619  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27910618 agtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 27910519  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |     
T  27910518 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaa-ccttgtttcagcccccgctatctctctctcaaagtttaa 27910420  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910419 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27910388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31545348 - 31544996
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545348 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 31545249  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545248 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 31545149  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||| |        
T  31545148 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccttta------tctcaaagtttgc 31545055  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  31545054 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 31544996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18469277 - 18468950
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18469277 gttcggtccaaattgacctagtct--gggagagagcagctcttcgttccactagatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaaaa 18469180  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18469179 agtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 18469080  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |     
T  18469079 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc--aaagtttat 18468982  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468981 catgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18468950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Original strand, 2818346 - 2818731
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |    
T  2818346 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 2818445  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2818446 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttccaaggtgaatcaaaccctcaaaccct 2818545  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |    
T  2818546 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagttta 2818639  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgcca 390  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  2818640 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccgaaaatacgtttttgttattcgctgcca 2818731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31543002 - 31542651
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31543002 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaagagaaatcaatgggtt-cgagaataa 31542904  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542903 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 31542804  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  31542803 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 31542710  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  31542709 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 31542651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15552513 - 15552178
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552513 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 15552414  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552413 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 15552314  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc----aaaat 295  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| |    
T  15552313 gtgtttgctcctaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagtcccctctatctctctctctctcaaagt 15552214  T
Q  296 agagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552213 ttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15552178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6745336 - 6745047
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6745336 gttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 6745237  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6745236 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-ccta 6745138  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6745137 gtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttcagccccctttatctctctctc 6745047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18511223 - 18511547
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  18511223 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaacgggttacaagaata 18511322  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18511323 agtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 18511422  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |  ||    
T  18511423 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctctc----aaagtttag 18511518  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18511519 tctgatacaaggtctatatttatattaaa 18511547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 10529110 - 10529394
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10529110 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 10529209  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10529210 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 10529309  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10529310 gtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacccactctatctc 10529394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 31179382 - 31179666
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31179382 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatgaatgggttacaagaataa 31179481  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179482 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 31179581  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31179582 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctc 31179666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39854751 - 39854468
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39854751 gttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 39854652  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39854651 agtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 39854552  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39854551 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 39854468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6747572 - 6747284
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6747572 gttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaaaagaaatcaatgagttacaagaataa 6747473  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6747472 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctag 6747374  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6747373 tgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaactctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctttctc 6747284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40221791 - 40221506
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  40221791 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 40221692  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  40221691 aagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaatcct 40221592  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221591 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 40221506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18509329 - 18509652
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaag-agaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| | ||||||||||||    
T  18509329 gttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaacgagttacaagaata 18509428  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18509429 agtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 18509528  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||| |  ||    
T  18509529 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccc-----tctatctctcaaagtttag 18509623  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509624 tctgatacaaggtctatatttatagtaaa 18509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 1189618 - 1189949
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagg-ggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  1189618 gttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 1189717  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1189718 taagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaaccc 1189817  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatag 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||     
T  1189818 tagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccgtagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttac 1189917  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 330  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189918 a-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 1189949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6756760 - 6756368
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaga-gaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||| ||||| ||||||| | || |||||||  ||||||||||    
T  6756760 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc-gtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaatg--ttacaagaat 6756664  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6756663 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggagaatcaaccctcaaaccct 6756564  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||      ||||||| |  |    
T  6756563 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcagctccctcta------tctcaaagttta 6756470  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
       ||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6756469 atatgatacaagatctatattaatagtaaaagtataacttaaaatttggaataaatctgcaccaaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcacca 6756370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 36402339 - 36402732
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  36402339 gttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaataata 36402438  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36402439 agtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtattttccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 36402538  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||  |  |     
T  36402539 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcgtgattgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaacgtttac 36402632  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  36402633 tctgatataaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaattt-gaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgttgccaacgcaccat 36402731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25904371 - 25904087
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25904371 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgataagtaacgttacaatagagatatcaatgtgttacaagaata 25904272  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25904271 agtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 25904172  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904171 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 25904087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26097999 - 26097717
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  26097999 gttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagc-ctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaata 26097901  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  26097900 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgtttcc-aaggtgaatcaaccctctaacccta 26097802  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26097801 gtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgccattctaaacctttatttcagccccctctatctc 26097717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 16092210 - 16092497
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  16092210 gttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatgggttacaagaat 16092309  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16092310 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 16092409  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 286  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092410 agtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctctc 16092497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 10474334 - 10474615
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  10474334 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaaagagatatcaatgggttacaaaaata 10474433  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  10474434 agtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcccaaggtgtatcaaccctcaaacccca 10474533  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10474534 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctat 10474615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 51 - 400
Target Start/End: Original strand, 31466040 - 31466383
Alignment:
Q  51 ctatatgatgagtaacgttacaaag-agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaag 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  31466040 ctatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaag 31466138  T
Q  150 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31466139 agactcaatcctaatactgtttctcaaggtgaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtcgtta 31466238  T
Q  250 cctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaa 349  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||| | ||      ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31466239 cttttttaaacctttgtttcagcccctttta------tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtcgcttaaaatttggaa 31466332  T
Q  350 caaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  31466333 caaatctgcacccaaaaatacatttatggtattccctgccagtgcaccatc 31466383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17073152 - 17072867
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  17073152 gttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 17073053  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17073052 aagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 17072953  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17072952 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 17072867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10587100 - 10586782
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10587100 gttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttaaaagaata 10587001  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10587000 agtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 10586901  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
      ||||||| || ||||||||||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |    
T  10586900 tcgtttgttcccaaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcag-cccctcta--tctctctcaaagttta 10586815  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586814 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10586782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 31472623 - 31472908
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||     
T  31472623 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaag 31472722  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    | |  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31472723 atgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacctt 31472822  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31472823 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 31472908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24127124 - 24126840
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  24127124 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaata 24127025  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  24127024 agtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtcaatcaatcttcaaacccta 24126925  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24126924 gtatttgttgacaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagccccatctatctc 24126840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 658367 - 658610
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  658367 gttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 658463  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658464 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaacccta 658563  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 246  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658564 gtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 17818503 - 17818776
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17818503 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgtatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 17818600  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  17818601 agtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccatcaaacccta 17818700  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 275  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17818701 gtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcccc 17818776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18596914 - 18596633
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||    
T  18596914 gttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaat 18596815  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  18596814 aagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccat 18596715  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 282  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  18596714 attgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctt--tatacccttgtttcagccccctctatc 18596633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 12555934 - 12556328
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaat--caatgggttacaagaat 98  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| | | | || || |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||     
T  12555934 gttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaaa 12556033  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||| ||| | | |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12556034 aagtctcttgtctaattctaccaaaactccaatc-tcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacctt 12556132  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||      ||||||| |  |    
T  12556133 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttcagccccctcta------tctcaaagttta 12556226  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  12556227 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaattttgaaacaaatctgtacacaaaaatacatttctgttattcgctgccagcgcatca 12556326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 39398004 - 39398287
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || | |  ||||||| ||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39398004 gttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 39398103  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39398104 agtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-ccta 39398202  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39398203 gtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 39398287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4410290 - 4410090
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4410290 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaataggttacaagaataa 4410191  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410190 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 4410091  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  4410090 t 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 37705791 - 37706075
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |  | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37705791 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 37705890  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37705891 agtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 37705990  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37705991 gtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaaccctagatttgtcgttgcctttctaaacctttatttcagccccctctatctc 37706075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2954684 - 2954400
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  2954684 gttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactatatgatgagtaactttacaaagagatatcaatgggttacaagaatac 2954585  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2954584 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtgaatcaaccctcaaaccctag 2954485  T
Q  201 tgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  2954484 tgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcatactcctctatctc 2954400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 696146 - 695873
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  696146 gttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 696047  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  696046 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 695948  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  695947 agtgtttgttccaaag-----------atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctttatctc 695873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 284
Target Start/End: Original strand, 34530722 - 34530961
Alignment:
Q  47 tccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaa 144  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||     
T  34530722 tccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtag 34530821  T
Q  145 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34530822 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 34530921  T
Q  245 tgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34530922 tgttgcatttctaaacacttgtttcagccccctctatctc 34530961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 110 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20043034
Alignment:
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 209  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  210 cgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20043108 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatctc 20043034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20044994
Alignment:
Q  106 ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 20045073  T
Q  206 gttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20045072 gttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtctc 20044994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10749968 - 10749796
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749968 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10749869  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10749868 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39798315 - 39798123
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39798315 gttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatacgatgagtatcattataaaagagaaatcaatgggttacaagaata 39798216  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798215 agtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 39798123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 20505854 - 20506041
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  20505854 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaata 20505951  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505952 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20506041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21289029 - 21288748
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||| |||      || |||||||||| ||    
T  21289029 gttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaacgttacaaa-aga------tgagttacaagaaaaa 21288937  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta- 199  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||     
T  21288936 atctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttttc-aaggtgaatcaaccctcaaaccctaa 21288838  T
Q  200 -----gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
         ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21288837 ccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctatttttattgttgctattctaaacccttatttcaaccccctctatctc 21288748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 41585755 - 41585956
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||| ||||    
T  41585755 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgacttacaaaaata 41585854  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41585855 agtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 41585954  T
Q  200 gt 201  Q
    ||    
T  41585955 gt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10757444 - 10757273
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10757444 gttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagaaaaatcaatgggttacaagaataa 10757345  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10757344 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc-gtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 3373148 - 3373320
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373148 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3373247  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3373248 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 15354586 - 15354757
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15354586 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 15354684  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15354685 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23665311 - 23665140
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23665311 gttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 23665213  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23665212 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 23793276 - 23793447
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23793276 gttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 23793374  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23793375 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 6661195 - 6661477
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||   || | ||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6661195 gttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 6661294  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |    
T  6661295 taagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaatcaacc--ccaactc 6661392  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6661393 tagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacataccctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccctctctatctc 6661477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 15356862 - 15357033
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15356862 gttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 15356960  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15356961 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 38960143 - 38960314
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38960143 gttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 38960241  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38960242 gtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 141 - 284
Target Start/End: Original strand, 26098403 - 26098546
Alignment:
Q  141 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagtt 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26098403 gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtc 26098502  T
Q  241 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26098503 ttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctc 26098546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 397
Target Start/End: Original strand, 20507665 - 20507864
Alignment:
Q  192 aaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctca 291  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||    
T  20507665 aaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctca 20507758  T
Q  292 aaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccag 391  Q
    || |  |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  20507759 aagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaatcttggaacaaatctgctcccaaaaatatgtttctgttattcgctgctag 20507858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2724161 - 2723964
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2724161 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 2724062  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | || ||||||||||||||         |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2724061 aatcacccgcctaattcta---------ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcatccctcaaacccta 2723971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 23741870 - 23742034
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23741870 gttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 23741968  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaata 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  23741969 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactccaatcctaata 23742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9020460 - 9020211
Alignment:
Q  28 ggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 125  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9020460 ggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaag 9020361  T
Q  126 tcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactct 225  Q
      |||  ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |   |||||||||||||||| | |||||   ||||||    
T  9020360 ctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgttttccaaggtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgttgccaagag--caactct 9020265  T
Q  226 atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctcta 280  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  9020264 atacaaaccctacttttg-tgttgcc-tcccaaacccttgttttcagctccctcta 9020211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20054105 - 20053834
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||  || | || |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||   ||||||||||||    
T  20054105 gttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatc---gggttacaagaa 20054009  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  20054008 taagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatctcca-----aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--tcaaccc 20053916  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 281  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20053915 tagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaactctagtttttgtgttgcc-ttctaaacccttgtttcagcgccctctat 20053834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 17413176 - 17413441
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  17413176 gttcggtccaacactgaccaactctgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 17413275  T
Q  98 taagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    ||||| | |   |||||||||||| |||||| ||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||    
T  17413276 taagttttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaacc 17413373  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||  |||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  17413374 ctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccatagttttagtgctgcc-ttctaaacccttgttt 17413441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36208844 - 36208656
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | | | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36208844 gttcggtccaaattgacctagtat-ggggaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 36208746  T
Q  99 aagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 187  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  36208745 aagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaaggtgaatcaac 36208656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 304 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39798058 - 39797962
Alignment:
Q  304 atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39798058 atacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgcaccatc 39797962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15143722 - 15143547
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||    
T  15143722 tgacctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacc 15143623  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  15143622 taattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgcttccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410000
Alignment:
Q  228 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| |    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtga 4410004  T
Q  328 aagt 331  Q
    ||||    
T  4410003 aagt 4410000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23667586 - 23667415
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  23667586 gttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatgagtgacgttacaaagagaaatcaatgggttgcaagcat-a 23667488  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    || |  |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  23667487 gtttttcgcctaattctttccaaagtcccaatctctttctgtaagcaagagagtccaatccttatagtgtttc 23667415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 290
Target Start/End: Original strand, 2144599 - 2144862
Alignment:
Q  27 gggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatg-ggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaa 123  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||| |   |||||||| ||||||    
T  2144599 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatataaaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattccacccaa 2144698  T
Q  124 agtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt-ttgttccgaagagacaa 220  Q
    |||||  |  ||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  2144699 agtcctgaatctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtgttgttgccaagag-caa 2144795  T
Q  221 actctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    ||||  ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  2144796 actc--tacaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgtttttgccccttctctctctctctc 2144862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1170967 - 1170811
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  1170967 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 1170871  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170870 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 35385477 - 35385634
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  35385477 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 35385573  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35385574 ctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 42771025 - 42770951
Alignment:
Q  54 tatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42771025 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 42770951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4897985 - 4897828
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaataagtctccc-gcc 110  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |  |||    
T  4897985 tgacctagtatgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcc 4897886  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  4897885 taattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25452652 - 25452498
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || || |||||||| ||||| |   |    
T  25452652 tgacctattctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagtaacaagaatcagtcttcaaac 25452556  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25452555 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25452498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4754379 - 4754159
Alignment:
Q  45 gatccactatat-gatgagtaacgttacaaagagaaatcaatg-ggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctg 141  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||| || || |   |||||||||| |||||||| ||  ||||||| |    
T  4754379 gatccactatattgatgagtaactttacaaagagatataaaaaaggttacaagaattagccttcaaacctaattctatccaaagtcacaatctcttccag 4754280  T
Q  142 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttt 241  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |    |||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  4754279 tgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagtgt 4754185  T
Q  242 tgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  4754184 ttgtgttggcttt-taaacccttgttt 4754159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25445653 - 25445501
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || || |||||||| ||||| |   |    
T  25445653 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagtaacaagaatcagtcttcaaac 25445557  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatag 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25445556 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatag 25445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770757
Alignment:
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||  | |||| ||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaata--gtttcccatggtgaatgaacc--ccaacctta 42770839  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42770838 gtgtttgttgccaagag-caaattctatataaa-cctaattttg-tgttgcc-ttccaaacccttgttttcagtcccctctatctc 42770757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 17841274 - 17841428
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  17841274 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 17841370  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  17841371 ctaattctacccaa-gttccagcctcttcccgtgacctagagactcaatcctaatagtg 17841428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22672991 - 22672837
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  22672991 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 22672895  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  22672894 ctaattctacccaa-gtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 2298122 - 2298183
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2298122 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28786465 - 28786407
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28786465 cctaattctgcccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 28786407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29748502 - 29748352
Alignment:
Q  114 ttctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  | ||||||| |||||||| |     
T  29748502 ttctacccaaagtcccgaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatc--ctaaccctactgtttgttgcc 29748405  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    |||||   || ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  29748404 aagag---aattctctacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgttt 29748352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1240489 - 1240428
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1240489 cctaattctacccaaa-tcccagcctcttcccgtgcctaagagactcaatcctaatagtgttt 1240428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 26098299 - 26098373
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26098299 gttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccatatgatgagtaacgttacaaa 26098373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29748314 - 29748260
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||    
T  29748314 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctcaaaatttggaacaaatc 29748260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10757236 - 10757180
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  10757236 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 10757180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 15354789 - 15354845
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  15354789 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 15354845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 15357065 - 15357121
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  15357065 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 15357121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23665110 - 23665054
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  23665110 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 23665054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 23793477 - 23793533
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  23793477 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 23793533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31542628 - 31542576
Alignment:
Q  348 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  31542628 aacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttatccgccagcgcaccatc 31542576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 38960349 - 38960405
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  38960349 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 38960405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 11962554 - 11962612
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  11962554 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagacacaatcctaatagtg 11962612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 284
Target Start/End: Original strand, 41585946 - 41586001
Alignment:
Q  229 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41585946 caaaccctagttttgttcttgttattctaaacccttgtttcagccccctttatctc 41586001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 15445291 - 15445453
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcc 110  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | || ||   ||    
T  15445291 tgacctagtct-gggaagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaatcattcttcaaacc 15445389  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgt---aaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||| |||     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15445390 taattctactcaaagtctcaatctcttcatgtggccgccaagagactcaatcctaacagtgttt 15445453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 171
Target Start/End: Original strand, 16093413 - 16093473
Alignment:
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16093413 ctaattctacctaa-gtcccagacttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16093473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Original strand, 2144898 - 2144954
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaa-atttggaacaaatct 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||    
T  2144898 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcaaataattggaacaaatct 2144954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23667385 - 23667329
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  23667385 tgatacaaggtctatatttatagttaaagtcatgcttaaaatctataacaaatctgc 23667329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 31179678 - 31179734
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  31179678 tgatacaatgtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 31179734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10749759 - 10749704
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctg 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |  ||||||||||    
T  10749759 tgatacaaggtctatatttatactaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctg 10749704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 186
Target Start/End: Original strand, 34033725 - 34033768
Alignment:
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34033725 accaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatcaa 34033768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 31782578 - 31782639
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31782578 cctaattctacccaat-tcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 31782639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40222822 - 40222769
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaata 165  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  40222822 taattctacccaa-gttccagcctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaata 40222769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 331
Target Start/End: Original strand, 3373348 - 3373377
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373348 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3373377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36208553 - 36208524
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208553 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 36208524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 20043258 - 20043222
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20043258 gttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29447 - 29044
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29447 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 29348  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29347 gtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctag 29248  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc----aaaata 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |     
T  29247 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagtt 29148  T
Q  297 gagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcac 396  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29147 tagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttgtaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcac 29048  T
Q  397 catc 400  Q
    ||||    
T  29047 catc 29044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 119)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 40836754 - 40837148
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836754 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 40836853  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836854 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 40836953  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     |||| | |       
T  40836954 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccccctcaatctc-----caaatttg-ct 40837047  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  40837048 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaaatatgtttctatttttcgctgccagcacaccat 40837147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 1049307 - 1049697
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049307 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1049406  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049407 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 1049506  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |         
T  1049507 tgtttattccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgct 1049600  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacc 397  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  1049601 ctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcacc 1049697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38394264 - 38393935
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38394264 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 38394165  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394164 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 38394065  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  38394064 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 38393967  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393966 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38393935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25542806 - 25542414
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542806 gttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25542707  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542706 gtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtcttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 25542608  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||       |||| ||||||| |         
T  25542607 tgttttttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacctttgtttcagccc-------ctctatctcaaagtttgct 25542515  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25542514 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaataaatctacactcaaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccat 25542415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 400
Target Start/End: Original strand, 27306245 - 27306634
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27306245 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtc 27306344  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27306345 tcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagttt 27306444  T
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctg 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  |  |||    
T  27306445 ttgttccaaagagacaaactctata-aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttactctg 27306537  T
Q  304 atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  27306538 atacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgctagcgcaccatc 27306634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 1046936 - 1047295
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1046936 gttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1047035  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047036 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 1047135  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc---aaaatag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    | ||      
T  1047136 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctctcttagat-t 1047234  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  1047235 agcttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 1047295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35907 - 35517
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35907 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 35808  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35807 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 35708  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  35707 gtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgtctttctgaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 35614  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcac 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||    
T  35613 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgctatttgctgccagcgcac 35517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48457931 - 48457602
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48457931 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 48457832  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  48457831 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccctaggtgaatgaaccctcaaacccta 48457732  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  48457731 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 48457634  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48457633 cctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 48457602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3878855 - 3878456
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3878855 gttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 3878756  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3878755 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaagcccta 3878656  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |        
T  3878655 gcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatc----tctcaaagtttgc 3878560  T
Q  300 cctgatacaaggtctat----atttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgca 395  Q
     ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |    
T  3878559 tctgatacaaggtctatattaatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgta 3878461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 7470033 - 7470359
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7470033 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 7470132  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7470133 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaacccta 7470232  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  7470233 gtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttag 7470330  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470331 tctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7470359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3036002 - 3035670
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3036002 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 3035903  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcct---gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035902 agtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 3035803  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaata 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |     
T  3035802 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtt 3035705  T
Q  297 gagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035704 tagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3035670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 7471991 - 7472317
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7471991 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 7472090  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472091 agtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 7472190  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  7472191 gtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttag 7472288  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472289 tctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7472317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 331
Target Start/End: Original strand, 7349285 - 7349615
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349285 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 7349384  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349385 tctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 7349484  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  7349485 tgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagc 7349584  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349585 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 7349615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20299738 - 20299407
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20299738 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 20299639  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaaccct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20299638 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccct 20299539  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa-cccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatag 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |      
T  20299538 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagttt 20299441  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299440 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 20299407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44842 - 44448
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44842 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 44743  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  44742 agtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 44643  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  44642 gtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 44549  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  44548 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggtacaaatctgcacccaaaaatatgtttatgttatttgctgccagcgcaccat 44449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 7351663 - 7351994
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351663 gttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7351762  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351763 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 7351862  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  7351863 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttag 7351962  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7351963 cctgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 7351994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20626316 - 20625990
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20626316 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 20626217  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20626216 agtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 20626117  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  20626116 gtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 20626019  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20626018 tctgatagaaggtctatatttataataaa 20625990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20630207 - 20629881
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20630207 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 20630108  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20630107 agtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 20630008  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  20630007 gtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 20629910  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20629909 tctgatagaaggtctatatttataataaa 20629881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20642626 - 20642300
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20642626 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 20642527  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20642526 agtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 20642427  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  20642426 gtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 20642329  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20642328 tctgatagaaggtctatatttataataaa 20642300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28487831 - 28487502
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28487831 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 28487732  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28487731 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacgaacccta 28487632  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  28487631 gtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 28487534  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28487533 cctgatacatggtctatatttataggaaaagt 28487502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1850259 - 1849969
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1850259 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 1850160  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1850159 agtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaacccta 1850060  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850059 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 1849969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18345817 - 18345490
Alignment:
Q  3 tcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18345817 tcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 18345718  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18345717 tctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt 18345618  T
Q  202 gtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcc 301  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| |  ||||    
T  18345617 atttgttgcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctcta--tctccctcaaagttcagcc 18345520  T
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345519 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44724857 - 44724573
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44724857 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 44724758  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44724757 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 44724658  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44724657 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctc 44724573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20297640 - 20297311
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20297640 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 20297541  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20297540 agtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 20297441  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||    
T  20297440 ctgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc--tctcaaagtttag 20297343  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20297342 cctgatacaaggtccatatttttagtaaaagt 20297311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 31435057 - 31435452
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31435057 gttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 31435156  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31435157 aagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 31435256  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||| |  |    
T  31435257 agcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttcta------tctcaaagttta 31435350  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgca-ctcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacc 397  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  31435351 ctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaac-aatttgcaccaaaaaaatacgtttctgttattcgttgccagcgcacc 31435449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 43253528 - 43253860
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43253528 gttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaata 43253627  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43253628 agtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-ccta 43253726  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc--tctatctctctctcaaaatag 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |      
T  43253727 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaaccttgtttcagccctctttctctctctctctcaaagttt 43253826  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253827 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43253860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40946606 - 40946318
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40946606 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaagaata 40946507  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  40946506 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtaaatcaacccacaaacccta 40946407  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 288  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40946406 gtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctgtccctctc 40946318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 45 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11757464 - 11757177
Alignment:
Q  45 gatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11757464 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 11757365  T
Q  144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757364 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 11757265  T
Q  243 gttgttgcctttctaaa-cccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757264 gttgttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11757177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11355536 - 11355252
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaga-gaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  11355536 gttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactatatgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaata 11355437  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11355436 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 11355337  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355336 gtgtttattgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 11355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28485843 - 28485515
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28485843 gttcggtccaaattgacctagtct-gaggagagagcaaccctctgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaata 28485745  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28485744 aatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccgcaaacccta 28485645  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| |  ||    
T  28485644 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctc--tctcaaagtttag 28485547  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485546 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 28485515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 31155922 - 31156271
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31155922 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 31156021  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31156022 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaatccta 31156121  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |        
T  31156122 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc------aaagtttgc 31156215  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgctta-aaatttggaacaaat 354  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  31156216 cttgatacaagctctatatttatagtaaaagtatagctcataaatttggaacaaat 31156271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21680305 - 21680021
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  21680305 gttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaagaata 21680206  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21680205 aatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaacccta 21680106  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680105 gtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 21680021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 37412136 - 37412423
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa--gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  37412136 gttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaatgagttacaagaa 37412235  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37412236 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 37412335  T
Q  198 tagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37412336 tagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctatatctc 37412423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 4295945 - 4296230
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  4295945 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaata 4296044  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4296045 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacccta 4296144  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296145 gtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 4296230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 20137120 - 20137404
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20137120 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 20137218  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20137219 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 20137318  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137319 agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 20137404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21678344 - 21678060
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  21678344 gttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaata 21678245  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21678244 cgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 21678145  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678144 gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgatgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 21678060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 13099485 - 13099771
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa--gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  13099485 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaa 13099584  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13099585 taaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactc 13099684  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13099685 tagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaaccccctctatctc 13099771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 42331008 - 42331335
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||| | | |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42331008 gttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactatataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 42331107  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc--tgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42331108 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 42331207  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatag 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |      
T  42331208 tagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagttt 42331301  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42331302 agtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 42331335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 85 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26804765 - 26804458
Alignment:
Q  85 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804765 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 26804666  T
Q  185 aacccacaaacc---ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 281  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26804665 aaccctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 26804567  T
Q  282 ctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttt 381  Q
         ||||||| |  |  |    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |    
T  26804566 -----tctcaaagtttactc----acaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaatacgtttctgttat 26804477  T
Q  382 tccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  26804476 ttgctgccagcgcaccatc 26804458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21990428 - 21990145
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |    
T  21990428 gttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaaaa 21990329  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21990328 agtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaacccta 21990229  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21990228 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 21990145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9681098 - 9680768
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||    
T  9681098 gttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaata 9680999  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9680998 agtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaacccta 9680899  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      || |    
T  9680898 gtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaaccccctctatctctctcaaggtttaca 9680799  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 330  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680798 -tctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 9680768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 443874 - 443589
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  443874 gttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatatcaatggattacaagaat 443775  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  443774 aagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 443675  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  443674 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccattgttttagctccctctatctc 443589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24748873 - 24748592
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24748873 gttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 24748774  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24748773 aagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccct 24748674  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24748673 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta 24748592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 21592154 - 21592438
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  21592154 gttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaata 21592253  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21592254 agtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 21592353  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21592354 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctttgtttcagccccctctatctc 21592438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9679333 - 9679009
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9679333 ggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtc 9679234  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9679233 tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgt 9679135  T
Q  204 ttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcct 302  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |   || |  ||    
T  9679134 ttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttaca-tct 9679036  T
Q  303 gatacaaggtctatatttatagtaaaa 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9679035 gatacaagatctatatttatagtaaaa 9679009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 39145997 - 39146282
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| | | | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  39145997 gttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaat 39146096  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  39146097 aagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccct 39146196  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39146197 agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgtttcagccccctccatctc 39146282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24258744 - 24258457
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata----tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaga 96  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| | |||||||||    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24258744 ttcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 24258645  T
Q  97 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||  || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24258644 ataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacc 24258545  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258544 atagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 24258457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Original strand, 27832651 - 27832916
Alignment:
Q  9 caaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttaca-aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||   | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27832651 caaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc 27832750  T
Q  107 cgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 206  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27832751 cgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatg 27832850  T
Q  207 ttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 272  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27832851 ttgccaagagacaaactctatacaaaccttagttctgttgttgcctttttaaacccttgtttcagc 27832916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25276374 - 25276135
Alignment:
Q  47 tccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  25276374 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaa 25276275  T
Q  145 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276274 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 25276175  T
Q  245 tgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  25276174 tgttgcctttctaaattattgttttagccccctctatctc 25276135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38396912 - 38396713
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38396912 gttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactatatgatgagtaaagttacaaagagaaatcaatgggttacaaaaataa 38396813  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38396812 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42223436 - 42223165
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||   | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||    
T  42223436 gttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaataggtttcaagaata 42223337  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42223336 agttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 42223237  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 270  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42223236 gtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttca 42223165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 7092224 - 7092431
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7092224 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 7092322  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7092323 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 7092422  T
Q  200 gtgtttgtt 208  Q
    |||||||||    
T  7092423 gtgtttgtt 7092431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 7094471 - 7094678
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7094471 gttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 7094570  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7094571 agtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 7094670  T
Q  200 gtgtttgtt 208  Q
     ||||||||    
T  7094671 -tgtttgtt 7094678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 284
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828928
Alignment:
Q  30 agagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 127  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22828771  T
Q  128 ccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctat 227  Q
     ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  22828772 tcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctat 22828871  T
Q  228 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22828872 acaaaccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctc 22828928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 346
Target Start/End: Original strand, 22251602 - 22251893
Alignment:
Q  47 tccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcct 140  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||     
T  22251602 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttccc 22251701  T
Q  141 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagtt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22251702 gtaaccaagagactcaatccta--------tcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagtt 22251793  T
Q  241 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaa 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||      ||||||| |  |  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22251794 ttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcctcctcta------tctcaaagtttactctgattcaaggtttatatttatagtaaaagtgtcgcttaa 22251887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 24817363 - 24817643
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  24817363 gttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaa 24817462  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||    
T  24817463 taagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaaccc---aaccc 24817559  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24817560 tagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttgac-ttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 24817643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567497
Alignment:
Q  160 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 18567632  T
Q  260 cccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgca 359  Q
    |||||||||||||||| ||||      ||||||| |  |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18567631 cccttgtttcagccccttcta------tctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaac-aatttgca 18567539  T
Q  360 -ctcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
     |  ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  18567538 ccaaaaaaatacgtttctgttattcgttgccagcgcaccatc 18567497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2935546 - 2935374
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935546 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2935447  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2935446 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 24813508 - 24813755
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaag-agaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  24813508 gttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaagaa 24813607  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||    
T  24813608 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaatcaaccc---aaccc 24813704  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 249  Q
    |||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24813705 tagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 24813755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 284
Target Start/End: Original strand, 20091583 - 20091836
Alignment:
Q  26 ggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 124  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091583 ggggagagagcagccctccgttccactat--gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 20091680  T
Q  125 gtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactc 224  Q
    ||| ||  ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||| | || || |||||||    
T  20091681 gtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag-caaactc 20091777  T
Q  225 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20091778 tatacaaaccctagttttg-tgttgcc-tccgaaacccttgttttcagccccctctatctc 20091836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1606657 - 1606486
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1606657 gttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 1606559  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1606558 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22137355 - 22137184
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22137355 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 22137257  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22137256 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40552382 - 40552211
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40552382 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 40552284  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40552283 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7188789 - 7188537
Alignment:
Q  30 agagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 127  Q
    ||||||||||  || | ||||||||| |||||| |||| ||||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7188789 agagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtc 7188690  T
Q  128 ccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctat 227  Q
     ||  || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  7188689 tcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaaccctat 7188593  T
Q  228 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7188592 acaaaccctatttttattgttgac-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 7188537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 9027205 - 9027376
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9027205 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 9027303  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9027304 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22108344 - 22108173
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22108344 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 22108246  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22108245 gtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40550104 - 40549933
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40550104 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 40550006  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40550005 gtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 133 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22392606 - 22392357
Alignment:
Q  133 ctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 232  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | || || |||| ||||||||||    
T  22392606 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca---accctagtgtttgttgccaatag-caaattctatacaaa 22392511  T
Q  233 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtc 332  Q
    |||||||||  ||        | |||||||||||||||||||||||||||||      ||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22392510 ccctagtttgatt--------tataaacccttgtttcagccccctctatctc------aaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 22392425  T
Q  333 tcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |  |||||||||||||    
T  22392424 tcgcttacaatttggaacaaatctgcactgaaaaatacatttctgttttttgcctccagcgcaccatc 22392357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24465735 - 24465543
Alignment:
Q  80 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 179  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24465735 atcaatgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggt 24465636  T
Q  180 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 279  Q
    |||||||  |   |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24465635 gaatcaattc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctct 24465548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22393997 - 22393876
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22393997 ggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagt 22393898  T
Q  103 ctcccgcctaattctacccaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22393897 ctcccgcctaattctacccaaa 22393876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26295726 - 26295580
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26295726 gttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 26295627  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaac 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  26295626 aagtctctcgcctaattctacccaaagtcacaatcgcttcctgtaac 26295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6332500 - 6332311
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||   || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||    
T  6332500 gttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaa 6332401  T
Q  98 taagtctccc-gcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  6332400 taagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttttccaaactgaatcaa 6332311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11081789 - 11081522
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatat-gatgagtaacgttaca-aagagaaatcaat--gggttacaag 95  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  || | |||| | ||  |||||||||| ||||| |||||| |||||   ||||||||||    
T  11081789 gttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccgttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaaaaagggttacaag 11081690  T
Q  96 aataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 194  Q
    ||| ||||| |   ||||||| ||| |||| ||| |  ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    ||    
T  11081689 aattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaatc--tcaa 11081592  T
Q  195 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    |||||||||||||| | |||||   || ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11081591 ccctagtgtttgttgccaagag---aattctctacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgttt 11081522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25351508 - 25351353
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cct 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |||    
T  25351508 tgacctagtctgggggagagaacagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacct 25351412  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25351411 aattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38396377 - 38396304
Alignment:
Q  217 acaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38396377 acaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctccctctctctctc 38396304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2121056 - 2120881
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  2121056 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 2120960  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt--cccaaggtgaatcaac 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2120959 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttgtccaaggtgaatcaac 2120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 16297032 - 16297222
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat-gggttacaaga 96  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||| || |||| |||| || ||  |||||||||||    
T  16297032 gttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatattaaaagggttacaaga 16297131  T
Q  97 ataagtctcccgc-ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    || | ||| |    |||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16297132 atcaatcttcaaatctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6049094 - 6048885
Alignment:
Q  55 atgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagac 153  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||| ||   |||||||||| |||||||| ||   |||||  || |||||||||     
T  6049094 atgatgagtaactttacaaagggatatcaaagggttataagaatacgtcttcaaacctaattctatccaaagtctcaatatcttctcgtgaccaagagat 6048995  T
Q  154 tcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | |||||   || ||| ||||||||||||||||| ||||| |     
T  6048994 tcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag---aattctttacaaaccctagttttgatgttggc- 6048901  T
Q  253 ttctaaacccttgttt 268  Q
    ||||||||||||||||    
T  6048900 ttctaaacccttgttt 6048885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 45366526 - 45366447
Alignment:
Q  304 atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttc 383  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45366526 atacaaggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcactgaaaaatacgtttctgtttttc 45366447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 3320076 - 3320232
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  3320076 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 3320172  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3320173 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 3324824 - 3324980
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  3324824 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 3324920  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3324921 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25405549 - 25405393
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  25405549 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 25405453  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25405452 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25357202 - 25357047
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cct 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||  ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |||    
T  25357202 tgacctagtctgggggagagatcatctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacct 25357106  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357105 aattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25410287 - 25410130
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  25410287 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 25410191  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25410190 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046641
Alignment:
Q  2 ttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaaggtttacaagaata 6046673  T
Q  100 agtc-tcccgcctaattctacccaaagtccca 130  Q
    |||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  6046672 agtcttcaaacctaattctacccaaagtccca 6046641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7069936 - 7069780
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  7069936 tgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 7069840  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069839 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7074943 - 7074787
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  7074943 tgacctagtctgggggagagtgcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 7074847  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7074846 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6349006 - 6348933
Alignment:
Q  55 atgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 127  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6349006 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 6348933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 328
Target Start/End: Original strand, 7094662 - 7094759
Alignment:
Q  229 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 328  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7094662 caaaccctatgtttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaa 7094759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 13290484 - 13290723
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13290484 gttcggtccaatactgaccaagtctgagggagagtgtagctctctgttccgctataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaaaggttacaagaat 13290583  T
Q  99 aagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
     | || ||   |||||||||||||| ||| | |   ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  |  | || |    
T  13290584 tattcttcaaacctaattctacccagagttctaatatcttcctgtgaccaagagactaaattctaatagtgtttctcgaaggtgaatca--ctcccaagc 13290681  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttt 241  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  13290682 ctagtgtttgttgccaagaga-aaactc--tacaaaccctagttt 13290723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 42006724 - 42006663
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42006724 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 328
Target Start/End: Original strand, 7092414 - 7092512
Alignment:
Q  229 caaaccctagt-tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaa 327  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||||    
T  7092414 caaaccctagtgtttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctcca--tctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaa 7092511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 8378529 - 8378686
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  8378529 tgacctagtctgggggagagagcaactctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 8378625  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378626 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30247031 - 30246973
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30247031 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 30246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38396294 - 38396239
Alignment:
Q  276 ctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396294 ctctctctctctctcaaaatttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38396239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 44512646 - 44512704
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44512646 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44512704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 15541116 - 15541177
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541116 cctaattatacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 183
Target Start/End: Original strand, 40281466 - 40281572
Alignment:
Q  78 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  40281466 aaatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattccaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaa 40281565  T
Q  177 ggtgaat 183  Q
    |||||||    
T  40281566 ggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11084544 - 11084467
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||| |||||||||| | |  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11084544 cctaattttacccaaagttcgaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 11084467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Original strand, 44143997 - 44144045
Alignment:
Q  120 ccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44143997 ccaaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44144045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 34546984 - 34547042
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34546984 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 34547042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2935335 - 2935279
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  2935335 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 2935279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 9027411 - 9027467
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  9027411 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 9027467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22108143 - 22108087
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  22108143 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 22108087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22137154 - 22137098
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  22137154 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 22137098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40549903 - 40549847
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  40549903 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 40549847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40552181 - 40552125
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  40552181 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 40552125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26210710 - 26210631
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||||||| |||||||| |  ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26210710 cctaattctaccgaaagtcccgaatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa 26210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21369703 - 21369642
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369703 cctaattttacccaa-gtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 208
Target Start/End: Original strand, 12310160 - 12310234
Alignment:
Q  133 ctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  12310160 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgttcaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgtt 12310234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 11759405 - 11759369
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11759405 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11759369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42006545 - 42006483
Alignment:
Q  304 atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaa 366  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  42006545 atacacggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatatggaacaaatcttcactgaaaa 42006483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1606452 - 1606423
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606452 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 1606423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Original strand, 7464652 - 7464697
Alignment:
Q  123 aagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  7464652 aagtcccagcctctccccgtgacaaagagactcaatcctaatagtg 7464697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 29159818 - 29159871
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat 54  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  29159818 gttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 29159871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 46516392 - 46516339
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat 54  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  46516392 gttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 46516339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6348903 - 6348813
Alignment:
Q  193 aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  6348903 aaccctaatgtttgttgccaagag-caaactcgatacaaaccctagttttcttttttac-ttctaaacccttgttttcagtcctctctatctc 6348813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7188526 - 7188470
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgctta-aaatttggaacaaatct 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||    
T  7188526 ctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 7188470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 9190090 - 9190038
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccacta 53  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||    
T  9190090 gttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccacta 9190038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 105)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 14507187 - 14507580
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507187 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgataagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14507286  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507287 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 14507386  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||| |         
T  14507387 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta------tctcaaagtttgct 14507480  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14507481 ctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctacactcaaaaatatgtttctgtttttcgctggcagcgcaccatc 14507580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 11983040 - 11983434
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11983040 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 11983139  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11983140 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 11983239  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     |||  | |      
T  11983240 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcctttgtttcagccccctctatctc-----caagtttg-c 11983333  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11983334 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgtttaaaatttgaaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccat 11983433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 4816242 - 4816608
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4816242 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 4816341  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4816342 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaacccta 4816441  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--------tctctctctca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  4816442 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctctctca 4816541  T
Q  292 aaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  4816542 aagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 4816608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 20915367 - 20915721
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915367 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20915466  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915467 gtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 20915566  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||  ||    
T  20915567 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc----aatttag 20915662  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  20915663 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 20915721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30967504 - 30967176
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30967504 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 30967405  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967404 agtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 30967305  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||    
T  30967304 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc--aaagtttag 30967207  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967206 cct-atacaaggtctatatttatagtaaaagt 30967176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 30034614 - 30034943
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30034614 gttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 30034713  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034714 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 30034813  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||| |  ||    
T  30034814 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttttagctccctctatctctctt--aaagtttag 30034911  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034912 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 30034943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 331
Target Start/End: Original strand, 2628898 - 2629226
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2628898 ttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataaa 2628997  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  2628998 ttctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaacctagt 2629097  T
Q  202 gtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcc 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |     
T  2629098 gtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctctctctcaaagtttaaca 2629196  T
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629197 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2629226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9020229 - 9019836
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9020229 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 9020130  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9020129 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 9020030  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      | |  |     
T  9020029 gtgattgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctc------agtttac 9019936  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||    
T  9019935 tctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaatacgtttctgttatttgctgtcagcgcaccat 9019837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 28241332 - 28241617
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28241332 gttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 28241431  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241432 agtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 28241531  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241532 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 28241617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 14458778 - 14459060
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14458778 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 14458877  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  14458878 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag--gaatcagccctcaaacccta 14458975  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14458976 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctc 14459060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 19704578 - 19704905
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagaga--aatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19704578 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaagaat 19704677  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19704678 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactc 19704777  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatag 297  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      
T  19704778 tagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctccatctctctctcaaagttt 19704877  T
Q  298 agcctgatacaaggtctatatttatagt 325  Q
       |||||||||||||||||||||||||    
T  19704878 gctctgatacaaggtctatatttatagt 19704905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26065284 - 26064959
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26065284 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaagagaagtcaatgggttacaagaataa 26065186  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26065185 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 26065086  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |      
T  26065085 tgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc-caagaaatact 26064990  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26064989 gtgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26085253 - 26084928
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26085253 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaagagaagtcaatgggttacaagaataa 26085155  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26085154 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 26085055  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    |||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |      
T  26085054 tgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc-caagaaatact 26084959  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26084958 gtgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 26084928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 1230260 - 1230544
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1230260 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 1230359  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1230360 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 1230459  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1230460 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccctctctatctc 1230544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 15541151 - 15541545
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15541151 gttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactatatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15541250  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15541251 cgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 15541350  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  ||    
T  15541351 gtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttag 15541444  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  15541445 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtaacttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatatgtttctgctattcgctgccagcgtaccat 15541544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 33 - 400
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530527
Alignment:
Q  33 gagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 131  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||     
T  15530166 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaa 15530264  T
Q  132 cctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaa 231  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15530265 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaa 15530364  T
Q  232 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |      | |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530365 accctagttttgttgttgccattctaagcccttgcttcagccccctctatctccc------agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15530458  T
Q  332 ctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||| |||||||    
T  15530459 atcgcttaaaatttggaacaaacctgcacccaaaaatatgtttctataattcactgccagcacaccatc 15530527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 15532693 - 15533085
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15532693 gttcagtcaaaattgacctagtctaggg-atagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15532791  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15532792 agtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 15532891  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
     |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  ||    
T  15532892 ttgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttag 15532985  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||  || ||||||||||||    
T  15532986 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataacttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatatgtttctcttatttgctaccagcgcaccat 15533085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 396
Target Start/End: Original strand, 30728839 - 30729229
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaa----tcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || | |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||    |||||| ||||||| ||||    
T  30728839 ggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataatatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgagttacaaaaata 30728938  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30728939 agtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaatccta 30729038  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||      ||||||  |  |     
T  30729039 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcagccccctcta------tctcaaggtttac 30729132  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcac 396  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30729133 tctgatacaagatctatatttatagtaaaagtaccgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcac 30729229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32280300 - 32279906
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatat-gatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |  ||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32280300 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 32280201  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  32280200 aagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccca 32280101  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaataga 298  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||| |||| || |  |    
T  32280100 agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccc-------ctctatctccaagttta 32280008  T
Q  299 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcacca 398  Q
       ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  32280007 ctatgatacaaggtctatatatataggaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatacatttatgttattcgccgccagcgcacca 32279908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 12195526 - 12195810
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195526 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 12195625  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195626 gtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 12195725  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195726 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 12195810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13057498 - 13057213
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13057498 gttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 13057399  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13057398 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 13057299  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057298 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 13057213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 26932573 - 26932863
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932573 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26932672  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26932673 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaacccta 26932772  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctc 290  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26932773 gtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcttttctaagcccttgtttcaaccccctctatctctctctc 26932863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3390679 - 3390398
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagt 102  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3390679 ggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagt 3390580  T
Q  103 ctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3390579 ctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtg 3390480  T
Q  203 tttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3390479 tttgttccaaagagaaaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtctatctc 3390398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 95 - 400
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227814
Alignment:
Q  95 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  195 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaa 294  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||      |||||||     
T  19227614 ccctagtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagcccccttta------tctcaaag 19227707  T
Q  295 tagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaaatatgtttctgtttttccctgccagcg 393  Q
    |     |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  19227708 tttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcg 19227807  T
Q  394 caccatc 400  Q
    |||||||    
T  19227808 caccatc 19227814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25477584 - 25477293
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacg-------ttacaaa-gagaaatcaatgggttac 92  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||       ||||||| |||| |||||||||||||    
T  25477584 ttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttac 25477485  T
Q  93 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25477484 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 25477385  T
Q  193 aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477384 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 25477293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 3629876 - 3630159
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3629876 gttcggtccaaattgacctagtat-ggggagagagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 3629974  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3629975 agtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 3630074  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3630075 gtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgatgtttcagccccctctatctc 3630159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13040058 - 13039773
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13040058 gttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 13039959  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13039958 aagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 13039859  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13039858 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctatatctc 13039773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 3631950 - 3632233
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3631950 gttcggtccaaattgacctagtct--gggacagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 3632047  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  3632048 aagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacccttaaaccct 3632147  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3632148 agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaactccctctatctc 3632233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 3233741 - 3234025
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  3233741 gttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaata 3233840  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3233841 agtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 3233940  T
Q  200 gtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3233941 gtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaaccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctctatct 3234025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 5273227 - 5273431
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273227 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5273326  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273327 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 5273426  T
Q  200 gtgtt 204  Q
    |||||    
T  5273427 gtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 24338459 - 24338743
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24338459 gttcggtccaaattgacatagtctgggggagag--cagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 24338556  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc- 197  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||  |  ||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||     
T  24338557 aagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttccaaggtaaatcaaccctcaaacccc 24338656  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338657 tagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 24338743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 12161569 - 12161841
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||   |  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12161569 gttcggtccaaattaacctagtttaggg-agagaacagccatccattttactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 12161667  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    | |||||| | ||||| |||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  12161668 aatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttcccaacgtgaaacaaccctcaaacccta 12161767  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 275  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12161768 gtgtttgttcc--agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagcccc 12161841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22490889 - 22490658
Alignment:
Q  55 atgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagac 153  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  22490889 atgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagac 22490790  T
Q  154 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490789 tcaatcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctt 22490690  T
Q  254 tc-taaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490689 tcaaaaacccttgtttcagccccctctatctc 22490658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 26066135 - 26066307
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066135 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26066234  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26066235 gtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15719947 - 15719673
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| | ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15719947 gttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 15719848  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||    
T  15719847 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaactc---aaccc 15719751  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719750 tagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 15719673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 26068406 - 26068578
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068406 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26068505  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26068506 gtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33309159 - 33308988
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33309159 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 33309061  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33309060 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 1069729 - 1069913
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| | | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1069729 gttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 1069828  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069829 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 29754720 - 29754892
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754720 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 29754819  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29754820 gtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33311428 - 33311257
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33311428 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-a 33311330  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33311329 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 389
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072271
Alignment:
Q  179 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccttc 1072166  T
Q  279 tatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgt 378  Q
    ||      ||||||| |  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  1072167 ta------tctcaaagtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 1072260  T
Q  379 ttttccctgcc 389  Q
    | ||| |||||    
T  1072261 tattcgctgcc 1072271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 3027876 - 3028145
Alignment:
Q  14 tgacctagtctagggg-agagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcc 110  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  3027876 tgacctagtctggggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcc 3027975  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 210  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |    
T  3027976 taattctactcaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgc 3028073  T
Q  211 gaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 284  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  3028074 caagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcc-ttccaaacccttgttttcagccccttttatctc 3028145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 16455435 - 16455701
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  16455435 gttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 16455534  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16455535 taaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa-ccac-aaccc 16455632  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    ||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  16455633 tagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaaccctagtttttgtgttgac-ttctaaacccttgttt 16455701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 204 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8995578 - 8995389
Alignment:
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctg 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      | |  |  |||    
T  8995578 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctc------agtttactctg 8995485  T
Q  304 atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  8995484 atacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaatacgtttctgttatttgctgtcagcgcaccatc 8995389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14466627 - 14466399
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||   || | | ||||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  14466627 gttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 14466528  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaaccc 197  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||    
T  14466527 atgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaatcctcaaaaccc 14466428  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactcta 226  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||    
T  14466427 tagtgtttgttgccaatagacaaactcta 14466399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15367335 - 15367101
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggg-gagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  15367335 gttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaatgggttacaagaat 15367236  T
Q  99 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 198  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||  ||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  15367235 aagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccct 15367139  T
Q  199 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaacccta 237  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| | |||||| |||||    
T  15367138 agtgtttgttgccaagag-caaacacaatacaaccccta 15367101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 12186082 - 12186271
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  12186082 gttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 12186181  T
Q  99 aagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 187  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186182 aagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 284
Target Start/End: Original strand, 32447502 - 32447611
Alignment:
Q  176 aggtgaatcaacccacaaacc-ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 274  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447502 aggtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 32447601  T
Q  275 cctctatctc 284  Q
    ||||||||||    
T  32447602 cctctatctc 32447611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17012287 - 17012063
Alignment:
Q  57 gatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  || ||||||||||||    
T  17012287 gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaagagactc 17012188  T
Q  156 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc 255  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||    
T  17012187 aatcctaatattgtttcagaaggtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag-tttgttgtttac-ttc 17012093  T
Q  256 taaacccttgt-ttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  17012092 taaacccttttattcagacccctctatctc 17012063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 284
Target Start/End: Original strand, 13870608 - 13870716
Alignment:
Q  175 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13870608 aaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag-cc 13870706  T
Q  275 cctctatctc 284  Q
    ||||||||||    
T  13870707 cctctatctc 13870716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 22857963 - 22858228
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaat-gggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  22857963 gttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaagatatatcaaaagggttacaagaa 22858062  T
Q  98 taagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    | ||||| |   ||||| |||||| |||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    ||||    
T  22858063 ttagtcttcaaacctaaatctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--tcaacc 22858160  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||    
T  22858161 ctagtgtttgttaccaagaga-aaattc--tacaaaccctagtttttgtgttagc-ttctaaacccttgttt 22858228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19696745 - 19696479
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  19696745 gttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaaaggattacaagaa 19696646  T
Q  98 taagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    ||||||| |   |||||||||| |||||||| ||  ||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||||    
T  19696645 taagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--tttgaacc 19696548  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 268  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||    
T  19696547 ctagtgattgttgccaagag-caaactctatacaaacccta-atttgttgtt-tgtttctaaacccttgttt 19696479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852561
Alignment:
Q  195 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17852650 ccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 17852561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15346650 - 15346522
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15346650 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaatgggttacaagaata 15346551  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcc 128  Q
    ||||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  15346550 agtcttccgcttaattttactcaaagtcc 15346522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26945393 - 26945258
Alignment:
Q  55 atgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagaga 152  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  26945393 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaga 26945294  T
Q  153 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 188  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26945293 cttaatcctaatagtgtttcccaaggtgactcaacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20527081 - 20526922
Alignment:
Q  29 gagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagt 126  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |   |||||||||||| |||||    
T  20527081 gagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttacaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagt 20526982  T
Q  127 cccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    |  |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20526981 cttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 20526922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13878883 - 13878727
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  13878883 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 13878787  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13878786 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16786075 - 16785919
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  16786075 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 16785979  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16785978 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 17694877 - 17695030
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatg-agtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  |||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   ||    
T  17694877 tgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactataatgatatagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacc 17694973  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17694974 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13883631 - 13883475
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   |||  || ||||||| ||||| |   ||    
T  13883631 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgaatttcaagaatcagtcttcaaacc 13883535  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883534 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 31248740 - 31248896
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| |   ||| ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  31248740 tgacctagtataggggagagagtagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 31248836  T
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31248837 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 22342826 - 22342980
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   |    
T  22342826 tgacctagtctaggggagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 22342922  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  22342923 ctaatactacccaaa-tcccagcctcttcccgtgaccaagagacgcaatcctaatagtg 22342980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 26887345 - 26887406
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26887345 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 35201447 - 35201508
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35201447 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Original strand, 24191538 - 24191603
Alignment:
Q  335 gcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  24191538 gcttaaaatttggaacaaatttgcactgaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgccccatc 24191603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Original strand, 24192635 - 24192700
Alignment:
Q  335 gcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  24192635 gcttaaaatttggaacaaatttgcactgaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgccccatc 24192700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26643259 - 26643179
Alignment:
Q  88 gttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26643259 gttacaagaattagtcttccaacctaattctacccaa-gtcccagcatcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 26643179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26749225 - 26749145
Alignment:
Q  88 gttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26749225 gttacaagaattagtcttccaacctaattctacccaa-gtcccagcatcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 26749145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 185
Target Start/End: Original strand, 28037794 - 28037927
Alignment:
Q  54 tatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataag-tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagag 151  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||| ||  || || | || | |||| |    
T  28037794 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaaggg 28037893  T
Q  152 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28037894 actcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 3577636 - 3577696
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3577636 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17036116 - 17036058
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17036116 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17036058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 186
Target Start/End: Original strand, 7542452 - 7542581
Alignment:
Q  59 tgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagc-ctcttcctgtaaccaagagactca 156  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |   |||||||||| ||||| |||||   ||||||| || |||||||||||||    
T  7542452 tgagtaactttacaaagagatatcaaagggttacaaaaattagtcttcaaacctaattctatccaaattcccaaatctcttcccgtgaccaagagactca 7542551  T
Q  157 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||| |||||||||||| | | |||||||||    
T  7542552 atcataatagtgtttctccaagtgaatcaa 7542581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10584212 - 10584155
Alignment:
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 269  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  10584212 aagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcttttataaacctttgtttc 10584155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 12166171 - 12166321
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   ||  |||||||||| ||||| |   |    
T  12166171 tgacctagtctaggggagatagcagctctctgcttcactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgaattacaagaatcagtcttcaaac 12166267  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12166268 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaat 12166321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346445
Alignment:
Q  158 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttt 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaattttatacaaaccctagttt 15346445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 25465601 - 25465710
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    ||||||||||| | |||| |||| | || ||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  25465601 gttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaaggggtacaagaat 25465700  T
Q  99 aagtctcccg 108  Q
    ||||||||||    
T  25465701 aagtctcccg 25465710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11138499 - 11138423
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 186  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11138499 taattctacctaaagtccccatctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 98
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911555
Alignment:
Q  15 gacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatattaaatggttacaagaat 12911555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 26068606 - 26068662
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  26068606 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 26068662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 22351973 - 22352031
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22351973 cctaattctacccaaa-tctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Original strand, 12937219 - 12937376
Alignment:
Q  15 gacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgccta 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||| || | ||   ||||    
T  12937219 gacctagtct-ggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatattaaatggttacaagaattagccttcaaaccta 12937317  T
Q  113 attctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||||| |||||  ||  || |||  || || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12937318 attctaccaaaagtttcaatctattctcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12937376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 356
Target Start/End: Original strand, 26066335 - 26066389
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  26066335 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatct 26066389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 168
Target Start/End: Original strand, 19701985 - 19702041
Alignment:
Q  111 taattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19701985 taattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25941704 - 25941650
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaata 165  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25941704 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaata 25941650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10584299 - 10584227
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat-atgatgagtaacgttaca 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | | |||||| |||||||||||| |||||    
T  10584299 gttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 13467585 - 13467642
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13467585 cctaattctacc--aagtcacagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 13467642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Original strand, 29755003 - 29755059
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  29755003 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 29755059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 30445815 - 30445699
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcc 110  Q
    ||||||||| | | |||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||   ||    
T  30445815 tgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaattagtcttcaaacc 30445716  T
Q  111 taattctacccaaagtc 127  Q
    |||||||||||||||||    
T  30445715 taattctacccaaagtc 30445699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33308961 - 33308905
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  33308961 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 33308905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33311230 - 33311174
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  33311230 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 33311174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33215888 - 33215830
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  33215888 cctaattctatccaa-gtcccagcctcttgccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33215830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 356
Target Start/End: Original strand, 12186376 - 12186431
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt-ctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  12186376 tgatacaaggtttatatttatagtaaaagtaatcgctaaaaaattggaacaaatct 12186431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15346399 - 15346320
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaac-aaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | || ||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||    
T  15346399 ctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaatctcagctcaaaaatacgtttctgtt 15346320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 25465927 - 25466075
Alignment:
Q  17 cctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-ccta 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| |   ||||    
T  25465927 cctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaaccta 25466023  T
Q  113 attctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaata 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||    
T  25466024 attctacccaa-gtcccagcctctttccgtgattaagagactcaatcctaata 25466075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 163
Target Start/End: Original strand, 5165936 - 5165989
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaa 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5165936 cctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 5165989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 357
Target Start/End: Original strand, 16455732 - 16455786
Alignment:
Q  303 gatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctg 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||||    
T  16455732 gatacaaggtatatatttatagtaaaggtatccctgaaaaattggaacaaatctg 16455786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 331
Target Start/End: Original strand, 3028157 - 3028186
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028157 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3028186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 331
Target Start/End: Original strand, 12195822 - 12195851
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195822 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 12195851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Original strand, 35201352 - 35201393
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata 55  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35201352 tgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 35201393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4595102 - 4595046
Alignment:
Q  193 aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||| | ||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4595102 aaccctagtgtttgttgccaagtga-aaactcta--caaaccctagttttgttgttgcct 4595046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 5572322 - 5572270
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactat 54  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  5572322 ttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 5572270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15367044 - 15366992
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaa 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | || ||||||||||    
T  15367044 ctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaa 15366992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19696446 - 19696394
Alignment:
Q  304 atacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatct 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||||    
T  19696446 atacaaggtctatatttatagtaaaagaatccttcaaaaattggaacaaatct 19696394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24436053 - 24436001
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccacta 53  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24436053 gttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccacta 24436001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 104
Target Start/End: Original strand, 28078215 - 28078310
Alignment:
Q  10 aaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtct 104  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||   | | |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28078215 aaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataatccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagg-ttacaagaataagtct 28078310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3156 - 2763
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3156 gttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3057  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3056 gtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 2957  T
Q  201 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |         
T  2956 tgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgct 2863  T
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  2862 ctgatacaagttctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcaccatc 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4272 - 3880
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4272 gttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 4174  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4173 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaacccta 4074  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |  ||    
T  4073 gtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttag 3981  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||    
T  3980 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgccatcgcaccat 3881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 41494 - 41779
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41494 gttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 41593  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41594 agtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 41693  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41694 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 41779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15296 - 14902
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15296 gttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15197  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15196 agtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactcta 15097  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  15096 gtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatcattgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 15003  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15002 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgcaccat 14903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 14393 - 14679
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14393 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 14492  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14493 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 14592  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 286  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14593 gtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcatccccctctatctctc 14679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6476 - 6124
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6476 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6377  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6376 atctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 6277  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |        
T  6276 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgc 6183  T
Q  300 cctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||    
T  6182 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaaactgtaacaaatctgc 6124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6125 - 6061
Alignment:
Q  335 gcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 400  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||    
T  6125 gctttaaatttgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttt-tatttttatccgccagcgcaccatc 6061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 79458 - 79178
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  79458 ggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc 79359  T
Q  104 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  79358 tcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgt 79259  T
Q  204 ttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  79258 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 79178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 318 - 25
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  318 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 219  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  218 gtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 119  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaa 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118 gtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaa 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 11484 - 11768
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11484 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 11583  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11584 agtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggaaaatcaaccctcaaacccta 11683  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11684 gtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaatccctgtttcagccccctctatctc 11768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 183652 - 183925
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  183652 gttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 183751  T
Q  100 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  183752 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 183850  T
Q  200 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  183851 gtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccc 183925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 52286 - 51961
Alignment:
Q  5 ggtccaaattgacctagtctaggggagagag--cagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataag 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||    
T  52286 ggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaag 52187  T
Q  102 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 201  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52186 tctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagt 52087  T
Q  202 gtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcc 301  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |  ||      
T  52086 gtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc----tctcaaagtttagta 51991  T
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51990 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 51961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2293 - 1988
Alignment:
Q  26 ggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 124  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2293 ggggagagagtagccctccgattcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaa 2194  T
Q  125 gtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactc 224  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2193 gtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaactc 2095  T
Q  225 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagagcctgatacaaggtctatatttatag 324  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |      ||| |||||||||||||||||||    
T  2094 tgtacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctttctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatag 1995  T
Q  325 taaaagt 331  Q
    | |||||    
T  1994 tgaaagt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1464 - 1673
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1464 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1563  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1564 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 1663  T
Q  201 tgtttgttcc 210  Q
    ||||||||||    
T  1664 tgtttgttcc 1673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 80130 - 79852
Alignment:
Q  7 tccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  80130 tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaggaataagtctc 80031  T
Q  106 ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt 205  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  80030 ctgcctaat-ctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaattttt 79932  T
Q  206 gtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79931 gttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 79852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 188363 - 188424
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  188363 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35644
Alignment:
Q  97 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  197 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35719 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 35644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 35870 - 35817
Alignment:
Q  2 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||    
T  35870 ttcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 85500 - 85238
Alignment:
Q  9 caaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85500 caaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc 85401  T
Q  107 cgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 206  Q
    || || ||||||| ||||||| ||  ||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  85400 cgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttg 85301  T
Q  207 ttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 269  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  85300 ttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttttaaatccttgtttc 85238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15831 - 16112
Alignment:
Q  1 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||  ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15831 gttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 15930  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    |||||    
T  15931 taagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaacc--tcaaccc 16028  T
Q  198 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 283  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16029 tagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaaccccctctatct 16112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Original strand, 16124 - 16180
Alignment:
Q  301 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgctta-aaatttggaacaaatct 356  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  16124 ctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaatct 16180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 1666 - 1927
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1666 tgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcct 1765  T
Q  112 aattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 211  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||       
T  1766 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaatcaa-ccac-aaccctagtgtttgtt--- 1860  T
Q  212 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 285  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1861 ------gaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccacctctatctct 1927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22392 - 22221
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22392 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaat-a 22294  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22293 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24667 - 24496
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24667 gttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaat-a 24569  T
Q  101 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24568 gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22191 - 22135
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  22191 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 22135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24466 - 24410
Alignment:
Q  302 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  24466 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 24410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Original strand, 16716 - 16942
Alignment:
Q  55 atgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagac 153  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||| |||    
T  16716 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgac 16815  T
Q  154 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 253  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16816 tcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgtctt 16911  T
Q  254 tctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 284  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16912 tc-aaacccttgttttcagcctcctctatctc 16942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 284
Target Start/End: Original strand, 993 - 1126
Alignment:
Q  156 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaa-----gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 250  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| | || | ||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  993 aatcctaaaagtatttcgcaaggtggatcaaccctccaaacgtagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 1092  T
Q  251 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1093 ctttctaaacccttgtttcagccccttctatctc 1126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5089 - 4901
Alignment:
Q  2 ttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa--gagaaatcaatgggttacaagaa 97  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||  || || ||||||||| ||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  5089 ttcggtccaatactgacctagtctggggcagagagcagttctatgttccactataatgatgagtatctttacaaaaagagatatcaatgggttacaaaaa 4990  T
Q  98 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4989 taagtctcccgcctaattctaccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaacatgaatcaa 4901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16482 - 16328
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| ||   || ||| ||||||| ||||| |   |    
T  16482 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttccaagaattagtcttcaaac 16386  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16385 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 224880 - 224819
Alignment:
Q  109 cctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  224880 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 57452 - 57613
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||  || ||   ||    
T  57452 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaatagatcttcaaacc 57551  T
Q  111 taattctacccaaagtccc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 171  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  57552 taattccacccaaagtcccgaatctcttccaatgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 57613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 17011 - 17165
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-c 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| |  ||   ||| ||||||| ||||| |   |    
T  17011 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagataataa---gtttcaagaatcagtcttcaaac 17107  T
Q  110 ctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 168  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17108 ctaattctacccaa-gtcctagcttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 4690 - 4728
Alignment:
Q  1 gttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4690 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3136
Alignment:
Q  14 tgacctagtctaggggagagagcagcactctgatccactata 55  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3095 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University