View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16943_low_80 (Length: 215)

Name: NF16943_low_80
Description: NF16943
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16943_low_80
NF16943_low_80
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (15-197)||(30301462-30301644)
chr8 (15-197)||(7344120-7344302)
chr8 (15-197)||(8419732-8419914)
chr8 (15-197)||(32375979-32376161)
chr8 (15-197)||(23924292-23924474)
chr8 (15-197)||(31959611-31959793)
chr8 (15-197)||(39784-39966)
chr8 (15-197)||(35962634-35962816)
chr8 (15-191)||(7171881-7172057)
chr8 (15-197)||(2124521-2124703)
chr8 (15-197)||(43376843-43377025)
chr8 (15-197)||(22588006-22588188)
chr8 (15-187)||(41744160-41744332)
chr8 (15-197)||(22661138-22661320)
chr8 (15-197)||(43679723-43679905)
chr8 (73-191)||(4867415-4867533)
chr8 (20-119)||(39751659-39751758)
chr8 (111-197)||(39751387-39751473)
chr8 (130-197)||(20548938-20549005)
chr8 (74-138)||(31281198-31281262)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (15-197)||(43620007-43620189)
chr7 (15-197)||(45767424-45767606)
chr7 (15-197)||(30790570-30790752)
chr7 (15-197)||(604106-604288)
chr7 (15-197)||(15069914-15070096)
chr7 (15-197)||(18109357-18109539)
chr7 (15-197)||(42503402-42503584)
chr7 (15-197)||(47742553-47742735)
chr7 (15-187)||(29592839-29593011)
chr7 (20-197)||(34622825-34623002)
chr7 (15-189)||(19044641-19044815)
chr7 (15-189)||(20709821-20709995)
chr7 (16-191)||(10705590-10705765)
chr7 (15-197)||(47064858-47065040)
chr7 (18-191)||(12111558-12111729)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (15-197)||(1608621-1608803)
chr6 (15-197)||(13382968-13383150)
chr6 (20-197)||(2051368-2051545)
chr6 (15-191)||(29667387-29667563)
chr6 (15-197)||(23959217-23959399)
chr6 (15-189)||(7537535-7537709)
chr6 (15-197)||(29286529-29286711)
chr6 (15-197)||(25140669-25140852)
chr6 (15-197)||(31150629-31150811)
chr6 (15-197)||(28362281-28362463)
chr6 (15-197)||(18609797-18609979)
chr6 (15-177)||(2259432-2259593)
chr6 (74-197)||(34230807-34230930)
chr6 (156-197)||(18351348-18351389)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (15-197)||(14280542-14280724)
chr5 (15-197)||(38856042-38856224)
chr5 (15-197)||(11029334-11029516)
chr5 (15-197)||(37814909-37815091)
chr5 (15-197)||(28882315-28882497)
chr5 (15-197)||(27863730-27863912)
chr5 (15-197)||(7796904-7797086)
chr5 (15-197)||(13563968-13564150)
chr5 (15-197)||(25890321-25890503)
chr5 (15-199)||(33994713-33994897)
chr5 (15-191)||(1039356-1039531)
chr5 (15-197)||(34122865-34123047)
chr5 (15-197)||(7017838-7018007)
chr5 (15-191)||(24050369-24050547)
chr5 (15-191)||(24053496-24053672)
chr5 (16-175)||(28387821-28387979)
chr5 (73-197)||(34079753-34079877)
chr5 (15-191)||(30352763-30352939)
chr5 (15-138)||(43179429-43179552)
chr5 (15-197)||(4196843-4197023)
chr5 (72-197)||(25877959-25878082)
chr5 (64-197)||(6267801-6267933)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (15-197)||(49564169-49564351)
chr4 (15-197)||(3407803-3407985)
chr4 (15-197)||(19069527-19069709)
chr4 (16-197)||(37394768-37394949)
chr4 (15-197)||(10374366-10374548)
chr4 (15-191)||(4774168-4774344)
chr4 (15-197)||(10422972-10423154)
chr4 (21-197)||(44050650-44050825)
chr4 (15-191)||(18578965-18579141)
chr4 (15-197)||(38460752-38460934)
chr4 (15-188)||(11506658-11506831)
chr4 (15-191)||(24415501-24415679)
chr4 (42-187)||(6186995-6187140)
chr4 (110-189)||(50904822-50904901)
chr4 (74-188)||(30043046-30043160)
chr4 (117-191)||(51642349-51642423)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (15-197)||(8156836-8157018)
chr3 (15-197)||(13743593-13743775)
chr3 (15-197)||(30943518-30943700)
chr3 (15-197)||(3952778-3952960)
chr3 (15-197)||(6744890-6745072)
chr3 (15-197)||(9426932-9427114)
chr3 (15-197)||(2743782-2743964)
chr3 (15-197)||(2857546-2857728)
chr3 (15-197)||(50957243-50957425)
chr3 (15-197)||(14402569-14402751)
chr3 (15-191)||(4002055-4002231)
chr3 (15-197)||(36813178-36813360)
chr3 (15-197)||(46989853-46990035)
chr3 (15-197)||(48246738-48246920)
chr3 (15-197)||(6489670-6489852)
chr3 (18-197)||(21952126-21952305)
chr3 (15-191)||(67216-67392)
chr3 (145-197)||(7841422-7841474)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (15-197)||(5351295-5351477)
chr2 (15-197)||(10620301-10620483)
chr2 (15-197)||(41564054-41564236)
chr2 (15-197)||(209312-209494)
chr2 (15-197)||(39798004-39798186)
chr2 (15-197)||(3795677-3795859)
chr2 (15-197)||(7267008-7267190)
chr2 (15-197)||(41181737-41181919)
chr2 (15-197)||(24753588-24753770)
chr2 (16-191)||(12905862-12906037)
chr2 (15-189)||(43944036-43944210)
chr2 (15-197)||(45479385-45479567)
chr2 (15-189)||(28342857-28343032)
chr2 (15-197)||(24601980-24602160)
chr2 (15-197)||(24611954-24612134)
chr2 (15-197)||(1096910-1097092)
chr2 (15-197)||(9659604-9659788)
chr2 (15-197)||(439374-439556)
chr2 (15-189)||(1150595-1150769)
chr2 (15-189)||(41052970-41053142)
chr2 (15-197)||(81814-81996)
chr2 (15-120)||(38949750-38949855)
chr2 (15-191)||(41004869-41005045)
chr2 (117-197)||(38950232-38950312)
chr2 (149-197)||(18000560-18000608)
chr2 (29-188)||(25613538-25613697)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (15-197)||(3944302-3944484)
chr1 (15-197)||(3993406-3993588)
chr1 (15-197)||(29352560-29352742)
chr1 (16-197)||(20353500-20353681)
chr1 (15-197)||(38771958-38772140)
chr1 (15-197)||(6558228-6558410)
chr1 (15-197)||(44469575-44469757)
chr1 (15-197)||(13633436-13633618)
chr1 (15-197)||(12643532-12643714)
chr1 (15-197)||(30909593-30909775)
chr1 (15-197)||(9710904-9711086)
chr1 (15-197)||(5081928-5082110)
chr1 (15-197)||(50113648-50113830)
chr1 (15-191)||(1655644-1655820)
chr1 (15-197)||(37018960-37019142)
chr1 (15-186)||(7966327-7966497)
chr1 (15-191)||(13177690-13177866)
chr1 (15-199)||(25039645-25039829)
chr1 (15-197)||(8459284-8459466)
chr1 (15-189)||(19495387-19495562)
chr1 (17-191)||(36072705-36072879)
chr1 (15-191)||(33168246-33168422)
chr1 (15-197)||(51666230-51666412)
chr1 (16-197)||(5141435-5141616)
chr1 (15-197)||(38690236-38690417)
chr1 (15-189)||(46978798-46978972)
chr1 (16-191)||(4517959-4518132)
chr1 (156-197)||(15051053-15051094)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (15-197)||(4890-5072)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (15-197)||(15519-15701)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (15-197)||(22741-22923)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (15-165)||(10828-10978)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (15-188)||(1315-1488)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (97-197)||(19743-19843)
scaffold0219 (15-99)||(19498-19582)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (18-191)||(21980-22144)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (121-197)||(8526-8602)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30301644 - 30301462
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301644 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 30301545  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301544 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 30301462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 7344120 - 7344302
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344120 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 7344219  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344220 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 7344302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8419914 - 8419732
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419914 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 8419815  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419814 attatatatgtacgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 8419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32376161 - 32375979
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32376161 gagatgaatacgcatgggaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 32376062  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32376061 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 32375979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23924474 - 23924292
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  23924474 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 23924375  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23924374 attatatatgtatgttcgttccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 23924292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 31959611 - 31959793
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  31959611 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaaaataatat 31959710  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31959711 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 31959793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39966 - 39784
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  39966 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtctttgcttattcgcaacgacggcgatgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 39867  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39866 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 39784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35962816 - 35962634
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35962816 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 35962717  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35962716 attatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgcaatgagttgttta 35962634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 7171881 - 7172057
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  7171881 gagatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 7171980  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7171981 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtactgagt 7172057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2124703 - 2124521
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2124703 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacaatagcgactttggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 2124604  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2124603 attatatatgtattttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 2124521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 43376843 - 43377025
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43376843 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggtttattcgcgacgatagtgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 43376942  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43376943 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 43377025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 22588006 - 22588188
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  22588006 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggctaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaagataatat 22588105  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22588106 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 22588188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41744332 - 41744160
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41744332 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagttatatgccttggcttattcatgacgatagcgacgtcggatttatatttcggaatatggtggaagataatat 41744233  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaat 187  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41744232 attatatatgtatattcgctccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgtgtaat 41744160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 22661138 - 22661320
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22661138 gagatgaatatgcatggaaaacggcaagccatatgccttggcttattcacgacgatagcgacgtcgggtctatgtttcggaatatggtggaagatgatat 22661237  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  22661238 attatatatgtatgttcgttccatatgcaactgcgcagaatgtcagtagagatttaatttaacgatatgtaatgtgttgttta 22661320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43679905 - 43679723
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||   |||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  43679905 gagatgaacacgcatggaaaacgacaagttatatgccttgacttattaaagacgatagagacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 43679806  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43679805 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagcagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgttta 43679723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 4867415 - 4867533
Alignment:
Q  73 cgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaat 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4867415 cgacgtcggatttatgtttcggattatggtggaaaataatatattatatacgtatgttcgttccatatccaattgcgttgaatgtaagtagggatttaat 4867514  T
Q  173 ttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  4867515 ttaatgataagtaatgagt 4867533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39751758 - 39751659
Alignment:
Q  20 gaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39751758 gaatacgcatggaaaacggcaaactatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattat 39751659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39751473 - 39751387
Alignment:
Q  111 atatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39751473 atatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattacgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 39751387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 197
Target Start/End: Original strand, 20548938 - 20549005
Alignment:
Q  130 tcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20548938 tcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 20549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31281262 - 31281198
Alignment:
Q  74 gacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccat 138  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31281262 gacgtaggatttatgtttcagaatatggttgaagataatatattatatctttatgttcgttccat 31281198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43620189 - 43620007
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43620189 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 43620090  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43620089 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 43620007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 45767424 - 45767606
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767424 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 45767523  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767524 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 45767606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 30790570 - 30790752
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790570 gagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 30790669  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790670 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 30790752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 604288 - 604106
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  604288 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 604189  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  604188 attatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 604106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 15069914 - 15070096
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15069914 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 15070013  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070014 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 15070096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 18109357 - 18109539
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18109357 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 18109456  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18109457 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 18109539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 42503402 - 42503584
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42503402 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctacatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 42503501  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42503502 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 42503584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 47742553 - 47742735
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47742553 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 47742652  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47742653 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 47742735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29593011 - 29592839
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29593011 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcaacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatac 29592912  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592911 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaat 29592839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34623002 - 34622825
Alignment:
Q  20 gaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34623002 gaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatgatggaagataatatattat 34622903  T
Q  120 atatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34622902 atatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaagtttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 34622825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19044815 - 19044641
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19044815 gagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataatat 19044716  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19044715 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatga 19044641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 20709821 - 20709995
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20709821 gagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataatat 20709920  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20709921 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatga 20709995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10705765 - 10705590
Alignment:
Q  16 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  10705765 agatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggctaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagatgatata 10705666  T
Q  116 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10705665 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttattgatgtgtaatgagt 10705590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 47064858 - 47065040
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   || ||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  47064858 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggtttattaaagatgatagcgacgtcaaatttatgtttcgaaatatggtggaaaataatat 47064957  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  47064958 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgttta 47065040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12111729 - 12111558
Alignment:
Q  18 atgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatatt 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |    
T  12111729 atgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggtttattaaagatgatagcgacgtcggatttatatttcggaatatggtggaaaataatat--t 12111632  T
Q  118 atatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12111631 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagt 12111558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1608803 - 1608621
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608803 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 1608704  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608703 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 1608621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13383150 - 13382968
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13383150 gagatgaatacgcatggaaaacgtcaagttatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13383051  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13383050 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagtagttta 13382968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2051545 - 2051368
Alignment:
Q  20 gaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2051545 gaatacgcatggaaaacggcaagttatatgtcttggcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcgaaatatggtggaagataatatattat 2051446  T
Q  120 atatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2051445 atatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 2051368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 29667387 - 29667563
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  29667387 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgatgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagttaatat 29667486  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29667487 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 29667563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23959399 - 23959217
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23959399 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcacgacgatagcgacgttggatttatgtttcggaatatggtgtaagataatat 23959300  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23959299 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgttta 23959217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7537709 - 7537535
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7537709 gagacgaatacgcatggaaaacagcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7537610  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7537609 attatatatgtatgttcgttccatatgcatttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatga 7537535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29286711 - 29286529
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29286711 gagacgaatacacatagaaaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 29286612  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29286611 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaggtttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 29286529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 25140669 - 25140852
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25140669 gagacgaatacacatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcgcatttatgtttcggaatatggtgaaagataatat 25140768  T
Q  115 attatat-atgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25140769 attatataatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 25140852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 31150629 - 31150811
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  31150629 gagatgaatacgcttggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgttttagaatatggtggaagataatat 31150728  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31150729 attatatatgtatgtttgatcgatatgcaattgcgttgaatgtatgtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 31150811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 28362281 - 28362463
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28362281 gagatgaataagcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatagcgacgtcgaatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 28362380  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28362381 attatatatgtatgttcgatcgatatgcaattgtgtagaatgtatgtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 28362463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 18609797 - 18609979
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  18609797 gagataaatatgcatggaaaacgacaagttatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaattatat 18609896  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  18609897 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgttta 18609979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2259593 - 2259432
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||   |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  2259593 gagatgaatacgcatagaaaacgacaagctatatgcattggcttattaaagacgaaagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaaaataatat 2259494  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaat 177  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2259493 attatatatgcatgtttgttccatatgcaa-tacgttgaatgtaagtaaggatttaatttaat 2259432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34230930 - 34230807
Alignment:
Q  74 gacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatt 173  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||| ||||| |||||||||    
T  34230930 gacgtccgatttatgttttagaatatggtagaagataatatattatatatgtatgttcgttccatctgcaactgtgtagaatgttagtagagatttaatt 34230831  T
Q  174 taatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||| ||||||||||| || |||||    
T  34230830 taacgatgtgtaatgtgttgttta 34230807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 197
Target Start/End: Original strand, 18351348 - 18351389
Alignment:
Q  156 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18351348 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaataagtagttta 18351389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 14280542 - 14280724
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280542 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 14280641  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280642 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 14280724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38856224 - 38856042
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38856224 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 38856125  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856124 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggattgaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 38856042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11029516 - 11029334
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11029516 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 11029417  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11029416 attatatatgtatgttcgtttcatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtgatgagtagttta 11029334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37815091 - 37814909
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37815091 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcacgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 37814992  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37814991 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaaagtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 37814909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28882497 - 28882315
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28882497 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcatttgcttatttgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 28882398  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882397 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtggggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 28882315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27863912 - 27863730
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27863912 gagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacagcgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaagataatat 27863813  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27863812 attatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 27863730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7797086 - 7796904
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7797086 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7796987  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7796986 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 7796904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13564150 - 13563968
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13564150 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13564051  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13564050 attatatatgtatgttcgatccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 13563968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25890503 - 25890321
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  25890503 gagatgaatacgcgtggaaaacagcaagcgatatgcctttgcttattcgcgacgacgtcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaataatat 25890404  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25890403 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 25890321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Original strand, 33994713 - 33994897
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  33994713 gagatgaatacgcatggacaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcttaatatggtggaagataatat 33994812  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttatg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33994813 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgtttatg 33994897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 1039356 - 1039531
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  1039356 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacatcggatttatgttt-ggaatatggtggaaaataatat 1039454  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1039455 gttatatatgtatgttcgtaccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagt 1039531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34123047 - 34122865
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34123047 gagatgaatacgcatggaaaacggtaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 34122948  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34122947 attatatatatatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtatgaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 34122865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7018007 - 7017838
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             ||||||||||||| |||||    
T  7018007 gagatgaatacacatggaaaatggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcaga-------------atatggtggaagataatat 7017921  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7017920 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 7017838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24050547 - 24050369
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24050547 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcgaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 24050448  T
Q  115 at--tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24050447 atattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgatgtgtaatgagt 24050369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24053672 - 24053496
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||   |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24053672 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcgaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 24053573  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24053572 attatatatgtatgttctttctatatgcaattgcgttgaatgtaattagggatataatttaatgatgtgtaatgagt 24053496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Original strand, 28387821 - 28387979
Alignment:
Q  16 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 115  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28387821 agatgaatacacatggaaaacgacaagttatatgcctttg-ttattcacgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 28387919  T
Q  116 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaattta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28387920 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgattgtaagtagggatttaattta 28387979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 197
Target Start/End: Original strand, 34079753 - 34079877
Alignment:
Q  73 cgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaat 172  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34079753 cgacggcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaat 34079852  T
Q  173 ttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  34079853 ttaatgatgtgtaatgagttgttta 34079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30352939 - 30352763
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  30352939 gagatgaatatgcatgaaaaacggcaagttatatgccttggcttgttaaagacgatagcgacgtcgtatttatgtttcggaatattgtggaaaataatat 30352840  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30352839 attatatatgtatgttttttccatatgcaattgcattgaatgtaagtaaagatttaatttattgatatgtaatgagt 30352763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 43179429 - 43179552
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43179429 gagatgaacacgcatggaaaacggtaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtttgatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 43179528  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43179529 attatatatgtatgttcgttccat 43179552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4197023 - 4196843
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||   |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  4197023 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctacatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtcgaaaataatat 4196924  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||    
T  4196923 attatatatgta--ttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatatgtaatgagttgttta 4196843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25878082 - 25877959
Alignment:
Q  72 gcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||    
T  25878082 gcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatg--tgtaagtagggatttaa 25877985  T
Q  172 tttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    | |||| | ||||||||||| |||||    
T  25877984 tataatcacgtgtaatgagttgttta 25877959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6267933 - 6267801
Alignment:
Q  64 cgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtag 163  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || || ||| | |||||| |||||    
T  6267933 cgacgatggcgacgtcgaatttatgtt-cggaatatgatggaagataatatattatatatgtatttttgttccatctgcaactgcgtagaatgtcagtag 6267835  T
Q  164 ggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
     |||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  6267834 agatttaatttaatgatatgtaatgtgttgttta 6267801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49564351 - 49564169
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564351 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 49564252  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564251 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 49564169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 3407803 - 3407985
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3407803 gagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 3407902  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407903 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 3407985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19069709 - 19069527
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19069709 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcgggtttatgtttcggaatatggtggaagataatat 19069610  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19069609 attatacatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagtagttta 19069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 37394768 - 37394949
Alignment:
Q  16 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37394768 agatgaatacgcatggaaaacggcaagttgtatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 37394867  T
Q  116 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37394868 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 37394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10374548 - 10374366
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10374548 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacatcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataatat 10374449  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10374448 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 10374366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 4774168 - 4774344
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4774168 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttatttgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 4774267  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4774268 gttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgcatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 4774344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 10422972 - 10423154
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10422972 gagacgaatacacatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcggcgattgcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 10423071  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  10423072 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatctaatgatatgtaatgagttgttta 10423154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 44050650 - 44050825
Alignment:
Q  21 aatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattata 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44050650 aatacgcatggaaaacaacaagctatatgt-ttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatattata 44050748  T
Q  121 tatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44050749 tatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgcaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 44050825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18579141 - 18578965
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18579141 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggctaattgaagacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 18579042  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18579041 attatatatgtatgttagttctatatgcaattgcgttgaatgtaagaagtgatttaatttaatgatgtgtaatgagt 18578965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38460934 - 38460752
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  38460934 gagatgaatgcgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgttggatttatgtttcagaatatggtggaaaataatat 38460835  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  38460834 attatatatgtatgtttgttgcatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgttta 38460752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 11506658 - 11506831
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||    
T  11506658 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaaaataatat 11506757  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11506758 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgtgtaatg 11506831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24415679 - 24415501
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatat--gcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaat 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||   |||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  24415679 gagatgaatacacatggaaaacgacaagctatatatgccttgacttattgaagacgatagcgacgttgcatttatgtttcggaatatgatggaaaataat 24415580  T
Q  113 atattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24415579 atattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagt 24415501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6187140 - 6186995
Alignment:
Q  42 gctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatg 141  Q
    ||||| || ||| |||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6187140 gctatgtgtcttggcttattcacgacgatagcgacattggatttatgtttagcaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatg 6187041  T
Q  142 taattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaat 187  Q
     || ||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6187040 caaatgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaatgatatgtaat 6186995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Original strand, 50904822 - 50904901
Alignment:
Q  110 aatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50904822 aatatattatatttgtatgtttgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgaaatga 50904901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Original strand, 30043046 - 30043160
Alignment:
Q  74 gacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatt 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| || || | ||| |||||| |  || ||||| |||    
T  30043046 gacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatttgtattttcgttccatttgcaacttcatagaatgtcaccagagatttcatt 30043145  T
Q  174 taatgatgtgtaatg 188  Q
    ||| ||| |||||||    
T  30043146 taacgatatgtaatg 30043160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 51642423 - 51642349
Alignment:
Q  117 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  51642423 tatatatgtatgttcgttctatatgtaattgtgatgaatgtaagttgggatttaacttaatgatatgtaatgagt 51642349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8157018 - 8156836
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8157018 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 8156919  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8156918 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 8156836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13743775 - 13743593
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743775 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 13743676  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743675 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 13743593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30943700 - 30943518
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943700 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 30943601  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943600 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 30943518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 3952778 - 3952960
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3952778 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 3952877  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3952878 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 3952960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 6744890 - 6745072
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6744890 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 6744989  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6744990 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 6745072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9427114 - 9426932
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9427114 gagatgaatacgcatggaaaacggcaaactatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 9427015  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9427014 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 9426932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2743964 - 2743782
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2743964 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 2743865  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2743864 attatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 2743782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 2857546 - 2857728
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  2857546 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaaaatggtggaaaataatat 2857645  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857646 attatatatgtatgttcattccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 2857728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 50957243 - 50957425
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50957243 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttttgtttcggaatatggtggaagataatat 50957342  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50957343 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 50957425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 14402569 - 14402751
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14402569 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 14402668  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14402669 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgacgtgtaatgagttgttta 14402751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 4002055 - 4002231
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  4002055 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaaaatggtggaaaataatat 4002154  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4002155 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 4002231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36813360 - 36813178
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36813360 gagatgaatacgtgtggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaatataatat 36813261  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36813260 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgttta 36813178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46990035 - 46989853
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46990035 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatgacgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaagataatat 46989936  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46989935 attatatatgtatgttcgttccacatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 46989853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48246920 - 48246738
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48246920 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgctttggcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 48246821  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48246820 attatatatgtatgtttgttccatatgcaactgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 48246738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6489852 - 6489670
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6489852 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgtcgtcggatttatatttcggaatatggtggaagataatat 6489753  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6489752 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 6489670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21952305 - 21952126
Alignment:
Q  18 atgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21952305 atgaatacgcatggaaaacggcaagctatgtgccttggcttattcgcgatgatagcgacgtcggatttaggtttcggaatatggtggaagatgatatatt 21952206  T
Q  118 atatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21952205 atatttgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaactagggatttaatttaatgacgtgtaatgagttgttta 21952126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 67392 - 67216
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  67392 gagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgtcttggcttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatac 67293  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  67292 attatatatgtatgttcgttccatatgtgattgcgttgaatgtaagtagggatttcatttaatgatgtgtaatgagt 67216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7841474 - 7841422
Alignment:
Q  145 ttgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7841474 ttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagttgttta 7841422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 5351295 - 5351477
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351295 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 5351394  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351395 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 5351477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10620483 - 10620301
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620483 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 10620384  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620383 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 10620301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 41564054 - 41564236
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564054 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 41564153  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564154 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 41564236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 209494 - 209312
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209494 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 209395  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209394 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 209312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 39798004 - 39798186
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39798004 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 39798103  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798104 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 39798186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3795859 - 3795677
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3795859 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgtgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 3795760  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795759 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 3795677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 7267008 - 7267190
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7267008 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatacctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7267107  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7267108 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 7267190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41181919 - 41181737
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41181919 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttatacgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 41181820  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41181819 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 41181737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 24753588 - 24753770
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24753588 gagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcttttgcttattcgcgacgacggcgacatcgtatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 24753687  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24753688 attatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 24753770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12906037 - 12905862
Alignment:
Q  16 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12906037 agatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 12905938  T
Q  116 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12905937 ttatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtacggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 12905862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43944210 - 43944036
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43944210 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttattcgcgatgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 43944111  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43944110 aatatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 43944036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 45479385 - 45479567
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45479385 gagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatatcggcgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 45479484  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  45479485 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgttta 45479567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28343032 - 28342857
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgttt-cggaatatggtggaagacaata 113  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28343032 gagacgaatacacatgtaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgttttcggaatatggtggaagataata 28342933  T
Q  114 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342932 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 28342857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24602160 - 24601980
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24602160 gagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcaacgtcggatttatttttcggaatatggtggaagataatat 24602061  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24602060 attatata--tatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 24601980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 24611954 - 24612134
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24611954 gagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcaacgtcggatttatttttcggaatatggtggaagataatat 24612053  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24612054 attatata--tatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 24612134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1097092 - 1096910
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1097092 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcttgggcttatttgcgacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 1096993  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1096992 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgttta 1096910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 9659604 - 9659788
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9659604 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcgagtttatgtttcggaatatggtggaagataatat 9659703  T
Q  115 a--ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9659704 attttatatttgtatgttcgttcaatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggtatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 9659788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 439374 - 439556
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  439374 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccctggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaagtaatat 439473  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  439474 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaaggagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgttta 439556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 1150595 - 1150769
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| | |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||    
T  1150595 gagataaatacgcatggaaaacggcaaactatacgccttggtttatttgtgacgatagcgacgtcggatttatgttttggaatatgatggaagatactat 1150694  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1150695 attatatatgtatgttcgttccatatgcaatttcattgaatgtaagtagtgatttaatttaatgatgtgtaatga 1150769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41053142 - 41052970
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41053142 gagacgaatacgcattgaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 41053043  T
Q  115 a-ttatatatgtatgttcgttcc--atatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    | |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  41053042 atttatatatgtgtgttcgttccatatatgcaattgcattgaatgtaagtagg-----aatttaatgatgtgtaatga 41052970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 81814 - 81996
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||   |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  81814 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatcccttgacttattaaagacgataacgacgtcggatttatgtttcggaatatggttgaaaataatat 81913  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  81914 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatgcatttaatataatcatgtgtaatgagttgttta 81996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Original strand, 38949750 - 38949855
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38949750 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 38949849  T
Q  115 attata 120  Q
    ||||||    
T  38949850 attata 38949855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41005045 - 41004869
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   |||||  | |||||| |||||||||||| ||||||| || || |  ||||    
T  41005045 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctacatgccctggcttattaaagacgattgggacgtcagatttatgtttcagaatatgttgaaaaattatat 41004946  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41004945 attatatatgtatgttcattccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagtgatttaatataatgatgtgtaatgagt 41004869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 197
Target Start/End: Original strand, 38950232 - 38950312
Alignment:
Q  117 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38950232 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 38950312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18000608 - 18000560
Alignment:
Q  149 attgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000608 attgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 18000560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25613697 - 25613538
Alignment:
Q  29 tggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatg 128  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||  |  |||| |||||||||||| | | ||    
T  25613697 tggaaaacggcgagctatgtgccttgacttattcgtgacgatagcgacgtaggatttatgtttatgaatataattaaagataatatattatatctttgtg 25613598  T
Q  129 ttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatg 188  Q
    |||||||||| || |  ||||| |||||| | ||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  25613597 ttcgttccatctgcatgtgcatagaatgtcaatagagattttatgtaatgatatgtaatg 25613538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3944484 - 3944302
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944484 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 3944385  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944384 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 3944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 3993406 - 3993588
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993406 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 3993505  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993506 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 3993588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29352742 - 29352560
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29352742 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 29352643  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29352642 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 29352560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 20353500 - 20353681
Alignment:
Q  16 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353500 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 20353599  T
Q  116 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20353600 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtataatgagtagttta 20353681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38772140 - 38771958
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38772140 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatccgcgacgacggtgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 38772041  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38772040 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 38771958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6558410 - 6558228
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6558410 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 6558311  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558310 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 6558228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 44469575 - 44469757
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44469575 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 44469674  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44469675 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 44469757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 13633436 - 13633618
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13633436 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgatgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13633535  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13633536 attatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttattgatgtgtaatgagtagttta 13633618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12643714 - 12643532
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  12643714 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaataatat 12643615  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12643614 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 12643532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 30909593 - 30909775
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30909593 gagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 30909692  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30909693 attatatatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtacttta 30909775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9711086 - 9710904
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9711086 gagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaagataatat 9710987  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9710986 attatatatgtatgttctttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 9710904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 5081928 - 5082110
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5081928 gagatgaatacgcatggaaaacgacaaggtatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 5082027  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5082028 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaaatatggatttaatttaatgatgtgtaaggagtacttta 5082110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50113830 - 50113648
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50113830 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 50113731  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  50113730 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaataatgtgtaatgagttgttta 50113648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 1655644 - 1655820
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1655644 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 1655743  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1655744 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaatgatttaatttaatgatgtgtaatgagt 1655820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 37018960 - 37019142
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37018960 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacataggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 37019059  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37019060 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 37019142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7966497 - 7966327
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7966497 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctt-gcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7966399  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaa 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7966398 attacatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaa 7966327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 13177690 - 13177866
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13177690 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttaatcgcaacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13177789  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13177790 attatatatgtatgttcattccatatgcaattgcattgaaagtaagtagggatttaatttaataatgtgtaatgagt 13177866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Original strand, 25039645 - 25039829
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25039645 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatacgccttggcttattcgcgtcgataacgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 25039744  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttatg 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25039745 attatatgtgtatgttcgttccatatacaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgtttatg 25039829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8459466 - 8459284
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  8459466 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcaaaatatggtagaagataatat 8459367  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8459366 attatacatgtatgttcgttctatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgttta 8459284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19495562 - 19495387
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaa-cggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 113  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19495562 gagatgaatacgtatgaaaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgagacgatagcgacgttggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 19495463  T
Q  114 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19495462 tattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 19495387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36072879 - 36072705
Alignment:
Q  17 gatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatat 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||   || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36072879 gatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggctaattgaagatgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatat 36072780  T
Q  117 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36072779 tatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagt 36072705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33168422 - 33168246
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  33168422 gagatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttgacttattttagacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 33168323  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33168322 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgagtgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagt 33168246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 51666230 - 51666412
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  51666230 gagatgaatacacatggaacacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 51666329  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  51666330 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgttta 51666412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 5141435 - 5141616
Alignment:
Q  16 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5141435 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcgttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatgtatgtttcggaatatgatggaagataatata 5141534  T
Q  116 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||| || |||||    
T  5141535 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaacgatatataatgtgttgttta 5141616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38690417 - 38690236
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||    
T  38690417 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcaaaatatggtggaaaataatat 38690318  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  38690317 attatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagta-ggatttaatataatgatgtgtaatgtgttgttta 38690236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 46978798 - 46978972
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  46978798 gagatgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcgaaatatggtggaaaataatat 46978897  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 189  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46978898 attatatatgtatgttcgttcctaatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatga 46978972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 4517959 - 4518132
Alignment:
Q  16 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  4517959 agatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttattaaagactatagcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 4518058  T
Q  116 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  4518059 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatt--atataatgatgtgtaatgagt 4518132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 197
Target Start/End: Original strand, 15051053 - 15051094
Alignment:
Q  156 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15051053 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 15051094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 4890 - 5072
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4890 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 4989  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4990 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 5072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 15519 - 15701
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  15519 gagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggggacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 15618  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15619 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 15701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22923 - 22741
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||    
T  22923 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatttgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaatattat 22824  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22823 attatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 22741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 165
Target Start/End: Original strand, 10828 - 10978
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10828 gagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcagatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 10927  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggg 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10928 attatatttgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggg 10978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0794 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 1315 - 1488
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||    
T  1315 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaaaataatat 1414  T
Q  115 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1415 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgtgtaatg 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Original strand, 19743 - 19843
Alignment:
Q  97 tatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttt 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19743 tatggtggaagataatatattatatatgtatgctcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagttgttt 19842  T
Q  197 a 197  Q
    |    
T  19843 a 19843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Original strand, 19498 - 19582
Alignment:
Q  15 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatat 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19498 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatat 19582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22144 - 21980
Alignment:
Q  18 atgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatatt 117  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||||   ||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |             
T  22144 atgaatacgcatggaaaatgacaagttatatgtcttggcttattaaagacaatagcgacgtcgaatttatgttttggaatatggtggaaaa--------- 22054  T
Q  118 atatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22053 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgagt 21980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8602 - 8526
Alignment:
Q  121 tatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8602 tatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta 8526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University