View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16944_low_18 (Length: 237)

Name: NF16944_low_18
Description: NF16944
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16944_low_18
NF16944_low_18
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (1-229)||(2897707-2897935)
chr3 (7-229)||(20461390-20461612)
chr3 (7-229)||(7793239-7793462)
chr3 (7-211)||(15482675-15482879)
chr3 (7-229)||(327054-327277)
chr3 (7-202)||(30065970-30066165)
chr3 (7-202)||(11854757-11854952)
chr3 (7-202)||(55022891-55023086)
chr3 (7-202)||(11070092-11070287)
chr3 (7-202)||(11165419-11165614)
chr3 (7-211)||(31097444-31097649)
chr3 (7-202)||(14499349-14499544)
chr3 (37-202)||(15617398-15617563)
chr3 (37-202)||(7109722-7109887)
chr3 (37-202)||(7113657-7113822)
chr3 (37-202)||(22336743-22336908)
chr3 (37-202)||(27409564-27409729)
chr3 (37-202)||(28949748-28949913)
chr3 (37-202)||(22321688-22321853)
chr3 (7-145)||(11300401-11300539)
chr3 (38-211)||(15850006-15850176)
chr3 (12-226)||(18383811-18384032)
chr3 (15-203)||(19725809-19726004)
chr3 (90-229)||(14668554-14668700)
chr3 (64-229)||(14665398-14665570)
chr3 (47-211)||(15464878-15465040)
chr3 (12-226)||(322592-322813)
chr3 (12-226)||(12496257-12496479)
chr3 (47-211)||(5223077-5223239)
chr3 (103-211)||(8489459-8489564)
chr3 (12-226)||(11862793-11863015)
chr3 (12-211)||(16797949-16798147)
chr3 (12-226)||(11851581-11851803)
chr3 (36-226)||(12037871-12038068)
chr3 (47-211)||(12339479-12339641)
chr3 (12-211)||(16808776-16808974)
chr3 (71-226)||(11298482-11298644)
chr3 (73-207)||(11300723-11300854)
chr3 (103-211)||(11854430-11854535)
chr3 (150-226)||(12172796-12172872)
chr3 (12-204)||(1982705-1982905)
chr3 (12-203)||(3402850-3403050)
chr3 (34-207)||(17241990-17242161)
chr3 (90-211)||(16750567-16750682)
chr3 (150-222)||(23053128-23053200)
chr3 (12-203)||(3389830-3390030)
chr3 (93-199)||(38814409-38814513)
chr3 (12-199)||(3833699-3833885)
chr3 (90-202)||(4111228-4111334)
chr3 (90-202)||(15964993-15965099)
chr3 (90-202)||(15968917-15969023)
chr3 (90-202)||(15972841-15972947)
chr3 (90-202)||(19775789-19775895)
chr3 (152-211)||(4589228-4589287)
chr3 (152-211)||(19775360-19775419)
chr3 (148-226)||(23408428-23408506)
chr3 (150-228)||(46822267-46822345)
chr3 (150-203)||(12511084-12511137)
chr3 (90-202)||(4107376-4107482)
chr3 (150-202)||(11557425-11557477)
chr3 (150-226)||(15878092-15878168)
chr3 (150-226)||(23077518-23077594)
chr3 (90-202)||(37439615-37439721)
chr3 (156-203)||(11595186-11595233)
chr3 (167-226)||(14878574-14878633)
chr3 (113-199)||(15941902-15941985)
chr3 (152-211)||(16696798-16696857)
chr3 (100-199)||(1598464-1598560)
chr3 (150-226)||(856140-856216)
chr3 (12-99)||(15060428-15060516)
chr3 (178-226)||(26196500-26196548)
chr3 (148-203)||(30029867-30029922)
chr3 (156-203)||(42325964-42326011)
chr3 (47-132)||(4589039-4589125)
chr3 (12-85)||(15051666-15051740)
chr3 (47-140)||(19775515-19775608)
chr3 (12-140)||(11595033-11595162)
chr3 (150-203)||(15051531-15051584)
chr3 (150-203)||(15060307-15060360)
chr3 (150-203)||(16369423-16369476)
chr3 (150-203)||(16909765-16909818)
chr3 (167-203)||(17525216-17525252)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (7-229)||(66305-66527)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (7-229)||(53559-53781)
scaffold0031 (90-202)||(36065-36171)
scaffold0031 (149-202)||(65838-65891)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (7-229)||(11312642-11312864)
chr7 (7-211)||(13635359-13635563)
chr7 (7-213)||(12318137-12318343)
chr7 (7-213)||(15580701-15580907)
chr7 (7-209)||(15605162-15605365)
chr7 (7-211)||(16583268-16583471)
chr7 (7-202)||(70655-70850)
chr7 (7-202)||(74764-74959)
chr7 (7-202)||(33128-33323)
chr7 (37-202)||(39722287-39722452)
chr7 (37-202)||(12714885-12715050)
chr7 (37-202)||(12718689-12718854)
chr7 (37-202)||(16114262-16114427)
chr7 (37-202)||(16117415-16117580)
chr7 (37-202)||(16907121-16907286)
chr7 (37-202)||(18283387-18283552)
chr7 (37-202)||(26292416-26292581)
chr7 (37-202)||(18279424-18279589)
chr7 (37-202)||(12704579-12704744)
chr7 (37-202)||(12723600-12723765)
chr7 (19-208)||(9593361-9593549)
chr7 (7-208)||(18948-19148)
chr7 (12-226)||(14429883-14430104)
chr7 (34-210)||(11987225-11987400)
chr7 (12-226)||(12321636-12321858)
chr7 (47-211)||(13918710-13918872)
chr7 (64-229)||(2832389-2832561)
chr7 (47-211)||(1859016-1859178)
chr7 (90-208)||(7519332-7519447)
chr7 (64-226)||(9751703-9751871)
chr7 (93-207)||(16457334-16457446)
chr7 (47-211)||(25927433-25927595)
chr7 (19-146)||(9644384-9644512)
chr7 (34-211)||(8917439-8917615)
chr7 (14-204)||(2760153-2760351)
chr7 (104-211)||(2530378-2530484)
chr7 (7-226)||(3271823-3272050)
chr7 (172-229)||(14152048-14152105)
chr7 (93-211)||(13149167-13149283)
chr7 (64-226)||(39267847-39268016)
chr7 (90-211)||(18425450-18425565)
chr7 (14-82)||(2530040-2530108)
chr7 (93-211)||(13461773-13461889)
chr7 (90-202)||(45169985-45170091)
chr7 (152-211)||(16275504-16275563)
chr7 (153-211)||(35151618-35151676)
chr7 (34-207)||(6801229-6801401)
chr7 (96-211)||(14216927-14217040)
chr7 (96-211)||(15728337-15728450)
chr7 (150-226)||(19649530-19649606)
chr7 (156-203)||(42204017-42204064)
chr7 (150-204)||(9446199-9446253)
chr7 (153-211)||(16724665-16724723)
chr7 (153-211)||(17701679-17701737)
chr7 (167-213)||(24054477-24054523)
chr7 (167-203)||(15211484-15211520)
chr7 (93-200)||(18556996-18557101)
chr7 (150-226)||(17138101-17138177)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (7-229)||(17804191-17804413)
chr6 (7-229)||(25767058-25767280)
chr6 (7-209)||(22429920-22430122)
chr6 (7-202)||(14472292-14472486)
chr6 (7-202)||(18955653-18955848)
chr6 (7-202)||(22862967-22863162)
chr6 (37-202)||(1644726-1644891)
chr6 (12-202)||(19870611-19870801)
chr6 (37-202)||(11566883-11567048)
chr6 (37-202)||(23395089-23395254)
chr6 (37-202)||(8243882-8244047)
chr6 (37-202)||(23989941-23990106)
chr6 (37-202)||(18917186-18917351)
chr6 (37-202)||(12618765-12618929)
chr6 (7-208)||(12706705-12706905)
chr6 (12-226)||(18907111-18907333)
chr6 (7-208)||(16741222-16741422)
chr6 (90-229)||(27325582-27325730)
chr6 (47-211)||(23414658-23414820)
chr6 (47-211)||(27556416-27556578)
chr6 (47-211)||(5616745-5616908)
chr6 (62-226)||(16523330-16523500)
chr6 (34-207)||(19662787-19662958)
chr6 (28-211)||(9482204-9482386)
chr6 (12-146)||(21834784-21834916)
chr6 (34-207)||(2685236-2685407)
chr6 (90-226)||(20907955-20908098)
chr6 (90-226)||(21766695-21766838)
chr6 (7-76)||(27415832-27415901)
chr6 (150-226)||(15894479-15894555)
chr6 (71-226)||(18180494-18180655)
chr6 (90-211)||(16624144-16624259)
chr6 (47-209)||(27416124-27416278)
chr6 (148-228)||(19848034-19848114)
chr6 (90-202)||(31477789-31477895)
chr6 (152-211)||(1644300-1644359)
chr6 (156-203)||(19790826-19790873)
chr6 (167-226)||(22432249-22432308)
chr6 (167-226)||(22438799-22438858)
chr6 (93-199)||(22592780-22592884)
chr6 (152-211)||(31478265-31478324)
chr6 (148-226)||(15041589-15041667)
chr6 (150-204)||(27553612-27553666)
chr6 (93-199)||(12496333-12496437)
chr6 (149-226)||(19873120-19873197)
chr6 (96-211)||(1587711-1587824)
chr6 (90-202)||(16760316-16760422)
chr6 (90-202)||(22949129-22949235)
chr6 (90-202)||(22953085-22953191)
chr6 (90-202)||(23871573-23871679)
chr6 (90-202)||(23875529-23875635)
chr6 (148-228)||(23992429-23992509)
chr6 (167-226)||(19862978-19863037)
chr6 (47-140)||(31478076-31478169)
chr6 (156-201)||(23657468-23657513)
chr6 (96-211)||(20803534-20803647)
chr6 (156-204)||(27567656-27567704)
chr6 (152-211)||(21702300-21702359)
chr6 (167-221)||(16929647-16929701)
chr6 (167-221)||(16965367-16965421)
chr6 (12-140)||(19790673-19790802)
chr6 (151-204)||(22408345-22408398)
chr6 (150-203)||(25603425-25603478)
chr6 (150-203)||(25611763-25611816)
chr6 (149-226)||(25642227-25642304)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (7-229)||(24735397-24735619)
chr2 (7-202)||(10101535-10101730)
chr2 (37-202)||(24649378-24649543)
chr2 (37-202)||(12901432-12901597)
chr2 (37-202)||(27379353-27379518)
chr2 (37-202)||(27383399-27383564)
chr2 (37-202)||(27601817-27601982)
chr2 (37-202)||(24628399-24628564)
chr2 (7-140)||(19688646-19688779)
chr2 (37-202)||(41530930-41531089)
chr2 (12-226)||(22811805-22812028)
chr2 (12-226)||(25963611-25963832)
chr2 (90-211)||(31344890-31345008)
chr2 (37-115)||(15477711-15477789)
chr2 (12-203)||(25961429-25961628)
chr2 (90-226)||(21916072-21916215)
chr2 (34-207)||(22461106-22461277)
chr2 (101-199)||(19928487-19928583)
chr2 (93-211)||(41666962-41667078)
chr2 (71-204)||(21318590-21318731)
chr2 (71-204)||(21327521-21327662)
chr2 (150-204)||(37524697-37524751)
chr2 (150-226)||(22799167-22799243)
chr2 (150-226)||(24716569-24716645)
chr2 (156-204)||(24869902-24869950)
chr2 (90-202)||(30344970-30345076)
chr2 (93-199)||(18855438-18855541)
chr2 (12-203)||(40428486-40428686)
chr2 (150-204)||(24174822-24174876)
chr2 (156-226)||(24673569-24673639)
chr2 (90-202)||(1283410-1283516)
chr2 (150-226)||(23019747-23019823)
chr2 (36-99)||(24673713-24673777)
chr2 (148-203)||(25616212-25616267)
chr2 (150-204)||(24655379-24655433)
chr2 (153-211)||(27263285-27263343)
chr2 (96-211)||(60829-60941)
chr2 (150-226)||(40622251-40622327)
chr2 (156-223)||(24680191-24680258)
chr2 (12-85)||(21918210-21918284)
chr2 (149-226)||(22741004-22741081)
chr2 (169-226)||(45678189-45678246)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (7-229)||(36133852-36134074)
chr4 (7-202)||(17810293-17810488)
chr4 (7-202)||(14757312-14757507)
chr4 (37-202)||(9556551-9556716)
chr4 (7-202)||(27534047-27534242)
chr4 (37-202)||(4561254-4561419)
chr4 (64-211)||(22634369-22634516)
chr4 (37-202)||(5756858-5757023)
chr4 (37-202)||(33742399-33742563)
chr4 (19-208)||(1951663-1951851)
chr4 (34-208)||(18222295-18222468)
chr4 (12-226)||(16487972-16488194)
chr4 (7-208)||(17152377-17152576)
chr4 (34-208)||(18228770-18228943)
chr4 (47-211)||(43256343-43256505)
chr4 (12-226)||(16356847-16357068)
chr4 (64-229)||(20157407-20157579)
chr4 (47-211)||(18236904-18237067)
chr4 (64-226)||(13812966-13813135)
chr4 (93-199)||(26243642-26243746)
chr4 (12-226)||(16348559-16348780)
chr4 (93-211)||(16243377-16243493)
chr4 (101-211)||(3412811-3412919)
chr4 (7-76)||(43256051-43256120)
chr4 (150-226)||(12570014-12570090)
chr4 (93-211)||(2014791-2014907)
chr4 (93-199)||(19757578-19757682)
chr4 (93-199)||(19782124-19782228)
chr4 (34-199)||(23139296-23139459)
chr4 (95-211)||(28569423-28569537)
chr4 (90-202)||(10712874-10712980)
chr4 (90-202)||(10926644-10926750)
chr4 (62-204)||(5338926-5339076)
chr4 (152-211)||(14708668-14708727)
chr4 (12-99)||(12570158-12570246)
chr4 (90-202)||(14954146-14954252)
chr4 (90-202)||(25689891-25689997)
chr4 (100-199)||(45938173-45938269)
chr4 (152-211)||(15224807-15224866)
chr4 (156-203)||(25555503-25555550)
chr4 (148-226)||(15093775-15093853)
chr4 (150-204)||(15353348-15353402)
chr4 (153-211)||(18602766-18602824)
chr4 (155-211)||(18609340-18609396)
chr4 (156-203)||(11250608-11250655)
chr4 (152-211)||(42997484-42997543)
chr4 (113-198)||(9530460-9530542)
chr4 (167-203)||(23843501-23843537)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (7-229)||(24782990-24783212)
chr1 (7-209)||(16080334-16080536)
chr1 (7-211)||(36819198-36819403)
chr1 (7-202)||(1010744-1010939)
chr1 (37-202)||(20228729-20228894)
chr1 (37-202)||(16375378-16375543)
chr1 (37-202)||(21407376-21407541)
chr1 (37-202)||(52639562-52639727)
chr1 (34-208)||(19211883-19212056)
chr1 (18-226)||(18182021-18182237)
chr1 (7-202)||(23819189-23819383)
chr1 (18-226)||(22449166-22449382)
chr1 (47-211)||(33797295-33797457)
chr1 (166-229)||(21313122-21313185)
chr1 (36-226)||(3472843-3473039)
chr1 (96-208)||(20138099-20138209)
chr1 (93-198)||(18882393-18882496)
chr1 (34-207)||(12646888-12647059)
chr1 (7-76)||(33797680-33797749)
chr1 (12-204)||(8761527-8761728)
chr1 (90-226)||(17678560-17678702)
chr1 (93-197)||(46975494-46975596)
chr1 (90-202)||(1925108-1925214)
chr1 (90-202)||(20924122-20924228)
chr1 (150-204)||(3705105-3705159)
chr1 (148-226)||(21788081-21788159)
chr1 (10-203)||(45310259-45310462)
chr1 (90-211)||(39244120-39244235)
chr1 (90-211)||(39247675-39247790)
chr1 (90-211)||(41388220-41388335)
chr1 (12-203)||(18393858-18394059)
chr1 (12-99)||(21022775-21022863)
chr1 (151-202)||(33050067-33050118)
chr1 (94-211)||(20229208-20229323)
chr1 (156-226)||(21022631-21022701)
chr1 (169-226)||(6151848-6151905)
chr1 (148-229)||(22468735-22468816)
chr1 (169-226)||(22831446-22831503)
chr1 (150-229)||(20135188-20135267)
chr1 (156-203)||(45489790-45489837)
chr1 (47-132)||(20229075-20229161)
chr1 (12-99)||(42865105-42865194)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (7-211)||(12916-13120)
scaffold0044 (14-211)||(19200-19397)
scaffold0044 (96-211)||(62273-62386)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (7-202)||(3765-3960)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (62-229)||(17410434-17410601)
chr5 (7-202)||(15236670-15236865)
chr5 (7-211)||(23535479-23535681)
chr5 (37-202)||(20295868-20296033)
chr5 (37-202)||(19472640-19472805)
chr5 (12-226)||(21366560-21366781)
chr5 (5-208)||(42805436-42805638)
chr5 (47-211)||(20911101-20911263)
chr5 (7-208)||(18774219-18774420)
chr5 (5-207)||(26742634-26742835)
chr5 (64-229)||(24767493-24767665)
chr5 (47-211)||(18355970-18356132)
chr5 (93-208)||(18784062-18784175)
chr5 (12-207)||(20232568-20232761)
chr5 (34-207)||(24532965-24533136)
chr5 (34-207)||(26666048-26666219)
chr5 (34-207)||(26937645-26937816)
chr5 (12-226)||(20805552-20805772)
chr5 (7-76)||(18356474-18356543)
chr5 (137-202)||(40723607-40723672)
chr5 (93-199)||(16674177-16674281)
chr5 (113-207)||(21340764-21340855)
chr5 (93-211)||(21885166-21885282)
chr5 (93-199)||(33409253-33409357)
chr5 (7-203)||(23451371-23451573)
chr5 (7-76)||(20910690-20910759)
chr5 (150-226)||(1859017-1859093)
chr5 (90-202)||(10753385-10753491)
chr5 (156-204)||(26680604-26680652)
chr5 (156-204)||(26952211-26952259)
chr5 (150-221)||(123346-123417)
chr5 (93-199)||(17718416-17718520)
chr5 (71-226)||(20766974-20767135)
chr5 (12-140)||(22757219-22757348)
chr5 (7-226)||(23458592-23458817)
chr5 (7-226)||(23462853-23463078)
chr5 (148-228)||(17517240-17517320)
chr5 (150-226)||(23572084-23572160)
chr5 (156-204)||(31342169-31342217)
chr5 (152-211)||(10752956-10753015)
chr5 (156-203)||(12028612-12028659)
chr5 (156-203)||(17919198-17919245)
chr5 (153-211)||(4036232-4036290)
chr5 (150-204)||(24221899-24221953)
chr5 (153-211)||(25229441-25229499)
chr5 (153-211)||(25293597-25293655)
chr5 (150-226)||(23512098-23512174)
chr5 (152-200)||(26172488-26172536)
chr5 (167-226)||(21873254-21873313)
chr5 (47-140)||(10753111-10753204)
chr5 (150-203)||(23201383-23201436)
chr5 (169-226)||(23501415-23501472)
chr5 (167-226)||(14079149-14079208)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (34-211)||(18549-18726)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (37-202)||(65448-65613)
scaffold0029 (37-202)||(61532-61697)
scaffold0029 (7-202)||(80736-80928)
scaffold0029 (150-226)||(12763-12839)
scaffold0029 (152-211)||(80307-80366)
scaffold0029 (71-140)||(80462-80530)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (7-211)||(2563-2766)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (7-198)||(13377-13568)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (12-211)||(173304-173501)
scaffold0001 (90-226)||(422505-422648)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (7-202)||(12443-12638)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (7-211)||(228263-228466)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (37-202)||(5021-5186)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (37-202)||(43251834-43251999)
chr8 (37-202)||(19278203-19278368)
chr8 (37-202)||(21972505-21972670)
chr8 (37-202)||(21976590-21976755)
chr8 (7-208)||(16231365-16231565)
chr8 (37-170)||(22111904-22112037)
chr8 (7-208)||(22044900-22045100)
chr8 (12-226)||(20465933-20466157)
chr8 (12-226)||(30643185-30643408)
chr8 (12-204)||(15602911-15603111)
chr8 (47-211)||(14398039-14398201)
chr8 (12-226)||(17926601-17926822)
chr8 (110-211)||(21387086-21387184)
chr8 (12-204)||(15611363-15611563)
chr8 (7-145)||(18619555-18619694)
chr8 (106-211)||(21383666-21383768)
chr8 (7-208)||(23834188-23834389)
chr8 (34-132)||(22028647-22028746)
chr8 (7-211)||(30308644-30308846)
chr8 (93-199)||(15531914-15532018)
chr8 (71-203)||(16410208-16410347)
chr8 (100-199)||(17828567-17828663)
chr8 (150-226)||(24755714-24755790)
chr8 (93-199)||(15538473-15538577)
chr8 (12-203)||(20856319-20856518)
chr8 (93-199)||(23846992-23847096)
chr8 (148-228)||(18678141-18678221)
chr8 (90-202)||(18862624-18862730)
chr8 (90-202)||(21827993-21828099)
chr8 (148-203)||(32121759-32121814)
chr8 (93-211)||(32605223-32605339)
chr8 (103-226)||(23776821-23776952)
chr8 (151-204)||(22010716-22010769)
chr8 (150-203)||(39094965-39095018)
chr8 (150-226)||(377271-377347)
chr8 (12-99)||(377415-377503)
chr8 (150-226)||(16861365-16861441)
chr8 (151-211)||(17055412-17055472)
chr8 (90-202)||(21410971-21411077)
chr8 (90-202)||(21805463-21805569)
chr8 (12-99)||(24755858-24755946)
chr8 (150-229)||(23648554-23648633)
chr8 (152-211)||(32598691-32598750)
chr8 (19-99)||(19259483-19259564)
chr8 (150-226)||(16184720-16184796)
chr8 (150-226)||(17353984-17354060)
chr8 (150-226)||(21162099-21162175)
chr8 (150-226)||(21168772-21168848)
chr8 (150-203)||(19259632-19259685)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (37-202)||(58639-58804)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (37-202)||(35863-36027)
scaffold0109 (12-211)||(6957-7155)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (7-211)||(19907-20110)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (7-211)||(9555-9759)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (7-226)||(4430-4657)
scaffold0676 (90-202)||(471-578)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (12-226)||(159-382)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (34-208)||(3447-3620)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (13-226)||(6204-6425)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (34-208)||(18277-18450)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (7-122)||(10474-10589)
scaffold0004 (149-226)||(69794-69871)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (12-226)||(393-615)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (12-226)||(42627-42844)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (12-226)||(1494-1715)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (62-226)||(17056-17228)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (17-204)||(5608-5803)
scaffold0476 (17-204)||(6803-6998)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (18-226)||(15087-15302)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (7-208)||(24858-25059)
scaffold0012 (90-202)||(189356-189462)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (12-203)||(46621-46820)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (7-226)||(18545-18774)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (12-226)||(9513-9733)
scaffold0104 (12-226)||(1830-2051)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (64-229)||(9990-10162)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (47-211)||(6693-6855)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (47-211)||(30897-31059)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (34-150)||(1-118)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (74-226)||(73725-73883)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (12-204)||(1384-1584)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (37-123)||(928-1014)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (64-218)||(2913-3074)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (12-146)||(21463-21597)
scaffold0037 (152-211)||(80810-80869)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (7-208)||(23232-23432)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (12-226)||(897-1118)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (47-211)||(20395-20557)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (12-226)||(44081-44302)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (12-211)||(6152-6350)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (47-211)||(207768-207942)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (12-203)||(1978-2178)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (150-226)||(289-365)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (93-211)||(9916-10032)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (93-211)||(18367-18483)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (93-199)||(63878-63982)
scaffold0042 (150-226)||(34960-35036)
scaffold0042 (93-199)||(75762-75866)
scaffold0042 (12-99)||(34804-34892)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (103-226)||(4790-4921)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (103-226)||(38465-38596)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (7-143)||(19181-19317)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (7-76)||(71460-71529)
scaffold0003 (103-209)||(71083-71180)
scaffold0003 (150-226)||(414091-414167)
scaffold0003 (113-199)||(139736-139819)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (150-226)||(14127-14203)
scaffold0056 (12-99)||(13971-14059)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (90-226)||(7471-7614)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (12-203)||(6310-6508)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (93-211)||(5977-6093)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (93-211)||(77148-77264)
scaffold0043 (167-226)||(18236-18295)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (12-203)||(19626-19826)
scaffold0017 (12-203)||(15104-15304)
scaffold0017 (167-203)||(193034-193070)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (150-226)||(6095-6171)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (90-202)||(11480-11586)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (90-202)||(14066-14172)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (152-211)||(9347-9406)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (12-203)||(35405-35605)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (151-226)||(2832-2907)
scaffold0158 (151-226)||(6498-6573)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (93-211)||(1889-2005)
scaffold0008 (7-226)||(30634-30859)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (12-99)||(6972-7060)
scaffold0311 (150-226)||(7128-7204)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (150-226)||(21844-21920)
scaffold0210 (150-226)||(29736-29812)
[»] scaffold0111 (3 HSPs)
scaffold0111 (108-211)||(8512-8613)
scaffold0111 (108-211)||(15656-15757)
scaffold0111 (170-202)||(32459-32491)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (150-226)||(14664-14740)
scaffold0081 (150-226)||(23679-23755)
scaffold0081 (150-226)||(39103-39179)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (12-203)||(8583-8783)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (152-211)||(15350-15409)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (93-199)||(9445-9549)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (17-76)||(15317-15376)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (93-211)||(16640-16756)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (153-211)||(381-439)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (150-204)||(2477-2531)
scaffold0439 (150-204)||(10337-10391)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (150-203)||(7311-7364)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (150-203)||(16389-16442)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (150-201)||(1817-1868)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (90-181)||(439-524)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (156-203)||(2191-2238)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (167-226)||(15737-15796)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (156-203)||(4273-4320)
scaffold0184 (12-137)||(4119-4245)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (113-199)||(36331-36414)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (12-140)||(192211-192340)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (169-226)||(280950-281007)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (150-226)||(1881-1957)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (150-226)||(26828-26904)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (150-226)||(9004-9080)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 2897707 - 2897935
Alignment:
Q  1 taatattgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttgg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |     
T  2897707 taatagtgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactgga 2897806  T
Q  101 attattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2897807 attattattgaatgatcaagaagttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 2897906  T
Q  201 gtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2897907 gtctgaataagataatcaagttgatgatg 2897935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 20461390 - 20461612
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20461390 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 20461489  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461490 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 20461589  T
Q  207 ataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  20461590 ataagataattaaaatgatgatg 20461612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 7793239 - 7793462
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7793239 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttgttgattgattgcattacttgaattatt 7793338  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctg-attatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793339 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 7793438  T
Q  206 aataagataattaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  7793439 aataagataattaaaatgatgatg 7793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15482879 - 15482675
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15482879 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 15482780  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482779 attgaatgctcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 15482680  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  15482679 ataag 15482675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 327054 - 327277
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  327054 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 327153  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga-ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327154 attgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 327253  T
Q  206 aataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    
T  327254 aataagataattaaattgatgatg 327277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30066165 - 30065970
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30066165 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 30066066  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30066065 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 30065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11854952 - 11854757
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11854952 tgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11854853  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11854852 attgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 11854757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 55023086 - 55022891
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  55023086 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 55022987  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  55022986 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattgttatttaactaagttacatgagt 55022891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11070287 - 11070092
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11070287 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11070188  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11070187 cttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 11070092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 11165419 - 11165614
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11165419 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11165518  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11165519 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 11165614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 31097444 - 31097649
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatga-aatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  || |||||| |||||    
T  31097444 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaagtgattatgttgtgatatattgattgattccactacttgaattat 31097543  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31097544 tgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactatgttgcatgagtctg 31097643  T
Q  206 aataag 211  Q
    ||||||    
T  31097644 aataag 31097649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14499544 - 14499349
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14499544 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaattgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 14499445  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14499444 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaactaagttgcatgagt 14499349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15617563 - 15617398
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15617563 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattacattacttgaattattattgaatgatcaggaacttgttgaaaatga 15617464  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15617463 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 15617398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7109887 - 7109722
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7109887 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 7109788  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7109787 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 7109722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7113822 - 7113657
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7113822 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 7113723  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7113722 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 7113657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22336908 - 22336743
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22336908 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 22336809  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22336808 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 22336743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 27409564 - 27409729
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27409564 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 27409663  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27409664 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 27409729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28949913 - 28949748
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28949913 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 28949814  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28949813 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 28949748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22321853 - 22321688
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22321853 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 22321754  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22321753 attggtattaagctattgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 22321688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Original strand, 11300401 - 11300539
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11300401 tgagacctatctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11300500  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11300501 attgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 211
Target Start/End: Original strand, 15850006 - 15850176
Alignment:
Q  38 gtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa 137  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15850006 gtgaagcttttatgaaatgctaaatgattatattgtgatatatggattgattgcataacttgaattattgttgaatgatcaagaaattg-tgaaaatgaa 15850104  T
Q  138 ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15850105 ttgttattaaac--ttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagactgaataag 15850176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 18383811 - 18384032
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||| || |||| ||||| || ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  18383811 cctatttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 18383910  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18383911 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18384009  T
Q  204 tgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |  | ||||| ||||||||||||    
T  18384010 tatacaagatgattaagatgatg 18384032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 19725809 - 19726004
Alignment:
Q  15 atttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaat 113  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||| ||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||| | |||||||||||    
T  19725809 atttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaatattattgaat 19725908  T
Q  114 gatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19725909 gatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgagtcatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 19726004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14668700 - 14668554
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668700 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 14668602  T
Q  182 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  14668601 atttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665398
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||     |||||||    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattttaaagttatactgttga 14665472  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  14665471 tgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15465040 - 15464878
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  15465040 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 15464942  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15464941 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 15464878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 322813 - 322592
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  322813 cctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 322714  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  322713 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatattgttgtgatctgattatgccgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 322615  T
Q  204 tgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |  | ||||| |||| |||||||    
T  322614 tatacaagatgattatgatgatg 322592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12496479 - 12496257
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  12496479 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 12496381  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12496380 aatgatcaagatgttgtagaaa-tgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgag 12496282  T
Q  202 tctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||   ||||||| | ||||||||||    
T  12496281 tcattataagatgaataagatgatg 12496257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5223239 - 5223077
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  5223239 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 5223141  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5223140 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgtatgagtatgaataag 5223077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 211
Target Start/End: Original strand, 8489459 - 8489564
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8489459 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 8489555  T
Q  203 ctgaataag 211  Q
     ||||||||    
T  8489556 atgaataag 8489564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11863015 - 11862793
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||  ||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  11863015 cctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 11862916  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttg----at----gtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |  |||     ||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11862915 aatgaccaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 11862817  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||    
T  11862816 ctttacaagatgattaagatgatg 11862793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Original strand, 16797949 - 16798147
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||| || ||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| |||    
T  16797949 cctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttg 16798048  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataa 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16798049 aatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatgttgcatgagtatgaataa 16798146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11851803 - 11851581
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||||||||||||| |||  |  |||||||||  |||||| || |||| |||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  11851803 cctatttaagatgttatctgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 11851704  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |         ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11851703 aatgaacaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttgcatgagt 11851605  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||    
T  11851604 ctatacaagatgattaagatgatg 11851581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Original strand, 12037871 - 12038068
Alignment:
Q  36 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 134  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12037871 ctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-t 12037969  T
Q  135 gaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  12037970 gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagtttatataagatgattaagatgatg 12038068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12339641 - 12339479
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  12339641 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 12339543  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    || ||  ||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12339542 aaact--tgatgagaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 12339479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Original strand, 16808776 - 16808974
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||| || ||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| | | ||||||| |||||| |||    
T  16808776 cctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttg 16808875  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataa 210  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||  |||||| | |||||  |||||||||| |||||||    
T  16808876 aatggtcaagaaattgttgcaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatattgcatgagtatgaataa 16808973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 11298482 - 11298644
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatc 162  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |         ||||| |||||||    
T  11298482 tgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatc 11298580  T
Q  163 tgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  11298581 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 11298644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Original strand, 11300723 - 11300854
Alignment:
Q  73 tgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgct 172  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  11300723 tgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaac-gtt-atgtgatttgattatgct 11300819  T
Q  173 gctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11300820 acaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaa 11300854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11854535 - 11854430
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11854535 tattattgaaagattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 11854439  T
Q  203 ctgaataag 211  Q
     ||||||||    
T  11854438 atgaataag 11854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12172872 - 12172796
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  12172872 tgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattatgatgatg 12172796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 1982705 - 1982905
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    |||| |||||||||||||||  |  ||||||| | ||||||| || ||||| ||| || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||| ||||    
T  1982705 cctaattaagatgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagttattgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaactatttttga 1982804  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||| | | | |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1982805 atgacctatatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 1982904  T
Q  204 t 204  Q
    |    
T  1982905 t 1982905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 3402850 - 3403050
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| |||    
T  3402850 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattccttgatttattcttg 3402949  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| | |  || |||||||||||||||||| |        ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3402950 aataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3403049  T
Q  203 c 203  Q
    |    
T  3403050 c 3403050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17242161 - 17241990
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  17242161 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 17242063  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  17242062 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaa 17241990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Original strand, 16750567 - 16750682
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16750567 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 16750660  T
Q  190 aagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  16750661 aagttgcaagaatatgaataag 16750682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Original strand, 23053128 - 23053200
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagat 222  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  23053128 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatataagatgattaagat 23053200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 3389830 - 3390030
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  3389830 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 3389929  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||  | |  || |||||||||||||||||| |        ||||   || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3389930 aaaaaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 3390029  T
Q  203 c 203  Q
    |    
T  3390030 c 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38814513 - 38814409
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  38814513 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 38814416  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  38814415 ttgcatg 38814409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3833885 - 3833699
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||| |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| || |||| ||||||    |||  ||| ||||||| || || ||||| |||||| |||    
T  3833885 cctattaaagatgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttg 3833786  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 199  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  3833785 aatgatcaagcaattgttgagaatgacttgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 3833699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 4111228 - 4111334
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  4111228 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 4111321  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  4111322 aagttgcatgagt 4111334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15965099 - 15964993
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  15965099 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 15965006  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  15965005 aagttgcatgagt 15964993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15969023 - 15968917
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  15969023 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 15968930  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  15968929 aagttgcatgagt 15968917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15972947 - 15972841
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  15972947 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 15972854  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  15972853 aagttgcatgagt 15972841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19775895 - 19775789
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  19775895 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 19775802  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  19775801 aagttgcatgagt 19775789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Original strand, 4589228 - 4589287
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4589228 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataag 4589287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19775419 - 19775360
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19775419 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataag 19775360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23408506 - 23408428
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  23408506 gctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46822345 - 46822267
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 228  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  46822345 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12511137 - 12511084
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 12511084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 4107376 - 4107482
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  4107376 gcattagttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 4107469  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  4107470 aagttgcatgagt 4107482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 202
Target Start/End: Original strand, 11557425 - 11557477
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  11557425 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 11557477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878168
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 23077518 - 23077594
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  23077518 tgttgttgtgatctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 37439615 - 37439721
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||| | ||||||  | ||||    
T  37439615 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctacaattgttgttaaact 37439708  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  37439709 aagttgcatgagt 37439721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 11595186 - 11595233
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11595186 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11595233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 14878574 - 14878633
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  14878574 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 14878633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Original strand, 15941902 - 15941985
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  15941902 tgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttattaaatt--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 15941985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16696857 - 16696798
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16696857 ttgatgtgatttgtttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 16696798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 1598464 - 1598560
Alignment:
Q  100 gattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcat 198  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  1598464 gattattgttaattgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttatttaagct--tgatgtgatttgattatgctgc-aatgttatttaactaagttgcat 1598559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 856216 - 856140
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  856216 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15060516 - 15060428
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  15060516 cctatataagatggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttg 15060428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  178 tgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30029922 - 30029867
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30029922 gctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtc 30029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42326011 - 42325964
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  42326011 tgtgatctgattatgctgctgctgttttttaactaagttgcatgagtc 42325964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 4589039 - 4589125
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4589039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 4589125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15051740 - 15051666
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgatt 85  Q
    ||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15051740 cctatataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgatt 15051666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19775608 - 19775515
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19775608 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 19775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Original strand, 11595033 - 11595162
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| |||||| |||    
T  11595033 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttg 11595132  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  11595133 aataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 11595162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15051584 - 15051531
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15051584 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15051531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15060360 - 15060307
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15060360 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15060307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16369476 - 16369423
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16369476 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttacttaaccaagttgcatgagtc 16369423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16909818 - 16909765
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16909818 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagtc 16909765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Original strand, 17525216 - 17525252
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17525216 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtc 17525252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 66305 - 66527
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  66305 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 66404  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66405 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 66504  T
Q  207 ataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  66505 ataagataattaaaatgatgatg 66527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53781 - 53559
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53781 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 53682  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53681 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 53582  T
Q  207 ataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  53581 ataagataattaaaatgatgatg 53559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36171
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  36065 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 36158  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  36159 aagttgcatgagt 36171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 202
Target Start/End: Original strand, 65838 - 65891
Alignment:
Q  149 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  65838 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11312864 - 11312642
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11312864 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11312765  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312764 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 11312665  T
Q  207 ataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  11312664 ataagataattaaaatgatgatg 11312642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 13635359 - 13635563
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13635359 tgaggcctatttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 13635458  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635459 attgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 13635558  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  13635559 ataag 13635563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12318343 - 12318137
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12318343 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 12318244  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318243 attgaatgattaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 12318144  T
Q  207 ataagat 213  Q
    |||||||    
T  12318143 ataagat 12318137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15580907 - 15580701
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15580907 tgagacctatttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattatt 15580808  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15580807 attgaatgataaaaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagtctga 15580708  T
Q  207 ataagat 213  Q
    |||||||    
T  15580707 ataagat 15580701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 15605162 - 15605365
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15605162 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 15605261  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15605262 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaaaatgcatgagtctg 15605361  T
Q  206 aata 209  Q
    ||||    
T  15605362 aata 15605365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16583471 - 16583268
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16583471 tgagacctatataagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttat-gattgattgcattacttgaattatt 16583373  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16583372 gttgaatgatcgagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacgttgcatgagtctga 16583273  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  16583272 ataag 16583268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 70655 - 70850
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  70655 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 70754  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  70755 attgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 70850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 74764 - 74959
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  74764 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 74863  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  74864 attgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 74959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33323 - 33128
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33323 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 33224  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33223 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattgttatttaactcagttgcatgagt 33128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39722452 - 39722287
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39722452 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 39722353  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39722352 gttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39722287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12715050 - 12714885
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12715050 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 12714951  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12714950 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 12714885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12718854 - 12718689
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12718854 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 12718755  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12718754 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 12718689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16114427 - 16114262
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16114427 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16114328  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16114327 attgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 16114262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16117580 - 16117415
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16117580 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16117481  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16117480 attgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 16117415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 16907121 - 16907286
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16907121 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16907220  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16907221 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 16907286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18283552 - 18283387
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18283552 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 18283453  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18283452 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 18283387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26292581 - 26292416
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26292581 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattaattgaattattattgaatgataaggaagttgttgaaaatga 26292482  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26292481 attgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 26292416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18279589 - 18279424
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18279589 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 18279490  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18279489 attggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 18279424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 12704579 - 12704744
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12704579 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgaatgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 12704678  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12704679 attggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 12704744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12723765 - 12723600
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12723765 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaataa 12723666  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12723665 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttatttaactaagttacatgagt 12723600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9593549 - 9593361
Alignment:
Q  19 aagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatc 117  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||  || | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9593549 aagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatc 9593450  T
Q  118 aagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaat 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9593449 aagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaat 9593361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 18948 - 19148
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||    
T  18948 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattat 19047  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19048 tattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctg 19145  T
Q  206 aat 208  Q
    |||    
T  19146 aat 19148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14430104 - 14429883
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  14430104 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 14430005  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14430004 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtatactgttgttgtgatctgattatgcggctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14429906  T
Q  204 tgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |  | ||||| ||||||||||||    
T  14429905 tatacaagatgattaagatgatg 14429883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11987400 - 11987225
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    |||| |||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11987400 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggattgattgcatttacttgatttattattgaatgatcaagaaactgttgaaa 11987301  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataa 210  Q
    |||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11987300 atgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataa 11987225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 12321636 - 12321858
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||| || ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||| |    
T  12321636 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatgg 12321735  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12321736 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagt 12321834  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||  | ||||| ||||||| ||||    
T  12321835 ctatacaagatgattaagaagatg 12321858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 13918710 - 13918872
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  13918710 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 13918808  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13918809 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 13918872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832561
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   || |     |||||    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatattgttga 2832487  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2832488 tgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 1859016 - 1859178
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  1859016 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgttatt 1859114  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1859115 aagct--tgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 1859178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 208
Target Start/End: Original strand, 7519332 - 7519447
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7519332 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 7519428  T
Q  190 aagttgcatgagtctgaat 208  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  7519429 aagttggatgagtctgaat 7519447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751871
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgat 156  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |       ||||||||    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttggaa-tgaattgatattatgaattatactgttgat 9751801  T
Q  157 gtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  9751802 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 9751871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 207
Target Start/End: Original strand, 16457334 - 16457446
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |    
T  16457334 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatg 16457431  T
Q  193 ttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||||||||||||||    
T  16457432 ttgcatgagtctgaa 16457446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 25927433 - 25927595
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  25927433 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaatttttatt 25927531  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25927532 aagtt--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 25927595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9644512 - 9644384
Alignment:
Q  19 aagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatc 117  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||  || | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9644512 aagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatc 9644413  T
Q  118 aagaagttgttgaaaatgaattgatatta 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9644412 aagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8917615 - 8917439
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  |    
T  8917615 aactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtga 8917516  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8917515 atgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgagtatgaataag 8917439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2760351 - 2760153
Alignment:
Q  14 tatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| ||| || | || |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||   ||||||||||    
T  2760351 tatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgagatattattgaa 2760253  T
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |         ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  2760252 tgatcatgatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttcgttatttaactaagttgcatgagtct 2760153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 211
Target Start/End: Original strand, 2530378 - 2530484
Alignment:
Q  104 attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatg-tgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2530378 attatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgattatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 2530475  T
Q  203 ctgaataag 211  Q
     ||||||||    
T  2530476 atgaataag 2530484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3272050 - 3271823
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||| || ||    
T  3272050 tgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttactgattaattgcattacttgaat-at 3271952  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgc 196  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  3271951 tattgaataatcaagatgttgtagaaa-tgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgc 3271853  T
Q  197 atgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  3271852 atgagtcattataagatgaataagatgatg 3271823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Original strand, 14152048 - 14152105
Alignment:
Q  172 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14152048 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 14152105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13149283 - 13149167
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  13149283 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 13149186  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  13149185 ttgcatgtgtatgaataag 13149167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39268016
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |         |||||     
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaagttttaatgttgt 39267945  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||    
T  39267946 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgatcaagatgatg 39268016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18425565 - 18425450
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18425565 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 18425472  T
Q  190 aagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  18425471 aagttgcaagaatatgaataag 18425450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 2530040 - 2530108
Alignment:
Q  14 tatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattg 82  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  2530040 tatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgatatattg 2530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13461889 - 13461773
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||     
T  13461889 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtaattaaactaat 13461792  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  13461791 ttgcatgagtatgaataag 13461773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 45169985 - 45170091
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  45169985 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 45170078  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  45170079 aagttgcatgagt 45170091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16275563 - 16275504
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16275563 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 16275504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35151676 - 35151618
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35151676 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 35151618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6801401 - 6801229
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat-ttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaa 131  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||   ||||  |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| || | |||||||||| |||||||     
T  6801401 aactgtgaagccattatgatatattaagtgattatgaagtgaaattatggattgattgcccttacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgag 6801303  T
Q  132 aatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  6801302 aatgatttgttattaagct--tgacatgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgggtctgaa 6801229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14217040 - 14216927
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  14217040 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattgaactaagttg 14216943  T
Q  196 catgagtctgaataag 211  Q
    ||||| | ||||||||    
T  14216942 catgaatatgaataag 14216927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15728450 - 15728337
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  15728450 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttg 15728353  T
Q  196 catgagtctgaataag 211  Q
    ||||| | ||||||||    
T  15728352 catgaatatgaataag 15728337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 19649530 - 19649606
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  19649530 tgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42204064 - 42204017
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  42204064 tgtgatctgattatgctgctgttgttgtttaactaagttgcatgagtc 42204017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Original strand, 9446199 - 9446253
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9446199 tgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 9446253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Original strand, 16724665 - 16724723
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16724665 tgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagtatgaataag 16724723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Original strand, 17701679 - 17701737
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17701679 tgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagtatgaataag 17701737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24054523 - 24054477
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagat 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  24054523 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagat 24054477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15211520 - 15211484
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15211520 tatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18557101 - 18556996
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  18557101 ttacttgaattattgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgctattgaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 18557004  T
Q  193 ttgcatga 200  Q
    ||||||||    
T  18557003 ttgcatga 18556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 17138101 - 17138177
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  17138101 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17804413 - 17804191
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17804413 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 17804314  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804313 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 17804214  T
Q  207 ataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  17804213 ataagataattaaaatgatgatg 17804191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 25767058 - 25767280
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25767058 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagtgattataatgtaatttattgattgattgcattacttgaattatt 25767157  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25767158 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaactaagttgcatgagtctga 25767257  T
Q  207 ataagataattaagatgatgatg 229  Q
    |||||||| || | |||||||||    
T  25767258 ataagatatttgaaatgatgatg 25767280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 22429920 - 22430122
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22429920 tgagacctatttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 22430019  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430020 attaaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatgagtctga 22430119  T
Q  207 ata 209  Q
    |||    
T  22430120 ata 22430122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14472486 - 14472292
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14472486 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 14472387  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14472386 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgtt-attaactaagttgcatgagt 14472292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 18955653 - 18955848
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18955653 tgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattgattgattgattgcattacttgaattatt 18955752  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18955753 attgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 18955848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22863162 - 22862967
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22863162 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 22863063  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22863062 attgaatgattagaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 22862967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1644891 - 1644726
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1644891 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 1644792  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  1644791 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagt 1644726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19870801 - 19870611
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    ||||||||||||  | | ||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19870801 cctatttaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattga 19870702  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19870701 atgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 19870611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11567048 - 11566883
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11567048 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 11566949  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11566948 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 11566883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23395254 - 23395089
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23395254 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 23395155  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23395154 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 23395089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8244047 - 8243882
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8244047 tgtggagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 8243948  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8243947 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 8243882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23990106 - 23989941
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23990106 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 23990007  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23990006 attggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 23989941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 18917186 - 18917351
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18917186 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 18917285  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18917286 attgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18917351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 12618765 - 12618929
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  12618765 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatga 12618863  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12618864 attggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 12618929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12706905 - 12706705
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||   ||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12706905 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggattgattgcatttacttgaattat 12706806  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12706805 ttttgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctg 12706708  T
Q  206 aat 208  Q
    |||    
T  12706707 aat 12706705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18907333 - 18907111
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtg-attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||||  |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  18907333 cctatttaagatgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttcattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 18907234  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18907233 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagt 18907135  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||    
T  18907134 ctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16741422 - 16741222
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16741422 tgagacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattat 16741323  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  16741322 tattgaatgatcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttattaaactaagttgcatgtgtctg 16741225  T
Q  206 aat 208  Q
    |||    
T  16741224 aat 16741222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Original strand, 27325582 - 27325730
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 180  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |        ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27325582 gcattacttgaaatattatggaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgattatgctgctattgt 27325681  T
Q  181 taattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27325682 taattaactaagttgcatgagtctgaataagataattgaaatgatgatg 27325730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23414820 - 23414658
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  23414820 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 23414722  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23414721 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 23414658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27556578 - 27556416
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27556578 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 27556480  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27556479 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 27556416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 5616745 - 5616908
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  5616745 ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgagaatgatttgttatt 5616844  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    || ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5616845 aaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 5616908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Original strand, 16523330 - 16523500
Alignment:
Q  62 tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tg 154  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |  ||       ||    
T  16523330 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataaagttg 16523428  T
Q  155 atgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  16523429 ttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 16523500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19662958 - 19662787
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  19662958 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 19662860  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19662859 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaa 19662787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Original strand, 9482204 - 9482386
Alignment:
Q  28 actgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttg 126  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| || |||| ||||||    ||| |||| ||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  9482204 actgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattatagattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattg 9482303  T
Q  127 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9482304 ttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgcttatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtgtatgaataag 9482386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 21834784 - 21834916
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||   || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |  | |||||||| | ||||||||    
T  21834784 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgttt--aactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaatattattg 21834881  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 146  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21834882 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21834916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 2685236 - 2685407
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||| |    
T  2685236 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgtcgattgatcaagaa-ttgttgaga 2685334  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  2685335 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaa 2685407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Original strand, 20907955 - 20908098
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  20907955 gcattacttgaattattcttgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtt 20908053  T
Q  182 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    | |||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||    
T  20908054 atttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatgatg 20908098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21766838 - 21766695
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |         ||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  21766838 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgtt 21766740  T
Q  182 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21766739 atttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 27415832 - 27415901
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27415832 tgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 27415901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 15894479 - 15894555
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  15894479 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 15894555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18180655 - 18180494
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatct 163  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| ||||||||    
T  18180655 tgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatct 18180557  T
Q  164 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  18180556 gattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 18180494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16624259 - 16624144
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||| |  |||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16624259 gcattacttgaagtattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagtt--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 16624166  T
Q  190 aagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  16624165 aagttgcaagaatatgaataag 16624144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 27416124 - 27416278
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  ||||||||   | ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27416124 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 27416222  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 209  Q
    |||||       |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27416223 aagct-------tgat-tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaata 27416278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 19848034 - 19848114
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 228  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  19848034 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 31477789 - 31477895
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  31477789 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 31477882  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  31477883 aagttgcatgagt 31477895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1644359 - 1644300
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1644359 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataag 1644300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 19790826 - 19790873
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19790826 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22432308 - 22432249
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  22432308 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22438858 - 22438799
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  22438858 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 22592780 - 22592884
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||    
T  22592780 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctacaaatgttatttaactaag 22592877  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  22592878 ttgcatg 22592884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Original strand, 31478265 - 31478324
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31478265 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataag 31478324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Original strand, 15041589 - 15041667
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||    
T  15041589 gctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtctttataagatgaacaagatgatg 15041667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Original strand, 27553612 - 27553666
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  27553612 tgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttctttaactaagttgcatgagtct 27553666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12496437 - 12496333
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 191  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  || ||||||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  12496437 ttacttgaaatattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttatagaacctgttg---tgatctgattatgctgcaaatgttatttaactaa 12496341  T
Q  192 gttgcatg 199  Q
    ||||||||    
T  12496340 gttgcatg 12496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19873197 - 19873120
Alignment:
Q  149 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  19873197 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Original strand, 1587711 - 1587824
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  1587711 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttg 1587808  T
Q  196 catgagtctgaataag 211  Q
    ||||| | ||||||||    
T  1587809 catgaatatgaataag 1587824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16760422 - 16760316
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  16760422 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 16760329  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||| ||||    
T  16760328 aagttgcacgagt 16760316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22949235 - 22949129
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  22949235 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 22949142  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  22949141 aagttgcatgagt 22949129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22953191 - 22953085
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  22953191 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 22953098  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  22953097 aagttgcatgagt 22953085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23871679 - 23871573
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  23871679 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 23871586  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  23871585 aagttgcatgagt 23871573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23875635 - 23875529
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  23875635 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 23875542  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  23875541 aagttgcatgagt 23875529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23992509 - 23992429
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 228  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  23992509 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19863037 - 19862978
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  19863037 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Original strand, 31478076 - 31478169
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31478076 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 31478169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Original strand, 23657468 - 23657513
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  23657468 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgag 23657513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Original strand, 20803534 - 20803647
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||    
T  20803534 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagctg 20803631  T
Q  196 catgagtctgaataag 211  Q
    ||||| | ||||||||    
T  20803632 catgaatatgaataag 20803647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Original strand, 27567656 - 27567704
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27567656 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgtatgagtct 27567704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21702359 - 21702300
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||    
T  21702359 ttgatgtgatttgattttgctgcaattgttatttaattaagttgcatgattatgaataag 21702300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 221
Target Start/End: Original strand, 16929647 - 16929701
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaga 221  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  16929647 tatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaaga 16929701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 221
Target Start/End: Original strand, 16965367 - 16965421
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaga 221  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  16965367 tatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaaga 16965421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Original strand, 19790673 - 19790802
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| |||||| |||    
T  19790673 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttg 19790772  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  19790773 aataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 19790802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 204
Target Start/End: Original strand, 22408345 - 22408398
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  22408345 gttgttgtgatctgattatactgcttttgttatttaaccaagttgcacgagtct 22408398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 25603425 - 25603478
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25603425 tgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 25611763 - 25611816
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25611763 tgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Original strand, 25642227 - 25642304
Alignment:
Q  149 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  25642227 ctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 25642304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24735619 - 24735397
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24735619 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcattacttgaattatt 24735520  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735519 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 24735420  T
Q  207 ataagataattaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  24735419 ataagataattaaagtgatgatg 24735397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 10101535 - 10101730
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10101535 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 10101634  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10101635 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 10101730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24649543 - 24649378
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24649543 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatga 24649444  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24649443 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 24649378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 12901432 - 12901597
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12901432 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatga 12901531  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12901532 attgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 12901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 27379353 - 27379518
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27379353 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 27379452  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27379453 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27379518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 27383399 - 27383564
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27383399 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 27383498  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27383499 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27383564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27601982 - 27601817
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27601982 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 27601883  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27601882 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 27601817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 24628399 - 24628564
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24628399 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 24628498  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24628499 attggtattaagctgttaatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 24628564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 19688646 - 19688779
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19688646 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 19688745  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19688746 attgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattg 19688779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 41530930 - 41531089
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    ||||||    
T  41530930 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagatgttg----aaatga 41531025  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  41531026 attgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 41531089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 22811805 - 22812028
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattga-tggcattacttggattattatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||| |  ||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||| || | |||||||    
T  22811805 cctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaaattgcattacctgaagtattatt 22811904  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |         ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22811905 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgag 22812003  T
Q  202 tctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||  | ||||| ||||||||||||    
T  22812004 tctatacaagatgattaagatgatg 22812028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 25963611 - 25963832
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  25963611 cctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 25963709  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25963710 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagttgcatgagt 25963808  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |   ||||||| | ||||||||||    
T  25963809 cattataagatgaataagatgatg 25963832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31345008 - 31344890
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  31345008 gcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaact 31344912  T
Q  190 aagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  31344911 aagttgcatgagtatgaataag 31344890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15477789 - 15477711
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatga 115  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15477789 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 25961429 - 25961628
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    |||||||||||||||| |||  |  ||||||  | ||||||| || |||||  || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||| ||||    
T  25961429 cctatttaagatgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttgttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttga 25961528  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25961529 atgatctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Original strand, 21916072 - 21916215
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |        || ||| ||||||||||||||| || | |||||    
T  21916072 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgtttttgtt 21916170  T
Q  182 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    | |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  21916171 atttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21916215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 22461106 - 22461277
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  22461106 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 22461204  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  22461205 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaa 22461277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 199
Target Start/End: Original strand, 19928487 - 19928583
Alignment:
Q  101 attattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 199  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19928487 attattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 19928583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41667078 - 41666962
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41667078 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 41666981  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  41666980 ttgcatgattatgaataag 41666962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Original strand, 21318590 - 21318731
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgat 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||         ||| |||| || ||||||    
T  21318590 tgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtagaaa-tgaattgataattatgaagttatgctgctgttgtgat 21318688  T
Q  162 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21318689 ctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtct 21318731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Original strand, 21327521 - 21327662
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgat 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||         ||| |||| || ||||||    
T  21327521 tgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtagaaa-tgaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgat 21327619  T
Q  162 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21327620 ctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtct 21327662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37524751 - 37524697
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37524751 tgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtct 37524697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 22799167 - 22799243
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  22799167 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 22799243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 24716569 - 24716645
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  24716569 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 24716645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24869950 - 24869902
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24869950 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtct 24869902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 30344970 - 30345076
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  30344970 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 30345063  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  30345064 aagttgcatgagt 30345076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 18855438 - 18855541
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  18855438 ttacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttgtttaactaag 18855534  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  18855535 ttgcatg 18855541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40428686 - 40428486
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| ||     
T  40428686 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattctta 40428587  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         | ||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  40428586 aataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgcttttgttattgaactaagttgcatgagt 40428487  T
Q  203 c 203  Q
    |    
T  40428486 c 40428486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24174876 - 24174822
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24174876 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 24174822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24673639 - 24673569
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  24673639 tgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcatgagtctgtacaagatgattaagatgatg 24673569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1283516 - 1283410
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | | ||    
T  1283516 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaatct 1283423  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  1283422 aagttgcatgagt 1283410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 23019747 - 23019823
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  23019747 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24673777 - 24673713
Alignment:
Q  36 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  24673777 ctgtgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttg 24673713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25616267 - 25616212
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25616267 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtc 25616212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Original strand, 24655379 - 24655433
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24655379 tgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 24655433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27263343 - 27263285
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  27263343 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 27263285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 60941 - 60829
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  60941 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgat-tgattatgctgcaattgttattaaactaagttg 60845  T
Q  196 catgagtctgaataag 211  Q
    ||||| | ||||||||    
T  60844 catgaatatgaataag 60829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 40622251 - 40622327
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  40622251 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24680258 - 24680191
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatg 223  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  24680258 tgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcttgagtctgtacaagatgattaagatg 24680191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 21918210 - 21918284
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgatt 85  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21918210 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgatt 21918284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Original strand, 22741004 - 22741081
Alignment:
Q  149 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  22741004 ctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22741081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 45678189 - 45678246
Alignment:
Q  169 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||    
T  45678189 tgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtccatacaagatgattaagatgatg 45678246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 36133852 - 36134074
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  36133852 tgagacctatttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgagttatt 36133951  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133952 attgaatgatcaggaagttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 36134051  T
Q  207 ataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  36134052 ataagataattaaaatgatgatg 36134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17810488 - 17810293
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17810488 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 17810389  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17810388 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 17810293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 14757312 - 14757507
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14757312 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 14757411  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14757412 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 14757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9556716 - 9556551
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9556716 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattagtattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 9556617  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9556616 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 9556551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27534242 - 27534047
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  27534242 tgagacctatctgagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttgttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaatcatt 27534143  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  27534142 attgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaactaagttgcatgagt 27534047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 4561254 - 4561419
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  4561254 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaataa 4561353  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4561354 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 4561419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 211
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634516
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 163  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 22634468  T
Q  164 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22634469 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgcgtctgaataag 22634516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 5756858 - 5757023
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5756858 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 5756957  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5756958 attggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatgagt 5757023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33742563 - 33742399
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  33742563 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatga 33742465  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33742464 attggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 33742399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 1951663 - 1951851
Alignment:
Q  19 aagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatc 117  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||  || | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1951663 aagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatc 1951762  T
Q  118 aagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaat 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1951763 aagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaat 1951851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 18222295 - 18222468
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18222295 aactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaa 18222394  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaat 208  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18222395 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaat 18222468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 16487972 - 16488194
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  16487972 cctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 16488071  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||        ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16488072 aatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 16488170  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||    
T  16488171 ctatacaagatgattaagatgatg 16488194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 17152377 - 17152576
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||    
T  17152377 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattat 17152476  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17152477 tattgaatgatcaaggaattgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctg 17152573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 18228770 - 18228943
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatgg-cattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  18228770 aactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttggaa 18228869  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaat 208  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18228870 atgaattgttatgaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaatttttatttaactaagttgcatgagtctgaat 18228943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 43256343 - 43256505
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  43256343 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 43256441  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43256442 aagct--tgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 43256505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 16356847 - 16357068
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-tagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||| ||||||||  ||  || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  16356847 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 16356945  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16356946 aatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 16357044  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |   ||||||| | ||||||||||    
T  16357045 cattataagatgaataagatgatg 16357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157579
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   || |     |||||    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttataccgttga 20157505  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||    
T  20157506 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18237067 - 18236904
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  18237067 ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgattaagaaattgttgagaatgatttgttatt 18236968  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    || |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18236967 aaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 18236904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813135
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |         |||||     
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaagttttaatgttgt 13813064  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  13813065 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 13813135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 26243642 - 26243746
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  26243642 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 26243739  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  26243740 ttgcatg 26243746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 16348559 - 16348780
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || | || |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||  | ||||||||    
T  16348559 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttaaaatattattg 16348657  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16348658 aattatcaagatgttgtggaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 16348756  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |   ||||||| | ||||||||||    
T  16348757 cattataagatgaataagatgatg 16348780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Original strand, 16243377 - 16243493
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  16243377 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 16243474  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  16243475 ttgcatgtgtatgaataag 16243493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3412919 - 3412811
Alignment:
Q  101 attattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3412919 attattgttgaatgatcaagaaattattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 3412822  T
Q  201 gtctgaataag 211  Q
    || ||||||||    
T  3412821 gtatgaataag 3412811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 43256051 - 43256120
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43256051 tgagacctatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 43256120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12570090 - 12570014
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12570090 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12570014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2014907 - 2014791
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  2014907 ttacttgaattattgtggaatgatcaagaaattgttgcgaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 2014810  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  2014809 ttgcatgtgtatgaataag 2014791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 19757578 - 19757682
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  19757578 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 19757675  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  19757676 ttgcatg 19757682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19782228 - 19782124
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  19782228 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 19782131  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  19782130 ttgcatg 19782124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23139459 - 23139296
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcat-tacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||   |||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| |    
T  23139459 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccatacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgaga 23139361  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 199  Q
    |||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  23139360 atgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 23139296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 211
Target Start/End: Original strand, 28569423 - 28569537
Alignment:
Q  95 acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 194  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28569423 acttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 28569520  T
Q  195 gcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||| | ||||||||    
T  28569521 gcatgattatgaataag 28569537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10712980 - 10712874
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  10712980 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 10712887  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  10712886 aagttgcatgagt 10712874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10926750 - 10926644
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  10926750 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 10926657  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  10926656 aagttgcatgagt 10926644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 204
Target Start/End: Original strand, 5338926 - 5339076
Alignment:
Q  62 tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgt 152  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||         ||| |||||    
T  5338926 tgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagattttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgctgt 5339024  T
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    || ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  5339025 tgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatgagtct 5339076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Original strand, 14708668 - 14708727
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14708668 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 14708727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12570246 - 12570158
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  12570246 cctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 12570158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 14954146 - 14954252
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  14954146 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 14954239  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  14954240 aagttgcatgagt 14954252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25689997 - 25689891
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  25689997 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 25689904  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  25689903 aagttgcatgagt 25689891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45938269 - 45938173
Alignment:
Q  100 gattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 199  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||    
T  45938269 gattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagatgcatg 45938173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15224866 - 15224807
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  15224866 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 15224807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25555550 - 25555503
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25555550 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 25555503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15093853 - 15093775
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||    
T  15093853 gctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatg 15093775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Original strand, 15353348 - 15353402
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15353348 tgttgctgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 15353402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Original strand, 18602766 - 18602824
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18602766 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataag 18602824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Original strand, 18609340 - 18609396
Alignment:
Q  155 atgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18609340 atgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataag 18609396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 11250608 - 11250655
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11250608 tgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Original strand, 42997484 - 42997543
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  42997484 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataag 42997543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9530542 - 9530460
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcat 198  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  9530542 tgatcaagaa-ttgttgagaatgatttattattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgtcatttaactaagttgcat 9530460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23843537 - 23843501
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23843537 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtc 23843501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 24782990 - 24783212
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  24782990 tgagacctacttaagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattaattgcattacttgaattatt 24783089  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24783090 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctga 24783189  T
Q  207 ataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  24783190 ataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 16080334 - 16080536
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16080334 tgagacctatttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 16080433  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16080434 attggatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaactaagttgcatgagtctga 16080533  T
Q  207 ata 209  Q
    |||    
T  16080534 ata 16080536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 36819198 - 36819403
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||    
T  36819198 tgagacctatttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattatattgtgatttatttattgattgcatttcttgaattatt 36819297  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819298 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 36819397  T
Q  206 aataag 211  Q
    ||||||    
T  36819398 aataag 36819403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1010939 - 1010744
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1010939 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 1010840  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1010839 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 1010744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 20228729 - 20228894
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20228729 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 20228828  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20228829 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagt 20228894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 16375378 - 16375543
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16375378 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16375477  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16375478 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 16375543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21407541 - 21407376
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21407541 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 21407442  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21407441 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 21407376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52639727 - 52639562
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52639727 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 52639628  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  52639627 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatgagt 52639562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19212056 - 19211883
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  19212056 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaga 19211957  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaat 208  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19211956 atgaattgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaat 19211883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 18182021 - 18182237
Alignment:
Q  18 taagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgat 116  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||| | ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  18182021 taagaagttaactgcaaactgtgaagctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgattcaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgat 18182120  T
Q  117 caagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaat 208  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| |        |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |     
T  18182121 caagatgttgttgaaa-taaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatac 18182219  T
Q  209 aagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  18182220 aagatgattaagatgatg 18182237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 23819189 - 23819383
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatgg-cattacttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||    
T  23819189 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtctttacttgaattat 23819288  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  23819289 tattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacgaagttgcatgagt 23819383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 22449166 - 22449382
Alignment:
Q  18 taagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgat 116  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  22449166 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgaaatattattgaatgat 22449265  T
Q  117 caagaagttgttgaaaa----tga-at--tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 209  Q
    ||||| |||||||||||    ||| ||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  | |    
T  22449266 caagatgttgttgaaaagtattgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctgctactattatttaactaagttgcatgagtctataca 22449365  T
Q  210 agataattaagatgatg 226  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22449366 agatgattaagatgatg 22449382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33797457 - 33797295
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  33797457 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattaatcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 33797359  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33797358 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 33797295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21313185 - 21313122
Alignment:
Q  166 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21313185 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 21313122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Original strand, 3472843 - 3473039
Alignment:
Q  36 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||  | ||||||||| ||||| |  | |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||  |    
T  3472843 ctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaattacttgaaatattgttgaatgatcaagatgttgttgaag-t 3472941  T
Q  135 gaattgatattaagctgttgat------gtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    || ||||||||| |  ||| ||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||    
T  3472942 gatttgatattatgaagttaatactcttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagttgatg 3473039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20138209 - 20138099
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20138209 cttgaattattgttgaatgttcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 20138112  T
Q  196 catgagtctgaat 208  Q
    |||||||||||||    
T  20138111 catgagtctgaat 20138099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18882496 - 18882393
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  18882496 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgataatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaag 18882399  T
Q  193 ttgcat 198  Q
    ||||||    
T  18882398 ttgcat 18882393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12647059 - 12646888
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  12647059 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 12646961  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||    
T  12646960 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgaatctgaa 12646888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33797749 - 33797680
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33797749 tgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 33797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 8761527 - 8761728
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |  |||| | |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||    
T  8761527 cctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattg 8761626  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||         ||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8761627 aataatcaagatgttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatgag 8761725  T
Q  202 tct 204  Q
    |||    
T  8761726 tct 8761728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Original strand, 17678560 - 17678702
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 182  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17678560 gcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgtta 17678658  T
Q  183 attaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
     ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  17678659 tttaaccaagttgcatgagtcgttataagatgaataagatgatg 17678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46975596 - 46975494
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  46975596 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 46975499  T
Q  193 ttgca 197  Q
    |||||    
T  46975498 ttgca 46975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 1925108 - 1925214
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  1925108 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 1925201  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  1925202 aagttgcatgagt 1925214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 20924122 - 20924228
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  20924122 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 20924215  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  20924216 aagttgcatgagt 20924228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Original strand, 3705105 - 3705159
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3705105 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 3705159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Original strand, 21788081 - 21788159
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21788081 gctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21788159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 45310259 - 45310462
Alignment:
Q  10 ggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| |    
T  45310259 ggcctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattgcttgatttattct 45310358  T
Q  109 tgaatgatcaagaagttgttgaaaatg-aattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 199  Q
    ||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |        ||||   || || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  45310359 tgaataaccttgaagttgttgaaaatgaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgtcgttatttaactaagttgcatg 45310458  T
Q  200 agtc 203  Q
    ||||    
T  45310459 agtc 45310462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Original strand, 39244120 - 39244235
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  ||||||| |  |||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39244120 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaagtt--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 39244213  T
Q  190 aagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  39244214 aagttgcaagaatatgaataag 39244235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Original strand, 39247675 - 39247790
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  ||||||| |  |||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39247675 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaagtt--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 39247768  T
Q  190 aagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  39247769 aagttgcaagaatatgaataag 39247790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Original strand, 41388220 - 41388335
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  |||||||||  ||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41388220 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaatttttattaagct--tgatacgaattgattatgctgcaattgttatttaact 41388313  T
Q  190 aagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  41388314 aagttgcaagaatatgaataag 41388335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 18393858 - 18394059
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  18393858 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 18393957  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaat-gaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    ||| | |  |||||||||||||||  ||||| |        ||||   || || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  18393958 aataaccttgaagttgttgaaaataaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgag 18394057  T
Q  202 tc 203  Q
    ||    
T  18394058 tc 18394059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21022863 - 21022775
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  21022863 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtgaattaatgattaattgcattacttg 21022775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 202
Target Start/End: Original strand, 33050067 - 33050118
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  33050067 gttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 33050118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 211
Target Start/End: Original strand, 20229208 - 20229323
Alignment:
Q  94 tacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 193  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  | ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  20229208 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaacttttgagaatgatttgttatttaact--taatgtgatttgattatgctggaattgttatttaactaagt 20229305  T
Q  194 tgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  20229306 tgcaagagtatgaataag 20229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21022701 - 21022631
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  21022701 tgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21022631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6151905 - 6151848
Alignment:
Q  169 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  6151905 tgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 6151848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Original strand, 22468735 - 22468816
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| |||||    
T  22468735 gctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 22831446 - 22831503
Alignment:
Q  169 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  22831446 tgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20135267 - 20135188
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| |||||    
T  20135267 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 45489790 - 45489837
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||    
T  45489790 tgtgatctgattatgctgctgctattatttaactaagttgcatgagtc 45489837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 20229075 - 20229161
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20229075 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 20229161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 42865105 - 42865194
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| | |||   |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  42865105 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 42865194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13120 - 12916
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13120 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 13021  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13020 attgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 12921  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  12920 ataag 12916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19397 - 19200
Alignment:
Q  14 tatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaat 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  19397 tatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaat 19298  T
Q  114 gatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19297 gatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 19200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 62386 - 62273
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  62386 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 62289  T
Q  196 catgagtctgaataag 211  Q
    ||||| | ||||||||    
T  62288 catgattatgaataag 62273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 3765 - 3960
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3765 tgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 3864  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3865 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17410601 - 17410434
Alignment:
Q  62 tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgat 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17410601 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgat 17410502  T
Q  162 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17410501 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 17410434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 15236670 - 15236865
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15236670 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattatt 15236769  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15236770 cttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 15236865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 23535479 - 23535681
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  23535479 tgagacctgtttaagatattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagtgattatac-gtgatttattgatagattgcattactttaattatt 23535577  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23535578 attgaatgatcaagaaattgttgaaa-tgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctga 23535676  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  23535677 ataag 23535681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20296033 - 20295868
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20296033 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 20295934  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20295933 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 20295868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 19472640 - 19472805
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19472640 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttaaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 19472739  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19472740 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 19472805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 21366560 - 21366781
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  21366560 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 21366659  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21366660 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21366758  T
Q  204 tgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |  | ||||| ||||||||||||    
T  21366759 tatacaagatgattaagatgatg 21366781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42805638 - 42805436
Alignment:
Q  5 attgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggatt 103  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| |||||||   ||| ||||| |||    
T  42805638 attgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattttatttacttgaatt 42805539  T
Q  104 attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42805538 attattaaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaaccaagttgcatgagtc 42805441  T
Q  204 tgaat 208  Q
    |||||    
T  42805440 tgaat 42805436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 20911101 - 20911263
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  20911101 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 20911199  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20911200 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 20911263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18774420 - 18774219
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat-ttattgattgatggcatt-acttggatta 104  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||| || | |||||||||   ||||  |||| ||||||| | ||| ||||| ||||    
T  18774420 tgagacctattaaagatattacctgagaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattgattgtatttacttgaatta 18774321  T
Q  105 ttattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  18774320 ttgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtct 18774223  T
Q  205 gaat 208  Q
    ||||    
T  18774222 gaat 18774219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 26742634 - 26742835
Alignment:
Q  5 attgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggatt 103  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| | ||||| | ||| ||| | |||    
T  26742634 attgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatggtttgattgtatttactcgaatt 26742733  T
Q  104 attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26742734 attattgaatgatcaaggaattgttgagaatgagttgttattaagcc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtc 26742831  T
Q  204 tgaa 207  Q
    ||||    
T  26742832 tgaa 26742835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767665
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     || ||||    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactattga 24767591  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  24767592 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatg 24767665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18356132 - 18355970
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  18356132 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 18356034  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    || ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18356033 aaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 18355970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18784175 - 18784062
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |    
T  18784175 ttacttgaattattgttgaatgataaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatg 18784078  T
Q  193 ttgcatgagtctgaat 208  Q
    ||||||||||||||||    
T  18784077 ttgcatgagtctgaat 18784062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20232761 - 20232568
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| || || ||||| |||||| |||    
T  20232761 cctatttaagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcctttacttgaattattgttg 20232662  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    | ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  20232661 attgatcaataa-ttgttgagaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcataagtctgaa 20232568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 24532965 - 24533136
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  24532965 aactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 24533063  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  24533064 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaa 24533136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 26666048 - 26666219
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  26666048 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 26666146  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  26666147 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaa 26666219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 26937645 - 26937816
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  26937645 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 26937743  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  26937744 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaa 26937816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20805772 - 20805552
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-tagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||| |||||||| |||  || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | | ||||||    
T  20805772 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatgttattg 20805674  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |         ||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20805673 aatgatctagatgttgttgaa--tgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 20805576  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |   ||||||| | ||||||||||    
T  20805575 cattataagatgaataagatgatg 20805552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18356543 - 18356474
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18356543 tgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 18356474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 202
Target Start/End: Original strand, 40723607 - 40723672
Alignment:
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40723607 attgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 40723672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16674281 - 16674177
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  16674281 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 16674184  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  16674183 ttgcatg 16674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Original strand, 21340764 - 21340855
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21340764 tgatcaagaa-ttgtttagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctgaa 21340855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Original strand, 21885166 - 21885282
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21885166 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 21885263  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  21885264 ttgcatgattatgaataag 21885282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33409357 - 33409253
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  33409357 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 33409260  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  33409259 ttgcatg 33409253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23451573 - 23451371
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||| |||||||| | || ||  ||||||||  |||| |  |||||||||| | |||    
T  23451573 tgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatat 23451475  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  23451474 tattgaatgattatgatgttgttgaaaa-gaattgatgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcat 23451376  T
Q  199 gagtc 203  Q
    |||||    
T  23451375 gagtc 23451371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 20910690 - 20910759
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20910690 tgagacctatttaagatgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaagtgattataatgtgat 20910759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 1859017 - 1859093
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  1859017 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 1859093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10753491 - 10753385
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  10753491 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 10753398  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  10753397 aagttgcatgagt 10753385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26680652 - 26680604
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680652 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtct 26680604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26952259 - 26952211
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26952259 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtct 26952211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 221
Target Start/End: Original strand, 123346 - 123417
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaga 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  123346 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagataaataaga 123417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 17718416 - 17718520
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||| | |   ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||||    
T  17718416 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatctgttattgaac--atgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaactaag 17718513  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  17718514 ttgcatg 17718520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20767135 - 20766974
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatc 162  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |         ||||| ||||||     
T  20767135 tgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatgttattgaatgatctagatgttgttgaa--tgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgatt 20767038  T
Q  163 tgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20766974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22757348 - 22757219
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||| |||||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  22757348 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattattg 22757249  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  22757248 aataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 22757219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23458817 - 23458592
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||| |||||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| | |||    
T  23458817 tgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatat 23458719  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  23458718 tattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcat 23458620  T
Q  199 gagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||   ||||||| | ||||||||||    
T  23458619 gagtcattataagatgaataagatgatg 23458592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23463078 - 23462853
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||| |||||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| | |||    
T  23463078 tgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatat 23462980  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  23462979 tattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcat 23462881  T
Q  199 gagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||   ||||||| | ||||||||||    
T  23462880 gagtcattataagatgaataagatgatg 23462853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 17517240 - 17517320
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 228  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  17517240 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23572160 - 23572084
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  23572160 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatg 23572084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31342217 - 31342169
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31342217 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 31342169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10753015 - 10752956
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10753015 ttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataag 10752956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 12028612 - 12028659
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12028612 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 12028659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 17919198 - 17919245
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17919198 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 17919245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4036290 - 4036232
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  4036290 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 4036232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24221953 - 24221899
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24221953 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaggttgcatgagtct 24221899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Original strand, 25229441 - 25229499
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  25229441 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 25229499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Original strand, 25293597 - 25293655
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  25293597 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 25293655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23512174 - 23512098
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  23512174 tgttgatgcgatctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 23512098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26172536 - 26172488
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  26172536 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgaatga 26172488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21873313 - 21873254
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21873313 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21873254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10753204 - 10753111
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10753204 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 10753111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23201436 - 23201383
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23201436 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 23201383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 23501415 - 23501472
Alignment:
Q  169 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  23501415 tgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14079208 - 14079149
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga-ataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  14079208 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaat-tgatataagatgattaagatgatg 14079149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Original strand, 18549 - 18726
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaa 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  18549 aactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatttttgaatgatcaagaaattattgaaaa 18648  T
Q  134 tgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18649 tgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaagttgcatgagtctgaataag 18726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 65448 - 65613
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65448 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 65547  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  65548 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 65613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 61532 - 61697
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  61532 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 61631  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  61632 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 61697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 80928 - 80736
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  80928 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattatt 80829  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  80828 attgaatgatcaggaagatgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 80736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12839 - 12763
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12839 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 80366 - 80307
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  80366 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataag 80307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 80530 - 80462
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  80530 tgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 2563 - 2766
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||    
T  2563 tgagacctatttaagatattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagtgattatattgtgatatattgattgattggattacttgaattgtt 2662  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2663 attgaatgatcaagaaattgttgaaa-tgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaagttgcatgagtctga 2761  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  2762 ataag 2766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Original strand, 13377 - 13568
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  13377 tgagacctatttaagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattatt 13476  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13477 attgaatgatcaagaagttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattattctgttattgttaattaactgagttgcat 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 173501 - 173304
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  173501 cctattaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagtgattatattgtgatatattgattgattgcattacttgaattattattga 173402  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  173401 atgataaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataag 173304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Original strand, 422505 - 422648
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  422505 gcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctgtt 422603  T
Q  182 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    | |||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||    
T  422604 atttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatgatg 422648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12638 - 12443
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12638 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 12539  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12538 attaaatgattgggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 228263 - 228466
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  228263 tgagacctacttaagatattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaagtgattatatagtgatttattgattgattgcatttacttgaattat 228362  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  228363 tattgaatgatcaagaaatagttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctg 228460  T
Q  206 aataag 211  Q
    ||||||    
T  228461 aataag 228466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 5021 - 5186
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5021 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 5120  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5121 attgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43251999 - 43251834
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  43251999 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatga 43251900  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43251899 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 43251834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 19278203 - 19278368
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19278203 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 19278302  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19278303 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 19278368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 21972505 - 21972670
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21972505 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 21972604  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21972605 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 21972670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 21976590 - 21976755
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21976590 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 21976689  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21976690 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 21976755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 16231365 - 16231565
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16231365 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattat 16231464  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16231465 tattgaatgatcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctg 16231562  T
Q  206 aat 208  Q
    |||    
T  16231563 aat 16231565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22112037 - 22111904
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22112037 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 22111938  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 170  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22111937 attggtattaagctgttgatataatctgattatg 22111904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22045100 - 22044900
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22045100 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattat 22045001  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  22045000 tatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatcaaactaagttgcatgagtctg 22044903  T
Q  206 aat 208  Q
    |||    
T  22044902 aat 22044900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 20465933 - 20466157
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  20465933 cctatataagaggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 20466032  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20466033 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagt 20466131  T
Q  203 c--tgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |  |  ||||||| ||||||||||||    
T  20466132 ctatatataagatgattaagatgatg 20466157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 30643185 - 30643408
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaa-gctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| ||| || ||||| ||||||| | ||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||    
T  30643185 cctatttaagatgttaactgcaatctgtgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 30643284  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30643285 gaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgag 30643383  T
Q  202 tctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||    ||||| ||||||||||||    
T  30643384 tctattcaagatgattaagatgatg 30643408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 15602911 - 15603111
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||| ||||||||  | | || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||    
T  15602911 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 15603009  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15603010 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgag 15603108  T
Q  202 tct 204  Q
    |||    
T  15603109 tct 15603111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 14398039 - 14398201
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  14398039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttgaaa-tgaattgttatt 14398137  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||| |  ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14398138 aagcttt--atgcgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 14398201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 17926601 - 17926822
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  17926601 cctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 17926699  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17926700 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagt 17926798  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |   ||||||| | ||||||||||    
T  17926799 cattataagatgaataagatgatg 17926822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21387184 - 21387086
Alignment:
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 209  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21387184 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaata 21387088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 15611363 - 15611563
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||| | ||||||  | | || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||    
T  15611363 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactactaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 15611461  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15611462 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctggttttgttatttaaccaagttgcatgag 15611560  T
Q  202 tct 204  Q
    |||    
T  15611561 tct 15611563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18619694 - 18619555
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatgg-cattacttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||    
T  18619694 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtctttacttgaattat 18619595  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  18619594 tattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattganatt 18619555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21383768 - 21383666
Alignment:
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21383768 tattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatg 21383672  T
Q  206 aataag 211  Q
    ||||||    
T  21383671 aataag 21383666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23834389 - 23834188
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtga-tttattgattgatggcatt-acttggatta 104  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  ||||||||| || ||||||| || |||||||||||   |||| ||||| || |||| | ||| ||||| ||||    
T  23834389 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaatcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaatttatggactgattgtatttacttgaatta 23834290  T
Q  105 ttattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    || |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| ||| |||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  23834289 ttgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgactatgatgcaattgttattaaactatgttgcatgagtct 23834192  T
Q  205 gaat 208  Q
    ||||    
T  23834191 gaat 23834188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22028746 - 22028647
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22028746 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 30308644 - 30308846
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  30308644 tgagacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtattacttgaattatt 30308743  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 206  Q
     ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||     ||||| ||| |||||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||    
T  30308744 gttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaa--atctgatgggatttgattatgttgcaattgttattaaactaatttgcatgagtatga 30308841  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  30308842 ataag 30308846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15532018 - 15531914
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  15532018 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 15531921  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  15531920 ttgcatg 15531914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 203
Target Start/End: Original strand, 16410208 - 16410347
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatc 162  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |        |||||| |||||||    
T  16410208 tgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatc 16410306  T
Q  163 tgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16410307 tgcctatgctgctattgttatttcactaagttgcatgagtc 16410347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 17828567 - 17828663
Alignment:
Q  100 gattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 199  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17828567 gattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaactaagttgcatg 17828663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24755790 - 24755714
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  24755790 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 24755714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15538577 - 15538473
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  15538577 ttacttgagttattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 15538480  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  15538479 ttgcatg 15538473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 20856319 - 20856518
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||  | ||||||| || ||||||| ||||||| || || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||| |||    
T  20856319 cctattaaagatgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttg 20856418  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| | | ||| |||||||||||||||||| | ||| |         | ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20856419 aataacctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagt 20856517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 23846992 - 23847096
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 191  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||   |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  23846992 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaatctgt---tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaa 23847088  T
Q  192 gttgcatg 199  Q
    ||||||||    
T  23847089 gttgcatg 23847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 18678141 - 18678221
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 228  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  18678141 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 18862624 - 18862730
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  18862624 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 18862717  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  18862718 aagttgcatgagt 18862730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 21827993 - 21828099
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  21827993 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 21828086  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  21828087 aagttgcatgagt 21828099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32121814 - 32121759
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32121814 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 32121759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32605339 - 32605223
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  32605339 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaag 32605242  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  32605241 ttgcatgattatgaataag 32605223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 226
Target Start/End: Original strand, 23776821 - 23776952
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 194  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||        ||| || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23776821 tattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagtt 23776920  T
Q  195 gcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  23776921 gcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 23776952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 204
Target Start/End: Original strand, 22010716 - 22010769
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22010716 gttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtct 22010769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 39094965 - 39095018
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39094965 tgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 39095018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 377347 - 377271
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||    
T  377347 tgttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtatatacaagatgattaagatgatg 377271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 377503 - 377415
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  377503 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 377415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 16861365 - 16861441
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  16861365 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccgagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16861441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Original strand, 17055412 - 17055472
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17055412 gttgatgttatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 17055472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21411077 - 21410971
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  21411077 gcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 21410984  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  21410983 aagttgcatgagt 21410971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21805569 - 21805463
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  21805569 gcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 21805476  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  21805475 aagttgcatgagt 21805463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24755946 - 24755858
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  24755946 cctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 24755858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23648633 - 23648554
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| |||||    
T  23648633 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32598750 - 32598691
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32598750 ttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 32598691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 19259483 - 19259564
Alignment:
Q  19 aagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  19259483 aagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttg 19259564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16184796 - 16184720
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  16184796 tgttgttgtgatatgcttatgctgctattgttgtttaaccaacttgcatgattctatataagatgattaagatgatg 16184720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 17353984 - 17354060
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  17353984 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 21162099 - 21162175
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21162099 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21162175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 21168772 - 21168848
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21168772 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21168848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 19259632 - 19259685
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19259632 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagtc 19259685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 58639 - 58804
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  58639 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 58738  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  58739 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 58804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 35863 - 36027
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  35863 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttg-aaatta 35961  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35962 attgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 36027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7155 - 6957
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||   |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| |||    
T  7155 cctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttg 7056  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataa 210  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||    
T  7055 aatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagcatgaataa 6958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 19907 - 20110
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19907 tgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatttacttgaattat 20006  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20007 tattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgaatctg 20104  T
Q  206 aataag 211  Q
    ||||||    
T  20105 aataag 20110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 9555 - 9759
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattat 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  9555 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcatttacttgaattat 9654  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9655 tattgaatgatcaagaaattgttattaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattacgctgcaattgttaattaactatgttgcatgagtct 9752  T
Q  205 gaataag 211  Q
     ||||||    
T  9753 aaataag 9759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4657 - 4430
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| | |||    
T  4657 tgagacctatataagaagttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatttattgattaattgcattacttgaaatat 4558  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgca 197  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4557 tatcgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgca 4459  T
Q  198 tgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  4458 tgagtctatacaagatgattaagatgatg 4430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 578 - 471
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  578 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgctattgttatttaact 485  T
Q  190 -aagttgcatgagt 202  Q
     |||||||||||||    
T  484 aaagttgcatgagt 471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 159
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||| ||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||| | || |||||||||| | ||||||||    
T  382 cctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgactaattgcattacttgaaatattattg 283  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  282 aatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 183  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||    
T  182 ctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 3447 - 3620
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3447 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatggattgattgcatttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttgaaa 3546  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaat 208  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3547 atgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatactgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaat 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6425
Alignment:
Q  13 ctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    ||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||| || |||||||||| | |||||||||    
T  6204 ctatttaggatgttaaatgcaatctgtgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaatattattga 6303  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6304 atgatcaagaagttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 6402  T
Q  204 tgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |  | ||||| ||||||||||||    
T  6403 tatacaagatgattaagatgatg 6425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 18277 - 18450
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18277 aactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaa 18376  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaat 208  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18377 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaat 18450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 10474 - 10589
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10474 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 10573  T
Q  107 attgaatgatcaagaa 122  Q
    ||||||||||||||||    
T  10574 attgaatgatcaagaa 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 69871 - 69794
Alignment:
Q  149 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  69871 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 615 - 393
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  615 cctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 516  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  515 aatgatcaagatgtcgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 417  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||    
T  416 ctatacaagatgattaagatgatg 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42844 - 42627
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| ||||| || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  42844 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 42745  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||||||||| ||||    |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42744 aatgatcaagatgttg----aaatgaattgatattatgaagttaatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 42649  T
Q  205 gaataagataattaagatgatg 226  Q
      | ||||| ||||||||||||    
T  42648 atacaagatgattaagatgatg 42627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1715 - 1494
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  1715 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 1616  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1615 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 1517  T
Q  204 tgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |  | ||||| ||||||||||||    
T  1516 tatacaagatgattaagatgatg 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17228
Alignment:
Q  62 tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgtt 153  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |        |||||    
T  17056 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaagatgttgttggaaatgaattgatattatgaagttatgctgtt 17155  T
Q  154 gatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  17156 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagtctatacaagatgattaagatgatg 17228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5608
Alignment:
Q  17 ttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatga 115  Q
    |||||||||||||||  | || ||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| | ||| | || ||||||||||   |||||||||||||    
T  5803 ttaagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatga 5704  T
Q  116 tcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5703 tcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtct 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6998 - 6803
Alignment:
Q  17 ttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatga 115  Q
    |||||||||||||||  | || ||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| | ||| | || ||||||||||   |||||||||||||    
T  6998 ttaagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatga 6899  T
Q  116 tcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6898 tcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtct 6803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15302 - 15087
Alignment:
Q  18 taagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgat 116  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  15302 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgat 15203  T
Q  117 caagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 209  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||       || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  | |    
T  15202 caagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgtgttgtgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagtgtataca 15104  T
Q  210 agataattaagatgatg 226  Q
    |||| ||||||||||||    
T  15103 agatgattaagatgatg 15087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 24858 - 25059
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24858 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattat 24957  T
Q  106 tattgaatgatcaa-gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    |||||||||||||| | | || |||||||||  ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  24958 tattgaatgatcaaaggaattattgaaaatgtgttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactgagttgcatgagtct 25055  T
Q  205 gaat 208  Q
    ||||    
T  25056 gaat 25059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 189356 - 189462
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  189356 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 189449  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  189450 aagttgcatgagt 189462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 46621 - 46820
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  46621 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 46720  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||        ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  46721 aatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagt 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 18545 - 18774
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||| | |||    
T  18545 tgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatat 18644  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgca 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18645 tattgaatgatcaagatgttgttg-aaacgaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgca 18743  T
Q  198 tgagtc--tgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||||  |  ||||||| ||||||||||||    
T  18744 tgagtctatatataagatgattaagatgatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9733 - 9513
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  9733 cctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 9635  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9634 aatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgagttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttgcatgagtc 9536  T
Q  204 tgaataagataattaagatgatg 226  Q
       ||||||| | ||||||||||    
T  9535 attataagatgaataagatgatg 9513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2051 - 1830
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  2051 cctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 1953  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1952 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagt 1854  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |   ||||||| | ||||||||||    
T  1853 cattataagatgaataagatgatg 1830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10162
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     || ||||    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactattga 10088  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  10089 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatg 10162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6693
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  6855 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 6757  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6756 aagct--tgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 6693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31059 - 30897
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  31059 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 30961  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30960 aagct--tgatgagatttgattatgctgtaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 30897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 118 - 1
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  118 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaga 19  T
Q  133 atgaattgatattaagct 150  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18 atgaattgttattaagct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Original strand, 73725 - 73883
Alignment:
Q  74 gatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgat 166  Q
    |||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |        ||||| |||||||||||    
T  73725 gatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgat 73823  T
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 73883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 1384 - 1584
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||| |||  || | || |||||||||| | ||||||||    
T  1384 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataattgcattacttgaaatattattg 1483  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  1484 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggttatttaactaagttgcatgagt 1582  T
Q  203 ct 204  Q
    ||    
T  1583 ct 1584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 123
Target Start/End: Original strand, 928 - 1014
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaag 123  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  928 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2913
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||   || |     |||||    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatt-aattgatattataaagttatattgttga 2976  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataatta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  2975 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataagtctatataagattatta 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 21463 - 21597
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| | ||||||||    
T  21463 cctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgtattacttgaaatattattg 21562  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 146  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21563 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Original strand, 80810 - 80869
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  80810 ttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataag 80869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23432 - 23232
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||    
T  23432 tgagacctattcaagatattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattat 23333  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 205  Q
    | |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  23332 tgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattaagctgcaattattattaaactatgtttcatgagtctg 23235  T
Q  206 aat 208  Q
    |||    
T  23234 aat 23232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1118 - 897
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||  |||||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  1118 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattg 1020  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1019 aatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagttgcatgagt 921  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |   ||||||| | ||||||||||    
T  920 cattataagatgaataagatgatg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 20395 - 20557
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||  | | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  20395 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacacgaaatattattgaataatcaagatgttgatgaaa-tgaattgttatt 20493  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20494 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataag 20557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44302 - 44081
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || | || |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||  | ||||||||    
T  44302 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttaaaatattattg 44204  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44203 aattatcaagatgttgtggaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 44105  T
Q  203 ctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |   ||||||| | ||||||||||    
T  44104 cattataagatgaataagatgatg 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Original strand, 6152 - 6350
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||   |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| |||    
T  6152 cctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttg 6251  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataa 210  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||    
T  6252 aatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagcatgaataa 6349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 207768 - 207942
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatat 144  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  207768 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatat 207867  T
Q  145 taag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    || |        |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  207868 tatgaagttatactgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataag 207942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 1978 - 2178
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattatt 109  Q
    |||||||||||| |||||||  |  ||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||| ||||| ||||| |  |||||||||| | | | |||    
T  1978 cctatttaagatattaactgaaatatgtgaagctgttatgaaaatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttgaaatttcatt 2077  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |         ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2078 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tggattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgag 2176  T
Q  202 tc 203  Q
    ||    
T  2177 tc 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 365 - 289
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  365 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10032 - 9916
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  10032 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 9935  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  9934 ttgcatgtgtatgaataag 9916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18483 - 18367
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  18483 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgtttatgctgcaaatgttatttaactaag 18386  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  18385 ttgcatgtgtatgaataag 18367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 63982 - 63878
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  63982 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 63885  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  63884 ttgcatg 63878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 34960 - 35036
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  34960 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataaaatgattaagatgatg 35036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 75866 - 75762
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  75866 ttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaag 75769  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  75768 ttgcatg 75762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 34804 - 34892
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  34804 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 34892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 226
Target Start/End: Original strand, 4790 - 4921
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 194  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||        |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4790 tattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagtt 4889  T
Q  195 gcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  4890 gcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 226
Target Start/End: Original strand, 38465 - 38596
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 194  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||         ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38465 tattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagtt 38564  T
Q  195 gcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  38565 gcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Original strand, 19181 - 19317
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |  |||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||   |||    
T  19181 tgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatat 19280  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata 143  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19281 tattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 19317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 71529 - 71460
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  71529 tgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 71460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 71180 - 71083
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||       |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  71180 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct-------tgat-tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 71090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 414091 - 414167
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  | | ||| ||||||||||||    
T  414091 tgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgcgtctatacatgatgattaagatgatg 414167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 139819 - 139736
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 199  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  139819 tgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttgttaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 139736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 14127 - 14203
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  14127 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 13971 - 14059
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  13971 cctatataggatgttaactgaaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttg 14059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7614 - 7471
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  7614 gcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgctgctgctgtt 7516  T
Q  182 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    | |||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||    
T  7515 atttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatgatg 7471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6508
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||| || |||| |||||| | | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||    
T  6310 cctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattg 6408  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6409 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 6507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6093
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  5977 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaag 6074  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  6075 ttgcatgagtatgaataag 6093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Original strand, 77148 - 77264
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  77148 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 77245  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  77246 ttgcatgattatgaataag 77264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18295 - 18236
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  18295 tatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 19626 - 19826
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||  | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| |||    
T  19626 cctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactgggtttattcttg 19725  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19726 aataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 19825  T
Q  203 c 203  Q
    |    
T  19826 c 19826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 15104 - 15304
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||  | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| |||    
T  15104 cctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactgggtttattcttg 15203  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15204 aataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 15303  T
Q  203 c 203  Q
    |    
T  15304 c 15304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Original strand, 193034 - 193070
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193034 tatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6171 - 6095
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  6171 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 11480 - 11586
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  11480 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 11573  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  11574 aagttgcatgagt 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 14066 - 14172
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  14066 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 14159  T
Q  190 aagttgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||    
T  14160 aagttgcatgagt 14172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9406 - 9347
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9406 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 9347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 35405 - 35605
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |  |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  35405 cctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 35504  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  35505 aataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 35604  T
Q  203 c 203  Q
    |    
T  35605 c 35605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2907 - 2832
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  2907 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 2832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6573 - 6498
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  6573 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 6498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1889
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  2005 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatttaactaag 1908  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  1907 ttgcatgattatgaataag 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 30634 - 30859
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||| ||| | || |||| | |||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||    
T  30634 tgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatat 30732  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| | ||| |        ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  30733 tattgaatgataaagatgtagttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatccgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcat 30831  T
Q  199 gagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||   ||||||| | ||||||||||    
T  30832 gagtcattataagatgaataagatgatg 30859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 6972 - 7060
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||    
T  6972 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgagatttaatgattaattgcattacttg 7060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 7128 - 7204
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  7128 tgttgttgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 7204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 21844 - 21920
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  21844 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 29736 - 29812
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  29736 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8512
Alignment:
Q  108 ttgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  8613 ttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaa 8516  T
Q  208 taag 211  Q
    ||||    
T  8515 taag 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15757 - 15656
Alignment:
Q  108 ttgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 207  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  15757 ttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaa 15660  T
Q  208 taag 211  Q
    ||||    
T  15659 taag 15656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32491 - 32459
Alignment:
Q  170 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32491 gctgctattgttaattaactatgttgcatgagt 32459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14740 - 14664
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  14740 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23755 - 23679
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  23755 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39179 - 39103
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  39179 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8783 - 8583
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| |||||| |||    
T  8783 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttg 8684  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 202  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  8683 aataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 8584  T
Q  203 c 203  Q
    |    
T  8583 c 8583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 15350
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  15409 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcataattatgaataag 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9549 - 9445
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || | |||| | ||||| |||| | ||||| |||||||||    
T  9549 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttatgatttaattatactgcaaatgttatttaactaag 9452  T
Q  193 ttgcatg 199  Q
    |||||||    
T  9451 ttgcatg 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 15317 - 15376
Alignment:
Q  17 ttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15317 ttaaaatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgataagtgattataatgtgat 15376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Original strand, 16640 - 16756
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16640 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 16737  T
Q  193 ttgcatgagtctgaataag 211  Q
    | |||||| | ||||||||    
T  16738 tcgcatgattatgaataag 16756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 381
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||    
T  439 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaattaagttgcatgattatgaataag 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Original strand, 2477 - 2531
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2477 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagtct 2531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Original strand, 10337 - 10391
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10337 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagtct 10391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 7311 - 7364
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7311 tgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 16389 - 16442
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16389 tgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1868 - 1817
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 201  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  1868 tgttgttgtggtctgattatgctgcctttgttatttaactaagttgcatgag 1817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 524 - 439
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  524 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgtt 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2238 - 2191
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2238 tgtgatttgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 2191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 15737 - 15796
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  15737 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 15796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 4273 - 4320
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 203  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4273 tgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Original strand, 4119 - 4245
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  4119 cctatttaagatgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 4218  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaa 137  Q
    ||| | |  ||||||||||||||||||    
T  4219 aataaccttgaagttgttgaaaatgaa 4245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36414 - 36331
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 199  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  36414 tgatcaagaa-ttgttaagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaattaagttgcatg 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Original strand, 192211 - 192340
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||| |  |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  192211 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 192310  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  192311 aattaccttgatgttgttgaaaatgaattg 192340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 280950 - 281007
Alignment:
Q  169 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  280950 tgctgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 281007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1881
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  1957 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26904 - 26828
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   ||||||| ||||| ||||||    
T  26904 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatg 26828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 9004 - 9080
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 226  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  9004 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University