View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16951_low_6 (Length: 403)

Name: NF16951_low_6
Description: NF16951
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16951_low_6
NF16951_low_6
[»] chr1 (96 HSPs)
chr1 (5-376)||(22449285-22449656)
chr1 (4-376)||(18182139-18182508)
chr1 (31-376)||(3472968-3473313)
chr1 (26-376)||(6151573-6151924)
chr1 (48-376)||(22831449-22831774)
chr1 (26-360)||(17678626-17678960)
chr1 (29-385)||(20091520-20091873)
chr1 (4-362)||(21788061-21788422)
chr1 (25-385)||(42865253-42865614)
chr1 (1-356)||(8761648-8761999)
chr1 (25-385)||(21714264-21714623)
chr1 (28-244)||(21022488-21022705)
chr1 (4-385)||(22468715-22469102)
chr1 (130-342)||(48603026-48603239)
chr1 (1-220)||(3705080-3705302)
chr1 (130-342)||(22131229-22131441)
chr1 (1-220)||(45489759-45489977)
chr1 (19-183)||(24783126-24783290)
chr1 (5-212)||(33050045-33050242)
chr1 (12-220)||(45310395-45310602)
chr1 (12-220)||(18393992-18394199)
chr1 (284-376)||(21022305-21022396)
chr1 (161-367)||(34509516-34509726)
chr1 (42-183)||(21313044-21313185)
chr1 (265-342)||(41781782-41781859)
chr1 (196-342)||(38801598-38801750)
chr1 (244-368)||(20248008-20248134)
chr1 (306-385)||(21709721-21709798)
chr1 (244-367)||(33680734-33680860)
chr1 (201-266)||(21022374-21022439)
chr1 (161-342)||(27250905-27251091)
chr1 (297-342)||(20134941-20134986)
chr1 (161-280)||(20847330-20847450)
chr1 (244-342)||(22922136-22922237)
chr1 (257-342)||(21753800-21753887)
chr1 (303-362)||(24783366-24783424)
chr1 (297-368)||(50210534-50210604)
chr1 (304-362)||(20847459-20847516)
chr1 (297-342)||(431498-431543)
chr1 (297-342)||(13213204-13213249)
chr1 (297-342)||(16361686-16361731)
chr1 (297-342)||(20916030-20916075)
chr1 (297-342)||(21840406-21840451)
chr1 (281-342)||(22123429-22123490)
chr1 (297-342)||(22532029-22532074)
chr1 (297-342)||(29776418-29776463)
chr1 (19-183)||(36819335-36819490)
chr1 (306-360)||(21172777-21172831)
chr1 (306-360)||(21312893-21312947)
chr1 (257-342)||(41050317-41050404)
chr1 (304-342)||(14295901-14295939)
chr1 (304-342)||(15860380-15860418)
chr1 (304-342)||(16275753-16275791)
chr1 (159-240)||(20916093-20916174)
chr1 (304-342)||(21341872-21341910)
chr1 (304-342)||(21346736-21346774)
chr1 (304-342)||(21477402-21477440)
chr1 (281-342)||(27161824-27161886)
chr1 (297-342)||(16368608-16368653)
chr1 (297-342)||(16758406-16758451)
chr1 (305-342)||(20454907-20454944)
chr1 (301-342)||(40388932-40388973)
chr1 (297-342)||(45575231-45575276)
chr1 (306-342)||(31612055-31612091)
chr1 (297-368)||(52928294-52928365)
chr1 (19-78)||(1010744-1010803)
chr1 (307-342)||(21161504-21161539)
chr1 (306-360)||(36819584-36819638)
chr1 (97-183)||(16080536-16080622)
chr1 (244-339)||(22237382-22237480)
chr1 (257-342)||(50622226-50622315)
chr1 (297-342)||(21896579-21896624)
chr1 (297-338)||(29297880-29297921)
chr1 (309-342)||(40129356-40129389)
chr1 (162-240)||(21161588-21161668)
chr1 (306-342)||(21706942-21706978)
chr1 (306-342)||(21711484-21711520)
chr1 (269-362)||(3705340-3705432)
chr1 (201-244)||(21022442-21022485)
chr1 (43-183)||(23763120-23763259)
chr1 (297-340)||(35261359-35261402)
chr1 (306-364)||(52639053-52639110)
chr1 (306-343)||(16080691-16080729)
chr1 (257-342)||(26064689-26064778)
chr1 (257-342)||(50614398-50614487)
chr1 (306-362)||(1010237-1010292)
chr1 (306-362)||(1925691-1925746)
chr1 (306-362)||(16375995-16376050)
chr1 (267-323)||(18394235-18394291)
chr1 (32-183)||(20138008-20138151)
chr1 (306-362)||(20924705-20924760)
chr1 (306-362)||(33797033-33797088)
chr1 (306-362)||(39244456-39244511)
chr1 (306-362)||(39248011-39248066)
chr1 (267-323)||(45490013-45490069)
chr1 (98-183)||(46975393-46975478)
[»] chr6 (113 HSPs)
chr6 (1-376)||(18906837-18907212)
chr6 (27-376)||(16523425-16523774)
chr6 (1-362)||(21766434-21766796)
chr6 (26-362)||(18180235-18180570)
chr6 (26-376)||(21740072-21740426)
chr6 (96-376)||(18692022-18692302)
chr6 (26-399)||(15894479-15894852)
chr6 (1-362)||(22408319-22408668)
chr6 (158-362)||(21830612-21830815)
chr6 (25-385)||(25642227-25642587)
chr6 (25-385)||(19862695-19863055)
chr6 (43-385)||(22334955-22335297)
chr6 (25-385)||(19872837-19873197)
chr6 (25-376)||(22431974-22432326)
chr6 (25-376)||(22438524-22438876)
chr6 (1-223)||(20907997-20908221)
chr6 (1-342)||(22074227-22074547)
chr6 (1-220)||(27567625-27567846)
chr6 (26-220)||(27553612-27553808)
chr6 (43-369)||(16965367-16965694)
chr6 (1-220)||(19790795-19791013)
chr6 (22-229)||(15041587-15041794)
chr6 (108-360)||(31164964-31165213)
chr6 (1-183)||(27325626-27325808)
chr6 (19-183)||(17804113-17804277)
chr6 (161-342)||(35245343-35245530)
chr6 (234-368)||(16960271-16960404)
chr6 (1-212)||(23657437-23657638)
chr6 (202-368)||(22831241-22831407)
chr6 (139-342)||(1561061-1561268)
chr6 (161-360)||(20638459-20638663)
chr6 (19-183)||(25767194-25767358)
chr6 (284-342)||(2077017-2077075)
chr6 (161-342)||(29060300-29060485)
chr6 (183-342)||(25611925-25612090)
chr6 (139-342)||(11185271-11185479)
chr6 (244-367)||(22080995-22081121)
chr6 (265-331)||(20908252-20908317)
chr6 (306-360)||(27325902-27325955)
chr6 (297-342)||(19773996-19774041)
chr6 (297-342)||(22780543-22780588)
chr6 (161-342)||(25629530-25629714)
chr6 (297-342)||(28496788-28496833)
chr6 (297-342)||(29809199-29809244)
chr6 (202-342)||(16920847-16920993)
chr6 (289-360)||(15041803-15041873)
chr6 (297-342)||(1595288-1595333)
chr6 (161-284)||(4738725-4738846)
chr6 (297-342)||(23992199-23992244)
chr6 (297-342)||(25603707-25603752)
chr6 (297-342)||(25644091-25644136)
chr6 (297-342)||(34963142-34963187)
chr6 (166-284)||(4186199-4186315)
chr6 (297-340)||(17288112-17288155)
chr6 (306-360)||(17803962-17804016)
chr6 (297-368)||(19303812-19303882)
chr6 (297-368)||(20593553-20593623)
chr6 (297-367)||(27333448-27333518)
chr6 (297-367)||(27394188-27394258)
chr6 (304-342)||(3852407-3852445)
chr6 (304-342)||(8227773-8227811)
chr6 (281-342)||(20557254-20557316)
chr6 (297-339)||(30677014-30677056)
chr6 (54-239)||(31155466-31155644)
chr6 (32-183)||(12706614-12706757)
chr6 (244-342)||(19651947-19652048)
chr6 (297-342)||(19848343-19848388)
chr6 (297-342)||(20361234-20361279)
chr6 (306-342)||(4738854-4738890)
chr6 (257-335)||(20076470-20076550)
chr6 (298-342)||(23019156-23019200)
chr6 (1-39)||(21834903-21834941)
chr6 (308-342)||(31155695-31155729)
chr6 (297-342)||(16448866-16448911)
chr6 (98-183)||(16741131-16741216)
chr6 (309-342)||(18926657-18926690)
chr6 (267-362)||(19791049-19791143)
chr6 (297-342)||(20108888-20108933)
chr6 (19-80)||(22430056-22430117)
chr6 (306-359)||(25135949-25136000)
chr6 (267-362)||(27553844-27553938)
chr6 (306-342)||(9100904-9100940)
chr6 (306-342)||(13019242-13019278)
chr6 (310-342)||(18456478-18456510)
chr6 (310-342)||(18461638-18461670)
chr6 (29-72)||(12496336-12496379)
chr6 (257-342)||(19668124-19668211)
chr6 (19-78)||(22862967-22863026)
chr6 (196-239)||(25603601-25603644)
chr6 (43-183)||(34298681-34298820)
chr6 (304-342)||(4643003-4643041)
chr6 (306-355)||(1588008-1588055)
chr6 (306-362)||(1644024-1644079)
chr6 (306-362)||(8243347-8243402)
chr6 (306-362)||(11566376-11566431)
chr6 (306-362)||(12619379-12619434)
chr6 (306-362)||(14471727-14471782)
chr6 (306-362)||(16623868-16623923)
chr6 (306-362)||(19870104-19870159)
chr6 (306-355)||(21702069-21702116)
chr6 (306-362)||(22862460-22862515)
chr6 (306-362)||(22948597-22948652)
chr6 (306-362)||(22952553-22952608)
chr6 (306-362)||(23394582-23394637)
chr6 (306-362)||(23414419-23414474)
chr6 (306-362)||(23871041-23871096)
chr6 (306-362)||(23874997-23875052)
chr6 (306-362)||(23989434-23989489)
chr6 (306-362)||(27556177-27556232)
chr6 (267-323)||(27567882-27567938)
chr6 (306-338)||(4186118-4186150)
chr6 (161-240)||(19773898-19773978)
chr6 (23-79)||(19848033-19848089)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-376)||(4156-4531)
[»] chr8 (100 HSPs)
chr8 (1-376)||(30643307-30643682)
chr8 (1-363)||(17926721-17927081)
chr8 (26-399)||(376973-377347)
chr8 (1-376)||(20466054-20466434)
chr8 (1-362)||(22010690-22011042)
chr8 (1-376)||(16410269-16410638)
chr8 (1-281)||(15611484-15611754)
chr8 (1-362)||(16861341-16861700)
chr8 (1-281)||(15603032-15603302)
chr8 (4-343)||(23776854-23777195)
chr8 (26-357)||(16184464-16184796)
chr8 (1-359)||(20856441-20856801)
chr8 (1-362)||(39094940-39095302)
chr8 (26-362)||(21168772-21169111)
chr8 (26-362)||(21162099-21162438)
chr8 (43-342)||(19898852-19899154)
chr8 (25-385)||(19982809-19983170)
chr8 (26-240)||(24755577-24755790)
chr8 (26-266)||(19259632-19259872)
chr8 (26-280)||(17353984-17354237)
chr8 (161-342)||(44385023-44385207)
chr8 (161-342)||(5866450-5866637)
chr8 (161-342)||(21249143-21249329)
chr8 (161-342)||(21254981-21255167)
chr8 (265-342)||(23913816-23913893)
chr8 (290-373)||(22873574-22873656)
chr8 (290-376)||(24755482-24755568)
chr8 (284-374)||(19259850-19259939)
chr8 (161-342)||(45131172-45131359)
chr8 (184-342)||(13597816-13597980)
chr8 (139-342)||(21490753-21490960)
chr8 (161-342)||(21389626-21389813)
chr8 (161-342)||(21396156-21396343)
chr8 (161-342)||(21778952-21779139)
chr8 (161-342)||(21790649-21790836)
chr8 (244-342)||(6520116-6520217)
chr8 (183-342)||(17140671-17140840)
chr8 (196-342)||(18818620-18818770)
chr8 (298-346)||(23406135-23406183)
chr8 (202-342)||(7372538-7372682)
chr8 (297-342)||(18879545-18879590)
chr8 (297-342)||(20535968-20536013)
chr8 (297-342)||(21919272-21919317)
chr8 (297-342)||(31971059-31971104)
chr8 (244-342)||(21673458-21673558)
chr8 (297-342)||(14409785-14409830)
chr8 (297-342)||(16413696-16413741)
chr8 (297-342)||(17612408-17612453)
chr8 (297-342)||(18678381-18678426)
chr8 (297-342)||(18717570-18717615)
chr8 (297-342)||(19896004-19896049)
chr8 (139-239)||(31971123-31971222)
chr8 (297-342)||(41597927-41597972)
chr8 (297-342)||(45291074-45291119)
chr8 (297-368)||(22626472-22626542)
chr8 (244-342)||(38855484-38855586)
chr8 (304-342)||(13508408-13508446)
chr8 (161-242)||(16199820-16199901)
chr8 (304-342)||(19937438-19937476)
chr8 (304-342)||(26223649-26223687)
chr8 (297-338)||(4083738-4083779)
chr8 (297-342)||(15203609-15203654)
chr8 (32-183)||(16231513-16231656)
chr8 (297-342)||(21673401-21673446)
chr8 (297-342)||(22874829-22874874)
chr8 (244-342)||(23761112-23761213)
chr8 (244-342)||(26355929-26356030)
chr8 (305-342)||(32121548-32121585)
chr8 (257-342)||(24352772-24352862)
chr8 (304-342)||(22965478-22965516)
chr8 (304-342)||(25484657-25484695)
chr8 (301-342)||(983733-983774)
chr8 (297-342)||(16092612-16092657)
chr8 (306-359)||(30309029-30309080)
chr8 (315-363)||(15603304-15603351)
chr8 (315-363)||(15611756-15611803)
chr8 (306-342)||(28649329-28649365)
chr8 (43-183)||(20527358-20527497)
chr8 (104-183)||(22044809-22044888)
chr8 (19-78)||(43251834-43251893)
chr8 (32-78)||(21383675-21383721)
chr8 (98-183)||(15531815-15531900)
chr8 (306-359)||(17055656-17055707)
chr8 (306-362)||(18863207-18863262)
chr8 (306-362)||(21386847-21386902)
chr8 (306-362)||(21410439-21410494)
chr8 (306-362)||(21804931-21804986)
chr8 (306-362)||(21828576-21828631)
chr8 (306-362)||(22111445-22111500)
chr8 (26-79)||(23648580-23648633)
chr8 (98-183)||(23847110-23847195)
chr8 (98-183)||(24445601-24445686)
chr8 (306-362)||(30940639-30940694)
chr8 (306-355)||(32598460-32598507)
chr8 (306-355)||(32604992-32605039)
chr8 (306-362)||(43251325-43251380)
chr8 (98-151)||(17828677-17828732)
chr8 (23-79)||(18678140-18678196)
chr8 (161-240)||(21919176-21919255)
chr8 (23-79)||(32121759-32121815)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-376)||(14815-15187)
[»] chr4 (110 HSPs)
chr4 (3-376)||(16488095-16488467)
chr4 (1-362)||(16348679-16349038)
chr4 (1-362)||(16356967-16357326)
chr4 (26-399)||(12569717-12570090)
chr4 (28-376)||(15121843-15122193)
chr4 (4-376)||(15093499-15093873)
chr4 (1-362)||(5338996-5339352)
chr4 (43-376)||(23843202-23843537)
chr4 (1-229)||(13813034-13813261)
chr4 (48-385)||(44675348-44675686)
chr4 (25-376)||(13569227-13569579)
chr4 (85-376)||(15125141-15125434)
chr4 (1-220)||(15353323-15353544)
chr4 (97-376)||(12423429-12423696)
chr4 (130-342)||(17048458-17048670)
chr4 (1-220)||(16351864-16352088)
chr4 (1-220)||(11250577-11250795)
chr4 (1-183)||(20157475-20157657)
chr4 (23-212)||(25555371-25555559)
chr4 (161-368)||(14053477-14053690)
chr4 (109-220)||(631105-631214)
chr4 (19-183)||(36133988-36134152)
chr4 (161-342)||(12902517-12902702)
chr4 (161-342)||(23374529-23374715)
chr4 (196-342)||(17046245-17046397)
chr4 (183-342)||(44052588-44052753)
chr4 (306-393)||(22634677-22634764)
chr4 (265-331)||(13813450-13813516)
chr4 (260-328)||(631243-631311)
chr4 (297-368)||(7798508-7798579)
chr4 (19-183)||(22634448-22634603)
chr4 (297-342)||(7893462-7893507)
chr4 (196-342)||(16240181-16240331)
chr4 (297-342)||(16377837-16377882)
chr4 (297-342)||(22636195-22636240)
chr4 (297-342)||(52873578-52873623)
chr4 (299-342)||(3096096-3096139)
chr4 (257-342)||(39706575-39706662)
chr4 (257-342)||(52243477-52243564)
chr4 (297-342)||(12773842-12773887)
chr4 (297-342)||(14038462-14038507)
chr4 (297-342)||(14280091-14280136)
chr4 (297-342)||(16270508-16270553)
chr4 (297-342)||(19618565-19618610)
chr4 (297-342)||(20149607-20149652)
chr4 (297-342)||(52312249-52312294)
chr4 (257-342)||(14132-14219)
chr4 (257-342)||(12288492-12288579)
chr4 (297-340)||(14928061-14928104)
chr4 (304-342)||(14971150-14971188)
chr4 (265-323)||(15353577-15353634)
chr4 (304-342)||(15367426-15367464)
chr4 (304-342)||(15369754-15369792)
chr4 (304-342)||(15373262-15373300)
chr4 (304-342)||(19242450-19242488)
chr4 (257-360)||(14157584-14157688)
chr4 (306-362)||(20157731-20157787)
chr4 (306-343)||(36134226-36134263)
chr4 (297-342)||(43198875-43198920)
chr4 (297-342)||(44102033-44102078)
chr4 (297-342)||(54799090-54799135)
chr4 (306-342)||(12613-12649)
chr4 (306-362)||(13818054-13818109)
chr4 (266-360)||(14164289-14164384)
chr4 (161-240)||(15551683-15551762)
chr4 (297-341)||(18215653-18215697)
chr4 (19-78)||(9556551-9556610)
chr4 (19-78)||(17810293-17810352)
chr4 (304-342)||(12610685-12610723)
chr4 (304-342)||(15705149-15705187)
chr4 (304-342)||(23803697-23803735)
chr4 (304-342)||(51464214-51464252)
chr4 (32-183)||(1951799-1951942)
chr4 (306-359)||(14708912-14708963)
chr4 (306-359)||(18236670-18236721)
chr4 (161-240)||(3096159-3096238)
chr4 (310-342)||(15375548-15375580)
chr4 (307-359)||(18603009-18603059)
chr4 (19-78)||(4561360-4561419)
chr4 (257-304)||(13813353-13813400)
chr4 (43-183)||(41385803-41385942)
chr4 (265-323)||(16352122-16352179)
chr4 (306-352)||(28569697-28569741)
chr4 (257-342)||(46640699-46640788)
chr4 (257-342)||(53082434-53082523)
chr4 (306-362)||(4561862-4561917)
chr4 (306-362)||(5757467-5757522)
chr4 (306-362)||(9556044-9556099)
chr4 (306-362)||(10712369-10712424)
chr4 (306-362)||(10926139-10926194)
chr4 (267-323)||(11250831-11250887)
chr4 (306-362)||(12487199-12487254)
chr4 (184-229)||(13813292-13813337)
chr4 (184-229)||(13813381-13813426)
chr4 (306-362)||(14757964-14758019)
chr4 (306-362)||(14954729-14954784)
chr4 (306-362)||(15224556-15224611)
chr4 (306-359)||(17152761-17152812)
chr4 (306-362)||(17809788-17809843)
chr4 (310-359)||(18609584-18609631)
chr4 (98-183)||(19757696-19757781)
chr4 (98-183)||(19782025-19782110)
chr4 (306-362)||(25689383-25689438)
chr4 (306-362)||(33741894-33741949)
chr4 (307-359)||(3412576-3412626)
chr4 (43-183)||(14678872-14679010)
chr4 (34-78)||(14757463-14757507)
chr4 (32-80)||(17152524-17152572)
chr4 (32-80)||(18222416-18222464)
chr4 (1-57)||(25555550-25555606)
[»] chr7 (127 HSPs)
chr7 (1-374)||(12321757-12322128)
chr7 (1-376)||(14429610-14429983)
chr7 (1-362)||(2759880-2760232)
chr7 (26-385)||(17138101-17138461)
chr7 (43-376)||(12186743-12187078)
chr7 (26-385)||(19649530-19649889)
chr7 (1-220)||(39267915-39268133)
chr7 (25-376)||(9702988-9703340)
chr7 (1-220)||(3271706-3271925)
chr7 (43-385)||(32216606-32216948)
chr7 (25-385)||(18154881-18155240)
chr7 (130-385)||(15211171-15211426)
chr7 (43-376)||(24054190-24054523)
chr7 (1-220)||(9446174-9446395)
chr7 (1-183)||(9751771-9751952)
chr7 (1-223)||(20569612-20569833)
chr7 (1-183)||(2832457-2832639)
chr7 (1-220)||(42203876-42204095)
chr7 (139-342)||(11996183-11996390)
chr7 (128-225)||(18301918-18302013)
chr7 (161-342)||(26211754-26211940)
chr7 (19-183)||(15580617-15580771)
chr7 (19-149)||(11312596-11312728)
chr7 (183-342)||(10588795-10588960)
chr7 (265-363)||(15580448-15580545)
chr7 (139-342)||(34200542-34200751)
chr7 (296-376)||(11858305-11858384)
chr7 (48-183)||(14152048-14152183)
chr7 (4-183)||(14932753-14932932)
chr7 (4-183)||(15356188-15356367)
chr7 (4-183)||(15360302-15360481)
chr7 (161-342)||(9508948-9509135)
chr7 (265-342)||(20487341-20487418)
chr7 (19-183)||(12318052-12318207)
chr7 (196-342)||(14258019-14258169)
chr7 (306-376)||(9752035-9752104)
chr7 (257-331)||(18301846-18301920)
chr7 (161-342)||(13032517-13032704)
chr7 (297-360)||(3564619-3564681)
chr7 (297-342)||(15755269-15755314)
chr7 (297-342)||(16402753-16402798)
chr7 (297-342)||(28505657-28505702)
chr7 (297-342)||(40443212-40443257)
chr7 (297-342)||(67493-67538)
chr7 (297-342)||(12256144-12256189)
chr7 (297-342)||(12698591-12698636)
chr7 (297-342)||(13869122-13869167)
chr7 (297-342)||(15144348-15144393)
chr7 (304-360)||(15605547-15605603)
chr7 (297-342)||(16213355-16213400)
chr7 (297-342)||(17062212-17062257)
chr7 (244-342)||(18005398-18005499)
chr7 (297-342)||(20110293-20110338)
chr7 (297-342)||(27848104-27848149)
chr7 (297-342)||(29329256-29329301)
chr7 (297-342)||(44116290-44116335)
chr7 (297-342)||(47831554-47831599)
chr7 (19-183)||(13635495-13635650)
chr7 (257-342)||(2282531-2282618)
chr7 (306-360)||(12317901-12317955)
chr7 (306-360)||(14933051-14933105)
chr7 (306-360)||(15356486-15356540)
chr7 (306-360)||(15360600-15360654)
chr7 (257-342)||(16056081-16056168)
chr7 (257-342)||(22072746-22072833)
chr7 (297-340)||(24274898-24274941)
chr7 (197-324)||(28505496-28505629)
chr7 (257-341)||(12901074-12901160)
chr7 (304-342)||(16495135-16495173)
chr7 (307-367)||(811467-811527)
chr7 (32-183)||(9593270-9593413)
chr7 (297-342)||(13647057-13647102)
chr7 (301-342)||(15082263-15082304)
chr7 (297-342)||(38898718-38898763)
chr7 (297-342)||(44013931-44013976)
chr7 (297-342)||(48273129-48273174)
chr7 (19-183)||(16583181-16583336)
chr7 (267-323)||(42203785-42203840)
chr7 (307-342)||(15605818-15605853)
chr7 (307-342)||(16220050-16220085)
chr7 (19-78)||(39722287-39722346)
chr7 (257-342)||(1868238-1868327)
chr7 (306-352)||(14152280-14152325)
chr7 (257-342)||(15008780-15008869)
chr7 (97-179)||(15605365-15605447)
chr7 (161-242)||(27848006-27848087)
chr7 (304-342)||(42376345-42376383)
chr7 (306-359)||(8917205-8917256)
chr7 (297-342)||(18456704-18456749)
chr7 (139-242)||(15755043-15755145)
chr7 (19-78)||(70791-70850)
chr7 (19-78)||(74900-74959)
chr7 (43-183)||(11262237-11262376)
chr7 (304-339)||(13831154-13831189)
chr7 (43-183)||(14953106-14953245)
chr7 (43-183)||(14959072-14959211)
chr7 (19-78)||(26292416-26292475)
chr7 (43-183)||(44408395-44408534)
chr7 (28-78)||(1859119-1859169)
chr7 (32-183)||(19096-19239)
chr7 (306-362)||(32623-32678)
chr7 (306-362)||(71304-71359)
chr7 (306-362)||(75413-75468)
chr7 (306-362)||(1859361-1859416)
chr7 (290-331)||(9446454-9446494)
chr7 (306-362)||(12705196-12705251)
chr7 (310-359)||(13461538-13461585)
chr7 (306-362)||(13919032-13919087)
chr7 (306-355)||(14216706-14216753)
chr7 (306-362)||(15083685-15083740)
chr7 (306-355)||(15728106-15728153)
chr7 (306-362)||(16113755-16113810)
chr7 (306-362)||(16116908-16116963)
chr7 (306-359)||(16457632-16457683)
chr7 (306-362)||(16907748-16907803)
chr7 (306-362)||(18282880-18282935)
chr7 (306-362)||(18425174-18425229)
chr7 (306-362)||(25927778-25927833)
chr7 (306-362)||(26291886-26291941)
chr7 (306-355)||(35151422-35151469)
chr7 (297-342)||(38227243-38227288)
chr7 (306-362)||(39721755-39721810)
chr7 (32-80)||(11987231-11987279)
chr7 (19-67)||(15605299-15605347)
chr7 (306-360)||(16583031-16583086)
chr7 (98-151)||(18556928-18556983)
chr7 (297-342)||(20220474-20220521)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (1-362)||(22811927-22812287)
chr2 (1-363)||(25963731-25964091)
chr2 (1-376)||(37524410-37524776)
chr2 (1-362)||(21318651-21319014)
chr2 (1-362)||(21327582-21327945)
chr2 (48-376)||(45678192-45678521)
chr2 (26-376)||(24673290-24673645)
chr2 (26-376)||(40622251-40622603)
chr2 (31-376)||(24679907-24680259)
chr2 (4-376)||(23019725-23020099)
chr2 (4-362)||(22799145-22799504)
chr2 (1-210)||(21916114-21916322)
chr2 (1-362)||(40428202-40428564)
chr2 (25-369)||(22741004-22741349)
chr2 (25-376)||(22758759-22759111)
chr2 (1-220)||(24655354-24655575)
chr2 (1-220)||(24174680-24174901)
chr2 (26-220)||(24716569-24716762)
chr2 (1-220)||(24869760-24869981)
chr2 (1-220)||(25961550-25961768)
chr2 (265-376)||(24716796-24716907)
chr2 (19-183)||(24735319-24735483)
chr2 (161-342)||(38292-38478)
chr2 (265-342)||(9784555-9784632)
chr2 (161-342)||(23072125-23072312)
chr2 (161-342)||(23103571-23103757)
chr2 (196-342)||(23654598-23654749)
chr2 (162-342)||(21900630-21900816)
chr2 (299-385)||(23031092-23031176)
chr2 (161-342)||(23060272-23060458)
chr2 (161-342)||(22336885-22337069)
chr2 (265-362)||(25961802-25961899)
chr2 (257-342)||(22413418-22413505)
chr2 (297-343)||(7679370-7679416)
chr2 (265-362)||(24655609-24655704)
chr2 (297-342)||(299110-299155)
chr2 (297-342)||(6725734-6725779)
chr2 (297-342)||(8946416-8946461)
chr2 (297-342)||(23076250-23076295)
chr2 (297-342)||(23130638-23130683)
chr2 (297-342)||(23133105-23133150)
chr2 (297-342)||(23712391-23712436)
chr2 (297-342)||(24643328-24643373)
chr2 (297-342)||(25616001-25616046)
chr2 (300-368)||(23657571-23657638)
chr2 (257-342)||(18787184-18787271)
chr2 (306-360)||(19691922-19691976)
chr2 (303-342)||(20322405-20322444)
chr2 (265-362)||(24174550-24174646)
chr2 (306-360)||(24735168-24735222)
chr2 (265-362)||(24869630-24869726)
chr2 (304-342)||(22105104-22105142)
chr2 (300-342)||(22731553-22731595)
chr2 (297-339)||(22738495-22738537)
chr2 (306-367)||(25175578-25175639)
chr2 (304-342)||(38967151-38967189)
chr2 (304-342)||(43137032-43137070)
chr2 (297-342)||(8056-8101)
chr2 (297-342)||(21177725-21177770)
chr2 (297-342)||(23040507-23040552)
chr2 (297-342)||(23713211-23713256)
chr2 (297-342)||(32215313-32215358)
chr2 (19-78)||(10101671-10101730)
chr2 (310-368)||(28405717-28405775)
chr2 (304-342)||(19671633-19671671)
chr2 (257-342)||(24688570-24688659)
chr2 (306-359)||(18855735-18855786)
chr2 (306-359)||(23186854-23186905)
chr2 (306-359)||(23598117-23598168)
chr2 (250-342)||(23791024-23791120)
chr2 (297-342)||(24367513-24367558)
chr2 (306-359)||(26124962-26125013)
chr2 (297-342)||(24697850-24697897)
chr2 (19-78)||(24649378-24649437)
chr2 (19-78)||(27379459-27379518)
chr2 (19-78)||(27383505-27383564)
chr2 (161-242)||(20308972-20309053)
chr2 (257-342)||(20520435-20520524)
chr2 (306-355)||(60599-60646)
chr2 (306-362)||(1282902-1282957)
chr2 (306-362)||(10102190-10102245)
chr2 (297-342)||(10822942-10822987)
chr2 (306-362)||(12902053-12902108)
chr2 (98-183)||(19928597-19928682)
chr2 (306-362)||(24629016-24629071)
chr2 (306-362)||(24648869-24648924)
chr2 (306-362)||(27601306-27601361)
chr2 (306-362)||(30345553-30345608)
chr2 (306-362)||(31344651-31344706)
chr2 (306-362)||(41531542-41531597)
chr2 (306-342)||(22134526-22134562)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-376)||(17127-17501)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (5-376)||(2104-2470)
[»] chr5 (107 HSPs)
chr5 (1-362)||(21366681-21367040)
chr5 (1-359)||(20805293-20805653)
chr5 (26-393)||(18770042-18770412)
chr5 (1-359)||(20766715-20767075)
chr5 (43-342)||(22032080-22032382)
chr5 (26-376)||(23201083-23201436)
chr5 (5-376)||(21872978-21873351)
chr5 (25-373)||(14078877-14079226)
chr5 (1-362)||(123321-123681)
chr5 (1-331)||(17919167-17919489)
chr5 (26-220)||(1859017-1859210)
chr5 (26-362)||(23511839-23512174)
chr5 (26-280)||(23571899-23572160)
chr5 (1-220)||(24221757-24221978)
chr5 (26-220)||(23451227-23451424)
chr5 (26-220)||(23458471-23458668)
chr5 (26-220)||(23462732-23462929)
chr5 (25-385)||(26703793-26704152)
chr5 (25-385)||(26973526-26973885)
chr5 (161-342)||(22107789-22107973)
chr5 (1-220)||(26680464-26680683)
chr5 (1-220)||(26952071-26952290)
chr5 (1-220)||(12028581-12028799)
chr5 (1-220)||(22757010-22757226)
chr5 (28-223)||(31342027-31342221)
chr5 (56-220)||(23439860-23440027)
chr5 (48-243)||(23501418-23501612)
chr5 (1-183)||(24767561-24767743)
chr5 (159-342)||(19661009-19661197)
chr5 (26-179)||(17410360-17410513)
chr5 (161-342)||(21808565-21808751)
chr5 (265-376)||(1859244-1859355)
chr5 (161-368)||(9077689-9077898)
chr5 (290-376)||(21887013-21887099)
chr5 (161-342)||(21293145-21293332)
chr5 (161-342)||(1096228-1096412)
chr5 (196-342)||(21729276-21729427)
chr5 (161-342)||(22074779-22074965)
chr5 (257-362)||(23439730-23439834)
chr5 (257-362)||(23451097-23451201)
chr5 (257-362)||(23458341-23458445)
chr5 (257-362)||(23462602-23462706)
chr5 (161-342)||(24493328-24493514)
chr5 (161-368)||(37723635-37723848)
chr5 (290-376)||(21877258-21877344)
chr5 (161-339)||(8287019-8287203)
chr5 (161-339)||(21997709-21997892)
chr5 (159-360)||(24528963-24529168)
chr5 (184-339)||(13025073-13025233)
chr5 (184-339)||(13095257-13095417)
chr5 (244-341)||(22959798-22959898)
chr5 (313-376)||(23571821-23571883)
chr5 (257-342)||(27989210-27989297)
chr5 (281-342)||(11581562-11581624)
chr5 (297-342)||(14047860-14047905)
chr5 (297-342)||(17517504-17517549)
chr5 (297-342)||(20918325-20918370)
chr5 (297-342)||(23064287-23064332)
chr5 (297-342)||(23390812-23390857)
chr5 (297-342)||(24066929-24066974)
chr5 (301-342)||(25421290-25421331)
chr5 (297-342)||(25431154-25431199)
chr5 (297-342)||(31060803-31060848)
chr5 (297-342)||(38619250-38619295)
chr5 (19-183)||(23535613-23535768)
chr5 (257-342)||(20027222-20027309)
chr5 (265-362)||(24221627-24221723)
chr5 (43-183)||(25534897-25535036)
chr5 (307-362)||(33896074-33896128)
chr5 (297-339)||(22411929-22411971)
chr5 (304-342)||(36314310-36314348)
chr5 (297-342)||(18319329-18319374)
chr5 (244-342)||(19668649-19668749)
chr5 (297-342)||(21329820-21329865)
chr5 (297-342)||(21565294-21565339)
chr5 (297-342)||(29329673-29329718)
chr5 (297-337)||(20902308-20902348)
chr5 (306-360)||(17410245-17410299)
chr5 (290-369)||(23501619-23501696)
chr5 (304-342)||(20807088-20807126)
chr5 (306-352)||(24767837-24767882)
chr5 (304-342)||(41095966-41096004)
chr5 (297-342)||(10776011-10776056)
chr5 (297-342)||(21502481-21502526)
chr5 (297-342)||(32027132-32027177)
chr5 (307-359)||(17730685-17730735)
chr5 (19-78)||(15236806-15236865)
chr5 (43-183)||(21295321-21295460)
chr5 (43-183)||(24554443-24554582)
chr5 (32-78)||(18355979-18356025)
chr5 (306-352)||(21885466-21885510)
chr5 (306-352)||(26172249-26172293)
chr5 (306-355)||(4036000-4036047)
chr5 (306-362)||(10752704-10752759)
chr5 (306-362)||(11226656-11226711)
chr5 (306-362)||(11230635-11230690)
chr5 (267-323)||(12028835-12028891)
chr5 (306-362)||(15237372-15237427)
chr5 (306-362)||(19473255-19473310)
chr5 (306-362)||(20295361-20295416)
chr5 (306-362)||(20911471-20911526)
chr5 (267-362)||(22756880-22756974)
chr5 (306-355)||(25229683-25229730)
chr5 (306-355)||(25293839-25293886)
chr5 (306-359)||(26743021-26743072)
chr5 (32-80)||(21340804-21340852)
chr5 (32-80)||(26742784-26742832)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (3-376)||(123-492)
[»] chr3 (147 HSPs)
chr3 (1-376)||(11862519-11862894)
chr3 (1-375)||(18383932-18384305)
chr3 (26-362)||(12172537-12172872)
chr3 (28-376)||(322318-322666)
chr3 (1-362)||(12496000-12496359)
chr3 (1-356)||(11298543-11298900)
chr3 (1-362)||(19725927-19726277)
chr3 (26-376)||(855864-856216)
chr3 (26-376)||(16369125-16369476)
chr3 (128-374)||(15067409-15067656)
chr3 (26-362)||(14878557-14878894)
chr3 (26-385)||(15878092-15878451)
chr3 (170-376)||(11849041-11849248)
chr3 (1-220)||(12037968-12038185)
chr3 (26-280)||(23053128-23053383)
chr3 (54-220)||(26196500-26196666)
chr3 (26-393)||(23077518-23077866)
chr3 (26-244)||(15051367-15051584)
chr3 (24-342)||(23408187-23408506)
chr3 (1-174)||(11851510-11851682)
chr3 (1-220)||(11557400-11557621)
chr3 (1-183)||(14665320-14665502)
chr3 (26-191)||(15060196-15060360)
chr3 (1-220)||(11595155-11595373)
chr3 (1-183)||(14668476-14668658)
chr3 (1-220)||(1982826-1983047)
chr3 (1-219)||(3402972-3403191)
chr3 (1-220)||(42325824-42326042)
chr3 (1-219)||(3389952-3390171)
chr3 (161-342)||(13210504-13210690)
chr3 (109-212)||(12852662-12852763)
chr3 (265-363)||(26196700-26196797)
chr3 (208-342)||(16796056-16796192)
chr3 (19-183)||(2897849-2898012)
chr3 (284-376)||(16909598-16909689)
chr3 (19-183)||(7793375-7793540)
chr3 (130-227)||(16796195-16796290)
chr3 (26-183)||(20461533-20461690)
chr3 (19-183)||(327190-327355)
chr3 (161-342)||(12398968-12399154)
chr3 (196-342)||(14682140-14682291)
chr3 (265-360)||(3403226-3403321)
chr3 (257-331)||(12852797-12852871)
chr3 (196-342)||(14670618-14670769)
chr3 (196-342)||(25476596-25476744)
chr3 (257-342)||(16097119-16097206)
chr3 (297-343)||(13442076-13442122)
chr3 (183-342)||(17487616-17487780)
chr3 (183-342)||(17499098-17499262)
chr3 (196-342)||(18438294-18438443)
chr3 (306-376)||(23053391-23053460)
chr3 (257-342)||(23083633-23083722)
chr3 (202-360)||(40213937-40214098)
chr3 (201-266)||(16909667-16909732)
chr3 (297-342)||(26683114-26683159)
chr3 (297-342)||(43840692-43840737)
chr3 (267-329)||(11557657-11557718)
chr3 (258-320)||(12038212-12038274)
chr3 (304-360)||(2898108-2898164)
chr3 (297-342)||(8499294-8499339)
chr3 (297-342)||(8898833-8898878)
chr3 (297-342)||(10556761-10556806)
chr3 (297-342)||(10901491-10901536)
chr3 (297-342)||(13543751-13543796)
chr3 (306-362)||(14665167-14665223)
chr3 (306-362)||(14668323-14668379)
chr3 (297-342)||(15412205-15412250)
chr3 (297-342)||(16283189-16283234)
chr3 (297-342)||(17447032-17447077)
chr3 (297-342)||(20698753-20698798)
chr3 (297-342)||(24153500-24153545)
chr3 (297-342)||(27165026-27165071)
chr3 (297-342)||(41123631-41123676)
chr3 (297-342)||(46821993-46822038)
chr3 (244-342)||(52523996-52524097)
chr3 (257-342)||(14972618-14972705)
chr3 (19-183)||(15482588-15482743)
chr3 (196-342)||(30029594-30029742)
chr3 (297-368)||(32307405-32307476)
chr3 (306-360)||(327452-327506)
chr3 (306-360)||(7793637-7793691)
chr3 (304-342)||(15076316-15076354)
chr3 (304-342)||(17736971-17737009)
chr3 (184-342)||(23274446-23274609)
chr3 (304-342)||(24341003-24341041)
chr3 (304-342)||(28194471-28194509)
chr3 (297-339)||(43550867-43550909)
chr3 (297-342)||(606648-606693)
chr3 (297-342)||(11425031-11425076)
chr3 (297-342)||(14234231-14234276)
chr3 (297-342)||(15467630-15467675)
chr3 (105-183)||(15850185-15850264)
chr3 (43-123)||(17525216-17525297)
chr3 (297-342)||(53301848-53301893)
chr3 (297-341)||(1644996-1645040)
chr3 (306-342)||(14572370-14572406)
chr3 (265-362)||(1983081-1983177)
chr3 (299-362)||(14872290-14872352)
chr3 (19-78)||(15617398-15617457)
chr3 (306-360)||(20461787-20461841)
chr3 (19-78)||(30065970-30066029)
chr3 (43-183)||(55148887-55149026)
chr3 (306-367)||(9512666-9512727)
chr3 (306-367)||(9520641-9520702)
chr3 (257-341)||(12174531-12174617)
chr3 (297-339)||(37251449-37251491)
chr3 (304-342)||(44494544-44494582)
chr3 (306-367)||(49668390-49668451)
chr3 (304-342)||(50242600-50242638)
chr3 (308-342)||(53071011-53071045)
chr3 (297-342)||(12120108-12120153)
chr3 (306-359)||(16809156-16809207)
chr3 (297-342)||(17661198-17661243)
chr3 (297-342)||(22110675-22110720)
chr3 (297-342)||(38962226-38962271)
chr3 (306-360)||(15482439-15482494)
chr3 (19-78)||(11070092-11070151)
chr3 (19-70)||(11165555-11165606)
chr3 (43-183)||(24187686-24187825)
chr3 (267-362)||(11595409-11595504)
chr3 (267-362)||(42325693-42325788)
chr3 (98-152)||(1598574-1598630)
chr3 (306-362)||(4589450-4589505)
chr3 (306-362)||(7109213-7109268)
chr3 (306-362)||(7113148-7113203)
chr3 (306-362)||(11069585-11069640)
chr3 (306-362)||(14498842-14498897)
chr3 (306-362)||(15616891-15616946)
chr3 (306-362)||(15964461-15964516)
chr3 (306-362)||(15968385-15968440)
chr3 (306-362)||(15972309-15972364)
chr3 (306-355)||(16696567-16696614)
chr3 (306-362)||(19775084-19775139)
chr3 (25-183)||(20722910-20723067)
chr3 (306-362)||(22321181-22321236)
chr3 (306-362)||(22336236-22336291)
chr3 (306-362)||(27410181-27410236)
chr3 (306-362)||(28949239-28949294)
chr3 (22-79)||(30029867-30029924)
chr3 (306-362)||(30065464-30065520)
chr3 (306-362)||(37440174-37440229)
chr3 (98-183)||(38814310-38814395)
chr3 (306-362)||(55022382-55022437)
chr3 (98-151)||(3833630-3833685)
chr3 (161-240)||(11424934-11425014)
chr3 (34-78)||(11854757-11854801)
chr3 (306-342)||(14577135-14577171)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (1-362)||(42370-42726)
scaffold0124 (111-212)||(24949-25048)
scaffold0124 (257-327)||(25082-25152)
scaffold0124 (297-342)||(38599-38644)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-343)||(73783-74124)
scaffold0022 (257-342)||(44355-44442)
scaffold0022 (257-342)||(78076-78163)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-376)||(621-998)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-376)||(46742-47119)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-362)||(1571-1931)
scaffold0104 (1-362)||(9254-9613)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (27-343)||(2589-2907)
scaffold0158 (27-343)||(6255-6573)
[»] scaffold0412 (2 HSPs)
scaffold0412 (1-362)||(6430-6780)
scaffold0412 (306-362)||(14036-14091)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (1-362)||(5335-5686)
scaffold0476 (1-362)||(6530-6881)
scaffold0476 (297-342)||(12514-12559)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (1-260)||(1-260)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (96-362)||(21635-21900)
scaffold0037 (244-367)||(22937-23063)
scaffold0037 (1-46)||(21584-21629)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (1-367)||(1505-1861)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (128-376)||(7272-7520)
scaffold0311 (26-123)||(7128-7225)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (26-376)||(21844-22197)
scaffold0210 (26-376)||(29736-30089)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (48-376)||(280953-281288)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (27-281)||(1315-1569)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (4-376)||(38498-38872)
scaffold0023 (161-330)||(119646-119820)
scaffold0023 (297-342)||(40417-40462)
scaffold0023 (244-342)||(100103-100204)
scaffold0023 (299-342)||(17997-18040)
scaffold0023 (297-342)||(44193-44238)
scaffold0023 (297-368)||(101265-101336)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (12-362)||(1541-1882)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (26-376)||(34960-35311)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (26-342)||(1637-1957)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (4-385)||(16367-16749)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (4-376)||(4823-5199)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (26-385)||(5811-6171)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-362)||(19307-19664)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (88-342)||(18810-19073)
scaffold0080 (3-147)||(18673-18821)
scaffold0080 (249-362)||(16740-16852)
scaffold0080 (297-342)||(20128-20173)
scaffold0080 (196-336)||(39679-39823)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-362)||(15226-15588)
scaffold0017 (1-362)||(19748-20110)
scaffold0017 (130-376)||(193122-193369)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (26-342)||(7053-7371)
scaffold0114 (162-342)||(15641-15827)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (25-385)||(69511-69871)
scaffold0004 (53-183)||(60835-60964)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-331)||(7286-7617)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (26-363)||(23417-23755)
scaffold0081 (26-363)||(38841-39179)
scaffold0081 (26-363)||(14401-14740)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (26-376)||(9004-9355)
scaffold0101 (297-342)||(1576-1621)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (1-220)||(43964-44182)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (43-385)||(10580-10918)
scaffold0297 (43-385)||(15737-16078)
[»] scaffold0327 (3 HSPs)
scaffold0327 (12-220)||(171-379)
scaffold0327 (265-342)||(37-114)
scaffold0327 (297-342)||(3642-3687)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (26-321)||(14127-14425)
scaffold0056 (159-368)||(17394-17607)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (1-356)||(33298-33649)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (26-385)||(7858-8216)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (1-220)||(422547-422767)
scaffold0001 (290-385)||(204600-204693)
scaffold0001 (265-362)||(422802-422898)
scaffold0001 (297-342)||(160437-160482)
scaffold0001 (297-342)||(500853-500898)
scaffold0001 (32-183)||(173217-173359)
[»] scaffold0550 (3 HSPs)
scaffold0550 (1-220)||(7355-7572)
scaffold0550 (321-376)||(9599-9654)
scaffold0550 (265-362)||(7224-7321)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (25-385)||(17953-18313)
scaffold0043 (306-360)||(77448-77500)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (25-376)||(65838-66189)
scaffold0031 (19-183)||(53481-53645)
scaffold0031 (306-360)||(53330-53384)
scaffold0031 (161-342)||(128509-128697)
scaffold0031 (306-362)||(36648-36703)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (25-373)||(18494-18844)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (3-220)||(414068-414284)
scaffold0003 (265-362)||(414318-414415)
scaffold0003 (161-368)||(340122-340335)
scaffold0003 (306-360)||(100849-100901)
[»] scaffold0036 (3 HSPs)
scaffold0036 (59-362)||(68616-68921)
scaffold0036 (19-183)||(66441-66605)
scaffold0036 (306-360)||(66702-66756)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (26-311)||(12550-12839)
scaffold0029 (306-376)||(10454-10523)
scaffold0029 (304-342)||(11101-11139)
scaffold0029 (19-78)||(61638-61697)
scaffold0029 (19-78)||(65554-65613)
scaffold0029 (306-362)||(66061-66116)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (108-373)||(3469-3735)
scaffold0149 (108-373)||(7900-8166)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (26-220)||(30783-30977)
scaffold0008 (290-363)||(34148-34220)
scaffold0008 (306-359)||(1654-1705)
scaffold0008 (297-342)||(15023-15068)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-159)||(6324-6482)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (26-385)||(1056-1415)
scaffold0261 (304-342)||(15443-15481)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (25-385)||(23562-23920)
[»] scaffold0111 (3 HSPs)
scaffold0111 (96-376)||(32171-32450)
scaffold0111 (32-72)||(8527-8567)
scaffold0111 (32-72)||(15671-15711)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (101-362)||(27238-27501)
[»] scaffold0439 (4 HSPs)
scaffold0439 (2-220)||(2453-2673)
scaffold0439 (2-220)||(10313-10533)
scaffold0439 (265-362)||(10566-10662)
scaffold0439 (265-334)||(2706-2773)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (25-342)||(19739-20057)
scaffold0139 (257-342)||(38182-38271)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (54-342)||(10252-10543)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (162-342)||(3276-3458)
scaffold0165 (162-342)||(7339-7522)
scaffold0165 (257-342)||(27993-28080)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (54-342)||(36213-36502)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (25-386)||(48500-48847)
scaffold0102 (297-342)||(19014-19059)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (43-369)||(178632-178957)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (186-362)||(2016-2193)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (1-223)||(2048-2269)
scaffold0410 (267-323)||(1960-2015)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (189-329)||(195119-195258)
scaffold0015 (1-194)||(192333-192528)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (29-225)||(4270-4465)
scaffold0184 (304-342)||(1419-1457)
scaffold0184 (267-323)||(4473-4529)
[»] scaffold0637 (2 HSPs)
scaffold0637 (1-220)||(8443-8661)
scaffold0637 (267-362)||(8312-8407)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (1-183)||(10058-10240)
scaffold0166 (306-352)||(10334-10379)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (201-342)||(404-548)
scaffold0484 (130-229)||(542-639)
[»] scaffold0819 (2 HSPs)
scaffold0819 (284-376)||(1848-1939)
scaffold0819 (201-266)||(1917-1982)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (109-220)||(7942-8051)
scaffold0142 (257-331)||(8077-8151)
scaffold0142 (297-342)||(16516-16561)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (196-281)||(8359-8445)
scaffold0673 (316-376)||(8290-8350)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (161-342)||(10600-10787)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (161-339)||(11620-11803)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (161-342)||(4471-4657)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (265-360)||(1005-1100)
scaffold1873 (97-183)||(1172-1258)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (4-183)||(29013-29192)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (161-342)||(13254-13441)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (139-362)||(4291-4517)
scaffold0046 (161-362)||(1736-1941)
scaffold0046 (161-342)||(28172-28359)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (265-342)||(6375-6452)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (161-342)||(31826-32012)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (161-342)||(168154-168340)
scaffold0011 (297-342)||(51673-51718)
[»] scaffold0289 (2 HSPs)
scaffold0289 (137-220)||(2450-2532)
scaffold0289 (306-362)||(2335-2390)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (297-376)||(65022-65100)
scaffold0064 (161-342)||(46753-46940)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (161-342)||(1708-1897)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (202-342)||(16039-16186)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (161-342)||(2576-2763)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (290-369)||(995-1073)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (196-342)||(5339-5491)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (162-342)||(31918-32105)
scaffold0171 (1-79)||(35527-35605)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (161-342)||(27638-27821)
scaffold0130 (306-351)||(6277-6321)
scaffold0130 (306-351)||(8276-8320)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (196-342)||(51339-51492)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (161-342)||(8239-8426)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (161-342)||(174524-174711)
scaffold0021 (297-342)||(121569-121614)
scaffold0021 (257-342)||(136665-136752)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (244-342)||(1306-1407)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (161-342)||(8704-8890)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (4-94)||(2913-3003)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (297-342)||(5148-5193)
[»] scaffold0292 (3 HSPs)
scaffold0292 (297-342)||(3230-3275)
scaffold0292 (297-342)||(10267-10312)
scaffold0292 (161-240)||(210-290)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (297-342)||(33-78)
scaffold0175 (161-342)||(33881-34068)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (297-342)||(38564-38609)
scaffold0145 (297-342)||(32279-32324)
scaffold0145 (297-342)||(32745-32790)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (297-342)||(15917-15962)
scaffold0120 (257-342)||(33227-33314)
scaffold0120 (257-342)||(45691-45778)
scaffold0120 (257-342)||(17600-17686)
scaffold0120 (32-183)||(20055-20197)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (297-368)||(1842-1913)
scaffold0621 (297-368)||(6259-6330)
scaffold0621 (295-342)||(8219-8266)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (161-342)||(12972-13157)
scaffold0193 (98-183)||(9346-9431)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (297-368)||(4971-5041)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (297-368)||(3463-3533)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (54-181)||(29479-29606)
scaffold0205 (306-362)||(29326-29382)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (257-342)||(24165-24252)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (297-339)||(6397-6439)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (297-339)||(12641-12683)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (297-342)||(1150-1195)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (297-342)||(6341-6386)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (244-342)||(6571-6672)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (297-342)||(8383-8428)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (297-342)||(10412-10457)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (297-342)||(11802-11847)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (297-342)||(8881-8926)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (297-342)||(20428-20473)
scaffold0305 (267-362)||(4649-4743)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (297-342)||(5397-5442)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (297-342)||(21848-21893)
scaffold0228 (19-183)||(18658-18813)
scaffold0228 (306-360)||(18907-18962)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (297-342)||(16912-16957)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (244-342)||(46059-46160)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (297-342)||(47043-47088)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (297-342)||(10075-10120)
scaffold0088 (196-280)||(20734-20819)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (297-342)||(52302-52347)
scaffold0075 (257-342)||(53830-53917)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (297-342)||(1611-1656)
scaffold0016 (1-72)||(207856-207927)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (156-220)||(205235-205297)
scaffold0014 (267-323)||(205333-205389)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (297-342)||(30076-30121)
scaffold0013 (19-183)||(2698-2853)
scaffold0013 (306-360)||(2947-3001)
scaffold0013 (306-362)||(73856-73911)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (244-342)||(129658-129759)
scaffold0010 (297-342)||(117949-117994)
scaffold0010 (43-183)||(241966-242105)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (297-342)||(161431-161476)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (161-342)||(4609-4794)
[»] scaffold0044 (5 HSPs)
scaffold0044 (19-183)||(12829-12984)
scaffold0044 (19-183)||(19113-19268)
scaffold0044 (306-360)||(12680-12735)
scaffold0044 (306-343)||(18981-19019)
scaffold0044 (306-355)||(62042-62089)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (295-342)||(76-123)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (161-340)||(1045-1234)
scaffold0106 (297-342)||(15530-15575)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (303-342)||(39006-39045)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (257-342)||(103912-103999)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (257-342)||(32286-32373)
scaffold0034 (306-355)||(16941-16988)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (306-368)||(132441-132503)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (32-183)||(228411-228553)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (161-242)||(1225-1306)
scaffold0598 (306-342)||(1333-1369)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (289-342)||(2460-2514)
scaffold0247 (304-342)||(18350-18388)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (297-342)||(786-831)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (306-359)||(9114-9165)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (297-342)||(11197-11242)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (244-342)||(8340-8441)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (244-342)||(29036-29137)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (297-338)||(37112-37153)
scaffold0141 (306-362)||(14649-14704)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (297-342)||(10058-10103)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (297-338)||(77659-77700)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (299-342)||(304-347)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (56-150)||(531-626)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (19-78)||(3901-3960)
scaffold0525 (306-362)||(4406-4461)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (306-368)||(31843-31905)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (306-367)||(3420-3481)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (26-108)||(26822-26904)
[»] scaffold0012 (5 HSPs)
scaffold0012 (306-352)||(25245-25290)
scaffold0012 (98-183)||(25065-25150)
scaffold0012 (298-342)||(225240-225284)
scaffold0012 (306-362)||(189939-189994)
scaffold0012 (314-342)||(5021-5049)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (306-359)||(1677-1728)
scaffold0546 (306-359)||(6517-6568)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (297-342)||(12321-12366)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (257-340)||(16344-16429)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (25-183)||(19484-19641)
scaffold0242 (25-183)||(25658-25815)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (297-342)||(2966-3011)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (306-359)||(36086-36137)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (306-359)||(11579-11630)
scaffold0109 (19-78)||(35968-36027)
scaffold0109 (306-359)||(6739-6790)
scaffold0109 (306-362)||(36526-36581)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (297-342)||(66294-66338)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (297-342)||(25699-25744)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (161-240)||(1224-1303)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (307-359)||(146-196)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (306-342)||(3422-3458)
scaffold0628 (306-342)||(7982-8018)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (297-341)||(6360-6404)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (257-342)||(2427-2517)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (19-70)||(12451-12502)
scaffold0349 (306-362)||(11936-11991)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (297-336)||(1730-1769)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (257-337)||(2079-2161)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (306-362)||(53-108)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (306-362)||(9366-9421)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (98-183)||(9761-9846)
[»] scaffold0372 (2 HSPs)
scaffold0372 (306-362)||(5636-5691)
scaffold0372 (38-78)||(5146-5186)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (306-355)||(15118-15165)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (306-362)||(20741-20796)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (26-103)||(4984-5061)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (306-362)||(33223-33278)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (306-355)||(9685-9732)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (297-342)||(6551-6598)
scaffold0420 (297-342)||(14005-14052)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (32-80)||(18398-18446)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (77-183)||(2718-2823)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (297-342)||(56048-56095)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 96)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 5 - 376
Target Start/End: Original strand, 22449285 - 22449656
Alignment:
Q  5 attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22449285 attgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctgctactattatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgct 22449384  T
Q  105 gaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22449385 gaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgg 22449484  T
Q  205 agctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctg 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22449485 agctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttaggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcattccctg 22449584  T
Q  305 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22449585 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcaatgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 22449656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 18182139 - 18182508
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18182139 aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgt 18182238  T
Q  104 tgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18182239 tgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatg-tttaaga-gatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctg 18182336  T
Q  204 gagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccct 303  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  18182337 gagctttgtactcaccacgaaggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatg-ttggggctcatgccat 18182435  T
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18182436 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgttgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 18182508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 376
Target Start/End: Original strand, 3472968 - 3473313
Alignment:
Q  31 ttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacatg 130  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3472968 ttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagttgatgttgaactccaaattattggatgtatatg 3473067  T
Q  131 agatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagca 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  3473068 agatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcataccctggagctttgtcctcaccacgatggagct 3473166  T
Q  231 tttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagag 329  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3473167 tttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagag 3473266  T
Q  330 gtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 376  Q
    || ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3473267 gtttagtttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 3473313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6151924 - 6151573
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    |||||||||||||||    || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6151924 tgttgttgtgatctgcccgtgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 6151825  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6151824 atatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatg 6151726  T
Q  226 gagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6151725 gagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccttgaattggtaccacatgcat 6151626  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6151625 ataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 6151573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 48 - 376
Target Start/End: Original strand, 22831449 - 22831774
Alignment:
Q  48 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatg 147  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  22831449 tgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgt-gaactccaaattattggatatatatgagatgaatattaagatg 22831547  T
Q  148 ttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgt 247  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |     
T  22831548 ttttagga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataacga 22831646  T
Q  248 tggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtc 347  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  22831647 tgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtt 22831745  T
Q  348 gcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22831746 gcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 22831774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 17678626 - 17678960
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17678626 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcgttataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgt 17678725  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||    
T  17678726 atatgagatgttgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatg 17678824  T
Q  226 gagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17678825 gagctttagctcaaaataaattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactaaactgttgggggatcatgctctgaattggtaccacatgcata 17678924  T
Q  324 taagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  17678925 taagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtc 17678960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 385
Target Start/End: Original strand, 20091520 - 20091873
Alignment:
Q  29 tgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtac 127  Q
    |||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  |     
T  20091520 tgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaat 20091619  T
Q  128 atgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgga 227  Q
    | ||||||||| ||  ||||||| |||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20091620 aagagatgatgtttttgatgttt-aagaag-tcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgga 20091717  T
Q  228 gcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataag 327  Q
    || || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20091718 gctttagctcaaaataatgttgggggctcatgccttgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataag 20091817  T
Q  328 aggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20091818 aggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 20091873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 362
Target Start/End: Original strand, 21788061 - 21788422
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  21788061 aattgatattacgaagtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgt 21788160  T
Q  104 tgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatg-ttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcca 201  Q
    ||||| |||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  21788161 tgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgtttttaaga-gatcgagtctatgcattagcatacatatgttgggggctcataccc 21788259  T
Q  202 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcat 298  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||||    
T  21788260 tggagcttagtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcat 21788359  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21788360 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtctcatagtcgagtcaa 21788422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Original strand, 42865253 - 42865614
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42865253 ctgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 42865352  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  42865353 acataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 42865451  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    ||||||||| ||||||| ||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42865452 tggagcattagctcaaactagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 42865551  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42865552 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 42865614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 8761648 - 8761999
Alignment:
Q  1 atgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatg 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || || || || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||           
T  8761648 atgaattgataattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatgagtctatacaagatgat------- 8761740  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcata-catttgttgggggctc 195  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8761741 --gttgaactccaaattattggatgtatattgagatgtttattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatgttgggggctc 8761838  T
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc 294  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |    
T  8761839 atgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttggggtc 8761938  T
Q  295 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 356  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  8761939 tcatgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcg 8761999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21714623 - 21714264
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21714623 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 21714524  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  21714523 aaataagagatgatgattgtgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 21714426  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || |||| |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21714425 tggagctttagctc-aaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 21714327  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21714326 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 21714264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21022705 - 21022488
Alignment:
Q  28 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattgg--atgt 125  Q
    |||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  21022705 ttgttgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatat 21022606  T
Q  126 acatgagatgatga-ttaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  21022605 atatgagatgataatttaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgtt-ggggctcatgccctagagctttgtcctcaccacgat 21022508  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataa 244  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  21022507 ggagcattagctcaaaataa 21022488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 385
Target Start/End: Original strand, 22468715 - 22469102
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||| |||| ||     
T  22468715 aattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 22468814  T
Q  104 tgaac----tccaaattattgga-tgtacatgagatgat--gattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctca 196  Q
    ||||     |||||||| ||||| | || | ||| |  |  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22468815 tgaagatgttccaaatttttggactatatacgaggttgtttgattaagatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatatatttgttgggggctca 22468912  T
Q  197 tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgggg 293  Q
    |||| |||||||| |||| || || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||    
T  22468913 tgccctggagcttagtacccaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatggggg 22469012  T
Q  294 ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  22469013 ctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgaagaaagatg-ttaagatgct 22469102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48603239 - 48603026
Alignment:
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48603239 gagatgatgattatgatgttt-aaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagc 48603142  T
Q  230 atttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aata--tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataa 326  Q
     || ||||||| ||  | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48603141 tttagctcaaattagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacctttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataa 48603042  T
Q  327 gaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  48603041 gaggtctaagttgcat 48603026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 3705080 - 3705302
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga-tgattaggatg 99  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| || ||||    
T  3705080 atgaattgttgttatgaaattttgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgattgaataagatg 3705179  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcat 197  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3705180 ttgttgagctccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcat 3705279  T
Q  198 gccatggagctttgtactcacca 220  Q
    ||| ||||||||| | |||||||    
T  3705280 gccctggagctttctcctcacca 3705302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 22131229 - 22131441
Alignment:
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22131229 gagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagc 22131326  T
Q  230 atttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataag 327  Q
     || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  22131327 tttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgaatataag 22131426  T
Q  328 aggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||    
T  22131427 aggtctaagttgcat 22131441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 45489759 - 45489977
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  45489759 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctattatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgt 45489857  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45489858 tgttgagctccaaattaatggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatg 45489955  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  45489956 ccctggagctttgtcctcacca 45489977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 24783126 - 24783290
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24783126 attaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatgaaatccaaattat 24783225  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24783226 tggatgtataagagatttgatgattaagatgttt--agatgattgagttcatgcattagcatacatt 24783290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 33050045 - 33050242
Alignment:
Q  5 attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgtt 104  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| ||||    
T  33050045 attgttattatgaaattatgaagttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtttatacatgatgaataagatgttgtt 33050144  T
Q  105 gaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatg 203  Q
    || ||||||||||||||||| | | ||||| |||        |||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  33050145 gagctccaaattattggatgcatattgaga-gat--------tgttttagattgattgagtccatgtattagcatac--ttgttgggggctcatgccctg 33050233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 45310395 - 45310602
Alignment:
Q  12 ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactcc 111  Q
    ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||||    
T  45310395 ttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgttgttgaactcc 45310493  T
Q  112 aaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctt 209  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  45310494 aaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcactagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctt 45310591  T
Q  210 tgtactcacca 220  Q
    ||| |||||||    
T  45310592 tgtcctcacca 45310602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 18393992 - 18394199
Alignment:
Q  12 ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactcc 111  Q
    ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| ||||    
T  18393992 ttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgttgttgagctcc 18394090  T
Q  112 aaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctt 209  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||    
T  18394091 aaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattaagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgctctggaactt 18394188  T
Q  210 tgtactcacca 220  Q
    ||| |||||||    
T  18394189 tgtcctcacca 18394199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 284 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21022396 - 21022305
Alignment:
Q  284 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21022396 atgttggggcctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtccatgatgaatgatgtt 21022305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34509726 - 34509516
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | |||| |||| ||    
T  34509726 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcattgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggtccttgat 34509628  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgt 354  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34509627 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcacattgt 34509529  T
Q  355 cgagtcaatgatg 367  Q
    |||||||| ||||    
T  34509528 cgagtcaaagatg 34509516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21313185 - 21313044
Alignment:
Q  42 ttatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatga 139  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||    
T  21313185 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatga 21313086  T
Q  140 ttaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21313085 ttaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 21313044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 342
Target Start/End: Original strand, 41781782 - 41781859
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41781782 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatacatataagaggtctaatttgcat 41781859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 38801598 - 38801750
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttg 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| |  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |    
T  38801598 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattaactcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgg 38801697  T
Q  291 gggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801698 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38801750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20248134 - 20248008
Alignment:
Q  244 atgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 341  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248134 atgttggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 20248035  T
Q  342 tttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
     | |||||| |||||||||||| |||||    
T  20248034 -tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 20248008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21709798 - 21709721
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21709798 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 21709721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33680860 - 33680734
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33680860 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 33680761  T
Q  341 atttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 367  Q
    | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  33680760 a-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 33680734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21022439 - 21022374
Alignment:
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaa 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21022439 atggagctttgtactcaccacgatggagcattaactcaaaataatgttggggcctcatgccctgaa 21022374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 27250905 - 27251091
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atg 259  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  | ||||  | ||||| |||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||    
T  27250905 gagtccatgcattagcattcattgataggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatg 27251004  T
Q  260 ccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
     |||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251005 tcctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 27251091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20134986 - 20134941
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20134986 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20134941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 280
Target Start/End: Original strand, 20847330 - 20847450
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg-ttggggccttat 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||||| | ||    
T  20847330 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgattggggcttgat 20847428  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatact 280  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  20847429 gccctggaagtatattaatact 20847450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Original strand, 22922136 - 22922237
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922136 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 22922235  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  22922236 at 22922237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21753887 - 21753800
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgttt-ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21753887 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgaggggttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21753800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 362
Target Start/End: Original strand, 24783366 - 24783424
Alignment:
Q  303 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  24783366 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtctcatggtcgagtcaa 24783424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Original strand, 50210534 - 50210604
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  50210534 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtataagttgca-tagtcacattgtcgagtcaaagatga 50210604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 362
Target Start/End: Original strand, 20847459 - 20847516
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  20847459 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgtattgtcgagtcaa 20847516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 431543 - 431498
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431543 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 431498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 13213204 - 13213249
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213204 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13213249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16361731 - 16361686
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361731 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16361686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20916075 - 20916030
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20916075 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20916030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21840451 - 21840406
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840451 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21840406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 342
Target Start/End: Original strand, 22123429 - 22123490
Alignment:
Q  281 aatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123429 aatacgttgggggcttgtgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22123490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22532074 - 22532029
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532074 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22532029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29776463 - 29776418
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776463 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 29776418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 36819335 - 36819490
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||         ||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  36819335 attaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc---------tgaataagttgatgatgaactccaaattat 36819425  T
Q  119 tggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| |  |||  | ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36819426 tggatgtataagtgatttaatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 36819490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21172831 - 21172777
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21172831 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 21172777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21312947 - 21312893
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21312947 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 21312893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 41050317 - 41050404
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41050317 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 41050404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 14295901 - 14295939
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295901 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14295939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 15860380 - 15860418
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860380 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15860418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 16275753 - 16275791
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275753 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16275791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20916174 - 20916093
Alignment:
Q  159 ttgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 240  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  20916174 ttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 20916093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21341910 - 21341872
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341910 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21341872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21346774 - 21346736
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346774 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21346736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21477440 - 21477402
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21477440 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21477402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 342
Target Start/End: Original strand, 27161824 - 27161886
Alignment:
Q  281 aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27161824 aatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagagatctaagttgcat 27161886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 16368608 - 16368653
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16368608 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 16368653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16758451 - 16758406
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16758451 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 16758406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 342
Target Start/End: Original strand, 20454907 - 20454944
Alignment:
Q  305 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454907 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20454944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40388973 - 40388932
Alignment:
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40388973 cctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 40388932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 45575231 - 45575276
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45575231 atgccccgtattggtaccacatgcatataataggtctaagttgcat 45575276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31612091 - 31612055
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612091 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31612055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Original strand, 52928294 - 52928365
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  52928294 atgccctagattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 52928365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1010803 - 1010744
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1010803 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 1010744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21161539 - 21161504
Alignment:
Q  307 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21161539 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21161504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 36819584 - 36819638
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36819584 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 36819638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Original strand, 16080536 - 16080622
Alignment:
Q  97 atgatgttgaactccaaattattggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||  | |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  16080536 atgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgacttgatgattaagatgtttt--gttgatagggtccatgcattagcatacatt 16080622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22237480 - 22237382
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||  |||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237480 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacattcatataagaggtctaagttg 22237382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 50622226 - 50622315
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  50622226 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 50622315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 21896579 - 21896624
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21896579 atgccctggattggtaccacatgcacataagaggtttaagttgcat 21896624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29297921 - 29297880
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29297921 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagtt 29297880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40129389 - 40129356
Alignment:
Q  309 ggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40129389 ggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 40129356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21161668 - 21161588
Alignment:
Q  162 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctca-tgccatggagctttgtactcaccatga-tggagcatttgctcaaa 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  21161668 agtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgattggagctttagctcaaa 21161588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21706978 - 21706942
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21706978 attggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 21706942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21711520 - 21711484
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21711520 attggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 21711484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Original strand, 3705340 - 3705432
Alignment:
Q  269 tatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3705340 tatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-gttggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 3705432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21022485 - 21022442
Alignment:
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa 244  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21022485 atggagctttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaaataa 21022442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23763259 - 23763120
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  23763259 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 23763161  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  23763160 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 23763120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 340
Target Start/End: Original strand, 35261359 - 35261402
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35261359 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgc 35261402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52639110 - 52639053
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  52639110 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaatg 52639053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 343
Target Start/End: Original strand, 16080691 - 16080729
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16080691 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcatt 16080729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26064778 - 26064689
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  26064778 atgccctggaagtatattaatacttaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 26064689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 50614398 - 50614487
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  50614398 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 50614487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1010292 - 1010237
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1010292 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 1010237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 1925691 - 1925746
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1925691 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 1925746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 16375995 - 16376050
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16375995 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 16376050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 18394235 - 18394291
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18394235 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 18394291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20138151 - 20138008
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--t 129  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  20138151 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 20138060  T
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  20138059 gataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 20138008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 20924705 - 20924760
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20924705 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 20924760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33797088 - 33797033
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgc-attgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33797088 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcaattgtcgagtcaa 33797033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 39244456 - 39244511
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39244456 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 39244511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 39248011 - 39248066
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39248011 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 39248066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 45490013 - 45490069
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45490013 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 45490069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 46975478 - 46975393
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  46975478 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 46975393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 113)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18907212 - 18906837
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18907212 atgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatga 18907113  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907112 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 18907013  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18907012 ctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcatgc 18906913  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18906912 cctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 18906837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Original strand, 16523425 - 16523774
Alignment:
Q  27 gttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgta 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523425 gttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgta 16523524  T
Q  127 catgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 226  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16523525 tatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatgg 16523623  T
Q  227 agcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatata 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523624 agcatttgctcaaaataattgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatata 16523723  T
Q  326 agaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16523724 agaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 16523774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21766796 - 21766434
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  21766796 atgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 21766697  T
Q  101 tgttgaac-tccaaattattggat--gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21766696 tgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagcccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 21766598  T
Q  198 gccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctca 297  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21766597 gccctggagttttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccttgaaagtatattaatactataatgttgggggctca 21766498  T
Q  298 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21766497 tgccctgaattggcaccacatgcatataataggtataagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 21766434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18180570 - 18180235
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180570 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgt 18180471  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||    
T  18180470 atatgagatgttgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatg 18180372  T
Q  226 gagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 324  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18180371 gagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 18180272  T
Q  325 aagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18180271 aagaggtttaggttgca-ttgtcacattgtcgagtcaa 18180235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Original strand, 21740072 - 21740426
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21740072 tgttgttgtgatctgcccgtgttgctattgttatttaactatgttgcacgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 21740171  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21740172 atatgagatgaagattaagatgttttagga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatg 21740270  T
Q  226 gagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa------tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatg 319  Q
    ||||||  |||||||||||   ||||| || |||||||||| |||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21740271 gagcatcagctcaaaataacaatgggggctcatgccctgaaggtatattaatactaaaatattaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatg 21740370  T
Q  320 catataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21740371 catataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagttaatgatgaatgatgtt 21740426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 96 - 376
Target Start/End: Original strand, 18692022 - 18692302
Alignment:
Q  96 gatgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18692022 gatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctt 18692120  T
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  18692121 atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggc 18692220  T
Q  295 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18692221 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 18692302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 15894479 - 15894852
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15894479 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaacttattggatat 15894578  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| || || ||||    
T  15894579 ataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctagagcttagtacacaacacgatg 15894677  T
Q  226 gagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15894678 gagcattagctc-aaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 15894776  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtttaagatgcttatgttgatgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15894777 ataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgttgagtcaaatgatgaaagatgtttaagatgc-tatgttgaagatgt 15894852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 22408319 - 22408668
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||             
T  22408319 atgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatactgcttttgttatttaaccaagttgcacgagtctatacaagaggac-------- 22408410  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22408411 -gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgat---taagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgtc 22408505  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
     |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  22408506 ctggagctttgtcgtcaccacgatggagcatttgctcaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgataggggctcat 22408605  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22408606 gccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 22408668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 158 - 362
Target Start/End: Original strand, 21830612 - 21830815
Alignment:
Q  158 attgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctta 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21830612 attgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctta 21830711  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21830712 tgccctgaaagtatattaatactataatgttggaggttcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-ttgtcgcattgtcga 21830810  T
Q  358 gtcaa 362  Q
    |||||    
T  21830811 gtcaa 21830815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Original strand, 25642227 - 25642587
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaact-ccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25642227 ctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattggat 25642326  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  25642327 aaataagagatgatgattaagatgttt-aaga-gatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 25642424  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25642425 tggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 25642524  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25642525 atataagtggtataagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 25642587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19863055 - 19862695
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19863055 ctgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 19862956  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  19862955 aaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacataagttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 19862858  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19862857 tggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 19862758  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19862757 atataagaggtctaagttgc-ttagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 19862695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 385
Target Start/End: Original strand, 22334955 - 22335297
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  22334955 tatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggatgaataagagatgatgatt 22335054  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| || |||||||     
T  22335055 aagatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtacgcaacacgatggagctttagctcaaat 22335152  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22335153 tagcgatgggggcttttgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 22335252  T
Q  339 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||| | |||||||  ||||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  22335253 gca-tagtcgcataatcgagtcaaagataaaagatg-ttaagatgct 22335297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19873197 - 19872837
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  19873197 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttaaaccttcaaattattggat 19873098  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  19873097 aaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacataatttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 19873000  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19872999 tggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 19872900  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19872899 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 19872837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22432326 - 22431974
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22432326 ctgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgtat 22432227  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||    
T  22432226 aaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggggctcatgctctggaactttgtactcaacacga 22432129  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22432128 tggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 22432029  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  22432028 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcaagtcaatgatgaaagatgtt 22431974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22438876 - 22438524
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22438876 ctgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgtat 22438777  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||    
T  22438776 aaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggggctcatgctctggaactttgtactcaacacga 22438679  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22438678 tggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 22438579  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  22438578 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcaagtcaatgatgaaagatgtt 22438524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20907997 - 20908221
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  20907997 atgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatga 20908096  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20908097 tgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagattgttttagattgatagagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatg 20908196  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||    
T  20908197 ccctggagctttgtcctcactatga 20908221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 22074227 - 22074547
Alignment:
Q  1 atgaattgatatt-atgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatg 99  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || || || || | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||             
T  22074227 atgaattgataatcatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttattattatttaactatgatgcatgagtctatacaagatg--------- 22074317  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074318 atgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtgcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgc 22074416  T
Q  200 catggagctttgtactcaccatgatggagcatt-tgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    | |||||| |||| ||||||| ||| |||| || | ||||  |  ||      ||||||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  22074417 cctggagccttgtcctcaccacgattgagctttgtcctcaccacgat------gcctta-------aaagtatattaatactatgatgttgggggctcat 22074503  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074504 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22074547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 27567625 - 27567846
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||  |||     
T  27567625 atgaattgttgttatgaaattacgatgtttttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgtatgagtctatacatgatgaataacatgt 27567724  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27567725 tgttgagctccaagttattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatg 27567824  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  27567825 ccctggagctttgtcctcacca 27567846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 27553612 - 27553808
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||     
T  27553612 tgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttctttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgc 27553711  T
Q  126 aca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27553712 atattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 27553808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 16965367 - 16965694
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac----tccaaattattggatgtacatgagatgatg 138  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||| || | ||||||      ||||||||||||||   | || |||||||     
T  16965367 tatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgttccaaattattggacaaatataagatgata 16965466  T
Q  139 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 238  Q
    ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| || ||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||    
T  16965467 attgagatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagtattcatatgatgggggcttatgctctggagcttagtactcaccacgatggagctttagctca 16965564  T
Q  239 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 337  Q
    |||||| | | ||| ||  ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16965565 aaataacgattggggctcttgccctgaa-gtatattaatacttattacgttgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 16965663  T
Q  338 tgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 369  Q
    |||| | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16965664 tgca-tagtctcatagtcgagtcaatgatgaa 16965694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19790795 - 19791013
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  19790795 atgaattgttgttatgaaattataatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgt 19790893  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19790894 tgttgagctccaaattactggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagttcatgcattagcatac--ttgttgggggctcatg 19790991  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  19790992 ccctggagctttgtcctcacca 19791013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 15041587 - 15041794
Alignment:
Q  22 atgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattg 120  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15041587 atgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtctttataagatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattg 15041686  T
Q  121 g-atgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacc 219  Q
    | || || | ||| |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |    
T  15041687 gtatataaaagagttgatgattgagat-ttttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaac 15041784  T
Q  220 atgatggagc 229  Q
    | ||||||||    
T  15041785 acgatggagc 15041794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 360
Target Start/End: Original strand, 31164964 - 31165213
Alignment:
Q  108 ctccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgtttt-aagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggag 206  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||||| |   ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31164964 ctccaaattactggatatataagagatgattaacgagatgtttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatt-gttgggggctcatgccctggag 31165061  T
Q  207 ctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgt 305  Q
    ||| ||||||| || |||||||| || |||| || ||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||    
T  31165062 cttagtactcaacacgatggagctttagctcgaa-tagcgatgggggctcatgccctgaa-gtatattaatacttatagcgatgggggctcatgccctgt 31165159  T
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  31165160 attggtaccacatgcatatgagatgtctaggttgca-tagtcgcattgtcgagtc 31165213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 27325626 - 27325808
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| |||   ||||    
T  27325626 atgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattgaaatga 27325725  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27325726 tgatgaactccaaattattggatgtataagagatttaatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 27325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17804277 - 17804113
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17804277 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattat 17804178  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17804177 tggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 17804113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35245530 - 35245343
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  35245530 gagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 35245432  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245431 tgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 35245343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 16960271 - 16960404
Alignment:
Q  234 gctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 332  Q
    ||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16960271 gctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaa-gtatattaatacttattacgttgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 16960369  T
Q  333 taagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||| |||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  16960370 taagctgca-tagtctcatagtcgagtcaatgatga 16960404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 23657437 - 23657638
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | | ||||||||||  || || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||          |||| ||| |||     
T  23657437 atgaattgttctgatgaaattataatgctgctgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgag----------atgaatag-atgt 23657525  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagat-gttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  23657526 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttaggttgattgagtccatgcattagcatacctt-gttgggggctcatg 23657624  T
Q  199 ccatggagctttgt 212  Q
    || |||||||||||    
T  23657625 ccctggagctttgt 23657638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22831407 - 22831241
Alignment:
Q  202 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctc-at 298  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||| |  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||   ||||||  ||    
T  22831407 tggagctttgtactcacgacgttggagcattagctaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatg---ggggcttgat 22831311  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  22831310 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaatgatga 22831241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1561268 - 1561061
Alignment:
Q  139 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 237  Q
    |||||| |||||||||| | | || |||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  1561268 attaagttgttttaagagg-tcgaatccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc 1561171  T
Q  238 aaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 332  Q
    ||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   |    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561170 aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgagaagggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 1561071  T
Q  333 taagttgcat 342  Q
    ||||||||||    
T  1561070 taagttgcat 1561061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 360
Target Start/End: Original strand, 20638459 - 20638663
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  20638459 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgacgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgat 20638558  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgt 354  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  20638559 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagttgcattgt 20638657  T
Q  355 cgagtc 360  Q
    ||||||    
T  20638658 cgagtc 20638663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 25767194 - 25767358
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||  ||   |||||| |||| ||||||||||    
T  25767194 attaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaactaagttgcatgagtctgaataagatatttgaaatgatgatgaaatccaaattat 25767293  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25767294 tggatgtataagagatttgatggttaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 25767358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 284 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2077075 - 2077017
Alignment:
Q  284 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2077075 atgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 2077017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29060485 - 29060300
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  29060485 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 29060387  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060386 gccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 29060300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Original strand, 25611925 - 25612090
Alignment:
Q  183 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 280  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25611925 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaatttagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 25612024  T
Q  281 aatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
     | ||   | | ||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25612025 caaatagcgatgggggcttgatgccgtatattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25612090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11185479 - 11185271
Alignment:
Q  139 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 237  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  11185479 attaagttgttttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggatttttgtactcaccgcgttggagcattagctc 11185382  T
Q  238 aaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 331  Q
    ||||| |  | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185381 aaaattagcgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggctttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 11185282  T
Q  332 ctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||    
T  11185281 ctaagttgcat 11185271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Original strand, 22080995 - 22081121
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080995 atgttgggggcttgatgccctagaagtatattaatactaattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 22081094  T
Q  341 atttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 367  Q
    | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  22081095 a-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 22081121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 331
Target Start/End: Original strand, 20908252 - 20908317
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 331  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20908252 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 20908317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 27325902 - 27325955
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27325902 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtc 27325955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 19773996 - 19774041
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773996 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19774041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 22780543 - 22780588
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780543 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22780588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 25629530 - 25629714
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  25629530 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 25629628  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25629629 gccctggaagtatattaatacttatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataggaggtctaaattgcat 25629714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 28496788 - 28496833
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496788 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 28496833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 29809199 - 29809244
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29809199 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 29809244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 342
Target Start/End: Original strand, 16920847 - 16920993
Alignment:
Q  202 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa-taatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||| ||     
T  16920847 tggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaatagcaatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggtctt 16920946  T
Q  297 -atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16920947 gatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 16920993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 360
Target Start/End: Original strand, 15041803 - 15041873
Alignment:
Q  289 tggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  15041803 tggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatatgagatgtctaggttgca-tagtcgcattgtcgagtc 15041873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1595333 - 1595288
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595333 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1595288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Original strand, 4738725 - 4738846
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctca-tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |   | ||||| ||||||    
T  4738725 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaact--cgatgggggcttatg 4738822  T
Q  260 ccctgaaagtatattaatactaata 284  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  4738823 -cctgacaatatattaatactaata 4738846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23992244 - 23992199
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992244 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23992199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 25603707 - 25603752
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25603707 atgccctatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25603752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25644136 - 25644091
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644136 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25644091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34963187 - 34963142
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963187 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 34963142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4186315 - 4186199
Alignment:
Q  166 catgtattagcatacatttgttgggggctca-tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctg 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |   | ||||| |||||| ||||    
T  4186315 catgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaact--cgatgggggcttatg-cctg 4186219  T
Q  265 aaagtatattaatactaata 284  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  4186218 acagtatattaatactaata 4186199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 340
Target Start/End: Original strand, 17288112 - 17288155
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17288112 atgccctgtattggtaccacatgtatataagaggtctaagttgc 17288155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17804016 - 17803962
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17804016 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 17803962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Original strand, 19303812 - 19303882
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 368  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||    
T  19303812 atgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcatattgtcgagtcaaagatga 19303882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20593623 - 20593553
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 368  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||    
T  20593623 atgccctggtttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgttgagtcaaagatga 20593553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 27333448 - 27333518
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt-gtcgagtcaatgatg 367  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  27333448 atgccctggattgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattcgtcgagtcaaagatg 27333518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 27394188 - 27394258
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt-gtcgagtcaatgatg 367  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  27394188 atgccctggattgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattcgtcgagtcaaagatg 27394258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 3852407 - 3852445
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852407 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3852445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 8227773 - 8227811
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8227773 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8227811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 342
Target Start/End: Original strand, 20557254 - 20557316
Alignment:
Q  281 aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20557254 aatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccatatgcatataagaggtctaagttgcat 20557316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 339
Target Start/End: Original strand, 30677014 - 30677056
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30677014 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 30677056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 239
Target Start/End: Original strand, 31155466 - 31155644
Alignment:
Q  54 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||     |||||||||||||  ||  |  || | || ||||||||||| ||    
T  31155466 tgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatgtt-----ccaaattattggac-tatttacgaagttgtttaagatgttt-aa 31155558  T
Q  154 gatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctca-tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaa 239  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  31155559 gatg-tcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaa 31155644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12706757 - 12706614
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--t 129  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  12706757 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 12706666  T
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12706665 gataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 12706614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19652048 - 19651947
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19652048 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagagatttaagttgc 19651949  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  19651948 at 19651947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 19848343 - 19848388
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19848343 atgccccgtattggtaccacatgcatatgagaggtctaagttgcat 19848388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 20361234 - 20361279
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20361234 atgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaaattgcat 20361279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 4738854 - 4738890
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738854 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 4738890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20076550 - 20076470
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076550 atgccctggaagtatattaatactaatagcgatgggggcttgatgccctcgattggtaccacatgcatataagaggtctaa 20076470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23019200 - 23019156
Alignment:
Q  298 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019200 tgccctggattagtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23019156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 21834903 - 21834941
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatct 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21834903 atgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatct 21834941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 342
Target Start/End: Original strand, 31155695 - 31155729
Alignment:
Q  308 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31155695 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31155729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 16448866 - 16448911
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448866 atgccctggattggtaccatatgcatataggaggtctaagttgcat 16448911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16741216 - 16741131
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16741216 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 16741131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18926690 - 18926657
Alignment:
Q  309 ggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18926690 ggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18926657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Original strand, 19791049 - 19791143
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19791049 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagattgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 19791143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20108933 - 20108888
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20108933 atgccctggattggtaccacatgcatttaagaggtttaagttgcat 20108888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 22430056 - 22430117
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 80  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  22430056 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatgagtct 22430117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 25135949 - 25136000
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25135949 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 25136000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Original strand, 27553844 - 27553938
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27553844 agtatattaatactatgatgttgggggctcatgccttg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 27553938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 9100904 - 9100940
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9100904 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 9100940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13019278 - 13019242
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13019278 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 13019242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18456510 - 18456478
Alignment:
Q  310 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456510 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18456478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18461670 - 18461638
Alignment:
Q  310 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461670 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18461638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12496379 - 12496336
Alignment:
Q  29 tgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgc 72  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  12496379 tgttgtgatctgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgc 12496336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19668211 - 19668124
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatacta-atatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||  |||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19668211 atgccctggaagtatattaatactttatacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatccatataagaggtttaagttgcat 19668124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22863026 - 22862967
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  22863026 attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 22862967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 239
Target Start/End: Original strand, 25603601 - 25603644
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaa 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25603601 atgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaa 25603644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Original strand, 34298681 - 34298820
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  34298681 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 34298779  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  34298780 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 34298820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 4643003 - 4643041
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4643003 gtattggtacgacatgcatataagaggtctaaattgcat 4643041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Original strand, 1588008 - 1588055
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  1588008 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 1588055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1644079 - 1644024
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1644079 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 1644024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8243402 - 8243347
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8243402 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 8243347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11566431 - 11566376
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11566431 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 11566376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 12619379 - 12619434
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12619379 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 12619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14471782 - 14471727
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14471782 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14471727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16623923 - 16623868
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16623923 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 16623868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19870159 - 19870104
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19870159 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 19870104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21702116 - 21702069
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  21702116 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 21702069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22862515 - 22862460
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22862515 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 22862460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22948652 - 22948597
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22948652 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 22948597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22952608 - 22952553
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22952608 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 22952553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23394637 - 23394582
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23394637 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 23394582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23414474 - 23414419
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23414474 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 23414419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23871096 - 23871041
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23871096 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 23871041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23875052 - 23874997
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23875052 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 23874997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23989489 - 23989434
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23989489 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 23989434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27556232 - 27556177
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27556232 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 27556177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 27567882 - 27567938
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatatgtttggg-gctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27567882 agtatattaatactatgatgttggggagctcatgccctg-attggtaccacatgcata 27567938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 338
Target Start/End: Original strand, 4186118 - 4186150
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4186118 attggtaccacatgtatataagaggtctaagtt 4186150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 19773898 - 19773978
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 240  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  19773898 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaa 19773978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Original strand, 19848033 - 19848089
Alignment:
Q  23 tgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 79  Q
    |||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19848033 tgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 19848089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4531 - 4156
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4531 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 4432  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4431 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttataagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 4332  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  4331 ctggagctttgtactcaccacgatggaacatttgctcaaaataatgttgggggtgcatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgggggttcatgc 4232  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4231 cctgaattggtaccacatgtatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 4156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 30643307 - 30643682
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30643307 atgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctattcaagatgattaagatga 30643406  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643407 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 30643506  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  30643507 ctggaactttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgc 30643606  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30643607 cctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 30643682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 17926721 - 17927081
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  17926721 atgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 17926820  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17926821 tgttgaactccaaattattggatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagtatacatttgttgggggctcatgcc 17926919  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||    
T  17926920 ctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctggaggctcatgc 17927019  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17927020 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaat 17927081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 377347 - 376973
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  377347 tgttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtatatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 377248  T
Q  126 acat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  377247 atatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatccatttgcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 377149  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  377148 tggagctttagctcaaaataatgttgggggctcatgccttgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 377049  T
Q  324 taagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatg-aatgatgtttaagatgcttatgttgatgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  377048 taagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgt 376973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 20466054 - 20466434
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctataca--agatgattaggat 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||    
T  20466054 atgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatatataagatgattaagat 20466153  T
Q  99 gatgttgaactccaaattattggatgtacat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20466154 gatgttgaactccaaattattggatatatataagagatgattattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 20466252  T
Q  197 tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttgggg 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||| | ||    
T  20466253 tgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctgaaagtatattaatacaaaaataatgttggagg 20466352  T
Q  294 ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466353 ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 20466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 22010690 - 22011042
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||            
T  22010690 atgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgat-------- 22010781  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22010782 -gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctcatgcc 22010879  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  22010880 ctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggctcat 22010979  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  22010980 gccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgttgagtcaa 22011042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 16410269 - 16410638
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||  || ||||||||            
T  16410269 atgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttcactaagttgcatgagtcattataagatgat-------- 16410360  T
Q  101 tgttgaac-tccaaattattggat--gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcat 197  Q
     ||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16410361 -gttgaatatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatggttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 16410458  T
Q  198 gccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctc 296  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  16410459 gccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctc 16410558  T
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgag-tcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  16410559 atgccctgaattggtaccacattcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagttaaatgatgaaagatgtt 16410638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 15611484 - 15611754
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||            
T  15611484 atgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctggttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgat-------- 15611575  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611576 -gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtctta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 15611673  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 281  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611674 ctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 15611754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 16861341 - 16861700
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  16861341 atgaattgttgttatgaaat-ataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccgagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 16861439  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16861440 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatgtttt-aggtgattgagtccatgcattaacatacatatgttgggggcacatgcc 16861538  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     |||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  16861539 ctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatg 16861638  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16861639 ccctgaattgataccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcacattgtcgagtcaa 16861700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 15603032 - 15603302
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||            
T  15603032 atgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgat-------- 15603123  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603124 -gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtctta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 15603221  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 281  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603222 ctggagatttctactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 15603302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Original strand, 23776854 - 23777195
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  23776854 aattgatattaagaagtcatgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgt 23776953  T
Q  104 tgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccat 202  Q
    ||||| |||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23776954 tgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattgagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccct 23777052  T
Q  203 ggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgc 300  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  23777053 ggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatactcaataatgatgggggctcatgc 23777152  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23777153 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 23777195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16184796 - 16184464
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  16184796 tgttgttgtgatatgcttatgctgctattgttgtttaaccaacttgcatgattctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatac 16184697  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  16184696 ataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatg 16184598  T
Q  226 gagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    ||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16184597 gagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagaatattaatactcaaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcat 16184498  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcga 357  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16184497 ataagatgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcga 16184464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 20856441 - 20856801
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  20856441 atgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattatgctgctt-tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgt 20856539  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856540 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 20856639  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggctc 296  Q
    || |||||  |||| ||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  20856640 ccctggagtcttgtcctcacaacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacttaaactgttgggggctc 20856739  T
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  20856740 atgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtctcattgtcgagt 20856801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 39094940 - 39095302
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  39094940 atgaattgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgt 39095039  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaagatgttttaaga-tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| |||||||||||||| || | | || |||| ||||| ||||  ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39095040 tgttgagctccaaattattggctgcatattgggatgttgattgagattattttagattgattgagtctatgcattagcatacatatgttgggggctcatg 39095139  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    || |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  39095140 ccctggagcttagtcctcaccacgatgaagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcat 39095239  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39095240 gccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 39095302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 21168772 - 21169111
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    |||||||||||||||  |||| || || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21168772 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggata 21168871  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagt--ccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 222  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  21168872 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtttccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacg 21168970  T
Q  223 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21168971 atggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccatgtattagtaccacatgc 21169070  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21169071 atataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 21169111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 21162099 - 21162438
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    |||||||||||||||  |||| || || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21162099 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggata 21162198  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagt--ccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 222  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  21162199 cttaagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtttccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacg 21162297  T
Q  223 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaata-ctaat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21162298 atggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatacccaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 21162397  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21162398 atataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 21162438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19899154 - 19898852
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||||||    
T  19899154 tatgctgctattgatatttaactatgttgcatgaattgatataagatgatcaagacgatgttgaacctccaaattattggatacctaagagatgatgatt 19899055  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||     
T  19899054 aagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattcgctcaaat 19898956  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19898955 taacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggcgcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 19898856  T
Q  339 gcat 342  Q
    ||||    
T  19898855 gcat 19898852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19983170 - 19982809
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||  | | || |||||||||| ||||||||||| |||    
T  19983170 ctgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagattgtcaagacgatgttgaacctccaaattattagat 19983071  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || ||    
T  19983070 acataaaagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtagtcaacacga 19982972  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    ||||||| | ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19982971 tggagcactagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcaggccctgaattggtaccacatgc 19982872  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19982871 ctataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcattgatgaaagatg-ttaagatgct 19982809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24755790 - 24755577
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  24755790 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatac 24755691  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  24755690 ataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatg 24755592  T
Q  226 gagcatttgctcaaa 240  Q
    ||||||| |||||||    
T  24755591 gagcattagctcaaa 24755577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 19259632 - 19259872
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||     
T  19259632 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatgttgtacctccaaattattggata 19259731  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||| |||    
T  19259732 tatatgagatgataattaagatgttttaata-gattgagtccatgcagtagcatacatttgttgggggctcatgccctagaactttttcctcaccacgat 19259830  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaa 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19259831 ggagcattagctcaaaataatgttgggggctcatgccctgaa 19259872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 280
Target Start/End: Original strand, 17353984 - 17354237
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17353984 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 17354083  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || |||    
T  17354084 aataagagatgatgattatgatgttt-aagaa-atcgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctcatgccctagagctttgtactcaacacgat 17354181  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact 280  Q
    |||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  17354182 ggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatact 17354237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 44385023 - 44385207
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgc 260  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | | | | |||||||    
T  44385023 gagtccatgcattagcattcatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattaacgattgaggcttatgc 44385122  T
Q  261 cctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385123 cctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgcccttaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 44385207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 5866450 - 5866637
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  5866450 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 5866548  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866549 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 5866637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21249329 - 21249143
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  21249329 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 21249231  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249230 gccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21249143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21255167 - 21254981
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  21255167 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 21255069  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255068 gccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21254981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23913893 - 23913816
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23913893 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23913816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 290 - 373
Target Start/End: Original strand, 22873574 - 22873656
Alignment:
Q  290 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgat 373  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22873574 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgat 22873656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24755568 - 24755482
Alignment:
Q  290 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24755568 ggggctcaagccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 24755482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 284 - 374
Target Start/End: Original strand, 19259850 - 19259939
Alignment:
Q  284 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatg 374  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19259850 atgttgggggctcatgccctgaattggtaccacgtgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg 19259939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 45131172 - 45131359
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  45131172 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 45131270  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131271 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctctattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 45131359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 13597816 - 13597980
Alignment:
Q  184 tgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgt-tggggccttatgccctgaaagtatattaatact- 280  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |  |||||| | |||||||| ||||||| |||||||     
T  13597816 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaaattagcgactggggcttgatgccctggaagtataataatactc 13597915  T
Q  281 -aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
     |||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13597916 aaatagtgattggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13597980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21490960 - 21490753
Alignment:
Q  139 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 237  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| | || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21490960 attaagatgttttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcgtt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc 21490863  T
Q  238 aaaataatg-ttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 332  Q
    ||| ||  | ||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||| | ||   | ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21490862 aaattagcgattgtggcttgatgccctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgccccgtattggtaccacatgcatataaaaggtc 21490763  T
Q  333 taagttgcat 342  Q
    ||||||||||    
T  21490762 taagttgcat 21490753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 21389626 - 21389813
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |  | ||| | ||| |    
T  21389626 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaatttagcgatggcggcttga 21389724  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389725 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21389813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 21396156 - 21396343
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||| | ||| |    
T  21396156 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatggcggcttga 21396254  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctca-tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396255 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21396343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 21778952 - 21779139
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |  | ||| | ||| |    
T  21778952 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaatttagcgatggcggcttga 21779050  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21779051 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21779139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 21790649 - 21790836
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||| | ||| |    
T  21790649 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatggcggcttga 21790747  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctca-tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790748 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21790836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6520217 - 6520116
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520217 atgttgggggcttgatgccctgaaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 6520118  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  6520117 at 6520116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17140840 - 17140671
Alignment:
Q  183 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa--taatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaata 278  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  17140840 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaata 17140741  T
Q  279 ct---aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatat-aagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||   ||||  | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17140740 ctcaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataaagaggtctaagttgcat 17140671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 18818620 - 18818770
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttgg 291  Q
    ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||    
T  18818620 atgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatggg 18818718  T
Q  292 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818719 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18818770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23406183 - 23406135
Alignment:
Q  298 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406183 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgt 23406135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7372682 - 7372538
Alignment:
Q  202 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc- 296  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| || || ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |    | | |||| |      
T  7372682 tggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tattgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaacagcgatgggggattg 7372584  T
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372583 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 7372538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 18879545 - 18879590
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879545 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18879590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20536013 - 20535968
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536013 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20535968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 21919272 - 21919317
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919272 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21919317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31971104 - 31971059
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971104 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31971059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21673558 - 21673458
Alignment:
Q  244 atgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 341  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21673558 atgttggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgca 21673459  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  21673458 t 21673458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 14409785 - 14409830
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409785 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14409830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 16413696 - 16413741
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413696 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16413741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 17612408 - 17612453
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17612408 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17612453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 18678381 - 18678426
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678381 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18678426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 18717570 - 18717615
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18717570 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18717615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19896049 - 19896004
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896049 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19896004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31971222 - 31971123
Alignment:
Q  139 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 237  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  31971222 attaagttgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc 31971125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41597972 - 41597927
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41597972 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 41597927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 45291074 - 45291119
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45291074 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 45291119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22626542 - 22626472
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 368  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  22626542 atgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctatgttgca-tagtcacattgtcgagtcaaagatga 22626472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Original strand, 38855484 - 38855586
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa--tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |  || |||  |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855484 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaattacgttgagggcttgatgccctggattagtaccacatgcatataagaggtctaagttg 38855583  T
Q  340 cat 342  Q
    |||    
T  38855584 cat 38855586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 13508408 - 13508446
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13508408 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13508446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 242
Target Start/End: Original strand, 16199820 - 16199901
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 242  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16199820 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaat 16199901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 19937438 - 19937476
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937438 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19937476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26223687 - 26223649
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26223687 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 26223649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4083779 - 4083738
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4083779 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 4083738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 15203609 - 15203654
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15203609 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 15203654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 16231513 - 16231656
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--t 129  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  16231513 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 16231604  T
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16231605 gataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 16231656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21673446 - 21673401
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21673446 atgccctggattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 21673401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22874874 - 22874829
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22874874 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctatgttgcat 22874829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Original strand, 23761112 - 23761213
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |  ||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761112 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacatttagggcttgatgccatagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 23761211  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  23761212 at 23761213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Original strand, 26355929 - 26356030
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26355929 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatacaagaggtttaagttgc 26356028  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  26356029 at 26356030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32121585 - 32121548
Alignment:
Q  305 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121585 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 32121548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24352862 - 24352772
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24352862 atgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcat 24352772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22965516 - 22965478
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22965516 gtattggtaccacatgcatacaagaggtctaagttgcat 22965478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 25484657 - 25484695
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25484657 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 25484695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 983733 - 983774
Alignment:
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  983733 cctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 983774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 16092612 - 16092657
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16092612 atgccctggattggtaccacatgcatataacatgtctaagttgcat 16092657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 30309029 - 30309080
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30309029 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 30309080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 363
Target Start/End: Original strand, 15603304 - 15603351
Alignment:
Q  315 acatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15603304 acatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaat 15603351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 363
Target Start/End: Original strand, 15611756 - 15611803
Alignment:
Q  315 acatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15611756 acatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaat 15611803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 28649329 - 28649365
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28649329 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 28649365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20527497 - 20527358
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  20527497 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 20527399  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  20527398 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 20527358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22044888 - 22044809
Alignment:
Q  104 tgaactccaaattattggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22044888 tgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 22044809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 43251893 - 43251834
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  43251893 attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 43251834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21383721 - 21383675
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  21383721 tgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 21383675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15531900 - 15531815
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  15531900 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 15531815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 17055656 - 17055707
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17055656 attggtaccacatgcatacagga-gtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 17055707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 18863207 - 18863262
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18863207 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 18863262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21386902 - 21386847
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21386902 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 21386847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21410494 - 21410439
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21410494 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 21410439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21804986 - 21804931
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21804986 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 21804931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 21828576 - 21828631
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21828576 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 21828631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22111500 - 22111445
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22111500 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 22111445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23648633 - 23648580
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 79  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23648633 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 23648580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Original strand, 23847110 - 23847195
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  23847110 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 23847195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Original strand, 24445601 - 24445686
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagatga--tgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  24445601 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataaattgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 24445686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 30940639 - 30940694
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30940639 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 30940694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32598507 - 32598460
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  32598507 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 32598460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32605039 - 32604992
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  32605039 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 32604992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43251380 - 43251325
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43251380 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 43251325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Original strand, 17828677 - 17828732
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgtttt 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||    
T  17828677 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataggttgattaagatgtttt 17828732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Original strand, 18678140 - 18678196
Alignment:
Q  23 tgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 79  Q
    |||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18678140 tgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18678196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 21919176 - 21919255
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 240  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  21919176 gagtccatgcattagcattcatt-gttgcgggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaa 21919255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 32121815 - 32121759
Alignment:
Q  23 tgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 79  Q
    |||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32121815 tgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 32121759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15187 - 14815
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15187 atgaattgatattatgaagttatgctgt-gttgtgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagtgtatacaagatgattaagatga 15089  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15088 tgttgaactccaacttattgggtgtatatgagatgatgattaagatattttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca--cc 14991  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  14990 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaattgttgggggctcatgc 14891  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14890 cctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcgatgatgaatgatgtt 14815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 110)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 16488095 - 16488467
Alignment:
Q  3 gaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatg 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16488095 gaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 16488194  T
Q  103 ttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  16488195 ttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtacatgcattagcatacattcgtt-ggggctcatgccct 16488293  T
Q  203 ggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  16488294 ggagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcattccc 16488393  T
Q  303 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16488394 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgttgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 16488467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 16348679 - 16349038
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  16348679 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 16348778  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348779 tgttgaactctaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 16348877  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  16348878 ctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgc 16348977  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16348978 cctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 16349038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 16356967 - 16357326
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  16356967 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 16357066  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357067 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 16357165  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||   ||| | |||||||||||    
T  16357166 ctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggaggcttatgccctaaaagtatattaatactgtaatgctgggggctcatgc 16357265  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16357266 cctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 16357326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12570090 - 12569717
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12570090 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 12569991  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||| || ||||    
T  12569990 ataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttataccctggagcttagtactcaacacgatg 12569892  T
Q  226 gagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12569891 gagcattagctc-aaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 12569793  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtttaagatgcttatgttgatgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12569792 ataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtttaagatgc-tatgttgaagatgt 12569717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 376
Target Start/End: Original strand, 15121843 - 15122193
Alignment:
Q  28 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgta 126  Q
    ||||||| |||||  |||| || || ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15121843 ttgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatata 15121942  T
Q  127 catgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 226  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15121943 tatgagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgg 15122041  T
Q  227 agcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||| |||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15122042 agcattagctcaaaataacaatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 15122141  T
Q  324 taagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15122142 taagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcaagtcaatgatgaatgatgtt 15122193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15093873 - 15093499
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15093873 aattgatattatgaagtcatgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatgt 15093774  T
Q  104 tgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccat 202  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15093773 tgaacctccaaattattggatatataagagatgatgattaagatgtttttaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccct 15093675  T
Q  203 ggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgc 300  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |  ||||||||||    
T  15093674 ggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatggtggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgatgagggctcatgc 15093575  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15093574 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgta-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 15093499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 5338996 - 5339352
Alignment:
Q  1 atgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatg 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||           
T  5338996 atgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatgagtctatacaagatgat------- 5339088  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctca 196  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5339089 --gttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgattaaaatgttgattaagatgatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctca 5339186  T
Q  197 tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggct 295  Q
    |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  5339187 tgccctggagccttgtcatcaccacgatggagctttagctctaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggct 5339286  T
Q  296 catgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5339287 catgccctgaattggtaccacatgcatataaaaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 5339352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 43 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23843537 - 23843202
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  23843537 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgatt 23843438  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||     
T  23843437 aagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattggctcaaat 23843339  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23843338 taacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 23843239  T
Q  339 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23843238 gca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatgtt 23843202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 13813034 - 13813261
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13813034 atgaattgatattatgaagttttaatgttgtggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 13813133  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813134 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 13813232  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagc 229  Q
     || |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13813233 ctgaagctttgtcctcaccacgattgagc 13813261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 44675686 - 44675348
Alignment:
Q  48 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagat 146  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||    
T  44675686 tgctattgttatttaactatgttgcatgaatagatataagatgatcaagacgatgttgaacctccaaattactggatacataagagatgatgattaagat 44675587  T
Q  147 gttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg 246  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  44675586 gttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacg 44675488  T
Q  247 ttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 343  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44675487 atgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-t 44675389  T
Q  344 tgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44675388 agtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 44675348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13569579 - 13569227
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||  |||||  |||| || || ||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13569579 ctgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatgttcaacctccaaattattggat 13569480  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  13569479 acataagagatgatgattaatatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 13569381  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    ||||||||| ||| ||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13569380 tggagcattagctgaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctg-attggtaccacatgc 13569282  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13569281 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 13569227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 376
Target Start/End: Original strand, 15125141 - 15125434
Alignment:
Q  85 aagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||     
T  15125141 aagatgattaagatgatgtcgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacata 15125239  T
Q  184 tgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  15125240 tgttgggggctcattccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaa 15125339  T
Q  284 at---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15125340 ataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgaatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 15125434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15353323 - 15353544
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||     
T  15353323 atgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgt 15353422  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15353423 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatg 15353522  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  15353523 ccctggagctttgtcctcacca 15353544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12423696 - 12423429
Alignment:
Q  97 atgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaaga-tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  12423696 atgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttttagattgattgagtccatgcgttaacatacatttgttgggggctc 12423597  T
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatt-tgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc 294  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| || | ||||              |   ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  12423596 atgccctggagctttgtcctcaccacgattgagctttgtcctca-------------ccacgatgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggc 12423510  T
Q  295 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12423509 tcatgtcctgaattggtaccaaatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 12423429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 17048458 - 17048670
Alignment:
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17048458 gagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagc 17048555  T
Q  230 atttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataag 327  Q
     || ||||||| ||  | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17048556 tttagctcaaattagcgatgggggcatatgccctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataag 17048655  T
Q  328 aggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||    
T  17048656 aggtctaagttgcat 17048670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16351864 - 16352088
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactg---ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattagga 97  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| || ||    
T  16351864 atgaattgttgttatgaatttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgctgttatttaacttagttgcatgtgtctatacatgatgaataaga 16351963  T
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc 195  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  16351964 tgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttctgttgggggctc 16352063  T
Q  196 atgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16352064 atgccttggagctttgtcctcacca 16352088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 11250577 - 11250795
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  11250577 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgt 11250675  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  11250676 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgactccatgcattagcatac--ttgttgggggatcatg 11250773  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  11250774 ccctggagttttgtcctcacca 11250795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 20157475 - 20157657
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| || ||    
T  20157475 atgaattgatattataaagttataccgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacga 20157574  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20157575 tgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 20157657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25555559 - 25555371
Alignment:
Q  23 tgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattgga 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  25555559 tgctgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgttgttgagctccaaattactgga 25555461  T
Q  123 tgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgt 212  Q
    || | | ||||||| ||||||||| |||||||   ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25555460 tgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgaatccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgt 25555371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 368
Target Start/End: Original strand, 14053477 - 14053690
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  14053477 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 14053575  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-tt 352  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  14053576 tgccctggaagtatattaatactaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattt 14053674  T
Q  353 gtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||| |||||||    
T  14053675 gtcgagtcgatgatga 14053690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Original strand, 631105 - 631214
Alignment:
Q  109 tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagct 208  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  631105 tccaaattattggatatatatgagatgataattaagatgttt--agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 631202  T
Q  209 ttgtactcacca 220  Q
    |||| |||||||    
T  631203 ttgtcctcacca 631214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 36133988 - 36134152
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  36133988 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattat 36134087  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36134088 tgaatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 36134152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12902702 - 12902517
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  12902702 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgat 12902604  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902603 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgaaggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12902517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 23374529 - 23374715
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg-ttggggccttat 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||    
T  23374529 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaatagcgattggggcttgat 23374627  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | ||   | ||||||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23374628 gccctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgccccgtattggtaccacatttatataagaggtctaagttgcat 23374715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17046397 - 17046245
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttg 290  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||   | | |    
T  17046397 atgccctggagctttgcactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgg 17046298  T
Q  291 gggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046297 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17046245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44052753 - 44052588
Alignment:
Q  183 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 280  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44052753 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 44052654  T
Q  281 --aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
      ||||| | | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052653 caaatatcgatgggggcttgatgtcctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 44052588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 306 - 393
Target Start/End: Original strand, 22634677 - 22634764
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt-taagatgcttatgttga 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  22634677 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcaagtcaatgatgaatgatgttatgagatgtttatgttga 22634764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 331
Target Start/End: Original strand, 13813450 - 13813516
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 331  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13813450 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 13813516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 328
Target Start/End: Original strand, 631243 - 631311
Alignment:
Q  260 ccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataaga 328  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  631243 ccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataaga 631311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7798579 - 7798508
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  7798579 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 7798508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 22634448 - 22634603
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||         || || | ||||| |||||||||||||||    
T  22634448 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgcgtct---------gaataagttgatgatgaactccaaattat 22634538  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22634539 tggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 22634603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7893507 - 7893462
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893507 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 7893462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 16240181 - 16240331
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 291  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  16240181 atgccctggagctttgtactcaacatgatggagctttagctcaga-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 16240279  T
Q  292 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
     |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16240280 agcttgatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16240331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 16377837 - 16377882
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377837 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16377882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22636240 - 22636195
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636240 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22636195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 52873578 - 52873623
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873578 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 52873623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3096139 - 3096096
Alignment:
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096139 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3096096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 39706575 - 39706662
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706575 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 39706662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 52243477 - 52243564
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243477 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 52243564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12773887 - 12773842
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12773887 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12773842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14038507 - 14038462
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038507 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14038462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14280136 - 14280091
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280136 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14280091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 16270508 - 16270553
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270508 atgccctgtattggtacaacatgcatataagaggtctaagttgcat 16270553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 19618565 - 19618610
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618565 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19618610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20149652 - 20149607
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149652 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20149607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52312294 - 52312249
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312294 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 52312249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 14132 - 14219
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14132 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 14219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 12288492 - 12288579
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12288492 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 12288579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 340
Target Start/End: Original strand, 14928061 - 14928104
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14928061 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 14928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 14971150 - 14971188
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14971150 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14971188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 323
Target Start/End: Original strand, 15353577 - 15353634
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15353577 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 15353634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15367464 - 15367426
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367464 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15367426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15369792 - 15369754
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15369792 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15369754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15373300 - 15373262
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373300 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15373262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19242488 - 19242450
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242488 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19242450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14157688 - 14157584
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgt 354  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || | ||| ||||||  |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14157688 atgccctagaagtatattaatacttattacgttgggggcttgatgccccggattgataccacatgtatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattgt 14157590  T
Q  355 cgagtc 360  Q
    ||||||    
T  14157589 cgagtc 14157584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 20157731 - 20157787
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  20157731 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttaca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 20157787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 343
Target Start/End: Original strand, 36134226 - 36134263
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134226 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 36134263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 43198875 - 43198920
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43198875 atgccctggattggtaccacatgcatatatgaggtctaagttgcat 43198920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44102078 - 44102033
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44102078 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaggttgcat 44102033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 54799090 - 54799135
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54799090 atgccctgcattggtaccacatgcatataagaggtataagttgcat 54799135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 12613 - 12649
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12613 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 13818054 - 13818109
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13818054 attggtaccacatgcatataagaggttttggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 13818109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14164384 - 14164289
Alignment:
Q  266 aagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||  |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14164384 aagtatattaatacttattacgttgggggcttgatgccccggattgataccacatgtatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattgtcgagtc 14164289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15551762 - 15551683
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 240  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  15551762 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 15551683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 341
Target Start/End: Original strand, 18215653 - 18215697
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18215653 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaatttgca 18215697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9556610 - 9556551
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9556610 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 9556551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17810352 - 17810293
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17810352 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 17810293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12610723 - 12610685
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12610723 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 12610685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15705187 - 15705149
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15705187 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 15705149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 23803697 - 23803735
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23803697 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 23803735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 51464214 - 51464252
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51464214 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 51464252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 1951799 - 1951942
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--t 129  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  1951799 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 1951890  T
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || | | |||||||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  1951891 gataagttgattaagatgtttt--gttgatagagttcatgcattagcatacatt 1951942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 14708912 - 14708963
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14708912 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 14708963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18236721 - 18236670
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18236721 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 18236670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3096238 - 3096159
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 240  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  3096238 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgaagcattagctcaaa 3096159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15375580 - 15375548
Alignment:
Q  310 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15375580 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15375548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 359
Target Start/End: Original strand, 18603009 - 18603059
Alignment:
Q  307 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18603009 ttggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 18603059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 4561360 - 4561419
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  4561360 attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 4561419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 304
Target Start/End: Original strand, 13813353 - 13813400
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctg 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  13813353 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg 13813400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Original strand, 41385803 - 41385942
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  41385803 tatgttgctgcggttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 41385901  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  41385902 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 41385942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 323
Target Start/End: Original strand, 16352122 - 16352179
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16352122 aaagtatattaatactatgatgttgggagctcatgccctg-attgctaccacatgcata 16352179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 352
Target Start/End: Original strand, 28569697 - 28569741
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28569697 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcatt 28569741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 46640699 - 46640788
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  46640699 atgccctgtaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccatatgcatgattaagaggtctaagttgcat 46640788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 53082434 - 53082523
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  53082434 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 53082523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 4561862 - 4561917
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4561862 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 4561917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 5757467 - 5757522
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5757467 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 5757522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9556099 - 9556044
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9556099 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 9556044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10712424 - 10712369
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10712424 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 10712369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10926194 - 10926139
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10926194 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 10926139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 11250831 - 11250887
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11250831 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 11250887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12487254 - 12487199
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12487254 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 12487199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 13813292 - 13813337
Alignment:
Q  184 tgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13813292 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagc 13813337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 13813381 - 13813426
Alignment:
Q  184 tgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13813381 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagc 13813426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 14757964 - 14758019
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14757964 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 14758019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 14954729 - 14954784
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14954729 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14954784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15224611 - 15224556
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15224611 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15224556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 17152761 - 17152812
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17152761 attggtactacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 17152812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17809843 - 17809788
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17809843 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 17809788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 359
Target Start/End: Original strand, 18609584 - 18609631
Alignment:
Q  310 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18609584 gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 18609631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Original strand, 19757696 - 19757781
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  19757696 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 19757781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19782110 - 19782025
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  19782110 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 19782025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25689438 - 25689383
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25689438 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 25689383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33741949 - 33741894
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33741949 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 33741894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3412626 - 3412576
Alignment:
Q  307 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3412626 ttggtagcacatgcatataagtg-tctaagttgcatt-gtcgcattgtcgagt 3412576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14679010 - 14678872
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  14679010 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 14678912  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||    |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  14678911 tacgatgtttt---gtgatagagtccatgcattagcattcatt 14678872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Original strand, 14757463 - 14757507
Alignment:
Q  34 tgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  14757463 tgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 14757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 17152524 - 17152572
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 80  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17152524 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtct 17152572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 18222416 - 18222464
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 80  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18222416 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct 18222464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25555606 - 25555550
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgtt 57  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25555606 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgtt 25555550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 127)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 12321757 - 12322128
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  12321757 atgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtctatacaagatgattaagaaga 12321856  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12321857 tgttaaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 12321956  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |    
T  12321957 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaacgtatatttatactaaaatgttgggggctcatcc 12322056  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatg 374  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12322057 cctgaattggtaccacatgc--ataagaggtctaagtttca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaatgatg 12322128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14429983 - 14429610
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14429983 atgaattgatatgatgaagt-atactgttgttgtgatctgattatgcggctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 14429885  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14429884 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcataca-ttgttgggggcttatgcc 14429787  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  14429786 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatg 14429687  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14429686 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 14429610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2760232 - 2759880
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            
T  2760232 atgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttcgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgat-------- 2760141  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2760140 -gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 2760043  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  2760042 ctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgcttaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcat 2759943  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||    
T  2759942 gccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgttgcattgtcgagtcaa 2759880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 26 - 385
Target Start/End: Original strand, 17138101 - 17138461
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17138101 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 17138200  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17138201 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgat 17138299  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17138300 ggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 17138399  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17138400 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 17138461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 43 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12187078 - 12186743
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12187078 tatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgatt 12186979  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12186978 aagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaa 12186880  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186879 taacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttggaggctcatgccctaaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 12186780  T
Q  339 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12186779 gca-tagtcgcatagtcgagtcagtgatgaatgatgtt 12186743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 385
Target Start/End: Original strand, 19649530 - 19649889
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19649530 tgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 19649629  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | ||||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  19649630 aataagagatgatgattatgatattt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgat 19649727  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19649728 ggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgga 19649827  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19649828 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 19649889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 39267915 - 39268133
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  39267915 atgaattgatattatgaagttttaatgttgtggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgatcaagatga 39268014  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39268015 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 39268113  T
Q  201 atggagctttgtactcacca 220  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  39268114 ctggagctttgtcctcacca 39268133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9703340 - 9702988
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||  |||||  |||| || || ||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9703340 ctgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatgttcaacctccaaattattggat 9703241  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  9703240 acataagagatgatgattaatatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 9703142  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    ||||||||| ||| ||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9703141 tggagcattagctgaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctg-attggtaccacatgc 9703043  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9703042 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 9702988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3271925 - 3271706
Alignment:
Q  1 atgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatg 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||||    
T  3271925 atgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 3271826  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3271825 atgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agataattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgc 3271727  T
Q  200 catggagctttgtactcacca 220  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  3271726 cctggagctttgtcctcacca 3271706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 385
Target Start/End: Original strand, 32216606 - 32216948
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |  | | ||||||||||||    
T  32216606 tatgctgctattattatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggttacataagagatgatgatt 32216705  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||     
T  32216706 aagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtacttaacacgatggagcattagctcaaat 32216804  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    ||  | ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32216805 tagcgatgggggcttatgccttgaaaatattttaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata-aagaggtctaagtt 32216903  T
Q  339 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32216904 gca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 32216948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Original strand, 18154881 - 18155240
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  |||  ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18154881 ctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgaagttgaacctccaaattattggat 18154980  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  18154981 aaataagagatgatgattgagatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 18155078  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || |||| |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18155079 tggagctttagctc-aaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 18155177  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18155178 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 18155240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 130 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15211426 - 15211171
Alignment:
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15211426 gagatgatgattaagatgttttaaga-gttagagtccatgcattagcatacataagttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagc 15211328  T
Q  230 atttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataa 326  Q
     || ||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | ||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15211327 tttagctcaaattaacgatgggggctcatgccctggaagtatattaatattcaaataacgttgggggctcatgccctgtattggtgccacatgcatataa 15211228  T
Q  327 gaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15211227 gaggtctaagttgca-tagtcgcatagttgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 15211171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24054523 - 24054190
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  || |||||||| |    |||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  24054523 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaaagagatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgatt 24054424  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
      ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| || |||| |||    
T  24054423 gtgatgttt-aag-tgatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacgcgatggagctttagctc-aaa 24054327  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24054326 tagagatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 24054227  T
Q  339 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24054226 gca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgtatgatgtt 24054190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 9446174 - 9446395
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||     
T  9446174 atgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgt 9446273  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9446274 tgttgagctccaaattattggatgcatatttagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgtcgggggctcatg 9446373  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  9446374 ccctggagctttgtcctcacca 9446395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 9751771 - 9751952
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9751771 atgaattgatattatgaa-ttatactgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 9751869  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  9751870 tgttgaactccaaattattggatgtataagatatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagttcatgcattagcatacatt 9751952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20569612 - 20569833
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  20569612 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatatgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgt 20569710  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20569711 tgttgagctccaaattatgggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagttcatgcattagcat--atttgttgggggctcatg 20569808  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  20569809 ccttggagctttgtcctcaccatga 20569833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 2832457 - 2832639
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  2832457 atgaattgatattataaagttatattgttgatgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatga 2832556  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || |||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  2832557 tgatgaactccaaattattggatttataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtctatacattagcatacatt 2832639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42204095 - 42203876
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | | ||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||     
T  42204095 atgaattgttgtcatgaaattataatgctgctgtgatctgattatgctgctgttgttgtttaactaagttgcatgagtcattataagatgaatag-atgt 42203997  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42203996 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaaaattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac-tttgttgggggctcatg 42203898  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  42203897 ccctggagctttgtcctcacca 42203876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 342
Target Start/End: Original strand, 11996183 - 11996390
Alignment:
Q  139 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 237  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||    
T  11996183 attaagatgttttaagagg-ttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgctctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctc 11996280  T
Q  238 aaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 332  Q
    ||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996281 aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 11996380  T
Q  333 taagttgcat 342  Q
    ||||||||||    
T  11996381 taagttgcat 11996390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18302013 - 18301918
Alignment:
Q  128 atgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  18302013 atgagatgatgattaagatgttt--agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgatg 18301918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26211940 - 26211754
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggg-cctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||  | ||||| |||| |    
T  26211940 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcagattagcgatgggggccttga 26211842  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26211841 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 26211754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15580771 - 15580617
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||         || || ||||||| |||||||||||||||    
T  15580771 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagtct---------gaataagatgatgatgaactccaaattat 15580681  T
Q  119 tggatgtacatgagat-gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15580680 tggatgtatgagagattgatgattaagatgttt--agatgattgagtccatgcattagcatacatt 15580617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11312728 - 11312596
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  11312728 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattat 11312629  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgtt 149  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  11312628 tggatgtataagagatttgatgattaagatgtt 11312596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10588960 - 10588795
Alignment:
Q  183 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 280  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10588960 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 10588861  T
Q  281 aatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
     | ||   | | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10588860 caaatagcgatgggggcttgatgccatgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10588795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15580545 - 15580448
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15580545 aaagtatattaatattatgatgatgggggctcatgccctgtaatgctaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtctcattgtcgagtcaat 15580448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34200751 - 34200542
Alignment:
Q  139 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 237  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34200751 attaagttgttttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc 34200654  T
Q  238 aaaataa-tgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact---aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagagg 330  Q
    ||||| | || || ||  || ||||| || |||||||||||||||   ||||  | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200653 aaaattagtgatgagggtttgatgccttggaagtatattaatactcaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagagg 34200554  T
Q  331 tctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||    
T  34200553 tctaagttgcat 34200542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11858384 - 11858305
Alignment:
Q  296 catgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11858384 catgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatgtt 11858305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 183
Target Start/End: Original strand, 14152048 - 14152183
Alignment:
Q  48 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaaga 145  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  14152048 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaaga 14152147  T
Q  146 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14152148 tgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 14152183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 14932753 - 14932932
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||   |||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||  |  ||| |||||| ||||||||    
T  14932753 aattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgt 14932852  T
Q  104 tgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  14932853 tgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagttcatgcattagcatacatt 14932932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 15356188 - 15356367
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||   |||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||  |  ||| |||||| ||||||||    
T  15356188 aattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgt 15356287  T
Q  104 tgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15356288 tgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagttcatgcattagcatacatt 15356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 15360302 - 15360481
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||   |||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||  |  ||| |||||| ||||||||    
T  15360302 aattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgt 15360401  T
Q  104 tgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15360402 tgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagttcatgcattagcatacatt 15360481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9509135 - 9508948
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||  | |||||  || ||    
T  9509135 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcgatgggggtttgat 9509036  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509035 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcatgatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 9508948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20487418 - 20487341
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20487418 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattgataccatatgcatataagaggtctaagttgcat 20487341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12318207 - 12318052
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||         || || ||||||| ||||||||||| |||    
T  12318207 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct---------gaataagatgatgatgaactccaaactat 12318117  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12318116 tggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 12318052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14258169 - 14258019
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa--tat-gtttggg 292  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |    | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |  ||| | | |||    
T  14258169 atgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattgcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaattatcgatgggg 14258070  T
Q  293 gctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258069 gcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14258019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 376
Target Start/End: Original strand, 9752035 - 9752104
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9752035 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagttgagtcaatgatgaatgatgtt 9752104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18301920 - 18301846
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18301920 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatacatataagaggt 18301846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13032704 - 13032517
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||    ||||| ||| ||    
T  13032704 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcaatgggggcttgat 13032605  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13032604 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccttgtattggtaacacatgcatataagaggtctaagttgcat 13032517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 360
Target Start/End: Original strand, 3564619 - 3564681
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  3564619 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgtcgagtc 3564681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 15755269 - 15755314
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755269 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15755314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 16402753 - 16402798
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16402753 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16402798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 28505657 - 28505702
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505657 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 28505702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40443257 - 40443212
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443257 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 40443212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 67538 - 67493
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67538 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 67493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 12256144 - 12256189
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12256144 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12256189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12698636 - 12698591
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12698636 atgccctgtattggtaccacatgcttataagaggtctaagttgcat 12698591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13869167 - 13869122
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869167 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13869122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 15144348 - 15144393
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144348 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15144393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 360
Target Start/End: Original strand, 15605547 - 15605603
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15605547 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 15605603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16213400 - 16213355
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213400 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16213355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 17062212 - 17062257
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062212 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17062257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18005499 - 18005398
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005499 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 18005400  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  18005399 at 18005398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20110338 - 20110293
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110338 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20110293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 27848104 - 27848149
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27848104 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 27848149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 29329256 - 29329301
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329256 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 29329301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44116335 - 44116290
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116335 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 44116290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 47831599 - 47831554
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831599 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 47831554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 13635495 - 13635650
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||         ||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  13635495 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc---------tgaataagttgatgatgaactccaaattat 13635585  T
Q  119 tggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| |  |||  || | |||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13635586 tggatgtataagtgatttgttaattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 13635650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 2282531 - 2282618
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2282531 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 2282618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12317955 - 12317901
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12317955 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 12317901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 14933051 - 14933105
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14933051 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt-tcgcatttgtcgagtc 14933105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 15356486 - 15356540
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15356486 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt-tcgcatttgtcgagtc 15356540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 15360600 - 15360654
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15360600 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt-tcgcatttgtcgagtc 15360654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16056168 - 16056081
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16056168 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 16056081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22072833 - 22072746
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072833 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgattccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22072746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24274941 - 24274898
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24274941 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 24274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Original strand, 28505496 - 28505629
Alignment:
Q  197 tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 291  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  28505496 tgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 28505595  T
Q  292 ggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatat 324  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505596 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatat 28505629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12901160 - 12901074
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 341  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12901160 atgccttggaagtatattaatacttaatacgttgagggctcgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggattaagttgca 12901074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16495173 - 16495135
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495173 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16495135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 367
Target Start/End: Original strand, 811467 - 811527
Alignment:
Q  307 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  811467 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 811527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9593413 - 9593270
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--t 129  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  9593413 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 9593322  T
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9593321 gataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 9593270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13647102 - 13647057
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13647102 atgccccgtattggtaccacatgcatataataggtctaagttgcat 13647057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 15082263 - 15082304
Alignment:
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15082263 cctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15082304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 38898718 - 38898763
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38898718 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaagtctaagttgcat 38898763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44013976 - 44013931
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44013976 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 44013931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48273174 - 48273129
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48273174 atgccctggattggtaccacatgcacataagaggtctaagttgcat 48273129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16583336 - 16583181
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||         ||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  16583336 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacgttgcatgagtc---------tgaataagttgatgatgaactccaaattat 16583246  T
Q  119 tggatgta--catgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||||    |||  || |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16583245 tggatgtattagtgatttgttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 16583181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42203840 - 42203785
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42203840 agtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 42203785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 342
Target Start/End: Original strand, 15605818 - 15605853
Alignment:
Q  307 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605818 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15605853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 342
Target Start/End: Original strand, 16220050 - 16220085
Alignment:
Q  307 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16220050 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16220085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 39722346 - 39722287
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39722346 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39722287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 1868238 - 1868327
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | |||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1868238 atgccctggaagtatattaatacttaatatgttgagggcttaatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 1868327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 352
Target Start/End: Original strand, 14152280 - 14152325
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14152280 attggtaccacatgcatataaaaggtctaagttgca-ttgtcgcatt 14152325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 15008780 - 15008869
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  15008780 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgaataagagatctaagttgcat 15008869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 179
Target Start/End: Original strand, 15605365 - 15605447
Alignment:
Q  97 atgatgttgaactccaaattattggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcata 179  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||    
T  15605365 atgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcata 15605447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 242
Target Start/End: Original strand, 27848006 - 27848087
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 242  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27848006 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctgaagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaaaat 27848087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 42376345 - 42376383
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42376345 gtattggtaccacatgcatataaaaggtctaagttgcat 42376383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8917256 - 8917205
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8917256 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 8917205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 18456704 - 18456749
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18456704 atgccctggattggtaccacatgcatataaaagatctaagttgcat 18456749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 242
Target Start/End: Original strand, 15755043 - 15755145
Alignment:
Q  139 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 237  Q
    |||||| |||||||||| | | || |||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||    
T  15755043 attaagttgttttaagagg-tcgaatccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggtgcattacctc 15755140  T
Q  238 aaaat 242  Q
    |||||    
T  15755141 aaaat 15755145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 70791 - 70850
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  70791 attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 70850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 74900 - 74959
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  74900 attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 74959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11262376 - 11262237
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  11262376 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 11262278  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  11262277 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 11262237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13831189 - 13831154
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831189 gtattggtaacacatgcatataagaggtctaagttg 13831154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14953245 - 14953106
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  14953245 tatgctgcttctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 14953147  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  14953146 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 14953106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14959211 - 14959072
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  14959211 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 14959113  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  14959112 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 14959072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26292475 - 26292416
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26292475 attaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 26292416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Original strand, 44408395 - 44408534
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  44408395 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 44408493  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  44408494 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 44408534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 1859119 - 1859169
Alignment:
Q  28 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  1859119 ttgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 1859169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 19096 - 19239
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--t 129  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  19096 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataact 19187  T
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  19188 gataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 19239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32678 - 32623
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  32678 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 32623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 71304 - 71359
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  71304 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 71359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 75413 - 75468
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  75413 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 75468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 1859361 - 1859416
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1859361 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatctgtcgagtcaa 1859416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 331
Target Start/End: Original strand, 9446454 - 9446494
Alignment:
Q  290 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9446454 ggggctcatgccctg-attggtaccacatgcataaaagaggt 9446494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 12705196 - 12705251
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12705196 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 12705251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13461585 - 13461538
Alignment:
Q  310 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13461585 gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 13461538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 13919032 - 13919087
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13919032 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatctgtcgagtcaa 13919087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14216753 - 14216706
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  14216753 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 14216706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15083740 - 15083685
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15083740 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15083685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15728153 - 15728106
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15728153 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 15728106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16113810 - 16113755
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16113810 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 16113755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16116963 - 16116908
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16116963 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 16116908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 16457632 - 16457683
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16457632 attggtaccacatgcatataa-ttgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 16457683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 16907748 - 16907803
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16907748 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 16907803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18282935 - 18282880
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18282935 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 18282880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18425229 - 18425174
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18425229 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 18425174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 25927778 - 25927833
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25927778 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 25927833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26291941 - 26291886
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26291941 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 26291886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35151469 - 35151422
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  35151469 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 35151422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38227288 - 38227243
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38227288 atgccctggattggtaaaaaatgcatataagaggtctaagttgcat 38227243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39721810 - 39721755
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39721810 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 39721755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 11987279 - 11987231
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 80  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11987279 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct 11987231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 15605299 - 15605347
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaa 67  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15605299 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 15605347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16583086 - 16583031
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16583086 attggtaccacatgcatgtaagagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 16583031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18556983 - 18556928
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgtttt 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||    
T  18556983 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt 18556928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 20220474 - 20220521
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20220474 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 20220521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 22811927 - 22812287
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22811927 atgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 22812026  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22812027 tgttgaacgccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 22812126  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  22812127 ctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaatattgttgggggcttatgcccttaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgc 22812226  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  22812227 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-tggtcgcattgtcgagtcaa 22812287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 25963731 - 25964091
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  25963731 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 25963830  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963831 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 25963929  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||||    
T  25963930 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggcttatgc 25964029  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25964030 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgggtcaat 25964091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37524776 - 37524410
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||            
T  37524776 atgaattgttgttatgaagttacaatgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgat-------- 37524685  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37524684 -gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 37524587  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  37524586 ctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatg 37524487  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat-gatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37524486 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgttgcattgtcgagtcaatggatgaaagatgtt 37524410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 21318651 - 21319014
Alignment:
Q  1 atgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatg 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||    
T  21318651 atgaattgataattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgaatgagatg 21318750  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgat-taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21318751 ttgttgaactccaaattattggatgtatataagatgatgatctaagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatg 21318850  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctca 297  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |    
T  21318851 ccctggagctttgtactcaccgcgatggagcatttgctcaaaaataacgttgggggcttaagccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctta 21318950  T
Q  298 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21318951 tgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgga-ttgtcgcattgtcgagtcaa 21319014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 21327582 - 21327945
Alignment:
Q  1 atgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatg 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  21327582 atgaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgaataagatg 21327681  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgat-taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21327682 ttgttgaactccaaattattggatgtatataagatgatgatctaagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatg 21327781  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctca 297  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||    
T  21327782 ccctggagctttgtactcaccgcgatggagcatttgctcaaaaataacgttgggggcttaagccctgaaagtatgttaatactaaacagttgggggctca 21327881  T
Q  298 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21327882 tgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 21327945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 48 - 376
Target Start/End: Original strand, 45678192 - 45678521
Alignment:
Q  48 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatg 147  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  45678192 tgctattgttatttaactatgttgcatgagtccatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggaaatatatgagatgatgattaagatg 45678291  T
Q  148 ttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgt 247  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
T  45678292 ttttagga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacga 45678390  T
Q  248 tggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 344  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||   | | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  45678391 tgggggctaatgcactgaaagtatattaatactaaaataaagatgggggctcatgccatgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ta 45678489  T
Q  345 gtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45678490 gtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 45678521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24673645 - 24673290
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    |||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24673645 tgttattgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcatgagtctgtacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 24673546  T
Q  126 acat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24673545 atatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 24673447  T
Q  224 tggagcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatg 319  Q
    |||||| || |||| ||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24673446 tggagctttagctcaaaaataacgatgggagctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatg 24673347  T
Q  320 catataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24673346 catataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaatgatgtt 24673290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Original strand, 40622251 - 40622603
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  40622251 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 40622350  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40622351 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgtgggctcatgcccttgagctttgtactcaccatgat 40622449  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    |||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40622450 ggagcattagctcaaaataacgatgtgggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 40622549  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40622550 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 40622603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24680259 - 24679907
Alignment:
Q  31 ttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacat- 129  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||     
T  24680259 ttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcttgagtctgtacaagatgattaagatggtgttgaacttcaaattattggatatatata 24680160  T
Q  130 ---gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 226  Q
       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24680159 tatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtcaatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgg 24680061  T
Q  227 agcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    |||||| |||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24680060 agcattagctcaaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcat 24679961  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24679960 ataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaatgatgtt 24679907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 23019725 - 23020099
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  23019725 aattgatattatgaagtcatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatgt 23019824  T
Q  104 tgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccat 202  Q
     |||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23019825 cgaacctccaaattattggatatataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccct 23019923  T
Q  203 ggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgc 300  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  23019924 ggagcttagtactcaacacgatggtgaattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggatgtatattaatactcaataacgttgggggctcatgc 23020023  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23020024 cctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 23020099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 362
Target Start/End: Original strand, 22799145 - 22799504
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  22799145 aattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgt 22799244  T
Q  104 tgaa-ctccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22799245 tgaatctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga-gaccgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccct 22799343  T
Q  203 ggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgc 300  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  22799344 ggagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgataggggctcatgc 22799443  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22799444 cttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 22799504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 21916114 - 21916322
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21916114 atgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgtttttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 21916213  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916214 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 21916312  T
Q  201 atggagcttt 210  Q
     |||||||||    
T  21916313 ctggagcttt 21916322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40428564 - 40428202
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||| || ||||     
T  40428564 atgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgcttttgttattgaactaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgt 40428465  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40428464 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatg 40428365  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    || |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  40428364 ccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcat 40428265  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40428264 gccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 40428202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 22741004 - 22741349
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaact-ccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22741004 ctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattggat 22741103  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  22741104 aaataagagatgatgattaagatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 22741201  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22741202 tggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 22741301  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  22741302 atataagaggtctaagttgca-tagtcgaatagtcgagtcaatgatgaa 22741349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 376
Target Start/End: Original strand, 22758759 - 22759111
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22758759 ctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaactagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacatccaaattattggat 22758858  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  22758859 aaataagagatgatgattaagatgtat-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacga 22758956  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||| ||  | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | ||   | | |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22758957 tggagctttagctcaaattagcgatgggggcctatgccctggaagtatataaatactcaaataacgatgggggctcatgccttgaattggtaccacatgc 22759056  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22759057 acataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatgtt 22759111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24655354 - 24655575
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||     
T  24655354 atgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgt 24655453  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24655454 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatg 24655553  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  24655554 ccctggagctttgtcctcacca 24655575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24174901 - 24174680
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||     
T  24174901 atgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgt 24174802  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24174801 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatg 24174702  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  24174701 ccctggagctttgtcctcacca 24174680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 24716569 - 24716762
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716569 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgt 24716668  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24716669 atatgagatgatgattaagatgggttaa-atgattgagtccatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24869981 - 24869760
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||     
T  24869981 atgaattgttgttatgaatttatgattttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgt 24869882  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24869881 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagagtgattgagtccatggattagcatacttttgttaggggctcatg 24869782  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  24869781 ccctggagctttgtcctcacca 24869760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 25961550 - 25961768
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  25961550 atgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcatta-aagatgaataagatgt 25961648  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgc 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25961649 tgttgagctccaaattattggattcatattgagatg-tgattaagatgttttagattgattgagtcaatgcattagcatacttttgttgggggctcatgc 25961747  T
Q  200 catggagctttgtactcacca 220  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  25961748 cctggagctttgtcctcacca 25961768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 376
Target Start/End: Original strand, 24716796 - 24716907
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-t 363  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24716796 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaatt 24716894  T
Q  364 gatgaatgatgtt 376  Q
    |||||| ||||||    
T  24716895 gatgaaagatgtt 24716907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24735483 - 24735319
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||   ||||| |||||||||||||||    
T  24735483 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaagtgatgatgaactccaaattat 24735384  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24735383 tggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 24735319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 38292 - 38478
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| ||    
T  38292 gagtccatgcattagcattcatt-gttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 38390  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38391 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9784632 - 9784555
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784632 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 9784555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 23072125 - 23072312
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  23072125 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgctctagagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 23072223  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23072224 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23072312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 23103571 - 23103757
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| ||    
T  23103571 gagtccatgcattagcactcatt-gttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 23103669  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23103670 gccctgaaagtatattactactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagctgcat 23103757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 23654598 - 23654749
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 291  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  23654598 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 23654697  T
Q  292 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654698 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23654749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Original strand, 21900630 - 21900816
Alignment:
Q  162 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atg 259  Q
    |||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||    
T  21900630 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaatttagcgatgggggcttgatg 21900729  T
Q  260 ccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21900730 ccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatttaagaggtctaagttgcat 21900816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23031176 - 23031092
Alignment:
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23031176 gccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 23031092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23060458 - 23060272
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  23060458 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 23060360  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23060359 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtgtaagttgcat 23060272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22337069 - 22336885
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 259  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| |   | |||||| | |||    
T  22337069 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacaatggagctttagctcaaattgc-gatggggcttgatg 22336971  T
Q  260 ccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336970 ccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22336885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 25961802 - 25961899
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25961802 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 25961899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 22413418 - 22413505
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22413418 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 22413505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7679416 - 7679370
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7679416 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 7679370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 24655609 - 24655704
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24655609 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgttgcattgtcgagtcaa 24655704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 299110 - 299155
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299110 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 299155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6725779 - 6725734
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6725779 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 6725734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8946461 - 8946416
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8946461 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 8946416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23076295 - 23076250
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23076295 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtgtaagttgcat 23076250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23130683 - 23130638
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130683 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23130638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23133150 - 23133105
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133150 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 23712391 - 23712436
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712391 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23712436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 24643328 - 24643373
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643328 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24643373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25616046 - 25616001
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616046 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25616001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23657638 - 23657571
Alignment:
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 368  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||    
T  23657638 ccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattttcgagtcaaagatga 23657571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 18787184 - 18787271
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18787184 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 18787271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 19691922 - 19691976
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19691922 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 19691976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20322444 - 20322405
Alignment:
Q  303 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20322444 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20322405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24174646 - 24174550
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24174646 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 24174550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24735222 - 24735168
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24735222 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 24735168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24869726 - 24869630
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24869726 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 24869630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22105142 - 22105104
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105142 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22105104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 342
Target Start/End: Original strand, 22731553 - 22731595
Alignment:
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22731553 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcttagttgcat 22731595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 339
Target Start/End: Original strand, 22738495 - 22738537
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738495 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 22738537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25175639 - 25175578
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  25175639 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 25175578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38967189 - 38967151
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967189 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38967151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43137070 - 43137032
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137070 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 43137032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 8056 - 8101
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8056 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 8101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 21177725 - 21177770
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21177725 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21177770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 23040507 - 23040552
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23040507 atgccctgtattggtaacatatgcatataagaggtctaagttgcat 23040552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 23713211 - 23713256
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23713211 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23713256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 32215313 - 32215358
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32215313 atgccccgtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 32215358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 10101671 - 10101730
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10101671 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 10101730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28405775 - 28405717
Alignment:
Q  310 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  28405775 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 28405717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19671671 - 19671633
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19671671 gtattggtaccacatgcataaaagaggtctaagttgcat 19671633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 24688570 - 24688659
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctca-tgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||   |||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24688570 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgaaggcttaatgccctggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcat 24688659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 18855735 - 18855786
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18855735 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 18855786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23186905 - 23186854
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23186905 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 23186854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23598168 - 23598117
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23598168 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 23598117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23791120 - 23791024
Alignment:
Q  250 gggccttatgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23791120 gggctttatgccctgcaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 23791024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24367558 - 24367513
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24367558 atgccctggattggtaccacatgcatatagaaggtctaagttgcat 24367513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26125013 - 26124962
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26125013 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 26124962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 24697850 - 24697897
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24697850 atgccctggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcat 24697897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24649437 - 24649378
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  24649437 attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 24649378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 27379459 - 27379518
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27379459 attaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27379518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 27383505 - 27383564
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27383505 attaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27383564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20309053 - 20308972
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 242  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20309053 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaaat 20308972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 20520435 - 20520524
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20520435 atgccctggaagtatattaatacttaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 20520524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 60646 - 60599
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  60646 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 60599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1282957 - 1282902
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1282957 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 1282902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 10102190 - 10102245
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10102190 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 10102245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 10822942 - 10822987
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10822942 atgctctggattggtaccacatgcatagaagaggtttaagttgcat 10822987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 12902053 - 12902108
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12902053 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 12902108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Original strand, 19928597 - 19928682
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  19928597 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 19928682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 24629016 - 24629071
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24629016 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 24629071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24648924 - 24648869
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24648924 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 24648869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27601361 - 27601306
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27601361 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 27601306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 30345553 - 30345608
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30345553 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 30345608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31344706 - 31344651
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31344706 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 31344651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 41531542 - 41531597
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41531542 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 41531597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 22134526 - 22134562
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22134526 attggtaccacatgcatataagagatttaagttgcat 22134562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 17127 - 17501
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17127 atgaattgatattatgaagttatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagtctatacaagatgattaagatga 17226  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  17227 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttataagatgatcgagtccatgcattagcatacaattgtt-ggggctaatgcc 17325  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  17326 ctggagcttcatactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaattgttgggggctcatgc 17425  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17426 cctgtattagtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttatcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 17501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 376
Target Start/End: Original strand, 2104 - 2470
Alignment:
Q  5 attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgtt 104  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  2104 attgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaataaaagatgaataagatgatgtt 2203  T
Q  105 gaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2204 gaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtatta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgg 2302  T
Q  205 agctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||    
T  2303 agctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-ataag---ggggctcatgccctg 2398  T
Q  305 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2399 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg-tgttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 2470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 107)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 21366681 - 21367040
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21366681 atgaattgatatgatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 21366779  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21366780 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgcc 21366878  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21366879 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatg 21366978  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21366979 ccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 21367040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20805653 - 20805293
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  20805653 atgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 20805554  T
Q  101 tgttgaac-tccaaattattggat--gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20805553 tgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcat 20805455  T
Q  198 gccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctc 296  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||    
T  20805454 gcccttgagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgagggctc 20805355  T
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20805354 atgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagt 20805293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 393
Target Start/End: Original strand, 18770042 - 18770412
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||  || ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18770042 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 18770141  T
Q  125 taca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 222  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18770142 tatagatgagatgatgattaagatgttttaaga-gactgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacg 18770240  T
Q  223 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatg 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18770241 atggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatg 18770340  T
Q  320 catataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgcttatgttga 393  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18770341 catataagaggtctaagttgca-tagttgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgcttatgttga 18770412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20767075 - 20766715
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  20767075 atgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgatttgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 20766976  T
Q  101 tgttgaac-tccaaattattggat--gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20766975 tgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttaa-atgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggttcat 20766877  T
Q  198 gccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctc 296  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||    
T  20766876 gccctatagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgagggcttatgccctgaaattatattaatactataatgctgggggctc 20766777  T
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20766776 atgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagt 20766715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 43 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22032382 - 22032080
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22032382 tatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgatt 22032283  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22032282 aagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgagggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaa 22032184  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032183 taacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 22032084  T
Q  339 gcat 342  Q
    ||||    
T  22032083 gcat 22032080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23201436 - 23201083
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23201436 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggata 23201337  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  23201336 cataagagatgatgattatgatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgat 23201238  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    |||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23201237 ggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgcactggaagtatattaatacttaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 23201138  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  23201137 tataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 23201083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21873351 - 21872978
Alignment:
Q  5 attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgtt 104  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||   |||  |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  21873351 attgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgtt 21873252  T
Q  105 gaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatg 203  Q
    || | |||||||||||||||  | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21873251 gaccctccaaattattggatacatatgagatgatcattaacatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctg 21873153  T
Q  204 gagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgcc 301  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | | ||||||||||||    
T  21873152 gagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcaatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgcc 21873053  T
Q  302 ctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||| ||||||    
T  21873052 ctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatattcgagtcgtatgatgaaagatgtt 21872978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14079226 - 14078877
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatg 124  Q
    |||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||     
T  14079226 ctgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaattattggata 14079127  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || |||    
T  14079126 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatgtgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 14079028  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    |||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    | | |  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14079027 ggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaactaacgatgagggctcatgccccgaattggtaccacatgca 14078928  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgat 373  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14078927 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgat 14078877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 123321 - 123681
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| | || || |     
T  123321 atgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagataaataagacg- 123419  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
      |||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||    
T  123420 --ttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcaatgatatgttgggggctcatg 123517  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    || |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||    
T  123518 ccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactattgggggctcat 123617  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  123618 gccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 123681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 17919167 - 17919489
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | |||||||||||   || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| |            
T  17919167 atgaattgttgttatgaaattacaatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgtt-------- 17919258  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
     ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17919259 -gttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatg 17919357  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    || |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  17919358 ccctggagcttagtcctcaccacgatggagcattaactcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcat 17919457  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17919458 gccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 17919489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 1859017 - 1859210
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859017 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgt 1859116  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1859117 atatgagatgatgattaagatgtttt-agttgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 1859210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23512174 - 23511839
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||| || ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23512174 tgttgatgcgatctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggata 23512075  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttt-taagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
     | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||| |||||||||||| ||||||   || ||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  23512074 cataagagatgatgattaagatgtttataaga-gatcgagctcatgcattagcatacatatgttgg---cttatgccctggagcttagtactcaccacga 23511979  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    |||||| || ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23511978 tggagctttagctcaaattaaagatgggggcttatgccctggaagtatattaatattcaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 23511879  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23511878 tataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 23511839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23572160 - 23571899
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    |||||||||||||||  |||| || || ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  23572160 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatgttcaattccaaattattggatat 23572061  T
Q  126 acat--------gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactca 217  Q
    | ||        || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23572060 atatatatatatgacatgatgattaaaatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgtttggggctcatgccctggagctttgtactca 23571962  T
Q  218 ccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact 280  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23571961 ccacgatggagcattagcttaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 23571899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24221978 - 24221757
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || ||||     
T  24221978 atgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaggttgcatgagtctatacatgatgaataagatgt 24221879  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24221878 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattaacatacttttgttgggggctcatg 24221779  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  24221778 ccctggagctttgtcctcacca 24221757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23451424 - 23451227
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23451424 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagataatgttgaactccaaattattggatgt 23451325  T
Q  126 aca-tgagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  23451324 atattgagatgttgattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtcctcacca 23451227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23458668 - 23458471
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23458668 tgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgt 23458569  T
Q  126 acat-gagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    | || |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23458568 atattgagatgttgactaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 23458471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23462929 - 23462732
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23462929 tgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgt 23462830  T
Q  126 acat-gagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    | || |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23462829 atattgagatgttgactaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 23462732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26704152 - 26703793
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  |||  ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26704152 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctctaaattattggat 26704053  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  26704052 aaataagagatgatgattgtgatgttt-aaga-gattgagtccatgcattagcatagatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 26703955  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||  ||||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  26703954 tggagctttagctc--aatagcgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctaaattggtaccacaagc 26703857  T
Q  321 atataagaggtc-taagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  26703856 atataagaggtcttaagttgca-tagtcgcatagtcgagccaatgatgaaagatg-ttaagatgct 26703793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26973885 - 26973526
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  |||  ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26973885 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctctaaattattggat 26973786  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  26973785 aaataagagatgatgattgtgatgttt-aaga-gattgagtccatgcattagcatagatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 26973688  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||  ||||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  26973687 tggagctttagctc--aatagcgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctaaattggtaccacaagc 26973590  T
Q  321 atataagaggtc-taagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  26973589 atataagaggtcttaagttgca-tagtcgcatagtcgagccaatgatgaaagatg-ttaagatgct 26973526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 22107789 - 22107973
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgc 260  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  22107789 gagtctatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgc 22107888  T
Q  261 cctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107889 cctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22107973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26680683 - 26680464
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||     
T  26680683 atgaattgttactatgaaattatgatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgt 26680584  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  26680583 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagttgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattatcatac--ttgttgggggctcatg 26680486  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  26680485 ccctggagctttgtcctcacca 26680464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26952290 - 26952071
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||     
T  26952290 atgaattgttactatgaaattatgatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgt 26952191  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  26952190 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagttgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattatcatac--ttgttgggggctcatg 26952093  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  26952092 ccctggagctttgtcctcacca 26952071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12028581 - 12028799
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  12028581 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgt 12028679  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12028680 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatg 12028777  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  12028778 ccctggagctttgtcctcacca 12028799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22757226 - 22757010
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  || ||||||| || ||||     
T  22757226 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttacatgagtcattataagatgaata-gatgt 22757128  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgc 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22757127 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttag-tgattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgc 22757031  T
Q  200 catggagctttgtactcacca 220  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  22757030 cctggagctttgtcctcacca 22757010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31342221 - 31342027
Alignment:
Q  28 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtac 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |     
T  31342221 ttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcat 31342122  T
Q  128 a-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    | ||||||  ||||||||||  ||||   |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31342121 attgagatattgattaagattgtttagattgatcgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccatga 31342027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23440027 - 23439860
Alignment:
Q  56 ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgtt--tta 152  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||    
T  23440027 ttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagataatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagatgttgatta 23439928  T
Q  153 agatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  23439927 agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtcctcacca 23439860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 23501418 - 23501612
Alignment:
Q  48 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaact-ccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagat 146  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||  | | ||||||||| ||| |||    
T  23501418 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacttccaaaatattggataaatacgagatgatgtttatgat 23501517  T
Q  147 gttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaata 243  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  23501518 gttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaata 23501612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 24767561 - 24767743
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||||    
T  24767561 atgaattgatattataaagttatactattgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatga 24767660  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| || |||||| |||||||||||||    
T  24767661 tgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagaatccatgcattagcatacatt 24767743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 342
Target Start/End: Original strand, 19661009 - 19661197
Alignment:
Q  159 ttgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt- 256  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||     
T  19661009 ttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccatggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttg 19661107  T
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661108 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19661197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17410513 - 17410360
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17410513 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgt 17410414  T
Q  126 acatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcata 179  Q
    | | ||||  | ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||    
T  17410413 ataagagattttatgattaagatgtttt--gttgatggagtccatgcattagcata 17410360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 21808565 - 21808751
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | |||||  || ||    
T  21808565 gagtccatgcattagccttcatt-gttgggggcttgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggtttgat 21808663  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808664 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21808751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 376
Target Start/End: Original strand, 1859244 - 1859355
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-t 363  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  1859244 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttttggttgca-tagtcgcattgtcgagtcaatt 1859342  T
Q  364 gatgaatgatgtt 376  Q
    |||||| ||||||    
T  1859343 gatgaaagatgtt 1859355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9077898 - 9077689
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  9077898 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 9077800  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 356  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  9077799 gccctggaagtatattaatacttatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgtcg 9077701  T
Q  357 agtcaatgatga 368  Q
    |||||| |||||    
T  9077700 agtcaaagatga 9077689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21887099 - 21887013
Alignment:
Q  290 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  21887099 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcgtatgatgaaagatgtt 21887013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 21293145 - 21293332
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  21293145 gagtccatgaattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 21293243  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttgggg--ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||    |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21293244 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtagcat 21293332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1096412 - 1096228
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 259  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||  | |||||| | |||    
T  1096412 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaacatgatggagctttagctcaaa-tagcgatggggcttgatg 1096314  T
Q  260 ccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096313 ccctgaaagtatattaatacttaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1096228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 21729276 - 21729427
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 291  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | |||||  || |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  21729276 atgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggtttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 21729375  T
Q  292 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729376 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21729427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22074965 - 22074779
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  22074965 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgtttgagtattagctcaaattagcgatgggggcttgat 22074867  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074866 gccctggaagtatattaatactcagatagtgatgggggcttgatgccctgtattgctaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22074779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23439834 - 23439730
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  23439834 atgccttgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgcccagaattggtaccacatgcatatatgaggtttaggttgca-ttgtagcattgtcg 23439736  T
Q  357 agtcaa 362  Q
    ||||||    
T  23439735 agtcaa 23439730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23451201 - 23451097
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  23451201 atgccttgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgcccagaattggtaccacatgcatatatgaggtttaggttgca-ttgtagcattgtcg 23451103  T
Q  357 agtcaa 362  Q
    ||||||    
T  23451102 agtcaa 23451097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23458445 - 23458341
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 356  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  23458445 atgccttgaaagtatattaatattaaactgttgggggctcctgccatgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcg 23458347  T
Q  357 agtcaa 362  Q
    ||||||    
T  23458346 agtcaa 23458341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23462706 - 23462602
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 356  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  23462706 atgccttgaaagtatattaatattaaactgttgggggctcctgccatgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcg 23462608  T
Q  357 agtcaa 362  Q
    ||||||    
T  23462607 agtcaa 23462602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24493514 - 24493328
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  24493514 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 24493416  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493415 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24493328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37723848 - 37723635
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  37723848 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaattagcgatgggggcttga 37723750  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-tt 352  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||  | | ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||    
T  37723749 tgccctggaagtatattaatactcgaatagcgatgggggcttgatgccctgtattagtaccacatgcatataagatgtctaagctgcatat-tcgcattt 37723651  T
Q  353 gtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||| |||||||    
T  37723650 gtcgagtcgatgatga 37723635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21877344 - 21877258
Alignment:
Q  290 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||| ||||||    
T  21877344 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcataatcgagtcgtatgatgaaagatgtt 21877258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 339
Target Start/End: Original strand, 8287019 - 8287203
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||| | ||| ||    
T  8287019 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtacccaccacgttggagctttagctcaaattagcgatggaggcttgat 8287118  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8287119 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 8287203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 339
Target Start/End: Original strand, 21997709 - 21997892
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  21997709 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacatgatggagcttgagctcaaa-tagcgatgggggctttat 21997807  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997808 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccatgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 21997892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24529168 - 24528963
Alignment:
Q  159 ttgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt- 256  Q
    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |  | |||||||| || ||||||| ||  | ||||| |||     
T  24529168 ttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtacttaatacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttt 24529070  T
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 352  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  24529069 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacatt 24528971  T
Q  353 gtcgagtc 360  Q
    ||||||||    
T  24528970 gtcgagtc 24528963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13025233 - 13025073
Alignment:
Q  184 tgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatacta 281  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| || || ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13025233 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacaggatggagctttagctcaaa-tagtgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactc 13025135  T
Q  282 atat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    | ||   | |  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025134 aaatagcgatgagagcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 13025073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13095417 - 13095257
Alignment:
Q  184 tgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatacta 281  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13095417 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacaggatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactc 13095319  T
Q  282 atat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    | ||   | |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095318 aaatagcgatgagggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 13095257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 341
Target Start/End: Original strand, 22959798 - 22959898
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959798 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 22959897  T
Q  341 a 341  Q
    |    
T  22959898 a 22959898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23571883 - 23571821
Alignment:
Q  313 ccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23571883 ccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagttgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 23571821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 27989210 - 27989297
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27989210 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttaagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 27989297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 342
Target Start/End: Original strand, 11581562 - 11581624
Alignment:
Q  281 aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581562 aatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 11581624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14047905 - 14047860
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14047905 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14047860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 17517504 - 17517549
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517504 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17517549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 20918325 - 20918370
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918325 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20918370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23064332 - 23064287
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064332 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23064287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 23390812 - 23390857
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390812 atgccctgtaatggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23390857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24066974 - 24066929
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24066974 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24066929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25421331 - 25421290
Alignment:
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421331 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25421290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25431199 - 25431154
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25431199 atgccctgtattggtaccacatgcatgtaagaggtctaagttgcat 25431154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31060848 - 31060803
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31060848 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31060803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38619295 - 38619250
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619295 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38619250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 23535613 - 23535768
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||| || | ||||| |||||||||| ||||    
T  23535613 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc---------tgaataagttgatgatgaactccaatttat 23535703  T
Q  119 tggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| |  |||  || |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23535704 tggatgtataagtgatttgttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 23535768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 20027222 - 20027309
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20027222 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 20027309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24221723 - 24221627
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24221723 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 24221627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25535036 - 25534897
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  25535036 tatgttgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgcatattgatatgatgat 25534938  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  25534937 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 25534897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 362
Target Start/End: Original strand, 33896074 - 33896128
Alignment:
Q  307 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  33896074 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattgttgagtcaa 33896128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22411971 - 22411929
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22411971 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 22411929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36314348 - 36314310
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314348 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 36314310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 18319329 - 18319374
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319329 atgccctggattggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 18319374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19668749 - 19668649
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19668749 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtacca-atgcatataagaggtctaagttgc 19668651  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  19668650 at 19668649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 21329820 - 21329865
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21329820 atgccctggattggtaccacatgcatataacaggtctaagttgcat 21329865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21565339 - 21565294
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21565339 atgccctggattggtaccacaagcatataagaggtctaagttgcat 21565294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29329718 - 29329673
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329718 atgccctggattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgcat 29329673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 337
Target Start/End: Original strand, 20902308 - 20902348
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902308 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 20902348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17410299 - 17410245
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17410299 attggtaccacatgcatataagaggtataagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 17410245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 369
Target Start/End: Original strand, 23501619 - 23501696
Alignment:
Q  290 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 369  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    
T  23501619 ggggctcatgccatgaat-ggtaccacatgcatataagagttttaagttgca-tagtcgcatagttgagtcaatgatgaa 23501696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 20807088 - 20807126
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20807088 gtattggtactacatgcatataagaggtctaagttgcat 20807126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 352
Target Start/End: Original strand, 24767837 - 24767882
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 352  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24767837 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatt 24767882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 41095966 - 41096004
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41095966 gtattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcat 41096004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 10776011 - 10776056
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10776011 atgccctggattggtaccacatgcatatagaaggtctaagttgcat 10776056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 21502481 - 21502526
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21502481 atgccctggattggtaccacatgcatctaaaaggtctaagttgcat 21502526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32027177 - 32027132
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32027177 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaggttgcat 32027132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 359
Target Start/End: Original strand, 17730685 - 17730735
Alignment:
Q  307 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17730685 ttggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 17730735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 15236806 - 15236865
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  15236806 attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 15236865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Original strand, 21295321 - 21295460
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  21295321 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 21295419  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  21295420 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 21295460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24554582 - 24554443
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  24554582 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 24554484  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  24554483 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 24554443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18356025 - 18355979
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  18356025 tgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18355979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 352
Target Start/End: Original strand, 21885466 - 21885510
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21885466 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcatt 21885510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26172293 - 26172249
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26172293 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcatt 26172249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4036047 - 4036000
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  4036047 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 4036000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10752759 - 10752704
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10752759 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 10752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11226711 - 11226656
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11226711 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 11226656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11230690 - 11230635
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11230690 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 11230635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 12028835 - 12028891
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12028835 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 12028891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 15237372 - 15237427
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15237372 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15237427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 19473255 - 19473310
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19473255 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 19473310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20295416 - 20295361
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20295416 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 20295361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 20911471 - 20911526
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20911471 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 20911526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22756974 - 22756880
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatatgtttg-gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22756974 agtatattaatactatgattgttgagggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagattgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 22756880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Original strand, 25229683 - 25229730
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25229683 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 25229730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Original strand, 25293839 - 25293886
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25293839 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 25293886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 26743021 - 26743072
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26743021 attgataccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 26743072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 21340804 - 21340852
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 80  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21340804 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtct 21340852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 26742784 - 26742832
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 80  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26742784 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtct 26742832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 492 - 123
Alignment:
Q  3 gaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatg 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  492 gaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 393  T
Q  103 ttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  392 ttgaactccaaattattggatgtatatga---gatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccct 297  T
Q  203 ggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgcc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  296 ggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctaggggctcatgcc 197  T
Q  302 ctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  196 ctgaattggtaccgcatgcatataagaggtttaggttgca-ttgt-gcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 147)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11862894 - 11862519
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | || | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11862894 atgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctttacaagatgattaagatga 11862795  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862794 tgttgtgctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 11862696  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||    
T  11862695 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgatgagggctcatg 11862596  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11862595 ccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 11862519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 18383932 - 18384305
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18383932 atgaattgatatgatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 18384030  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18384031 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgcc 18384129  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  18384130 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggtttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatg 18384229  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgt 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18384230 ccctgtattggttccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgt 18384305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12172872 - 12172537
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12172872 tgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattatgatgatgttgaacctccaaattattggata 12172773  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  12172772 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgtagctttgtactcaccacgat 12172674  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12172673 ggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatattaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 12172574  T
Q  325 aagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12172573 aagaggtctaagttgca-ttctcgcattgtcgagtcaa 12172537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 322666 - 322318
Alignment:
Q  28 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtac 127  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  322666 ttgttgtgatctgattatgccgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattatgatgatgttgaactccaaattattggatgcat 322567  T
Q  128 atgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgga 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  322566 atgacatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctgaagctttgtactcaccacgatgga 322468  T
Q  228 gcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  322467 gcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccgtgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatataa 322368  T
Q  327 gaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  322367 gaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 322318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12496359 - 12496000
Alignment:
Q  1 atgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatg 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||    
T  12496359 atgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 12496260  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12496259 atgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagat-tatttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgc 12496161  T
Q  200 catggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  12496160 cctggagctttttactcaccatgatggagcattttctcaaaataatgttgggg-gttataccctaaaagtatattaatactataatgctgggggctcatg 12496062  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12496061 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgccgcattgtcgagtcaa 12496000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 11298543 - 11298900
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  11298543 atgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 11298642  T
Q  101 tgttgaac-tccaaattattggat--gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11298643 tgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatctgttgggggttcat 11298741  T
Q  198 gccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctc 296  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  11298742 gccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtataataatactataatgttgggggctc 11298841  T
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 356  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||    
T  11298842 atgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtcgca-ttgttgcattgtcg 11298900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 19725927 - 19726277
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||            
T  19725927 atgaattgatattatgag-tcatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgat-------- 19726017  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19726018 -gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgcgggttcatgcc 19726115  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  19726116 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatg 19726215  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19726216 ccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 19726277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 856216 - 855864
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||     
T  856216 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgtttatcctccaaattattggata 856117  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  856116 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattaacatacatttgttggaggctcatgccctggagctttgtactcaccacgat 856018  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  856017 ggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccttgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 855918  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  855917 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 855864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16369476 - 16369125
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  |  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16369476 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttacttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggata 16369377  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16369376 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggagcttatgccctggagctttgtactcaccacgat 16369278  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16369277 ggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttaaggctcatgccctgcattggtaccacatgcat 16369178  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16369177 ataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 16369125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 128 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15067656 - 15067409
Alignment:
Q  128 atgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15067656 atgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgga 15067558  T
Q  228 gcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 324  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15067557 gcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 15067458  T
Q  325 aagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatg 374  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15067457 aagaggtctaagttgca-tagccgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg 15067409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 14878557 - 14878894
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14878557 tgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaatctccaaattattggata 14878656  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||    
T  14878657 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgtagggggctcatgccctggagattagtactcaccacgat 14878755  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    ||||| || ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14878756 ggagctttagctcaaattaaagatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgttggaggctcatgccctatattggtaccacatgcat 14878855  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14878856 ataagaagtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 14878894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 385
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878451
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 15878191  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  15878192 aataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgat 15878289  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15878290 ggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 15878389  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15878390 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 15878451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 170 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11849248 - 11849041
Alignment:
Q  170 tattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11849248 tattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaag 11849149  T
Q  269 tatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatg 367  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11849148 tatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatg 11849050  T
Q  368 aatgatgtt 376  Q
    || ||||||    
T  11849049 aaagatgtt 11849041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12037968 - 12038185
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||    
T  12037968 atgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctt-tgttatttaactaagttgcatgagtttatataagatgattaagatga 12038066  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12038067 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-atatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 12038165  T
Q  201 atggagctttgtactcacca 220  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  12038166 ctggagctttgtcctcacca 12038185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 280
Target Start/End: Original strand, 23053128 - 23053383
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23053128 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatataagatgattaagataatgttgaactccaaattattggatgt 23053227  T
Q  126 acat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  23053228 atataagagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggatcatgccttggagcttagtactcaacacga 23053326  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact 280  Q
    ||||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  23053327 tggagcattagctcaaactagaaatgggggcttatgccctggaaatatattaatact 23053383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 220
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196666
Alignment:
Q  54 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaa 26196599  T
Q  154 gatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26196600 gatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 26196666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 393
Target Start/End: Original strand, 23077518 - 23077866
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23077518 tgttgttgtgatctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattagtggatat 23077617  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatg-ttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    | | |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  23077618 ataagagatgatgattgagatgtttttaaga-gatcgagtccattcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgat 23077716  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 324  Q
    ||||||||  |||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |                   | |||||||||||||||||||    
T  23077717 ggagcattatctcaaactagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaa------------------cgaattggtaccacatgcatat 23077798  T
Q  325 aagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgcttatgttga 393  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23077799 gagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagttgagtcaatgatgaaagatgtttatgatgcttatgttga 23077866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15051584 - 15051367
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15051584 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatcttgaactccaaattattggatgt 15051485  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15051484 atatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttggggcctcatgccctggagctttgtactcaccacgatg 15051386  T
Q  226 gagcatttgctcaaaataa 244  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  15051385 gagcattagctcaaaataa 15051367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23408506 - 23408187
Alignment:
Q  24 gctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattgga 122  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23408506 gctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga 23408407  T
Q  123 tgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 222  Q
    |  | | ||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |    
T  23408406 taaataagagatgatgattttgatgttt-aaga-gatcgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacg 23408309  T
Q  223 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatg 319  Q
    ||||||| || |||| |||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23408308 atggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatg 23408210  T
Q  320 catataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23408209 catataagaggtctaagttgcat 23408187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11851682 - 11851510
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11851682 atgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 11851583  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtatta 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11851582 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcatta 11851510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 11557400 - 11557621
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||     
T  11557400 atgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtttatacatgatgaataagatgt 11557499  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    || ||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11557500 tgctgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatg 11557599  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  11557600 ccctggagctttgtcctcacca 11557621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14665502 - 14665320
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  14665502 atgaattgatattttaaagttatactgttgatgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatga 14665403  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14665402 tgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatatttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 14665320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15060360 - 15060196
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060360 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgt 15060261  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggg 191  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15060260 atatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 15060196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 11595155 - 11595373
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  11595155 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgt 11595253  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11595254 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatg 11595351  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  11595352 ccctggagctttgtcctcacca 11595373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14668658 - 14668476
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  14668658 atgaattgatattataaagttatactgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatga 14668559  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||  | |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  14668558 tgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaaaatgtttt--gttgatagagtccatgcattaacatacatt 14668476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 1982826 - 1983047
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||     
T  1982826 atgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaaaaagatgt 1982925  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| |||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1982926 tgttgagctccaaattattaggtgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatg 1983025  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||| ||| |||||||    
T  1983026 ccctggagctatgtcctcacca 1983047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 3402972 - 3403191
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | | ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  3402972 atgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgt 3403071  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3403072 tgttgagctccaaattagtggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattaacatac-tttgttgggggctcatg 3403170  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacc 219  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3403171 ccctggagctttgtcctcacc 3403191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42326042 - 42325824
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  42326042 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttttttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgt 42325944  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||     
T  42325943 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcata 42325846  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  42325845 ccctggagctttgtcctcacca 42325824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 3389952 - 3390171
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | | ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  3389952 atgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgt 3390051  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3390052 tgttgagctccaatttagtggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac-tttgttgggggctcatg 3390150  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacc 219  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3390151 ccctggagctttgtcctcacc 3390171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 13210504 - 13210690
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  13210504 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 13210602  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210603 gccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13210690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 212
Target Start/End: Original strand, 12852662 - 12852763
Alignment:
Q  109 tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagct 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12852662 tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttt--agatgatagagtcaatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 12852759  T
Q  209 ttgt 212  Q
    ||||    
T  12852760 ttgt 12852763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Original strand, 26196700 - 26196797
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26196700 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctttattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtctcattgtcgagtcaat 26196797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16796192 - 16796056
Alignment:
Q  208 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctcatgccctgt 305  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||      
T  16796192 tttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctaa 16796093  T
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796092 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16796056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 2897849 - 2898012
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| || | | ||||| |||||||||||||||    
T  2897849 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagataatcaagttgatgatgaactccaaattat 2897948  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| | ||||  ||| |||||||||||||    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2897949 tggatgtataagagatttgaagattaagatgttt---aatgatagagtccatgcattagcatacatt 2898012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 284 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16909689 - 16909598
Alignment:
Q  284 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16909689 atgttgggggctcatgccctgaattggtaccacttgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 16909598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 7793375 - 7793540
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctga-ttatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaatta 117  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  7793375 attaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaatta 7793474  T
Q  118 ttggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7793475 ttggatgtataagagatttgatgatgaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 7793540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16796290 - 16796195
Alignment:
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgga 227  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16796290 gagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgga 16796195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Original strand, 20461533 - 20461690
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20461533 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaacttcaaattattggatgt 20461632  T
Q  126 acatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    | | ||||  ||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20461633 ataagagatttgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 20461690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 327190 - 327355
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctga-ttatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaatta 117  Q
    |||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||   ||||| ||||||||||||||    
T  327190 attaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaattgatgatgaactccaaatta 327289  T
Q  118 ttggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||||||||    
T  327290 ttggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcatgagcatacatt 327355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12399154 - 12398968
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  12399154 gagtccatgcattagcattcatt-gttggtggcttgatgccctggagcactgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 12399056  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatatgt---ttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||     | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399055 gccctggaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12398968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14682291 - 14682140
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 291  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  14682291 atgccttggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 14682192  T
Q  292 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682191 ggcttgatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14682140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 360
Target Start/End: Original strand, 3403226 - 3403321
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||    
T  3403226 aaagtatatcaatattatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtc 3403321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 331
Target Start/End: Original strand, 12852797 - 12852871
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12852797 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 12852871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14670769 - 14670618
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 291  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||   | | ||    
T  14670769 atgccttggagctttgtagtcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagcatattaatactcaaatagcgatggg 14670670  T
Q  292 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670669 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14670618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 25476596 - 25476744
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttg-ggg 293  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| || || |||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||    || |||    
T  25476596 atgccctggagctttgtactcaacaagatggagctttagctcaaa-tagtgatgggggttgatgccctgtaagtatattaatactcaatagcgatgaggg 25476694  T
Q  294 ctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476695 cttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25476744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16097206 - 16097119
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggct-catgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097206 atgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttcatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16097119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13442122 - 13442076
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442122 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 13442076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17487780 - 17487616
Alignment:
Q  183 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 280  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17487780 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 17487682  T
Q  281 --aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
      |||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17487681 caaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtataagttgcat 17487616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17499262 - 17499098
Alignment:
Q  183 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 280  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17499262 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 17499164  T
Q  281 --aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
      |||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17499163 caaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 17499098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18438443 - 18438294
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggg 292  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||  || ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | | |||    
T  18438443 atgccctggagctttgtactcaacacgatggagttttagctcaaa-tagtgaagggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggg 18438345  T
Q  293 gctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438344 gcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18438294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 376
Target Start/End: Original strand, 23053391 - 23053460
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  23053391 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcgatgatgaaagatgtt 23053460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 23083633 - 23083722
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083633 atgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23083722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 40213937 - 40214098
Alignment:
Q  202 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatatg----tttggggctc 296  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||     | ||||  |     
T  40213937 tggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgtgggcttg 40214035  T
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  40214036 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgtcgagtc 40214098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16909732 - 16909667
Alignment:
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaa 266  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16909732 atggagctttgtactaaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctcatgccctgaa 16909667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26683159 - 26683114
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26683159 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 26683114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43840737 - 43840692
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840737 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 43840692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Original strand, 11557657 - 11557718
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagag 329  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11557657 agtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagag 11557718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Original strand, 12038212 - 12038274
Alignment:
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12038212 tgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 12038274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 360
Target Start/End: Original strand, 2898108 - 2898164
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2898108 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 2898164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8499339 - 8499294
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499339 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8499294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8898878 - 8898833
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898878 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8898833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10556806 - 10556761
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10556806 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10556761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 10901491 - 10901536
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10901491 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10901536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13543796 - 13543751
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13543796 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13543751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14665223 - 14665167
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14665223 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14665167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14668379 - 14668323
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14668379 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14668323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15412250 - 15412205
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412250 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15412205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 16283189 - 16283234
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283189 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16283234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 17447032 - 17447077
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17447032 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17447077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 20698753 - 20698798
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698753 atgccctgtattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20698798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 24153500 - 24153545
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153500 atgccctgcattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24153545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27165071 - 27165026
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165071 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 27165026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41123676 - 41123631
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123676 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 41123631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46822038 - 46821993
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822038 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 46821993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Original strand, 52523996 - 52524097
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52523996 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgc 52524095  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  52524096 at 52524097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14972705 - 14972618
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc--tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||   | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972705 atgccctggaagtatattaatacttatagggatgggggcttgatgccctcgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14972618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15482743 - 15482588
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||         ||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  15482743 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc---------tgaataagttgatgatgaactccaaattat 15482653  T
Q  119 tggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| |  |||  || |||||||| ||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15482652 tggatgtataagtgacttgttgattaaggtgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 15482588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30029742 - 30029594
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggg 292  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||  ||  | ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||   | | |||    
T  30029742 atgccctggagctttgtactcaacatgttggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttatgcc-tggaagtatattaatactcaaatagcgatgggg 30029645  T
Q  293 gctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029644 gcttgatgccccatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 30029594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 32307476 - 32307405
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  32307476 atgctctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 32307405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 327452 - 327506
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  327452 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 327506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 7793637 - 7793691
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7793637 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 7793691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 15076316 - 15076354
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15076316 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15076354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17737009 - 17736971
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737009 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17736971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23274609 - 23274446
Alignment:
Q  184 tgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg-ttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 281  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  | | ||||| | ||||||||  |||||| |||||||     
T  23274609 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaatagcgataggggcttgatgccctg-gagtataataatactc 23274511  T
Q  282 atat---gtttgggg-ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    | ||   | | ||||  | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274510 aaatagcgataggggtttgatgctccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23274446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 24341003 - 24341041
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24341003 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24341041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28194509 - 28194471
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194509 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 28194471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 339
Target Start/End: Original strand, 43550867 - 43550909
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43550867 atgccctgtattggtaccacatgcatataataggtctaagttg 43550909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 606648 - 606693
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  606648 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 606693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 11425031 - 11425076
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425031 atgctctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 11425076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14234276 - 14234231
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14234276 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 14234231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15467675 - 15467630
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15467675 atgccctggattggtaccacatacatataagaggtctaagttgcat 15467630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 183
Target Start/End: Original strand, 15850185 - 15850264
Alignment:
Q  105 gaactccaaattattggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15850185 gaactccaaattattggatgtataagtgatatgatgattaagatgtttt-tgttgatagagtccatgcattagcatacatt 15850264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 123
Target Start/End: Original strand, 17525216 - 17525297
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggat 123  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17525216 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatgttgaacctccaaattattggat 17525297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 53301848 - 53301893
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301848 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 53301893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 341
Target Start/End: Original strand, 1644996 - 1645040
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1644996 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtcgaagttgca 1645040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14572406 - 14572370
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572406 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14572370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 1983081 - 1983177
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1983081 aaagtatattaatactatgatgttggggcctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 1983177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 362
Target Start/End: Original strand, 14872290 - 14872352
Alignment:
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  14872290 gccctgtattggtaccacattcatataagaagtccaagttgca-ttgtggcatagtcgagtcaa 14872352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15617457 - 15617398
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15617457 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 15617398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 20461787 - 20461841
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20461787 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 20461841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30066029 - 30065970
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30066029 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 30065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 55149026 - 55148887
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  55149026 tatgttgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 55148928  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  55148927 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 55148887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9512727 - 9512666
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  9512727 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 9512666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9520702 - 9520641
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  9520702 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 9520641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 341
Target Start/End: Original strand, 12174531 - 12174617
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12174531 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtataagatgca 12174617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 339
Target Start/End: Original strand, 37251449 - 37251491
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37251449 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttg 37251491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44494582 - 44494544
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44494582 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 44494544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 49668390 - 49668451
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  49668390 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 49668451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50242638 - 50242600
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50242638 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 50242600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 342
Target Start/End: Original strand, 53071011 - 53071045
Alignment:
Q  308 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53071011 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 53071045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 12120108 - 12120153
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12120108 atgctctgtattggtaccacatgcatatagaaggtctaagttgcat 12120153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 16809156 - 16809207
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16809156 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 16809207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 17661198 - 17661243
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17661198 atgccctggattgttaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 17661243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 22110675 - 22110720
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22110675 atgctctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 22110720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 38962226 - 38962271
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38962226 atgccctggattggtaccacatgcatatagaaggtctaagttgcat 38962271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15482494 - 15482439
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15482494 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 15482439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 11070151 - 11070092
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  11070151 attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 11070092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 11165555 - 11165606
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 70  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11165555 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 11165606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24187825 - 24187686
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  24187825 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 24187727  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  24187726 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 24187686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Original strand, 11595409 - 11595504
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11595409 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 11595504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42325788 - 42325693
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42325788 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 42325693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 152
Target Start/End: Original strand, 1598574 - 1598630
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgtttta 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||    
T  1598574 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttta 1598630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 4589450 - 4589505
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4589450 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 4589505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7109268 - 7109213
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7109268 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 7109213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7113203 - 7113148
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7113203 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 7113148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11069640 - 11069585
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11069640 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 11069585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14498897 - 14498842
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14498897 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 14498842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15616946 - 15616891
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15616946 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 15616891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15964516 - 15964461
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15964516 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15964461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15968440 - 15968385
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15968440 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15968385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15972364 - 15972309
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15972364 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15972309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16696614 - 16696567
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16696614 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 16696567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19775139 - 19775084
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19775139 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 19775084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20723067 - 20722910
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggat 123  Q
    ||||| |||||| |||| |||| ||||  |||||||||| ||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  20723067 ctgttattgtgacctgactatgctgctgttgttatttaaataagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggat 20722969  T
Q  124 gtaca-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    | | | ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  20722968 gcatattgatatgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 20722910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22321236 - 22321181
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22321236 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 22321181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22336291 - 22336236
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22336291 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 22336236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 27410181 - 27410236
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27410181 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 27410236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28949294 - 28949239
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28949294 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 28949239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 30029924 - 30029867
Alignment:
Q  22 atgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 79  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30029924 atgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtc 30029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30065520 - 30065464
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30065520 attggtaccacatgcatataaagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 30065464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 37440174 - 37440229
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37440174 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 37440229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 38814395 - 38814310
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  38814395 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 38814310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 55022437 - 55022382
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  55022437 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 55022382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3833685 - 3833630
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgtttt 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||    
T  3833685 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataggttgattaagatgtttt 3833630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 11424934 - 11425014
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 240  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||    
T  11424934 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa 11425014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 11854801 - 11854757
Alignment:
Q  34 tgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  11854801 tgatctgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 11854757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 14577135 - 14577171
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14577135 attggtaccacatgcatataagacgtctaagatgcat 14577171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42726 - 42370
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42726 atgaattgatattatgaagttaa--tgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 42629  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42628 tgttgaactccaaattattggatgtatatga---gatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggatcatgcc 42533  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  42532 ctggaggtttgtactcaccacgatggagtatttgctcaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcat 42433  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  42432 gccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattatcgagtcaa 42370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 212
Target Start/End: Original strand, 24949 - 25048
Alignment:
Q  111 caaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagcttt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24949 caaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttt--agatgatagagtccttgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 25046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 327
Target Start/End: Original strand, 25082 - 25152
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataag 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25082 atgccctaaaagtatattaatactatgatgtttggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataag 25152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 38599 - 38644
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38599 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctacgttgcat 38644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 73783 - 74124
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  73783 atgaattgatatgatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 73881  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  73882 tgttgaaatccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgcc 73980  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||    
T  73981 ctggagctttgtactaaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatacaataatgctgggggctcatg 74080  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  74081 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcatt 74124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44442 - 44355
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44442 atgccctgtaagtatattaatacttaatacgttgagagcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 44355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 78163 - 78076
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  78163 atgccctgtaagtatattaatacttaatacgttgagagcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 78076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 998 - 621
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  998 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 899  T
Q  101 tgttgaac-tccaaattattggat--gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  898 tgttgaacatccaaattattggatatgtgtatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 800  T
Q  198 gccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctc 296  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  799 gccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttggggg-ttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctc 701  T
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgag-tcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  700 atgccctaaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagttaaatgatgaaagatgtt 621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 46742 - 47119
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || |||| || || |||||    
T  46742 atgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtcattataagacgaataagatga 46841  T
Q  101 tgttgaac-tccaaattattggatgtacat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcat 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46842 tgttgaacatccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttatga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctcat 46940  T
Q  198 gccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctca 297  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  46941 gccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctta 47040  T
Q  298 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47041 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtcgca-ttgtttcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 47119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1931 - 1571
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  1931 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 1832  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1831 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatagttt-agatgattgagtctatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 1733  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||    
T  1732 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaactaattgttgggggcttatgccctaaaagtatagtaatactataatgctgggggctcatg 1633  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  1632 ccctgaattggtaccatatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgtattgtcgagtcaa 1571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9613 - 9254
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  9613 atgaattgatattatgag-ttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 9515  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9514 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatagttt-agatgattgagtctatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 9416  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatg 299  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||    
T  9415 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaactaattgttgggggcttatgccctaaaagtatagtaatactataatgctgggggctcatg 9316  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  9315 ccctgaattggtaccatatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgtattgtcgagtcaa 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2907 - 2589
Alignment:
Q  27 gttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgta 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2907 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatata 2808  T
Q  127 catgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  2807 tatgagatgatgattaagatgttttaag-tgattgagtccatgcattaccatacatttgttgggggctcatgcccttgagctttgtactcaccacgatgg 2709  T
Q  227 agcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2708 agctttagctcaaaataatgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 2609  T
Q  324 taagaggtctaagttgcatt 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2608 taagaggtctaagttgcatt 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6573 - 6255
Alignment:
Q  27 gttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgta 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6573 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatata 6474  T
Q  127 catgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 226  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6473 tatgagatgatgattaagatgttttaag-ggattgagtccatgcattaccatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgg 6375  T
Q  227 agcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6374 agctttagctcaaaataatgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatacaaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 6275  T
Q  324 taagaggtctaagttgcatt 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6274 taagaggtctaagttgcatt 6255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 6430 - 6780
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||            
T  6430 atgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcattataagatgat-------- 6521  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6522 -gttgaactccaaattattggatgtatatgagataatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgcc 6619  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||   |||||||||||    
T  6620 ctagagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactataatgccgggggctcatgc 6719  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6720 cctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 6780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 14036 - 14091
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14036 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 14091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5686 - 5335
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatga-ttaggatg 99  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  5686 atgaattgatattatgaact-atgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgagttaagatg 5588  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5587 atgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagatg----------attgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 5498  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    || || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  5497 ccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcat 5398  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5397 gccctatattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 5335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6881 - 6530
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatga-ttaggatg 99  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  6881 atgaattgatattatgaact-atgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgagttaagatg 6783  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6782 atgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagatg----------attgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 6693  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    || || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  6692 ccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcat 6593  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6592 gccctatattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 6530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12559 - 12514
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12559 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 260 - 1
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  260 atgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatga 161  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 61  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgc 260  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  60 ctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgtagggggcttatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 96 - 362
Target Start/End: Original strand, 21635 - 21900
Alignment:
Q  96 gatgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21635 gatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 21733  T
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21734 atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccttgaaagtatattaatactaaaatgttgggggc 21833  T
Q  295 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21834 tcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 21900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Original strand, 22937 - 23063
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22937 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagagatctaagttgc 23036  T
Q  341 atttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 367  Q
    | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  23037 a-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 23063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 21584 - 21629
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  21584 atgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatg 21629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 1505 - 1861
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            
T  1505 atgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgata------- 1597  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
      ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598 --ttgaactccaaattattggatttatgtgagatgatgattaagatgttttagattgattgagtccatacattagcatacatttgttgggggctcatgcc 1695  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 300  Q
     |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1696 ctggagccttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgc 1795  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatg 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1796 cctgaattggtaccacatgcatatatgaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaatgatg 1861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 128 - 376
Target Start/End: Original strand, 7272 - 7520
Alignment:
Q  128 atgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  7272 atgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtaatcaccacgatgga 7371  T
Q  228 gcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372 gcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtttattaatactaaaatgttgggggctcatgccctgtattggttccacatgcatataag 7471  T
Q  328 aggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7472 aggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 7520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 7128 - 7225
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggat 123  Q
    |||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7128 tgttgttgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaattccaaattattggat 7225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Original strand, 21844 - 22197
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21844 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 21943  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcat-acatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21944 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagcccatgcattagcattacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 22042  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||||||  |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22043 tggagcattaactcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgc 22142  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22143 atatacgaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 22197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Original strand, 29736 - 30089
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  29736 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 29835  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcat-acatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29836 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagcccatgcattagcattacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 29934  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||||||  |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29935 tggagcattaactcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgc 30034  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30035 atatacgaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 30089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 376
Target Start/End: Original strand, 280953 - 281288
Alignment:
Q  48 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacatg-------agatgatgat 140  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||        | ||||||||    
T  280953 tgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatatatatatatatatatgatgat 281052  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 240  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  281053 taagatgttttaaga--attgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaa 281150  T
Q  241 ataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 337  Q
    |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  281151 ataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 281250  T
Q  338 tgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  281251 tgca-tagtcgcatggtcgagtcaatgatgaatgatgtt 281288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1569 - 1315
Alignment:
Q  27 gttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgta 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1569 gttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgta 1470  T
Q  127 catgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 226  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  1469 tatgaggtgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatag 1371  T
Q  227 agcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 281  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1370 agcattttctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 38498 - 38872
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  38498 aattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgt 38597  T
Q  104 tgaa-ctccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccat 202  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  38598 tgaacctccaaattattggatttataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccct 38696  T
Q  203 ggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgc 300  Q
    ||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  38697 ggagcttagtactcaacacgattgagcattagctcaaattagcaatgggggcttatgccctagaagtatattaatactcaataatgttgggggctcatgc 38796  T
Q  301 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38797 cctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaggttgca-ttgtcacattgtcgagtcaagtgatgaaggatgtt 38872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 119820 - 119646
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  119820 gagtccatgcattagcattcatt-gttgagggcttgatgccctggagctctgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 119722  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatact--aatatgtttgggg--ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagagg 330  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||    |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119721 gccctggaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagagg 119646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 40417 - 40462
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40417 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 40462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 100204 - 100103
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100204 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcctgatgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 100105  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  100104 at 100103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 342
Target Start/End: Original strand, 17997 - 18040
Alignment:
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17997 gccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44238 - 44193
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44238 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 44193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 101336 - 101265
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  101336 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagctgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaggatga 101265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1882 - 1541
Alignment:
Q  12 ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactcc 111  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||         ||||||||||    
T  1882 ttatgaacttataatgttgttgtggtctgattatgctgcctttgttatttaactaagttgcatgaggctatacaagatgat---------gttgaactcc 1792  T
Q  112 aaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagcttt 210  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1791 aaattattagatgtatatgagatgatgattaggatgtttttagattgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 1692  T
Q  211 gtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattgg 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| || ||||     
T  1691 gtcctcaccatgatggagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggcgctcatgccatgaattga 1592  T
Q  311 taccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  1591 taccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattttcgagtcaa 1541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Original strand, 34960 - 35311
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  34960 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataaaatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatac 35059  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  35060 ataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatg 35158  T
Q  226 gagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35159 gagcattagctc-aaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacaatgggggctcatgccttgtattggtaccacatgcat 35257  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35258 ataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 35311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1637
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  1957 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaaatattggata 1858  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1857 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgat 1759  T
Q  225 ggagcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    ||||| || |||| ||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1758 ggagctttagctcaaaaataacgatgggagctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 1659  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  1658 atataaggggtctaagttgcat 1637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 385
Target Start/End: Original strand, 16367 - 16749
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |  |||||||    
T  16367 aattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaacaatatgatgt 16466  T
Q  104 tgaa-ctccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccat 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||  | | ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  16467 tgaatctctaaattattggatacataagagatgatgattatgacgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggatcatgccct 16565  T
Q  203 ggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatg 299  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||    
T  16566 ggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatg 16665  T
Q  300 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16666 ccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 16749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 4823 - 5199
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  4823 aattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgt 4922  T
Q  104 tgaa-ctccaaattattggatgtacat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  4923 tgaacctccaaattattggatatatataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcaatagcatagatatgttgggggcttatgcc 5021  T
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcat 298  Q
     |  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  5022 ctaaagcttagtactcaacatgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataatgatgggggctcat 5121  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 376  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  5122 accctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatcgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 5199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6171 - 5811
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6171 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 6072  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  6071 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgat 5973  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  5972 ggagctttagctcaaattagcgatgggagcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggcttatgtcctgaattggtaccacatgca 5873  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5872 tataagaggtctaagttgca-ttgttgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 5811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 19307 - 19664
Alignment:
Q  1 atgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatg 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || || || || ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||           
T  19307 atgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatttgcttgtgctgttattgttatttaactatgatggatgagtctatacaagatgat------- 19399  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcata-catttgttgggggctc 195  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19400 --gttgaactccaaattattggatgtatattgagatgtttattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatgttgggggctc 19497  T
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc 294  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  19498 atgccctagagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggc 19597  T
Q  295 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19598 tcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 19664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 88 - 342
Target Start/End: Original strand, 18810 - 19073
Alignment:
Q  88 atgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacat--------gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcata 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18810 atgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatatatatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcata 18908  T
Q  180 catttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatac 279  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18909 catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatggggtcttatgccctgaaagtatattaatac 19008  T
Q  280 t--aatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19009 taaaatatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 19073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 18673 - 18821
Alignment:
Q  3 gaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc--tatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||    
T  18673 gaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatatataagatgattaagatga 18772  T
Q  101 tgttgaactccaaattattgg--atgtacatgagatgatgattaagatg 147  Q
    |||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||    
T  18773 tgttgaactccaaattattggatatatatatgagataatgattaagatg 18821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 362
Target Start/End: Original strand, 16740 - 16852
Alignment:
Q  249 ggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||    
T  16740 gggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaacagttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataaaaggtttaggttgca-ttgtcg 16838  T
Q  349 cattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||    
T  16839 cattgtcgagtcaa 16852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 20128 - 20173
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20128 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 20173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39823 - 39679
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 291  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  39823 atgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggagcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 39725  T
Q  292 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaag 336  Q
    ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39724 ggcttgatgccctctattggtactacatgcatataagaggtctaag 39679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 15226 - 15588
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  15226 atgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgt 15325  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15326 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagatcgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatg 15425  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  15426 ccatggagcttagtcctcaccacgatggagaatttgctcaaataattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactaaattgttgggggctcat 15525  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15526 gccct-aattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 19748 - 20110
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  19748 atgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgt 19847  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19848 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagatcgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatg 19947  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  19948 ccatggagcttagtcctcaccacgatggagaatttgctcaaataattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactaaattgttgggggctcat 20047  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20048 gccct-aattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 20110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 130 - 376
Target Start/End: Original strand, 193122 - 193369
Alignment:
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  193122 gagatgatgattaagatgctttaaca-gttagagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagc 193220  T
Q  230 atttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataa 326  Q
     || ||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  193221 tttagctcaaattaacgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaataatgttgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatataa 193320  T
Q  327 gaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  193321 gaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatgtt 193369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7371 - 7053
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7371 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 7272  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7271 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttttgggttcatgccctggagctttgtactcaccacgat 7173  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    ||||| || |||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  7172 ggagctttagctc-aaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcataccctgaattggtgccacatgca 7074  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7073 tataagaggtctaagttgcat 7053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Original strand, 15641 - 15827
Alignment:
Q  162 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-at 258  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| ||    
T  15641 agtccatgcattaacattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 15739  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15740 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacattcatataagaggtctaagttgcat 15827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 69871 - 69511
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  69871 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 69772  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  69771 aaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 69674  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  69673 tggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 69574  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  69573 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 69511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 183
Target Start/End: Original strand, 60835 - 60964
Alignment:
Q  53 ctgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaagatgttt 150  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||| |||||||    
T  60835 ctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttt 60933  T
Q  151 taagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  60934 t--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 60964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 7286 - 7617
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| | || ||||     
T  7286 atgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagattaataagatgt 7385  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  7386 tgttgagctcaaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattaatatgttgggggctcatg 7485  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    || || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  7486 ccctgaagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcat 7585  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 331  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7586 gccct-aattggtaccacatgcatataagaggt 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23755 - 23417
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||     
T  23755 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgagcctccaaattattggata 23656  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  23655 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgat 23557  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    | ||| ||| |||||| ||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23556 gtagctttttctcaaattatcgatgggggcttattccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 23457  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23456 ataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaat 23417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39179 - 38841
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||     
T  39179 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgagcctccaaattattggata 39080  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  39079 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgat 38981  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 322  Q
    | |||||| ||||||| ||  |  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38980 gcagcattagctcaaattagcgaagggggcttataccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 38881  T
Q  323 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38880 ataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaat 38841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14740 - 14401
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgtt-gaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  14740 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatgtttgaacctccaaattatttgat 14641  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  14640 acataagggatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 14542  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    || |||||| ||||||| ||  |  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14541 tgtagcattagctcaaattagcgaagggggcttattccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 14442  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14441 tataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaat 14401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Original strand, 9004 - 9355
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9004 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 9103  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  9104 aataagagatgatgattatgatgttt-aagaa-atcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgat 9201  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat--atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    |||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9202 ggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaattaacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 9301  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9302 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgcatgatgtt 9355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 1576 - 1621
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1576 atgccctgaattggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 1621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44182 - 43964
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||    
T  44182 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatga 44083  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44082 tgttgaactctaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 43984  T
Q  201 atggagctttgtactcacca 220  Q
     |||||||||||||||||||    
T  43983 ctggagctttgtactcacca 43964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 385
Target Start/End: Original strand, 10580 - 10918
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||  | | ||||||||||||    
T  10580 tatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaat-attggataaataagagatgatgatt 10678  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||     
T  10679 atgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattaggatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagcattagctcaaat 10776  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    |||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777 taa---tgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 10873  T
Q  339 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10874 gca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 10918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 385
Target Start/End: Original strand, 15737 - 16078
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  15737 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgatt 15836  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
    | ||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||     
T  15837 atgatgttt-aaga-gatcaagtccatgcattagcatacatttgttgcgggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattaactcaaat 15934  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15935 tagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggcttatgccctgaattggtaccacatgcatataggaggtctaagttg 16034  T
Q  340 catttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16035 ca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 16078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 379 - 171
Alignment:
Q  12 ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactcc 111  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  379 ttatgaagttatattgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactcc 280  T
Q  112 aaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  279 aaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgaaagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttg 180  T
Q  212 tactcacca 220  Q
    | |||||||    
T  179 tcctcacca 171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 114 - 37
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 aaagtatattaatactaaattgttaggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 3642 - 3687
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3642 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 321
Target Start/End: Original strand, 14127 - 14425
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14127 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 14226  T
Q  126 acat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  14227 atataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacga 14325  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    ||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14326 tggagcattagctc-aaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccatatgc 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 368
Target Start/End: Original strand, 17394 - 17607
Alignment:
Q  159 ttgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt- 256  Q
    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| |||     
T  17394 ttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggaggtttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttg 17492  T
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 352  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  17493 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacatt 17591  T
Q  353 gtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||||| |||||    
T  17592 gtcgagtcaaagatga 17607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33649 - 33298
Alignment:
Q  1 atgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatg 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||           
T  33649 atgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatggatgagtctatacaagatgat------- 33557  T
Q  100 atgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcata-catttgttgggggctc 195  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  33556 --gttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttttttaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatgttgcgggctc 33459  T
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc 294  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||    
T  33458 atgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaatgtatattaatactaaactgtcgggggc 33359  T
Q  295 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 356  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  33358 tcatgccctgaattcgtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcg 33298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 385
Target Start/End: Original strand, 7858 - 8216
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaact-ccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  || | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7858 tgttgttgtaatctgcctaggctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatatgagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattggata 7957  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  7958 aataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgat 8055  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  8056 ggagcattagctcaaattagtgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccct-aaatggtaccacatgca 8154  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8155 tataagaggtttaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 422547 - 422767
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  422547 atgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatga 422646  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaaga-tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  422647 tgttgaactccaaattattggatgtaaatgagatgatgattaagatggttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggcttatgc 422746  T
Q  200 catggagctttgtactcacca 220  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  422747 cctggagctttgtcctcacca 422767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 290 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 204693 - 204600
Alignment:
Q  290 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  204693 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgca-ctgtcgcatagtcgagtcaataatgaaagatg-ttaagatgct 204600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 422802 - 422898
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  422802 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccagatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 422898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 160482 - 160437
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160482 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 160437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 500898 - 500853
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  500898 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 500853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 173359 - 173217
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--t 129  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||         || || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  173359 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct---------gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 173269  T
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  173268 gataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 173217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7572 - 7355
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  7572 atgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatga 7473  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7472 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgatagagtccatgcattagcatac-tttgttgggggctcatgcc 7375  T
Q  201 atggagctttgtactcacca 220  Q
     | ||||||||| |||||||    
T  7374 ctagagctttgtcctcacca 7355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Original strand, 9599 - 9654
Alignment:
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9599 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 9654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7321 - 7224
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7321 aaagtatattaatactatgatgttgagggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttatatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 7224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18313 - 17953
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18313 ctgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 18214  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | || ||    
T  18213 aaataagagatgatgattatgatgttt-aagaag-tcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcataccctggagcttagtactgaacacga 18116  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat--atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||   || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18115 tggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaattattgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 18016  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18015 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 17953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 77448 - 77500
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  77448 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgttgcattgtcgagtc 77500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 376
Target Start/End: Original strand, 65838 - 66189
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||   || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  65838 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 65937  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||    
T  65938 aaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgaactcaacacga 66035  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || |||| |||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  66036 tggagctttagctc-aaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggctcatgccctgaaatggtaccacatgc 66134  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  66135 ataaaagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatgtt 66189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 53645 - 53481
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  53645 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattat 53546  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  53545 tggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 53481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 53384 - 53330
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  53384 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 53330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 128697 - 128509
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  128697 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 128599  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatatgt---ttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgc--atataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||     | ||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  128598 gcccttgaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccgcatgcatatataagaggtctaagttgcat 128509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 36648 - 36703
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36648 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 36703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 373
Target Start/End: Original strand, 18494 - 18844
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||  |||||  |||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||    
T  18494 ctgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgataaagaagatgttgaacctccaaattattggat 18593  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||    
T  18594 acataagagatgaagattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 18692  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  18693 tggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaaatggtaacacatgc 18792  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgat 373  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18793 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgat 18844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 414068 - 414284
Alignment:
Q  3 gaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatg 102  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||    
T  414068 gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgcgtctatacatgatgattaagatgatg 414167  T
Q  103 ttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  414168 ttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaaatgtttt-agatgatagagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccct 414266  T
Q  203 ggagctttgtactcacca 220  Q
    |||||||||| |||||||    
T  414267 ggagctttgtcctcacca 414284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 414318 - 414415
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  414318 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggcaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 414415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 368
Target Start/End: Original strand, 340122 - 340335
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |||||||| || ||| |||||   | ||||| ||| ||    
T  340122 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagct-aaaattgcgatgggggcttgat 340220  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa----gttgcatttgtcgcatt 352  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||| ||||    
T  340221 gccctggaagtatattaatactaatagcgatgggggcttgatgccctcgattggtaccacatgcatataagaggtctaattaagttgcata-gtcacatt 340319  T
Q  353 gtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||||| |||||    
T  340320 gtcgagtcaaagatga 340335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 100901 - 100849
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  100901 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtc 100849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 68921 - 68616
Alignment:
Q  59 tttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat- 156  Q
    ||||| |||||||| ||||||  || ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| ||||     
T  68921 tttaantaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgtcgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagatt 68822  T
Q  157 gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt 256  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  68821 gattgagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggctt 68722  T
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||    
T  68721 atgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgt 68624  T
Q  355 cgagtcaa 362  Q
    ||||||||    
T  68623 cgagtcaa 68616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 66441 - 66605
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  66441 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattat 66540  T
Q  119 tggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  66541 tggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 66605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 66702 - 66756
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  66702 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 66756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12839 - 12550
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    |||||||||||||||  |||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  |||||| |    
T  12839 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttaaattccaaatcgttggatat 12740  T
Q  126 acat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12739 atatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 12641  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aat-atgtttggggctcatgccctgtattggt 311  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||| |||| || ||| ||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12640 tggagcattagctcaaattagtgatgggggcttacgctctggaagtatactaatactcaaataatgttgggggctcatgccctgaattggt 12550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 306 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10523 - 10454
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10523 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 10454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11139 - 11101
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 61638 - 61697
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  61638 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 61697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 65554 - 65613
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  65554 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 65613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 66061 - 66116
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  66061 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 66116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3735 - 3469
Alignment:
Q  108 ctccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagc 207  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  3735 ctccaaattactggatatataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagtatacatatgttaggggctcatgccctggagc 3637  T
Q  208 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctg 304  Q
    || ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||   | | |||||||||||||||    
T  3636 ttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatatttatactcaaataacgatgggggctcatgccctg 3537  T
Q  305 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgat 373  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3536 aattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatggtcgagtcaatgatgaatgat 3469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8166 - 7900
Alignment:
Q  108 ctccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagc 207  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  8166 ctccaaattactggatatataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagtatacatatgttaggggctcatgccctggagc 8068  T
Q  208 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctg 304  Q
    || ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||   | | |||||||||||||||    
T  8067 ttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatatttatactcaaataacgatgggggctcatgccctg 7968  T
Q  305 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgat 373  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7967 aattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatggtcgagtcaatgatgaatgat 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 30783 - 30977
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 125  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30783 tgttgttgtgatccgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgt 30882  T
Q  126 acatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30883 atatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 30977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 363
Target Start/End: Original strand, 34148 - 34220
Alignment:
Q  290 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 363  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34148 ggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatatgagagatttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaat 34220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1705 - 1654
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1705 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 15023 - 15068
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15023 atgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 6324 - 6482
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6324 atgaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 6423  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6424 tgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgat 6482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1415 - 1056
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 124  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1415 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 1316  T
Q  125 tacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 224  Q
     | | ||||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || |||    
T  1315 aataagagatgatgattttgat-ttttaagat-atcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgttctggagctttgtactcaacacgat 1218  T
Q  225 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 321  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||| | ||||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1217 ggagctttagctcaaattagcgatgggggcatatgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 1118  T
Q  322 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    || ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  1117 taaaagaggtctaagttgca-tagtcacatagtcgagtcaatgacgaaagatg-ttaagatgct 1056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15481 - 15443
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15481 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23920 - 23562
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23920 ctgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 23821  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23820 aaataagagatgatgattgtgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaacacga 23723  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    | |||| || ||||  |||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||   | | || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  23722 tagagctttagctc--aatagtgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgggagctcatgccccgaattggtaccacatgc 23625  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 385  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23624 atataagaggtctaagttgca-tagtctcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 23562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32450 - 32171
Alignment:
Q  96 gatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggct 194  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  32450 gatgatgtcgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattatcatacatatgttgggggct 32352  T
Q  195 catgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 291  Q
    |||||| || ||||| ||   || || ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  32351 catgccctgaagcttagt---caacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatggg 32255  T
Q  292 ggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32254 ggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgattgatgtt 32171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8567 - 8527
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgc 72  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8567 tgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgc 8527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15711 - 15671
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgc 72  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15711 tgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgc 15671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 362
Target Start/End: Original strand, 27238 - 27501
Alignment:
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27238 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatg 27337  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 298  Q
    || |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||    
T  27338 ccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaacacttgggggctcat 27437  T
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27438 accctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 27501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 2453 - 2673
Alignment:
Q  2 tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgat 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||| |    
T  2453 tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagtctatacatgatgaataagatgtt 2552  T
Q  102 gttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2553 gttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgc 2652  T
Q  200 catggagctttgtactcacca 220  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  2653 cttggagctttgtcctcacca 2673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 10313 - 10533
Alignment:
Q  2 tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgat 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||| |    
T  10313 tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagtctatacatgatgaataagatgtt 10412  T
Q  102 gttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10413 gttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgc 10512  T
Q  200 catggagctttgtactcacca 220  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  10513 cttggagctttgtcctcacca 10533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 10566 - 10662
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10566 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtctagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 10662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 2706 - 2773
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta 334  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2706 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtcta 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20057 - 19739
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 123  Q
    |||||||||| |||||  |||| | ||| ||||||||||  ||| ||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20057 ctgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 19958  T
Q  124 gtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
      | | ||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||    
T  19957 aaataagagataatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagttttgtactcaacacga 19860  T
Q  224 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 320  Q
    |||||| || ||||||  ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19859 tggagctttagctcaat-tagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 19761  T
Q  321 atataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19760 atataagaggtctaagttgcat 19739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38271 - 38182
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  38271 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 38182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10543 - 10252
Alignment:
Q  54 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgtttta 152  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||    | ||||||| |||||||||||||||    
T  10543 tgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgatcaagacgatgttgaacctccaaattcttggatacctaagagatgacgattaagatgtttta 10444  T
Q  153 agatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggg 252  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| | |||||    
T  10443 aga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggtgctcatgcccttgagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggg 10345  T
Q  253 ccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10344 gcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaagtcgcat 10252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3276
Alignment:
Q  162 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgcc 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  3458 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgcc 3359  T
Q  262 ctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3358 ctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7339
Alignment:
Q  162 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgcc 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  7522 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgcc 7423  T
Q  262 ctgaaagtatattaatact-aata--tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7422 ctggaagtatattaatactcaataacctttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 7339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 27993 - 28080
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27993 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 28080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36502 - 36213
Alignment:
Q  54 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgtttta 152  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||  ||||||| |    
T  36502 tgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt-a 36404  T
Q  153 agatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggg 252  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||  | |||||    
T  36403 agagg-ttgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacatgatggagctttagctc-aaatagcgatgggg 36306  T
Q  253 ccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
     || |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36305 gctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattagtaccacatgcatataagaggtctaacttgcat 36213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 386
Target Start/End: Original strand, 48500 - 48847
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgatt-aggatgatgttgaa-ctccaaattattgga 122  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||| || ||| ||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48500 ctgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgtgtcgatataagatgaatcaagatgatgttgaatctccaaattattgga 48599  T
Q  123 tgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 222  Q
    || | | ||||||||| ||| ||||||| |||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||      
T  48600 tgaataagagatgatgtttacgatgttt-aagaag-tcgagtccatgcattagcatacatatgttgg---------------agctttgtactcaccaca 48682  T
Q  223 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatg 319  Q
    ||||||| || ||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48683 atggagctttagctcaaaataaagatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatg 48782  T
Q  320 catataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgctt 386  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  48783 catataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgctt 48847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19059 - 19014
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19059 atgctctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 178957 - 178632
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtacatgagatgatgatt 141  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  |||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  178957 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgatt 178858  T
Q  142 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 241  Q
      ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||  ||    
T  178857 gtgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcataccctggagctttgtacttaacatgatggagctttagctc--aa 178762  T
Q  242 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    ||  | ||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |  |   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  178761 tagcgatgggggcttatgccctggcggtatattaacactcaattagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 178662  T
Q  339 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 369  Q
    ||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  178661 gca-tactcgcatagtcgagtcaatgatgaa 178632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2193 - 2016
Alignment:
Q  186 ttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aata 284  Q
    ||||||||| || || ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2193 ttgggggcttataccctggagcttactactcaccacgatggagcattagctcaaattaaagatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaata 2094  T
Q  285 t-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
      ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2093 aagttgggggctcatgccctgtatttgtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 2016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2269 - 2048
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  2269 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatttgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgt 2171  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    | |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2170 tcttgaactccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgatttagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatg 2073  T
Q  199 ccatggagctttgtactcaccatga 223  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  2072 ccctggagctttgtcctcaccatga 2048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2015 - 1960
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2015 agtatattaatactataatgttgggggctaatgccttg-attggtaccacatgcata 1960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 329
Target Start/End: Original strand, 195119 - 195258
Alignment:
Q  189 ggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtt 288  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  195119 ggggctcatgccctggagcttaatcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgtt 195218  T
Q  289 tggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagag 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  195219 gggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagag 195258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 192333 - 192528
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||| || ||||     
T  192333 atgaattgttataatgaagttataatgttgttgtgatttgaatatgctgcctttgttatttaactaagttgtgtgagtcattataagatgaataagatgt 192432  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaagatgttttaaga-tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggct 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  192433 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattattttagattgattgagtccatgcattagcattcatatgttgggggct 192528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 4270 - 4465
Alignment:
Q  29 tgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  4270 tgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcata 4368  T
Q  129 -tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 225  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  4369 ttgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctgaagctttgtcctcaccacgatg 4465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 1419 - 1457
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1419 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 4473 - 4529
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4473 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 4529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8661 - 8443
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||     
T  8661 atgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgt 8563  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||   | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8562 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattcattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatg 8465  T
Q  199 ccatggagctttgtactcacca 220  Q
    || ||||||||| | |||||||    
T  8464 ccctggagctttttcctcacca 8443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8407 - 8312
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8407 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 10058 - 10240
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||||    
T  10058 atgaattgatattataaagttatactattgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatga 10157  T
Q  101 tgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| || |||||| |||||||||||||    
T  10158 tgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagaatccatgcattagcatacatt 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 352
Target Start/End: Original strand, 10334 - 10379
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 352  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10334 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatt 10379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 404
Alignment:
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aatatgttt--ggggctca 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||    
T  548 atggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacctttgggggctca 449  T
Q  298 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  448 tgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 639 - 542
Alignment:
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  639 gagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcaggccctggagctttgtactcaccacaatggagc 542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 284 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1939 - 1848
Alignment:
Q  284 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1939 atgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 1848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1982 - 1917
Alignment:
Q  201 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaa 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1982 atggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctcatgccctgaa 1917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8051
Alignment:
Q  109 tccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagct 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7942 tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttt--agatgatagagtccctacattagcatacattcgttgggggctcatgccctggagct 8039  T
Q  209 ttgtactcacca 220  Q
    |||| |||||||    
T  8040 ttgtcctcacca 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 331
Target Start/End: Original strand, 8077 - 8151
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8077 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctaatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16561 - 16516
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561 atgccctggataggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8445 - 8359
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8445 atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 8359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8350 - 8290
Alignment:
Q  316 catgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8350 catgcatataagaggtttaggttgcatt-gtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 8290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 10600 - 10787
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  10600 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 10698  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 339
Target Start/End: Original strand, 11620 - 11803
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  11620 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 11718  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11719 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 11803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4657 - 4471
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  4657 gagtccatgcattagcattcatt-gttaggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 4559  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4558 gccctggaagtatattaatactcaaataccgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1100 - 1005
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1100 aaagtatattaatactatgatgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1258 - 1172
Alignment:
Q  97 atgatgttgaactccaaattattggatgtacatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1258 atgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 1172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29192 - 29013
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||   |||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||     
T  29192 aattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtctatacatgatgattaagttgatga 29093  T
Q  104 tgaactccaaattattggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29092 tgaattccaaattattggatgtataagtgatatgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 29013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13441 - 13254
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  13441 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 13343  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13342 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccatatgcatataagaggtctaagttgcat 13254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4517 - 4291
Alignment:
Q  139 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 237  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  4517 attaagatgtttttagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcacctcgttggagcattagctc 4420  T
Q  238 aaaataatg-ttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 332  Q
    ||| ||  | ||||||| | ||||| |  ||||||| |||||||  ||||| | ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4419 aaattagcgattggggcttgatgcctttgaagtataataatactcaaatatcgattggggcttgatgccccttattggtaccacatgcatataagaggtc 4320  T
Q  333 taagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4319 taagttgca-tagtcgcattgtcgagtcaa 4291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1941 - 1736
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg-ttggggccttat 258  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||||| | ||    
T  1941 gagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgattggggcttgat 1843  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgt 354  Q
    |||||  ||||||| ||||||| | ||   | ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1842 gccctagaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgccccatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattgt 1744  T
Q  355 cgagtcaa 362  Q
    ||||||||    
T  1743 cgagtcaa 1736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28359 - 28172
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttat- 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||   ||||| ||||      
T  28359 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggaggtttagctcaaattaacaatgggggcttaaa 28260  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28259 gccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccatgtattagtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 28172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 342
Target Start/End: Original strand, 6375 - 6452
Alignment:
Q  265 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6375 aaagtatattaatactatgatgttgagggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 6452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31826
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  32012 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 31914  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatact--aatatgtttgggg--ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||    |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31913 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaagtctaagttgcat 31826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 168154 - 168340
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  168154 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgat 168252  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||| |||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168253 gccctggaagtattttaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 168340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51718 - 51673
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51718 atgccctgtattgctaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 51673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2450
Alignment:
Q  137 tgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2532 tgattaagatgtttta-gacgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 2450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2390 - 2335
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2390 attggtaccacatgcatataagaggttttggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 2335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 376
Target Start/End: Original strand, 65022 - 65100
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  65022 atgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 65100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46940 - 46753
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  46940 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctagagctttgtactccccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 46842  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46841 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 46753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1708
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat---gttggggcctt 256  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |   | ||||| |||    
T  1897 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaaattagcgatgggggctt 1799  T
Q  257 -atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
     |||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1798 gatgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16186 - 16039
Alignment:
Q  202 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa--taatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggct 295  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||    
T  16186 tggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggct 16087  T
Q  296 c-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16086 tgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2763
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat-aatgttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||| |    
T  2576 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctagagctttgtactcacaacgttggagcattagctcaaaattaacgatgggggcttga 2674  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2675 tgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgtcttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 369
Target Start/End: Original strand, 995 - 1073
Alignment:
Q  290 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 369  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  995 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-taatcgcatagtcgagtcaatgatgaa 1073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 5339 - 5491
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttg 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| | ||   | | |    
T  5339 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgataccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgg 5438  T
Q  291 gggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5439 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 5491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32105 - 31918
Alignment:
Q  162 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-at 258  Q
    |||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |  | ||||| ||| ||    
T  32105 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggggcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 32006  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32005 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 35527 - 35605
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 79  Q
    |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35527 atgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 35605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27821 - 27638
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 259  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | || |||||||| || ||||||| ||  | |||||| | |||    
T  27821 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactaaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatggggcttgatg 27723  T
Q  260 ccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27722 ccctggaagtatattaatacttatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 27638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 351
Target Start/End: Original strand, 6277 - 6321
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6277 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcatttgtcgcat 6321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 351
Target Start/End: Original strand, 8276 - 8320
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8276 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcatttgtcgcat 8320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51492 - 51339
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa--taatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttg 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||    ||    
T  51492 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcaatg 51393  T
Q  291 gggc--tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51392 ggaacttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 51339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8426 - 8239
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||| || |  | ||||| ||| |    
T  8426 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggatctttgtactcaccacattggagcattagctcaacattagcgatggggacttga 8328  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   | | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327 tgccctggaagtatattaatactaaaatagcgatgggggcttgatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 174711 - 174524
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  174711 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggagaatttgctcaaaattagcgatgggggcttga 174613  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174612 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggtggcttgatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 174524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 121614 - 121569
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121614 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 121569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 136665 - 136752
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  136665 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcctgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggattaagttgcat 136752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Original strand, 1306 - 1407
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 1405  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  1406 at 1407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 8704 - 8890
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||  || || ||||| ||| ||    
T  8704 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaat-tagtgatgggggcttgat 8802  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8803 gccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3003 - 2913
Alignment:
Q  4 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgatta 94  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  3003 aattgatattataaagttatattgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataagtctatataagattatta 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 5148 - 5193
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5148 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 5193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3275 - 3230
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3275 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10312 - 10267
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10312 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 210
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggc-tcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 240  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  290 gagtccatgcattagcatttctttgttgggggcttgatgccctggagctttgcactcaacacgatggagctttagctcaaa 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 78 - 33
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 33  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34068 - 33881
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 257  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| || | |||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  34068 gagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctgcaactttgtactcaccacgttggagctttagctcaaaattagcgatgggggcttga 33970  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33969 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgccctgtattcgtaccatatgcatataagaggtctaagttgcat 33881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38609 - 38564
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38609 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32324 - 32279
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32324 atgccctgtattggtacaacatgcatataagaggtctaagttgcat 32279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32790 - 32745
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32790 atgccctgtattggtacaacatgcatataagaggtctaagttgcat 32745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15962 - 15917
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 33227 - 33314
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33227 atgccctggaagtatattaatacttataccgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 33314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45778 - 45691
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45778 atgccctggaagtatattaatacttataccgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 45691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 17600 - 17686
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||    |||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17600 atgccctggaagtatattaatacttatagcgatggggcttgattccctggattggtaccacatgcatagaagaggtctaagttgcat 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 20055 - 20197
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--t 129  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||         || || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  20055 tgtgatctgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgaatct---------gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 20145  T
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20146 gataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 20197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1913 - 1842
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  1913 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6330 - 6259
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  6330 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 6259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8219
Alignment:
Q  295 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8266 tcatgccatgcattggtaccacaagcatataagaggtttaagttgcat 8219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13157 - 12972
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atg 259  Q
    ||||||||| ||||||||    |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||    
T  13157 gagtccatgcattagcatttcattgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttgatg 13059  T
Q  260 ccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13058 ccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 12972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9431 - 9346
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtacatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  9431 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 9346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Original strand, 4971 - 5041
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||    
T  4971 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgttgagtcaaagatga 5041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Original strand, 3463 - 3533
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  3463 atgccctggattggtaccacattcatataagaggtctaagttgca-taatcgcattgtcgagtcaaagatga 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29606 - 29479
Alignment:
Q  54 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--tgagatgatgattaagatgtttt 151  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||    
T  29606 tgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtataagtaatatgatgattaagatgtttt 29507  T
Q  152 aagatgattgagtccatgtattagcataca 181  Q
      | |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  29506 --gttgatagagtctatgcattagcataca 29479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29382 - 29326
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29382 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 29326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 24165 - 24252
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  ||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24165 atgccctggaagtatattaatacataatacattgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 339
Target Start/End: Original strand, 6397 - 6439
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6397 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 6439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 339
Target Start/End: Original strand, 12641 - 12683
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 12683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1195 - 1150
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1195 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6341
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6386 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 6341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6672 - 6571
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6672 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctcagttgc 6573  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  6572 at 6571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 8383 - 8428
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8383 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10457 - 10412
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10457 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11847 - 11802
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11847 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 11802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8926 - 8881
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20473 - 20428
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20473 atgccctgtattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgcat 20428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4743 - 4649
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4743 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagattgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 4649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5442 - 5397
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5442 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 5397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21893 - 21848
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 18658 - 18813
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||         ||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  18658 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaagttgcatgagtc---------tgaataagttgatgatgaactccaaattat 18748  T
Q  119 tggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| |  |||  ||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18749 tggatgtataagtgatttgatgattaaggtgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 18813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 18907 - 18962
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18907 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 18962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 16912 - 16957
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16912 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Original strand, 46059 - 46160
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46059 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactatgttaagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatataagaggtataagttgc 46158  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  46159 at 46160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 47043 - 47088
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47043 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 47088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10120 - 10075
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10120 atgccctatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20819 - 20734
Alignment:
Q  196 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20819 atgccttggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 20734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 52302 - 52347
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52302 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 52347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 53830 - 53917
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53830 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 53917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1656 - 1611
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1656 atgccctgtaatggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 207856 - 207927
Alignment:
Q  1 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgc 72  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  207856 atgaattgatattatgaagttatactgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgc 207927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 205235 - 205297
Alignment:
Q  156 tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  205235 tgattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 205297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 205333 - 205389
Alignment:
Q  267 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 323  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  205333 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 205389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30121 - 30076
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30121 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 30076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 2698 - 2853
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||         ||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  2698 attaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaagttgcatgagtc---------tgaataagttgatgatgaactccaaattat 2788  T
Q  119 tggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  2789 tggatgtataagtgatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtacatgcattagcatacatt 2853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 2947 - 3001
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2947 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 73856 - 73911
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  73856 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 73911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 129759 - 129658
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||  |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  129759 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacattcatataagaggtctaagttgc 129660  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  129659 at 129658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 117949 - 117994
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  117949 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 117994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 242105 - 241966
Alignment:
Q  43 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca-tgagatgatgat 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  242105 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 242007  T
Q  141 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  242006 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 241966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 161431 - 161476
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161431 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 161476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4794 - 4609
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| || | ||||  ||  | ||||| ||| ||    
T  4794 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagttttgtactcaccacgttggagctttaggtcaat-tagcgatgggggcttgat 4697  T
Q  259 gccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||| || |||||||||||||||  |||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4696 gccttggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacattcttataagaggtctaagttgcat 4609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 5)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12984 - 12829
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||         || || | ||||| |||||||||||||||    
T  12984 attaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtct---------gaataagttgatgatgaactccaaattat 12894  T
Q  119 tggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| |  |||  || |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12893 tggatgtataagtgatttgttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 12829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19268 - 19113
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattat 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||         || || | ||||| |||||||||||||||    
T  19268 attaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtct---------gaataagttgatgatgaactccaaattat 19178  T
Q  119 tggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    |||||||| |  |||  || |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19177 tggatgtataagtgatttgttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 19113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12735 - 12680
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12735 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 12680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19019 - 18981
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19019 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcatt 18981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 62089 - 62042
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  62089 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 62042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 342
Target Start/End: Original strand, 76 - 123
Alignment:
Q  295 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  76 tcatgccctgtattagtaccacatgtatataagaggtctaagttgcat 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1234 - 1045
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggct-catgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa-taatgttggggcctt-a 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||| |    
T  1234 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttcatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 1136  T
Q  258 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcata----taagaggtctaagttgc 340  Q
    || |||| ||||||||||| ||| | ||   | | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  1135 tgtcctggaagtatattaaaactcaaatagcggtcggggcttgatgccccgtattggtaccacatgcatataattaagaggtctaagttgc 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 15530 - 15575
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15530 atgccctggattggtaccacatgcatataacaagtctaagttgcat 15575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Original strand, 39006 - 39045
Alignment:
Q  303 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39006 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 39045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 103912 - 103999
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  103912 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggattaagttgcat 103999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32373 - 32286
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32373 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctatgttgcat 32286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Original strand, 16941 - 16988
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16941 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 16988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 132503 - 132441
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  132503 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 132441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 228411 - 228553
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtaca--t 129  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||         || || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  228411 tgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct---------gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 228501  T
Q  130 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||  ||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  228502 gatttgatgattaaggtgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 228553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 242
Target Start/End: Original strand, 1225 - 1306
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 242  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  1225 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaat 1306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 1333 - 1369
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1333 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 342
Target Start/End: Original strand, 2460 - 2514
Alignment:
Q  289 tggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2460 tggggctcgatgctctgtattggtacaacatgcatataagaggtctaagttgcat 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 18350 - 18388
Alignment:
Q  304 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18350 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 786
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  831 atgccctggattggtaccacatgcatataagagttctaagttgcat 786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9165 - 9114
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9165 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 9114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11242 - 11197
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11242 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctacgttgcat 11197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Original strand, 8340 - 8441
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8340 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgc 8439  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  8440 at 8441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 342
Target Start/End: Original strand, 29036 - 29137
Alignment:
Q  244 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||  |||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29036 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatggatataagaggtctaagttgc 29135  T
Q  341 at 342  Q
    ||    
T  29136 at 29137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37153 - 37112
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37153 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 37112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 14649 - 14704
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14649 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10103 - 10058
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10103 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Original strand, 77659 - 77700
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77659 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 77700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 347 - 304
Alignment:
Q  299 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  347 gccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 626 - 531
Alignment:
Q  56 ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtacatgagatgatgattaagatgttt 150  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||| ||| |||||||    
T  626 ttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgtttatgatgttt 531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 3901 - 3960
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3901 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 4406 - 4461
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4406 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 4461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31905 - 31843
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  31905 attggtatcacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 31843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3481 - 3420
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  3481 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 3420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26904 - 26822
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac 108  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  26904 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatgttgaac 26822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 5)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 352
Target Start/End: Original strand, 25245 - 25290
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25245 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgca-ttgtcgcatt 25290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Original strand, 25065 - 25150
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25065 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 25150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 225284 - 225240
Alignment:
Q  298 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  225284 tgccctggattggtaccatatgcatataagaggtttaagttgcat 225240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 189939 - 189994
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  189939 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 189994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 342
Target Start/End: Original strand, 5021 - 5049
Alignment:
Q  314 cacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5021 cacatgcatataagaggtctaagttgcat 5049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1728 - 1677
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1728 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 1677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 6517 - 6568
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6517 attggtaccacatgcatataag-tgtccaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 6568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12366 - 12321
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12366 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggattaagttgcat 12321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 340
Target Start/End: Original strand, 16344 - 16429
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16344 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgc 16429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19641 - 19484
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggat 123  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| ||||  |||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19641 ctgttattgtgacttgactatgatgctgttgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgatgtttagctccaaattattggat 19543  T
Q  124 gtaca-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    | | | ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  19542 gcatattgatatgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 19484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25815 - 25658
Alignment:
Q  25 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggat 123  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| ||||  |||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25815 ctgttattgtgacttgactatgatgctgttgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgatgtttagctccaaattattggat 25717  T
Q  124 gta-catgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    | |   ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  25716 gcattttgatatgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 25658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3011
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2966 atgccctggattgctaccacatgcatataagaggtataagttgcat 3011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36137 - 36086
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36137 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 36086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 11579 - 11630
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11579 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 35968 - 36027
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    |||| ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35968 attaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 36027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6790 - 6739
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6790 attggtaccacatgcatataag-tgtccaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 6739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 36526 - 36581
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36526 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 36581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 66338 - 66294
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  66338 atgccctgtattggtaccacatgcatataaga-gactaagttgcat 66294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25744 - 25699
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25744 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaggttgcat 25699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 1224 - 1303
Alignment:
Q  161 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 240  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  1224 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaa 1303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 196 - 146
Alignment:
Q  307 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 359  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  196 ttggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 3422 - 3458
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3422 attggtaccacatgcatataagaggtctgagttgcat 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 7982 - 8018
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7982 attggtaccacatgcatataagaggtctgagttgcat 8018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6404 - 6360
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 341  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6404 atgccgtggattggtagcacatgcatataagaggtctaagttgca 6360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2517 - 2427
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2517 atgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12502 - 12451
Alignment:
Q  19 attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 70  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12502 attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 12451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11991 - 11936
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11991 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 11936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1769 - 1730
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaag 336  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1769 atgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaag 1730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 337
Target Start/End: Original strand, 2079 - 2161
Alignment:
Q  257 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2079 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacatgcatataagaggtttaagt 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 53 - 108
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  53 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9421 - 9366
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9421 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 9366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Original strand, 9761 - 9846
Alignment:
Q  98 tgatgttgaactccaaattattggatgtaca--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| | | |||||||||||||||  | ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9761 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgataaagtccatgaattagcatacatt 9846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 5636 - 5691
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5636 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 5691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Original strand, 5146 - 5186
Alignment:
Q  38 ctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 78  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5146 ctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15165 - 15118
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15165 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 15118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 20741 - 20796
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20741 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 20796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 4984 - 5061
Alignment:
Q  26 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 103  Q
    ||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||  |||||| || ||||||||    
T  4984 tgttgttgtgatctccctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcaatatgagatgaataagatgatgt 5061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 33223 - 33278
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33223 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 33278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9732 - 9685
Alignment:
Q  306 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  9732 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 9685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 6551 - 6598
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6551 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 14005 - 14052
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14005 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 14052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 18398 - 18446
Alignment:
Q  32 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 80  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18398 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct 18446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2823 - 2718
Alignment:
Q  77 gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtacat-gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattag 175  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||    
T  2823 gtctatatatgatgattaagatgacgtttggctccaaattattggatgcatatcgatatgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattag 2726  T
Q  176 catacatt 183  Q
    ||| ||||    
T  2725 cattcatt 2718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 56048 - 56095
Alignment:
Q  297 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  56048 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 56095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University