View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16974_low_24 (Length: 407)

Name: NF16974_low_24
Description: NF16974
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16974_low_24
NF16974_low_24
[»] chr2 (102 HSPs)
chr2 (10-407)||(44492989-44493385)
chr2 (10-361)||(18672342-18672696)
chr2 (10-407)||(42487462-42487858)
chr2 (13-407)||(21439624-21440021)
chr2 (28-383)||(20720077-20720425)
chr2 (195-407)||(40364862-40365073)
chr2 (195-371)||(13371973-13372149)
chr2 (195-407)||(31771422-31771634)
chr2 (195-407)||(7439326-7439537)
chr2 (195-407)||(3043339-3043550)
chr2 (216-407)||(10357421-10357611)
chr2 (195-407)||(20721207-20721418)
chr2 (216-407)||(8737810-8738000)
chr2 (216-407)||(31436144-31436333)
chr2 (216-407)||(33832123-33832312)
chr2 (220-407)||(42274304-42274490)
chr2 (197-407)||(43932715-43932923)
chr2 (195-407)||(14200942-14201155)
chr2 (195-406)||(44286662-44286868)
chr2 (10-172)||(43932554-43932717)
chr2 (216-383)||(33031180-33031346)
chr2 (233-406)||(41120845-41121016)
chr2 (195-406)||(25100691-25100901)
chr2 (242-407)||(6457372-6457537)
chr2 (195-407)||(8392312-8392515)
chr2 (195-407)||(30784291-30784492)
chr2 (237-392)||(32318963-32319119)
chr2 (211-406)||(23496666-23496861)
chr2 (237-407)||(3118079-3118248)
chr2 (217-407)||(19058643-19058832)
chr2 (269-407)||(25666144-25666281)
chr2 (238-407)||(36511995-36512164)
chr2 (262-407)||(32318322-32318467)
chr2 (216-349)||(44879717-44879850)
chr2 (269-407)||(34073624-34073762)
chr2 (288-407)||(29809401-29809519)
chr2 (262-407)||(32319565-32319711)
chr2 (230-383)||(9111698-9111850)
chr2 (220-407)||(13027445-13027631)
chr2 (195-352)||(36881180-36881337)
chr2 (198-349)||(18917366-18917512)
chr2 (262-383)||(37592924-37593042)
chr2 (269-369)||(33000914-33001015)
chr2 (195-291)||(29809232-29809328)
chr2 (216-291)||(35498773-35498848)
chr2 (224-317)||(3118639-3118732)
chr2 (229-407)||(10287239-10287413)
chr2 (10-68)||(3105544-3105602)
chr2 (312-407)||(16709143-16709238)
chr2 (312-407)||(20973248-20973343)
chr2 (309-407)||(36218631-36218729)
chr2 (312-391)||(3854926-3855005)
chr2 (312-407)||(12620338-12620433)
chr2 (312-407)||(13803290-13803385)
chr2 (312-407)||(35516312-35516407)
chr2 (312-407)||(37850323-37850418)
chr2 (312-407)||(41178710-41178805)
chr2 (103-153)||(3104985-3105035)
chr2 (332-406)||(35498695-35498768)
chr2 (312-407)||(9737497-9737593)
chr2 (315-407)||(45301274-45301366)
chr2 (314-385)||(7662400-7662471)
chr2 (312-407)||(10214818-10214913)
chr2 (312-407)||(14542160-14542255)
chr2 (219-254)||(37592894-37592929)
chr2 (312-379)||(41781983-41782049)
chr2 (197-295)||(13803172-13803270)
chr2 (197-295)||(18549396-18549494)
chr2 (312-374)||(22982357-22982418)
chr2 (309-407)||(37741925-37742023)
chr2 (197-295)||(37850204-37850302)
chr2 (197-295)||(44300696-44300794)
chr2 (314-407)||(17614942-17615035)
chr2 (315-407)||(38063071-38063164)
chr2 (303-407)||(31653362-31653466)
chr2 (197-260)||(2431369-2431432)
chr2 (197-260)||(6708008-6708071)
chr2 (312-407)||(7401658-7401753)
chr2 (197-260)||(16709025-16709088)
chr2 (197-252)||(17615431-17615486)
chr2 (312-407)||(18549514-18549609)
chr2 (197-260)||(20506053-20506116)
chr2 (197-260)||(25553484-25553547)
chr2 (197-260)||(33666723-33666786)
chr2 (197-260)||(35516462-35516525)
chr2 (197-252)||(37850812-37850867)
chr2 (197-260)||(41178592-41178655)
chr2 (197-252)||(45300821-45300876)
chr2 (197-255)||(6708583-6708641)
chr2 (314-348)||(7662773-7662807)
chr2 (314-348)||(7749081-7749115)
chr2 (197-255)||(9737653-9737711)
chr2 (197-255)||(17614824-17614882)
chr2 (314-348)||(30098714-30098748)
chr2 (314-348)||(31653755-31653789)
chr2 (314-348)||(36219027-36219061)
chr2 (197-255)||(39375229-39375287)
chr2 (197-271)||(40855586-40855660)
chr2 (313-407)||(44612880-44612973)
chr2 (312-349)||(6244514-6244551)
chr2 (330-407)||(10972476-10972553)
chr2 (314-378)||(29924843-29924907)
[»] chr8 (124 HSPs)
chr8 (195-407)||(5765692-5765904)
chr8 (10-407)||(24451588-24451987)
chr8 (195-407)||(28755151-28755363)
chr8 (10-407)||(35369294-35369690)
chr8 (10-363)||(36063221-36063580)
chr8 (10-407)||(35863145-35863544)
chr8 (10-407)||(16473087-16473486)
chr8 (10-407)||(16477658-16478057)
chr8 (10-407)||(21135427-21135823)
chr8 (10-407)||(39337084-39337488)
chr8 (103-378)||(41281181-41281461)
chr8 (195-407)||(36018216-36018428)
chr8 (195-407)||(38706419-38706630)
chr8 (213-407)||(42499375-42499567)
chr8 (195-407)||(27875423-27875634)
chr8 (195-407)||(28015604-28015815)
chr8 (195-407)||(36470801-36471012)
chr8 (197-403)||(17842572-17842776)
chr8 (195-364)||(30968810-30968979)
chr8 (195-407)||(18839894-18840105)
chr8 (195-407)||(25101938-25102149)
chr8 (219-407)||(43988155-43988343)
chr8 (195-407)||(44265552-44265763)
chr8 (197-376)||(37706702-37706880)
chr8 (10-179)||(37706545-37706712)
chr8 (195-407)||(37967639-37967852)
chr8 (195-383)||(5695889-5696077)
chr8 (215-407)||(33322637-33322828)
chr8 (216-407)||(23483448-23483638)
chr8 (216-407)||(43622788-43622981)
chr8 (216-383)||(6018166-6018333)
chr8 (195-407)||(5250366-5250578)
chr8 (216-407)||(41590336-41590525)
chr8 (195-361)||(6590414-6590581)
chr8 (237-407)||(3865796-3865965)
chr8 (216-407)||(8784682-8784872)
chr8 (197-407)||(32514022-32514233)
chr8 (197-407)||(42024231-42024439)
chr8 (237-407)||(6244192-6244362)
chr8 (216-407)||(18304663-18304855)
chr8 (216-383)||(43936513-43936680)
chr8 (269-407)||(17498544-17498681)
chr8 (237-407)||(32243782-32243951)
chr8 (230-407)||(6243576-6243749)
chr8 (195-407)||(30658431-30658626)
chr8 (195-307)||(36126457-36126570)
chr8 (195-286)||(31185693-31185784)
chr8 (237-407)||(44894432-44894600)
chr8 (230-383)||(3866405-3866557)
chr8 (262-407)||(17062408-17062552)
chr8 (262-407)||(17585806-17585950)
chr8 (230-407)||(32244411-32244587)
chr8 (216-399)||(28701665-28701850)
chr8 (211-349)||(10410010-10410148)
chr8 (210-365)||(36910486-36910638)
chr8 (309-402)||(27000886-27000978)
chr8 (17-92)||(13323522-13323597)
chr8 (280-405)||(21159841-21159966)
chr8 (195-288)||(12469421-12469514)
chr8 (255-407)||(9252751-9252901)
chr8 (195-290)||(2827031-2827125)
chr8 (312-407)||(7419830-7419925)
chr8 (10-65)||(41280610-41280665)
chr8 (312-407)||(41315452-41315547)
chr8 (302-383)||(13323634-13323715)
chr8 (312-407)||(4517045-4517140)
chr8 (332-407)||(6413383-6413457)
chr8 (312-407)||(7637055-7637150)
chr8 (344-399)||(10409894-10409948)
chr8 (312-407)||(11385568-11385663)
chr8 (312-407)||(28174250-28174345)
chr8 (312-407)||(34058760-34058855)
chr8 (312-407)||(41219668-41219763)
chr8 (312-407)||(42219324-42219419)
chr8 (312-407)||(44090493-44090588)
chr8 (309-407)||(30378192-30378290)
chr8 (309-407)||(30839046-30839144)
chr8 (197-295)||(32098689-32098787)
chr8 (312-407)||(2060975-2061070)
chr8 (197-260)||(12616363-12616426)
chr8 (312-407)||(18365255-18365350)
chr8 (312-391)||(24541854-24541933)
chr8 (312-407)||(27923718-27923813)
chr8 (312-383)||(34050590-34050661)
chr8 (312-407)||(36765596-36765691)
chr8 (197-295)||(13699389-13699487)
chr8 (197-295)||(24685350-24685448)
chr8 (197-295)||(27519553-27519651)
chr8 (197-295)||(28174365-28174463)
chr8 (197-295)||(34058642-34058740)
chr8 (197-294)||(13082749-13082846)
chr8 (312-385)||(17918811-17918884)
chr8 (312-407)||(12616481-12616577)
chr8 (197-260)||(2060857-2060920)
chr8 (312-407)||(4136984-4137079)
chr8 (312-407)||(13082867-13082962)
chr8 (312-407)||(16729114-16729209)
chr8 (197-260)||(19183102-19183165)
chr8 (315-370)||(22849855-22849910)
chr8 (314-385)||(27519693-27519764)
chr8 (368-407)||(28695053-28695092)
chr8 (312-407)||(32098807-32098901)
chr8 (312-407)||(35209560-35209655)
chr8 (197-260)||(36051803-36051866)
chr8 (312-407)||(36051921-36052016)
chr8 (312-407)||(39106869-39106963)
chr8 (312-407)||(41724882-41724977)
chr8 (312-371)||(42175207-42175266)
chr8 (197-260)||(42219513-42219576)
chr8 (197-255)||(4516927-4516985)
chr8 (309-347)||(5549145-5549183)
chr8 (197-295)||(11385450-11385548)
chr8 (197-295)||(30378074-30378172)
chr8 (314-348)||(32099160-32099194)
chr8 (197-295)||(39106983-39107081)
chr8 (197-295)||(41724764-41724862)
chr8 (197-295)||(42175322-42175420)
chr8 (314-407)||(8076329-8076422)
chr8 (311-348)||(8076723-8076760)
chr8 (197-293)||(8076212-8076308)
chr8 (316-407)||(13699507-13699596)
chr8 (197-293)||(17918928-17919024)
chr8 (292-356)||(28695091-28695155)
chr8 (211-247)||(30806332-30806368)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (10-383)||(46044081-46044457)
chr7 (195-407)||(38599073-38599285)
chr7 (10-363)||(33624936-33625289)
chr7 (10-407)||(38199155-38199552)
chr7 (107-363)||(44167680-44167940)
chr7 (10-407)||(3495749-3496153)
chr7 (10-383)||(43083639-43084021)
chr7 (216-407)||(6331001-6331192)
chr7 (10-363)||(15130859-15131207)
chr7 (216-407)||(43597483-43597673)
chr7 (216-407)||(22378457-22378647)
chr7 (195-407)||(10620498-10620709)
chr7 (195-407)||(38159059-38159269)
chr7 (195-405)||(7238554-7238763)
chr7 (10-306)||(45958516-45958815)
chr7 (195-407)||(4926481-4926692)
chr7 (216-407)||(6588793-6588983)
chr7 (211-407)||(47791944-47792139)
chr7 (195-383)||(18059135-18059320)
chr7 (195-407)||(44081063-44081275)
chr7 (195-407)||(14990526-14990735)
chr7 (195-407)||(15420137-15420346)
chr7 (195-382)||(11396936-11397124)
chr7 (216-407)||(35482058-35482245)
chr7 (195-407)||(4899842-4900053)
chr7 (195-407)||(37539890-37540103)
chr7 (237-407)||(12621594-12621763)
chr7 (195-407)||(1544453-1544664)
chr7 (216-407)||(1962003-1962194)
chr7 (237-407)||(8832814-8832985)
chr7 (216-407)||(15652795-15652981)
chr7 (195-407)||(27727204-27727418)
chr7 (237-407)||(1065796-1065965)
chr7 (195-356)||(9633147-9633308)
chr7 (237-407)||(37107784-37107953)
chr7 (195-407)||(43574345-43574557)
chr7 (242-383)||(46330928-46331069)
chr7 (237-407)||(38594618-38594788)
chr7 (10-141)||(6934745-6934875)
chr7 (237-407)||(42974127-42974298)
chr7 (234-399)||(10463312-10463475)
chr7 (241-407)||(36019787-36019951)
chr7 (195-407)||(29155940-29156155)
chr7 (10-92)||(44167548-44167630)
chr7 (237-407)||(8081912-8082081)
chr7 (231-407)||(1066416-1066593)
chr7 (10-160)||(46331100-46331252)
chr7 (211-358)||(47139730-47139878)
chr7 (230-407)||(37108412-37108589)
chr7 (195-405)||(28924600-28924809)
chr7 (211-306)||(16080773-16080868)
chr7 (312-407)||(7208003-7208098)
chr7 (319-407)||(21109448-21109536)
chr7 (312-407)||(9900541-9900636)
chr7 (312-407)||(23023526-23023621)
chr7 (312-407)||(39035847-39035942)
chr7 (312-407)||(45986193-45986288)
chr7 (309-391)||(5029211-5029293)
chr7 (309-407)||(30740669-30740767)
chr7 (302-407)||(2510673-2510778)
chr7 (310-407)||(6972306-6972403)
chr7 (290-371)||(41571635-41571712)
chr7 (312-407)||(11620048-11620143)
chr7 (312-407)||(21202285-21202379)
chr7 (312-407)||(28642486-28642581)
chr7 (312-407)||(34651590-34651685)
chr7 (197-260)||(45986343-45986406)
chr7 (197-295)||(39035962-39036060)
chr7 (197-295)||(42335642-42335740)
chr7 (313-407)||(47784815-47784909)
chr7 (312-385)||(46158066-46158139)
chr7 (215-295)||(17314602-17314682)
chr7 (312-407)||(23064447-23064543)
chr7 (197-260)||(24424432-24424495)
chr7 (197-252)||(30740224-30740279)
chr7 (312-407)||(33772389-33772483)
chr7 (197-260)||(47229717-47229780)
chr7 (197-255)||(2510555-2510613)
chr7 (197-295)||(9900656-9900754)
chr7 (197-295)||(21202399-21202497)
chr7 (197-295)||(23023641-23023739)
chr7 (197-295)||(36040060-36040158)
chr7 (197-255)||(38332488-38332546)
chr7 (197-295)||(45983511-45983609)
chr7 (314-371)||(36039948-36040005)
chr7 (311-348)||(41098795-41098832)
chr7 (197-282)||(45985742-45985827)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (195-407)||(33744640-33744852)
chr6 (10-407)||(5079293-5079696)
chr6 (10-371)||(17245721-17246086)
chr6 (195-407)||(26356637-26356848)
chr6 (195-405)||(10915411-10915620)
chr6 (195-407)||(844212-844424)
chr6 (195-407)||(29691889-29692100)
chr6 (216-407)||(17697385-17697575)
chr6 (195-407)||(861336-861548)
chr6 (195-383)||(5087168-5087356)
chr6 (195-407)||(8709941-8710152)
chr6 (216-407)||(15721061-15721254)
chr6 (195-407)||(5974287-5974498)
chr6 (195-407)||(30660884-30661096)
chr6 (195-407)||(12481860-12482072)
chr6 (195-407)||(20977468-20977680)
chr6 (217-399)||(30492823-30493004)
chr6 (197-407)||(28476167-28476380)
chr6 (216-407)||(1821087-1821275)
chr6 (197-407)||(18502972-18503181)
chr6 (198-407)||(938950-939158)
chr6 (195-407)||(20977102-20977314)
chr6 (195-354)||(34046544-34046704)
chr6 (197-407)||(3375395-3375605)
chr6 (195-351)||(20897789-20897947)
chr6 (237-407)||(21108087-21108257)
chr6 (197-407)||(20510585-20510783)
chr6 (195-407)||(22731975-22732188)
chr6 (237-407)||(3914442-3914612)
chr6 (269-407)||(33518409-33518545)
chr6 (195-364)||(14256129-14256297)
chr6 (288-407)||(2087543-2087661)
chr6 (203-345)||(24958869-24959012)
chr6 (230-407)||(289103-289280)
chr6 (216-342)||(30353125-30353252)
chr6 (314-407)||(289455-289549)
chr6 (271-364)||(11400122-11400215)
chr6 (103-181)||(18502903-18502984)
chr6 (230-282)||(3913929-3913981)
chr6 (288-407)||(30916772-30916894)
chr6 (309-407)||(19693152-19693250)
chr6 (220-407)||(8235179-8235365)
chr6 (312-407)||(12783443-12783538)
chr6 (312-407)||(13400276-13400371)
chr6 (312-407)||(15053906-15054001)
chr6 (312-407)||(16270287-16270382)
chr6 (195-282)||(16736630-16736716)
chr6 (312-407)||(2857445-2857540)
chr6 (197-295)||(15053788-15053886)
chr6 (197-295)||(22007276-22007374)
chr6 (197-294)||(945975-946072)
chr6 (312-407)||(945859-945954)
chr6 (197-260)||(2857327-2857390)
chr6 (196-255)||(12783598-12783657)
chr6 (197-260)||(16270169-16270232)
chr6 (197-260)||(33971568-33971631)
chr6 (197-260)||(35129330-35129393)
chr6 (197-295)||(19693270-19693368)
chr6 (314-348)||(22006825-22006859)
chr6 (312-369)||(5359323-5359380)
chr6 (197-254)||(5359772-5359829)
chr6 (311-348)||(15054301-15054338)
chr6 (312-348)||(33971082-33971118)
[»] chr3 (131 HSPs)
chr3 (195-407)||(39562527-39562739)
chr3 (195-407)||(46295157-46295370)
chr3 (10-407)||(50614870-50615273)
chr3 (10-348)||(32943150-32943495)
chr3 (10-407)||(37179047-37179448)
chr3 (10-407)||(117235-117636)
chr3 (10-367)||(45235132-45235494)
chr3 (10-407)||(44557367-44557768)
chr3 (195-407)||(40762578-40762789)
chr3 (195-407)||(45419763-45419974)
chr3 (195-407)||(29348379-29348589)
chr3 (216-407)||(23883389-23883579)
chr3 (195-407)||(9018126-9018338)
chr3 (195-407)||(27492419-27492631)
chr3 (195-407)||(45406768-45406979)
chr3 (216-407)||(44808838-44809029)
chr3 (220-407)||(25250122-25250306)
chr3 (195-407)||(38174008-38174219)
chr3 (216-407)||(53517783-53517973)
chr3 (216-365)||(23921074-23921221)
chr3 (195-407)||(11045510-11045720)
chr3 (10-183)||(32147311-32147485)
chr3 (195-407)||(19601654-19601868)
chr3 (195-353)||(11293953-11294111)
chr3 (10-179)||(53397418-53397586)
chr3 (243-407)||(21749672-21749835)
chr3 (230-407)||(25232761-25232944)
chr3 (237-407)||(32147102-32147271)
chr3 (10-183)||(53439626-53439798)
chr3 (195-407)||(54268832-54269035)
chr3 (211-407)||(19669806-19670001)
chr3 (237-392)||(33476210-33476364)
chr3 (237-399)||(41927371-41927534)
chr3 (216-403)||(44287767-44287953)
chr3 (237-407)||(31991172-31991342)
chr3 (237-407)||(52701266-52701436)
chr3 (195-381)||(34995661-34995848)
chr3 (237-364)||(44556656-44556782)
chr3 (248-407)||(53397201-53397361)
chr3 (195-407)||(23917434-23917637)
chr3 (247-383)||(53439440-53439575)
chr3 (237-407)||(8575920-8576092)
chr3 (236-407)||(33475574-33475745)
chr3 (230-407)||(44556022-44556198)
chr3 (276-407)||(26268629-26268758)
chr3 (297-407)||(41927919-41928027)
chr3 (195-348)||(53377430-53377583)
chr3 (224-317)||(8575373-8575466)
chr3 (195-250)||(15771881-15771936)
chr3 (312-407)||(34226027-34226122)
chr3 (312-407)||(869455-869550)
chr3 (312-407)||(3078383-3078478)
chr3 (312-407)||(10182228-10182323)
chr3 (312-407)||(28055254-28055349)
chr3 (312-407)||(28065679-28065774)
chr3 (312-407)||(30778754-30778849)
chr3 (230-317)||(31991819-31991905)
chr3 (312-407)||(36777878-36777973)
chr3 (312-407)||(45454346-45454441)
chr3 (312-407)||(50362402-50362497)
chr3 (312-407)||(53328524-53328619)
chr3 (312-407)||(55006153-55006248)
chr3 (197-295)||(869570-869668)
chr3 (333-407)||(28260390-28260464)
chr3 (312-407)||(1486949-1487044)
chr3 (312-407)||(4994108-4994203)
chr3 (312-407)||(15490757-15490852)
chr3 (312-407)||(33391037-33391132)
chr3 (312-407)||(40126886-40126981)
chr3 (312-407)||(45344026-45344121)
chr3 (312-407)||(47198996-47199091)
chr3 (312-407)||(49612288-49612383)
chr3 (197-295)||(1486831-1486929)
chr3 (197-295)||(10182110-10182208)
chr3 (197-295)||(15490639-15490737)
chr3 (314-352)||(27973585-27973623)
chr3 (197-295)||(31269711-31269809)
chr3 (314-371)||(34442166-34442224)
chr3 (197-295)||(36777993-36778091)
chr3 (197-295)||(55006035-55006133)
chr3 (312-407)||(23878609-23878705)
chr3 (315-407)||(43127683-43127775)
chr3 (197-260)||(3078533-3078596)
chr3 (197-252)||(7576315-7576370)
chr3 (197-260)||(12015266-12015329)
chr3 (195-242)||(13814059-13814106)
chr3 (197-348)||(15491123-15491274)
chr3 (356-407)||(15772003-15772054)
chr3 (197-260)||(19006876-19006939)
chr3 (312-407)||(24342677-24342772)
chr3 (197-260)||(25577964-25578027)
chr3 (312-391)||(30664101-30664180)
chr3 (197-260)||(30786454-30786517)
chr3 (312-391)||(32245747-32245826)
chr3 (197-252)||(34226517-34226572)
chr3 (312-407)||(42367757-42367852)
chr3 (312-371)||(43660421-43660480)
chr3 (312-407)||(43729775-43729869)
chr3 (312-407)||(48585871-48585966)
chr3 (197-260)||(48586352-48586415)
chr3 (312-371)||(50133561-50133620)
chr3 (197-260)||(50762493-50762556)
chr3 (312-407)||(51324696-51324791)
chr3 (197-260)||(53328068-53328131)
chr3 (312-407)||(53947569-53947663)
chr3 (314-348)||(4993776-4993810)
chr3 (197-295)||(8339789-8339887)
chr3 (197-295)||(16644748-16644846)
chr3 (197-271)||(23878147-23878221)
chr3 (197-295)||(28055136-28055234)
chr3 (197-295)||(28065561-28065659)
chr3 (197-295)||(29166992-29167090)
chr3 (197-247)||(32970222-32970272)
chr3 (197-295)||(34225909-34226007)
chr3 (197-255)||(47199151-47199209)
chr3 (197-295)||(53629115-53629213)
chr3 (197-255)||(53947724-53947782)
chr3 (197-250)||(33390864-33390917)
chr3 (315-348)||(48586264-48586297)
chr3 (197-282)||(51368013-51368098)
chr3 (197-254)||(53328669-53328726)
chr3 (315-348)||(53520103-53520136)
chr3 (311-348)||(53628663-53628700)
chr3 (312-348)||(3173338-3173374)
chr3 (312-404)||(16128542-16128634)
chr3 (314-370)||(23252034-23252090)
chr3 (331-371)||(28685442-28685482)
chr3 (315-407)||(30786572-30786664)
chr3 (312-407)||(37126883-37126979)
chr3 (215-295)||(50362517-50362597)
chr3 (311-347)||(55006549-55006585)
[»] chr1 (126 HSPs)
chr1 (195-407)||(31400325-31400537)
chr1 (10-407)||(11999824-12000224)
chr1 (10-383)||(33708730-33709111)
chr1 (10-407)||(12368028-12368432)
chr1 (10-407)||(30982171-30982571)
chr1 (10-378)||(46596564-46596937)
chr1 (10-371)||(36248465-36248833)
chr1 (10-342)||(37986534-37986869)
chr1 (195-407)||(30719586-30719797)
chr1 (199-407)||(52493634-52493842)
chr1 (216-405)||(46517171-46517359)
chr1 (216-407)||(19791345-19791534)
chr1 (220-407)||(13501312-13501496)
chr1 (195-407)||(26020377-26020588)
chr1 (146-383)||(36367814-36368056)
chr1 (220-407)||(51561350-51561536)
chr1 (216-407)||(26805490-26805681)
chr1 (227-407)||(7565189-7565369)
chr1 (195-407)||(35188279-35188485)
chr1 (220-364)||(43504915-43505059)
chr1 (195-383)||(21091179-21091366)
chr1 (10-251)||(29231368-29231612)
chr1 (237-406)||(12897111-12897280)
chr1 (195-407)||(35530892-35531103)
chr1 (195-407)||(10041218-10041429)
chr1 (10-183)||(15053986-15054162)
chr1 (237-407)||(52881693-52881863)
chr1 (195-407)||(31024034-31024246)
chr1 (211-371)||(2059487-2059645)
chr1 (197-407)||(39681899-39682110)
chr1 (237-392)||(27551530-27551684)
chr1 (237-399)||(49767799-49767962)
chr1 (234-407)||(52882326-52882498)
chr1 (237-407)||(11397137-11397307)
chr1 (262-407)||(47008692-47008835)
chr1 (195-407)||(5430542-5430753)
chr1 (237-405)||(25352061-25352229)
chr1 (230-407)||(12251382-12251558)
chr1 (275-407)||(28701061-28701192)
chr1 (211-407)||(48410250-48410445)
chr1 (237-385)||(52009990-52010138)
chr1 (195-407)||(15053733-15053936)
chr1 (195-407)||(33707347-33707560)
chr1 (230-407)||(49768421-49768598)
chr1 (230-407)||(27550898-27551073)
chr1 (10-92)||(40182066-40182148)
chr1 (216-338)||(21794508-21794630)
chr1 (10-92)||(36362892-36362974)
chr1 (224-319)||(42972161-42972256)
chr1 (312-407)||(4486935-4487030)
chr1 (312-407)||(17964113-17964208)
chr1 (312-407)||(31861626-31861721)
chr1 (312-407)||(36796034-36796129)
chr1 (313-407)||(37710854-37710948)
chr1 (312-407)||(4647183-4647278)
chr1 (312-407)||(10383092-10383187)
chr1 (312-407)||(26507608-26507703)
chr1 (312-407)||(34076061-34076156)
chr1 (312-407)||(47632656-47632751)
chr1 (312-407)||(48624267-48624362)
chr1 (312-407)||(48723526-48723621)
chr1 (309-407)||(2207594-2207692)
chr1 (197-407)||(35766913-35767123)
chr1 (211-407)||(6216369-6216568)
chr1 (314-407)||(14007044-14007137)
chr1 (314-407)||(14410935-14411028)
chr1 (314-407)||(31266968-31267061)
chr1 (312-407)||(4574078-4574172)
chr1 (312-407)||(10371586-10371681)
chr1 (312-407)||(14421271-14421366)
chr1 (312-407)||(15358344-15358439)
chr1 (312-407)||(25136951-25137046)
chr1 (312-407)||(26451182-26451277)
chr1 (309-407)||(7586947-7587045)
chr1 (197-295)||(14410817-14410915)
chr1 (309-407)||(26911169-26911267)
chr1 (197-407)||(29972443-29972652)
chr1 (197-295)||(47632771-47632869)
chr1 (197-370)||(10371138-10371310)
chr1 (314-407)||(14743945-14744038)
chr1 (220-407)||(28479783-28479969)
chr1 (211-251)||(802801-802841)
chr1 (314-390)||(26136191-26136267)
chr1 (312-407)||(48468234-48468330)
chr1 (197-265)||(48624413-48624481)
chr1 (312-407)||(7603719-7603814)
chr1 (197-296)||(10658734-10658833)
chr1 (197-252)||(14007199-14007254)
chr1 (197-260)||(14865684-14865747)
chr1 (197-260)||(27851305-27851368)
chr1 (197-260)||(34076211-34076274)
chr1 (312-363)||(42972086-42972137)
chr1 (312-407)||(45336446-45336541)
chr1 (312-407)||(46667618-46667713)
chr1 (312-391)||(52526859-52526938)
chr1 (197-260)||(52760383-52760446)
chr1 (197-295)||(2207712-2207810)
chr1 (197-295)||(4057683-4057781)
chr1 (197-295)||(14006926-14007024)
chr1 (197-295)||(15358459-15358557)
chr1 (197-295)||(17963995-17964093)
chr1 (273-327)||(20357120-20357174)
chr1 (273-327)||(20562781-20562835)
chr1 (197-295)||(25137066-25137164)
chr1 (197-295)||(26507490-26507588)
chr1 (197-295)||(32037382-32037480)
chr1 (197-271)||(34075650-34075724)
chr1 (197-295)||(35767143-35767241)
chr1 (197-295)||(36449617-36449715)
chr1 (314-348)||(36796427-36796461)
chr1 (312-350)||(46947174-46947212)
chr1 (309-391)||(48609848-48609928)
chr1 (197-295)||(48723408-48723506)
chr1 (201-295)||(52526728-52526822)
chr1 (312-390)||(52760518-52760595)
chr1 (314-407)||(10372765-10372858)
chr1 (197-294)||(14744059-14744156)
chr1 (211-251)||(802668-802708)
chr1 (292-348)||(12255799-12255855)
chr1 (196-252)||(14743492-14743548)
chr1 (197-265)||(15926610-15926678)
chr1 (215-295)||(31267081-31267161)
chr1 (314-370)||(34075767-34075823)
chr1 (109-153)||(36362993-36363037)
chr1 (200-260)||(45583714-45583774)
chr1 (312-348)||(46634808-46634844)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (195-407)||(3870-4082)
[»] chr4 (141 HSPs)
chr4 (211-407)||(44289783-44289979)
chr4 (10-383)||(33689086-33689459)
chr4 (10-407)||(25422173-25422568)
chr4 (195-407)||(48082549-48082761)
chr4 (10-407)||(10321801-10322201)
chr4 (10-407)||(53571334-53571731)
chr4 (10-407)||(31316646-31317046)
chr4 (18-407)||(11670212-11670597)
chr4 (10-363)||(44209289-44209641)
chr4 (195-407)||(53323881-53324092)
chr4 (195-393)||(53423541-53423740)
chr4 (195-407)||(1870212-1870422)
chr4 (220-407)||(19522818-19523004)
chr4 (199-407)||(30331260-30331467)
chr4 (195-407)||(33177399-33177610)
chr4 (220-407)||(3873155-3873341)
chr4 (216-407)||(47309540-47309730)
chr4 (195-383)||(28448369-28448557)
chr4 (194-383)||(22068226-22068415)
chr4 (195-407)||(47379156-47379366)
chr4 (195-383)||(23473456-23473643)
chr4 (216-407)||(47463470-47463662)
chr4 (195-403)||(7490802-7491010)
chr4 (195-383)||(51395590-51395778)
chr4 (195-407)||(4850200-4850411)
chr4 (195-407)||(55938174-55938384)
chr4 (237-407)||(44452190-44452360)
chr4 (216-407)||(42972733-42972923)
chr4 (195-407)||(48219866-48220076)
chr4 (195-356)||(13603938-13604099)
chr4 (237-407)||(34513038-34513207)
chr4 (195-383)||(10085614-10085801)
chr4 (237-405)||(28163745-28163913)
chr4 (195-407)||(52947738-52947951)
chr4 (216-328)||(7617417-7617529)
chr4 (224-383)||(43938131-43938291)
chr4 (195-328)||(3862466-3862600)
chr4 (195-328)||(3871223-3871357)
chr4 (195-385)||(20650482-20650672)
chr4 (274-407)||(20177933-20178064)
chr4 (10-141)||(510807-510937)
chr4 (10-141)||(18087000-18087130)
chr4 (10-159)||(35060724-35060874)
chr4 (197-407)||(38499393-38499603)
chr4 (220-407)||(51876113-51876302)
chr4 (278-407)||(38114273-38114401)
chr4 (195-407)||(55283213-55283424)
chr4 (230-398)||(44452819-44452986)
chr4 (269-383)||(35060878-35060992)
chr4 (314-407)||(13718072-13718164)
chr4 (288-405)||(35351735-35351853)
chr4 (240-361)||(35821262-35821383)
chr4 (309-407)||(52788862-52788959)
chr4 (312-407)||(29445637-29445732)
chr4 (195-265)||(13717972-13718042)
chr4 (309-407)||(15636920-15637018)
chr4 (309-383)||(37329618-37329692)
chr4 (195-257)||(38114215-38114277)
chr4 (312-407)||(343919-344014)
chr4 (312-407)||(6203171-6203266)
chr4 (312-407)||(8949623-8949718)
chr4 (312-391)||(10386705-10386784)
chr4 (312-407)||(19320825-19320920)
chr4 (312-407)||(22515663-22515758)
chr4 (312-407)||(24281878-24281973)
chr4 (312-407)||(28756316-28756411)
chr4 (312-407)||(31312147-31312242)
chr4 (312-407)||(38698836-38698931)
chr4 (312-407)||(42931163-42931258)
chr4 (314-407)||(16618859-16618952)
chr4 (312-385)||(39269782-39269855)
chr4 (197-260)||(1776792-1776855)
chr4 (312-407)||(9428069-9428163)
chr4 (312-391)||(11152325-11152404)
chr4 (312-407)||(34680338-34680433)
chr4 (312-407)||(47016251-47016346)
chr4 (312-407)||(52224545-52224640)
chr4 (312-407)||(53237981-53238076)
chr4 (197-295)||(16618972-16619070)
chr4 (197-295)||(18092600-18092698)
chr4 (197-295)||(22515545-22515643)
chr4 (197-295)||(24281993-24282091)
chr4 (197-295)||(35627084-35627182)
chr4 (197-295)||(38698951-38699049)
chr4 (197-295)||(47500334-47500432)
chr4 (302-348)||(50116581-50116627)
chr4 (197-295)||(52224427-52224525)
chr4 (312-385)||(23708882-23708955)
chr4 (314-407)||(34509757-34509850)
chr4 (312-385)||(35015451-35015524)
chr4 (296-348)||(4821856-4821908)
chr4 (314-370)||(28541230-28541286)
chr4 (303-407)||(29246897-29247001)
chr4 (312-348)||(39669865-39669901)
chr4 (312-391)||(1776643-1776722)
chr4 (312-391)||(4553390-4553469)
chr4 (312-407)||(6488526-6488620)
chr4 (197-260)||(11996607-11996670)
chr4 (197-252)||(18093207-18093262)
chr4 (195-282)||(20177824-20177911)
chr4 (312-407)||(28540859-28540954)
chr4 (197-260)||(29441866-29441929)
chr4 (197-260)||(29445519-29445582)
chr4 (197-260)||(40943151-40943214)
chr4 (312-391)||(42643005-42643084)
chr4 (197-260)||(42931313-42931376)
chr4 (312-407)||(47500219-47500314)
chr4 (312-407)||(47875941-47876035)
chr4 (312-407)||(50642612-50642707)
chr4 (197-260)||(50642762-50642825)
chr4 (312-407)||(53231222-53231316)
chr4 (197-295)||(4553256-4553354)
chr4 (198-252)||(8770672-8770726)
chr4 (197-295)||(9427951-9428049)
chr4 (197-255)||(11152192-11152250)
chr4 (312-390)||(18092735-18092812)
chr4 (197-255)||(19320980-19321038)
chr4 (197-255)||(23624370-23624428)
chr4 (197-295)||(25768142-25768240)
chr4 (197-255)||(28756198-28756256)
chr4 (197-295)||(31312029-31312127)
chr4 (197-255)||(34509639-34509697)
chr4 (197-295)||(34756803-34756901)
chr4 (197-255)||(39656121-39656179)
chr4 (197-295)||(47016366-47016464)
chr4 (197-255)||(53238136-53238194)
chr4 (309-350)||(19037621-19037662)
chr4 (311-348)||(22516056-22516093)
chr4 (312-385)||(23624510-23624583)
chr4 (215-252)||(37437225-37437262)
chr4 (311-348)||(42930826-42930863)
chr4 (220-253)||(45557899-45557932)
chr4 (311-348)||(52823030-52823067)
chr4 (197-253)||(343800-343856)
chr4 (197-293)||(6488408-6488504)
chr4 (312-348)||(11968248-11968284)
chr4 (311-347)||(16618520-16618556)
chr4 (314-370)||(19320493-19320549)
chr4 (312-348)||(34680005-34680041)
chr4 (314-370)||(39656611-39656667)
chr4 (197-265)||(47499769-47499837)
[»] chr5 (113 HSPs)
chr5 (195-407)||(30394186-30394397)
chr5 (10-363)||(8217800-8218157)
chr5 (195-407)||(2005129-2005341)
chr5 (10-407)||(38693259-38693655)
chr5 (10-407)||(41139131-41139531)
chr5 (10-363)||(26865496-26865852)
chr5 (10-363)||(43440666-43441019)
chr5 (195-407)||(10463843-10464054)
chr5 (195-407)||(1683143-1683354)
chr5 (195-407)||(34785228-34785439)
chr5 (195-407)||(37103138-37103349)
chr5 (195-407)||(8313315-8313525)
chr5 (199-407)||(24636920-24637128)
chr5 (195-407)||(8336949-8337159)
chr5 (216-407)||(27307925-27308115)
chr5 (195-407)||(27335736-27335947)
chr5 (216-407)||(40158371-40158560)
chr5 (195-407)||(17742431-17742643)
chr5 (195-407)||(34527123-34527335)
chr5 (195-407)||(34010028-34010239)
chr5 (197-407)||(13920169-13920378)
chr5 (216-371)||(4426163-4426318)
chr5 (195-361)||(9687509-9687675)
chr5 (230-407)||(43210639-43210816)
chr5 (195-361)||(14049733-14049899)
chr5 (195-371)||(8404372-8404549)
chr5 (195-407)||(31211294-31211506)
chr5 (10-176)||(13920371-13920535)
chr5 (216-407)||(621625-621815)
chr5 (197-407)||(10674746-10674956)
chr5 (195-407)||(4462862-4463073)
chr5 (195-407)||(42852829-42853040)
chr5 (195-360)||(4461940-4462105)
chr5 (195-353)||(21837098-21837256)
chr5 (195-407)||(18261156-18261364)
chr5 (237-407)||(19332566-19332736)
chr5 (216-398)||(28456624-28456804)
chr5 (195-407)||(42877590-42877800)
chr5 (104-307)||(18950752-18950959)
chr5 (224-407)||(41192983-41193165)
chr5 (195-321)||(22023075-22023201)
chr5 (195-407)||(36875962-36876170)
chr5 (195-407)||(2004058-2004261)
chr5 (242-352)||(9924401-9924510)
chr5 (195-407)||(22166851-22167065)
chr5 (195-406)||(27280258-27280470)
chr5 (195-407)||(30698660-30698871)
chr5 (220-407)||(30733927-30734112)
chr5 (220-379)||(3548350-3548507)
chr5 (198-407)||(28616006-28616217)
chr5 (262-392)||(9168596-9168726)
chr5 (195-378)||(37446534-37446717)
chr5 (216-334)||(6365296-6365414)
chr5 (269-407)||(2262845-2262983)
chr5 (230-407)||(40272562-40272740)
chr5 (312-407)||(14711581-14711676)
chr5 (312-407)||(24334013-24334108)
chr5 (312-407)||(43209998-43210092)
chr5 (312-407)||(6450139-6450234)
chr5 (312-391)||(7572991-7573070)
chr5 (312-407)||(27432467-27432562)
chr5 (312-407)||(42992489-42992584)
chr5 (312-385)||(5597747-5597820)
chr5 (315-407)||(27189068-27189160)
chr5 (312-407)||(4123196-4123291)
chr5 (312-407)||(4291695-4291789)
chr5 (312-407)||(7234522-7234617)
chr5 (312-407)||(8315572-8315667)
chr5 (312-407)||(18404368-18404462)
chr5 (312-407)||(19928530-19928625)
chr5 (312-407)||(34818915-34819010)
chr5 (312-407)||(41906860-41906955)
chr5 (302-348)||(796275-796321)
chr5 (197-291)||(4123078-4123172)
chr5 (197-295)||(6450021-6450119)
chr5 (197-295)||(24333895-24333993)
chr5 (197-295)||(27432582-27432680)
chr5 (197-295)||(34818797-34818895)
chr5 (303-407)||(23425310-23425413)
chr5 (312-371)||(2567424-2567483)
chr5 (197-260)||(4034551-4034614)
chr5 (312-407)||(4034669-4034764)
chr5 (197-252)||(4123685-4123740)
chr5 (314-349)||(4291362-4291397)
chr5 (312-371)||(22982021-22982080)
chr5 (197-260)||(22982466-22982529)
chr5 (312-407)||(24090067-24090162)
chr5 (197-260)||(33010290-33010353)
chr5 (197-260)||(33010888-33010951)
chr5 (220-406)||(34876047-34876234)
chr5 (197-255)||(4291848-4291906)
chr5 (314-348)||(6450532-6450566)
chr5 (197-255)||(7234677-7234735)
chr5 (314-348)||(8980398-8980432)
chr5 (197-295)||(19928645-19928743)
chr5 (341-407)||(22023191-22023256)
chr5 (197-295)||(22981868-22981966)
chr5 (197-255)||(24090216-24090274)
chr5 (378-407)||(14049894-14049923)
chr5 (303-348)||(16939657-16939702)
chr5 (312-385)||(19000595-19000668)
chr5 (311-348)||(20453426-20453463)
chr5 (309-378)||(20960763-20960832)
chr5 (311-348)||(25001258-25001295)
chr5 (355-404)||(32537537-32537586)
chr5 (197-265)||(156147-156215)
chr5 (197-253)||(4035153-4035209)
chr5 (215-295)||(5597860-5597940)
chr5 (312-348)||(7411234-7411270)
chr5 (294-405)||(15426624-15426732)
chr5 (197-265)||(18076012-18076080)
chr5 (315-407)||(18740695-18740787)
chr5 (197-253)||(38983284-38983340)
[»] scaffold0651 (1 HSPs)
scaffold0651 (10-407)||(6652-7052)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (10-407)||(239802-240201)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (10-407)||(9749-10152)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (28-383)||(23915-24263)
scaffold0097 (195-407)||(25035-25246)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (195-336)||(2830-2970)
scaffold0734 (328-407)||(3257-3336)
[»] scaffold0562 (1 HSPs)
scaffold0562 (220-407)||(3974-4160)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (216-407)||(158027-158216)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (195-407)||(7037-7249)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (195-407)||(5895-6106)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (195-407)||(17355-17565)
[»] scaffold0148 (2 HSPs)
scaffold0148 (197-407)||(35379-35588)
scaffold0148 (10-179)||(35578-35745)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (216-407)||(1263-1456)
[»] scaffold1191 (1 HSPs)
scaffold1191 (195-382)||(798-986)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (195-353)||(21728-21886)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (197-407)||(47831-48040)
scaffold0024 (196-282)||(32942-33031)
[»] scaffold1190 (1 HSPs)
scaffold1190 (195-361)||(180-347)
[»] scaffold0571 (1 HSPs)
scaffold0571 (195-355)||(8609-8770)
[»] scaffold0707 (1 HSPs)
scaffold0707 (269-407)||(6953-7089)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (288-392)||(283308-283412)
scaffold0005 (230-346)||(283081-283197)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (240-371)||(6197-6330)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (211-407)||(52450-52651)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (230-394)||(123198-123362)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (312-407)||(9320-9415)
[»] scaffold0493 (3 HSPs)
scaffold0493 (312-407)||(6865-6960)
scaffold0493 (197-252)||(7355-7410)
scaffold0493 (311-348)||(7259-7296)
[»] scaffold1037 (1 HSPs)
scaffold1037 (197-252)||(602-657)
[»] scaffold1031 (1 HSPs)
scaffold1031 (197-252)||(720-775)
[»] scaffold0991 (2 HSPs)
scaffold0991 (312-391)||(900-979)
scaffold0991 (197-295)||(766-864)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (312-407)||(48161-48256)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (197-252)||(235003-235058)
scaffold0011 (312-348)||(235109-235145)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (195-326)||(158674-158805)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (216-244)||(758-786)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (312-348)||(36585-36621)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 102)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44493385 - 44492989
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  44493385 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagtttttttttggaataat 44493286  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaaaattttagtccctgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||||||||    
T  44493285 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaatattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaattttttttttaa-ttttagtccctgc 44493187  T
Q  210 aaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  44493186 aaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttattgagataagtttagaactctatgaaaggttcaattactaaaattt 44493087  T
Q  310 ataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacg-acaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  44493086 ataatattttaacatcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgaaaaaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaatttt 44492989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18672696 - 18672342
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  18672696 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcggacatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 18672598  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtcc 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |     ||||||||||     
T  18672597 tactagtcaaaaatatcttttcatgataaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaattacttctaattttagtca 18672498  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18672497 ctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaa 18672398  T
Q  306 atctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  18672397 atttataattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaagacgataaaa 18672342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 42487462 - 42487858
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||          ||||| |    
T  42487462 aaaaatattcacgattttcaccatcttatcaatgacttctcttgcattgtcgagcatgagtggctttgttgctgaattgatagtttttattt-gaata-t 42487559  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaaaattttagtccctg 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||           ||||||||||||||    
T  42487560 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccctaaaaaaaatacttctaattttagtccctg 42487659  T
Q  209 caaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatc 308  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  42487660 ctaaaacaaagtttgtttgattatctttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttaaaacgctatgaaaggttcaattactaaaatt 42487759  T
Q  309 tata-attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    || |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  42487760 taaattttttttaacatgaaatgaattcaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatataaatcaaatttt 42487858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 407
Target Start/End: Original strand, 21439624 - 21440021
Alignment:
Q  13 aatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataattac 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          ||||||||||    
T  21439624 aatattcacgattttcattatcttatcgatgacttcttttgcattgtcgggcatgagtgattttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataattac 21439722  T
Q  113 tagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtccct 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||         |     |||||||||||||    
T  21439723 tagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataaatagttttagtaggtttttttagtccctacaaaaaaaaatcacttctaattttagtccct 21439822  T
Q  208 gcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaat 307  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21439823 actaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaat 21439922  T
Q  308 ctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
     || | ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  21439923 ttaaatttttttaacttgaaacgaattaaatataaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatataaatcaaatttt 21440021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20720425 - 20720077
Alignment:
Q  28 cactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataattactagtcaaaaatatat 127  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||          || |||||||||||||||||||| |    
T  20720425 cactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcggacatgagtgattttgttgccgaattgatagtcttttttg-gagtaattactagtcaaaaatatct 20720327  T
Q  128 tttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccct-acaannnnnnnnnaaaattttagtccctgcaaaaataaagtttgttt 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||           ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  20720326 tttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccctaaaaaaaaatacttctaattttagtcccttctaaaacaaagtttgttt 20720227  T
Q  227 aattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatga 326  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||       |||||| |||||||||| || ||||||||||  |||    
T  20720226 aattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacac-------ggttcaattactaaaatttagaattttttaatttga 20720134  T
Q  327 aataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  20720133 aatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaa 20720077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 40364862 - 40365073
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  40364862 aattttaatccatgctaaaataaagtttgtttaactatcctcaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactattgaaggtt 40364961  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40364962 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaac-aaaatatggacgta 40365060  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  40365061 taaatcaaatttt 40365073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 195 - 371
Target Start/End: Original strand, 13371973 - 13372149
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13371973 aattttagtccctgtaacactaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggtt 13372072  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13372073 catttactaaaatttagaaatttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata 13372149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31771634 - 31771422
Alignment:
Q  195 aattttagtccc-tgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  31771634 aattttagtcccctgttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgacacaagtttagaacactatgaaagtt 31771535  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||| ||    
T  31771534 tcatttactaaaatttaaaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggatgt 31771436  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    |||||| |||||||    
T  31771435 agaaattaaatttt 31771422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7439537 - 7439326
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7439537 aattttagtctctgttacaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 7439438  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  7439437 catttagtaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgta 7439339  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| |||||||    
T  7439338 gaaattaaatttt 7439326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 3043339 - 3043550
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  3043339 aattttagttcctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcataaattttttaacgaattttttgagacaagtttagaacaatatgaaaggtt 3043438  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  3043439 catttactaaaattcagaatattttaacataaaactaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgta 3043537  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  3043538 gaaatcaaatttt 3043550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10357611 - 10357421
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  10357611 aaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 10357512  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10357511 ttttaaccttaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctgggcgtagaaatcaaatttt 10357421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 20721207 - 20721418
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20721207 aattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 20721306  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    || ||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  20721307 caattaataaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacata 20721405  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  20721406 taaatcaaatttt 20721418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 8737810 - 8738000
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||    
T  8737810 aaagtttatttaattatccttaaaatcttaaatttttgaacggttttttttagaaaagtttagaacactatgaaaggttcgtttactaaaatttaaattt 8737909  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8737910 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 8738000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31436333 - 31436144
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31436333 aaagtttgtttaattatccttaaacacttaaatttttgaacgatt-tttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaat 31436235  T
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  31436234 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt-aaatgacaaaagttaaagataaaattaac-aaattctgaacgtagaaatcaaatttt 31436144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 33832123 - 33832312
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataat 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  33832123 aaagtctgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatt-tttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaat 33832221  T
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  33832222 tttttaa-atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagtataagataaaattaac-aaattctggacgtacaaatcaaatttt 33832312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Original strand, 42274304 - 42274490
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||    
T  42274304 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttaccaaaatttagattttttt 42274403  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  42274404 aatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctagacatagaaatcaaatttt 42274490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Original strand, 43932715 - 43932923
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  43932715 ttttagtccc-gctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagagaagtttagaacaatatgaaaggttca 43932813  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
     ||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||| || |    
T  43932814 attattaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagtgaaagataaaagtaa-taaaatctggacatata 43932912  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||    
T  43932913 aatcaaatttt 43932923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 14200942 - 14201155
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | | ||||| |||||||| ||  |||||||    
T  14200942 aattttagtctctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttctgagacaagcttagaacattacaaaaggtt 14201041  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatat-gaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||| ||| || |||||  |||||||    
T  14201042 catttaataaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatggattttttttaaatgacaaaagttcaagataaaagcaaaaaaaaattggacgt 14201141  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  14201142 agaaatcaaatttt 14201155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 195 - 406
Target Start/End: Original strand, 44286662 - 44286868
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  44286662 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaagatt 44286761  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| || |||||    
T  44286762 catttactaaaatttacaattttttaacatgaaacgaat----tatgaattttttaaaacgccaaaacttaaagataaaattaac-aaaatctgaacgta 44286856  T
Q  395 gaaatcaaattt 406  Q
    ||||||||||||    
T  44286857 gaaatcaaattt 44286868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 43932554 - 43932717
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag-nnnnnnnnnagaataa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||           ||||||    
T  43932554 aaaaatattcatgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggtatgagtggttttgttgcctaattgatagttttttttttggaataa 43932653  T
Q  109 ttactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43932654 ttactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttt 43932717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 216 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 33031346 - 33031180
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||    
T  33031346 aaagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactataaaaggttcatttaccaaaatttagattt 33031247  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||||    
T  33031246 ttttaacatgaaacgaatt-aatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaa 33031180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 41121016 - 41120845
Alignment:
Q  233 ccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaa 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||  ||    
T  41121016 ccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactatgaaaagttcatttaccaaaatttagacttttttaacatgaaacgaa 41120917  T
Q  333 ttaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattt 406  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41120916 ttaaataagaatttttt-aaacggcaaaaattaaagataaaattaac-aaaatatggacgtagaaatcaaattt 41120845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25100901 - 25100691
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25100901 aatttcagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatt-ttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 25100803  T
Q  295 catttactaaaatct-ataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    || |||||||||| | ||  ||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||| || ||||    
T  25100802 cacttactaaaatttaatttttttttagcatgaaacgaaataaatatgaatcttttaaaacggcaaaagttaaagctaaaattaac-aaaatctgaacgt 25100704  T
Q  394 agaaatcaaattt 406  Q
    | |||||||||||    
T  25100703 aaaaatcaaattt 25100691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6457537 - 6457372
Alignment:
Q  242 cttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-aacatgaaataaattaaatat 340  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  6457537 cttaaatttttgaacgatttttttgagacacctttagaacactatgaaaggttcatttactaaaacttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatat 6457438  T
Q  341 gaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6457437 gaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 6457372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 8392312 - 8392515
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagttt-agaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||          | |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  8392312 aattttagtccctgctaaaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaacttttcaac----------agacaagttttagaacaatataaaaggt 8392401  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |  || |    
T  8392402 tcatttaataaaatctagaattttttaacgtgaaataaattaaatatgaatttttgtaaacgacaaaagtttcagataaaagtaaccaaaatgtacacat 8392501  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||| ||||    
T  8392502 agaaatcaattttt 8392515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30784492 - 30784291
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||  |||| | |||||||||||||||        |||    
T  30784492 aattttagtccatgttacaacaaagtttgtttaattatcctaaaattcttaaattttg-aacaatatttttgagacaagtttagaacac--------gtt 30784402  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||    
T  30784401 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac--aaatatggacgta 30784304  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  30784303 gaaatcaaatttt 30784291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 392
Target Start/End: Original strand, 32318963 - 32319119
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttt-ttaacatgaaataaatta 335  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||    
T  32318963 aaactcttaaatttttcaatgattttttttatataagtttagaacattactaaaggttcatttactaaattttagaatttttttaacatgaaataaatta 32319062  T
Q  336 aatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  32319063 aatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacg 32319119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 211 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23496861 - 23496666
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatcta 310  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||  | ||| |||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  23496861 aaaattaaatttgttttattatccttaaacttttgaattttttaacaattttttggagacacgttatgaacattataaaatgttcatttactaaaatata 23496762  T
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattt 406  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23496761 taattttttaacatgagatgaattaaatttgaatttttttaaacgacaaaagtttaagacaaagataacaaaaatgtggaagtataaatcaaattt 23496666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3118248 - 3118079
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  3118248 aaactcttaaatttttcaatgatttttttgacacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaatt-tagaattttttaacatgaaataaattaa 3118150  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||| |||||| | |||| |||||| |||||||    
T  3118149 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaaaaaaaatctagacgcagaaataaaatttt 3118079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 407
Target Start/End: Original strand, 19058643 - 19058832
Alignment:
Q  217 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  || |||  | ||||||| ||| |||| | |||||| |||||| || |||||    
T  19058643 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacaatttttagtagacacatctagaacattataaaagatccatttattaaaatttagaattt 19058742  T
Q  317 tttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||    
T  19058743 tttaacatgagattaactaaatatgaatttgtttaaacgac-aaagtttaagataaaagtaacaaaaatctagttgtaaaaatcaaatttt 19058832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25666281 - 25666144
Alignment:
Q  269 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||     
T  25666281 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaattttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaattaaaa 25666182  T
Q  369 atataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
     || || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25666181 gtaaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 25666144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 238 - 407
Target Start/End: Original strand, 36511995 - 36512164
Alignment:
Q  238 aactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||    
T  36511995 aactcttaaatttttgaaagatttttttttagacaagtttagaacactatgaaatgtttattttctaaaatttagaattttgtaacataaaacaaattaa 36512094  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||  ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  36512095 atatggattttttaaaacgacaaatgttaaagataaaattaa-taaaatctggatgtaaaaatcaaatttt 36512164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32318467 - 32318322
Alignment:
Q  262 tttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || || || |||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  32318467 tttttatacaagtttagaacattacaaacggctcgtttaataaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatgaatttttttaatagacaaaa 32318368  T
Q  362 gtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  32318367 gttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaatttt 32318322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 216 - 349
Target Start/End: Original strand, 44879717 - 44879850
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | ||    
T  44879717 aaagtttgtttaactatctctaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaaatttagaacactatgaaaagttcatttaacaaaatttagattt 44879816  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttt 349  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44879817 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 44879850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Original strand, 34073624 - 34073762
Alignment:
Q  269 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  34073624 acaagtttagaacactaagaaagattcatttaataaaatttagaattttctaacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaactacaaaagttaaag 34073723  T
Q  369 at-ataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    || | ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  34073724 ataaaaagtaac-aaaatatggatgtagaaattaaatttt 34073762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 29809401 - 29809519
Alignment:
Q  288 aaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatat 387  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||| |    
T  29809401 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaaggaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaac-aaaattt 29809499  T
Q  388 ggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  29809500 ggatgtagaaatcagatttt 29809519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 407
Target Start/End: Original strand, 32319565 - 32319711
Alignment:
Q  262 tttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttt-ttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaa 360  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||    
T  32319565 tttttatacaagttttgaacattactaaaagttcgtttactaaaatttataatttttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagtgaaa 32319664  T
Q  361 agtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  32319665 agttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaatttt 32319711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9111850 - 9111698
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || ||  || || || |||| |||| | || |||||||||| |||||||    
T  9111850 tatccttaaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagatcattacaaacggctcgtttaataaatt-tagaattttttaatatgaaat 9111752  T
Q  330 aaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  9111751 aaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 9111698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Original strand, 13027445 - 13027631
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataat-tttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||   | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  | | | ||||    
T  13027445 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttcggagacacgtttagaacattataaaaggttcgtttactaaaattgaaattctttt 13027544  T
Q  319 taacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||| || |||||| ||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  13027545 taacatgagatgaattaagtataaaaatttt-aaatgacaaaagtttaagata-aaataacaaaaatttggacgtaaagatcaaatttt 13027631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36881337 - 36881180
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||  | || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36881337 aattttagtctctgttacaacaaaatttatttaattatccttaaactctaaaaattttgaatgatttttttttgacaagtttagaacgctatgaaaggtt 36881238  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaa 352  Q
    || | |||||||| ||   ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  36881237 caataactaaaatttaattttttttaacataaaatgaattaaatgtgaatgttttaaa 36881180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18917512 - 18917366
Alignment:
Q  198 tttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcat 297  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || |||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18917512 tttagtctctgctaaaacaaagtttgtttaattatctttaaattcttaaattttcgaatgatttttttgagacatatttagaacactatgaaaggttcat 18917413  T
Q  298 ttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttt 349  Q
    || ||||      |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18917412 ttgctaa-----ttttttttttaacatgaaacaaattaaatatgattttttt 18917366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 383
Target Start/End: Original strand, 37592924 - 37593042
Alignment:
Q  262 tttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  37592924 tttttagacaaatttagaacaccatgaaaagttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacggattaaatatgaa---tttaaaatgacaaaa 37593020  T
Q  362 gtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||| |||||| || ||||||||    
T  37593021 gttaaagataaaattaacaaaa 37593042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 269 - 369
Target Start/End: Original strand, 33000914 - 33001015
Alignment:
Q  269 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttt-ttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaa 367  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  33000914 acaagtttagaacaatatgaaatgttcaattactaaaatttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaa 33001013  T
Q  368 ga 369  Q
    ||    
T  33001014 ga 33001015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 291
Target Start/End: Original strand, 29809232 - 29809328
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaag 291  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  29809232 aattttagtccatgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttggaacgatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaag 29809328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35498848 - 35498773
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35498848 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatt-tttttatgacaagtttataacactatgaaag 35498773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Original strand, 3118639 - 3118732
Alignment:
Q  224 tttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttt 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  3118639 tttaactatccttaaactcttaaaatttttaacgaattttttgatacaagtttagaacattacaaaaggtttatttactaaaatttagaatttt 3118732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10287413 - 10287239
Alignment:
Q  229 ttatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||   | ||||||||||||||    
T  10287413 ttatcctcaaatttttaaattttttaacgatttttataagacaagtttataacactacaaaagattcatttactaaaa-cttagactttttaacatgaaa 10287315  T
Q  329 taaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||     ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10287314 tgaatttaatataaaaattttaaa---taaaaagttcatgataaaattaacaaaaatatggacgtagaaattaaatttt 10287239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 3105602 - 3105544
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatga 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3105602 aaaaatattcaagattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatga 3105544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16709238 - 16709143
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  16709238 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 16709143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20973343 - 20973248
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  20973343 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 20973248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36218729 - 36218631
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  36218729 tataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 36218631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3855005 - 3854926
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| |||||    
T  3855005 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggac 3854926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12620433 - 12620338
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  12620433 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 12620338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13803385 - 13803290
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  13803385 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 13803290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 35516312 - 35516407
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| ||||  || |||| |||||||    
T  35516312 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaaatttt 35516407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37850418 - 37850323
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||  || |||| |||||||    
T  37850418 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacggcaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaaatttt 37850323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41178805 - 41178710
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  41178805 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 41178710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3105035 - 3104985
Alignment:
Q  103 gaataattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  3105035 gaataattactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaataatatcataac 3104985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35498768 - 35498695
Alignment:
Q  332 attaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattt 406  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  35498768 attaaatatgaatttttaaaaatgacaaaagttaaagataaaattaac-aaattctggacgtagaaatcaaattt 35498695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 9737497 - 9737593
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  9737497 aattttttaacatgtaatgaattaaatataaatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 9737593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 407
Target Start/End: Original strand, 45301274 - 45301366
Alignment:
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||  | |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  45301274 tttttaacatgaaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataagattaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 45301366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7662471 - 7662400
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  7662471 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaat 7662400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 10214818 - 10214913
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| || || || |||| |||||||    
T  10214818 aattttttaacatgtaatgaattaaatatattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 10214913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 14542160 - 14542255
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  14542160 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacctaaaaataaaatttt 14542255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 254
Target Start/End: Original strand, 37592894 - 37592929
Alignment:
Q  219 gtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttta 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37592894 gtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttta 37592929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 379
Target Start/End: Original strand, 41781983 - 41782049
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaac 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| || |||||| |||||||    
T  41781983 aattttttaacatgaaataaattaaatattaagtttttaaaatg-caaaaattcaagataaaagtaac 41782049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 13803172 - 13803270
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  13803172 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 13803270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 18549396 - 18549494
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  18549396 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 18549494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22982418 - 22982357
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataa 374  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  22982418 aatttttcaacatgaaatgaactaaatatgaatttttt-aaacaccaaaagtttaagatataa 22982357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Original strand, 37741925 - 37742023
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||  | |||||| || |||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  37741925 tataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaagtcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 37742023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 37850204 - 37850302
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  37850204 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 37850302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44300794 - 44300696
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  44300794 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 44300696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17615035 - 17614942
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||  || |||| |||||||    
T  17615035 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaaatttt 17614942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38063164 - 38063071
Alignment:
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttt-aaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  38063164 tttttaacatgcaatgaattaaatataattttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 38063071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31653466 - 31653362
Alignment:
Q  303 aaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaa 402  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| | ||| || |||| ||    
T  31653466 aaaatttaaaattttttaacatgtaatgaatcaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaatgaa 31653367  T
Q  403 atttt 407  Q
    |||||    
T  31653366 atttt 31653362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2431432 - 2431369
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  2431432 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaaattttaaattttttaatgatt 2431369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 6708008 - 6708071
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  6708008 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 6708071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7401753 - 7401658
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || |||||| |  |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  7401753 aattttttaacatgtaatgaattacatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaacttaacaaaaatttggacttaaaaataaaatttt 7401658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 16709025 - 16709088
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16709025 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 16709088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17615486 - 17615431
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17615486 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttttaaattttt 17615431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18549609 - 18549514
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| | ||| || |||| |||||||    
T  18549609 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaattttgacctaaaaataaaatttt 18549514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20506116 - 20506053
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  20506116 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaaattttaaattttttaatgatt 20506053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 25553484 - 25553547
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  25553484 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 25553547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33666786 - 33666723
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33666786 ttttagtccctgttaaattaaatgttgtttaattatgcttaaacttttaaattttttaatgatt 33666723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35516525 - 35516462
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  35516525 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 35516462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37850867 - 37850812
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37850867 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttttaaattttt 37850812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 41178592 - 41178655
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  41178592 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 41178655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Original strand, 45300821 - 45300876
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  45300821 ttttagtccctgctaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaattttt 45300876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6708641 - 6708583
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  6708641 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 6708583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7662807 - 7662773
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7662807 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 7662773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7749115 - 7749081
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7749115 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 7749081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9737711 - 9737653
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  9737711 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 9737653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 17614824 - 17614882
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  17614824 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 17614882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30098748 - 30098714
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30098748 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 30098714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31653789 - 31653755
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31653789 ttttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttt 31653755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36219061 - 36219027
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36219061 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 36219027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39375287 - 39375229
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  39375287 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 39375229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40855660 - 40855586
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttataca 271  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  40855660 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaaagattttttatataca 40855586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 407
Target Start/End: Original strand, 44612880 - 44612973
Alignment:
Q  313 attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||  |||| || |||||| ||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  44612880 attttttaacatgagacgaattaaatatgaatttttt-aatcgcgaaaaattcaagataaaagtaactaaaatatgggtctagaaatcagatttt 44612973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6244551 - 6244514
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttt 349  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6244551 aattttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttt 6244514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10972553 - 10972476
Alignment:
Q  330 aaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| || || || |||| |||||||    
T  10972553 aaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 10972476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29924907 - 29924843
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaa 378  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  29924907 ttttttaacatgtaatgaattaagtatgaacttttttaaacgtcaaaatttcaagataaaagtaa 29924843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 124)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 5765692 - 5765904
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765692 aattttagtccctgctaaaataaattttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 5765791  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765792 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 5765891  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  5765892 gaaatcaaatttt 5765904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24451987 - 24451588
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||          |||||||    
T  24451987 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgaatggttttgttgctgaattgatagttttttttg-gaataat 24451889  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtcc 205  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |     |||||||||||    
T  24451888 tactggtcaaaaatatcttttcatgctgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaaatacttctaattttagtcc 24451789  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24451788 ctgctaaaataaagtttgtttaattattcttaaactcttaaaattttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaa 24451689  T
Q  306 atctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatt 405  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||||    
T  24451688 atttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaatt 24451590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 28755151 - 28755363
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28755151 aattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattattgttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 28755250  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28755251 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgaacgta 28755350  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  28755351 gaaatcaaatttt 28755363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35369690 - 35369294
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  35369690 aaaaatattcacgattttcactatcttattgaagacttctcttggattgtcgcgcatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttg---gaataat 35369594  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa---aattttagtccc 206  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||              ||||||||||||    
T  35369593 tactagacaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtagattttttagtccctacaaaaaaaaaatcttctaattttagtccc 35369494  T
Q  207 tgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 306  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35369493 tgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattgctaaaa 35369394  T
Q  307 tctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattt 406  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  35369393 tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatttggacatataaatcaaattt 35369295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 363
Target Start/End: Original strand, 36063221 - 36063580
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnag-aataa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||          | |||||    
T  36063221 aaaaatgttcacgattttcaccatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgagcatgagtggctttgttgccgaattgatagttttttttttggaataa 36063320  T
Q  109 ttactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaaaat-----tttagt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||     ||||||    
T  36063321 ttactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaaaaaaaatctaattttagt 36063420  T
Q  204 ccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttacta 303  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36063421 tcctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattatgaaaggttcaattacta 36063520  T
Q  304 aaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagt 363  Q
    |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36063521 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagt 36063580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35863544 - 35863145
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||          |||||||    
T  35863544 aaaaatattcacaattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtgattttgttaccaacttgatagtttttttttggaataat 35863445  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa---aattttagtccc 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||    
T  35863444 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaattacttctaatattagtccc 35863345  T
Q  207 tgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 306  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35863344 tgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacaatatttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaa 35863245  T
Q  307 tctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattt 406  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  35863244 tttaaaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaactataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaattt 35863146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16473486 - 16473087
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||         ||||||||    
T  16473486 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacgtctcttgcattgtcgggcatgattgattttgttgccgaattgatagttttttt--agaataat 16473389  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aattttagtc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |     ||| ||||||    
T  16473388 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaagtactatcataacgagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaaattatttataatattagtc 16473289  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16473288 cctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaa 16473189  T
Q  305 aatcta-taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaa 403  Q
    ||| || |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||| ||||| || ||||||||    
T  16473188 aatttattttttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagta--aaaaatctggacatataaatcaaa 16473091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16478057 - 16477658
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||         ||||||||    
T  16478057 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacgtctcttgcattgtcgggcatgattgattttgttgccgaattgatagttttttt--agaataat 16477960  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aattttagtc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |     ||| ||||||    
T  16477959 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaagtactatcataacgagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaaattatttataatattagtc 16477860  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16477859 cctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaa 16477760  T
Q  305 aatcta-taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaa 403  Q
    ||| || |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||| ||||| || ||||||||    
T  16477759 aatttattttttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagta--aaaaatctggacatataaatcaaa 16477662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21135823 - 21135427
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatctt-attaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||           |||||    
T  21135823 aaaaatattcacgattttcactatctttatcaatgacttctcttgaattgtcgggcatgagtgattttgtttccgaattgatagttttttttttaaataa 21135724  T
Q  109 ttactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtc 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||     |||||||||||||||||||||||||||         ||    ||||||||||    
T  21135723 ttactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcata-----ttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaattaattctaattttagtc 21135629  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21135628 cctgccaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacattatgaaaggttcaattactaa 21135529  T
Q  305 aatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaat 404  Q
    ||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  21135528 aatttagaattttttaaaatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaat 21135430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39337488 - 39337084
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          |||||||    
T  39337488 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttattttgaattgtcgggcatgagtgattttgttgccgaattgataggttttttttggaataat 39337389  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa-------aatttta 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |        |||||||    
T  39337388 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccctacaaaaaaaaaaaatcacttctaatttta 39337289  T
Q  202 gtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttac 301  Q
    |||| | | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39337288 gtccatactaagacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaatcttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaa 39337189  T
Q  302 taaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatca 401  Q
    |||||| || | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| | | ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||    
T  39337188 taaaatttaaatttttttaacattaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaatagaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatataaatca 39337090  T
Q  402 aatttt 407  Q
    ||||||    
T  39337089 aatttt 39337084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 103 - 378
Target Start/End: Original strand, 41281181 - 41281461
Alignment:
Q  103 gaataattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |     ||     
T  41281181 gaataattactagtcaaaaatatattttcctgataaaaataccatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaaattacttctaaa 41281280  T
Q  198 tttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcat 297  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  41281281 tttagtccttgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaa 41281380  T
Q  298 ttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaa 378  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  41281381 ttactaaagtttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa 41281461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36018428 - 36018216
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  36018428 aattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttcttaacaatttttttgagacaagttttgaacactataaaaggtt 36018329  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  36018328 catttattaaaatctagatttttttaacatgaaataaataaaatatgtatttttttaaaccaaaaaagtttaagataaaagtaacaaaaatatgaatgta 36018229  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  36018228 gaaatcaaatttt 36018216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 38706419 - 38706630
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||| |||||  | || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  38706419 aattttagaccctgttacaacaaagtttgtttaattattcttaaacacttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaaggtt 38706518  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  38706519 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgta 38706617  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  38706618 gaaatcaaatttt 38706630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 213 - 407
Target Start/End: Original strand, 42499375 - 42499567
Alignment:
Q  213 aataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctata 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  42499375 aataaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatt-ttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga 42499473  T
Q  313 attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  42499474 attttttaacataaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagatacaattaa-aacaatatggacgtaaaaattaaatttt 42499567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 27875423 - 27875634
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27875423 aattttagtccctcttacaacaaagtttgtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggtt 27875522  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||  ||||| ||||||||    
T  27875523 catttactaaaatttagaattttttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagata-aaataaacaaaatctggacgta 27875621  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  27875622 gaaatcaaatttt 27875634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 28015604 - 28015815
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28015604 aattttagtccctcttacaacaaagtttgtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggtt 28015703  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||  ||||| ||||||||    
T  28015704 catttactaaaatttagaattttttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagata-aaataaacaaaatctggacgta 28015802  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  28015803 gaaatcaaatttt 28015815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 36470801 - 36471012
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  36470801 aattttaggccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatgaaaggtt 36470900  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  | |||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  36470901 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacagcgaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgta 36470999  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  36471000 gaaatcaaatttt 36471012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17842776 - 17842572
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||   ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  17842776 ttttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttccaaacgatt-ttttgggacatgtttagaacactataaaaagttca 17842678  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  17842677 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacgtaga 17842579  T
Q  397 aatcaaa 403  Q
    |||||||    
T  17842578 aatcaaa 17842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30968979 - 30968810
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  30968979 aattttagtccctcttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacggttttttttagacaagtttagaacaatatgaaatgtt 30968880  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 364  Q
    | ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30968879 cgtttactaaaatttagaattttttaatatgtaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 30968810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 18839894 - 18840105
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  18839894 aattttagtccatgttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttcgaacgattttttttggatatgtttagaacactatgaaaggtt 18839993  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||| ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||  ||||| ||||| ||    
T  18839994 catctactaaaacttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaagagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacata 18840092  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  18840093 gaaatcaaatttt 18840105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 25101938 - 25102149
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25101938 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacaatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggtt 25102037  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| || |||| ||||| ||||||||    
T  25102038 cacttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttcaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaac-aaaatctggacgta 25102136  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  25102137 gaaatcaaatttt 25102149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 219 - 407
Target Start/End: Original strand, 43988155 - 43988343
Alignment:
Q  219 gtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||    
T  43988155 gtttgtttaattatacttaaactcttaaattttttagcgattttttttacctaagtttagaacactatgaaaggtttatatactaaaatttagaattttt 43988254  T
Q  319 taacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  43988255 taacataaaatgagttaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagataaaagtaacaaaaatctggatgtaaaaatcaaatttt 43988343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44265763 - 44265552
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44265763 aattttactccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttcgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 44265664  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||  ||| ||||| ||||| ||    
T  44265663 catttgctaaaatttagaattttttaacatgaaaagaattaaatatgagttttttaaaacgccaaaaattaaagataaaatcaac-aaaatctggactta 44265565  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  44265564 gaaatcaaatttt 44265552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 37706702 - 37706880
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37706702 ttttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatt-tttttagacaagattagaacactatgaaaggttca 37706800  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagt 376  Q
     ||| |||||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  37706801 attattaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagt 37706880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 37706545 - 37706712
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||          |||||||    
T  37706545 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggtatgagtggttttgttgcctaattgatagtttttttt--gaataat 37706642  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccct 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706643 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccct 37706712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37967852 - 37967639
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37967852 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaatcatccttaaactcttaaagttttgaacgattttttttaagacaagtttagaacactatgaaaggt 37967753  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaa-cgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  37967752 tcatttaccaaaatttagatatttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggaaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatatggacg 37967654  T
Q  393 tagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||    
T  37967653 tagaaatcaaatttt 37967639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Original strand, 5695889 - 5696077
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5695889 aattttagtctctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgattttttcgagacaagtttaaaacactatgaaaggtt 5695988  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  5695989 catttactaaaatttagaattttttaatatgagatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaa 5696077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33322828 - 33322637
Alignment:
Q  215 taaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataat 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  33322828 taaagtttgtttaattatctttaaactcttaaaattttgaacgattttttcaatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaatttagatt 33322729  T
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  33322728 tttttaacatgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctagacgtaaaaatcaaatttt 33322637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23483638 - 23483448
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||    
T  23483638 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttattaaaatttagagtt 23483539  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||  || ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  23483538 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaattgcaaaagttaaagatcaaattaac-caaatgtggacgtagaaatcaaatttt 23483448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 43622788 - 43622981
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaaggttcatttact-aaaatctataa 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  43622788 aaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttaaacgatt-tttttatgacaagtttataacactatgaaaggtgcatttacttaaaatttagaa 43622886  T
Q  314 tttt-ttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43622887 tttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaaacaaattatggacgtagaaatcaaatttt 43622981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 216 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6018333 - 6018166
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| || | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6018333 aaagtttgtttaattattcttaaacttttaaatttttgaacaatttttatgagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttataatt 6018234  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||| || ||||||||    
T  6018233 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttattaaaacaacaaaagataaagataaaactaacaaaa 6018166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 5250366 - 5250578
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| || ||||| ||  ||||||||    
T  5250366 aattttagtccctcttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaattcagaacgctgcgaaaggtt 5250465  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgac-aaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || |||| ||||| |  ||||    
T  5250466 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctaaacgt 5250564  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  5250565 agaaatcaaatttt 5250578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 41590336 - 41590525
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  41590336 aaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaatt-tttttatgacaagtttataacactatgaaaggttca-ttactaaaatttagaat 41590433  T
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||| ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  41590434 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattctggaagtagaaatcaaatttt 41590525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6590581 - 6590414
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6590581 aattttagtccttgttacaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaccatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 6590482  T
Q  295 catttactaaaatctata-attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6590481 catttactaaaatttagattttttttaacatgaaaaaaattaaatatgatttttttaaaacgagaaaa 6590414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3865965 - 3865796
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  3865965 aaactcttaaatttttaaatgatt-tttttatacaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaactttagaattttttaacatgaaataaattaa 3865867  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  3865866 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaatttt 3865796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8784872 - 8784682
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  8784872 aaagtttgtttaattatccgtaaactctcaaattttcgaacaatttttttgacataagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttaaaatt 8784773  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| || |||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  8784772 ttttaacataaaaagaattaaatatgaattttttaaaacggctgaagttaaagataaaattaa-taaaatctgaacgtagaaatcaaatttt 8784682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Original strand, 32514022 - 32514233
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||  ||  ||||||||     
T  32514022 ttttagtccctactaaaacaaagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattattttgagacaagtttagaacgttacaaaaggttcg 32514121  T
Q  297 tttactaaaatctata-attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtag 395  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| || ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  32514122 tttactaaaatttagattttttttaacatgaaatgaattaaatataaatttttgtaaaggaaaaaagttaaagataaaagtaacaaaattctggacgtag 32514221  T
Q  396 aaatcaaatttt 407  Q
    | || |||||||    
T  32514222 atataaaatttt 32514233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Original strand, 42024231 - 42024439
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  42024231 ttttagtccctgctaaaacaaagtttctctaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatt--ttttagacaagtttagaacattaccaaaagtttg 42024328  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||||||||   |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  42024329 tttactaaaatttagaattttataccatgaaatgggttaaatatgaatttttttgaaagacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctcgacgtaga 42024428  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    ||| |||||||    
T  42024429 aataaaatttt 42024439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Original strand, 6244192 - 6244362
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6244192 aaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaaatattcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaa 6244291  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||  |||||| |||||||    
T  6244292 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctagacacagaaataaaatttt 6244362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 18304663 - 18304855
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt--atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataa 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |     
T  18304663 aaagtttgattaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttttaagacatgtttagaacactatgaaaggttcattttccaaaatttagat 18304762  T
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18304763 ttttgtaacttcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaatttaaagataaaatcaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 18304855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 216 - 383
Target Start/End: Original strand, 43936513 - 43936680
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||   ||    
T  43936513 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagttttgaacgctatgaaagatttatttaccaaaatttaatttt 43936612  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  43936613 ttttaacatgaaacgaattaaaaataaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaa 43936680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Original strand, 17498544 - 17498681
Alignment:
Q  269 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 368  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17498544 acaagtttagaacactataaaagattcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 17498643  T
Q  369 atataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| || |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  17498644 ataaaattaac-aaaatttgaacgtagaaatcaaatttt 17498681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32243951 - 32243782
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32243951 aaactcttaaatttttcaatgatt-tttttatacaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttataattttttaacatgaaataatttaa 32243853  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||| | |||||| ||| |||||||||| || ||| |||||| |||||| | |||| || ||| |||||||    
T  32243852 atataattttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaaaaaaaatctagacgcaggaataaaatttt 32243782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6243749 - 6243576
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa-tctataattttttaacatgaaa 328  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  6243749 tatccttaaactctt---tttttcaacgatt--ttttatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaaatttagaattttttaacatgaaa 6243655  T
Q  329 taaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
     |||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  6243654 caaattaaatatgaatttttttaaaagataaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatatggatgcagaaattaaatttt 6243576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 30658431 - 30658626
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||        
T  30658431 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaattatttttttaagacaagtttagaacactatgaaa---- 30658526  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
                | || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  30658527 ------------tttagatttttttaacatgaaacaaattaattatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgta 30658613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36126570 - 36126457
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttt-aacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  36126570 aattttagtccctgctaaaataaagtttgtttaactatccttaaactattaaattttttgaacgatttttttaagacaagtttaaaacactataaaaggt 36126471  T
Q  294 tcatttactaaaat 307  Q
    ||||||||||||||    
T  36126470 tcatttactaaaat 36126457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31185784 - 31185693
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactat 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31185784 aattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaatttttgaaagattctttttatacaagtttagaacactat 31185693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Original strand, 44894432 - 44894600
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||    
T  44894432 aaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaaatgttcgtttactaaaatttagaattatttagcttgaaataaattaa 44894531  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||   ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  44894532 atatgaatttttttaaaagac--aagtttaaaataattgtaacaaaaatctggacgcagaaataaaatttt 44894600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 383
Target Start/End: Original strand, 3866405 - 3866557
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  || || ||||||| | |||| || |||||||||| |||||||    
T  3866405 tatccttaaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcatttaat-aaatttagaattttttaatatgaaat 3866503  T
Q  330 aaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  3866504 aaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 3866557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 407
Target Start/End: Original strand, 17062408 - 17062552
Alignment:
Q  262 tttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17062408 tttttagacaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaa 17062507  T
Q  362 gtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| ||||   || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17062508 gttaaagacgaaattaac-aaaatctggacatagaaatcaaatttt 17062552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17585950 - 17585806
Alignment:
Q  262 tttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17585950 tttttagacaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaa 17585851  T
Q  362 gtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| ||||   || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17585850 gttaaagacgaaattaac-aaaatctggacatagaaatcaaatttt 17585806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Original strand, 32244411 - 32244587
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  || || ||||||| | |||| || |||||||||| |||||||    
T  32244411 tatccttaaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcatttaat-aaatttagaattttttaatatgaaat 32244509  T
Q  330 aaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||| | |||| |||||||    
T  32244510 aaattaaatatggatttttttagtagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcataaataaaatttt 32244587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 399
Target Start/End: Original strand, 28701665 - 28701850
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacacta---tgaaaggttcatttactaaaatctata 312  Q
    ||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||| || |||| |||| | |||| ||||||| | ||   | |||||||  ||||||||||| |  |    
T  28701665 aaagtttctctaattatcttcaaactcttaaatctttaaatgatt-ttttgagacaaatttagaatagtaccataaaaggtttgtttactaaaatttgga 28701763  T
Q  313 attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaat 399  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28701764 atttattaacatgaaatgaattaaatataaatatttttaaaagactaaagtttaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaat 28701850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10410148 - 10410010
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatcta 310  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||| |||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||    
T  10410148 aaaacaaagtttctctaattatccttagagtcttaaatttttgaacgatttttttaagataagtttaaaacattacaaaagattcatttaccaaaattta 10410049  T
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttt 349  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10410048 gaattttttaacatgaaatgaattaaatatgattttttt 10410010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36910638 - 36910486
Alignment:
Q  210 aaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatct 309  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  ||||  | |||||||||||| |    
T  36910638 aaaaacaaagtttatttaattttccttaaaatcttaaattttttaacgattttttgtaaacaagtttagaacattacaaaagacttatttactaaaattt 36910539  T
Q  310 ataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttt 365  Q
    | |  |||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  36910538 aga--tttttaacatgacatgaattaaatatgaaaattttcaaacga-aaaagttt 36910486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 27000978 - 27000886
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaa 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  27000978 tataattttttaacatgagataaattaaatatgaatttttt-aaacgagaaaagttcaatataaaagtcacgaaaatttggacgtagaaatcaa 27000886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Original strand, 13323522 - 13323597
Alignment:
Q  17 ttcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag 92  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13323522 ttcatgattttcactatcttatcgatgacttcttttgctttgtcgggcatgagttgttttgttgccgaattgatag 13323597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 405
Target Start/End: Original strand, 21159841 - 21159966
Alignment:
Q  280 acactatgaaaggttcatttactaaaatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaa 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |    
T  21159841 acactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaatatgaaacggattaaatataaattttttaaaatggcaaaagttaaagata-aagtta 21159939  T
Q  379 caaaaatatggacgtagaaatcaaatt 405  Q
      ||||| | || ||||||||||||||    
T  21159940 acaaaatctagatgtagaaatcaaatt 21159966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12469514 - 12469421
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatga 288  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  12469514 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcctaaatttttgaataatttttttaagacaagtttagaacactatga 12469421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9252901 - 9252751
Alignment:
Q  255 acgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaac 354  Q
    |||||| |||| | |||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  9252901 acgatttttttgagacaaatttaaaatactatgaaaggttcgttaacgaaaatttaaatttttttaacataaaacaaattaaatat-aaattttgaaaac 9252803  T
Q  355 gacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |  ||||||| |||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9252802 ggtaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggaagtagaaatcaaatttt 9252751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2827125 - 2827031
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaa 290  Q
    |||||||||| |||| || | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2827125 aattttagtctctgctaagacaatgtttgtttaattatcctcaaactctt-aattttttgaagatttttttgacacaagtttagaacactatgaaa 2827031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7419925 - 7419830
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| || || || |||| |||||||    
T  7419925 aattttttaacatgtaataaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 7419830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 65
Target Start/End: Original strand, 41280610 - 41280665
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggca 65  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41280610 aaaaatattcaagattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggca 41280665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 41315452 - 41315547
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  41315452 aattttttaacatgtaatgaattaaatataaaatttttaaatcgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatatggacctaaaaataaaatttt 41315547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 383
Target Start/End: Original strand, 13323634 - 13323715
Alignment:
Q  302 taaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  13323634 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaa 13323715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4517140 - 4517045
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  4517140 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgctaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaaatttt 4517045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 407
Target Start/End: Original strand, 6413383 - 6413457
Alignment:
Q  332 attaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  6413383 attaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggatgtaggaatcaaatttt 6413457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 7637055 - 7637150
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  7637055 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 7637150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10409948 - 10409894
Alignment:
Q  344 ttttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaat 399  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10409948 ttttttaaaa-gacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaat 10409894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11385663 - 11385568
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||| | ||| || |||| |||||||    
T  11385663 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaaatttt 11385568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 28174250 - 28174345
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  28174250 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaattaaatttt 28174345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34058855 - 34058760
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||  |||||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  34058855 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaaattaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 34058760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41219763 - 41219668
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  41219763 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 41219668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 42219324 - 42219419
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  42219324 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacataaaaataaaatttt 42219419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 44090493 - 44090588
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| || || || |||| |||||||    
T  44090493 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgcacctaaaaataaaatttt 44090588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30378290 - 30378192
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  30378290 tataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaatacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 30378192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Original strand, 30839046 - 30839144
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || ||| ||||||  ||||| | ||| || ||| ||||||||    
T  30839046 tataattttttaacatgaaattaattaaacatgaattttttaaaatgtcaaaaattgaaaataaaagtaaagaaaatctagacttataaaacaaatttt 30839144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 32098689 - 32098787
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  32098689 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacatgtttaaaacattataaaaggttc 32098787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2061070 - 2060975
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || || | ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  2061070 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactagcgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 2060975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 12616363 - 12616426
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  12616363 ttttagtccctgctaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 12616426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18365350 - 18365255
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  18365350 aattttttatcatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 18365255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Original strand, 24541854 - 24541933
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| |||||    
T  24541854 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttgttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggac 24541933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27923813 - 27923718
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  27923813 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatatttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 27923718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 34050590 - 34050661
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||||    
T  34050590 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaa 34050661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36765691 - 36765596
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  36765691 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaacttcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 36765596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 13699389 - 13699487
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  13699389 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 13699487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 24685350 - 24685448
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  24685350 ttttagtccctgtaaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttcatgattttttacatacttgtttaaaacattattaaaggttc 24685448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 27519553 - 27519651
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  27519553 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 27519651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28174463 - 28174365
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  28174463 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 28174365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 34058642 - 34058740
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  34058642 ttttagtccctgctaaattaaaatttgtttaattaggcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 34058740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Original strand, 13082749 - 13082846
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| |||||||    
T  13082749 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggtt 13082846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Original strand, 17918811 - 17918884
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||| | |||| |||||    
T  17918811 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattgaagatattactaacgaaaat 17918884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12616577 - 12616481
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttt-aaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  12616577 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaaacgtcaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 12616481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 2060857 - 2060920
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  2060857 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 2060920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4137079 - 4136984
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||| || || || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  4137079 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccataaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 4136984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13082962 - 13082867
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || | |||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  13082962 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcatgataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 13082867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 16729114 - 16729209
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| || ||||  |||| ||||| || |||| |||||||    
T  16729114 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacggaaatttggacctaaaaataaaatttt 16729209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19183165 - 19183102
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19183165 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 19183102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22849910 - 22849855
Alignment:
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat 370  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  22849910 tttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttaaaagccaaaattttaagat 22849855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27519764 - 27519693
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||||    
T  27519764 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaat 27519693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 368 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28695092 - 28695053
Alignment:
Q  368 gatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28695092 gatataagtaactaaaatatggacgtagaagtcaaatttt 28695053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32098901 - 32098807
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||| || || || |||| |||||||    
T  32098901 aattttttaacatgta-tgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatataagataaaactaacaaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 32098807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 35209560 - 35209655
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||   |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  35209560 aattttttaacaggtaatgaattaaatatattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 35209655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 36051803 - 36051866
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  36051803 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 36051866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36052016 - 36051921
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  36052016 aattttttaacatgtaatgaatgaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacttaaaaataaaatttt 36051921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 39106869 - 39106963
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  39106869 aattttttaacatgtaatgaat-aaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 39106963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41724977 - 41724882
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  41724977 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttataaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 41724882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 42175207 - 42175266
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  42175207 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagata 42175266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42219576 - 42219513
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  42219576 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 42219513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 4516927 - 4516985
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  4516927 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaaattttaaattttttaa 4516985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 347
Target Start/End: Original strand, 5549145 - 5549183
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttt 347  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5549145 tataattttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttt 5549183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 11385450 - 11385548
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  11385450 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgtttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 11385548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 30378074 - 30378172
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  30378074 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaatttttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 30378172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32099194 - 32099160
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32099194 ttttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttt 32099160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39107081 - 39106983
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  39107081 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattttgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 39106983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 41724764 - 41724862
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  41724764 ttttagtccccgataaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 41724862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42175420 - 42175322
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||||||   ||| |||| ||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  42175420 ttttagtccctattaaattaaaatttatttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttatatacttgtttaaaacattataaaaggttc 42175322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8076422 - 8076329
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||| | ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  8076422 ttttttaacatgtaatgagttaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 8076329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8076760 - 8076723
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8076760 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 8076723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 293
Target Start/End: Original strand, 8076212 - 8076308
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||    
T  8076212 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggt 8076308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13699596 - 13699507
Alignment:
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  13699596 ttttaacatgtaatgaattaaatataa--tttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 13699507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17919024 - 17918928
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||    
T  17919024 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttacaacattataaaaggt 17918928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28695155 - 28695091
Alignment:
Q  292 gttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacga 356  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28695155 gttcatttactaaaattttaaattgtttaagatgagatgaattaaataagaatttttttaaacga 28695091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 247
Target Start/End: Original strand, 30806332 - 30806368
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaa 247  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30806332 aaaacaaagtttgtttaattgtccttaaactcttaaa 30806368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 383
Target Start/End: Original strand, 46044081 - 46044457
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  46044081 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagtttttttttggaataat 46044180  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa---aattttagtccc 206  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||    
T  46044181 tattagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactaattttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaattacttctaattttagtccc 46044280  T
Q  207 tgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 306  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46044281 tgctaaaacaaagtttttttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaa 46044380  T
Q  307 tctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  46044381 tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaa 46044457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38599285 - 38599073
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38599285 aattttagtcactgctaaaataaattttgcttaattatctttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaagatt 38599186  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38599185 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaattttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 38599086  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  38599085 gaaatcaaatttt 38599073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33625289 - 33624936
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  33625289 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattatcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagtttttttg--gaataat 33625192  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtcc 205  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |     |||||||||||    
T  33625191 tactagtcaaaaatatctcttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaaacaaaatttacttctaattttagtcc 33625092  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33625091 ttgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttaga--gattttttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaa 33624994  T
Q  306 atctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagt 363  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33624993 atttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 33624936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38199552 - 38199155
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||          |||||||    
T  38199552 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcaggcatgagtggttttgttgacgaattaatagttttttttg-gaataat 38199454  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa--aattttagtccc 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||             ||||||||||||    
T  38199453 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccctaaaaaaaaattacttctaattttagtccc 38199354  T
Q  207 tgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 306  Q
    | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||    
T  38199353 tactaaaacaaagtt-gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcaatcaataaaa 38199255  T
Q  307 tctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattt 406  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| ||||||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  38199254 tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaaaaaaaattaaagataaaagtaa-taaaatatggacatataaatcaaattt 38199156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 363
Target Start/End: Original strand, 44167680 - 44167940
Alignment:
Q  107 aattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa----aattttag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |     ||||||||    
T  44167680 aattactagtcaaaaatatatttttatgatgaaaatactatcataactagttttagtaagttttttagtccctacaaaaaaaatttacttctaattttag 44167779  T
Q  203 tccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttact 302  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44167780 tcactgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttataacactatgaaaggttcaattact 44167879  T
Q  303 aaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagt 363  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44167880 aaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacgataaaagt 44167940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3496153 - 3495749
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcatt----gtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||    
T  3496153 aaaaatattcatgattttcactattttatcgatgacttcttttgcattaattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttatg-gaa 3496055  T
Q  106 taattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa----aatttt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |     ||||||    
T  3496054 taattactaatcaaaaatatattttcctgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccctacaaaaaaaaatcacttctaatttt 3495955  T
Q  201 agtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcattta 300  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| |  |||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  3495954 agtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgaggcaagtttaaaacactatgaaagattcaatta 3495855  T
Q  301 ctaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatc 400  Q
     |||||| || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || |||||    
T  3495854 ataaaatttaaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatataaatc 3495756  T
Q  401 aaatttt 407  Q
    |||||||    
T  3495755 aaatttt 3495749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 383
Target Start/End: Original strand, 43083639 - 43084021
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnna--gaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||            |||||    
T  43083639 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcggacatgagtgattttgttgccgaattgatagtttttttttttggaata 43083738  T
Q  108 attactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaaa------atttt 200  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||           |      |||||    
T  43083739 attactagtcaaaagtttcttttcttgatgaaaatactatcataactagttttaataggtttttttagtccctacaaaaaaaaaaattacttctaatttt 43083838  T
Q  201 agtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcattta 300  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43083839 agtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaatta 43083938  T
Q  301 ctaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
     |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||| | |||||| |||||| ||||    
T  43083939 ataaaatttagaattttttaacatgaaaaaaattaaatatgaatttttgaaaacaattaaagataaagataaaagtaataaaa 43084021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6331192 - 6331001
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6331192 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 6331093  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6331092 ttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaaatctggacatagaaatcaaatttt 6331001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15131207 - 15130859
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||    
T  15131207 aaaattattcacgattttcactatcttatcgatgacttatgttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgataattttttttg-gaataat 15131109  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnna----aaattttagtcc 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |     |||||||||||    
T  15131108 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatacaatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaattacttctaattttagtcc 15131009  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||        ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15131008 ttgctaaaacaaagtttgtttaattat--------tcttaaacttttgaacgtttttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaa 15130917  T
Q  306 atctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagt 363  Q
    || || ||||||| || || |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15130916 atttagaatttttaaatattaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 15130859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 43597483 - 43597673
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  43597483 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttattttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 43597582  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43597583 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 43597673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 22378457 - 22378647
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  22378457 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactacgaaaggtacatttactaaaatttagaatt 22378556  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22378557 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 22378647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 10620498 - 10620709
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   || | |||||||| ||||||||||||| |||    
T  10620498 aattttagtccttgctaaaataaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttcattaagacaagttttgaacactatgaaaagtt 10620597  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10620598 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaac-aaaatatggacgta 10620696  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  10620697 taaatcaaatttt 10620709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38159269 - 38159059
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38159269 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttacactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 38159170  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||| |||    
T  38159169 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata-aattaac-aaaatctggaggta 38159072  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  38159071 gaaatcaaatttt 38159059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 195 - 405
Target Start/End: Original strand, 7238554 - 7238763
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  7238554 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacattatgaaaggtt 7238653  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttt-aagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||    
T  7238654 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacga-aaaagtttaaagataaaattaac-aaaatctggacgt 7238751  T
Q  394 agaaatcaaatt 405  Q
    ||||||||||||    
T  7238752 agaaatcaaatt 7238763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 45958516 - 45958815
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||          || ||||    
T  45958516 aaaaatattaacaattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtgaggcatgagtgattttgttgccgaattgatagtttttttttggagtaat 45958615  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa---aattttagtccc 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||              |||||||||  |    
T  45958616 tactagtcaaaaatatcttttcatggtgaaaatactatcttaactagttttagtaggttttttagtccttacaaaaaaaattacttctaattttagtttc 45958715  T
Q  207 tgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 306  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45958716 tgctaaaacaaagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaa 45958815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4926692 - 4926481
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||  | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  4926692 aattttagtctctgttacaacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggtt 4926593  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| || |||| ||||| || |||||    
T  4926592 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcacaagttaaagataaaattaac-aaaatctgaacgta 4926494  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  4926493 gaaatcaaatttt 4926481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6588983 - 6588793
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  6588983 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatt-tttttatgacaagtttataacactaggaaaggttcatttactaaaatttagaat 6588885  T
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  6588884 tttttaacatgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaac-aaattctggacgtagaaatcaaatttt 6588793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 47792139 - 47791944
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatcta 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  47792139 aaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatgtttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatctaccaaaattta 47792040  T
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
     | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  47792039 gatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 47791944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18059320 - 18059135
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18059320 aattttagtccctgttacaacaaa-tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatt--ttttggacaagtttagaacactatgaaaggtt 18059224  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  18059223 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaattaacaaaa 18059135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44081275 - 44081063
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  44081275 aattttagtccttgttaatacaaagtttgtttaattatacttaaattcttaaatttttgagcgaatttttttagacaaatttagaatactatgaaaggtt 44081176  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44081175 catttactaaaatttaaaatttttaaaattgaaattaattaaatatgaattttttaaaacgactaaacatcaagataaaagtaacaaaaatatggacgta 44081076  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| |||||||    
T  44081075 gaaattaaatttt 44081063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 14990526 - 14990735
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  14990526 aattttagtccttgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggtt 14990625  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||| ||||| || | |||    
T  14990626 ca-ttactaaaatttataattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaa-ggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctgaatgta 14990722  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  14990723 gaaatcaaatttt 14990735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 15420137 - 15420346
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  15420137 aattttagtccttgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggtt 15420236  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||| ||||| || | |||    
T  15420237 ca-ttactaaaatttataattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaa-ggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctgaatgta 15420333  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  15420334 gaaatcaaatttt 15420346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 195 - 382
Target Start/End: Original strand, 11396936 - 11397124
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | | | ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  11396936 aattttagtccctgctaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttgtgtaagacaggtttataacactgtgaatggat 11397035  T
Q  295 catttactaaaatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaa 382  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  11397036 catttactaaaatttagaatttttttagcgtgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgtcaaaagttaaagataaaagtaacaaa 11397124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 35482058 - 35482245
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  35482058 aaagtttgtttaattatctttaaactgttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 35482157  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35482158 tttt--cattaaatgaattaaatatgaatttttt-aaacgctaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 35482245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 4899842 - 4900053
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  4899842 aattttagtacctgttaaaacaaagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttataacactatgaaaggtt 4899941  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat-ataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| | ||||||| ||||| |||| ||    
T  4899942 catttactaaaatttagaa-tttctaacatgaaacaaattaaatatgaattttttcaaaccgcaaaacttaaagataaaaagtaac-aaaatctggatgt 4900039  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  4900040 agaaatcaaatttt 4900053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37540103 - 37539890
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||   | | |  ||||||||| |   |||||||    
T  37540103 aattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttccgagatatatttagaacatttcaaaaggtt 37540004  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaatt-ttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  | ||| |    
T  37540003 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttttaaacgacaaaagttcaagataaaagcaacaaaaaattagactt 37539904  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
     |||||||||||||    
T  37539903 ggaaatcaaatttt 37539890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Original strand, 12621594 - 12621763
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12621594 aaactcttaaatttttcaaagatt-tttttatacaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttaaaattttttaacatgaaataaattaa 12621692  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||| ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  12621693 atatgaatttttttaaaagacgaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaatttt 12621763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 1544453 - 1544664
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||   |    
T  1544453 aattttaatccttgctaaaacaaattttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatatttttgagtcaagtttagaacactatgaaaaact 1544552  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||| |||| || |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||  ||| |||    
T  1544553 catttgctaagattttgaattttttaacttgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagatgaaagtaac-aaaatcgggatgta 1544651  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  1544652 gaaatcaaatttt 1544664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1962194 - 1962003
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||    
T  1962194 aaagttcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatatttttgagacaagtatagaacactatgaaaggtcaatttattaaaatttagaatt 1962095  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatg-aattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1962094 ttttaacatgaaacgaatgaaatatgtattttttttaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaattaaatttt 1962003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8832985 - 8832814
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaatta 335  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |  | |||| ||||||||||||||    
T  8832985 aaactcttaaatttttcaatgatttttttttatacaagtttagaacattacaaaaggttcatttactaaaatttagacctatttagcatgaaataaatta 8832886  T
Q  336 aatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  8832885 aatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaatttt 8832814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 15652795 - 15652981
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatct--ataa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |  ||      
T  15652795 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttttgagatacgtttagaacaatatgaaaggtttatttattaaaatttagattt 15652894  T
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||      || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15652895 ttttttaatatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagt------taaaagtaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 15652981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 27727204 - 27727418
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  27727204 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatactaagaaaggtt 27727303  T
Q  295 catttactaaaatctataa--ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    |||| ||| |||| || ||  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |  ||||| ||||||    
T  27727304 cattaacttaaatttagaattttttttaccataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaatttaacaaaatctggacg 27727403  T
Q  393 tagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||    
T  27727404 tagaaatcaaatttt 27727418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1065965 - 1065796
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1065965 aaactcttaaatttttcaatgatt-tttgtatactagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaa 1065867  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  1065866 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctagacgtaggaataaaatttt 1065796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 356
Target Start/End: Original strand, 9633147 - 9633308
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaa-ttttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  9633147 aattttaatccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttaatgatattttttagacaagtttataacattataaaaggt 9633246  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacga 356  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9633247 tcatttactaaaattcataa-tttttaacttgaaataaattaaatatgaattcttttaaacga 9633308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37107953 - 37107784
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  37107953 aaactcttaaatttttcaatgatt-tttttatacaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttcaacatgaaataaattaa 37107855  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  37107854 atataaattttttaaaaagacaaaagttcaaaataaaagcaacaaaaatctggacgcaggaataaaatttt 37107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 43574557 - 43574345
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| |||    
T  43574557 aattttaatccctgctaaaacaaattttgtttaattattcttaaactctaaaatgtttgaacgatttttttgtgacaagtttagaacactataaaatgtt 43574458  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat-ataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||  ||||| | || ||    
T  43574457 catttattaaaatttagaattttctaacttgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaaagtaa-taaaatttagatgt 43574359  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  43574358 agaaatcaaatttt 43574345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 46331069 - 46330928
Alignment:
Q  242 cttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatg 341  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  46331069 cttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgtaacgaattaaatatg 46330970  T
Q  342 aattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  46330969 aatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaa 46330928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38594788 - 38594618
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||    
T  38594788 aaactcttaaatttttcaatgatttttttgatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaatcaa 38594689  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||| | |||| |||||||    
T  38594688 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctagacgcataaattaaatttt 38594618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 6934745 - 6934875
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  6934745 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatggcttctcttgcattgtcgggcatgagcggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 6934843  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaa 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6934844 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaa 6934875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Original strand, 42974127 - 42974298
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  42974127 aaactcttaaatttttcaatgatttttttaatataagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttaacatggaataaattaa 42974226  T
Q  337 atatga-attttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||  |||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  42974227 atatgatttttttttaaaagacaaaagtttgaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaatttt 42974298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 399
Target Start/End: Original strand, 10463312 - 10463475
Alignment:
Q  234 cttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaat 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| ||  | || |||||||||| ||||||| |||    
T  10463312 cttaaactcttaaatttttgaacgatctttttgagacaagtttaaaacattacaaaaggttcgtttaccaa--tttagaattttttaaaatgaaattaat 10463409  T
Q  334 taaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaat 399  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10463410 taaatatgaatttttttaaaagacaaaaatttaagataaaagtaacaaaaatctggacgtagaaat 10463475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 407
Target Start/End: Original strand, 36019787 - 36019951
Alignment:
Q  241 tcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatat 340  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||| ||||    
T  36019787 tcttaaatttttgaac-atttttttgagacaagtttataacattatgaaatgttcatttactaaaatttagaactttttaacatgaaacgaattagatat 36019885  T
Q  341 gaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  36019886 gaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctagacgtagaaatcaaatttt 36019951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 29155940 - 29156155
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaaca----ctatgaaa 290  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||||     |||| |     
T  29155940 aattttagtccctattagaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttatgaacaattttttttaaacaagtttagaacattatatatggac 29156039  T
Q  291 ggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgga 390  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||  | ||| ||||    
T  29156040 ggtttatttacaaaaatttagaattttttaatttgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagctaaaagcaa-tagaatctgga 29156138  T
Q  391 cgtagaaatcaaatttt 407  Q
    | |||||||||||||||    
T  29156139 catagaaatcaaatttt 29156155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 44167548 - 44167630
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag 92  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44167548 aaaaatattcacgattttcattatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag 44167630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8082081 - 8081912
Alignment:
Q  237 aaactcttaaatttttt-aacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaatta 335  Q
    |||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||    
T  8082081 aaactcttaaaaattttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaaatgttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaatta 8081982  T
Q  336 aatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8081981 aatatgaatttttttaaaagac--aagtttaaaataattgtaacaaaaatatggacgcagaaataaaatttt 8081912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 407
Target Start/End: Original strand, 1066416 - 1066593
Alignment:
Q  231 atccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt--atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || || || |||| |||| | || |||||||||| ||||||    
T  1066416 atccttaaactcttaaatttttcaatgattttttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcgtttaataaatt-tagaattttttaatatgaaa 1066514  T
Q  329 taaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  1066515 taaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaatttt 1066593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 46331252 - 46331100
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag---nnnnnnnnnagaat 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||             ||||    
T  46331252 aaaaatattcatgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattttcgggcatgagtggtttggttgccgaattgatagttttttctttttggaat 46331153  T
Q  107 aattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagtttt 160  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  46331152 aattactagtcaaaaatat-ctttcatgatgaaaatactatcataactaatttt 46331100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 358
Target Start/End: Original strand, 47139730 - 47139878
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatcta 310  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  47139730 aaaacaaattttgtttaattatccttaaacatttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttaaaacattatgcaaggttcatttactaaaattta 47139829  T
Q  311 -taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgaca 358  Q
     || |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  47139830 gtattttttttatatgaaatgaattaaatatgaattgttttaaatgaca 47139878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Original strand, 37108412 - 37108589
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  || || || |||| | |||| || |||||||||  |||||||    
T  37108412 tatccttaaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcgtttaat-aaatttagaattttttattatgaaat 37108510  T
Q  330 aaattaaatat-gaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||  |||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||| | |||| |||||||    
T  37108511 aaattaactatggattttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacggaaaaataaaatttt 37108589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 28924809 - 28924600
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| || | |||  || |||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||| |||  | ||| ||||| |||| ||| ||| |||    
T  28924809 aattttagtccttgtataaactaaatttgtttaattatctttgaattcttaaagttttgaacgattttttggagacatgtttaaaacattataaaatgtt 28924710  T
Q  295 catttactaaaatc--tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttta-aaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| || |     ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||    
T  28924709 catttactaaaaaaaatataattttttaacaagagaa----taaatatgaattttttttaaacgacaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctggac 28924614  T
Q  392 gtagaaatcaaatt 405  Q
    ||||||||||||||    
T  28924613 gtagaaatcaaatt 28924600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 16080773 - 16080868
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| | | |||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  16080773 aaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttatgatttctttgagaaaagtttagaacattaagaaatgttcatttactaaaa 16080868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 7208003 - 7208098
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  7208003 aattttttaacatgtaataaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 7208098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 407
Target Start/End: Original strand, 21109448 - 21109536
Alignment:
Q  319 taacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat-ataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  21109448 taacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaaagtaac-aaaatctcgatgtagaaatcaaatttt 21109536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 9900541 - 9900636
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  9900541 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 9900636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 23023526 - 23023621
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  23023526 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 23023621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 39035847 - 39035942
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  39035847 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaaatttt 39035942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 45986193 - 45986288
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  45986193 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 45986288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 391
Target Start/End: Original strand, 5029211 - 5029293
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| |||||    
T  5029211 tataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 5029293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Original strand, 30740669 - 30740767
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||| | ||||| || |||||| || |||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  30740669 tataattttttaacatgtaatgaattaaatatattttttttaaaaagccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatatggacctaaaaataaaatttt 30740767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2510778 - 2510673
Alignment:
Q  302 taaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatca 401  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |    
T  2510778 taaaatttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 2510679  T
Q  402 aatttt 407  Q
    ||||||    
T  2510678 aatttt 2510673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 407
Target Start/End: Original strand, 6972306 - 6972403
Alignment:
Q  310 ataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||  ||||| || |||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6972306 ataatcttttaacatgtaatgagttaaatatgaatttttctaaacatcaaaatttcaagattaaagtagcaaaaatttggacctagaaatcaaatttt 6972403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41571712 - 41571635
Alignment:
Q  290 aggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41571712 aggttcatttactaaaatttaatttttttaaacatgagataaattaaat----attttttaaaacgacaaaagttcaagata 41571635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11620143 - 11620048
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| |  |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  11620143 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaagctaacgaaaatttggacataaaaataaaatttt 11620048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 21202285 - 21202379
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  21202285 aattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 21202379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28642581 - 28642486
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  28642581 aattttttaacatataatgaattaaatataatttttttaaaacgttaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 28642486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 34651590 - 34651685
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  34651590 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 34651685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45986406 - 45986343
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  45986406 ttttagtccctgtaaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 45986343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39036060 - 39035962
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  39036060 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 39035962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42335740 - 42335642
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||||||   ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  42335740 ttttagtccctattaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaacgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 42335642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 407
Target Start/End: Original strand, 47784815 - 47784909
Alignment:
Q  313 attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | | ||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  47784815 attttttaacatgtaataaattaaatataatttttttaaaatgccgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 47784909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Original strand, 46158066 - 46158139
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  46158066 aattttttaacatgtaatgaaataaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaaactaacgaaaat 46158139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Original strand, 17314602 - 17314682
Alignment:
Q  215 taaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  17314602 taaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaacgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 17314682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23064543 - 23064447
Alignment:
Q  312 aattttttaacat-gaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  23064543 aattttttaacattgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaaatttt 23064447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24424495 - 24424432
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  24424495 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 24424432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Original strand, 30740224 - 30740279
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  30740224 ttttagtccctgtaaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaattttt 30740279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 33772389 - 33772483
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| || |||||| |  |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  33772389 aattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaatgccaaaaattcaagataaacctaacaaaaatttggacttaaaaataaaatttt 33772483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47229780 - 47229717
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  47229780 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 47229717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 2510555 - 2510613
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  2510555 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 2510613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9900754 - 9900656
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  9900754 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgtttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 9900656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21202497 - 21202399
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  21202497 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaatttttttatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 21202399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23023739 - 23023641
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  23023739 ttttaatccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 23023641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36040158 - 36040060
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | | ||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  36040158 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaatttaaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 36040060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 38332488 - 38332546
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  38332488 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 38332546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 45983511 - 45983609
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| | || ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  45983511 ttttagttcctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttcttcatacttgtttaaaacattataaaaggttc 45983609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 371
Target Start/End: Original strand, 36039948 - 36040005
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  36039948 ttttttaacatgtaataagttaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagata 36040005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41098832 - 41098795
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41098832 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 41098795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 45985742 - 45985827
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaaca 282  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||  ||||| ||||| ||||    
T  45985742 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaaagattttttacatacatgtttataaca 45985827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 33744640 - 33744852
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33744640 aattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 33744739  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33744740 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaataaaaatatggacgta 33744839  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  33744840 gaaatcaaatttt 33744852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 5079293 - 5079696
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnna--gaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||            |||||    
T  5079293 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcggacatgagtggttttgttgccgaattgatagtttttttttttggaata 5079392  T
Q  108 attactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagt 203  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||         |     |||||||||    
T  5079393 attactagtcaaaaatatctttttatgatgaaaatactatcataactagttttagtagattttttagttcctacaaaaaaaaattacttctaattttagt 5079492  T
Q  204 ccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttact 302  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5079493 tcctgctaaaacaaagtttgttaaattatccttaaagtcttaaatttttaaacgattttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattact 5079592  T
Q  303 aaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaa 402  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||    
T  5079593 aaaatttaattttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaa 5079691  T
Q  403 atttt 407  Q
    |||||    
T  5079692 atttt 5079696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17246086 - 17245721
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  17246086 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 17245988  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtc 204  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||         |     ||||||| ||    
T  17245987 taatagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttattaggtttttttagtccatacaaaaaaaaattacttctaattttaatc 17245888  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17245887 cctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataa 17245788  T
Q  305 aatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    ||| || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  17245787 aatttagaattttttaacatgaaacgaaataaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagata 17245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26356848 - 26356637
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26356848 aattttagtccctgttacagcaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 26356749  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  26356748 catttactaaaatttaaaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgta 26356650  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  26356649 gaaatcaaatttt 26356637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 195 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10915620 - 10915411
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10915620 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 10915521  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  10915520 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaatgttaaagataaaattaac-aaaatatggacgta 10915422  T
Q  395 gaaatcaaatt 405  Q
    |||||||||||    
T  10915421 gaaatcaaatt 10915411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 844424 - 844212
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  844424 aattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 844325  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat-ataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||| ||||| || | ||    
T  844324 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaaagtaac-aaaatctgaatgt 844226  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  844225 agaaatcaaatttt 844212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 29691889 - 29692100
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  29691889 aattttagtccctactacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaacttaaaacactatgaaaggtt 29691988  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  29691989 catttactaaaatttagaatttattaacatgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagtaac-aaaatatggacgtt 29692087  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  29692088 gaaatcaaatttt 29692100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 17697385 - 17697575
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17697385 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgattttttttagaaaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 17697484  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17697485 tattaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 17697575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 861336 - 861548
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||    
T  861336 aattttagtccctgctaaaacaaaacttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagaaaagttttgaacactatgaaaggtt 861435  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat-ataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||| ||    
T  861436 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaac-aaaatctggatgt 861534  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  861535 agaaatcaaatttt 861548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Original strand, 5087168 - 5087356
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5087168 aattttagtccctactacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaactttttgaacggttgtttttagacaagtttagaacactatgaaatgtt 5087267  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  5087268 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaa 5087356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8710152 - 8709941
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  8710152 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttaagacaagtttagaatactatgaaaggtt 8710053  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  8710052 cattaactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgta 8709954  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  8709953 gaaatcaaatttt 8709941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 15721061 - 15721254
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt--atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  15721061 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaattttagaa 15721160  T
Q  314 tttt-ttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15721161 tttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 15721254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 5974287 - 5974498
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  5974287 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttcagacaagtttagaatactatgaaaggtt 5974386  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||| ||||| |||| |||    
T  5974387 cattaactaaaatttaaaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggatgta 5974485  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  5974486 gaaatcaaatttt 5974498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30661096 - 30660884
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30661096 aattttagtccctgttacaacaaattttgtttaattatacttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 30660997  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaatt-ttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||| |||| ||    
T  30660996 catttactaaaatttagaattttttaacataaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaac-aaaatctggatgt 30660898  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  30660897 agaaatcaaatttt 30660884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12482072 - 12481860
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12482072 aattttagtccctattacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggtt 12481973  T
Q  295 catttactaaaatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||| || |||| |||||  ||||||    
T  12481972 catttgctaaaatttagaatttttttaacataaaataaattaaatataaatattttaaaacgaaagaagttaaagataaaattaac-aaaatcaggacgt 12481874  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  12481873 agaaatcaaatttt 12481860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20977680 - 20977468
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20977680 aattttagtccctgctaaagcaaagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatattttttagacaagtttagaacactatgaaaggtt 20977581  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag-atataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    |||||||||| || || ||   ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||| || |||| ||||| |||||||    
T  20977580 catttactaatatttaaaaaaatttaacatgaaaagaattaaatgtgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataac-aaaatctggacgt 20977482  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  20977481 agaaatcaaatttt 20977468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 217 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30493004 - 30492823
Alignment:
Q  217 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30493004 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaagggttcatttactaaaatttataattt 30492905  T
Q  317 tttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaat 399  Q
    ||||||||||||  | |||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| || |||  ||||| |||||||||||||    
T  30492904 tttaacatgaaacgagttaaatataatttttttaaaatgaaaaaagttaaagata-aaataaacaaaatctggacgtagaaat 30492823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Original strand, 28476167 - 28476380
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaat----tttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaagg 292  Q
    ||||||||||| | | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||| ||||||| |||| | ||||  ||| ||||||||||||||    
T  28476167 ttttagtccctactacaacaaagtttgtttaattattcttaaattcttaaataaatttttgaacgatttttttgagacaaacttaaaacactatgaaagg 28476266  T
Q  293 ttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28476267 ttcatttactaaaatttagaatttattaacatgaaaagaattaaatataaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagtaac-aaaatatggacg 28476365  T
Q  393 tagaaatcaaatttt 407  Q
    | |||||||||||||    
T  28476366 ttgaaatcaaatttt 28476380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1821275 - 1821087
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1821275 aaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttataacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 1821176  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1821175 ttttaacattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagata-aaata--caaaatttggacgtagaaatcaaatttt 1821087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Original strand, 18502972 - 18503181
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18502972 ttttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttca 18503071  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
     ||| |||||| || | ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || |    
T  18503072 attaataaaatttaaatttttttaacctgaaacgaattacatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatata 18503170  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||    
T  18503171 aatcaaatttt 18503181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 198 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 939158 - 938950
Alignment:
Q  198 tttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcat 297  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  939158 tttagtctctgctgaaacaaagtttgtttaattatcctcaaactcctaaattttcgaacgatttttttgagacatgtttagaacactttgaaaggttcat 939059  T
Q  298 ttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaa 397  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||| | |||||||||||    
T  939058 ttactaaaatttaaatttttttaacatgaaatgaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttaaagataaaagcaac-aaagtctggacgtagaa 938960  T
Q  398 atcaaatttt 407  Q
     |||||||||    
T  938959 ttcaaatttt 938950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20977314 - 20977102
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20977314 aattttagtccctgctaaagcaaagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgattgttttaagacaagtttagaacactatgaaaggtt 20977215  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag-atataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||| |||| || || ||    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| || |||| ||||| | |||||    
T  20977214 cattttctaatatttaaaaacaattaacatgaaaagaagtaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataac-aaaatctagacgt 20977116  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  20977115 agaaatcaaatttt 20977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34046704 - 34046544
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34046704 aattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 34046605  T
Q  295 catttactaaaatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaac 354  Q
    || ||| |||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  34046604 caattaataaaatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttaaaaac 34046544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3375605 - 3375395
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| | ||     
T  3375605 ttttagtccctactgaaacaaagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattacaaaatgctcg 3375506  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
    | ||||||||| |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||| || |||||||    
T  3375505 tatactaaaatttggaattttttaacataaaatgaattaaatatgaatatttttaaacgacaaaagttcaagataaaattatcaaaaatctgaacgtaga 3375406  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    ||| |||||||    
T  3375405 aataaaatttt 3375395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 351
Target Start/End: Original strand, 20897789 - 20897947
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt-ctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  20897789 aattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattattttttagacaagtttaagacgctatgaaaggt 20897888  T
Q  294 tcatttactaaaatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaa 351  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20897889 tcatttactaaaatttagaatttttttaacatgaaacgaattaaacatgaattttttaa 20897947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Original strand, 21108087 - 21108257
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21108087 aaacttttaaatttttcaattatttttttgatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttataattatttagcatgaaataaattaa 21108186  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  21108187 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaatttt 21108257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20510783 - 20510585
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||           | | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20510783 ttttagtccctgttacaataaagtttgtttaattatctttaaaaccttaaatttttt-----------tgagacaaatttagaacactatgaaaggttca 20510695  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  20510694 ttaactaaaatttagaattttttaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtaga 20510596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 22731975 - 22732188
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttt-aacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| | |||| | |||||||||||||||| | | | ||    
T  22731975 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaaaattttgaacgaattttttaagacaagtttagaacactgtaatatgt 22732074  T
Q  294 tcatttactaaaatctataatttt-ttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    |||||||| ||||| || | |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||| | ||| ||    
T  22732075 tcatttaccaaaatttagattttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaatgttaaagataaaattaac-aaagtctggccg 22732173  T
Q  393 tagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||    
T  22732174 tagaaatcaaatttt 22732188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Original strand, 3914442 - 3914612
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  3914442 aaactcttaaatttttcaatgatttttttgacacaagtttagaacattacaaaaagttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattag 3914541  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||| || ||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  3914542 atatgaaattttttaaaagacaaaagttcaaaataaaactaacagaaatctagacgtagaaataaaatttt 3914612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Original strand, 33518409 - 33518545
Alignment:
Q  269 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  33518409 acaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt-aacctaaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaag 33518507  T
Q  369 atataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33518508 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 33518545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 364
Target Start/End: Original strand, 14256129 - 14256297
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| |  ||||  |   ||||||||||||||||    
T  14256129 aattttagtccataaaacaaaaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacaattttttgtg-acaaactcgaaacactatgaaaggtt 14256227  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 364  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14256228 catttactaaaatttagaatttattaacatgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagtt 14256297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2087661 - 2087543
Alignment:
Q  288 aaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatat 387  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||| |    
T  2087661 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgagccgaattaaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaattaac-aaaatct 2087563  T
Q  388 ggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2087562 ggacgtagaaatcaaatttt 2087543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 203 - 345
Target Start/End: Original strand, 24958869 - 24959012
Alignment:
Q  203 tccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttact 302  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||| || |||||||    
T  24958869 tccctgctaaaacaaattttgtttaattatctttaaactcttaaatttt-taacgattttttttagacaagtttgtaacactacgaaagatttatttact 24958967  T
Q  303 aaaatctataa--ttttttaacatgaaataaattaaatatgaatt 345  Q
    ||||| || ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24958968 aaaatttagaattttttttaacctgaaatgaattaaatatgaatt 24959012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 289280 - 289103
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 328  Q
    |||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||  || || || |||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  289280 tatccttaaactctaaaaaatttcaatgatttttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcgtttgataaaatttagaattttttaatatgaaa 289181  T
Q  329 taaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  289180 taaattaaatatggattttttaata-gacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaatttt 289103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 342
Target Start/End: Original strand, 30353125 - 30353252
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctata--a 313  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |       
T  30353125 aaagtttatttaattatctttaaacacttaaatttttgaacgatt-tttttagacaagtttagaacattatgaaaggttcacttactaaaatttagagtt 30353223  T
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatga 342  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30353224 ttttttaacatgaaacgaattaaatatga 30353252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Original strand, 289455 - 289549
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaac-aaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  289455 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaaatctggacgtagaaataaaatttt 289549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 364
Target Start/End: Original strand, 11400122 - 11400215
Alignment:
Q  271 aagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 364  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11400122 aagtttagaacactataaaacattcatttactaaaattaacaattttctaacatgaaactaattaaatataaattttttaaaacgccaaaagtt 11400215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 181
Target Start/End: Original strand, 18502903 - 18502984
Alignment:
Q  103 gaataattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttt--tagtagg-ttttttagtccctac 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  18502903 gaataattattagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttatagtaggattttttagtccctac 18502984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3913981 - 3913929
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaaca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3913981 tatccttaaactcttaaatttttcaacgattttttttatacaagtttagaaca 3913929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 30916772 - 30916894
Alignment:
Q  288 aaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatat---aagtaacaaaaa 384  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| | || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  30916772 aaaggttcatttattaaaatttaaaattttataacataagatgaattaaatataaatttttttaaacgaaaaaagttaaagatatatgaagtaacaaaaa 30916871  T
Q  385 tatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    | | ||| || |||| |||||||    
T  30916872 tcttgacataaaaattaaatttt 30916894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Original strand, 19693152 - 19693250
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  19693152 tataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 19693250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Original strand, 8235179 - 8235365
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || | ||  || | | |||||||| | ||| |||  |||||||||||| || |||||| | ||    
T  8235179 tttgtttaattaaccttacactctttaatttttgaatgaattttcgtaaaaatgtttagaagattataaaaatttcatttactaatatttataatctctt 8235278  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    || |||| || ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||  |||||  | || |||||||||||||||    
T  8235279 aatatgacatgaattaaacatgaatttttt-aaacatcaaaagttcaagataaaagtaaacaaaatcagaacatagaaatcaaatttt 8235365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 12783443 - 12783538
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  12783443 aattttttaacatgtaatgaattaaatataacttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 12783538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13400371 - 13400276
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  13400371 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 13400276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15054001 - 15053906
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  15054001 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 15053906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16270382 - 16270287
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  16270382 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 16270287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 282
Target Start/End: Original strand, 16736630 - 16736716
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaaca 282  Q
    |||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | | ||||||||||||    
T  16736630 aattttaggccctgttaaaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac-atttttttaagataagtttagaaca 16736716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2857540 - 2857445
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| | ||| || |||| |||||||    
T  2857540 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaaatttt 2857445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 15053788 - 15053886
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  15053788 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaatattaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 15053886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22007374 - 22007276
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  22007374 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 22007276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 946072 - 945975
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| |||||||    
T  946072 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggtt 945975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 945859 - 945954
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||| |||| || |||||| || |||| ||||| | ||| || |||| |||||||    
T  945859 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttgttaaaacgaaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaaatttt 945954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 2857327 - 2857390
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  2857327 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 2857390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12783657 - 12783598
Alignment:
Q  196 attttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  12783657 attttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 12783598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 16270169 - 16270232
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16270169 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 16270232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33971631 - 33971568
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  33971631 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 33971568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35129393 - 35129330
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  35129393 ttttagtccctgtcaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 35129330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19693368 - 19693270
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  19693368 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaatttttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 19693270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Original strand, 22006825 - 22006859
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22006825 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 22006859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5359380 - 5359323
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaaga 369  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||    
T  5359380 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaatttaaga 5359323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5359829 - 5359772
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttta 254  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5359829 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaatttttta 5359772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15054338 - 15054301
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15054338 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 15054301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Original strand, 33971082 - 33971118
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33971082 aattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 33971118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 131)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 39562527 - 39562739
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39562527 aattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacaattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 39562626  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39562627 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataactaacaaaaatatggacgta 39562726  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  39562727 gaaatcaaatttt 39562739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 46295370 - 46295157
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46295370 aattttagtccctcctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 46295271  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgac-aaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46295270 catttactaaaatctataattttttaacattaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 46295171  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  46295170 agaaatcaaatttt 46295157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 50614870 - 50615273
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  50614870 aaaaatattcacgattttcactatcttatcaatgacttcttttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 50614968  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa-------aatttta 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |        |||||||    
T  50614969 tactagtcaaaaatatattttcttgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccctacaaaaaaaaaatattacttataatttta 50615068  T
Q  202 gtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttac 301  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50615069 gtccctactaaaacaaagtttgtttaattttccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaa 50615168  T
Q  302 taaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatca 401  Q
     ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||    
T  50615169 aaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatataaatca 50615267  T
Q  402 aatttt 407  Q
    ||||||    
T  50615268 aatttt 50615273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32943495 - 32943150
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  32943495 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagtttttttttggaataat 32943396  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-------aattttag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |        ||||||||    
T  32943395 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccatacaaaaaaaaaatattacttctaattttag 32943296  T
Q  203 tccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttact 302  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32943295 tccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagttttgaacactatgaaaggttcaattact 32943196  T
Q  303 aaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||| || |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  32943195 aaaatttagaattttttaatattaaaagaattaaatatgaattttt 32943150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37179448 - 37179047
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnna-gaataa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||    
T  37179448 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgattggttttgttgccgaattgatagtttctttttttgaataa 37179349  T
Q  109 ttactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa---aattttagtcc 205  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |    | |||||||      
T  37179348 ttattagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttcagtccctacaaaaaaaattaattctagttttagtta 37179249  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37179248 ctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaaattttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaa 37179149  T
Q  306 atctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaat 404  Q
    || || || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  37179148 atttagaatttttttaacatcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaatgtaa-taaaatctggacatataaatcaaat 37179050  T
Q  405 ttt 407  Q
    |||    
T  37179049 ttt 37179047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 117235 - 117636
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||          |||||||    
T  117235 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacatcttttgcattgtcaggcatgagaggttttgttatcgaattgatagtttttttttggaataat 117334  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||         |     ||||||||||    
T  117335 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttaggccctacaaaaaaaaattacttctaattttagtc 117434  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  117435 cctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataa 117534  T
Q  305 aatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaat 404  Q
    ||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  117535 aatttaaatttttttaacatgaaacgaattaaaaatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatataaatcaaat 117633  T
Q  405 ttt 407  Q
    |||    
T  117634 ttt 117636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 367
Target Start/End: Original strand, 45235132 - 45235494
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  45235132 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 45235230  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaaaatt------ttagt 203  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||      |||||    
T  45235231 tgctagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcgtaactagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaaaattacttctaaatttagt 45235330  T
Q  204 ccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttacta 303  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | || | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45235331 ccatgctaaaacaaagtttgtttaattatccataaactcttaaattttttaacggttttattgagacaagtttagaacactttgaaaggttcaattacta 45235430  T
Q  304 aaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaa 367  Q
    |||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  45235431 aaatttagaatattttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaattttaa 45235494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 44557367 - 44557768
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          |||||||    
T  44557367 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcgggcatgagtagttttgttgccgaattgatagtttttttg--gaataat 44557464  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnn------aaaattttag 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||               | |||||| |    
T  44557465 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcattactagttttagtaggtttttttagtccctgcaaaaaaaaaaattacttataattttcg 44557564  T
Q  203 tccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttact 302  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  44557565 tccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaatctcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaat 44557664  T
Q  303 aaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaa 402  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  44557665 aaaatttaattttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatataaatcaa 44557763  T
Q  403 atttt 407  Q
    |||||    
T  44557764 atttt 44557768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 40762578 - 40762789
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||| ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  40762578 aattttaatccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgattttttttaaacaagtttagaacactatgaaagatt 40762677  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||| ||||| | ||||||    
T  40762678 caattactaaaatctagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagatgaaattaac-aaaatcttgacgta 40762776  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  40762777 gaaatcaaatttt 40762789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 45419763 - 45419974
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45419763 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacattatgaaaggtt 45419862  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| || |||| ||||| ||||||||    
T  45419863 catttactaaaatttagaattttttaacattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaatataaaattaac-aaaatctggacgta 45419961  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  45419962 gaaatcaaatttt 45419974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29348589 - 29348379
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  29348589 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatatttaaactcttaaatttttgaacgatt-tttttagacaaatttataacactatgaaaggtt 29348491  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  29348490 catttactaaaatttagaattttttaacataaaacgaactaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgta 29348392  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  29348391 aaaatcaaatttt 29348379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 23883389 - 23883579
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  23883389 aaagtttgtttaattattcttaaactcttaaattttagaacaattttttttagacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaatatttacaatt 23883488  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23883489 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 23883579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9018338 - 9018126
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    |||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||| | || |||||| |||||| ||||||||    
T  9018338 aattttagtctctgctaaaacaatatttgtttaattatacttaaactcttaaatttttgtgcgatttttttttacacgagtttataacactgtgaaaggt 9018239  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||    
T  9018238 tcatttacaaaaatttagaattttttaacatgaaataaattcaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata-aaataacaaaaatatggaagt 9018140  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    | ||||||||||||    
T  9018139 aaaaatcaaatttt 9018126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27492631 - 27492419
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  27492631 aattttagtccatgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcccaaatttttgaacgatatttttgagacaagtttagaacactatgaaatgtt 27492532  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat-ataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    |||||| |||||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||| ||    
T  27492531 catttattaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaaagtaac-aaaatttggatgt 27492433  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  27492432 agaaatcaaatttt 27492419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 45406979 - 45406768
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | | | ||||||||||||||||||||||||    
T  45406979 aattttagtccatgctaaaacaaa-tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttataagaaaagtttagaacactatgaaaggtt 45406881  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaaga-tataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||| |||| ||    
T  45406880 catttactaaaatttagaattttctaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagattaaaagtaac-aaaatctggatgt 45406782  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    | ||||||||||||    
T  45406781 aaaaatcaaatttt 45406768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 44808838 - 44809029
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataat 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  44808838 aaagtttgttcaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaggtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaat 44808937  T
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  44808938 tttttaacataaaatgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaattttgacgtaaaaatcaaatttt 44809029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25250306 - 25250122
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25250306 tttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 25250207  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25250206 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaata-aaata--caaaatttggacgtagaaatcaaatttt 25250122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38174219 - 38174008
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38174219 aattttagtccctgttataacaaagtttatttaattatctttaaactcttaaattattgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaaaggtt 38174120  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||| ||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| || |||| ||||| | ||||||    
T  38174119 catatactaaaatttaaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctagacgta 38174021  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  38174020 gaaatcaaatttt 38174008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 53517783 - 53517973
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  53517783 aaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatt-tttttatgataagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaaa 53517881  T
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  53517882 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaaagacaaaagttaaagataaatttaac-aaattctggacgtagaaatcaaatttt 53517973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 365
Target Start/End: Original strand, 23921074 - 23921221
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||    
T  23921074 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatt-tttttagataagtttataacactatgaaaggctcattttctaaaatttagaatt 23921172  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttt 365  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23921173 ttttaacatgaaa-gaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttt 23921221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11045720 - 11045510
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||| | |  ||||||||    
T  11045720 aattttagtccctattacaatcaagtttgtt-aattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatagtgagaaaggtt 11045622  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  11045621 catttactaaaatttagaattttttaccataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaattaac-aaaatctggacgta 11045523  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  11045522 gaaatcaaatttt 11045510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32147485 - 32147311
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnna---gaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||             ||||    
T  32147485 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcg--catgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttttttggaat 32147388  T
Q  107 aattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32147387 aattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaatactataataactaattttagtaggttttttagtccctacaa 32147311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19601868 - 19601654
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactat--gaaagg 292  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| | ||||  ||||||  || ||||||||||||||  ||||||    
T  19601868 aattttagtcactgctgaaacaaagtttcttaaattatacttaaactcttaaaattttcatcgatcttttttaggcacgtttagaacactatatgaaagg 19601769  T
Q  293 ttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  19601768 ttcatttgctaaaatttagaattttttaacacgaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctggatg 19601669  T
Q  393 tagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||| |||||||    
T  19601668 tagaaattaaatttt 19601654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 195 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11294111 - 11293953
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11294111 aattttagtccctagtacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgacttcttttacacaagtttagaacactatgaaaagtt 11294012  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaa 353  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11294011 catttactaaaatttagaattttttaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaa 11293953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53397586 - 53397418
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          || || |    
T  53397586 aaaaatattcacaattttcattatcttattgatgatttctcttgcattgtcgggcatgagtgattttgttgccgaattgatagttttttttg-gagtagt 53397488  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccct 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53397487 tactagtcaaaaatattttttcatgatgaaaatgctatcataactagttttagtaggttttttagtccct 53397418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 243 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21749835 - 21749672
Alignment:
Q  243 ttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatga 342  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  21749835 ttaaatttttgaaccattttttttagacaagtttagaatactgtgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattaaaaatga 21749736  T
Q  343 attttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21749735 attttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaattaaatttt 21749672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25232944 - 25232761
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-----atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataa-ttttttaaca 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||     |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  25232944 tatccttaaactcttaaatttttcaacaatttttttttttatatacaagtttagaacattagaaaaggttcgtttactaaaatttagaaattttttaaca 25232845  T
Q  324 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  25232844 tgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcataaataaaatttt 25232761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32147271 - 32147102
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||    
T  32147271 aaactcttaaatttttgaacgattttttggagacaagtttagaacactatgaaatgttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaa 32147172  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  32147171 atatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataagagtaa-taaaatatggacatataaatcaaatttt 32147102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 53439798 - 53439626
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||          || || |    
T  53439798 aaaaatattcacaattttcattatcttattgatgacttctcttgcattgttggacatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gagtagt 53439700  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaa 183  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53439699 tattagttaaaaatatcttttcatgatgaaaatgctatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaa 53439626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 54268832 - 54269035
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||    |||||||||| | | ||| | |    
T  54268832 aattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatt----ttat----gtttagaacatt-tcaaaagat 54268922  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||| ||| ||||||||  ||||| ||    
T  54268923 catttcctaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatataaatttttttaaacgacaaaaaatcaagataaaagcaacaaaaaattggactta 54269022  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  54269023 gaaatcaaatttt 54269035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19670001 - 19669806
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatcta 310  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  19670001 aaaacaaaatttatttaattattcttgaactcttaaatttttgaacgatt-tttttagacaagtttagaacactatcaaaggttcaattactaaaattta 19669903  T
Q  311 taatttttt-aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
     |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  19669902 gaatttttttaacatgaaacgaattaaatacgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaatttt 19669806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 392
Target Start/End: Original strand, 33476210 - 33476364
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33476210 aaactcttaaatttttcaatgatt-tttttatacaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaa 33476308  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||    
T  33476309 atataaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaaaaaaaatctggacg 33476364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41927534 - 41927371
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaatta 335  Q
    ||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41927534 aaacttttaaatttttcaatgatttttttttatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactgaaatttagaattttttaacatgaaataaatta 41927435  T
Q  336 aatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaat 399  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41927434 aatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaat 41927371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 216 - 403
Target Start/End: Original strand, 44287767 - 44287953
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||| |  | | ||||||||||| ||||||| || ||||    
T  44287767 aaagtttgtttaattatccttaaattcataa-tttttgaacgatttttttgagtcaattttagaatatcacggaaggttcatttgctaaaatttagaatt 44287865  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaa 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  44287866 ttttaacatgaaatgaattaaatatgaatttttttaaacgacgaaggtttaagataaaagtaacaaaaaattggacgtagaattcaaa 44287953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31991342 - 31991172
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| | | |||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31991342 aaactcttaaatttttcaatgatttttttgacaaaagtttagaacattacaaaaggtttgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaa 31991243  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  31991242 ataagaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatttggacgcagaaataaaatttt 31991172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 52701436 - 52701266
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||    
T  52701436 aaactcttaaatttttcaatgatttttttgatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaa 52701337  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||| | |||| |||||||    
T  52701336 atatgaatttttttaaaggacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctagacgcataaataaaatttt 52701266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 34995848 - 34995661
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||  | |||  ||||||||| ||| ||||||    
T  34995848 aattttagtccctgctaaaactaaatttgtttaattatccttaaactattaaattttagaacgatttttttggaaacacttttagaacattataaaaggt 34995749  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaa 381  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| ||||    
T  34995748 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgagatgaattaaatatgattttttttaaatgacaaaatttcaagataaaagtcacaa 34995661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Original strand, 44556656 - 44556782
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44556656 aaactcttaaatttttcaatgatt-tttttatacaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaa 44556754  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtt 364  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44556755 atatgaatttttttaaaagacaaaagtt 44556782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 248 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 53397361 - 53397201
Alignment:
Q  248 ttttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt--aacatgaaataaattaaatatgaatt 345  Q
    ||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  53397361 tttttgaacgatttttttgagaaaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaaaacatgaaacaaattaaatatgaatt 53397262  T
Q  346 ttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  53397261 tttgaaaacgataaaagttaaagatagaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaatttt 53397201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23917637 - 23917434
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  23917637 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaaatttagaatactatgaaaggtt 23917538  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||| ||||     | |  |||||||||||||||  |||   ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| || |||| | ||| ||||||||    
T  23917537 cattaacta-----tttttttttttaacatgaaacgaat---ataggaatttcttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaac-acaatttggacgta 23917447  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  23917446 gaaatcaaatttt 23917434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 53439575 - 53439440
Alignment:
Q  247 attttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattt 346  Q
    |||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53439575 atttttgaacgatttttttgagaaaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaatt-tagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattt 53439477  T
Q  347 tttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    || ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  53439476 ttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaa 53439440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Original strand, 8575920 - 8576092
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaatta 335  Q
    ||||||||||| |||| || |||| ||||| | |||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  8575920 aaactcttaaacttttcaatgatttttttttacacaagtttagaacattacaagaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaatta 8576019  T
Q  336 aatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||  |||||| |||||||    
T  8576020 aatatgaattttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctagacacagaaataaaatttt 8576092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33475745 - 33475574
Alignment:
Q  236 taaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaatt 334  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||  || || || |||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  33475745 taaactcttaaatttttcaatgatttttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcgtttaataaatt-tagaattttttaatatgaaataaatt 33475647  T
Q  335 aaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  33475646 aaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaatttt 33475574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44556198 - 44556022
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| | | || || || |||| |||| | || |||||||||  |||||||    
T  44556198 tatccttaaactcttaaatttttcaatgattttttttaaacaagtttagaacattgtaaacggctcctttaataaatt-tagaattttttattatgaaat 44556100  T
Q  330 aaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||| || |||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  44556099 aaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaattaacaaaattctggacgcagaaataaaatttt 44556022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 407
Target Start/End: Original strand, 26268629 - 26268758
Alignment:
Q  276 tagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataag 375  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | | |  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  26268629 tagaacattatataaggttcatttactaaattttttttttttttaacataagatgaattaaatatgaattttttaa--cgacaaaagttcaagataaaag 26268726  T
Q  376 taacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26268727 taataaaaatatgggcgtagaaatcaaatttt 26268758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 407
Target Start/End: Original strand, 41927919 - 41928027
Alignment:
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  41927919 tttactaaaatttagaactttttaatatgaaataaattaaatatgaattttttaaa--gacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatttggacgcaga 41928016  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    ||| |||||||    
T  41928017 aataaaatttt 41928027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53377583 - 53377430
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||| | ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  53377583 aattttaatccttgctaaaa-aaagtttgttttattatcattaaacttttggatttatgaacgatttttttttagacaaatttagaacactctgaaaggt 53377485  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  53377484 tcatttactaaaatttagaattttctaacatggaacgaattaaatatgaattttt 53377430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8575466 - 8575373
Alignment:
Q  224 tttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttt 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  8575466 tttaactatccttaaactcttaaattttttaacgaattttttgatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaatttt 8575373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 250
Target Start/End: Original strand, 15771881 - 15771936
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattt 250  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15771881 aattctagtccctgctaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttatattt 15771936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34226122 - 34226027
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  34226122 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 34226027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 869455 - 869550
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  869455 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 869550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 3078383 - 3078478
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  3078383 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 3078478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10182323 - 10182228
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  10182323 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 10182228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28055349 - 28055254
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  28055349 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 28055254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28065774 - 28065679
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  28065774 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 28065679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30778849 - 30778754
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  30778849 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 30778754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 317
Target Start/End: Original strand, 31991819 - 31991905
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || ||  ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  31991819 tatccttaaactcttaaatttttcaacaatt-tttttatacaagtttagaccattacaaaaggatcgtttactaaaatttagaatttt 31991905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 36777878 - 36777973
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  36777878 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 36777973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 45454346 - 45454441
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  45454346 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 45454441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 50362402 - 50362497
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  50362402 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 50362497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 53328524 - 53328619
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  53328524 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 53328619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 55006248 - 55006153
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  55006248 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 55006153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 869668 - 869570
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  869668 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttatatacttgtttaaaacattataaaaggttc 869570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 407
Target Start/End: Original strand, 28260390 - 28260464
Alignment:
Q  333 ttaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  28260390 ttaaatatgaacttttttaaatgacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctagatgtagaaattaaatttt 28260464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1487044 - 1486949
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  1487044 aattttttaacatgtaatgaatcaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 1486949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 4994108 - 4994203
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  4994108 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatgtttttaaaacgccaaaaattaaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 4994203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15490852 - 15490757
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||  || |||| |||||||    
T  15490852 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaaatttt 15490757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 33391037 - 33391132
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||| ||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  33391037 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccaaaaatttgagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 33391132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40126981 - 40126886
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| | ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  40126981 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 40126886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 45344121 - 45344026
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||| || |||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  45344121 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttataacgccaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 45344026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 47198996 - 47199091
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||  || |||| |||||||    
T  47198996 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaaatttt 47199091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 49612288 - 49612383
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  49612288 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgctaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 49612383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 1486831 - 1486929
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  1486831 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 1486929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 10182110 - 10182208
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  10182110 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 10182208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 15490639 - 15490737
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  15490639 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 15490737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27973623 - 27973585
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaa 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27973623 ttttttaacataaaataaattaaatatgaattttttaaa 27973585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31269809 - 31269711
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  31269809 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 31269711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34442224 - 34442166
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaatt-ttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  34442224 ttttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttaaaacgtcaaaattttaagata 34442166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36778091 - 36777993
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  36778091 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 36777993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 55006035 - 55006133
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  55006035 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaatattaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 55006133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 23878609 - 23878705
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  23878609 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 23878705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 43127775 - 43127683
Alignment:
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  43127775 tttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 43127683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3078596 - 3078533
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  3078596 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 3078533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Original strand, 7576315 - 7576370
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  7576315 ttttagtccctgctaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaattttt 7576370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 12015266 - 12015329
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12015266 ttttagtacctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaactcctaaattttttaaagatt 12015329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 242
Target Start/End: Original strand, 13814059 - 13814106
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactc 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  13814059 aattttagtccctgctaaaataacgtttgcttaattatctttaaactc 13814106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15491274 - 15491123
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||| |||||| ||| | ||||   | | |  |||     
T  15491274 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaaagattttttatatacatgttcataacatcgtaagacattct 15491175  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||  ||||  | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15491174 tttataaaaaaatttagttttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 15491123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 356 - 407
Target Start/End: Original strand, 15772003 - 15772054
Alignment:
Q  356 acaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15772003 acaaaagttcaagataaaagaaacaaaaatttcgacgtagaaatcaaatttt 15772054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19006939 - 19006876
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19006939 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaaattttaaattttttaatgatt 19006876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 24342677 - 24342772
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| | ||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  24342677 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttgaaacgccgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 24342772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 25577964 - 25578027
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  25577964 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattattcttaaacttctaaattttttaaagatt 25578027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Original strand, 30664101 - 30664180
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||| |  ||||| || |||||| || |||||||||| |||||    
T  30664101 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaatcaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggac 30664180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 30786454 - 30786517
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  30786454 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaaattttaaattttttaatgatt 30786517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 32245826 - 32245747
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||| || |||| ||||| |||||    
T  32245826 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaatataaaactaacgaaaatttggac 32245747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34226572 - 34226517
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  34226572 ttttagtccctgctaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaattttt 34226517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 42367757 - 42367852
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || ||| |  |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  42367757 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaaaataaacctaacaaaaatttggacttaaaaataaaatttt 42367852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 43660421 - 43660480
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  43660421 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagata 43660480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 43729775 - 43729869
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || | |||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  43729775 aattttttaacatgtaatgaattaaatat-atttttttaaaacgccaaaaattcatgataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 43729869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48585966 - 48585871
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||| | || |||| |||||||    
T  48585966 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgggcctaaaaataaaatttt 48585871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48586415 - 48586352
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  48586415 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaattttttaaagatt 48586352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50133620 - 50133561
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  50133620 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagata 50133561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 50762493 - 50762556
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  50762493 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 50762556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 51324791 - 51324696
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| || |||||| || |||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  51324791 aattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaactacaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 51324696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 53328068 - 53328131
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  53328068 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaattttttaaagatt 53328131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 53947569 - 53947663
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||   ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  53947569 aattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaaacgcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 53947663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Original strand, 4993776 - 4993810
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4993776 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 4993810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8339887 - 8339789
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  8339887 ttttagttcctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 8339789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16644846 - 16644748
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  16644846 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaactttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 16644748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Original strand, 23878147 - 23878221
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttataca 271  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  23878147 ttttagtccctgctaaattaaaatttgcttaattatacttaaacttctaaatttttgaaagattttttatataca 23878221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 28055136 - 28055234
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  28055136 ttttagtctctgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 28055234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 28065561 - 28065659
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  28065561 ttttagtctctgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 28065659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29167090 - 29166992
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||||||   ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  29167090 ttttagtccctattaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 29166992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 247
Target Start/End: Original strand, 32970222 - 32970272
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaa 247  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32970222 ttttagtccctgttaaaattaaatttgtttaatcatccttaaactcttaaa 32970272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 34225909 - 34226007
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||||||   ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  34225909 ttttagtcccttttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 34226007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 47199209 - 47199151
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  47199209 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 47199151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 53629213 - 53629115
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  53629213 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 53629115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 53947782 - 53947724
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  53947782 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 53947724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33390917 - 33390864
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||    
T  33390917 ttttagtccctgcaaaattaaaatttgcttaattgtgcttaaacttttaaattt 33390864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 48586297 - 48586264
Alignment:
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48586297 tttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttt 48586264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 51368013 - 51368098
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaaca 282  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||  ||||| ||||| ||||    
T  51368013 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaaagattttttacatacatgtttataaca 51368098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53328726 - 53328669
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttta 254  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  53328726 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaatttttta 53328669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53520136 - 53520103
Alignment:
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53520136 tttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 53520103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Original strand, 53628663 - 53628700
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53628663 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 53628700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3173374 - 3173338
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3173374 aattttttaacaaaaaataaattaaatatgaattttt 3173338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 404
Target Start/End: Original strand, 16128542 - 16128634
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaat 404  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |  |||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| ||||    
T  16128542 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaat 16128634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23252090 - 23252034
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||    
T  23252090 ttttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttctaaaagccaaaattttaagat 23252034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28685482 - 28685442
Alignment:
Q  331 aattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  28685482 aattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagata 28685442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30786664 - 30786572
Alignment:
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  | ||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  30786664 tttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacatcgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 30786572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 37126883 - 37126979
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||| |||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  37126883 aattttttaacatgtaatgaatcaaatataattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 37126979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50362597 - 50362517
Alignment:
Q  215 taaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  50362597 taaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 50362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 55006585 - 55006549
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttt 347  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  55006585 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttt 55006549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 126)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31400537 - 31400325
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31400537 aattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaatattttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 31400438  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31400437 catttactaaaatctataattttttatcatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 31400338  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  31400337 gaaatcaaatttt 31400325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12000224 - 11999824
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||          |||||||    
T  12000224 aaaaatattctcgattttcactatcttatcaatgacttctcttgcattgtcgggtatgagtggttttgttgccaaattcatagtttttttttggaataat 12000125  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtcc 205  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |     |||||||||||    
T  12000124 tactagtaaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtagattttttagtccctacaaaaaaaaattacttctaattttagtcc 12000025  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12000024 ctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgattattttgagacatgtttagaacactatgaaatgttcaattactaaa 11999925  T
Q  306 atctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatt 405  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  11999924 atttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaaattaaagataaaagt-actaaaatctggacatataaatcaaatt 11999826  T
Q  406 tt 407  Q
    ||    
T  11999825 tt 11999824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 383
Target Start/End: Original strand, 33708730 - 33709111
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnag---aat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||              |||    
T  33708730 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgagttctcttgcattgtcggacatgagtggttttgttgccgaattggtagttttttttttttgaaat 33708829  T
Q  107 aattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aatttta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |     |||||||    
T  33708830 aattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaatactataataactagttttagtaggttttttagtccctaaaaaaaaagtattacttctaatttta 33708929  T
Q  202 gtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttac 301  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33708930 gtcccttctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattac 33709029  T
Q  302 taaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  33709030 taaaatttagaattttttaatatgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaa 33709111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 12368028 - 12368432
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  12368028 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtctggcatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 12368126  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa--------aatttt 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||        ||||||    
T  12368127 tattagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccctacaaaaaaaataaaattacttctaatttt 12368226  T
Q  201 agtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcattta 300  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12368227 agtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaatta 12368326  T
Q  301 ctaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatc 400  Q
     |||||| || |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  |||||||| || || |||||    
T  12368327 ataaaatttagaattttttaacatgaaacgtattaaatattaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatgaacatataaatc 12368425  T
Q  401 aaatttt 407  Q
    |||||||    
T  12368426 aaatttt 12368432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 30982171 - 30982571
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  30982171 aaaaaaattcacaattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattg-cgggcgtgggtggttttgttgccgaattgatagtttttttttggaataat 30982269  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aattttagtc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          |     ||| ||||||    
T  30982270 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactaattttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaaattacttcaaatattagtc 30982369  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30982370 cctgctaaaacaaagtttgtttaaatatccttaaaatcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcaattactaa 30982469  T
Q  305 aatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaat 404  Q
    ||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  30982470 aatttagaattttttaacatgaagcgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaat 30982568  T
Q  405 ttt 407  Q
    |||    
T  30982569 ttt 30982571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 378
Target Start/End: Original strand, 46596564 - 46596937
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||           |||||||    
T  46596564 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtccggcatgagtggtttggttgcctaattgatattttttttttggaataat 46596663  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aattttagtc 204  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||          |     ||||||||||    
T  46596664 tactaatcaaaaatatcttttcatgatgaaaatattatcataactaattttagtagattttttagtccctacaaaaaaaaaattacttctaattttagtc 46596763  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
      ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  46596764 tatgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacggttttttttagacaagtttagaacactgtgaaaggttcaattattaa 46596863  T
Q  305 aatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaa 378  Q
    ||| || | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  46596864 aatttagatttttttaacataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa 46596937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36248833 - 36248465
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgat-agnnnnnnnnnagaataa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||    
T  36248833 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcggatatgagtggttttgttgccgaattgattagtttttttttggaataa 36248734  T
Q  109 ttactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-------aatttta 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |        |||||||    
T  36248733 ttactagtcaaaaatatatgttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttt-agtccctacaaaaaaaaaaaattacttctaatttta 36248635  T
Q  202 gtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttac 301  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  36248634 gtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcaattaa 36248535  T
Q  302 taaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  36248534 taaaatttaaaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagata 36248465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Original strand, 37986534 - 37986869
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||          |||||||    
T  37986534 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgactttttttccattgtcaggcatgagtggttttgttgttgaattgatagttttttttg-gaataat 37986632  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa---aattttagtcc 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||         |    |||||||||||    
T  37986633 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcaaaactagttttagtaggtttttttagtccctacaaaaaaaaaatagtctaattttagtcc 37986732  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37986733 ctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaa 37986832  T
Q  306 atctataattttttaacatgaaataaattaaatatga 342  Q
    || || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  37986833 atttagaattgtttaacatgaaacgaattaaatatga 37986869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30719797 - 30719586
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30719797 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 30719698  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  30719697 catttactaaaatttagaattttttaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgta 30719599  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  30719598 gaaatcaaatttt 30719586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 52493842 - 52493634
Alignment:
Q  199 ttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcat 297  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52493842 ttagtccctcctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacactatgaaaggttcat 52493743  T
Q  298 ttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaa 397  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  52493742 ttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaa-taaaatctggaagtagaa 52493644  T
Q  398 atcaaatttt 407  Q
    ||||||||||    
T  52493643 atcaaatttt 52493634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 216 - 405
Target Start/End: Original strand, 46517171 - 46517359
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  46517171 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgatcgatttttttgggacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagactt 46517270  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatt 405  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46517271 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatt 46517359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19791534 - 19791345
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  19791534 aaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatt-tttttatgcaagtttataacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 19791436  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||| ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  19791435 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttataacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaattttggaggtagaaatcaaatttt 19791345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13501496 - 13501312
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13501496 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacact--gaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 13501399  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13501398 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 13501312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 26020377 - 26020588
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||  | || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26020377 aattttagtctctgttacaacaaagtttgtttaattatcattaaactcttgaatttttgaacgatttttttgtgacaagtttataacactatgaaaggtt 26020476  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| || |||||    
T  26020477 catttactaaaatttagaattttttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaatttaaagataaaattaac-aaaatctgaacgta 26020575  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  26020576 gaaatcaaatttt 26020588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Original strand, 36367814 - 36368056
Alignment:
Q  146 atcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaac 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  36367814 atcataactagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaaattacttctaattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatttttaaac 36367913  T
Q  241 tcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatat 340  Q
    || ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36367914 tcataaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtttaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatat 36368013  T
Q  341 gaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||| ||||    
T  36368014 gaatttttgaaaacgataaaatttaaagataaaagtaataaaa 36368056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Original strand, 51561350 - 51561536
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51561350 tttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 51561449  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| || |||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  51561450 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaaaata-aaataaacaaaatttgaacgtagaaatcaaatttt 51561536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 26805490 - 26805681
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctata-at 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||  |    
T  26805490 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactatttttttaagacaagtttagaacactaagaaatgttcatttaccaaaatttatattt 26805589  T
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  26805590 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctgaacgtaaaaatcaaatttt 26805681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 227 - 407
Target Start/End: Original strand, 7565189 - 7565369
Alignment:
Q  227 aattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatga 326  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7565189 aattatcttcaaactcttaacttttttaacgatttttatgagacaagtttagaacattacgaaaggtacatttactaaaatttagaattttttaacatga 7565288  T
Q  327 aataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7565289 aatgaatttaatatgaatttttttaaacgagaaaagttcaagataaaattaacaaaaatatggacatagaaatcaaatttt 7565369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35188485 - 35188279
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||     ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| || |||||| ||    
T  35188485 aattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaactgtccttaa-----taaattttttaacgatttttttgagacaagtttaaaactctctgaaagatt 35188391  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||    
T  35188390 catatactaaaatatagaattttttaacatgaaataaattaaatat-attttttttaaacaacaaaagtttaagataaaagtaacaaaaatataaatgta 35188292  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  35188291 gaaatcaaatttt 35188279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43505059 - 43504915
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  43505059 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactgttttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttggaatttttt 43504960  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 364  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43504959 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttagaacgacaaaagtt 43504915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21091366 - 21091179
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21091366 aattttagtccctgctaagacaatgtttgtttgattatcctcaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactgtgaaaggtt 21091267  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||||| ||||    
T  21091266 catttattaaaatttataattttttaacgcgaaatgaattaaatatgaat-ttttaaaacatcaaaagttaaagattaaagtaataaaa 21091179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29231612 - 29231368
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag-nnnnnnnnnagaataa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||           ||||||    
T  29231612 aaaaatattcactattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcggacatgagtgattttcttgccgaattgatagttttttttttggaataa 29231513  T
Q  109 ttactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtagg-ttttttagtccctacaa-nnnnnnnnnaaaattttagtccc 206  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||            ||||||||||||    
T  29231512 ttactagtaaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggcttttttagttcctacaattttttttttctaattttagtccc 29231413  T
Q  207 tgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttt 251  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29231412 tactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttt 29231368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 406
Target Start/End: Original strand, 12897111 - 12897280
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12897111 aaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactgaaatttagaattttttaacatgaaataaattaa 12897210  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattt 406  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  12897211 atatgattttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatttggacgcagaaataaaattt 12897280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35531103 - 35530892
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||    
T  35531103 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatt-ttttaagacaaatttagaacactatgaaatgtt 35531005  T
Q  295 catttactaaaatctata-attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||| ||||| || |  |||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||    
T  35531004 catttaccaaaatttagattttttttaacaagaaacgaattaaatataatttttttaaaatgataaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgt 35530906  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  35530905 agaaatcaaatttt 35530892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 10041218 - 10041429
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  10041218 aattttagtccctgttacattaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgatttttttaagaaaagtttagaacaccatgaaaggtt 10041317  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| || |||  ||||| || |||||    
T  10041318 catttaccaaaatttaaatttttttaacattatacgaattaaatataaattttctaaaacggcaaaagttaaagataaaattaa-taaaatctgaacgta 10041416  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| |||||||    
T  10041417 gaaattaaatttt 10041429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15054162 - 15053986
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag--nnnnnnnnnagaata 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            |||||    
T  15054162 aaaaatattcacgattttcactatcatattgatgatttcttttgcattgtcgggtatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttgttggaata 15054063  T
Q  108 attactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtagg-ttttttagtccctacaa 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15054062 attactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataattagttttagtaggtttttttagtccctacaa 15053986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 52881863 - 52881693
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  52881863 aaactcttaaatttttcaatgattttttttgtacaagtttagaacattacaaaatattcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaa 52881764  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  52881763 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgtcgaaataaaatttt 52881693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 31024034 - 31024246
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||| |||||||||| |||  ||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || |   | ||||||||||||||| ||||||||    
T  31024034 aattatagtccctgccaaac-aaattttgtataattatcctcaagctcttaacttttttaacgatttttatgggataagtttagaacactacgaaaggtt 31024132  T
Q  295 catttactaaaatctataatttt-ttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| || |    
T  31024133 catttactaaaatctaggatttttttaacatgaaatgtatttaatatgaatttttttaaacgaaaaaagttcaagataaaattaacaaaaatatgaacat 31024232  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  31024233 agaaatcaaatttt 31024246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 211 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2059645 - 2059487
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatcta 310  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2059645 aaaacaaaatttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatt-tttttagataagtttagaacattataaaaggttcatttactaaaattta 2059547  T
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2059546 gaatttgttaacatgaaacaaattaaatatgaatattttaaaacga-aaaagttaaagata 2059487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39682110 - 39681899
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39682110 ttttggtccctgctaaaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaagtttatgaacaatttttttaagacaagtttaaaacactatgaaaggttca 39682011  T
Q  297 tttactaaaatctataatttttt-aacatgaaataa-attaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  39682010 tttactaaaatttagaatttttttaacatgaaaacggattaaataggatttttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggatgta 39681912  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  39681911 gaaatcaaatttt 39681899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 237 - 392
Target Start/End: Original strand, 27551530 - 27551684
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  27551530 aaactcttaaatttttcaatgatt-tttttatacaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttttacatgaaataaattaa 27551628  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  27551629 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacg 27551684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 237 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 49767962 - 49767799
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaatta 335  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  49767962 aaactcttaaatttttcaataatttttttttatacaagtctagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaatta 49767863  T
Q  336 aatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaat 399  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  49767862 aatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaat 49767799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 407
Target Start/End: Original strand, 52882326 - 52882498
Alignment:
Q  234 cttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaat 333  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  52882326 cttaaactcttaaatttttcaaagattatttt-atacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaattaat 52882424  T
Q  334 taaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||    
T  52882425 taaatatgaatttttttaaaagacaaaatttcaaaataaaagtaacaaaaatctggaggcagaaataaaatttt 52882498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11397307 - 11397137
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||| | || |||| |||| |||||||||||||||    
T  11397307 aaactcttaaatttttcaatgatttttttgatacaagtgtagaacattacaaaaggttcgtttactaaattttagaattatttagcatgaaataaattaa 11397208  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11397207 atatgaatttttttaaaagacaaaagtgcaaaataaaagtaacaaaaatatggacgcagaaataaaatttt 11397137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 262 - 407
Target Start/End: Original strand, 47008692 - 47008835
Alignment:
Q  262 tttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47008692 tttttagacaagtttagaacactatgaaaggtttatttactaaaatttagaattttt-aacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 47008790  T
Q  362 gtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  47008791 gttaaagataaaattaac-aaaatgtggacgtagaaattaaatttt 47008835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 5430542 - 5430753
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || || | | ||||||||| |||| ||  |||| ||    
T  5430542 aattttagcccctgctaaaacaaattttgtttaattatccttaaacttgtaaatttttgaacggtttttctaagacaagtttataacattacaaaagatt 5430641  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| || | | || ||| |||||||| |||||||||    
T  5430642 catttactgaaatttagaattttttaacataaaatgaattaaatatg-atttttttaaacgataaaaattcatgttaaaagcaacaaaaaaatggacgta 5430740  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  5430741 gaaatcaaatttt 5430753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 237 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 25352229 - 25352061
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||    
T  25352229 aaactcttaaatttttcaatgatttttttgatacaagtttaaaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaa 25352130  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatt 405  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||    
T  25352129 atatgaatttttttaaaagacaaaagttgaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcataaataaaatt 25352061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Original strand, 12251382 - 12251558
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaat 329  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  12251382 tatctttaaactcttaaaattttcaatgatt-tttttatacaagtttataacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaatatgaaat 12251480  T
Q  330 aaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  12251481 aaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaatttt 12251558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28701192 - 28701061
Alignment:
Q  275 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataa 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28701192 ttagaacactatgagaggttcatttactaaaatttagaactttttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 28701093  T
Q  375 gtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
     |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28701092 ttaac-aaaatctggacgtggaaatcaaatttt 28701061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48410445 - 48410250
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatct 309  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||||||| || | ||  ||||||||  | |||||||| |    
T  48410445 aaaacaaagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttgaac-agtctttttgagacaagtttaaaaaattacaaaaggttcggtcactaaaattt 48410347  T
Q  310 ataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  48410346 agaattttttaacatgaaatggattaaatataatttttttaaaa-gacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctggacgtataaattaaatttt 48410250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 52010138 - 52009990
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||    
T  52010138 aaactcttaaatttttcaatgatttttttgatacaaatttagaacattgcaaaaggttcatttactaaaatttagaaatatttagcatgaaataaattaa 52010039  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  52010038 atatgaatttttttaaaagaaaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaat 52009990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15053936 - 15053733
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||        ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  15053936 aattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaa--------tttttgaacaaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggct 15053845  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    || | | |||||| || ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  15053844 caatcaataaaatttagaatgttttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacata 15053746  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  15053745 taaatcaaatttt 15053733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 33707347 - 33707560
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttt-aacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    || || |  | || | | ||||||||| |||| ||  |||| |    
T  33707347 aattttagtccatgttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactctaaaaaaaattgaaagtattttctgagacaagtttaaaacattacaaaagtt 33707446  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||||    
T  33707447 tcatttactaaaatttaaatttttttaatatgaaatgtattaaatataaattttttcaaacgataaaagttcaagataaaagcaacaaaaatttgaacgt 33707546  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  33707547 agaaatcaaatttt 33707560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Original strand, 49768421 - 49768598
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| ||  || || || |||| |||| | || |||||||||  ||||||    
T  49768421 tatccttaaactcttaaatttttcaatggtttttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcgtttaataaatt-tagaattttttattatgaaa 49768519  T
Q  329 taaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||| |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||    
T  49768520 taaattaaatatgaatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaataaaattctggacgtagaaataaaatttt 49768598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27551073 - 27550898
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||    ||||||| |||| | || |||||| ||| |||||||    
T  27551073 tatccttaaactcttaaatttttaaa-gattttttttatacaagtttagaacattacaaacaactcatttaataaatt-tagaattttctaatatgaaat 27550976  T
Q  330 aaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  27550975 aaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaatttt 27550898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40182148 - 40182066
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40182148 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatggcttctcttgcattgccgggcatgagcggttttgttgccaaattgatag 40182066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21794630 - 21794508
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||| | |||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| || ||||    
T  21794630 aaagtttgcttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgaattttttgagacaagtttagaatattaagaaaggttcattaactaaaatttagaatt 21794531  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaat 338  Q
    ||||| ||| |||  ||||||||    
T  21794530 ttttaccataaaacgaattaaat 21794508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 36362892 - 36362974
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag 92  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36362892 aaaaatattcacaattttcattatcttatcgatgacttctcttgcattgtcaagcatgagtggttttgttgtcgaattgatag 36362974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42972256 - 42972161
Alignment:
Q  224 tttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42972256 tttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttcggagacacttttagaagattataaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 42972161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4487030 - 4486935
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  4487030 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 4486935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17964208 - 17964113
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  17964208 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 17964113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 31861626 - 31861721
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  31861626 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatatggacctaaaaataaaatttt 31861721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36796129 - 36796034
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  36796129 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaagtaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 36796034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 407
Target Start/End: Original strand, 37710854 - 37710948
Alignment:
Q  313 attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| |||||    
T  37710854 attttttaacatgaaatgagttaaatatgaaatttttaaacttccaaaaatttaagataaaagtaataaaaatatggacctaaaaatcatatttt 37710948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4647278 - 4647183
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| || || || |||| |||||||    
T  4647278 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgcacctaaaaataaaatttt 4647183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 10383092 - 10383187
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  10383092 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 10383187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26507703 - 26507608
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  26507703 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 26507608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 34076061 - 34076156
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  34076061 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaaatttt 34076156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 47632656 - 47632751
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  47632656 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 47632751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 48624267 - 48624362
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  48624267 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 48624362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48723621 - 48723526
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  48723621 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaaatttt 48723526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Original strand, 2207594 - 2207692
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  2207594 tataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 2207692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Original strand, 35766913 - 35767123
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||| || |||| ||   ||||| ||| |||||| ||| | |   ||     
T  35766913 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttatatttttaaatgatttttaacatacatgttaagaacattataataatctct 35767012  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
    ||||  ||||  || |||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |    
T  35767013 tttataaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattacatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaa 35767112  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    ||| |||||||    
T  35767113 aataaaatttt 35767123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 407
Target Start/End: Original strand, 6216369 - 6216568
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatt---tactaaaat 307  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  | | || ||||| ||| ||  ||||||| | |   |||||||||    
T  6216369 aaaataaaatttatttaattatccttaaactattaaatttttgaacgattttttaaagaaaaatttagtacattacaaaaggtttagtaactactaaaat 6216468  T
Q  308 ctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
     || ||| ||||||||| |||| | |||||||| ||     | |||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6216469 ttagaatattttaacataaaatgagttaaatataaaaaaaattaaacaacaaaagttcaagataaaaacaacaaaaattcagacgtagaaatcaaatttt 6216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14007137 - 14007044
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  14007137 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 14007044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14411028 - 14410935
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||  || |||| |||||||    
T  14411028 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaattaaatttt 14410935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Original strand, 31266968 - 31267061
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  31266968 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccgaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 31267061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 4574078 - 4574172
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  4574078 aattttttaatatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 4574172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 10371586 - 10371681
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||  ||||| || ||| |||||| ||||| || |||| |||||||    
T  10371586 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcgagataaaactaagaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 10371681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14421366 - 14421271
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  14421366 aattttttaacatgtaaggaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 14421271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 15358344 - 15358439
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| | ||| || |||| |||||||    
T  15358344 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaattttgacctaaaaataaaatttt 15358439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 25136951 - 25137046
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  25136951 aattttttaacatataatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 25137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26451277 - 26451182
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  26451277 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 26451182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Original strand, 7586947 - 7587045
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  7586947 tataattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 7587045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 14410817 - 14410915
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  14410817 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 14410915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Original strand, 26911169 - 26911267
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| || || || |||||| ||  ||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  26911169 tataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccagaaattcaagataaaacaaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 26911267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Original strand, 29972443 - 29972652
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||||| ||||  || || | ||||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||| || ||| |||||||||| ||| | | |||      
T  29972443 ttttagtccctgctaaaaccaatttggattaattatccttaaacctttaaatttttgaatgattttttgtagacatgtttagaacattataagaagtttt 29972542  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
    ||||| | ||  |  ||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||  ||||||  ||||| ||||| |||     
T  29972543 tttaccacaactttgaattttttagcataagatgaattaaatatgaatgtttt-aaacgccaaaagttcaatatgaaagtaatgaaaatctggacctagt 29972641  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    |||||| ||||    
T  29972642 aatcaattttt 29972652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47632869 - 47632771
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  47632869 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 47632771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 370
Target Start/End: Original strand, 10371138 - 10371310
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||  ||||| ||| | ||||   | | |  |||     
T  10371138 ttttagtccctgtaaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaaagattttttacatacatgttcataacatcgtaagacattct 10371237  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat 370  Q
    ||||  ||||  | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  10371238 tttataaaaaaat-tatttttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttaaaagccaaaattttaagat 10371310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Original strand, 14743945 - 14744038
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||| | ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  14743945 ttttttaacatgtaatgaattaaatatagtttttttaaaatgccaaaaattgaagataaaactaacgaaaatttggacctagaaataaaatttt 14744038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28479969 - 28479783
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt-ttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||  | ||| |||||||| | ||| |||  |||| | |||||||| || | || |||    
T  28479969 tttgtttaattatccttaaactattaagtttttgaacgatattttggagacatgtttagaatattattaaaaattcaataactaaaatttaaatttcttt 28479870  T
Q  319 taacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||  | ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||  | ||| ||||||| || || |  ||||||||||||    
T  28479869 taacatgatgtgaattaaatatga--cttttaaaatgacaaaagttcaagatgaaggtagcaaaaatctgaacatgaaaatcaaatttt 28479783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Original strand, 802801 - 802841
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  802801 aaaataaagtttgtttgattatccttaaactctttaatttt 802841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26136267 - 26136191
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgga 390  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||    
T  26136267 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgga 26136191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 48468234 - 48468330
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaat-tttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  48468234 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattatttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacataaaaataaaatttt 48468330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48624481 - 48624413
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttt 265  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| ||||    
T  48624481 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttt 48624413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7603814 - 7603719
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||| ||  |||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  7603814 aattttttaacatataatgaattaaatataatttttttaaatcgctaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 7603719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10658833 - 10658734
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| |||||||||    
T  10658833 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtataattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttca 10658734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14007254 - 14007199
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14007254 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaactcctaaattttt 14007199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 14865684 - 14865747
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  14865684 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 14865747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27851368 - 27851305
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  27851368 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 27851305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34076274 - 34076211
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  34076274 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 34076211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 42972137 - 42972086
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagt 363  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  42972137 aattttttaacatgagatgaattaaatatgatttttcttaaacgacaaaagt 42972086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 45336541 - 45336446
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  45336541 aattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaacataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 45336446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 46667713 - 46667618
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||| || |||| ||||| | ||| || |||| |||||||    
T  46667713 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaaatttt 46667618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 52526938 - 52526859
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||| || |||| ||||| |||||    
T  52526938 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 52526859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 52760383 - 52760446
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  52760383 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 52760446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2207810 - 2207712
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  2207810 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaatttttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 2207712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 4057683 - 4057781
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  4057683 ttttagttcctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 4057781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 14006926 - 14007024
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  14006926 ttttagtctctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 14007024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15358557 - 15358459
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  15358557 ttttagtctctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 15358459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 17963995 - 17964093
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  17963995 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttgaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 17964093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20357174 - 20357120
Alignment:
Q  273 gtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaa 327  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  20357174 gtttagaacattataaaaggtttatttaataaaatttagaattttttaacatgaa 20357120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Original strand, 20562781 - 20562835
Alignment:
Q  273 gtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaa 327  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  20562781 gtttagaacattataaaaggtttatttaataaaatttagaattttttaacatgaa 20562835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25137164 - 25137066
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  25137164 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattaggtttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttagaacattataaaaggttc 25137066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 26507490 - 26507588
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  26507490 tttttgtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 26507588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32037480 - 32037382
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  32037480 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaatttttttaatgattttttaaatacttgtttaaaacattataaaaggttc 32037382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Original strand, 34075650 - 34075724
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttataca 271  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||| |||||    
T  34075650 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaaagatttttttcataca 34075724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35767241 - 35767143
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  35767241 ttttagtccatgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 35767143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36449715 - 36449617
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||||||||||   ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  36449715 ttttagtcccttttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 36449617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36796461 - 36796427
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36796461 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 36796427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 350
Target Start/End: Original strand, 46947174 - 46947212
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttta 350  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46947174 aattttttaacaaaaaataaattaaatatgaatttttta 46947212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 391
Target Start/End: Original strand, 48609848 - 48609928
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| |||||    
T  48609848 tataattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttt-aaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 48609928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 48723408 - 48723506
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  48723408 ttttattccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 48723506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 295
Target Start/End: Original strand, 52526728 - 52526822
Alignment:
Q  201 agtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  52526728 agtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttagatacttgtttaaaacattataaaaggttc 52526822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 52760595 - 52760518
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgga 390  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||    
T  52760595 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacg-caaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgga 52760518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Original strand, 10372765 - 10372858
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||| | ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  10372765 ttttttaacatgtaatgaattaaatatagtttttttaaaatgccaaaaattgaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 10372858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14744156 - 14744059
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| |||||||    
T  14744156 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaatattttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggtt 14744059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Original strand, 802668 - 802708
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttt 251  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  802668 aaaacaaagtttgttttattatccttaaactctttaatttt 802708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 348
Target Start/End: Original strand, 12255799 - 12255855
Alignment:
Q  292 gttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||||    
T  12255799 gttcatttattaaaatttataagtttttaacatgcgatgaattaaatatgaactttt 12255855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Original strand, 14743492 - 14743548
Alignment:
Q  196 attttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  14743492 attttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaattttt 14743548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Original strand, 15926610 - 15926678
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttt 265  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||||    
T  15926610 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaaagattttttt 15926678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31267161 - 31267081
Alignment:
Q  215 taaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  31267161 taaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 31267081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Original strand, 34075767 - 34075823
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||    
T  34075767 ttttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttctaaaagccaaaattttaagat 34075823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Original strand, 36362993 - 36363037
Alignment:
Q  109 ttactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataac 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  36362993 ttactagtcaaaaatatcttttcgtgatgaaaatactatcataac 36363037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45583774 - 45583714
Alignment:
Q  200 tagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  45583774 tagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 45583714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46634844 - 46634808
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46634844 aattttttaacataacataaattaaatatgaattttt 46634808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 3870 - 4082
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3870 aattatagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 3969  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3970 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgaacgta 4069  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  4070 gaaatcaaatttt 4082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 141)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 211 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44289979 - 44289783
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatcta 310  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289979 aaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatcta 44289880  T
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289879 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 44289783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 383
Target Start/End: Original strand, 33689086 - 33689459
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  33689086 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagtttttttg--gaataat 33689183  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa--aattttagtccct 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||             ||||||| |||||    
T  33689184 tactagtcaaaaatatcttttcatggtgaaaatactatcataactagctttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaatacttctaattttaatccct 33689283  T
Q  208 gcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaat 307  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33689284 gctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaattcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagagcactatgaaaggttcaattactaaaat 33689383  T
Q  308 ctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  33689384 ttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaa 33689459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25422568 - 25422173
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  25422568 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgtctttttttgcattgtctggcatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 25422470  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaaaatttt-agtccctg 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||            ||||| ||||||||    
T  25422469 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccctaaaaaaatttacttttatttttagtccctg 25422370  T
Q  209 caaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatc 308  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  25422369 ctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactatcaaaggttcaattactaaaatt 25422270  T
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||    
T  25422269 tagaattttttaacataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaatgttaaagataaaagta--aaaaatctggacatataaatcaaatttt 25422173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48082761 - 48082549
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48082761 aattttagtctctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaacggtt 48082662  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48082661 catttacaaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttataaaacgacaaaagtttaagatataaataacaaaaatatggacgta 48082562  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  48082561 gaaatcaaatttt 48082549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10322201 - 10321801
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||    
T  10322201 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggtatgagtggttttgttgctgaattgatagtttttttt-agaataat 10322103  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aattttagtc 204  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |     ||||||||||    
T  10322102 taatagtcaaaaatatctttacatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaaaattacttctaattttagtc 10322003  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10322002 cctgctaaaaaaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgacacaagtttagaacactgtgaaaggttcaattactaa 10321903  T
Q  305 aatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaat 404  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  10321902 aatttagaatattttatcatgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaat 10321804  T
Q  405 ttt 407  Q
    |||    
T  10321803 ttt 10321801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 53571334 - 53571731
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  53571334 aaaaatattcacgattttcaccatcttatcaatgacttcttttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 53571432  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa-aattttagtccct 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||            |||||||||||||    
T  53571433 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttaatccctacaaaaaaaaacttctaattttagtccct 53571532  T
Q  208 gcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaat 307  Q
     | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  53571533 actaaaacaaagtttgtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaat 53571632  T
Q  308 ctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| |||||| ||||||  |||||||| || || ||||||||||||    
T  53571633 ttagaattttttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatgtacatataaatcaaatttt 53571731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31317046 - 31316646
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  31317046 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatcacttctcttgcattgtcgggcacgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 31316948  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||         |     ||||||||||    
T  31316947 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccttacaaaaaaaaattacttctaattttagtc 31316848  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31316847 c-tgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaa 31316749  T
Q  305 aatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaa 403  Q
    ||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| || |||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  31316748 aatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataa-taaaatttggacatataaatcaaa 31316650  T
Q  404 tttt 407  Q
    ||||    
T  31316649 tttt 31316646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11670597 - 11670212
Alignment:
Q  18 tcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataattactagtc 117  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||    
T  11670597 tcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcagacatgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataattactagtc 11670499  T
Q  118 aaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aattttagtccctgcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||          |     ||||||||||||| | ||    
T  11670498 aaaaatatattttcatgatgaaat-------ataactaattttagtagtttttttagtccctacaaagacaaaattacttctaattttagtccctactaa 11670406  T
Q  213 aataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctata 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || |    
T  11670405 aacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactacgaaaggttcaattaataaaatttaga 11670306  T
Q  313 attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  11670305 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatataaatcaaatttt 11670212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 363
Target Start/End: Original strand, 44209289 - 44209641
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||          |||||||    
T  44209289 aaaaatattcacgatttttactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggctttgttgccgaatttatagttttttttt-gaataat 44209387  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-aattttagtccctg 208  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||            ||||||||||| ||    
T  44209388 taccagtcaaaaatatcttttcatgattaaaatactatcatatctagttttagtaggttttt-agtccctaaaaaaaaaaaaatctaattttagtccttg 44209486  T
Q  209 caaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatc 308  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  44209487 cgaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaagattcaattactaaaatt 44209586  T
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagt 363  Q
    || ||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  44209587 tagaatcttttaacacgaaaagaattaaatatgtatttttgaaaaggataaaagt 44209641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 53324092 - 53323881
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  53324092 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 53323993  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  53323992 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgta 53323894  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  53323893 gaaatcaaatttt 53323881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 195 - 393
Target Start/End: Original strand, 53423541 - 53423740
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  53423541 aattttagtctctgctaaaataaagtttgtttaactatccttaaactcttaaattttttaacaattcttttaagacaagtttagaacactatgaaaggtt 53423640  T
Q  295 catttactaaaatctataa--ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53423641 catttactaaaatttagaattttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttatagataaaagtaac-aaaatatggacg 53423739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1870422 - 1870212
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  1870422 aattttagtccctgctaaaataaagtttgtttaactatccttaaactattaaatttttgaacgatt-ttttaagacaagtttagaacactataaaatgtt 1870324  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1870323 catttactaaaatttagaattttttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaac-aaaatatggacgta 1870225  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  1870224 taaatcaaatttt 1870212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19523004 - 19522818
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19523004 tttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 19522905  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19522904 aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 19522818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 199 - 407
Target Start/End: Original strand, 30331260 - 30331467
Alignment:
Q  199 ttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatt 298  Q
    ||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30331260 ttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaaaggttcatt 30331359  T
Q  299 tactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaa 398  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  30331360 tactaaaatttagaattttttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaa 30331458  T
Q  399 tcaaatttt 407  Q
    |||||||||    
T  30331459 tcaaatttt 30331467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 33177399 - 33177610
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||    
T  33177399 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactatgaaaagtt 33177498  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  33177499 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaacgttaaagataaaattaac-aaaatctggacgta 33177597  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  33177598 gaaatcaaatttt 33177610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Original strand, 3873155 - 3873341
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3873155 tttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 3873254  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  3873255 aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaac-aaaacctgtacgtagaaatcaaatttt 3873341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 47309730 - 47309540
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  47309730 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactgtgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 47309631  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  47309630 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatcttgacgtataaatcaaatttt 47309540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Original strand, 28448369 - 28448557
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28448369 aattttagtccctcttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 28448468  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  28448469 catttactaaaatttacaattttttaacatgaaacaaattgaatatgaatttttcaaaacgacaaaacttaaagataaaattaacaaaa 28448557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22068415 - 22068226
Alignment:
Q  194 aaattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||    
T  22068415 aaattttagtcccttttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagatatgtttagaacactatgaaaggt 22068316  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    |||||| ||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||    
T  22068315 tcattttctaaaatttagatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagattaaattaacaaaa 22068226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 47379156 - 47379366
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| | ||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  47379156 aattttagtccatgctaatacgaagtttgtttaattatacttaaactctaaa--ttttgagcgaatattttgagacaagtttagaatactatgaaaggtt 47379253  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47379254 catttactaaaatttagaatttttaaaaatgaaatgaattaaatatgtattttttaaaatgacaaaacgtcaagataaaagtaacaaaaatatggacgta 47379353  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  47379354 gaaatcaaatttt 47379366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Original strand, 23473456 - 23473643
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||||    
T  23473456 aattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatcggtaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactgtgaaaggtt 23473555  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  23473556 ca-ttactaaaatttaaaattttttaacatgaaacaaattaaatatgagtttttaaatacgtcaaaaattaaagatataagtaataaaa 23473643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 47463662 - 47463470
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaaca---ctatgaaaggttcatttactaaaatctata 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  47463662 aaagtttgtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgatt-ttttgagacaagtttagaacaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaat 47463564  T
Q  313 attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47463563 tttttttaacattaaacaaattaaatatgaattttttaaaacagtaaaaattaaagataaaattaac-aaaatatggacgtagaaatcaaatttt 47463470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7491010 - 7490802
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttt-aacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7491010 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaaatttttgaacaactttttttagacaagtttagaacactataaaaggt 7490911  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||| |||||||| | || | |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||    
T  7490910 tcaattactaaagtttagatttttttaagatgaaacgaattaaatatgaatattttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgt 7490812  T
Q  394 agaaatcaaa 403  Q
    ||||||||||    
T  7490811 agaaatcaaa 7490802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Original strand, 51395590 - 51395778
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  | ||    
T  51395590 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagttta-aacactatgagtgatt 51395688  T
Q  295 catttactaaaatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  51395689 catttactaaaatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatatttcaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaa 51395778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4850411 - 4850200
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | || | |||  ||||||||| |||||||| ||    
T  4850411 aattttagttcttgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttgaatttttgaacgattttattgagacacatttagaacaatatgaaagatt 4850312  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||| ||| || || ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| | | ||||||    
T  4850311 catttagtaatatttagaatttttcaacatgaaacgaatttaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaataacaaaact-tagacgta 4850213  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  4850212 gaaatcaaatttt 4850200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 55938384 - 55938174
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||| |    
T  55938384 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgaaataagtttagaacactacgaaagg-t 55938286  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    | ||||||| ||| || ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |||| ||||| || |||||    
T  55938285 cgtttactagaatttagaattttttaacataaaacgaattaaatctgaattttttaaaacaacaaatgttaaagataaaattaac-aaaatctgcacgta 55938187  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  55938186 gaaatcaaatttt 55938174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44452360 - 44452190
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    ||||||||||| |||| || || | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44452360 aaactcttaaaattttcaatgaatttttttatacaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaa 44452261  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  44452260 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaatttt 44452190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 42972733 - 42972923
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||   | | ||    
T  42972733 aaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacgagtttagaatactatgaaaggttcattta-tcaaaaaaaaattt 42972831  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42972832 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttgttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 42972923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 48219866 - 48220076
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| || ||||||||||| |||| ||||||  ||||||  || |||||||||| |||||||||||    
T  48219866 aattttagtccctgctaaaacaaagtttcttaaattatact-aaactcttaaaattttcaacgatcttttttaagcacgtttagaacattatgaaaggtt 48219964  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||  |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  48219965 catttgttaaaatttagaattttttaacaagaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaa-ttcaatataaaagtaacaaaaatttggatgta 48220063  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| |||||||    
T  48220064 gaaattaaatttt 48220076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13604099 - 13603938
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatt-ttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  13604099 aattttaatccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttaatgatattttttagacaagtttataacattataaaaggt 13604000  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacga 356  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13603999 tcatttactaaaattcataa-tttttaacttgaaataaattaaatatgaattcttttaaacga 13603938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Original strand, 34513038 - 34513207
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||    
T  34513038 aaactcttaaatttttcattgattttttttatacaagtttagaacattacaagaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaa 34513137  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  34513138 atatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa-ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaatttt 34513207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10085801 - 10085614
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   |||| |||||||||||||||||  ||    
T  10085801 aattttagtccctgctaaaacaatttttttttaattatccttaaactcttaaatttttgaacggtttttttgtgacaaatttagaacactatgaaatctt 10085702  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat-ataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  10085701 catttactaaaatttagaa-tttttaacatgaaacaaattaaat-taaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaacaaaa 10085614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 405
Target Start/End: Original strand, 28163745 - 28163913
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |    
T  28163745 aaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattta 28163844  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatt 405  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||||    
T  28163845 atatgaatttttttaaaagacaaaagttgaaaataaaagtaacaaaaatctggaagcagaaataaaatt 28163913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 52947738 - 52947951
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttt-tatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||  | |||  ||||||||| ||| ||| ||    
T  52947738 aattttagtccctgctaaaattaaatttatttaattatccttaaactgttaaattttagaacgatttttttggagacacttttagaacattataaaaagt 52947837  T
Q  294 tcatttactaaaatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| |||| |||||| | ||| ||    
T  52947838 tcatttactaaaatttagaatttttttaacatgagataaattaaatatgaatttttt-aaatgacaaaatttcaagataaaagtcacaaaagtttggtcg 52947936  T
Q  393 tagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||| ||||    
T  52947937 tagaaatcaattttt 52947951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 216 - 328
Target Start/End: Original strand, 7617417 - 7617529
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7617417 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 7617516  T
Q  316 ttttaacatgaaa 328  Q
    |||||||||||||    
T  7617517 ttttaacatgaaa 7617529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 224 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 43938291 - 43938131
Alignment:
Q  224 tttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataa-ttttttaac 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  43938291 tttaattatcctttaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagcttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaac 43938192  T
Q  323 atgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||  |||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||| | || ||||||||    
T  43938191 atgaaacgaattaaatatgaaaattttaaaacgaaaatagttcaagaaaaaattaacaaaa 43938131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Original strand, 3862466 - 3862600
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | |||||||||    
T  3862466 aattttagtccctgttacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaaggt 3862565  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3862566 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaa 3862600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Original strand, 3871223 - 3871357
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | |||||||||    
T  3871223 aattttagtccctgttacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaaggt 3871322  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 328  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3871323 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaa 3871357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 385
Target Start/End: Original strand, 20650482 - 20650672
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| | ||   |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  20650482 aattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatctttaaaatcttaaaagttttagcgattttcttgggacaagtttggaacatcacgaaagatt 20650581  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  20650582 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattattttaatagacaaaagttcaagataaaagtaacgaaaat 20650672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 407
Target Start/End: Original strand, 20177933 - 20178064
Alignment:
Q  274 tttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatata 373  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  20177933 tttagaacaatatggaaggttcatttactaaaattta-aattttttaacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 20178031  T
Q  374 agtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20178032 agtaac-aaaatctggacgtataaatcaaatttt 20178064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 510807 - 510937
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  510807 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatggcttctcttgcattgccgggcatgagcggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 510905  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaa 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  510906 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaa 510937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18087130 - 18087000
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  18087130 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatggcttctcttgcattgccgggcatgagcggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 18087032  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaa 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18087031 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaa 18087000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 159
Target Start/End: Original strand, 35060724 - 35060874
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatag-nnnnnnnnnagaataa 108  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||           ||||||    
T  35060724 aaaaacatttacgattttcgctatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgggtggttttgttgccgaactgatagttttttttttggaataa 35060823  T
Q  109 ttactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttt 159  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35060824 ttattagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttt 35060874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38499603 - 38499393
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    |||||||||||   |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||| || | ||  ||||||||     
T  38499603 ttttagtccctattaaaacaaagtttctctaattatccttaaactattaaatcttaaaacgattttttttaaacaagtttataatattacaaaaggttcg 38499504  T
Q  297 tttactaaaatctata-attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtag 395  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  38499503 tttactaaaatttaaattttttttaacatgaaatgaattaaatatgaatatttttaaaagacatgagttcaagataaaagtaa-aaaaatctggacatag 38499405  T
Q  396 aaatcaaatttt 407  Q
    |||| |||||||    
T  38499404 aaataaaatttt 38499393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 51876302 - 51876113
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatct--ataatttt 317  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||| |  | || |||    
T  51876302 tttgattaattattcttaaactcttaaacttttgaacgaatttttttagacaagtttataacaatgtgaaatgttcatttattaaaatttagacaagttt 51876203  T
Q  318 ttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt-taagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  51876202 ttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaaatttt 51876113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 407
Target Start/End: Original strand, 38114273 - 38114401
Alignment:
Q  278 gaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagta 377  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||    
T  38114273 gaacgctaggaaatgttcatttactaaaatttaaaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaatta 38114372  T
Q  378 acaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  38114373 ac-aaaatctggacatataaatcaaatttt 38114401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 55283424 - 55283213
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| |  |||||  || ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| ||   | ||| |||||||||| ||| ||| |||    
T  55283424 aattttagtccttctaaaaactaaatttgtttaattattcttgaattcttaaatttttgaacgatttttaggagacatgtttagaacattataaaatgtt 55283325  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||| ||||||  || | |||||||| | || |  | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| || |||||    
T  55283324 catttgctaaaaaatagatttttttaataggagaagatttaaatatgatttttttaaa-cgacaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctgaacgta 55283226  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  55283225 gaaatcaaatttt 55283213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 398
Target Start/End: Original strand, 44452819 - 44452986
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 328  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||  | || |||| |||| | || |||||||||| ||||||    
T  44452819 tatccttaaactcttaaaattttcaatgatttttttttatacaagtttagaacattacaaacagctcgtttaataaatt-tagaattttttaatatgaaa 44452917  T
Q  329 taaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| | |||||| |||||    
T  44452918 taaattaaatatgaattttttaata-gacaaaagttcaaaataaaagtagcaaaattctggacgcagaaa 44452986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 383
Target Start/End: Original strand, 35060878 - 35060992
Alignment:
Q  269 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 368  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||     
T  35060878 acaagtttagagcactttgaaatattcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgattttttgaaaacgataaaagttaaaa 35060977  T
Q  369 atataagtaacaaaa 383  Q
    ||| |||||| ||||    
T  35060978 ataaaagtaataaaa 35060992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Original strand, 13718072 - 13718164
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  13718072 ttttttaacatgaaacgcattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagatcaagataaaattaac-aaaatcaggacgtagaaatcaaatttt 13718164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 405
Target Start/End: Original strand, 35351735 - 35351853
Alignment:
Q  288 aaaggttcatttactaaaatctataattttt-taacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaata 386  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||| ||||| ||| | |     
T  35351735 aaaggttcatttactaaaatttaaaatttttgtaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttcatcaacaaaagttcaagataaaagtatcaatactt 35351834  T
Q  387 tggacgtagaaatcaaatt 405  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  35351835 tatacgtagaaatcaaatt 35351853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 35821383 - 35821262
Alignment:
Q  240 ctcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaat 338  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| || || |||||||||||||||   ||| |||    
T  35821383 ctcttaaattttagaactatt-tttttagacaagtttagaacatcatgaaaggttcatatactagaatttacaatttttttaacatgaaacttattgaat 35821285  T
Q  339 atgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  35821284 atgaattttataaaacgacaaaa 35821262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Original strand, 52788862 - 52788959
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  52788862 tataattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgtcaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 52788959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29445732 - 29445637
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  29445732 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctagaaataaaatttt 29445637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 13717972 - 13718042
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttt 265  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13717972 aattttagtccatgttacaaaaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttt 13718042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15637018 - 15636920
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  15637018 tataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 15636920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 37329692 - 37329618
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  37329692 tataattttttaaaatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaa 37329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 257
Target Start/End: Original strand, 38114215 - 38114277
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacg 257  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38114215 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacg 38114277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 344014 - 343919
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  344014 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 343919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6203266 - 6203171
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  6203266 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 6203171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8949718 - 8949623
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  8949718 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 8949623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Original strand, 10386705 - 10386784
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| |||||    
T  10386705 aattttttaacatgtaatgaattaaatatcatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggac 10386784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 19320825 - 19320920
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  19320825 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 19320920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22515758 - 22515663
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  22515758 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 22515663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 24281878 - 24281973
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  24281878 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 24281973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28756411 - 28756316
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  28756411 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 28756316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31312242 - 31312147
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  31312242 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 31312147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 38698836 - 38698931
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  38698836 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 38698931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 42931163 - 42931258
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  42931163 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 42931258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Original strand, 16618859 - 16618952
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  16618859 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaatttt 16618952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 39269855 - 39269782
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||||    
T  39269855 aattttttaacatgtaatgaattatatatgaattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaat 39269782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1776855 - 1776792
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1776855 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaatcttaaattttttaatgatt 1776792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9428163 - 9428069
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  9428163 aattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 9428069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11152404 - 11152325
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| |||||    
T  11152404 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 11152325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 34680338 - 34680433
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  34680338 aattttttaacatgtaatgaattaaatttaatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 34680433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 47016251 - 47016346
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  47016251 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 47016346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 52224640 - 52224545
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  52224640 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttgtttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 52224545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 53237981 - 53238076
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  53237981 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 53238076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16619070 - 16618972
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  16619070 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaatattaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 16618972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 18092600 - 18092698
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  18092600 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 18092698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 22515545 - 22515643
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  22515545 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 22515643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24282091 - 24281993
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  24282091 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 24281993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 35627084 - 35627182
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  35627084 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 35627182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38699049 - 38698951
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  38699049 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttccatacttgtttaaaacattataaaaggttc 38698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47500432 - 47500334
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  47500432 ttttagtccctgttaaattaagatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaacgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 47500334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 50116627 - 50116581
Alignment:
Q  302 taaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50116627 taaaatcttttattttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 50116581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 52224427 - 52224525
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  52224427 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 52224525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Original strand, 23708882 - 23708955
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||||    
T  23708882 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaat 23708955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34509850 - 34509757
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  34509850 ttttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaagtaatgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 34509757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35015524 - 35015451
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||||    
T  35015524 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaat 35015451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 348
Target Start/End: Original strand, 4821856 - 4821908
Alignment:
Q  296 atttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  4821856 atttactaaaatttagaattttttaacgtgcaataaattaaatataaattttt 4821908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28541286 - 28541230
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat 370  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  28541286 ttttttaacatgtaataatttaaatatgaatttttttaaaagccaaaattttaagat 28541230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 407
Target Start/End: Original strand, 29246897 - 29247001
Alignment:
Q  303 aaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaa 402  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||  ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| ||    
T  29246897 aaaaactagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 29246996  T
Q  403 atttt 407  Q
    |||||    
T  29246997 atttt 29247001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39669901 - 39669865
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39669901 aattttttaacaagaaataaattaaatatgaattttt 39669865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Original strand, 1776643 - 1776722
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| |||||    
T  1776643 aattttttaacatgtaatgaaataaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 1776722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4553469 - 4553390
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| |||||    
T  4553469 aattttttaacatgtaatgaattaaatttaatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 4553390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6488620 - 6488526
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||  |||| ||||| || |||| |||||||    
T  6488620 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaac-tcaaaaatttaagataaaactaacgtaaatttggacctaaaaataaaatttt 6488526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 11996607 - 11996670
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  11996607 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaattttttaaagatt 11996670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18093262 - 18093207
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18093262 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttttaaattttt 18093207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 282
Target Start/End: Original strand, 20177824 - 20177911
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaaca 282  Q
    |||||||||| |||  | || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| | |||| |||||||||    
T  20177824 aattttagtcactgttacaacaaaatttgtttaattattcttaatctcttaaatttttgaacaatttttttgagacaaatttagaaca 20177911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28540954 - 28540859
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  28540954 aattttttaacttgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaggaaaatttggacctaaaaataaaatttt 28540859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 29441866 - 29441929
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  29441866 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 29441929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 29445519 - 29445582
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  29445519 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 29445582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 40943151 - 40943214
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  40943151 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaaattttaaattttttaatgatt 40943214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Original strand, 42643005 - 42643084
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| | ||||| || |||||| || |||| ||||| |||||    
T  42643005 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 42643084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42931376 - 42931313
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  42931376 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 42931313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 47500219 - 47500314
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||| || |||| ||||| ||||  || |||| |||||||    
T  47500219 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaaatttt 47500314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 47875941 - 47876035
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  47875941 aattttttaacatgtaatgaattaaatat-atttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 47876035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 50642612 - 50642707
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  50642612 aattttttaacatgtaatgaatgaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacttaaaaataaaatttt 50642707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 50642825 - 50642762
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  50642825 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 50642762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 53231222 - 53231316
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  53231222 aattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 53231316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 4553256 - 4553354
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  4553256 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaatttttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 4553354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8770726 - 8770672
Alignment:
Q  198 tttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8770726 tttagtccttgataaaatcaagtttgtttaattatccttaaactcatgaattttt 8770672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 9427951 - 9428049
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  | | |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  9427951 ttttagtccctgttatattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 9428049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 11152192 - 11152250
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  11152192 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 11152250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18092812 - 18092735
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgga 390  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||    
T  18092812 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacg-caaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgga 18092735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19321038 - 19320980
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  19321038 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 19320980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 23624370 - 23624428
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  23624370 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 23624428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25768240 - 25768142
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  25768240 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaatttttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 25768142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 28756198 - 28756256
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  28756198 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 28756256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 31312029 - 31312127
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  31312029 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattattcttaaaattttagattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 31312127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 34509639 - 34509697
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  34509639 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 34509697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 34756803 - 34756901
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  34756803 ttttagtccctgttaaaataaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaaaattttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 34756901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 39656121 - 39656179
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  39656121 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 39656179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47016464 - 47016366
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  47016464 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgtttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 47016366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 53238194 - 53238136
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  53238194 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 53238136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19037662 - 19037621
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttta 350  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  19037662 tataattttttaacaaaacataaattaaatatgaatttttta 19037621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22516093 - 22516056
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22516093 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 22516056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23624583 - 23624510
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||| || |||| |||||    
T  23624583 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttgaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaat 23624510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 252
Target Start/End: Original strand, 37437225 - 37437262
Alignment:
Q  215 taaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37437225 taaaatttgtttaattatgcttaaactcttaaattttt 37437262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Original strand, 42930826 - 42930863
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42930826 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 42930863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 45557932 - 45557899
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45557932 tttgtttaattatccttaaactcttaaaattttt 45557899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Original strand, 52823030 - 52823067
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  52823030 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 52823067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 253
Target Start/End: Original strand, 343800 - 343856
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttt 253  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  343800 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaatttttt 343856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 293
Target Start/End: Original strand, 6488408 - 6488504
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||    
T  6488408 ttttagtccctgttaaataaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggt 6488504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Original strand, 11968248 - 11968284
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11968248 aattttttatcatgaaataaattaaatattaattttt 11968284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 347
Target Start/End: Original strand, 16618520 - 16618556
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttt 347  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16618520 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttt 16618556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Original strand, 19320493 - 19320549
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||    
T  19320493 ttttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttaaaagccaaaatttcaagat 19320549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Original strand, 34680005 - 34680041
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34680005 aattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 34680041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39656667 - 39656611
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||    
T  39656667 ttttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttctaaaagccaaaattttaagat 39656611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Original strand, 47499769 - 47499837
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttt 265  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||||    
T  47499769 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaaagattttttt 47499837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 113)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30394397 - 30394186
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30394397 aattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaacttttttaacgattctttttatacaagtttataacactatgaa-ggtt 30394299  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30394298 catttgctaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 30394199  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  30394198 gaaatcaaatttt 30394186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 363
Target Start/End: Original strand, 8217800 - 8218157
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||          ||||| |    
T  8217800 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgttgggcatgaatgattttgttgccgaattgatagtttttttttggaatatt 8217899  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtcc 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||         |     ||||||||||     
T  8217900 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcgtaactagttttagtagattttttagtccctacaaaaaaaaaatacttctaattttagtct 8217999  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8218000 ctgctaaaataaagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaa 8218099  T
Q  306 atctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagt 363  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8218100 atttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgataaaagt 8218157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2005341 - 2005129
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2005341 aattttagtccctgctaaaataatttttgcttaattatctttaaactcttaaattttttaaagattctttttatacaagattataacactatgaaaggtt 2005242  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2005241 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaagaaaaatatggacgta 2005142  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  2005141 gaaatcaaatttt 2005129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 38693259 - 38693655
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||    
T  38693259 aaaaatattcacgattttcactatattatcgatgacttctcttgcattgtcgagcatgagtggttttgttgctgaattgatagttttttttg-gaataat 38693357  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtcc 205  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||         |     ||| |||||||    
T  38693358 ttctagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataact---tttagtaggttttttagtccctacaaaaaacaattacttctaatattagtcc 38693454  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38693455 ctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcaattactaaa 38693554  T
Q  306 atctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatt 405  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||||    
T  38693555 atttataattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaatt 38693653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41139531 - 41139131
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||          |||||||    
T  41139531 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggtatgagtggttttgttgccaaattgatagtttttttttggaataat 41139432  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa---aattttagtccc 206  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||      
T  41139431 tactagtcgaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcatcactaattttagtaggttttttagtccctacaacaaaaattacttctaattttagtcta 41139332  T
Q  207 tgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 306  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  41139331 tgctaaaaaaaaatttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattgtgaaaggttcaattactaaaa 41139232  T
Q  307 tctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatt 405  Q
    | || || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||||    
T  41139231 tttagaatttttttatcatgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatataaatcaaatt 41139133  T
Q  406 tt 407  Q
    ||    
T  41139132 tt 41139131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 363
Target Start/End: Original strand, 26865496 - 26865852
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||    
T  26865496 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgcccaattgatagttttttttg-gaataat 26865594  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnn---aaaattttagtcc 205  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||            | |||||||||||    
T  26865595 tactagtaaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccctacaaaaaaaattacttataattttagtcc 26865694  T
Q  206 ctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaa 305  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  26865695 ctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaagctcttaaatttttgaatgaatttttttagacaagtttagaacactatgaaaggtccaattaataaa 26865794  T
Q  306 atctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagt 363  Q
    || || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  26865795 atttaaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagt 26865852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 363
Target Start/End: Original strand, 43440666 - 43441019
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||          |||||||    
T  43440666 aaaaatattcacgatttttactatcttattgatgatttatcttgcattgtccggcatgagtgactttgttgccgaattgatagtttttattg-gaataat 43440764  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaaaattttagtccctg 208  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||           ||||||||||| ||    
T  43440765 tactagtcaaaaatatctttttatcatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccctaaaaaaaatacttctaattttagtccatg 43440864  T
Q  209 caaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatc 308  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43440865 ctaaaacaaagtttgtttgattatccttaaattcttaaatttttgaatgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatt 43440964  T
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagt 363  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43440965 tataattttttaacatgaaacgaattcaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 43441019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10464054 - 10463843
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10464054 aattttagtccctattacaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 10463955  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  10463954 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgta 10463856  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  10463855 gaaatcaaatttt 10463843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 1683143 - 1683354
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  1683143 aattttagtccctactaaaataaagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatttctttaagacaagtttagaacactatgaaaagtt 1683242  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  1683243 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaa-taaaatatggacgta 1683341  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  1683342 taaatcaaatttt 1683354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 34785228 - 34785439
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34785228 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaattttttaacgattttttttagacaagtttataacactatgaaaggtt 34785327  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  34785328 catttactaaaatttaaatttttttaacataaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgta 34785426  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  34785427 aaaatcaaatttt 34785439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37103349 - 37103138
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37103349 aattttagtccttgttacaacaaagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggtt 37103250  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  37103249 catttactaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaaaatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgta 37103151  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| |||||||    
T  37103150 gaaattaaatttt 37103138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8313525 - 8313315
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  8313525 aattttagtccctattataagaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactatgaaaggtt 8313426  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||    
T  8313425 catttactaaaattcagaa-tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaac-aaaatatggacgta 8313328  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  8313327 gaaatcaaatttt 8313315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 407
Target Start/End: Original strand, 24636920 - 24637128
Alignment:
Q  199 ttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcat 297  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24636920 ttagtccctcctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacactatgaaaggttcat 24637019  T
Q  298 ttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaa 397  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  24637020 ttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaa-taaaatctggaagtagaa 24637118  T
Q  398 atcaaatttt 407  Q
    ||||||||||    
T  24637119 atcaaatttt 24637128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8337159 - 8336949
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8337159 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatt-ttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 8337061  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || |||| ||||| | ||||||    
T  8337060 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaactgcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctagacgta 8336962  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  8336961 gaaatcaaatttt 8336949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27308115 - 27307925
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  27308115 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaaaactatgaaagattcatttaccacaatttagaatt 27308016  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27308015 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatcttgacgtagaaatcaaatttt 27307925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27335947 - 27335736
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||| ||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  27335947 aattttagttcctgttacaacaaagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaaggtt 27335848  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  27335847 catttaccaaaatttatatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatatgggcgta 27335749  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  27335748 aaaatcaaatttt 27335736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40158560 - 40158371
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  40158560 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatt-tttttatgacaagtttataac-ctatgaaaggttcatttactaaaatttagaat 40158463  T
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40158462 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaac-aaattatggacgtagatatcaaatttt 40158371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17742643 - 17742431
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  17742643 aattttagtccccgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatgaaaggtt 17742544  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaatt-ttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    ||||||| ||||  || | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||    
T  17742543 catttaccaaaacttagatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgt 17742445  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  17742444 agaaatcaaatttt 17742431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34527335 - 34527123
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34527335 aattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 34527236  T
Q  295 catttactaaaatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    || ||| |||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  34527235 caattaataaaatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacat 34527137  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    | ||||||||||||    
T  34527136 ataaatcaaatttt 34527123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34010239 - 34010028
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  34010239 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtactatttttttgagacaagtttagaatactaagaaaggtt 34010140  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||    
T  34010139 cattaactaaaatttagaattttttaccataaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagtttaagataaaattaac-aaaatctgaacgta 34010041  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  34010040 gaaatcaaatttt 34010028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13920378 - 13920169
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13920378 ttttagtctctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttca 13920279  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
     ||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |    
T  13920278 attattaaaatttagaattttttaacatgaaattaattaaatatgaatatttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatttggacatata 13920180  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||    
T  13920179 aatcaaatttt 13920169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4426318 - 4426163
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  4426318 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaatattcatttactaaaatttagaatt 4426219  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4426218 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagata 4426163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Original strand, 9687509 - 9687675
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9687509 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaatcgatttttttgatataagtttagaacactataaaaggtt 9687608  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9687609 cgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaa 9687675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Original strand, 43210639 - 43210816
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaat 329  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43210639 tatccttaaactctaaaatttttcaacgattttttttatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttaaaattttttaacatgaaat 43210738  T
Q  330 aaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||||||  ||  |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  43210739 aaattaaatatgaatttttctaagagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgaagaaataaaatttt 43210816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Original strand, 14049733 - 14049899
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||| || |||| |||    
T  14049733 aattttagtccctgctaaaataaagtttgtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgattttcttaatacacgtttagaacattacgaaaagtt 14049832  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14049833 catttactaatatttaaaattttttaacatcaaatgaattaaatataaatttttttaaacgacaaaa 14049899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 371
Target Start/End: Original strand, 8404372 - 8404549
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  8404372 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactaaaaaaggtt 8404471  T
Q  295 catttactaaaatctata-attttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8404472 catttaccaaaatttagattttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagata 8404549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31211506 - 31211294
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  31211506 aattttagtccctcttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttaaacaagtttagaacaatatgaaaggt 31211407  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    | |||||| ||||| || | |||||||| ||||||  |||| |||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||  ||||||    
T  31211406 ttatttacaaaaatttagatttttttaatatgaaacgaattcaataggagttttttaaaacagcaaaagttaaagatataagtaa-taaaatcgggacgt 31211308  T
Q  394 agaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||    
T  31211307 agaaatcaaatttt 31211294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13920535 - 13920371
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||           ||||||    
T  13920535 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggtatgagtggttttgttgcctaattgatagtttttttga--aataat 13920438  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtc 176  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13920437 tactagtcaaaaatatctttttatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtc 13920371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 621625 - 621815
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||    
T  621625 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttagaacgatttttatgagacagatttagaacactataaaaggttcatttactagaatttacaatt 621724  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| |||| |||||||||| |||||    
T  621725 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaac-aaaatctggatgtagaaatcacatttt 621815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10674956 - 10674746
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |  ||||||||     
T  10674956 ttttagtccctactaaaacaaagtttctctaattatccttaaacttttaaatctttaaacgatttttttgagacaagtttagaacaccacaaaaggttcg 10674857  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10674856 tttactaaaatttagaatttattaacataaaatgaattaaatatgaatatttttaaaataccaaagttcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtaga 10674757  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    ||  |||||||    
T  10674756 aacaaaatttt 10674746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4463073 - 4462862
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  | |||||||||||  |||||||||| ||    
T  4463073 aattttagtccctcgtacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgattttttcgagacaagtttagagtactatgaaagatt 4462974  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |||| |||||  ||| |||    
T  4462973 cattgactaaaatttagaatttgttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatcaggatgta 4462875  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  4462874 gaaatcaaatttt 4462862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42853040 - 42852829
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| || || | | | |||||||||||| |||||||| ||    
T  42853040 aattttagtccttgctaaaagaaagtttgtttaattattcttaaattcttgaatttttgaacgttttttatgagataagtttagaacaatatgaaagatt 42852941  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  42852940 catttactaaaatttaaaatttttcaacgtgaaacgaatttaaaatgaattttttaaaacgactaaagttaaaaataaaagtaac-aaaatctggacgta 42852842  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  42852841 gaaatcaaatttt 42852829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 360
Target Start/End: Original strand, 4461940 - 4462105
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactat-gaaaggt 293  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||  |||||||  ||||||    
T  4461940 aattttagtccctgctaaaacgaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatt-ttttgagacaagtttaatacactataaaaaggt 4462038  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaa 360  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4462039 tcatttactaaaatttagaactttctaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaa 4462105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21837256 - 21837098
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21837256 aattttagtccatgctaaaacaaattttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaatgattttttcgatacaagtttagaacactataaaaggtt 21837157  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaa 353  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  21837156 catttactaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaatatgaatttcttaaaa 21837098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 18261156 - 18261364
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| | |||   | || ||||||||| |||||||||||||||     
T  18261156 aattttagtccctgctaaagcaaagtttgttaaattatacttacacttttaaattttttagcaatttaatgtaaacaagtttataacactatgaaaggtc 18261255  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |     |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  18261256 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaactaatt----ttttttttaaacgacaaaagttcaagataaaactaacaaaaatctggacgta 18261351  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  18261352 gaaatcaaatttt 18261364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19332736 - 19332566
Alignment:
Q  237 aaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||  || |||| |||| |||||||||||||||    
T  19332736 aaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaagttagaattatttagcatgaaataaattaa 19332637  T
Q  337 atatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||    
T  19332636 atatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaaaaaaaatctggacgcagaaataaaatttt 19332566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 216 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28456804 - 28456624
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||   ||    
T  28456804 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttgtgagacaagtttagaatactatgaaaagttcattaactaaaatttactttt 28456705  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaa 398  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  28456704 ttttaacatgaaactaattaaatatgaatttttt-aaacgaaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaa 28456624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 42877590 - 42877800
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||| | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  42877590 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaggatatttttaagacaagtttagaatgccatgaaaggtt 42877689  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||| ||||| ||   |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  42877690 catttaccaaaatttaattttttttaagatgaaacgaattaaatatgaa-tttttaaaacgacaaaagataaagataaaattaac-aaaatctggacgta 42877787  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| |||||||    
T  42877788 gaaataaaatttt 42877800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 307
Target Start/End: Original strand, 18950752 - 18950959
Alignment:
Q  104 aataattactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccctacaannnnnnnnnaa-----aatt 198  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||          |     || |    
T  18950752 aataaataccagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataacttgttttagtaggttttttagtccttacaaaaaaaaaattacttctaaat 18950851  T
Q  199 ttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatt 298  Q
    ||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18950852 ttagttc-tgataaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaat 18950950  T
Q  299 tactaaaat 307  Q
    |||||||||    
T  18950951 tactaaaat 18950959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 407
Target Start/End: Original strand, 41192983 - 41193165
Alignment:
Q  224 tttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaaca 323  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  41192983 tttaactatccttaagctcttaaacttttgaactatttttgttagacaagtttagaacactatcaaaggttcatttacaaaaatttagaattttttaaca 41193082  T
Q  324 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    | |||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  41193083 taaaacgaattgaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaac-taaatctggacgtagaattcaaatttt 41193165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 321
Target Start/End: Original strand, 22023075 - 22023201
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22023075 aattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacaccatgaaaggtt 22023174  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaa 321  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  22023175 catttactaaaatttagaattttttaa 22023201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36876170 - 36875962
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| || |  || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  36876170 aattttagtccctgctaagaccaaatttgtgttattatcctcaaactcttaaattttttaatgatt-tttttagacaagtttggaacattattaaaggtt 36876072  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| |||||| || |||||||||| || |||| |||    
T  36876071 tatttactaaaattcagaattttttaacatgaaataaattaaatat-aatctttttaaac-aaaaaaatttaagttaaaagtaacaaatatttggatgta 36875974  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  36875973 -aaatcaaatttt 36875962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2004261 - 2004058
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  2004261 aattttagtccctgctacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttata--------cgatttatttgaggcaagtttagaacactatgaaaggtt 2004170  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||| ||| ||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |  ||||| ||||| ||    
T  2004169 cattttctacaatttagaattgttaaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagata-aagttaacaaaatctggacata 2004071  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  2004070 aaaatcaaatttt 2004058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9924510 - 9924401
Alignment:
Q  242 cttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatg 341  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9924510 cttaaatttttaaacgatt-tttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaaaatgaaacaaattaaatatg 9924412  T
Q  342 aattttttaaa 352  Q
    || ||||||||    
T  9924411 aaatttttaaa 9924401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 22166851 - 22167065
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttt-ttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    |||| ||||||| || |||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||| || | | |||| |||||||||||| |||||||    
T  22166851 aattatagtccccgctaaaacaaattttgtataattatcttcaaacacttaactttttttaacgatttttatgagacaaatttagaacactacgaaaggt 22166950  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||| || |||| || |||||| || ||||||||||||||||     
T  22166951 tcatttagtaaaatttagaattttttaacaagaaatgagtttaatatgaattttttttaaatgaaaaaatttcaagataaaattaacaaaaatatggaca 22167050  T
Q  393 tagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||    
T  22167051 tagaaatcaaatttt 22167065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27280470 - 27280258
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  27280470 aattttagtacctgctaaaacaaattttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaa---attttttttagacaagtttagaacattattaaaggtt 27280374  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaa-----ttttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgg 389  Q
    |||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||  |     ||||||||||| | |||| || ||| || |||||||| |||| |||    
T  27280373 catttactaaaattcggaattttttgacatgaaatgaattaaatatatatttttttttttaaaac-aaaaaatttcaagttaaaagtaacagaaatttgg 27280275  T
Q  390 acgtagaaatcaaattt 406  Q
    | |||||||||||||||    
T  27280274 atgtagaaatcaaattt 27280258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 30698660 - 30698871
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| |  |||||  || ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||  | ||| |||||||||| ||| ||| |||    
T  30698660 aattttagtccttctaaaaactaaatttgtttaattattcttgaattcttaaatttttgaacgattttttggagacatgtttagaacattataaaatgtt 30698759  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |  ||||  |||||| || |||||    
T  30698760 catttactaaaaaatataattttttaacaggagaagaattaaatatgaatttttt-aaacgacaaaaattcaagaaaagagtagtaaaaatctgaacgta 30698858  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  30698859 gaaatcaaatttt 30698871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Original strand, 30733927 - 30734112
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||| ||| |||  | ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||    
T  30733927 tttgtttaattactcttgaattcttaaatttttgaacaattttttggagacatgtttagaacattataaaatgttcatttactaaaaaatagaatttttt 30734026  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30734027 aacatgacaagaattaaatatgaattttt--aaacgtcaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctggacgtagaaatcaaatttt 30734112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 379
Target Start/End: Original strand, 3548350 - 3548507
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  3548350 tttgtttaattatccttaaacacttaaacatttgaacgatttattttagacaaatttagaacattatgaaaggttcatttactaaaattta-aattattt 3548448  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaac 379  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  3548449 aatgtgaaatgaattaaatatgaatttttt-aaatgccaaaagttcaagataaaagtaac 3548507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 407
Target Start/End: Original strand, 28616006 - 28616217
Alignment:
Q  198 tttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaaca-ctatgaaaggttca 296  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  28616006 tttagttcatgccaaaacaaagtttgttttattatccttaaactcttaaatctttgaacggatttttttaggcaaatttagaacatttatgaaaggttca 28616105  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtag 395  Q
    ||||||| | |  | | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || || ||| ||||| |||||||  | ||||||    
T  28616106 tttactagagttaagatttttttaaaatgaaataaattaaatatgaattttttttaaatgacaaaacttcaacataaaagtagcaaaaatcagaacgtag 28616205  T
Q  396 aaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||    
T  28616206 aaatcaaatttt 28616217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Original strand, 9168596 - 9168726
Alignment:
Q  262 tttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  9168596 tttttatacaagtttagaacattacaaacggctcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatttgaatttttttaaaagacaaaa 9168695  T
Q  362 gtttaagatataagtaacaaaaatatggacg 392  Q
    ||| || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  9168696 gttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacg 9168726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37446717 - 37446534
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||| | |||||||||||||  ||| || ||||    
T  37446717 aattttagtccctattaaagcaaagtttgtttaattatccttgaactcttaaattgttgaaagatt-ttttaaaacaagtttagaaccatataaatggtt 37446619  T
Q  295 catttactaaaatctataatttttt-aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaa 378  Q
    || |||||||||| || |||||||| ||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37446618 cacttactaaaatttagaatttttttaatgtgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaa 37446534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 334
Target Start/End: Original strand, 6365296 - 6365414
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  6365296 aaagtttgtataattatccttaaactcttgaatttgttaaagatttatttaagacaagtttagaaaactatgaaatgttcatttactagaacctataatt 6365395  T
Q  316 ttttaacatgaaataaatt 334  Q
    || ||||||||||||||||    
T  6365396 ttataacatgaaataaatt 6365414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Original strand, 2262845 - 2262983
Alignment:
Q  269 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 368  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||     
T  2262845 acaagtttagaacattataaaaacttcgtttactaaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatataaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 2262944  T
Q  369 atataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| ||||||||||||| || ||| | |||| |||||||    
T  2262945 ataaaagtaacaaaaatctgtacgcataaataaaatttt 2262983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40272740 - 40272562
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt--atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaa 327  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || || || |||| |||| | || |||||||||| |||||    
T  40272740 tatccttaaaatctttaatttttgaatgattttttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcgtttaataaatt-tagaattttttaatatgaa 40272642  T
Q  328 ataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  40272641 ataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaatttt 40272562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14711676 - 14711581
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  14711676 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 14711581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24334108 - 24334013
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| | ||| || |||| |||||||    
T  24334108 aattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaaatttt 24334013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 43210092 - 43209998
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  | | | |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||    
T  43210092 aattttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttcga-aaaaaagtaagaaaaatctggacgaagaaataaaatttt 43209998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6450234 - 6450139
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  6450234 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 6450139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Original strand, 7572991 - 7573070
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| |||||    
T  7572991 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggac 7573070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 27432467 - 27432562
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  27432467 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 27432562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42992584 - 42992489
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  42992584 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 42992489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Original strand, 5597747 - 5597820
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||    
T  5597747 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaagttcaagataaaattaacgaaaat 5597820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27189160 - 27189068
Alignment:
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  27189160 tttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 27189068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4123291 - 4123196
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| | ||||| || |||||| || |||| ||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  4123291 aattttttaacatgtaatcaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctagaaataaaatttt 4123196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 4291695 - 4291789
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  4291695 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacg-caaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 4291789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 7234522 - 7234617
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  7234522 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 7234617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 8315572 - 8315667
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  8315572 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 8315667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18404462 - 18404368
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||| || |||||||||| | ||| || |||| |||||||    
T  18404462 aattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaatgccaaaaattaaagataaaactaacaaaaatttagacctaaaaataaaatttt 18404368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 19928530 - 19928625
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  19928530 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 19928625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34819010 - 34818915
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  34819010 aattttttaacatgtaatgaatcaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 34818915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41906955 - 41906860
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  41906955 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgtacctaaaaataaaatttt 41906860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 796321 - 796275
Alignment:
Q  302 taaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  796321 taaaatctttaattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 796275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 291
Target Start/End: Original strand, 4123078 - 4123172
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaag 291  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| ||| |||||  ||||| |||| ||| ||||    
T  4123078 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatccttaaaattttaaatttttttatgattttttatatacttgtttaaaacattataaaag 4123172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 6450021 - 6450119
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  6450021 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 6450119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 24333895 - 24333993
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  24333895 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 24333993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27432680 - 27432582
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  27432680 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 27432582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 34818797 - 34818895
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  34818797 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 34818895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 407
Target Start/End: Original strand, 23425310 - 23425413
Alignment:
Q  303 aaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaa 402  Q
    ||||| |||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| || ||||||||| ||  || ||||||||||    
T  23425310 aaaatttataatttttaaacataggatgaattaaatatgaatttttaaaattg-caaaagttcaagataaaattaacaaaaaaatttacttagaaatcaa 23425408  T
Q  403 atttt 407  Q
    |||||    
T  23425409 atttt 23425413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 2567424 - 2567483
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||||    
T  2567424 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaatttaagata 2567483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 4034551 - 4034614
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  4034551 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 4034614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4034764 - 4034669
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| | ||| || |||| |||||||    
T  4034764 aattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaaatttt 4034669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4123740 - 4123685
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4123740 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatccttaaacttctaaattttt 4123685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 349
Target Start/End: Original strand, 4291362 - 4291397
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttt 349  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4291362 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaatttttt 4291397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22982080 - 22982021
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22982080 aattttttaacacgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagata 22982021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22982529 - 22982466
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  22982529 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 22982466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 24090067 - 24090162
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||| || |||| ||||| ||||  || |||| |||||||    
T  24090067 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaaatttt 24090162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 33010290 - 33010353
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  33010290 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 33010353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33010951 - 33010888
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatt 260  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  33010951 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgatt 33010888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34876234 - 34876047
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatct-ataattttt 318  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||| || | ||| ||  |  |||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||  | | |||||||    
T  34876234 tttgtttaattattcttgcacttttagattttttaatgactgtttgtaggcttgtttagaacattataaaatgttcttttacaaaaaaattagaattttt 34876135  T
Q  319 taacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattt 406  Q
    ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||    
T  34876134 tattacgaaataaattaaatatgaaatttttaaacttttaaaagttcaagataaaagtaacgaagatatagacttagaaatcatattt 34876047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4291906 - 4291848
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  4291906 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 4291848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6450566 - 6450532
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6450566 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 6450532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7234735 - 7234677
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  7234735 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaaattttaaattttttaa 7234677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8980432 - 8980398
Alignment:
Q  314 ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8980432 ttttttaacatgtaataaattaaatatgaattttt 8980398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19928743 - 19928645
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  19928743 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 19928645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 407
Target Start/End: Original strand, 22023191 - 22023256
Alignment:
Q  341 gaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| || || |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22023191 gaattttttaaaacgaaaaaagttaaagctaaaattaac-aaaattcggacgtagaaatcaaatttt 22023256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 22981868 - 22981966
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  22981868 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 22981966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24090274 - 24090216
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaa 255  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  24090274 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaattttttaa 24090216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 407
Target Start/End: Original strand, 14049894 - 14049923
Alignment:
Q  378 acaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14049894 acaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 14049923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16939702 - 16939657
Alignment:
Q  303 aaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  16939702 aaaatttataattttttaacaaaatataaattaaatatgaattttt 16939657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Original strand, 19000595 - 19000668
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaat 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| || |||| |||||    
T  19000595 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaat 19000668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20453463 - 20453426
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20453463 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 20453426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20960832 - 20960763
Alignment:
Q  309 tataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaa 378  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| || |||||| ||||||    
T  20960832 tataattttttaatatctaatgaattaaatatgaatttttttaaacgttaaaatttcaagataaaagtaa 20960763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25001295 - 25001258
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25001295 taattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 25001258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 404
Target Start/End: Original strand, 32537537 - 32537586
Alignment:
Q  355 gacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaat 404  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32537537 gacaagagttcaagaaaaaagtaacaaaaatatggacgtagaaataaaat 32537586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 156215 - 156147
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttt 265  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||||    
T  156215 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttataaatttttgaaagattttttt 156147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4035209 - 4035153
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttt 253  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  4035209 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttt 4035153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5597940 - 5597860
Alignment:
Q  215 taaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  5597940 taaaatttgtttaattatgtttaaacttttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 5597860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Original strand, 7411234 - 7411270
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7411234 aattttttaacataacataaattaaatatgaattttt 7411270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 405
Target Start/End: Original strand, 15426624 - 15426732
Alignment:
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgt 393  Q
    |||| ||||||||| || | ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| || | || ||||| | ||| |    
T  15426624 tcatatactaaaatttaaagttttttaa--tgagataaattaaatatg-atttttttaaacgtcaaaagttcaagataaaaatgactaaaatctagactt 15426720  T
Q  394 agaaatcaaatt 405  Q
    |||||| |||||    
T  15426721 agaaattaaatt 15426732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18076080 - 18076012
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttt 265  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||||    
T  18076080 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttataaatttttgaaagattttttt 18076012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 407
Target Start/End: Original strand, 18740695 - 18740787
Alignment:
Q  315 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||| || || |||  ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  18740695 tttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagttaaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 18740787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 253
Target Start/End: Original strand, 38983284 - 38983340
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttt 253  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  38983284 ttttagtccctgtgaaattaaaatttgtttaattatgcttaaaattttaaatttttt 38983340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0651
Description:

Target: scaffold0651; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 6652 - 7052
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  6652 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatcacttctcttgcattgtcgggcacgagtggttttgttgccgaattgatagttttttttg-gaataat 6750  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||         |     ||||||||||    
T  6751 tactagtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggtttttttagtccttacaaaaaaaaattacttctaattttagtc 6850  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6851 c-tgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaa 6949  T
Q  305 aatctataa-ttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaa 403  Q
    ||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| || |||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  6950 aatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataa-taaaatttggacatataaatcaaa 7048  T
Q  404 tttt 407  Q
    ||||    
T  7049 tttt 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 239802 - 240201
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |  |||||    
T  239802 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagtttttttgaa--ataat 239899  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||         |     ||||||||||    
T  239900 tactagtcaaaaatattttttcatgatgaaaatactatcataactagttttaataggtttttttagtccctacaaaaaaaaattacttctaattttagtc 239999  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaa 304  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  240000 cctactaaaacaaagtttgtttaattatccttcaactgttaaatttttgaacgacttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataa 240099  T
Q  305 aatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaat 404  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || | |||||||    
T  240100 aatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatatttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacatatagatcaaat 240198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Original strand, 9749 - 10152
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||          |||||||    
T  9749 aaaaatattcacgattttcactatcttatcgatgacttcttttgcattgtcgggcatgagtgattttcttgccgaattaatagttttttctg-gaataat 9847  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggtttttt-agtccctacaannnnnnnnnaa----aattttagtc 204  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||         |     ||||||||||    
T  9848 tactagtcaaaaacatcttttaatgatgaaaatactatcataactagttttagcaggtttttttagtccctacaaaaaaaaatcacttctaattttagtc 9947  T
Q  205 cctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacg-attctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttacta 303  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9948 cctactaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaattttttaatgaatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaata 10047  T
Q  304 aaatcta--taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatca 401  Q
    |||| ||  |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||  ||  ||||||||||| || ||||||    
T  10048 aaatttaattttttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaaacaa-taaaatatggacatataaatca 10146  T
Q  402 aatttt 407  Q
    ||||||    
T  10147 aatttt 10152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24263 - 23915
Alignment:
Q  28 cactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataattactagtcaaaaatatat 127  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||          || |||||||||||||||||||| |    
T  24263 cactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcggacatgagtgattttgttgccgaattgatagtcttttttg-gagtaattactagtcaaaaatatct 24165  T
Q  128 tttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccct-acaannnnnnnnnaaaattttagtccctgcaaaaataaagtttgttt 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||           ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  24164 tttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtaggttttttagtccctaaaaaaaaatacttctaattttagtcccttctaaaacaaagtttgttt 24065  T
Q  227 aattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatga 326  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||       |||||| |||||||||| || ||||||||||  |||    
T  24064 aattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacac-------ggttcaattactaaaatttagaattttttaatttga 23972  T
Q  327 aataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaa 383  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  23971 aatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaa 23915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 25035 - 25246
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25035 aattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtt 25134  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    || ||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  25135 caattaataaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatatggacata 25233  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  25234 taaatcaaatttt 25246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 195 - 336
Target Start/End: Original strand, 2830 - 2970
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2830 aattttagtcc-tgctaaaataaattttgtttaattatcgttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagcacactatgaaaggtt 2928  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2929 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaa 2970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Original strand, 3257 - 3336
Alignment:
Q  328 ataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3257 ataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggatgtagaaatcaaatttt 3336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Original strand, 3974 - 4160
Alignment:
Q  220 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3974 tttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 4073  T
Q  320 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  4074 aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaac-aaaacctgtacgtagaaatcaaatttt 4160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Original strand, 158027 - 158216
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  158027 aaagtttgtttaattctccttaaactcttcaatttttgaacgatt-ttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 158125  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  158126 ttttaccatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaattaaatttt 158216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7249 - 7037
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||| |||    
T  7249 aattttagtctctgctaaaacaaagtttgtttaattatcattaaactcttaaattttttaatgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaaagtt 7150  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || | |  ||||| |||| |||    
T  7149 catttactaaaatttagaattttctaacacgaaacaaattaaatatgaattttttaaaaagataaaagttaaatataaaaattaacaaaatttggatgta 7050  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  7049 gaaatcaaatttt 7037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 5895 - 6106
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  5895 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttgattttttgaacgatttttttgagacaagtttggaacactatgaaaggtt 5994  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||    
T  5995 catttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctgaacgta 6093  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||    
T  6094 gaaatcaaatttt 6106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 407
Target Start/End: Original strand, 17355 - 17565
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||| |||| || ||    
T  17355 aattttagtccctactaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaaagatttttttgagacaagtttagaacaccatgatagatt 17454  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| ||    
T  17455 catttactaaaatttagaa-tttttaacatgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacaacaaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggactta 17552  T
Q  395 gaaatcaaatttt 407  Q
     ||||||||||||    
T  17553 aaaatcaaatttt 17565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35588 - 35379
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||  | |||||||||||||    
T  35588 ttttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagattattatgaaaggttca 35489  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |    
T  35488 attactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaaatctggacatata 35390  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||    
T  35389 aatcaaatttt 35379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35745 - 35578
Alignment:
Q  10 aaaaatattcacgattttcactatcttattaatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttttgttgccgaattgatagnnnnnnnnnagaataat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          ||||| |    
T  35745 aaaaatattcatgattttcactatcttatcgatgacttctcttgcattgtcgggcatgagtggttctgttgccgaattgatagtttttttg--gaatagt 35648  T
Q  110 tactagtcaaaaatatattttcatgatgaaaacattatcataactagttttagtaggttttttagtccct 179  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35647 tacttgtcaaaaatatcttttcatgatgaaaatactatcataactagttttagtagattttttagtccct 35578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1456 - 1263
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1456 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 1357  T
Q  316 ttttaacatgaaataaattaaatatga---attttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||    |||||| ||| |  ||||| | |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1356 ttttaacatgaaacgaattaaatatgatttttttttttaaatggtaaaagctaaagataaaattaac-aaaatctggacgtagaaatcaaatttt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1191
Description:

Target: scaffold1191; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 986 - 798
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggt 293  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  986 aattttagtccctcttacaaaaaagtttgtttgattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagataagtttagaacactataaaaggt 887  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaa 382  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||||    
T  886 tcatttactaaaatttagaattttttaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgaaaaaagttaaagataaaattaacaaa 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 353
Target Start/End: Original strand, 21728 - 21886
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  21728 aattttagtccatgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacactataaaaggtt 21827  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaa 353  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  21828 catttactaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaatttgaatttcttaaaa 21886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Original strand, 47831 - 48040
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttca 296  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || | |||||||||||||| ||  | ||||||     
T  47831 ttttagtccctacgaaaacaaactttttctaattatccttaaactcttaaatttttgaacaattttcttgagacaagtttagaacattacaagaggttcg 47930  T
Q  297 tttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtaga 396  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  47931 ttttctaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatataaatttttt-aaacgacaaaagttcaagataaaagtaacaaatatccggacgtaga 48029  T
Q  397 aatcaaatttt 407  Q
    ||| |||||||    
T  48030 aataaaatttt 48040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 282
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33031
Alignment:
Q  196 attttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt---atacaagtttagaaca 282  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||   | ||||||||||||||    
T  32942 attttagtccctactaaaacaaagtttttctaattatccttgaactcttaaatttttgaacaattttttttttgaaacaagtttagaaca 33031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1190
Description:

Target: scaffold1190; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Original strand, 180 - 347
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  180 aattttagtccttgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagttcagaacactacgaaaggtt 279  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatg-aaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaa 361  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  280 catttactaaaatttagaattttttaaaatgaaaaaaaattaaatataattttttgaaaacgacaaaa 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0571
Description:

Target: scaffold0571; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8770 - 8609
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaa-ggt 293  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  8770 aattttagtccctcttacaacaaagtttgtttgattattcttaaattcttaaatttttgaacgattttttttagataaggttagaacactatgaaaaggt 8671  T
Q  294 tcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacg 355  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  8670 tcatttactaaaatttagaattttttaagatgaaacgaattaaatatgaatttcttaaaacg 8609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7089
Alignment:
Q  269 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6953 acaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt-aacctaaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaag 7051  T
Q  369 atataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7052 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 7089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 392
Target Start/End: Original strand, 283308 - 283412
Alignment:
Q  288 aaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatat 387  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |    
T  283308 aaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatct 283407  T
Q  388 ggacg 392  Q
    |||||    
T  283408 ggacg 283412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 283197 - 283081
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattcttttt-atacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||  || || || |||| |||| | || |||||||||| ||||||    
T  283197 tatccttaaactcttaaatttttcaattatttttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcgtttattaaatt-tagaattttttaatatgaaa 283099  T
Q  329 taaattaaatatgaattt 346  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  283098 taaattaaatatggattt 283081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 240 - 371
Target Start/End: Original strand, 6197 - 6330
Alignment:
Q  240 ctcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatg--aaataaattaaa 337  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  6197 ctcttaaatttttgaacgattttttcgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaaaaaaaattaaa 6296  T
Q  338 tatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagata 371  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| || ||||||    
T  6297 tatgatttttttaaaaccagaaaaattaaagata 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 52651 - 52450
Alignment:
Q  211 aaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttat-acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatct 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||| ||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  52651 aaaacaaagtttgtttaattatccttagactcgtaaattttggaacggttttttctaagataagtttagaacattataaaaggttcatttactaaaattt 52552  T
Q  310 ataattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttta----aaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatt 405  Q
    | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||     | |||| ||||||  |||||| ||| ||||||||  || || |||||||||||||    
T  52551 agatttttttaacttgaaatgaattaaatatgaatttttttttttacacgataaaagtacaagataaaagcaacaaaaaattgcacatagaaatcaaatt 52452  T
Q  406 tt 407  Q
    ||    
T  52451 tt 52450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 394
Target Start/End: Original strand, 123198 - 123362
Alignment:
Q  230 tatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaat 329  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||  |||| |||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||    
T  123198 tatccttaaactcttaaaatttttaacgatttttccgagacacatttaaaacaatataaaagctgcatttactaaaatttaaaattttttaacttgagat 123297  T
Q  330 aaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgta 394  Q
     |||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  123298 gaattaaatataaattttttcaaacagcaaatgtttaagataaaagtaacaaaaacttggacgta 123362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9415 - 9320
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| || || || |||| |||||||    
T  9415 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgcacctaaaaataaaatttt 9320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6960 - 6865
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| | ||||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  6960 aattttttaacatgtaatgaattaaatattatttttttaaaaagccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 6865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7410 - 7355
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  7410 ttttagtccctgtaaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaattttt 7355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7296 - 7259
Alignment:
Q  311 taattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7296 taattttttaacgtgtaataaattaaatatgaattttt 7259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1037 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1037
Description:

Target: scaffold1037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 657 - 602
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  657 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttttaaattttt 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1031 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1031
Description:

Target: scaffold1031; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 775 - 720
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  775 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttttaaattttt 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0991 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0991
Description:

Target: scaffold0991; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 900
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggac 391  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||| |||||    
T  979 aattttttaacttgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0991; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 766 - 864
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttc 295  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  766 ttttagtccctgttaaattaaaatttgtttaattacacttaaaattttaaattttttaatgattttttacatacttgtttaaaacattataaaaggttc 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48256 - 48161
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 407  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||    
T  48256 aattttttaacatttaatgaattaaatataatttttttaaaacgcccaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 48161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Original strand, 235003 - 235058
Alignment:
Q  197 ttttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 252  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  235003 ttttagtccctgtcaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttttaaattttt 235058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Original strand, 235109 - 235145
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  235109 aattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttt 235145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 158805 - 158674
Alignment:
Q  195 aattttagtccctgcaaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggtt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |   ||   | ||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  158805 aattttagtccctgctaaaactaaatctgtttaattatcttcaaactcttaaatttttgaaaaaaatttcaaacacatgtttagaacattataaaagatt 158706  T
Q  295 catttactaaaatctataattttttaacatga 326  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  158705 tatttagcaaaatttataattttttaacatga 158674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 244
Target Start/End: Original strand, 758 - 786
Alignment:
Q  216 aaagtttgtttaattatccttaaactctt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  758 aaagtttgtttaattatccttaaactctt 786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36621 - 36585
Alignment:
Q  312 aattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttt 348  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  36621 aattttttaacataacataaattaaatatgaattttt 36585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University