View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16978_low_13 (Length: 315)

Name: NF16978_low_13
Description: NF16978
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16978_low_13
NF16978_low_13
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (1-191)||(9008078-9008268)
chr5 (1-189)||(1579035-1579223)
chr5 (1-189)||(1605592-1605780)
chr5 (1-189)||(27679190-27679378)
chr5 (1-191)||(27420855-27421045)
chr5 (1-194)||(24105692-24105885)
chr5 (1-194)||(33491217-33491410)
chr5 (1-193)||(16069348-16069540)
chr5 (1-194)||(16737468-16737661)
chr5 (1-191)||(19358523-19358713)
chr5 (1-191)||(20992167-20992357)
chr5 (1-182)||(3386507-3386688)
chr5 (1-190)||(4120935-4121124)
chr5 (1-193)||(5202967-5203159)
chr5 (9-189)||(8374367-8374547)
chr5 (1-189)||(33991139-33991327)
chr5 (1-191)||(35782665-35782855)
chr5 (1-190)||(31883142-31883331)
chr5 (1-181)||(1165622-1165802)
chr5 (1-189)||(38598471-38598659)
chr5 (1-191)||(3921578-3921768)
chr5 (1-188)||(31410476-31410663)
chr5 (1-188)||(26602963-26603140)
chr5 (1-129)||(27025015-27025143)
chr5 (53-191)||(20992354-20992496)
chr5 (47-180)||(33284642-33284775)
chr5 (36-189)||(25634581-25634732)
chr5 (69-122)||(41818552-41818605)
chr5 (1-38)||(35420445-35420482)
chr5 (52-176)||(31638157-31638281)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (1-191)||(20089465-20089655)
chr1 (1-194)||(16052087-16052280)
chr1 (1-194)||(39260367-39260560)
chr1 (1-189)||(1168499-1168687)
chr1 (1-189)||(25897370-25897558)
chr1 (1-189)||(52753168-52753356)
chr1 (1-196)||(26663247-26663442)
chr1 (1-182)||(29078519-29078700)
chr1 (7-196)||(29288138-29288327)
chr1 (1-189)||(26580291-26580479)
chr1 (1-189)||(41928516-41928704)
chr1 (1-191)||(38829063-38829253)
chr1 (4-190)||(43905649-43905835)
chr1 (1-189)||(1940768-1940956)
chr1 (1-189)||(33510480-33510668)
chr1 (1-188)||(52696788-52696975)
chr1 (1-191)||(32671573-32671763)
chr1 (1-189)||(1170465-1170653)
chr1 (1-185)||(8079730-8079914)
chr1 (1-185)||(19715182-19715366)
chr1 (1-188)||(42370816-42371003)
chr1 (1-188)||(970545-970734)
chr1 (1-186)||(5215384-5215569)
chr1 (1-194)||(49146163-49146356)
chr1 (1-185)||(2473722-2473906)
chr1 (1-185)||(46760966-46761150)
chr1 (1-188)||(12682817-12683004)
chr1 (1-188)||(40092488-40092675)
chr1 (1-189)||(2347652-2347841)
chr1 (1-189)||(17591687-17591872)
chr1 (1-184)||(8120870-8121053)
chr1 (1-191)||(13996744-13996934)
chr1 (1-194)||(15203103-15203296)
chr1 (1-191)||(46409429-46409621)
chr1 (1-188)||(51359238-51359424)
chr1 (1-191)||(6765453-6765643)
chr1 (1-191)||(7145201-7145391)
chr1 (1-188)||(23498457-23498644)
chr1 (1-169)||(17587526-17587694)
chr1 (1-183)||(15717787-15717968)
chr1 (1-189)||(15554173-15554353)
chr1 (1-151)||(40149497-40149647)
chr1 (19-187)||(29695673-29695842)
chr1 (189-299)||(9038305-9038415)
chr1 (56-189)||(52086263-52086396)
chr1 (1-193)||(38171824-38172003)
chr1 (37-172)||(23322897-23323032)
chr1 (36-189)||(5217840-5217992)
chr1 (116-191)||(5675099-5675174)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (1-186)||(38856089-38856274)
chr3 (1-192)||(42307912-42308103)
chr3 (1-189)||(37698150-37698338)
chr3 (1-188)||(25999382-25999569)
chr3 (1-191)||(15520149-15520339)
chr3 (1-189)||(22174997-22175185)
chr3 (1-191)||(8042598-8042788)
chr3 (1-193)||(20842355-20842547)
chr3 (1-189)||(29445481-29445669)
chr3 (1-189)||(50528922-50529110)
chr3 (1-189)||(54534335-54534521)
chr3 (2-193)||(25494293-25494484)
chr3 (1-191)||(32244111-32244301)
chr3 (1-182)||(21581042-21581223)
chr3 (1-189)||(46452169-46452357)
chr3 (5-195)||(15520623-15520813)
chr3 (1-189)||(54870181-54870369)
chr3 (1-191)||(12117665-12117855)
chr3 (5-187)||(20699144-20699326)
chr3 (1-194)||(32359247-32359440)
chr3 (1-194)||(35226435-35226628)
chr3 (1-189)||(38933939-38934126)
chr3 (1-182)||(44609340-44609521)
chr3 (1-189)||(24835706-24835894)
chr3 (4-188)||(26122808-26122992)
chr3 (1-178)||(42104978-42105155)
chr3 (3-189)||(34700334-34700520)
chr3 (11-188)||(2895179-2895356)
chr3 (30-194)||(35643205-35643369)
chr3 (1-189)||(53028218-53028398)
chr3 (2-188)||(44688760-44688940)
chr3 (1-182)||(48925010-48925189)
chr3 (1-129)||(16354399-16354527)
chr3 (48-182)||(50529827-50529961)
chr3 (54-191)||(49128040-49128177)
chr3 (1-159)||(12915930-12916087)
chr3 (1-68)||(24366143-24366210)
chr3 (5-61)||(13696914-13696970)
chr3 (140-193)||(24366081-24366134)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-188)||(14422702-14422889)
chr8 (1-190)||(18594534-18594723)
chr8 (1-189)||(39206584-39206772)
chr8 (1-188)||(29938060-29938247)
chr8 (1-189)||(10836776-10836964)
chr8 (1-185)||(13110406-13110590)
chr8 (1-188)||(35118052-35118239)
chr8 (1-183)||(2042545-2042727)
chr8 (1-189)||(22260651-22260839)
chr8 (1-189)||(24113187-24113375)
chr8 (1-191)||(4035843-4036033)
chr8 (3-191)||(34998919-34999107)
chr8 (1-189)||(39218775-39218963)
chr8 (1-184)||(144397-144580)
chr8 (1-191)||(6144294-6144484)
chr8 (1-187)||(34842386-34842572)
chr8 (1-182)||(34679478-34679659)
chr8 (1-181)||(44804965-44805145)
chr8 (1-188)||(33278399-33278586)
chr8 (1-184)||(41575516-41575699)
chr8 (1-189)||(7774762-7774950)
chr8 (1-193)||(38167176-38167368)
chr8 (1-186)||(7791412-7791597)
chr8 (9-185)||(28639280-28639460)
chr8 (31-191)||(40117903-40118063)
chr8 (31-189)||(33287076-33287234)
chr8 (1-189)||(7811993-7812181)
chr8 (1-188)||(5320563-5320750)
chr8 (1-190)||(36491154-36491343)
chr8 (48-194)||(26783801-26783947)
chr8 (3-185)||(8021721-8021895)
chr8 (2-183)||(42571598-42571776)
chr8 (4-184)||(66203-66384)
chr8 (2-108)||(9807339-9807445)
chr8 (36-191)||(2322068-2322223)
chr8 (59-182)||(5005171-5005294)
chr8 (36-185)||(39220258-39220407)
chr8 (100-185)||(9806875-9806960)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-194)||(36696-36889)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (1-186)||(7164184-7164369)
chr7 (1-190)||(30181035-30181224)
chr7 (2-191)||(42204149-42204339)
chr7 (1-189)||(24792343-24792531)
chr7 (1-191)||(42965007-42965197)
chr7 (1-191)||(43067984-43068174)
chr7 (1-190)||(12101189-12101378)
chr7 (2-187)||(20346487-20346672)
chr7 (1-188)||(22649705-22649892)
chr7 (1-188)||(33359101-33359288)
chr7 (1-191)||(3511318-3511508)
chr7 (1-191)||(4347268-4347458)
chr7 (1-194)||(36890841-36891033)
chr7 (1-193)||(6394744-6394936)
chr7 (1-184)||(4477332-4477515)
chr7 (1-191)||(933280-933470)
chr7 (1-191)||(5280855-5281045)
chr7 (1-191)||(15655907-15656097)
chr7 (1-188)||(25748485-25748672)
chr7 (1-183)||(1803029-1803211)
chr7 (1-189)||(32041539-32041727)
chr7 (1-189)||(33846540-33846723)
chr7 (1-181)||(43156718-43156898)
chr7 (1-188)||(12097601-12097788)
chr7 (1-187)||(8630665-8630851)
chr7 (1-183)||(38866547-38866729)
chr7 (1-184)||(42673467-42673646)
chr7 (1-185)||(9452591-9452775)
chr7 (1-186)||(17753600-17753785)
chr7 (1-185)||(46891350-46891535)
chr7 (1-186)||(46134315-46134500)
chr7 (1-191)||(16894518-16894698)
chr7 (1-129)||(48865690-48865818)
chr7 (41-191)||(19828265-19828415)
chr7 (1-193)||(43021591-43021779)
chr7 (36-191)||(37005857-37006012)
chr7 (36-191)||(43405015-43405170)
chr7 (91-193)||(37704973-37705075)
chr7 (43-188)||(36849590-36849735)
chr7 (36-193)||(30075277-30075431)
chr7 (36-191)||(15655458-15655613)
chr7 (97-181)||(27691433-27691517)
chr7 (52-119)||(20163886-20163953)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-186)||(1756773-1756958)
chr4 (1-193)||(23776468-23776660)
chr4 (1-190)||(54189540-54189729)
chr4 (1-189)||(50055110-50055298)
chr4 (1-188)||(19913639-19913826)
chr4 (1-193)||(14987784-14987976)
chr4 (1-189)||(15241037-15241225)
chr4 (1-189)||(53717473-53717661)
chr4 (4-191)||(20877041-20877228)
chr4 (1-188)||(38055154-38055341)
chr4 (1-191)||(50353795-50353985)
chr4 (1-189)||(27488657-27488845)
chr4 (1-189)||(28032721-28032909)
chr4 (1-185)||(35490782-35490966)
chr4 (1-193)||(45424543-45424735)
chr4 (1-187)||(11639587-11639773)
chr4 (1-187)||(37968766-37968952)
chr4 (1-190)||(44784926-44785115)
chr4 (1-189)||(2481417-2481605)
chr4 (1-189)||(6611369-6611557)
chr4 (1-189)||(48909842-48910030)
chr4 (1-191)||(8932187-8932377)
chr4 (1-191)||(23704218-23704408)
chr4 (1-187)||(40428729-40428915)
chr4 (1-186)||(54412627-54412812)
chr4 (1-185)||(8591101-8591285)
chr4 (1-184)||(19164982-19165164)
chr4 (1-193)||(30423574-30423765)
chr4 (1-185)||(52139203-52139387)
chr4 (1-184)||(16700782-16700965)
chr4 (1-185)||(1617084-1617268)
chr4 (1-188)||(6688636-6688817)
chr4 (1-189)||(37464717-37464905)
chr4 (1-189)||(43289969-43290157)
chr4 (1-187)||(47632032-47632219)
chr4 (2-184)||(53875658-53875840)
chr4 (1-189)||(15669179-15669367)
chr4 (1-185)||(31969681-31969865)
chr4 (1-192)||(53353048-53353247)
chr4 (1-181)||(27583641-27583821)
chr4 (1-189)||(27536113-27536297)
chr4 (3-184)||(30171581-30171762)
chr4 (1-176)||(33703850-33704025)
chr4 (2-189)||(44379197-44379384)
chr4 (14-182)||(28360433-28360602)
chr4 (1-186)||(44375844-44376029)
chr4 (1-181)||(40680047-40680227)
chr4 (1-189)||(55344834-55345022)
chr4 (1-176)||(38071332-38071504)
chr4 (36-189)||(50053439-50053592)
chr4 (1-189)||(16703821-16704005)
chr4 (1-108)||(23269055-23269162)
chr4 (100-191)||(23265865-23265956)
chr4 (36-193)||(44548185-44548343)
chr4 (37-112)||(51780763-51780838)
chr4 (1-67)||(53408137-53408204)
chr4 (36-191)||(17493327-17493482)
chr4 (1-43)||(23261895-23261937)
chr4 (130-189)||(9595973-9596031)
chr4 (41-98)||(55344724-55344781)
chr4 (1-83)||(9595911-9595982)
chr4 (1-46)||(48748197-48748242)
chr4 (1-29)||(50055301-50055329)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (1-189)||(6086620-6086808)
chr6 (1-193)||(26704360-26704552)
chr6 (1-188)||(26946897-26947084)
chr6 (1-189)||(2837543-2837731)
chr6 (1-191)||(3347544-3347734)
chr6 (1-188)||(30691850-30692037)
chr6 (1-186)||(3955787-3955972)
chr6 (1-188)||(9459562-9459749)
chr6 (1-185)||(17261094-17261278)
chr6 (1-189)||(21893453-21893641)
chr6 (1-191)||(18613534-18613724)
chr6 (1-189)||(11167238-11167426)
chr6 (1-189)||(16307029-16307217)
chr6 (1-194)||(20726784-20726973)
chr6 (1-189)||(35198282-35198469)
chr6 (1-184)||(34887313-34887496)
chr6 (24-189)||(52834-52999)
chr6 (1-177)||(1153603-1153779)
chr6 (1-185)||(28199529-28199714)
chr6 (1-183)||(30698950-30699132)
chr6 (1-114)||(33464402-33464515)
chr6 (1-94)||(53001-53094)
chr6 (109-190)||(33463698-33463779)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-188)||(22972-23159)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-193)||(33906068-33906260)
chr2 (1-188)||(31517236-31517423)
chr2 (3-188)||(3873267-3873452)
chr2 (1-192)||(26323207-26323398)
chr2 (1-191)||(1108274-1108463)
chr2 (1-189)||(18806905-18807093)
chr2 (1-189)||(4232163-4232351)
chr2 (1-189)||(39635448-39635636)
chr2 (4-189)||(6174852-6175037)
chr2 (1-185)||(4016039-4016223)
chr2 (1-184)||(1482924-1483106)
chr2 (2-189)||(5733395-5733582)
chr2 (1-185)||(28329860-28330042)
chr2 (1-189)||(42937715-42937904)
chr2 (1-191)||(19901159-19901348)
chr2 (1-193)||(30270700-30270892)
chr2 (36-186)||(30420223-30420373)
chr2 (1-189)||(2178790-2178978)
chr2 (1-185)||(850997-851181)
chr2 (1-189)||(16588797-16588985)
chr2 (1-181)||(16066315-16066495)
chr2 (1-171)||(19383956-19384126)
chr2 (1-184)||(429817-430000)
chr2 (1-187)||(44947570-44947749)
chr2 (36-189)||(42446625-42446778)
chr2 (36-184)||(3585291-3585439)
chr2 (43-187)||(22101210-22101353)
chr2 (52-182)||(12517256-12517385)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (1-187)||(3708-3894)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-185)||(145266-145450)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-189)||(27-215)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-193)||(10230-10422)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-186)||(316-501)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-185)||(27-212)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (161-189)||(1066-1094)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 9008078 - 9008268
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008078 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 9008177  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008178 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 9008268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1579223 - 1579035
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1579223 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 1579124  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579123 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1579035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1605592 - 1605780
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1605592 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 1605691  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605692 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1605780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27679190 - 27679378
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679190 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 27679289  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679290 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27679378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27421045 - 27420855
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27421045 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 27420946  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27420945 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 27420855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 24105692 - 24105885
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105692 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 24105791  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24105792 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggagccttagtc 24105885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 33491217 - 33491410
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491217 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgataagctatt 33491316  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491317 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 33491410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16069540 - 16069348
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069540 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16069441  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16069440 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggaccttagt 16069348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 16737468 - 16737661
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737468 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16737567  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  16737568 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattcaaacgagaccttagtc 16737661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19358713 - 19358523
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358713 acataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 19358614  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19358613 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctta 19358523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 20992167 - 20992357
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20992167 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgctatt 20992266  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20992267 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctta 20992357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 3386507 - 3386688
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386507 acataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3386606  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386607 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4121124 - 4120935
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4121124 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaattatt 4121025  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4121024 tttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacggggcctt 4120935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5203159 - 5202967
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5203159 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 5203060  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5203059 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggccatagt 5202967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 8374367 - 8374547
Alignment:
Q  9 tcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttattta 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8374367 tcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 8374466  T
Q  109 tttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8374467 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggcct 8374547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33991327 - 33991139
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33991327 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 33991228  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33991227 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaaacggggcct 33991139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 35782665 - 35782855
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagc-cggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782665 acataaattcataagctccttg-taagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 35782763  T
Q  100 ttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35782764 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctta 35782855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31883331 - 31883142
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31883331 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 31883232  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31883231 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcctt 31883142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 1165622 - 1165802
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1165622 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataagctatt 1165721  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1165722 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 38598471 - 38598659
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598471 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 38598570  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38598571 tttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaaccgggcct 38598659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3921768 - 3921578
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921768 acataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3921669  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  3921668 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgggacctta 3921578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31410663 - 31410476
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31410663 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatgataagctatt 31410564  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||   ||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  31410563 tttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgcggcc 31410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 26602963 - 26603140
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26602963 acataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 26603062  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603063 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtag----------ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27025143 - 27025015
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025143 acataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 27025044  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaa 129  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  27025043 tttatttatttacccgaacatctttaaaa 27025015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992496
Alignment:
Q  53 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  153 c----acataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctta 20992496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 180
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  47 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtaga 146  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  147 taagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 180  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634581
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||   ||||||||| ||||   ||| ||| |||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcct 25634581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 122
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  69 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacc 122  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 35420445 - 35420482
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaa 38  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35420445 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638157
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagc 151  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||  ||||| | |||||| |||| ||  ||||||   ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  152 ccacataagctcaaaataagccaat 176  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||    
T  31638181 tcacataaacataaaataagtcaat 31638157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20089655 - 20089465
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089655 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 20089556  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089555 tttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 20089465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16052280 - 16052087
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052280 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16052181  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052180 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 16052087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 39260367 - 39260560
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39260367 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 39260466  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39260467 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaagtc 39260560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1168687 - 1168499
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168687 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 1168588  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168587 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1168499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25897558 - 25897370
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897558 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 25897459  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25897458 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 25897370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 52753168 - 52753356
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52753168 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatt 52753267  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753268 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52753356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26663442 - 26663247
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26663442 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 26663343  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtcct 196  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26663342 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggtcttaatcct 26663247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29078700 - 29078519
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078700 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 29078601  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078600 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29288327 - 29288138
Alignment:
Q  7 attcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29288327 attcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatt 29288228  T
Q  107 tatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtcct 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29288227 tatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaagtcct 29288138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 26580291 - 26580479
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580291 acataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26580390  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580391 tttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 26580479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 41928516 - 41928704
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41928516 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 41928615  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928616 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggcct 41928704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38829253 - 38829063
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829253 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgataagctatt 38829154  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38829153 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaaacagagcctta 38829063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43905835 - 43905649
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905835 taaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 43905736  T
Q  104 atttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43905735 atttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggagcctt 43905649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1940768 - 1940956
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1940768 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatgataagctatt 1940867  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940868 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1940956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33510668 - 33510480
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33510668 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 33510569  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510568 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33510480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52696975 - 52696788
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52696975 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 52696876  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696875 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32671763 - 32671573
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32671763 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatt 32671664  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671663 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 32671573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1170465 - 1170653
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1170465 acataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 1170564  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170565 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 8079730 - 8079914
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8079730 acataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatt 8079829  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079830 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 19715182 - 19715366
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19715182 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgataagctatt 19715281  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19715282 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 42370816 - 42371003
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  42370816 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttttt 42370915  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42370916 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 970545 - 970734
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac--tatgataagcta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  970545 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatatgataatcta 970644  T
Q  99 tttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  970645 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5215569 - 5215384
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5215569 acataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 5215470  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215469 tttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 49146356 - 49146163
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146356 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 49146257  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  49146256 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggagccttagtc 49146163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2473906 - 2473722
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2473906 acataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataataagctatt 2473807  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2473806 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 46761150 - 46760966
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46761150 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 46761051  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46761050 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaaacggg 46760966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12683004 - 12682817
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12683004 acataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 12682905  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12682904 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcc 12682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40092675 - 40092488
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40092675 acataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagatatt 40092576  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40092575 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2347841 - 2347652
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2347841 acataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactat 2347742  T
Q  100 ttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2347741 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggcct 2347652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17591872 - 17591687
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17591872 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 17591773  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17591772 tttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatccaaacggggcct 17591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8121053 - 8120870
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  8121053 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 8120954  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120953 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 13996744 - 13996934
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13996744 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataagctatt 13996843  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13996844 tttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaacagggcctta 13996934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15203296 - 15203103
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15203296 acataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 15203197  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  15203196 tttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggccatagtc 15203103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46409621 - 46409429
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaa--gccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409621 acataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 46409522  T
Q  99 tttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  46409521 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcctta 46409429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 51359238 - 51359424
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51359238 acataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatgataagctatt 51359337  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||| |  |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359338 tttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6765643 - 6765453
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  6765643 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgataaactatt 6765544  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||  |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6765543 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggtctta 6765453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7145391 - 7145201
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7145391 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 7145292  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctc-aaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||||||  |||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7145291 tttgtttatttacc-caacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaaacgggacctta 7145201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23498644 - 23498457
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  23498644 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatgaactatt 23498545  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  23498544 tttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattcaaacagggcc 23498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 17587526 - 17587694
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17587526 acataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatgataagctgtt 17587625  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaata 169  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17587626 tttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15717968 - 15717787
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15717968 acataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga-aagctatt 15717870  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 183  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||   | |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15717869 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacg 15717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 15554173 - 15554353
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||        | ||||||    
T  15554173 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa--------atgctatt 15554264  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15554265 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 15554353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 40149647 - 40149497
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  40149647 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgataaattatt 40149548  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagc 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40149547 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  19 cttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaa 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  119 caccttt-aaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    ||||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 299
Target Start/End: Original strand, 9038305 - 9038415
Alignment:
Q  189 ttagtcctaattagttcttatttgtcagctttgattgactcttccaaaaatacagttaagtgtttaacaatgaaattattaatgtgcatcagaaatatta 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9038305 ttagtcctaattagtccttatttgtcagctttgattgactcttccaaaagtacaattaagtgtttaacaatgaaattattgatgtgcatcagaaatatta 9038404  T
Q  289 tagaagaatat 299  Q
    |||||||||||    
T  9038405 tagaagaatat 9038415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086263
Alignment:
Q  56 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccac 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | |||| |||| |||||| |||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  156 ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaacagggcct 52086263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38172003 - 38171824
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  38172003 acataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 38171917  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  38171916 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaaacggagccttagt 38171824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 172
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  37 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctta 136  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   |||| |||| |||| || |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  137 taggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 172  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217992
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||| |||    ||| ||| |||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||   ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcct 5217992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5675174 - 5675099
Alignment:
Q  116 aaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||| |||| ||| |||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5675174 aaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggcctta 5675099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38856274 - 38856089
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856274 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 38856175  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856174 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 42307912 - 42308103
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307912 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 42308011  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttag 192  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42308012 tttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttag 42308103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 37698150 - 37698338
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698150 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 37698249  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698250 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 37698338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25999569 - 25999382
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999569 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 25999470  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999469 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 15520149 - 15520339
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15520149 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataagttatt 15520248  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520249 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 15520339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 22174997 - 22175185
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22174997 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 22175096  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175097 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8042788 - 8042598
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8042788 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 8042689  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8042688 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggcctta 8042598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 20842355 - 20842547
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20842355 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatgataagttgtt 20842454  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842455 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 20842547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29445669 - 29445481
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29445669 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 29445570  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445569 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 29445481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 50529110 - 50528922
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50529110 acataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 50529011  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529010 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 54534335 - 54534521
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  54534335 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatgataagctatt 54534432  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54534433 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54534521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 25494293 - 25494484
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494293 cataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 25494392  T
Q  102 ttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25494393 ttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccatagt 25494484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32244301 - 32244111
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32244301 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 32244202  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32244201 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 32244111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21581223 - 21581042
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21581223 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatt 21581124  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21581123 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 46452169 - 46452357
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  46452169 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatt 46452268  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46452269 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15520813 - 15520623
Alignment:
Q  5 aaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattttta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15520813 aaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttg 15520714  T
Q  105 tttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtcc 195  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15520713 tttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaagtcc 15520623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 54870181 - 54870369
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54870181 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgataagctatt 54870280  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870281 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcct 54870369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 12117665 - 12117855
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12117665 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatt 12117764  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12117765 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctta 12117855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20699326 - 20699144
Alignment:
Q  5 aaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattttta 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20699326 aaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttg 20699227  T
Q  105 tttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699226 tttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32359440 - 32359247
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32359440 acataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 32359341  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32359340 tttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggaccttagtc 32359247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35226628 - 35226435
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  35226628 acataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgat 35226529  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  35226528 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaaacagggcctaagtc 35226435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38934126 - 38933939
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38934126 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 38934027  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934026 tttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 38933939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 44609340 - 44609521
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44609340 acataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 44609439  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609440 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 44609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 24835706 - 24835894
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24835706 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatt 24835805  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24835806 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggcct 24835894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26122992 - 26122808
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122992 taaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 26122893  T
Q  104 atttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  ||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26122892 atttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 42104978 - 42105155
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42104978 acataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 42105077  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 178  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42105078 tttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34700520 - 34700334
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 102  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34700520 ataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 34700421  T
Q  103 tatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34700420 tatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggcct 34700334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2895356 - 2895179
Alignment:
Q  11 ataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatt 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  2895356 ataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatt 2895257  T
Q  111 tacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  2895256 tacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaatggggcc 2895179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643205
Alignment:
Q  30 ggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  130 cagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
      |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggctttagtc 35643205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 53028398 - 53028218
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  53028398 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgataagctatt 53028299  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||        |||| |||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53028298 tttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcct 53028218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44688940 - 44688760
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44688940 cataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatgataagctattt 44688842  T
Q  102 ttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||     |||||||||| |||||||||||    
T  44688841 ttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc-----ataagccaattcaaacggggcc 44688760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 48925010 - 48925189
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48925010 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataaactatt 48925109  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48925110 tttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16354527 - 16354399
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16354527 acataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgataagttatt 16354428  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaa 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16354427 tttatttatttacccaaacacctttaaaa 16354399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 182
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  48 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  148 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128040
Alignment:
Q  54 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagccc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  154 acataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcctta 49128040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12916087 - 12915930
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  12916087 acataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatgataaactatt 12915988  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataa 159  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||    
T  12915987 tttatttatttatccaaacacctttaaaa-agatttatggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 24366210 - 24366143
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366210 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13696970 - 13696914
Alignment:
Q  5 aaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696970 aaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24366134 - 24366081
Alignment:
Q  140 gagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24366134 gagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaaggggccttagt 24366081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14422889 - 14422702
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422889 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 14422790  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14422789 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18594723 - 18594534
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594723 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 18594624  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594623 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 18594534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39206772 - 39206584
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206772 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 39206673  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206672 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29938247 - 29938060
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938247 acataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 29938148  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938147 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 10836776 - 10836964
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10836776 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatt 10836875  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10836876 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 10836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13110590 - 13110406
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13110590 acataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatgataagctatt 13110491  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110490 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 35118052 - 35118239
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118052 acataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35118151  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118152 tttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 2042545 - 2042727
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2042545 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 2042644  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042645 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 22260651 - 22260839
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22260651 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaggataagctatt 22260750  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260751 tttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 24113187 - 24113375
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24113187 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctgtt 24113286  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24113287 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 24113375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4036033 - 4035843
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036033 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 4035934  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4035933 tttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggcctta 4035843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Original strand, 34998919 - 34999107
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34998919 ataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaagataagctatttt 34999018  T
Q  103 tatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34999019 tatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatccatacgggacctta 34999107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39218963 - 39218775
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  39218963 acataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatgataaaccatt 39218864  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39218863 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39218775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 144580 - 144397
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  144580 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 144481  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  144480 tttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 6144294 - 6144484
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144294 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 6144393  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6144394 tttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctta 6144484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 34842386 - 34842572
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34842386 acataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 34842485  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842486 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 34679478 - 34679659
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34679478 acataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatt 34679577  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34679578 tttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 44804965 - 44805145
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44804965 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 44805064  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44805065 tttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaaa 44805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33278586 - 33278399
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33278586 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 33278487  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||   |||||   |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278486 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41575699 - 41575516
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41575699 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagcaatt 41575600  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575599 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7774950 - 7774762
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7774950 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 7774851  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7774850 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatctaaacgaggcct 7774762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 38167176 - 38167368
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  38167176 acataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactagt 38167275  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  38167276 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaacagggccatagt 38167368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7791597 - 7791412
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7791597 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 7791498  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7791497 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28639460 - 28639280
Alignment:
Q  9 tcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttattta 108  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28639460 tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 28639361  T
Q  109 tttacctaaacacctttaaaacagct----tataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28639360 tttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattcaaacggg 28639280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118063
Alignment:
Q  31 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaac 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  131 agcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 40118063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 33287076 - 33287234
Alignment:
Q  31 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaac 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  33287076 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaa 33287175  T
Q  131 agcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33287176 agcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 33287234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7812181 - 7811993
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7812181 acataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 7812082  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   || || | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7812081 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggcct 7811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5320750 - 5320563
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  5320750 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatgataaattatt 5320651  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5320650 tttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36491343 - 36491154
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||    
T  36491343 acataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataagctgtt 36491244  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||  || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36491243 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaatggggcctt 36491154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 194
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783947
Alignment:
Q  48 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  148 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggccttagtc 26783947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8021895 - 8021721
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8021895 ataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttt 8021804  T
Q  103 tatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8021803 tatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8021721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42571776 - 42571598
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571776 cataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattt 42571679  T
Q  102 ttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 183  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571678 ttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 66203 - 66384
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagccgga-gggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  66203 taaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactattataagttatttt 66302  T
Q  103 tatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||   | ||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  66303 tatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatctaaacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9807445 - 9807339
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9807445 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatgataagctattt 9807346  T
Q  102 ttattta 108  Q
    |||||||    
T  9807345 ttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322223
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||   |||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcctta 2322223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005171
Alignment:
Q  59 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacata 158  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  159 agctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaaac 5005171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220258
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||   | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    || |  |||||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 39220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  100 ttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36889 - 36696
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36889 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 36790  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36789 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaagtc 36696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7164369 - 7164184
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164369 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 7164270  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164269 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 30181035 - 30181224
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181035 acataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 30181134  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181135 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 30181224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42204339 - 42204149
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204339 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 42204240  T
Q  102 ttatttatttacctaaacacctttaaaacag-cttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204239 ttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 42204149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 24792343 - 24792531
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792343 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 24792442  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24792443 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 24792531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 42965007 - 42965197
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965007 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 42965106  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42965107 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaaggggcctta 42965197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 43067984 - 43068174
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43067984 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatgataagctatt 43068083  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43068084 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctta 43068174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 12101189 - 12101378
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101189 acataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 12101288  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12101289 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaatggggcctt 12101378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20346672 - 20346487
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20346672 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctattt 20346573  T
Q  102 ttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346572 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22649705 - 22649892
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22649705 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataaactatt 22649804  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22649805 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 33359101 - 33359288
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359101 acataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 33359200  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359201 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3511508 - 3511318
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511508 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3511409  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3511408 tttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacgggacctta 3511318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4347458 - 4347268
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4347458 acataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctatt 4347359  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4347358 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcctta 4347268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 36890841 - 36891033
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36890841 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 36890940  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36890941 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaaacggggccttagtc 36891033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6394936 - 6394744
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6394936 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatt 6394837  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6394836 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggccttagt 6394744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 4477332 - 4477515
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4477332 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatt 4477431  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477432 tttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 933470 - 933280
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  933470 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 933371  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  933370 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattcaaacagggcctta 933280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5281045 - 5280855
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5281045 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 5280946  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5280945 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 5280855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15656097 - 15655907
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15656097 acataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 15655998  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655997 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 15655907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25748672 - 25748485
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748672 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 25748573  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25748572 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1803211 - 1803029
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803211 acataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgataagctatt 1803112  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 183  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1803111 tttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32041727 - 32041539
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041727 acataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 32041628  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32041627 tttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 32041539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 33846540 - 33846723
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33846540 acataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataagctatt 33846634  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846635 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33846723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43156898 - 43156718
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43156898 acataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatgataagctatt 43156799  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156798 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 12097601 - 12097788
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12097601 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatgataatctatt 12097700  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12097701 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaaatggggcc 12097788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8630851 - 8630665
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8630851 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 8630752  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  8630751 tttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 38866729 - 38866547
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38866729 acataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataaactatt 38866630  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 183  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38866629 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaaacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42673646 - 42673467
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42673646 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 42673547  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
        |||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42673546 ----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaaacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9452775 - 9452591
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9452775 acataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatgataaactatt 9452676  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||  || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9452675 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17753785 - 17753600
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17753785 acataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgttaagctatt 17753686  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17753685 tttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacgggg 17753600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 46891350 - 46891535
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  46891350 acataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgacaaactatt 46891449  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaaca-gcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46891450 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 46134315 - 46134500
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  46134315 acataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataaactatt 46134414  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46134415 tttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16894518 - 16894698
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16894518 acataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 16894617  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894618 tttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtag----------ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 16894698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 48865818 - 48865690
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48865818 acataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 48865719  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaa 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48865718 tttatttatttacccaaacacctttaaaa 48865690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828265
Alignment:
Q  41 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttatagg 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  141 agtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcctta 19828265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 43021591 - 43021779
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43021591 acataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataataagttatt 43021686  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43021687 tttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaatggggccttagt 43021779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006012
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| | |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagcctta 37006012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405015
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||   |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggcctta 43405015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704973
Alignment:
Q  91 ataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcctt 37704976  T
Q  191 agt 193  Q
    |||    
T  37704975 agt 37704973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 188
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849735
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggag 142  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||| | | |||   ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  143 tagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||| || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggcc 36849735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075431
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||   | | |||  ||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctatttttatt-atttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    ||   ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccatagt 30075431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655613
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| | ||| |  |||||||   |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||   |||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcctta 15655613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 181
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691517
Alignment:
Q  97 tatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaattcaaa 27691517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaac 119  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1756773 - 1756958
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1756773 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatt 1756872  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756873 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 23776468 - 23776660
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776468 acataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 23776567  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23776568 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccctagt 23776660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 54189729 - 54189540
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189729 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 54189630  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189629 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 54189540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 50055110 - 50055298
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50055110 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatt 50055209  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055210 ttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50055298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 19913639 - 19913826
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19913639 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 19913738  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913739 ttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14987976 - 14987784
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987976 acataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 14987877  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987876 tttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 14987784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 15241037 - 15241225
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15241037 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 15241136  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15241137 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 53717473 - 53717661
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717473 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 53717572  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717573 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 53717661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20877228 - 20877041
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20877228 taaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactattttt 20877129  T
Q  104 atttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20877128 atttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 20877041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38055341 - 38055154
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  38055341 acataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaaatatt 38055242  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38055241 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50353985 - 50353795
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50353985 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatcataagctatt 50353886  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353885 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 50353795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27488657 - 27488845
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488657 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 27488756  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27488757 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 27488845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 28032721 - 28032909
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28032721 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatgataagctatt 28032820  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  28032821 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatctaaacagggcct 28032909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 35490782 - 35490966
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35490782 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 35490881  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35490882 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 45424543 - 45424735
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45424543 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 45424642  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45424643 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttagt 45424735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 11639587 - 11639773
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639587 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 11639686  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11639687 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 37968766 - 37968952
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968766 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 37968865  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  37968866 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggc 37968952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 44784926 - 44785115
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44784926 acataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 44785025  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44785026 tttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 44785115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 2481417 - 2481605
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2481417 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 2481516  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481517 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2481605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 6611369 - 6611557
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6611369 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataagctatt 6611468  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6611469 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 6611557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48910030 - 48909842
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48910030 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 48909931  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48909930 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 48909842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 8932187 - 8932377
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8932187 acataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgttaagctatt 8932286  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8932287 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 8932377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 23704218 - 23704408
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23704218 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 23704317  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23704318 tttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctta 23704408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 40428729 - 40428915
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428729 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatt 40428828  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40428829 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54412812 - 54412627
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412812 acataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 54412713  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412712 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 8591101 - 8591285
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591101 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 8591200  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  8591201 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaagtcaaacggg 8591285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 19164982 - 19165164
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19164982 acataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 19165079  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacag-cttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165080 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 30423574 - 30423765
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423574 acataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 30423672  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30423673 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacgggaccttagt 30423765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52139387 - 52139203
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139387 acataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 52139288  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52139287 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16700965 - 16700782
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16700965 acataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 16700866  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16700865 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1617268 - 1617084
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1617268 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttatt 1617169  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617168 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 6688636 - 6688817
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||    
T  6688636 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatgataagctatt 6688729  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6688730 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37464905 - 37464717
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37464905 acataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 37464806  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37464805 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 43289969 - 43290157
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289969 acataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 43290068  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43290069 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 43290157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47632219 - 47632032
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47632219 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgagaagctatt 47632120  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacc-tttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47632119 tttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 53875840 - 53875658
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53875840 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatgataagctattt 53875741  T
Q  102 ttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53875740 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15669367 - 15669179
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15669367 acataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 15669268  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669267 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31969865 - 31969681
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31969865 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 31969766  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  31969765 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattcaaacggg 31969681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53353247 - 53353048
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 96  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353247 acataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 53353148  T
Q  97 tatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccaca----taagctcaaaataagccaatccaaacggggccttag 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353147 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaacggggccttag 53353048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 27583641 - 27583821
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27583641 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatgataagttatt 27583740  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 181  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27583741 tttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27536113 - 27536297
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27536113 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatt 27536212  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536213 tttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30171762 - 30171581
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171762 ataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 30171663  T
Q  103 tatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171662 catttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33704025 - 33703850
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33704025 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtt 33703926  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaat 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  33703925 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 44379197 - 44379384
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  44379197 cataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactattt 44379296  T
Q  102 ttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44379297 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcct 44379384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  14 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttattta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  113 cctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
    || ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44376029 - 44375844
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44376029 acataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataaactatt 44375930  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44375929 tttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 40680047 - 40680227
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680047 acataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 40680146  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 181  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||   ||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  40680147 tttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaaa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 55344834 - 55345022
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| || ||||||||||||||    
T  55344834 acataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgataagctatt 55344933  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  55344934 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacggggcct 55345022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 38071332 - 38071504
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38071332 acataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 38071428  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaat 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38071429 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053439
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16704005 - 16703821
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16704005 acataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 16703906  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||    |||| ||||||||||| |||||    
T  16703905 tttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc----taagtcaatccaaacgaggcct 16703821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 23269055 - 23269162
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269055 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 23269154  T
Q  101 tttattta 108  Q
    ||||||||    
T  23269155 tttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 191
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265956
Alignment:
Q  100 ttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 23265956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548343
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataa-gccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggccttagt 44548343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780838
Alignment:
Q  37 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttattta 112  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgattta 51780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 53408204 - 53408137
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccgga-gggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408204 acataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493327
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| ||||||  |||| || ||||||  ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    ||||||||||||| |  || ||||  |||||||||| |||||| |||  |||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcctaacatggcctta 17493327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 23261895 - 23261937
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261895 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Original strand, 9595973 - 9596031
Alignment:
Q  130 cagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9595973 cagcttatgagagtagataagcccacataaactc-aaataagccaatccaaacggggcct 9596031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 98
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  41 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 9595911 - 9595982
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595911 acataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 48748242 - 48748197
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  48748242 acataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 50055329 - 50055301
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagcc 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055329 acataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 6086620 - 6086808
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086620 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 6086719  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086720 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6086808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 26704360 - 26704552
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704360 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26704459  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26704460 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggccctagt 26704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 26946897 - 26947084
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946897 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26946996  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946997 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2837731 - 2837543
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2837731 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgataagctatt 2837632  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837631 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2837543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 3347544 - 3347734
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3347544 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 3347643  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347644 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 3347734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30692037 - 30691850
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692037 acataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 30691938  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30691937 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 30691850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 3955787 - 3955972
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3955787 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 3955886  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955887 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9459749 - 9459562
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459749 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 9459650  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459649 tttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 17261094 - 17261278
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17261094 acataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatattataagctatt 17261193  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17261194 tttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21893641 - 21893453
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893641 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 21893542  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21893541 tttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggcct 21893453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18613724 - 18613534
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18613724 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatgataagctgtt 18613625  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18613624 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctta 18613534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11167426 - 11167238
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167426 acataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 11167327  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||   | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167326 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 11167238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16307029 - 16307217
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16307029 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 16307128  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16307129 tttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 16307217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20726973 - 20726784
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20726973 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatt 20726874  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagtc 194  Q
    ||||    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20726873 ttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccatagtc 20726784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198282
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaa-agcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggcct 35198282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 34887313 - 34887496
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34887313 acataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 34887412  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34887413 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52834
Alignment:
Q  24 taagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacct 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  124 ttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1153779 - 1153603
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1153779 acataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatt 1153680  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 177  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1153679 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 28199529 - 28199714
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28199529 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatt 28199627  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagta---gataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28199628 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28199714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 30698950 - 30699132
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30698950 acataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatgataagctatt 30699049  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| | || |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  30699050 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 33464515 - 33464402
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33464515 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 33464416  T
Q  101 tttatttatttacc 114  Q
    |||| |||||||||    
T  33464415 tttacttatttacc 33464402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 53094 - 53001
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53094 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463698
Alignment:
Q  109 tttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 190  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 33463698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22972 - 23159
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22972 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 23071  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23072 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 33906068 - 33906260
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906068 acataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 33906167  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33906168 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaaacagggccttagt 33906260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 31517236 - 31517423
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31517236 acataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 31517335  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517336 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Original strand, 3873267 - 3873452
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3873267 ataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatt 3873366  T
Q  103 tatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3873367 tatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 26323207 - 26323398
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323207 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26323306  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttag 192  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26323307 tttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggccttag 26323398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1108463 - 1108274
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1108463 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatt 1108364  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1108363 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 1108274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 18806905 - 18807093
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806905 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 18807004  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807005 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18807093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 4232163 - 4232351
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232163 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 4232262  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4232263 tttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39635636 - 39635448
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39635636 acataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctata 39635537  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39635536 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggcct 39635448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 6174852 - 6175037
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6174852 taaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaaatattttt 6174951  T
Q  104 atttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6174952 atttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6175037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4016223 - 4016039
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4016223 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatacgttatt 4016124  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016123 tttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 1482924 - 1483106
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1482924 acataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataataagctatt 1483023  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1483024 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaaaacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5733582 - 5733395
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5733582 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgttt 5733483  T
Q  102 ttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  5733482 ttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggcct 5733395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 28329860 - 28330042
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28329860 acataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 28329957  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28329958 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42937904 - 42937715
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42937904 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactat 42937805  T
Q  100 ttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42937804 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 42937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 19901159 - 19901348
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19901159 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 19901258  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 191  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19901259 ttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 19901348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 30270700 - 30270892
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30270700 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 30270799  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    ||  |||||||| | |||||| |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30270800 ttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggccttagt 30270892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420373
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 30420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 2178790 - 2178978
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2178790 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 2178889  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  2178890 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggcct 2178978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 851181 - 850997
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |     
T  851181 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatgataagctcta 851082  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  851081 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaaacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16588797 - 16588985
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16588797 acattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatt 16588896  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||   |||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16588897 tttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacggagcct 16588985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 16066315 - 16066495
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066315 acataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16066414  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacag-cttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16066415 tttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 19383956 - 19384126
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  19383956 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatgataaactatt 19384055  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataag 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  || ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  19384056 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 430000 - 429817
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  430000 acataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataagctatt 429901  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  429900 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataagggaattcaaacgg 429817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 44947570 - 44947749
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44947570 acataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 44947662  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||  |||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  44947663 tttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaatacaaatggggc 44947749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446778
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    ||   ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaaacggggcct 42446778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585291
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagctt 135  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |  | ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  136 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 184  Q
    ||   ||| |||||  |||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101353
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggag 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||   ||| ||||||||||  ||||||   ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  143 tagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    |||||||  ||||||||  ||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  22101310 tagataa-accacataaattctgaataacccaattcaaacggggc 22101353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Original strand, 12517256 - 12517385
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagc 151  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||| |  || | |||||| ||||  | |||||||   |||||||||||    
T  12517256 gcttgttaaaatattgcttaagctgcttatgaaattaggataagctcttttaattaaggtatccaaacacttttaggaaagcttattttagtagataagc 12517355  T
Q  152 ccacataagctcaaaataagccaatccaaac 182  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12517356 tcacataagct-taaataagccaatccaaac 12517385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3894 - 3708
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3894 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3795  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 187  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3794 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 145266 - 145450
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145266 acataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 145365  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  145366 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27 - 215
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 126  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  127 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaatacaaacggggcct 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10422 - 10230
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10422 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatt 10323  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttagt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10322 tttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttagt 10230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 316 - 501
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  316 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 415  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  416 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 27 - 212
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatt 125  T
Q  101 tttatttatttacctaaacacctttaaaacagcttataggagta---gataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  126 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 1066
Alignment:
Q  161 ctcaaaataagccaatccaaacggggcct 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1094 ctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University