View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16978_low_2 (Length: 718)

Name: NF16978_low_2
Description: NF16978
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16978_low_2
NF16978_low_2
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-189)||(1108275-1108463)
chr2 (1-189)||(26323207-26323396)
chr2 (1-188)||(42937715-42937904)
chr2 (1-187)||(31517236-31517423)
chr2 (3-187)||(3873267-3873452)
chr2 (1-170)||(33906068-33906237)
chr2 (1-188)||(2178790-2178978)
chr2 (1-170)||(16066315-16066484)
chr2 (1-189)||(30270700-30270889)
chr2 (1-188)||(4232163-4232351)
chr2 (1-188)||(18806905-18807093)
chr2 (4-188)||(6174852-6175037)
chr2 (1-184)||(4016039-4016223)
chr2 (2-174)||(5733410-5733582)
chr2 (1-170)||(1482924-1483092)
chr2 (1-188)||(39635448-39635636)
chr2 (1-170)||(28329860-28330027)
chr2 (1-170)||(19383956-19384125)
chr2 (1-189)||(19901159-19901347)
chr2 (36-185)||(30420223-30420373)
chr2 (1-170)||(429831-430000)
chr2 (1-170)||(851012-851181)
chr2 (1-188)||(16588797-16588985)
chr2 (1-170)||(44947570-44947732)
chr2 (36-162)||(3585313-3585439)
chr2 (36-149)||(42446625-42446738)
chr2 (43-152)||(22101210-22101319)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-187)||(14422702-14422889)
chr8 (1-190)||(18594533-18594723)
chr8 (1-188)||(39206584-39206772)
chr8 (1-188)||(10836776-10836964)
chr8 (1-187)||(29938060-29938247)
chr8 (1-186)||(34842386-34842572)
chr8 (1-170)||(144411-144580)
chr8 (1-184)||(13110406-13110590)
chr8 (1-188)||(22260651-22260839)
chr8 (1-188)||(24113187-24113375)
chr8 (1-188)||(39218775-39218963)
chr8 (1-187)||(35118052-35118239)
chr8 (1-182)||(2042545-2042727)
chr8 (1-189)||(4035844-4036033)
chr8 (1-189)||(6144294-6144483)
chr8 (1-170)||(7774781-7774950)
chr8 (1-187)||(33278399-33278586)
chr8 (31-189)||(40117903-40118062)
chr8 (1-185)||(7791412-7791597)
chr8 (1-170)||(34679478-34679647)
chr8 (1-169)||(38167176-38167344)
chr8 (3-170)||(34998919-34999086)
chr8 (1-183)||(41575516-41575699)
chr8 (1-187)||(5320563-5320750)
chr8 (30-188)||(33287075-33287234)
chr8 (1-170)||(44804965-44805134)
chr8 (1-188)||(7811993-7812181)
chr8 (1-189)||(36491154-36491343)
chr8 (2-182)||(42571598-42571776)
chr8 (41-184)||(8021721-8021865)
chr8 (48-189)||(26783801-26783943)
chr8 (9-170)||(28639295-28639460)
chr8 (4-170)||(66203-66370)
chr8 (2-108)||(9807339-9807445)
chr8 (36-189)||(2322068-2322222)
chr8 (59-162)||(5005191-5005294)
chr8 (36-170)||(39220273-39220407)
chr8 (100-170)||(9806890-9806960)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-189)||(12101189-12101378)
chr7 (1-189)||(30181035-30181224)
chr7 (1-187)||(22649705-22649892)
chr7 (1-187)||(33359101-33359288)
chr7 (1-185)||(7164184-7164369)
chr7 (2-186)||(20346487-20346672)
chr7 (1-189)||(42965007-42965196)
chr7 (1-188)||(24792343-24792531)
chr7 (1-186)||(8630665-8630851)
chr7 (1-189)||(3511319-3511508)
chr7 (1-189)||(5280856-5281045)
chr7 (2-189)||(42204150-42204339)
chr7 (1-189)||(43067984-43068173)
chr7 (1-187)||(25748485-25748672)
chr7 (1-170)||(933301-933470)
chr7 (1-189)||(6394747-6394936)
chr7 (1-170)||(38866560-38866729)
chr7 (1-183)||(4477332-4477515)
chr7 (1-188)||(32041539-32041727)
chr7 (1-170)||(1803042-1803211)
chr7 (1-189)||(4347269-4347458)
chr7 (1-189)||(15655908-15656097)
chr7 (1-188)||(33846540-33846723)
chr7 (1-165)||(12097601-12097765)
chr7 (1-189)||(36890841-36891029)
chr7 (1-170)||(42673481-42673646)
chr7 (1-170)||(9452606-9452775)
chr7 (1-170)||(43156729-43156898)
chr7 (1-170)||(46134315-46134484)
chr7 (1-149)||(16894518-16894666)
chr7 (1-130)||(48865689-48865818)
chr7 (1-170)||(17753616-17753785)
chr7 (1-184)||(46891350-46891535)
chr7 (41-189)||(19828266-19828415)
chr7 (1-189)||(43021591-43021776)
chr7 (36-189)||(37005857-37006011)
chr7 (91-170)||(37704996-37705075)
chr7 (36-170)||(43405036-43405170)
chr7 (92-174)||(27691428-27691510)
chr7 (43-162)||(36849590-36849709)
chr7 (36-189)||(15655458-15655612)
chr7 (36-187)||(30075277-30075426)
chr7 (52-119)||(20163886-20163953)
chr7 (188-225)||(22851551-22851588)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (1-189)||(9008078-9008267)
chr5 (1-189)||(33491217-33491406)
chr5 (1-188)||(1579035-1579223)
chr5 (1-188)||(1605592-1605780)
chr5 (1-188)||(27679190-27679378)
chr5 (1-190)||(4120934-4121124)
chr5 (1-189)||(27420856-27421045)
chr5 (1-189)||(24105692-24105881)
chr5 (1-187)||(5202972-5203159)
chr5 (1-189)||(19358524-19358713)
chr5 (1-170)||(16069371-16069540)
chr5 (1-170)||(16737468-16737637)
chr5 (1-170)||(3386507-3386676)
chr5 (1-170)||(31883162-31883331)
chr5 (9-188)||(8374367-8374547)
chr5 (1-189)||(3921579-3921768)
chr5 (1-189)||(20992167-20992356)
chr5 (1-170)||(1165622-1165791)
chr5 (1-170)||(33991158-33991327)
chr5 (1-189)||(35782665-35782854)
chr5 (1-188)||(38598471-38598659)
chr5 (1-187)||(31410476-31410663)
chr5 (1-149)||(26602963-26603111)
chr5 (1-143)||(27025001-27025143)
chr5 (53-189)||(20992354-20992495)
chr5 (47-170)||(33284642-33284765)
chr5 (52-159)||(31638174-31638281)
chr5 (36-188)||(25634581-25634732)
chr5 (69-121)||(41818552-41818604)
chr5 (188-227)||(10585693-10585732)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (1-189)||(42307912-42308101)
chr3 (1-188)||(37698150-37698338)
chr3 (1-187)||(25999382-25999569)
chr3 (1-189)||(8042599-8042788)
chr3 (1-189)||(32244112-32244301)
chr3 (1-188)||(29445481-29445669)
chr3 (2-187)||(25494293-25494479)
chr3 (1-189)||(15520149-15520338)
chr3 (1-170)||(21581054-21581223)
chr3 (1-185)||(38856089-38856274)
chr3 (1-189)||(12117665-12117854)
chr3 (1-188)||(22174997-22175185)
chr3 (1-188)||(46452169-46452357)
chr3 (5-188)||(15520629-15520813)
chr3 (1-188)||(50528922-50529110)
chr3 (1-188)||(54870181-54870369)
chr3 (11-170)||(2895197-2895356)
chr3 (1-189)||(20842355-20842544)
chr3 (1-189)||(32359251-32359440)
chr3 (1-170)||(42104978-42105147)
chr3 (1-188)||(24835706-24835894)
chr3 (1-188)||(54534335-54534521)
chr3 (5-186)||(20699144-20699326)
chr3 (3-188)||(34700334-34700520)
chr3 (4-187)||(26122808-26122992)
chr3 (1-169)||(35226460-35226628)
chr3 (1-188)||(38933939-38934126)
chr3 (1-170)||(44609340-44609509)
chr3 (2-161)||(44688782-44688940)
chr3 (1-170)||(48925010-48925177)
chr3 (1-149)||(16354379-16354527)
chr3 (31-186)||(35643212-35643368)
chr3 (1-170)||(53028237-53028398)
chr3 (48-170)||(50529827-50529949)
chr3 (1-159)||(12915930-12916087)
chr3 (54-189)||(49128041-49128177)
chr3 (1-68)||(24366143-24366210)
chr3 (5-61)||(13696914-13696970)
chr3 (191-245)||(30600446-30600500)
chr3 (133-170)||(24366104-24366141)
chr3 (206-240)||(27456363-27456397)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-187)||(26704360-26704547)
chr6 (1-187)||(30691850-30692037)
chr6 (1-185)||(3955787-3955972)
chr6 (1-188)||(2837543-2837731)
chr6 (1-188)||(6086620-6086808)
chr6 (1-188)||(21893453-21893641)
chr6 (1-187)||(26946897-26947084)
chr6 (1-189)||(3347544-3347733)
chr6 (1-170)||(34887313-34887482)
chr6 (1-187)||(9459562-9459749)
chr6 (1-184)||(17261094-17261278)
chr6 (1-189)||(18613535-18613724)
chr6 (1-188)||(16307029-16307217)
chr6 (1-187)||(20726790-20726973)
chr6 (1-170)||(1153610-1153779)
chr6 (1-188)||(11167238-11167426)
chr6 (1-188)||(35198282-35198469)
chr6 (24-188)||(52834-52999)
chr6 (1-170)||(30698950-30699119)
chr6 (1-170)||(28199529-28199699)
chr6 (1-117)||(33464399-33464515)
chr6 (1-94)||(53001-53094)
chr6 (188-272)||(26259853-26259937)
chr6 (495-600)||(26259524-26259623)
chr6 (109-189)||(33463698-33463779)
chr6 (641-693)||(26259423-26259475)
chr6 (362-422)||(26259701-26259761)
chr6 (188-251)||(26590155-26590218)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (7-188)||(29288145-29288327)
chr1 (1-188)||(1168499-1168687)
chr1 (1-188)||(25897370-25897558)
chr1 (1-188)||(39260367-39260555)
chr1 (1-189)||(20089466-20089655)
chr1 (1-185)||(26663257-26663442)
chr1 (1-170)||(29078531-29078700)
chr1 (1-188)||(26580291-26580479)
chr1 (1-188)||(33510480-33510668)
chr1 (1-188)||(52753168-52753356)
chr1 (1-188)||(1940768-1940956)
chr1 (1-187)||(970545-970734)
chr1 (1-167)||(7145226-7145391)
chr1 (1-189)||(16052091-16052280)
chr1 (1-189)||(32671574-32671763)
chr1 (1-184)||(8079730-8079914)
chr1 (1-188)||(41928516-41928704)
chr1 (1-188)||(2347652-2347841)
chr1 (1-170)||(38829084-38829253)
chr1 (1-184)||(2473722-2473906)
chr1 (1-187)||(52696788-52696975)
chr1 (1-189)||(49146167-49146356)
chr1 (1-188)||(1170465-1170653)
chr1 (1-184)||(19715182-19715366)
chr1 (1-187)||(42370816-42371003)
chr1 (4-190)||(43905648-43905835)
chr1 (1-170)||(12682835-12683004)
chr1 (1-170)||(40092506-40092675)
chr1 (1-183)||(8120870-8121053)
chr1 (1-185)||(5215384-5215569)
chr1 (1-185)||(6765458-6765643)
chr1 (1-189)||(13996744-13996933)
chr1 (1-170)||(15203127-15203296)
chr1 (1-170)||(23498475-23498644)
chr1 (1-170)||(46760981-46761150)
chr1 (1-169)||(17587526-17587694)
chr1 (1-170)||(46409450-46409621)
chr1 (1-188)||(17591687-17591872)
chr1 (1-149)||(40149499-40149647)
chr1 (1-187)||(51359238-51359424)
chr1 (19-186)||(29695673-29695842)
chr1 (1-170)||(15717800-15717968)
chr1 (1-188)||(15554173-15554353)
chr1 (56-170)||(52086282-52086396)
chr1 (37-170)||(23322897-23323030)
chr1 (68-170)||(38171847-38171949)
chr1 (188-251)||(12542902-12542965)
chr1 (188-246)||(1848393-1848451)
chr1 (1-53)||(38171951-38172003)
chr1 (36-118)||(5217840-5217921)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (1-189)||(54189540-54189729)
chr4 (1-188)||(53717473-53717661)
chr4 (1-189)||(45424543-45424732)
chr4 (1-188)||(15241037-15241225)
chr4 (1-187)||(23776468-23776655)
chr4 (1-187)||(38055154-38055341)
chr4 (1-186)||(11639587-11639773)
chr4 (4-189)||(20877042-20877228)
chr4 (1-171)||(31969695-31969865)
chr4 (1-186)||(40428729-40428915)
chr4 (1-185)||(1756773-1756958)
chr4 (1-189)||(50353796-50353985)
chr4 (1-188)||(50055110-50055298)
chr4 (1-187)||(19913639-19913826)
chr4 (1-190)||(44784926-44785116)
chr4 (1-189)||(14987787-14987976)
chr4 (1-170)||(28032721-28032890)
chr4 (1-174)||(37968766-37968939)
chr4 (1-188)||(6611369-6611557)
chr4 (1-188)||(48909842-48910030)
chr4 (1-189)||(23704218-23704407)
chr4 (1-185)||(54412627-54412812)
chr4 (1-183)||(19164982-19165164)
chr4 (1-188)||(27488657-27488845)
chr4 (1-183)||(16700782-16700965)
chr4 (1-170)||(8591101-8591270)
chr4 (1-188)||(2481417-2481605)
chr4 (1-188)||(37464717-37464905)
chr4 (1-188)||(43289969-43290157)
chr4 (1-184)||(52139203-52139387)
chr4 (1-184)||(1617084-1617268)
chr4 (1-188)||(15669179-15669367)
chr4 (1-184)||(35490782-35490966)
chr4 (1-186)||(47632032-47632219)
chr4 (1-189)||(30423574-30423762)
chr4 (1-170)||(33703856-33704025)
chr4 (1-187)||(6688636-6688817)
chr4 (1-188)||(27536113-27536297)
chr4 (2-183)||(53875658-53875840)
chr4 (1-189)||(8932187-8932376)
chr4 (1-170)||(27583641-27583810)
chr4 (14-170)||(28360445-28360602)
chr4 (2-170)||(44379197-44379365)
chr4 (1-170)||(38071332-38071498)
chr4 (1-189)||(53353050-53353247)
chr4 (1-170)||(40680047-40680216)
chr4 (1-185)||(44375844-44376029)
chr4 (36-188)||(50053439-50053592)
chr4 (1-170)||(55344834-55345003)
chr4 (3-183)||(30171581-30171762)
chr4 (1-163)||(16703843-16704005)
chr4 (1-108)||(23269055-23269162)
chr4 (37-119)||(51780763-51780845)
chr4 (100-189)||(23265865-23265955)
chr4 (36-170)||(44548185-44548319)
chr4 (1-67)||(53408137-53408204)
chr4 (36-148)||(17493370-17493482)
chr4 (1-43)||(23261895-23261937)
chr4 (52-170)||(46257269-46257387)
chr4 (41-94)||(55344724-55344777)
chr4 (47-83)||(9595946-9595982)
chr4 (1-46)||(48748197-48748242)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-188)||(36701-36889)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-187)||(22972-23159)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (1-186)||(3708-3894)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-189)||(10233-10422)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-165)||(27-191)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-185)||(316-501)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-170)||(145266-145435)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-170)||(27-197)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (188-253)||(20640-20705)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1108463 - 1108275
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1108463 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatt 1108364  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaaccatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1108363 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggcctt 1108275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 26323207 - 26323396
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26323207 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26323306  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26323307 tttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcctt 26323396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42937904 - 42937715
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937904 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactat 42937805  T
Q  100 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  42937804 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 42937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 31517236 - 31517423
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31517236 acataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 31517335  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31517336 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 3873267 - 3873452
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3873267 ataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatt 3873366  T
Q  103 tatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  3873367 tatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 33906068 - 33906237
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33906068 acataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 33906167  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33906168 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataa 33906237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 2178790 - 2178978
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  2178790 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 2178889  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||  |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||    
T  2178890 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggcct 2178978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 16066315 - 16066484
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16066315 acataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16066414  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16066415 tttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataa 16066484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 30270700 - 30270889
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30270700 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 30270799  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  30270800 ttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggcctt 30270889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 4232163 - 4232351
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4232163 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 4232262  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4232263 tttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 18806905 - 18807093
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18806905 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 18807004  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18807005 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18807093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 6174852 - 6175037
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattttt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6174852 taaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaaatattttt 6174951  T
Q  104 atttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6174952 atttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6175037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4016223 - 4016039
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  4016223 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatacgttatt 4016124  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4016123 tttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5733582 - 5733410
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  5733582 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgttt 5733483  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacca 174  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5733482 ttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaacca 5733410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 1482924 - 1483092
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  1482924 acataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataataagctatt 1483023  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1483024 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataa 1483092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39635636 - 39635448
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  39635636 acataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctata 39635537  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaac-catccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  39635536 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggcct 39635448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 28329860 - 28330027
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28329860 acataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 28329957  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28329958 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataa 28330027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 19383956 - 19384125
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19383956 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatgataaactatt 19384055  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | || |||| ||||||||||    
T  19384056 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataa 19384125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 19901159 - 19901347
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19901159 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 19901258  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19901259 ttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 19901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 185
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420373
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 30420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 430000 - 429831
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  430000 acataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataagctatt 429901  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  429900 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataa 429831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 851181 - 851012
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |     
T  851181 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatgataagctcta 851082  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  851081 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataa 851012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 16588797 - 16588985
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16588797 acattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatt 16588896  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||    
T  16588897 tttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacggagcct 16588985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 44947570 - 44947732
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947570 acataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 44947662  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44947663 tttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataa 44947732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585313
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||  ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagct 162  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagct 3585313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 149
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446738
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  136 atgggagtagataa 149  Q
    |||  |||||||||    
T  42446725 atgttagtagataa 42446738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101319
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggag 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| |||||  |||| || ||||||||| ||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  143 tagataaacc 152  Q
    ||||||||||    
T  22101310 tagataaacc 22101319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14422889 - 14422702
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14422889 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 14422790  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14422789 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18594723 - 18594533
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18594723 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 18594624  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggccttg 190  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18594623 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttg 18594533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39206772 - 39206584
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39206772 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 39206673  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39206672 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 10836776 - 10836964
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10836776 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatt 10836875  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  10836876 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 10836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29938247 - 29938060
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29938247 acataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 29938148  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29938147 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 34842386 - 34842572
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842386 acataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 34842485  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  34842486 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 144580 - 144411
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144580 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 144481  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  144480 tttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataa 144411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13110590 - 13110406
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13110590 acataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatgataagctatt 13110491  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13110490 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22260651 - 22260839
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22260651 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaggataagctatt 22260750  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22260751 tttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 24113187 - 24113375
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24113187 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctgtt 24113286  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  24113287 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 24113375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39218963 - 39218775
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  39218963 acataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatgataaaccatt 39218864  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39218863 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39218775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 35118052 - 35118239
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35118052 acataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35118151  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35118152 tttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 2042545 - 2042727
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  2042545 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 2042644  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacg 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2042645 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4036033 - 4035844
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4036033 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 4035934  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4035933 tttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggcctt 4035844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 6144294 - 6144483
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6144294 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 6144393  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  6144394 tttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 6144483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7774950 - 7774781
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7774950 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 7774851  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7774850 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataa 7774781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33278586 - 33278399
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278586 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 33278487  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  33278486 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118062
Alignment:
Q  31 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  131 gtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 40118062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7791597 - 7791412
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7791597 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 7791498  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  7791497 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 34679478 - 34679647
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34679478 acataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatt 34679577  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34679578 tttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 34679647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 38167176 - 38167344
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38167176 acataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactagt 38167275  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38167276 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaata 38167344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Original strand, 34998919 - 34999086
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34998919 ataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaagataagctatttt 34999018  T
Q  103 tatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34999019 tatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataa 34999086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41575699 - 41575516
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41575699 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagcaatt 41575600  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 183  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41575599 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5320750 - 5320563
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5320750 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatgataaattatt 5320651  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5320650 tttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 33287075 - 33287234
Alignment:
Q  30 agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33287075 agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 33287174  T
Q  130 agtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcct 188  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  33287175 aagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 33287234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 44804965 - 44805134
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44804965 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 44805064  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44805065 tttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataa 44805134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7812181 - 7811993
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7812181 acataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 7812082  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  7812081 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggcct 7811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36491343 - 36491154
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||    
T  36491343 acataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataagctgtt 36491244  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  36491243 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaatggggcctt 36491154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 42571776 - 42571598
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42571776 cataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattt 42571679  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacg 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42571678 ttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8021865 - 8021721
Alignment:
Q  41 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatggg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  8021865 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatggg 8021766  T
Q  141 agtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8021765 agtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8021721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 189
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783943
Alignment:
Q  48 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  148 aaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcctt 26783943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28639460 - 28639295
Alignment:
Q  9 tcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 108  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639460 tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 28639361  T
Q  109 tttacccaaacacttttaaaaagtct----tatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||    ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  28639360 tttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataa 28639295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Original strand, 66203 - 66370
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtc-agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  66203 taaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactattataagttatttt 66302  T
Q  103 tatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||    
T  66303 tatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataa 66370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9807445 - 9807339
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9807445 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatgataagctattt 9807346  T
Q  102 ttattta 108  Q
    |||||||    
T  9807345 ttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322222
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||  |||||||||| ||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcctt 2322222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005191
Alignment:
Q  59 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 158  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  159 agct 162  Q
    ||||    
T  5005194 agct 5005191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220273
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||  ||||||||   || |||||||||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataa 39220273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806890
Alignment:
Q  100 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataa 9806890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 12101189 - 12101378
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12101189 acataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 12101288  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12101289 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaatggggcctt 12101378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 30181035 - 30181224
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30181035 acataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 30181134  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30181135 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 30181224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22649705 - 22649892
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22649705 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataaactatt 22649804  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22649805 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 33359101 - 33359288
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33359101 acataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 33359200  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33359201 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7164369 - 7164184
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7164369 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 7164270  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7164269 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20346672 - 20346487
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20346672 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctattt 20346573  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20346572 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 42965007 - 42965196
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42965007 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 42965106  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  42965107 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaaggggcctt 42965196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 24792343 - 24792531
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24792343 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 24792442  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  24792443 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 24792531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8630851 - 8630665
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630851 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 8630752  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaac-catccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  8630751 tttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3511508 - 3511319
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3511508 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3511409  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  3511408 tttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacgggacctt 3511319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5281045 - 5280856
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5281045 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 5280946  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  5280945 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 5280856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42204339 - 42204150
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42204339 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 42204240  T
Q  102 ttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42204239 ttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 42204150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 43067984 - 43068173
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43067984 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatgataagctatt 43068083  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  43068084 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 43068173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25748672 - 25748485
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25748672 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 25748573  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  25748572 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 933470 - 933301
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933470 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 933371  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  933370 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataa 933301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6394936 - 6394747
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6394936 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatt 6394837  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  6394836 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggcctt 6394747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38866729 - 38866560
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38866729 acataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataaactatt 38866630  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866629 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 38866560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 4477332 - 4477515
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4477332 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatt 4477431  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4477432 tttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32041727 - 32041539
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32041727 acataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 32041628  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  32041627 tttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 32041539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1803211 - 1803042
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1803211 acataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgataagctatt 1803112  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1803111 tttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 1803042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4347458 - 4347269
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4347458 acataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctatt 4347359  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  4347358 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcctt 4347269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15656097 - 15655908
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15656097 acataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 15655998  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15655997 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 15655908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 33846540 - 33846723
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33846540 acataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataagctatt 33846634  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33846635 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33846723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 12097601 - 12097765
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12097601 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatgataatctatt 12097700  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  12097701 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaa 12097765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 36890841 - 36891029
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36890841 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 36890940  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaaccatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |  | ||||||||||||||||    
T  36890941 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaataagtcaatccaaacggggcctt 36891029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42673646 - 42673481
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  42673646 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 42673547  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
        ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42673546 ----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataa 42673481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9452775 - 9452606
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9452775 acataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatgataaactatt 9452676  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||   ||||||||||||||||||    
T  9452675 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataa 9452606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43156898 - 43156729
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43156898 acataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatgataagctatt 43156799  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43156798 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa 43156729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 46134315 - 46134484
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46134315 acataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataaactatt 46134414  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46134415 tttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataa 46134484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 16894518 - 16894666
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894518 acataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 16894617  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 149  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16894618 tttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 16894666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 48865818 - 48865689
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865818 acataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 48865719  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48865718 tttatttatttacccaaacacctttaaaaa 48865689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17753785 - 17753616
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17753785 acataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgttaagctatt 17753686  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||    
T  17753685 tttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataa 17753616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 46891350 - 46891535
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  46891350 acataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgacaaactatt 46891449  T
Q  101 tttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46891450 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828266
Alignment:
Q  41 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatggg 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  141 agtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcctt 19828266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 43021591 - 43021776
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  43021591 acataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataataagttatt 43021686  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43021687 tttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaatggggcctt 43021776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006011
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    || | ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagcctt 37006011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704996
Alignment:
Q  91 ataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 37704996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405036
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    || ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataa 43405036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 174
Target Start/End: Original strand, 27691428 - 27691510
Alignment:
Q  92 taaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacca 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  27691428 taaaatatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaacca 27691510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 162
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849709
Alignment:
Q  43 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggag 142  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  143 tagataaacccacataagct 162  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagct 36849709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655612
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||  |||||| || | |||||||| | | ||||| || ||||||||| ||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcctt 15655612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 187
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075426
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||   | | ||| | |||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 187  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 119  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Original strand, 22851551 - 22851588
Alignment:
Q  188 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaa 225  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22851551 ttgaactccctttagtaacatcacgtgataaattctaa 22851588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 9008078 - 9008267
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9008078 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 9008177  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9008178 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 9008267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 33491217 - 33491406
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33491217 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgataagctatt 33491316  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33491317 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 33491406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1579223 - 1579035
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579223 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 1579124  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1579123 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1579035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1605592 - 1605780
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605592 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 1605691  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1605692 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1605780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27679190 - 27679378
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27679190 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 27679289  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27679290 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27679378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4121124 - 4120934
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4121124 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaattatt 4121025  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacca-tccaaacggggccttg 190  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4121024 tttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacggggccttg 4120934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27421045 - 27420856
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421045 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 27420946  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27420945 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 27420856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 24105692 - 24105881
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24105692 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 24105791  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  24105792 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcctt 24105881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5203159 - 5202972
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5203159 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 5203060  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5203059 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19358713 - 19358524
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19358713 acataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 19358614  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  19358613 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctt 19358524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16069540 - 16069371
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16069540 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16069441  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16069440 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataa 16069371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 16737468 - 16737637
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16737468 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16737567  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16737568 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 16737637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 3386507 - 3386676
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3386507 acataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3386606  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3386607 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataa 3386676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31883331 - 31883162
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883331 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 31883232  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31883231 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataa 31883162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Original strand, 8374367 - 8374547
Alignment:
Q  9 tcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374367 tcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 8374466  T
Q  109 tttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  8374467 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggcct 8374547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3921768 - 3921579
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3921768 acataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3921669  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  3921668 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgggacctt 3921579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 20992167 - 20992356
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  20992167 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgctatt 20992266  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  20992267 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctt 20992356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 1165622 - 1165791
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1165622 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataagctatt 1165721  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1165722 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataa 1165791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33991327 - 33991158
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33991327 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 33991228  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  33991227 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataa 33991158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 35782665 - 35782854
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35782665 acataaattcataagctccttgtaagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35782764  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  35782765 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctt 35782854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 38598471 - 38598659
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38598471 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 38598570  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  38598571 tttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaaccgggcct 38598659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31410663 - 31410476
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31410663 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatgataagctatt 31410564  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  31410563 tttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgcggcc 31410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 26602963 - 26603111
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26602963 acataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 26603062  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26603063 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 26603111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27025143 - 27025001
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27025143 acataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 27025044  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagt 143  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27025043 tttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992495
Alignment:
Q  53 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  153 c----acataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctt 20992495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 170
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284765
Alignment:
Q  47 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtaga 146  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  147 taaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||| |||| |||||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataa 33284765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638174
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaac 151  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||| |    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  152 ccacataa 159  Q
     |||||||    
T  31638181 tcacataa 31638174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634581
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||||||||   ||| |||   |||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||  ||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcct 25634581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818604
Alignment:
Q  69 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacac 121  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacac 41818604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10585732 - 10585693
Alignment:
Q  188 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaat 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10585732 ttgaactccctttaataacatcacatgataaattctaaat 10585693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 42307912 - 42308101
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42307912 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 42308011  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42308012 tttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 42308101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 37698150 - 37698338
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37698150 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 37698249  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37698250 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 37698338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25999569 - 25999382
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25999569 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 25999470  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25999469 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8042788 - 8042599
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042788 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 8042689  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8042688 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggcctt 8042599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32244301 - 32244112
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244301 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 32244202  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  32244201 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 32244112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29445669 - 29445481
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29445669 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 29445570  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29445569 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 29445481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 25494293 - 25494479
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25494293 cataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattt 25494392  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  25494393 ttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 15520149 - 15520338
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  15520149 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataagttatt 15520248  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15520249 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 15520338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21581223 - 21581054
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21581223 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatt 21581124  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21581123 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 21581054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38856274 - 38856089
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38856274 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 38856175  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38856174 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 12117665 - 12117854
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12117665 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatt 12117764  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  12117765 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctt 12117854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22174997 - 22175185
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22174997 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 22175096  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22175097 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 46452169 - 46452357
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46452169 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatt 46452268  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  46452269 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15520813 - 15520629
Alignment:
Q  5 aaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattttta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  15520813 aaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttg 15520714  T
Q  105 tttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15520713 tttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15520629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 50529110 - 50528922
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  50529110 acataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 50529011  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50529010 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 54870181 - 54870369
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54870181 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgataagctatt 54870280  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  54870281 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcct 54870369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2895356 - 2895197
Alignment:
Q  11 ataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  2895356 ataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatt 2895257  T
Q  111 tacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895256 tacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataa 2895197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 20842355 - 20842544
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  20842355 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatgataagttgtt 20842454  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20842455 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 20842544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32359440 - 32359251
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359440 acataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 32359341  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  32359340 tttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 32359251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 42104978 - 42105147
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42104978 acataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 42105077  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42105078 tttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 42105147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 24835706 - 24835894
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24835706 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatt 24835805  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24835806 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggcct 24835894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 54534335 - 54534521
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  54534335 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatgataagctatt 54534432  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  54534433 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54534521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20699326 - 20699144
Alignment:
Q  5 aaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattttta 104  Q
    |||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  20699326 aaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttg 20699227  T
Q  105 tttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20699226 tttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34700520 - 34700334
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttt 102  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34700520 ataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 34700421  T
Q  103 tatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34700420 tatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggcct 34700334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26122992 - 26122808
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattttt 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26122992 taaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 26122893  T
Q  104 atttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  26122892 atttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35226628 - 35226460
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  35226628 acataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgat 35226529  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35226528 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaata 35226460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38934126 - 38933939
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  38934126 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 38934027  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38934026 tttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagat-aagccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 38933939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 44609340 - 44609509
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  44609340 acataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 44609439  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44609440 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataa 44609509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44688940 - 44688782
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattt 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44688940 cataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatgataagctattt 44688842  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagc 161  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44688841 ttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 48925010 - 48925177
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48925010 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataaactatt 48925109  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  48925110 tttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataa 48925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16354527 - 16354379
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16354527 acataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgataagttatt 16354428  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  16354427 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35643368 - 35643212
Alignment:
Q  31 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  35643368 gagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaa 35643269  T
Q  131 gtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggc 186  Q
    | ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  35643268 ggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 53028398 - 53028237
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  53028398 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgataagctatt 53028299  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||        | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53028298 tttatttatttacc--------tctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa 53028237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 170
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529949
Alignment:
Q  48 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  148 aaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||  |||||||| ||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataa 50529949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12916087 - 12915930
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12916087 acataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatgataaactatt 12915988  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataa 159  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||    
T  12915987 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128041
Alignment:
Q  54 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaaccc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  154 acataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcctt 49128041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 24366210 - 24366143
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366210 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13696970 - 13696914
Alignment:
Q  5 aaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696970 aaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 245
Target Start/End: Original strand, 30600446 - 30600500
Alignment:
Q  191 aactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaa 245  Q
    ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30600446 aactccctttactaaaatcatgtgataaattctaaataggccaacaaagaactaa 30600500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24366141 - 24366104
Alignment:
Q  133 cttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24366141 cttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataa 24366104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27456397 - 27456363
Alignment:
Q  206 catcacgtgataaattctaaatgggccaacaaaga 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27456397 catcgcgtgataaattctaaatgggccaacaaaga 27456363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26704360 - 26704547
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26704360 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26704459  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26704460 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30692037 - 30691850
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30692037 acataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 30691938  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  30691937 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 30691850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 3955787 - 3955972
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3955787 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 3955886  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3955887 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2837731 - 2837543
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2837731 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgataagctatt 2837632  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2837631 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2837543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 6086620 - 6086808
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6086620 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 6086719  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6086720 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6086808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21893641 - 21893453
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21893641 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 21893542  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaacggggcct 188  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21893541 tttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggcct 21893453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26946897 - 26947084
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26946897 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26946996  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26946997 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 3347544 - 3347733
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3347544 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 3347643  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3347644 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 3347733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 34887313 - 34887482
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34887313 acataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 34887412  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34887413 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataa 34887482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9459749 - 9459562
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9459749 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 9459650  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  9459649 tttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 17261094 - 17261278
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  17261094 acataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatattataagctatt 17261193  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17261194 tttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18613724 - 18613535
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  18613724 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatgataagctgtt 18613625  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18613624 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 18613535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 16307029 - 16307217
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16307029 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 16307128  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16307129 tttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 16307217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20726973 - 20726790
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20726973 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatt 20726874  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20726873 ttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1153779 - 1153610
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1153779 acataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatt 1153680  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  1153679 tttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataa 1153610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11167426 - 11167238
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11167426 acataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 11167327  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  | || |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11167326 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 11167238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198282
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaaag-cttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggcct 35198282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52834
Alignment:
Q  24 taagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacactt 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  124 ttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 30698950 - 30699119
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  30698950 acataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatgataagctatt 30699049  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | || |||| | ||||||| |||| |||||    
T  30699050 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataa 30699119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 28199529 - 28199699
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28199529 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatt 28199627  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagta---gataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  28199628 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataa 28199699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 33464515 - 33464399
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464515 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 33464416  T
Q  101 tttatttatttacccaa 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  33464415 tttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 53094 - 53001
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53094 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26259937 - 26259853
Alignment:
Q  188 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaacctttaatatatttttaagcttttgt 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26259937 ttgaactccctttagtgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaacctttaatatatttttaagcttttgt 26259853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 495 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 26259623 - 26259524
Alignment:
Q  495 gcttatttggttttgacatcttttatctatatctatatctatagtatataacaaaccaactaactttttatttattgaggatatgtaggaattgcaatta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26259623 gcttatttggttttgacatcttttatctatatctata------gtatataacaaaccagctaactttttatttattgaggatatgtaggaattgcaatta 26259530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463698
Alignment:
Q  109 tttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 33463698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 641 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 26259475 - 26259423
Alignment:
Q  641 gttgtagcgtgtggggttgtgggatcgcataaaacataatacgattatagcta 693  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26259475 gttgcagcgtgtggggttgtgggatcgcataaaacataatacgattatagcta 26259423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26259761 - 26259701
Alignment:
Q  362 aaggatggccgccttcttcaccttgcctcagataaggcttgggtatctggcttcatggcag 422  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26259761 aaggacggtcgccttcttcaccttacctcagataaggcttgggtatctggcttcttggcag 26259701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26590218 - 26590155
Alignment:
Q  188 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaaccttt 251  Q
    ||||||| |||||| | | |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26590218 ttgaacttcctttagtaatatcaagtgataaattttaaatggaccaacaaataactaaaccttt 26590155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29288327 - 29288145
Alignment:
Q  7 attcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288327 attcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatt 29288228  T
Q  107 tatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  29288227 tatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 29288145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1168687 - 1168499
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1168687 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 1168588  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1168587 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1168499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25897558 - 25897370
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25897558 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 25897459  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  25897458 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 25897370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 39260367 - 39260555
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39260367 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 39260466  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39260467 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39260555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20089655 - 20089466
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20089655 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 20089556  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20089555 tttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 20089466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26663442 - 26663257
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26663442 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 26663343  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26663342 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29078700 - 29078531
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29078700 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 29078601  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29078600 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 29078531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 26580291 - 26580479
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26580291 acataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 26580390  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26580391 tttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 26580479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33510668 - 33510480
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510668 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 33510569  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33510568 tttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33510480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 52753168 - 52753356
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  52753168 acataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatt 52753267  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52753268 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52753356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1940768 - 1940956
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  1940768 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatgataagctatt 1940867  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1940868 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1940956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 970545 - 970734
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac--tatgataaacta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  970545 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatatgataatcta 970644  T
Q  99 tttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  970645 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7145391 - 7145226
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145391 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 7145292  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaa 167  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7145291 tttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaa 7145226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16052280 - 16052091
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16052280 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 16052181  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16052180 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcctt 16052091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32671763 - 32671574
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32671763 acataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatt 32671664  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32671663 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 32671574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 8079730 - 8079914
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8079730 acataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatt 8079829  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8079830 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 41928516 - 41928704
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928516 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 41928615  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  41928616 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggcct 41928704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2347841 - 2347652
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347841 acataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactat 2347742  T
Q  100 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaac-catccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2347741 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggcct 2347652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38829253 - 38829084
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38829253 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgataagctatt 38829154  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38829153 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataa 38829084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2473906 - 2473722
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2473906 acataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataataagctatt 2473807  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2473806 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52696975 - 52696788
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  52696975 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 52696876  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  52696875 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 49146356 - 49146167
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49146356 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 49146257  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  49146256 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggagcctt 49146167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1170465 - 1170653
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1170465 acataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 1170564  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1170565 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 19715182 - 19715366
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19715182 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgataagctatt 19715281  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19715282 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 42370816 - 42371003
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  42370816 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttttt 42370915  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  42370916 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43905835 - 43905648
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattttt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43905835 taaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 43905736  T
Q  104 atttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggccttg 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  43905735 atttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggagccttg 43905648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12683004 - 12682835
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12683004 acataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 12682905  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12682904 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataa 12682835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40092675 - 40092506
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40092675 acataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagatatt 40092576  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  40092575 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataa 40092506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8121053 - 8120870
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8121053 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 8120954  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8120953 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5215569 - 5215384
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5215569 acataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 5215470  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5215469 tttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6765643 - 6765458
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6765643 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgataaactatt 6765544  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  6765543 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 6765458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 13996744 - 13996933
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  13996744 acataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataagctatt 13996843  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  13996844 tttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaacagggcctt 13996933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15203296 - 15203127
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15203296 acataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatt 15203197  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15203196 tttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataa 15203127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23498644 - 23498475
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23498644 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatgaactatt 23498545  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23498544 tttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataa 23498475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46761150 - 46760981
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  46761150 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatt 46761051  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  46761050 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataa 46760981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 17587526 - 17587694
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  17587526 acataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatgataagctgtt 17587625  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 169  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  17587626 tttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46409621 - 46409450
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaa--gtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaacta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46409621 acataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 46409522  T
Q  99 tttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  46409521 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataa 46409450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17591872 - 17591687
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17591872 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 17591773  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  17591772 tttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagat-aagccacataagctc--aataagccaatccaaacggggcct 17591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 40149647 - 40149499
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40149647 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgataaattatt 40149548  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40149547 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 40149499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 51359238 - 51359424
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  51359238 acataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatgataagctatt 51359337  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51359338 tttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  19 cttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  119 cacttttaaaaagtc-ttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 186  Q
    ||| ||||||||    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15717968 - 15717800
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15717968 acataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga-aagctatt 15717870  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||  || |||||| ||||||||||    
T  15717869 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataa 15717800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 15554173 - 15554353
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||     |||||    
T  15554173 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa---atg-----ctatt 15554264  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  15554265 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 15554353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086282
Alignment:
Q  56 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccac 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  156 ataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||| |||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataa 52086282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323030
Alignment:
Q  37 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctta 136  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| | || |||||   |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  137 tgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataa 23323030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38171949 - 38171847
Alignment:
Q  68 cataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||   |||||||  ||||||    
T  38171949 cataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaa 38171850  T
Q  168 taa 170  Q
    |||    
T  38171849 taa 38171847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12542965 - 12542902
Alignment:
Q  188 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaaccttt 251  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12542965 ttgaactcccttaaaaaacatcacgtgataaattttaaatggaccaacaaagaactaagccttt 12542902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Original strand, 1848393 - 1848451
Alignment:
Q  188 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaa 246  Q
    |||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1848393 ttgagctccctttaaaaatatcaggtgataaattctaaatgggccaacaatgaactaaa 1848451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 38172003 - 38171951
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggc 53  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  38172003 acataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggc 38171951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217921
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaa 118  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaa 5217921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54189729 - 54189540
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54189729 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 54189630  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  54189629 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 54189540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 53717473 - 53717661
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53717473 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 53717572  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  53717573 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 53717661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 45424543 - 45424732
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424543 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 45424642  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  45424643 tttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 45424732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 15241037 - 15241225
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15241037 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 15241136  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  15241137 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 23776468 - 23776655
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23776468 acataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 23776567  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23776568 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38055341 - 38055154
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38055341 acataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaaatatt 38055242  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  38055241 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 11639587 - 11639773
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11639587 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 11639686  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11639687 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20877228 - 20877042
Alignment:
Q  4 taaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattttt 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877228 taaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactattttt 20877129  T
Q  104 atttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20877128 atttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 20877042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31969865 - 31969695
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969865 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 31969766  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31969765 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaa 31969695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 40428729 - 40428915
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40428729 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatt 40428828  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  40428829 tttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 1756773 - 1756958
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1756773 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatt 1756872  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1756873 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 50353985 - 50353796
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  50353985 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatcataagctatt 50353886  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  50353885 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 50353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 50055110 - 50055298
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50055110 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatt 50055209  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50055210 ttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50055298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 19913639 - 19913826
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  19913639 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 19913738  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19913739 ttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 44784926 - 44785116
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44784926 acataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 44785025  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggccttg 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44785026 tttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttg 44785116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14987976 - 14987787
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14987976 acataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 14987877  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14987876 tttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 14987787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 28032721 - 28032890
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28032721 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatgataagctatt 28032820  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28032821 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 28032890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 37968766 - 37968939
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37968766 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 37968865  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacca 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37968866 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaacca 37968939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 6611369 - 6611557
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6611369 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataagctatt 6611468  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6611469 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 6611557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 48910030 - 48909842
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48910030 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 48909931  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  48909930 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 48909842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 23704218 - 23704407
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704218 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 23704317  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  23704318 tttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctt 23704407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 54412812 - 54412627
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54412812 acataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 54412713  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  54412712 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 19164982 - 19165164
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19164982 acataaattcataagctccttgttaagcc-gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 19165079  T
Q  101 tttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19165080 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27488657 - 27488845
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27488657 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 27488756  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27488757 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 27488845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16700965 - 16700782
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16700965 acataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 16700866  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16700865 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 8591101 - 8591270
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8591101 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 8591200  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8591201 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataa 8591270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 2481417 - 2481605
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  2481417 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 2481516  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2481517 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2481605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37464905 - 37464717
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37464905 acataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactgtt 37464806  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  37464805 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 43289969 - 43290157
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43289969 acataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 43290068  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || | ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  43290069 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 43290157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 52139387 - 52139203
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52139387 acataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 52139288  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  52139287 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1617268 - 1617084
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1617268 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttatt 1617169  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1617168 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15669367 - 15669179
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15669367 acataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtt 15669268  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15669267 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 35490782 - 35490966
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35490782 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatt 35490881  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 184  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35490882 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47632219 - 47632032
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47632219 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgagaagctatt 47632120  T
Q  101 tttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  47632119 tttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 30423574 - 30423762
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30423574 acataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 30423672  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  30423673 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacgggacctt 30423762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33704025 - 33703856
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  33704025 acataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtt 33703926  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33703925 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataa 33703856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 6688636 - 6688817
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||    
T  6688636 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatgataagctatt 6688729  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  6688730 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27536113 - 27536297
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27536113 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatt 27536212  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    ||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27536213 tttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 53875840 - 53875658
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  53875840 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatgataagctattt 53875741  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  53875740 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 8932187 - 8932376
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  8932187 acataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgttaagctatt 8932286  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8932287 tttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 8932376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 27583641 - 27583810
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  27583641 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatgataagttatt 27583740  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27583741 tttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataa 27583810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360445
Alignment:
Q  14 agctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttattta 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  113 cccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataa 28360445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Original strand, 44379197 - 44379365
Alignment:
Q  2 cataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactattt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44379197 cataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactattt 44379296  T
Q  102 ttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| || | |||| ||||||||||    
T  44379297 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataa 44379365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 38071332 - 38071498
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071332 acataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 38071428  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38071429 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 38071498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 53353247 - 53353050
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaac 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53353247 acataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 53353148  T
Q  97 tatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccaca----taagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| |    |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53353147 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 53353050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 40680047 - 40680216
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40680047 acataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 40680146  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||    
T  40680147 tttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataa 40680216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44376029 - 44375844
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44376029 acataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataaactatt 44375930  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||    ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  44375929 tttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053439
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 55344834 - 55345003
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| || |||||||| |||||    
T  55344834 acataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgataagctatt 55344933  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344934 tttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataa 55345003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30171762 - 30171581
Alignment:
Q  3 ataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30171762 ataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatttt 30171663  T
Q  103 tatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 183  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30171662 catttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16704005 - 16703843
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16704005 acataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 16703906  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctc 163  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  16703905 tttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 23269055 - 23269162
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23269055 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 23269154  T
Q  101 tttattta 108  Q
    ||||||||    
T  23269155 tttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 119
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  37 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 119  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265955
Alignment:
Q  100 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 23265955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 170
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548319
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  136 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataa 44548319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 53408204 - 53408137
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcaga-gggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408204 acataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493370
Alignment:
Q  36 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 135  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  |||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  136 atgggagtagata 148  Q
    || ||||||||||    
T  17493382 ataggagtagata 17493370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 23261895 - 23261937
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctga 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23261895 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 170
Target Start/End: Original strand, 46257269 - 46257387
Alignment:
Q  52 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaac 151  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||  ||||||  |||||||||||    
T  46257269 gcttattaaactatagaataaacagcttatgaaattgtgataaactctttcaattgatttacccaaacaattttgtaaatgcttatgtcagtagataaac 46257368  T
Q  152 ccacataagctcaaaataa 170  Q
      |||||| || |||||||    
T  46257369 ttacataaacttaaaataa 46257387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 94
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344777
Alignment:
Q  41 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataa 55344777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 83
Target Start/End: Original strand, 9595946 - 9595982
Alignment:
Q  47 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 83  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595946 tttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 48748242 - 48748197
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  48748242 acataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36889 - 36701
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36889 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 36790  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36789 tttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 36701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22972 - 23159
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22972 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 23071  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23072 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3894 - 3708
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3894 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 3795  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3794 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10422 - 10233
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10422 acataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatt 10323  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  10322 tttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 10233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 27 - 191
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 126  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  127 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaa 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 316 - 501
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  316 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatt 415  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  416 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 145266 - 145435
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  145266 acataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatt 145365  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  145366 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataa 145435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 27 - 197
Alignment:
Q  1 acataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatt 125  T
Q  101 tttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagta---gataaacccacataagctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  126 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataa 197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 253
Target Start/End: Original strand, 20640 - 20705
Alignment:
Q  188 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaacctttaa 253  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  20640 ttgaattccctttagtaacaccacatgataaattctaaattggccaacaaagatataaacttttaa 20705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University