View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16991_low_7 (Length: 612)

Name: NF16991_low_7
Description: NF16991
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16991_low_7
NF16991_low_7
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (1-596)||(34231827-34232422)
chr5 (1-568)||(34239579-34240137)
chr5 (43-499)||(42129461-42129914)
chr5 (91-498)||(41712663-41713070)
chr5 (174-371)||(41571205-41571402)
chr5 (42-276)||(42124306-42124540)
chr5 (181-281)||(41432339-41432439)
chr5 (425-507)||(41571459-41571541)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (41-559)||(12249003-12249515)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (27-499)||(8523613-8524085)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (43-355)||(25522086-25522398)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (179-272)||(11118949-11119042)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 568; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 596
Target Start/End: Original strand, 34231827 - 34232422
Alignment:
Q  1 gttttcaacagctagttcattttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatct 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34231827 gttttcaacagctagttcgttttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatct 34231926  T
Q  101 atcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaa 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34231927 atcaaacaatcaacttacagggcatatcagtgcaatctcgtcctattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaa 34232026  T
Q  201 tcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaacttcaaaatttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34232027 tcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaacttcaaaatttgt 34232126  T
Q  301 attctttgtccccttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaagggaattggatttatcttctat 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34232127 attctttgtccctttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgtcagttacaatttttctcatctaagggaattggatttgtcttctat 34232226  T
Q  401 caacttgacaaactttcccatattatcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggttg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34232227 caacttgacaaactttcccatattatcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggttg 34232326  T
Q  501 tttgaaacagcagaatctttgaacctctctcaaaattgcttcacttcaatagaccaaatctcaaggaatgttgaccagcttggtagtcttgatctt 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34232327 tttgaaacagcagaatctttgaacctctctcaaaattgcttcacttcaatagaccaaatctcaaggaatgttgatcagcttggtagtcttgatctt 34232422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Original strand, 34239579 - 34240137
Alignment:
Q  1 gttttcaacagctagttcattttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatct 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||  | ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  | | |||||    
T  34239579 gttttcaaaagctaatttatttgaggttaaatgacaacttgctaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttctttggtacttctgtatct 34239678  T
Q  101 atcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaa 200  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||  |||| ||   ||||||||||||||  |||||||| |     
T  34239679 atcaaacaatcgacttacagggcctatcagtgaaatctcatcatattccttagagtatctatctctatgcaacaacaagctacaaggtgatattccaaat 34239778  T
Q  201 tcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaacttcaaaatttgt 300  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  |  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||     
T  34239779 tcaattttcaaccttgcaaacctaattacactatgtctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaagactttacaaaacttcaaaaattgg 34239878  T
Q  301 attctttgtccccttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaagggaattggatttatcttctat 400  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||   |||||||||| |||||  |    
T  34239879 attctctgtccctttcacataatagccaattatcactaaactttgaatacaatgttacttaccatttttctcaactaacaaaattggatttgtcttcctt 34239978  T
Q  401 caacttgacaaactttcccatattatcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggttg 500  Q
     |  |||||  | ||||| | ||||| || ||||   |||      || |   ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||     
T  34239979 gagtttgactgaatttcctaaattattaggaaaa---cta------gaatcacttgatttgtccaataacaaacttaatggaacagtgtccaattggtta 34240069  T
Q  501 tttgaaacagcagaatctttgaacctctctcaaaattgcttcacttcaatagaccaaatctcaaggaa 568  Q
     |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34240070 cttgaaacatcaagatctttgaacctctctcaaaacttgttcacatcaatagaccaaatctcaaggaa 34240137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 42129914 - 42129461
Alignment:
Q  43 taaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtc 142  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |  |||||  ||||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  42129914 taaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccgtctttggttcatttagttctatcaaataatcgtcttacaaggcatatcactgcaatctcatc 42129815  T
Q  143 gtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatca 242  Q
     ||||| ||| ||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| || |  |||||||||||    
T  42129814 atattccttaaagaagctagatctaagcggcaacaagctacaaggcaatattccaaaatctattttcaaccttgcaaacttaactttgctagatctatca 42129715  T
Q  243 tcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccccttcacagaatacacaattatcactaacct 342  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  || |||| | |||||| ||||  ||||||||| |||| |    
T  42129714 tcaaacaacttgagtgatgttattgattttcaacacttttccaaacttcaatatttgaaaactctgtcactttcacataatagccaattatcattaacat 42129615  T
Q  343 ttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaagggaattggatttatcttctatcaacttgacaaactttcccatattatcagaaaaattcctaag 442  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||   ||||||  ||| ||| |      
T  42129614 ttgaacccaatgtcaattacaatttttcttatctatcaaaattggatttgtcttctatcaatttgacagaatttccca---tatcagggaaagtcccatt 42129518  T
Q  443 tttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggtt 499  Q
     || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  42129517 gttagattctcttgatttgtccaataacaaacttaatggaaaggtgccagattggtt 42129461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 498
Target Start/End: Original strand, 41712663 - 41713070
Alignment:
Q  91 atttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaa 190  Q
    ||||| |||||||||| || | | ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||  ||| |||||  ||| ||||| ||| |||||||    
T  41712663 atttagatctatcaaataaccgacttatagggcatatcattgcaatctcatcatattccttagaggagctatatctattcggcaacaaactagaaggcaa 41712762  T
Q  191 tattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaactt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  || ||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||   | |||||    
T  41712763 tattccagaatcaattttcaaacttataaacctaactagactagacctatcatcaaacaacttcagtggtgttgttgattttcaatacttctccgaactt 41712862  T
Q  291 caaaat-ttgtattctttgtccccttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaagggaattggat 389  Q
    |||||| | ||| ||| |||||| |||||  ||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  41712863 caaaatctagta-tctctgtccctttcacttaataatcaattgtcactaaactttgaatccattgtcaattacaatttttctcaactaatagaattggat 41712961  T
Q  390 ttatcttctatcaacttgacaaactttcccatattatcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgc 489  Q
    ||||||||| | |  |||||    ||| | | |||||||| |||| |   || |||| | ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  41712962 ttatcttctttgagtttgactcgattttcaaaattatcaggaaaactttcaaatttgaaatattttgatctgtctaataacaaaattaatggaagagtgc 41713061  T
Q  490 caaattggt 498  Q
    |||||||||    
T  41713062 caaattggt 41713070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 371
Target Start/End: Original strand, 41571205 - 41571402
Alignment:
Q  174 aacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  || ||  | ||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  41571205 aacaagctacaaggcgatattcctgaatctattttcaaccttgtaaacctaactacactatgcctgtcatcaaacaacttgagtggtattgtcaatttta 41571304  T
Q  274 aacactttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccccttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttct 371  Q
    || |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41571305 aatacttttccaaacttcaaaatttgaattctctgtccctttcacataatagtcaattatcaccgaactttgaatccaatgtcagttacaatttttct 41571402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42124540 - 42124306
Alignment:
Q  42 ctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgt 141  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||  || |||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||| || |    
T  42124540 ctaaatggaacagttccttcctccttgttatctttgccttctttggcaattttagatctatcatataatcgacttacagggcatatcagtgaaatatcat 42124441  T
Q  142 cgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatc 241  Q
    | ||||| ||| |    |||| |||| ||   |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||   |||  || ||   |||  ||||||    
T  42124440 catattctttaaacatgctaactctaagcaacaacaggctacaaggcaatattcctgagtccattttcaacctaacaaaactatctcacttaattctatc 42124341  T
Q  242 atcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaac 276  Q
     || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42124340 ttcgaacgacttgagtggtcttgtcaattttcaac 42124306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41432439 - 41432339
Alignment:
Q  181 tacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactt 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||   ||   |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  41432439 tacaaggaaatattccagaatcacttttcaaccttgtaaaccttactaacttgtgtctatcttcaaataacttgagtggttttgtcaattttaaactctt 41432340  T
Q  281 t 281  Q
    |    
T  41432339 t 41432339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 507
Target Start/End: Original strand, 41571459 - 41571541
Alignment:
Q  425 atcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggttgtttgaaa 507  Q
    ||||| ||||||||  ||||||   ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  41571459 atcaggaaaattccctagtttgagatatcttgatttgtccaacaacaaactttatggaagagtgcccaattggttgcttgaaa 41571541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 12249515 - 12249003
Alignment:
Q  41 tctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcg 140  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||  | || || | || |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  12249515 tctaaacggaacaattcctcccaccttgttatctttgccttctttggaacatctagagctgtcaaacaatcgatttacaggacatatcagtgcaatctca 12249416  T
Q  141 tcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctat 240  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||   || ||  | ||||| |||    
T  12249415 tcgtattcgttagatacgctatatctatctggtaacaagctacaaggcaatattccaaaatccattttcaaccttacaaccctaactagactagatttat 12249316  T
Q  241 catcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccccttcacagaatacacaattatcactaac 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||    |||| || | |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12249315 catcaaacaacttgagtggtgttgttgattttcaactcttttccaaacttcattggttgttttttctgtccctttcacataatagccaattatcactaac 12249216  T
Q  341 ctttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaagggaattggatttatcttctatcaacttgacaaactttcccatattatcaga-aaaattcct 439  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||  || |  |||||   |||| ||||  ||||| |||| |||||| | |||||||       |||   ||||||     
T  12249215 ctttgaatccaatgtcagtttcatttactcccgactaagaatattgtattttccttctgtcaatttgacagaatttccca-------agattgaattccc 12249123  T
Q  440 aagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggttgtttgaaacagcagaatctttgaacctctctcaaaattgc 539  Q
    ||| || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||  |||  |     
T  12249122 aagattagattctcttgatttgtcaaataataaacttaatggaagcgtgcccaattggttgcttgaaatatcaggatctttgaacctcgctggaaaccgt 12249023  T
Q  540 ttcacttcaatagaccaaat 559  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  12249022 ttcacttccatagaccaaat 12249003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 8524085 - 8523613
Alignment:
Q  27 ttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagggcata 126  Q
    ||||||||||||   ||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||||   ||| || ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  8524085 ttaaatgacaacttgctaaatggtacaattcctccctccttgttatccttgccatttttgctagtattagatttatcaaataatcaacttacagggaata 8523986  T
Q  127 tcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagc 226  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||  ||||  |||| |    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||      
T  8523985 tcagcgcaatctcatcatattccttagagtttctatctctaagtaacaacaggctacaaggcaatattccagaatccattttcaaccttgcaaacctaag 8523886  T
Q  227 tgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccccttcacagaataca 326  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||| |||||| ||||| | | ||||   | |||| | ||||      
T  8523885 tagactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttccaaaacatttccaaccttcaacatttgaaatttttgcagctttcagataatagc 8523786  T
Q  327 caattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaagggaattggatttatcttctatcaacttgacaaactttcccatattat 426  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| | ||||| | |||||| |||||||| ||| |||||| | |  |||||  | ||||| |  || |    
T  8523785 caattatcagtaaactttgaatccagtgtcaattatagtttttttgatctaatggaattgggtttgtcttctttgagtttgactgagtttcctaacttct 8523686  T
Q  427 cagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggtt 499  Q
    |||||||| ||| ||  ||||  ||| ||||| |||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  8523685 cagaaaaactcccaatgttggtatatcttgatctgtctaataacaaaattagtggaagtgtgccaaattggtt 8523613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 25522086 - 25522398
Alignment:
Q  43 taaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtc 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| ||||||| | |||||||   ||||||||||| ||| ||    
T  25522086 taaatggaacaattccttcctctttgttatctttgccttctttggtatatttatatctatctaacaatcgacttacaggatctatcagtgcaacctcatc 25522185  T
Q  143 gtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatca 242  Q
     ||||| ||||||  | ||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||  || ||    ||  ||||||     
T  25522186 atattccttagagagtttaaatctatacaacaacaagctacaaggcaatattccagaatccattttcaatcttacaaacctaactaatctaattctatct 25522285  T
Q  243 tcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaactt-caaaatttgtattctttgtccccttcacagaatacacaattatcactaacc 341  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||  ||| ||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||||| |    
T  25522286 ttaaacgacttgagtggttttgtcaattttcaacacttttccaaacttacaaatcttcgatt-tttatccctttcatggaatactcaattgtcactaaac 25522384  T
Q  342 tttgaatccaatgt 355  Q
    || |||||||||||    
T  25522385 ttcgaatccaatgt 25522398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11119042 - 11118949
Alignment:
Q  179 gctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11119042 gctacaaggcaatattccagaatgcattttcagcctaacaaagctagatgaactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttt 11118949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University