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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16994_high_1 (Length: 754)

Name: NF16994_high_1
Description: NF16994
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16994_high_1
NF16994_high_1
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (12-739)||(1319610-1320337)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 653; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 653; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 1320337 - 1319610
Alignment:
Q  12 gcagagataaaacatcaacaatggagttggtagaaaaatgataataacgagagaatcaaaccactgccaaaaatcttttgacaaaagatcaatgcagata 111  Q
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T  1320337 gcagagataaaacatcaacaatggagttggtagaaaaatgataataacgagagaatcaaaccactgccaaaaatcttttgacaaaagatcaatgcagata 1320238  T
Q  112 ggctacaaatggaaacaatattttaaaattagacattgtgagtatattttttctgactttgtagattgttctcaaatagaattataacgttaatatttta 211  Q
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T  1320237 ggctacaaatggaaacaatattttaaaattagacattgtgagtatattttttctgactttttagattgttctcaaatagaattataacgttaatatttta 1320138  T
Q  212 aatatggtcatgactcttgacaaaatttacttatataatctttatgataaatgttagagactaaattgataactaagccctagttaattttttaaatata 311  Q
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T  1320137 aaaatggtcatgactcttgacgaaatttacttatataatctttatgataaatgttagagactaaattgataactaa-acctagttaattttttaaatata 1320039  T
Q  312 attacctgatgatagttaatagtaaatggttaaatacaaagagcaacttaacaatctaatag--attttgtttttgaaagattaacaatctaatagatag 409  Q
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T  1320038 atgacctgatgataattaatagtaaatggttaaatacaaatagcaacttaacaatctaatagtttttttttttttgaaagattaacaatctaatagatag 1319939  T
Q  410 aatcaaatgatcgttttaaaaaattcataatc-tataaacctattttgagaacgcaaaatcatggactaattggtttactttacacacataattttagtg 508  Q
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T  1319938 aatcaaatgatcgttttaaaaaattcataatcttataaacctattttgagaacgcaaaatcatggactaattggtttactttacacacataattttagtg 1319839  T
Q  509 tctcgatgtccttttaggtcgttaacaacttgtcagaactagctatatgacttgaatataaaatatacatacaggacaaacttggaatttcccatcacaa 608  Q
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T  1319838 tctcgatatccttttaggtcgttaacaacttgtcagaactagctatatgacttgaatataaaatatacatacaggacaaacttggaatttcccatcacaa 1319739  T
Q  609 cattttacatgtataaatataagtaacaaattaaaaccagacatcaccaccttataaataacaagttgtacgttaaatattaattagttctaaacatcct 708  Q
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T  1319738 ca--ttacatgtataaatataagtaacaaattaaaaccagacatcaccaccttataaataacaagttgtacgttaaatattaattagttctaaacatcct 1319641  T
Q  709 caatccacttcatagtataggtttggattct 739  Q
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T  1319640 caatccacttcatagtataggtttggattct 1319610  T

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