View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16996_high_6 (Length: 373)

Name: NF16996_high_6
Description: NF16996
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16996_high_6
NF16996_high_6
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (25-346)||(2041-2362)
scaffold0234 (25-346)||(10932-11253)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (25-346)||(17684189-17684510)
chr6 (25-346)||(27380972-27381293)
chr6 (25-346)||(27471355-27471676)
chr6 (25-346)||(11651889-11652210)
chr6 (25-346)||(17691160-17691481)
chr6 (25-346)||(29309056-29309377)
chr6 (25-346)||(29316016-29316336)
chr6 (25-346)||(188697-189018)
chr6 (107-346)||(27296877-27297116)
chr6 (73-346)||(16394165-16394438)
chr6 (105-342)||(25536915-25537152)
chr6 (124-345)||(16559193-16559414)
chr6 (21-329)||(13359010-13359314)
chr6 (25-129)||(16566257-16566361)
chr6 (42-336)||(2669476-2669768)
chr6 (39-346)||(16789071-16789373)
chr6 (39-346)||(22859888-22860190)
chr6 (39-346)||(27508347-27508649)
chr6 (39-346)||(1586108-1586410)
chr6 (39-332)||(27527947-27528235)
chr6 (39-346)||(14074480-14074782)
chr6 (39-302)||(18019885-18020143)
chr6 (107-324)||(10359073-10359285)
chr6 (39-346)||(8612915-8613221)
chr6 (109-261)||(20736413-20736562)
chr6 (40-168)||(27925935-27926062)
chr6 (40-243)||(17850321-17850521)
chr6 (57-162)||(28172754-28172859)
chr6 (31-163)||(20553492-20553622)
chr6 (92-277)||(8510155-8510338)
chr6 (37-249)||(19218427-19218630)
chr6 (233-346)||(33317055-33317167)
chr6 (107-346)||(17120505-17120740)
chr6 (107-249)||(21994655-21994794)
chr6 (25-77)||(25537148-25537200)
chr6 (205-268)||(28172899-28172963)
chr6 (39-134)||(13995151-13995245)
chr6 (190-329)||(28756145-28756283)
chr6 (53-174)||(19347092-19347212)
chr6 (38-218)||(22560311-22560487)
chr6 (114-261)||(5758565-5758709)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (25-346)||(18262378-18262699)
chr4 (25-346)||(18269239-18269560)
chr4 (25-346)||(55612849-55613170)
chr4 (25-346)||(26963806-26964127)
chr4 (25-346)||(26970629-26970950)
chr4 (25-346)||(868763-869084)
chr4 (25-346)||(19926480-19926801)
chr4 (25-346)||(5707486-5707807)
chr4 (25-346)||(5714114-5714435)
chr4 (25-346)||(8858333-8858654)
chr4 (25-346)||(10621053-10621374)
chr4 (31-346)||(10628132-10628447)
chr4 (25-346)||(28392854-28393175)
chr4 (25-346)||(8845369-8845690)
chr4 (25-346)||(4426336-4426645)
chr4 (31-346)||(35223732-35224047)
chr4 (35-346)||(5667849-5668156)
chr4 (25-350)||(20311458-20311781)
chr4 (114-346)||(10677303-10677534)
chr4 (114-346)||(10890943-10891174)
chr4 (39-346)||(15461497-15461799)
chr4 (39-346)||(34975551-34975853)
chr4 (39-346)||(2677013-2677315)
chr4 (39-346)||(15815021-15815323)
chr4 (39-346)||(18111043-18111345)
chr4 (39-346)||(3369023-3369325)
chr4 (39-346)||(17299959-17300261)
chr4 (39-346)||(18163162-18163464)
chr4 (39-346)||(20243937-20244239)
chr4 (39-346)||(26531613-26531915)
chr4 (39-346)||(4675983-4676285)
chr4 (35-171)||(56516232-56516368)
chr4 (95-245)||(21453961-21454110)
chr4 (40-346)||(5870419-5870720)
chr4 (107-330)||(19365586-19365806)
chr4 (107-346)||(1941791-1942026)
chr4 (107-329)||(19362477-19362695)
chr4 (60-346)||(32646523-32646807)
chr4 (114-346)||(9487625-9487853)
chr4 (107-330)||(5528495-5528714)
chr4 (39-244)||(32636484-32636685)
chr4 (114-330)||(5616469-5616681)
chr4 (126-346)||(30040489-30040705)
chr4 (43-121)||(24700213-24700291)
chr4 (114-330)||(9538033-9538244)
chr4 (107-261)||(4546147-4546298)
chr4 (129-346)||(11421096-11421309)
chr4 (218-268)||(24701361-24701411)
chr4 (95-249)||(33888594-33888743)
chr4 (86-213)||(34777850-34777975)
chr4 (237-318)||(9937745-9937826)
chr4 (31-83)||(10677538-10677590)
chr4 (31-83)||(10891178-10891230)
chr4 (27-97)||(9937933-9938003)
chr4 (116-207)||(9937830-9937923)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (25-346)||(6110230-6110551)
chr3 (25-346)||(16482203-16482524)
chr3 (25-346)||(10579075-10579396)
chr3 (25-346)||(15600604-15600925)
chr3 (25-346)||(15607149-15607470)
chr3 (25-346)||(10572312-10572633)
chr3 (25-346)||(15341939-15342260)
chr3 (25-346)||(18520141-18520462)
chr3 (40-346)||(8490676-8490982)
chr3 (32-342)||(18522836-18523146)
chr3 (25-346)||(13211468-13211789)
chr3 (25-346)||(15357306-15357627)
chr3 (25-346)||(17780838-17781159)
chr3 (31-346)||(13248779-13249094)
chr3 (25-346)||(32056619-32056941)
chr3 (25-350)||(17199900-17200225)
chr3 (25-346)||(13516977-13517294)
chr3 (31-346)||(1647241-1647556)
chr3 (25-346)||(17136525-17136840)
chr3 (25-346)||(29925137-29925458)
chr3 (25-346)||(29974290-29974611)
chr3 (56-346)||(16200627-16200917)
chr3 (39-346)||(21034238-21034540)
chr3 (39-346)||(15846536-15846838)
chr3 (39-346)||(20147554-20147856)
chr3 (39-346)||(21398792-21399094)
chr3 (31-328)||(24253130-24253423)
chr3 (39-346)||(14890391-14890693)
chr3 (39-346)||(55427021-55427323)
chr3 (39-346)||(12299911-12300212)
chr3 (107-346)||(25978728-25978963)
chr3 (114-312)||(15526827-15527021)
chr3 (31-248)||(14147013-14147226)
chr3 (188-346)||(28088251-28088408)
chr3 (107-346)||(11787654-11787889)
chr3 (78-207)||(28953965-28954093)
chr3 (107-346)||(15317176-15317408)
chr3 (80-272)||(32280313-32280507)
chr3 (25-77)||(19089734-19089786)
chr3 (193-308)||(30464147-30464261)
chr3 (31-124)||(9504455-9504548)
chr3 (35-150)||(8251933-8252048)
chr3 (25-98)||(16200291-16200363)
chr3 (185-249)||(36138033-36138097)
chr3 (118-170)||(4189223-4189275)
chr3 (185-249)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (25-346)||(18252196-18252517)
chr1 (25-346)||(18532234-18532555)
chr1 (25-346)||(27131130-27131450)
chr1 (25-346)||(27310297-27310618)
chr1 (25-346)||(16358755-16359076)
chr1 (31-346)||(3855639-3855954)
chr1 (31-346)||(36816354-36816668)
chr1 (65-346)||(22641594-22641871)
chr1 (31-346)||(27277278-27277592)
chr1 (25-218)||(21171081-21171274)
chr1 (39-346)||(19706439-19706741)
chr1 (39-346)||(43802365-43802667)
chr1 (153-346)||(9916497-9916689)
chr1 (39-346)||(28134723-28135025)
chr1 (25-179)||(22657108-22657262)
chr1 (55-346)||(23507096-23507385)
chr1 (39-346)||(9456116-9456418)
chr1 (31-268)||(12014084-12014319)
chr1 (39-346)||(20391239-20391541)
chr1 (39-346)||(20779645-20779947)
chr1 (39-346)||(22670257-22670559)
chr1 (39-346)||(42816989-42817291)
chr1 (39-346)||(22612492-22612794)
chr1 (30-326)||(633925-634216)
chr1 (32-148)||(9917837-9917952)
chr1 (114-346)||(8727741-8727969)
chr1 (39-346)||(47667485-47667776)
chr1 (107-330)||(29096789-29097008)
chr1 (55-144)||(12006461-12006550)
chr1 (233-346)||(28145723-28145835)
chr1 (39-171)||(35930582-35930713)
chr1 (114-246)||(21881475-21881604)
chr1 (94-259)||(24301691-24301855)
chr1 (114-167)||(51997353-51997406)
chr1 (47-173)||(26923553-26923678)
chr1 (199-279)||(12006332-12006413)
chr1 (185-244)||(10852402-10852461)
chr1 (128-207)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (25-345)||(21940831-21941151)
chr8 (25-346)||(22171653-22171974)
chr8 (25-346)||(6094289-6094610)
chr8 (25-346)||(24642815-24643135)
chr8 (83-346)||(15326422-15326685)
chr8 (83-346)||(15506791-15507054)
chr8 (205-346)||(28548393-28548534)
chr8 (36-279)||(14983710-14983950)
chr8 (31-346)||(8371253-8371563)
chr8 (39-346)||(21969333-21969635)
chr8 (34-231)||(24797224-24797419)
chr8 (39-346)||(12562123-12562425)
chr8 (39-346)||(27007517-27007819)
chr8 (39-346)||(27014660-27014962)
chr8 (39-346)||(27880487-27880789)
chr8 (39-346)||(28020668-28020970)
chr8 (31-330)||(38232115-38232412)
chr8 (39-346)||(22130609-22130911)
chr8 (39-346)||(25611195-25611497)
chr8 (40-346)||(22659494-22659795)
chr8 (39-346)||(21916676-21916978)
chr8 (39-346)||(45534273-45534575)
chr8 (107-346)||(26240551-26240786)
chr8 (31-249)||(18835342-18835556)
chr8 (107-346)||(6430953-6431188)
chr8 (27-166)||(32872741-32872880)
chr8 (115-261)||(8781959-8782102)
chr8 (239-336)||(24796731-24796826)
chr8 (62-148)||(2375214-2375300)
chr8 (184-330)||(20535226-20535371)
chr8 (107-346)||(2962932-2963171)
chr8 (42-136)||(29645537-29645631)
chr8 (233-351)||(36970439-36970556)
chr8 (233-350)||(2375411-2375528)
chr8 (197-319)||(29645675-29645797)
chr8 (86-138)||(10920427-10920479)
chr8 (25-60)||(28555049-28555084)
chr8 (107-146)||(36970332-36970371)
chr8 (285-346)||(8968015-8968076)
chr8 (286-334)||(41368106-41368154)
chr8 (286-334)||(41375077-41375125)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (31-346)||(24695186-24695501)
chr5 (25-346)||(19714218-19714539)
chr5 (25-346)||(19706939-19707259)
chr5 (25-346)||(18569581-18569904)
chr5 (55-346)||(17298621-17298912)
chr5 (25-224)||(39538754-39538953)
chr5 (55-346)||(17285470-17285759)
chr5 (31-259)||(18806843-18807069)
chr5 (184-350)||(27347252-27347417)
chr5 (239-346)||(24701950-24702057)
chr5 (39-346)||(20941027-20941329)
chr5 (39-346)||(25805385-25805687)
chr5 (39-346)||(31899-32201)
chr5 (39-346)||(12789663-12789965)
chr5 (39-346)||(22941250-22941552)
chr5 (39-346)||(23545922-23546224)
chr5 (36-170)||(22546912-22547046)
chr5 (39-346)||(24933306-24933608)
chr5 (41-334)||(20100255-20100543)
chr5 (39-346)||(31096816-31097118)
chr5 (39-346)||(12764990-12765296)
chr5 (39-346)||(5097651-5097953)
chr5 (39-346)||(7865430-7865736)
chr5 (39-346)||(9811733-9812039)
chr5 (39-346)||(12703874-12704180)
chr5 (121-259)||(18806483-18806619)
chr5 (121-259)||(18806663-18806799)
chr5 (261-350)||(28719471-28719558)
chr5 (97-346)||(18829281-18829530)
chr5 (31-119)||(27347425-27347513)
chr5 (107-350)||(26129689-26129928)
chr5 (39-346)||(26245102-26245404)
chr5 (265-346)||(39538954-39539035)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (25-346)||(7273-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (25-346)||(6654-6975)
scaffold0390 (25-346)||(13670-13991)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (25-342)||(15152609-15152926)
chr7 (25-346)||(29327950-29328271)
chr7 (25-346)||(11535782-11536103)
chr7 (25-346)||(11542700-11543021)
chr7 (20-346)||(12750987-12751313)
chr7 (25-346)||(12738702-12739023)
chr7 (25-346)||(18561173-18561485)
chr7 (35-346)||(13392326-13392637)
chr7 (34-352)||(18257559-18257874)
chr7 (39-346)||(2204552-2204854)
chr7 (39-346)||(8464999-8465301)
chr7 (39-346)||(18400104-18400406)
chr7 (39-346)||(18407088-18407390)
chr7 (39-346)||(48808496-48808798)
chr7 (39-346)||(15729751-15730053)
chr7 (39-346)||(18139338-18139640)
chr7 (39-346)||(19230888-19231190)
chr7 (39-334)||(30254138-30254428)
chr7 (106-346)||(2365169-2365407)
chr7 (107-346)||(41680968-41681203)
chr7 (39-346)||(10668901-10669204)
chr7 (114-346)||(34128647-34128875)
chr7 (39-334)||(47166871-47167161)
chr7 (40-324)||(24443349-24443628)
chr7 (31-261)||(19388544-19388774)
chr7 (107-346)||(28130628-28130863)
chr7 (58-148)||(10235361-10235451)
chr7 (107-346)||(18259124-18259359)
chr7 (37-324)||(25845498-25845780)
chr7 (37-324)||(25845917-25846199)
chr7 (107-308)||(19393462-19393659)
chr7 (198-335)||(39112138-39112275)
chr7 (40-148)||(47833875-47833983)
chr7 (25-80)||(15148308-15148363)
chr7 (114-346)||(14591924-14592153)
chr7 (114-346)||(16011515-16011744)
chr7 (30-139)||(19859113-19859221)
chr7 (121-260)||(31190524-31190660)
chr7 (34-172)||(3132849-3132986)
chr7 (44-162)||(7662569-7662686)
chr7 (114-246)||(22969024-22969153)
chr7 (31-117)||(7396361-7396450)
chr7 (197-272)||(22948499-22948574)
chr7 (158-346)||(15169290-15169474)
chr7 (104-162)||(7396469-7396527)
chr7 (73-128)||(29983179-29983234)
chr7 (192-256)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (25-346)||(18454-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (25-350)||(25706-26031)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (25-346)||(21329968-21330289)
chr2 (25-346)||(18796672-18796993)
chr2 (31-352)||(18619976-18620296)
chr2 (31-346)||(36270338-36270650)
chr2 (75-346)||(20978091-20978360)
chr2 (31-346)||(22183206-22183518)
chr2 (34-332)||(6991847-6992146)
chr2 (25-334)||(18822249-18822556)
chr2 (39-346)||(30174377-30174679)
chr2 (39-346)||(24250032-24250334)
chr2 (39-346)||(24229215-24229517)
chr2 (31-171)||(19279460-19279600)
chr2 (107-334)||(15342014-15342237)
chr2 (40-148)||(18851977-18852085)
chr2 (114-348)||(29800545-29800775)
chr2 (183-346)||(17241034-17241196)
chr2 (45-148)||(36801899-36802003)
chr2 (114-261)||(19616509-19616653)
chr2 (199-279)||(36799745-36799826)
chr2 (114-248)||(40301034-40301164)
chr2 (279-346)||(41661694-41661761)
chr2 (116-321)||(41316305-41316506)
chr2 (114-249)||(21626824-21626955)
chr2 (185-261)||(28740910-28740986)
chr2 (110-173)||(28718943-28719006)
chr2 (41-148)||(28741220-28741326)
chr2 (35-68)||(12098616-12098649)
chr2 (107-148)||(24763751-24763792)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (25-327)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (25-350)||(5695-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (90-346)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (39-346)||(183-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (39-346)||(3675-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (39-346)||(119730-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (39-334)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (39-308)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (107-346)||(67374-67609)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (107-346)||(26609-26844)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (39-346)||(39988-40290)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (39-249)||(8305-8511)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (31-148)||(90033-90151)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (156-346)||(102-288)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (116-318)||(8807-9005)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (114-346)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (114-249)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (107-346)||(53832-54066)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (78-169)||(45956-46051)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2362 - 2041
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 2263  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 2163  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2162 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 2063  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2062 gatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11253 - 10932
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11253 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11154  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11153 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 11054  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11053 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10954  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10953 gatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17684510 - 17684189
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684510 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17684411  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684410 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17684311  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684310 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17684211  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17684210 gatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27381293 - 27380972
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381293 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27381194  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381193 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27381094  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381093 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27380994  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27380993 gatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27471676 - 27471355
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471676 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27471577  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471576 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27471477  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471476 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27471377  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27471376 gatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 11651889 - 11652210
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651889 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11651988  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651989 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattc 11652088  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11652188  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11652189 gatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17691481 - 17691160
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691481 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17691382  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691381 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17691282  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691281 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17691182  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17691181 gatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 29309056 - 29309377
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309056 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29309155  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309156 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29309255  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309256 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29309355  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29309356 gatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 29316016 - 29316336
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316016 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29316115  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316116 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29316215  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316216 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29316314  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29316315 gatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 189018 - 188697
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189018 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 188919  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188918 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 188819  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  188818 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgatt 188719  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||| |||||||| |||||||    
T  188718 gatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 73 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394165
Alignment:
Q  73 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 172  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  173 aaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  273 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 105 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  105 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc 204  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  205 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  305 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 124 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  124 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  224 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 323  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  324 tgatgggtactccatgaatcat 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13359314 - 13359010
Alignment:
Q  21 ggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 120  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  13359314 ggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagt 13359215  T
Q  121 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 219  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||   |  |||||  ||||||||| | |||  ||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  13359214 attagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--ttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtg 13359120  T
Q  220 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13359119 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagt 13359020  T
Q  320 tggttgatgg 329  Q
     |||||||||    
T  13359019 cggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16566361 - 16566257
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566361 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16566262  T
Q  125 ggagt 129  Q
    |||||    
T  16566261 ggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 336
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  42 actattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 141  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  142 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaa 240  Q
     ||||||  | |||||| ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaa 2669672  T
Q  241 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 336  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669673 atcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 16789071 - 16789373
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789071 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 16789169  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  16789170 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 16789266  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  16789267 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 16789365  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  16789366 gaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22860190 - 22859888
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860190 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22860092  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22860091 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22859995  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22859994 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22859896  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  22859895 gaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27508649 - 27508347
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27508649 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27508551  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27508550 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27508454  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  27508453 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgat 27508355  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  27508354 gaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1586410 - 1586108
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1586410 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 1586312  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  1586311 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 1586215  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1586214 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 1586116  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  1586115 gaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27528235 - 27527947
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27528235 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27528137  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27528136 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27528040  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 332  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27528039 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 14074480 - 14074782
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14074480 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagtaatatttat 14074578  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | ||| ||||||    
T  14074579 aatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctg 14074675  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  14074676 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 14074774  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  14074775 gaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18020143 - 18019885
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020143 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18020045  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18020044 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18019948  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 302  Q
    ||| |||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  18019947 aaatcactatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10359285 - 10359073
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || ||  | ||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||     
T  10359285 acatagatataaatattataggtaatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcac 10359190  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||    
T  10359189 aatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacagg 10359091  T
Q  307 atgactataaagttggtt 324  Q
    || || || |||||||||    
T  10359090 ataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 8612915 - 8613221
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8612915 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 8613013  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 235  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  8613014 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 8613111  T
Q  236 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  8613112 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 8613210  T
Q  336 catgaatcatg 346  Q
     ||||||||||    
T  8613211 gatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  109 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatag 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | | ||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  209 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 261  Q
    ||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Original strand, 27925935 - 27926062
Alignment:
Q  40 agactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 139  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  27925935 agactattatgtggataaactgatgatctcatctcacggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttata 27926033  T
Q  140 ttggattgatccgtcatgagaatactaca 168  Q
    ||| |||||  || ||||| |||||||||    
T  27926034 ttgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17850521 - 17850321
Alignment:
Q  40 agactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 139  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| | || | ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17850521 agactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatata 17850422  T
Q  140 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    ||||||||| ||  | | |||||||||||| |     ||| ||   |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17850421 ttggattgaccctccttaagaatactacattg----ggttttatgtaagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctg 17850326  T
Q  239 aaacc 243  Q
    |||||    
T  17850325 aaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 28172754 - 28172859
Alignment:
Q  57 gactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcat 156  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  |||    
T  28172754 gactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccat 28172853  T
Q  157 gagaat 162  Q
    ||||||    
T  28172854 gagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20553622 - 20553492
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || ||    
T  20553622 aaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aatattaagaata 20553524  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaata 163  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20553523 atatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 277
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  92 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 190  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||  || |||||  || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  191 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 277  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 249
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  37 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| || | ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaat-atgagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  137 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 236  Q
    ||     ||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| ||||    
T  19218526 at-----attgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tttcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  237 tgaaaccactatg 249  Q
    |||||||||||||    
T  19218618 tgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 346
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  233 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 332  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  333 ctccatgaatcatg 346  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||| ||| ||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 249
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 249  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 25537200 - 25537148
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcaca 77  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25537200 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 268
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  205 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 268  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13995245 - 13995151
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995245 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  190 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  290 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 329  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  53 ggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 152  Q
    |||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  153 tcatgagaatactacatagtaa 174  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560311
Alignment:
Q  38 agagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 137  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  138 tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 218  Q
    || || ||||| |    ||||||| ||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||||  | |||||  | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 261  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 18262378 - 18262699
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262378 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18262477  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262478 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18262577  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262578 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18262677  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18262678 gatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 18269239 - 18269560
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269239 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18269338  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269339 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18269438  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269439 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18269538  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18269539 gatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 55612849 - 55613170
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612849 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 55612948  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612949 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 55613048  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613049 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 55613148  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55613149 gatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 26963806 - 26964127
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963806 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26963905  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963906 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26964005  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964006 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26964105  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26964106 gatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 26970629 - 26970950
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970629 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26970728  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970729 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26970828  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970829 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26970928  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26970929 gatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 868763 - 869084
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868763 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 868862  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  868863 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 868962  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868963 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 869062  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  869063 gatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19926801 - 19926480
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19926801 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatatta 19926702  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926701 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 19926602  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926601 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19926502  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19926501 gatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 5707486 - 5707807
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707486 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5707585  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707586 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5707685  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707686 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5707785  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5707786 gatgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 5714114 - 5714435
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714114 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5714213  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714214 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5714313  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714314 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5714413  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5714414 gatgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 8858333 - 8858654
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8858333 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatatta 8858432  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858433 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 8858532  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858533 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 8858632  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8858633 gatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10621374 - 10621053
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621374 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatttta 10621275  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621274 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttc 10621175  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621174 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10621075  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10621074 gatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10628447 - 10628132
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628447 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 10628348  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10628347 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccaccct 10628248  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628247 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 10628148  T
Q  331 tactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  10628147 tactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28393175 - 28392854
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393175 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 28393076  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393075 gaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 28392976  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392975 cacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 28392876  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28392875 gatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 8845369 - 8845690
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8845369 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatatta 8845468  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845469 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 8845568  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845569 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggtt 8845668  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8845669 gatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4426645 - 4426336
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426645 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 4426546  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||            |||||||||||||||||||||||||    
T  4426545 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaag------------ttctcatagtgatagtggtgtattc 4426458  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4426457 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggtt 4426358  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4426357 gatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 35223732 - 35224047
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35223732 aaagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagta 35223831  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35223832 atatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccct 35223931  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35223932 ttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtg 35224031  T
Q  331 tactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35224032 tactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 35 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5668156 - 5667849
Alignment:
Q  35 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 134  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5668156 catagagactattatgtggatagaccgatgatcat--ctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatat 5668059  T
Q  135 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 234  Q
    ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5668058 ttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttaga 5667959  T
Q  235 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667958 cctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 5667861  T
Q  335 ccatgaatcatg 346  Q
    ||| ||||||||    
T  5667860 ccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 20311458 - 20311781
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20311458 atcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatatta 20311557  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtatt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||   || | |||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20311558 ggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttat-gtaactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtatt 20311654  T
Q  224 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 323  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20311655 ccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggt 20311754  T
Q  324 tgatgggtactccatgaatcatgatga 350  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311755 taatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  314 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  314 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 15461497 - 15461799
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461497 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15461595  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15461596 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15461692  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15461693 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15461791  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  15461792 gaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 34975551 - 34975853
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975551 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 34975649  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  34975650 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 34975746  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  34975747 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 34975845  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  34975846 gaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 2677013 - 2677315
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677013 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2677111  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2677112 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2677208  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2677209 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2677307  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  2677308 gaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 15815021 - 15815323
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15815119  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15815120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15815216  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  15815217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 15815315  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  15815316 gaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18111345 - 18111043
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111345 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18111247  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18111246 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18111150  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18111149 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18111051  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  18111050 gaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3369325 - 3369023
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3369325 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 3369227  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3369226 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3369130  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  3369129 aaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 3369031  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  3369030 gaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17300261 - 17299959
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300261 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 17300163  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  17300162 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 17300066  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| | |||  ||    
T  17300065 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgagcacttgat 17299967  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  17299966 gaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 18163162 - 18163464
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18163162 gagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 18163260  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||| | ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  18163261 attggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 18163357  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18163358 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 18163456  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  18163457 gaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 20243937 - 20244239
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20243937 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 20244035  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  20244036 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 20244132  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20244133 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20244231  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  20244232 gaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 26531613 - 26531915
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26531613 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagtaatatttat 26531711  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  26531712 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 26531808  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  26531809 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 26531907  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  26531908 gaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4676285 - 4675983
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4676285 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 4676187  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  4676186 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 4676090  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  4676089 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 4675991  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  4675990 gaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 171
Target Start/End: Original strand, 56516232 - 56516368
Alignment:
Q  35 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  56516232 catagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatat 56516331  T
Q  135 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 171  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  56516332 ttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  95 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 194  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  195 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 245  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 346
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870720
Alignment:
Q  40 agactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  140 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 239  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 5870614  T
Q  240 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 339  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  5870615 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatg 5870713  T
Q  340 aatcatg 346  Q
    |||||||    
T  5870714 aatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 330
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365806
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca- 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcac 19365682  T
Q  206 tagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacag 305  Q
     | ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  19365683 caatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacag 19365781  T
Q  306 gatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365782 gatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Original strand, 1941791 - 1942026
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| |||||||||||     
T  1941791 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcac 1941887  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| |||    
T  1941888 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaagg 1941986  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1941987 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 329
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgg 329  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32646807 - 32646523
Alignment:
Q  60 tgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgag 159  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||| ||    
T  32646807 tgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataag 32646708  T
Q  160 aatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 258  Q
    ||| |||||||  ||| |||||  | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  32646707 aatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctgga 32646611  T
Q  259 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646610 tgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  314 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  307 atgactataaagttggttgatggg 330  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 244
Target Start/End: Original strand, 32636484 - 32636685
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32636484 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagtaatatttat 32636582  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| || |||| ||    
T  32636583 attggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctccgacgtg 32636679  T
Q  239 aaacca 244  Q
    ||||||    
T  32636680 aaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 330
Target Start/End: Original strand, 5616469 - 5616681
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   | ||||||||||||| |||  |  |||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||    
T  5616469 tataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatgaaa-gtgtcataagatattcttacaatgata 5616565  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
     |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| |||     
T  5616566 atggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactg 5616664  T
Q  314 taaagttggttgatggg 330  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  5616665 taacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  126 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 225  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  226 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 325  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  326 atgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 121
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  43 ctattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 121  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 330
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttat-gaaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  314 taaagttggttgatggg 330  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 261
Target Start/End: Original strand, 4546147 - 4546298
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | ||||||||||||||||||     
T  4546147 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcac 4546243  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 261  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4546244 aatgataatagtgtatatcgctctttgacctaaaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 346
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  129 taatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  229 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 328  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  329 ggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 268
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  218 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 249
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  95 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| ||  ||||| ||||| |||||  |  | ||||  ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  195 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 249  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  86 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |   | ||||  ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  186 agtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  237 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10677590 - 10677538
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcat 83  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10677590 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10891230 - 10891178
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcat 83  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10891230 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9938003 - 9937933
Alignment:
Q  27 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttat 97  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938003 catcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  116 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca---tagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 207  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    |||||  | |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 6110230 - 6110551
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110230 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6110329  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110330 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6110429  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110430 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 6110529  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6110530 gatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16482524 - 16482203
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482524 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16482425  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482424 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16482325  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482324 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 16482225  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16482224 gatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10579396 - 10579075
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579396 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10579297  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10579197  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579196 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10579097  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10579096 gatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15600925 - 15600604
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600925 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15600826  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600825 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15600726  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600725 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15600626  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  15600625 gatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15607470 - 15607149
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607470 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15607371  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607370 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15607271  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607270 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15607171  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  15607170 gatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10572633 - 10572312
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572633 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10572534  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572533 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10572434  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572433 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10572334  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10572333 gatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15342260 - 15341939
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15342260 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15342161  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342160 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15342061  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342060 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15341961  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15341960 gatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 18520141 - 18520462
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520141 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18520240  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520241 ggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18520340  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18520341 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 18520440  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18520441 gatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 40 - 346
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490982
Alignment:
Q  40 agactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  140 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 8490875  T
Q  240 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490876 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 8490975  T
Q  340 aatcatg 346  Q
    |||||||    
T  8490976 aatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 32 - 342
Target Start/End: Original strand, 18522836 - 18523146
Alignment:
Q  32 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522836 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18522935  T
Q  132 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18522936 tatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctt 18523035  T
Q  232 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523036 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18523135  T
Q  332 actccatgaat 342  Q
    |||||||||||    
T  18523136 actccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 13211468 - 13211789
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211468 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13211567  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211568 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 13211667  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211668 cacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13211767  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13211768 gatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15357627 - 15357306
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15357627 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15357528  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357527 ggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15357428  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357427 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15357328  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15357327 gatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17781159 - 17780838
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17781060  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781059 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17780960  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17780959 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggtt 17780860  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17780859 gatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 13248779 - 13249094
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248779 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 13248878  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248879 atatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 13248978  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248979 tcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 13249078  T
Q  331 tactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  13249079 tactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32056941 - 32056619
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tatt 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056941 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatatt 32056842  T
Q  124 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056841 atgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 32056742  T
Q  224 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 323  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056741 ccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 32056642  T
Q  324 tgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  32056641 tgatggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17200225 - 17199900
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200225 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17200126  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200125 ggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17200026  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17200025 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggtt 17199926  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatgatga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17199925 gatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 13516977 - 13517294
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516977 atcattaaagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13517076  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  13517077 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccc 13517172  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13517173 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggta 13517272  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13517273 gatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1647556 - 1647241
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1647556 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 1647457  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1647456 atgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccaccct 1647357  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1647356 tcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgag 1647257  T
Q  331 tactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  1647256 tactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 17136525 - 17136840
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  17136525 atcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------ta 17136618  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136619 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17136718  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136719 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17136818  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  17136819 gatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 29925137 - 29925458
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29925137 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29925236  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925237 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29925336  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29925337 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29925436  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  29925437 gatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 29974290 - 29974611
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29974290 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29974389  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974390 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29974489  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29974490 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29974589  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  29974590 gatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 56 - 346
Target Start/End: Original strand, 16200627 - 16200917
Alignment:
Q  56 agactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtca 155  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||    
T  16200627 agactgatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccacca 16200726  T
Q  156 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 255  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16200727 tgagaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccct 16200826  T
Q  256 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200827 agatgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 21034238 - 21034540
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034238 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21034336  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21034337 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21034433  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21034434 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 21034532  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  21034533 gaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15846838 - 15846536
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846838 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15846740  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15846739 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15846643  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15846642 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15846544  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  15846543 gaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20147856 - 20147554
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147856 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20147758  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20147757 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20147661  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20147660 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20147562  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  20147561 gaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399094
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21398987  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21398988 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21399086  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  21399087 gaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24253423 - 24253130
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||     
T  24253423 aaagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagtt 24253324  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |    
T  24253323 atatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cat 24253228  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253227 tcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890693
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    ||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  14890686 gaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 55427021 - 55427323
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55427021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 55427119  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  55427120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 55427216  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  55427217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 55427315  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  55427316 gaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 12299911 - 12300212
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12299911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagtaatatttat 12300008  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12300009 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12300105  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12300106 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12300204  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  12300205 gaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 312
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||   | ||| |||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 312  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 248
Target Start/End: Original strand, 14147013 - 14147226
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| |    
T  14147013 aaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagga 14147111  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    ||||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| ||    
T  14147112 atatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactct 14147208  T
Q  231 tcgacctgaaaccactat 248  Q
    | ||||||||||||||||    
T  14147209 tagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Original strand, 28088251 - 28088408
Alignment:
Q  188 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 287  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || || |||||||  ||||||    
T  28088251 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagggctttgttgccattc 28088349  T
Q  288 aaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
     ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088350 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787889
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gatattttcataagatattctcac 11787750  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  78 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 176  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  177 gttataaaaagtgtcataagatattctcata 207  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317176
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||  | | ||||||||||||||||||     
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgtcataagatattctcac 15317312  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  ||    
T  15317311 aatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacgg 15317216  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || |  |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15317215 ataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaatcatg 15317176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 272
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  80 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 179  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| ||   ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  180 ataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 272  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19089786 - 19089734
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcaca 77  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19089786 atcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 308
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  193 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 292  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  293 ttgtccgtaacaggat 308  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 124
Target Start/End: Original strand, 9504455 - 9504548
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  | ||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  9504455 aaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaatatta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  35 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 134  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| ||||||| || || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  135 ttatattggattgatc 150  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Original strand, 16200291 - 16200363
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatc 98  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  16200291 atcattaaagcatggagactatt-tgtggagagactgatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  185 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 249  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189275
Alignment:
Q  118 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 170  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata 4189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 249
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  185 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 249  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 18252196 - 18252517
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252196 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18252295  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18252395  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252396 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18252495  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18252496 gatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18532555 - 18532234
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532555 atcattaaagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18532456  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532455 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18532356  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532355 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18532256  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18532255 gatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27131450 - 27131130
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131450 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27131351  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131350 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27131251  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131250 cacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27131152  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27131151 gatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27310618 - 27310297
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27310618 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 27310519  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27310518 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattc 27310419  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27310418 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 27310319  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27310318 gatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16359076 - 16358755
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16359076 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatatta 16358977  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358976 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16358877  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16358876 cacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggtt 16358777  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16358776 gatgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3855954 - 3855639
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3855954 aaagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagta 3855855  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3855854 atatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccat 3855755  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3855754 tcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccgg 3855655  T
Q  331 tactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  3855654 tactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36816668 - 36816354
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816668 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 36816569  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36816568 atatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccct 36816470  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  36816469 ttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgatagg 36816370  T
Q  331 tactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||  |||||||    
T  36816369 tactccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641594
Alignment:
Q  65 atcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 164  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  165 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  265 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27277592 - 27277278
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27277592 aaagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagta 27277493  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    ||||||||| | |||||| ||  ||| |||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27277492 atatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccct 27277394  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  27277393 ttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaaggg 27277294  T
Q  331 tactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||| |||||||    
T  27277293 tactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21171274 - 21171081
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171274 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21171175  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171174 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19706741 - 19706439
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706741 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19706643  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19706642 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19706546  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19706545 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 19706447  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  19706446 gaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43802667 - 43802365
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802667 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 43802569  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  43802568 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 43802472  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  43802471 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 43802373  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  43802372 gaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9916689 - 9916497
Alignment:
Q  153 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgt 250  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916689 tcatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgt 9916593  T
Q  251 accctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916592 accctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28135025 - 28134723
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135025 gagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28134927  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28134926 attggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28134830  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28134829 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 28134731  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  28134730 gaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22657262 - 22657108
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22657262 atcattaaagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatatta 22657163  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 179  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22657162 tgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 346
Target Start/End: Original strand, 23507096 - 23507385
Alignment:
Q  55 tagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 154  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  23507096 tagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccacc 23507195  T
Q  155 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 253  Q
    || ||||| ||||| || |     | |||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23507196 attagaatgctacagagaacgttgtgtaaaaag---cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtacc 23507292  T
Q  254 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||  || | |||| |||||| | ||| ||||    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507293 ctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 9456116 - 9456418
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456116 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 9456214  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  9456215 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 9456311  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  9456312 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 9456410  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  9456411 gaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12014319 - 12014084
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12014319 aaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagta 12014220  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 229  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | ||||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12014219 atattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcaccc 12014123  T
Q  230 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 268  Q
    ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014122 ttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20391541 - 20391239
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20391541 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttat 20391443  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| ||||||    
T  20391442 attggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctg 20391346  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20391345 aaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20391247  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  20391246 gaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20779947 - 20779645
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779947 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20779849  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20779848 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20779752  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20779751 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20779653  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  20779652 gaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22670559 - 22670257
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670559 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22670461  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22670460 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22670364  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22670363 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22670265  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  22670264 gaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 42817291 - 42816989
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817291 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 42817193  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  42817192 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 42817096  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  42817095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 42816997  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  42816996 gaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 22612492 - 22612794
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22612492 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatattttt 22612590  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22612591 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22612687  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||    
T  22612688 aaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgat 22612786  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  22612787 gaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 633925 - 634216
Alignment:
Q  30 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 129  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  633925 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 634023  T
Q  130 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 229  Q
    |||||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  634024 aatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 634120  T
Q  230 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 326  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  634121 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9917952 - 9917837
Alignment:
Q  32 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 131  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9917952 aagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcacatctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaa 9917854  T
Q  132 tatttatattggattga 148  Q
    |||||||||||||||||    
T  9917853 tatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727969
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgata 8727837  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
       ||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  8727838 agagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 8727936  T
Q  314 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||  |||| | |||||||||  ||||||||||    
T  8727937 taacattggctaatgggtacttgatgaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47667776 - 47667485
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47667776 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttat 47667678  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||           |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  47667677 attggattgacccaccgtga-----------agt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 47667592  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  47667591 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 47667493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 330
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  307 atgactataaagttggttgatggg 330  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12006550 - 12006461
Alignment:
Q  55 tagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 144  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006550 tagactgatgatcacaacttacgaatcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  233 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 332  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  333 ctccatgaatcatg 346  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 171
Target Start/End: Original strand, 35930582 - 35930713
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35930582 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 35930680  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatag 171  Q
    |||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  35930681 attggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 246  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  94 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 192  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| |||||||| ||||||| |  |||||   |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  193 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactac 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  47 tatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 146  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  147 gatccgtcatgagaatactacatagta 173  Q
    || ||  | ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  199 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 279  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  185 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 244  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  128 gtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 207  Q
    |||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttat-gaaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 25 - 345
Target Start/End: Original strand, 21940831 - 21941151
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940831 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21940930  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21941030  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941031 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 21941130  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcat 345  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21941131 gatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 22171653 - 22171974
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22171653 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 22171752  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171753 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 22171852  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171853 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 22171952  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22171953 gatgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 6094289 - 6094610
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094289 atcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6094388  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094389 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6094488  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6094489 cacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggtt 6094588  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6094589 gatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 24642815 - 24643135
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642815 atcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 24642914  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24642915 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 24643013  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24643014 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggtt 24643113  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24643114 gatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 83 - 346
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  83 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  183 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  283 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 83 - 346
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  83 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  183 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  283 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 205 - 346
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  205 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  305 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14983950 - 14983710
Alignment:
Q  36 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 135  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  14983950 atagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-t 14983852  T
Q  136 tatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcga 234  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  14983851 tatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcga 14983755  T
Q  235 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983754 cctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8371563 - 8371253
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  8371563 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagta 8371465  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||    
T  8371464 atatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctct 8371368  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  8371367 tagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatggg 8371269  T
Q  331 tactccatgaatcatg 346  Q
    ||||  ||||||||||    
T  8371268 tacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 21969333 - 21969635
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969333 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21969431  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21969432 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21969528  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21969529 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21969627  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  21969628 gaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  34 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 133  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||| ||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  134 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 12562123 - 12562425
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562123 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 12562221  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12562222 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12562318  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12562319 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 12562417  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  12562418 gaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27007819 - 27007517
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007819 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27007721  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27007720 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27007624  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27007623 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27007525  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  27007524 gaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27014962 - 27014660
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014962 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27014864  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27014863 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27014767  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27014766 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27014668  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  27014667 gaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27880789 - 27880487
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880789 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27880691  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27880690 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27880594  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27880593 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27880495  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  27880494 gaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28020970 - 28020668
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020970 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28020872  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28020871 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28020775  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  28020774 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 28020676  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  28020675 gaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38232412 - 38232115
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||    
T  38232412 aaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcacatctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggta 38232313  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 229  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  38232312 atatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcc 38232216  T
Q  230 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 329  Q
    |  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  38232215 tcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatgg 38232116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22130911 - 22130609
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22130813  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22130812 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 22130716  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22130715 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22130617  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  22130616 gaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 25611195 - 25611497
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611195 gagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25611293  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| ||||||    
T  25611294 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctg 25611390  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||    
T  25611391 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgat 25611489  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  25611490 gaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659494
Alignment:
Q  40 agactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  140 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 239  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 22659600  T
Q  240 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 339  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22659599 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 22659501  T
Q  340 aatcatg 346  Q
    |||||||    
T  22659500 aatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 21916676 - 21916978
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916676 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttat 21916774  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21916775 attggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21916871  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  ||    
T  21916872 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgat 21916970  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  21916971 gaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45534575 - 45534273
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45534575 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 45534477  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  45534476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 45534380  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  45534379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 45534281  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  45534280 gaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Original strand, 26240551 - 26240786
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  26240551 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 26240647  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||  |  |||||  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| |||    
T  26240648 aatgattataatgtatatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaagg 26240746  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26240747 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Original strand, 18835342 - 18835556
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  18835342 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagta 18835440  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||    
T  18835441 atatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttttaaaaa-tgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactct 18835537  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatg 249  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  18835538 tagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 32872880 - 32872741
Alignment:
Q  27 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||||     
T  32872880 catcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagt 32872781  T
Q  127 agtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatacta 166  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32872780 aataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  115 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  215 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 261  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 148
Target Start/End: Original strand, 2375214 - 2375300
Alignment:
Q  62 atgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 148  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2375214 atgatcacatcacacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattga 2375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535226
Alignment:
Q  184 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  284 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattct 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   |  ||||||||||||||||| |  |||| | |   | ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  204 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 303  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  304 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 136
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  42 actattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 136  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 351
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  233 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 332  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  333 ctccatgaatcatgatgat 351  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  233 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 332  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  333 ctccatgaatcatgatga 350  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 319
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  197 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  297 ccgtaacaggatgactataaagt 319  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  86 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 60
Target Start/End: Original strand, 28555049 - 28555084
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagact 60  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555049 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 36970332 - 36970371
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970332 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  285 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  286 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 334  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  286 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 334  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24695501 - 24695186
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695501 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 24695402  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695401 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 24695302  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695301 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 24695202  T
Q  331 tactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  24695201 tactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19714539 - 19714218
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714539 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 19714440  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714439 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattc 19714340  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714339 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19714240  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  19714239 gatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19707259 - 19706939
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19707259 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatacta 19707160  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  19707159 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattc 19707060  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19707059 cacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggtt 19706961  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19706960 gatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18569904 - 18569581
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatat 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569904 atcattaaagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatat 18569805  T
Q  123 taggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18569804 taggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtat 18569705  T
Q  223 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18569704 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattgg 18569605  T
Q  323 ttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  18569604 ttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17298912 - 17298621
Alignment:
Q  55 tagactgatgatcacacct--cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 152  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17298912 tagactgatgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgaccca 17298813  T
Q  153 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 251  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17298812 ccatgagaatactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgta 17298716  T
Q  252 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298715 ccctaggtttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Original strand, 39538754 - 39538953
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538754 atcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 39538853  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538854 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 55 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17285759 - 17285470
Alignment:
Q  55 tagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 154  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||       
T  17285759 tagactgatgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaca 17285660  T
Q  155 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 253  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  17285659 atgagaatactacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtacc 17285563  T
Q  254 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||| | | ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285562 ctaggtttaggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18807069 - 18806843
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18807069 aaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagta 18806970  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 229  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18806969 atgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagtt-ttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccaccc 18806873  T
Q  230 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 259  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806872 ttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27347417 - 27347252
Alignment:
Q  184 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27347417 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgttttgtcacc 27347318  T
Q  284 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 350  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347317 attcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 239 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 20941027 - 20941329
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941027 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20941125  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20941126 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20941222  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20941223 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 20941321  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  20941322 gaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 25805687 - 25805385
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805687 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25805589  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  |||||    
T  25805588 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctg 25805492  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  25805491 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 25805393  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  25805392 gaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 31899 - 32201
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 31997  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31998 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 32094  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  32095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 32193  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  32194 gaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12789965 - 12789663
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12789965 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 12789867  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| ||||||    
T  12789866 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctg 12789770  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12789769 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12789671  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  12789670 gaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 22941250 - 22941552
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941250 gagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22941348  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22941349 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22941445  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  22941446 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 22941544  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  22941545 gaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 23545922 - 23546224
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545922 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 23546020  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  23546021 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 23546117  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23546118 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 23546216  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  23546217 gaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22547046 - 22546912
Alignment:
Q  36 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 135  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22547046 atagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatt 22546947  T
Q  136 tatattggattgatccgtcatgagaatactacata 170  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22546946 tatattggattgaccagccatgagaatactacata 22546912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24933608 - 24933306
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24933608 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 24933510  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  24933509 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 24933413  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  24933412 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 24933314  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  24933313 gaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  41 gactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  141 tggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 240  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  241 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 334  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 31096816 - 31097118
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31096816 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagtaatatttat 31096914  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31096915 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 31097011  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  31097012 aaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 31097110  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  31097111 gaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12765296 - 12764990
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12765296 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12765198  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 235  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||   |  || |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12765197 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12765100  T
Q  236 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 335  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12765099 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12765001  T
Q  336 catgaatcatg 346  Q
     ||||||||||    
T  12765000 gatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 5097651 - 5097953
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5097651 gagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagtaatatttat 5097749  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||| | ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  5097750 attggattaacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 5097846  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||   ||    
T  5097847 aaaccactatgatcccgagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtacatgat 5097945  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  5097946 gaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7865736 - 7865430
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7865736 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 7865638  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 235  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  7865637 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 7865540  T
Q  236 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  7865539 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 7865441  T
Q  336 catgaatcatg 346  Q
     ||||||||||    
T  7865440 gatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9812039 - 9811733
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9812039 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 9811941  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 235  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  9811940 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 9811843  T
Q  236 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 335  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  9811842 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 9811744  T
Q  336 catgaatcatg 346  Q
     ||||||||||    
T  9811743 gatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12704180 - 12703874
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12704180 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12704082  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 235  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12704081 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12703984  T
Q  236 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 335  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12703983 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12703885  T
Q  336 catgaatcatg 346  Q
     ||||||||||    
T  12703884 gatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  121 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 219  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  220 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  121 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 219  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  220 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  261 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829281
Alignment:
Q  97 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataag 196  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  ||||||||   ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttat-gtaagttccataag 18829434  T
Q  197 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 295  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  296 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27347513 - 27347425
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347513 aaagcatagagactattttgtggataggccgatgatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| |||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 350  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 26245102 - 26245404
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26245102 gagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26245200  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    | | |||||||||    | |||||||| ||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | ||| ||||||    
T  26245201 acttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctcttagacctg 26245297  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||  ||    
T  26245298 aaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgggtacttgat 26245396  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  26245397 gaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  265 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 7273 - 7594
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 7372  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7373 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 7472  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7473 cacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 7572  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7573 gatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6975 - 6654
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6975 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6876  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6875 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6776  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6775 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 6676  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6675 gatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13991 - 13670
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13991 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatatta 13892  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 13792  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13791 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13692  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  13691 gatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Original strand, 15152609 - 15152926
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152609 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15152708  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152709 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15152808  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152809 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15152908  T
Q  325 gatgggtactccatgaat 342  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15152909 gatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 29327950 - 29328271
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327950 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29328049  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328050 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29328149  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29328150 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgctt 29328249  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29328250 gatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11536103 - 11535782
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11536103 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatatta 11536004  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11536003 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11535904  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535903 caacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11535804  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11535803 gatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11543021 - 11542700
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11543021 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatatta 11542922  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11542921 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11542822  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11542821 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 11542722  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11542721 gatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 346
Target Start/End: Original strand, 12750987 - 12751313
Alignment:
Q  20 tggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12750987 tggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaa 12751086  T
Q  120 tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751087 tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 12751186  T
Q  220 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751187 tattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 12751286  T
Q  320 tggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12751287 tggttgatggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 12738702 - 12739023
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738702 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 12738801  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738802 ctcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 12738901  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12738902 caccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggtt 12739001  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12739002 gatgggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 18561173 - 18561485
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561173 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18561272  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  18561273 ggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattc 18561363  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18561364 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgatt 18561463  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||| |||||| || ||||||||    
T  18561464 gataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 346
Target Start/End: Original strand, 13392326 - 13392637
Alignment:
Q  35 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 134  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  13392326 catagagactattgtattggtagatcgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatat 13392425  T
Q  135 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 234  Q
    ||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13392426 ttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttga 13392525  T
Q  235 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 334  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13392526 cctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtact 13392625  T
Q  335 ccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||||||    
T  13392626 ccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18257874 - 18257559
Alignment:
Q  34 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 133  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257874 gcataaagactattatgtggatagattgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 18257775  T
Q  134 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcg 233  Q
    ||||||||||||| | ||  | | |||||| ||||||||  | || || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |    
T  18257774 tttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttag 18257677  T
Q  234 acctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 333  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257676 acctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtac 18257578  T
Q  334 tccatgaatcatgatgatg 352  Q
    |  | |||||||| |||||    
T  18257577 ttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 2204552 - 2204854
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204552 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2204650  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2204651 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2204747  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2204748 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2204846  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  2204847 gaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465301
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  8465294 gaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 18400104 - 18400406
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400104 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18400202  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18400203 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18400299  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18400300 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18400398  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  18400399 gaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 18407088 - 18407390
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407088 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18407186  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18407187 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18407283  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18407284 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18407382  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  18407383 gaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48808798 - 48808496
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808798 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 48808700  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  48808699 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 48808603  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  48808602 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 48808504  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  48808503 gaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 15729751 - 15730053
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15729751 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 15729849  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  15729850 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 15729946  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15729947 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 15730045  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  15730046 gaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18139640 - 18139338
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18139640 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 18139542  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18139541 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18139445  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18139444 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgat 18139346  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  18139345 gaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 19230888 - 19231190
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230888 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19230986  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19230987 actggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19231083  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19231084 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 19231182  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  19231183 gaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 334
Target Start/End: Original strand, 30254138 - 30254428
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30254138 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 30254236  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| ||    
T  30254237 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttg 30254333  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254334 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 346
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  106 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||   |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  206 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 304  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  305 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10669204 - 10668901
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10669204 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 10669106  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 237  Q
    | | |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | | ||| |||||    
T  10669105 actagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacct 10669009  T
Q  238 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 337  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |    
T  10669008 gaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttga 10668910  T
Q  338 tgaatcatg 346  Q
    |||||||||    
T  10668909 tgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||   ||||| | |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  314 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47167161 - 47166871
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47167161 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagtaatatttat 47167063  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    | | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  47167062 actagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 47166966  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  47166965 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  40 agactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  140 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 239  Q
     | |||| | ||  | ||||| ||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttga 24443433  T
Q  240 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443432 aaccattatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388774
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || | ||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 228  Q
    ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||   |  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||     
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccact 19388741  T
Q  229 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 261  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388742 cttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Original strand, 28130628 - 28130863
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||| |||||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  28130628 acataggtataaatatcaggagtaatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 28130724  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | | ||| | ||||||  ||  ||| ||||||||| |||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  28130725 aataataatagtgtatatcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 28130823  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28130824 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 148
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235451
Alignment:
Q  58 actgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 148  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattga 10235451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||| ||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  37 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 136  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  137 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 236  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25845585  T
Q  237 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845584 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  37 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 136  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  137 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 236  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25846004  T
Q  237 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846003 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19393659 - 19393462
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |   | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | ||||||||||||||||     
T  19393659 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcac 19393563  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||    
T  19393562 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaagg 19393464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  198 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  298 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 335  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  40 agactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 139  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  140 ttggattga 148  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Original strand, 15148308 - 15148363
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagat 80  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15148308 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592153
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 14592120  T
Q  314 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  14592121 taacgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 14592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011744
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 16011711  T
Q  314 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  16011712 taatgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 16011744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 139
Target Start/End: Original strand, 19859113 - 19859221
Alignment:
Q  30 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 129  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19859113 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19859211  T
Q  130 aatatttata 139  Q
    ||||||||||    
T  19859212 aatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  121 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 220  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||   ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  221 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 260  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 172
Target Start/End: Original strand, 3132849 - 3132986
Alignment:
Q  34 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 133  Q
    ||||||||||||  ||||   |||||||||||||||| |||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||    
T  3132849 gcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taata 3132947  T
Q  134 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 172  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3132948 tttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7662686 - 7662569
Alignment:
Q  44 tattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 143  Q
    |||||||| | || ||||||||||| | || ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |    
T  7662686 tattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattag 7662588  T
Q  144 attgatccgtcatgagaat 162  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  7662587 attgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 246  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 117
Target Start/End: Original strand, 7396361 - 7396450
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgta---ggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatata 117  Q
    |||||||||||||||||||||    |||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396361 aaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaataaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  197 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 272  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  158 agaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 257  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  258 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 162
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396527
Alignment:
Q  104 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 162  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggattaacccgtcataagaat 7396527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 128
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  73 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  192 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 256  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 18454 - 18774
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18454 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18553  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18554 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18653  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18753  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  18754 gat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26031 - 25706
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26031 atcattaaagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatatta 25932  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 25832  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 25732  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatgatga 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  25731 gatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21330289 - 21329968
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330289 atcattaaagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21330190  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330189 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21330090  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21330089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggtt 21329990  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21329989 gatggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 18796672 - 18796993
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796672 atcattaaagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18796771  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796772 ggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattc 18796871  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18796872 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgtt 18796971  T
Q  325 gatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  18796972 gatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 18619976 - 18620296
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18619976 aaagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagta 18620075  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 230  Q
    ||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18620076 atatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttat-gaaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccct 18620174  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 330  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18620175 ttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatggg 18620274  T
Q  331 tactccatgaatcatgatgatg 352  Q
    |||||||  ||||||| |||||    
T  18620275 tactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 36270338 - 36270650
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||   |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36270338 aaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagta 36270437  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 229  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||  ||| ||||  |||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36270438 atatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-caccc 36270533  T
Q  230 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 329  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36270534 ttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgg 36270633  T
Q  330 gtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||| ||||||||||    
T  36270634 gtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 346
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978360
Alignment:
Q  75 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  175 aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 273  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  274 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22183518 - 22183206
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22183518 aaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagta 22183419  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 229  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||   || |||||  |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22183418 ata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccc 22183323  T
Q  230 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 329  Q
    || ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22183322 tttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgg 22183223  T
Q  330 gtactccatgaatcatg 346  Q
    ||| |  ||||||||||    
T  22183222 gtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  34 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 131  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  132 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccaccct 230  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||  ||||  || ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatagaaaa--ttatgtaa-gtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 6991950  T
Q  231 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 329  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6991949 tcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgg 6991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 334
Target Start/End: Original strand, 18822249 - 18822556
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||   ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18822249 atcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatatta 18822348  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtatt 223  Q
       ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||  ||| |||||  ||||  ||  |||  |||||||||  |||| ||||||||||    
T  18822349 atggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaaga-tctcaagtcattctcatatagataagtggtgtatt 18822445  T
Q  224 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  18822446 ccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggt 18822545  T
Q  324 tgatgggtact 334  Q
    | |||||||||    
T  18822546 taatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 30174377 - 30174679
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174377 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 30174475  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  30174476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 30174572  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  30174573 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 30174671  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  30174672 gaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24250334 - 24250032
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250334 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 24250236  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  24250235 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 24250139  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  24250138 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 24250040  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  24250039 gaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24229517 - 24229215
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24229517 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 24229419  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| | | ||    
T  24229418 actggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttg 24229322  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||    
T  24229321 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgat 24229223  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  24229222 gaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Original strand, 19279460 - 19279600
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 130  Q
    |||||||| |||||||||||   || |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  19279460 aaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagta 19279559  T
Q  131 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 171  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19279560 atatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||| |||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtact 334  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18852085 - 18851977
Alignment:
Q  40 agactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 139  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18852085 agactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttata 18851986  T
Q  140 ttggattga 148  Q
    |||||||||    
T  18851985 ttggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 348
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800775
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  ||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggata 29800641  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 313  Q
     |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |    
T  29800642 atggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatca 29800740  T
Q  314 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatgat 348  Q
    ||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||    
T  29800741 taatgttggttaatgggcacttgacgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 346
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  183 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  283 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  45 attatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 143  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  144 attga 148  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 261
Target Start/End: Original strand, 19616509 - 19616653
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19616509 tataaatattaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgata 19616605  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 261  Q
     | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19616606 atagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  199 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||  | | ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatgaa--gtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 248  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  279 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  116 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || ||  |||||||||| || ||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  216 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 315  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  316 aagttg 321  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 249
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||   ||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 249  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  185 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  110 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  41 gactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    ||||| |||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaatat-gagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  141 tggattga 148  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12098649 - 12098616
Alignment:
Q  35 catagagactattatgtaggtagactgatgatca 68  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12098649 catagagactattatgtatgtagactgatgatca 12098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24763792 - 24763751
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 148  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24763792 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1461
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatatta 1258  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 agagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 1358  T
Q  225 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1359 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggtt 1458  T
Q  325 gat 327  Q
    |||    
T  1459 gat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 5695 - 6013
Alignment:
Q  25 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 124  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5695 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5794  T
Q  125 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||    
T  5795 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcatt 5885  T
Q  224 cca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 322  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886 ccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 5985  T
Q  323 ttgatgggtactccatgaatcatgatga 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5986 ttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 90 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  90 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  190 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  290 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 183 - 485
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 gagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 281  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  282 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 378  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 477  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  478 gaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3675
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3977 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 3879  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3878 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3782  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  3781 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 3683  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  3682 gaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 119730 - 120032
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119730 gagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 119828  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  119829 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 119925  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  119926 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 120024  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  120025 gaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13251 - 12961
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13251 gagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 13153  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  13152 accggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactcttagacctg 13056  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13055 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 130526 - 130262
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130526 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 130428  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  130427 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 130331  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130330 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 67609 - 67374
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| |||||||||||     
T  67609 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcac 67513  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  67512 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 67414  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  67413 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39988
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |  ||||||| ||    ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  239 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 338  Q
    |||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  339 gaatcatg 346  Q
    ||||||||    
T  39995 gaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 249
Target Start/End: Original strand, 8305 - 8511
Alignment:
Q  39 gagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8403  T
Q  139 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 238  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8404 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8500  T
Q  239 aaaccactatg 249  Q
    |||||||||||    
T  8501 aaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 90151 - 90033
Alignment:
Q  31 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacacctcacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 129  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  90151 aaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtat 90052  T
Q  130 aatatttatattggattga 148  Q
    || ||||||||||||||||    
T  90051 aacatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 346
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  156 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 255  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  256 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 318
Target Start/End: Original strand, 8807 - 9005
Alignment:
Q  116 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| |||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  216 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 315  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactata 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||||   |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  211 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 310  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  311 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  114 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 213  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagtat--gttacgaag-gtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  214 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 249  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 346
Target Start/End: Original strand, 53832 - 54066
Alignment:
Q  107 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 206  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  53832 acataggtataaatattaagagtaatattcacactgggttgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcaa 53928  T
Q  207 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 306  Q
      || || | || |||    | ||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  53929 catgttaatagtttatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctaggtgt-ggactcaagtgctttatg-ccattctaacgttgtatgtaaaagg 54026  T
Q  307 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 346  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54027 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 169
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  78 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataa----atattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacat 169  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University