View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17002_low_6 (Length: 547)

Name: NF17002_low_6
Description: NF17002
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17002_low_6
NF17002_low_6
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (15-528)||(15301396-15301909)
chr8 (15-528)||(15481765-15482278)
chr8 (15-528)||(15445144-15445656)
chr8 (13-528)||(15282875-15283402)
chr8 (13-528)||(15463244-15463771)
chr8 (153-520)||(15114025-15114392)
chr8 (77-528)||(15312249-15312712)
chr8 (77-528)||(15492618-15493081)
chr8 (117-333)||(18051086-18051302)
chr8 (368-497)||(15280288-15280429)
chr8 (368-497)||(15460657-15460798)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 506; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15301909 - 15301396
Alignment:
Q  15 caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15301909 caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac 15301810  T
Q  115 tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15301809 tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggaaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac 15301710  T
Q  215 aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15301709 aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag 15301610  T
Q  315 gaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15301609 gaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg 15301510  T
Q  415 tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15301509 tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc 15301410  T
Q  515 cttttatttaagag 528  Q
    ||||||||||||||    
T  15301409 cttttatttaagag 15301396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15482278 - 15481765
Alignment:
Q  15 caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482278 caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac 15482179  T
Q  115 tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482178 tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggaaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac 15482079  T
Q  215 aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482078 aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag 15481979  T
Q  315 gaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15481978 gaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg 15481879  T
Q  415 tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15481878 tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc 15481779  T
Q  515 cttttatttaagag 528  Q
    ||||||||||||||    
T  15481778 cttttatttaagag 15481765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15445656 - 15445144
Alignment:
Q  15 caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac 114  Q
    |||| |||||| |||||  |||| | |||||||| ||| | |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15445656 caaaaggcaacgacttagactattataagtatatgcatgttattgacctttctaacaaccatttttcgggtagaataccttcagaagtatttagactcac 15445557  T
Q  115 tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac 214  Q
    ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15445556 tgcattgaaatccttgaacttgt-acaaaatcaattaatgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac 15445458  T
Q  215 aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15445457 aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgttgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag 15445358  T
Q  315 gaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15445357 gaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggtaatcctgaactttgtggaactccactcattgagaaatgcaaacacaatgaagcccttgg 15445258  T
Q  415 tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc 514  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |     
T  15445257 tgaggacacaaatgacgaggaaggatccgagttaatggaatgtttctatatgggcatgggagttggatttgcaacaggcttctggatagtttttggttct 15445158  T
Q  515 cttttatttaagag 528  Q
    |||||||| |||||    
T  15445157 cttttattcaagag 15445144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15283402 - 15282875
Alignment:
Q  13 agcaaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactc 112  Q
    |||||| || ||| ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15283402 agcaaaaggaaacgacttaacctatgacaagtatatgcatgtcgttgacctttctaacaaccaattgtcaggtagaatacctatagaagtatttagactc 15283303  T
Q  113 actgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaa 212  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15283302 actgcattgaaatccttaaacttgtcacaaaatcaattaatgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacaattagagtcccttgatttgtcaa 15283203  T
Q  213 acaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283202 acaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtctgctataacttttcttgaggtattaaacctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccatt 15283103  T
Q  313 aggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagccctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  15283102 aggaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggcaatcctgaactttgtggaactccactcattgagaaatgcaaaaagaatgaagcccct 15283003  T
Q  413 ggtgaggacataaat------------gatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctgga 500  Q
    |||||||||| ||||            || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15283002 ggtgaggacacaaatgttatggcaaaagaagaggaaggatctgagctaatggaatgtttctatatgggcatgggagttggatttacaacaggcttctgga 15282903  T
Q  501 tagtttttggtacccttttatttaagag 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15282902 tagtttttggtacccttttatttaagag 15282875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15463771 - 15463244
Alignment:
Q  13 agcaaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactc 112  Q
    |||||| || ||| ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15463771 agcaaaaggaaacgacttaacctatgacaagtatatgcatgtcgttgacctttctaacaaccaattgtcaggtagaatacctatagaagtatttagactc 15463672  T
Q  113 actgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaa 212  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15463671 actgcattgaaatccttaaacttgtcacaaaatcaattaatgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacaattagagtcccttgatttgtcaa 15463572  T
Q  213 acaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15463571 acaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtctgctataacttttcttgaggtattaaacctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccatt 15463472  T
Q  313 aggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagccctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  15463471 aggaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggcaatcctgaactttgtggaactccactcattgagaaatgcaaaaagaatgaagcccct 15463372  T
Q  413 ggtgaggacataaat------------gatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctgga 500  Q
    |||||||||| ||||            || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15463371 ggtgaggacacaaatgttatggcaaaagaagaggaaggatctgagctaatggaatgtttctatatgggcatgggagttggatttacaacaggcttctgga 15463272  T
Q  501 tagtttttggtacccttttatttaagag 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15463271 tagtttttggtacccttttatttaagag 15463244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 153 - 520
Target Start/End: Original strand, 15114025 - 15114392
Alignment:
Q  153 tgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtc 252  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15114025 tgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatttctcaaacaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtc 15114124  T
Q  253 tctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatg 352  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15114125 tctttcttttcttgaggtattgaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagctttacaccacttagttgtatg 15114224  T
Q  353 ggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatgg 452  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  15114225 ggtaatcctgaactttgtggaactccactcattgcgaaatgcaaacacaatgaagcccctggtgaggacacaaatgacgaggaatgatccgagttaatgg 15114324  T
Q  453 aatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtaccctttta 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  15114325 aatgtttctatatgggcatgggagttggatttgcaatcagcttttggattgtttttggttctctttta 15114392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 77 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15312712 - 15312249
Alignment:
Q  77 ttgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcactgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattg 176  Q
    ||||| || ||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15312712 ttgtccggcagaattcctttagaaatattcagactcactgcattacaatccttgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgaaattg 15312613  T
Q  177 gcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15312612 gcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaactcactttcaggagaaattcctcaaaccatgtctgctctatcttttcttgaggtattgaa 15312513  T
Q  277 tctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaact 376  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15312512 tctctcattcaacaatttaaaaggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggcaatcctgaactttgtggaagt 15312413  T
Q  377 ccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaat------------gatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctata 464  Q
    || |||||||| |||||||| ||  || ||| || || ||  |||||||||            || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15312412 ccgctcattgagaaatgcaaccatgataaagtccctgatggtgacataaatgttatggcaaaagaagaggaaggatccgagctaatggaatgtttctata 15312313  T
Q  465 tgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacccttttatttaagag 528  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  15312312 tgggtatgggagttggatttgcaacaggcttctgggtagtttttggttctcttttattcaagag 15312249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 77 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15493081 - 15492618
Alignment:
Q  77 ttgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcactgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattg 176  Q
    ||||| || ||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15493081 ttgtccggcagaattcctttagaaatattcagactcactgcattacaatccttgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgaaattg 15492982  T
Q  177 gcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15492981 gcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaactcactttcaggagaaattcctcaaaccatgtctgctctatcttttcttgaggtattgaa 15492882  T
Q  277 tctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaact 376  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15492881 tctctcattcaacaatttaaaaggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggcaatcctgaactttgtggaagt 15492782  T
Q  377 ccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaat------------gatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctata 464  Q
    || |||||||| |||||||| ||  || ||| || || ||  |||||||||            || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15492781 ccgctcattgagaaatgcaaccatgataaagtccctgatggtgacataaatgttatggcaaaagaagaggaaggatccgagctaatggaatgtttctata 15492682  T
Q  465 tgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacccttttatttaagag 528  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  15492681 tgggtatgggagttggatttgcaacaggcttctgggtagtttttggttctcttttattcaagag 15492618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 117 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18051302 - 18051086
Alignment:
Q  117 cattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaa 216  Q
    |||| |||||| | || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||| || | || || ||    
T  18051302 cattgcaatccttaaatttgtcgcataatcaattaatgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacaattggaatcccttaatttctcgaataa 18051203  T
Q  217 cacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattagga 316  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  || |  |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18051202 cacactttctggagaaattcctaaaagcatgtctgctttaactttccttgaggcattgaatctctcattcaacaatttggagggtcaaatcccattagga 18051103  T
Q  317 acccaactccaaagctt 333  Q
    |||||||| ||||||||    
T  18051102 acccaacttcaaagctt 18051086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 368 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15280429 - 15280288
Alignment:
Q  368 tgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaatgat------------gaggaaggatccgagctaatggaat 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |            ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15280429 tgtggaactccactcattgagaaatgcaaacacaatgaagcccctggtgaggacacaaatgttatggcaaaagaagagtaaggatctgagctaatggaat 15280330  T
Q  456 gtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttct 497  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  15280329 gtttctatatgggcatgggagttggatttgcaacaggcttct 15280288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 368 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15460798 - 15460657
Alignment:
Q  368 tgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaatgat------------gaggaaggatccgagctaatggaat 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |            ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15460798 tgtggaactccactcattgagaaatgcaaacacaatgaagcccctggtgaggacacaaatgttatggcaaaagaagagtaaggatctgagctaatggaat 15460699  T
Q  456 gtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttct 497  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  15460698 gtttctatatgggcatgggagttggatttgcaacaggcttct 15460657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University