View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17004_low_1 (Length: 416)

Name: NF17004_low_1
Description: NF17004
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17004_low_1
NF17004_low_1
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (3-407)||(32296574-32296979)
chr3 (3-390)||(5727940-5728328)
chr3 (3-390)||(47029415-47029803)
chr3 (3-390)||(5717030-5717418)
chr3 (3-390)||(5764040-5764428)
chr3 (3-390)||(10649033-10649420)
chr3 (3-391)||(8217593-8217983)
chr3 (3-407)||(29658879-29659283)
chr3 (3-391)||(5472949-5473336)
chr3 (3-390)||(51787984-51788371)
chr3 (3-396)||(4340587-4340980)
chr3 (3-390)||(4790544-4790932)
chr3 (3-390)||(4422880-4423267)
chr3 (3-368)||(31958366-31958733)
chr3 (3-368)||(5603224-5603591)
chr3 (3-368)||(24334157-24334524)
chr3 (3-407)||(28109862-28110271)
chr3 (3-391)||(10402110-10402497)
chr3 (3-407)||(18248683-18249087)
chr3 (3-407)||(16422128-16422532)
chr3 (3-407)||(29142665-29143072)
chr3 (3-407)||(4629730-4630133)
chr3 (3-407)||(21680646-21681049)
chr3 (3-391)||(22381492-22381879)
chr3 (3-391)||(17970777-17971163)
chr3 (3-407)||(28027236-28027638)
chr3 (3-407)||(48471872-48472280)
chr3 (3-390)||(5019675-5020061)
chr3 (3-390)||(18231155-18231542)
chr3 (3-391)||(20071994-20072384)
chr3 (3-407)||(16618400-16618808)
chr3 (3-407)||(20570757-20571161)
chr3 (6-396)||(5590275-5590665)
chr3 (3-391)||(18286266-18286653)
chr3 (3-391)||(18301567-18301954)
chr3 (3-391)||(22864759-22865145)
chr3 (3-391)||(22879818-22880204)
chr3 (3-390)||(11104272-11104660)
chr3 (3-396)||(17978861-17979255)
chr3 (3-391)||(6536654-6537042)
chr3 (3-391)||(7079183-7079576)
chr3 (3-368)||(28345155-28345519)
chr3 (3-390)||(18057222-18057612)
chr3 (3-390)||(31030156-31030536)
chr3 (3-390)||(6207862-6208245)
chr3 (6-389)||(18336591-18336968)
chr3 (3-407)||(19700431-19700847)
chr3 (3-390)||(4727595-4727976)
chr3 (3-391)||(32445115-32445494)
chr3 (3-390)||(15735011-15735393)
chr3 (3-390)||(35886726-35887109)
chr3 (3-390)||(8283369-8283767)
chr3 (3-390)||(4689613-4689994)
chr3 (3-391)||(5658095-5658480)
chr3 (3-252)||(15886652-15886895)
chr3 (281-391)||(15886894-15887006)
chr3 (305-390)||(8002522-8002607)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (3-391)||(12034-12421)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (3-390)||(30174471-30174859)
chr5 (3-389)||(33881133-33881519)
chr5 (3-389)||(18369300-18369686)
chr5 (3-395)||(3795539-3795932)
chr5 (7-390)||(11555360-11555742)
chr5 (3-391)||(37760987-37761376)
chr5 (3-391)||(43084263-43084651)
chr5 (3-391)||(18494536-18494923)
chr5 (3-391)||(28655247-28655636)
chr5 (3-390)||(40467321-40467708)
chr5 (3-407)||(22894405-22894808)
chr5 (3-390)||(41680710-41681098)
chr5 (6-391)||(9544478-9544864)
chr5 (3-407)||(33298522-33298930)
chr5 (3-407)||(37352412-37352816)
chr5 (3-390)||(13180561-13180944)
chr5 (3-391)||(37746090-37746484)
chr5 (3-389)||(11329644-11330032)
chr5 (3-407)||(32590044-32590447)
chr5 (3-382)||(30158048-30158427)
chr5 (3-389)||(8659240-8659625)
chr5 (3-407)||(28953548-28953952)
chr5 (3-389)||(24729977-24730363)
chr5 (3-390)||(13318596-13318982)
chr5 (3-391)||(13436442-13436836)
chr5 (3-396)||(6880303-6880697)
chr5 (3-390)||(23631975-23632364)
chr5 (3-407)||(9323466-9323869)
chr5 (3-391)||(15752626-15753008)
chr5 (3-407)||(2517054-2517459)
chr5 (3-407)||(12138165-12138568)
chr5 (3-396)||(33522382-33522776)
chr5 (26-391)||(30035431-30035795)
chr5 (3-390)||(34622524-34622912)
chr5 (3-407)||(31820178-31820580)
chr5 (3-391)||(37665254-37665642)
chr5 (3-391)||(5643805-5644191)
chr5 (3-391)||(18122184-18122572)
chr5 (6-391)||(31437469-31437847)
chr5 (3-407)||(26486385-26486778)
chr5 (10-407)||(25206266-25206670)
chr5 (10-407)||(25270422-25270826)
chr5 (3-391)||(22992892-22993272)
chr5 (3-391)||(15652528-15652914)
chr5 (3-391)||(23897879-23898261)
chr5 (3-391)||(33783492-33783875)
chr5 (3-391)||(24608250-24608634)
chr5 (3-391)||(24975854-24976236)
chr5 (3-390)||(30940642-30941023)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (3-389)||(13518009-13518395)
chr6 (3-407)||(27284177-27284581)
chr6 (3-406)||(27623522-27623927)
chr6 (3-407)||(27355926-27356330)
chr6 (3-407)||(8899514-8899918)
chr6 (3-407)||(34458323-34458725)
chr6 (3-391)||(16755815-16756204)
chr6 (3-390)||(4763759-4764146)
chr6 (3-390)||(28166490-28166878)
chr6 (3-407)||(33370246-33370650)
chr6 (3-407)||(29555537-29555941)
chr6 (3-389)||(27491130-27491516)
chr6 (3-391)||(27063477-27063864)
chr6 (3-407)||(22928696-22929102)
chr6 (3-389)||(16680136-16680523)
chr6 (3-407)||(26110226-26110629)
chr6 (3-407)||(26772444-26772847)
chr6 (3-391)||(26791811-26792199)
chr6 (3-390)||(29507412-29507801)
chr6 (3-389)||(29579012-29579397)
chr6 (3-407)||(4539573-4539978)
chr6 (3-396)||(30551815-30552208)
chr6 (3-407)||(28213433-28213838)
chr6 (3-407)||(27200165-27200569)
chr6 (3-407)||(27248664-27249068)
chr6 (3-390)||(4778876-4779264)
chr6 (3-390)||(13292766-13293147)
chr6 (3-407)||(4531267-4531671)
chr6 (6-391)||(14139218-14139597)
chr6 (3-406)||(16937840-16938243)
chr6 (6-391)||(27013728-27014106)
chr6 (3-391)||(26926763-26927135)
chr6 (3-391)||(27208899-27209283)
chr6 (3-391)||(27239945-27240329)
chr6 (3-390)||(27031019-27031403)
chr6 (3-305)||(26666473-26666774)
chr6 (3-391)||(24869705-24870087)
chr6 (3-390)||(27025141-27025524)
chr6 (3-390)||(24299575-24299957)
chr6 (3-390)||(15406348-15406731)
chr6 (3-390)||(15418135-15418518)
chr6 (15-369)||(20174566-20174930)
chr6 (15-369)||(22161061-22161425)
chr6 (310-407)||(23851450-23851547)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (3-390)||(20332290-20332678)
chr4 (3-390)||(40099504-40099892)
chr4 (3-390)||(27157180-27157569)
chr4 (3-407)||(39856630-39857032)
chr4 (3-390)||(24586229-24586617)
chr4 (3-389)||(14104554-14104939)
chr4 (3-389)||(30759775-30760159)
chr4 (3-389)||(33667671-33668055)
chr4 (3-407)||(18794485-18794889)
chr4 (3-391)||(54839400-54839787)
chr4 (3-391)||(5700549-5700937)
chr4 (3-391)||(14753362-14753749)
chr4 (3-391)||(34182832-34183218)
chr4 (3-407)||(1906245-1906654)
chr4 (6-396)||(21975708-21976098)
chr4 (3-407)||(5011870-5012275)
chr4 (3-396)||(31120378-31120772)
chr4 (3-391)||(36338394-36338774)
chr4 (7-391)||(24118672-24119055)
chr4 (3-407)||(15276497-15276904)
chr4 (3-407)||(15233809-15234217)
chr4 (3-407)||(15380106-15380510)
chr4 (3-391)||(6575871-6576251)
chr4 (3-383)||(1673877-1674258)
chr4 (3-390)||(17019062-17019445)
chr4 (3-310)||(36324185-36324484)
chr4 (3-390)||(14671026-14671410)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (3-390)||(254510-254897)
chr2 (3-390)||(37945723-37946111)
chr2 (3-391)||(27809697-27810087)
chr2 (3-390)||(16167475-16167862)
chr2 (3-391)||(12592806-12593198)
chr2 (3-390)||(13930402-13930791)
chr2 (3-390)||(12661536-12661922)
chr2 (3-391)||(3788490-3788877)
chr2 (3-390)||(37931369-37931763)
chr2 (3-391)||(37383673-37384061)
chr2 (3-407)||(39896048-39896452)
chr2 (3-368)||(22922001-22922368)
chr2 (3-390)||(27122522-27122907)
chr2 (3-389)||(34867681-34868066)
chr2 (3-390)||(9343845-9344232)
chr2 (3-368)||(19410342-19410709)
chr2 (3-407)||(40239489-40239892)
chr2 (3-390)||(39045680-39046067)
chr2 (3-407)||(12710459-12710863)
chr2 (3-407)||(27782212-27782616)
chr2 (3-391)||(34160840-34161230)
chr2 (3-407)||(37679749-37680155)
chr2 (3-407)||(37695014-37695420)
chr2 (3-396)||(21697031-21697427)
chr2 (3-391)||(32055798-32056185)
chr2 (3-390)||(31882284-31882670)
chr2 (3-396)||(16823195-16823588)
chr2 (3-396)||(16897892-16898285)
chr2 (3-407)||(21671028-21671435)
chr2 (3-407)||(11629043-11629446)
chr2 (3-391)||(34297152-34297533)
chr2 (3-339)||(31868644-31868979)
chr2 (3-407)||(27396303-27396717)
chr2 (3-407)||(19450276-19450689)
chr2 (3-391)||(28888275-28888658)
chr2 (3-391)||(34268784-34269167)
chr2 (3-390)||(23122436-23122818)
chr2 (7-391)||(27428315-27428692)
chr2 (3-390)||(20843909-20844296)
chr2 (3-190)||(23116993-23117180)
chr2 (334-390)||(31887682-31887738)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (3-407)||(3047-3453)
scaffold0159 (3-246)||(17949-18194)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (3-391)||(9360620-9361007)
chr8 (3-390)||(31360527-31360914)
chr8 (3-396)||(28355780-28356176)
chr8 (3-390)||(33248365-33248751)
chr8 (3-391)||(18796704-18797093)
chr8 (3-368)||(31483700-31484067)
chr8 (3-407)||(19680430-19680833)
chr8 (3-395)||(29835317-29835708)
chr8 (3-390)||(44566979-44567369)
chr8 (3-390)||(15773573-15773960)
chr8 (3-391)||(18715478-18715868)
chr8 (3-391)||(21342000-21342389)
chr8 (3-407)||(12086553-12086958)
chr8 (40-391)||(33264729-33265079)
chr8 (3-390)||(19910992-19911381)
chr8 (3-407)||(19202205-19202598)
chr8 (3-407)||(22074759-22075164)
chr8 (3-407)||(27602744-27603141)
chr8 (131-407)||(16260205-16260480)
chr8 (6-391)||(19655180-19655562)
chr8 (3-390)||(2131098-2131479)
chr8 (3-391)||(22138904-22139286)
chr8 (3-390)||(19694094-19694477)
chr8 (3-386)||(14569160-14569540)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (3-390)||(3647147-3647534)
chr1 (3-390)||(10968666-10969054)
chr1 (3-389)||(10951093-10951480)
chr1 (3-389)||(28591085-28591470)
chr1 (3-390)||(41787177-41787566)
chr1 (25-407)||(51644204-51644588)
chr1 (3-391)||(28155726-28156116)
chr1 (3-407)||(20334283-20334689)
chr1 (3-407)||(16201895-16202307)
chr1 (3-407)||(20466761-20467173)
chr1 (3-407)||(21891630-21892020)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (3-390)||(26678858-26679246)
chr7 (3-390)||(26663666-26664054)
chr7 (3-407)||(16745274-16745679)
chr7 (3-401)||(26441238-26441637)
chr7 (3-407)||(5141088-5141493)
chr7 (3-390)||(39206893-39207280)
chr7 (3-390)||(5164380-5164767)
chr7 (3-390)||(26518789-26519174)
chr7 (3-368)||(4138999-4139366)
chr7 (3-390)||(31558148-31558535)
chr7 (3-396)||(24586289-24586682)
chr7 (3-391)||(5154079-5154466)
chr7 (3-407)||(16047294-16047695)
chr7 (25-391)||(26509471-26509839)
chr7 (3-391)||(45737296-45737686)
chr7 (3-391)||(11418533-11418921)
chr7 (3-407)||(11446867-11447271)
chr7 (3-407)||(26268839-26269247)
chr7 (3-382)||(45393223-45393602)
chr7 (3-390)||(2160566-2160955)
chr7 (3-407)||(4205368-4205772)
chr7 (3-393)||(16443757-16444148)
chr7 (3-407)||(3451297-3451702)
chr7 (3-407)||(26313603-26314006)
chr7 (3-407)||(31084376-31084781)
chr7 (6-391)||(2779247-2779626)
chr7 (3-304)||(26595750-26596053)
chr7 (3-391)||(31129900-31130282)
chr7 (3-407)||(10847562-10847968)
chr7 (3-391)||(16512194-16512576)
chr7 (3-390)||(10910680-10911061)
chr7 (305-390)||(26531926-26532011)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (3-391)||(9510-9897)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (3-391)||(4471-4862)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-390)||(18584-18973)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (3-391)||(8797-9184)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (3-407)||(1639-2043)
scaffold0322 (3-407)||(12028-12443)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (3-391)||(9912-10299)
scaffold0143 (3-391)||(33295-33680)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (3-407)||(15551-15962)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (3-407)||(13931-14336)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (3-407)||(25097-25509)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (3-390)||(6065-6449)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (3-390)||(24774-25157)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (3-175)||(1-173)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (229-407)||(359-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (245-407)||(26243-26405)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (3-383)||(40497-40898)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32296979 - 32296574
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296979 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 32296880  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296879 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 32296780  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32296779 ctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattc 32296680  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32296679 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaacttc 32296580  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  32296579 tgatga 32296574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5728328 - 5727940
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728328 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5728229  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728228 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5728129  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728128 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5728029  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728028 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 5727940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 47029803 - 47029415
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029803 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 47029704  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 47029604  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029603 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 47029504  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029503 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 47029415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5717418 - 5717030
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717418 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5717319  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717318 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5717219  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717218 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5717119  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5717118 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 5717030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 5764040 - 5764428
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764040 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5764139  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764140 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5764239  T
Q  203 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764240 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5764339  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5764340 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 5764428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10649420 - 10649033
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649420 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10649321  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10649320 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 10649221  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649220 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 10649122  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10649121 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 10649033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8217983 - 8217593
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217983 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8217884  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8217883 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 8217784  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217783 taactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 8217685  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8217684 ccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 8217593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 29658879 - 29659283
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658879 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29658978  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658979 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 29659078  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659079 actttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 29659177  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||     
T  29659178 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 29659277  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  29659278 tgatga 29659283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5473336 - 5472949
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473336 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5473237  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5473236 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 5473138  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473137 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5473039  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5473038 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 5472949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 51788371 - 51787984
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788371 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 51788272  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51788271 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatata 51788172  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788171 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 51788073  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51788072 acaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 51787984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Original strand, 4340587 - 4340980
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340587 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 4340686  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4340687 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 4340786  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340787 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 4340885  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||    
T  4340886 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaa 4340980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 4790544 - 4790932
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790544 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4790643  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4790644 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 4790743  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||     
T  4790744 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggattt 4790842  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4790843 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 4790932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4423267 - 4422880
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423267 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4423168  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4423167 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 4423068  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  4423067 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 4422969  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422968 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 4422880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 368
Target Start/End: Original strand, 31958366 - 31958733
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31958366 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 31958465  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958466 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31958565  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31958566 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31958665  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31958666 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 31958733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 3 - 368
Target Start/End: Original strand, 5603224 - 5603591
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5603224 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgct 5603323  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603324 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5603423  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5603424 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 5603523  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5603524 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 5603591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 3 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24334524 - 24334157
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24334524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 24334425  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24334424 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatag 24334325  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24334324 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24334225  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24334224 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 24334157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 28109862 - 28110271
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109862 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28109961  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109962 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaacgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 28110061  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28110062 atagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacgga 28110161  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaaa 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||| ||||||     
T  28110162 ttcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaag 28110261  T
Q  398 cttctgatga 407  Q
    |||| |||||    
T  28110262 cttcagatga 28110271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10402497 - 10402110
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402497 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10402398  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402397 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 10402298  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  10402297 gctttgaaagtagaa-aaaaatagaatttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggattt 10402200  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10402199 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 10402110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18249087 - 18248683
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18248988  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248987 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgta 18248888  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248887 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttc-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18248789  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||     
T  18248788 acaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 18248689  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  18248688 tgatga 18248683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16422532 - 16422128
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422532 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16422433  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 199  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  16422432 caggtttgcttt-caaaatacacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 16422334  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16422333 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16422235  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16422234 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc-ggaaactttgaattcgcaagcacagaagct 16422136  T
Q  400 tctgatga 407  Q
    || |||||    
T  16422135 tcagatga 16422128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 29142665 - 29143072
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29142665 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 29142764  T
Q  103 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29142765 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 29142864  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142865 tagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 29142964  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  29142965 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 29143064  T
Q  400 tctgatga 407  Q
    || |||||    
T  29143065 tcagatga 29143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4630133 - 4629730
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4630133 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4630035  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4630034 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 4629935  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4629934 actttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatta 4629836  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  4629835 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 4629736  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  4629735 agatga 4629730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21681049 - 21680646
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21681049 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 21680951  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21680950 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatata 21680851  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680850 actttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 21680752  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  21680751 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 21680652  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  21680651 agatga 21680646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 22381492 - 22381879
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  22381492 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgct 22381590  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381591 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 22381690  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22381691 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 22381789  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22381790 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 22381879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 17970777 - 17971163
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970777 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacgcatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 17970876  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  17970877 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatag 17970976  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17970977 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 17971074  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17971075 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 17971163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28027638 - 28027236
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027638 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28027539  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  28027538 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatag 28027439  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28027438 ctttgaaagtagaag-aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattca 28027341  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttct 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||| |||||| ||| |    
T  28027340 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctttt 28027241  T
Q  403 gatga 407  Q
    |||||    
T  28027240 gatga 28027236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48472280 - 48471872
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472280 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 48472181  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-----caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472180 caggtttgcttttcaaaatagacagaaagttttcaatttttaaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 48472081  T
Q  198 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  48472080 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatgg 48471982  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaa 397  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  48471981 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggaa 48471882  T
Q  398 cttctgatga 407  Q
    ||| ||||||    
T  48471881 cttttgatga 48471872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5020061 - 5019675
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5020061 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5019962  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5019961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 5019862  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5019861 gctttgaaagtagaagaaag-tagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattt 5019764  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019763 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 5019675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18231542 - 18231155
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18231542 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgct 18231443  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231442 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 18231343  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231342 gctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18231244  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18231243 gcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 18231155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20072384 - 20071994
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072384 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20072285  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20072284 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 20072185  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  20072184 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacgga 20072087  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20072086 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 20071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 16618400 - 16618808
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16618400 cacagactatcctggggaagagcctccttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16618499  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 196  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  16618500 caggtttgcttt-caaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 16618598  T
Q  197 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 296  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16618599 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 16618697  T
Q  297 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16618698 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaa 16618797  T
Q  397 acttctgatga 407  Q
     ||||||||||    
T  16618798 gcttctgatga 16618808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 20570757 - 20571161
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570757 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 20570856  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20570857 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 20570956  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20570957 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 20571055  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||     
T  20571056 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 20571155  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  20571156 tgatga 20571161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 396
Target Start/End: Original strand, 5590275 - 5590665
Alignment:
Q  6 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590275 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacctattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 5590374  T
Q  106 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5590375 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagct 5590474  T
Q  205 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 304  Q
    ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  5590475 ttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 5590573  T
Q  305 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  5590574 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 5590665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 18286266 - 18286653
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18286266 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18286364  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286365 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18286464  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18286465 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18286562  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  18286563 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagca 18286653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 18301567 - 18301954
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18301567 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18301665  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301666 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18301765  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18301766 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18301863  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  18301864 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagca 18301954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 22864759 - 22865145
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864759 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22864858  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22864859 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacag 22864958  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22864959 ctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggattt 22865055  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22865056 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 22865145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 22879818 - 22880204
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879818 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22879917  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22879918 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacag 22880017  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22880018 ctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggattt 22880114  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22880115 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 22880204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 11104272 - 11104660
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104272 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11104371  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata--t 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||  |    
T  11104372 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatattt 11104471  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  11104472 agctttgaaagtaaaaagaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggatt 11104570  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11104571 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaactcgcaagc 11104660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Original strand, 17978861 - 17979255
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17978861 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgct 17978960  T
Q  103 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17978961 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 17979060  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17979061 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 17979159  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  17979160 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 17979255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 6536654 - 6537042
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6536654 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgct 6536753  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536754 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 6536853  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  6536854 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 6536952  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6536953 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 6537042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7079576 - 7079183
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079576 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 7079477  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc-aattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7079476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatat 7079377  T
Q  201 a----gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 296  Q
    |    |||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7079376 atatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 7079278  T
Q  297 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7079277 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 7079183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28345519 - 28345155
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345519 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28345420  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28345419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 28345320  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28345319 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 28345222  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28345221 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 28345155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18057612 - 18057222
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057612 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18057513  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18057512 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 18057413  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18057412 taactttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18057314  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18057313 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 18057222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 31030156 - 31030536
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31030156 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatcttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 31030254  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030255 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31030349  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  31030350 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31030448  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31030449 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 31030536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6208245 - 6207862
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6208245 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6208147  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6208146 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcctttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 6208053  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6208052 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 6207953  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6207952 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 6207862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18336968 - 18336591
Alignment:
Q  6 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 105  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18336968 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcag 18336870  T
Q  106 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 205  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336869 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 18336775  T
Q  206 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18336774 tgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 18336676  T
Q  306 agcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18336675 agcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 18336591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19700847 - 19700431
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19700847 cacagactatcctggggaagaatctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19700748  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19700747 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttttt 19700649  T
Q  195 ------gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatg 288  Q
          ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19700648 ttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 19700550  T
Q  289 actccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaa 388  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19700549 actccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattcgcaa 19700450  T
Q  389 gcacagaaacttctgatga 407  Q
     || || | ||||||||||    
T  19700449 acataggagcttctgatga 19700431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4727976 - 4727595
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727976 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4727878  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4727877 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 4727784  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4727783 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4727685  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4727684 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 4727595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 32445494 - 32445115
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32445494 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 32445396  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  32445395 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatataa 32445303  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  32445302 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 32445204  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  32445203 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcgagca 32445115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 15735011 - 15735393
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15735011 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15735109  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| |    
T  15735110 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtaca 15735204  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15735205 taactttgaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15735302  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15735303 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 15735393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35887109 - 35886726
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |     
T  35887109 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttaca 35887011  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  35887010 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 35886917  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35886916 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 35886818  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35886817 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 35886726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 8283369 - 8283767
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8283369 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 8283468  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg- 190  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||          |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  8283469 caggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgt 8283568  T
Q  191 ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgac 290  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||   ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8283569 ttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaaacacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 8283667  T
Q  291 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8283668 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 8283767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4689994 - 4689613
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4689994 cacagactatcctggaggagaatctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 4689896  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  4689895 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 4689803  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4689802 taacttagaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4689705  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4689704 ttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacgcagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 4689613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5658480 - 5658095
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5658480 cacagactatccttgaggagaacctgcttgtaacatgcgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 5658382  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
     |||||||||||||||||      |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  5658381 taggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 5658288  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat--gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
    || | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5658287 taacgttgaaagtaaaaggaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaatgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacgg 5658189  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5658188 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 5658095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 15886652 - 15886895
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15886652 cacagactatccgggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatg-ttcgtttgaatgtaccctgttgct 15886750  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 199  Q
    ||||||||||||||||       ||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||||| |    
T  15886751 caggtttgcttttcaa-------aaaactttttcaattttcaagatgtttgcttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtaca 15886843  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 252  Q
    || ||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15886844 taactttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 391
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887006
Alignment:
Q  281 aaggcatgactccacggattc-acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaacttt 378  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  379 gaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||    
T  15886994 gaattcgcaagca 15887006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002522
Alignment:
Q  305 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 8002522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12421 - 12034
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12421 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12322  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12321 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatatag 12222  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12221 ctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 12123  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12122 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagca 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30174859 - 30174471
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174859 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 30174760  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174759 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 30174660  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174659 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 30174560  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174559 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 30174471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33881519 - 33881133
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881519 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33881420  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 33881320  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881319 ctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 33881220  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881219 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 33881133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Original strand, 18369300 - 18369686
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369300 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18369399  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369400 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 18369499  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18369500 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 18369599  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369600 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 18369686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3795932 - 3795539
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795932 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3795833  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795832 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3795733  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795732 ctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 3795633  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacaga 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3795632 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacaga 3795539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11555742 - 11555360
Alignment:
Q  7 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 106  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555742 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 11555643  T
Q  107 tttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555642 tttgcttttcaaaatagacaagaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttt 11555543  T
Q  207 gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11555542 gaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaa 11555444  T
Q  307 gcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11555443 gcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 11555360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37761376 - 37760987
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37761376 cacagtctatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgct 37761277  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761276 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 37761177  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37761176 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatt 37761078  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  37761077 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 37760987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 43084651 - 43084263
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084651 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 43084552  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43084551 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaactttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 43084452  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084451 actttgaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 43084353  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  43084352 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattcgccagca 43084263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 18494536 - 18494923
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494536 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18494635  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||    
T  18494636 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatatag 18494735  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18494736 ctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattca 18494834  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18494835 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaacttcgaattcgccagca 18494923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28655636 - 28655247
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655636 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28655537  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28655536 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtata 28655437  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28655436 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggat 28655339  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28655338 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 28655247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 40467321 - 40467708
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467321 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40467420  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40467421 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatata 40467520  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  40467521 gctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 40467619  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467620 ataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 40467708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22894808 - 22894405
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22894808 cacagactatcctggggaagagtctgcttgtaacacatatcgaaatagacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 22894709  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22894708 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacata 22894610  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  22894609 gctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 22894511  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22894510 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttc 22894411  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  22894410 tgatga 22894405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41681098 - 41680710
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41681098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 41681000  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41680999 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 41680900  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41680899 agctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggatt 41680800  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41680799 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 41680710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 6 - 391
Target Start/End: Original strand, 9544478 - 9544864
Alignment:
Q  6 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544478 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 9544577  T
Q  106 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9544578 gtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 9544677  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  9544678 gctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 9544775  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9544776 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcct-gaaactttgaattcgcaagca 9544864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33298930 - 33298522
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33298930 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 33298831  T
Q  103 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33298830 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 33298731  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298730 tagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 33298631  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaac 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |    
T  33298630 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 33298531  T
Q  399 ttctgatga 407  Q
    ||| |||||    
T  33298530 ttcagatga 33298522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 37352412 - 37352816
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37352412 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 37352511  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37352512 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 37352611  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37352612 gctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 37352710  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| | ||||  ||||| |||     
T  37352711 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttt 37352810  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  37352811 tgatga 37352816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 13180561 - 13180944
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180561 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13180660  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180661 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13180755  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  13180756 ctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 13180855  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180856 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 13180944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 37746090 - 37746484
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaaca------tactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccct 96  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37746090 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacattaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccct 37746189  T
Q  97 gttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746190 gttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 37746289  T
Q  197 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 296  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37746290 atatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 37746389  T
Q  297 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37746390 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 37746484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11330032 - 11329644
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11329933  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat- 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||     
T  11329932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatt 11329833  T
Q  201 -agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11329832 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 11329734  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329733 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 11329644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 32590044 - 32590447
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590044 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32590143  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32590144 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatata 32590243  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32590244 gctttgaaagtagaag-aaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattc 32590341  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||| |||     
T  32590342 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttt 32590441  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  32590442 tgatga 32590447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30158427 - 30158048
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30158427 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 30158328  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30158327 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 30158228  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30158227 gctttgaaagtagaagaaaggtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 30158129  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaat 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30158128 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaat 30158048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Original strand, 8659240 - 8659625
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659240 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 8659339  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8659340 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 8659439  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8659440 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 8659538  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8659539 acaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcc-cgaaactttgaattcacaag 8659625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 28953548 - 28953952
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28953548 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28953646  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28953647 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 28953746  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953747 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 28953845  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  28953846 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 28953945  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    | |||||    
T  28953946 cagatga 28953952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24730363 - 24729977
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24730363 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 24730264  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24730263 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatat 24730164  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24730163 agctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24730066  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730065 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 24729977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 13318596 - 13318982
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318596 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13318695  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318696 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13318795  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  13318796 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 13318894  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13318895 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcataacatttcccagaaactttgaattcgcaagc 13318982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 13436442 - 13436836
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436442 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaatatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13436541  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13436542 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgta 13436641  T
Q  198 tatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13436642 tatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 13436740  T
Q  297 gattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13436741 gattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 13436836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6880697 - 6880303
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880697 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacacattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6880598  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6880597 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatata 6880498  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6880497 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 6880399  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||| ||||||    
T  6880398 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 6880303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23632364 - 23631975
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632364 cacagactatcctggaggagaaccggcttataacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 23632265  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 199  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632264 caagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaagatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 23632165  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23632164 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 23632066  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23632065 tcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 23631975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9323869 - 9323466
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9323869 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 9323770  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9323769 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 9323670  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9323669 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 9323572  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9323571 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttc 9323472  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  9323471 agatga 9323466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 15752626 - 15753008
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752626 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15752725  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15752726 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaa----gaaagaaaatgttttgtatatag 15752821  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15752822 ctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattca 15752919  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15752920 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 15753008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2517459 - 2517054
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2517459 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacacgttgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 2517360  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517359 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 2517260  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2517259 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatct-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacggat 2517162  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  2517161 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 2517062  T
Q  400 tctgatga 407  Q
    | ||||||    
T  2517061 tttgatga 2517054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12138568 - 12138165
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12138568 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12138469  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12138468 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 12138369  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12138368 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 12138271  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12138270 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttc 12138171  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  12138170 agatga 12138165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33522776 - 33522382
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33522776 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 33522677  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33522676 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 33522577  T
Q  202 gctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33522576 gctttgaaagtaaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 33522478  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  33522477 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 33522382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 26 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30035795 - 30035431
Alignment:
Q  26 ctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagac 125  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30035795 ctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaac 30035696  T
Q  126 aaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaata 224  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30035695 aaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-ta 30035597  T
Q  225 gagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatt 324  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30035596 gaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatt 30035498  T
Q  325 ttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30035497 ttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 30035431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34622912 - 34622524
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622912 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34622813  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622812 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34622713  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  34622712 gctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattc 34622614  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34622613 acaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 34622524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 31820178 - 31820580
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31820178 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgct 31820277  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31820278 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 31820377  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31820378 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 31820475  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttct 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||| |    
T  31820476 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttt 31820575  T
Q  403 gatga 407  Q
    |||||    
T  31820576 gatga 31820580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 37665254 - 37665642
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37665254 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 37665352  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37665353 caggtttgctttttaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 37665452  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37665453 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 37665551  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  37665552 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaattttgaattcgcaagca 37665642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5644191 - 5643805
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5644191 cacagattatcttggaggagaacctgcttttaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 5644093  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5644092 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcgattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 5643993  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5643992 gctttgaaagtaaaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 5643895  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5643894 acaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagca 5643805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 18122184 - 18122572
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18122184 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18122282  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  18122283 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 18122382  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18122383 gctttgaaagtagaaaaaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18122481  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18122482 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 18122572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31437847 - 31437469
Alignment:
Q  6 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31437847 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 31437748  T
Q  106 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 205  Q
    |||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437747 gtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 31437654  T
Q  206 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 305  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31437653 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 31437555  T
Q  306 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31437554 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 31437469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26486778 - 26486385
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26486778 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26486679  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26486678 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 26486579  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26486578 ctttg-----------aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26486491  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26486490 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttc 26486391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25206670 - 25206266
Alignment:
Q  10 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 109  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25206670 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25206571  T
Q  110 gcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 201  Q
    ||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25206570 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25206472  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  25206471 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25206373  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || || | |||    
T  25206372 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagctt 25206273  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    |||||||    
T  25206272 ctgatga 25206266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25270826 - 25270422
Alignment:
Q  10 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 109  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25270826 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25270727  T
Q  110 gcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 201  Q
    ||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25270726 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25270628  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  25270627 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25270529  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || || | |||    
T  25270528 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagctt 25270429  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    |||||||    
T  25270428 ctgatga 25270422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 22992892 - 22993272
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22992892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 22992990  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992991 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcatcatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 22993084  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  22993085 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 22993183  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22993184 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcgatacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 22993272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 15652528 - 15652914
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15652528 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15652626  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||    | | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652627 caggtttgcttttttttaaaaaaaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 15652726  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  15652727 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 15652825  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15652826 caaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 15652914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23898261 - 23897879
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23898261 cacagactatcctggagaagaatctgcttgcaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 23898162  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----gta 197  Q
    ||||||||||||          |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    |||    
T  23898161 caggtttgcttt----------caaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgta 23898072  T
Q  198 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |     
T  23898071 catagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatga 23897973  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23897972 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcggaagca 23897879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33783875 - 33783492
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33783875 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 33783777  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gtat 198  Q
    | ||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||     
T  33783776 ccggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 33783684  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33783683 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 33783585  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33783584 tttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 33783492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24608634 - 24608250
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24608634 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacacttgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 24608535  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 199  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  24608534 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24608442  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||   ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24608441 taactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaagcacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24608343  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24608342 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 24608250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24976236 - 24975854
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24976236 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgct 24976137  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24976136 caggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24976045  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24976044 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24975946  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24975945 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcgagca 24975854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30941023 - 30940642
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30941023 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgct 30940925  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 199  Q
    ||||||||||||||||||        |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  30940924 caggtttgcttttcaaaa--------actttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 30940833  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||  |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30940832 taactttgaaagtaaaaagaaagcaga-atttcaaacaaaagcacaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 30940734  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30940733 ttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 30940642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Original strand, 13518009 - 13518395
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518009 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13518108  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13518208  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518209 ctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 13518308  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 13518395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 27284177 - 27284581
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284177 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27284276  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 27284376  T
Q  203 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27284377 ctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 27284475  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27284476 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagcttc 27284575  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  27284576 agatga 27284581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 406
Target Start/End: Original strand, 27623522 - 27623927
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623522 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27623621  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27623622 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatata 27623721  T
Q  202 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623722 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27623821  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  27623822 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 27623921  T
Q  401 ctgatg 406  Q
    ||||||    
T  27623922 ctgatg 27623927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 27355926 - 27356330
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355926 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27356025  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356026 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27356125  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356126 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 27356224  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||     
T  27356225 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 27356324  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  27356325 tgatga 27356330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 8899514 - 8899918
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899514 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8899613  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8899614 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 8899713  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899714 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 8899812  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  8899813 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 8899912  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  8899913 agatga 8899918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 34458323 - 34458725
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458323 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34458422  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 34458521  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458522 cttagaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 34458620  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttct 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||| |    
T  34458621 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttt 34458720  T
Q  403 gatga 407  Q
    |||||    
T  34458721 gatga 34458725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16756204 - 16755815
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756204 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16756105  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat--gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756104 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattgtcaaaatatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 16756005  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16756004 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 16755906  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16755905 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 16755815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4764146 - 4763759
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764146 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4764047  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4764046 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 4763947  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  4763946 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 4763848  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4763847 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 4763759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28166878 - 28166490
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166878 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28166779  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  28166778 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 28166679  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28166678 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 28166580  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28166579 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaagc 28166490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 33370246 - 33370650
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370246 cacagactatcctggaggagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33370345  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33370346 caggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatata 33370445  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370446 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 33370544  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||     
T  33370545 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 33370644  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  33370645 tgatga 33370650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29555941 - 29555537
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29555941 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgtt 29555842  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555841 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagcttttaattttctaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 29555742  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  29555741 gctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggattt 29555643  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29555642 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttc 29555543  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  29555542 tgatga 29555537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 27491516 - 27491130
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491516 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27491417  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27491416 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 27491317  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27491316 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 27491218  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  27491217 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 27491130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27063864 - 27063477
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063864 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27063765  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27063764 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 27063665  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  27063664 gctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 27063567  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  27063566 acaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaagca 27063477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 22928696 - 22929102
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22928696 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgct 22928795  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  22928796 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 22928895  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22928896 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 22928994  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22928995 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagct 22929094  T
Q  400 tctgatga 407  Q
    || |||||    
T  22929095 tcagatga 22929102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 16680523 - 16680136
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680523 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgct 16680424  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16680423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 16680324  T
Q  202 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  16680323 actttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggatt 16680225  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680224 ttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 16680136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 26110226 - 26110629
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110226 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatatggaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26110325  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110326 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 26110425  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26110426 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26110524  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttct 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||  ||||| ||| |    
T  26110525 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctttt 26110624  T
Q  403 gatga 407  Q
    |||||    
T  26110625 gatga 26110629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 26772444 - 26772847
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26772444 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26772543  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772544 caggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 26772643  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26772644 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 26772741  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||  ||||| |||     
T  26772742 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttt 26772841  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  26772842 tgatga 26772847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26792199 - 26791811
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26792199 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26792100  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26792099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26792000  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  26791999 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggattt 26791901  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26791900 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26791811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29507801 - 29507412
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507801 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgct 29507702  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29507701 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatata 29507602  T
Q  202 gctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||| || |  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29507601 gctttgaaagtaaaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 29507503  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29507502 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 29507412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 29579397 - 29579012
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579397 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 29579298  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  29579297 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatata 29579198  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29579197 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 29579100  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29579099 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatttgcaag 29579012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 4539573 - 4539978
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4539573 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 4539672  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539673 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 4539772  T
Q  203 ctttgaaagt-agaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4539773 ctttgaaagtaaaaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 4539871  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  4539872 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 4539971  T
Q  401 ctgatga 407  Q
     ||||||    
T  4539972 ttgatga 4539978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Original strand, 30551815 - 30552208
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30551815 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 30551914  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30551915 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 30552014  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30552015 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 30552113  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  30552114 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 30552208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28213838 - 28213433
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28213838 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 28213739  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28213738 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 28213639  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28213638 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 28213540  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  28213539 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 28213440  T
Q  401 ctgatga 407  Q
     ||||||    
T  28213439 ttgatga 28213433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27200569 - 27200165
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200569 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27200471  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27200470 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacat 27200371  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27200370 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27200273  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||| ||    
T  27200272 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagct 27200173  T
Q  400 tctgatga 407  Q
    | ||||||    
T  27200172 tttgatga 27200165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 27248664 - 27249068
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248664 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27248762  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27248763 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacat 27248862  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27248863 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27248960  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||| ||    
T  27248961 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagct 27249060  T
Q  400 tctgatga 407  Q
    | ||||||    
T  27249061 tttgatga 27249068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4779264 - 4778876
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4779264 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4779166  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4779165 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtataca 4779066  T
Q  202 gcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  4779065 gcttttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggatt 4778967  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4778966 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 4778876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 13292766 - 13293147
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292766 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13292865  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292866 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 13292960  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13292961 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 13293059  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13293060 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 13293147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4531671 - 4531267
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaa-atagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 101  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4531671 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaagatagacacccacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgc 4531573  T
Q  102 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  4531572 tcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtatac 4531473  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  4531472 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggatt 4531374  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||| |||    
T  4531373 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagctt 4531274  T
Q  401 ctgatga 407  Q
     ||||||    
T  4531273 ttgatga 4531267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 391
Target Start/End: Original strand, 14139218 - 14139597
Alignment:
Q  6 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14139218 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcag 14139317  T
Q  106 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 205  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139318 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 14139412  T
Q  206 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 305  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  14139413 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 14139511  T
Q  306 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14139512 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 14139597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 406
Target Start/End: Original strand, 16937840 - 16938243
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937840 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16937939  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  16937940 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatata 16938039  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  16938040 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattc 16938137  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||| ||| || |||    
T  16938138 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcgcaagtacaaaagctt 16938237  T
Q  401 ctgatg 406  Q
    | ||||    
T  16938238 cagatg 16938243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27014106 - 27013728
Alignment:
Q  6 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 105  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27014106 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattaaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 27014007  T
Q  106 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 205  Q
    |||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014006 gtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 27013913  T
Q  206 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 305  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27013912 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 27013814  T
Q  306 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27013813 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 27013728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26927135 - 26926763
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||    
T  26927135 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctc---------------atttgaatgtaccctgttgct 26927051  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  26927050 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 26926951  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  26926950 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 26926853  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26926852 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26926763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27209283 - 27208899
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27209283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27209185  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gta 197  Q
    || |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||    
T  27209184 caagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 27209092  T
Q  198 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27209091 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27208993  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27208992 atttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27208899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 27239945 - 27240329
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27239945 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27240043  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gta 197  Q
    || |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||    
T  27240044 caagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 27240136  T
Q  198 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27240137 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27240235  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27240236 atttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27240329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27031403 - 27031019
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27031403 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27031305  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 199  Q
    |||||||||||||||||| |    |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  27031304 caggtttgcttttcaaaaaa----aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtaca 27031209  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27031208 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27031110  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27031109 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagc 27031019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 305
Target Start/End: Original strand, 26666473 - 26666774
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26666473 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26666572  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666573 caggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 26666672  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26666673 gctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 26666770  T
Q  302 acaa 305  Q
    ||||    
T  26666771 acaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24870087 - 24869705
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24870087 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24869989  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24869988 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24869896  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24869895 taactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24869797  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24869796 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 24869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27025524 - 27025141
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27025524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactagctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgct 27025425  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gtat 198  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||     
T  27025424 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgtac 27025332  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27025331 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 27025233  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27025232 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagagactttgaattcgcaagc 27025141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 24299575 - 24299957
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24299575 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttact 24299673  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| ||    
T  24299674 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcatttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtacat 24299768  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    | |||||| |||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24299769 aactttgagagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24299867  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24299868 tacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 24299957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 15406348 - 15406731
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15406348 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15406446  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  15406447 caggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 15406540  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15406541 tatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15406639  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15406640 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagc 15406731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 15418135 - 15418518
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15418135 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15418233  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  15418234 caggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 15418327  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15418328 tatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15418426  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15418427 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagc 15418518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20174930 - 20174566
Alignment:
Q  15 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  20174930 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 20174831  T
Q  115 tcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 205  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  20174830 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 20174731  T
Q  206 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 303  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  20174730 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 20174632  T
Q  304 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||    
T  20174631 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcct 20174566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 22161061 - 22161425
Alignment:
Q  15 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22161061 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 22161160  T
Q  115 tcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 205  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  22161161 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 22161260  T
Q  206 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 303  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  22161261 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 22161359  T
Q  304 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||    
T  22161360 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcct 22161425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 407
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851547
Alignment:
Q  310 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttctgatga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 23851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 20332290 - 20332678
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332290 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20332389  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20332390 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatag 20332489  T
Q  203 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332490 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 20332589  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332590 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 20332678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 40099504 - 40099892
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099504 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40099603  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099604 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 40099703  T
Q  203 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099704 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 40099803  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099804 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 40099892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 27157180 - 27157569
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27157279  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27157280 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 27157379  T
Q  202 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157380 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27157479  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157480 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 27157569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39857032 - 39856630
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39856933  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 39856833  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856832 ctttgaaagtagaagaaaaa-agagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 39856735  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttct 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||     
T  39856734 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttca 39856635  T
Q  403 gatga 407  Q
    |||||    
T  39856634 gatga 39856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 24586229 - 24586617
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586229 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgct 24586328  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586329 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 24586428  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586429 ctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 24586528  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24586529 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 24586617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14104939 - 14104554
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104939 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 14104840  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104839 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 14104740  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14104739 ctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 14104641  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104640 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 14104554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 30760159 - 30759775
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30760159 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 30760060  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30760059 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 30759960  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30759959 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 30759862  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759861 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 30759775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Original strand, 33667671 - 33668055
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33667671 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 33667770  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33667771 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 33667870  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33667871 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 33667968  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667969 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 33668055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 18794485 - 18794889
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794485 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 18794584  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18794585 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 18794684  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794685 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18794783  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||| |||||| |||     
T  18794784 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 18794883  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  18794884 tgatga 18794889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 54839787 - 54839400
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839787 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 54839688  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54839687 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 54839588  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  54839587 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caagcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 54839490  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54839489 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 54839400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5700937 - 5700549
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700937 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5700838  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700837 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5700738  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5700737 gctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 5700640  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  5700639 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagca 5700549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 14753362 - 14753749
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14753362 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 14753460  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753461 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 14753560  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14753561 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 14753658  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14753659 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 14753749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 34182832 - 34183218
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34182832 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 34182930  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182931 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34183029  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  34183030 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 34183128  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34183129 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 34183218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1906654 - 1906245
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1906654 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1906555  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttt----tg 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  1906554 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttg 1906456  T
Q  196 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 295  Q
    || || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1906455 tacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 1906357  T
Q  296 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacaga 395  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1906356 agatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatg 1906257  T
Q  396 aacttctgatga 407  Q
    | ||||||||||    
T  1906256 agcttctgatga 1906245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21976098 - 21975708
Alignment:
Q  6 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21976098 agactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgg 21975999  T
Q  106 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21975998 gtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagct 21975899  T
Q  205 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 304  Q
    ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21975898 ttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcgcagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcaca 21975800  T
Q  305 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  21975799 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 21975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5012275 - 5011870
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5012275 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgct 5012176  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  5012175 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatata 5012076  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5012075 gctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 5011977  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  5011976 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 5011877  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    | |||||    
T  5011876 cagatga 5011870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Original strand, 31120378 - 31120772
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31120378 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 31120477  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 200  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31120478 cgggtttgcttttcaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 31120577  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31120578 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 31120676  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||    
T  31120677 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaa 31120772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 36338394 - 36338774
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36338394 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36338492  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338493 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 36338586  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36338587 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 36338685  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  36338686 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 36338774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24119055 - 24118672
Alignment:
Q  7 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 106  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24119055 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccagcacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccgg 24118957  T
Q  107 tttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118956 tttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 24118857  T
Q  206 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 305  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  24118856 tgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 24118758  T
Q  306 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24118757 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 24118672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 15276497 - 15276904
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15276497 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 15276596  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 197  Q
    || |||| |||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  15276597 caagtttacttt-caaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgta 15276695  T
Q  198 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15276696 catagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 15276794  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaa 397  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15276795 atttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaag 15276894  T
Q  398 cttctgatga 407  Q
    ||||||||||    
T  15276895 cttctgatga 15276904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15234217 - 15233809
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15234217 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcc 15234118  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  15234117 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttcaagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgt 15234019  T
Q  197 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 296  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||    
T  15234018 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacg 15233920  T
Q  297 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  15233919 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaa 15233820  T
Q  397 acttctgatga 407  Q
     ||| ||||||    
T  15233819 gcttatgatga 15233809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 15380106 - 15380510
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15380106 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaaaagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 15380205  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  15380206 caggcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttaatttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacat 15380304  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15380305 agctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 15380403  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15380404 tacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataaccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagctt 15380503  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    | |||||    
T  15380504 cggatga 15380510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6576251 - 6575871
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6576251 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6576153  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||       |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576152 caggtttgcttttcaaag------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 6576059  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  6576058 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 6575960  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6575959 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagca 6575871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1674258 - 1673877
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1674258 cacagactatcctagggaagaacctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1674161  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 197  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  1674160 caagtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgta 1674062  T
Q  198 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
     || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  1674061 catggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacgg 1673963  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaatt 383  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1673962 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaatt 1673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17019445 - 17019062
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17019445 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 17019347  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||      |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  17019346 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacat 17019253  T
Q  201 agcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||| ||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17019252 agcttttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcataggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 17019154  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17019153 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 17019062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 36324185 - 36324484
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36324185 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36324283  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324284 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 36324377  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36324378 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 36324476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14671410 - 14671026
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14671410 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 14671311  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtata 199  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| |    
T  14671310 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtaca 14671217  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  14671216 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggat 14671118  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14671117 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagc 14671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 254510 - 254897
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254510 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 254609  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 254708  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254709 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 254808  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254809 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 254897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 37945723 - 37946111
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945723 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37945822  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945823 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 37945922  T
Q  203 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945923 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 37946022  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946023 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 37946111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27810087 - 27809697
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27810087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgct 27809988  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809987 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 27809888  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809887 ctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27809788  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27809787 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27809697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16167862 - 16167475
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167862 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16167763  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16167762 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 16167663  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167662 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 16167564  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167563 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 16167475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12593198 - 12592806
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593198 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12593099  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12593098 caggtttgctttccaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 12592999  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592998 atagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 12592899  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12592898 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 12592806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 13930402 - 13930791
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930402 cacagactatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13930501  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13930502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 13930601  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13930602 agctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggatt 13930701  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930702 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 13930791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12661922 - 12661536
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661922 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12661823  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661822 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 12661723  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12661722 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 12661624  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12661623 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 12661536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3788877 - 3788490
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788877 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3788778  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788777 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3788678  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3788677 ctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggattta 3788579  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3788578 taaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 3788490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37931763 - 37931369
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37931763 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 37931664  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931663 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 37931564  T
Q  202 gctttgaaagtagaag------aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 295  Q
    ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931563 gctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 37931464  T
Q  296 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931463 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 37931369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37384061 - 37383673
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37384061 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 37383962  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 37383862  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  37383861 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattca 37383763  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37383762 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 37383673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39896452 - 39896048
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896452 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39896353  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896352 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 39896253  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  39896252 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattca 39896154  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  39896153 caaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttccccaaaaactttgaattctcaagtacagaagcttc 39896054  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  39896053 agatga 39896048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 368
Target Start/End: Original strand, 22922001 - 22922368
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22922001 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 22922100  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922101 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 22922200  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22922201 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 22922300  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22922301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 22922368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27122907 - 27122522
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122907 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27122808  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27122807 caggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatag 27122708  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27122707 ctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 27122610  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27122609 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 27122522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34868066 - 34867681
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34868066 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34867967  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34867966 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 34867867  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  34867866 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattc 34867769  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867768 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaag 34867681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 9343845 - 9344232
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343845 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9343944  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9343945 caggtttgcttttcaaaatggacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatata 9344044  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  9344045 gctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 9344143  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344144 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 9344232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 368
Target Start/End: Original strand, 19410342 - 19410709
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19410342 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgct 19410441  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19410442 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatag 19410541  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19410542 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 19410641  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19410642 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 19410709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40239892 - 40239489
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40239892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 40239794  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  40239793 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatata 40239694  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239693 actttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 40239595  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  40239594 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 40239495  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  40239494 agatga 40239489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 39045680 - 39046067
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39045779  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39045780 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatata 39045879  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  39045880 gctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 39045978  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39045979 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattgaacacagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaagc 39046067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 12710459 - 12710863
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12710459 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 12710558  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710559 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 12710658  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710659 agctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 12710756  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  12710757 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 12710856  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    | |||||    
T  12710857 cagatga 12710863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27782616 - 27782212
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782616 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 27782517  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27782516 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 27782417  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782416 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 27782318  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||     
T  27782317 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 27782218  T
Q  402 tgatga 407  Q
    ||||||    
T  27782217 tgatga 27782212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34161230 - 34160840
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161230 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtgacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34161131  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161130 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 34161031  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34161030 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 34160932  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34160931 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 34160840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 37679749 - 37680155
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679749 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37679848  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37679849 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 37679948  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37679949 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 37680046  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaac 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| |    
T  37680047 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagc 37680146  T
Q  399 ttctgatga 407  Q
    ||| |||||    
T  37680147 ttcagatga 37680155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 37695014 - 37695420
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695014 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37695113  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37695114 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 37695213  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37695214 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 37695311  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaac 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| |    
T  37695312 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagc 37695411  T
Q  399 ttctgatga 407  Q
    ||| |||||    
T  37695412 ttcagatga 37695420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Original strand, 21697031 - 21697427
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21697031 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 21697130  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21697131 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 21697229  T
Q  198 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
     |||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21697230 catagctttgaaagtaggaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 21697328  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697329 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 21697427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 32056185 - 32055798
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056185 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32056086  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056085 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 32055986  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  32055985 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattt 32055888  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055887 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 32055798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31882670 - 31882284
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31882670 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 31882571  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882570 caagtttgcttttcaaaatagaaaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31882471  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31882470 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31882373  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882372 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 31882284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Original strand, 16823195 - 16823588
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16823195 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16823294  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16823295 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 16823394  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16823395 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 16823493  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  16823494 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16823588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16898285 - 16897892
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16898285 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16898186  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16898185 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 16898086  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16898085 gctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 16897987  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  16897986 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16897892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 21671028 - 21671435
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671028 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21671127  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21671128 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 21671227  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21671228 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 21671325  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaa 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||     
T  21671326 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaag 21671425  T
Q  398 cttctgatga 407  Q
    |||| |||||    
T  21671426 cttcagatga 21671435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 11629043 - 11629446
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11629043 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 11629141  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11629142 caggtttgtttttcaaaatagacaaagagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 11629241  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11629242 agctttgaaaataaaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 11629339  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  11629340 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 11629439  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    | |||||    
T  11629440 cagatga 11629446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34297533 - 34297152
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297533 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34297434  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297433 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcgaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 34297340  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  34297339 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattca 34297241  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34297240 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 34297152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 31868644 - 31868979
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868644 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31868743  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31868744 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 31868843  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31868844 gctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31868941  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 339  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31868942 acaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27396717 - 27396303
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27396717 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 27396618  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag----------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtt 192  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27396617 taggtttgcttt-caaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgtt 27396519  T
Q  193 tt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgac 290  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27396518 ttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 27396420  T
Q  291 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27396419 tccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 27396320  T
Q  391 acagaaacttctgatga 407  Q
    ||| || ||||||||||    
T  27396319 acaaaagcttctgatga 27396303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 19450276 - 19450689
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||    
T  19450276 cacagactatcctggggaagagcctgcttataacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgct 19450375  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt------caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-- 194  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19450376 caggtttacttt-caaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttt 19450474  T
Q  195 ---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgact 291  Q
       ||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |    
T  19450475 tttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacatgctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgatt 19450573  T
Q  292 ccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19450574 ccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 19450673  T
Q  392 cagaaacttctgatga 407  Q
    ||||| ||||||||||    
T  19450674 cagaagcttctgatga 19450689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28888658 - 28888275
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28888658 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28888560  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  28888559 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 28888466  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  28888465 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggat 28888367  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28888366 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 28888275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 34268784 - 34269167
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34268784 cacagactatcctagagaagaatctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 34268883  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||       ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  34268884 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 34268976  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34268977 taactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacatgctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 34269075  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34269076 ttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcatgacatttcctagaaactttgaattcacaagca 34269167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 23122436 - 23122818
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23122436 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 23122534  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  23122535 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacat 23122628  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    | ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  23122629 aactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatt 23122727  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23122728 tgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 23122818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 391
Target Start/End: Original strand, 27428315 - 27428692
Alignment:
Q  7 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27428315 gactatcctgggggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcagg 27428413  T
Q  107 tttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagc 203  Q
    ||||||||||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | | ||| |    
T  27428414 tttgcttttcaaaa--------acttttgcaattttcaagatgtttgtttcgaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataac 27428505  T
Q  204 tttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 303  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  27428506 tttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttac 27428604  T
Q  304 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  27428605 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaactcacaagca 27428692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20844296 - 20843909
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20844296 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 20844197  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--at 198  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |     
T  20844196 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaac 20844102  T
Q  199 atagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
    ||| |||| ||| ||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  20844101 ataacttttgaaggtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacgg 20844003  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20844002 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctaggaactttgaattcgcaagc 20843909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23117180 - 23116993
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23117180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcc 23117081  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||  ||||||||||||||| || || |||| | |||||||    
T  23117080 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatggtcaaaaacgttagttcaagcattgtcatgatgaagataggaggaaaatg 23116993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 390
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887738
Alignment:
Q  334 ggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 31887738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3453
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3047 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 3146  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3147 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatag 3246  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3247 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 3346  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3347 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaactt 3446  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    |||||||    
T  3447 ctgatga 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18194 - 17949
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 18095  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18094 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatag 17995  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 246  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17994 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaag 17949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9361007 - 9360620
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361007 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9360908  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360907 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 9360808  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360807 ctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 9360709  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9360708 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 9360620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31360914 - 31360527
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360914 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31360815  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31360814 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 31360715  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360714 actttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 31360616  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31360615 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 31360527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Original strand, 28355780 - 28356176
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355780 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28355879  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355880 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 28355979  T
Q  203 ctttgaaagtagaag--aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355980 ctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 28356079  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||| ||||||    
T  28356080 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 28356176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33248751 - 33248365
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248751 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33248652  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248651 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 33248552  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33248551 ctttgaaagtagaagaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 33248453  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33248452 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 33248365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18797093 - 18796704
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797093 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18796994  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796993 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 18796894  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  18796893 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 18796795  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18796794 ataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 18796704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 368
Target Start/End: Original strand, 31483700 - 31484067
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31483700 cacagactatcctggaggagaacctgctcgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgct 31483799  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483800 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31483899  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31483900 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31483999  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31484000 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 31484067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19680833 - 19680430
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680833 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19680734  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19680733 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 19680634  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19680633 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 19680536  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  19680535 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 19680436  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  19680435 agatga 19680430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29835708 - 29835317
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835708 cacagattatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29835609  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29835608 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 29835509  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  29835508 ctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 29835410  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacaga 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  29835409 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacaga 29835317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44567369 - 44566979
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567369 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 44567270  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44567269 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 44567170  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44567169 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 44567072  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcct-ggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44567071 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaattcgcaagc 44566979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15773960 - 15773573
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773960 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15773861  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15773860 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatata 15773761  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||| |||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  15773760 gctctgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 15773662  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15773661 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 15773573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18715868 - 18715478
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715868 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagtcatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18715769  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18715768 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 18715669  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18715668 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 18715571  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18715570 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 18715478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 21342000 - 21342389
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342000 cacagactattctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21342099  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21342100 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 21342199  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  21342200 gctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacagaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 21342298  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21342299 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagca 21342389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 12086553 - 12086958
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12086553 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 12086652  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12086653 caggcttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 12086752  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12086753 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 12086851  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  12086852 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 12086951  T
Q  401 ctgatga 407  Q
     ||||||    
T  12086952 ttgatga 12086958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 40 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33265079 - 33264729
Alignment:
Q  40 tattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaat 139  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33265079 tattgaaatagacattgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaat 33264980  T
Q  140 tttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaa 238  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  33264979 tttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaa 33264882  T
Q  239 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 338  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264881 aagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 33264782  T
Q  339 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33264781 tacattgaacacagtaatcatggcatttcctaggaactttgaattcgcaagca 33264729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 19910992 - 19911381
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19910992 cacagactatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19911091  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  19911092 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 19911191  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19911192 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19911290  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  19911291 ttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatttgcaagc 19911381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 19202205 - 19202598
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19202205 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19202304  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19202305 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 19202404  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19202405 ctttg-----------aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 19202492  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaa-actttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19202493 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaacttc 19202592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 22074759 - 22075164
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22074759 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 22074858  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtata 199  Q
    || | ||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |    
T  22074859 catgcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttattttcaagaagtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtaca 22074957  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22074958 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcctaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22075056  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  22075057 ttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggcaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagct 22075156  T
Q  400 tctgatga 407  Q
    ||||||||    
T  22075157 tctgatga 22075164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 27602744 - 27603141
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  27602744 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgca 27602842  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||        || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  27602843 caggtttgcttttcaaaa--------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 27602934  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602935 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27603033  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  27603034 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 27603133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 131 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260205
Alignment:
Q  131 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt 16260382  T
Q  231 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260381 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattg 16260282  T
Q  331 gttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttctgatga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||    
T  16260281 gttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 16260205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 391
Target Start/End: Original strand, 19655180 - 19655562
Alignment:
Q  6 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19655180 agactatcctggggaagagtctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcag 19655279  T
Q  106 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatag 202  Q
    ||||||||| |||||      |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||     
T  19655280 gtttgcttt-caaaa------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataa 19655372  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |    
T  19655373 ctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggattta 19655471  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaa--ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19655472 caaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 19655562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 2131098 - 2131479
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2131098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 2131196  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    |||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  2131197 caggtttgcttttcaaag-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 2131289  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  2131290 taactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggat 2131388  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2131389 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 2131479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22139286 - 22138904
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22139286 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgct 22139187  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    || ||||||||| |||||        |  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  22139186 caagtttgcttt-caaaa--------actttttcaattttcaagacgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 22139096  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22139095 taactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22138997  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22138996 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 22138904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19694477 - 19694094
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19694477 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 19694379  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  19694378 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 19694285  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19694284 taactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19694186  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19694185 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 19694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14569540 - 14569160
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14569540 cacagaatatcctggaggagaacctgcttgtaacatgtattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 14569442  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat-- 198  Q
    ||||||||  ||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |      
T  14569441 caggtttgtctttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttttttg 14569349  T
Q  199 ---atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 295  Q
       ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14569348 aacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 14569250  T
Q  296 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||   |||||||||||||||    
T  14569249 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattaca-ttcccaaaaactttgaattcgc 14569160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3647534 - 3647147
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647534 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3647435  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647434 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3647335  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  3647334 ctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 3647235  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3647234 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 3647147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10969054 - 10968666
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969054 cacagaccatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10968955  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10968954 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatag 10968855  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968854 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 10968755  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10968754 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 10968666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 10951480 - 10951093
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10951480 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 10951381  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10951380 caggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatatag 10951281  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10951280 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagattc 10951181  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10951180 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatccgcaag 10951093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28591470 - 28591085
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591470 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28591371  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28591370 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatag 28591271  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28591270 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 28591172  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591171 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 28591085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 41787177 - 41787566
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787177 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 41787276  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 41787376  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  41787377 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggat 41787474  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787475 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 41787566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 25 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 51644588 - 51644204
Alignment:
Q  25 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644588 cctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 51644489  T
Q  125 caaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa- 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51644488 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaa 51644389  T
Q  223 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644388 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaa 51644289  T
Q  323 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttctgatga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  51644288 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 51644204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28156116 - 28155726
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156116 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28156017  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28156016 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 28155917  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28155916 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 28155819  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28155818 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 28155726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 20334283 - 20334689
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20334382  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  20334383 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 20334481  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  20334482 atagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaatttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 20334580  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaac 398  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20334581 tttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagc 20334680  T
Q  399 ttctgatga 407  Q
    ||| |||||    
T  20334681 ttcagatga 20334689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 16201895 - 16202307
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16201895 cacagactatcctggagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16201994  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  16201995 caggtttgcttt-caaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgttttttt 16202093  T
Q  195 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 292  Q
      ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16202094 ttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 16202192  T
Q  293 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcac 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16202193 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcac 16202292  T
Q  393 agaaacttctgatga 407  Q
    || | ||||||||||    
T  16202293 aggagcttctgatga 16202307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20467173 - 20466761
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20467173 cacagactatcatggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgct 20467074  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc--------aattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--tt 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||         |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20467073 caggtttgcttt-caaaatagacaggaactttttttttttctaattttgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggttt 20466975  T
Q  193 ttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 292  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20466974 ttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 20466876  T
Q  293 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcac 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  20466875 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcat 20466776  T
Q  393 agaaacttctgatga 407  Q
    |||| ||||||||||    
T  20466775 agaagcttctgatga 20466761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 21891630 - 21892020
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21891630 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 21891728  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||          
T  21891729 caggtttgcttttcaaaaaaaactt----ttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttt------ 21891818  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
         ||||  || || | ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21891819 -----tgaacataaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 21891912  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21891913 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagct 21892012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 26678858 - 26679246
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26678858 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26678957  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26678958 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatag 26679057  T
Q  203 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679058 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 26679157  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679158 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26679246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 26663666 - 26664054
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663666 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26663765  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26663766 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatag 26663865  T
Q  203 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663866 ctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 26663965  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663966 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26664054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 16745274 - 16745679
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16745274 cacagactatcctgaaggagaacttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgct 16745373  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745374 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 16745473  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745474 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 16745572  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16745573 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagctt 16745672  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    | |||||    
T  16745673 cagatga 16745679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26441637 - 26441238
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441637 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26441538  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26441537 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatag 26441438  T
Q  203 ctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441437 ctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggattc 26441338  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  26441337 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 26441238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 5141088 - 5141493
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141088 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5141187  T
Q  103 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5141188 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 5141287  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141288 aactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5141386  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  5141387 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 5141486  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    | |||||    
T  5141487 cagatga 5141493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 39206893 - 39207280
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206893 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39206992  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  39206993 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatata 39207092  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207093 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 39207191  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39207192 acaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 39207280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5164767 - 5164380
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5164767 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5164668  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata- 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5164667 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5164568  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  5164567 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattc 5164469  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5164468 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 5164380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26519174 - 26518789
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26519174 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26519075  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26519074 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 26518975  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26518974 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26518877  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518876 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26518789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 3 - 368
Target Start/End: Original strand, 4138999 - 4139366
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138999 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4139098  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 4139198  T
Q  203 ctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4139199 ctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4139298  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4139299 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 4139366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 31558148 - 31558535
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558148 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31558247  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31558248 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 31558347  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31558348 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31558446  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558447 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 31558535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 3 - 396
Target Start/End: Original strand, 24586289 - 24586682
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586289 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 24586388  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24586389 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatag 24586488  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24586489 ctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacgaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 24586587  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||| ||||||    
T  24586588 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 24586682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5154466 - 5154079
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5154466 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5154367  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154366 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5154267  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  5154266 ctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 5154168  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5154167 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 5154079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16047695 - 16047294
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16047695 cacagactatcccggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgct 16047596  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16047595 caggcttgcttt-caaaatagacaaaaacttttcaattttcaggatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacatag 16047498  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  16047497 ctttgacagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 16047399  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttct 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16047398 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttct 16047299  T
Q  403 gatga 407  Q
    |||||    
T  16047298 gatga 16047294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 26509471 - 26509839
Alignment:
Q  25 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 124  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509471 cctgcttgtgacatgtattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 26509570  T
Q  125 caaaaag-ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509571 caaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 26509670  T
Q  224 agagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa- 322  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  26509671 ggagttttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaat 26509770  T
Q  323 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26509771 ttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26509839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 45737686 - 45737296
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737686 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagatatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45737587  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45737586 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 45737487  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45737486 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 45737389  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45737388 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 45737296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 11418533 - 11418921
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418533 cacagactatcctggaggaggacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11418632  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11418633 caggtttgcttttcaaaacagacagaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 11418732  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  11418733 gctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 11418831  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11418832 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagca 11418921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11447271 - 11446867
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11447271 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgct 11447172  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447171 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 11447072  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11447071 agctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 11446974  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  11446973 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 11446874  T
Q  401 ctgatga 407  Q
     ||||||    
T  11446873 ttgatga 11446867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 26268839 - 26269247
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268839 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26268938  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26268939 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgta 26269038  T
Q  198 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 297  Q
     ||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26269039 catagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 26269137  T
Q  298 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaa 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||     
T  26269138 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 26269237  T
Q  398 cttctgatga 407  Q
    ||| ||||||    
T  26269238 cttttgatga 26269247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 45393602 - 45393223
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393602 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatactgaaatggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45393503  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  45393502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtata 45393403  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45393402 gctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 45393304  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaat 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45393303 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaat 45393223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2160955 - 2160566
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160955 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 2160856  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 199  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  2160855 cagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 2160756  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2160755 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 2160657  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160656 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 2160566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4205772 - 4205368
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205772 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4205673  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4205672 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 4205573  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4205572 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 4205475  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  4205474 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 4205375  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    | |||||    
T  4205374 cagatga 4205368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 393
Target Start/End: Original strand, 16443757 - 16444148
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16443757 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16443856  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  16443857 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 16443955  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16443956 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggat 16444054  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcaca 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16444055 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcaca 16444148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3451702 - 3451297
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3451702 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattggaatagacattcacataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgct 3451603  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451602 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 3451503  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451502 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcaccagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 3451405  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaact 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  3451404 tcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 3451305  T
Q  400 tctgatga 407  Q
    || |||||    
T  3451304 tcagatga 3451297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 26313603 - 26314006
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313603 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26313702  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26313703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatag 26313802  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26313803 ctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26313900  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  26313901 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttc 26314000  T
Q  402 tgatga 407  Q
     |||||    
T  26314001 agatga 26314006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Original strand, 31084376 - 31084781
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31084376 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 31084475  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31084575  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  31084576 gctttgaaagtagaagaaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattc 31084674  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  31084675 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 31084774  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    | |||||    
T  31084775 cagatga 31084781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2779626 - 2779247
Alignment:
Q  6 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779626 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 2779527  T
Q  106 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 205  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779526 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 2779432  T
Q  206 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 305  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  2779431 tgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 2779333  T
Q  306 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2779332 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 2779247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26596053 - 26595750
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596053 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26595954  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26595953 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatata 26595854  T
Q  202 gctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595853 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26595754  T
Q  301 caca 304  Q
    ||||    
T  26595753 caca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31130282 - 31129900
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31130282 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgct 31130183  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130182 caggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 31130088  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  31130087 ctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31129989  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31129988 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 31129900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10847968 - 10847562
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  10847968 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 10847871  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 196  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  10847870 caggtttacttt-caaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 10847772  T
Q  197 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 296  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10847771 acatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-cagacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 10847673  T
Q  297 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 396  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10847672 gatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaa 10847573  T
Q  397 acttctgatga 407  Q
     ||||||||||    
T  10847572 gcttctgatga 10847562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 16512194 - 16512576
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16512194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgct 16512293  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||        |  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  16512294 caggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 16512385  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16512386 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggcttaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16512484  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16512485 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 16512576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 10910680 - 10911061
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10910680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgct 10910778  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  10910779 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 10910871  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10910872 taactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 10910970  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10910971 ttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgtattcgcaagc 10911061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 305 - 390
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532011
Alignment:
Q  305 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26532011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 9510 - 9897
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9609  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 9709  T
Q  203 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  9710 ctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattta 9808  T
Q  303 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9809 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 9897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 4471 - 4862
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4471 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4570  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4571 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4670  T
Q  201 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4671 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4769  T
Q  301 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4770 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 4862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18973 - 18584
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18973 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18874  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18873 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18774  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  18773 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggat 18676  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18675 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Original strand, 8797 - 9184
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8896  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8897 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 8996  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8997 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 9094  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9095 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagca 9184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2043 - 1639
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2043 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgct 1944  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1943 caggtttgcttttcaaagtaaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatata 1844  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  1843 gctttgaaagtagaag-aaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 1746  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  1745 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaactt 1646  T
Q  401 ctgatga 407  Q
    |||||||    
T  1645 ctgatga 1639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12443 - 12028
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12443 cacagactatcctggagaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12344  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg----------- 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  12343 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgttttttttttt 12245  T
Q  191 ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctc-aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatga 289  Q
    |||| || ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12244 ttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 12146  T
Q  290 ctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaag 389  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12145 ctccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaag 12046  T
Q  390 cacagaaacttctgatga 407  Q
     |||||| ||||||||||    
T  12045 tacagaagcttctgatga 12028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10299 - 9912
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10299 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10200  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10199 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 10100  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  10099 gctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattc 10002  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10001 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33680 - 33295
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 33582  T
Q  103 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||||||||| |||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  33581 caggtttgcttttacaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 33487  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33486 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 33388  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 391  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33387 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 33295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15962 - 15551
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15863  T
Q  103 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa------tgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgtttt 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||    
T  15862 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgtttt 15763  T
Q  195 gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15762 gtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 15664  T
Q  295 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacag 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  15663 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacag 15564  T
Q  395 aaacttctgatga 407  Q
    || ||| ||||||    
T  15563 aagcttttgatga 15551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14336 - 13931
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14336 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 14237  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 201  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14236 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 14137  T
Q  202 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14136 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 14038  T
Q  302 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  14037 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 13938  T
Q  401 ctgatga 407  Q
     ||||||    
T  13937 ttgatga 13931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25509 - 25097
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25509 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 25410  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt- 194  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  25409 caggtttgcttt-caaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttt 25311  T
Q  195 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 292  Q
      ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  25310 tcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcgcaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactc 25212  T
Q  293 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcac 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25211 cacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcac 25112  T
Q  393 agaaacttctgatga 407  Q
    |||| ||||||||||    
T  25111 agaagcttctgatga 25097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6449 - 6065
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6449 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6350  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--at 198  Q
    ||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |     
T  6349 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaac 6257  T
Q  199 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 298  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6256 ataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaatatgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 6158  T
Q  299 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6157 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 6065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Original strand, 24774 - 25157
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24774 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24872  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 199  Q
    ||||||| ||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24873 caggttttcttttcaaaa------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 24966  T
Q  200 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 299  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24967 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 25065  T
Q  300 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 390  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25066 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagcaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 25157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 1
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtagcacatattgaaatagacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 74  T
Q  103 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 229 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 359
Alignment:
Q  229 tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 328  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  537 tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 438  T
Q  329 tggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttctgatga 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  437 tggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 407
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26405
Alignment:
Q  245 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  345 gaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaaacttctgatga 407  Q
    || ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatga 26405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 383
Target Start/End: Original strand, 40497 - 40898
Alignment:
Q  3 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacac-atattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttg 100  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  40497 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacattatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttg 40596  T
Q  101 ctcaggtttg-cttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaat-gtttgtttc-aagca--ttgt-cattatcaaaa--tagaaagaaaa--- 188  Q
    |||||||||| |||||| |||     |||   ||| ||||||| ||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||  ||||| |||||       
T  40597 ctcaggtttgtcttttctaaa-----aaactttttccaatttttcaagattgtttgtttcgaagcaatttgtacattattaaaaaatagaaggaaaaatg 40691  T
Q  189 tgttttgtatatagctttgaaa-gtagaagaaaaat-agagttttcaaac--aaaagcaaaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtc-agccaaa 282  Q
    | ||||||| ||| |||||||| ||| || | |||  ||||||||||||   ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40692 ttttttgtacataactttgaaaagtaaaaaagaaagcagagttttcaaaacaaaaagcacagactcaaaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaa 40791  T
Q  283 ggcatgactcc-acggattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-attg-aacacagtaatcactacatttcctggaaact 376  Q
    ||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||    
T  40792 ggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaattgaaacacaacaatcattacatttcctagaaact 40891  T
Q  377 ttgaatt 383  Q
    |||||||    
T  40892 ttgaatt 40898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University