View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17034_low_20 (Length: 427)

Name: NF17034_low_20
Description: NF17034
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17034_low_20
NF17034_low_20
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (186-415)||(4681923-4682152)
chr8 (186-400)||(4737274-4737488)
chr8 (18-360)||(4889458-4889800)
chr8 (186-400)||(4996924-4997138)
chr8 (187-414)||(4704011-4704238)
chr8 (186-388)||(4716046-4716251)
chr8 (186-400)||(4775939-4776157)
chr8 (186-393)||(4900482-4900689)
chr8 (186-400)||(4912881-4913093)
chr8 (186-415)||(4689501-4689729)
chr8 (186-400)||(10447863-10448071)
chr8 (186-400)||(21438821-21439038)
chr8 (186-415)||(4746053-4746281)
chr8 (194-363)||(4923567-4923736)
chr8 (193-400)||(4726725-4726931)
chr8 (192-402)||(4874658-4874870)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (35-75)||(2131532-2131572)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 186 - 415
Target Start/End: Original strand, 4681923 - 4682152
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  4681923 aatacgaaatactagttgatactatgagaaacatcaagaaggcctatggggtggctagaaattggcagggagatccatgtggtccagtaaactatatgtg 4682022  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 385  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4682023 ggaaggcctaaactgcagtcttgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 4682122  T
Q  386 cttcaattatcctctaatgttatatatatt 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4682123 cttcaagtatcctctaatgttatatatatt 4682152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Original strand, 4737274 - 4737488
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4737274 aatactaaataccagttgatactatgacaaacatcaagaatgcttatggtgtggcaagaaattggcaaggagatccatgtgcccctgtgaattacatgtg 4737373  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 385  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4737374 ggaaggcctaaactgtagtagtgatggcaataacattccaagaatcacatctttgtaagtttataattccttaaataaaccatatgcataaattcaaaaa 4737473  T
Q  386 cttcaattatcctct 400  Q
    |||||||||||||||    
T  4737474 cttcaattatcctct 4737488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4889800 - 4889458
Alignment:
Q  18 attttcaactgcattctataataatcactacgatgaaaacataaactaattctctctcatggatggttgtaaaacatttaatacta-tgaacaaatttaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  | || | |||||||||||    
T  4889800 attttcaactgcattctataacaacgactacgatgaaaacataaactaattctctttcatatatggttgtaaaacatt-acgaatagtcaacaaatttaa 4889702  T
Q  117 aacatttagggacgaaggttgtatatgaatttatagaatcattt-tgttgtaatccnnnnnnnnnnnnnnaatacgaaatactagttgatactatcacaa 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||                 ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4889701 aatatttagggacgaaggttgtatatgaatttatagagtaatttatggtataaag-taatccttttttttaatacgaaatactagttgatactatcacaa 4889603  T
Q  216 acatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtgggaaggtctaacctgtagtattgatggcaa 315  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  4889602 acatcaagaatgcttatgggctgactagaaattgggaaggagatccatgtgcccctgtgaattacgtgtgggaaggcctaaactgcagtattgatggcaa 4889503  T
Q  316 taacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaa 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  4889502 taacatcccaagaatcatatctttgtaagtatacaattccttaaa 4889458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Original strand, 4996924 - 4997138
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4996924 aatactaaatactagttgatactatcataaacatcaagaacacttatggggtggctagaaattggcaaggagatccatgtgcccctgtgaattatatgtg 4997023  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 385  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4997024 ggaaggcctaaactgcagtcttgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaggtttataattccttaaataaaccatatgcataaattcaaaaa 4997123  T
Q  386 cttcaattatcctct 400  Q
    ||| |||||||||||    
T  4997124 cttgaattatcctct 4997138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 187 - 414
Target Start/End: Original strand, 4704011 - 4704238
Alignment:
Q  187 atacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4704011 atacgaaatactagttgatactatcatgaatatcaagaacacttatggggtgtctagaaattggcaaggagatccatgtgtccctgtgaattacatgtgg 4704110  T
Q  287 gaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaac 386  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4704111 gaaggcgtaaactgtactattgatgccaatagcatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatccataaattcaagaac 4704210  T
Q  387 ttcaattatcctctaatgttatatatat 414  Q
    |||||||||| | | |||||| ||||||    
T  4704211 ttcaattatcatttgatgttaaatatat 4704238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 186 - 388
Target Start/End: Original strand, 4716046 - 4716251
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4716046 aatacaaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatacttatggggtgactagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgaattatatgtg 4716145  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatccct---taaataaatcatatgcataaattcaa 382  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||    
T  4716146 ggaaggcctaaattgtagtattgatggctatagcatcccaagaatcacatctctgtaagtttacaatcccttaataaataaaccatatgcataacttcaa 4716245  T
Q  383 aaactt 388  Q
    ||||||    
T  4716246 aaactt 4716251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4776157 - 4775939
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4776157 aatacaaaatactagttgataatatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtgcccctgtgaattatatgtg 4776058  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtag---tattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaa-ttca 381  Q
    |||||| |||| ||||||   |  ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  4776057 ggaaggcctaaactgtagcactgatgatgacaataatcccccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaattaaccatatgcataaatttca 4775958  T
Q  382 aaaacttcaattatcctct 400  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4775957 aaaactttaattatcctct 4775939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 186 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4900689 - 4900482
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4900689 aataccaaatgctagttgatactatcacaaacatcaaggatgcttatggggtggctagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgaaatatatgtg 4900590  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 385  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  4900589 ggaagtcctaaactgtagtattgatggctatagcattccaagaatcacatctttgtaagtttacaattccttaaataaactgtatgcataacttcaaaaa 4900490  T
Q  386 cttcaatt 393  Q
    ||||||||    
T  4900489 cttcaatt 4900482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4913093 - 4912881
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4913093 aataccaaataatagttaatgctatcacaaacatcaaggatgcttatgtggtggctagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgaattatatgtg 4912994  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 385  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  4912993 ggaaggcctaaactgtagtattgatggctatagcattccaagaatcacatctttgtaagtttaccattccttaaataaaccata--cataaattcaagaa 4912896  T
Q  386 cttcaattatcctct 400  Q
    |||||||||||||||    
T  4912895 cttcaattatcctct 4912881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 415
Target Start/End: Original strand, 4689501 - 4689729
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4689501 aataccaaatactagttgatactattacaaacattaagaaggcctatggagtggctagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgaattatatgtg 4689600  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtat---tgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaa 382  Q
    |||||| ||||  ||||||||   ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||   ||||||||||    
T  4689601 ggaaggcctaaattgtagtattgatgatgccaataaccccccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcacttcaataaaccata---ataaattcaa 4689697  T
Q  383 aaacttcaattatcctctaatgttatatatatt 415  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4689698 aaacttcaa-taacctctaatgttatatatatt 4689729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Original strand, 10447863 - 10448071
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  10447863 aataccaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatgggatggctagaaattggaatggagatccatgtggtccagtgaagtatatgtg 10447962  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 385  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      |||| ||||||||||||||    
T  10447963 ggaaggcctaaactgtagtattgatggcaataacattcaaagaatcacatctttgtaagtttagaatcacttaaa------atatacataaattcaaaaa 10448056  T
Q  386 cttcaattatcctct 400  Q
    ||| |||| ||||||    
T  10448057 ctttaattgtcctct 10448071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21439038 - 21438821
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21439038 aataccaaatactagttgatgctatcacaaacgtcaaggatgcttataaggtggctagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgggaattatatgtg 21438939  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcata---aattcaa 382  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |   |||||||    
T  21438938 ggaaggcctaaattgtagcattgatggatatagcatcccaagaatcacatctttgtaagtttactattccttaaataaaccatatgcaaatataattcaa 21438839  T
Q  383 aaacttcaattatcctct 400  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21438838 aaacttcaattatcctct 21438821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 186 - 415
Target Start/End: Original strand, 4746053 - 4746281
Alignment:
Q  186 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||     
T  4746053 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggggttgcgagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgcagtatatgta 4746152  T
Q  286 ggaaggtctaacctgtagtattga---tggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattc-a 381  Q
    |||| | |||| ||| ||||||||   ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    | || ||||||||||||||| |    
T  4746153 ggaatgcctaaactgcagtattgatggtggaaataaccccccaagaatcacatatttgtaagtttataattcct----tcaaccatatgcataaattcaa 4746248  T
Q  382 aaaacttcaattatcctctaatgttatatatatt 415  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4746249 aaaacttcaa-taacctctaatgttatatatatt 4746281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4923736 - 4923567
Alignment:
Q  194 atactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtgggaaggtc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  4923736 atactagttgatactatcacaaacatcaagaagacttatggggtggctaaaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaagtatatatgggaaggcc 4923637  T
Q  294 taacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataa 363  Q
    ||| ||| ||  |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  4923636 taaactgcagcgttgatggatataaccccccaagaatcacatctttgtaagtctactatcccttgaataa 4923567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 400
Target Start/End: Original strand, 4726725 - 4726931
Alignment:
Q  193 aatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtgggaaggt 292  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  4726725 aatacaagttgatactatgacaaacatcaagaatgcttatggggtgactaggaattggcagggagatccatgtggtcccgtgaaatatatgtgggaaggc 4726824  T
Q  293 ctaacctgtagtattga---tggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaacttc 389  Q
     ||| ||| ||||||||   ||| ||||||  |  |||||||| || |||||||||||| ||  ||    ||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  4726825 ttaaactgcagtattgatggtggaaataaccccaaaagaatcatatatttgtaagtttataaaacc----ataaaccatatgcataaattccaaaacttt 4726920  T
Q  390 aattatcctct 400  Q
    |||||||||||    
T  4726921 aattatcctct 4726931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4874870 - 4874658
Alignment:
Q  192 aaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtgggaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  |||||     || |||||||||||    
T  4874870 aaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggggtggaaagaaattggcaaggagatccatgttaccctgaagcatacatgtgggaagg 4874771  T
Q  292 tctaacctgtagtat---tgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaactt 388  Q
     |||| |||||||||   | ||   | |  |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||| |    
T  4874770 cctaaactgtagtatgcattatctgattggcggcccaagaatcctatctttgtaagtttacaatccctgaaataaaccat-ttcataaattcaacaacct 4874672  T
Q  389 caattatcctctaa 402  Q
    ||||||||||||||    
T  4874671 caattatcctctaa 4874658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 2131572 - 2131532
Alignment:
Q  35 ataataatcactacgatgaaaacataaactaattctctctc 75  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2131572 ataataaatactatgatgaaaacataaactaattctctctc 2131532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University