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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17044_low_1 (Length: 814)

Name: NF17044_low_1
Description: NF17044
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17044_low_1
NF17044_low_1
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (6-765)||(32245822-32246580)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 684; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 684; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 32246580 - 32245822
Alignment:
Q  6 gtccaagaatatatatagaattcaaattaaattattgagttgaatagtatttttgacattctataggcatgcattttgattagatcattttccaatttcc 105  Q
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T  32246580 gtccaataatatatatagaattcaaatttaattattcagttgaatagtatttttgacattctataagcatgcattttgattagatcattttccaatttcc 32246481  T
Q  106 atgaataccttttcttgtagaatccttatctctagttgcattttttgttgtccctatagtcagaatcagaagcatatatgatatatacatccctttttac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246480 atgaataccttttcttgtagaatccttatctctagttgcattttttgttgtccctatagtcagaatcagaagcatatatgatatatacatccctttttac 32246381  T
Q  206 tattctttgatgtatataggaagcgttcactagcaaaattgcatccaaaatggaccatccttttatttttccttttaatagcatagaaaaataatgggtg 305  Q
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T  32246380 tattctttgatgtatataggaagcgttcactggcaaaattgcatccaaaatggaccatccttttatttttccttt-aatagcatagaaaaataatgggtg 32246282  T
Q  306 gacattgtgctttaagtgatgaaatccactatttttaaaatttaaagggagactttatttcagaacattgggtcctgattaattgcgtacagcactacaa 405  Q
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T  32246281 gacattgtgctttaagtgatgaaatccactatttttaaaatttaaagggagactttatttcagaacattgggtcctgattaattgcgtacagcactaaaa 32246182  T
Q  406 tcattagaggatgaaacaaaattggttttatattaacacgtgaatgaaaggaaaataaatttgaaatgaatatatgaattttgaagcatacagatataat 505  Q
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T  32246181 tcattagaggacgaaacaaaattggttttatattaacacgtgaatgaaaggaaaataaatttgaaatgaatatatgaattttgaagcatacagatataat 32246082  T
Q  506 tatttatcatagtgatcacgctgtaatattggttctcatattagtatctgcatagatatttttattgtaatacatgattgaatggttgcaggaataatta 605  Q
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T  32246081 tatttatcatagtgatcacgctgtaatattggttctcatattagtatctgcatagatatttttgttgtaatacatgattgaatggttgcacgaataatta 32245982  T
Q  606 ttttaatattcgttttaatattaaggagggacatatcttaaagagcaaaagatgtttgcagattttatggttaagaaggaatcacatttatggttcaatg 705  Q
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T  32245981 ttttaatattcgttttaatattaaggagggacatatcttaaagagcaaaagatgtttgcagattttatggttaagaaggaatcacatttatggtccaatg 32245882  T
Q  706 cttgggactgttccgtctgtcatagagtctctcagataatcttaaaatttaatttctgct 765  Q
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T  32245881 cttgggactgcctcgtctgtcatggtgtctctcagataatcttgaaacttaatttctgct 32245822  T

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