View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17049_low_1 (Length: 788)

Name: NF17049_low_1
Description: NF17049
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17049_low_1
NF17049_low_1
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (381-769)||(15164196-15164577)
chr1 (3-374)||(8996014-8996384)
chr1 (3-379)||(40999851-41000225)
chr1 (149-384)||(15161612-15161847)
chr1 (3-376)||(38121682-38122054)
chr1 (3-376)||(39000931-39001303)
chr1 (3-375)||(432092-432462)
chr1 (3-376)||(12167966-12168338)
chr1 (3-376)||(11738548-11738919)
chr1 (3-375)||(16832534-16832904)
chr1 (3-375)||(9667447-9667817)
chr1 (7-376)||(44505018-44505388)
chr1 (3-376)||(33491948-33492320)
chr1 (74-384)||(36083869-36084178)
chr1 (3-376)||(49249112-49249476)
chr1 (3-376)||(13217799-13218167)
chr1 (76-384)||(9268748-9269056)
chr1 (3-157)||(15161142-15161296)
chr1 (156-384)||(16130706-16130925)
chr1 (4-352)||(13830328-13830673)
chr1 (6-232)||(39454146-39454375)
chr1 (3-153)||(16129699-16129848)
chr1 (4-352)||(6244242-6244583)
chr1 (2-153)||(16130252-16130402)
chr1 (131-271)||(13249115-13249254)
chr1 (132-271)||(31473658-31473796)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (3-379)||(22233597-22233973)
chr8 (4-376)||(13510004-13510375)
chr8 (4-376)||(13599534-13599905)
chr8 (3-376)||(22180641-22181013)
chr8 (3-384)||(16958590-16958972)
chr8 (3-372)||(22242997-22243366)
chr8 (3-379)||(22222422-22222789)
chr8 (3-375)||(4861702-4862072)
chr8 (3-376)||(9067917-9068289)
chr8 (3-376)||(8743033-8743405)
chr8 (3-376)||(11308737-11309109)
chr8 (3-379)||(22228764-22229131)
chr8 (3-376)||(28925893-28926265)
chr8 (3-376)||(3298842-3299213)
chr8 (3-375)||(28370133-28370504)
chr8 (3-376)||(27348066-27348438)
chr8 (3-376)||(41577081-41577453)
chr8 (6-384)||(12538200-12538583)
chr8 (54-375)||(34006524-34006842)
chr8 (4-381)||(1607326-1607703)
chr8 (3-283)||(16580125-16580404)
chr8 (184-379)||(17993087-17993281)
chr8 (175-384)||(13849071-13849278)
chr8 (187-384)||(21692669-21692866)
chr8 (3-186)||(24040756-24040937)
chr8 (214-384)||(36736948-36737117)
chr8 (3-154)||(17992934-17993085)
chr8 (337-379)||(22227255-22227297)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (1-376)||(1274625-1274999)
chr7 (4-375)||(22909158-22909528)
chr7 (3-384)||(2477698-2478080)
chr7 (3-384)||(3544620-3545002)
chr7 (3-376)||(2797313-2797685)
chr7 (3-376)||(10346055-10346427)
chr7 (3-376)||(12090210-12090582)
chr7 (3-376)||(31158026-31158398)
chr7 (3-376)||(2631436-2631808)
chr7 (3-374)||(31878641-31879009)
chr7 (3-376)||(8107638-8108010)
chr7 (3-373)||(22321554-22321922)
chr7 (3-376)||(23795134-23795506)
chr7 (39-376)||(19471940-19472275)
chr7 (3-384)||(24482784-24483165)
chr7 (3-353)||(12190883-12191230)
chr7 (3-376)||(12183906-12184276)
chr7 (3-384)||(45500453-45500832)
chr7 (54-376)||(6172607-6172927)
chr7 (3-342)||(31664279-31664616)
chr7 (2-352)||(29032568-29032907)
chr7 (3-274)||(22818452-22818721)
chr7 (3-287)||(1953997-1954270)
chr7 (264-375)||(22820404-22820515)
chr7 (3-97)||(19472291-19472385)
chr7 (294-364)||(31882440-31882510)
chr7 (7-101)||(19063557-19063651)
chr7 (322-384)||(1954285-1954347)
chr7 (182-271)||(8139140-8139229)
chr7 (304-384)||(9702027-9702108)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (2-384)||(9786846-9787229)
chr2 (2-384)||(21160004-21160385)
chr2 (3-376)||(36667619-36667991)
chr2 (3-376)||(27257425-27257796)
chr2 (3-384)||(14700681-14701063)
chr2 (3-384)||(13230084-13230463)
chr2 (1-384)||(28457619-28458001)
chr2 (3-376)||(36040012-36040384)
chr2 (3-376)||(29223755-29224126)
chr2 (3-376)||(29337054-29337425)
chr2 (4-375)||(23924783-23925152)
chr2 (3-384)||(24662871-24663253)
chr2 (3-376)||(43991571-43991937)
chr2 (79-374)||(41977710-41978004)
chr2 (3-384)||(32522969-32523348)
chr2 (149-376)||(42700723-42700949)
chr2 (198-384)||(40200173-40200359)
chr2 (223-373)||(36557315-36557466)
chr2 (3-181)||(36557465-36557644)
chr2 (187-384)||(31758500-31758697)
chr2 (3-157)||(42702175-42702328)
chr2 (3-137)||(5784513-5784646)
chr2 (222-271)||(24852800-24852849)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (2-384)||(1232233-1232614)
chr3 (3-376)||(9989436-9989807)
chr3 (3-376)||(48167944-48168315)
chr3 (7-375)||(37471438-37471804)
chr3 (3-375)||(2357200-2357571)
chr3 (3-384)||(3588440-3588820)
chr3 (3-379)||(23193963-23194334)
chr3 (3-376)||(45527687-45528059)
chr3 (3-376)||(7652972-7653344)
chr3 (3-376)||(10385820-10386192)
chr3 (3-376)||(22097707-22098078)
chr3 (3-375)||(20837134-20837504)
chr3 (3-375)||(36469187-36469557)
chr3 (3-384)||(33248028-33248409)
chr3 (3-376)||(27850301-27850672)
chr3 (54-384)||(26335197-26335528)
chr3 (3-376)||(4742753-4743122)
chr3 (7-376)||(52307835-52308203)
chr3 (106-384)||(49434238-49434517)
chr3 (142-376)||(37022867-37023102)
chr3 (3-277)||(8615543-8615816)
chr3 (181-376)||(20963006-20963200)
chr3 (272-376)||(8625931-8626035)
chr3 (3-189)||(23385436-23385622)
chr3 (224-376)||(23411748-23411889)
chr3 (3-137)||(27030672-27030805)
chr3 (304-351)||(27104326-27104373)
chr3 (149-352)||(17404894-17405097)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (3-374)||(37251657-37252026)
chr5 (3-376)||(16904359-16904731)
chr5 (3-376)||(11723026-11723398)
chr5 (3-376)||(27166848-27167219)
chr5 (3-376)||(9404464-9404836)
chr5 (3-376)||(11766795-11767166)
chr5 (3-376)||(31846020-31846391)
chr5 (7-376)||(30606826-30607194)
chr5 (3-376)||(33434643-33435014)
chr5 (3-375)||(34869497-34869868)
chr5 (3-376)||(34456337-34456707)
chr5 (3-376)||(6269930-6270302)
chr5 (3-376)||(14344509-14344873)
chr5 (3-341)||(7315005-7315342)
chr5 (4-379)||(39655783-39656159)
chr5 (118-376)||(7315358-7315616)
chr5 (6-376)||(24835778-24836134)
chr5 (255-379)||(519320-519444)
chr5 (220-376)||(32226914-32227070)
chr5 (131-271)||(42747484-42747623)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (3-376)||(25976989-25977361)
chr6 (3-376)||(34006542-34006914)
chr6 (3-376)||(3539087-3539459)
chr6 (3-376)||(26515178-26515550)
chr6 (4-376)||(24161006-24161376)
chr6 (3-376)||(9932555-9932927)
chr6 (78-376)||(34913803-34914100)
chr6 (3-384)||(5988744-5989124)
chr6 (3-376)||(14270711-14271084)
chr6 (3-376)||(32806513-32806884)
chr6 (3-375)||(21596279-21596653)
chr6 (3-376)||(1454835-1455203)
chr6 (3-376)||(1466527-1466895)
chr6 (3-384)||(15642456-15642838)
chr6 (3-375)||(24878905-24879276)
chr6 (3-379)||(21631220-21631598)
chr6 (3-364)||(13173586-13173938)
chr6 (3-372)||(13182111-13182471)
chr6 (4-379)||(9518193-9518565)
chr6 (3-379)||(26604379-26604755)
chr6 (142-376)||(16698088-16698321)
chr6 (3-283)||(32821841-32822119)
chr6 (3-137)||(14479600-14479733)
chr6 (83-270)||(6867907-6868095)
chr6 (120-352)||(25541255-25541486)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (3-384)||(726-1106)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (3-376)||(116318-116689)
scaffold0019 (308-376)||(169158-169226)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (7-376)||(19247578-19247945)
chr4 (3-375)||(30218137-30218513)
chr4 (3-376)||(4838886-4839258)
chr4 (3-384)||(53895419-53895798)
chr4 (3-375)||(40995298-40995671)
chr4 (3-376)||(21677417-21677789)
chr4 (3-384)||(46691779-46692158)
chr4 (3-376)||(26069765-26070139)
chr4 (2-376)||(1188004-1188376)
chr4 (3-376)||(22047721-22048093)
chr4 (3-376)||(33110452-33110825)
chr4 (3-376)||(323478-323850)
chr4 (3-352)||(20948785-20949133)
chr4 (5-376)||(42532636-42533007)
chr4 (54-376)||(5273312-5273633)
chr4 (54-376)||(52618594-52618914)
chr4 (7-384)||(26373373-26373747)
chr4 (3-353)||(55326816-55327165)
chr4 (69-376)||(35416446-35416750)
chr4 (187-384)||(9417175-9417372)
chr4 (7-271)||(6640021-6640286)
chr4 (3-97)||(44432081-44432175)
chr4 (304-375)||(8895205-8895277)
chr4 (304-384)||(13568266-13568347)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (3-376)||(11954-12324)
scaffold0298 (3-376)||(15724-16094)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (3-376)||(28649-29021)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (3-376)||(8782-9154)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-384)||(14222-14605)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (3-376)||(12234-12606)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (3-384)||(76194-76573)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (3-375)||(25401-25772)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (3-374)||(6772-7141)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (3-384)||(16215-16595)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (115-376)||(12238-12491)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (106-243)||(7205-7341)
scaffold0447 (106-243)||(11819-11955)
scaffold0447 (272-341)||(7340-7409)
scaffold0447 (272-341)||(11954-12023)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (106-243)||(9814-9950)
scaffold0383 (272-341)||(9949-10018)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (255-379)||(35070-35191)
scaffold0160 (3-195)||(35212-35405)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (6-232)||(9343-9572)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (3-137)||(1604-1737)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (3-90)||(5-92)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 381 - 769
Target Start/End: Original strand, 15164196 - 15164577
Alignment:
Q  381 caatgaggttagtgagcgaaacatttgaaaataaatctaactaatattgagtagccatggcctggtccaactgctcttccgttctaccttgtacattgca 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15164196 caatgaggttagtgagcgtaacatttggaaataaatctaactaatattgagtagccatggcctggtccaactgctcttctgttctaccttgtacattgca 15164295  T
Q  481 ccctcaacaccatgtgtatgagtaccccgtcaattgtatatcacagagattactatcttgaacaacttcataaaagccttatcggcatgcatcagtgtgt 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |    
T  15164296 ccctcaacaccatgtgtatgagtaccccgtcaattgtatatcacagagattactatcttgaacaacttcataaaagccttattggcatgcat-------t 15164388  T
Q  581 cacataaaaataaaatattcagcatatacttacgaaataggtcccggatagttggaactacactcgagttacccaaaccccgaaagctccagcttatgat 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15164389 cacataaaaataaaatattcagcatatacttacgaaataggtcccggatagttggaactgcactcgagttacccaaacccgggaagctccagcttatgat 15164488  T
Q  681 agtcatttttcccagaaggcctgatattaggacccttcgatnnnnnnnnngagtatcgttaccgtttcctccatccttccccttgctat 769  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15164489 agtcatttttcccagaaggcctgatattaggacccttcgataaaaaaaatgagtatcgttaccgtttcctccatccttccccttgctat 15164577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8996384 - 8996014
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||  || | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8996384 caagatttgttgcgacatcatggatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 8996285  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8996284 tgggttttgatgtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatgattctagctatttattcaatattgttgttattattgcatttaa 8996185  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  8996184 tgtttta-ttgagatttaaaatgatatggacacatccttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgctaat 8996086  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8996085 atttgataatcacttttaatctaaaaattaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaa 8996014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41000225 - 40999851
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||     
T  41000225 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcctcatcctttgcaaatctatcatagacatatgtagttatatctactcttg 41000126  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41000125 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 41000027  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    |  |||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41000026 tcttttatt-gagatttgaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 40999928  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40999927 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgat 40999851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 149 - 384
Target Start/End: Original strand, 15161612 - 15161847
Alignment:
Q  149 tttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15161612 tttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaaggatattaacaaatacttttggatc 15161711  T
Q  249 caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15161712 caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatatagaacttaatgcttttgggtcatt 15161811  T
Q  349 taatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15161812 taatcggttgggaaatagtcgattaaacggttcaat 15161847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38122054 - 38121682
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  38122054 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 38121956  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38121955 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 38121856  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38121855 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 38121757  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  38121756 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 38121682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39001303 - 39000931
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  39001303 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 39001205  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       |||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39001204 gtagttttaaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 39001105  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  39001104 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgtcaa 39001006  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39001005 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 39000931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 432462 - 432092
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||     
T  432462 caagatttgttgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttg 432363  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  432362 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 432264  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  432263 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 432165  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  432164 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtgaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaa 432092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12168338 - 12167966
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  12168338 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccatttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 12168240  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12168239 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 12168140  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12168139 ttgtttta-ttgagattcaaaataatattgacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 12168041  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  12168040 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaac 12167966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11738919 - 11738548
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  11738919 caagatttgttgacacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 11738820  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  |||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11738819 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgcaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 11738721  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| | |||||| |||||||||| |||| ||| ||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11738720 tgttttact-gagattcaaaatgatatggacacataattttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 11738622  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  11738621 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgactaaac 11738548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16832904 - 16832534
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||     
T  16832904 caagatttgttgagacatcatggatcttatcatgaaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagatatatgtagctatatctactcttg 16832805  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16832804 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgctattcttgcatttaa 16832706  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    |   |||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  16832705 tatgttattt-agattcaaaatgatatggacacatatttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaat 16832607  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  16832606 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaa 16832534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9667817 - 9667447
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |  |||     
T  9667817 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatacattcttg 9667718  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9667717 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 9667619  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9667618 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 9667520  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  9667519 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttggtaaatcgtcgattaaa 9667447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44505388 - 44505018
Alignment:
Q  7 atttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacggg 106  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||  ||     
T  44505388 atttgttgagacatcatggatcatgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaaacttgtggt 44505289  T
Q  107 ttttaaggtattcaaa-caagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg-ttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatg 204  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  44505288 ttttgaggtattcaaaacaagctattatgtaatcttttgattatttaatatatgggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattg 44505189  T
Q  205 ctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatat 304  Q
     |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  44505188 ttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaaattatcactctagacatggatgttaatat 44505090  T
Q  305 ttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44505089 ttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 44505018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33492320 - 33491948
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||     
T  33492320 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagccacatctactcttg 33492221  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      | || | |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  33492220 tag-ttctgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttca 33492122  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33492121 ttgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 33492023  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33492022 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 33491948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 74 - 384
Target Start/End: Original strand, 36083869 - 36084178
Alignment:
Q  74 atagacatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-attt 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  36083869 atagacatatgtagttacatctacc-ttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactctt-atcttttaatatatggttctagcttattt 36083966  T
Q  173 attcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatc 271  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||  || ||||| ||||||||    
T  36083967 attcaatattgttgttattcttgtgtttaatgttttatt-gagattcaaaatgatattgacaaatacttttgggtctaagaaatataataacaatctatc 36084065  T
Q  272 ttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgat 371  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36084066 ttaagttttcattctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcatttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgat 36084165  T
Q  372 taaacgattcaat 384  Q
    |||||||| ||||    
T  36084166 taaacgatccaat 36084178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 49249112 - 49249476
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  49249112 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 49249211  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      | |||| |||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49249212 tag-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa--------tcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 49249302  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  49249303 ttgttttatt-gagattcaaaattatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagaaatggatgttaa 49249401  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  49249402 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgagtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 49249476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13218167 - 13217799
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  13218167 caagatttgttgagacatcatggaacttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 13218068  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| ||| |||||||||||  ||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||    
T  13218067 tgg-ttttgaggcattcaaacaagatattatgtaatcttttgataatttaatatacggttctagctatttattcaatattgttgttatt---gcctttaa 13217972  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  13217971 tgttttatta-agattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagttatcactctagacatgaatgttaat 13217873  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  13217872 atttgataatcacttttaatctaggacttaatacttttggataatttaattagctgggaaatcgtcgattaaac 13217799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 384
Target Start/End: Original strand, 9268748 - 9269056
Alignment:
Q  76 agacatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttatt 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9268748 agacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaccaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatgtttctagctatttatt 9268847  T
Q  176 caatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaa 275  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  9268848 caatattgttattattcttgcatctaaagctttatttgagatttgaaattttattgacaaatacttttggatctaggatcagaataataatctatc-taa 9268946  T
Q  276 gttatcactctagatatagatgttaatatttgataatca-cttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaa 374  Q
    ||  ||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||| | || ||||||   ||||||||| |||||||||    
T  9268947 gtgttcattctagacatagaatttaatctttgataatcaccttgaaatcaagagcttaatgcttttaggtcgtttaattgattgggaaatcgtcgattaa 9269046  T
Q  375 acgattcaat 384  Q
    ||||| ||||    
T  9269047 acgatccaat 9269056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 15161142 - 15161296
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  15161142 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcttcatcctctgcaaagctatcatagacatatgtagttacatctactctta 15161241  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatata 157  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15161242 tgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgattttttaatata 15161296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 384
Target Start/End: Original strand, 16130706 - 16130925
Alignment:
Q  156 tatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggatt 255  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |    
T  16130706 tatgattctagccatttattcaatattgttgttattcttgctttta---------ttgagatttgaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaat 16130796  T
Q  256 agaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctg 355  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  16130797 aaaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatcgg 16130896  T
Q  356 ttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    || || ||| |||||||||||||| ||||    
T  16130897 ttagggaatcgtcgattaaacgatccaat 16130925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 352
Target Start/End: Original strand, 13830328 - 13830673
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||||      
T  13830328 aagatttgttgagacgtcatgaatcttagcatgaaatcttcatttttctttcatcctttgcaaagttttcatagacatatgtagctacatttacccttgt 13830427  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |   ||||||    
T  13830428 gggtttttaggtattcaaacaagctattatgtatta-cttgatcatttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttattattgt---atttaa 13830523  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    | |||||||| |||||  ||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||  ||||| | | |||||| || |   ||||     
T  13830524 tactttatttaagatttgaaatgttattgaaaaatacttttgggtctagggttagaataataatctatc-aaagttttgattctagagattggatttaag 13830622  T
Q  303 atttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttggatcatttaat 352  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||    
T  13830623 ttttgataatcactttgtaatcaagaacttaaggctatcgtatcatttaat 13830673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 39454146 - 39454375
Alignment:
Q  6 gatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgg 105  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||    |||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  39454146 gatttgtagagatatcatgaatcttagtatggaatcttcatctttcttccatcttttgcaaagttatcatagacatatgtagctacatctacgcttgtgg 39454245  T
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcatta---tgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||   ||||| || |||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  39454246 tttttaaggtattcaaacaagctattaatttgtaatct-ttgatcatttaatttaaggttctagcttatttattcaatattgttattattcttgagttta 39454344  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattga 232  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  39454345 atgctttatttaagatttgaaatgttattga 39454375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 16129699 - 16129848
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  16129699 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcttcatcatttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactctt- 16129797  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaa 153  Q
      |||||| ||||||||||||||   ||||||||| || |||||| |||||    
T  16129798 gtggttttgaggtattcaaacaatctattatgtaatcttttgatcatttaa 16129848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 352
Target Start/End: Original strand, 6244242 - 6244583
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||    |||| | |||||||||| |||  | | || |||||| ||||||||||      
T  6244242 aagatttgtagagatatcatgaatattgtcatggaatcttcatccttcttccatcttttgcaaagctactatgaaaacatatagctacatctacccttgt 6244341  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| | |||||||  |||||    
T  6244342 gggttttgaggtattcaaacaa-------tgtaaactcttgatcatttaatatatggttccagctcttttattcaatattgttatcattcttgtgtttaa 6244434  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || ||||||| |||||  ||||| |||||| |  |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||| | | |||||| |||||  |||      
T  6244435 tg-tttattttagattcgaaatgttattgaaaggtacttttgaatctagggttaaaataataatctat-taaagtttttattctagacatagagtttaga 6244532  T
Q  303 atttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttggatcatttaat 352  Q
     |||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  6244533 ttttggtaatcactttaaaatcaagaacttaatgttattgggtcatttaat 6244583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 16130252 - 16130402
Alignment:
Q  2 tcaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| | ||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16130252 tcaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcttcatcatttgcaaagttatcatagacatatgtagctatatctactctt 16130351  T
Q  102 acgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaa 153  Q
       | |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||    
T  16130352 -gtgattttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaa 16130402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13249254 - 13249115
Alignment:
Q  131 tatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatatt 230  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||   ||||||||| | || ||| ||||| |  |||| |||||| ||||    
T  13249254 tatgtaatcttttgttcttttaatatatgattctagctctttatttgatattgagattattcttgtaattcatg-tttatatttgatttaaaatgttatt 13249156  T
Q  231 gacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatc 271  Q
    || ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  13249155 gaaaaatacttttgaatctagggttagaataatcatctatc 13249115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31473796 - 31473658
Alignment:
Q  132 atgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattg 231  Q
    |||||| || |||||| || |||||||| ||||| || ||||||  ||||||   ||||||||||| || ||| ||||| |  |||| |||||| |||||    
T  31473796 atgtaatcttttgatccttaaatatatgattctagctttttatttgatattgagattattcttgcaattcatg-tttatgtttgatttaaaatgttattg 31473698  T
Q  232 acaaatacttttggatccaggattagaataataatctatc 271  Q
    | ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  31473697 aaaaatacttttgaatctagggttagaataatcatctatc 31473658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22233973 - 22233597
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22233973 caagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 22233874  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22233873 tgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatgattctagctgtttattcaatattgttgttattcttgtgtttaa 22233774  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22233773 tgttttatt-gagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatttaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaa 22233675  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22233674 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatctgttgggaaatcgtcgattaaacgat 22233597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 13510004 - 13510375
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  13510004 aagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgt 13510103  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13510104 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 13510203  T
Q  204 gctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaata 303  Q
    | |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13510204 gtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactctagacatggatgttaata 13510302  T
Q  304 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13510303 tttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 13510375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 13599534 - 13599905
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  13599534 aagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgt 13599633  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13599634 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 13599733  T
Q  204 gctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaata 303  Q
    | |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13599734 gtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactctagacatggatgttaata 13599832  T
Q  304 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13599833 tttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 13599905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 22180641 - 22181013
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  22180641 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 22180740  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22180741 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 22180840  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22180841 tgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 22180939  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22180940 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 22181013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Original strand, 16958590 - 16958972
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16958590 caagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 16958689  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16958690 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatttaatttcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcactattgttgttattcttgtattta 16958789  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc-caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  16958790 atgtttta-ttgagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctattttaagttatcactttagacatagatttta 16958888  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16958889 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 16958972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22243366 - 22242997
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  22243366 caagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacctttg 22243267  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  22243266 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatttcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattattgttattcttgaattaa 22243167  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22243166 atgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 22243068  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgatt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  22243067 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgatt 22242997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22222789 - 22222422
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatat--tttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22222789 caagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaccct 22222690  T
Q  101 tacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattt 200  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||            ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22222689 tgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactt-----------atatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgtgttt 22222601  T
Q  201 aatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtt 299  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22222600 aatgttttatt-gagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatttaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgtt 22222502  T
Q  300 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22222501 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgat 22222422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4862072 - 4861702
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  4862072 caagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 4861973  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4861972 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 4861874  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4861873 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 4861775  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4861774 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaa 4861702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9068289 - 9067917
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  9068289 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 9068191  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9068190 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 9068091  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9068090 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 9067992  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9067991 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 9067917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8743405 - 8743033
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  8743405 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 8743307  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8743306 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttta 8743207  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8743206 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 8743108  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8743107 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 8743033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11309109 - 11308737
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  11309109 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatctccaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 11309011  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11309010 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 11308911  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11308910 ctgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 11308812  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11308811 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 11308737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22229131 - 22228764
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatat--tttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22229131 caagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaccct 22229032  T
Q  101 tacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattt 200  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||            ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22229031 tgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactt-----------atatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgtgttt 22228943  T
Q  201 aatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtt 299  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22228942 aatgttttatt-gagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatttaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgtt 22228844  T
Q  300 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22228843 aatatttgataatcatttttaaactagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgat 22228764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28926265 - 28925893
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  28926265 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 28926167  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28926166 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 28926067  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28926066 ttgtttta-ttgagattcaaaaagatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 28925968  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28925967 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 28925893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 3298842 - 3299213
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||   |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  3298842 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcaccctttcttcatccattgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 3298940  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  3298941 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 3299040  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3299041 tgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 3299139  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3299140 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 3299213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Original strand, 28370133 - 28370504
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||     
T  28370133 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatttactcttg 28370232  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      | |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28370233 tag-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 28370331  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28370332 ttgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaataaaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 28370430  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28370431 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaa 28370504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 27348066 - 27348438
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  27348066 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagttatcatagacatatgtagctacatctactcttg 27348165  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      | | || |||||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27348166 tag-tcttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 27348264  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27348265 ttgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatccatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 27348363  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27348364 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 27348438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41577453 - 41577081
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  41577453 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 41577354  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      | ||| | ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  41577353 tagctttga-ggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttta 41577255  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||    
T  41577254 ttgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacgtacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctaaacatggatcttaa 41577156  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41577155 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 41577081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 384
Target Start/End: Original strand, 12538200 - 12538583
Alignment:
Q  6 gatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  12538200 gatttgttgagacatcatgaatcttgtcattgaatcttcatctcttcttcatcatttgcaaagctatcttagacatatgtaggtacatctacccttgtgg 12538299  T
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||      
T  12538300 gttttgaggtattcaaacaaactattatgtaattttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttg-attttatta 12538398  T
Q  206 tttatttgagat------tgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtt 299  Q
    |||  |||||||      | |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12538399 ttttattgagatttaaaattaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagttatcactctagatatggatgtt 12538498  T
Q  300 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  || | |||| |||||||||||||| ||||    
T  12538499 aatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtcatttaatcgattagaaaatcgtcgattaaacgatccaat 12538583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34006842 - 34006524
Alignment:
Q  54 tcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||    
T  34006842 tcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt-gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaa 34006744  T
Q  154 tatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccagga 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| ||| |  |    
T  34006743 tatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattg-ttta-ttgagattcaaaatgatatggacacataattttgaatctataa 34006646  T
Q  254 ttagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatc 353  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  34006645 atagaataacaatctatcttaagttatcactctatacattgatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatc 34006546  T
Q  354 tgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
     |||||||||| |||| |||||    
T  34006545 ggttgggaaatcgtcgtttaaa 34006524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 381
Target Start/End: Original strand, 1607326 - 1607703
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||      
T  1607326 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcatggaatcttcatctttctttcatcctttgcaaagctttcataggcatatgtagctacatctacccttgt 1607425  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatct-tttaatatatggttctacc-tatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
    || |||| ||||||||||||||   |||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||    
T  1607426 ggattttgaggtattcaaacaaactattatgtaa--tctttatttatttaatatatggttctaccttatttattaaatattgttattattcttgtactta 1607523  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||   ||||    
T  1607524 atgctttatttaagatttgaaatgttattgaaaaataattttggatctagagttagaataataatctatc-taagtttttattctagatataggatttaa 1607622  T
Q  302 tatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattc 381  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||   ||| || || ||||||||||||||||    
T  1607623 tctttgataatcactttgtaatcaagaagttaatgctattgtatcgtttaatagattgagacatcgtcgattaaacgattc 1607703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 283
Target Start/End: Original strand, 16580125 - 16580404
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  16580125 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 16580223  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16580224 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 16580323  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcac 283  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16580324 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcac 16580404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 379
Target Start/End: Original strand, 17993087 - 17993281
Alignment:
Q  184 ttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcac 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17993087 ttgttattcttgcatttaatgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcac 17993185  T
Q  284 tctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  17993186 tctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgcttggaaaatcgtcgattaaacgat 17993281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13849278 - 13849071
Alignment:
Q  175 tcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatctta 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| |    
T  13849278 tcaatattgttattattcttgtatttaaagctttatt-gagatttgaaatgatattgacaaatacttttgaatctaggagtagaataacaatctatct-a 13849181  T
Q  275 agttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaa 374  Q
    |||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||  ||||||||    
T  13849180 agttttcattctatacatagatgttaatctttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttagatcaattaatagattgggaaatcatcgattaa 13849081  T
Q  375 acgattcaat 384  Q
    | ||| ||||    
T  13849080 atgatccaat 13849071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 384
Target Start/End: Original strand, 21692669 - 21692866
Alignment:
Q  187 ttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactc 285  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| || ||| ||    
T  21692669 ttattcttgtgtttaatgctttatt-gagattcaaaatgatattgacaaatgcttttggatccaagaaatagaataacaatctattttaaattttcattc 21692767  T
Q  286 tagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  21692768 tagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatttttgattaaacgatccaat 21692866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 24040756 - 24040937
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24040756 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcctcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactctta 24040855  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttg 186  Q
      |||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24040856 -tggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgat-atttaatatatggttttagctatttattcaatattgttg 24040937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 214 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36737117 - 36736948
Alignment:
Q  214 agattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatc 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  36737117 agattcaaaatgatattgacaaatacttttgaatctaggaatagaataataatctatct-aagttttcactctagacatagattttaatctttgataatc 36737019  T
Q  314 acttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||  |||||||||   |||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  36737018 actattaatctagaacttgaagcttttgagtcatttaatagattgggaaatcatcgattaaatgatgcaat 36736948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 17992934 - 17993085
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17992934 caagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 17993033  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaat 154  Q
     || |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||    
T  17993034 tggattttgaggtattcaaacaagccattatgtaatcttttgatcatttaat 17993085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22227297 - 22227255
Alignment:
Q  337 ttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22227297 ttttgggtcatttaatctgttgggaaatcgtcgattaaacgat 22227255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 1274625 - 1274999
Alignment:
Q  1 ctcaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1274625 ctcaagatttgttgagacatcatggatctcggcattgaatctttatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaccct 1274724  T
Q  101 tacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattt 200  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274725 tctgggttttgaggtattcaaacaagttattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcattt 1274824  T
Q  201 aatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1274825 aatgtttta-ttgagattcaaaatgatatagacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgtta 1274923  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  1274924 atatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaac 1274999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 375
Target Start/End: Original strand, 22909158 - 22909528
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   | | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||      
T  22909158 aagatttgttgagacatcatggatctagtcattgaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt 22909257  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22909258 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatatattcaatattgttgttattcttgcatttaat 22909357  T
Q  204 gctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaata 303  Q
    | |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22909358 gtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaata 22909456  T
Q  304 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22909457 tttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaa 22909528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Original strand, 2477698 - 2478080
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  2477698 caagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcctcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctccatctacccttg 2477797  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2477798 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttctattta 2477897  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc-caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2477898 aggcttta-ttgagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacataaatgtta 2477996  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  2477997 atatttgataatcacttttcatctagaacttaatgcttttgggtcgtttaataggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaat 2478080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3545002 - 3544620
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |  ||||||||| | |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3545002 caagatttgttgagacatcatggatctaggcattaaatcttcatctcttctccatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 3544903  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3544902 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaattacttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtattta 3544803  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3544802 atgttttatt-gagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatttaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgtta 3544704  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3544703 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 3544620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2797685 - 2797313
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2797685 caagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 2797586  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     ||||||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2797585 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaattttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 2797486  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2797485 tgtttta-ttgagatttaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 2797387  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2797386 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 2797313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10346427 - 10346055
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  10346427 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 10346329  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10346328 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 10346229  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10346228 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 10346130  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10346129 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 10346055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12090582 - 12090210
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||     
T  12090582 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaatctt- 12090484  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaata-ttgttgttattcttgcattta 201  Q
      |||||| |||||||||||||||  | |||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  12090483 gtggttttgaggtattcaaacaagctaatatgtaatattttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatatttgttgttattattgctttta 12090384  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12090383 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaactagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 12090285  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12090284 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 12090210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31158398 - 31158026
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  31158398 caagatttgttgagacatcatggatcatgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 31158300  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31158299 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaccttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 31158200  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31158199 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 31158101  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31158100 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 31158026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 2631436 - 2631808
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||     
T  2631436 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctactctt- 2631534  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  2631535 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattattgttattcttgttttca 2631634  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2631635 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 2631733  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2631734 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 2631808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 374
Target Start/End: Original strand, 31878641 - 31879009
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||     
T  31878641 caagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttt-tcatcctttgcaaaactatcaaagacatatgtagctacatctactcttg 31878739  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31878740 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcagttaa 31878838  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  31878839 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatataataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttagt 31878937  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  31878938 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaa 31879009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8108010 - 8107638
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  8108010 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 8107911  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
        |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  8107910 taa-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttca 8107812  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  8107811 ttgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaa 8107713  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8107712 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 8107638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22321922 - 22321554
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  22321922 caagatttgttgagacatcatggatcttttcattgaatcttcatcctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 22321824  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22321823 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcctttaatatatggttctagcttatttattc-atattgttgttattcttgctttta 22321725  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22321724 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 22321626  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgatta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22321625 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgatta 22321554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 23795134 - 23795506
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||     
T  23795134 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctattatagacatatgtagctccatctactctt- 23795232  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  23795233 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaaaattgttgttattcttgttttta 23795332  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23795333 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacatatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 23795431  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  23795432 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttagtcgattgggaaatcgtcgattaaac 23795506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 39 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19472275 - 19471940
Alignment:
Q  39 atcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaa 138  Q
    ||||||||  |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||||||||  |||||||||     
T  19472275 atcttcatcctttcttcatcctttgtaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt-gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaat 19472177  T
Q  139 ctcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaata 238  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||||| |||| |||    
T  19472176 cttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacata 19472078  T
Q  239 cttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgctt 338  Q
    |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19472077 cttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgctt 19471978  T
Q  339 ttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19471977 ttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 19471940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Original strand, 24482784 - 24483165
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   | | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  24482784 caagatttgttgagacatcatggatctagacattgaatcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 24482883  T
Q  103 cgggtttta-aggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24482884 tggattttagaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatcttttaaaatatggttctagtttatttattcaatattgttgttattcttgtgttt 24482983  T
Q  201 aatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtt 299  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24482984 aatgttttatt-gagattcaaaatgatattgacaattacttttgggtctaagaactagaataataatttatcttaagttatcactctagacatagatgtt 24483082  T
Q  300 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  24483083 aatatttgataatcatttttaatctag-acttaatgcttttgggtcatttaatcggttgag-aatcgtcgattaaacgatccaat 24483165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 12190883 - 12191230
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||     
T  12190883 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtatttacatctactcttg 12190982  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12190983 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctggatatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 12191081  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  12191082 tgttttatt-gagattcaaa-tgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaaa 12191179  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  12191180 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatc 12191230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 12183906 - 12184276
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||     
T  12183906 caagatttgttgagacatcatagatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatcta-ctttt 12184004  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
      |||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12184005 gtggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttgttcaatattgttgttattcttgcatttaa 12184104  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| ||||||||  ||||||||| || | ||||||||| ||| ||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||     
T  12184105 tgtttta-ttgagatt-caaatgatatggatacatacttttgaatctagagatagaataacaatctatcttgagttatcactctatacatggatgttaaa 12184202  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12184203 atttgataatcacttttaatctacgacttaatgcttttgggtaatttaatcagttgggaaatcgtcgattaaac 12184276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45500832 - 45500453
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  | | |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||     
T  45500832 caagatttgttgagacatcatagatcttgtcattgaatcttcatttcttcttcatcatttgcaaagctatcacagacatatgtagttatatctactcttg 45500733  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45500732 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgaccatttaatatatggttatagttatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 45500634  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  45500633 tgttttatt-gagatttgaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatgtatcttaagttatcactctagacatgaatgttaat 45500535  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45500534 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 45500453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 376
Target Start/End: Original strand, 6172607 - 6172927
Alignment:
Q  54 tcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||    
T  6172607 tcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactctt-gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaa 6172705  T
Q  154 tatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccagga 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||| || |    
T  6172706 tatatggttctagctatttattcaatattgctgttattcttgcgtttattgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatactttttaatctagaa 6172804  T
Q  254 ttagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatc 353  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||    
T  6172805 atagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcagttttaatctaggacttaatgcttttaggtaatttaatc 6172904  T
Q  354 tgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  6172905 ggttgggaaatcgtcgattaaac 6172927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31664616 - 31664279
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||     
T  31664616 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttaatcctttacaaagctatcataaacatatctagctacatctactcttg 31664517  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||| |||| |  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  31664516 tgg-ttttgaggtattcgaacaggctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 31664418  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |    
T  31664417 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaactagaataacaatctatcttaagttatcaatctagacatggatgttagt 31664319  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664318 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgg 31664279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29032907 - 29032568
Alignment:
Q  2 tcaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||| |||   ||||| | ||| |||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29032907 tcaagatttgttgagacatcatgagtctagacatggaatcttcatctttctttcatcatttgccaagcttgcatagacatatgtagctacatctaacctt 29032808  T
Q  102 acgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattt 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29032807 gtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaacttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtattt 29032708  T
Q  201 aatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc-caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtt 299  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||||||| ||| ||||||||||||||||            | ||    
T  29032707 aatgcttta-ttgaaattcaaaatgatattgacaaatacttttgaatctaagaaatagaataaaaatatatcttaagttatcac------------tttt 29032621  T
Q  300 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29032620 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcaattaat 29032568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 22818452 - 22818721
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||     
T  22818452 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatgaaatcttcatcttttcttcatcatttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttg 22818551  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22818552 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatgtatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 22818650  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatctta 274  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||    
T  22818651 tgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatctta 22818721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 287
Target Start/End: Original strand, 1953997 - 1954270
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  | | |||||||||  | ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  1953997 caagatttgttaagacatcatggatcttgtcattgaatcttcaattcttcttcatcctttgaaaagctatcatagacatatgtagctatatctactatt- 1954095  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
      |||||| ||||||| |||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||| ||||     
T  1954096 gtggttttgaggtatttaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaa---------tattcttgcttttat 1954186  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactcta 287  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1954187 tgcttta-ttgagatttgaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactcta 1954270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 264 - 375
Target Start/End: Original strand, 22820404 - 22820515
Alignment:
Q  264 aatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaa 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  22820404 aatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcaattttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaa 22820503  T
Q  364 tagtcgattaaa 375  Q
    | ||||||||||    
T  22820504 tcgtcgattaaa 22820515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19472385 - 19472291
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctac 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19472385 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcttggaatcttcatcctttctgcatcctttgtaaagctatcatagacatatgtagctacatctac 19472291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 31882440 - 31882510
Alignment:
Q  294 gatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  31882440 gatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatacttttgggtgatttaatcggttgggaaat 31882510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 19063557 - 19063651
Alignment:
Q  7 atttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| | ||| |||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19063557 atttgttgagacatcatggatctaagcattgaatcttcatctcttcttcattctatgtaaagctatcatagacatatgtagttatatctaccctt 19063651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 384
Target Start/End: Original strand, 1954285 - 1954347
Alignment:
Q  322 tctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  1954285 tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaat 1954347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8139229 - 8139140
Alignment:
Q  182 tgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatc 271  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |  ||||  |||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8139229 tgttattattcttgtgtttaatgctttatatatgatttgaaatgatattgaaaggtacttttgaatccacgattagaataataatctatc 8139140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9702108 - 9702027
Alignment:
Q  304 tttgataatcacttttaatctag-aacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  9702108 tttgataatcactttgaatattggaacttaaagcttttgtatcatttaatagtttgggaaatcgacgattaaacgactcaat 9702027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9787229 - 9786846
Alignment:
Q  2 tcaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctt 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||    
T  9787229 tcaagatttgttgagatatcatgaatctaggcatgaaatcttcatattttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtaagtatatctaccatt 9787130  T
Q  102 acgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattt 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9787129 gtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaacttttgatcatttaatatatggttatagcttatttattcaatattgttgttattcttgtattt 9787030  T
Q  201 aatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtt 299  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9787029 aatgctttatt-gagattcaatatgatattaacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgtc 9786931  T
Q  300 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9786930 aatatttgataatcacttttaatccaagacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgattcaat 9786846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 384
Target Start/End: Original strand, 21160004 - 21160385
Alignment:
Q  2 tcaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21160004 tcaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatctcttcttcatcttttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaccctt 21160103  T
Q  102 acgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21160104 gtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatttcttgatcattcaatatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 21160203  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21160204 atgtttta-ttgagattcaaaataatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 21160302  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21160303 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaat 21160385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36667991 - 36667619
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  36667991 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 36667892  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36667891 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 36667792  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  36667791 tgtttta-ttgagatttaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctaggcatggatgttaat 36667693  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36667692 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatccgttgggaaatcgtcgattaaac 36667619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 27257425 - 27257796
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  27257425 caagattcattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 27257524  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27257525 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatagttctagctatttattcaatattgttgttattcttaaatttaa 27257623  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  27257624 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttaaatctagaaatagaataacaatctatcttaaattatcactctagacatggatgttaat 27257722  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27257723 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 27257796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Original strand, 14700681 - 14701063
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||     
T  14700681 caagatttgttgagacatcttgagtctaggcaaggaaacttcatattttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagttacatctacccttg 14700780  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14700781 tgggttttgaggtattcaaactaactattatgtaaacttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttgttcttgtattta 14700880  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14700881 atgctttatt-gagattcaaaatgatattgagaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgtta 14700979  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14700980 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatatttttaggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 14701063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13230463 - 13230084
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  13230463 caagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttacaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 13230364  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || || | |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13230363 tgg-ttctgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 13230265  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13230264 tgttttatt-gagatttgaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 13230166  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13230165 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttagttcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 13230084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28458001 - 28457619
Alignment:
Q  1 ctcaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  || | |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28458001 ctcaagatttgttaagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttcatcctttgcaatgctatcatagacatatgtagctacatctaccct 28457902  T
Q  101 tacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcatt 199  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |     
T  28457901 tgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatttcttgatcttttaatatatagttctagcttatttatttaatattgttgttattcttg--tg 28457804  T
Q  200 taatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatactttt-ggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgt 298  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28457803 taatgcttta-ttgagattcaaaatgatattgacaaatacttttgggtttaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgt 28457705  T
Q  299 taatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  28457704 taatatttgataattacatttaatctagaatttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaat 28457619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36040384 - 36040012
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  36040384 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 36040286  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36040285 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 36040186  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    |  |||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36040185 tttttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctataaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 36040086  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36040085 atttgataatcacttttaatctaggacttgatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 36040012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 29223755 - 29224126
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  29223755 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 29223854  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      |  ||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29223855 tag--tttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 29223952  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29223953 ttgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactttagacatggatgttaa 29224051  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  29224052 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaac 29224126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 29337054 - 29337425
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  29337054 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 29337153  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      |  ||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29337154 tag--tttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 29337251  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29337252 ttgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactttagacatggatgttaa 29337350  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  29337351 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaac 29337425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23925152 - 23924783
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||      
T  23925152 aagatttgttgagacatcatggatcatgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtatctacatctactctt-g 23925054  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 203  Q
      ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23925053 ttgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatatatggttatagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 23924954  T
Q  204 gctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaata 303  Q
    | |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  23924953 gtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataataatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatt 23924855  T
Q  304 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  23924854 tttgataatcacttttaatctaggttttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcaattaaa 23924783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24663253 - 24662871
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   ||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  24663253 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcattgaatcttcatctttctttcatcctttgcgaagcttgcatagacatatgtagctacatctacgcttg 24663154  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24663153 tgagttttgaggtattcaaacaagctattacgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttattattcttgcattta 24663054  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    | ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||   ||||    
T  24663053 aagctttatttaagatttgaaatgttattgacaaatacttttggatctaagattaaaataataatctatc-taagttttcattctagacataggatttaa 24662955  T
Q  302 tatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  24662954 tctttgataatcactttgtaatcaagaacttaatgctttttggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaat 24662871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 43991571 - 43991937
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||      ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  43991571 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatctt------ttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 43991664  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43991665 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtgctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 43991763  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  43991764 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaaatagaataacaatctatcttaagttatcactgtagacatggatgttaa 43991862  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  43991863 tatttgataatcacttttaatctaggacgtaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgataaaac 43991937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 79 - 374
Target Start/End: Original strand, 41977710 - 41978004
Alignment:
Q  79 catatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaa 178  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || || ||||||||||||    
T  41977710 catatatagctacatctaccattgtgggttttaaggtattcaaacaagccattatgtaaacttttgatattttaatatacgattttagctatttattcaa 41977809  T
Q  179 tattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagtt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||    
T  41977810 tattgttgttattcttgcatttaatgttttatt-gagatttaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagtt 41977908  T
Q  279 atcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaa 374  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  41977909 atcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaa 41978004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Original strand, 32522969 - 32523348
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  | | |||||||||| | ||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||     
T  32522969 caagatttattgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcttcgtcctttgcaaagctatcatggacatatgtagctatttctacccttg 32523068  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| | ||||     
T  32523069 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttatagcgatttattcaatagtgttgttattcttacttttat 32523167  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  32523168 tgttttatt-gagatttgaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatccatcttaagttatcactctaaacatggatgttaat 32523266  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  32523267 atttgataatcacttttaatctaaaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaacgatccaat 32523348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 149 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42700949 - 42700723
Alignment:
Q  149 tttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||    
T  42700949 tttaatatatggttctagctatttgtttaatattgttgttattcttgcttttattgttttatt-gagattcaaaatgatatgaacacatacttttgaatc 42700851  T
Q  249 caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatt 348  Q
     || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||    
T  42700850 tagaaatagaataacaatctatattaagttatcactctagacatggaagttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgctttttggtaatt 42700751  T
Q  349 taatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42700750 taatcggttgggaaatcgtcgattaaac 42700723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Original strand, 40200173 - 40200359
Alignment:
Q  198 tttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagat 296  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  40200173 tttaatgctttatt-gagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttttcattccagacatagat 40200271  T
Q  297 gttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40200272 gttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 40200359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 223 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36557466 - 36557315
Alignment:
Q  223 atgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36557466 atgatattgacaaatacttttgaatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaa 36557367  T
Q  322 tctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgatta 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | | |||||||| ||||||||    
T  36557366 tctagaacttaatgcttttgggtcattcaaacggctgggaaatcgtcgatta 36557315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36557644 - 36557465
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||     
T  36557644 caagatttgttgagacatcatggatctaggcatttaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttg 36557545  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttct-acctatttattcaatat 181  Q
     || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36557544 tggattttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctaacttatttattcaatat 36557465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 384
Target Start/End: Original strand, 31758500 - 31758697
Alignment:
Q  187 ttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactc 285  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||  |||||||| || |||||||||||| ||| ||    
T  31758500 ttattcttgtgtttaatgctttatt-gagattcaaaatgatattgaccaatgcttttggatctaagaaatagaataacaagctatcttaagttttcattc 31758598  T
Q  286 tagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  31758599 cagacataaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgttgattaaacgatccaat 31758697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42702328 - 42702175
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  42702328 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcctcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 42702230  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatata 157  Q
      |||||| ||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  42702229 gtggttttgaggtattcaaataagctattatgtaatcttttgatcatttaatata 42702175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5784646 - 5784513
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  5784646 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 5784548  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaa 137  Q
       ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  5784547 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 5784513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 271
Target Start/End: Original strand, 24852800 - 24852849
Alignment:
Q  222 aatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatc 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  24852800 aatgatattgaaaaatacttttgaatctagggttagaataatcatctatc 24852849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1232614 - 1232233
Alignment:
Q  2 tcaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1232614 tcaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatctttatctcttcttcatcctttgcaaagctattatagacatatgtagctacatctaccctt 1232515  T
Q  102 acgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1232514 gtgggttttgaggtattcaaacaaaccattatgtaatttcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattctttcattta 1232415  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  1232414 atgtttta-ttgagatttaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactatagacatggatgttaa 1232316  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1232315 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaat 1232233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 9989436 - 9989807
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||   |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  9989436 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcaccctttcttcaacctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 9989534  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9989535 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 9989634  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9989635 tgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 9989733  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9989734 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 9989807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48168315 - 48167944
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  48168315 caagatttgttgagacatcagggatcttatcatggaatctgcatcttcacttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 48168216  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48168215 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatattgttttagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 48168117  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  48168116 tgttttatt-gagattcaaaatgacatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 48168018  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48168017 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 48167944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37471804 - 37471438
Alignment:
Q  7 atttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacggg 106  Q
    ||||||||||||  |||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  37471804 atttgttgagacgacatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgtgg- 37471706  T
Q  107 ttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgct 206  Q
    |||| | |||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  37471705 ttttgatgtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgtt 37471606  T
Q  207 ttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatattt 306  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  37471605 ttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaatattt 37471507  T
Q  307 gataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  37471506 gataatcacttttaatctagaacttaattcttttggataatttaatcagttgagaaatcgtcgattaaa 37471438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Original strand, 2357200 - 2357571
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || || ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||     
T  2357200 caagatttgttgagacatcatgagtctaggcatgaaatcttcatctttctttcatcctttgccaagcttgtatagacatatgtagctacatctaacattg 2357299  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357300 tgggttttgaggtattcaaacaaaccatgatgtaaactcttgatcttctaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcattta 2357399  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc-caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||    
T  2357400 atgcttta-ttgagattcaaaatgatattgacaaatacttttgaatctaagaaatagaataataatctatattaagttatcactctag--acagatgtta 2357496  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||  |||||||||    
T  2357497 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcaattaattgattgggaaatcatcgattaaa 2357571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Original strand, 3588440 - 3588820
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  3588440 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 3588538  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3588539 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 3588638  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     |  |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3588639 ttatttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagagatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaa 3588737  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3588738 tatttgataatcacttataatctaggacttaatgcttttgggtcatttagtcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 3588820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Original strand, 23193963 - 23194334
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||     
T  23193963 caagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaa-ctatcagagacatatgtagctacatctacccttg 23194061  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  23194062 tgggttttgaggtattcaaacaagccattacgtaatcttttgatcatttaatatatggttctatctatttattcaatattgtt---attcttgcatttaa 23194158  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23194159 tgttttatt-gagattcaaaataatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 23194257  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  23194258 atttgataaacacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaacgat 23194334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 45527687 - 45528059
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||     
T  45527687 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcatcatcctttgcaaagctatcatagacatatctagctacatctactcttg 45527786  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattt-a 201  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45527787 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatacatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttta 45527885  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45527886 atgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaataaaataaaaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 45527984  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45527985 tatttgataatcacttttaatctaggacttgatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 45528059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7653344 - 7652972
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||     
T  7653344 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcttagacatatgtagctacatctactctt- 7653246  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  7653245 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttca 7653146  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7653145 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 7653047  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7653046 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 7652972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10386192 - 10385820
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  10386192 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 10386094  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10386093 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcctttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttgta 10385994  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10385993 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 10385895  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10385894 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 10385820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 22097707 - 22098078
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  22097707 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 22097805  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
       ||||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  22097806 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgatcatttaatatatggttctagccatttattcaatattgttgttattcttacttttat 22097905  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22097906 tgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 22098004  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22098005 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggttaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 22098078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Original strand, 20837134 - 20837504
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||     
T  20837134 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttg 20837233  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  20837234 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattattgttattcttgcttttat 20837332  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  20837333 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatattaat 20837431  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  20837432 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcatcgattaaa 20837504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36469557 - 36469187
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||     
T  36469557 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacaactactcttg 36469458  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36469457 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatctttagatcttttaatacatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcatttta 36469359  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    |  |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36469358 ttgtttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagacatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 36469260  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  36469259 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcggttaaa 36469187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Original strand, 33248028 - 33248409
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  33248028 caagatttgttgagacatcatgaatttaggcattgaatcttcatctctttttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctgcatctacccttg 33248127  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctaccta-tttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || | ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||    
T  33248128 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatctttcgatattttaatatatgattctagctaatttattcaatattgttgttat-cttatgttta 33248226  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||| || | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33248227 atgctttatt-gagattcaaaatgatattgaccaatatttttgggtctaagaactagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgtta 33248325  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33248326 atatttgataatcactttttatctcgaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 33248409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27850672 - 27850301
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||     
T  27850672 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcatttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccaatcttg 27850573  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| ||||||| |||||||  |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27850572 tgg-ttttgaggtatttaaacaagctattatgtaattttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 27850474  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27850473 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcgtaagttatcactctagacatggatgttaat 27850375  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  27850374 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggctaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaac 27850301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 384
Target Start/End: Original strand, 26335197 - 26335528
Alignment:
Q  54 tcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26335197 tcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaa 26335296  T
Q  154 tatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc-cag 251  Q
    |||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |     
T  26335297 tatatgattttagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatttattgcttta-ttgagattcaaaacgatattgacaaatacttttggatctaaa 26335395  T
Q  252 gattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaa 351  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||    
T  26335396 aaatagaataacaatctatcttaagttataactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttatgggtcgtttaa 26335495  T
Q  352 tctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |  ||| |||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  26335496 taggtttggaaatcgtcaattaaatgatccaat 26335528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4743122 - 4742753
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  | || ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  4743122 caagatttgttgagagatcatggatcttgtcatgaaatcttcatcttttcttcatcgtttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 4743024  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4743023 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatc-attaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 4742925  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4742924 tg-ttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 4742827  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  4742826 atttaataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggtttggaaattgtcgattaaac 4742753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 52308203 - 52307835
Alignment:
Q  7 atttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacggg 106  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||    |    
T  52308203 atttgtttagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcttagacatatgtagctacatctactctt-gtag 52308105  T
Q  107 ttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||     
T  52308104 ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatacatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgt 52308005  T
Q  206 tttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatt 305  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  52308004 ttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctataaatagaataataatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatt 52307906  T
Q  306 tgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  52307905 tgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaac 52307835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 49434238 - 49434517
Alignment:
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcatttaatg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  49434238 gttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttcatcttttaatatatagttctaacttatttatttaatattgttgttattcttgtgtttaatg 49434337  T
Q  205 ctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaata 303  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||||||| |||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  49434338 ttttatt-gagatttaaaatgatattgacaaatacttttgggtctaagaaatagaataacaatctatcttaagtttacattctagacatagatgttaata 49434436  T
Q  304 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  49434437 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 49434517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 142 - 376
Target Start/End: Original strand, 37022867 - 37023102
Alignment:
Q  142 ttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatactt 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  37022867 ttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatattt 37022965  T
Q  242 ttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctaga--acttaatgcttt 339  Q
    ||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||    
T  37022966 ttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttgatatttgataatcacttttaatctatatgatttaatgcttt 37023065  T
Q  340 tggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  37023066 tgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgataaaac 37023102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 8615543 - 8615816
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  8615543 caagatttgttgagacatcatggatcttatcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 8615641  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8615642 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 8615741  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagt 277  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  8615742 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagt 8615816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20963200 - 20963006
Alignment:
Q  181 ttgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttat 280  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  20963200 ttgttgttattattgcttttattgttttatt-gagattcaaaatgatatgaacatatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaaggtat 20963102  T
Q  281 cactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  20963101 cactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggactcaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcatcgattaaac 20963006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 272 - 376
Target Start/End: Original strand, 8625931 - 8626035
Alignment:
Q  272 ttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgat 371  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  8625931 ttaatttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgat 8626030  T
Q  372 taaac 376  Q
    |||||    
T  8626031 taaac 8626035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 23385436 - 23385622
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||| ||   |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  |||     
T  23385436 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatctacaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatttagctacatctattcttg 23385535  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgtta 189  Q
      | ||||| ||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23385536 tagttttta-ggtattcaaacaagctattatgtaattttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgtta 23385622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 376
Target Start/End: Original strand, 23411748 - 23411889
Alignment:
Q  224 tgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatc 323  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||    
T  23411748 tgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacgatctatcttaagttatcactctagacat-----------tttgataatcacttttaatc 23411836  T
Q  324 tagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23411837 tagaacttaattcttttgggtaatttattcggttgggaaatcgtcgattaaac 23411889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27030805 - 27030672
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  27030805 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 27030707  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaa 137  Q
       ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  27030706 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 27030672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 351
Target Start/End: Original strand, 27104326 - 27104373
Alignment:
Q  304 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaa 351  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27104326 tttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttggatcaattaa 27104373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17405097 - 17404894
Alignment:
Q  149 tttaatatatggttctacctattt-attcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggat 247  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| | |||  ||||| |||||| |  || ||||| ||    
T  17405097 tttaatatatggttctagatcttttattcaatattgttattattcttgtgtttaatg-tttattttaaatttgaaatgttattgaaaggtatttttgaat 17404999  T
Q  248 ccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttggatca 346  Q
      ||| ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||  |||||  |||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| |||     
T  17404998 atagggttagaataataatctatc-aaagtttttactctagtaatagagtttaggttttggtaatcactttaaaatcaagaacttaatgctattgaatcg 17404900  T
Q  347 tttaat 352  Q
    ||||||    
T  17404899 tttaat 17404894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37252026 - 37251657
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  37252026 caagatttattgagacatcatgagtca-aggatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagatatatgtagctacatctacccttg 37251928  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37251927 tgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 37251828  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  37251827 tgtttta-ttgaaattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaat 37251729  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  37251728 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcgtttgggaaatcgtcgattaa 37251657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16904731 - 16904359
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  16904731 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 16904633  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16904632 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcctatttattcaatattgttgttattcttgctttta 16904533  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16904532 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 16904434  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16904433 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 16904359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11723398 - 11723026
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  11723398 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 11723300  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11723299 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 11723200  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11723199 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 11723101  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11723100 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 11723026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27167219 - 27166848
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  27167219 caagatttgttgggacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 27167120  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| ||||||||||||||   ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27167119 tgg-ttttgaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 27167021  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27167020 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacatatatttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 27166922  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  27166921 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaac 27166848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 9404464 - 9404836
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  9404464 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 9404562  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9404563 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttta 9404662  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9404663 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 9404761  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9404762 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 9404836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 11766795 - 11767166
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  11766795 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 11766893  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11766894 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 11766993  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    |  |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11766994 tatttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 11767092  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11767093 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 11767166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 31846020 - 31846391
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||     
T  31846020 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatttaatcttg 31846119  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
      | |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  31846120 tag-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 31846218  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31846219 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 31846317  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31846318 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 31846391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30607194 - 30606826
Alignment:
Q  7 atttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacggg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    |    
T  30607194 atttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt-gtag 30607096  T
Q  107 ttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||     
T  30607095 ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgt 30606996  T
Q  206 tttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatt 305  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30606995 ttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataataatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatt 30606897  T
Q  306 tgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30606896 tgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 30606826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 33434643 - 33435014
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||     
T  33434643 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctcctcttg 33434742  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
      | |||| ||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33434743 tag-ttttgaggtactcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 33434841  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33434842 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 33434940  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  33434941 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgacgattaaac 33435014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34869868 - 34869497
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| | ||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  34869868 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatctcttattcattctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 34869769  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34869768 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatctttcgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatataa 34869669  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || | || |||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||| || | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34869668 tgttcta-ttgagatttaaaatgatatggacacgtacttttgaatctagaaataaaataacaatctttcttaagttatcactctagacatggatgttaat 34869570  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  34869569 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcctcgattaaa 34869497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 34456337 - 34456707
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  34456337 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 34456435  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34456436 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttta 34456535  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||    
T  34456536 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactc--gacatggatgttaa 34456632  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34456633 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 34456707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 6269930 - 6270302
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  6269930 caagatttgttgtgacaacatggatcttgtcaaggaatcttcatattttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttg 6270029  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  6270030 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgatcatttaatatatatttctagctatttattcaatattgttgttattcttgtctttat 6270128  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||| | |||||||||| ||||  |||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6270129 tgttttatt-gagactcaaaatgatatggacatgtacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 6270227  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgtt-gggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  6270228 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgctttttggtaatttaatcggttggggaaatcgtcgattaaac 6270302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 14344509 - 14344873
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  14344509 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 14344608  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      | |||| |||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14344609 tag-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa--------tcttttaatatatggttctaacttatttattcaatattgttgttattcttgttttta 14344699  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14344700 ttgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 14344798  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14344799 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 14344873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 341
Target Start/End: Original strand, 7315005 - 7315342
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  7315005 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 7315103  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7315104 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttta 7315203  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7315204 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 7315302  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7315303 tatttgataatcatttttaatctagaacttaatgcttttg 7315342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39656159 - 39655783
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||   | ||||||||||||||| ||||||||||      
T  39656159 aagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatctttctttcatcctttgtcaagcttgcaaagacatatgtagctacatctacccttgt 39656060  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  39656059 gggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatcttcttattattcttgcatttaa 39655960  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
     |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| | | |||||| ||||   |||||    
T  39655959 agctttatttgagatttgaaatgttattgacaaatacttttgaatctagggttaaaataataatctatc-taagttttaattctagacataggatttaat 39655861  T
Q  303 atttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||   ||||||||| ||||||| ||||||    
T  39655860 ctttgataatcactttgtaatcaagaacttaatggttttgggtcgtttaatagattgggaaatcgtcgattgaacgat 39655783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 118 - 376
Target Start/End: Original strand, 7315358 - 7315616
Alignment:
Q  118 tcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgaga 216  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| ||||    
T  7315358 tcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttatt-gaga 7315456  T
Q  217 ttgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcact 316  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7315457 ttcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcact 7315556  T
Q  317 tttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7315557 tttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 7315616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Original strand, 24835778 - 24836134
Alignment:
Q  6 gatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgg 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||        
T  24835778 gatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt-gta 24835876  T
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24835877 gttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattg 24835976  T
Q  205 ctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatat 304  Q
     |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||             | || |||||||||||    
T  24835977 tttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaa-------------acatggatgttaatat 24836062  T
Q  305 ttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24836063 ttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 24836134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 255 - 379
Target Start/End: Original strand, 519320 - 519444
Alignment:
Q  255 tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatct 354  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||      
T  519320 tagaataacaatctatcttaagttttcattctaaatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaatag 519419  T
Q  355 gttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  519420 gttgggaaattgtcgattaaacgat 519444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 376
Target Start/End: Original strand, 32226914 - 32227070
Alignment:
Q  220 aaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcactttt 319  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  32226914 aaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctgtcttaagttatcactctagacatgaatgtcaatatttgataatcactttt 32227013  T
Q  320 aatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32227014 aatctaggacttagtgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 32227070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42747623 - 42747484
Alignment:
Q  131 tatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatatt 230  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||  ||||||   ||||||||||  || ||| ||||| |  |||| |||||| ||||    
T  42747623 tatgtaatcttttgatctttgaatatatgattctagctctttatttgatattgagattattcttgcgattcatg-tttatgtttgatttaaaatgttatt 42747525  T
Q  231 gacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatc 271  Q
    || ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  42747524 gaaaaatacttttgaatctagggttagaataatcatctatc 42747484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 25976989 - 25977361
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  25976989 caagattcattgagacatcatgaatcttgttatggaatcttcatcttttcttcatctt-tgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 25977087  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctaccta-tttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25977088 tgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttgtttattcaatattgttgttatttttgtattta 25977187  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25977188 atgatttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 25977286  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25977287 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 25977361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 34006542 - 34006914
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  34006542 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 34006640  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34006641 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttta 34006740  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34006741 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 34006839  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34006840 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 34006914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 3539087 - 3539459
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  3539087 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 3539185  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3539186 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 3539285  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3539286 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 3539384  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3539385 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 3539459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26515550 - 26515178
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  26515550 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 26515452  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26515451 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 26515352  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26515351 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 26515253  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26515252 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 26515178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24161376 - 24161006
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||      
T  24161376 aagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcattcttggcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt 24161277  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 203  Q
    || |||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24161276 gg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgatcatttaatatatggttctagttatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 24161178  T
Q  204 gctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaata 303  Q
    | |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  24161177 gttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataataatctatcttaagttatcactctcgacatggatgttaata 24161079  T
Q  304 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24161078 tttgataatcacttttaatcaaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 24161006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9932927 - 9932555
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||     
T  9932927 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatatacatatgtagctacatctactctt- 9932829  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9932828 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 9932729  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9932728 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 9932630  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9932629 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 9932555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 78 - 376
Target Start/End: Original strand, 34913803 - 34914100
Alignment:
Q  78 acatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattca 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34913803 acatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctatctatttattca 34913902  T
Q  178 atattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagt 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  34913903 atattgctgttattcttgcatttaatgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagt 34914001  T
Q  278 tatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34914002 tatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtaatttaatcagttgggaaatcgtcgattaaac 34914100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5989124 - 5988744
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||     
T  5989124 caagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttt-tcatcatttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatttacccttg 5989026  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5989025 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtgttta 5988926  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc-caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  5988925 atgcttta-ttgagattcaaaatgatattgacaaatacttttgggtctaagaactag-ataacaatctatcttaagttttcattctagacatagatgtta 5988828  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  5988827 atatttgataatcacttttaatttagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggtagggaaatcgtcaattaaacgatccaat 5988744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 14270711 - 14271084
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  ||   |||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  14270711 caagatttgttgagacatcatagatctaggcagtgaatcttcatcttttcttcatcttttgcaaaactatcatagacatatgtagctatatatacccttg 14270810  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14270811 tgggttttgaggtattcaaacaagcaattatgtaatttcttgattttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtgttta 14270910  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14270911 atgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaatagcaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 14271009  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14271010 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 14271084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32806884 - 32806513
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||     
T  32806884 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatgaaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtatctacacctactcttg 32806785  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32806784 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatatatggttatagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 32806686  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32806685 tggtttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataaaaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 32806587  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32806586 atttaataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 32806513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21596653 - 21596279
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatctta----gcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacc 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||     || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  21596653 caagatttgttgagacatcatagatcttgtcatgcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaaa 21596554  T
Q  99 cttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcat 198  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21596553 ctt-gtggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgctt 21596455  T
Q  199 ttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgt 298  Q
    ||| || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21596454 ttattgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaaactatcttaagttatcactctagacatggatgt 21596356  T
Q  299 taatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21596355 taatatttgataatcacttttaatctagaccttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaa 21596279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 1454835 - 1455203
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||   ||||||| ||| |||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  1454835 caagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaatcttcatctttctttcatcctttgccaagcttgcatagacatatgtaactacatctacccttg 1454934  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1454935 tgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttgtttattcaatattgttgttattcttgtatttg 1455034  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||      |||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1455035 atgtttta-ttgagattcaaaatgatgttgacaaatacttttgaatc-----atagaattacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 1455128  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  1455129 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaac 1455203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 1466527 - 1466895
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||   ||||||| ||| |||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  1466527 caagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaatcttcatctttctttcatcctttgccaagcttgcatagacatatgtaactacatctacccttg 1466626  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1466627 tgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttgtttattcaatattgttgttattcttgtatttg 1466726  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||      |||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1466727 atgtttta-ttgagattcaaaatgatgttgacaaatacttttgaatc-----atagaattacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 1466820  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  1466821 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaac 1466895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Original strand, 15642456 - 15642838
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15642456 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcatgaaatcttcatctttctttcatcctttgctaagcttgcatagacatatgtagctaaatctacccttg 15642555  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15642556 tgggttttgaggtattcaaataagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattgaatattgttattattcttgccttta 15642655  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    | ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||   ||||    
T  15642656 aagctttatttaagatttgaaatgttattgacaaatacttttggatctaggattagaataataatctatc-tatgttttcattctagacatagtatttaa 15642754  T
Q  302 tatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  15642755 tctttcataatcactttgtaatcaagaacttaatgcttttggatcgtttaataggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaat 15642838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Original strand, 24878905 - 24879276
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||     
T  24878905 caagattcattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatatactcttg 24879004  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      | |||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  24879005 tag-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggctatagcttatttattcaatattgttgttattcttgtgttta 24879103  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  24879104 atgttttatt-gagatacaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactttagacatggatgttaa 24879202  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  24879203 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaa 24879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Original strand, 21631220 - 21631598
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatat--tttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   | | |||||||||| |  |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||    
T  21631220 caagatttgttgagacatcatggatctagacatagaatcttcatctcttttcttcatcctttgtaaagctatcatagacatatgtagttacatctactct 21631319  T
Q  101 tacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcatt 199  Q
    |  || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21631320 tgtggatttga-ggtattcaaacaagctattacgtaaactcttgatcttttaatacatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatt 21631418  T
Q  200 taatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgt 298  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21631419 taatgctttatt-gagattcaaaatgatattgaaaaatgcttttgaatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgt 21631517  T
Q  299 taatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  21631518 taatctttgataatcacttataatctagaacttaatgtttttgggtcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgat 21631598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13173938 - 13173586
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatat--tttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||   || |||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||    
T  13173938 caagatttgttgagatatcatgagtcg--gcatggaatcttcatctcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatac--------atctaccct 13173849  T
Q  101 tacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattt 200  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13173848 tgtgagttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatcttttgatcatttaatatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgcattt 13173749  T
Q  201 aatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  13173748 aatgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgtta 13173650  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  13173649 atatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaat 13173586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13182471 - 13182111
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatat--tttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||   || |||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||    
T  13182471 caagatttgttgagatatcatgagtcg--gcatggaatcttcatctcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatac--------atctaccct 13182382  T
Q  101 tacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattt 200  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13182381 tgtgagttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatcttttgatcatttaatatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgttttt 13182282  T
Q  201 aatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  13182281 aatgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgtta 13182183  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgatt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  13182182 atatttgataatcacttttaatctagtacttaatgcttttgggtaatttaatcggttggaaaatcgtcgatt 13182111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9518565 - 9518193
Alignment:
Q  4 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||   ||||||| ||| ||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  9518565 aagatttgttgagacatcatgaattttagcatgaaatcttcatctttctttcatcctttgccaagtttgcatagacatatgtagctacatctacccttgt 9518466  T
Q  104 gggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  9518465 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagtttatttattcataattgttattattcttgcatttaa 9518366  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
     |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||     |||||| | | |||||| ||||   |||||    
T  9518365 agctttatttgagatttgaaatgttattgacaaatacttttgaatctagggttagaataataatc-----taagtttttattctagacataggatttaat 9518271  T
Q  303 atttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
     ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| || ||||||   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  9518270 ctttgataatcactttgtaattaagaacttaatacttttgggtcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgat 9518193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Original strand, 26604379 - 26604755
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    |||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  26604379 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcatggaatcttcatctttcttccatcttttgcaaagctttcatagacatatgtagctacatctatccttg 26604478  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     |||| || ||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  26604479 tgggtattgaggtattcaaaaaagctattatgtaatct-ttgatcatttaatataagattctagcttatttattcaatattgttattattcttgttttta 26604577  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||| | | |||||| |||||  ||||    
T  26604578 atgctttatttaagatttgaaatgttattgaaaaatacttttggatgtagggttagaataataatctatc-aaagtttttattctagacatagagtttaa 26604676  T
Q  302 tatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
      ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  26604677 gttttgataatcactttgtaatcaagaacttaatgctatttgatcgtttaatagattgggaaatcgtcgattaaacgat 26604755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 376
Target Start/End: Original strand, 16698088 - 16698321
Alignment:
Q  142 ttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatactt 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||    
T  16698088 ttgatcatttaatatatggttctaactatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttatt-gaaattcaaaatgatatggacacatactt 16698186  T
Q  242 ttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 341  Q
    ||| ||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16698187 ttgaatctagaaatagaataacaacctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttg 16698286  T
Q  342 gatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    | | |||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  16698287 ggtaatttaatcggtttggaaatcgtcgattaaac 16698321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 283
Target Start/End: Original strand, 32821841 - 32822119
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||  || | |||||||||| | |||  |||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||     
T  32821841 caagatttgttgataaatcatggatctatgcattgaatcttcatctcttctccatccttttaaaagctatcatagacaaatgtagctacatctac--ttg 32821938  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| || | ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32821939 tgggttttgaggtattcaaataagcaattatgtaatctttagat-ttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtattta 32822037  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc-caggattagaataataatctatcttaagttatcac 283  Q
     || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  32822038 ctgtttta-ttgagattcaaaatgatattgacaaatacttttgggtctaagaactagaataacaatatatcataagttatcac 32822119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 14479600 - 14479733
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  14479600 caagatttgttgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaatctatcatagacatatgtagctatatctactctt- 14479698  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaa 137  Q
      |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  14479699 gtggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 14479733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6868095 - 6867907
Alignment:
Q  83 tgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatat 181  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| || |||| ||  ||||    
T  6868095 tgtagctacatctacccttgtgggttttaaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatatatggttctagctcatttttttgatat 6867996  T
Q  182 tgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctat 270  Q
    | || ||| |||||  ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||| |  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  6867995 ttttattagtcttgtgtttaatgctttatttaagatttgaaatgttattgaaaggtacttttgaatctagggttagaataataatctat 6867907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 352
Target Start/End: Original strand, 25541255 - 25541486
Alignment:
Q  120 aaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagatt 218  Q
    |||||||  ||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||  |||  |||||||||| | |||    
T  25541255 aaacaagctattatgtaatct-ttgatcatttcatataaggttctagcttatttattaaatattgttattattcttgtgtttcttgctttatttaaaatt 25541353  T
Q  219 gaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttt 318  Q
      ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| | | |||||| || ||  ||||  |||| ||||||||||    
T  25541354 tgaaatgttattgaaatatacttttgaatatagggttagaataataatatatc-aaagtt-ttattctagacatggagtttaagttttggtaatcacttt 25541451  T
Q  319 -taatctagaacttaatgcttttggatcatttaat 352  Q
     ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  25541452 gtaatcaagagcttaatgctattggatcgtttaat 25541486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1106 - 726
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||| ||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||     
T  1106 caagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaattttcatatcttcttcgtcctttgcaaagttatcacagacatatgtagctacatctacctttg 1007  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1006 tgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtgtagcttatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 907  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  906 tgttttatt-gagattcaaaataatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 808  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  807 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgattttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 116689 - 116318
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  116689 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcctcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 116590  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| ||||||| |||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  116589 tgg-ttttgaggtatttaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctattaattcaatattgttgttattcttgaatttaa 116491  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  116490 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 116392  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  116391 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 116318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 169226 - 169158
Alignment:
Q  308 ataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  169226 ataatcactttaaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 169158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19247945 - 19247578
Alignment:
Q  7 atttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacggg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  19247945 atttgttgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtgg- 19247847  T
Q  107 ttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgct 206  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19247846 ttttgaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgtt 19247747  T
Q  207 ttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatattt 306  Q
    ||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19247746 ttatt-gagcttcaaaatgatatagacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatattt 19247648  T
Q  307 gataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19247647 gataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 19247578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30218513 - 30218137
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  30218513 caagatttgttgagacgtcatgagtctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttagcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 30218414  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacc----tatttattcaatattgttgttattcttgcat 198  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  30218413 tggattttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttattatttattcaatattgttgctattcttgtat 30218314  T
Q  199 ttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc-caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatg 297  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30218313 ttaatgcttta-ttgagattcaaaatgatattgacaaatactttttgttctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatg 30218215  T
Q  298 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  30218214 ttaatatttgataatcacttttaatctaaaacttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcatcgattaaa 30218137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4839258 - 4838886
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  4839258 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 4839160  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4839159 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 4839060  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4839059 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 4838961  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4838960 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 4838886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Original strand, 53895419 - 53895798
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  53895419 caagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggagtcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttc 53895518  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||   | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53895519 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactct---tattttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtgttta 53895615  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatc-caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  53895616 atgcttta-ttgagattcaaaatgatattgacaaatacttttgggtctaagaaatagaataacaatctatcttaagttttcattctagacatagatgtta 53895714  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  53895715 atatttgataatcacttttaatctagaccttaatgtttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtctattaaacgatccaat 53895798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40995671 - 40995298
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  40995671 caagatttgttgagacatcatggatcttatcattgaatcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttg 40995572  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaata---tatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatt 199  Q
     || |||| ||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40995571 tgg-ttttgaggtattcaaaaaagctattatgtaatcttttgatcatttaataatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttt 40995473  T
Q  200 taatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtt 299  Q
    || ||  ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40995472 tattgtcttatt-gagatttaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgtt 40995374  T
Q  300 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40995373 aatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgagtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaa 40995298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21677789 - 21677417
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  || |  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  21677789 caagattcattgagacatcatgaatctaggcataaaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttg 21677690  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     || |||| ||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677689 tgg-ttttgaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcattta 21677591  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| || ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21677590 atgtttgatt-gagatttaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 21677492  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21677491 tatttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 21677417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46692158 - 46691779
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||     
T  46692158 caagatttgttgagacatcatgaatcttgtcattgaatcttcatttcttcctcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagttatatctactcttg 46692059  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46692058 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 46691960  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||| || | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  46691959 tgttttatt-gagatttgaaatgatatggacacatacttttaaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatccctctaaacattgatgttaat 46691861  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  46691860 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttaggtcaattaatcggttgggaaatcatcgattaaacgatccaat 46691779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 26069765 - 26070139
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagcta--tatctaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26069765 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcaactcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatatctaccct 26069864  T
Q  101 tacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattt 200  Q
    |  || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26069865 tgtggattttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgctttt 26069964  T
Q  201 aatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgtta 300  Q
    | || |||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  26069965 attgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacagacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgtatgtta 26070063  T
Q  301 atatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  26070064 atatttgataatcacttttagtctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaac 26070139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 376
Target Start/End: Original strand, 1188004 - 1188376
Alignment:
Q  2 tcaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||    
T  1188004 tcaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcatgaaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataggcatatgtagctacatctactctt 1188103  T
Q  102 acgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      || |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1188104 gtgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatgattctagttatttatttaatattgttgttattattgaattta 1188202  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1188203 atgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaatagcaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 1188301  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  1188302 tatttgataatcacttttaatctaggacttgatgcttttgggtgatttaatcggttgggaaatcgtcgaataaac 1188376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 22047721 - 22048093
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  22047721 caagatttgttgagacattatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 22047819  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  22047820 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttatttttgttttta 22047919  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22047920 ttgtttta-ttgagattcagaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 22048018  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22048019 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 22048093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33110825 - 33110452
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || ||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||     
T  33110825 caagatttgttgagacatcatgaatttaggcatgacatcttcatctttttttcatcctttgcaaagctatcgtagacatatgtagttatatatacccttg 33110726  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33110725 tgggttttgaggtattcacacaagccattatgtaaacttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtattta 33110626  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |  |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33110625 aagcttta-ttgagatttgaaatgatattgacaaatacttttgaatctaggaaaaacataagagtctatcttaagttatcattctagacatagatgttaa 33110527  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   || | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33110526 tatttgataatcacttttaatctataacttaatgttcaggggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 33110452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 323478 - 323850
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||     
T  323478 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctactcttg 323577  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
      | |||| | |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  323578 tag-ttttgatgtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 323676  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  323677 ttgttttatt-gagattcaaaatgatacggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcacgctagacatggatgttaa 323775  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  323776 tatttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 323850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 352
Target Start/End: Original strand, 20948785 - 20949133
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||     
T  20948785 caagatttgtcgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgtcaagctatcataaatatatgtagctacatctatccttg 20948884  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20948885 tgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtattta 20948984  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
      |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  20948985 tagcttta-ttgagatttgaaatgatattgacaaatacttttggatctaggaatagaataacaatctatc-taagttttcattccagacatagatgttaa 20949082  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaat 352  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  20949083 tctttgataatcacttttaatctagaatttaatgtttttggatcaattaat 20949133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42533007 - 42532636
Alignment:
Q  5 agatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacg 104  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  42533007 agatttgttgagacgtcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcatttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtg 42532908  T
Q  105 ggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg-ttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaat 203  Q
    | |||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  42532907 g-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatgggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttatt 42532809  T
Q  204 gctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttgga-tccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    | ||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||| || || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42532808 gttttatta-agattcaaaatgatatggacacatactttttgaatctagaactagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 42532710  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  42532709 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaac 42532636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5273633 - 5273312
Alignment:
Q  54 tcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  5273633 tcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt-gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaa 5273535  T
Q  154 tatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccagg 252  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||     
T  5273534 tatatggttctagcttatttattcaaaattgttgttattcttgtttttattgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctaga 5273436  T
Q  253 attagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaat 352  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5273435 aatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaat 5273336  T
Q  353 ctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    | |||||||||| |||||||||||    
T  5273335 cggttgggaaatcgtcgattaaac 5273312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 376
Target Start/End: Original strand, 52618594 - 52618914
Alignment:
Q  54 tcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||   |||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||    
T  52618594 tcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactatt-gtggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaa 52618692  T
Q  154 tatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccagga 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||| || |    
T  52618693 tatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgattta-ttgagattcaaaatgatatggacacaaacttttgaatctagaa 52618791  T
Q  254 ttagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatc 353  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  52618792 atagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatc 52618891  T
Q  354 tgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
      | ||||||| ||| |||||||    
T  52618892 gatcgggaaatcgtcaattaaac 52618914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26373747 - 26373373
Alignment:
Q  7 atttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacg-g 105  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| | | |||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||| | | |    
T  26373747 atttgttgagatatcatggatcttatcattgaatcttcatttcttctttatcctttgcaaagctatcatagacatatatagctatatca--cctcatgtg 26373650  T
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgc 205  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  26373649 gttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgctttta-tgt 26373551  T
Q  206 tttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatt 305  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| |  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  26373550 tttatt-gagatttgaaatgatatggacacatacttttgaatctataaatagaataacaatctaccttaagttatcactctagacatgaatgttaatatt 26373452  T
Q  306 tgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26373451 tgataatcacttttaatctataacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaacgatccaat 26373373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 55326816 - 55327165
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  55326816 caagattcattgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatcttttcttcatccattccaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttg 55326915  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     || |||| |||||||||| ||||  |||||| || || |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  55326916 tgg-ttttgaggtattcaagcaagctattatgcaatcttttgatcatttaatatatggttctagcttatttattcaaaattgttgttattcttgtgttta 55327014  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  55327015 atgctttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactttagacatggatgttaa 55327113  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  55327114 tatttgataatcacttttaatctagagcttaatgtttttgggtaatttaatc 55327165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35416750 - 35416446
Alignment:
Q  69 ctattatagacatatgtagctatatctacccttacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct 168  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| |||  || |||| | |||||||| ||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |     
T  35416750 ctatcatagacatatgtagttacatctactcttgtgg-ttttgatgtattcaa-caagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagca 35416653  T
Q  169 atttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatct 268  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||    
T  35416652 atttattcaatattattgatattcttgcttttattgttttatt-gagattcaaaaagatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatct 35416554  T
Q  269 atcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtc 368  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||    
T  35416553 atcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtc 35416454  T
Q  369 gattaaac 376  Q
     |||||||    
T  35416453 aattaaac 35416446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 187 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9417372 - 9417175
Alignment:
Q  187 ttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggat-tagaataataatctatcttaagttatcactc 285  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  9417372 ttattcttgtgtttaatgctttatt-gagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcgtaagttttcattc 9417274  T
Q  286 tagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  9417273 tagacatagatgttaatattttacaatcacttttaatctagaatttaatgcttttggtttgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaat 9417175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 271
Target Start/End: Original strand, 6640021 - 6640286
Alignment:
Q  7 atttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctc-atcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgg 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| | || ||| | | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  6640021 atttgttgagacatcttgaatcttagcatgtaatcttcatcttt-cttctatcttttccaaagctttcatagacatatgtagctacatctacccttgtgg 6640119  T
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttct-acctatttattcaatattg-ttgttattcttgcatttaat 203  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||| || || ||||||  ||||||    
T  6640120 gttttgaggtattcaaacaagctattatggaatct-ttgatcatttaatataaggttctaatttatttattcattattgattattgttcttgtgtttaat 6640218  T
Q  204 gctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatc 271  Q
    |||||||||  ||||  ||||| |||||| ||||||||||| | | |||  || ||||||||||||||    
T  6640219 gctttatttatgatttgaaatgttattgaaaaatacttttgaacctagggctaaaataataatctatc 6640286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 44432175 - 44432081
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctac 97  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44432175 caagatttcttgagacatcatggatcttgccatggaatcttcaccctttcttcatcctttacaaagctatcatagacatatgtagctacatctac 44432081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Original strand, 8895205 - 8895277
Alignment:
Q  304 tttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||||    
T  8895205 tttgataatcactttgaaatcaagaacttaatgcttttggatcgtttaataggttgagaaatcatcgattaaa 8895277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13568347 - 13568266
Alignment:
Q  304 tttgataatcacttttaatctag-aacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  13568347 tttgataatcactttgaatattggaacttaaagcttttgtatcatttaatagtttgggaaatcgacgattaaacgactcaat 13568266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12324 - 11954
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||     
T  12324 caagatttattgagacatcatgaatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatat--agctgcatctacccttg 12227  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     | ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12226 tgtgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtactagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 12127  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12126 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagaaatggatgttaat 12028  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12027 atttgataattacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 11954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16094 - 15724
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||     
T  16094 caagatttattgagacatcatgaatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatat--agctgcatctacccttg 15997  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     | ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15996 tgtgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtactagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 15897  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15896 tgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagaaatggatgttaat 15798  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15797 atttgataattacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 15724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29021 - 28649
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  29021 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 28923  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28922 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 28823  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28822 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 28724  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  28723 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttggaaaatcgtcgattaaac 28649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 8782 - 9154
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  8782 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 8880  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8881 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 8980  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8981 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 9079  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9080 tatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 9154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 14222 - 14605
Alignment:
Q  1 ctcaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |  |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14222 ctcaagatttgttgagacatcatgagtttagggatggaatcttcatctttttttcatcctttgcaaagctatcatatacatatgtagctacatctaccct 14321  T
Q  101 tacgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcatt 199  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  14322 tgtgggttttgaggtattcaaacaagccatta-gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagtttatttattcaatatagttgttattcttgtgtt 14420  T
Q  200 taatgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggat-ccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgt 298  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  14421 taatgcttta-ttgagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatataagaaatagaataacaatctatcttaagttttcattctagacatagatgt 14519  T
Q  299 taatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||   |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  14520 taatatttgataatcactttaaatcaagagcttaatgcttttggatcgtttaatagattggaaaatcgtcgattaaacgatccaat 14605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 12234 - 12606
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||     
T  12234 caagatttattgagacatcatgaatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatat--agctgcatctacccttg 12331  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgtt-attcttgcattta 201  Q
     | ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12332 tgtgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtactagctatttattcaatattgttgtttattcttgcattta 12431  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    ||  |||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12432 attgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagaaatggatgttaa 12531  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12532 tatttgataattacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 12606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 76573 - 76194
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||     
T  76573 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcaacaattcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagatacatctactcttg 76474  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     |  |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76473 tga-ttttgaggtattcaaacaagttattatgtaatcttttgatcatttaatgtatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 76375  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  76374 tgttttatt-gagattcaaaatgatatgaacacatacttttgaatctagaaataaaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaat 76276  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  76275 atttgataatcacttttaatctacgacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaat 76194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 182; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25772 - 25401
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||     
T  25772 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagatatatgtagctacatctactctt- 25674  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
       ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25673 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta 25574  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
     || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25573 ttgtttta-ttgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaa 25475  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  25474 tatttgataatcacttttaatctagtacttaatgcttttgggtaaattaatcggtttggaaatcgtcgattaaa 25401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 374
Target Start/End: Original strand, 6772 - 7141
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||     
T  6772 caagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttg 6871  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaa 202  Q
     || |||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6872 tgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat 6970  T
Q  203 tgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaat 302  Q
    || ||| || |||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6971 tgttttctt-gagattcaaaatgatatgaacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatattttaagttatcactctagacatggatgttaat 7069  T
Q  303 atttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||  ||||| |||| |||||||||    
T  7070 atttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaattggttggaaaatcgtcgattaa 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16595 - 16215
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||| || |||||||     
T  16595 caagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatcttttcttcatcctttgccaagctatcttagacatatgtatctacatatacccttg 16496  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16495 tgggttttgaggtatttaaataagctattatgtaaacccttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatggttgttattcttgtattta 16396  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaa 301  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||| |   |||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  16395 aggcttta-ttgagatttgaaatgatattaactaatacttttggatctaggaattatataacaatctatc-taagttttcattctagacatagatgttaa 16298  T
Q  302 tatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaacgattcaat 384  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  16297 tctttgataatcatttttaatctagaacttaatgcttttggatcgattaatagattgggaaatcatcgattaaacgatccaat 16215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12491 - 12238
Alignment:
Q  115 tattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacct-atttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttg 213  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||    
T  12491 tattcaaacaagctattatgtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgctttta---------ttg 12401  T
Q  214 agattgaaaatgatattgacaaatacttttggatccaggattagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatc 313  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12400 agattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatc 12301  T
Q  314 acttttaatctagaacttaatgcttttggatcatttaatctgttgggaaatagtcgattaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12300 acttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 12238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Original strand, 7205 - 7341
Alignment:
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7205 gttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatctattcaatattgttgttattcttgcatttaatgt 7304  T
Q  206 tttatttgagattgaaaatgatattgacaaatactttt 243  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  7305 ttta-ttgagattcaaaatgttatggacacatactttt 7341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Original strand, 11819 - 11955
Alignment:
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11819 gttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatctattcaatattgttgttattcttgcatttaatgt 11918  T
Q  206 tttatttgagattgaaaatgatattgacaaatactttt 243  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  11919 ttta-ttgagattcaaaatgttatggacacatactttt 11955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7409
Alignment:
Q  272 ttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 341  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7340 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttg 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Original strand, 11954 - 12023
Alignment:
Q  272 ttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 341  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11954 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttg 12023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Original strand, 9814 - 9950
Alignment:
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctacctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9814 gttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatctattcaatattgttgttattcttgcatttaatgt 9913  T
Q  206 tttatttgagattgaaaatgatattgacaaatactttt 243  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  9914 ttta-ttgagattcaaaatgttatggacacatactttt 9950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Original strand, 9949 - 10018
Alignment:
Q  272 ttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 341  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9949 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttg 10018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 255 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35191 - 35070
Alignment:
Q  255 tagaataataatctatcttaagttatcactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttggatcatttaatc 353  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35191 tagaataacaatctaccttaagttatcactcta----tagatgttaatatttgataatcacttttaaatctagaacttaatgctttttggtcatttaatc 35096  T
Q  354 tgttgggaaatagtcgattaaacgat 379  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  35095 ggttgggaaatcgtcgattaaacgat 35070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35405 - 35212
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  |  || ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||   |||||||||||||| || ||| ||| ||     
T  35405 caagatttgttgagacattatgagtctcggtatgaaatcttcatttttctttcatcctttgccaagcttgcatagacatatgtaggtacatccaccattg 35306  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttg 195  Q
     | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35305 tgagttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatttcttgattttttaatatatggttatagcttatttattcaatattgttgttattcttg 35212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9572 - 9343
Alignment:
Q  6 gatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctacccttacgg 105  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||    |||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  9572 gatttgtagagatatcatgaatcttagtatggaatcttcatctttcttccatcttttgcaaagttatcatagacatatgtagctacatctacgcttgtgg 9473  T
Q  106 gttttaaggtattcaaacaagtcatta---tgtaaactcttgatcttttaatatatggttcta-cctatttattcaatattgttgttattcttgcattta 201  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||   ||||| || |||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  9472 tttttaaggtattcaaacaagctattaatttgtaatct-ttgatcatttaatttaaggttctagcttatttattcaatattgttattattcttgagttta 9374  T
Q  202 atgctttatttgagattgaaaatgatattga 232  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  9373 atgctttatttaagatttgaaatgttattga 9343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 1604 - 1737
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagctatatctaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  1604 caagatttgttgagacatcatggatcttatcatggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactctt- 1702  T
Q  103 cgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaa 137  Q
       ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  1703 gtagttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 1737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 92 - 5
Alignment:
Q  3 caagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcctcatcctctgcaaagctattatagacatatgtagcta 90  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  92 caagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcctctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagcta 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University