View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17049_low_32 (Length: 229)

Name: NF17049_low_32
Description: NF17049
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17049_low_32
NF17049_low_32
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-213)||(15388190-15388402)
chr4 (1-213)||(14760118-14760330)
chr4 (1-213)||(14668261-14668473)
chr4 (1-213)||(5009120-5009332)
chr4 (1-213)||(6573103-6573315)
chr4 (1-213)||(17016291-17016503)
chr4 (1-213)||(34185772-34185984)
chr4 (1-213)||(18313990-18314202)
chr4 (1-213)||(24589173-24589385)
chr4 (1-213)||(54836636-54836848)
chr4 (1-202)||(39853893-39854094)
chr4 (1-213)||(14101788-14102000)
chr4 (1-209)||(20335233-20335441)
chr4 (1-213)||(24115907-24116119)
chr4 (1-213)||(27160129-27160341)
chr4 (3-213)||(15231117-15231327)
chr4 (1-202)||(18797426-18797627)
chr4 (1-213)||(36341329-36341541)
chr4 (1-212)||(1903500-1903711)
chr4 (1-213)||(33670612-33670824)
chr4 (1-211)||(15281749-15281959)
chr4 (1-213)||(21972946-21973158)
chr4 (1-213)||(30757005-30757217)
chr4 (1-213)||(31123324-31123536)
chr4 (1-213)||(40102449-40102661)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-213)||(27394793-27395005)
chr2 (1-213)||(23125369-23125581)
chr2 (1-213)||(37948663-37948875)
chr2 (1-202)||(27806945-27807146)
chr2 (1-213)||(12658767-12658979)
chr2 (1-213)||(34294385-34294597)
chr2 (1-211)||(27431242-27431452)
chr2 (1-213)||(20841144-20841356)
chr2 (1-213)||(28885438-28885650)
chr2 (1-213)||(39048620-39048832)
chr2 (1-202)||(13933348-13933549)
chr2 (1-213)||(11631985-11632197)
chr2 (1-202)||(257454-257655)
chr2 (1-213)||(40236739-40236951)
chr2 (1-202)||(12590050-12590251)
chr2 (1-213)||(31879517-31879729)
chr2 (1-213)||(39893300-39893512)
chr2 (1-213)||(16826139-16826351)
chr2 (1-213)||(16895129-16895341)
chr2 (1-213)||(19413302-19413514)
chr2 (1-213)||(32053034-32053246)
chr2 (1-213)||(34864915-34865127)
chr2 (1-213)||(37380908-37381120)
chr2 (1-213)||(37682696-37682908)
chr2 (1-213)||(37697961-37698173)
chr2 (1-213)||(37928600-37928812)
chr2 (1-202)||(9346787-9346988)
chr2 (1-202)||(21673976-21674177)
chr2 (1-213)||(12713402-12713614)
chr2 (1-192)||(21699972-21700163)
chr2 (1-211)||(19453224-19453434)
chr2 (1-104)||(31890292-31890395)
chr2 (3-104)||(22924951-22925052)
chr2 (1-104)||(3785833-3785936)
chr2 (1-104)||(16164820-16164923)
chr2 (1-104)||(27779574-27779677)
chr2 (1-104)||(27819331-27819434)
chr2 (1-104)||(34158184-34158287)
chr2 (1-104)||(27119864-27119967)
chr2 (1-63)||(27827841-27827903)
chr2 (116-172)||(12383932-12383988)
chr2 (116-172)||(22949665-22949721)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (1-213)||(22077684-22077896)
chr8 (1-213)||(27605678-27605890)
chr8 (1-213)||(14560855-14561067)
chr8 (1-213)||(18793935-18794147)
chr8 (1-213)||(19691329-19691541)
chr8 (1-213)||(2134033-2134245)
chr8 (1-202)||(19205135-19205336)
chr8 (1-213)||(9357856-9358068)
chr8 (1-213)||(29832557-29832769)
chr8 (1-202)||(28358725-28358926)
chr8 (1-213)||(19677678-19677890)
chr8 (1-213)||(31357759-31357971)
chr8 (1-213)||(18712715-18712927)
chr8 (1-213)||(12089496-12089708)
chr8 (1-213)||(33261965-33262177)
chr8 (1-213)||(31486644-31486856)
chr8 (1-104)||(15770914-15771017)
chr8 (1-81)||(44564347-44564427)
chr8 (1-87)||(21344944-21345030)
chr8 (152-213)||(16286632-16286694)
chr8 (117-202)||(19844409-19844494)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (1-213)||(5593212-5593424)
chr3 (1-213)||(18054455-18054667)
chr3 (1-213)||(18273907-18274119)
chr3 (1-213)||(18289208-18289420)
chr3 (1-213)||(18304509-18304721)
chr3 (1-212)||(4793490-4793701)
chr3 (1-211)||(8286325-8286535)
chr3 (1-218)||(18333818-18334035)
chr3 (1-213)||(8299164-8299376)
chr3 (1-213)||(15889560-15889772)
chr3 (1-213)||(21677896-21678108)
chr3 (1-218)||(35883954-35884171)
chr3 (1-213)||(6205096-6205308)
chr3 (1-213)||(15737949-15738161)
chr3 (1-213)||(22384433-22384645)
chr3 (1-213)||(29145611-29145823)
chr3 (1-213)||(29661825-29662037)
chr3 (1-213)||(4686848-4687060)
chr3 (1-213)||(4724824-4725036)
chr3 (1-202)||(20573698-20573899)
chr3 (1-202)||(32442355-32442556)
chr3 (1-213)||(8214928-8215140)
chr3 (1-213)||(20069233-20069445)
chr3 (1-213)||(48469120-48469332)
chr3 (1-213)||(7076399-7076611)
chr3 (1-213)||(28112809-28113021)
chr3 (1-213)||(47026646-47026858)
chr3 (1-213)||(5016907-5017119)
chr3 (1-213)||(5606169-5606381)
chr3 (1-213)||(10399337-10399549)
chr3 (1-213)||(28342370-28342582)
chr3 (1-202)||(18245945-18246146)
chr3 (1-213)||(4343531-4343743)
chr3 (1-213)||(4420108-4420320)
chr3 (1-213)||(5470181-5470393)
chr3 (1-213)||(6539597-6539809)
chr3 (1-213)||(7999753-7999965)
chr3 (1-213)||(10646266-10646478)
chr3 (1-209)||(19697687-19697895)
chr3 (1-213)||(22867703-22867915)
chr3 (1-213)||(22882762-22882974)
chr3 (1-213)||(28024475-28024687)
chr3 (1-211)||(16621345-16621555)
chr3 (1-213)||(24331356-24331568)
chr3 (1-213)||(31961310-31961522)
chr3 (1-213)||(51785216-51785428)
chr3 (20-213)||(11107226-11107419)
chr3 (1-213)||(17981804-17982016)
chr3 (1-213)||(18228389-18228601)
chr3 (1-104)||(17992786-17992889)
chr3 (1-104)||(31033091-31033194)
chr3 (1-104)||(4627087-4627190)
chr3 (1-104)||(32293930-32294033)
chr3 (1-104)||(5714375-5714478)
chr3 (1-104)||(5725285-5725388)
chr3 (1-104)||(5766980-5767083)
chr3 (114-174)||(15592879-15592939)
chr3 (1-76)||(6963288-6963363)
chr3 (116-174)||(15918749-15918807)
chr3 (116-174)||(20443349-20443407)
chr3 (116-174)||(41440475-41440533)
chr3 (116-172)||(5950772-5950828)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-213)||(10913566-10913778)
chr7 (1-213)||(2157803-2158015)
chr7 (1-213)||(26438486-26438698)
chr7 (1-213)||(26534570-26534782)
chr7 (3-213)||(2106862-2107072)
chr7 (3-213)||(11421478-11421688)
chr7 (1-213)||(45390449-45390661)
chr7 (1-211)||(16515127-16515337)
chr7 (1-202)||(26516032-26516233)
chr7 (1-213)||(5131225-5131437)
chr7 (1-213)||(5144037-5144249)
chr7 (1-213)||(22145424-22145636)
chr7 (1-213)||(26271783-26271995)
chr7 (1-213)||(26316545-26316757)
chr7 (1-211)||(10844851-10845061)
chr7 (1-202)||(31561087-31561288)
chr7 (1-213)||(3448535-3448747)
chr7 (1-213)||(4141943-4142155)
chr7 (1-213)||(4202618-4202830)
chr7 (1-213)||(11444116-11444328)
chr7 (3-211)||(16044550-16044758)
chr7 (1-211)||(10842691-10842901)
chr7 (1-202)||(16748214-16748415)
chr7 (1-213)||(26666611-26666823)
chr7 (1-213)||(24589231-24589443)
chr7 (1-192)||(16446703-16446894)
chr7 (64-213)||(9621879-9622028)
chr7 (1-104)||(2776592-2776695)
chr7 (1-104)||(26512393-26512496)
chr7 (1-104)||(26681803-26681906)
chr7 (1-104)||(31127245-31127348)
chr7 (1-104)||(39209836-39209939)
chr7 (3-97)||(45734658-45734752)
chr7 (1-104)||(31087319-31087422)
chr7 (116-172)||(9469590-9469646)
chr7 (126-174)||(16287201-16287249)
chr7 (116-172)||(16393246-16393302)
chr7 (116-172)||(30369758-30369814)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-213)||(27022365-27022577)
chr6 (1-213)||(27287119-27287331)
chr6 (1-213)||(29552786-29552998)
chr6 (1-213)||(13295706-13295918)
chr6 (1-213)||(15421075-15421287)
chr6 (1-213)||(22931639-22931851)
chr6 (1-213)||(23854084-23854296)
chr6 (1-213)||(24866945-24867157)
chr6 (1-209)||(27626466-27626674)
chr6 (1-213)||(16677369-16677581)
chr6 (1-213)||(27179685-27179897)
chr6 (1-213)||(27269342-27269554)
chr6 (1-213)||(34461261-34461473)
chr6 (1-213)||(3699312-3699524)
chr6 (1-213)||(4760992-4761204)
chr6 (1-209)||(17089198-17089406)
chr6 (1-213)||(26921606-26921818)
chr6 (1-213)||(27010960-27011172)
chr6 (1-213)||(16753050-16753262)
chr6 (1-213)||(27060735-27060947)
chr6 (1-213)||(29504645-29504857)
chr6 (1-213)||(4528514-4528726)
chr6 (1-213)||(4542529-4542741)
chr6 (1-213)||(4720890-4721102)
chr6 (1-213)||(27488362-27488574)
chr6 (1-213)||(29576243-29576455)
chr6 (1-213)||(30554771-30554983)
chr6 (1-192)||(20171797-20171988)
chr6 (1-192)||(22164003-22164194)
chr6 (3-213)||(16940784-16940994)
chr6 (1-213)||(26113167-26113379)
chr6 (1-213)||(28210683-28210895)
chr6 (1-213)||(4776109-4776321)
chr6 (1-104)||(22455869-22455972)
chr6 (1-141)||(26992096-26992236)
chr6 (1-104)||(14142149-14142252)
chr6 (1-104)||(26775382-26775485)
chr6 (1-104)||(26789154-26789257)
chr6 (1-104)||(27197523-27197626)
chr6 (1-104)||(27251609-27251712)
chr6 (1-104)||(27358865-27358968)
chr6 (1-104)||(27449208-27449311)
chr6 (1-97)||(8902458-8902554)
chr6 (3-97)||(28163836-28163930)
chr6 (1-104)||(13520947-13521049)
chr6 (1-88)||(33373186-33373273)
chr6 (116-172)||(9136223-9136279)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (1-213)||(15655467-15655679)
chr5 (1-213)||(41677944-41678156)
chr5 (1-213)||(11552594-11552806)
chr5 (1-213)||(33295767-33295979)
chr5 (1-213)||(33780728-33780940)
chr5 (1-202)||(40470259-40470460)
chr5 (1-213)||(22995826-22996038)
chr5 (1-213)||(23629209-23629421)
chr5 (1-213)||(24684854-24685066)
chr5 (1-213)||(24973145-24973357)
chr5 (1-213)||(18372243-18372455)
chr5 (1-213)||(31434703-31434915)
chr5 (1-213)||(37355352-37355564)
chr5 (1-211)||(23895447-23895657)
chr5 (1-213)||(3792780-3792992)
chr5 (1-213)||(9320715-9320927)
chr5 (1-213)||(12135414-12135626)
chr5 (1-213)||(18497434-18497646)
chr5 (1-213)||(26483633-26483845)
chr5 (1-213)||(43081494-43081706)
chr5 (1-213)||(13321539-13321751)
chr5 (1-213)||(28652481-28652693)
chr5 (1-213)||(30032667-30032879)
chr5 (1-213)||(37767700-37767912)
chr5 (1-213)||(6877544-6877756)
chr5 (1-213)||(8662184-8662396)
chr5 (1-213)||(24586613-24586825)
chr5 (1-213)||(30155270-30155482)
chr5 (1-213)||(30171708-30171920)
chr5 (1-213)||(30937874-30938086)
chr5 (1-213)||(31823116-31823328)
chr5 (1-213)||(33519619-33519831)
chr5 (1-213)||(34619757-34619969)
chr5 (1-213)||(37668195-37668407)
chr5 (1-213)||(37758222-37758434)
chr5 (1-208)||(22891707-22891914)
chr5 (1-211)||(25203519-25203729)
chr5 (1-211)||(25267674-25267884)
chr5 (1-202)||(15755561-15755762)
chr5 (1-213)||(24727208-24727420)
chr5 (1-213)||(32592983-32593195)
chr5 (1-213)||(5641027-5641239)
chr5 (1-213)||(28956494-28956706)
chr5 (1-213)||(2514301-2514513)
chr5 (1-104)||(18125125-18125228)
chr5 (1-103)||(13439392-13439494)
chr5 (1-104)||(9547418-9547521)
chr5 (1-104)||(11326985-11327088)
chr5 (1-104)||(13183502-13183605)
chr5 (1-104)||(29887906-29888009)
chr5 (1-104)||(33878479-33878581)
chr5 (1-76)||(351924-351999)
chr5 (116-172)||(5440049-5440105)
chr5 (116-172)||(11944246-11944302)
chr5 (116-172)||(15784549-15784605)
chr5 (116-172)||(17957376-17957432)
chr5 (126-174)||(34468900-34468948)
chr5 (116-172)||(36375786-36375842)
chr5 (116-172)||(37000440-37000496)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-211)||(3301-3511)
scaffold0089 (75-213)||(43877-44015)
scaffold0089 (140-211)||(32096-32167)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-213)||(9268-9480)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (1-213)||(30525-30737)
scaffold0143 (1-211)||(19304-19514)
scaffold0143 (1-104)||(7301-7404)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-202)||(21894561-21894762)
chr1 (1-213)||(51641452-51641664)
chr1 (1-208)||(20339113-20339320)
chr1 (1-202)||(10965910-10966111)
chr1 (1-213)||(28588219-28588431)
chr1 (1-213)||(3644366-3644581)
chr1 (1-202)||(41790122-41790323)
chr1 (1-213)||(10948311-10948523)
chr1 (3-211)||(20464212-20464420)
chr1 (1-210)||(16204846-16205055)
chr1 (1-104)||(28153079-28153182)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-213)||(15813-16025)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-208)||(1436-1643)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-213)||(23003-23215)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-213)||(9254-9466)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-213)||(12803-13015)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-213)||(11740-11952)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-213)||(11181-11393)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-213)||(5991-6203)
scaffold0159 (141-213)||(23111-23183)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-211)||(9279-9489)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (2-211)||(5484-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (117-213)||(1155-1251)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-203)||(43542-43754)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (114-174)||(35165-35225)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (138-199)||(33706-33770)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (116-172)||(29443-29499)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15388190 - 15388402
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15388190 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggttg 15388289  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388290 attctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 15388389  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    |||||||||||||    
T  15388390 ttttcggtctgtg 15388402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 14760118 - 14760330
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  14760118 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 14760217  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14760218 attctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 14760317  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  14760318 ttctcggtctgtg 14760330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14668473 - 14668261
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  14668473 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 14668374  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14668373 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaatctctgacttgc 14668274  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  14668273 ttctcggtctgtg 14668261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5009332 - 5009120
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  5009332 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 5009233  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5009232 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 5009133  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  5009132 ttctctgtctgtg 5009120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6573315 - 6573103
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  6573315 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 6573216  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6573215 attctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 6573116  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  6573115 ttctctgtctgtg 6573103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17016503 - 17016291
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  17016503 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 17016404  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17016403 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 17016304  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  17016303 ttctcggtctgtg 17016291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34185772 - 34185984
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  34185772 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctg 34185871  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34185872 attctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 34185971  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  34185972 ttctcggtctgtg 34185984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18313990 - 18314202
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  18313990 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 18314089  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18314090 attcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 18314189  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  18314190 ttctctgtctgtg 18314202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 24589173 - 24589385
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  24589173 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctg 24589272  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24589273 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 24589372  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  24589373 ttctcagtctgtg 24589385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54836848 - 54836636
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  54836848 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 54836749  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  54836748 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctctgacttgc 54836649  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  54836648 ttctcggtctgtg 54836636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39854094 - 39853893
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  39854094 gccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 39853995  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39853994 gttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 39853895  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  39853894 tt 39853893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14102000 - 14101788
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  14102000 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctg 14101901  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  14101900 attctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 14101801  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  14101800 ttctctgtctgtg 14101788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20335233 - 20335441
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  20335233 gccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 20335332  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20335333 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 20335432  T
Q  201 ttttcggtc 209  Q
    || ||||||    
T  20335433 ttctcggtc 20335441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24116119 - 24115907
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  | ||| ||    
T  24116119 gccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgacaggctg 24116020  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24116019 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 24115920  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  24115919 ttctcggtctgtg 24115907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 27160129 - 27160341
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  27160129 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 27160228  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27160229 gttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 27160328  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  27160329 ttctctgtctgtg 27160341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15231327 - 15231117
Alignment:
Q  3 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  15231327 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 15231228  T
Q  103 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 202  Q
    || |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  15231227 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 15231128  T
Q  203 ttcggtctgtg 213  Q
     ||||||||||    
T  15231127 ctcggtctgtg 15231117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18797426 - 18797627
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  18797426 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 18797525  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18797526 gttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 18797625  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  18797626 tt 18797627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 36341329 - 36341541
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |  ||||| ||    
T  36341329 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattccatacgataggctg 36341428  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  36341429 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgt 36341528  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  36341529 ttctctgtctgtg 36341541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1903711 - 1903500
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||   ||||| | |||||| ||    
T  1903711 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttccatacaataggctg 1903612  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  1903611 attcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgt 1903512  T
Q  201 ttttcggtctgt 212  Q
    || |||||||||    
T  1903511 ttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 33670612 - 33670824
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  33670612 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 33670711  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  33670712 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 33670811  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  33670812 ttctctgtctgtg 33670824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 15281749 - 15281959
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  15281749 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctg 15281848  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  15281849 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgt 15281948  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  15281949 ttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21973158 - 21972946
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  21973158 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 21973059  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  21973058 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 21972959  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  21972958 ttctctgtctgtg 21972946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30757217 - 30757005
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  30757217 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 30757118  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  30757117 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgc 30757018  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  30757017 ttctctgtctgtg 30757005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 31123324 - 31123536
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  31123324 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 31123423  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31123424 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 31123523  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  31123524 ttctctgtctgtg 31123536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 40102449 - 40102661
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  40102449 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 40102548  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  40102549 gttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 40102648  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  40102649 ttctctgtctgtg 40102661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27395005 - 27394793
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27395005 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggttg 27394906  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394905 attctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 27394806  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    |||||||||||||    
T  27394805 ttttcggtctgtg 27394793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 23125369 - 23125581
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  23125369 gccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 23125468  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23125469 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 23125568  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  23125569 ttctcggtctgtg 23125581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 37948663 - 37948875
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  37948663 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 37948762  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37948763 gttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 37948862  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  37948863 ttctcggtctgtg 37948875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27807146 - 27806945
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  27807146 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 27807047  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27807046 gttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 27806947  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  27806946 tt 27806945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12658979 - 12658767
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  12658979 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 12658880  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  12658879 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgc 12658780  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||| ||||    
T  12658779 ttctcggtttgtg 12658767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34294597 - 34294385
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  34294597 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 34294498  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34294497 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 34294398  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  34294397 ttctcggtctgtg 34294385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 27431242 - 27431452
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |     
T  27431242 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggcta 27431341  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  27431342 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgc 27431441  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  27431442 ttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20841356 - 20841144
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  20841356 gccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 20841257  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20841256 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 20841157  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  20841156 ttctcggtctgtg 20841144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28885650 - 28885438
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||    
T  28885650 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttg 28885551  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28885550 attctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 28885451  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  28885450 ttctcggtctgtg 28885438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 39048620 - 39048832
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  39048620 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 39048719  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  39048720 attcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcttacttgc 39048819  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  39048820 ttctcagtctgtg 39048832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13933348 - 13933549
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  13933348 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 13933447  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13933448 attcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 13933547  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  13933548 tt 13933549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 11631985 - 11632197
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  11631985 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 11632084  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  11632085 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 11632184  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  11632185 ttctctgtctgtg 11632197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 257454 - 257655
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  257454 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 257553  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  257554 gttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 257653  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  257654 tt 257655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40236951 - 40236739
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  40236951 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattccatacaataggctg 40236852  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40236851 gttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 40236752  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  40236751 ttctctgtctgtg 40236739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12590251 - 12590050
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | || ||| ||    
T  12590251 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaacaggctg 12590152  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12590151 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 12590052  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  12590051 tt 12590050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31879729 - 31879517
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  31879729 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 31879630  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31879629 gttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 31879530  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  31879529 ttctctgtctgtg 31879517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39893512 - 39893300
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  39893512 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 39893413  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39893412 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 39893313  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  39893312 ttctctgtctgtg 39893300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 16826139 - 16826351
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  16826139 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 16826238  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  16826239 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 16826338  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  16826339 ttctctgtctgtg 16826351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16895341 - 16895129
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  16895341 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 16895242  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  16895241 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 16895142  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  16895141 ttctctgtctgtg 16895129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 19413302 - 19413514
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  19413302 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 19413401  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  19413402 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 19413501  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  19413502 ttctctgtctgtg 19413514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32053246 - 32053034
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  32053246 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 32053147  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  32053146 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 32053047  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  32053046 ttctctgtctgtg 32053034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34865127 - 34864915
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  34865127 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 34865028  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  34865027 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 34864928  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  34864927 ttctctgtctgtg 34864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37381120 - 37380908
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  37381120 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 37381021  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||     
T  37381020 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaacctctgacttgt 37380921  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  37380920 ttctcggtctgtg 37380908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 37682696 - 37682908
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  37682696 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 37682795  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  37682796 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 37682895  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  37682896 ttctctgtctgtg 37682908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 37697961 - 37698173
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  37697961 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 37698060  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  37698061 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 37698160  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  37698161 ttctctgtctgtg 37698173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37928812 - 37928600
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  37928812 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 37928713  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  37928712 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 37928613  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  37928612 ttctctgtctgtg 37928600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 9346787 - 9346988
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  9346787 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 9346886  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  9346887 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 9346986  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  9346987 tt 9346988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 21673976 - 21674177
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  21673976 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 21674075  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  21674076 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 21674175  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  21674176 tt 21674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 12713402 - 12713614
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  12713402 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 12713501  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  12713502 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 12713601  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  12713602 ttctctgtctgtg 12713614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 21699972 - 21700163
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  21699972 gccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctg 21700071  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 192  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21700072 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctc 21700163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 19453224 - 19453434
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  19453224 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctg 19453323  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  19453324 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgt 19453423  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  19453424 ttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 31890292 - 31890395
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  31890292 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaataggctg 31890391  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  31890392 attc 31890395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Original strand, 22924951 - 22925052
Alignment:
Q  3 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  22924951 cttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggttgat 22925050  T
Q  103 tc 104  Q
    ||    
T  22925051 tc 22925052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3785936 - 3785833
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  3785936 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 3785837  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  3785836 attc 3785833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16164923 - 16164820
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  16164923 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 16164824  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  16164823 attc 16164820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27779677 - 27779574
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  27779677 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 27779578  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  27779577 attc 27779574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27819434 - 27819331
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  27819434 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 27819335  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  27819334 attc 27819331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34158287 - 34158184
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  34158287 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 34158188  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  34158187 attc 34158184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27119967 - 27119864
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  27119967 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 27119868  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  27119867 attc 27119864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27827903 - 27827841
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaa 63  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  27827903 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12383988 - 12383932
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12383988 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22949721 - 22949665
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949721 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22077684 - 22077896
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22077684 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggttg 22077783  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077784 attctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 22077883  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    |||||||||||||    
T  22077884 ttttcggtctgtg 22077896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 27605678 - 27605890
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  27605678 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 27605777  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27605778 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 27605877  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  27605878 ttctcggtctgtg 27605890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14561067 - 14560855
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||    
T  14561067 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttg 14560968  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14560967 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 14560868  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  14560867 ttctcggtctgtg 14560855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18794147 - 18793935
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  18794147 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 18794048  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18794047 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 18793948  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  18793947 ttctcggtctgtg 18793935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19691541 - 19691329
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  19691541 gccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 19691442  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19691441 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgc 19691342  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||| ||||    
T  19691341 ttctcggtttgtg 19691329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 2134033 - 2134245
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  2134033 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 2134132  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2134133 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 2134232  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  2134233 ttctcggtctgtg 2134245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19205135 - 19205336
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  19205135 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 19205234  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  19205235 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 19205334  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  19205335 tt 19205336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9358068 - 9357856
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  9358068 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 9357969  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  9357968 gttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgc 9357869  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  9357868 ttctctgtctgtg 9357856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29832769 - 29832557
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  29832769 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 29832670  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  29832669 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctgacttgc 29832570  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  29832569 ttctctgtctgtg 29832557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 28358725 - 28358926
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  28358725 gccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 28358824  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  28358825 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 28358924  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  28358925 tt 28358926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19677890 - 19677678
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  19677890 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 19677791  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  19677790 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 19677691  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  19677690 ttctctgtctgtg 19677678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31357971 - 31357759
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  31357971 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagggtg 31357872  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| |||| || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31357871 gttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 31357772  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  31357771 ttctctgtctgtg 31357759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18712927 - 18712715
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | || ||| ||    
T  18712927 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacaggctg 18712828  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  18712827 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgt 18712728  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  18712727 ttctcggtctgtg 18712715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 12089496 - 12089708
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  12089496 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 12089595  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  12089596 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 12089695  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  12089696 ttctctgtctgtg 12089708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33262177 - 33261965
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  33262177 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 33262078  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  33262077 gttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 33261978  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  33261977 ttctctgtctgtg 33261965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 31486644 - 31486856
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  31486644 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 31486743  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31486744 gttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctctgacttgc 31486843  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  31486844 ttctctgtctgtg 31486856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15771017 - 15770914
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  15771017 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 15770918  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  15770917 attc 15770914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 44564427 - 44564347
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 81  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564427 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 44564347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 21344944 - 21345030
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcc 87  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  21344944 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcc 21345030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286632
Alignment:
Q  152 tatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc-cgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 16286632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19844494 - 19844409
Alignment:
Q  117 ttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 202  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |  || || ||||||| |||||||||    
T  19844494 ttgaaaattggtccacatgtggcagtcatatgagatataaatctggagatgtagttcaatctaccaagaaaacctctgacttgctt 19844409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 5593212 - 5593424
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  5593212 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctg 5593311  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5593312 attctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 5593411  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  5593412 ttctctgtctgtg 5593424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18054667 - 18054455
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  18054667 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctg 18054568  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18054567 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 18054468  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  18054467 ttctcggtctgtg 18054455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18273907 - 18274119
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  18273907 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 18274006  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18274007 attctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 18274106  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  18274107 ttctcggtctgtg 18274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18289208 - 18289420
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  18289208 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 18289307  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18289308 attctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 18289407  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  18289408 ttctcggtctgtg 18289420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18304509 - 18304721
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  18304509 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 18304608  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18304609 attctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 18304708  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  18304709 ttctcggtctgtg 18304721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4793490 - 4793701
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  4793490 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 4793589  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4793590 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 4793689  T
Q  201 ttttcggtctgt 212  Q
    || |||||||||    
T  4793690 ttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 8286325 - 8286535
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  8286325 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 8286424  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8286425 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 8286524  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  8286525 ttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18334035 - 18333818
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  18334035 gccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 18333936  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18333935 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 18333836  T
Q  201 ttttcggtctgtgctgct 218  Q
    || |||||||||| ||||    
T  18333835 ttctcggtctgtggtgct 18333818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8299376 - 8299164
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||    
T  8299376 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttg 8299277  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8299276 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 8299177  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  8299176 ttctcggtctgtg 8299164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15889560 - 15889772
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  15889560 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 15889659  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15889660 attctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 15889759  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  15889760 ttctcggtctgtg 15889772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21678108 - 21677896
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  21678108 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctg 21678009  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21678008 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 21677909  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  21677908 ttctcggtctgtg 21677896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35884171 - 35883954
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  35884171 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 35884072  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35884071 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 35883972  T
Q  201 ttttcggtctgtgctgct 218  Q
    || |||||||||| ||||    
T  35883971 ttctcggtctgtggtgct 35883954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6205308 - 6205096
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  6205308 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 6205209  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6205208 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 6205109  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  6205108 ttctcagtctgtg 6205096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15737949 - 15738161
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | | |||| ||    
T  15737949 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacagtaggctg 15738048  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15738049 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 15738148  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  15738149 ttctcggtctgtg 15738161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22384433 - 22384645
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||    
T  22384433 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttg 22384532  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  22384533 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaacctctgacttgc 22384632  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  22384633 ttctcggtctgtg 22384645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 29145611 - 29145823
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  29145611 gccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 29145710  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  29145711 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctaacttgc 29145810  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  29145811 ttctcggtctgtg 29145823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 29661825 - 29662037
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  29661825 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 29661924  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29661925 attcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 29662024  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  29662025 ttctcggtctgtg 29662037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4687060 - 4686848
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  4687060 gccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 4686961  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4686960 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 4686861  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4686860 ttctcagtctgtg 4686848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4725036 - 4724824
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  4725036 gccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 4724937  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4724936 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 4724837  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4724836 ttctcagtctgtg 4724824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 20573698 - 20573899
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||| ||    
T  20573698 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattccatacaataggctg 20573797  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20573798 gttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 20573897  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  20573898 tt 20573899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32442556 - 32442355
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||  ||    
T  32442556 gccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagactg 32442457  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32442456 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 32442357  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  32442356 tt 32442355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8215140 - 8214928
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||    
T  8215140 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaacaggctg 8215041  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||  || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  8215040 attttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgc 8214941  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  8214940 ttctctgtctgtg 8214928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20069445 - 20069233
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||    
T  20069445 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgataggctg 20069346  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20069345 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 20069246  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  20069245 ttctcagtctgtg 20069233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48469332 - 48469120
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||    
T  48469332 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaacaggctg 48469233  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  48469232 gttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctatgacttgt 48469133  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  48469132 ttctctgtctgtg 48469120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7076611 - 7076399
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  7076611 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 7076512  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  7076511 gttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 7076412  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  7076411 ttctcggtctgtg 7076399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 28112809 - 28113021
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  28112809 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaacaggctg 28112908  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  28112909 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 28113008  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  28113009 ttctctgtctgtg 28113021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47026858 - 47026646
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  47026858 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 47026759  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  47026758 attcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 47026659  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  47026658 ttctctgtctgtg 47026646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5017119 - 5016907
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  5017119 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 5017020  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  5017019 gttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 5016920  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  5016919 ttctctgtctgtg 5016907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 5606169 - 5606381
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  5606169 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 5606268  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  5606269 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 5606368  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  5606369 ttctctgtctgtg 5606381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10399549 - 10399337
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  10399549 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 10399450  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  10399449 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgt 10399350  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  10399349 ttctctgtctgtg 10399337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28342582 - 28342370
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  28342582 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 28342483  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  28342482 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 28342383  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  28342382 ttctctgtctgtg 28342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18246146 - 18245945
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  18246146 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 18246047  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18246046 gttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 18245947  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  18245946 tt 18245945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 4343531 - 4343743
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  4343531 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 4343630  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4343631 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 4343730  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4343731 ttctctgtctgtg 4343743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4420320 - 4420108
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  4420320 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 4420221  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4420220 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 4420121  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4420120 ttctctgtctgtg 4420108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5470393 - 5470181
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  5470393 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 5470294  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  5470293 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 5470194  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  5470193 ttctctgtctgtg 5470181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 6539597 - 6539809
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  6539597 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 6539696  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  6539697 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 6539796  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  6539797 ttctctgtctgtg 6539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7999965 - 7999753
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  7999965 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 7999866  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  7999865 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 7999766  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  7999765 ttctctgtctgtg 7999753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10646478 - 10646266
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  10646478 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 10646379  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  10646378 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 10646279  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  10646278 ttctctgtctgtg 10646266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19697895 - 19697687
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  19697895 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 19697796  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| | ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  19697795 attcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgt 19697696  T
Q  201 ttttcggtc 209  Q
    || ||||||    
T  19697695 ttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22867703 - 22867915
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  22867703 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 22867802  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  22867803 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 22867902  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  22867903 ttctctgtctgtg 22867915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22882762 - 22882974
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  22882762 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 22882861  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  22882862 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 22882961  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  22882962 ttctctgtctgtg 22882974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28024687 - 28024475
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  28024687 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctg 28024588  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28024587 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 28024488  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  28024487 ttctctgtctgtg 28024475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 16621345 - 16621555
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  16621345 gccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctg 16621444  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  16621445 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgt 16621544  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  16621545 ttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24331568 - 24331356
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  24331568 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattccatacaacaggctg 24331469  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  24331468 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 24331369  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  24331368 ttctctgtctgtg 24331356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 31961310 - 31961522
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  31961310 gccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 31961409  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31961410 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 31961509  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  31961510 ttctctgtctgtg 31961522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51785428 - 51785216
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  51785428 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 51785329  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  51785328 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 51785229  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  51785228 ttctctgtctgtg 51785216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107419
Alignment:
Q  20 gacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttg 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||| ||| || || |||| |  |||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  120 aaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 213  Q
    || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 11107419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 17981804 - 17982016
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  17981804 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 17981903  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  17981904 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 17982003  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  17982004 ttctctgtctgtg 17982016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18228601 - 18228389
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  18228601 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 18228502  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18228501 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 18228402  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  18228401 ttctctgtctgtg 18228389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 17992786 - 17992889
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  17992786 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggttg 17992885  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  17992886 attc 17992889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 31033091 - 31033194
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||    
T  31033091 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataataggctg 31033190  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  31033191 attc 31033194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 4627190 - 4627087
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  4627190 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 4627091  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  4627090 attc 4627087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 32294033 - 32293930
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  32294033 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 32293934  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  32293933 attc 32293930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5714478 - 5714375
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  5714478 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 5714379  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  5714378 attc 5714375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5725388 - 5725285
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  5725388 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 5725289  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  5725288 attc 5725285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 5766980 - 5767083
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  5766980 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 5767079  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  5767080 attc 5767083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Original strand, 15592879 - 15592939
Alignment:
Q  114 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 174  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15592879 aatttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15592939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 6963288 - 6963363
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 76  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6963288 gccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 6963363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15918807 - 15918749
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 174  Q
    |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15918807 tttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15918749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20443407 - 20443349
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 174  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20443407 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 20443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41440533 - 41440475
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 174  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41440533 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 41440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 5950772 - 5950828
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950772 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 10913566 - 10913778
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  10913566 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctg 10913665  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10913666 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 10913765  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  10913766 ttctcggtctgtg 10913778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2158015 - 2157803
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  2158015 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 2157916  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2157915 attcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 2157816  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  2157815 ttctcggtctgtg 2157803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26438698 - 26438486
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  26438698 gccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 26438599  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  26438598 gttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgt 26438499  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  26438498 ttctcggtctgtg 26438486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 26534570 - 26534782
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  26534570 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 26534669  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26534670 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 26534769  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||| ||||    
T  26534770 ttctcggtttgtg 26534782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 2106862 - 2107072
Alignment:
Q  3 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  2106862 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttgat 2106961  T
Q  103 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 202  Q
    || || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2106962 tctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgctt 2107061  T
Q  203 ttcggtctgtg 213  Q
     ||||| ||||    
T  2107062 ctcggtatgtg 2107072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 11421478 - 11421688
Alignment:
Q  3 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | || ||| ||||    
T  11421478 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacaggctgat 11421577  T
Q  103 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 202  Q
    || || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11421578 tctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaccctctgacttgctt 11421677  T
Q  203 ttcggtctgtg 213  Q
     ||||||||||    
T  11421678 ctcggtctgtg 11421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45390661 - 45390449
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  45390661 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 45390562  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  45390561 attctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 45390462  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  45390461 ttctctgtctgtg 45390449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 16515127 - 16515337
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  16515127 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattccatacaataggctg 16515226  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  16515227 attctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgc 16515326  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  16515327 ttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26516233 - 26516032
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  26516233 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 26516134  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26516133 attcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 26516034  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  26516033 tt 26516032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5131437 - 5131225
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  5131437 gcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 5131338  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5131337 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 5131238  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  5131237 ttctctgtctgtg 5131225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 5144037 - 5144249
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  5144037 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctg 5144136  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5144137 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 5144236  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  5144237 ttctcggtctgtg 5144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22145636 - 22145424
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  22145636 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 22145537  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||     
T  22145536 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctaacttgt 22145437  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  22145436 ttctcggtctgtg 22145424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 26271783 - 26271995
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  26271783 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 26271882  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26271883 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 26271982  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  26271983 ttctctgtctgtg 26271995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 26316545 - 26316757
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  26316545 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 26316644  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  26316645 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 26316744  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  26316745 ttctctgtctgtg 26316757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10845061 - 10844851
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  10845061 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 10844962  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  10844961 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgt 10844862  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  10844861 ttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 31561087 - 31561288
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  31561087 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 31561186  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31561187 gttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 31561286  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  31561287 tt 31561288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3448747 - 3448535
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  3448747 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 3448648  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  3448647 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 3448548  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  3448547 ttctctgtctgtg 3448535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 4141943 - 4142155
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  4141943 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 4142042  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4142043 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 4142142  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4142143 ttctctgtctgtg 4142155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4202830 - 4202618
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  4202830 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 4202731  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
      || || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  4202730 gctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctaacttgc 4202631  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4202630 ttctctgtctgtg 4202618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11444328 - 11444116
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  11444328 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 11444229  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  11444228 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgc 11444129  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  11444128 ttctctgtctgtg 11444116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16044758 - 16044550
Alignment:
Q  3 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  16044758 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgat 16044659  T
Q  103 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 202  Q
    || |  |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  16044658 tcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 16044559  T
Q  203 ttcggtctg 211  Q
     ||||||||    
T  16044558 ctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 10842691 - 10842901
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  10842691 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctg 10842790  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||     
T  10842791 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaacctctaacttgt 10842890  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  10842891 ttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16748214 - 16748415
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||    
T  16748214 gccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggttg 16748313  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  16748314 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 16748413  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  16748414 tt 16748415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 26666611 - 26666823
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  | ||| ||    
T  26666611 gccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgacaggctg 26666710  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  26666711 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 26666810  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  26666811 ttctctgtctgtg 26666823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 24589231 - 24589443
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  24589231 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 24589330  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  24589331 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 24589430  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  24589431 ttctctgtctgtg 24589443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16446703 - 16446894
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||| | |||||  ||    
T  16446703 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttccatacaatagtctg 16446802  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 192  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16446803 attcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaacctc 16446894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621879
Alignment:
Q  64 aagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcggga 163  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  164 gatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 9621879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 2776695 - 2776592
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  2776695 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 2776596  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  2776595 attc 2776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 26512393 - 26512496
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  26512393 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 26512492  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  26512493 attc 26512496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 26681803 - 26681906
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  26681803 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 26681902  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  26681903 attc 26681906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 31127348 - 31127245
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  31127348 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 31127249  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  31127248 attc 31127245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 39209836 - 39209939
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  39209836 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggttg 39209935  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  39209936 attc 39209939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 45734752 - 45734658
Alignment:
Q  3 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataatagg 97  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  45734752 cttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 45734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 31087319 - 31087422
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  31087319 gccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 31087418  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  31087419 attc 31087422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9469646 - 9469590
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469646 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 174
Target Start/End: Original strand, 16287201 - 16287249
Alignment:
Q  126 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 174  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16287201 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 16287249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 16393246 - 16393302
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 30369758 - 30369814
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369758 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27022577 - 27022365
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  27022577 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 27022478  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27022477 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 27022378  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  27022377 ttctcggtctgtg 27022365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 27287119 - 27287331
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  27287119 gccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 27287218  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||  || |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27287219 attatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 27287318  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  27287319 ttctcggtctgtg 27287331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29552998 - 29552786
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  29552998 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 29552899  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29552898 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 29552799  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  29552798 ttctcagtctgtg 29552786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 13295706 - 13295918
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||| ||    
T  13295706 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattccatacaataggctg 13295805  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13295806 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 13295905  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  13295906 ttctcggtctgtg 13295918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15421075 - 15421287
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  15421075 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 15421174  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15421175 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 15421274  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  15421275 ttctcggtctgtg 15421287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22931639 - 22931851
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  22931639 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctg 22931738  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22931739 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 22931838  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  22931839 ttctcggtctgtg 22931851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 23854084 - 23854296
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  23854084 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctg 23854183  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23854184 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 23854283  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  23854284 ttctcggtctgtg 23854296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24867157 - 24866945
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  24867157 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 24867058  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24867057 attctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 24866958  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  24866957 ttctcggtctgtg 24866945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27626466 - 27626674
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  27626466 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaataggctg 27626565  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27626566 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 27626665  T
Q  201 ttttcggtc 209  Q
    || ||||||    
T  27626666 ttctcggtc 27626674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16677581 - 16677369
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  16677581 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 16677482  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16677481 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgt 16677382  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  16677381 ttctctgtctgtg 16677369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27179897 - 27179685
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  27179897 gccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaataggctg 27179798  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27179797 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 27179698  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  27179697 ttctcggtctgtg 27179685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 27269342 - 27269554
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  27269342 gccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaataggctg 27269441  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27269442 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 27269541  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  27269542 ttctcggtctgtg 27269554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34461261 - 34461473
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  34461261 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 34461360  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34461361 gttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 34461460  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  34461461 ttctcagtctgtg 34461473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3699524 - 3699312
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  3699524 gccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaataggctg 3699425  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3699424 attcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgt 3699325  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  3699324 ttctctgtctgtg 3699312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4761204 - 4760992
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  4761204 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 4761105  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4761104 gttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 4761005  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4761004 ttctctgtctgtg 4760992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17089198 - 17089406
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  17089198 gccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccacacaataggctg 17089297  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17089298 attcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 17089397  T
Q  201 ttttcggtc 209  Q
    || ||||||    
T  17089398 ttctcggtc 17089406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26921818 - 26921606
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || ||| ||    
T  26921818 gccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggctg 26921719  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26921718 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 26921619  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  26921618 ttctcggtctgtg 26921606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27011172 - 27010960
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  27011172 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 27011073  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  27011072 gttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 27010973  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  27010972 ttctctgtctgtg 27010960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16753262 - 16753050
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  16753262 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctg 16753163  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  16753162 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgt 16753063  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  16753062 ttctcggtctgtg 16753050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27060947 - 27060735
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | || ||| ||    
T  27060947 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaacaggctg 27060848  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  27060847 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctctgacttgc 27060748  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  27060747 ttctctgtctgtg 27060735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29504857 - 29504645
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  29504857 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 29504758  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  29504757 gttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctgacttgc 29504658  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  29504657 ttctctgtctgtg 29504645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4528726 - 4528514
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | || ||| ||    
T  4528726 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaacaggctg 4528627  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4528626 gttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 4528527  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4528526 ttctctgtctgtg 4528514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 4542529 - 4542741
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  4542529 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 4542628  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4542629 gttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 4542728  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4542729 ttctctgtctgtg 4542741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 4720890 - 4721102
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  4720890 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 4720989  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4720990 gttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 4721089  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4721090 ttctctgtctgtg 4721102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27488574 - 27488362
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  27488574 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 27488475  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  27488474 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 27488375  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  27488374 ttctctgtctgtg 27488362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29576455 - 29576243
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  29576455 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 29576356  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  29576355 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctgacttgc 29576256  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  29576255 ttctctgtctgtg 29576243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 30554771 - 30554983
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  30554771 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 30554870  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  30554871 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 30554970  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  30554971 ttctctgtctgtg 30554983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20171988 - 20171797
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  20171988 gccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaatgggttg 20171889  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 192  Q
    |||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20171888 attcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctc 20171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 22164003 - 22164194
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  22164003 gccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaatgggttg 22164102  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 192  Q
    |||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22164103 attcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctc 22164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 16940784 - 16940994
Alignment:
Q  3 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| || |    
T  16940784 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggt 16940883  T
Q  103 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 202  Q
    || || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  16940884 tctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgctt 16940983  T
Q  203 ttcggtctgtg 213  Q
     || |||||||    
T  16940984 ctctgtctgtg 16940994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 26113167 - 26113379
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  26113167 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 26113266  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  26113267 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 26113366  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  26113367 ttctctgtctgtg 26113379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28210895 - 28210683
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  28210895 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 28210796  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  28210795 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 28210696  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  28210695 ttctctgtctgtg 28210683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4776321 - 4776109
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  4776321 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 4776222  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4776221 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 4776122  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  4776121 ttctctgtctgtg 4776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 22455869 - 22455972
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22455869 gccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggttg 22455968  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  22455969 attc 22455972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26992236 - 26992096
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| ||    
T  26992236 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatagaataggctg 26992137  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcgg 141  Q
    |||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||    
T  26992136 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 14142149 - 14142252
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  14142149 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 14142248  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  14142249 attc 14142252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 26775382 - 26775485
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  26775382 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 26775481  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  26775482 attc 26775485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 26789257 - 26789154
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  26789257 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 26789158  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  26789157 attc 26789154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27197626 - 27197523
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  27197626 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 27197527  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  27197526 attc 27197523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 27251609 - 27251712
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  27251609 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 27251708  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  27251709 attc 27251712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 27358865 - 27358968
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  27358865 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 27358964  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  27358965 attc 27358968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 27449208 - 27449311
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  27449208 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 27449307  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  27449308 attc 27449311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 8902458 - 8902554
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataatagg 97  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  8902458 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaatagg 8902554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 28163930 - 28163836
Alignment:
Q  3 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataatagg 97  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  28163930 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 28163836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 13520947 - 13521049
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  13520947 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaataggctg 13521045  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  13521046 attc 13521049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 33373186 - 33373273
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 88  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33373186 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33373273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 9136223 - 9136279
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136223 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15655467 - 15655679
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || ||    
T  15655467 gccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatgggctg 15655566  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15655567 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 15655666  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  15655667 ttctcggtctgtg 15655679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41678156 - 41677944
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  41678156 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 41678057  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  41678056 attctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctaacttgc 41677957  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  41677956 ttctcggtctgtg 41677944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11552806 - 11552594
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  11552806 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 11552707  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11552706 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 11552607  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  11552606 ttctcagtctgtg 11552594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33295979 - 33295767
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  33295979 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 33295880  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33295879 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 33295780  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  33295779 ttctcggtctgtg 33295767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33780940 - 33780728
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  33780940 gccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 33780841  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33780840 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 33780741  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  33780740 ttctcggtctgtg 33780728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 40470259 - 40470460
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  40470259 gccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaataggctg 40470358  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40470359 gttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 40470458  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  40470459 tt 40470460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22995826 - 22996038
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | || ||| ||    
T  22995826 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacaggctg 22995925  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22995926 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 22996025  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  22996026 ttctcagtctgtg 22996038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23629421 - 23629209
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  23629421 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 23629322  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23629321 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 23629222  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  23629221 ttctcggtctgtg 23629209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 24684854 - 24685066
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  24684854 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 24684953  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24684954 attctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 24685053  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  24685054 ttctcggtctgtg 24685066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24973357 - 24973145
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  24973357 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaataggctg 24973258  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  24973257 attctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaacctctgacttgc 24973158  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  24973157 ttctcggtctgtg 24973145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18372243 - 18372455
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  18372243 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctg 18372342  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  18372343 attctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 18372442  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  18372443 ttctctgtctgtg 18372455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31434915 - 31434703
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  31434915 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 31434816  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31434815 gttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 31434716  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  31434715 ttctctgtctgtg 31434703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 37355352 - 37355564
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  37355352 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 37355451  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  37355452 gttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 37355551  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  37355552 ttctctgtctgtg 37355564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23895657 - 23895447
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  23895657 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 23895558  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  23895557 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgt 23895458  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  23895457 ttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3792992 - 3792780
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  3792992 gccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctg 3792893  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3792892 attctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 3792793  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  3792792 ttctctgtctgtg 3792780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9320927 - 9320715
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  9320927 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 9320828  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  9320827 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 9320728  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  9320727 ttctctgtctgtg 9320715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12135626 - 12135414
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  12135626 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 12135527  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  12135526 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 12135427  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  12135426 ttctctgtctgtg 12135414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18497434 - 18497646
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  18497434 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 18497533  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  18497534 gttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgt 18497633  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  18497634 ttctctgtctgtg 18497646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26483845 - 26483633
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  26483845 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 26483746  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  26483745 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 26483646  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  26483645 ttctctgtctgtg 26483633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43081706 - 43081494
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  43081706 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 43081607  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  43081606 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 43081507  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  43081506 ttctcggtctgtg 43081494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 13321539 - 13321751
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  13321539 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 13321638  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  13321639 gttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 13321738  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  13321739 ttctctgtctgtg 13321751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28652693 - 28652481
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  28652693 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 28652594  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  28652593 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 28652494  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  28652493 ttctcggtctgtg 28652481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30032879 - 30032667
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  30032879 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 30032780  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  30032779 gttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 30032680  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  30032679 ttctctgtctgtg 30032667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 37767700 - 37767912
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  37767700 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 37767799  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  37767800 gttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 37767899  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  37767900 ttctctgtctgtg 37767912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6877756 - 6877544
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | || ||| ||    
T  6877756 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaacaggctg 6877657  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  6877656 gttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 6877557  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  6877556 ttctctgtctgtg 6877544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 8662184 - 8662396
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  8662184 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 8662283  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  8662284 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 8662383  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  8662384 ttctctgtctgtg 8662396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24586825 - 24586613
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  24586825 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 24586726  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  24586725 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 24586626  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  24586625 ttctctgtctgtg 24586613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30155482 - 30155270
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  30155482 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 30155383  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  30155382 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 30155283  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  30155282 ttctctgtctgtg 30155270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30171920 - 30171708
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||| ||    
T  30171920 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattccatacaataggctg 30171821  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30171820 gttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 30171721  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  30171720 ttctctgtctgtg 30171708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30938086 - 30937874
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  30938086 gccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 30937987  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30937986 attcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 30937887  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  30937886 ttctcggtctgtg 30937874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 31823116 - 31823328
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  31823116 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 31823215  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31823216 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 31823315  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  31823316 ttctctgtctgtg 31823328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33519831 - 33519619
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  33519831 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 33519732  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  33519731 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 33519632  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  33519631 ttctctgtctgtg 33519619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34619969 - 34619757
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  34619969 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctg 34619870  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34619869 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 34619770  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  34619769 ttctctgtctgtg 34619757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 37668195 - 37668407
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  37668195 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 37668294  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  37668295 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 37668394  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  37668395 ttctctgtctgtg 37668407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37758434 - 37758222
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  37758434 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 37758335  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  37758334 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 37758235  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  37758234 ttctctgtctgtg 37758222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22891914 - 22891707
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  22891914 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctg 22891815  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22891814 attcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgt 22891715  T
Q  201 ttttcggt 208  Q
    || |||||    
T  22891714 ttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25203729 - 25203519
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||| | |||||| ||    
T  25203729 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaataggctg 25203630  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  25203629 attcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgt 25203530  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  25203529 ttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25267884 - 25267674
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||| | |||||| ||    
T  25267884 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaataggctg 25267785  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  25267784 attcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgt 25267685  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  25267684 ttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 15755561 - 15755762
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  15755561 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 15755660  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  15755661 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 15755760  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  15755761 tt 15755762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24727420 - 24727208
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  24727420 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 24727321  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  24727320 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 24727221  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  24727220 ttctctgtctgtg 24727208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 32592983 - 32593195
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  32592983 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctg 32593082  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32593083 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 32593182  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  32593183 ttctctgtctgtg 32593195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5641239 - 5641027
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  5641239 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 5641140  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  5641139 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 5641040  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  5641039 ttctctgtctgtg 5641027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 28956494 - 28956706
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  28956494 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaataggctg 28956593  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28956594 gttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 28956693  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  28956694 ttctctgtctgtg 28956706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2514513 - 2514301
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||   ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  2514513 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctg 2514414  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  2514413 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 2514314  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  2514313 ttctctgtctgtg 2514301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 18125125 - 18125228
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  18125125 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 18125224  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  18125225 attc 18125228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 13439392 - 13439494
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  13439392 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 13439491  T
Q  101 att 103  Q
    |||    
T  13439492 att 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 9547418 - 9547521
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  9547418 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 9547517  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  9547518 attc 9547521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11327088 - 11326985
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  11327088 gccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggttg 11326989  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  11326988 attc 11326985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 13183502 - 13183605
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||| ||    
T  13183502 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttccatacaataggctg 13183601  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  13183602 attc 13183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 29887906 - 29888009
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  29887906 gccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 29888005  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  29888006 attc 29888009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 33878581 - 33878479
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  33878581 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaataggctg 33878483  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  33878482 attc 33878479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 351924 - 351999
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 76  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  351924 gccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 351999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 5440049 - 5440105
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440049 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 11944246 - 11944302
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 15784549 - 15784605
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784549 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17957432 - 17957376
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957432 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34468948 - 34468900
Alignment:
Q  126 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 174  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34468948 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 34468900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 36375786 - 36375842
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375786 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 37000440 - 37000496
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000440 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3511 - 3301
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  3511 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctg 3412  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3411 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 3312  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  3311 ttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 43877 - 44015
Alignment:
Q  75 cattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 174  Q
    ||||||| |||||| | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43877 cattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 43976  T
Q  175 aacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  43977 aacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtg 44015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 211
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  140 ggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9268
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | || ||| ||    
T  9480 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacaggctg 9381  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9380 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 9281  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  9280 ttctcggtctgtg 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30737 - 30525
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  30737 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 30638  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30637 attctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 30538  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  30537 ttctcggtctgtg 30525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19514 - 19304
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  19514 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctg 19415  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||     
T  19414 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctaacttgt 19315  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  19314 ttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7404 - 7301
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  7404 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 7305  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  7304 attc 7301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 21894561 - 21894762
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  21894561 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 21894660  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21894661 attctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc 21894760  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  21894761 tt 21894762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51641664 - 51641452
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  51641664 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctg 51641565  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  51641564 attctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 51641465  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  51641464 ttctctgtctgtg 51641452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 20339113 - 20339320
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  20339113 gccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaataggctg 20339212  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20339213 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgc 20339312  T
Q  201 ttttcggt 208  Q
    ||||||||    
T  20339313 ttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10966111 - 10965910
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  10966111 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 10966012  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10966011 attcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 10965912  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  10965911 tt 10965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28588431 - 28588219
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  28588431 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 28588332  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28588331 gttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctctgacttgc 28588232  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  28588231 ttctctgtctgtg 28588219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3644581 - 3644366
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataat-ctttgatgctatcaaaagcttcct-ggcattcattattccacataataggt 98  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||     
T  3644581 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattccatacaataggc 3644482  T
Q  99 tgattcattt-tgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggact 197  Q
    |||||| ||| | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3644481 tgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 3644382  T
Q  198 tgcttttcggtctgtg 213  Q
    ||||| || |||||||    
T  3644381 tgcttctctgtctgtg 3644366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 41790122 - 41790323
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  41790122 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 41790221  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  41790222 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgc 41790321  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  41790322 tt 41790323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10948523 - 10948311
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  10948523 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 10948424  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  10948423 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 10948324  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  10948323 ttctctgtctgtg 10948311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20464420 - 20464212
Alignment:
Q  3 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  20464420 cttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 20464321  T
Q  103 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 202  Q
    || |  |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20464320 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagacttgttt 20464221  T
Q  203 ttcggtctg 211  Q
     ||||||||    
T  20464220 ctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16204846 - 16205055
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||| | |||||| ||    
T  16204846 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttccatacaataggctg 16204945  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  16204946 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaacctctgacttgc 16205045  T
Q  201 ttttcggtct 210  Q
    || |||||||    
T  16205046 ttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 28153182 - 28153079
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||    
T  28153182 gccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctg 28153083  T
Q  101 attc 104  Q
    ||||    
T  28153082 attc 28153079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16025 - 15813
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  16025 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 15926  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15925 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgc 15826  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || ||||||||||    
T  15825 ttctcggtctgtg 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 1436 - 1643
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  1436 gccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaataggctg 1535  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1536 attcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgc 1635  T
Q  201 ttttcggt 208  Q
    ||||||||    
T  1636 ttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 23003 - 23215
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  23003 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctg 23102  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  23103 attcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 23202  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  23203 ttctctgtctgtg 23215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9466 - 9254
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  9466 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 9367  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  9366 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 9267  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  9266 ttctctgtctgtg 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13015 - 12803
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  13015 gccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 12916  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||  || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  12915 gttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgc 12816  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  12815 ttctctgtctgtg 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 11740 - 11952
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  11740 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 11839  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  11840 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 11939  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  11940 ttctctgtctgtg 11952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11393 - 11181
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  11393 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctg 11294  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  11293 gttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 11194  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  11193 ttctctgtctgtg 11181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 5991 - 6203
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| | || ||| ||    
T  5991 gccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctg 6090  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
     ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  6091 gttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgc 6190  T
Q  201 ttttcggtctgtg 213  Q
    || || |||||||    
T  6191 ttctctgtctgtg 6203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23111
Alignment:
Q  141 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 23111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9489 - 9279
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttg 100  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||  | || |||||||  ||||| | |||||| ||    
T  9489 gccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttccatacaataggctg 9390  T
Q  101 attcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgc 200  Q
    |||| |   ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||     
T  9389 attcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaagcctctgacttgt 9290  T
Q  201 ttttcggtctg 211  Q
    || ||||||||    
T  9289 ttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 211
Target Start/End: Original strand, 5484 - 5693
Alignment:
Q  2 ccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttga 101  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || |  | |||||||    
T  5484 ccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttcataccacaggttga 5583  T
Q  102 ttcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgct 201  Q
    ||  |  |||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5584 tttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaacctctgacttgct 5683  T
Q  202 tttcggtctg 211  Q
    | || |||||    
T  5684 tctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1251 - 1155
Alignment:
Q  117 ttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 213  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1251 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 43542 - 43754
Alignment:
Q  1 gccttccttccactggcgggacaaggata-ggtggttccagcagataatct-ttgatgctatc--aaaagcttcctggcattcatt--attccacataat 94  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||   ||||||||| ||||||||| |  |||||| | |||    
T  43542 gccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatacaat 43641  T
Q  95 aggt-tgattcattttga-gaaatttgaaaattggcccgcaggtt-gcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaa-ttcaaacgcccgaggaaacc 190  Q
    |||  |||||| || | | | |  ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  43642 aggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaacc 43741  T
Q  191 tcggacttgcttt 203  Q
    || ||||||||||    
T  43742 tctgacttgcttt 43754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Original strand, 35165 - 35225
Alignment:
Q  114 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 174  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35165 aatttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 35225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33706
Alignment:
Q  138 gcggtcatatgagatat-gaa-tcgggagatgtaattcaaacg-cccgaggaaacctcggacttg 199  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttg 33706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29499 - 29443
Alignment:
Q  116 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 172  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29499 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University