View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17052_low_4 (Length: 496)

Name: NF17052_low_4
Description: NF17052
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17052_low_4
NF17052_low_4
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (1-480)||(27604336-27604816)
chr6 (6-480)||(27592658-27593131)
chr6 (6-480)||(26802518-26802988)
chr6 (6-480)||(27679022-27679495)
chr6 (6-480)||(27677257-27677725)
chr6 (6-480)||(27706041-27706513)
chr6 (172-477)||(27698297-27698602)
chr6 (209-480)||(27718219-27718490)
chr6 (209-480)||(27610842-27611113)
chr6 (1-476)||(27427244-27427713)
chr6 (139-476)||(26884243-26884580)
chr6 (218-480)||(28781215-28781477)
chr6 (218-458)||(28786376-28786616)
chr6 (218-458)||(28792497-28792737)
chr6 (299-480)||(27724775-27724956)
chr6 (218-476)||(26861696-26861951)
chr6 (152-475)||(27530983-27531303)
chr6 (38-480)||(26646555-26646992)
chr6 (38-480)||(26752523-26752960)
chr6 (309-476)||(31284368-31284535)
chr6 (182-476)||(25538620-25538914)
chr6 (194-476)||(25579799-25580081)
chr6 (227-476)||(26656069-26656318)
chr6 (227-476)||(26762040-26762289)
chr6 (217-476)||(25481822-25482081)
chr6 (284-475)||(26848741-26848932)
chr6 (218-475)||(27214498-27214758)
chr6 (218-475)||(27234470-27234730)
chr6 (258-480)||(28227026-28227248)
chr6 (194-476)||(26142945-26143227)
chr6 (227-475)||(27337923-27338171)
chr6 (227-475)||(27398663-27398911)
chr6 (309-476)||(26623056-26623223)
chr6 (309-476)||(26729034-26729201)
chr6 (192-476)||(26056006-26056290)
chr6 (192-476)||(26075976-26076260)
chr6 (320-480)||(28242880-28243040)
chr6 (277-472)||(26949745-26949940)
chr6 (302-475)||(28098302-28098475)
chr6 (258-480)||(28234640-28234861)
chr6 (1-112)||(28786677-28786788)
chr6 (1-112)||(28792798-28792909)
chr6 (375-476)||(26823920-26824021)
chr6 (275-480)||(28181190-28181395)
chr6 (336-476)||(26048925-26049065)
chr6 (336-476)||(26070094-26070234)
chr6 (275-480)||(28185442-28185647)
chr6 (320-480)||(28325557-28325717)
chr6 (1-109)||(28781543-28781651)
chr6 (275-472)||(28297619-28297816)
chr6 (275-472)||(28514257-28514454)
chr6 (366-478)||(28139619-28139731)
chr6 (332-478)||(26341894-26342043)
chr6 (330-480)||(26937170-26937320)
chr6 (1-86)||(27698218-27698301)
chr6 (277-474)||(26975134-26975331)
chr6 (385-480)||(28150013-28150108)
chr6 (385-475)||(2184369-2184459)
chr6 (385-474)||(2184980-2185069)
chr6 (277-474)||(25071741-25071938)
chr6 (354-475)||(26811590-26811711)
chr6 (277-472)||(26635774-26635969)
chr6 (277-472)||(26741740-26741935)
chr6 (277-475)||(27665025-27665223)
chr6 (309-412)||(29826171-29826274)
chr6 (277-472)||(26959250-26959445)
chr6 (282-348)||(25506897-25506963)
chr6 (285-474)||(24715667-24715856)
chr6 (435-480)||(25506975-25507020)
chr6 (18-81)||(26143338-26143399)
chr6 (438-474)||(26617401-26617437)
chr6 (438-474)||(26723329-26723365)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (209-473)||(3260-3525)
scaffold0349 (209-480)||(14196-14466)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-476)||(59650-60119)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-476)||(18073842-18074311)
chr4 (1-480)||(18731132-18731602)
chr4 (4-480)||(18699031-18699498)
chr4 (4-480)||(18655108-18655575)
chr4 (1-480)||(18723713-18724183)
chr4 (218-480)||(18679403-18679665)
chr4 (317-474)||(5090902-5091059)
chr4 (339-476)||(17989013-17989147)
chr4 (1-112)||(18679188-18679304)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (227-473)||(4529-4775)
scaffold0277 (227-480)||(13490-13743)
scaffold0277 (1-109)||(13307-13415)
scaffold0277 (1-112)||(4344-4457)
[»] scaffold0419 (2 HSPs)
scaffold0419 (227-480)||(7601-7854)
scaffold0419 (1-109)||(7929-8037)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (219-476)||(28127516-28127773)
chr1 (219-480)||(28164200-28164460)
chr1 (1-480)||(267978-268455)
chr1 (55-106)||(28164048-28164100)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (227-480)||(29273628-29273881)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (275-480)||(27524-27729)
scaffold0038 (258-480)||(34801-35023)
scaffold0038 (320-480)||(43042-43202)
scaffold0038 (320-480)||(116872-117032)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (332-480)||(58245-58393)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (278-474)||(17993593-17993789)
chr2 (421-480)||(3279764-3279823)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (333-475)||(16689092-16689234)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 27604336 - 27604816
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgt 99  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27604336 gtatgtaacaacatcataatcacatccatgtacactcagaatatattatacatttctaactattttgacatataaataactaatacttgtttaaaaacgt 27604435  T
Q  100 aaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27604436 aaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggtaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttatg 27604535  T
Q  200 taatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttctta 299  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |    
T  27604536 tagtgttgagtacccaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctttatgttatcctca 27604635  T
Q  300 tcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaa 399  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604636 tcattttgaaacctttttttatgctcagccaatgcttgaccgtaactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaa 27604735  T
Q  400 cgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27604736 cgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatag 27604816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Original strand, 27592658 - 27593131
Alignment:
Q  6 taacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaata---ctttttaaaaac-gtaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||     
T  27592658 taacaacatcacaatcacatccatgta--ctaagaatgtattatacatttctaactatttcgacatataaataactaatagtacttgtttaaaactgtat 27592755  T
Q  102 ataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagta 201  Q
    |||||||||||||||   | | ||||||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27592756 ataaaaaaggtattt---cccttttaacctttaagatgagattattgtaaaattgaagttgaagaaataaaatagaaaagggaaaaataggatttaagta 27592852  T
Q  202 atgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatc 301  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  27592853 aagttgggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcgtctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatc 27592952  T
Q  302 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  27592953 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaaca 27593052  T
Q  402 aggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27593053 gggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatag 27593131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26802988 - 26802518
Alignment:
Q  6 taacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaata 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26802988 taacaacatcacaatcacatccatgta--ctcataatatattatacatttctaactatttcaacatataaataactaatacttgtttaaaaacgtatata 26802891  T
Q  105 aaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatg 204  Q
    | ||||||||||   | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26802890 agaaaggtattt---cccatttaacctttaagatgagattattgggaaattgaagttgaagaaataaaatataaaagggaaaaataggatttaagtaaag 26802794  T
Q  205 ttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcatt 304  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  26802793 ttgggtaccgaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctccaacctctccatgttatccttatcatt 26802694  T
Q  305 ttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgagg 404  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26802693 ttgaaaccttttttcatgctcagccaatgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaataggcaagacgagg 26802594  T
Q  405 cgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  26802593 cgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatag 26802518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27679495 - 27679022
Alignment:
Q  6 taacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaata---ctttttaaaaac-gtaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||     
T  27679495 taacaacatcacaatcacatccatgta--ctaagaatgtattatacatttctaactatttcgacatataaataactaatagtacttgtttaaaactgtat 27679398  T
Q  102 ataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagta 201  Q
    |||||||||||||||   | | ||||||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27679397 ataaaaaaggtattt---cccttttaacctttaagatgagattattgtaaaattgaagttgaagaaataaaatagaaaagggaaaaataggatttaagta 27679301  T
Q  202 atgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatc 301  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||    
T  27679300 aagttgggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctttttccatccttgcaacctctccatgtttttcggatc 27679201  T
Q  302 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27679200 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaacagtaggttccacaccaaagaaaacaggcagaacg 27679101  T
Q  402 aggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679100 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 27679022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Original strand, 27677257 - 27677725
Alignment:
Q  6 taacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatact--ttttaaaaacgtaaat 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||| ||    
T  27677257 taacaacatcacaatcacatccatgta--ct---aatgtattatacatttctaactatttcgacatataaataactaatagtacttttaaaactgtatat 27677351  T
Q  104 aaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaat 203  Q
    |||||||||||||   | | ||||||||| || |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  27677352 aaaaaaggtattt---cccttttaacctttaagatgagattattgtgaaattgaagttgaagaaataaaatagaaaagggaaaaataggatttaagtaaa 27677448  T
Q  204 gttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcat 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  27677449 gttgggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgcttttcggatcat 27677548  T
Q  304 tttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27677549 tttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacaatagtaggttccacagcaaagaaaacaggcagaacgag 27677648  T
Q  404 gcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677649 gcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 27677725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Original strand, 27706041 - 27706513
Alignment:
Q  6 taacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaata---ctttttaaaaac-gtaa 101  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||     
T  27706041 taacaacatcccaatcacatccatgta--ctaagaatgtattattcatttctaactatttcgacatataaataactaatagtacttgtttaaaactgtat 27706138  T
Q  102 ataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagta 201  Q
    |||||||||||||||     | ||||| ||| || |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27706139 ataaaaaaggtatttc----cctttaaactttaagatgagattattgtgaaattgaagttgaagaaataaaatagaaaagggaaaaataggatttaagta 27706234  T
Q  202 atgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatc 301  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  27706235 aagttgggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatc 27706334  T
Q  302 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  27706335 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttctacaccaaataaaacaggcagaacg 27706434  T
Q  402 aggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27706435 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatag 27706513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 172 - 477
Target Start/End: Original strand, 27698297 - 27698602
Alignment:
Q  172 aatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttcca 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27698297 aatacaaaagggaaatataggatttaagtaaagttgggtacctgggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttcca 27698396  T
Q  272 tcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaa 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  27698397 tccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgctttgccataactacctttatgatgtctcacattagtt 27698496  T
Q  372 ggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcat 471  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27698497 ggttccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcat 27698596  T
Q  472 agttga 477  Q
    ||||||    
T  27698597 agttga 27698602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 209 - 480
Target Start/End: Original strand, 27718219 - 27718490
Alignment:
Q  209 gtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttga 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27718219 gtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttattcttatcattttga 27718318  T
Q  309 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27718319 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 27718418  T
Q  409 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27718419 cctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatag 27718490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 209 - 480
Target Start/End: Original strand, 27610842 - 27611113
Alignment:
Q  209 gtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttga 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27610842 gtacccaggaggactatcatggtagccggaaaagtttgcagcctggctcagagccactttccatccctgcaacctctccatgttattcttatcattttga 27610941  T
Q  309 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27610942 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcactttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 27611041  T
Q  409 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27611042 cctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatag 27611113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 27427244 - 27427713
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcaca--atcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaac 97  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  27427244 gtatgtaacaacatcacacaatcacatccatgta--ctcataatatattatacatttttaactattttgacatataaataactaacaattgtttaaaaac 27427341  T
Q  98 gtaaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggattta 197  Q
     |||||||||||||| ||  |   ||||||  ||| || |||    ||||| | ||| |||||| ||||||  |||| ||||| | ||||  |||| |||    
T  27427342 ataaataaaaaaggtgttaca---catttaggctttaagatgg---tattgaggaatagaaattaaataaattaaatgcaaaaagcaaaac-aggaatta 27427434  T
Q  198 agtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttct 297  Q
    |||||    | ||||| | ||  |  ||||||||||| ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27427435 agtaaataggcgtacccatgactatcatcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcg 27427534  T
Q  298 tatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaa 397  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27427535 tatcattttgaaacctattttcatgctcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaa 27427634  T
Q  398 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27427635 aacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttg 27427713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 139 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26884580 - 26884243
Alignment:
Q  139 gagattattgggcaatt-gaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccgg 237  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||| || |  |||| | ||   |||  |||||||||||    
T  26884580 gagattattggggaatttgaaattaaagaaagaaaatataaaaaaggaaaatatgatttaagtaaagtgggatacccaaga---ctaaaatggtagccgg 26884484  T
Q  238 aaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttc 337  Q
    | ||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26884483 acaagttagcaacttgcctcatagccattttccatcgctgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaaccttttttcatggtcagccaatgcttc 26884384  T
Q  338 accataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatg--atgt 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  26884383 accataactacctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaacaaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgt 26884284  T
Q  436 gaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26884283 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 26884243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 218 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28781477 - 28781215
Alignment:
Q  218 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 317  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28781477 aggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttt 28781378  T
Q  318 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 417  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28781377 tcatgtccagccaatgcttcaccataaggacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtct 28781278  T
Q  418 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||| ||||||||||||||    
T  28781277 tgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatag 28781215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 218 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28786616 - 28786376
Alignment:
Q  218 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 317  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28786616 aggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttt 28786517  T
Q  318 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 417  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28786516 tcatgcccagccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtct 28786417  T
Q  418 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaat 458  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28786416 tgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaat 28786376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 218 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28792737 - 28792497
Alignment:
Q  218 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 317  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28792737 aggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttt 28792638  T
Q  318 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 417  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28792637 tcatgcccagccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtct 28792538  T
Q  418 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaat 458  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28792537 tgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaat 28792497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 299 - 480
Target Start/End: Original strand, 27724775 - 27724956
Alignment:
Q  299 atcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  27724775 atcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaa 27724874  T
Q  399 acgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27724875 acgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatag 27724956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 218 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26861951 - 26861696
Alignment:
Q  218 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 317  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||    
T  26861951 aggactaaaatggtagcctgacaagttagcagcttggttcagagcaactttccatctctgcaacctctccatgttatccatatcattttgaaaccttttt 26861852  T
Q  318 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  26861851 tcatgcttagccaatgcttcaccataaatacctctatgatgtcgcacattagtaggatccatgccatagaaaacaggcaaaacgacgcgacccttttcct 26861752  T
Q  418 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    |   ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26861751 t---gcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttg 26861696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 475
Target Start/End: Original strand, 27530983 - 27531303
Alignment:
Q  152 aattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagca 251  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||| | |     ||| ||| | ||| || |||||||| ||     
T  27530983 aattgaaattaaagaaagaaaatataaaagggaaaaataggatttaagtaaagtgggctacccatgtt---tataatgctggccagacaagttagccgct 27531079  T
Q  252 tggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctt 351  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||     
T  27531080 tggctcagagcttctttccattgctgcaacctctcagtgttatccttatcattttgaaacttttttttatgcacagctaatgcttcaccatatctacctg 27531179  T
Q  352 tatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaa 451  Q
    | ||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27531180 tgtgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaataaaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaa 27531279  T
Q  452 acaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  27531280 acaaaatgaagaagatgcatagtt 27531303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26646992 - 26646555
Alignment:
Q  38 agaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatctc-atttaaccttgaa 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||   ||| || |  | |||||| ||| ||    
T  26646992 agaatatattatacagttctaactcttttgacatataaataatttatacttgtttaaaaacattaataaaaa---tatgtgtttcctatttaagctttaa 26646896  T
Q  136 tatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagcc 235  Q
     |||||||| ||| | ||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||| || | ||||| ||||   |||| |||||| ||    
T  26646895 gatgagatt-ttgtggaaaaaaaattaaataaagaaaatataaaaaggaaaaacaaggtttaagtaaagtggggtacccagga---ctataatggtatcc 26646800  T
Q  236 ggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgc 334  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||| |  ||| |||||||||| | |||||| || |||| ||| |||| ||  | |||     
T  26646799 ggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgttccttgtttttcttgttattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatg- 26646701  T
Q  335 ttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatg 434  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| || |  |||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646700 ttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatg 26646601  T
Q  435 tgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26646600 tggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatag 26646555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26752960 - 26752523
Alignment:
Q  38 agaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatctc-atttaaccttgaa 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||   ||| || |  | |||||| ||| ||    
T  26752960 agaatatattatacagttctaactcttttgacatataaataatttatacttgtttaaaaacattaataaaaa---tatgtgtttcctatttaagctttaa 26752864  T
Q  136 tatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagcc 235  Q
     |||||||| ||| | ||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||| || | ||||| ||||   |||| |||||| ||    
T  26752863 gatgagatt-ttgtggaaaaaaaattaaataaagaaaatataaaaaggaaaaacaaggtttaagtaaagtggggtacccagga---ctataatggtatcc 26752768  T
Q  236 ggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgc 334  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||| |  ||| |||||||||| | |||||| || |||| ||| |||| ||  | |||     
T  26752767 ggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgttccttgtttttcttgttattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatg- 26752669  T
Q  335 ttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatg 434  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| || |  |||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752668 ttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatg 26752569  T
Q  435 tgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26752568 tggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatag 26752523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 309 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 31284535 - 31284368
Alignment:
Q  309 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 408  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31284535 aacctctcttcatgcttagccaatgcttctccataactacctctatgatgtcgcacatgagaaggatccacgccaaagaaaacgggcaaaacgaggcgac 31284436  T
Q  409 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    | |||  ||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31284435 cattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttg 31284368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25538914 - 25538620
Alignment:
Q  182 ggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaac 281  Q
    ||||||| | ||||||||||| || | ||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |  |||||| |  ||||     
T  25538914 ggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaat 25538815  T
Q  282 ctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcag-ccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccaca 380  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||||||||||    
T  25538814 cgctccatgtttttctcattattttgaaacctctcttcatgcttagtaaaatgc-tcaccataactcccactctgatgtcgtaactgagtaggttccaca 25538716  T
Q  381 ccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
     || ||||||| ||||| || | || || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25538715 tcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 25538620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25580081 - 25579799
Alignment:
Q  194 tttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttt 293  Q
    ||||||||| || | ||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |  |||||| |  |||| | ||||||||||    
T  25580081 tttaagtaaagtggggtacccatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttgggtaagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgttt 25579982  T
Q  294 ttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaaca 392  Q
    ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||  | || || |||||||||| ||  | |||||||| |  |||| |||||||||| || |||||||     
T  25579981 ttctcgttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatact-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacg 25579883  T
Q  393 ggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    ||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25579882 ggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 25579799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26656318 - 26656069
Alignment:
Q  227 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 326  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  26656318 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 26656219  T
Q  327 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 425  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  26656218 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaa 26656120  T
Q  426 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26656119 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 26656069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26762289 - 26762040
Alignment:
Q  227 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 326  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  26762289 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 26762190  T
Q  327 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 425  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  26762189 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaa 26762091  T
Q  426 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26762090 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 26762040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25482081 - 25481822
Alignment:
Q  217 gaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctt 316  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||||  |||||| |  |||| | ||||||||||||||  | |||||| |||| ||     
T  25482081 gaggactataatgatagccggacaaattagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacccctc 25481982  T
Q  317 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtc 416  Q
    |||||||| || ||    |||||||||||||| | ||||| |||| |||| || ||| ||||||||| ||||||| || || || | || || |||||||    
T  25481981 ttcatgcttagtcagatattcaccataactacatgtatgacgtcgaacatcagtaggatccacaccatagaaaacgggtaatactaagcaactctttgtc 25481882  T
Q  417 ttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25481881 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 25481822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 284 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26848932 - 26848741
Alignment:
Q  284 ctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacacca 383  Q
    ||||||| ||| ||| | ||||||||||  || |||||||| ||| | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  26848932 ctccatgctttccttgttattttgaaacacctcttcatgcttagcaagtgcttcaccataactactattctgatgtcgcacatgagaaggttctatgcca 26848833  T
Q  384 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
     |||||||||| | ||| | || |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26848832 tagaaaacaggaataaccatgctacccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagtt 26848741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 218 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27214758 - 27214498
Alignment:
Q  218 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 317  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||||| |  ||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  27214758 aggactataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctct 27214659  T
Q  318 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttat---gatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 414  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||||||||    || |   |||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||| | ||| |||||||| |||     
T  27214658 tcatgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgaccttttt 27214559  T
Q  415 tcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
     |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27214558 ccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27214498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 218 - 475
Target Start/End: Original strand, 27234470 - 27234730
Alignment:
Q  218 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 317  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||||| |  ||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  27234470 aggactataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctct 27234569  T
Q  318 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttat---gatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 414  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||||||||    || |   |||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||| | ||| |||||||| |||     
T  27234570 tcatgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgaccttttt 27234669  T
Q  415 tcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
     |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27234670 ccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28227248 - 28227026
Alignment:
Q  258 agagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgat 357  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||| |||||| | | ||| | |||||| ||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || ||||    
T  28227248 agagccatcttccatttctgcaacctatccatgctatgcttgttattttggaacctctctatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgat 28227149  T
Q  358 gtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaa 457  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| |  |||  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28227148 gtcgcacatgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaacaaggcgccgattttccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaa 28227049  T
Q  458 tgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  28227048 tgaagaagaagcataattgatag 28227026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26143227 - 26142945
Alignment:
Q  194 tttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttt 293  Q
    ||||||||| || | ||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |  |||||| |  |||| | ||||||||||    
T  26143227 tttaagtaaagtggggtacccatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgttt 26143128  T
Q  294 ttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaaca 392  Q
    ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||| | ||  | |||| ||| |  |||| |||||||||| || |||||||     
T  26143127 ttctcgttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatgct-caccataaatcccactctgatttcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacg 26143029  T
Q  393 ggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    || || || | || || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26143028 ggaaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 26142945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 475
Target Start/End: Original strand, 27337923 - 27338171
Alignment:
Q  227 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 326  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||  ||||||  || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| | | |||||||| |    
T  27337923 atggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaacttatcttcatgctta 27338022  T
Q  327 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 425  Q
    |  | |||| ||||||||||| ||  | |||||||| || |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    | |||| |||||||||||||     
T  27338023 gtaagatgc-tcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcag 27338121  T
Q  426 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27338122 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtt 27338171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 475
Target Start/End: Original strand, 27398663 - 27398911
Alignment:
Q  227 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 326  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||  ||||||  || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| | | |||||||| |    
T  27398663 atggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaacttatcttcatgctta 27398762  T
Q  327 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 425  Q
    |  | |||| ||||||||||| ||  | |||||||| || |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    | |||| |||||||||||||     
T  27398763 gtaagatgc-tcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcag 27398861  T
Q  426 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27398862 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtt 27398911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 309 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26623223 - 26623056
Alignment:
Q  309 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 408  Q
    ||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||| ||  | ||||| || |  |||| ||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  26623223 aacctctttgcatgcttagcaagtgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgac 26623124  T
Q  409 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26623123 cctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttg 26623056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 309 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26729201 - 26729034
Alignment:
Q  309 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 408  Q
    ||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||| ||  | ||||| || |  |||| ||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  26729201 aacctctttgcatgcttagcaagtgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgac 26729102  T
Q  409 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26729101 cctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttg 26729034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26056290 - 26056006
Alignment:
Q  192 gatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgt 291  Q
    ||||||||||| || | ||||  | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||  |||||| |  |||| | ||||||||    
T  26056290 gatttaagtaaagtagggtactcatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgt 26056191  T
Q  292 ttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaa 390  Q
    ||||||  | |||||| |||| || || ||||| ||  | ||||| |||||||||| ||  | |||||||| |  |||| |||||||||| || ||||||    
T  26056190 ttttctcgttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaa 26056092  T
Q  391 caggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    | ||||| || | || || |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26056091 cgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 26056006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26076260 - 26075976
Alignment:
Q  192 gatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgt 291  Q
    ||||||||||| || | ||||  | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||  |||||| |  |||| | ||||||||    
T  26076260 gatttaagtaaagtagggtactcatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgt 26076161  T
Q  292 ttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaa 390  Q
    ||||||  | |||||| |||| || || ||||| ||  | ||||| |||||||||| ||  | |||||||| |  |||| |||||||||| || ||||||    
T  26076160 ttttctcgttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaa 26076062  T
Q  391 caggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    | ||||| || | || || |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26076061 cgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 26075976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28243040 - 28242880
Alignment:
Q  320 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 419  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| || ||| |||||    
T  28243040 atgctcagccagtgctttaccataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttg 28242941  T
Q  420 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28242940 cagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatag 28242880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 26949940 - 26949745
Alignment:
Q  277 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 376  Q
    |||||| |||||||||||| ||    ||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||    
T  26949940 gcaaccgctccatgttttttttgctcttttggaacctctcttcatgcttagcaagtgcttcaccataactataattctgatgtcgcacgtgagaaggttc 26949841  T
Q  377 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcata 472  Q
     ||| || ||||||| |||| ||| |||||||| |||  |||| || | |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  26949840 tacatcatagaaaactggcagaacaaggcgacctttttccttgaagtagtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcata 26949745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 475
Target Start/End: Original strand, 28098302 - 28098475
Alignment:
Q  302 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| ||| ||||||    
T  28098302 attttggaacctctcttcatgcttagctaatgcttcaccataactccccgtctgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcacaaaaaataggaaaaacg 28098401  T
Q  402 aggcgaccctttgtctt-gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
    | || ||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  28098402 aagcaacccttt-tcttcgtaacggtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagtt 28098475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28234861 - 28234640
Alignment:
Q  258 agagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgat 357  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || ||||    
T  28234861 agagccatcttccatttctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgat 28234762  T
Q  358 gtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaa 457  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| |  |||  || | ||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28234761 gtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtctattttcctcgaagc-ataaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaa 28234663  T
Q  458 tgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  28234662 tgaagaagaagcataattgatag 28234640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28786788 - 28786677
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  28786788 gtatgtaacaacatcacaatcacatccatgta--ctcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaaataattaaatacttgtttaaaaacg 28786691  T
Q  99 taaataaaaaaggt 112  Q
    |||||| |||||||    
T  28786690 taaatagaaaaggt 28786677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28792909 - 28792798
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  28792909 gtatgtaacaacatcacaatcacatccatgta--ctcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaaataattaaatacttgtttaaaaacg 28792812  T
Q  99 taaataaaaaaggt 112  Q
    |||||| |||||||    
T  28792811 taaatagaaaaggt 28792798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 375 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26824021 - 26823920
Alignment:
Q  375 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26824021 tccacaccatagaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 26823922  T
Q  475 tg 476  Q
    ||    
T  26823921 tg 26823920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28181395 - 28181190
Alignment:
Q  275 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 374  Q
    ||||||||| |||||| | | ||| | |||||| ||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  28181395 ctgcaacctatccatgctatgcttgttattttggaacctctctatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggt 28181296  T
Q  375 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
    |||||| || ||||||  |||||||| || || ||  ||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28181295 tccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 28181196  T
Q  475 tgatag 480  Q
    ||||||    
T  28181195 tgatag 28181190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26049065 - 26048925
Alignment:
Q  336 tcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgt 435  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |  |||| |||||||||| || | ||||| ||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26049065 tcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgt 26048966  T
Q  436 gaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26048965 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 26048925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26070234 - 26070094
Alignment:
Q  336 tcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgt 435  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |  |||| |||||||||| || | ||||| ||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26070234 tcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgt 26070135  T
Q  436 gaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26070134 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttg 26070094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28185647 - 28185442
Alignment:
Q  275 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 374  Q
    |||||||||||||||| | | ||| | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||    
T  28185647 ctgcaacctctccatgctatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccagtgctttaccataactgcccgtgtgatgtcgcacgtgagaaggt 28185548  T
Q  375 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
    |||||| || ||||||  |||||||| || || ||  ||  |||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28185547 tccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 28185448  T
Q  475 tgatag 480  Q
    ||||||    
T  28185447 tgatag 28185442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28325717 - 28325557
Alignment:
Q  320 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 419  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||||| || |||   |||    
T  28325717 atgctcggccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttg 28325618  T
Q  420 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
     |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  28325617 aagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatag 28325557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 28781651 - 28781543
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| || ||||||||||    
T  28781651 gtatgtaacaacatcacaatcacatccatgta--ctcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaaataattaaataattgtttaaaaacg 28781554  T
Q  99 taaataaaaaa 109  Q
    |||||| ||||    
T  28781553 taaatagaaaa 28781543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 472
Target Start/End: Original strand, 28297619 - 28297816
Alignment:
Q  275 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| |  ||| ||| ||| ||||| | ||||||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  28297619 ctgcaacctctccatgttattcttgttattttggaacttctctatatgatcatccagtgctttagcataacttccatgttgatgtcgcacatgagaaggt 28297718  T
Q  375 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcata 472  Q
    |||||| || | ||||  |||||||| || || |   ||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  28297719 tccacatcataaaaaatcggcaaaactagacggctactttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcata 28297816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 28514454 - 28514257
Alignment:
Q  275 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| |  ||| ||| ||| ||||| | ||||||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  28514454 ctgcaacctctccatgttattcttgttattttggaacttctctatatgatcatccagtgctttagcataacttccatgttgatgtcgcacatgagaaggt 28514355  T
Q  375 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcata 472  Q
    |||||| || | ||||  |||||||| || || |   ||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  28514354 tccacatcataaaaaatcggcaaaactagacggctactttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcata 28514257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 366 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 28139731 - 28139619
Alignment:
Q  366 tgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaag 465  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |  |||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28139731 tgagaaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaag 28139632  T
Q  466 aggcatagttgat 478  Q
    |||||||||||||    
T  28139631 aggcatagttgat 28139619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 478
Target Start/End: Original strand, 26341894 - 26342043
Alignment:
Q  332 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgacc---ctttgtcttgtagcaatga 428  Q
    ||||||||| ||||| ||  | ||| |||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||||    ||||||   ||||| |||| ||||||||    
T  26341894 tgcttcaccgtaactcccaatctgacgtcgtacatgagaaggttccatgtcatagaaaacaggcaaaattttgcgacccttctttgccttgaagcaatga 26341993  T
Q  429 atgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgat 478  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26341994 atgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgat 26342043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 330 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26937320 - 26937170
Alignment:
Q  330 aatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaa 429  Q
    |||||| |||||||||| ||  | || ||||| || |||||||| |||||  || |||||| ||||||||  ||  |||| ||||||||| |||| | ||    
T  26937320 aatgctgcaccataactcccagtttggtgtcgaacgtgagaaggatccacttcatagaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaa 26937221  T
Q  430 tgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26937220 cgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatag 26937170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 27698218 - 27698301
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatac 86  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27698218 gtatgaaacaacatcacaatcacatctatgta--ctcagaatatattataaatttctaactatttcgacatataaataactaatac 27698301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26975331 - 26975134
Alignment:
Q  277 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 376  Q
    |||||| ||||| |||||  || | ||||||||||| || |||||||| ||| | | |||||||||||||  | ||  | |  |||||||||||||||||    
T  26975331 gcaaccgctccaagttttcatttttattttgaaacccctcttcatgcttagcaagtacttcaccataactgtcattcagtttacgcacatgagaaggttc 26975232  T
Q  377 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
        ||| |||||||||| | ||| | || |||||||   ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26975231 tgtgccatagaaaacaggaataactatgctacccttttcattggaacaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26975134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28150108 - 28150013
Alignment:
Q  385 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||||| ||||| ||| | || |||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28150108 agaaaataggcagaactaagcaaccctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatag 28150013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 2184459 - 2184369
Alignment:
Q  385 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||| |||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2184459 agaaaactggtagaaccaggcgtccctttgacttggagtaacgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtt 2184369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 2185069 - 2184980
Alignment:
Q  385 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
    ||||||| |||| |||  |||| ||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2185069 agaaaactggcagaaccgggcgtccctttgacttggagcaacgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 2184980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25071938 - 25071741
Alignment:
Q  277 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 376  Q
    |||||| |||||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||  | ||  | | |||||| || ||||||||    
T  25071938 gcaaccgctccatgtgttccttgttattttgaaacccctcttcatgcttagcaaatgattcaccataactgtcattcagttttcgcacctgcgaaggttc 25071839  T
Q  377 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
        ||| ||||||  || | ||| ||||||| ||||  |||| || | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  25071838 ggtgccatagaaaattggtagaacaaggcgactcttttccttgaagtagtgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26811711 - 26811590
Alignment:
Q  354 tgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaac 453  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||| |||||||| |||  |||| || | | ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26811711 tgatgtcgcacgtgagaaggttccacaccatagaaaactggtagaacaaggcgacctttttccttgaagtagttaatgatgtggacaagctcatctaaac 26811612  T
Q  454 aaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
    |||| || ||||  ||||||||    
T  26811611 aaaacgacgaagttgcatagtt 26811590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 26635969 - 26635774
Alignment:
Q  277 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 376  Q
    |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||   | |||||||| ||| |  ||||||||||||||  | ||  | | ||||||||||||||||||    
T  26635969 gcaaccactccatgttttccttgctattttgaaactgatcttcatgcttagcaagcgcttcaccataactgtcatttagttttcgcacatgagaaggttc 26635870  T
Q  377 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcata 472  Q
        ||| |||||||||| | |||   || |||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26635869 ggtgccatagaaaacaggaataaccttgctacccttttcattggagcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26635774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 26741935 - 26741740
Alignment:
Q  277 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 376  Q
    |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||   | |||||||| ||| |  ||||||||||||||  | ||  | | ||||||||||||||||||    
T  26741935 gcaaccactccatgttttccttgctattttgaaactgatcttcatgcttagcaagcgcttcaccataactgtcatttagttttcgcacatgagaaggttc 26741836  T
Q  377 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcata 472  Q
        ||| |||||||||| | |||   || |||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26741835 ggtgccatagaaaacaggaataaccttgctacccttttcattggagcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26741740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 475
Target Start/End: Original strand, 27665025 - 27665223
Alignment:
Q  277 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 376  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  |  |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||   | | ||||||||||||||||||    
T  27665025 gcaaccgctccatgttttccatgtcattttgaaactccacttcatgcttagcaagtgcttcaccataactgtcttccagttttcgcacatgagaaggttc 27665124  T
Q  377 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct-tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
        ||| |||||||||| | |||   |  | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  27665125 ggtgccatagaaaacaggaataaccttggtaaccttt-tctctgaagcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27665223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29826274 - 29826171
Alignment:
Q  309 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 408  Q
    ||||||| |||| | |||| || | ||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||    
T  29826274 aacctctcttcaagatcagtcattcctttaccataactcccagtctgatgtcgcacatgagaaggatccacatcatagaaaataggcaaaacgagacgac 29826175  T
Q  409 cctt 412  Q
    ||||    
T  29826174 cctt 29826171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 26959445 - 26959250
Alignment:
Q  277 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 376  Q
    |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||  || |||||||| ||| |  |||||||||||||| || ||  | | ||||||||||||||||||    
T  26959445 gcaaccgctccatgttttccttgctattttgaaactgctcttcatgcttagcaagcgcttcaccataactgccatttagttttcgcacatgagaaggttc 26959346  T
Q  377 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcata 472  Q
        ||| |||||||||| | ||    || ||| |||   ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  26959345 tgtgccatagaaaacaggaataatcgtgctacctttttcattggagaaatgaatgatgtggacaagttcatccaaataaaacgaagaagaagcata 26959250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 348
Target Start/End: Original strand, 25506897 - 25506963
Alignment:
Q  282 ctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactac 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  25506897 ctctccatgtttttcttattattttgaaacttctcttcatgcttagtcagatcttcaccataactac 25506963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 24715856 - 24715667
Alignment:
Q  285 tccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaa 384  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||  | |||||||| ||| |  ||||||||||||||  | ||  | | |||||||||||||||||||   |||     
T  24715856 tccatgtgttccttgttattttgaaacccgtcttcatgcttagcaagagcttcaccataactgtcatttagttttcgcacatgagaaggttccgtgccat 24715757  T
Q  385 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
    |||||||||| | ||| | || ||||||  | ||| ||||||| ||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  24715756 agaaaacaggaataaccatgccacccttgttattgaagcaatggatgatgtgggaaagttcgcctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 24715667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 480
Target Start/End: Original strand, 25506975 - 25507020
Alignment:
Q  435 tgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25506975 tgaacaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatag 25507020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26143399 - 26143338
Alignment:
Q  18 aatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact 81  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  26143399 aatcacatccatgtat--tgagaatatattatgcaattctaacttttttgacatataaataact 26143338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26617437 - 26617401
Alignment:
Q  438 acaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26617437 acaagttcatctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26617401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26723365 - 26723329
Alignment:
Q  438 acaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26723365 acaagttcatctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26723329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 209 - 473
Target Start/End: Original strand, 3260 - 3525
Alignment:
Q  209 gtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttttt-cttatcattttg 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  3260 gtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttttttcggatcattttg 3359  T
Q  308 aaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3360 aaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcga 3459  T
Q  408 ccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatag 473  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3460 ccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatag 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 209 - 480
Target Start/End: Original strand, 14196 - 14466
Alignment:
Q  209 gtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttga 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14196 gtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttga 14295  T
Q  309 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14296 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 14395  T
Q  409 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14396 cctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatag 14466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 60119 - 59650
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcaca--atcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaac 97  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  60119 gtatgtaacaacatcacacaatcacatccatgta--ctcataatatattatacatttttaactattttgacatataaataactaacaattgtttaaaaac 60022  T
Q  98 gtaaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggattta 197  Q
     |||||||||||||| ||  |   ||||||  ||| || |||    ||||| | ||| |||||| ||||||  |||| ||||| | ||||  |||| |||    
T  60021 ataaataaaaaaggtgttaca---catttaggctttaagatgg---tattgaggaatagaaattaaataaattaaatgcaaaaagcaaaac-aggaatta 59929  T
Q  198 agtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttct 297  Q
    |||||    | ||||| | ||  |  ||||||||||| ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  59928 agtaaataggcgtacccatgactatcatcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcg 59829  T
Q  298 tatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaa 397  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  59828 tatcattttgaaacctattttcatgctcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaa 59729  T
Q  398 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  59728 aacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttg 59650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18074311 - 18073842
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcaca--atcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaac 97  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  18074311 gtatgtaacaacatcacacaatcacatccatgta--ctcataatatattatacatttttaactattttgacatataaataactaacaattgtttaaaaac 18074214  T
Q  98 gtaaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggattta 197  Q
     |||||||||||||| ||  |   ||||||  ||| || |||    ||||| | ||| |||||| ||||||  |||| ||||| | ||||  |||| |||    
T  18074213 ataaataaaaaaggtgttaca---catttaggctttaagatgg---tattgaggaatagaaattaaataaattaaatgcaaaaagcaaaac-aggaatta 18074121  T
Q  198 agtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttct 297  Q
    |||||    | ||||| | ||  |  ||||||||||| ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18074120 agtaaataggcgtacccatgactatcatcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcg 18074021  T
Q  298 tatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaa 397  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18074020 tatcattttgaaacctattttcatgctcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaa 18073921  T
Q  398 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18073920 aacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttg 18073842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 18731132 - 18731602
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgt 99  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18731132 gtatgtaacaacatcacagtcacatccatgtc--ctcataatatatcatacatttctaactattttgacttataaataactaatacttgtttaaaaatgt 18731229  T
Q  100 aaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaag 199  Q
    ||| ||||||||| |||   |  |||||  ||| || |||  ||||||| | |||  ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||  || ||| |||    
T  18731230 aaa-aaaaaaggtgttt---ccaatttaggctttaagatggtattattgaggaataaaaattaaataaataaaatgcaaaatggaaaacaagaatt-aag 18731324  T
Q  200 taatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttctta 299  Q
    ||| |  ||||||| | ||   |||  |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||     
T  18731325 taaagaggagtacccatga---ctaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttg 18731421  T
Q  300 tcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaa 398  Q
    | |||||| || |||||||  |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  18731422 ttattttggaaactctttttgtgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggcaaa 18731520  T
Q  399 acgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731521 acaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 18731602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 18699031 - 18699498
Alignment:
Q  4 tgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaa 102  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||   |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18699031 tgtaacaacatcacagtcacatccatgtc--ctcatagtatatcatacatttctaactattttgacttataaataactaatacttgtttaaaaacgtaat 18699128  T
Q  103 taaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaa 202  Q
    |||||| ||| |||   |  |||||  ||| || |||  || |||| | |||  ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||  || ||| ||||||    
T  18699129 taaaaa-ggtgttt---ccaatttaggctttaagatggtatcattgaggaataaaaattaaataaataaaatgcaaaaaggaaaacaagaatt-aagtaa 18699223  T
Q  203 tgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatca 302  Q
     |  ||||||| || |   |||  |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  18699224 agaggagtacccagaa---ctaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagctaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgtta 18699320  T
Q  303 ttttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacg 401  Q
    ||||| || |||||| | |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  18699321 ttttggaaactctttccgtgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatctacgccatagaaaacaggcaaaacg 18699419  T
Q  402 aggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18699420 agacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 18699498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 18655108 - 18655575
Alignment:
Q  4 tgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaa 102  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18655108 tgtaacaacatcacagtcacatccattta--ctcataatatatcatacatttctaactattttgacttataaataactaatacttgtttaaaaatgtaaa 18655205  T
Q  103 taaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaa 202  Q
    |||||| ||| |||   |  |||||  ||| || |||  || |||| | |||  ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||  | || |||||| |    
T  18655206 taaaaa-ggtgttt---cgaatttaggctttaagatggtatcattgaggaataaaaattaaataaataaaatgcaaaaaggaaaac-atgaattaagtga 18655300  T
Q  203 tgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatca 302  Q
     |  ||||||| ||||   |||  |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  18655301 agaggagtacccagga---ctagaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgtta 18655397  T
Q  303 ttttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacg 401  Q
    ||||| ||  |||||   |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  18655398 ttttggaaattctttctgtgcttagtgagatg-ttcaccataacttccagtttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaaaacaggaaaaacg 18655496  T
Q  402 aggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655497 agacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 18655575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 18723713 - 18724183
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgt 99  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18723713 gtatgtaacaacatcacagtcacatccattta--ctcataatatatcatacatttctaactattttgacttataaataactaatacttgtttaaaaatgt 18723810  T
Q  100 aaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaag 199  Q
    ||||||||| ||| |||   |  |||||  ||| || |||  |||| || |   |  || || |||||| ||||| ||||| ||||||  || ||| |||    
T  18723811 aaataaaaa-ggtgttt---ccaatttaggctttaagatggtattactgaggtttaaaatttaaataaataaaatgcaaaaaggaaaacaagaatt-aag 18723905  T
Q  200 taatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttctta 299  Q
    ||| |  ||||||| ||||   |||  |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||     
T  18723906 taaagaggagtacccagga---ctaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttg 18724002  T
Q  300 tcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaa 398  Q
    | |||||| || ||| |||  |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | || ||||| |  |||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  18724003 ttattttggaaactcattttgtgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttggtgtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggcaaa 18724101  T
Q  399 acgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18724102 acaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 18724183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 480
Target Start/End: Original strand, 18679403 - 18679665
Alignment:
Q  218 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 317  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |  |||||| | ||||||| |||||||||||| || | |||||| || ||||||    
T  18679403 aggactaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagctaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttattgttattttggaaactcttt 18679502  T
Q  318 tcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtc 416  Q
       || | ||  | ||| |||||||||||||||  | |||||||  |  |||| ||| |||||  || |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18679503 cagtgattagtgagatg-ttcaccataactaccactttgatgtcatatgtgagtaggatccacgacatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtc 18679601  T
Q  417 ttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679602 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 18679665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 317 - 474
Target Start/End: Original strand, 5090902 - 5091059
Alignment:
Q  317 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtc 416  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||  |    
T  5090902 ttcatgctcagcaagtgcttcaccataacttccagtctgatatcgcacatgagaaggttccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttcc 5091001  T
Q  417 ttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  5091002 ttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagt 5091059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 476
Target Start/End: Original strand, 17989013 - 17989147
Alignment:
Q  339 ccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaac-aggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtga 437  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||  |||||||| |||||||||||     
T  17989013 ccatacctacctgtatgatgtcgcacatcaga-ggttccacaccaaagaaaacaaggcaaaacgagg-aaccc--tggtttgtagcagtgaatgatgtgg 17989108  T
Q  438 acaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    ||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17989109 acaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttg 17989147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 18679188 - 18679304
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaa-------ctattgtgacatataaataactaatactt-ttta 92  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||       ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18679188 gtatgtaacaacatcacagtcacacccatgta--ctcataatatatcatacatttctaaattcaaactattttgacttataaataactaatacttgttta 18679285  T
Q  93 aaaacgtaaataaaaaaggt 112  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  18679286 aaaacgtaaat-aaaaaggt 18679304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 227 - 473
Target Start/End: Original strand, 4529 - 4775
Alignment:
Q  227 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4529 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 4628  T
Q  327 gccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4629 gccaatgcttcaccataactacctttcagatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 4728  T
Q  427 gaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatag 473  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4729 gaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatag 4775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13743
Alignment:
Q  227 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13490 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgtcca 13589  T
Q  327 gccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaat 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13590 gccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaat 13689  T
Q  427 gaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||    
T  13690 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatag 13743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 13307 - 13415
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||    
T  13307 gtatgtaacaacatcacaatcacatccatgta--ctcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaagtaattaaatacttgtttaaaaacg 13404  T
Q  99 taaataaaaaa 109  Q
    |||||| ||||    
T  13405 taaatagaaaa 13415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 4344 - 4457
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatat--tatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaa 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||    
T  4344 gtatgtaacaacatcacaatcacatccatgt--actcataatatatggtatacatttctaactattgtgacataaaagtaattaaatacttgtttaaaaa 4441  T
Q  97 cgtaaataaaaaaggt 112  Q
    |||||||| |||||||    
T  4442 cgtaaatataaaaggt 4457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7854 - 7601
Alignment:
Q  227 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7854 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgtcca 7755  T
Q  327 gccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaat 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7754 gccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaat 7655  T
Q  427 gaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||    
T  7654 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatag 7601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8037 - 7929
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||    
T  8037 gtatgtaacaacatcacaatcacatccatgta--ctcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaagtaattaaatacttgtttaaaaacg 7940  T
Q  99 taaataaaaaa 109  Q
    |||||| ||||    
T  7939 taaatagaaaa 7929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 219 - 476
Target Start/End: Original strand, 28127516 - 28127773
Alignment:
Q  219 ggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctttt 318  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||| |     
T  28127516 ggactataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacctctctc 28127615  T
Q  319 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctt 418  Q
    |||||| ||| |   ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28127616 catgcttagcaagctcttcaccataactccctgtatgatatcgcacatcagtaggatccacgccaaagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtctt 28127715  T
Q  419 gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 476  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28127716 gtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 28127773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 219 - 480
Target Start/End: Original strand, 28164200 - 28164460
Alignment:
Q  219 ggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctttt 318  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||       
T  28164200 ggactataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacctctcac 28164299  T
Q  319 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctt 418  Q
    |||||| ||  |   |||  |||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28164300 catgcttagtaagatctttgccataactccctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacgccaa-gaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtctt 28164398  T
Q  419 gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164399 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 28164460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 267978 - 268455
Alignment:
Q  1 gtatgtaacaacgtcaca--atcacatccatgtag--actcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaa 95  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||| |   ||||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  267978 gtatgtaacaacatcacacaatcacatccatgcatgtactcaaaatatattatacgtttctaactatttcgtcatataaacaactaatacttatttagaa 268077  T
Q  96 acgtaaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatt 195  Q
    ||||||||||||||||| || |    ||||||   || || |||  ||||| | | ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||||||  || |||    
T  268078 acgtaaataaaaaaggttttagc---catttatggtttaagatggtattatcgaggaatagaaattaaataaataaaatgaaaaaaggaaaacaagaatt 268174  T
Q  196 taagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttttt 295  Q
     |||||| |   |||||| | ||   |||  ||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  268175 -aagtaaagagcagtacccacga---ctagaatggtagccagacaagttagaagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgttttt 268270  T
Q  296 cttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacagg 394  Q
    |||   |||||| || |||| ||| |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||| ||| |||| || ||    
T  268271 cttgctattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacggg 268369  T
Q  395 caaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268370 caaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 268455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 106
Target Start/End: Original strand, 28164048 - 28164100
Alignment:
Q  55 tctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaa 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  28164048 tctaactattttgacatataaatatcttatacttgtttaaaaacataaataaa 28164100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Original strand, 29273628 - 29273881
Alignment:
Q  227 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 326  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||  |||||| | |||||||  ||||||||||||||   |||||| || |||| ||| | || |    
T  29273628 atggtagccagacaagttagaagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaaccgatccatgtttttcttgctattttggaaactctcttcgtactta 29273727  T
Q  327 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 425  Q
    |  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  29273728 gtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacaggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcag 29273826  T
Q  426 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29273827 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 29273881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27729 - 27524
Alignment:
Q  275 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 374  Q
    ||||||||| |||||| | | ||| | |||||| ||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27729 ctgcaacctatccatgctatgcttgttattttggaacctctctatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacatgagaaggt 27630  T
Q  375 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
    |||||| || ||||||  |||||||| ||||| |  |||  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  27629 tccacatcatagaaaattggcaaaacaaggcgccgattttccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 27530  T
Q  475 tgatag 480  Q
    ||||||    
T  27529 tgatag 27524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 35023 - 34801
Alignment:
Q  258 agagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgat 357  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || ||||    
T  35023 agagccatcttccatttctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgat 34924  T
Q  358 gtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaa 457  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||||| || || ||  ||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34923 gtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaa 34824  T
Q  458 tgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  34823 tgaagaagaagcataattgatag 34801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 43202 - 43042
Alignment:
Q  320 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 419  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| || ||| |||||    
T  43202 atgctcagccagtgctttaccataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttg 43103  T
Q  420 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43102 cagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatag 43042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 117032 - 116872
Alignment:
Q  320 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 419  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||||| || |||   |||    
T  117032 atgctcggccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttg 116933  T
Q  420 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
     |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  116932 aagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatag 116872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 332 - 480
Target Start/End: Original strand, 58245 - 58393
Alignment:
Q  332 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatg 431  Q
    ||||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||  |||||||| ||||| || | |  || | |||| ||||||    
T  58245 tgctttaccataacttccatcttgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcatagaaaattggcaaaactaggcgcccatattcctcgaagcagtgaatg 58344  T
Q  432 atgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  58345 atgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatag 58393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 474
Target Start/End: Original strand, 17993593 - 17993789
Alignment:
Q  278 caacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttcc 377  Q
    ||||| ||||||||||| |||   ||||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||     
T  17993593 caaccgctccatgttttccttgctattttgaaaaccctcttcatgcttagcaagtgcttcaccataactatcattctgatgtcgcacctgagaaggttct 17993692  T
Q  378 acaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcg-accctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 474  Q
       ||| |||||||||| |  ||  | || |||||||   ||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  17993693 gtgccatagaaaacaggaattac-cgtcgtacccttttcattggagcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 17993789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279764
Alignment:
Q  421 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 480  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatag 3279764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16689234 - 16689092
Alignment:
Q  333 gcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatga 432  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| ||||| |||||  || |||||||||||||||| || ||||| ||||   || ||| || |||||    
T  16689234 gcttcaccataacttccaatctgatgtctcacatgcgaaggatccacgtcatagaaaacaggcaaaactagccgaccttttgcactgaagccatcaatga 16689135  T
Q  433 tgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 475  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  16689134 tgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagtt 16689092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University