View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17057_low_5 (Length: 223)

Name: NF17057_low_5
Description: NF17057
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17057_low_5
NF17057_low_5
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (5-215)||(33341812-33342022)
chr3 (17-215)||(7853913-7854111)
chr3 (5-215)||(54685415-54685625)
chr3 (10-180)||(17956103-17956274)
chr3 (10-193)||(30152893-30153078)
chr3 (10-184)||(45581591-45581767)
chr3 (10-172)||(54038243-54038406)
chr3 (16-160)||(16996176-16996321)
chr3 (16-168)||(19570805-19570957)
chr3 (76-215)||(19946629-19946768)
chr3 (16-156)||(50112168-50112309)
chr3 (19-168)||(317628-317778)
chr3 (16-168)||(22144389-22144542)
chr3 (19-162)||(16182065-16182209)
chr3 (10-172)||(3992522-3992686)
chr3 (16-140)||(12349847-12349970)
chr3 (10-163)||(53771022-53771177)
chr3 (16-168)||(13817492-13817642)
chr3 (10-172)||(23492346-23492509)
chr3 (10-136)||(16261463-16261589)
chr3 (16-168)||(35123674-35123826)
chr3 (16-168)||(6154448-6154600)
chr3 (10-163)||(2844172-2844327)
chr3 (16-168)||(14298399-14298551)
chr3 (16-168)||(14304026-14304178)
chr3 (16-163)||(53898572-53898719)
chr3 (16-184)||(17523006-17523176)
chr3 (16-168)||(6146863-6147015)
chr3 (76-215)||(47784924-47785064)
chr3 (16-168)||(14295415-14295569)
chr3 (10-163)||(38167896-38168050)
chr3 (16-162)||(17100636-17100783)
chr3 (16-162)||(17101321-17101468)
chr3 (19-172)||(11329081-11329235)
chr3 (38-179)||(17139474-17139616)
chr3 (38-172)||(14528151-14528286)
chr3 (134-215)||(9303343-9303425)
chr3 (71-163)||(28558188-28558282)
chr3 (25-172)||(12560362-12560510)
chr3 (16-172)||(54423986-54424142)
chr3 (16-163)||(19260956-19261104)
chr3 (46-172)||(55440996-55441123)
chr3 (16-168)||(14301042-14301196)
chr3 (16-163)||(12349656-12349809)
chr3 (38-188)||(12488865-12489017)
chr3 (100-163)||(14059414-14059478)
chr3 (39-178)||(17204667-17204807)
chr3 (61-187)||(38811170-38811297)
chr3 (76-188)||(1990759-1990873)
chr3 (106-187)||(17960520-17960602)
chr3 (16-69)||(34439460-34439513)
chr3 (24-135)||(8631801-8631912)
chr3 (63-179)||(9590918-9591035)
chr3 (76-193)||(12952915-12953034)
chr3 (19-138)||(17938582-17938701)
chr3 (38-179)||(15876034-15876176)
chr3 (76-163)||(3576615-3576703)
chr3 (38-138)||(16880131-16880231)
chr3 (76-187)||(34559857-34559969)
chr3 (16-46)||(28558271-28558301)
chr3 (104-178)||(17191511-17191583)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (16-214)||(11583982-11584184)
chr5 (10-172)||(2031783-2031946)
chr5 (10-193)||(11342635-11342821)
chr5 (16-193)||(1168321-1168500)
chr5 (16-168)||(28261498-28261651)
chr5 (16-161)||(21397073-21397222)
chr5 (10-172)||(21204898-21205062)
chr5 (17-168)||(21646857-21647009)
chr5 (16-168)||(11337303-11337455)
chr5 (16-168)||(24475560-24475708)
chr5 (16-168)||(4865239-4865393)
chr5 (16-184)||(20712036-20712206)
chr5 (10-172)||(21650668-21650831)
chr5 (133-215)||(16105573-16105656)
chr5 (17-137)||(21906729-21906846)
chr5 (133-215)||(109075-109158)
chr5 (16-140)||(24183249-24183370)
chr5 (25-179)||(19405503-19405658)
chr5 (19-187)||(7728378-7728547)
chr5 (46-168)||(23466434-23466557)
chr5 (19-188)||(3673818-3673989)
chr5 (38-187)||(21616974-21617124)
chr5 (25-188)||(23493875-23494040)
chr5 (104-179)||(16595474-16595550)
chr5 (104-187)||(32966352-32966436)
chr5 (19-171)||(19862183-19862336)
chr5 (176-214)||(24225596-24225634)
chr5 (76-188)||(6456580-6456694)
chr5 (76-187)||(37983325-37983434)
chr5 (76-179)||(29917931-29918035)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (16-215)||(75-274)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (38-215)||(3230-3407)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (10-215)||(18583264-18583453)
chr6 (10-180)||(35015276-35015447)
chr6 (16-180)||(19983416-19983581)
chr6 (17-168)||(25744331-25744483)
chr6 (76-215)||(18823573-18823712)
chr6 (10-163)||(26089718-26089871)
chr6 (16-156)||(32898779-32898920)
chr6 (76-215)||(18839428-18839567)
chr6 (10-172)||(18002615-18002777)
chr6 (10-163)||(23994904-23995059)
chr6 (16-168)||(22440911-22441064)
chr6 (19-168)||(31628245-31628395)
chr6 (10-172)||(15742339-15742505)
chr6 (17-172)||(18777119-18777275)
chr6 (16-168)||(13014826-13014979)
chr6 (133-215)||(4991002-4991085)
chr6 (19-162)||(16086001-16086144)
chr6 (19-162)||(18432626-18432770)
chr6 (19-193)||(18398890-18399065)
chr6 (19-180)||(18381803-18381965)
chr6 (16-153)||(18570271-18570409)
chr6 (104-215)||(17083383-17083496)
chr6 (19-187)||(22361885-22362054)
chr6 (38-163)||(25367376-25367502)
chr6 (19-168)||(16106499-16106643)
chr6 (64-172)||(28195259-28195367)
chr6 (106-163)||(15740211-15740269)
chr6 (74-179)||(18629786-18629892)
chr6 (38-184)||(25651197-25651345)
chr6 (104-187)||(25919571-25919655)
chr6 (104-163)||(33324675-33324735)
chr6 (104-163)||(35136217-35136277)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (10-172)||(41506928-41507091)
chr8 (10-180)||(24716981-24717152)
chr8 (10-153)||(39115267-39115411)
chr8 (19-168)||(41246635-41246785)
chr8 (16-168)||(19993171-19993324)
chr8 (16-163)||(22234920-22235068)
chr8 (16-168)||(20573309-20573461)
chr8 (16-140)||(37611675-37611798)
chr8 (16-184)||(20481565-20481735)
chr8 (17-172)||(274416-274572)
chr8 (17-172)||(641277-641433)
chr8 (17-172)||(827083-827239)
chr8 (10-184)||(16039000-16039176)
chr8 (19-156)||(20647949-20648087)
chr8 (19-156)||(20654025-20654163)
chr8 (25-179)||(39446892-39447046)
chr8 (100-168)||(20567200-20567268)
chr8 (76-168)||(20567335-20567427)
chr8 (76-168)||(20573528-20573620)
chr8 (64-168)||(25122513-25122618)
chr8 (25-187)||(38533607-38533770)
chr8 (83-193)||(29759893-29760005)
chr8 (38-187)||(5854572-5854722)
chr8 (27-163)||(21680984-21681121)
chr8 (107-187)||(22736046-22736127)
chr8 (19-180)||(23837163-23837325)
chr8 (104-168)||(15969796-15969860)
chr8 (38-187)||(26011452-26011602)
chr8 (109-180)||(21198362-21198434)
chr8 (38-188)||(33528383-33528533)
chr8 (38-187)||(15933256-15933406)
chr8 (10-136)||(24385871-24385988)
chr8 (19-72)||(20561751-20561804)
chr8 (63-188)||(23226240-23226368)
chr8 (62-188)||(23149736-23149865)
chr8 (111-180)||(24929018-24929087)
chr8 (63-180)||(31194488-31194606)
chr8 (104-180)||(17285232-17285309)
chr8 (74-188)||(22742717-22742833)
chr8 (76-179)||(27233244-27233348)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (16-215)||(21442-21642)
scaffold0120 (16-215)||(31141-31341)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (16-215)||(24890-25088)
scaffold0158 (16-146)||(25212-25341)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (10-172)||(111388-111550)
chr7 (10-193)||(126366-126551)
chr7 (19-215)||(7284180-7284376)
chr7 (10-184)||(32494165-32494341)
chr7 (16-168)||(39046740-39046893)
chr7 (16-172)||(11287390-11287547)
chr7 (10-163)||(42056408-42056563)
chr7 (16-168)||(35094794-35094946)
chr7 (10-163)||(2190305-2190460)
chr7 (16-168)||(12758965-12759117)
chr7 (10-163)||(3049565-3049719)
chr7 (10-172)||(2028893-2029057)
chr7 (16-168)||(15822548-15822701)
chr7 (38-168)||(45452305-45452435)
chr7 (16-172)||(3894998-3895155)
chr7 (16-179)||(16570122-16570287)
chr7 (16-179)||(16595375-16595540)
chr7 (19-163)||(26070384-26070529)
chr7 (19-163)||(26094171-26094316)
chr7 (16-168)||(47289758-47289911)
chr7 (10-180)||(1937131-1937290)
chr7 (16-172)||(12248237-12248395)
chr7 (16-168)||(44865204-44865360)
chr7 (38-179)||(49047813-49047955)
chr7 (16-179)||(13274753-13274918)
chr7 (62-215)||(14272049-14272203)
chr7 (16-168)||(143622-143769)
chr7 (10-180)||(17224048-17224220)
chr7 (16-184)||(12369957-12370127)
chr7 (38-187)||(16915067-16915217)
chr7 (38-187)||(48356602-48356752)
chr7 (10-188)||(13377485-13377666)
chr7 (76-188)||(4484683-4484797)
chr7 (109-188)||(4446168-4446249)
chr7 (109-188)||(14935319-14935400)
chr7 (109-188)||(15362912-15362993)
chr7 (104-187)||(34241393-34241477)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (10-180)||(6202-6373)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (10-180)||(31399-31570)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (10-180)||(41274-41445)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (10-193)||(14951713-14951898)
chr4 (17-180)||(25119333-25119498)
chr4 (16-168)||(53704850-53705003)
chr4 (10-180)||(5682646-5682817)
chr4 (12-193)||(55376710-55376893)
chr4 (16-180)||(34395222-34395387)
chr4 (12-168)||(23270047-23270204)
chr4 (16-168)||(44055892-44056045)
chr4 (16-168)||(16732146-16732299)
chr4 (16-156)||(44346816-44346957)
chr4 (18-168)||(53907818-53907966)
chr4 (16-168)||(30457880-30458033)
chr4 (16-153)||(21959580-21959718)
chr4 (10-163)||(15272431-15272586)
chr4 (16-162)||(820033-820177)
chr4 (16-124)||(8872588-8872699)
chr4 (113-215)||(16522748-16522851)
chr4 (16-163)||(12837317-12837464)
chr4 (16-163)||(30232613-30232761)
chr4 (38-172)||(18494467-18494602)
chr4 (113-215)||(9295624-9295727)
chr4 (25-163)||(13809636-13809775)
chr4 (17-140)||(45458973-45459096)
chr4 (39-179)||(27960938-27961078)
chr4 (104-187)||(37957230-37957314)
chr4 (38-215)||(7185983-7186159)
chr4 (78-187)||(7964890-7965000)
chr4 (19-140)||(52265628-52265749)
chr4 (104-187)||(19821981-19822065)
chr4 (19-188)||(15044784-15044955)
chr4 (104-180)||(14901197-14901274)
chr4 (10-188)||(15109459-15109640)
chr4 (104-180)||(47535251-47535328)
chr4 (62-180)||(41166109-41166228)
chr4 (76-188)||(41256546-41256660)
chr4 (39-187)||(18276392-18276541)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (19-215)||(234-430)
scaffold0310 (139-215)||(6603-6679)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (10-172)||(12639-12802)
scaffold0039 (39-172)||(19049-19183)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (35-180)||(30056-30202)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (10-163)||(79846-80000)
scaffold0034 (16-140)||(46171-46295)
scaffold0034 (16-140)||(40664-40788)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (10-193)||(22366970-22367154)
chr1 (10-172)||(21859984-21860147)
chr1 (10-193)||(15861545-15861728)
chr1 (10-175)||(44035090-44035255)
chr1 (16-168)||(49967628-49967780)
chr1 (16-168)||(35522436-35522588)
chr1 (16-168)||(41212046-41212202)
chr1 (16-168)||(21718206-21718358)
chr1 (16-163)||(22403227-22403375)
chr1 (16-184)||(35054716-35054886)
chr1 (40-179)||(51627805-51627945)
chr1 (16-172)||(27329872-27330026)
chr1 (104-187)||(27674755-27674838)
chr1 (104-186)||(22829629-22829712)
chr1 (38-140)||(9784239-9784341)
chr1 (38-187)||(17608886-17609036)
chr1 (104-187)||(19603055-19603139)
chr1 (107-187)||(38033882-38033962)
chr1 (76-180)||(20177140-20177245)
chr1 (104-187)||(20955644-20955728)
chr1 (76-179)||(21194980-21195084)
chr1 (62-180)||(13377003-13377122)
chr1 (61-187)||(37234022-37234149)
chr1 (19-86)||(9784184-9784248)
chr1 (109-180)||(41229149-41229221)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (10-180)||(162297-162469)
scaffold0016 (16-156)||(164204-164345)
scaffold0016 (10-180)||(166383-166547)
scaffold0016 (76-180)||(116690-116795)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (10-180)||(22274688-22274858)
chr2 (16-168)||(23836822-23836975)
chr2 (16-168)||(32465835-32465988)
chr2 (10-180)||(22283921-22284091)
chr2 (16-184)||(25876036-25876206)
chr2 (62-215)||(19433495-19433649)
chr2 (10-172)||(9653015-9653179)
chr2 (17-168)||(4448251-4448402)
chr2 (12-168)||(6879414-6879571)
chr2 (10-160)||(21274168-21274319)
chr2 (16-168)||(28974026-28974179)
chr2 (16-168)||(271148-271300)
chr2 (16-180)||(25601989-25602154)
chr2 (19-184)||(36890805-36890972)
chr2 (52-168)||(27261783-27261900)
chr2 (133-215)||(24826961-24827044)
chr2 (61-187)||(3403-3529)
chr2 (39-179)||(22579999-22580140)
chr2 (113-215)||(25212977-25213081)
chr2 (16-179)||(24571408-24571572)
chr2 (153-215)||(43645824-43645886)
chr2 (104-187)||(722353-722437)
chr2 (19-184)||(67952-68119)
chr2 (147-188)||(24884643-24884684)
chr2 (104-174)||(25305416-25305487)
chr2 (61-184)||(23821767-23821892)
chr2 (61-184)||(23830846-23830971)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (10-175)||(570-736)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (16-161)||(11825-11970)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (16-168)||(32180-32333)
scaffold0091 (16-168)||(41970-42123)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (16-168)||(132367-132520)
scaffold0021 (16-172)||(11660-11818)
scaffold0021 (17-132)||(88289-88404)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (16-168)||(70739-70892)
scaffold0001 (12-168)||(60784-60940)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (16-168)||(5363-5516)
scaffold0480 (16-172)||(8998-9156)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (16-168)||(22668-22821)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (16-168)||(6962-7118)
scaffold0673 (16-168)||(939-1092)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (19-172)||(109582-109736)
scaffold0035 (17-172)||(118081-118237)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (10-172)||(1097-1261)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (10-172)||(13505-13669)
scaffold0251 (10-163)||(21479-21634)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (10-172)||(14921-15085)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (16-168)||(254931-255084)
scaffold0011 (16-168)||(261537-261690)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (10-172)||(17523-17686)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (16-168)||(14854-15004)
scaffold0083 (75-168)||(14194-14288)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (16-161)||(7556-7699)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (19-156)||(85321-85459)
scaffold0014 (10-172)||(159275-159436)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (16-168)||(693-846)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (16-156)||(38287-38428)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (16-180)||(253106-253271)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (16-179)||(9903-10067)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (16-184)||(15588-15761)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (16-172)||(8960-9117)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (16-168)||(635-788)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (10-172)||(55553-55717)
scaffold0032 (100-187)||(93973-94061)
scaffold0032 (76-163)||(104799-104887)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (19-162)||(1300-1444)
scaffold0359 (16-168)||(11771-11921)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (10-163)||(6662-6816)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (19-172)||(10094-10248)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (10-172)||(193607-193770)
scaffold0004 (10-163)||(186645-186799)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (10-172)||(9626-9789)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (109-215)||(28466-28573)
scaffold0150 (165-215)||(21637-21687)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (10-172)||(94948-95111)
scaffold0037 (16-172)||(24845-25002)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (16-168)||(112662-112812)
scaffold0022 (38-179)||(109556-109698)
scaffold0022 (100-187)||(103123-103211)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (16-184)||(146561-146731)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (42-193)||(1332-1485)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (16-163)||(3-151)
scaffold0160 (76-172)||(3492-3589)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (19-180)||(4906-5068)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (19-168)||(11688-11837)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (16-168)||(48124-48277)
scaffold0068 (16-168)||(61572-61725)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (113-215)||(130486-130589)
scaffold0028 (38-163)||(79521-79647)
scaffold0028 (16-85)||(89586-89655)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (25-179)||(33854-34008)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (10-163)||(147-301)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (19-140)||(33668-33789)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (74-172)||(24372-24471)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (41-179)||(31010-31149)
scaffold0031 (25-83)||(70676-70734)
scaffold0031 (104-187)||(97403-97487)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (61-172)||(1889-2001)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (19-180)||(76967-77129)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (76-187)||(43975-44087)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (62-184)||(270-393)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (17-80)||(4351-4414)
scaffold0740 (100-168)||(4284-4353)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (102-172)||(7807-7878)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (46-156)||(3308-3419)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (99-184)||(6622-6708)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (38-187)||(69415-69565)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (25-187)||(2483-2646)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (155-212)||(12990-13048)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (104-180)||(35444-35520)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (123-180)||(1364-1422)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (175-215)||(12694-12734)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (102-172)||(22715-22786)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (19-188)||(2436-2607)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (180-215)||(3392-3427)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (76-188)||(107967-108080)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (133-184)||(5823-5875)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33342022 - 33341812
Alignment:
Q  5 ggtagattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgat 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33342022 ggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgat 33341923  T
Q  105 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33341922 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgat 33341823  T
Q  205 tttgatgatgt 215  Q
    |||||| ||||    
T  33341822 tttgattatgt 33341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7854111 - 7853913
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7854111 tcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatgg 7854012  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7854011 cttgggtttgcatgaatcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7853913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Original strand, 54685415 - 54685625
Alignment:
Q  5 ggtagattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgat 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54685415 ggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgat 54685514  T
Q  105 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaa 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54685515 gataattcatggcttggatttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgctgttgctggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgat 54685614  T
Q  205 tttgatgatgt 215  Q
    |||||||||||    
T  54685615 tttgatgatgt 54685625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 17956103 - 17956274
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  17956103 attatactcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 17956202  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17956203 tacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 17956274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30153078 - 30152893
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  30153078 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 30152979  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 193  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  30152978 tatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 30152893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45581767 - 45581591
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45581767 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 45581668  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  45581667 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 45581591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 54038243 - 54038406
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54038243 attatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgataa 54038342  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||| | ||||||    
T  54038343 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttaagaaataaattgttgttgttggttt 54038406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Original strand, 16996176 - 16996321
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  16996176 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 16996275  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgt 160  Q
    ||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  16996276 gcttgagtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagttgt 16996321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 19570805 - 19570957
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19570805 ctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 19570904  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19570905 gcttgagtttgcataattcttggttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19570957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19946768 - 19946629
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 175  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19946768 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 19946669  T
Q  176 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19946668 aaaatgggttgataatatagaagtttgattttgatgatgt 19946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Original strand, 50112168 - 50112309
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  50112168 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 50112267  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 156  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  50112268 gcttgagtttgcatgattcatggtttgtttttgagaaatgag 50112309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 317628 - 317778
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  317628 aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggct 317727  T
Q  119 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    || ||||| || |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  317728 tgagtttgtataattcttggtttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 317778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 22144389 - 22144542
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| ||||    
T  22144389 ctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgataatacatg 22144488  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22144489 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 22144542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 16182065 - 16182209
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16182065 aattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggct 16182164  T
Q  119 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 162  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  16182165 tgggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttg 16182209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3992686 - 3992522
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  3992686 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 3992587  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  3992586 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 3992522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Original strand, 12349847 - 12349970
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  12349847 ctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 12349946  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgatt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  12349947 gcttggg-ttgcatgattcatgatt 12349970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 53771177 - 53771022
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  53771177 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 53771078  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  53771077 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 53771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13817642 - 13817492
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13817642 ctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 13817546  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13817545 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 13817492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23492509 - 23492346
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  23492509 attatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 23492410  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  23492409 ttcatggcttgggtatgcatgattcatagtttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 23492346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16261589 - 16261463
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  16261589 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 16261490  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16261489 ttcatggcttgggtatgcatgattcat 16261463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35123826 - 35123674
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  35123826 ctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 35123727  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35123726 gtttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35123674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 6154448 - 6154600
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  6154448 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 6154547  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6154548 gcttggg-ttgcatgattcataattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6154600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2844327 - 2844172
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  2844327 attatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 2844228  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2844227 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2844172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14298551 - 14298399
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  14298551 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatg 14298452  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14298451 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14298399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14304178 - 14304026
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  14304178 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatg 14304079  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14304078 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14304026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 53898572 - 53898719
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  ||| ||||||||||||    
T  53898572 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatgtcatgttgttggtgataattcatg 53898671  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  53898672 gcttgggtttgcaagattcatgatttatgttgagaaatgagatgttgt 53898719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 17523006 - 17523176
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgt-ttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||  | | |||||||||||||||    
T  17523006 ctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataattcat 17523105  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||    
T  17523106 ggcttgggtttgcatgatttatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggt 17523176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 6146863 - 6147015
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||    
T  6146863 ctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataataattcatg 6146962  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6146963 gcttgggttt-catgattcatgattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6147015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Original strand, 47784924 - 47785064
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||||| ||| || |  ||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  47784924 tgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggtgattctg 47785023  T
Q  175 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47785024 taaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 47785064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14295569 - 14295415
Alignment:
Q  16 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||||||||||    
T  14295569 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataattcat 14295470  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14295469 ggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14295415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38168050 - 38167896
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  38168050 attatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaa 38167951  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  38167950 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 38167896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17100783 - 17100636
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  17100783 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 17100684  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17100683 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17100636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17101468 - 17101321
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  17101468 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 17101369  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 162  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17101368 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17101321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329235
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11329181 tgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17139616 - 17139474
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17139616 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatg 17139517  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  17139516 atttgttgttgcgaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 17139474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 172
Target Start/End: Original strand, 14528151 - 14528286
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14528151 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaattcatggcttgggtatgaatgattcatg 14528250  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14528251 atttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 14528286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 9303343 - 9303425
Alignment:
Q  134 catgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9303343 catgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaacgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28558282 - 28558188
Alignment:
Q  71 atggttgttg-ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  28558282 atggttgttgattgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgt 28558188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560510
Alignment:
Q  25 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 124  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | |||| |||||| ||||||||||     
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggta 12560461  T
Q  125 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12560462 tgcatgattcatgatttgatgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 12560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 54424142 - 54423986
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | ||| |  |  | |||||| |||||||    
T  54424142 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattattcatg 54424043  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  54424042 gcttgggtatgcatgattcatgatttgttatgagaaataagttgttgttgttggttt 54423986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 19260956 - 19261104
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | | || |  |  ||| |||||||||    
T  19260956 ctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaatgttaattcatg 19261055  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  19261056 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttatgaaataagttgttgt 19261104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 172
Target Start/End: Original strand, 55440996 - 55441123
Alignment:
Q  46 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| || | ||| || |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  55440996 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgattttttg 55441095  T
Q  145 ttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  55441096 ttgagaaatgagatgttgttggtggttt 55441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14301196 - 14301042
Alignment:
Q  16 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||||||    
T  14301196 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattattcat 14301097  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14301096 gtctttggtttgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14301042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 12349656 - 12349809
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  | |||||||| |||||    
T  12349656 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaatcatg 12349755  T
Q  116 gcttg-----ggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||     |||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  12349756 gcttggccatggtttgcatgattcataatttgatgatgagaaataagttgttgt 12349809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 12488865 - 12489017
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12488865 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgttcataattcatg 12488964  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    | ||  || || ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  12488965 atttaatgatgggaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 12489017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 163
Target Start/End: Original strand, 14059414 - 14059478
Alignment:
Q  100 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14059414 ttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcatgatctgttgatgagaaatgagatgttgt 14059478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17204807 - 17204667
Alignment:
Q  39 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 138  Q
    |||||| |||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  17204807 ttgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatga 17204708  T
Q  139 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 178  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17204707 tttgttgatgagaaatgagttgttgttagtggttttgtaaa 17204667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 38811170 - 38811297
Alignment:
Q  61 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttg 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| || | ||||||||||||    
T  38811170 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgatcagaaatgagttg 38811269  T
Q  160 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38811270 ttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38811297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1990873 - 1990759
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt-tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtttt 173  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1990873 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtttt 1990774  T
Q  174 gtaaaatgggttgat 188  Q
    |||||||||||||||    
T  1990773 gtaaaatgggttgat 1990759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Original strand, 17960520 - 17960602
Alignment:
Q  106 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  17960520 ataattcatgacttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgggaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 17960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 34439460 - 34439513
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatc 69  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34439460 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8631912 - 8631801
Alignment:
Q  24 gtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggt 123  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||| ||||| ||||||| |  ||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  8631912 gtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggt 8631813  T
Q  124 ttgcatgattca 135  Q
    ||||||||||||    
T  8631812 ttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 9590918 - 9591035
Alignment:
Q  63 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 161  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  9590918 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgagaaatgagttgtt 9591017  T
Q  162 gtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    || | |||||||||||||    
T  9591018 gttgttggttttgtaaaa 9591035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12953034 - 12952915
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12953034 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 12952935  T
Q  175 t-aaaatgggttgataatga 193  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  12952934 taaaaatgggttgattatga 12952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17938701 - 17938582
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| || ||| || |   ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| || ||||||||||    
T  17938701 aattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcattcatggct 17938602  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga 138  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  17938601 tgggtttacatgattcatga 17938582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15876176 - 15876034
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  15876176 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttaggtattcataattcatg 15876077  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  15876076 atttgtggatgagaaatgagttggtgttggtagtttggtaaaa 15876034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 163
Target Start/End: Original strand, 3576615 - 3576703
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  | | |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3576615 tgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgt 3576703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16880231 - 16880131
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | |||| |||||| | ||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16880231 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatg 16880132  T
Q  138 a 138  Q
    |    
T  16880131 a 16880131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34559969 - 34559857
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||| ||| | || |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34559969 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttg 34559870  T
Q  175 taaaatgggttga 187  Q
    |||||||||||||    
T  34559869 taaaatgggttga 34559857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 28558301 - 28558271
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558301 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17191583 - 17191511
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 178  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17191583 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtt---ggtggttttgtaaa 17191511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11584184 - 11583982
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 112  Q
    |||||||||||||||||||    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11584184 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 11584085  T
Q  113 atggcttggg-tttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  11584084 atggcttgggttttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttcgtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagtttgtttttgatg 11583985  T
Q  212 atg 214  Q
    |||    
T  11583984 atg 11583982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2031946 - 2031783
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2031946 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataa 2031847  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  2031846 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 2031783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11342821 - 11342635
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttagtcatatgtttgatgata 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  11342821 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatg 11342722  T
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 193  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  11342721 atatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgtcttggtgaaaatgggttgattatga 11342635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 1168321 - 1168500
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  1168321 ctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 1168420  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  1168421 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28261651 - 28261498
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  28261651 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataattcatg 28261552  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28261551 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 28261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21397222 - 21397073
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg---ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  21397222 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 21397123  T
Q  113 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  21397122 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgtt 21397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21205062 - 21204898
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |  || ||  |||    
T  21205062 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttatttattctaa 21204963  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21204962 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 21204898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 21646857 - 21647009
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21646857 tcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatg-ttgatgataattcatg 21646955  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||| || |||  | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21646956 gcttgggtttgtataattattggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 21647009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 11337303 - 11337455
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11337303 ctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattcatg 11337402  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11337403 gcttgagtttacatgattcatgattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 11337455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24475708 - 24475560
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  24475708 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaat---tgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 24475614  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24475613 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 24475560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4865393 - 4865239
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa-ttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  4865393 ctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataatttcat 4865294  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4865293 ggcttgggtttgcataattcttgaattgttgttgagagatgaggtgttgttggtg 4865239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20712206 - 20712036
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||    
T  20712206 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatg 20712107  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20712106 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20712036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21650831 - 21650668
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  21650831 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 21650732  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21650731 ttcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgtggtgaaataagttgttgttgttggttt 21650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16105656 - 16105573
Alignment:
Q  133 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16105656 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16105573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21906846 - 21906729
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  21906846 tcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatgg 21906750  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21906749 cttgggtttgcatgattcatg 21906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Original strand, 109075 - 109158
Alignment:
Q  133 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  109075 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgatagagaagaagtttgattttgatgatgt 109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Original strand, 24183249 - 24183370
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | || |||||||| |  ||||| |   ||||||||||| |||    
T  24183249 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtcatgt---tgatgataattaatg 24183345  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgatt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24183346 gcttgggtttgcatgattcatgatt 24183370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19405658 - 19405503
Alignment:
Q  25 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 124  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||  || |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  19405658 tgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggta 19405559  T
Q  125 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  19405558 tgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 19405503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728378
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||| || |||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgct 7728448  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  7728447 tgggtgtgcataattcatgaattgttggtgagagatgaggtgttgttggtgactttgaaaaatgggttga 7728378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23466557 - 23466434
Alignment:
Q  46 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgtt 143  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23466557 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 23466459  T
Q  144 gttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||    
T  23466458 gttgaggaatgatatgttgttggtg 23466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673818
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||  |  || |||||||| ||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggct 3673890  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    ||||| | ||| | ||| || ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  3673889 tgggtgttcataaatcacgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 3673818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21617124 - 21616974
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  21617124 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcatg 21617025  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21617024 atttgatgatgagaagtgagctgttgtggttggttttgtaaaatgggttga 21616974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493875
Alignment:
Q  25 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 124  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| |||||||||||||||     
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtg 23493941  T
Q  125 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||| ||||||    
T  23493940 ttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgagttgat 23493875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16595550 - 16595474
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  16595550 tgataattcatgacttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 16595474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Original strand, 32966352 - 32966436
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32966352 tgataattcatggcttgagcgtgcataattcataattggttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 32966436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19862336 - 19862183
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  |||||  |||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||    
T  19862336 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgact 19862237  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtt 171  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19862236 tgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtt 19862183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 214
Target Start/End: Original strand, 24225596 - 24225634
Alignment:
Q  176 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24225596 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 24225634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6456694 - 6456580
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | || |||||    
T  6456694 tgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtttttg 6456595  T
Q  175 ta-aaatgggttgat 188  Q
    || ||| ||||||||    
T  6456594 tacaaacgggttgat 6456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37983434 - 37983325
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | ||| |||| | || ||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  37983434 tgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcaggatttgatgatgaaaaatgagttgttgt---tggttttg 37983338  T
Q  175 taaaatgggttga 187  Q
    |||||||||||||    
T  37983337 taaaatgggttga 37983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29918035 - 29917931
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  29918035 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgttgagaaataaattattgtcgttggttttg 29917936  T
Q  175 taaaa 179  Q
    |||||    
T  29917935 taaaa 29917931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 75
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  274 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 175  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  174 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgctgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3230
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T
Q  138 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3307 attgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18583453 - 18583264
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||                |||||||    
T  18583453 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttg----------------atgataa 18583370  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18583369 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttga 18583270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 35015276 - 35015447
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  35015276 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 35015375  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35015376 tacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 35015447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 19983416 - 19983581
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||    
T  19983416 ctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatg 19983515  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19983516 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 19983581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744483
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25744431 cttgggtttgcataattcttggtttgttgtagagaaatgagatgttgttggtg 25744483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Original strand, 18823573 - 18823712
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 175  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18823573 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgt 18823672  T
Q  176 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18823673 aaaatggcttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 18823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26089871 - 26089718
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  26089871 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 26089772  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  26089771 ttcatggtttgggtatgcatgattcataattgttgttgtgaaataagttgttgt 26089718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32898920 - 32898779
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  32898920 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattaatg 32898821  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 156  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32898820 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 32898779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Original strand, 18839428 - 18839567
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 175  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18839428 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgt 18839527  T
Q  176 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  18839528 aaaatgagttgaaaaagaagaagtttgattttgatgatgt 18839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 18002615 - 18002777
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |  | |||| |||    
T  18002615 attatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaa 18002714  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18002715 ttcatggcttgggtatgcatgattcatacttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18002777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23995059 - 23994904
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  23995059 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 23994960  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23994959 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 23994904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22441064 - 22440911
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  22441064 ctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 22440965  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  22440964 gcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 22440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31628395 - 31628245
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31628395 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 31628296  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  31628295 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 31628245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 15742339 - 15742505
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatgg---ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||| || |  |  |||     
T  15742339 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgc 15742438  T
Q  107 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  15742439 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgctggttt 15742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18777275 - 18777119
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  18777275 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 18777176  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18777175 cttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18777119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 13014826 - 13014979
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||||| ||    
T  13014826 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataattcgtg 13014925  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  13014926 gcttggg-ttgcatgattcttgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 13014979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4991085 - 4991002
Alignment:
Q  133 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4991085 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 4991002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16086144 - 16086001
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||| ||    
T  16086144 aattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgact 16086045  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  16086044 tgggtttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttg 16086001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18432770 - 18432626
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||| |  || || |  |||||||||||||||||||    
T  18432770 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataattcatggct 18432671  T
Q  119 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 162  Q
    ||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| |||||    
T  18432670 tgggtttgcatgattaatggtttattgttgaaaaatgagatgttg 18432626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398890
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 18398966  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 193  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18398965 tgggtgtgcataattcatgaattgtgataagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgattatga 18398890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381965
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 18381902  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18381903 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 18381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18570409 - 18570271
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  18570409 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 18570310  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 153  Q
    || ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  18570309 gcctgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 18570271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Original strand, 17083383 - 17083496
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagttt 201  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || | |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17083383 tgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgattagaaatgagttgttgttgttgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagttt 17083482  T
Q  202 gaatttgatgatgt 215  Q
    || |||||||||||    
T  17083483 gattttgatgatgt 17083496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 22361885 - 22362054
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||    
T  22361885 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 22361984  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22361985 tgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaattgagttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 22362054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Original strand, 25367376 - 25367502
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25367376 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattcatg 25367475  T
Q  138 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25367476 aattgttgatgagaaatgagatgttgt 25367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16106643 - 16106499
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||| |     
T  16106643 aattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgac- 16106545  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
        ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16106544 ----tttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttgttggtg 16106499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 28195259 - 28195367
Alignment:
Q  64 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 162  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  28195259 atgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataatt-atgatttattgttgagaaatgagatgttg 28195357  T
Q  163 tcggtggttt 172  Q
    | ||| ||||    
T  28195358 ttggtagttt 28195367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15740269 - 15740211
Alignment:
Q  106 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15740269 ataattcatggtttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgt 15740211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 179
Target Start/End: Original strand, 18629786 - 18629892
Alignment:
Q  74 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  18629786 gttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 18629885  T
Q  173 tgtaaaa 179  Q
    |||||||    
T  18629886 tgtaaaa 18629892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25651345 - 25651197
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  25651345 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 25651246  T
Q  138 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  25651245 attggatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 25651197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25919655 - 25919571
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  25919655 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgaaaaatgagttattgttggtgactttgtaaaatgagttga 25919571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33324735 - 33324675
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  33324735 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 33324675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 163
Target Start/End: Original strand, 35136217 - 35136277
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  35136217 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 35136277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 41506928 - 41507091
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41506928 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataa 41507027  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41507028 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 41507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 24716981 - 24717152
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  24716981 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatga 24717080  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24717081 tacatggcttgggtttgcatgattcataatttgttgttgataaatggattgttgttggtggttttgtaaaat 24717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39115411 - 39115267
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39115411 attatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 39115312  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 153  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  39115311 ttcatgacttgtgtatgcatgattcataatttattgttgagaaat 39115267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41246785 - 41246635
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  41246785 aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggct 41246686  T
Q  119 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41246685 tgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 41246635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 19993171 - 19993324
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19993171 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 19993270  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19993271 gctagggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19993324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 22234920 - 22235068
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22234920 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 22235019  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    | |||||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  22235020 gattgggtttgcataattcttggtttgttgttgaggattgagatgttgt 22235068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 20573309 - 20573461
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  20573309 ctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 20573408  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573409 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37611798 - 37611675
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  37611798 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatg 37611699  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgatt 140  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37611698 gcttggg-ttgcataattcatgatt 37611675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20481735 - 20481565
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||    
T  20481735 ctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatg 20481636  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20481635 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20481565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 274572 - 274416
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  274572 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 274473  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  274472 cttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 274416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Original strand, 641277 - 641433
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  641277 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 641376  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  641377 cttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 641433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Original strand, 827083 - 827239
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  827083 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 827182  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  827183 cttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 827239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 16039000 - 16039176
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  16039000 attatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 16039099  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    || ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  16039100 tttatggcttggatatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 16039176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 20647949 - 20648087
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||| |||||||    
T  20647949 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatccatggct 20648048  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20648049 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20648087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 20654025 - 20654163
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  20654025 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaattcattgct 20654124  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20654125 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 39446892 - 39447046
Alignment:
Q  25 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 124  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||     
T  39446892 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 39446991  T
Q  125 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  39446992 tgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 39447046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Original strand, 20567200 - 20567268
Alignment:
Q  100 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567200 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 168
Target Start/End: Original strand, 20567335 - 20567427
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567335 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 168
Target Start/End: Original strand, 20573528 - 20573620
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573528 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122513
Alignment:
Q  64 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgtt 161  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgtt 25122520  T
Q  162 gtcggtg 168  Q
    || ||||    
T  25122519 gttggtg 25122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533607
Alignment:
Q  25 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 124  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtg 38533671  T
Q  125 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||    
T  38533670 tgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggagactttgtaaaatgggttga 38533607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29760005 - 29759893
Alignment:
Q  83 gttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaat 180  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||  ||||    
T  29760005 gttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgttgttggtgttttggtgtaaat 29759906  T
Q  181 gggttgataatga 193  Q
    |||||||| ||||    
T  29759905 gggttgattatga 29759893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5854722 - 5854572
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  5854722 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 5854623  T
Q  138 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5854622 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 5854572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21681121 - 21680984
Alignment:
Q  27 aattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttg 126  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||  || |  || || |  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21681121 aattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatg 21681022  T
Q  127 catgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  21681021 catgattcatgatttgttgtggagaaataagatgttgt 21680984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Original strand, 22736046 - 22736127
Alignment:
Q  107 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22736046 taattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattgttgatgaaaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 22736127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837163
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 23837226  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23837225 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtgaaat 23837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15969860 - 15969796
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  15969860 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattgtagaggagaaatgagttgttgttggtg 15969796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26011602 - 26011452
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  26011602 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 26011503  T
Q  138 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26011502 atttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 26011452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 180
Target Start/End: Original strand, 21198362 - 21198434
Alignment:
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21198362 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtggtttggtaaaat 21198434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33528533 - 33528383
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  33528533 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatat-tttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 33528435  T
Q  138 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 188  Q
    ||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  33528434 atttgatgatgagaaatgggttgttgttgttgattttgtaaaatgggttgat 33528383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15933406 - 15933256
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |   | | |||||    
T  15933406 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatcatg 15933307  T
Q  138 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||| |  | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15933306 atttgaagatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 15933256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 24385871 - 24385988
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||         ||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  24385871 attatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattgtaat---------gatcaatagatgttgttgttgttaagtgattttatggatgctaa 24385961  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24385962 ttcatggcttgggtatgcatgattcat 24385988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Original strand, 20561751 - 20561804
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaat 72  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20561751 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 188
Target Start/End: Original strand, 23226240 - 23226368
Alignment:
Q  63 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgtt 161  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |  |||||||||  |||||    
T  23226240 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgattatgagaaatggattgtt 23226339  T
Q  162 gtcggtggttttgta--aaatgggttgat 188  Q
    || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23226340 gttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23226368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23149865 - 23149736
Alignment:
Q  62 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 160  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| | ||| || |  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  23149865 tcatgttcaatagttgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgatgatgaaaaatgagttgt 23149766  T
Q  161 tgtcggtggttttgta--aaatgggttgat 188  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23149765 tgttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23149736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 180
Target Start/End: Original strand, 24929018 - 24929087
Alignment:
Q  111 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24929018 tcattgcttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 24929087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 180
Target Start/End: Original strand, 31194488 - 31194606
Alignment:
Q  63 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 161  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  31194488 catgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgcacatgattcatgatttgttggtgaaaaatgagttgtt 31194587  T
Q  162 gtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  31194588 gttggtgactttgtaaaat 31194606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17285309 - 17285232
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17285309 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcaaaat 17285232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22742833 - 22742717
Alignment:
Q  74 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||| |||||||||| | ||| | || | | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22742833 gttgttgttgttgttgaggaatattgttgttgatgattcgtggcttgggtgttcataaatcttggtttgttgatgagaaataagttgttgttgttggttt 22742734  T
Q  173 tgt-aaaatgggttgat 188  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22742733 tgtaaaaatgggttgat 22742717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 179
Target Start/End: Original strand, 27233244 - 27233348
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | |  |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  27233244 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgataatgagaaataagttgttgttgttggttttg 27233343  T
Q  175 taaaa 179  Q
    |||||    
T  27233344 taaaa 27233348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21642 - 21442
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| | | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  21642 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 21543  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21542 gcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 21443  T
Q  215 t 215  Q
    |    
T  21442 t 21442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31341 - 31141
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||| |||||| |   |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  31341 ctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 31242  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31241 gcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaaaaagtttgattttgatgatg 31142  T
Q  215 t 215  Q
    |    
T  31141 t 31141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25088 - 24890
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||||||    
T  25088 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatg 24989  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24988 gcttgggtt-gcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 24890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25341 - 25212
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||||||    
T  25341 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatg 25242  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgtt 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25241 gcttggg-ttgcatgattcatgattgttgtt 25212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 111388 - 111550
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  111388 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 111487  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  111488 ttcatggcttgggtatgcatgattcaaatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 111550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 126551 - 126366
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |    
T  126551 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatgatga 126452  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg-taaaatgggttgataatga 193  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  126451 tacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggagaaaatgggttgattatga 126366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 7284180 - 7284376
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  7284180 aattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataattcatggct 7284279  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  7284280 tgagtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgttaaatgggttgataatggagaagtttgattttgacgatgt 7284376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 32494165 - 32494341
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32494165 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatgataa 32494264  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  32494265 ttcatggcttgtgtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 32494341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046893
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 39046839  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39046840 gcttgggtttgcataattcttgatctgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 39046893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11287547 - 11287390
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11287547 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 11287448  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11287447 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11287390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Original strand, 42056408 - 42056563
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||  |  ||| |||    
T  42056408 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatgctaa 42056507  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  42056508 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 42056563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35094946 - 35094794
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  35094946 ctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaatg-ttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaatcatg 35094848  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35094847 gcttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 35094794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Original strand, 2190305 - 2190460
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  2190305 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaa 2190404  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2190405 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2190460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12759117 - 12758965
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||    
T  12759117 ctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataattcatg 12759018  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  12759017 gcttgggtttgcaggatttatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 12758965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3049719 - 3049565
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  3049719 attatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaa 3049620  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  3049619 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 3049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2029057 - 2028893
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||| || |  | |||| |||    
T  2029057 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaagtgatgttatggatgctaa 2028958  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  2028957 ttcatgacttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 2028893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 15822548 - 15822701
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||    
T  15822548 ctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatg 15822647  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15822648 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 15822701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452435
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatg 45452404  T
Q  138 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45452405 atttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 45452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3895155 - 3894998
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  3895155 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 3895056  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  3895055 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 3894998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 16570122 - 16570287
Alignment:
Q  16 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||||||    
T  16570122 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcat 16570221  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16570222 ggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16570287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16595540 - 16595375
Alignment:
Q  16 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||||||    
T  16595540 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcat 16595441  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16595440 ggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16595375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 26070384 - 26070529
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  26070384 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26070483  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26070484 tgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26070529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 26094171 - 26094316
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  26094171 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26094270  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26094271 tgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26094316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47289911 - 47289758
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |   |||||||||||||||    
T  47289911 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgataattcatg 47289812  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  47289811 gcttgtg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 47289758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 1937131 - 1937290
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  1937131 attatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaatt------------atgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatga 1937218  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||    
T  1937219 tacatgacttgggtttgcatgattcataattttttgttgagaaatggattattgttggtggttttgtgaaat 1937290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 12248237 - 12248395
Alignment:
Q  16 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | ||||||||| |||    
T  12248237 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataatgcat 12248336  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12248337 gacttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 12248395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44865360 - 44865204
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt---agtcatatgtttgatgataattc 112  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||| |  || ||||||||||    
T  44865360 ctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgttgttaagtcatgtagtttatgataattc 44865261  T
Q  113 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  44865260 atggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 44865204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 49047813 - 49047955
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49047813 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatggcttgggtatgcatgattcatg 49047912  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  49047913 atttgttgttgagaaacgagatgttgttggtagtttggtaaaa 49047955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13274918 - 13274753
Alignment:
Q  16 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||    
T  13274918 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcat 13274819  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  13274818 ggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 13274753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 14272049 - 14272203
Alignment:
Q  62 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 160  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  14272049 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgattagatgatgagaaatgagttgt 14272148  T
Q  161 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  14272149 tggtggtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagttttattttaatgatgt 14272203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 143769 - 143622
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||      ||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||    
T  143769 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa------ttgttgttgttaagtcatgttgttaatgataattcatg 143676  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  143675 gcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 17224048 - 17224220
Alignment:
Q  10 attatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || |||||     
T  17224048 attatactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatg 17224147  T
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17224148 attcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 17224220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 12369957 - 12370127
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| || |  |  || || |||||||    
T  12369957 ctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattattcatg 12370056  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || | |||||| || |||||||||    
T  12370057 gcttaggtatgcatgattcatgatttgttattgagaaataagttgtagttgttggtttggtgaaaatgggt 12370127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Original strand, 16915067 - 16915217
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  16915067 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 16915166  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    | ||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16915167 atttgatgaagagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 16915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48356752 - 48356602
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  48356752 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 48356653  T
Q  138 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48356652 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 48356602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13377666 - 13377485
Alignment:
Q  10 attatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 108  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||     
T  13377666 attatactcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatg 13377567  T
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  13377566 attcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 13377485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4484797 - 4484683
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||   ||||||||    
T  4484797 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgtgcttggttttg 4484698  T
Q  175 t-aaaatgggttgat 188  Q
    | |||||||||||||    
T  4484697 taaaaatgggttgat 4484683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4446249 - 4446168
Alignment:
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  4446249 attcatggcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgtgaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 4446168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14935400 - 14935319
Alignment:
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14935400 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 14935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15362993 - 15362912
Alignment:
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15362993 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 15362912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Original strand, 34241393 - 34241477
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  34241393 tgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaagggttga 34241477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 6202 - 6373
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  6202 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatgatga 6301  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6302 tacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 31399 - 31570
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  31399 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 31498  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31499 tacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 31570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41445 - 41274
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  41445 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 41346  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  41345 tacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 41274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14951898 - 14951713
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |    
T  14951898 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatgatga 14951799  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 193  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  14951798 tatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 14951713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 25119333 - 25119498
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||    
T  25119333 tcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataatgatacatgg 25119432  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25119433 cttgggtttgcatgattcataattttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25119498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 53704850 - 53705003
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  53704850 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 53704949  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53704950 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53705003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 5682646 - 5682817
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| |    
T  5682646 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttattcatattgttgatgatga 5682745  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5682746 tatatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 5682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 55376710 - 55376893
Alignment:
Q  12 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |  ||||||||||||    
T  55376710 tatactcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataatt 55376809  T
Q  112 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  55376810 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgatgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 55376893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34395387 - 34395222
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  34395387 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 34395288  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  34395287 gcttgagtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 34395222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 23270047 - 23270204
Alignment:
Q  12 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  23270047 tatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 23270146  T
Q  112 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23270147 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 23270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44056045 - 44055892
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  44056045 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataattcatg 44055946  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44055945 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 44055892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16732299 - 16732146
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  16732299 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 16732200  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16732199 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 16732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44346957 - 44346816
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  44346957 ctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataattcatg 44346858  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 156  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  44346857 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 44346816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 53907818 - 53907966
Alignment:
Q  18 caattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  53907818 caattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgattagtcatgttgttgatgataattcatggc 53907914  T
Q  118 ttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53907915 ttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53907966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30458033 - 30457880
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  30458033 ctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatg 30457934  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||| |||||| |||||| |  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  30457933 gcttggg-ttgcataattcattattttgttatagagaaatgagatgttgttggtg 30457880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 153
Target Start/End: Original strand, 21959580 - 21959718
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21959580 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 21959679  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaat 153  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21959680 gcttgggcttgcatgattcatagtttgtggttgagaaat 21959718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Original strand, 15272431 - 15272586
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  15272431 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 15272530  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15272531 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 15272586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Original strand, 820033 - 820177
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  820033 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 820129  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttg 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||    
T  820130 gcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttg 820177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Original strand, 8872588 - 8872699
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 112  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  8872588 ctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataactc 8872687  T
Q  113 atggcttgggtt 124  Q
    ||||||||||||    
T  8872688 atggcttgggtt 8872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16522851 - 16522748
Alignment:
Q  113 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 211  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16522851 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatg 16522752  T
Q  212 atgt 215  Q
    ||||    
T  16522751 atgt 16522748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 12837317 - 12837464
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  12837317 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 12837416  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  12837417 gcttgggtatgcatgattcatgatttgttg-tgagaaataagttgttgt 12837464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 30232613 - 30232761
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  30232613 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 30232712  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  30232713 gcttgggtatgcattattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 30232761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 172
Target Start/End: Original strand, 18494467 - 18494602
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| || || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18494467 gttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggtatgcatgattcatg 18494566  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18494567 acttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 18494602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9295727 - 9295624
Alignment:
Q  113 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 211  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9295727 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttatgtaaaatgagttgataaagaagaagtttgattttgatg 9295628  T
Q  212 atgt 215  Q
    ||||    
T  9295627 atgt 9295624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 13809636 - 13809775
Alignment:
Q  25 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 124  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | | | || |  |||||||||||||||||||||| |     
T  13809636 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggata 13809735  T
Q  125 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13809736 tgcatgattcatgattggttgttgagaaatgagatgttgt 13809775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Original strand, 45458973 - 45459096
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||| |||||| |||||    
T  45458973 tcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatccatgg 45459072  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatgatt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45459073 cttgggtttgcatgattcatgatt 45459096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27961078 - 27960938
Alignment:
Q  39 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 138  Q
    |||||| |||||| | ||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27961078 ttgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt-atga 27960980  T
Q  139 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
     || ||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||    
T  27960979 tttattgttgagaaatgagatattgttggtagtttggtaaaa 27960938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Original strand, 37957230 - 37957314
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37957230 tgataattcacggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 37957314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 7185983 - 7186159
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || | |||||    
T  7185983 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatcatg 7186082  T
Q  138 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7186083 atttgatgatgagatatgagttgttgt---tgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7186159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 187
Target Start/End: Original strand, 7964890 - 7965000
Alignment:
Q  78 ttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta 176  Q
    ||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7964890 ttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgta 7964989  T
Q  177 aaatgggttga 187  Q
    |||||||||||    
T  7964990 aaatgggttga 7965000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265749
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||   || |||| ||||||||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggct 52265727  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgatt 140  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  52265728 tgggtgttcataattcatgatt 52265749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Original strand, 19821981 - 19822065
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||    
T  19821981 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtttttggtgactttgtaaaatgagttga 19822065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15044955 - 15044784
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  15044955 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 15044856  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15044855 tgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15044784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14901274 - 14901197
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14901274 tgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatgagaaatgggttgttgttggtggttttgtaaaat 14901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 15109459 - 15109640
Alignment:
Q  10 attatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 108  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||     
T  15109459 attatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatg 15109558  T
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15109559 attcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15109640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 180
Target Start/End: Original strand, 47535251 - 47535328
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47535251 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttaatgagaaatgagttgttgttgatggttttgtaaaat 47535328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Original strand, 41166109 - 41166228
Alignment:
Q  62 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 160  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| | ||||||||||||| | ||| | | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  41166109 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcataacttatgatttgttgatgagaaatgagttgt 41166208  T
Q  161 tgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  41166209 tgtgggtggttttgtgaaat 41166228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Original strand, 41256546 - 41256660
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  41256546 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 41256645  T
Q  175 t-aaaatgggttgat 188  Q
    | |||||||||||||    
T  41256646 taaaaatgggttgat 41256660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18276541 - 18276392
Alignment:
Q  39 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 138  Q
    |||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | |||||||||||   ||| ||||  ||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  18276541 ttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatga 18276442  T
Q  139 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    || |  | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18276441 tttgacgatgagtattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 18276392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 234 - 430
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||| |||    
T  234 aattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatagct 333  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  334 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagcttttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 215
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6679
Alignment:
Q  139 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6603 ttgttgttgagaattgagttgttcttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 6679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 12639 - 12802
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12639 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 12738  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  12739 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 172
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19183
Alignment:
Q  39 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataa 19148  T
Q  139 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  19149 tttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 19183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30202 - 30056
Alignment:
Q  35 atggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202 atggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 30103  T
Q  135 atga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  30102 atgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 30056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 80000 - 79846
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80000 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 79901  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  79900 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 79846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 46295 - 46171
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  46295 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgattcatg 46196  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgatt 140  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  46195 gcttgggtgttcataattcatgatt 46171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40788 - 40664
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||    |||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  40788 ctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 40689  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgatt 140  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  40688 gcttgggtgttcataattcatgatt 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22367154 - 22366970
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  22367154 attatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 22367056  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 193  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  22367055 tacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 22366970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21860147 - 21859984
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  21860147 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 21860048  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21860047 tacatggctcgggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatgaattgttgttgttggttt 21859984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 15861545 - 15861728
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |    
T  15861545 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt--ttgtttagtcatattgttgatgatga 15861642  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 193  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  15861643 tgcatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 15861728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 44035090 - 44035255
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  44035090 attatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgatga 44035189  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 175  Q
     | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  44035190 -taatggcttgagtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 44035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49967780 - 49967628
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||     
T  49967780 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatt 49967681  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  49967680 gcttcggtttgcatgattcatggttgttgttgaggaatgagatgttgttggtg 49967628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 35522436 - 35522588
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  35522436 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataattcatg 35522535  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35522536 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35522588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41212202 - 41212046
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt---tgtttagtcatatgtttgatgataattc 112  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41212202 ctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 41212103  T
Q  113 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41212102 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 41212046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21718358 - 21718206
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  21718358 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 21718259  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21718258 gcttgggtttgcatgattcatggttgttcttgagaaatgagatgttgttggtg 21718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 22403227 - 22403375
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  22403227 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 22403326  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  22403327 gcttgggttt-catgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgt 22403375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35054886 - 35054716
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  35054886 ctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 35054787  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35054786 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtggaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 35054716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 179
Target Start/End: Original strand, 51627805 - 51627945
Alignment:
Q  40 tgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 138  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51627805 tgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 51627903  T
Q  139 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  51627904 tttgctgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 51627945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 27329872 - 27330026
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  27329872 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 27329971  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  ||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  27329972 gcttgggtatgcatgattcataat--ttgttgtcaaataagttgttgttgttggttt 27330026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27674838 - 27674755
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  27674838 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 27674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 186
Target Start/End: Original strand, 22829629 - 22829712
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22829629 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttg 22829712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Original strand, 9784239 - 9784341
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9784239 gttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcatg 9784338  T
Q  138 att 140  Q
    |||    
T  9784339 att 9784341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17609036 - 17608886
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  17609036 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 17608937  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    | ||| |  |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17608936 atttgattatgagaattgagttgttgttgttggttttggaaaatgggttga 17608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19603139 - 19603055
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  19603139 tgataattcatgacttgggtgtgaataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 19603055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Original strand, 38033882 - 38033962
Alignment:
Q  107 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38033882 taattcatggcttgggtgtgcatagttcacgattgttgatgagaaataagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38033962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20177245 - 20177140
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20177245 tgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttggatattcataattcatgatttgttgaagagaaatgagttgttgttggtggttttg 20177146  T
Q  175 taaaat 180  Q
    | ||||    
T  20177145 tgaaat 20177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Original strand, 20955644 - 20955728
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  20955644 tgataattcatggcttcggtgtgaataattcgtgaattgttggtgtgaaatgagttgttgtgggtgactttgtaaaaggggttga 20955728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21195084 - 21194980
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  21195084 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 21194985  T
Q  175 taaaa 179  Q
    |||||    
T  21194984 taaaa 21194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Original strand, 13377003 - 13377122
Alignment:
Q  62 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgt 160  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| | |||||||||||| || | ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  13377003 tcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgaattgt 13377102  T
Q  161 tgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||| || |||||||| ||||    
T  13377103 tgttggcggttttgtgaaat 13377122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 37234022 - 37234149
Alignment:
Q  61 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttg 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | |||||||| | || ||| || ||||||     
T  37234022 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgtccataaatcatgatttgatgatgaaaattgagttt 37234121  T
Q  160 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37234122 ttgtggttggttttgtaaaatgggttga 37234149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 9784184 - 9784248
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 86  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  9784184 aattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9784248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 180
Target Start/End: Original strand, 41229149 - 41229221
Alignment:
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  41229149 attcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaat 41229221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 162297 - 162469
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttagtcatatgtttgatgata 108  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  162297 attatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatg 162396  T
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  162397 atatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 162469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 164345 - 164204
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  164345 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaattcatg 164246  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 156  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  164245 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 164204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 166383 - 166547
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||  |||||||| |    
T  166383 attatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt-------taatattgttgatgatga 166475  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  166476 tacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaaaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 166547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 180
Target Start/End: Original strand, 116690 - 116795
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  116690 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggttttg 116789  T
Q  175 taaaat 180  Q
    ||||||    
T  116790 taaaat 116795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22274858 - 22274688
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  22274858 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatga 22274759  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22274758 tagatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 22274688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 23836822 - 23836975
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  23836822 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcattttgttgatgataattcatg 23836921  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
     ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23836922 acttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 23836975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32465988 - 32465835
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32465988 ctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 32465889  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32465888 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32465835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22284091 - 22283921
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||  |||||||| |    
T  22284091 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatgatga 22283992  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22283991 tacatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgctgttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaat 22283921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 25876036 - 25876206
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25876036 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 25876135  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  25876136 gcttgggtttgcataattcttggcttgttattgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 25876206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 19433495 - 19433649
Alignment:
Q  62 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 160  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19433495 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 19433594  T
Q  161 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19433595 tgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 19433649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 9653015 - 9653179
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  9653015 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaa 9653114  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9653115 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9653179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 4448251 - 4448402
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||    
T  4448251 tcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 4448350  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4448351 cttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaaaaatgagatgttgttggtg 4448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6879571 - 6879414
Alignment:
Q  12 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||     
T  6879571 tatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatgataata 6879472  T
Q  112 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||| |||||||||  || |||| | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6879471 catgtcttgggtttaaataattcttggtttgttgttgagaattgagatgttgttggtg 6879414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Original strand, 21274168 - 21274319
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  21274168 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 21274267  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 160  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21274268 ttcatggcttggg-tagcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21274319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28974179 - 28974026
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||| |||| |||||||||   |||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  28974179 ctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 28974080  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28974079 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtg 28974026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 271300 - 271148
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||     
T  271300 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcata 271201  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  271200 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaggaatgagatgttgttggtg 271148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25602154 - 25601989
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||| |||||    
T  25602154 ctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaatcatg 25602055  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25602054 gcttaggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25601989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 36890805 - 36890972
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  36890805 aattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 36890904  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  36890905 tgggtatgcatgattcttgatttgttgttgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 36890972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27261900 - 27261783
Alignment:
Q  52 ttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgaga 150  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27261900 ttgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttaaga 27261801  T
Q  151 aatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  27261800 aatgagatgttgttggtg 27261783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Original strand, 24826961 - 24827044
Alignment:
Q  133 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24826961 tcatgattgttgttgagaaaatgagctgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgatattgatgatgt 24827044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3529
Alignment:
Q  61 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgt 160  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3403 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattgtagatgagaaatgagttgt 3502  T
Q  161 tgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3503 tgttggtgactttgtaaaatgggttga 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Original strand, 22579999 - 22580140
Alignment:
Q  39 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 138  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || || |  || || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22579999 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 22580098  T
Q  139 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  22580099 tttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 22580140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25213081 - 25212977
Alignment:
Q  113 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag--aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgat 210  Q
    ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  25213081 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaaatttgattttgat 25212982  T
Q  211 gatgt 215  Q
    |||||    
T  25212981 gatgt 25212977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 24571408 - 24571572
Alignment:
Q  16 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||   ||| ||| |||||| || || | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |||||||||| ||||    
T  24571408 ctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataactcat 24571507  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    | ||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  24571508 g-cttggctatgtatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 24571572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43645886 - 43645824
Alignment:
Q  153 tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43645886 tgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttggtaatgaaaaagtttgattttgatgatgt 43645824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 722437 - 722353
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  722437 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttattgatgagatatgagttgttgttggtgactttgtaaaattggttga 722353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 67952
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggct 68020  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    || || | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  68019 tgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 67952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24884684 - 24884643
Alignment:
Q  147 gagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 188  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24884684 gagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgat 24884643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25305487 - 25305416
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25305487 tgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtagttttg 25305416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 23821767 - 23821892
Alignment:
Q  61 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23821767 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23821866  T
Q  160 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23821867 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23821892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 23830846 - 23830971
Alignment:
Q  61 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23830846 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23830945  T
Q  160 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23830946 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23830971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 570 - 736
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||| |    
T  570 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatgatga 669  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 175  Q
    | |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  670 tacatggcttgggtttgcatgattaataatttgttgttgagaaatggattattgttggtggttttgt 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Original strand, 11825 - 11970
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11825 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 11924  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 161  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11925 gcttgagtttgcatggttcatgattggtgttgagaaatgagatgtt 11970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32333 - 32180
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32333 ctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 32234  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32233 gcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 41970 - 42123
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  41970 ctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 42069  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42070 gcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 42123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 132367 - 132520
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  132367 ctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 132466  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  132467 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 132520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11818 - 11660
Alignment:
Q  16 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |  |  |||||||||||||||    
T  11818 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataattcat 11719  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11718 ggcttggttatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 88404 - 88289
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||||| |||    
T  88404 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaattcttgg 88305  T
Q  117 cttgggtttgcatgat 132  Q
    ||||||| ||||||||    
T  88304 cttgggtatgcatgat 88289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 70739 - 70892
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  70739 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 70838  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  70839 acttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 70892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 60940 - 60784
Alignment:
Q  12 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 111  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  60940 tatacttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 60841  T
Q  112 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  60840 catgacttgggtttgcatgattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 60784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 5363 - 5516
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  5363 ctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 5462  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5463 gtttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 5516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9156
Alignment:
Q  16 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||    
T  8998 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcat 9097  T
Q  115 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9098 ggcttaggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtcggtggttt 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22821 - 22668
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  22821 ctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataattcatg 22722  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22721 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgttgttggtg 22668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 6962 - 7118
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6962 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 7061  T
Q  113 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7062 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 939 - 1092
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  939 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 1038  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1039 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109736
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 109681  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  109682 tgggattgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 109736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Original strand, 118081 - 118237
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  118081 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatgg 118180  T
Q  117 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  118181 cttggggttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 118237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 1097 - 1261
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  1097 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 1196  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1197 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgagaaataagttgttgttgttggttt 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 13505 - 13669
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  13505 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 13604  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  13605 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 13669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Original strand, 21479 - 21634
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  21479 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 21578  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  21579 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 21634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15085 - 14921
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  15085 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 14986  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  14985 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 254931 - 255084
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  254931 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 255030  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  255031 gcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 255084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 261537 - 261690
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  261537 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 261636  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  261637 gcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17686
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  17523 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 17622  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  17623 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatatgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15004 - 14854
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15004 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 14908  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14907 gcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14288 - 14194
Alignment:
Q  75 ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14288 ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7699 - 7556
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  7699 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 7600  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 161  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||    
T  7599 gcttgggtttgcatgattc--gttggttgttgagaaatgagatgtt 7556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 85459 - 85321
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  85459 aattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtt 85360  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85359 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 85321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 159436 - 159275
Alignment:
Q  10 attatactcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 108  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||   |||| || |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |   ||||||||    
T  159436 attatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt---tgatgata 159340  T
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  159339 atttttggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 159275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 693 - 846
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  693 ctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 792  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  793 gcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38428 - 38287
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||     
T  38428 ctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcata 38329  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 156  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38328 acttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 38287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 253106 - 253271
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||| |    
T  253106 ctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataattcaag 253205  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  253206 gcttgggtttgcatgattcatgatttcttgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 253271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 9903
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||    
T  10067 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattattcatg 9968  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  9967 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 15588 - 15761
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||    
T  15588 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgctaattc 15687  T
Q  113 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  15688 atggcttgggtatgcatgattcataattttttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9117 - 8960
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  9117 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 9018  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9017 gcttgggtttgcttgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 635 - 788
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  635 ctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataattcatg 734  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  735 gcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 55717 - 55553
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  55717 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 55618  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  55617 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 55553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 187
Target Start/End: Original strand, 93973 - 94061
Alignment:
Q  100 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  93973 ttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttgttggtgagaaatgagatgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 94061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 163
Target Start/End: Original strand, 104799 - 104887
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  104799 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgt 104887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1300
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  1444 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggct 1345  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1344 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttg 1300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 11771 - 11921
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11771 ctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 11867  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||| |||||| | ||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  11868 gcttggg-ttgcataactcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 11921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Original strand, 6662 - 6816
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  6662 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 6761  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  6762 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10248
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 10193  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  10194 tgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgatggttt 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 193607 - 193770
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  193607 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 193705  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  193706 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgcgaaataagttgttgttgttggttt 193770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Original strand, 186645 - 186799
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  186645 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 186743  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  186744 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 186799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 9626 - 9789
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |  | |||| |||    
T  9626 attatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaa 9725  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9726 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28573 - 28466
Alignment:
Q  109 attcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 207  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28573 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgatttt 28474  T
Q  208 gatgatgt 215  Q
    ||||||||    
T  28473 gatgatgt 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21687 - 21637
Alignment:
Q  165 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21687 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 21637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 95111 - 94948
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||| |||    
T  95111 attatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatgctaa 95012  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  95011 ttcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 94948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 24845 - 25002
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||| ||    
T  24845 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcttg 24944  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24945 gcttgggtattcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 112662 - 112812
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |   || ||||||||||||    
T  112662 ctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgt---tgttgataattcatg 112758  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  112759 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 109698 - 109556
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  109698 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcacgattcatg 109599  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  109598 atttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 187
Target Start/End: Original strand, 103123 - 103211
Alignment:
Q  100 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  103123 ttgatgataattcatggtttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 146731 - 146561
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||||||||    
T  146731 ctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcatgttaattcatg 146632  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 184  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  146631 gcttgggtatgcatgattcataatttgtttttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 146561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1332
Alignment:
Q  42 ttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tt 140  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1485 ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 1386  T
Q  141 gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 193  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  1385 gttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 3
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  151 ctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatg 52  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  51 gcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggattgttgt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3492
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  3589 tgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggaatgttgttggtggttt 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5068 - 4906
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  5068 aattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 4969  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||| | | ||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4968 tggttgttcataattcatgatttgctgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 11688 - 11837
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  11688 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgact 11787  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11788 tgggtttgcataattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48277 - 48124
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  48277 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattcatg 48178  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  48177 gcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 48124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 61725 - 61572
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  61725 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattcatg 61626  T
Q  116 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  61625 gcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 61572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 130589 - 130486
Alignment:
Q  113 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 211  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  130589 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttaataaagaagaagtttgattttgatg 130490  T
Q  212 atgt 215  Q
    ||||    
T  130489 atgt 130486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 79647 - 79521
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| |||| ||   |||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  79647 gttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 79548  T
Q  138 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
     |||| || ||||||||||||||||||    
T  79547 aattggtgatgagaaatgagttgttgt 79521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Original strand, 89586 - 89655
Alignment:
Q  16 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 85  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  89586 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 33854 - 34008
Alignment:
Q  25 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 124  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||     
T  33854 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 33953  T
Q  125 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  33954 tgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 34008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Original strand, 147 - 301
Alignment:
Q  10 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  147 attatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 246  T
Q  110 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  247 ttcatggcttgagtatgcatgattcataatttattgttgtgaaataagttgttgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33789 - 33668
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||    
T  33789 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 33690  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgatt 140  Q
     |||| | ||| ||||||||||    
T  33689 agggtgttcataattcatgatt 33668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 172
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24471
Alignment:
Q  74 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  24372 gttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 24471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31149 - 31010
Alignment:
Q  41 gttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-t 139  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||| || |  || |  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31149 gttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattcatgact 31050  T
Q  140 tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  31049 tgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 70734 - 70676
Alignment:
Q  25 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 83  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  70734 tgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Original strand, 97403 - 97487
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||| | || | |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  97403 tgatgattcatgccttgggttttcataaatcatgatttgatgataagaattgagttgttgttattggttttgtaaaatgggttga 97487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2001 - 1889
Alignment:
Q  61 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 159  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |   |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2001 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattcttggcttgagtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatg 1902  T
Q  160 ttgtcggtggttt 172  Q
    ||||  |||||||    
T  1901 ttgttagtggttt 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 76967 - 77129
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || |  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||  |||| ||||||||||    
T  76967 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggct 77066  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  77067 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 77129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 187
Target Start/End: Original strand, 43975 - 44087
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 174  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43975 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 44074  T
Q  175 taaaatgggttga 187  Q
    |||||||||||||    
T  44075 taaaatgggttga 44087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 270
Alignment:
Q  62 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 160  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || | |||| |||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  393 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgccttgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 294  T
Q  161 tgtcggtggttttgtaaaatgggt 184  Q
    ||| |||||||||||||| |||||    
T  293 tgttggtggttttgtaaactgggt 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4414 - 4351
Alignment:
Q  17 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg 80  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4414 tcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4353 - 4284
Alignment:
Q  100 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4353 ttgatgataattcatggtttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7878 - 7807
Alignment:
Q  102 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7878 gatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3419 - 3308
Alignment:
Q  46 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 144  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||| ||||| | ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3419 tgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg 3320  T
Q  145 ttgagaaatgag 156  Q
    ||||||||||||    
T  3319 ttgagaaatgag 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6708 - 6622
Alignment:
Q  99 tttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 184  Q
    |||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6708 tttgttgatgattcatggcttgggtggtcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggt 6622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 69565 - 69415
Alignment:
Q  38 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 137  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  69565 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 69466  T
Q  138 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  69465 atttgatgatgagaattgaggtgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 69415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2646 - 2483
Alignment:
Q  25 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 124  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||| ||||||     
T  2646 tgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtg 2547  T
Q  125 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 187  Q
    | ||| | |||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  2546 ttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttgttggttttctaaaatgggttga 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13048
Alignment:
Q  155 agttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatga 212  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12990 agttgttgttgatggttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35520 - 35444
Alignment:
Q  104 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35520 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaat 35444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1364
Alignment:
Q  123 tttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 180  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1422 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12694
Alignment:
Q  175 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12734 taaaatgggttgatagtgaagaagtttgattttgatgatgt 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 172
Target Start/End: Original strand, 22715 - 22786
Alignment:
Q  102 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 172  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  22715 gatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 22786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 2436 - 2607
Alignment:
Q  19 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 118  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  2436 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 2535  T
Q  119 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 188  Q
    ||||  | ||| |||||||  ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  2536 tgggcgttcataattcatgttttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 215
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3427
Alignment:
Q  180 tgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3392 tgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 108080 - 107967
Alignment:
Q  76 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 175  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  108080 tgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattttgatgagaaataagttgttgttgttggtttttt 107981  T
Q  176 -aaaatgggttgat 188  Q
     |||||||||||||    
T  107980 aaaaatgggttgat 107967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 184
Target Start/End: Original strand, 5823 - 5875
Alignment:
Q  133 tcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta-aaatgggt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5823 tcatgattgttggtgagaaatgagatgttgttggttgttttgtataaatgggt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University