View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17063_low_100 (Length: 247)

Name: NF17063_low_100
Description: NF17063
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17063_low_100
NF17063_low_100
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (1-245)||(29623106-29623350)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (5-245)||(35385980-35386220)
chr5 (1-208)||(35754819-35755026)
chr5 (5-245)||(35366828-35367068)
chr5 (5-237)||(35410649-35410881)
chr5 (1-245)||(35376374-35376624)
chr5 (1-245)||(35423633-35423883)
chr5 (81-245)||(35370212-35370379)
chr5 (106-206)||(35437020-35437120)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (5-242)||(10420556-10420793)
chr1 (5-245)||(10415669-10415909)
chr1 (104-223)||(10410077-10410196)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (1-237)||(30662998-30663234)
chr2 (1-237)||(30671678-30671914)
chr2 (1-237)||(30626047-30626283)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (5-172)||(1153787-1153954)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (68-223)||(13564620-13564775)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 29623106 - 29623350
Alignment:
Q  1 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29623106 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagact 29623205  T
Q  101 catattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29623206 catattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttc 29623305  T
Q  201 atctttcctagagatttacattctgcaatgaaactctctgctgct 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29623306 atctttcctagagatttacattctgcaatgaaactctttgctgct 29623350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35386220 - 35385980
Alignment:
Q  5 tgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagactcata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||||  |    
T  35386220 tgcatgagctacatcaagagcaatgtctaacctttatgtgaggttgagattatgattttcagacccttcattattgtgcaaaaacttttcaagactctca 35386121  T
Q  105 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttcatct 204  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  35386120 tttgacatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacccttataatcaacacttgaacaacaggttaggaccttgacaagattctggtgcttcatct 35386021  T
Q  205 ttcctagagatttacattctgcaatgaaactctctgctgct 245  Q
    |||| ||||  || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  35386020 ttcccagagcattgcattctgccatgaaactctttgctgct 35385980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35755026 - 35754819
Alignment:
Q  1 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35755026 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctaacctttgtgtgaggttgagattaaaatttcctgacccttcattatcgtgcaacaacttttcaagact 35754927  T
Q  101 catattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttc 200  Q
    |  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  35754926 cccatttgacatgaactcaaaaacaatagctttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaaaatcttgacaagattccggtgcttc 35754827  T
Q  201 atctttcc 208  Q
    ||||||||    
T  35754826 atctttcc 35754819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35367068 - 35366828
Alignment:
Q  5 tgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagactcata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||||||        
T  35367068 tgcatgagctacatcaagagcaatgtcaactctgtgtctgaggctgagattatgatttccagacccttcgttatcatgcagaagcttttctagacttccc 35366969  T
Q  105 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttcatct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35366968 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcttcacccttataatcaatgcttgaacaacaagttaggatcttgacaagatttcggtgcttcatct 35366869  T
Q  205 ttcctagagatttacattctgcaatgaaactctctgctgct 245  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  35366868 ttcctagagcttcacattctgctttgaaactctttgctgct 35366828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35410881 - 35410649
Alignment:
Q  5 tgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagactcata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||  |    
T  35410881 tgcatgagctacatcaagagcaatgtctaacctttgtgtgaggttgagattatgattttcagacccttcgttatcatgcaaaaacttttctagattccca 35410782  T
Q  105 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttcatct 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||    
T  35410781 ttaggcattaactcaaaaacaatagccttgaactcttcaccattataatcaacacttgaacaacacgttaggattttgacaagattacggtgcctcatct 35410682  T
Q  205 ttcctagagatttacattctgcaatgaaactct 237  Q
    ||| || ||  || ||||| || ||||||||||    
T  35410681 ttcttaaagcattgcattccgccatgaaactct 35410649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35376624 - 35376374
Alignment:
Q  1 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccaga-tc-----cttcattatcgtgcaacatcttttc 94  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |  ||| ||| ||     |||| ||| | |||||||  |||||    
T  35376624 ccaatgcatgagctacgtcgagagcaatgtctaacctttgtgtgaaattgagattcagatttctagactcatgatcttcgttaccatgcaacaggttttc 35376525  T
Q  95 tagactcatattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccgg 194  Q
     ||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  35376524 cagattcccactaggcatgaactcaaaaacaatggccttaaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagattacgg 35376425  T
Q  195 tgtttcatctttcctagagatttacattctgcaatgaaactctctgctgct 245  Q
    || ||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35376424 tgcttcatctttcctaaagcattgcattccgcaatgaaactctttgctgct 35376374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35423883 - 35423633
Alignment:
Q  1 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccaga-tc-----cttcattatcgtgcaacatcttttc 94  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |  ||| ||| ||     |||| ||| | |||||||  |||||    
T  35423883 ccaatgcatgagctacgtcgagagcaatgtctaacctttgtgtgaaattgagattcagatttctagactcatgatcttcgttaccatgcaacaggttttc 35423784  T
Q  95 tagactcatattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccgg 194  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  35423783 tagattcccactaggcatgaactcaaaaacaatggccttaaaatcttcaccattataatcaacacttgaacagcaagttaggattttcacaagattacgg 35423684  T
Q  195 tgtttcatctttcctagagatttacattctgcaatgaaactctctgctgct 245  Q
    || ||||||||||||| ||  || |||||  | |||||||||| |||||||    
T  35423683 tgcttcatctttcctaaagcattgcattccaccatgaaactctttgctgct 35423633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35370379 - 35370212
Alignment:
Q  81 tgcaacatcttttctagactcatattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaa-tcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatc 179  Q
    |||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  35370379 tgcaacatgttttctaaactcccattgggcatgaactcaaaaacaatagccttggaactcttcaccattataatcaacacttgagcaacacgttaggatt 35370280  T
Q  180 ttgacaagattccggtgtttcatctttcctagagattt--acattctgcaatgaaactctctgctgct 245  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||  ||  | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  35370279 ttgacaagattacggtgcctcatctttcctaaagcattgcatattccgcaatgaaactctttgctgct 35370212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35437120 - 35437020
Alignment:
Q  106 taggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttcatctt 205  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | ||| ||   ||||||||||||    
T  35437120 taggcatgaattcaaaaactatagccttgaaaacttcaccattataatcaatacttgaacagaaagttaggagcttcagaaggtttttgtgtttcatctt 35437021  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  35437020 t 35437020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 242
Target Start/End: Original strand, 10420556 - 10420793
Alignment:
Q  5 tgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagactcata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||       
T  10420556 tgcatgagctacatcaagagcaatgtcaaccctttgtctgaggctgagattatgaattccagacccttctttatcgtgcagaagcttttctagactcccc 10420655  T
Q  105 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttcatct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10420656 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcttcacccttataatcaacgcttgaacaacaagttaggatcttgacaaggtttcggtgtttcatct 10420755  T
Q  205 ttcctagagatttacattctgcaatgaaactctctgct 242  Q
    ||||||||| ||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  10420756 ttcctagagcttcgcgttctgctttgaaactctttgct 10420793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Original strand, 10415669 - 10415909
Alignment:
Q  5 tgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagactcata 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||       
T  10415669 tgcatgagctagatcaagagcgatgtctaacctttgtgccaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccagactcccc 10415768  T
Q  105 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttcatct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  10415769 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtgcttcatct 10415868  T
Q  205 ttcctagagatttacattctgcaatgaaactctctgctgct 245  Q
    |||||| ||  || |||||  | |||||||||| |||||||    
T  10415869 ttcctaaagcattgcattcctccatgaaactctttgctgct 10415909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Original strand, 10410077 - 10410196
Alignment:
Q  104 attaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttcatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  10410077 attaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttaacaagattccggtgcttcatg 10410176  T
Q  204 tttcctagagatttacattc 223  Q
    ||||| |||| ||| |||||    
T  10410177 tttcccagagctttgcattc 10410196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30663234 - 30662998
Alignment:
Q  1 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  30663234 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtcaaccctttgtgtgaggctgagattatgaattccagactcttcgttatcgtgcagaagcttttctagact 30663135  T
Q  101 catattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttc 200  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||    
T  30663134 ccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcgtcacccttataatctacgcttgaacaacatgtaagaatcttgacaagatttcggtgcttc 30663035  T
Q  201 atctttcctagagatttacattctgcaatgaaactct 237  Q
    |||||||| | || ||| ||||| ||  |||||||||    
T  30663034 atctttcccaaagctttgcattcagctgtgaaactct 30662998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30671914 - 30671678
Alignment:
Q  1 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  30671914 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtcaaccctttgtgtgaggctgagattatgaattccagactcttcgttatcgtgcagaagcttttctagact 30671815  T
Q  101 catattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttc 200  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||    
T  30671814 ccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcgtcacccttataatctacgcttgaacaacatgtaagaatcttgacaagatttcggtgcttc 30671715  T
Q  201 atctttcctagagatttacattctgcaatgaaactct 237  Q
    |||||||| | || ||| ||||| ||  |||||||||    
T  30671714 atctttcccaaagctttgcattcagctgtgaaactct 30671678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30626283 - 30626047
Alignment:
Q  1 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  30626283 ccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtcaaccctttgtgtgaggctgagattatgaattccagactcttcgttatcgtgcagaagcttttctagact 30626184  T
Q  101 catattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtttc 200  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||    
T  30626183 ccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcgtcacccttataatctattcttgaacaacatgtaagaatcttgacaagatttcggtgcttc 30626084  T
Q  201 atctttcctagagatttacattctgcaatgaaactct 237  Q
    |||||||| | || ||| ||||| ||  |||||||||    
T  30626083 atctttcccaaagctttgcattcagctgtgaaactct 30626047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1153954 - 1153787
Alignment:
Q  5 tgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctagactcata 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| ||  || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||       
T  1153954 tgcatgagctatatcaagagcaaaatctaccctttttgtgagcttgagattgtgattttcagacccttcaatatcatgcaacatcttttctagactcccg 1153855  T
Q  105 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  1153854 ttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttgcaatcaatacttgagcaacaagt 1153787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13564775 - 13564620
Alignment:
Q  68 tccttcattatcgtgcaacatcttttctagactcatattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaa 167  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||     
T  13564775 tccttcgttattgtgcaacatcttttctagactaccattagacatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcgtcacccttattatcaatacttgaacat 13564676  T
Q  168 caagttaggatcttgacaagattccggtgtttcatctttcctagagatttacattc 223  Q
     |||  || ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  13564675 taaggaagaatcttaacacgatttcggtgcttcatctttcctaaagctttgcattc 13564620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University