View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17071_high_3 (Length: 362)

Name: NF17071_high_3
Description: NF17071
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17071_high_3
NF17071_high_3
[»] chr6 (146 HSPs)
chr6 (5-339)||(21702864-21703200)
chr6 (6-339)||(2684550-2684884)
chr6 (6-339)||(19663343-19663677)
chr6 (7-339)||(25134868-25135201)
chr6 (3-318)||(20800601-20800918)
chr6 (25-347)||(1586944-1587269)
chr6 (1-339)||(12496872-12497210)
chr6 (2-339)||(16741784-16742121)
chr6 (60-339)||(22592053-22592333)
chr6 (25-339)||(25928796-25929112)
chr6 (25-237)||(5616029-5616242)
chr6 (1-235)||(20061330-20061566)
chr6 (1-235)||(20802436-20802672)
chr6 (80-337)||(12707267-12707525)
chr6 (1-235)||(30695033-30695269)
chr6 (6-235)||(27327256-27327487)
chr6 (6-235)||(27387996-27388227)
chr6 (1-235)||(2869279-2869515)
chr6 (23-215)||(1538121-1538314)
chr6 (23-215)||(1544208-1544401)
chr6 (1-235)||(2875894-2876130)
chr6 (1-211)||(12763406-12763618)
chr6 (1-232)||(22429222-22429453)
chr6 (1-235)||(26131197-26131433)
chr6 (2-218)||(30597963-30598179)
chr6 (47-339)||(9481530-9481823)
chr6 (1-218)||(30637321-30637540)
chr6 (1-218)||(4232642-4232859)
chr6 (1-235)||(29586968-29587204)
chr6 (1-235)||(29593011-29593247)
chr6 (21-235)||(18193744-18193960)
chr6 (1-218)||(20648982-20649200)
chr6 (1-235)||(6981339-6981573)
chr6 (1-235)||(8229567-8229803)
chr6 (1-235)||(18931756-18931992)
chr6 (1-218)||(17016112-17016331)
chr6 (1-218)||(28315269-28315488)
chr6 (1-218)||(8797887-8798105)
chr6 (14-157)||(18729995-18730140)
chr6 (1-218)||(32564433-32564651)
chr6 (1-218)||(25982747-25982967)
chr6 (1-218)||(27429473-27429692)
chr6 (25-154)||(25111575-25111705)
chr6 (25-154)||(25118207-25118337)
chr6 (1-219)||(16551261-16551480)
chr6 (1-219)||(16627817-16628036)
chr6 (1-217)||(16577525-16577742)
chr6 (1-217)||(16617638-16617855)
chr6 (14-339)||(17804773-17805099)
chr6 (1-218)||(28257646-28257863)
chr6 (1-218)||(28336395-28336612)
chr6 (1-218)||(28343019-28343236)
chr6 (1-218)||(27186408-27186627)
chr6 (1-218)||(27208244-27208463)
chr6 (1-218)||(27240765-27240984)
chr6 (1-218)||(27262613-27262832)
chr6 (1-218)||(28264270-28264487)
chr6 (120-339)||(23656731-23656950)
chr6 (170-340)||(11567437-11567607)
chr6 (170-340)||(12618206-12618376)
chr6 (170-340)||(23395643-23395813)
chr6 (14-305)||(20907235-20907527)
chr6 (170-340)||(19871167-19871337)
chr6 (170-340)||(23990495-23990665)
chr6 (25-339)||(29095708-29096023)
chr6 (23-123)||(18181283-18181384)
chr6 (25-235)||(27552844-27553055)
chr6 (25-235)||(27566897-27567107)
chr6 (208-340)||(8244437-8244569)
chr6 (136-237)||(16522719-16522820)
chr6 (25-237)||(25766382-25766596)
chr6 (6-185)||(21591251-21591431)
chr6 (25-89)||(21415981-21416045)
chr6 (25-123)||(19790044-19790143)
chr6 (136-237)||(22405404-22405505)
chr6 (6-113)||(21732398-21732505)
chr6 (271-347)||(22059194-22059270)
chr6 (1-81)||(22759687-22759768)
chr6 (25-179)||(25594566-25594722)
chr6 (25-81)||(14099439-14099495)
chr6 (14-56)||(9481140-9481182)
chr6 (13-100)||(16372664-16372755)
chr6 (1-179)||(34295256-34295436)
chr6 (25-81)||(34833440-34833496)
chr6 (25-84)||(14117493-14117552)
chr6 (273-339)||(22429494-22429560)
chr6 (1-112)||(20177956-20178068)
chr6 (1-112)||(22157923-22158035)
chr6 (14-81)||(22332276-22332345)
chr6 (1-108)||(21834071-21834178)
chr6 (271-339)||(22080187-22080255)
chr6 (136-218)||(4189652-4189734)
chr6 (1-81)||(11285004-11285087)
chr6 (1-63)||(31316332-31316394)
chr6 (1-77)||(34369161-34369240)
chr6 (289-339)||(16372426-16372476)
chr6 (1-81)||(19809363-19809444)
chr6 (291-340)||(3707985-3708034)
chr6 (25-81)||(17036549-17036606)
chr6 (163-339)||(18907709-18907885)
chr6 (23-84)||(23656633-23656694)
chr6 (291-340)||(25594834-25594883)
chr6 (1-95)||(8736602-8736697)
chr6 (26-81)||(17031634-17031690)
chr6 (5-53)||(18907996-18908044)
chr6 (275-339)||(19652797-19652861)
chr6 (291-339)||(31154867-31154915)
chr6 (1-63)||(24290262-24290324)
chr6 (1-63)||(24314268-24314330)
chr6 (120-179)||(34369284-34369343)
chr6 (120-154)||(4168578-4168612)
chr6 (25-63)||(4168671-4168709)
chr6 (120-154)||(4209258-4209292)
chr6 (25-63)||(4209351-4209389)
chr6 (1-43)||(16924010-16924051)
chr6 (1-43)||(16928726-16928767)
chr6 (274-340)||(18231205-18231271)
chr6 (1-43)||(18698559-18698600)
chr6 (120-154)||(18916577-18916611)
chr6 (1-43)||(22405268-22405309)
chr6 (281-339)||(25956082-25956140)
chr6 (117-154)||(14099365-14099402)
chr6 (295-340)||(18916752-18916797)
chr6 (25-81)||(23276513-23276570)
chr6 (163-236)||(25641548-25641621)
chr6 (291-339)||(4185292-4185340)
chr6 (291-339)||(4667682-4667730)
chr6 (291-339)||(4674529-4674577)
chr6 (291-339)||(8797766-8797814)
chr6 (291-339)||(11284745-11284793)
chr6 (3-43)||(16964444-16964483)
chr6 (120-180)||(17031534-17031594)
chr6 (291-339)||(24290554-24290602)
chr6 (291-339)||(25118022-25118070)
chr6 (291-339)||(27186287-27186335)
chr6 (291-339)||(27208123-27208171)
chr6 (291-339)||(27241057-27241105)
chr6 (291-339)||(27262905-27262953)
chr6 (291-339)||(27429765-27429813)
chr6 (291-339)||(28257936-28257984)
chr6 (291-339)||(28264560-28264608)
chr6 (291-339)||(28336685-28336733)
chr6 (291-339)||(28343309-28343357)
chr6 (3-43)||(31154577-31154617)
chr6 (291-339)||(32564724-32564772)
chr6 (291-339)||(34369455-34369503)
[»] chr3 (195 HSPs)
chr3 (1-339)||(16690773-16691113)
chr3 (1-339)||(16697368-16697708)
chr3 (1-339)||(17242547-17242886)
chr3 (1-339)||(38814961-38815300)
chr3 (25-339)||(839822-840138)
chr3 (2-339)||(16808093-16808430)
chr3 (2-339)||(16797247-16797584)
chr3 (25-259)||(16862448-16862684)
chr3 (25-306)||(28331692-28331974)
chr3 (1-304)||(15941096-15941399)
chr3 (25-339)||(15849312-15849628)
chr3 (25-235)||(13315399-13315610)
chr3 (25-339)||(19809607-19809922)
chr3 (1-235)||(418701-418937)
chr3 (1-218)||(10845448-10845667)
chr3 (14-235)||(31096758-31096980)
chr3 (1-235)||(26890136-26890371)
chr3 (22-278)||(1597692-1597949)
chr3 (1-235)||(26793584-26793820)
chr3 (1-235)||(31421742-31421978)
chr3 (1-235)||(41091536-41091772)
chr3 (25-215)||(5149137-5149325)
chr3 (1-235)||(13258045-13258281)
chr3 (14-235)||(13251399-13251623)
chr3 (1-218)||(6599464-6599682)
chr3 (1-218)||(6606144-6606362)
chr3 (6-339)||(7792543-7792876)
chr3 (2-182)||(3834266-3834447)
chr3 (1-235)||(6609160-6609397)
chr3 (1-235)||(10004318-10004555)
chr3 (1-235)||(10010965-10011202)
chr3 (1-235)||(16634531-16634767)
chr3 (1-235)||(16641141-16641377)
chr3 (1-235)||(43161806-43162042)
chr3 (1-235)||(43168043-43168279)
chr3 (1-211)||(14672425-14672636)
chr3 (1-235)||(26788044-26788280)
chr3 (2-218)||(5106076-5106292)
chr3 (2-218)||(37616110-37616326)
chr3 (1-218)||(48424182-48424401)
chr3 (1-218)||(48430960-48431179)
chr3 (1-235)||(10904908-10905146)
chr3 (6-235)||(16488864-16489095)
chr3 (1-235)||(10911580-10911818)
chr3 (1-235)||(1332251-1332487)
chr3 (25-218)||(30066693-30066888)
chr3 (8-211)||(16623251-16623456)
chr3 (1-218)||(15583909-15584128)
chr3 (1-218)||(15590567-15590786)
chr3 (1-339)||(326355-326694)
chr3 (1-235)||(53379541-53379777)
chr3 (1-235)||(53386193-53386429)
chr3 (1-218)||(5201921-5202139)
chr3 (1-218)||(20056591-20056810)
chr3 (1-218)||(20063229-20063448)
chr3 (1-218)||(3691318-3691537)
chr3 (25-339)||(15483238-15483533)
chr3 (1-218)||(16757760-16757980)
chr3 (6-218)||(20460732-20460944)
chr3 (14-339)||(11594343-11594669)
chr3 (14-128)||(7576545-7576660)
chr3 (24-179)||(5222189-5222345)
chr3 (23-126)||(22640819-22640923)
chr3 (116-339)||(11852170-11852393)
chr3 (1-339)||(12037132-12037472)
chr3 (116-339)||(11863320-11863543)
chr3 (6-217)||(42326642-42326854)
chr3 (170-340)||(7110276-7110446)
chr3 (170-340)||(7114211-7114381)
chr3 (121-235)||(22670247-22670361)
chr3 (170-340)||(27409005-27409175)
chr3 (6-304)||(11297714-11298013)
chr3 (136-339)||(19725228-19725431)
chr3 (24-339)||(1982024-1982340)
chr3 (170-340)||(22322242-22322412)
chr3 (170-340)||(55023422-55023592)
chr3 (117-339)||(12496854-12497076)
chr3 (208-340)||(28950303-28950435)
chr3 (1-123)||(16810204-16810326)
chr3 (170-340)||(15617952-15618122)
chr3 (170-340)||(22337297-22337467)
chr3 (136-339)||(321330-321533)
chr3 (117-237)||(323288-323408)
chr3 (208-339)||(11855313-11855444)
chr3 (1-123)||(26190183-26190307)
chr3 (271-340)||(4588266-4588335)
chr3 (136-339)||(14877818-14878024)
chr3 (141-339)||(3402287-3402485)
chr3 (117-339)||(18383214-18383436)
chr3 (170-305)||(11164941-11165076)
chr3 (136-339)||(15070720-15070923)
chr3 (136-339)||(15080879-15081082)
chr3 (151-235)||(22642701-22642785)
chr3 (1-63)||(15342795-15342856)
chr3 (1-63)||(15349438-15349499)
chr3 (1-84)||(15726119-15726204)
chr3 (1-84)||(41200985-41201070)
chr3 (190-339)||(11299893-11300041)
chr3 (153-218)||(16747183-16747248)
chr3 (1-84)||(15361524-15361607)
chr3 (1-84)||(15397094-15397177)
chr3 (136-339)||(16370007-16370210)
chr3 (1-179)||(20723716-20723896)
chr3 (5-108)||(23076663-23076767)
chr3 (1-106)||(16716280-16716387)
chr3 (6-108)||(23052263-23052366)
chr3 (25-84)||(23703983-23704042)
chr3 (25-84)||(23722439-23722498)
chr3 (25-84)||(23740895-23740954)
chr3 (14-179)||(55149715-55149883)
chr3 (1-84)||(4291604-4291689)
chr3 (1-84)||(10152925-10153010)
chr3 (163-236)||(17524517-17524590)
chr3 (136-339)||(15052115-15052318)
chr3 (1-84)||(15338265-15338348)
chr3 (1-84)||(15403706-15403789)
chr3 (271-339)||(26190460-26190528)
chr3 (25-84)||(4711108-4711167)
chr3 (25-84)||(17709834-17709893)
chr3 (1-81)||(7986542-7986623)
chr3 (1-179)||(24188514-24188695)
chr3 (1-179)||(8720344-8720524)
chr3 (1-179)||(9072231-9072411)
chr3 (271-339)||(11556847-11556915)
chr3 (291-339)||(13321549-13321597)
chr3 (1-63)||(409990-410052)
chr3 (1-63)||(1144740-1144802)
chr3 (4-81)||(16337012-16337090)
chr3 (271-333)||(12340333-12340395)
chr3 (1-54)||(12483290-12483344)
chr3 (1-113)||(16690015-16690127)
chr3 (1-81)||(16863363-16863444)
chr3 (291-340)||(12891981-12892030)
chr3 (291-340)||(15829491-15829540)
chr3 (291-340)||(15991585-15991634)
chr3 (291-340)||(17252538-17252587)
chr3 (23-123)||(17673777-17673878)
chr3 (275-339)||(1644137-1644201)
chr3 (271-339)||(12173385-12173453)
chr3 (275-339)||(12933763-12933827)
chr3 (271-339)||(20460997-20461065)
chr3 (292-339)||(14499904-14499951)
chr3 (163-234)||(15877171-15877242)
chr3 (138-236)||(25475703-25475801)
chr3 (1-43)||(323483-323524)
chr3 (289-339)||(5222029-5222079)
chr3 (292-338)||(6609057-6609103)
chr3 (292-338)||(10004215-10004261)
chr3 (292-338)||(10010862-10010908)
chr3 (292-338)||(10904805-10904851)
chr3 (292-338)||(10911477-10911523)
chr3 (1-43)||(11852468-11852509)
chr3 (1-43)||(12497152-12497193)
chr3 (133-218)||(14573311-14573396)
chr3 (25-113)||(856891-856979)
chr3 (291-340)||(4291348-4291397)
chr3 (291-340)||(4710852-4710901)
chr3 (291-340)||(10235876-10235925)
chr3 (28-84)||(10326685-10326742)
chr3 (14-43)||(11863618-11863647)
chr3 (25-81)||(12892241-12892298)
chr3 (25-81)||(15829751-15829808)
chr3 (25-81)||(15991316-15991373)
chr3 (25-81)||(17252270-17252327)
chr3 (163-236)||(26190347-26190420)
chr3 (291-339)||(3691197-3691245)
chr3 (291-339)||(5201800-5201848)
chr3 (291-339)||(5419786-5419834)
chr3 (291-339)||(5426184-5426232)
chr3 (291-339)||(6606023-6606071)
chr3 (291-339)||(7986283-7986331)
chr3 (291-339)||(8720636-8720684)
chr3 (291-339)||(9072523-9072571)
chr3 (291-339)||(10326429-10326477)
chr3 (291-339)||(12483005-12483053)
chr3 (23-55)||(12506285-12506317)
chr3 (291-339)||(15343086-15343134)
chr3 (291-339)||(15349729-15349777)
chr3 (291-339)||(15584201-15584249)
chr3 (291-339)||(15590859-15590907)
chr3 (291-339)||(15726411-15726459)
chr3 (291-339)||(16336753-16336801)
chr3 (271-339)||(16690285-16690353)
chr3 (291-339)||(16747321-16747369)
chr3 (291-339)||(16758053-16758101)
chr3 (291-339)||(17674046-17674094)
chr3 (291-339)||(20056883-20056931)
chr3 (291-339)||(23704249-23704297)
chr3 (291-339)||(23722705-23722753)
chr3 (291-339)||(23741161-23741209)
chr3 (3-43)||(25475566-25475606)
chr3 (271-339)||(42326520-42326588)
chr3 (275-339)||(49667560-49667624)
chr3 (292-340)||(53379834-53379882)
chr3 (292-340)||(53386486-53386534)
[»] chr8 (104 HSPs)
chr8 (2-339)||(22134423-22134761)
chr8 (2-339)||(22109510-22109848)
chr8 (2-339)||(22165573-22165911)
chr8 (25-339)||(17052583-17052899)
chr8 (3-305)||(32599239-32599543)
chr8 (3-306)||(32605810-32606115)
chr8 (2-339)||(22057158-22057495)
chr8 (1-339)||(15539024-15539362)
chr8 (2-339)||(23844108-23844445)
chr8 (14-339)||(22057925-22058251)
chr8 (1-339)||(15532464-15532802)
chr8 (14-339)||(22029134-22029460)
chr8 (2-339)||(22045435-22045772)
chr8 (1-333)||(23834727-23835060)
chr8 (1-237)||(30307946-30308182)
chr8 (1-279)||(17827782-17828061)
chr8 (1-235)||(18855617-18855852)
chr8 (1-235)||(22084491-22084727)
chr8 (1-211)||(18866036-18866247)
chr8 (1-235)||(19111855-19112092)
chr8 (1-235)||(19118196-19118433)
chr8 (1-315)||(16230765-16231079)
chr8 (2-218)||(17668763-17668979)
chr8 (2-218)||(17675415-17675631)
chr8 (22-304)||(24433448-24433732)
chr8 (1-235)||(22121564-22121800)
chr8 (5-235)||(23252007-23252238)
chr8 (1-235)||(22114862-22115098)
chr8 (1-235)||(22122575-22122811)
chr8 (1-218)||(28455504-28455723)
chr8 (1-339)||(22826422-22826760)
chr8 (1-235)||(21914782-21915017)
chr8 (1-179)||(5533630-5533809)
chr8 (1-219)||(18066027-18066246)
chr8 (1-218)||(22048644-22048864)
chr8 (1-126)||(15440477-15440603)
chr8 (1-339)||(15610649-15610988)
chr8 (136-339)||(19983695-19983898)
chr8 (136-339)||(19977047-19977250)
chr8 (117-339)||(22009976-22010198)
chr8 (6-339)||(16409440-16409774)
chr8 (23-339)||(39094154-39094471)
chr8 (119-339)||(21168020-21168240)
chr8 (208-340)||(21971984-21972116)
chr8 (208-340)||(43252387-43252519)
chr8 (170-340)||(19277646-19277816)
chr8 (170-340)||(22112405-22112575)
chr8 (1-337)||(16411471-16411808)
chr8 (208-340)||(21976069-21976201)
chr8 (6-123)||(20855076-20855193)
chr8 (23-123)||(16860561-16860662)
chr8 (1-339)||(16406756-16407095)
chr8 (136-236)||(19899725-19899825)
chr8 (119-339)||(21161413-21161634)
chr8 (1-237)||(15602260-15602497)
chr8 (119-304)||(24756356-24756541)
chr8 (119-339)||(16185328-16185548)
chr8 (135-339)||(17926029-17926233)
chr8 (267-339)||(18620054-18620126)
chr8 (1-84)||(29123916-29124001)
chr8 (7-98)||(11609042-11609134)
chr8 (1-179)||(20528186-20528366)
chr8 (1-84)||(8353953-8354038)
chr8 (1-84)||(16882363-16882446)
chr8 (163-339)||(377878-378054)
chr8 (163-339)||(20465382-20465558)
chr8 (136-339)||(19258918-19259121)
chr8 (275-339)||(21388907-21388971)
chr8 (136-232)||(23776179-23776275)
chr8 (1-108)||(30642449-30642557)
chr8 (4-43)||(5865459-5865498)
chr8 (1-63)||(20013053-20013115)
chr8 (1-63)||(20019129-20019191)
chr8 (1-44)||(22985441-22985484)
chr8 (4-43)||(23776045-23776084)
chr8 (170-339)||(25362499-25362669)
chr8 (6-43)||(19899920-19899957)
chr8 (25-113)||(20462862-20462950)
chr8 (25-113)||(20465243-20465331)
chr8 (291-340)||(26934658-26934707)
chr8 (291-339)||(8354245-8354293)
chr8 (3-43)||(21395246-21395286)
chr8 (3-43)||(21789739-21789779)
chr8 (1-63)||(20023117-20023179)
chr8 (1-63)||(23844990-23845052)
chr8 (1-113)||(378105-378217)
chr8 (25-63)||(23054503-23054541)
chr8 (25-81)||(3217042-3217099)
chr8 (25-81)||(26934390-26934447)
chr8 (136-218)||(5865593-5865675)
chr8 (275-339)||(5865732-5865796)
chr8 (275-339)||(17141515-17141579)
chr8 (291-339)||(20013345-20013393)
chr8 (291-339)||(20019421-20019469)
chr8 (291-339)||(20023409-20023457)
chr8 (291-339)||(20528026-20528074)
chr8 (275-339)||(21255821-21255885)
chr8 (275-339)||(21395431-21395495)
chr8 (275-339)||(21789924-21789988)
chr8 (271-339)||(23776284-23776352)
chr8 (271-339)||(28398224-28398292)
chr8 (291-339)||(29123661-29123709)
chr8 (271-339)||(30642720-30642788)
chr8 (275-339)||(31971845-31971909)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (3-338)||(15854-16191)
[»] chr4 (130 HSPs)
chr4 (3-339)||(18601936-18602272)
chr4 (3-347)||(3413364-3413708)
chr4 (2-339)||(28568636-28568974)
chr4 (6-339)||(2015354-2015688)
chr4 (5-339)||(14707827-14708163)
chr4 (3-339)||(18608508-18608844)
chr4 (25-339)||(17151725-17152039)
chr4 (1-339)||(18221568-18221907)
chr4 (6-339)||(16242597-16242931)
chr4 (1-332)||(18228116-18228448)
chr4 (1-339)||(23139845-23140184)
chr4 (1-341)||(26242857-26243198)
chr4 (25-335)||(42996665-42996976)
chr4 (21-339)||(19756812-19757131)
chr4 (21-339)||(19782675-19782994)
chr4 (25-339)||(16677804-16678119)
chr4 (1-279)||(45938783-45939061)
chr4 (1-235)||(15362812-15363047)
chr4 (25-237)||(18237570-18237783)
chr4 (25-339)||(16646361-16646676)
chr4 (6-237)||(9271301-9271533)
chr4 (1-235)||(14298039-14298275)
chr4 (1-235)||(12475699-12475935)
chr4 (1-235)||(12482329-12482565)
chr4 (1-235)||(22195299-22195535)
chr4 (1-211)||(26284098-26284309)
chr4 (1-235)||(36883925-36884161)
chr4 (6-211)||(7900368-7900574)
chr4 (1-235)||(15382684-15382920)
chr4 (1-235)||(18296304-18296540)
chr4 (2-233)||(9531115-9531347)
chr4 (23-215)||(15321237-15321430)
chr4 (1-235)||(16231031-16231268)
chr4 (1-235)||(14304663-14304899)
chr4 (1-235)||(15149135-15149371)
chr4 (1-235)||(14074509-14074746)
chr4 (1-211)||(18023653-18023865)
chr4 (1-235)||(15257287-15257524)
chr4 (1-235)||(14267600-14267836)
chr4 (1-235)||(17809092-17809328)
chr4 (1-218)||(29040090-29040309)
chr4 (1-235)||(1950974-1951209)
chr4 (1-235)||(23961489-23961726)
chr4 (2-218)||(19779483-19779699)
chr4 (1-207)||(23954854-23955063)
chr4 (1-235)||(8385492-8385728)
chr4 (1-235)||(8392168-8392404)
chr4 (1-235)||(17089169-17089405)
chr4 (43-235)||(6872657-6872851)
chr4 (1-235)||(20115822-20116058)
chr4 (1-218)||(12299088-12299307)
chr4 (1-218)||(12348765-12348983)
chr4 (1-218)||(18071865-18072084)
chr4 (6-218)||(36133158-36133371)
chr4 (8-181)||(15363524-15363695)
chr4 (1-218)||(55796154-55796372)
chr4 (1-235)||(15352496-15352731)
chr4 (1-139)||(17961561-17961701)
chr4 (25-339)||(11249776-11250091)
chr4 (120-339)||(16351159-16351378)
chr4 (1-139)||(17990905-17991045)
chr4 (170-340)||(5756299-5756469)
chr4 (170-340)||(33742952-33743122)
chr4 (170-339)||(14756783-14756952)
chr4 (5-220)||(5338589-5338805)
chr4 (170-340)||(4560695-4560865)
chr4 (119-332)||(12570656-12570869)
chr4 (170-340)||(24021660-24021830)
chr4 (163-339)||(16487421-16487597)
chr4 (271-347)||(43255623-43255699)
chr4 (136-236)||(44676335-44676435)
chr4 (163-338)||(16356296-16356471)
chr4 (1-339)||(16347895-16348233)
chr4 (1-233)||(13570218-13570451)
chr4 (170-339)||(17047433-17047602)
chr4 (25-179)||(30234414-30234571)
chr4 (1-179)||(14679699-14679879)
chr4 (14-179)||(14685910-14686078)
chr4 (25-123)||(25556281-25556380)
chr4 (25-84)||(40472278-40472337)
chr4 (25-84)||(40478951-40479010)
chr4 (1-84)||(385543-385628)
chr4 (1-81)||(41384922-41385003)
chr4 (1-84)||(51493007-51493092)
chr4 (6-339)||(15094373-15094708)
chr4 (163-339)||(15123270-15123446)
chr4 (1-84)||(16955882-16955967)
chr4 (271-309)||(27534582-27534620)
chr4 (1-81)||(35614724-35614805)
chr4 (14-81)||(23839269-23839338)
chr4 (1-179)||(8047685-8047865)
chr4 (1-179)||(8054298-8054478)
chr4 (1-100)||(12522890-12522992)
chr4 (271-339)||(25556065-25556133)
chr4 (1-63)||(4772951-4773013)
chr4 (4-43)||(17053876-17053915)
chr4 (1-63)||(19941365-19941427)
chr4 (1-63)||(21334890-21334952)
chr4 (1-63)||(23082443-23082505)
chr4 (6-100)||(23844318-23844413)
chr4 (23-84)||(16351061-16351122)
chr4 (291-340)||(17810848-17810897)
chr4 (25-81)||(23651531-23651588)
chr4 (291-340)||(53433952-53434001)
chr4 (291-339)||(385835-385883)
chr4 (275-339)||(3097212-3097276)
chr4 (1-61)||(16356134-16356193)
chr4 (291-339)||(17961807-17961855)
chr4 (291-339)||(17991151-17991199)
chr4 (291-339)||(55796033-55796081)
chr4 (292-339)||(12299381-12299428)
chr4 (1-59)||(27710604-27710662)
chr4 (1-50)||(6866642-6866691)
chr4 (28-113)||(15121010-15121095)
chr4 (136-236)||(12903450-12903550)
chr4 (291-340)||(16956132-16956181)
chr4 (26-63)||(35171432-35171469)
chr4 (6-43)||(44676530-44676567)
chr4 (25-81)||(53434212-53434269)
chr4 (271-339)||(20947-21015)
chr4 (291-339)||(4772673-4772721)
chr4 (291-339)||(8047977-8048025)
chr4 (275-339)||(8846956-8847020)
chr4 (291-339)||(12349056-12349104)
chr4 (136-218)||(15552537-15552619)
chr4 (291-339)||(18071744-18071792)
chr4 (291-339)||(19941657-19941705)
chr4 (291-339)||(23082165-23082213)
chr4 (291-339)||(27710322-27710370)
chr4 (271-339)||(36133424-36133492)
[»] chr5 (140 HSPs)
chr5 (2-334)||(26172995-26173328)
chr5 (6-339)||(26665327-26665661)
chr5 (6-339)||(26936924-26937258)
chr5 (6-339)||(24532245-24532579)
chr5 (1-339)||(33409783-33410122)
chr5 (2-339)||(21884381-21884719)
chr5 (25-347)||(25228620-25228944)
chr5 (25-347)||(25292776-25293100)
chr5 (25-347)||(4036788-4037113)
chr5 (28-339)||(18784576-18784888)
chr5 (6-339)||(20233106-20233440)
chr5 (21-339)||(16674730-16675049)
chr5 (1-347)||(21339959-21340306)
chr5 (1-339)||(26741936-26742275)
chr5 (1-304)||(17717630-17717934)
chr5 (25-305)||(42805958-42806239)
chr5 (25-339)||(18774711-18775026)
chr5 (1-333)||(21483032-21483365)
chr5 (1-235)||(27517430-27517666)
chr5 (1-235)||(27524067-27524303)
chr5 (1-211)||(22062071-22062283)
chr5 (25-304)||(15441168-15441449)
chr5 (1-235)||(22133679-22133914)
chr5 (4-211)||(29477197-29477405)
chr5 (1-235)||(40707800-40708037)
chr5 (1-235)||(40714442-40714679)
chr5 (1-211)||(22140345-22140556)
chr5 (1-211)||(29470549-29470760)
chr5 (1-211)||(34293742-34293954)
chr5 (1-235)||(1691626-1691862)
chr5 (1-211)||(14994225-14994437)
chr5 (1-211)||(15000868-15001080)
chr5 (1-235)||(18037857-18038093)
chr5 (1-235)||(37292626-37292862)
chr5 (2-218)||(23610669-23610885)
chr5 (2-218)||(23842065-23842281)
chr5 (1-218)||(25107481-25107700)
chr5 (1-218)||(25166574-25166793)
chr5 (1-235)||(27686518-27686754)
chr5 (2-218)||(27669622-27669838)
chr5 (1-235)||(33726538-33726775)
chr5 (1-219)||(34565532-34565752)
chr5 (1-219)||(34572187-34572407)
chr5 (1-235)||(24471437-24471673)
chr5 (9-235)||(37285952-37286180)
chr5 (1-235)||(16355524-16355760)
chr5 (1-235)||(16362183-16362419)
chr5 (1-235)||(41769872-41770108)
chr5 (1-235)||(41776496-41776732)
chr5 (2-218)||(27662982-27663198)
chr5 (2-218)||(41097414-41097631)
chr5 (1-235)||(27609386-27609621)
chr5 (2-218)||(22265642-22265860)
chr5 (1-235)||(17706121-17706356)
chr5 (1-235)||(27616046-27616281)
chr5 (6-211)||(19992587-19992794)
chr5 (1-235)||(22327403-22327639)
chr5 (1-218)||(17411144-17411360)
chr5 (1-211)||(41293625-41293837)
chr5 (8-235)||(22334014-22334243)
chr5 (1-218)||(21666997-21667215)
chr5 (1-218)||(22409838-22410057)
chr5 (1-154)||(24021022-24021176)
chr5 (1-218)||(37544740-37544958)
chr5 (1-218)||(29317115-29317333)
chr5 (1-218)||(20776586-20776805)
chr5 (1-235)||(12027756-12027991)
chr5 (25-339)||(24222464-24222780)
chr5 (170-339)||(18356904-18357072)
chr5 (170-340)||(20296422-20296592)
chr5 (1-102)||(25407177-25407278)
chr5 (5-347)||(31342743-31343085)
chr5 (117-237)||(20806249-20806369)
chr5 (1-123)||(1855911-1856034)
chr5 (136-334)||(14079703-14079901)
chr5 (5-123)||(17918347-17918465)
chr5 (7-235)||(122497-122732)
chr5 (136-236)||(21887527-21887627)
chr5 (1-123)||(22760457-22760580)
chr5 (15-339)||(21365860-21366185)
chr5 (23-123)||(26681383-26681484)
chr5 (23-123)||(26952990-26953091)
chr5 (1-179)||(24555270-24555450)
chr5 (1-84)||(22598459-22598544)
chr5 (1-81)||(24596400-24596481)
chr5 (23-123)||(6540955-6541056)
chr5 (136-339)||(23515558-23515764)
chr5 (1-179)||(21294452-21294632)
chr5 (1-179)||(25535715-25535895)
chr5 (25-84)||(17284899-17284958)
chr5 (163-211)||(25407130-25407178)
chr5 (1-84)||(23585019-23585104)
chr5 (14-55)||(23529548-23529589)
chr5 (1-179)||(23250677-23250857)
chr5 (25-108)||(23572890-23572974)
chr5 (1-100)||(25807675-25807777)
chr5 (1-63)||(19769202-19769264)
chr5 (1-63)||(19775799-19775861)
chr5 (23-57)||(12029603-12029637)
chr5 (4-42)||(21870782-21870820)
chr5 (4-42)||(21875062-21875100)
chr5 (1-81)||(23336507-23336588)
chr5 (163-339)||(18769347-18769523)
chr5 (25-113)||(22033143-22033231)
chr5 (291-340)||(22325408-22325457)
chr5 (291-340)||(22344072-22344121)
chr5 (291-340)||(22353419-22353468)
chr5 (291-340)||(24020836-24020885)
chr5 (274-339)||(26681166-26681231)
chr5 (274-339)||(26952773-26952838)
chr5 (275-339)||(17411023-17411087)
chr5 (291-339)||(22257955-22258003)
chr5 (291-339)||(22598204-22598252)
chr5 (1-63)||(14359008-14359070)
chr5 (120-179)||(14359129-14359188)
chr5 (25-100)||(22344250-22344328)
chr5 (9-52)||(23202257-23202300)
chr5 (271-337)||(122768-122834)
chr5 (292-338)||(33726435-33726481)
chr5 (291-340)||(15236262-15236311)
chr5 (25-113)||(18769208-18769296)
chr5 (25-81)||(22325140-22325197)
chr5 (25-81)||(22353679-22353736)
chr5 (163-236)||(23500688-23500761)
chr5 (291-340)||(25807967-25808016)
chr5 (271-339)||(6540739-6540807)
chr5 (3-43)||(9078852-9078892)
chr5 (271-339)||(12028027-12028095)
chr5 (120-179)||(13026024-13026083)
chr5 (120-179)||(13096208-13096267)
chr5 (291-339)||(17284643-17284691)
chr5 (291-339)||(19768924-19768972)
chr5 (291-339)||(19775521-19775569)
chr5 (291-339)||(21294744-21294792)
chr5 (3-43)||(21985350-21985390)
chr5 (163-235)||(22760345-22760417)
chr5 (271-339)||(23572659-23572727)
chr5 (291-339)||(23584764-23584812)
chr5 (291-339)||(25535555-25535603)
chr5 (136-180)||(37724613-37724657)
[»] chr1 (94 HSPs)
chr1 (2-347)||(17045949-17046295)
chr1 (2-347)||(17040411-17040757)
chr1 (5-339)||(21616014-21616350)
chr1 (1-339)||(46976045-46976384)
chr1 (1-339)||(20920148-20920486)
chr1 (1-339)||(12647444-12647783)
chr1 (25-339)||(23818514-23818829)
chr1 (1-341)||(18882940-18883281)
chr1 (25-339)||(19212444-19212757)
chr1 (5-341)||(20138657-20138995)
chr1 (1-235)||(44844072-44844308)
chr1 (1-211)||(21844932-21845145)
chr1 (1-235)||(51327867-51328104)
chr1 (1-235)||(51334502-51334739)
chr1 (1-211)||(21829419-21829632)
chr1 (6-218)||(16079640-16079853)
chr1 (1-212)||(36818548-36818761)
chr1 (1-235)||(43079119-43079355)
chr1 (1-235)||(18599295-18599531)
chr1 (1-235)||(41477717-41477953)
chr1 (1-235)||(46156510-46156746)
chr1 (6-339)||(21305890-21306223)
chr1 (1-235)||(20215119-20215354)
chr1 (1-218)||(27897850-27898068)
chr1 (1-218)||(43062467-43062685)
chr1 (1-218)||(49335269-49335487)
chr1 (1-218)||(44756803-44757021)
chr1 (1-218)||(41348040-41348259)
chr1 (1-218)||(16344963-16345182)
chr1 (1-218)||(16351610-16351829)
chr1 (1-218)||(33394545-33394763)
chr1 (1-218)||(41355477-41355696)
chr1 (6-115)||(21225564-21225674)
chr1 (1-219)||(47659892-47660113)
chr1 (6-235)||(45488938-45489168)
chr1 (170-340)||(21407930-21408100)
chr1 (208-340)||(16374857-16374989)
chr1 (23-235)||(33049300-33049513)
chr1 (23-123)||(17677800-17677901)
chr1 (119-339)||(21787341-21787561)
chr1 (170-333)||(52640095-52640258)
chr1 (117-237)||(3472223-3472343)
chr1 (1-123)||(24782291-24782414)
chr1 (136-237)||(8760949-8761050)
chr1 (271-339)||(24782562-24782630)
chr1 (136-236)||(42864527-42864627)
chr1 (1-50)||(29795821-29795870)
chr1 (6-113)||(22830563-22830670)
chr1 (1-179)||(23763948-23764128)
chr1 (271-338)||(16079906-16079973)
chr1 (14-107)||(18393167-18393261)
chr1 (1-81)||(19064356-19064437)
chr1 (1-81)||(19112246-19112327)
chr1 (14-81)||(21438629-21438698)
chr1 (23-123)||(45309579-45309680)
chr1 (25-84)||(3704371-3704430)
chr1 (14-81)||(19105589-19105658)
chr1 (163-339)||(22432126-22432302)
chr1 (271-339)||(18393425-18393493)
chr1 (163-305)||(3704489-3704632)
chr1 (23-81)||(18657744-18657803)
chr1 (1-63)||(21806389-21806451)
chr1 (1-63)||(21836221-21836283)
chr1 (1-63)||(33385411-33385473)
chr1 (1-63)||(33392055-33392117)
chr1 (1-54)||(18625466-18625520)
chr1 (181-339)||(21023238-21023396)
chr1 (291-340)||(1011299-1011348)
chr1 (291-340)||(8305693-8305742)
chr1 (5-108)||(18181306-18181410)
chr1 (291-340)||(50887234-50887283)
chr1 (275-339)||(20248880-20248944)
chr1 (1-63)||(20524402-20524466)
chr1 (291-339)||(21835943-21835991)
chr1 (7-43)||(38800587-38800623)
chr1 (271-339)||(45309828-45309896)
chr1 (120-213)||(33385532-33385625)
chr1 (25-81)||(50886966-50887023)
chr1 (291-339)||(16345255-16345303)
chr1 (291-339)||(16351902-16351950)
chr1 (271-339)||(18181572-18181640)
chr1 (291-339)||(18625757-18625805)
chr1 (291-339)||(21438371-21438419)
chr1 (275-339)||(21715149-21715213)
chr1 (25-100)||(21715388-21715464)
chr1 (291-339)||(21806681-21806729)
chr1 (291-339)||(23763788-23763836)
chr1 (291-339)||(27898141-27898189)
chr1 (271-339)||(33049549-33049617)
chr1 (291-339)||(33385703-33385751)
chr1 (291-339)||(33392347-33392395)
chr1 (291-339)||(43062758-43062806)
chr1 (291-339)||(44756682-44756730)
chr1 (291-339)||(49335148-49335196)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (3-339)||(76363-76701)
scaffold0043 (163-339)||(18840-19016)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (6-339)||(2454-2788)
scaffold0546 (3-237)||(5342-5577)
[»] scaffold0109 (7 HSPs)
scaffold0109 (6-339)||(10519-10853)
scaffold0109 (3-237)||(7730-7965)
scaffold0109 (25-235)||(27324-27535)
scaffold0109 (183-339)||(38191-38347)
scaffold0109 (6-80)||(38108-38182)
scaffold0109 (6-81)||(44105-44182)
scaffold0109 (291-339)||(43846-43894)
[»] chr7 (123 HSPs)
chr7 (14-339)||(16438239-16438565)
chr7 (3-339)||(16723847-16724183)
chr7 (3-339)||(17700861-17701197)
chr7 (1-339)||(6801787-6802126)
chr7 (6-347)||(13149721-13150063)
chr7 (3-305)||(35152166-35152470)
chr7 (25-347)||(15728892-15729217)
chr7 (5-339)||(16276067-16276403)
chr7 (1-339)||(18248-18587)
chr7 (1-339)||(8918026-8918366)
chr7 (3-304)||(14217525-14217826)
chr7 (25-339)||(11987788-11988103)
chr7 (25-304)||(18557582-18557861)
chr7 (2-237)||(13462437-13462673)
chr7 (1-235)||(59866-60102)
chr7 (14-237)||(48592664-48592883)
chr7 (1-235)||(15022809-15023046)
chr7 (1-235)||(15155380-15155616)
chr7 (1-235)||(9593976-9594211)
chr7 (1-235)||(9644939-9645174)
chr7 (1-235)||(18176810-18177046)
chr7 (1-235)||(18183482-18183718)
chr7 (6-339)||(12318703-12319037)
chr7 (1-235)||(18163863-18164099)
chr7 (8-218)||(16406492-16406703)
chr7 (1-211)||(1348201-1348413)
chr7 (1-235)||(13685142-13685378)
chr7 (1-235)||(15162010-15162246)
chr7 (14-235)||(44785677-44785901)
chr7 (14-235)||(44792318-44792542)
chr7 (2-218)||(22131381-22131597)
chr7 (2-218)||(40522554-40522770)
chr7 (1-235)||(22361-22597)
chr7 (1-235)||(8201265-8201501)
chr7 (24-219)||(14654581-14654778)
chr7 (1-235)||(11238161-11238397)
chr7 (1-235)||(13691757-13691993)
chr7 (1-235)||(11231474-11231710)
chr7 (120-339)||(7536761-7536981)
chr7 (1-235)||(9510201-9510437)
chr7 (1-235)||(1245212-1245447)
chr7 (1-235)||(12702578-12702813)
chr7 (14-237)||(13634673-13634897)
chr7 (6-218)||(11313345-11313557)
chr7 (1-218)||(8720108-8720326)
chr7 (1-218)||(18584491-18584709)
chr7 (1-218)||(8706692-8706910)
chr7 (6-339)||(20568792-20569126)
chr7 (1-146)||(11366795-11366942)
chr7 (1-218)||(18552723-18552941)
chr7 (170-340)||(33681-33851)
chr7 (170-340)||(16906562-16906732)
chr7 (120-235)||(42205794-42205907)
chr7 (25-337)||(15581234-15581547)
chr7 (170-340)||(26292968-26293138)
chr7 (170-335)||(12724110-12724275)
chr7 (170-340)||(12715439-12715609)
chr7 (170-340)||(18279978-18280148)
chr7 (170-340)||(12719243-12719413)
chr7 (117-237)||(14430581-14430701)
chr7 (1-123)||(2760944-2761067)
chr7 (120-235)||(9445497-9445612)
chr7 (23-123)||(14144584-14144685)
chr7 (170-305)||(16114801-16114936)
chr7 (170-305)||(16117954-16118089)
chr7 (1-84)||(32768506-32768591)
chr7 (1-233)||(9703951-9704184)
chr7 (23-123)||(3272554-3272655)
chr7 (1-179)||(11263036-11263216)
chr7 (25-84)||(20702206-20702265)
chr7 (281-339)||(10861-10919)
chr7 (1-81)||(26420813-26420894)
chr7 (1-179)||(12693182-12693362)
chr7 (273-341)||(15604755-15604823)
chr7 (1-81)||(14149405-14149488)
chr7 (1-81)||(12686745-12686826)
chr7 (271-339)||(12321193-12321261)
chr7 (3-43)||(24055367-24055407)
chr7 (28-179)||(44407575-44407728)
chr7 (1-63)||(14331641-14331703)
chr7 (1-63)||(14338225-14338287)
chr7 (1-81)||(7537007-7537088)
chr7 (25-154)||(9410706-9410837)
chr7 (1-54)||(10870258-10870312)
chr7 (1-54)||(10876388-10876442)
chr7 (1-81)||(11547470-11547551)
chr7 (1-81)||(11554066-11554147)
chr7 (190-339)||(17137433-17137582)
chr7 (266-340)||(18283941-18284015)
chr7 (1-43)||(25354052-25354094)
chr7 (273-339)||(42205690-42205756)
chr7 (291-340)||(6016653-6016702)
chr7 (282-339)||(11313224-11313281)
chr7 (5-108)||(12320926-12321030)
chr7 (163-236)||(19648827-19648900)
chr7 (291-339)||(9410521-9410569)
chr7 (275-339)||(11768341-11768405)
chr7 (291-339)||(14337947-14337995)
chr7 (141-232)||(2831675-2831766)
chr7 (272-339)||(10508534-10508601)
chr7 (8-43)||(27847030-27847065)
chr7 (1-43)||(14430777-14430818)
chr7 (25-103)||(18532073-18532154)
chr7 (25-81)||(19684-19741)
chr7 (25-81)||(4317758-4317815)
chr7 (25-81)||(6016385-6016442)
chr7 (291-339)||(8706571-8706619)
chr7 (291-339)||(8719987-8720035)
chr7 (136-180)||(9750866-9750910)
chr7 (291-339)||(10876103-10876151)
chr7 (136-180)||(11029347-11029391)
chr7 (271-339)||(11525047-11525115)
chr7 (291-339)||(14331363-14331411)
chr7 (275-339)||(18006244-18006308)
chr7 (275-339)||(19648939-19649003)
chr7 (291-339)||(20702472-20702520)
chr7 (291-339)||(26420554-26420602)
chr7 (123-179)||(26420714-26420770)
chr7 (136-218)||(27847160-27847242)
chr7 (275-339)||(27847299-27847363)
chr7 (291-339)||(32768251-32768299)
chr7 (275-339)||(34185007-34185071)
chr7 (275-339)||(34201385-34201449)
[»] chr2 (108 HSPs)
chr2 (1-339)||(22460382-22460721)
chr2 (25-347)||(61383-61707)
chr2 (6-339)||(23187652-23187986)
chr2 (6-339)||(23598915-23599249)
chr2 (14-339)||(19927707-19928033)
chr2 (25-339)||(41667505-41667821)
chr2 (25-339)||(27263827-27264143)
chr2 (95-339)||(26125780-26126024)
chr2 (1-232)||(27603501-27603734)
chr2 (1-211)||(24913154-24913365)
chr2 (1-235)||(27216745-27216981)
chr2 (1-235)||(1843763-1844000)
chr2 (1-235)||(16997729-16997966)
chr2 (25-237)||(27386195-27386408)
chr2 (1-211)||(19489114-19489326)
chr2 (1-235)||(22320176-22320412)
chr2 (1-235)||(22326329-22326565)
chr2 (1-235)||(26876759-26876994)
chr2 (1-235)||(16929135-16929371)
chr2 (1-235)||(16980882-16981118)
chr2 (1-235)||(16986623-16986859)
chr2 (1-235)||(17004362-17004599)
chr2 (6-211)||(23171790-23171999)
chr2 (6-211)||(23583047-23583256)
chr2 (1-235)||(27617976-27618213)
chr2 (1-235)||(9340962-9341198)
chr2 (1-235)||(9489596-9489832)
chr2 (1-235)||(9608857-9609093)
chr2 (1-235)||(28431103-28431339)
chr2 (16-339)||(19687963-19688286)
chr2 (8-218)||(10327554-10327765)
chr2 (1-237)||(18854652-18854889)
chr2 (1-235)||(13305780-13306016)
chr2 (6-218)||(24736100-24736312)
chr2 (1-218)||(10867070-10867289)
chr2 (1-179)||(29281927-29282106)
chr2 (1-218)||(27369999-27370217)
chr2 (1-218)||(27376482-27376700)
chr2 (1-137)||(25936396-25936533)
chr2 (6-339)||(24175387-24175721)
chr2 (14-339)||(24870467-24870793)
chr2 (1-339)||(25962897-25963236)
chr2 (14-339)||(40429052-40429378)
chr2 (170-340)||(24649931-24650101)
chr2 (1-305)||(37525248-37525553)
chr2 (25-235)||(24654553-24654764)
chr2 (117-337)||(22811231-22811451)
chr2 (170-340)||(27602373-27602543)
chr2 (208-340)||(27378832-27378964)
chr2 (25-98)||(26121061-26121135)
chr2 (170-340)||(27382840-27383010)
chr2 (221-340)||(24627891-24628010)
chr2 (25-98)||(26126523-26126597)
chr2 (1-122)||(10867694-10867817)
chr2 (136-339)||(22798442-22798645)
chr2 (6-113)||(45677340-45677447)
chr2 (1-235)||(21917497-21917731)
chr2 (271-347)||(44369750-44369826)
chr2 (1-84)||(12829902-12829987)
chr2 (1-81)||(24506257-24506338)
chr2 (205-339)||(24674176-24674309)
chr2 (1-84)||(29234409-29234494)
chr2 (1-84)||(29347708-29347793)
chr2 (23-115)||(24703126-24703219)
chr2 (1-179)||(25586441-25586621)
chr2 (1-90)||(11679763-11679853)
chr2 (25-179)||(21138484-21138641)
chr2 (25-179)||(21146551-21146708)
chr2 (1-63)||(13969558-13969620)
chr2 (1-63)||(24708920-24708982)
chr2 (1-63)||(24715567-24715629)
chr2 (1-63)||(41603920-41603982)
chr2 (1-63)||(41609839-41609901)
chr2 (1-63)||(45056614-45056676)
chr2 (257-339)||(23019143-23019225)
chr2 (1-54)||(44380384-44380438)
chr2 (1-54)||(44387054-44387108)
chr2 (291-340)||(21138753-21138802)
chr2 (291-340)||(24879783-24879832)
chr2 (291-340)||(30970461-30970510)
chr2 (291-340)||(41530492-41530541)
chr2 (1-81)||(37319058-37319139)
chr2 (291-340)||(10101127-10101176)
chr2 (25-81)||(19645201-19645258)
chr2 (291-340)||(19645469-19645518)
chr2 (163-236)||(22740303-22740376)
chr2 (163-236)||(22758058-22758131)
chr2 (14-43)||(22811126-22811155)
chr2 (274-339)||(24654802-24654867)
chr2 (25-81)||(24871680-24871737)
chr2 (25-81)||(24879515-24879572)
chr2 (25-81)||(30970193-30970250)
chr2 (25-113)||(40621413-40621501)
chr2 (271-339)||(10327433-10327501)
chr2 (291-339)||(10866949-10866997)
chr2 (291-339)||(10874116-10874164)
chr2 (291-339)||(13969850-13969898)
chr2 (271-339)||(21115723-21115791)
chr2 (136-218)||(23067916-23067998)
chr2 (275-339)||(23100685-23100749)
chr2 (168-204)||(24703272-24703308)
chr2 (291-339)||(24708642-24708690)
chr2 (291-339)||(24715289-24715337)
chr2 (291-339)||(25586281-25586329)
chr2 (291-339)||(29234153-29234201)
chr2 (291-339)||(29282218-29282266)
chr2 (291-339)||(29347452-29347500)
chr2 (291-339)||(44387345-44387393)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (3-347)||(922-1266)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-339)||(10478-10817)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (3-339)||(2452-2790)
scaffold0008 (1-156)||(13964-14121)
scaffold0008 (1-112)||(29925-30037)
[»] scaffold0044 (5 HSPs)
scaffold0044 (3-305)||(62821-63124)
scaffold0044 (25-305)||(19775-20056)
scaffold0044 (25-259)||(13484-13719)
scaffold0044 (1-218)||(72089-72307)
scaffold0044 (2-218)||(31224-31440)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (5-347)||(15912-16256)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-339)||(18931-19271)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (2-339)||(9997-10335)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (25-339)||(506-821)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (21-339)||(23793-24112)
scaffold0010 (1-179)||(242794-242974)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (6-339)||(8887-9221)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-339)||(17548-17887)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (25-318)||(2353-2647)
[»] scaffold0042 (5 HSPs)
scaffold0042 (1-339)||(64430-64770)
scaffold0042 (1-339)||(79675-80015)
scaffold0042 (2-339)||(76314-76652)
scaffold0042 (119-332)||(34180-34394)
scaffold0042 (119-339)||(40852-41073)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (14-339)||(1876-2202)
scaffold0013 (61-339)||(9916-10196)
scaffold0013 (6-218)||(131577-131790)
[»] scaffold0029 (7 HSPs)
scaffold0029 (6-340)||(105104-105439)
scaffold0029 (6-339)||(125308-125641)
scaffold0029 (170-340)||(81051-81221)
scaffold0029 (25-108)||(13564-13648)
scaffold0029 (120-179)||(64888-64947)
scaffold0029 (291-334)||(65059-65102)
scaffold0029 (292-340)||(61095-61143)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-339)||(173867-174206)
scaffold0001 (14-339)||(421734-422060)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (28-339)||(10753-11065)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (25-305)||(11065-11346)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-235)||(58650-58886)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (1-235)||(139747-139983)
scaffold0017 (117-347)||(56665-56895)
scaffold0017 (14-339)||(14517-14843)
scaffold0017 (136-234)||(190598-190695)
scaffold0017 (136-234)||(192301-192398)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (14-334)||(17886-18207)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (1-237)||(12431-12668)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-218)||(65715-65934)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (25-339)||(24183-24497)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (1-235)||(9006-9242)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (1-198)||(2-201)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (23-215)||(61419-61612)
scaffold0028 (1-211)||(68212-68425)
scaffold0028 (23-215)||(42285-42478)
scaffold0028 (170-340)||(58080-58250)
scaffold0028 (6-81)||(7749-7826)
scaffold0028 (291-340)||(23588-23637)
scaffold0028 (291-340)||(7579-7628)
scaffold0028 (275-339)||(133207-133271)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-237)||(36983-37220)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-211)||(6070-6283)
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (6-260)||(199-455)
scaffold0052 (1-235)||(57460-57696)
scaffold0052 (1-218)||(11055-11274)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (1-211)||(6752-6964)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (2-157)||(94705-94861)
scaffold0032 (6-95)||(1-91)
scaffold0032 (8-43)||(52468-52503)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (2-218)||(39400-39617)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-218)||(61502-61721)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (26-211)||(155802-155989)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (177-347)||(5436-5606)
scaffold0130 (3-109)||(5331-5438)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (25-232)||(4396-4604)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (3-157)||(29914-30069)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (6-218)||(54262-54474)
scaffold0031 (275-339)||(54141-54205)
scaffold0031 (136-218)||(19742-19824)
scaffold0031 (275-339)||(65248-65312)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-237)||(9805-10040)
scaffold0004 (25-81)||(79051-79108)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (1-218)||(31502-31721)
scaffold0144 (291-339)||(31794-31842)
[»] scaffold0003 (9 HSPs)
scaffold0003 (1-237)||(140387-140623)
scaffold0003 (1-218)||(57671-57890)
scaffold0003 (25-237)||(97285-97497)
scaffold0003 (23-84)||(413347-413408)
scaffold0003 (13-179)||(429912-430081)
scaffold0003 (291-339)||(429752-429800)
scaffold0003 (273-339)||(413545-413611)
scaffold0003 (291-339)||(57550-57598)
scaffold0003 (120-171)||(413445-413497)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (1-218)||(22901-23120)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (1-218)||(3269-3487)
scaffold0126 (291-339)||(3560-3608)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (23-167)||(19011-19157)
[»] scaffold0036 (4 HSPs)
scaffold0036 (1-215)||(65607-65821)
scaffold0036 (1-215)||(70748-70962)
scaffold0036 (25-179)||(74919-75074)
scaffold0036 (271-339)||(65877-65945)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-218)||(38740-38960)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-218)||(75852-76072)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (14-339)||(191520-191846)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (2-179)||(3375-3553)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (14-128)||(19242-19357)
scaffold0120 (145-212)||(19353-19420)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (5-334)||(18536-18866)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-339)||(5597-5935)
[»] scaffold0439 (4 HSPs)
scaffold0439 (6-215)||(1631-1841)
scaffold0439 (6-215)||(9491-9701)
scaffold0439 (271-339)||(1897-1965)
scaffold0439 (271-339)||(9757-9825)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (6-235)||(204181-204411)
scaffold0014 (271-339)||(204447-204515)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (1-237)||(1092-1329)
[»] scaffold1048 (2 HSPs)
scaffold1048 (6-235)||(2117-2347)
scaffold1048 (271-339)||(2013-2081)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (136-339)||(4319-4522)
scaffold0149 (136-339)||(8750-8953)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (119-339)||(63962-64182)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (14-304)||(1293-1584)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (208-340)||(3276-3408)
[»] scaffold0104 (3 HSPs)
scaffold0104 (120-339)||(2425-2644)
scaffold0104 (120-339)||(10106-10325)
scaffold0104 (1-50)||(36099-36148)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (170-339)||(12998-13167)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (243-339)||(9911-10007)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-109)||(16301-16410)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (136-237)||(273466-273567)
scaffold0005 (1-84)||(307929-308014)
scaffold0005 (291-339)||(307674-307722)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (120-339)||(6581-6800)
scaffold0342 (25-84)||(6485-6544)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (136-339)||(4249-4452)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (119-235)||(3467-3583)
scaffold0158 (119-235)||(7133-7249)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (271-347)||(79783-79859)
[»] scaffold0393 (2 HSPs)
scaffold0393 (117-236)||(2090-2209)
scaffold0393 (14-43)||(2285-2314)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (2-339)||(866-1204)
[»] scaffold0425 (2 HSPs)
scaffold0425 (163-339)||(757-933)
scaffold0425 (25-108)||(988-1072)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (147-236)||(17780-17869)
scaffold0174 (3-43)||(17647-17687)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (119-236)||(15374-15491)
scaffold0081 (119-236)||(24392-24509)
scaffold0081 (119-236)||(39816-39933)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-82)||(221009-221090)
[»] scaffold1991 (1 HSPs)
scaffold1991 (267-339)||(830-902)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (1-123)||(7593-7716)
scaffold0476 (291-339)||(6182-6230)
scaffold0476 (291-339)||(7377-7425)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (14-108)||(47451-47546)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (119-236)||(6806-6923)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (270-339)||(206967-207036)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (1-339)||(44628-44966)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (5-52)||(1907-1954)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (6-123)||(5493-5611)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (6-123)||(5243-5361)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (6-123)||(6368-6486)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-81)||(29396-29477)
scaffold0138 (1-81)||(41392-41473)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (163-236)||(16104-16177)
scaffold0324 (275-339)||(2-66)
[»] scaffold0256 (4 HSPs)
scaffold0256 (25-213)||(19345-19535)
scaffold0256 (25-81)||(24188-24245)
scaffold0256 (291-339)||(19613-19661)
scaffold0256 (291-339)||(24456-24504)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (1-179)||(13729-13909)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-84)||(74828-74911)
scaffold0009 (291-339)||(74573-74621)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (25-123)||(1984-2083)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (25-84)||(29-88)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (18-123)||(274-380)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (170-339)||(169111-169280)
scaffold0023 (1-109)||(13766-13876)
scaffold0023 (271-339)||(37951-38019)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (119-236)||(163-280)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (25-218)||(11839-12034)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (136-237)||(2702-2803)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (136-236)||(838-938)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (14-179)||(26203-26371)
scaffold0242 (14-179)||(20029-20197)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (25-111)||(34725-34812)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (170-339)||(1506-1675)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-113)||(38002-38114)
scaffold0080 (1-113)||(17835-17948)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (291-340)||(5280-5329)
scaffold0560 (25-62)||(5012-5049)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (3-43)||(245-285)
scaffold0598 (136-218)||(379-461)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (1-179)||(16921-17101)
[»] scaffold0718 (2 HSPs)
scaffold0718 (4-43)||(4325-4364)
scaffold0718 (275-337)||(4597-4659)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (163-304)||(231-372)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (1-81)||(3545-3626)
scaffold0180 (291-339)||(3286-3334)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (170-339)||(4073-4242)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (119-236)||(13375-13493)
scaffold0056 (3-43)||(16394-16434)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (291-340)||(13019-13068)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-42)||(36996-37037)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (291-339)||(691-739)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (176-339)||(1531-1694)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (25-100)||(27660-27736)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (5-100)||(20989-21085)
scaffold0210 (5-100)||(28881-28977)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (271-339)||(7890-7958)
scaffold0114 (6-79)||(8006-8079)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (4-43)||(17238-17277)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (275-342)||(15134-15201)
scaffold0297 (163-236)||(10178-10251)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (141-236)||(12130-12225)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (5-43)||(2176-2214)
scaffold0106 (5-43)||(8153-8191)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-81)||(37491-37572)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (291-340)||(266-315)
scaffold0628 (117-177)||(92-152)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (6-43)||(175666-175703)
[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (24-60)||(1012-1048)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (275-339)||(732-796)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (120-179)||(1-60)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (271-339)||(4274-4342)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (275-339)||(7140-7204)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (3-43)||(194-234)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (291-339)||(9680-9728)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (136-214)||(9753-9831)
[»] scaffold0423 (2 HSPs)
scaffold0423 (140-218)||(5801-5879)
scaffold0423 (275-339)||(10727-10791)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (271-339)||(6529-6597)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (25-100)||(27239-27315)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (5-100)||(8141-8237)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (271-339)||(60646-60714)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 146)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21703200 - 21702864
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattt 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21703200 ggctgcgagtttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgtttaattgacaaagttaggattgattt 21703101  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatg 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703100 agaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatg 21703001  T
Q  203 tttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21703000 tttaggatgaattctgagattgaaactatgcttagaactttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaaatcatcgctcg 21702901  T
Q  303 ccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  21702900 ccatagcgagctatgattctcgcctcgcgagtgatga 21702864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 2684550 - 2684884
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2684550 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattgattta 2684649  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2684650 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 2684749  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2684750 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatttgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 2684849  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2684850 atagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 2684884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19663677 - 19663343
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19663677 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataatcctgatgaataattgacaaagttaggattgattta 19663578  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663577 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 19663478  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663477 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaattcgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 19663378  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19663377 atagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 19663343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 25134868 - 25135201
Alignment:
Q  7 ctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25134868 ctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttag 25134967  T
Q  106 aaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25134968 aaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttt 25135067  T
Q  206 aggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcca 305  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25135068 aggacgaattctgcgattgaaattaggcatagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcctaaattcattgctcgcca 25135167  T
Q  306 tagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25135168 tggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 25135201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 20800601 - 20800918
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20800601 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 20800700  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20800701 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 20800799  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    | |||||||||||||||||   |||||| ||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20800800 aagtttaggatgaattctggatttgaaactaggcgtagaactaagttagatgatgattttcgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 20800899  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatga 318  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  20800900 tcgccatagcgagctatga 20800918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Original strand, 1586944 - 1587269
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1586944 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaggttaggattgatttagaagagttttggaattagg 1587043  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgag 220  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  1587044 tcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattaatgtagaaactgtcctataaccttagactatgtttaggatgaattctgga 1587142  T
Q  221 attgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaac 320  Q
     |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  1587143 tttgaaactaggcttagaactatgttagatgatgattttcgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatc 1587242  T
Q  321 ctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1587243 ctcgcctcgcgagggatgatgttcatc 1587269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12497210 - 12496872
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12497210 agagtgctgcgattttcttcaaataaggtaagggtgagactattaattcagttttgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggattg 12497111  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12497110 atttagaaattttttgaaattaggtcaaatccccaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccatcctataaccttagaat 12497011  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497010 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgaaatt-gtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 12496912  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12496911 tcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12496872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16742121 - 16741784
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||  ||| ||| |||| ||    
T  16742121 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgattaattagcaaagttcggatgga 16742023  T
Q  101 tttagaaaa-gttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16742022 tttagaaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 16741923  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  16741922 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttttgtaaaaactgcattctacccgag-caaagttcatcgc 16741824  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16741823 tcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagggatga 16741784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 60 - 339
Target Start/End: Original strand, 22592053 - 22592333
Alignment:
Q  60 attgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaag 158  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22592053 attgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaag 22592152  T
Q  159 ttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||     
T  22592153 ttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattatg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagatgatgaaa 22592251  T
Q  258 ttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  22592252 atcgtgtgaaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatga 22592333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25929112 - 25928796
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25929112 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattccgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 25929013  T
Q  124 tcaaaaccctaa-aattgatgatcaaacggtaaaa-gttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25929012 tcaaaaacctaggaattgatgatcaaacggtataatgatgtt-agattgatgtagaaaccatcctaaaaccttagaatatgtttaggatgaattctgaaa 25928914  T
Q  222 ttgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| |    
T  25928913 ttgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaaatgcatcaagtccgagcctaaattcatcgctcgccatggcgagctatgaatc 25928814  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25928813 tcgcctcgcgagtgatga 25928796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 5616029 - 5616242
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5616029 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattattataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 5616128  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  5616129 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattgtggaatt 5616228  T
Q  224 gaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||    
T  5616229 gaaattaggcttag 5616242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20061566 - 20061330
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20061566 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 20061467  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20061466 atttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 20061367  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  20061366 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 20061330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20802672 - 20802436
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20802672 agagtgctgcgattttcttcattcgaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 20802573  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20802572 atttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 20802473  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  20802472 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 20802436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12707525 - 12707267
Alignment:
Q  80 taattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaa 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12707525 taattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaa 12707426  T
Q  179 accgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattct 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||  | ||||||| || |||| ||  |||| ||| ||||||||    
T  12707425 accgtcctataaccttaaaatatgtttaggatgaattctggaattgatactaggcttagaaccatgttagttgttgaaatttttgtaaaaactgcattct 12707326  T
Q  279 gtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgat 337  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  12707325 gcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcaatgatcatcgcctcgcgagtgat 12707267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30695269 - 30695033
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30695269 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 30695170  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30695169 atttagaaaaattttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 30695070  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  30695069 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 30695033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 27327256 - 27327487
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27327256 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattggttta 27327355  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27327356 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgt 27327455  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  27327456 ttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 27327487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 27387996 - 27388227
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27387996 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattggttta 27388095  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27388096 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgt 27388195  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  27388196 ttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 27388227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2869279 - 2869515
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2869279 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagtaaggattg 2869378  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2869379 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 2869478  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     ||||||| |||| ||| ||| ||  |||||||||||    
T  2869479 catgtttaagatggattatgaaatcaaaattaggctt 2869515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 1538121 - 1538314
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1538121 acaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagagaagttttgaaatta 1538220  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 215  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1538221 ggtcgaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 1538314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 1544208 - 1544401
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1544208 acaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagagaagttttgaaatta 1544307  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 215  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1544308 ggtcgaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 1544401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2875894 - 2876130
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  2875894 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgatcgttgtaattttgatgattaattgacaaagtaaggattg 2875993  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2875994 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 2876093  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     ||||||| |||| ||| ||| ||  |||||||||||    
T  2876094 catgtttaagatggattatgaaatcaaaattaggctt 2876130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12763618 - 12763406
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12763618 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattttgatgattagttgacaaagttaggattg 12763519  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12763518 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 12763419  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  12763418 catgtttaggatg 12763406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22429222 - 22429453
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22429222 agagggctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcagtagtgttaattgctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattt 22429321  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22429322 aattagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaat 22429421  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattagg 232  Q
    || |||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  22429422 at-tttaggatgagttctggaattgaagttagg 22429453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26131433 - 26131197
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26131433 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 26131334  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26131333 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 26131234  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  26131233 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 26131197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30598179 - 30597963
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattga-caagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30598179 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttgctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattga 30598081  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  30598080 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 30597982  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30597981 atgtttaggatgaattctg 30597963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 339
Target Start/End: Original strand, 9481530 - 9481823
Alignment:
Q  47 ttcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgat 145  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9481530 ttcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaagattgatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgat 9481629  T
Q  146 caaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgt 245  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||  | ||||    
T  9481630 caaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaattgaaattggacttagaaccatgt 9481729  T
Q  246 tagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||| ||||| ||||     | ||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |  | | | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  9481730 tagttgatggatttttgagaaaaactgttttctgcccgagccaaagttcatcgctcgccctgtcgaacgatgatcctcgcctcgcaagtgatga 9481823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 30637321 - 30637540
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30637321 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 30637419  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30637420 gatttagagaagttttggaattaggtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 30637519  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30637520 atatgtttaggatgaattctg 30637540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 4232642 - 4232859
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4232642 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctaatgattagttgacaaagttaggattg 4232740  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  4232741 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaccggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 4232839  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4232840 tatgtttaggatgaattctg 4232859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 29586968 - 29587204
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29586968 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 29587066  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29587067 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 29587166  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  29587167 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 29587204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 29593011 - 29593247
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29593011 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 29593109  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29593110 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 29593209  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  29593210 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 29593247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 18193744 - 18193960
Alignment:
Q  21 atacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18193744 atacaaggtaagggtgagactaataattctataacgttaattgctgtaattttgatgattagttgacaaagttaggattgatttagagaagttttggaat 18193843  T
Q  120 taggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18193844 taggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtgtagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaacatgtttaggatgaattctg 18193943  T
Q  219 agattgaaattaggctt 235  Q
      ||  |||||||||||    
T  18193944 gaatcaaaattaggctt 18193960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20648982 - 20649200
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20648982 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 20649080  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  20649081 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 20649179  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20649180 atatgtttaggatgaattctg 20649200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6981573 - 6981339
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6981573 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 6981475  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  6981474 gatttagagaag-tttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 6981377  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  6981376 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 6981339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8229803 - 8229567
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8229803 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 8229705  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8229704 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 8229605  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  8229604 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 8229567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18931992 - 18931756
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18931992 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 18931894  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18931893 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 18931794  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  18931793 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 18931756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 17016112 - 17016331
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17016112 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 17016211  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  17016212 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 17016311  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  17016312 tatgtttaggaagaattctg 17016331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28315488 - 28315269
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28315488 agagggctgcgatttttcttcatacaaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 28315389  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  28315388 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 28315289  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28315288 tatgtttaggatgaattctg 28315269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8798105 - 8797887
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8798105 agagggctgcgaatttcttcatacaaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 8798006  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||    
T  8798005 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctttaaccttagaat 8797906  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8797905 atgtttaggatgaattctg 8797887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 18729995 - 18730140
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18729995 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 18730094  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18730095 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa 18730140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 32564433 - 32564651
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32564433 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 32564531  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  32564532 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 32564631  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32564632 tatgtttaggatgaattctg 32564651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25982967 - 25982747
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  25982967 agagggccgtgattttcttcataactaggtaagggtgagactaataattcaatagtgttaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttagaatt 25982868  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  25982867 aatttggagaagttttggaattaggtcaaaaccttaaaaattaatgattaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 25982768  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25982767 atatgtttaggatgaattctg 25982747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27429473 - 27429692
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27429473 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 27429572  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  27429573 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 27429672  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27429673 tatgtttaggatgaattctg 27429692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25111705 - 25111575
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25111705 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgttttagaaaagttttggaattagg 25111606  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggta 154  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25111605 tcaaaaccttaaaattgatgattaaacggta 25111575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25118337 - 25118207
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25118337 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgttttagaaaagttttggaattagg 25118238  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggta 154  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25118237 tcaaaaccttaaaattgatgattaaacggta 25118207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 16551261 - 16551480
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16551261 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 16551359  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| |||||||||||| || |  ||| ||||| |||||||||||    
T  16551360 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaactgtcctttaaccttagaa 16551459  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctga 219  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16551460 tatgtttaggatgaattctga 16551480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 16627817 - 16628036
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16627817 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 16627915  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| |||||||||||| || |  ||| ||||| |||||||||||    
T  16627916 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaactgtcctttaaccttagaa 16628015  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctga 219  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16628016 tatgtttaggatgaattctga 16628036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16577742 - 16577525
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16577742 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 16577644  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||    
T  16577643 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 16577544  T
Q  199 tatgtttaggatgaattct 217  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  16577543 tatgtttatgatgaattct 16577525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16617638 - 16617855
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16617638 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 16617736  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||    
T  16617737 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 16617836  T
Q  199 tatgtttaggatgaattct 217  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  16617837 tatgtttatgatgaattct 16617855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17805099 - 17804773
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagt 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| || || || |    
T  17805099 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattggagaaat 17805000  T
Q  112 tttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
         || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17804999 cgaa-aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgtttaggatg 17804901  T
Q  212 aattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagca 310  Q
    |||||||  || ||||||||||||    | |||      |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||     
T  17804900 aattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcg 17804802  T
Q  311 agcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  17804801 aacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17804773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 28257646 - 28257863
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28257646 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 28257744  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  28257745 gatttagagaagttttggaattaggtcaaa-ccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 28257843  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28257844 tatgtttaggatgaattctg 28257863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 28336395 - 28336612
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28336395 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 28336493  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  28336494 gatttagagaagttttggaattaggtcaaa-ccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 28336592  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28336593 tatgtttaggatgaattctg 28336612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 28343019 - 28343236
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28343019 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 28343117  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  28343118 gatttagagaagttttggaattaggtcaaa-ccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 28343216  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28343217 tatgtttaggatgaattctg 28343236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27186627 - 27186408
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | | ||   ||||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27186627 agagggctgtgtttttcttcataaccaggtaagggtgggactaataacttaatagcattaacctctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 27186528  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  27186527 gattcagagaagttttcgaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 27186429  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27186428 atatgtttaggatgaattctg 27186408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27208463 - 27208244
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | | ||   ||||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27208463 agagggctgtgtttttcttcataaccaggtaagggtgggactaataacttaatagcattaacctctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 27208364  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  27208363 gattcagagaagttttcgaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 27208265  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27208264 atatgtttaggatgaattctg 27208244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27240765 - 27240984
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | | ||   ||||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27240765 agagggctgtgtttttcttcataaccaggtaagggtgggactaataacttaatagcattaacctctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 27240864  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  27240865 gattcagagaagttttcgaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 27240963  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27240964 atatgtttaggatgaattctg 27240984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27262613 - 27262832
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | | ||   ||||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27262613 agagggctgtgtttttcttcataaccaggtaagggtgggactaataacttaatagcattaacctctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 27262712  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  27262713 gattcagagaagttttcgaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 27262811  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27262812 atatgtttaggatgaattctg 27262832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 28264270 - 28264487
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28264270 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtgggggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 28264368  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  28264369 gatttagagaagttttggaattaggtcaaa-ccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 28264467  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28264468 tatgtttaggatgaattctg 28264487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 339
Target Start/End: Original strand, 23656731 - 23656950
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  23656731 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaatttattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtttagaatgaattctgg 23656830  T
Q  220 gattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatga 318  Q
     | |||||||||||||||  | | |  |   |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | ||||    
T  23656831 aactgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatga 23656929  T
Q  319 acctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  23656930 tcctcgcctcgcgagtgatga 23656950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11567607 - 11567437
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11567607 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 11567508  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11567507 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 11567437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Original strand, 12618206 - 12618376
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12618206 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 12618305  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12618306 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 12618376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23395813 - 23395643
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23395813 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 23395714  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23395713 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 23395643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 305
Target Start/End: Original strand, 20907235 - 20907527
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  20907235 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagtt 20907334  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
    ||| |||||||   ||      || |||||||||  | | | | ||| || |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| |||| |||| |||    
T  20907335 ttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccgatgatgataagctg-ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgattagaatg 20907433  T
Q  212 aattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcca 305  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||  | |||| |||| | | ||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20907434 aattatggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcaagtatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgcca 20907527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19871337 - 19871167
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19871337 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattagccttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 19871238  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19871237 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 19871167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23990665 - 23990495
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23990665 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 23990566  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  23990565 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagcgatgat 23990495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Original strand, 29095708 - 29096023
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || || |||||||||||||||  ||||  |||||||||| || || ||       || |||    
T  29095708 aaggtaagggtgagactaacgattcagtaatgttatttcttataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagaaaccgaa-aactag 29095806  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||   ||    
T  29095807 gtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctatgaccttagattatgaatatgatgaattctagaat 29095906  T
Q  223 tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
     ||||||||||||    | |||      |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  | | | |||| ||    
T  29095907 cgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccatgacgaacgatgatcc 29096005  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29096006 tcgcctcgcgagtgatga 29096023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18181384 - 18181283
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18181384 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttggaatta 18181285  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  18181284 gg 18181283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 27552844 - 27553055
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||  ||||  |||||||||| || || ||       || |||    
T  27552844 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagaaaccgaa-aactag 27552942  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  27552943 gtcaactccctaaaattgatgatcaaacagtaaaaattgatgagatggatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtttaggaagaattatggaat 27553042  T
Q  223 tgaaattaggctt 235  Q
     ||||||||||||    
T  27553043 cgaaattaggctt 27553055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 27566897 - 27567107
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||  ||||  |||||||||| || ||  |       || |||    
T  27566897 aaggtatgggtgagactaatgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagcaaccgaa-aactag 27566995  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  27566996 gtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagatggatgtag-aacagtcccttgaccttagaatatgtttaggatgacttctggaat 27567094  T
Q  223 tgaaattaggctt 235  Q
     ||||||||||||    
T  27567095 cgaaattaggctt 27567107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8244569 - 8244437
Alignment:
Q  208 gatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccata 307  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||      
T  8244569 gatgaattctggaattgaaattaagcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcctcgattcatcgctcgccacg 8244470  T
Q  308 gcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8244469 gcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 8244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Original strand, 16522719 - 16522820
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16522719 aattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattgaaattaggctt 16522818  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  16522819 ag 16522820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 25766382 - 25766596
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt--agaaaagttttggaatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||  ||||  | |||||||||||  ||||||       || |    
T  25766382 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaatgaggattgatttggagaaaa---cgaaaact 25766478  T
Q  121 aggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||| |||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||     
T  25766479 aggtcaaatctctaaaaattgatgatcaaacggtagaaagtgattagattgttgtagaaaacgtcccttgatcttagaataggcctaggatgaattctgg 25766578  T
Q  220 gattgaaattaggcttag 237  Q
     |||||||||||||||||    
T  25766579 aattgaaattaggcttag 25766596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21591431 - 21591251
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattga--t 101  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  ||||  ||||||||||  |    
T  21591431 gctgcaattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttacaattctgatgattagttagcaagaattaggattgaatt 21591332  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcc 185  Q
     ||||||   |    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21591331 gtagaaa---tcgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcc 21591251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21416045 - 21415981
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21416045 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaa 21415981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Original strand, 19790044 - 19790143
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| || || |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19790044 aaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 19790143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Original strand, 22405404 - 22405505
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  22405404 aattaatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgacctttgattatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggctt 22405503  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  22405504 ag 22405505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 21732398 - 21732505
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgattta 104  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  21732398 gctgcaattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta 21732497  T
Q  105 gaaaagttt 113  Q
     ||||||||    
T  21732498 -aaaagttt 21732505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 22059194 - 22059270
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22059194 tgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 22059270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22759768 - 22759687
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22759768 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 22759687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 25594566 - 25594722
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttg-tagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| ||       || ||    
T  25594566 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttgttgttaattctgatgattagttagcaaggattaggattgatttagagaa-aacgaaaacta 25594664  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| | | |||||||||||||    
T  25594665 ggtcaaaaccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggtcaaattgatgtagaaa 25594722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14099495 - 14099439
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14099495 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttgttgtaattctgatgatta 14099439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 56
Target Start/End: Original strand, 9481140 - 9481182
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9481140 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatg 9481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16372755 - 16372664
Alignment:
Q  13 ttttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattga 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||    
T  16372755 ttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaacgttaattgattgtaattctgatgattagttaacaagaattaggattga 16372664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 34295256 - 34295436
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  34295256 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactactaactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 34295354  T
Q  97 ttgatt--tagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| |   ||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  34295355 ttgaatcggagaaaa---cgaaaattaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 34295436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 34833496 - 34833440
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  34833496 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttattgtaattctgatgatta 34833440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14117552 - 14117493
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  14117552 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 14117493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 339
Target Start/End: Original strand, 22429494 - 22429560
Alignment:
Q  273 cattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  22429494 cattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22429560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20178068 - 20177956
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||| |||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  20178068 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaatctatgtaattctgatggtccaattaacaagttaggatt 20177970  T
Q  99 gatttagaaaagtt 112  Q
    || ||||| |||||    
T  20177969 gaattagagaagtt 20177956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 22157923 - 22158035
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||| |||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  22157923 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaatctatgtaattctgatggtccaattaacaagttaggatt 22158021  T
Q  99 gatttagaaaagtt 112  Q
    || ||||| |||||    
T  22158022 gaattagagaagtt 22158035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22332345 - 22332276
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22332345 tttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgattgtaattctgatgatta 22332276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 21834071 - 21834178
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||  ||  | ||||||||||  |||| |||||||||| |||    
T  21834071 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccttacaattctgatgatcaaattaacaagttagggttg 21834169  T
Q  100 atttagaaa 108  Q
    | |||||||    
T  21834170 aattagaaa 21834178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 22080187 - 22080255
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  22080187 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatga 22080255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4189734 - 4189652
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4189734 aattgatgatcaaacggtgaaaagttgtt-agaatgatgtagaaaacgtccctagaccttagataatgtttaggatgaattctg 4189652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11285087 - 11285004
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  11285087 agagagctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgattgtaattctgattatta 11285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 31316332 - 31316394
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31316332 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 31316394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 34369161 - 34369240
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatg 77  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  34369161 agagagctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgattgtaattctgatg 34369240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16372476 - 16372426
Alignment:
Q  289 aaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16372476 aaattcatcgctcgccatggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 16372426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19809444 - 19809363
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttg-tagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  19809444 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgatgataattctgatgatta 19809363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 3707985 - 3708034
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3707985 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 3708034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 17036549 - 17036606
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  17036549 aaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaattgattgtaattttgatgatta 17036606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18907885 - 18907709
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt-cg 261  Q
    |||||||||||   ||| |||||| | |||||||| ||||  || |||||||||||  || ||||||||||||    | |||  ||||| ||||||| ||    
T  18907885 ttagattgatgcttaaaacgtccttttaccttagattatgaataagatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgcgagatgttgaattttcg 18907786  T
Q  262 tgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  18907785 tgaa-aaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18907709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Original strand, 23656633 - 23656694
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||    
T  23656633 acaaggtaagggtgagactaacgattcagtaatgttaattcgtataactctgatgattaatt 23656694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 25594834 - 25594883
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25594834 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 25594883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8736697 - 8736602
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttagg 95  Q
    |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  8736697 agagagctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatttatgtaattctgatgatcaaattaacaagttagg 8736602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17031690 - 17031634
Alignment:
Q  26 aggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  17031690 aggtaagggtgagactaataattcaataacgttaactgattgtaattctgatgatta 17031634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18908044 - 18907996
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagta 53  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18908044 ggctgcgattttcatcaaacaaggtaagggtgagactaatgatttagta 18907996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19652861 - 19652797
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  19652861 ttctgtccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcacgagtgatga 19652797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 31154867 - 31154915
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31154867 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatga 31154915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 24290262 - 24290324
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24290262 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttgattg 24290324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 24314268 - 24314330
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24314268 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttgattg 24314330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Original strand, 34369284 - 34369343
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  34369284 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattgatgtagaaa 34369343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4168612 - 4168578
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggta 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4168612 taggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggta 4168578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4168709 - 4168671
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4168709 aaggtaagggtgagactaataactcagtactgttaattg 4168671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4209292 - 4209258
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggta 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4209292 taggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggta 4209258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4209389 - 4209351
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4209389 aaggtaagggtgagactaataactcagtactgttaattg 4209351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 16924010 - 16924051
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16924010 agagggctgcgattt-catcatacaaggtaagggtgagactaa 16924051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 16928726 - 16928767
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16928726 agagggctgcgattt-catcatacaaggtaagggtgagactaa 16928767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18231271 - 18231205
Alignment:
Q  274 attctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  18231271 attctgcccgagcctgaattcatcgctcgccctcgcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 18231205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 18698559 - 18698600
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18698559 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaa 18698600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 154
Target Start/End: Original strand, 18916577 - 18916611
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggta 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18916577 taggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggta 18916611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 22405268 - 22405309
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22405268 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaa 22405309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 339
Target Start/End: Original strand, 25956082 - 25956140
Alignment:
Q  281 ccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  25956082 ccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 25956140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14099402 - 14099365
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggta 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14099402 aattaggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggta 14099365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 340
Target Start/End: Original strand, 18916752 - 18916797
Alignment:
Q  295 atcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18916752 atcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 18916797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 23276513 - 23276570
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||| ||||||||||||    
T  23276513 aaggtaagggtgagactaataactcagtattgctaattgaatgtaattctgatgatta 23276570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 25641548 - 25641621
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||   || ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25641548 ttagattgatggataaatcgtccttggactttagactatgaataggatgaattctgggattgaaattaggctta 25641621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 4185292 - 4185340
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4185292 attcatcgctcgccttcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 4185340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 4667682 - 4667730
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4667682 attcatcgctcgccttcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 4667730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 4674529 - 4674577
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4674529 attcatcgctcgccttcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 4674577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8797814 - 8797766
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8797814 attcatcgctcgccacggcgagccatgatcctcgcctcgcgagtgatga 8797766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11284793 - 11284745
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  11284793 attcatcgctcgccatggcgagctaagaatctcgcctcgcgagtgatga 11284745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 16964444 - 16964483
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16964444 agggctgcgattt-catcatacaaggtaagggtgagactaa 16964483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17031594 - 17031534
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaac 180  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||| ||  ||||||||||||||    
T  17031594 taggtcaaaaccatagaattgatgatcaaacggtagtaattggtttaattgatgtagaaac 17031534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 24290554 - 24290602
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24290554 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 24290602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25118070 - 25118022
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25118070 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacttcgcctcgcgagtgatga 25118022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27186335 - 27186287
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27186335 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 27186287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27208171 - 27208123
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27208171 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 27208123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 27241057 - 27241105
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27241057 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 27241105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 27262905 - 27262953
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27262905 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 27262953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 27429765 - 27429813
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27429765 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 27429813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 28257936 - 28257984
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28257936 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 28257984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 28264560 - 28264608
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28264560 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 28264608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 28336685 - 28336733
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28336685 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 28336733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 28343309 - 28343357
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28343309 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 28343357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 31154577 - 31154617
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  31154577 agggctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaa 31154617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 32564724 - 32564772
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32564724 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 32564772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 34369455 - 34369503
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  34369455 attcatcgctcgccatggcgagctatgagtctcgcctcgcgagtgatga 34369503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 195)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16691113 - 16690773
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16691113 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 16691014  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16691013 atttagaaaagttttggatttaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgttgtagaaaccgtcctataaccttagaa 16690914  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16690913 tatgtttaggatgaattctgggattgaaactaagcttagaactttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 16690814  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16690813 ctcgccatagcgagctatgattctcgcctcgcgagtgatga 16690773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16697708 - 16697368
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16697708 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagcaatattgattgttgtaattctgatgattaattggcaaagttaggattg 16697609  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16697608 atttagaaaagttttggatttaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 16697509  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16697508 tatgtttaggatgaattctgggattgaaactaagcttagaactttgttagatgatgattttcatgtagaaagtgcattttgtccgagccaaaattcatcg 16697409  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16697408 ctcgccatagcaagctatgattctcgcctcgcgagtgatga 16697368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17242886 - 17242547
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17242886 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattg 17242787  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17242786 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 17242687  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17242686 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatttgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 17242587  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17242586 tcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17242547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 38815300 - 38814961
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38815300 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgggactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 38815201  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38815200 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 38815101  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||   ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38815100 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagatgatgataatcgtgtgaaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcg 38815002  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38815001 ctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 38814961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 840138 - 839822
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  840138 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 840039  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  840038 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-tggtgttagattgatgtagaaactgtctcacaaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 839940  T
Q  222 ttgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
    ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| |    
T  839939 ttgaaattaggctcagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcctaaattcatcgctcgccatggcgagctatgaatc 839840  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||| |||||    
T  839839 tcgcctcgcgagggatga 839822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 16808093 - 16808430
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16808093 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgattaattggcaaagttaggattga 16808191  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16808192 attagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaacgtcctataaccttagaata 16808291  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |  | |||| |||| ||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  16808292 tgtttaggatgaattatggaattgaaattaggctttgaaccatgtgagatcatgaaatttttgtaaaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgct 16808391  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||| | || ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  16808392 cgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16808430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 16797247 - 16797584
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16797247 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatagtgattgttataattctgatgattaattggcaaagttaggattga 16797345  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16797346 attagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgattagattgatgtagaaaacgtcctataaccttagaata 16797445  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    |||| |||| ||||| ||  |||| ||| | ||||||| ||||||| |  ||||| |||    
T  16797446 tgtttaggatgaattctggaattgaaattaggctttgaatcatgtgagatcatgaaatttttgtaaaaactacattctgcccgagcctatgttcatggct 16797545  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||| | || ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  16797546 cgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16797584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 16862448 - 16862684
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16862448 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 16862547  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16862548 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaat 16862647  T
Q  223 tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt 259  Q
     |||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||    
T  16862648 cgaaattagacttagaaccatgttagatgatggattt 16862684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Original strand, 28331692 - 28331974
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28331692 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattaacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 28331791  T
Q  124 tcaaaacccta-aaattgatgatcaaacggtaaaa-gttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28331792 tcaaaaacctagaaattgatgatcaaacggtataatgatgtt-agattgatgtagaaaccatcctacaac-ttagaatatgtttaggatgaattctgaga 28331889  T
Q  222 ttgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccat 306  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28331890 ttgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaaatgcatcaagtccgagcctaaattcatcgctcgccat 28331974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 15941096 - 15941399
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15941096 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttttgatgaataattgacaaagttaggattg 15941195  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15941196 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaaccaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgttgtagaaaccgtcctataaccttagaat 15941295  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||   | ||||||||||    
T  15941296 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgaaattcgtgtagaac-tgcaatctgcccgtagcgaaattcatcg 15941393  T
Q  299 ctcgcc 304  Q
    ||||||    
T  15941394 ctcgcc 15941399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Original strand, 15849312 - 15849628
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15849312 aaggtaagggtgagactaataattcagtaattttgattgttataataattatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 15849411  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15849412 tcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaagttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 15849511  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacct 322  Q
    |||||||| |||||  | |||| |||| ||||| ||| |   | ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| | || ||  |||| |||    
T  15849512 gaaattagacttagaaccatgtgagattatgaatttttgaaaaaaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgctcgccctggcgagggatgatcct 15849611  T
Q  323 cgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||||    
T  15849612 cgcctcgcgagtgatga 15849628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 13315399 - 13315610
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13315399 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgatagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 13315498  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  13315499 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattatggaatc 13315598  T
Q  224 gaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||    
T  13315599 aaaattaggctt 13315610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19809922 - 19809607
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19809922 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaggttaggattgatttagaaatgttttggaattagg 19809823  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  19809822 tcaaaacccaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattatggaatc 19809723  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctc 323  Q
     ||||||||||| |  | ||||||| ||||| ||||  |  | |||  |  ||||| ||||||| |  ||||||||||||| | || ||  |||| ||||    
T  19809722 aaaattaggctttgaaccatgttagttgatggattttttagaaaaaccgttttctgcccgagcctatgttcatcgctcgccttggcgagggatgatcctc 19809623  T
Q  324 gcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  19809622 gcctcgcgagtgatga 19809607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 418937 - 418701
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  418937 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 418838  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  418837 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 418738  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  418737 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 418701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 10845448 - 10845667
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10845448 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaaaggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 10845547  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  10845548 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 10845647  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10845648 tatgtttaggatgaattctg 10845667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 31096758 - 31096980
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31096758 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 31096857  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096858 ttgaaattaggtcaaatccctaaatttgatgatcaaacggtaaaactggattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 31096957  T
Q  213 attctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||  |  ||||||||||||    
T  31096958 attctggaaacgaaattaggctt 31096980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26890371 - 26890136
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26890371 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 26890273  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  26890272 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaacctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctttaaccttagaa 26890173  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  26890172 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 26890136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 278
Target Start/End: Original strand, 1597692 - 1597949
Alignment:
Q  22 tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1597692 tacaaggtaagggtgagactattaatttagtattgttaattgatatagttctaatgaataattgacaaagttaggatgaatttagaaaagttttggaatt 1597791  T
Q  121 aggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgag 220  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1597792 aggttaaaacctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg-g 1597890  T
Q  221 at-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattct 278  Q
    || |||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1597891 atgtgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaactgcattct 1597949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26793584 - 26793820
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26793584 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaataacattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 26793683  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26793684 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactggtttagatttatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 26793783  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  26793784 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 26793820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31421742 - 31421978
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31421742 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 31421841  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31421842 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgaggtagaaaccgtcctataaccttagaa 31421941  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  31421942 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 31421978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 41091536 - 41091772
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41091536 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 41091635  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41091636 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 41091735  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  41091736 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 41091772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 5149137 - 5149325
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5149137 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatatta---gttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 5149233  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5149234 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 5149325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13258281 - 13258045
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13258281 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 13258183  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13258182 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaagcggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgttctttaaccttaga 13258083  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  13258082 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 13258045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13251623 - 13251399
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagt 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13251623 tttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattgatttagagaagt 13251524  T
Q  112 tttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13251523 tttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaagcggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgttctttaaccttagaatatgtttaggat 13251424  T
Q  211 gaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||    
T  13251423 gaattctggaatcaaaattaggctt 13251399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6599682 - 6599464
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6599682 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagtgttaatctctgtaattctgatgattagttgacaacgttaggattg 6599584  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  6599583 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgattaaacggtaaaatttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 6599484  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6599483 tatgtttaggatgaattctg 6599464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6606362 - 6606144
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6606362 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagtgttaatctctgtaattctgatgattagttgacaacgttaggattg 6606264  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  6606263 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgattaaacggtaaaatttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 6606164  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6606163 tatgtttaggatgaattctg 6606144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 7792543 - 7792876
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7792543 gctgcgattttcatcaattaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgacgattaattgacaaagttaggattgaatta 7792642  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||    
T  7792643 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtccactgacattagaatatgtt 7792741  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgc 303  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||  |   |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7792742 taggatgaattctggaattgagattaggcttagagccatgagattagatgaattt-ttgaagaaaattgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgc 7792840  T
Q  304 catagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  7792841 cctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 7792876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3834447 - 3834266
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3834447 gagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 3834349  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccg 182  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3834348 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaacccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccg 3834266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6609397 - 6609160
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6609397 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 6609298  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6609297 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 6609198  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  6609197 atatgtttaggatgaattctggaataaaaattaggctt 6609160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10004555 - 10004318
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10004555 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 10004456  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10004455 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 10004356  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  10004355 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 10004318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10011202 - 10010965
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10011202 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 10011103  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10011102 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 10011003  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  10011002 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 10010965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16634767 - 16634531
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16634767 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16634669  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16634668 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 16634569  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  16634568 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 16634531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16641377 - 16641141
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16641377 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16641279  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16641278 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 16641179  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  16641178 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 16641141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43162042 - 43161806
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43162042 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 43161944  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43161943 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 43161844  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  43161843 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 43161806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43168279 - 43168043
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43168279 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 43168181  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43168180 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 43168081  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  43168080 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 43168043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 14672425 - 14672636
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  14672425 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagt-gacaaagttaggattg 14672523  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14672524 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccatcctttaaccttagaa 14672623  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  14672624 catgtttaggatg 14672636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26788044 - 26788280
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26788044 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 26788143  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26788144 atttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactggtttagatttatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 26788243  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  26788244 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 26788280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 5106076 - 5106292
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5106076 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 5106174  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  5106175 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 5106273  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  5106274 atgtttaggaagaattctg 5106292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37616326 - 37616110
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37616326 gagggctgcgattt-cttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 37616228  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  37616227 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 37616129  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37616128 atgtttaggatgaattctg 37616110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48424401 - 48424182
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48424401 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 48424303  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48424302 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 48424203  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48424202 atatgtttaggatgaattctg 48424182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48431179 - 48430960
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48431179 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 48431081  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48431080 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 48430981  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48430980 atatgtttaggatgaattctg 48430960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10905146 - 10904908
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  10905146 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgaatagttgacaaagttaggatt 10905047  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10905046 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 10904947  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  10904946 aatatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 10904908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 16488864 - 16489095
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||  ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  16488864 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattgtttta 16488963  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16488964 gaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgt 16489063  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  16489064 ttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 16489095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10911818 - 10911580
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  10911818 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgaatagttgacaaagttaggatt 10911719  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10911718 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtccttcaaccttag 10911619  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  10911618 aatatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 10911580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1332251 - 1332487
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1332251 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 1332349  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1332350 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 1332449  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  1332450 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 1332487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30066888 - 30066693
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066888 aaggtaagggtaagactcataattcaataacgttgattgctgtaattttgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 30066789  T
Q  124 tcaaaaccctaaa-attgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066788 tcaaaaccctaaagattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaactgtcctttaaccttagaatatgtttaggatgaattctg 30066693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 211
Target Start/End: Original strand, 16623251 - 16623456
Alignment:
Q  8 tgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttaga 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16623251 tgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattgatttaga 16623350  T
Q  107 aaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttt 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16623351 aaagtttggaaattaggtcaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaacatgttt 16623450  T
Q  206 aggatg 211  Q
    ||||||    
T  16623451 aggatg 16623456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15583909 - 15584128
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15583909 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 15584008  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||    
T  15584009 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccatcctttaaccttagaa 15584108  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15584109 tatgtttaggaagaattctg 15584128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15590567 - 15590786
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15590567 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 15590666  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||    
T  15590667 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccatcctttaaccttagaa 15590766  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15590767 tatgtttaggaagaattctg 15590786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 326355 - 326694
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||    
T  326355 agagtgctgcgattttcttcaaacaagataagggtgagactaataattcagtaatgttgattagtatagttctgatgattaattagcaagaattaggatt 326454  T
Q  99 gatttaga--aaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    || || ||  |||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||    
T  326455 gaattggaggaaacgaa---aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttag 326551  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaatt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||   |||||||||   ||||||  | ||| ||||||||| |||||| || |||    
T  326552 aatatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgattagatgat--ttttcgtaga-aaactgcattctgcccgagcgaacatt 326648  T
Q  294 catcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  326649 catcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 326694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 53379541 - 53379777
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53379541 agagggctgcgatttttcttcatacaaggtaagggtgggactaataactcagtaacaataatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 53379640  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| ||| |||||||    
T  53379641 gaattagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattggagaataaacggtaaaacttgtttagattggtgaaagaaccgtcctttaaacttagaa 53379740  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  53379741 tatgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 53379777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 53386193 - 53386429
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53386193 agagggctgcgatttttcttcatacaaggtaagggtgggactaataactcagtaacaataatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 53386292  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| ||| |||||||    
T  53386293 gaattagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattggagaataaacggtaaaacttgtttagattggtgaaagaaccgtcctttaaacttagaa 53386392  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  53386393 tatgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 53386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5202139 - 5201921
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5202139 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 5202041  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  5202040 gatttagagaagatttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 5201941  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5201940 tatgtttaggatgaattctg 5201921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20056591 - 20056810
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20056591 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 20056690  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  20056691 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 20056789  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20056790 atatgtttaggatgaattctg 20056810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20063229 - 20063448
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20063229 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 20063328  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  20063329 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 20063427  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20063428 atatgtttaggatgaattctg 20063448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3691537 - 3691318
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3691537 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 3691438  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  3691437 gatttagaggagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 3691338  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3691337 tatgtttaggatgaattctg 3691318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15483533 - 15483238
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttgg-aattag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15483533 aaggtaagggtgagactaataattcggtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaagtttttgtaattag 15483434  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||| |||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15483433 gtcaaatccctaaaattgat---------------------tagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaat 15483355  T
Q  223 tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacct 322  Q
    |||||||||||||||  | |||  |||| ||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||| | || ||  |||| |||    
T  15483354 tgaaattaggcttagaaccatgcgagatcatgaaatttttgtaaaaactgcattctgcccgagcctatgttcattgctcgccctggcgagtgatgatcct 15483255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16757760 - 16757980
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    |||| || |||||| || ||||||| ||||||||     
T  16757760 agagggctgcgattttctgcaaattaaggtaagggtgagactaataattcaatagcgttaacctctgtaattttgatgactagttgacaaagttaggatc 16757859  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  16757860 gatttagagaagttttggaattaggtcaaa-ccctaaaaaattgatgattaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctgtaaccttag 16757958  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16757959 aatatgtttaggatgaattctg 16757980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 20460732 - 20460944
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||  || |  |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||    
T  20460732 gctgcgattttcatcaattaaggtaagggcgagactaatgattcagtagtattaatccttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatta 20460831  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||    
T  20460832 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatatgtt 20460930  T
Q  205 taggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||    
T  20460931 taggatgaattctg 20460944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 11594343 - 11594669
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagt 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| || || || |    
T  11594343 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattggagaaat 11594442  T
Q  112 tttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
         || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  11594443 cgaa-aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgtttaggatg 11594541  T
Q  212 aattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagca 310  Q
    |||||||  || ||||||||||||    | |||      |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||     
T  11594542 aattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcg 11594640  T
Q  311 agcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11594641 aacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 11594669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7576660 - 7576545
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7576660 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 7576561  T
Q  113 ttggaattaggtcaaa 128  Q
    ||| ||||||||||||    
T  7576560 ttgaaattaggtcaaa 7576545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5222345 - 5222189
Alignment:
Q  24 caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5222345 caaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaattgctgtaattctgatgattaattgataaagttaggattggtttagagaagttttggaattag 5222246  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||    
T  5222245 gtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaa 5222189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Original strand, 22640819 - 22640923
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22640819 acaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgttgtaattatgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 22640918  T
Q  122 ggtca 126  Q
    |||||    
T  22640919 ggtca 22640923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11852393 - 11852170
Alignment:
Q  116 gaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  11852393 gaattaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaagtgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgtttaggatgaatt 11852294  T
Q  216 ctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt-cgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagca 314  Q
    |||  |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||| | || | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | |     
T  11852293 ctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaattttcatgaa-aaactgcattctggccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacg 11852195  T
Q  315 atgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  11852194 atgatcctcgcctcgcgagggatga 11852170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 12037132 - 12037472
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggatt 98  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||   |||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12037132 agagggctgcgattttctgcaaattaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccatgtaattctgatgattaaattaacaagttaggatt 12037231  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    || || || || |     ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || || | ||||||||     
T  12037232 gaattggagaaatcgaa-aattaggtcaaaaccttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgttctttgaccttagat 12037330  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgt-agaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatc 297  Q
    |||| ||| ||||||||  |  || |||||||||||||   | |||  |   ||||| |||  ||  | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  12037331 tatgattaagatgaattaagcaatcgaaattaggcttaaaaccatgagattagatgacttttttgagaaaaactgcattctgcccgagcctacattcatc 12037430  T
Q  298 gctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12037431 gctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12037472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11863543 - 11863320
Alignment:
Q  116 gaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||| | |||  || |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  11863543 gaattaggtcaaatccttagaattgatgattaaacgttgaaaagtgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaatt 11863444  T
Q  216 ctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagca 314  Q
    |||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | || | |     
T  11863443 ctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaattttcgtg-aaaaactgcattctacccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacg 11863345  T
Q  315 atgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  11863344 atgatcctcgcctcgcgagggatga 11863320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42326854 - 42326642
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||    
T  42326854 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttacaattctgatgattagttagcaagaattaggattgaatt 42326755  T
Q  104 --agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
      |||||   |    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||| ||| |  | ||||||||||||    
T  42326754 gtagaaa---tcgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtagaaattgattagattgttgtagaaaacgttccttgaccttagaatat 42326658  T
Q  202 gtttaggatgaattct 217  Q
    ||||||||||||||||    
T  42326657 gtttaggatgaattct 42326642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7110446 - 7110276
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7110446 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 7110347  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7110346 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 7110276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7114381 - 7114211
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7114381 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 7114282  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7114281 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 7114211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Original strand, 22670247 - 22670361
Alignment:
Q  121 aggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgag 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||      
T  22670247 aggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgattatattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaacatgtttaggatggattatgga 22670346  T
Q  221 attgaaattaggctt 235  Q
    ||  |||||||||||    
T  22670347 atcaaaattaggctt 22670361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Original strand, 27409005 - 27409175
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27409005 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 27409104  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27409105 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 27409175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 11297714 - 11298013
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | |||||||||| || || |||| |||||||||| |||    
T  11297714 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaaattaggattgaatta 11297813  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    ||||  || || |||||||   ||    | | |||||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||||| | |||||||| |||||    
T  11297814 gaaagtttatgaaattagggttaataggtgatattgatgatccaatgataataagctgtt-agattgatgcataaaacgtcctttgaccttagattatgt 11297912  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgc 303  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  11297913 ttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgc 11298012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Original strand, 19725228 - 19725431
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  19725228 aattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattatggaattgaaattaggctt 19725327  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtg 335  Q
    ||  | |||| |||| ||||||||   ||| ||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||| | |  | | |||| |||||||||||||| |    
T  19725328 agaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattatgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgtgaacgatgatcctcgcctcgcgaggg 19725427  T
Q  336 atga 339  Q
    ||||    
T  19725428 atga 19725431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Original strand, 1982024 - 1982340
Alignment:
Q  24 caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1982024 caaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgattcttataattctgatgattaattaacaaagttagcattgaattagaaaagttttgaaattag 1982123  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
    |   ||      || ||||||||| || | | | ||| || |||||||  |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||| ||| ||||||  |    
T  1982124 ggttaatagaagaatttgatgatccaatgatgataagctg-ttagatttttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgtttagaatggattctggaa 1982222  T
Q  222 ttgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaac 320  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||||   |||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | || | | |||| |    
T  1982223 ttgaaattaggcttagaaccatgtgagatgatggattt-tagtagaaaactgcattctgcctgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatc 1982321  T
Q  321 ctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1982322 ctcgcctcgcgagtgatga 1982340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22322412 - 22322242
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22322412 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 22322313  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||  | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22322312 gtgcatcatgtccgagcttagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 22322242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 55023592 - 55023422
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  55023592 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattatggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 55023493  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  55023492 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 55023422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12497076 - 12496854
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  12497076 aattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattc 12496977  T
Q  217 tgagattgaaattaggcttagtgctatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagc 313  Q
    ||  |||||||||||||||||  | | |   ||||||||  | ||||||  | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | |    
T  12496976 tggaattgaaattaggcttagaaccaagagattagatga--attttcgtaga-aaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaac 12496880  T
Q  314 aatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  12496879 gatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12496854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28950435 - 28950303
Alignment:
Q  208 gatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccata 307  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||      
T  28950435 gatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacg 28950336  T
Q  308 gcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  28950335 gcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatgat 28950303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16810326 - 16810204
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  16810326 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattgatgcaattctgatgatcaaattaacaagttaggattg 16810228  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    | |||||||  |||||||||||||    
T  16810227 aattagaaagtttttggaattagg 16810204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15618122 - 15617952
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15618122 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattggaattaggcttagaaccttgttagatgatgatttttgtgtagaaa 15618023  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15618022 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 15617952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22337467 - 22337297
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22337467 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttataaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 22337368  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||  | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22337367 gtgcatcatgtccgagcttagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 22337297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Original strand, 321330 - 321533
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  321330 aattgatgattaaacggtgaaaattagttagattgatgtagaaaatgtcctttgaccttagaatatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggctt 321429  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    ||  | |||| |||||||| ||||   ||| ||| | || ||||| |||||||   |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||     
T  321430 agaaccatgtgagatgatggattt-tcgtaaaaactacacttctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagg 321528  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  321529 gatga 321533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 323408 - 323288
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  323408 aattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattc 323309  T
Q  217 tgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  323308 tggaattgaaattaggcttag 323288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11855444 - 11855313
Alignment:
Q  208 gatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgt-agaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccat 306  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| || |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11855444 gatgaattctggaattgaaattagggttagaactatgttaattgatgaaatt-gtgtgaaaaaatgcattctgtccgagccaaagttcatcgctcgccat 11855346  T
Q  307 agcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11855345 agcgagccatgatcctcgcctcgcgagtgatga 11855313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 26190183 - 26190307
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  26190183 agagggctgcgattttctgcaaattaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggatt 26190282  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    || |||||||||||||  |||||||    
T  26190283 gaattagaaaagtttttaaattagg 26190307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 340
Target Start/End: Original strand, 4588266 - 4588335
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4588266 tgcattctgtccgagccaaaattcatccctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 4588335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Original strand, 14877818 - 14878024
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  || ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14877818 aattgatgatcaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgaatatgataaattctggaattgaaattaggctt 14877917  T
Q  236 ---agtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcg 331  Q
       | | | |||| || || |||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | || |  |||||||||||    
T  14877918 aaaattaccatgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatcattctcgcctcgcg 14878016  T
Q  332 agtgatga 339  Q
    ||||||||    
T  14878017 agtgatga 14878024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 339
Target Start/End: Original strand, 3402287 - 3402485
Alignment:
Q  141 atgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgc 240  Q
    ||||| ||||||| ||| |||  | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |    
T  3402287 atgattaaacggtgaaaattgagtggattgctgtagaaactgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaac 3402386  T
Q  241 tatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgat 337  Q
     |||   ||||||||  | ||||||  | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||    
T  3402387 catgagattagatga--attttcgt-aaaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgat 3402483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 339
Target Start/End: Original strand, 18383214 - 18383436
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  18383214 aattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacgatgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattc 18383313  T
Q  217 tgagattgaaattaggcttagtgctatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagc 313  Q
    ||  |||||||||||| ||||  | | |   ||||||||  | ||||||  | ||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| | || | |    
T  18383314 tggaattgaaattaggattagaaccaagagattagatga--attttcgtaga-aaactgcattctgcccgagcctacattcatcactcgccctcgcgaac 18383410  T
Q  314 aatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  18383411 gatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18383436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 305
Target Start/End: Original strand, 11164941 - 11165076
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11164941 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattatggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 11165040  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcca 305  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  11165041 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgcca 11165076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15070923 - 15070720
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||    
T  15070923 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgttctttgaccttagattatgaatatgatgaattctggaatcgaatttaggctt 15070824  T
Q  236 agtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
        | |||| ||||| | || ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||||    
T  15070823 ttaaccatgtgagatgttggattttcgtg-aaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 15070725  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  15070724 gatga 15070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15081082 - 15080879
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||    
T  15081082 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgttctttgaccttagattatgaatatgatgaattctggaatcgaatttaggctt 15080983  T
Q  236 agtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
        | |||| ||||| | || ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||||    
T  15080982 ttaaccatgtgagatgttggattttcgtg-aaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 15080884  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  15080883 gatga 15080879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Original strand, 22642701 - 22642785
Alignment:
Q  151 ggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  22642701 ggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaacatgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 22642785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 15342795 - 15342856
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15342795 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 15342856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 15349438 - 15349499
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15349438 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 15349499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 15726119 - 15726204
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15726119 agagggcttcgattttctgcaaacttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 15726204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 41200985 - 41201070
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  41200985 agagggctgcgattttctgcaaacttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattggttgttgtaattctgatgattaatt 41201070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Original strand, 11299893 - 11300041
Alignment:
Q  190 accttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaa 289  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || ||||  |||||||||  ||||||| || |    
T  11299893 accttagataatgattatgatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgttaattgatgaaatt-gtgtgaaaagtgcatcatgtccgaaccta 11299991  T
Q  290 aattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||    
T  11299992 aattcatccctcgccatggcgatctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 11300041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 218
Target Start/End: Original strand, 16747183 - 16747248
Alignment:
Q  153 taaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747183 taaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctgtaaccttagaatatgtttaggatgaattctg 16747248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15361607 - 15361524
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15361607 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 15361524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 15397094 - 15397177
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15397094 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 15397177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16370210 - 16370007
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  16370210 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaatttaggctt 16370111  T
Q  236 agtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
        | |||| ||||| | || ||||||| | ||| ||||||||| || |||| | |||||||||| ||| | || | | |||| ||||||||||||||     
T  16370110 taaaccatgtgagatgttggattttcgtg-aaaaactgcattctgcccaagcctatattcatcgcttgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgaga 16370012  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  16370011 gatga 16370007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20723896 - 20723716
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  20723896 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 20723798  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  20723797 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 20723716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 23076663 - 23076767
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||    
T  23076663 ggctgcgattttcttcaattaaggtaacggtgagactaatgattcagtagtattaattgatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggactgaatt 23076762  T
Q  104 agaaa 108  Q
    |||||    
T  23076763 agaaa 23076767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16716387 - 16716280
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcat-acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16716387 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 16716288  T
Q  99 gatttaga 106  Q
    ||||||||    
T  16716287 gatttaga 16716280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Original strand, 23052263 - 23052366
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  23052263 gctgcgattttcttcaattaaagtaagggtgagactaatgattcagtagtattaattcatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta 23052362  T
Q  105 gaaa 108  Q
    ||||    
T  23052363 gaaa 23052366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Original strand, 23703983 - 23704042
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23703983 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 23704042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Original strand, 23722439 - 23722498
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23722439 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 23722498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Original strand, 23740895 - 23740954
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23740895 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 23740954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 55149883 - 55149715
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt--agaa 107  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||  ||||    
T  55149883 tttcttcataactaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggattgaattggagaa 55149784  T
Q  108 aagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  55149783 aa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 55149715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4291689 - 4291604
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata--caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| || |||||    
T  4291689 agagggctgcgattttctgcaaattcaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgacgagtaatt 4291604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 10152925 - 10153010
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  10152925 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgagtaatt 10153010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 17524517 - 17524590
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  17524517 ttagattgatgtataaaccgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaatggaaattaggctta 17524590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15052318 - 15052115
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||  |||||| | |||||  || ||||||||||||    
T  15052318 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgttctttgaccttagattatgaataggattatttctggaatcgaaattaggctt 15052219  T
Q  236 agtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
        | |||| ||||| | || ||||||| | ||| ||||||||| ||||| | | | |||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||||    
T  15052218 ttaaccatgtgagatgttggattttcgtg-aaaaattgcattctgcccgagactataatcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 15052120  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  15052119 gatga 15052115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15338348 - 15338265
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15338348 agagggctgcaattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 15338265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 15403706 - 15403789
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15403706 agagggctgcaattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 15403789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 26190460 - 26190528
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  26190460 tgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcacgagtgatga 26190528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4711167 - 4711108
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  4711167 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgagtaatt 4711108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Original strand, 17709834 - 17709893
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  17709834 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgagtaatt 17709893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 7986623 - 7986542
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  7986623 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattttgatgatta 7986542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24188695 - 24188514
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaa-tgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagg 95  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  |||||    
T  24188695 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaattgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagg 24188597  T
Q  96 attgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  24188596 attgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 24188514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 8720344 - 8720524
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |||||||||||| || |||||  ||||||    
T  8720344 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattagga 8720442  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
     ||||||  ||||||       || |||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||    
T  8720443 gtgatttggagaaaa---cgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaa 8720524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 9072231 - 9072411
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |||||||||||| || |||||  ||||||    
T  9072231 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattagga 9072329  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
     ||||||  ||||||       || |||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||    
T  9072330 gtgatttggagaaaa---cgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaa 9072411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 11556847 - 11556915
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11556847 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 11556915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13321597 - 13321549
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13321597 attcatcgctcgccatggcaagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 13321549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 409990 - 410052
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  409990 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 410052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 1144740 - 1144802
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1144740 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 1144802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16337090 - 16337012
Alignment:
Q  4 gggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16337090 gggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggacaaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 16337012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12340395 - 12340333
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgag 333  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  12340395 tgcattctgcccgagcctacattcatcactcgccatagcgagcaatgatcctcgccacgcgag 12340333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 12483344 - 12483290
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcat-acaaggtaagggtgagactaataattcagtaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12483344 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaa 12483290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 16690015 - 16690127
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||| |||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  16690015 agagagctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatttatgtaattcttatgatcaaattaacaagttaggatt 16690113  T
Q  99 gatttagaaaagttt 113  Q
    || ||| ||||||||    
T  16690114 gaatta-aaaagttt 16690127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 16863363 - 16863444
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  16863363 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataaatcagtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 16863444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12892030 - 12891981
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12892030 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 12891981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15829540 - 15829491
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15829540 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 15829491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 15991585 - 15991634
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15991585 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 15991634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 17252538 - 17252587
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17252538 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 17252587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 17673777 - 17673878
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || || || ||||||| |||| || ||||||| |||||  |||||||||| || |||||    
T  17673777 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattttgatgatcaattaacaaagttagaattgaaatagaaaagttatgaaatta 17673876  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  17673877 gg 17673878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 1644137 - 1644201
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  1644137 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 1644201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12173453 - 12173385
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  12173453 tgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12173385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 12933763 - 12933827
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |  | | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12933763 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcacgaacaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12933827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 20460997 - 20461065
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  20460997 tgctttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 20461065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14499951 - 14499904
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14499951 ttcatcgctcgccatggcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 14499904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 234
Target Start/End: Original strand, 15877171 - 15877242
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggct 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15877171 ttagattgatgtataaaccgtccttagaccctagataatgattaggatgaattttgggattgaaattaggct 15877242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Original strand, 25475703 - 25475801
Alignment:
Q  138 ttgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    ||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  25475703 ttgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaattctgaaatcgatgttaggctta 25475801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 323524 - 323483
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  323524 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaa 323483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5222079 - 5222029
Alignment:
Q  289 aaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5222079 aaattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 5222029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6609103 - 6609057
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatg 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6609103 ttcatcgctcgccacagcgagtgatgaacctcgcctcgcgagtgatg 6609057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10004261 - 10004215
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatg 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10004261 ttcatcgctcgccacagcgagtgatgaacctcgcctcgcgagtgatg 10004215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10010908 - 10010862
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatg 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10010908 ttcatcgctcgccacagcgagtgatgaacctcgcctcgcgagtgatg 10010862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10904851 - 10904805
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatg 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10904851 ttcatcgctcgccacagcgagtgatgaacctcgcctcgcgagtgatg 10904805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10911523 - 10911477
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatg 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10911523 ttcatcgctcgccacagcgagtgatgaacctcgcctcgcgagtgatg 10911477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 11852509 - 11852468
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11852509 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaa 11852468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 12497193 - 12497152
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12497193 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaa 12497152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14573396 - 14573311
Alignment:
Q  133 taaaattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14573396 taaaattgttgatcaaacggtgaaaagttgttt-gaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgtttaggatgaattctg 14573311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 856979 - 856891
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||   |||| || |||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  856979 aaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccatgtaattttgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta-aaaagttt 856891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4291397 - 4291348
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4291397 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 4291348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4710901 - 4710852
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4710901 attcatcgctcgccacggcgagccatgaatctcgcctcgcgagtgatgat 4710852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 10235876 - 10235925
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10235876 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagggatgat 10235925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 10326742 - 10326685
Alignment:
Q  28 gtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10326742 gtaagggtgagactaataacttagtaatactaattgattgtaattctgatgattaatt 10326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 11863647 - 11863618
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11863647 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 11863618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12892298 - 12892241
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  12892298 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 12892241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15829808 - 15829751
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  15829808 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 15829751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 15991316 - 15991373
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  15991316 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 15991373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 17252270 - 17252327
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  17252270 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 17252327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 26190347 - 26190420
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||  |  || |||||||||||||    
T  26190347 ttaaattgatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgattaagatgaattaaggaatcgaaattaggctta 26190420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3691245 - 3691197
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3691245 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 3691197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5201848 - 5201800
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5201848 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 5201800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 5419786 - 5419834
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5419786 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 5419834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 5426184 - 5426232
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5426184 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 5426232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6606071 - 6606023
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6606071 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 6606023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7986331 - 7986283
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  7986331 attcatcgctcgccatggcgagctatgagtctcgcctcgcgagtgatga 7986283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 8720636 - 8720684
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8720636 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 8720684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 9072523 - 9072571
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9072523 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 9072571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10326477 - 10326429
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  10326477 attcatcgctcgccatggcgagctatgaatctcgcctcgcaagtgatga 10326429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12483053 - 12483005
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12483053 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12483005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 12506317 - 12506285
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaat 55  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12506317 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtaat 12506285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 15343086 - 15343134
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15343086 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 15343134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 15349729 - 15349777
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15349729 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 15349777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 15584201 - 15584249
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15584201 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 15584249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 15590859 - 15590907
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15590859 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 15590907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 15726411 - 15726459
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15726411 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 15726459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16336801 - 16336753
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16336801 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16336753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 16690285 - 16690353
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  16690285 tgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagttatga 16690353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 16747321 - 16747369
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16747321 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16747369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 16758053 - 16758101
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16758053 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16758101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 17674046 - 17674094
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  17674046 attcatcgctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17674094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 20056883 - 20056931
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20056883 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 20056931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 23704249 - 23704297
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23704249 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 23704297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 23722705 - 23722753
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23722705 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 23722753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 23741161 - 23741209
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23741161 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 23741209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 25475566 - 25475606
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  25475566 agggctgcgattttcatcctataaggtaagggtgagactaa 25475606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 42326588 - 42326520
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  42326588 tgcatcctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 42326520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 49667560 - 49667624
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  49667560 ttctgcccgagccaacattcttcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 49667624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 340
Target Start/End: Original strand, 53379834 - 53379882
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  53379834 ttcatcgctcgccacagcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 53379882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 340
Target Start/End: Original strand, 53386486 - 53386534
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  53386486 ttcatcgctcgccacagcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 53386534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 104)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 22134423 - 22134761
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22134423 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaatcgacaaagttaggattga 22134522  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22134523 tttagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaata 22134622  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22134623 tgtttaggatgaattctgggattgaaactaagcttagaactttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcaatctgtcagagccaaaattcatcgct 22134722  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22134723 cgccatagcgagccatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22134761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 22109510 - 22109848
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22109510 gagggctgcgattttcttcatacaaggttagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 22109609  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  22109610 tttagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagcctaagaatg 22109709  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22109710 tgtttaggatgaattatgggattgaaactaagcttagaactttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcaatctgtcagagccaaaattcatcgct 22109809  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22109810 cgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22109848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 22165573 - 22165911
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22165573 gagggctgcgattttcttcatacaaggttaaggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattttgatgattaattgacaaagttaggattga 22165672  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22165673 tttagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaata 22165772  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22165773 tgtttaggatgaattctaggattgaaactaagcttagaactttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcaatctgtcagagccaaaattcatcgct 22165872  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  22165873 cgccatagcgagccatgatcctcgcctcgtgagtgatga 22165911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Original strand, 17052583 - 17052899
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052583 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaaattatgattgatttagaaaagttttggaattagg 17052682  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052683 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 17052782  T
Q  223 tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacct 322  Q
    ||||| |||||||||  ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  17052783 tgaaactaggcttagaacttagttggatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgaatct 17052882  T
Q  323 cgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| |||||||||    
T  17052883 cgcctcgtgagtgatga 17052899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32599543 - 32599239
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  32599543 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgaggattaattgacaaagttatgattgat 32599444  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32599443 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaata 32599344  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32599343 tgtttaggatgaattctgggattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcgtgtccgagccaaaattcatcgct 32599244  T
Q  301 cgcca 305  Q
    |||||    
T  32599243 cgcca 32599239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32606115 - 32605810
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  32606115 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgaggattaattgacaaagttatgattgat 32606016  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32606015 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaata 32605916  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32605915 tgtttaggatgaattatgggattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcatgtagaaagtgcatcgtgtccgagccaaaattcatcgct 32605816  T
Q  301 cgccat 306  Q
    ||||||    
T  32605815 cgccat 32605810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22057495 - 22057158
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22057495 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgtcatgattctgatgattaattgacaaagttaggattga 22057397  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22057396 tttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 22057297  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  22057296 tgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttttgtaaaaattgcattctgcccgagcctatattcatcgct 22057197  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  22057196 cgcaatagcgagccatgatcctctcctcgcgagtgatga 22057158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15539362 - 15539024
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15539362 agagtgctgcgactttcttcaaacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggattg 15539263  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539262 atttagaaaagtttcggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 15539163  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15539162 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgaaattcgtgcag-aactgcattctgcccgagccaaagttcatcg 15539065  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  15539064 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatga 15539024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 23844108 - 23844445
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23844108 gagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 23844206  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23844207 atttagaaaagttttgaaattaggttaac-ccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 23844305  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||| |||||||  | ||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  23844306 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaagtttatcg 23844404  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  23844405 ctcgccatagagagctatgatcctcgcctcgcgagggatga 23844445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22058251 - 22057925
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22058251 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattctgtaatattgattgttatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaagtt 22058152  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22058151 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 22058052  T
Q  213 attctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaag 312  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||  ||    
T  22058051 attctggaattgaaactaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttttgtaaaaactgcattctgcccgagccaaagttgatcgctcgccatagggag 22057952  T
Q  313 caatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22057951 caatgatcctcgcctcgcgagtcatga 22057925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15532802 - 15532464
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15532802 agagtgctgcaattttcttcaaacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggattg 15532703  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532702 atttagaaaagtttcggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 15532603  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15532602 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgaaattcgtgcag-aactgcattctgcccgagccaaagttcatcg 15532505  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  15532504 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcacgagggatga 15532464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22029460 - 22029134
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22029460 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataataaaataatattgattgttatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaagtt 22029361  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22029360 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 22029261  T
Q  213 attctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaag 312  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||| ||  |||| ||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  22029260 attctggaattgaaactaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttttgtaaaaactacattctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgag 22029161  T
Q  313 caatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  22029160 caatgatcctcacctcgcgagggatga 22029134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22045772 - 22045435
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22045772 gagggctgcgattt-cttcatataaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgtcatgattctgatgattaattgacaaagttaggattga 22045674  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22045673 tttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 22045574  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||   ||| ||| ||||||||  ||||||| |  ||||||| |    
T  22045573 tgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaaattttagtaaaaattgcattctacccgagcctatgttcatcgtt 22045474  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  22045473 cgccatagcgagccatgatcctcgcctcgcgagggatga 22045435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23835060 - 23834727
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23835060 agagggctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgaataattgacaaagttaggatt 23834962  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23834961 gatttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 23834862  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  23834861 tatgtttaggatgaattctggatttgaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttttgtaggaactgcattctgcccgagctaaagttcatcg 23834762  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgag 333  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  23834761 ctcgccatggcgagcaatgatcctcgccacgcgag 23834727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 30307946 - 30308182
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30307946 agagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagtgtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggatt 30308044  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  30308045 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtaaaaagcgtcctataacc-tagaa 30308143  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30308144 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttag 30308182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 17827782 - 17828061
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17827782 agagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggatt 17827880  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17827881 gatttagataagttttgtaattaggttaaattcctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 17827980  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctg 279  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17827981 tatgtttaggacgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagatgatgaaattcgtgtagaaactgcattctg 17828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18855852 - 18855617
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18855852 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18855754  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855753 atttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 18855654  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  18855653 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 18855617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22084727 - 22084491
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22084727 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 22084628  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaa-attgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22084627 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaagattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22084528  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  22084527 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 22084491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18866247 - 18866036
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18866247 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactgataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18866149  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18866148 atttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 18866049  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  18866048 catgtttaggatg 18866036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19112092 - 19111855
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19112092 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 19111993  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19111992 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 19111893  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  19111892 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 19111855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19118433 - 19118196
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19118433 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 19118334  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19118333 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 19118234  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  19118233 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 19118196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 16230765 - 16231079
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16230765 agagggctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagaataataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgataaagttaggatt 16230863  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16230864 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaatagattagattgatgtagaaacaatcctataaccttagaa 16230963  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |   ||||| ||||||  | ||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  16230964 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgattagatgattttcgtaga-aaactgcattctgcccgagcctatgttcatcg 16231062  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaa 315  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  16231063 ctcgccacagcgagcaa 16231079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 17668763 - 17668979
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17668763 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 17668861  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  17668862 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 17668960  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17668961 atgtttaggatgaattctg 17668979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 17675415 - 17675631
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17675415 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 17675513  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  17675514 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 17675612  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17675613 atgtttaggatgaattctg 17675631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Original strand, 24433448 - 24433732
Alignment:
Q  22 tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24433448 tacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggatgaatttagaaaagttttggaatt 24433547  T
Q  121 aggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24433548 aggttaaaacctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgttccataaccttagaatatgtttaggatgaattctg- 24433646  T
Q  220 gat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   | | ||||||||||||||    
T  24433647 gatgtgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgaaattcgtgtagaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgctcgcc 24433732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22121564 - 22121800
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22121564 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 22121663  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaa-attgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22121664 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaatattgatgatcaaacggtaaaacatgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22121763  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  22121764 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 22121800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 23252007 - 23252238
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttc-ttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatt 102  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23252007 ggctgcgattttcattcatt-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatt 23252105  T
Q  103 tagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatg 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23252106 tagaaaagttttgtaattaggtcaaatccctaaatttgatgatcaaacgttaaaactggattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatg 23252205  T
Q  203 tttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23252206 tttaggatgaattctgaaaacgaaattaggctt 23252238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22114862 - 22115098
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22114862 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 22114961  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22114962 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttaaattgatgtagaaaccgtcctttaaccttataa 22115061  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  22115062 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 22115098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22122575 - 22122811
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22122575 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaattattcaatagcattgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 22122674  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22122675 atttagaaaagtttttgaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22122774  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     ||| |||||||| ||| | | ||  |||||||||||    
T  22122775 catgattaggatggattataaaatcaaaattaggctt 22122811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28455723 - 28455504
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28455723 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 28455625  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28455624 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 28455525  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28455524 atatgtttaggatgaattctg 28455504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22826760 - 22826422
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22826760 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgacactaataattcagtaatgttagtttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattg 22826661  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  22826660 att-agaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaa 22826563  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattca 295  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |  ||   |||||||||   ||||||  | ||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  22826562 tatgtttaggatgagttatgggattgaaattaggcttagaaccgtgtgattagatgat--ttttcgtaga-aaactgcattctgcccgagccaacattca 22826466  T
Q  296 tcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  22826465 tcgctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22826422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21914782 - 21915017
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21914782 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 21914880  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  21914881 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 21914979  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  21914980 atatgtttaggatgaattctgcaatcaaaattaggctt 21915017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5533630 - 5533809
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5533630 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 5533728  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtc-aaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||    
T  5533729 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaa 5533809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18066246 - 18066027
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18066246 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 18066148  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||    
T  18066147 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 18066048  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctga 219  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18066047 tatgtttaggatgaattctga 18066027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22048864 - 22048644
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggat 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22048864 agagggctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggat 22048765  T
Q  98 tgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaa-aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||  ||||| |||||||||    
T  22048764 tgatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaagaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattaatgtaagaattgtcctgtaaccttag 22048666  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22048665 aatatgtttaggatgaattctg 22048644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15440603 - 15440477
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15440603 agagtgctgcaattttcttcaaacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggattg 15440504  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtca 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15440503 atttagaaaagtttcggaattaggtca 15440477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 15610649 - 15610988
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | |||||||||| || || |||||||||||| |    
T  15610649 agagagctgcgattttcttgatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaagttaggatag 15610748  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||||||  || || |||||||   ||    | |||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||     
T  15610749 aattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctgtt-agattgatgcataaaacgtcctttgaccttagat 15610847  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||   | | ||| ||||||||| ||||||    ||||||||    
T  15610848 tatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgaaaaaattgcattctgcccgagcttgtattcatcg 15610947  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  15610948 ctcgccatagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 15610988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19983898 - 19983695
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19983898 aattgatgattaaacggtgaaagttggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaattgaaattaggctt 19983799  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    |   | |||| |||||||| ||||   ||| ||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||| ||||    
T  19983798 aaaaccatgtgagatgatggattt-tcgtaaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgagagt 19983700  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  19983699 gatga 19983695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19977250 - 19977047
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19977250 aattgatgattaaacggtgaaagttggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctcgaattgaaattaggctt 19977151  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    |   | |||| |||||||| ||||   ||| ||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||| ||||    
T  19977150 aaaaccatgtgagatgatggattt-tcgtaaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgagagt 19977052  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  19977051 gatga 19977047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 339
Target Start/End: Original strand, 22009976 - 22010198
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22009976 aattaggtcaaatccctagaattgatgattaaacagtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaattc 22010075  T
Q  217 tgagattgaaattaggcttagtgctatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagc 313  Q
    ||  |||||||||||||||||  | |||   ||||||||  | ||||||  | ||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | |    
T  22010076 tggaattgaaattaggcttagaaccatgagattagatga--attttcgtaga-aaactacattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctggcgaac 22010172  T
Q  314 aatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  22010173 gatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22010198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 16409440 - 16409774
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | |||||||||| || || |||| |||||||||| |||    
T  16409440 gctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaaattaggattgaatta 16409539  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    ||||  || || |||||||   ||    | |||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||| | |||||||| |||||    
T  16409540 gaaagtttatgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagttgtt-agattgatgcataaaatgtcctttgaccttagattatgt 16409638  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgc 303  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||    || ||| ||||||||| |||||||   |||||||||| ||    
T  16409639 ttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcataaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcgcttgc 16409738  T
Q  304 catagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  16409739 cctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16409774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 339
Target Start/End: Original strand, 39094154 - 39094471
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || |  |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  39094154 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgattcttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaattttttgaaatta 39094253  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgag 220  Q
    ||   ||      || |||||||||  | | ||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  39094254 gggttaataggagaatttgatgatccgaagataataagctgtt-agattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgtttagaatgaattctgga 39094352  T
Q  221 attgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaac 320  Q
    |||||||||||||||||    |||| |||| ||| ||||   ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| |    
T  39094353 attgaaattaggcttagaatcatgtgagatcatgtatttttcgtaaaaactgcattctgtccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatc 39094452  T
Q  321 ctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  39094453 ctcgcctcgcgagggatga 39094471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 339
Target Start/End: Original strand, 21168020 - 21168240
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||| ||||| || || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  21168020 ttagatcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 21168119  T
Q  219 agattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatg 317  Q
      ||||||||||||||||   | |||| || || |||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||    
T  21168120 gaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaccgatg 21168218  T
Q  318 aacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  21168219 atcctcgcctcgcgagtgatga 21168240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Original strand, 21971984 - 21972116
Alignment:
Q  208 gatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccata 307  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||      
T  21971984 gatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgttcgagcctagattcatcgctcgccacg 21972083  T
Q  308 gcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21972084 gcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 21972116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43252519 - 43252387
Alignment:
Q  208 gatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccata 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||      
T  43252519 gatgaattctggaattgaaattagacttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacg 43252420  T
Q  308 gcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  43252419 gcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 43252387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Original strand, 19277646 - 19277816
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19277646 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 19277745  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | | |||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19277746 gtgcatcatgtccgagcctagactcatcgctcgccacgacgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 19277816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22112575 - 22112405
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22112575 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattatggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 22112476  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22112475 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacgacgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 22112405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16411471 - 16411808
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | ||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  16411471 agagagctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattccgatgatcaaattaacaagttaggattg 16411570  T
Q  100 atttagaaaagttt-tggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    | ||| |||||||| || |||||||   ||    | |||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||    
T  16411571 aatta-aaaagtttatgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctgtt-agattgatgcataaaacgtcctttgaccttaga 16411668  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaag-tgcattctgtccgagccaaaattcat 296  Q
     ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||   |||||||  ||||||||| |||||||   ||||||    
T  16411669 ttatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaattttc-gtagaaaactgcattctgcccgagcctgtattcat 16411767  T
Q  297 cgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgat 337  Q
     ||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||    
T  16411768 tgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgat 16411808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Original strand, 21976069 - 21976201
Alignment:
Q  208 gatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccata 307  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||      
T  21976069 gatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcctagacacatcgctcgccacg 21976168  T
Q  308 gcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21976169 gcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 21976201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Original strand, 20855076 - 20855193
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || || ||||||| |||| || ||||||||||||| |||    
T  20855076 gctgcgatttt-ttcataaaaggtaagggtgagactaacaattcagtgatgttaattcttataattatgatgatcaattaacaaagttaggattgaatta 20855174  T
Q  105 gaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  20855175 gaaaagttttgaaattagg 20855193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 16860561 - 16860662
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  16860561 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcttataattctgatgatcaattgacaaagttaggattgaattataaaagtttttaaatta 16860660  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  16860661 gg 16860662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 16406756 - 16407095
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | ||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  16406756 agagagctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaaattaggattg 16406855  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||||||  || || |||||||   ||    | |||||||||||| || | ||| ||| || ||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||     
T  16406856 aattagaaagtttatgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctg-ttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagat 16406954  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||    || ||| ||||||||| |||||||   ||||||||    
T  16406955 tatgtttagaatgaattatggaaatgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcataaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcg 16407054  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| | |  | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  16407055 ctcgccctcgtgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 16407095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19899825 - 19899725
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  19899825 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattatggaattgaaattaggctt 19899726  T
Q  236 a 236  Q
    |    
T  19899725 a 19899725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 339
Target Start/End: Original strand, 21161413 - 21161634
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatga-tcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattct 217  Q
    |||||||||| || || ||||||||  | ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  21161413 ttaggtcaaatccttagaattgatgtgttaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattct 21161512  T
Q  218 gagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaat 316  Q
    |  ||||||||||||||||   | |||| || || |||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | ||    
T  21161513 ggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgat 21161611  T
Q  317 gaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  21161612 gatcctcgcctcgcgagggatga 21161634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15602260 - 15602497
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | || |||||||  |||| |||||||||||| |    
T  15602260 agagagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattatgatgatcaaattaacaagttaggatag 15602359  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||||||  || || |||||||   ||    | |||||||||||| || | ||| ||| || ||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||     
T  15602360 aattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctg-ttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagat 15602458  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  15602459 tatgtttagaatgaattatggaattgaaattaggcttag 15602497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24756541 - 24756356
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||  || |||||||||||    
T  24756541 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattatgaatatgatgaattctg 24756442  T
Q  219 agattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
      ||||||||||||||||     |||| || || |||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  24756441 gaattgaaattaggcttaaaatcatgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgcc 24756356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16185548 - 16185328
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||  || |||||||| ||    
T  16185548 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccctagactatgaataagatgaattttg 16185449  T
Q  219 agattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatg 317  Q
      ||||||||||||||||   | || | || || |||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||    
T  16185448 gaattgaaattaggcttaaaaccatatgagctgttgaattttcgtg-aaaaactgcattctacccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatg 16185350  T
Q  318 aacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  16185349 atcctcgcctcgctagtgatga 16185328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 339
Target Start/End: Original strand, 17926029 - 17926233
Alignment:
Q  135 aaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggc 233  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||    
T  17926029 aaattgatgatcaaatgataataagctgtt-agattaatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgtttagaatgaaatctggaattgagattaggc 17926127  T
Q  234 ttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgag 333  Q
    ||||    |||| |||| ||||| ||   ||| ||| |||||| || |||||||   |||||||||||||| |||| | | |||| ||| ||||||||||    
T  17926128 ttagaatcatgtgagatcatgaaattttcgtaaaaactgcattatgcccgagcctgtattcatcgctcgccctagcgaacgatgatccttgcctcgcgag 17926227  T
Q  334 tgatga 339  Q
    ||||||    
T  17926228 tgatga 17926233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18620126 - 18620054
Alignment:
Q  267 aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18620126 aaagtgcattatgtccgagccaaagttcatcgctcgtcatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18620054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 29124001 - 29123916
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    ||||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29124001 agagggctgcgtttttctgcaaacttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 29123916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 11609134 - 11609042
Alignment:
Q  7 ctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  11609134 ctgcaattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggatt 11609042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20528366 - 20528186
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatt-gttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  20528366 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattaattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 20528268  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  20528267 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 20528186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 8353953 - 8354038
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  8353953 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 8354038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 16882363 - 16882446
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16882363 agagggttgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 16882446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 378054 - 377878
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt-cg 261  Q
    |||||||||||   |||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||    | |||| ||||| || |||| ||    
T  378054 ttagattgatgcttaaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcg 377955  T
Q  262 tgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||| |||||||||||    
T  377954 tgaa-aaattgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgccttgcgagtgatga 377878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Original strand, 20465382 - 20465558
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt-cg 261  Q
    |||||||||||   ||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||    | |||| ||||| || |||| |     
T  20465382 ttagattgatgcttaaaacgtcctttgaccttagattatggttaggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttca 20465481  T
Q  262 tgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  20465482 tgaa-aaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 20465558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Original strand, 19258918 - 19259121
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  || || | |||||||| |||   ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  19258918 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaattgttctttgaccttagattattaataggatgaattctggaatcgaaattaggctt 19259017  T
Q  236 agtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
        | |||| ||||| | || ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |  |||||| |||||| | || | | |||| |||| ||||||||||    
T  19259018 taaaccatgtgagatgttggattttcgtg-aaaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcactcgccctcgcgaacgatgatcctcacctcgcgagt 19259116  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  19259117 gatga 19259121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 21388907 - 21388971
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21388907 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccatcgcgaacaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 21388971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 232
Target Start/End: Original strand, 23776179 - 23776275
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattagg 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||   |||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  23776179 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattataaataggataaattatggaattgaaattagg 23776275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 30642449 - 30642557
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  30642449 agagagctgcgattttcatcaactaaggtaagggtgagactaatgattcaatattgttaatctatgtaatcctgatgatcaaattaacaagttaggattg 30642548  T
Q  100 atttagaaa 108  Q
    | |||||||    
T  30642549 aattagaaa 30642557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 43
Target Start/End: Original strand, 5865459 - 5865498
Alignment:
Q  4 gggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5865459 gggctgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagactaa 5865498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 20013053 - 20013115
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20013053 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 20013115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 20019129 - 20019191
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20019129 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 20019191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 22985441 - 22985484
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaat 44  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22985441 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaat 22985484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 43
Target Start/End: Original strand, 23776045 - 23776084
Alignment:
Q  4 gggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776045 gggctgcggttttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 23776084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 339
Target Start/End: Original strand, 25362499 - 25362669
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt-cgtgtagaa 268  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||| | ||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||   | |||| ||||| || |||| |||| | ||    
T  25362499 gatgtagaaactgtcctttgacattaaattatgaatatgatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaa 25362598  T
Q  269 agtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| | ||||||||||||| ||||    
T  25362599 actgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgcccttgcgaacgatgatcatcgcctcgcgagttatga 25362669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 19899957 - 19899920
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19899957 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaa 19899920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Original strand, 20462862 - 20462950
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||  |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20462862 aaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatttatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta-aaaagttt 20462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Original strand, 20465243 - 20465331
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||  |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20465243 aaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatttatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta-aaaagttt 20465331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 26934658 - 26934707
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26934658 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 26934707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 8354245 - 8354293
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8354245 attcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 8354293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 21395246 - 21395286
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21395246 agggctgcgattttcatcaaacaaggtaagggtgagactaa 21395286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 21789739 - 21789779
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21789739 agggctgcgattttcatcaaacaaggtaagggtgagactaa 21789779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 20023117 - 20023179
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20023117 agaggactgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 20023179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 23844990 - 23845052
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  23844990 agagggctgcgattt-cttcataactaggtaagggtgagactaataactcaatattgttaattg 23845052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 378217 - 378105
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||  |||| | ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  378217 agagagctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatttatgtaatcctgatgatcaaattaacaagttaggatt 378119  T
Q  99 gatttagaaaagttt 113  Q
    || ||| ||||||||    
T  378118 gaatta-aaaagttt 378105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Original strand, 23054503 - 23054541
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23054503 aaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 23054541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3217099 - 3217042
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  3217099 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 3217042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 26934390 - 26934447
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  26934390 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 26934447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 5865593 - 5865675
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccg-tcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  5865593 aattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaactgttccta-gaccttagataatgtgtaggatgaattctg 5865675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 5865732 - 5865796
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  5865732 ttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 5865796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17141579 - 17141515
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  17141579 ttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17141515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 20013345 - 20013393
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20013345 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 20013393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 20019421 - 20019469
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20019421 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 20019469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 20023409 - 20023457
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20023409 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 20023457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20528074 - 20528026
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  20528074 attcatcgctcgccacagcgagctatgagtctcgcctcgcgagtgatga 20528026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21255885 - 21255821
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||| ||| |||||||||| |||||    
T  21255885 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgcccttgcaaacgatgatccttgcctcgcgagggatga 21255821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 21395431 - 21395495
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  21395431 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacaatgatcctcgcctcgcgagggatga 21395495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 21789924 - 21789988
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  21789924 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacaatgatcctcgcctcgcgagggatga 21789988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 23776284 - 23776352
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  23776284 tgcattctgcccgagcctatattcatcgcttgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23776352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28398292 - 28398224
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||| | || ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  28398292 tgcattctgcccgagctgagattcatcgctcgccctcgcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 28398224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29123709 - 29123661
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29123709 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 29123661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 30642720 - 30642788
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |  | | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  30642720 tgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcacgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 30642788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31971909 - 31971845
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  31971909 ttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 31971845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 338
Target Start/End: Original strand, 15854 - 16191
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15854 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 15953  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15954 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaata 16053  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16054 tgtttaggatgaattctgggattgaaactaggcttagaactatgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgcccgagccgaaattcatcgct 16153  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatg 338  Q
    |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16154 cgccatggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatg 16191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 130)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 18601936 - 18602272
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18601936 agggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaaagttaggaatgat 18602034  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18602035 ttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 18602134  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 301  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18602135 gtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaactatgctagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcattgctc 18602234  T
Q  302 gccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  18602235 gccatagcgagctatgaacttcgcctagcgagtgatga 18602272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3413708 - 3413364
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3413708 agggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttctagttctgatgattaattgacaaagttaggattgat 3413610  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaacccta-aaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3413609 ttagaaaatttttggaattaggtcaaaaccctacaaattgatgatcaat-ggtacaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 3413511  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3413510 tgtttaggatgaattctgggattgaaattaggcttaaaaccatgttagatgatgattttcgtgtagaaagagcattctgtccgagccaaaattcatcgct 3413411  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3413410 ctccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 3413364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 28568636 - 28568974
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28568636 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttagggttga 28568735  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28568736 tttagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaata 28568835  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28568836 tgtttaggatgaattatgggattgaaactaagcttagaactttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcaatctgtccgagccaaaattcatcgct 28568935  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | |||| || | | ||||  |||||||||||||||||||    
T  28568936 caccattgcgaactatgattctcgcctcgcgagtgatga 28568974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2015688 - 2015354
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2015688 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 2015589  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2015588 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 2015489  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |  |||||| |||||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2015488 taggatgaattctgaaatttaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaattgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 2015389  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2015388 atagtgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 2015354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 14707827 - 14708163
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattt 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14707827 ggctgcgattttcttcatataaggtaagggtgagaataataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattt 14707926  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14707927 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatat 14708025  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  14708026 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattatcgtgtagaaagtgcattctgcccgagcagaaattcatcgctc 14708125  T
Q  302 gccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  14708126 gccatagtgagctatgattctcgcctcgcgagtgatga 14708163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 18608508 - 18608844
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||    
T  18608508 agggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgataaagttatgaatgat 18608606  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18608607 ttagaaaagttttggaattaggttaaaaccgtaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttaaattgatgtagaaaccgtcctataaccctagaatat 18608706  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 301  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18608707 gtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaactatgctagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 18608806  T
Q  302 gccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||| ||| || ||| ||| |||| |||||||||    
T  18608807 gccatagcgagctataaacttcgtctcgtgagtgatga 18608844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Original strand, 17151725 - 17152039
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaagttaggattgatttagaaaagttttggaattaggt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  17151725 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagtaggattgatttagaaaatttttaaaattaggt 17151824  T
Q  125 caaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17151825 caaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaattg 17151924  T
Q  225 aaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcg 324  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||     
T  17151925 aaattaggcttagaactatgttagttgatgaaatttgtgtagaaattgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagctatgatcctca 17152024  T
Q  325 cctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| |||||||||    
T  17152025 cctcgagagtgatga 17152039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 18221568 - 18221907
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18221568 agagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagagtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggatt 18221666  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18221667 gatttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 18221766  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  | |||| |||| ||||| ||  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  18221767 tatgtttaggatgaattctggaattgagattaggcttagaaccatgtgagatcatgaaatttttgtagaaactgtattctgtctgagccaaagttcatcg 18221866  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18221867 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18221907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 16242597 - 16242931
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16242597 gctgcgattttcttcatacaaggtacgggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 16242696  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16242697 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgccctataaccttagaatatgtt 16242796  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| ||||| ||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16242797 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatggatttttgagaaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 16242896  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||    
T  16242897 atagcgagctatgatcctcgccacgcgagggatga 16242931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 18228116 - 18228448
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18228116 agagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggatt 18228214  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228215 gatttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 18228314  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||  | |||| |||| ||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18228315 tatgtttaggatgaattctggaattgagattagccttagaaccatgtgagatcatgaaatttgtgtagaaactatattctgtccgagccaaagttcatcg 18228414  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcga 332  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  18228415 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcga 18228448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23140184 - 23139845
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23140184 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagtcctgatgaataattgacaaagttaggattg 23140085  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23140084 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtaaaaaccgtcctataaccttagaat 23139985  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||| |||||||  | || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139984 atgtttaggatgaattctgaaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtatgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 23139885  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23139884 tcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23139845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 26242857 - 26243198
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||    
T  26242857 agagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctcatgaataattgacaaagttaagatt 26242955  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26242956 gatttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaactgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 26243055  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatc 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26243056 tatgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgaaattcgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatc 26243154  T
Q  298 gctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatg 341  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  26243155 gctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatgatg 26243198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 335
Target Start/End: Original strand, 42996665 - 42996976
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  42996665 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttggttattgtgattctgatgattaattgacaaagttagg-ttgatttataaaagttttggaattacg 42996763  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42996764 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggataaattctgggat 42996863  T
Q  223 tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacct 322  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  42996864 tgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgcccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgaatct 42996963  T
Q  323 cgcctcgcgagtg 335  Q
    |||||||||||||    
T  42996964 cgcctcgcgagtg 42996976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 339
Target Start/End: Original strand, 19756812 - 19757131
Alignment:
Q  21 atacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19756812 atacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgactaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaat 19756911  T
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19756912 taggtcaaatccttaaaattgatgagcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctacaaccttagaatatgtttaggatgaattctg- 19757010  T
Q  220 gat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatga 318  Q
    ||| |||||||| ||||||  | ||||||| |||||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757011 gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatga 19757110  T
Q  319 acctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  19757111 tcctcgcctcgcgagtgatga 19757131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19782994 - 19782675
Alignment:
Q  21 atacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19782994 atacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgactaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaat 19782895  T
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19782894 taggtcaaatccttaaaattgatgagcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctacaaccttagaatatgtttaggatgaattctg- 19782796  T
Q  220 gat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatga 318  Q
    ||| |||||||| ||||||  | ||||||| |||||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19782795 gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatga 19782696  T
Q  319 acctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  19782695 tcctcgcctcgcgagtgatga 19782675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Original strand, 16677804 - 16678119
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16677804 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaagttttgtaattagg 16677903  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16677904 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgagtagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 16678003  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctc 323  Q
    ||||||||||||||  | || | |||| ||||| ||  ||||| || ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16678004 gaaattaggcttagaaccatatgagatcatgaaatttttgtaggaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctc 16678103  T
Q  324 gcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  16678104 gcctcgcgagtgatga 16678119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45939061 - 45938783
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||      
T  45939061 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattaacaaagttaggatga 45938962  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45938961 atttagaaaagttttggaattaggttaaagacctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 45938862  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctg 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45938861 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttggatgatgaa-ttcgtgtagaaattgcattctg 45938783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15363047 - 15362812
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15363047 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 15362949  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15362948 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 15362849  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  15362848 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 15362812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18237783 - 18237570
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18237783 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattattataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 18237684  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  18237683 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattgtggaatt 18237584  T
Q  224 gaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||    
T  18237583 gaaattaggcttag 18237570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16646676 - 16646361
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  16646676 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaagttttgtaattaga 16646577  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  16646576 taaaatctctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatatgtttaggatgaattctggaatt 16646477  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctc 323  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||  |||| ||| ||||||||| |||| |  | |||||||||||||| | || ||  |||| ||||    
T  16646476 gaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaaatttttgtaaaaactgcattctgcccgaccttatattcatcgctcgccctggcgagggatgatcctc 16646377  T
Q  324 gcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  16646376 gcctcgcgagtgatga 16646361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 9271301 - 9271533
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9271301 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgaccaagttaggattgattta 9271400  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9271401 gaaaagttttggaaataggtcaaaaccctaaaattgatgataaaacggtgagaattgtttagattgatgtaaaaactatcctataaccttagaatatgtt 9271500  T
Q  205 taggatgaattctgagat-tgaaattaggcttag 237  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9271501 taggacgaattctg-gatgtgaaattaggcttag 9271533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14298039 - 14298275
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14298039 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttgattgctgtaattctaatgattaattgacaaagttaggattg 14298138  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14298139 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaacactaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 14298238  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| || |||  |||||||||||    
T  14298239 catgtttaggatggattatgggatcaaaattaggctt 14298275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12475935 - 12475699
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12475935 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 12475836  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12475835 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 12475736  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  12475735 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 12475699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12482565 - 12482329
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12482565 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 12482466  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12482465 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 12482366  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  12482365 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 12482329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22195535 - 22195299
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22195535 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagtgtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 22195436  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22195435 atttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22195336  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  22195335 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 22195299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 26284098 - 26284309
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26284098 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 26284196  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26284197 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcgaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 26284296  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  26284297 catgtttaggatg 26284309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 36883925 - 36884161
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36883925 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 36884024  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36884025 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 36884124  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  36884125 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 36884161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Original strand, 7900368 - 7900574
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7900368 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacattaattgttgtaattctgatgattgattgacaaagttaggattgattta 7900467  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7900468 gaaaagttttggaattaggtcagaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagaatgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtt 7900567  T
Q  205 taggatg 211  Q
    |||||||    
T  7900568 taggatg 7900574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15382684 - 15382920
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15382684 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 15382783  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15382784 atttagaaaagtttgggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 15382883  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  15382884 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 15382920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18296540 - 18296304
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18296540 agagtgctgcgattttcttaattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18296441  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18296440 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18296341  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  18296340 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 18296304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9531347 - 9531115
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9531347 gagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagtgctgatgaataattgacaaagttaggattg 9531249  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9531248 atttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactaagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 9531149  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggc 233  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9531148 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggc 9531115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 15321237 - 15321430
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15321237 acaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagagaagttttgaaatta 15321336  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15321337 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 15321430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16231031 - 16231268
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16231031 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 16231130  T
Q  100 atttagaaaagttttgg-aattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16231131 atttagaaaagttttgggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 16231230  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  16231231 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 16231268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14304663 - 14304899
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  14304663 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctaaagattaattgacaaagttaggattg 14304762  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14304763 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaacttagaa 14304862  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
      ||||||||||| ||| || |||  |||||||||||    
T  14304863 attgtttaggatggattatgggatcaaaattaggctt 14304899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15149371 - 15149135
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15149371 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 15149272  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15149271 atttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 15149172  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  15149171 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 15149135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14074746 - 14074509
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14074746 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 14074647  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14074646 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 14074547  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  14074546 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 14074509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 18023653 - 18023865
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18023653 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 18023752  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18023753 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccatcctttaaccttagaa 18023852  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  18023853 catgtttaggatg 18023865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15257524 - 15257287
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15257524 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 15257425  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15257424 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgattaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 15257325  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  15257324 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 15257287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14267600 - 14267836
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14267600 agagtgctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattctataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaagatt 14267698  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14267699 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaacactaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtgtagattgatgtagaaaccgtcctatagccttaga 14267798  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  14267799 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 14267836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17809328 - 17809092
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17809328 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 17809230  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17809229 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 17809130  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  17809129 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 17809092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 29040090 - 29040309
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29040090 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 29040188  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29040189 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 29040288  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29040289 atatgtttaggatgaattctg 29040309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1950974 - 1951209
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1950974 agagggctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggatt 1951072  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1951073 gatttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaatttgatgatcaaatggtaaaactggattagattgatgtagaaattgtcctataaccttagaa 1951172  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  1951173 tgtgtttaggatgaattctggaaacgaaattaggctt 1951209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23961726 - 23961489
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23961726 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 23961628  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23961627 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 23961528  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    || ||||||| |||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  23961527 aacatgtttaagatggattatggaatcaaaattaggctt 23961489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 19779483 - 19779699
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19779483 gagggctgcgattt-cttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 19779581  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaa-ccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  19779582 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccccaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 19779680  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19779681 atgtttaggatgaattctg 19779699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23955063 - 23954854
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23955063 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 23954965  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23954964 gatttaaagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 23954865  T
Q  197 aatatgtttag 207  Q
    || ||||||||    
T  23954864 aacatgtttag 23954854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8385728 - 8385492
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8385728 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 8385630  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8385629 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 8385530  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  8385529 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 8385492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8392404 - 8392168
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8392404 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 8392306  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8392305 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 8392206  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  8392205 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 8392168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 17089169 - 17089405
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17089169 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 17089267  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17089268 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 17089367  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  17089368 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 17089405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 6872657 - 6872851
Alignment:
Q  43 ataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttg 140  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6872657 ataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattttgaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattg 6872756  T
Q  141 atgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  6872757 atgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaacatgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 6872851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20116058 - 20115822
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || |||| |||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  20116058 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattg 20115959  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20115958 ttttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 20115859  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  20115858 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 20115822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 12299088 - 12299307
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12299088 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 12299187  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  12299188 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 12299287  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12299288 tatgtttaggaagaattctg 12299307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 12348765 - 12348983
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12348765 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 12348863  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  12348864 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 12348963  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12348964 tatgtttaggatgaattctg 12348983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18072084 - 18071865
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18072084 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 18071985  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  18071984 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 18071885  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18071884 tatgtttaggatgaattctg 18071865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 36133158 - 36133371
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  36133158 gctgcgattttcatcaattaaggtaagagtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 36133257  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||||||| |||    
T  36133258 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatttgt 36133356  T
Q  204 ttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||    
T  36133357 ttaggatgaattctg 36133371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15363695 - 15363524
Alignment:
Q  8 tgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttaga 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15363695 tgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttaga 15363596  T
Q  107 aaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaacc 181  Q
    ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15363595 aa--gtttggaattaggttaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaacttgtttagattgatgtagaaacc 15363524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55796372 - 55796154
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||   |||| |||||||||||| || |||| |||||||||    
T  55796372 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataacacagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttaacaaagttaggatt 55796274  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  55796273 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 55796175  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  55796174 atatgtttaggatgaattctg 55796154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15352496 - 15352731
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggatt 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||||  ||||||||    
T  15352496 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaacgattcagtaatgttaattcttaaaattctgatgattaattagcaagaattaggatt 15352595  T
Q  99 gattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    || ||  ||||||       || ||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15352596 gaattggagaaaa---cgaaaactagttcaaatccctaaaattgatgatcaaactgtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctatgaccttag 15352692  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | ||||  ||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  15352693 attatgaataggatgaattatggaatcgaaattaggctt 15352731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 17961561 - 17961701
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17961561 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 17961660  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961661 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt 17961701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Original strand, 11249776 - 11250091
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| || || || |     || |||    
T  11249776 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattggagaaatcgaa-aactag 11249874  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  11249875 gtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgtttatgatgaattctggaat 11249974  T
Q  223 tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
     || ||||||||||   | |||      |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||    
T  11249975 cgagattaggcttaaaaccatgagtttagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcc 11250073  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11250074 tcgcctcgcgagtgatga 11250091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 339
Target Start/End: Original strand, 16351159 - 16351378
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16351159 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgacccttgaccttagaatatgtttagaatgaattctgg 16351258  T
Q  220 gattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatga 318  Q
     | |||||||||||||||  | | |  |   |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||    
T  16351259 aactgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaattt-ttgaagaaaattgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctagcgaacgatga 16351357  T
Q  319 acctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  16351358 tcctcgcctcgcgagggatga 16351378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 17990905 - 17991045
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17990905 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 17991004  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17991005 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt 17991045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Original strand, 5756299 - 5756469
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5756299 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 5756398  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5756399 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 5756469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33743122 - 33742952
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33743122 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 33743023  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33743022 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 33742952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 339
Target Start/End: Original strand, 14756783 - 14756952
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14756783 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 14756882  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14756883 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 14756952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 5338589 - 5338805
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||    
T  5338589 ggctgcgattttcttcaattaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatt 5338688  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    |||||||||||| |||||||   ||      || ||||||||| || | | | || |  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  5338689 agaaaagttttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccaatgatgataggttgttaaattgatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgt 5338788  T
Q  204 ttaggatgaattctgag 220  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5338789 ttagaatgaattctgag 5338805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Original strand, 4560695 - 4560865
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4560695 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 4560794  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  4560795 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcttcgcctcgcgagtgatgat 4560865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12570869 - 12570656
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12570869 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 12570770  T
Q  219 agattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatg 317  Q
      ||||||||||||||||   | |||| || || |||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||    
T  12570769 gaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatg 12570671  T
Q  318 aacctcgcctcgcga 332  Q
    | |||||||||||||    
T  12570670 atcctcgcctcgcga 12570656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24021830 - 24021660
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||     
T  24021830 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaat 24021731  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24021730 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 24021660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Original strand, 16487421 - 16487597
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgt 262  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||       
T  16487421 ttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaaatctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttc 16487520  T
Q  263 gtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  16487521 gtaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16487597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 43255623 - 43255699
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43255623 tgcattctgcccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 43255699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44676435 - 44676335
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  44676435 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaattgaaattagactt 44676336  T
Q  236 a 236  Q
    |    
T  44676335 a 44676335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 338
Target Start/End: Original strand, 16356296 - 16356471
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgt 262  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| | |||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||       
T  16356296 ttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttatattatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttc 16356395  T
Q  263 gtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatg 338  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||||||||    
T  16356396 gtaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatg 16356471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 16347895 - 16348233
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgatt-aattgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | ||||||||||  |||| |||||||||||||     
T  16347895 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcgaattaacaagttaggattt 16347993  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||||||  || |  |||||||   ||    | |||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||||| | | ||||||     
T  16347994 aattagaaagtttgtaaaattagggttaataagtgaaattgatgatccaatgataataaggtgtt-agattgatgcataaaacgtcctttgaacttagat 16348092  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  | || | |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||| |||||||   ||||||||    
T  16348093 tatgtttagaatgcattctggaattgaaattaggcttagaaccatttgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcg 16348192  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| | |  | | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  16348193 ctcgccctcgtgaacgatgatcctcgccccgcgagtgatga 16348233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13570451 - 13570218
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||  |||||||  | |||||  ||||| |||||||  | || |||||||||||||||||    
T  13570451 agagagctgcgattttcatcaactaaggtaagggtgagactaacgattcagttttattaatccttgtaattctgatagtcaaattgacaagttaggattg 13570352  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||  ||| || || |||||||   ||    | |||||||||||| || | | | |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||     
T  13570351 aattaagaaatttatgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgatgataagttgtt-agattgatgtataaaccgtcctttgaccttagat 13570253  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggc 233  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13570252 tatgattaggatgaattctggaattgaaattaggc 13570218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 339
Target Start/End: Original strand, 17047433 - 17047602
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt-cgtgtagaa 268  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||   | |||| ||||| || |||| |||| ||||    
T  17047433 gatgtagaaactgtcctttgacattagattatgaataggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaagaa 17047532  T
Q  269 agtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
      ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  17047533 c-tgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17047602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 30234414 - 30234571
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||  |||||||||| || || ||       || ||    
T  30234414 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtgattctgatgattagttaacaagctttaggattgaattggagaaaaacgaaaacta 30234513  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||  |||||||||||||    
T  30234514 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaggaattggtttaattgatgtagaaa 30234571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14679879 - 14679699
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  14679879 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 14679781  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  14679780 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 14679699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14686078 - 14685910
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt--agaa 107  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||  ||||    
T  14686078 tttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggattgaattggagaa 14685979  T
Q  108 aagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  14685978 aa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 14685910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25556380 - 25556281
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| || || |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  25556380 aaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattataaaagttttgaaattagg 25556281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 40472337 - 40472278
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40472337 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 40472278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 40479010 - 40478951
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40479010 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 40478951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 385543 - 385628
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  385543 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 385628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 41384922 - 41385003
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41384922 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 41385003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 51493007 - 51493092
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  51493007 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 51493092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15094708 - 15094373
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattg-attt 103  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||   | |  ||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||     
T  15094708 gctgcaattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaacgattcagtatttttaatccgtatgattctgataatcaaattaacaagttaggattgaatta 15094609  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatg 202  Q
    |||||| || || |||||||   ||    | |||||||||||| || | |   |||||| |||||||||||   |||||||||| | |||||||| ||||    
T  15094608 agaaaaattatgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgatgttaagttg-ttagattgatgcttaaaccgtcctttgaccttagattatg 15094510  T
Q  203 tttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 301  Q
      ||||||||||||||  ||||||||||||||||   |  | | |  ||||||| ||||||| | ||| ||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  15094509 aataggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccttttgaattgatgaattttcgtg-aaaaactgcattctgcctgagcctatattcatcgctc 15094411  T
Q  302 gccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||| | || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15094410 gccctcgcgaacaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 15094373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Original strand, 15123270 - 15123446
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgt 262  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||  | |||| |||||||| ||||       
T  15123270 ttagattgatgcataaaccgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattaaaatttggcttagaaccatgtgagatgatggattt-tc 15123368  T
Q  263 gtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     || ||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  15123369 ataaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgcttgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 15123446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 16955882 - 16955967
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16955882 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagagtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgagtaatt 16955967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27534620 - 27534582
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27534620 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagc 27534582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 35614805 - 35614724
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35614805 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcggtaatgttaattgattgtgattctgatgatta 35614724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23839338 - 23839269
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  23839338 tttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattttgatgatta 23839269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 8047685 - 8047865
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |||||||||||| || |||||  ||||||    
T  8047685 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagatttagga 8047783  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
     ||||||  ||||||       || |||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||    
T  8047784 gtgatttggagaaaa---cgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaa 8047865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 8054298 - 8054478
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |||||||||||| || |||||  ||||||    
T  8054298 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattagga 8054396  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
     ||||||  ||||||       || |||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||    
T  8054397 gtgatttggagaaaa---cgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaa 8054478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12522992 - 12522890
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||    
T  12522992 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaatcgattgtaattctgatgattagttggcaagaattagga 12522894  T
Q  97 ttga 100  Q
    ||||    
T  12522893 ttga 12522890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25556133 - 25556065
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  25556133 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 25556065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4773013 - 4772951
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4773013 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 4772951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 17053915 - 17053876
Alignment:
Q  4 gggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17053915 gggctgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagactaa 17053876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 19941365 - 19941427
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19941365 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 19941427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21334952 - 21334890
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21334952 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 21334890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23082505 - 23082443
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23082505 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 23082443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23844413 - 23844318
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||   |||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  23844413 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaacgattcagttttattaatctatgtaattctgataatcaaattaacaagttaggattga 23844318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Original strand, 16351061 - 16351122
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | || |||||||||| ||||    
T  16351061 acaaggtaagggtgagactaatgattcggtaatgttaattcgtataattctgatgatcaatt 16351122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17810897 - 17810848
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17810897 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 17810848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23651588 - 23651531
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  23651588 aaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 23651531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 53434001 - 53433952
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53434001 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 53433952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 385835 - 385883
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  385835 attcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 385883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3097276 - 3097212
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  3097276 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 3097212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 16356134 - 16356193
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaat 61  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  16356134 agagagctgcgattt-cttgatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaat 16356193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 17961807 - 17961855
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17961807 attcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17961855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 17991151 - 17991199
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17991151 attcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17991199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 55796081 - 55796033
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  55796081 attcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 55796033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 339
Target Start/End: Original strand, 12299381 - 12299428
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12299381 ttcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12299428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 27710662 - 27710604
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgtta 59  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27710662 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgtta 27710604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 6866642 - 6866691
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattca 50  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6866642 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattca 6866691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Original strand, 15121010 - 15121095
Alignment:
Q  28 gtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15121010 gtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta-aaaagttt 15121095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12903550 - 12903450
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggct 234  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  || ||   ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  12903550 aattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaattgttcttagaccttagataatgattatgatgaattctgggatcgagattaggct 12903452  T
Q  235 ta 236  Q
    ||    
T  12903451 ta 12903450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 16956132 - 16956181
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16956132 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgtctcgcgagtgatgat 16956181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 35171469 - 35171432
Alignment:
Q  26 aggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35171469 aggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattg 35171432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 44676567 - 44676530
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44676567 gctgcaattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaa 44676530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 53434269 - 53434212
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  53434269 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 53434212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21015 - 20947
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| || | |   ||||||||||||||||||||    
T  21015 tgcattctgtccgagctgacattcatcgctcgccttagcgagtagttgtcctcgcctcgcgagtgatga 20947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4772721 - 4772673
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4772721 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 4772673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 8047977 - 8048025
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8047977 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 8048025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8847020 - 8846956
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  8847020 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 8846956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 12349056 - 12349104
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12349056 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12349104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15552619 - 15552537
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccg-tcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  15552619 aattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaactgttccta-gaccttagataatgtgtaggatgaattctg 15552537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18071792 - 18071744
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18071792 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18071744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 19941657 - 19941705
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19941657 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 19941705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23082213 - 23082165
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23082213 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 23082165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27710370 - 27710322
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27710370 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 27710322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 36133424 - 36133492
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  36133424 tgctttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 36133492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 140)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26173328 - 26172995
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26173328 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 26173229  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26173228 tttagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaata 26173129  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26173128 tgtttaggatgaattctgggattgaaactaagcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcaatctgtctgagccaaaattcatcgct 26173029  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  26173028 cgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagt 26172995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 26665327 - 26665661
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26665327 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtatttttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattgattta 26665426  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665427 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 26665526  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665527 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatttgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 26665626  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26665627 atagcgagccatgatcctcgcctcgcgagtgatga 26665661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 26936924 - 26937258
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26936924 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtatttttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattgattta 26937023  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26937024 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 26937123  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26937124 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatttgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 26937223  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26937224 atagcgagccatgatcctcgcctcgcgagtgatga 26937258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 24532245 - 24532579
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24532245 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattgattta 24532344  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24532345 gaatagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtggaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 24532444  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24532445 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatttgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 24532544  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24532545 atagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 24532579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33410122 - 33409783
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33410122 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 33410023  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33410022 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattcatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 33409923  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |  |||||||||||||   ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33409922 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccttgttagatgatgataatcgtgtgaaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcg 33409824  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33409823 ctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgaatgatga 33409783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 21884381 - 21884719
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21884381 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataaatcagtaatgttaattgttgtaattctgataattaattgacaaagttaggattga 21884480  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21884481 attagaaaacttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaattgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaata 21884580  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| || ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21884581 tattaaggatgaattctgggattgaaactaagcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcaatctgtcagagccaaaattcatcgct 21884680  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||    
T  21884681 cgccatagcgagctatgattctcgcctcgcgagggatga 21884719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Original strand, 25228620 - 25228944
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  25228620 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaagttatgattgatttagaagagttttggaattatg 25228719  T
Q  124 tcaaaacccta-aaattgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  25228720 tcaaaaccctacaaattgatgatcaaacggtaaga-ttgtgttagattgatgtagaaaccgtcccataaccttagaatatgtttaggatgaattctggat 25228818  T
Q  222 ttgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  25228819 ttgaaactaggcttagaactatgttagatgattattttcgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcc 25228918  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25228919 tcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 25228944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Original strand, 25292776 - 25293100
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  25292776 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaagttatgattgatttagaagagttttggaattatg 25292875  T
Q  124 tcaaaacccta-aaattgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  25292876 tcaaaaccctacaaattgatgatcaaacggtaaga-ttgtgttagattgatgtagaaaccgtcccataaccttagaatatgtttaggatgaattctggat 25292974  T
Q  222 ttgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  25292975 ttgaaactaggcttagaactatgttagatgattattttcgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcc 25293074  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25293075 tcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 25293100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4037113 - 4036788
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4037113 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaggttatgattgatttagagaagttttagaattagg 4037014  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgag 220  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4037013 tcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggg 4036915  T
Q  221 attgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaac 320  Q
    ||||||| ||||||||   ||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  4036914 attgaaactaggcttaaaacttagttggatgatgattttcgtgtagaaaatgcattatgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatc 4036815  T
Q  321 ctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4036814 ctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 4036788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18784888 - 18784576
Alignment:
Q  28 gtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattaggtca 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18784888 gtaaggatgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgaataattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattaggtca 18784789  T
Q  127 aaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaa 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18784788 aatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatatgtttaggatgaattctggaattgaa 18784689  T
Q  227 attaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcc 326  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  18784688 attaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttgtgtaaaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcaatgatccccgcc 18784589  T
Q  327 tcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||    
T  18784588 tcgcgagtgatga 18784576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20233440 - 20233106
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20233440 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctaatgaataattgacaaagttaggattgattta 20233341  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20233340 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtggaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 20233241  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| |||||||  | ||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20233240 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgcc 20233141  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  20233140 atagcgagcaatgatcctcgcctcacaagtgatga 20233106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16675049 - 16674730
Alignment:
Q  21 atacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16675049 atacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatggctaattgacaaagttatgattgatttagaaaagttttgaaat 16674950  T
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16674949 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg- 16674851  T
Q  220 gat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatga 318  Q
    ||| |||||||| ||||||  |  ||||||||||||||  | ||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16674850 gatgtgaaattaagcttagaaccgtgttagatgatgaaaattgtgtgaaaacaacattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagcaatga 16674751  T
Q  319 acctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16674750 tcctcgcctcgcgagtgatga 16674730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 21339959 - 21340306
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  21339959 agagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaatggtgagacttttaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattcacaaagttaggatt 21340057  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21340058 aatttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 21340157  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatc 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21340158 tatgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccttgttagatgatgaaattcgtgtagaaactgcattctgtccaagccaaaattcatc 21340256  T
Q  298 gctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21340257 gctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 21340306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 26741936 - 26742275
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26741936 agagggctacgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagaaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggatt 26742034  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742035 gatttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacagtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 26742134  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  | |||| |||| ||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||    
T  26742135 tatgtttaggatgaattctggaattgagattaggcttagaaccatgtgagatcatgaaatttatgtagaaactgcattttgtccgagccaaagtccatcg 26742234  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||| ||| || ||||||||    
T  26742235 ctcgccatagcgagctatgatcctcaccttgcaagtgatga 26742275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 17717630 - 17717934
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17717630 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagagtgggactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaaagttaggatcg 17717729  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17717730 atttggaaaagttttggaattaggttaaaactctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgtagaaaccgttctataaccttagaat 17717829  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||   | | ||||||||    
T  17717830 atgttttggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagatgatgaaattcatgtagaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcg 17717928  T
Q  299 ctcgcc 304  Q
    ||||||    
T  17717929 ctcgcc 17717934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42806239 - 42805958
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42806239 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgtaaattgttataattctgatgaataattgacaaaattaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 42806140  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  42806139 tcaaatccctaaaattgatgatcaaccggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcatataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 42806040  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcca 305  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42806039 gaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttgtgtaaacactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgcca 42805958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18775026 - 18774711
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18775026 aaggtaagggtgagactaataatttagtaatgttaattgttataattctgatgaataactgacaaagttaggattgatttagaaacgttttgaaattagg 18774927  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||    
T  18774926 tcaaatccctaatattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaactgtcctataaccttataatatatttaggatgaattctagaatt 18774827  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctc 323  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |    
T  18774826 gaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttgtgtaaaaacttcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgtcatagcgagcaatgatcccc 18774727  T
Q  324 gcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  18774726 gcctcgcgagtgatga 18774711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21483365 - 21483032
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  21483365 agagggctgcgattt-ctttaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattcattgttataattctgatgaataatagacaaagttaggatt 21483267  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21483266 gatttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 21483167  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||  | ||||||| ||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21483166 tatgtttaggatgaattctggatttgaaatttggcttagaaccatgttagttgatgaaatttttgtaggaactgcattctgcccgagccaaagttcatcg 21483067  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgag 333  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  21483066 ctcgccataacgagcaatgatcctcgcctcgcgag 21483032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27517666 - 27517430
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27517666 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 27517567  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27517566 atttagagaagttttggaattaggtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 27517467  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  27517466 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 27517430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27524303 - 27524067
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27524303 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 27524204  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27524203 atttagagaagttttggaattaggtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 27524104  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  27524103 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 27524067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 22062071 - 22062283
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22062071 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 22062170  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22062171 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22062270  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  22062271 catgtttaggatg 22062283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 304
Target Start/End: Original strand, 15441168 - 15441449
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441168 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtatttctgatgattaattgacaatgttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 15441267  T
Q  124 tcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggta-aaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15441268 tcaaaaacctaaaaattgatgatcaaacggtataatgatg-ttagattgatgtagaaaccgtcctataacattagaatatgtttaggatgaattctg-ga 15441365  T
Q  222 t-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    | ||||||||| ||||   |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   | | ||||||||||||||    
T  15441366 tgtgaaattagacttaaaaccttgttagatgatgaatttcgtgtagaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgctcgcc 15441449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22133914 - 22133679
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22133914 agagggctgcgattt-cttcatagaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 22133816  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133815 atttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 22133716  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  22133715 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 22133679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 29477197 - 29477405
Alignment:
Q  4 gggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29477197 gggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattttgatgattaattgacaaagttaggattgatt 29477295  T
Q  103 tagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29477296 tagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataatcttagaacat 29477395  T
Q  202 gtttaggatg 211  Q
    ||||||||||    
T  29477396 gtttaggatg 29477405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40708037 - 40707800
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40708037 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 40707938  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40707937 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 40707838  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  40707837 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 40707800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40714679 - 40714442
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40714679 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 40714580  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40714579 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 40714480  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  40714479 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 40714442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22140556 - 22140345
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22140556 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 22140458  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22140457 atttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcttataaccttagaa 22140358  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||| ||||    
T  22140357 catgtttaagatg 22140345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 29470549 - 29470760
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29470549 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatcaagttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 29470647  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29470648 atttagaaaaattttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataatcttagaa 29470747  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  29470748 catgtttaggatg 29470760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 34293742 - 34293954
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34293742 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 34293841  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34293842 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 34293941  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  34293942 catgtttaggatg 34293954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1691626 - 1691862
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1691626 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 1691725  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1691726 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 1691825  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  1691826 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 1691862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 14994225 - 14994437
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14994225 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 14994324  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14994325 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 14994424  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  14994425 catgtttaggatg 14994437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 15000868 - 15001080
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15000868 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 15000967  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15000968 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 15001067  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  15001068 catgtttaggatg 15001080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18037857 - 18038093
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18037857 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18037956  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18037957 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactggtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18038056  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  18038057 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 18038093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37292626 - 37292862
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37292626 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcgttgattgttgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 37292725  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37292726 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 37292825  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  37292826 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 37292862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23610885 - 23610669
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23610885 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 23610787  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  23610786 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 23610688  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23610687 atgtttaggatgaattctg 23610669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23842281 - 23842065
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23842281 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 23842183  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  23842182 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 23842084  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23842083 atgtttaggatgaattctg 23842065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25107700 - 25107481
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25107700 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 25107602  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25107601 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 25107502  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25107501 atatgtttaggatgaattctg 25107481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25166793 - 25166574
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25166793 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 25166695  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25166694 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 25166595  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25166594 atatgtttaggatgaattctg 25166574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27686518 - 27686754
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27686518 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 27686617  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27686618 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaacctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 27686717  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  27686718 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 27686754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 27669622 - 27669838
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27669622 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 27669720  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  27669721 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 27669819  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27669820 atgtttaggatgaattctg 27669838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33726775 - 33726538
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33726775 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 33726676  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33726675 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 33726576  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  33726575 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 33726538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34565752 - 34565532
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34565752 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 34565654  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34565653 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 34565554  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34565553 atatgtttaggatgaattctga 34565532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34572407 - 34572187
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34572407 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 34572309  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34572308 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 34572209  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34572208 atatgtttaggatgaattctga 34572187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24471437 - 24471673
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24471437 agagtgctacgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 24471536  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24471537 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagagtgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 24471636  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  24471637 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 24471673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 37285952 - 37286180
Alignment:
Q  9 gcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaa 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37285952 gcgattttcttcaaacaaggtaaggctgagactaataattcaatagcgttgattgttgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattgatttagaa 37286051  T
Q  108 aagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttta 206  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37286052 aagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgttta 37286151  T
Q  207 ggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  37286152 ggatggattatggaatcaaaattaggctt 37286180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16355760 - 16355524
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16355760 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16355662  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16355661 gatttagaaaagttttggaattaggttaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 16355562  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  16355561 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 16355524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16362419 - 16362183
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16362419 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16362321  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16362320 gatttagaaaagttttggaattaggttaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 16362221  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  16362220 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 16362183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41770108 - 41769872
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41770108 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 41770010  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41770009 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 41769910  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  41769909 acatgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 41769872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41776732 - 41776496
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41776732 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 41776634  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41776633 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 41776534  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  41776533 acatgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 41776496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 27662982 - 27663198
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  27662982 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgtaatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaagattga 27663080  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  27663081 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 27663179  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27663180 atgtttaggatgaattctg 27663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 41097414 - 41097631
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41097414 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 41097512  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||    
T  41097513 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaaacttgttagattgatgaaagaaccgccctttaaccttagaat 41097612  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41097613 atgtttaggatgaattctg 41097631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27609621 - 27609386
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27609621 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 27609523  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  27609522 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 27609424  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  27609423 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 27609386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22265860 - 22265642
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22265860 gagggctgcgattt-cttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 22265762  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct---aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  22265761 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaactgtcctttaaccttaga 22265663  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22265662 atatgtttaggatgaattctg 22265642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 17706121 - 17706356
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  17706121 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttagaatt 17706219  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  17706220 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 17706318  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  17706319 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 17706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27616281 - 27616046
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27616281 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 27616183  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  27616182 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 27616084  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||    
T  27616083 atatgtttatgatgaattctggaatcaaaattaggctt 27616046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19992794 - 19992587
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||  ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  19992794 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattgtttta 19992695  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  19992694 gaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgtttagattgatgtagaaatcgtcctttaaccttagaacatgt 19992595  T
Q  204 ttaggatg 211  Q
    ||||||||    
T  19992594 ttaggatg 19992587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22327403 - 22327639
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  22327403 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattg 22327502  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22327503 ttttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcgaatggtaaaacttgtttaaattgatgtagaaatcgtcctttaaccttagaa 22327602  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  22327603 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 22327639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17411360 - 17411144
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17411360 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaaggatgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattggcaaagttaggattg 17411262  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   | || |||||||    
T  17411261 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtctcttgacattagaat 17411163  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17411162 atgtttaggatgaattctg 17411144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 41293625 - 41293837
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41293625 agagggctgcgattt-ctccataaccaggtaatggtgagactaataattcaataacgttggttgatgtaattctgatgattaattgacaaagttagggtt 41293723  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41293724 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatccaacggtaaaacttgattagattgacgtagaaaccgtcctttaaccttaga 41293823  T
Q  198 atatgtttaggatg 211  Q
    | ||||||||||||    
T  41293824 acatgtttaggatg 41293837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 22334014 - 22334243
Alignment:
Q  8 tgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttaga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  22334014 tgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatattgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattgttttaga 22334113  T
Q  107 aaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttt 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  22334114 aaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcgaatggtaaaacttgtttaaattgatgtagaaatcgtcctttaaccttagaacatgttt 22334213  T
Q  206 aggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  22334214 aggatggattatggaatcaaaattaggctt 22334243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 21666997 - 21667215
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21666997 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 21667095  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  21667096 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 21667195  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  21667196 tatgtttaggaagaattctg 21667215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22409838 - 22410057
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| |||| || |||||||||    
T  22409838 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgagaaagttaggatt 22409937  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  22409938 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccttaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 22410037  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  22410038 tatgtttaggaagaattctg 22410057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24021176 - 24021022
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24021176 agagtgctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 24021078  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggta 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24021077 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggta 24021022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37544958 - 37544740
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaagttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37544958 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaagttaggattg 37544859  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||    
T  37544858 attcagagaagttttggaattaggtcaaaaccctagaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaat 37544759  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37544758 atgtttaggatgaattctg 37544740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29317333 - 29317115
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29317333 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 29317235  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||    
T  29317234 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 29317135  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29317134 tatgtttaggatgaattctg 29317115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20776805 - 20776586
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| || |||| ||||||||     
T  20776805 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttaacaaagttaggatc 20776706  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||     
T  20776705 gatttagaggagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagag 20776606  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  20776605 tatgtttagaatgaattctg 20776586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12027756 - 12027991
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| ||  ||||  ||||||||    
T  12027756 agagagctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggatt 12027855  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    || || || || |     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||||    
T  12027856 gaattggagaaatcgaa-aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaa 12027954  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  12027955 tatgtttaggatgaattctggaatcgaaattaggctt 12027991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24222780 - 24222464
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||  ||||  |||||||||| |  ||  |       || |||    
T  24222780 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaataggaggaaaccgaaaactag 24222681  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||  |     
T  24222680 gtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtttagaatgaattatggaac 24222581  T
Q  223 tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
    |||||||||||||||  |  ||  |   |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||    
T  24222580 tgaaattaggcttagaaccttgagattagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcc 24222482  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24222481 tcgcctcgcgagtgatga 24222464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18357072 - 18356904
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18357072 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattaagatgaattctggatttgaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaattt-gtgtagaaa 18356974  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18356973 ctgcattttgtccgagccaaagttcatcgctcgccatagctagcaacgatcctcgcctcgcgagtgatga 18356904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20296592 - 20296422
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20296592 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 20296493  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20296492 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccatggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 20296422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 25407278 - 25407177
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25407278 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 25407180  T
Q  100 att 102  Q
    |||    
T  25407179 att 25407177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31343085 - 31342743
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaagt-taggattgattt 103  Q
    ||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||    
T  31343085 ggctgcgattttcatcaattagggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattagtatgattctgatgattaattagcaagaataggattgaatt 31342986  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
     || | ||     || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||  | ||||||||||||||    
T  31342985 ggagaggtcgaa-aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaaattgattagattgttgtagaaaatgtcccttgaccttagaatatgt 31342887  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcg 302  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||||    | |||      |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31342886 ttaggatgaattctggaatcgtaattaggctttaaaccatgagtttagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcg 31342788  T
Q  303 ccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    || | || | | |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31342787 ccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatgttgttcatc 31342743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20806369 - 20806249
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||     
T  20806369 aattaggtcaaatccctagaattgatgattaaacggagaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaatta 20806270  T
Q  217 tgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  20806269 tggaattgaaattaggcttag 20806249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 1855911 - 1856034
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || || |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  1855911 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacgaagttaggattg 1856010  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    | ||||||||||| || |||||||    
T  1856011 aattagaaaagttatgaaattagg 1856034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14079901 - 14079703
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  14079901 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattatggaattgaaattaggctt 14079802  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    ||  |  ||| |||||||| ||||   ||| ||| |||| ||||| | ||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||||    
T  14079801 agaaccttgtgagatgatggattt-tcgtaaaaactgcacttctgcctgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 14079703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 17918347 - 17918465
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgattt 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |  |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||    
T  17918347 ggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaatgatttagtaatgttaattagtatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatt 17918445  T
Q  104 agaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  17918446 agaaaagttttgaaattagg 17918465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 122497 - 122732
Alignment:
Q  7 ctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  | || |||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||     
T  122497 ctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttgattagtataattctgatgattaattatcaagaattaggattgaattg 122596  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgttta------gattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||  | |     ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||      ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  122597 gaggaatcgaa-aacaaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattatgattagattgttgtagaaactgtcctttgaccttagaa 122695  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  122696 tatgtttaggatgaattctggaatcgaaattaggctt 122732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21887627 - 21887527
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||  || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  21887627 aattgatgattaaacggtaaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaatatgatgaattctggaattgaaattaggctt 21887528  T
Q  236 a 236  Q
    |    
T  21887527 a 21887527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22760580 - 22760457
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| || || |||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  22760580 agagtgctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttatgattg 22760481  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  22760480 aattagaaaagttttgaaattagg 22760457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 21365860 - 21366185
Alignment:
Q  15 ttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattgatttagaaaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | ||  |||||| || || ||||||||||||||| |||||||  ||     
T  21365860 ttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattaagatgatcaaattaacaagttaggattgaattagaaagtttg 21365959  T
Q  114 tggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    || |||||||   ||    | |||| ||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||||    
T  21365960 tgaaattagggttaataggtgaaatcgatgatccaatgataataagctgtt-agattgatgcataaaacgtcctttgaccttagattatgtttagaatga 21366058  T
Q  213 attctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaag 312  Q
    ||||||  |||||||||||||||||  | |||  |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| | || |     
T  21366059 attctggaattgaaattaggcttagaaccatgcgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctcgcgaa 21366158  T
Q  313 caatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
      |||| |||||| |||||||||||||    
T  21366159 tgatgatcctcgcttcgcgagtgatga 21366185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 26681484 - 26681383
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |  |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26681484 acaaggtaagtgtgagactaatgattcagtaatgttaattagtatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaatta 26681385  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  26681384 gg 26681383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 26953091 - 26952990
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |  |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26953091 acaaggtaagtgtgagactaatgattcagtaatgttaattagtatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaatta 26952992  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  26952991 gg 26952990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24555450 - 24555270
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  24555450 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 24555352  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  24555351 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 24555270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22598544 - 22598459
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22598544 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 22598459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24596481 - 24596400
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24596481 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 24596400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6541056 - 6540955
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || ||| || || |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6541056 acaaggtaaggatgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaatta 6540957  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  6540956 gg 6540955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23515764 - 23515558
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23515764 aattgatgatcaagcggtgaaaattggttagattgatgtagaaattgtcctttggccttagattatgaataggatgaattctggaattgaaattaggctt 23515665  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcg---ccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcg 331  Q
    |   | |||| || || |||| ||||||| | ||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||   || | || | | |||| ||||||||||||    
T  23515664 aaaaccatgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaactgcattcagcccgagcctacattcatcgctcgcgacccttgcgaacgatgatcctcgcctcgcg 23515566  T
Q  332 agtgatga 339  Q
    ||||||||    
T  23515565 agtgatga 23515558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 21294452 - 21294632
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  21294452 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 21294550  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  21294551 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 21294632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25535895 - 25535715
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  25535895 agagagctgcgattt-cttcataaccagataagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 25535797  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||    
T  25535796 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtagaaattggttaaattgatgtagaaa 25535715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17284958 - 17284899
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17284958 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 17284899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25407178 - 25407130
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25407178 ttagattaatgtagaaaccgtcctataaccttagaacatgtttaggatg 25407130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23585104 - 23585019
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  23585104 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagggtgagactaataactctgtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 23585019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Original strand, 23529548 - 23529589
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaat 55  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23529548 tttcttcatacaaggcaagggtgagactaataattcagtaat 23529589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23250857 - 23250677
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |||||||||||| || |||||  ||||||    
T  23250857 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattagga 23250759  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
     ||||||  ||||||       || |||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||    
T  23250758 gtgatttggagaaaa---cgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaa 23250677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23572974 - 23572890
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||   |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23572974 aaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccatgtagttctgatgatcaaattaacaagttaggattgaattagaaa 23572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 25807675 - 25807777
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |||||||||||| || |||||  ||||||    
T  25807675 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattagga 25807773  T
Q  97 ttga 100  Q
    ||||    
T  25807774 ttga 25807777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19769264 - 19769202
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19769264 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 19769202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19775861 - 19775799
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19775861 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 19775799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 57
Target Start/End: Original strand, 12029603 - 12029637
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgt 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12029603 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgt 12029637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 42
Target Start/End: Original strand, 21870782 - 21870820
Alignment:
Q  4 gggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagacta 42  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21870782 gggctgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagacta 21870820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 42
Target Start/End: Original strand, 21875062 - 21875100
Alignment:
Q  4 gggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagacta 42  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21875062 gggctgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagacta 21875100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 23336507 - 23336588
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||    
T  23336507 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaatcgattgtaattctgatgatta 23336588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Original strand, 18769347 - 18769523
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt-cg 261  Q
    |||||||||||   ||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||  |||||||||||    | |||| || || ||||||| ||    
T  18769347 ttagattgatgcttaaaacgtcctttaaccttagattatgaataggatgaattctggaatcaaaattaggctttaaaccatgtgagttgttgaattttcg 18769446  T
Q  262 tgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || | ||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  18769447 tgaa-aaactgcattttgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18769523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22033231 - 22033143
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22033231 aaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta-aaaagttt 22033143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 22325408 - 22325457
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22325408 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 22325457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22344121 - 22344072
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22344121 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 22344072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22353468 - 22353419
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22353468 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 22353419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24020885 - 24020836
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24020885 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 24020836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26681231 - 26681166
Alignment:
Q  274 attctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  26681231 attctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 26681166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26952838 - 26952773
Alignment:
Q  274 attctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  26952838 attctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 26952773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17411087 - 17411023
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  17411087 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 17411023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 22257955 - 22258003
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22257955 attcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22258003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22598252 - 22598204
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22598252 attcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22598204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 14359008 - 14359070
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14359008 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattg 14359070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Original strand, 14359129 - 14359188
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||    
T  14359129 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaa 14359188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22344328 - 22344250
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  22344328 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgattagttggcaagaattaggattga 22344250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 23202300 - 23202257
Alignment:
Q  9 gcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagt 52  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23202300 gcgattttcgtcaaacaaggtaagggtgagactaacaattcagt 23202257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 337
Target Start/End: Original strand, 122768 - 122834
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgat 337  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  | | | |||| ||||||||||||||||||    
T  122768 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctgacgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgat 122834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33726481 - 33726435
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatg 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33726481 ttcatcgctcgccacagcgagtgatgaacctcgcctcgcgagtgatg 33726435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 15236262 - 15236311
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15236262 attcatctctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 15236311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Original strand, 18769208 - 18769296
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18769208 aaggtaagggtgagactaatgatttagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta-aaaagttt 18769296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 22325140 - 22325197
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  22325140 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 22325197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22353736 - 22353679
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  22353736 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 22353679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 23500688 - 23500761
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23500688 ttagattgatgcataaaccgtcctttgaccctagataatgattaggatgaattctggaattgaaattagactta 23500761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 25807967 - 25808016
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25807967 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 25808016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6540807 - 6540739
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||| | || | | | || ||||||||||||||||||||    
T  6540807 tgcattatgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgaagatcctcgcctcgcgagtgatga 6540739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 9078892 - 9078852
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  9078892 agggctgcgattttcatcctataaggtaagggtgagactaa 9078852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 12028027 - 12028095
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| | || | | |||| |||| |||||||||||||||    
T  12028027 tgcattctgcccgagcaaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcacctcgcgagtgatga 12028095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13026083 - 13026024
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13026083 taggtcaaaactatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaa 13026024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13096267 - 13096208
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13096267 taggtcaaaactatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaa 13096208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17284691 - 17284643
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17284691 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 17284643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19768972 - 19768924
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19768972 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 19768924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19775569 - 19775521
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19775569 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 19775521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 21294744 - 21294792
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  21294744 attcatcgctcgccacagcgagctatgagtctcgcctcgcgagtgatga 21294792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 21985350 - 21985390
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21985350 agggctgcgattttcatcctataaggtaagggtgagactaa 21985390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22760417 - 22760345
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  22760417 ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgcttagaatgaattctggaagtgaaattaggctt 22760345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23572727 - 23572659
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  23572727 tgcattctgcccgagtctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23572659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23584812 - 23584764
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23584812 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23584764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25535603 - 25535555
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  25535603 attcatcgctcgccacagcgagctatgagtctcgcctcgcgagtgatga 25535555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37724657 - 37724613
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaac 180  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37724657 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaac 37724613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 94)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Original strand, 17045949 - 17046295
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17045949 gagggctgcgattt-cttcatataaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaggttaggattga 17046047  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046048 tttagaagagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 17046146  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagatt-gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatc 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17046147 tatgtttaggatgaattct-agatttgaaactaggcttagaactatgttagatgatgattttcgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatc 17046245  T
Q  298 gctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17046246 gctcgccatagcaagctatgatcctcgcctcgcgagggatgatgttcatc 17046295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Original strand, 17040411 - 17040757
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17040411 gagggctgcgattt-cttcatataaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaggttaggattga 17040509  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17040510 tttagaagagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 17040608  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17040609 tatgtttaggatgaattctggatttgaaactaggcttagaactatgttagatgatgatttttgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcg 17040708  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17040709 ctcgccatagcgagctatgatcctcgccttgcgagtgatgatgttcatc 17040757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21616350 - 21616014
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21616350 ggctgcgattttcttcatacaaggtacgggtgaaactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgagtaattgacaaagttaggattgattt 21616251  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21616250 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacagcaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatg 21616151  T
Q  203 tttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcg 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21616150 tttaggatgaattctgggattgaatttaggcttagaaccatgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcctgtccgagccaaaattcatcgctcg 21616051  T
Q  303 ccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21616050 ccatagcgagcaatgaatctcgccttgcgagtgatga 21616014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 46976384 - 46976045
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46976384 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 46976285  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46976284 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 46976185  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||   ||||||  ||| |||||| || |  ||||||| |||||||    
T  46976184 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagatgatgataatcgtgtgaaaactgcattttgccttagccaaagttcatcg 46976086  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46976085 ctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 46976045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 20920148 - 20920486
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  20920148 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagacgattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattaacaaagttacgattg 20920247  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20920248 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 20920347  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20920348 atgtttaggatgaattctgaaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatt-gtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 20920446  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20920447 tcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 20920486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12647783 - 12647444
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12647783 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattg 12647684  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12647683 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccatcctataaccttagaat 12647584  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| |||||||  | ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12647583 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaagttcatcgc 12647484  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  12647483 tcgccatagtgagctatgatcatcgcctcgcgagtgatga 12647444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Original strand, 23818514 - 23818829
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23818514 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgatataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 23818613  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23818614 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 23818713  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctc 323  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  23818714 gaaattaggctttgaactatgttagttgatgaaattcgtgtagaaactgcattttgtccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagctatgatcctc 23818813  T
Q  324 gcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||| |||||||||||    
T  23818814 gccttgcgagtgatga 23818829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18883281 - 18882940
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18883281 agagggctgcgattt-cttcaatacaaagtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggatt 18883183  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18883182 gatttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagtaactgtcctataaccttagaa 18883083  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |  |||||| |||||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18883082 tatgtttaggatgaattctggaattgatattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcg 18882983  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatg 341  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18882982 ctcgccatagcgagctatgaccctcgcctcgcgagtgatgatg 18882940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19212757 - 19212444
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  19212757 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgactaattgacaaagttaggattgatttagaaaa--tttgaaattagg 19212660  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  19212659 tcaaatccctaaaatttatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattttggaatt 19212560  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctc 323  Q
    ||||||||||||||  | ||||| | ||||||| ||  ||| |||| |||||| || | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19212559 gaaattaggcttagaaccatgttggttgatgaaatttttgtggaaactgcattatgcctgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctc 19212460  T
Q  324 gcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  19212459 gcctcgcgagtgatga 19212444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20138995 - 20138657
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtt-ctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20138995 ggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaatttctaatgattaattgacaaagttaggattgat 20138897  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20138896 ttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaaccgtaaaactgagttagattgatgtagaaatcgtcctataaccttagaatat 20138797  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagat-tgaaatt-aggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||  | ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20138796 gtttaggatgaattctg-gatgtgaaattgaagcttagaaccatgttagttgaggaattt-gtgtagaaactgcattctgcccgagccaaaattcatcgc 20138699  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatg 341  Q
    ||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20138698 tcgtcatagtgagccatgatcctcgcctcgcgagtgatgatg 20138657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 44844072 - 44844308
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44844072 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 44844171  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44844172 atttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 44844271  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  44844272 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 44844308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21845145 - 21844932
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21845145 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaaaggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 21845047  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa---ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845046 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 21844947  T
Q  197 aatatgtttaggatg 211  Q
    || ||||||||||||    
T  21844946 aacatgtttaggatg 21844932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 51327867 - 51328104
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51327867 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 51327966  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51327967 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 51328066  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  51328067 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 51328104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 51334502 - 51334739
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51334502 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 51334601  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51334602 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 51334701  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  51334702 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 51334739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21829632 - 21829419
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21829632 agagggttgcgattt-cttcatacaaggtaagagtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 21829534  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa---ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21829533 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccatcctataaccttag 21829434  T
Q  197 aatatgtttaggatg 211  Q
    || ||||||||||||    
T  21829433 aagatgtttaggatg 21829419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 16079640 - 16079853
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  16079640 gctgcgattttcttcaattaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctatgattctcatgattaatcgacaaagttaggattgaatta 16079739  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16079740 gaaaagttttgtaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaagaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 16079839  T
Q  205 taggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||    
T  16079840 taggatgaattctg 16079853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36818548 - 36818761
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36818548 agagggctgcgattttctacactataaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctatgattctgatgattaattgacaaagttaggatt 36818647  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36818648 gaattagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaagaattgtttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaa 36818747  T
Q  199 tatgtttaggatga 212  Q
    ||||||||||||||    
T  36818748 tatgtttaggatga 36818761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43079355 - 43079119
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43079355 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 43079257  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43079256 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 43079157  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  43079156 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 43079119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18599295 - 18599531
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||  ||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  18599295 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtgattctgatgaataaatggcaaagttaggattg 18599394  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18599395 ttttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18599494  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  18599495 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 18599531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 41477717 - 41477953
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41477717 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 41477816  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41477817 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgaggatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaaaa 41477916  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  41477917 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 41477953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 46156510 - 46156746
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46156510 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 46156608  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46156609 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 46156708  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  46156709 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 46156746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21306223 - 21305890
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  21306223 gctgcgattttcatcaattaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggatttaatta 21306124  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||| ||||||||    
T  21306123 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtataaattgattagattgatgtagaaactgtcccctgacattataatatgtt 21306025  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgc 303  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| | || |||  |   |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21306024 taggatgaattctggaattgagattaggctttgagccatgagattagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgc 21305926  T
Q  304 catagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  21305925 cctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 21305890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20215119 - 20215354
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20215119 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaatgatgttagttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 20215217  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  20215218 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatggaagaaccgtcctttaaccttaga 20215316  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  20215317 atatgtttaggatgaattctgcaatcaaaattaggctt 20215354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27897850 - 27898068
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27897850 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 27897948  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  27897949 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 27898048  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27898049 tatgtttaggatgaattctg 27898068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 43062467 - 43062685
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43062467 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 43062565  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  43062566 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 43062665  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43062666 tatgtttaggatgaattctg 43062685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49335487 - 49335269
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49335487 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 49335389  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  49335388 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 49335289  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  49335288 tatgtttaggatgaattctg 49335269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44757021 - 44756803
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44757021 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 44756923  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  44756922 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 44756823  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  44756822 tatgtttaggaagaattctg 44756803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 41348040 - 41348259
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41348040 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggatt 41348139  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  41348140 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 41348238  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41348239 atatgtttaggatgaattctg 41348259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16344963 - 16345182
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16344963 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 16345062  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  16345063 gatttagaggagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 16345162  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16345163 tatgtttaggatgaattctg 16345182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16351610 - 16351829
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16351610 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 16351709  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  16351710 gatttagaggagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 16351809  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16351810 tatgtttaggatgaattctg 16351829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33394763 - 33394545
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33394763 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 33394665  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||    
T  33394664 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttataa 33394565  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  33394564 tatgtttaggaagaattctg 33394545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 41355477 - 41355696
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41355477 agagggctgcgattttcatcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggatt 41355576  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  41355577 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 41355675  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41355676 atatgtttaggatgaattctg 41355696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 21225564 - 21225674
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21225564 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 21225663  T
Q  105 gaaaagttttg 115  Q
    |||||||||||    
T  21225664 gaaaagttttg 21225674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47660113 - 47659892
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggat 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||     
T  47660113 agagggctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggaa 47660014  T
Q  98 tgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||    
T  47660013 tgatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttag 47659915  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  47659914 aacatgtttaggatgaattctga 47659892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 45488938 - 45489168
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||    
T  45488938 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttacaattctgatgattagttagcaagaattaggattgaatt 45489037  T
Q  104 --agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
      |||||   |    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  45489038 gtagaaa---tcgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatat 45489134  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  45489135 gtttaggatgaattctggaatcgaaattaggctt 45489168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21408100 - 21407930
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21408100 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 21408001  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21408000 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 21407930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Original strand, 16374857 - 16374989
Alignment:
Q  208 gatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccata 307  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  16374857 gatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccaca 16374956  T
Q  308 gcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    || ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  16374957 gcgagctatgatactcgcctcgcgagtgatgat 16374989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 33049300 - 33049513
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt--agaaaagttttggaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||  ||||||       ||    
T  33049300 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattagtataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattggagaaaacaaa---aa 33049396  T
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  33049397 ctaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatacgtttagaatgaattatg 33049496  T
Q  219 agattgaaattaggctt 235  Q
      || ||||||||||||    
T  33049497 gaatcgaaattaggctt 33049513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 17677800 - 17677901
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17677800 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaatta 17677899  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  17677900 gg 17677901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 339
Target Start/End: Original strand, 21787341 - 21787561
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  21787341 ttaggtcaaatccttagaattgatgtttaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagaatatgaataggatgaattttg 21787440  T
Q  219 agattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatg 317  Q
      ||||||||||||||||   | |||| || ||||||| ||||||  | ||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||    
T  21787441 gaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgatgaattttcgt-aaaaaactacattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatg 21787539  T
Q  318 aacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  21787540 atcctcgcctcgcgagtgatga 21787561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52640258 - 52640095
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  52640258 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 52640159  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgag 333  Q
    | ||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||    
T  52640158 gcgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgag 52640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 3472223 - 3472343
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3472223 aattaggtcaaattcttagaattaatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaattc 3472322  T
Q  217 tgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  3472323 tggaattgaaattaggcttag 3472343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 24782291 - 24782414
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |  || |  |||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  24782291 agagggctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgatttagtaatattggtccttatgattctgatgattaattgacaaagttgggatgg 24782390  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  24782391 aattagaaaagttttgaaattagg 24782414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Original strand, 8760949 - 8761050
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8760949 aattaatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttataatatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggctt 8761048  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  8761049 ag 8761050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 24782562 - 24782630
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24782562 tgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 24782630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Original strand, 42864527 - 42864627
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  42864527 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattatggaattgaaattaggctt 42864626  T
Q  236 a 236  Q
    |    
T  42864627 a 42864627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 29795821 - 29795870
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattca 50  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29795821 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattca 29795870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 22830563 - 22830670
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgattta 104  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||    
T  22830563 gctgcaattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttagcattgaatta 22830662  T
Q  105 gaaaagttt 113  Q
     ||||||||    
T  22830663 -aaaagttt 22830670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23764128 - 23763948
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  23764128 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 23764030  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  23764029 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 23763948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 338
Target Start/End: Original strand, 16079906 - 16079973
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatg 338  Q
    |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16079906 tgcattctgctcgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatg 16079973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Original strand, 18393167 - 18393261
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| || |  |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18393167 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaa 18393261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19064437 - 19064356
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19064437 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataacttagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 19064356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19112327 - 19112246
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19112327 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataacttagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 19112246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21438698 - 21438629
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21438698 tttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 21438629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 45309579 - 45309680
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| || |  |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  45309579 acaaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattataaaagttttgaaatta 45309678  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  45309679 gg 45309680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Original strand, 3704371 - 3704430
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  3704371 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaatt 3704430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19105658 - 19105589
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19105658 tttcttcataaccaggtaagggtgagactaataacttagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 19105589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Original strand, 22432126 - 22432302
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgat-gaatttcg 261  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||  ||  |||||||||||    | |||| ||||| | || |||||    
T  22432126 ttagattgatgcataaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcaaaattaggcttttaaccatgtgagatgttggattttcg 22432225  T
Q  262 tgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| | | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  22432226 tg-aaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgtcctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22432302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 18393425 - 18393493
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  18393425 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18393493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Original strand, 3704489 - 3704632
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgt 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||| || ||  | |||  |   |||||||||  |    
T  3704489 ttagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtttagaatgaattgtggaactgaaattagactcagaaccatgagattagatgaatttttt 3704588  T
Q  263 gtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcca 305  Q
    | || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3704589 gaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgcca 3704632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 81
Target Start/End: Original strand, 18657744 - 18657803
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18657744 acaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgactgtaattctgatgatta 18657803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 21806389 - 21806451
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21806389 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 21806451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21836283 - 21836221
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21836283 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 21836221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 33385411 - 33385473
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33385411 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 33385473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 33392055 - 33392117
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33392055 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 33392117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 18625466 - 18625520
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcat-acaaggtaagggtgagactaataattcagtaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18625466 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaa 18625520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21023396 - 21023238
Alignment:
Q  181 cgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgt 280  Q
    |||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||    | |||| |||||||||||||    || ||| |||||||||     
T  21023396 cgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgatgaatttttgttaaaaactgcattctgc 21023297  T
Q  281 ccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||| ||| |||||    
T  21023296 ccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgagagagatga 21023238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1011348 - 1011299
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1011348 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 1011299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8305742 - 8305693
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8305742 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 8305693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 18181306 - 18181410
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatt 102  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |  ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  18181306 ggctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttatgattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaat 18181404  T
Q  103 tagaaa 108  Q
    ||||||    
T  18181405 tagaaa 18181410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 50887234 - 50887283
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50887234 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 50887283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20248944 - 20248880
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  20248944 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgcccttgcaaacgatgatcctcgcctcacgagtgatga 20248880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 20524402 - 20524466
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20524402 agagagctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattg 20524466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21835991 - 21835943
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21835991 attcatcgctcgccacggcgagcaatgaatctcgcctcgcgagtgatga 21835943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 43
Target Start/End: Original strand, 38800587 - 38800623
Alignment:
Q  7 ctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38800587 ctgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagactaa 38800623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 45309828 - 45309896
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||  |||||||||||| |||||||    
T  45309828 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctagcgaacgatggtcctcgcctcgcgggtgatga 45309896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 213
Target Start/End: Original strand, 33385532 - 33385625
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaa 213  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||  ||||    ||||||||  ||||||||||||||    
T  33385532 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgtccctagaccttagataatgtttaggatgaa 33385625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 50886966 - 50887023
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  50886966 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 50887023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 16345255 - 16345303
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16345255 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16345303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 16351902 - 16351950
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16351902 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16351950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 18181572 - 18181640
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  18181572 tgcattctgcccgagcccatgttcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18181640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 18625757 - 18625805
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18625757 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18625805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21438419 - 21438371
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21438419 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 21438371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21715213 - 21715149
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  21715213 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 21715149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21715464 - 21715388
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||  |||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  21715464 aaggtaagggtgagactaatgattcagttttattaattcatgtaattctgataatcaaattaacaagttaggattga 21715388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 21806681 - 21806729
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21806681 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 21806729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23763836 - 23763788
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  23763836 attcatcgctcgccacagcgagctatgagtctcgcctcgcgagtgatga 23763788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 27898141 - 27898189
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27898141 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 27898189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 33049549 - 33049617
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | || | |||||||||||||| |||||    
T  33049549 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgataatcctcgcctcgcgagggatga 33049617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 33385703 - 33385751
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33385703 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 33385751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 33392347 - 33392395
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33392347 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 33392395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 43062758 - 43062806
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43062758 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 43062806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44756730 - 44756682
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44756730 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 44756682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 49335196 - 49335148
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  49335196 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 49335148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 76363 - 76701
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  76363 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgatcaattgacaaagttaggatcgat 76462  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaat-tgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76463 ttagaaaagttttggaattaggtcagaaccctaaaaagtgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 76561  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  76562 atgtttaggatgaattctgagattgaaactaagcttagaactctgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaagattcatcgc 76661  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  76662 tcgccatagcgagctatgatcctcgtctcgcgagggatga 76701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19016 - 18840
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgt 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||   | |||| |||||||| ||||       
T  19016 ttagattgatgtataaaccgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgatggattt-tc 18918  T
Q  263 gtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  18917 gtaaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgctagtgatga 18840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2788 - 2454
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2788 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgcaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 2689  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2688 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 2589  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  2588 taggacgaattctgagattgaaattaggcatagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagtccaaattcatcgctcgcc 2489  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  2488 atggcaagctatgaatctcgcctcgggagtgatga 2454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Original strand, 5342 - 5577
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5342 agggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagagtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattga 5440  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5441 tttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaatattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtaaaaactgtcctataaccttagaata 5540  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5541 tgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttag 5577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 7)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 10519 - 10853
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10519 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgcaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 10618  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10619 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 10718  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  10719 taggacgaattctgagattgaaattaggcatagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagtccaaattcatcgctcgcc 10818  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10819 atggcaagctatgaatctcgcctcgggagtgatga 10853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7965 - 7730
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7965 agggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagagtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattga 7867  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7866 tttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaatattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtaaaaactgtcctataaccttagaata 7767  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7766 tgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttag 7730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27535 - 27324
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27535 aaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 27436  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||     
T  27435 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatggattatggaatc 27336  T
Q  224 gaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||    
T  27335 aaaattaggctt 27324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 339
Target Start/End: Original strand, 38191 - 38347
Alignment:
Q  183 tcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtcc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||    
T  38191 tcctataaccttagaatatgtttaggacgaattttgagattgaaattaggcatagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaaatgcatcatgtcc 38290  T
Q  283 gagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  38291 gagcccaaattcatcgctcgccatggcgagctatgaatctcgcctcgcgagcgatga 38347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 38108 - 38182
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgatt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  38108 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagagtaataatttagtaatgttagttgttgcaattctgatgatt 38182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 44182 - 44105
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  44182 gctgcgattttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgagtgtaattctgatgatta 44105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43894 - 43846
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43894 attcatcgctcgccatggcaagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 43846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 123)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 16438239 - 16438565
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16438239 tttcttcacacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgatataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaattt 16438338  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16438339 ttgaaattaggtcaaatctataaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 16438438  T
Q  213 attctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaag 312  Q
    ||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16438439 attctggaattgaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaatttcgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgag 16438538  T
Q  313 caatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  16438539 ctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16438565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 16723847 - 16724183
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16723847 agggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatactaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 16723945  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  16723946 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgttaaaaccatcctataaccttagaatat 16724045  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 301  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16724046 gtttaggatgaattatgggattgaaactaggcttagaactttgttagatgatgattttcgtgtagaaactgcattctgtccgaaccaaagttcatcgctc 16724145  T
Q  302 gccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16724146 gccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16724183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Original strand, 17700861 - 17701197
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17700861 agggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatactaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 17700959  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  17700960 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgttaaaaccatcctataaccttagaatat 17701059  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 301  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17701060 gtttaggatgaattatgggattgaaactaggcttagaactttgttagatgatgattttcgtgtagaaactgcattctgtccgaaccaaagttcatcgctc 17701159  T
Q  302 gccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17701160 gccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17701197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6802126 - 6801787
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6802126 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattg 6802027  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6802026 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaactgatgatcaaacggcaaaggttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 6801927  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6801926 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatttgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaagttcatcgc 6801827  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6801826 tcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 6801787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13150063 - 13149721
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13150063 gctgcaattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcggtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 13149964  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149963 gaaaatttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 13149864  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| |||||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149863 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 13149764  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13149763 atagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 13149721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35152470 - 35152166
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35152470 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 35152371  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35152370 ttagagaagtattggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgccctataaccttagaata 35152271  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35152270 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgcccgaggcaaaattcatcgct 35152171  T
Q  301 cgcca 305  Q
    |||||    
T  35152170 cgcca 35152166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15729217 - 15728892
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15729217 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaggttaggattgatttagaagagttttggaattagg 15729118  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgag 220  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  15729117 tcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattaatgtagaaactgtcctataaccttagactatgtttaggatgaattctgga 15729019  T
Q  221 attgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaac 320  Q
     |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  15729018 tttgaaactaggcttagaactatgttagatgatgattttcgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatc 15728919  T
Q  321 ctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15728918 ctcgcctcgcgagggatgatgttcatc 15728892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16276403 - 16276067
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattt 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16276403 ggctgcgatttgcttcatacaaggtaagggcgagactaataattgagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgattt 16276304  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16276303 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacattaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatg 16276204  T
Q  203 tttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcg 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  16276203 tttaggatgaattctgagattcaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgcccgaaccgaaattcatcgctcg 16276104  T
Q  303 ccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  16276103 ccatagcgagctatgattctcgcctcgcgagttatga 16276067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 18248 - 18587
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18248 agagggctgcgattt-cttcaatagaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattccgatgattaattgacaaagttaggatt 18346  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18347 gatttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 18446  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||  ||||| || | ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  18447 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttatgtaggaactacattctgcccgtgccaaagttcatcg 18546  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18547 ctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8918366 - 8918026
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8918366 agagggttgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatattgattgttatgattctgatgattaattgacaaagttaagattg 8918267  T
Q  100 atttagaaaagttttggaa-ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8918266 atttagaaaagttttgaaaattaggtcaaatccctaaaattaatgatcaaacggtagaactgagttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaa 8918167  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8918166 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaactatgttagttgatgaaattcgtagagaaactgcattctgtccgagccaaagttcatcg 8918067  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8918066 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 8918026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14217826 - 14217525
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14217826 agggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaaagttaggattgat 14217728  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14217727 ttagaaaagttttggaattatgttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgaagaaaccgtcctataaccttagaata 14217628  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| |||   | | |||||||||    
T  14217627 tgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttggatgatgaa-ttcacgtagaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgc 14217530  T
Q  300 tcgcc 304  Q
    |||||    
T  14217529 tcgcc 14217525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11988103 - 11987788
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11988103 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattttgatgattaattggcaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaattagg 11988004  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  11988003 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatatgtttaggatgaattctggaatt 11987904  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctc 323  Q
    |||| |||||||||  | ||||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| | || ||  |||| ||||    
T  11987903 gaaactaggcttagaaccatgttagttgatggaatttttgtagaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgctcgccctggcgagtgatgatcctc 11987804  T
Q  324 gcctcgcgagtgatga 339  Q
    || |||||||||||||    
T  11987803 gcttcgcgagtgatga 11987788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18557861 - 18557582
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18557861 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgataaagttaggattgaattagagaagttttggaattagg 18557762  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat- 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  18557761 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgtaaaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggacgaattctg-gatg 18557663  T
Q  223 tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||   | | ||||||||||||||    
T  18557662 tgaaattaggcttagaaccttgttagatgatg-attttgtgtagaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgctcgcc 18557582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13462673 - 13462437
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| | |||    
T  13462673 gagggctgcaattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttatgattctcatgattaattgacaaagttagaaatga 13462574  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13462573 tttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaactgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtaaaaactgtcctataaccttagaata 13462474  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13462473 tgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttag 13462437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 59866 - 60102
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  59866 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 59965  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  59966 atttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtccgttaaccttagaa 60065  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  60066 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 60102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 48592664 - 48592883
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48592664 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 48592763  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48592764 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa-----ttagattgatgtagaaaccttcctataaccttagaatatgtttaggatga 48592858  T
Q  213 attctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  48592859 attctggaattgaaattaggcttag 48592883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15023046 - 15022809
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15023046 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 15022947  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15022946 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 15022847  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  15022846 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 15022809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15155380 - 15155616
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15155380 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 15155479  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15155480 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 15155579  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  15155580 catgtttaggatggattatgagatcaaaattaggctt 15155616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9594211 - 9593976
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9594211 agagggctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggatt 9594113  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9594112 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaatttgatgatcaaacggtaaaactggattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaa 9594013  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  9594012 tatgtttaggatgaattctggaaacgaaattaggctt 9593976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9645174 - 9644939
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9645174 agagggctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggatt 9645076  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9645075 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaatttgatgatcaaacggtaaaactggattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaa 9644976  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  9644975 tatgtttaggatgaattctggaaacgaaattaggctt 9644939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18177046 - 18176810
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18177046 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgtttgttgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18176947  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18176946 gtttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgaggtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18176847  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||    
T  18176846 catgtttaggatggattatgaaatcaaaattaggctt 18176810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18183718 - 18183482
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18183718 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18183619  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18183618 gtttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgaggtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18183519  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  18183518 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 18183482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12319037 - 12318703
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||| || | |||||| |||    
T  12319037 gctgcgattttcatcaattaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagtaaagattgaatta 12318938  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12318937 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtt 12318838  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 301  Q
    |||||||| |||||  |  ||||||||| ||    | |||   |||||||  || ||| | | || || || |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  12318837 taggatgagttctggaaccgaaattaggatttaaaccatgagattagatg--gatttttgagaag-aactgtattctgcccgagcctacattcatcgctc 12318741  T
Q  302 gccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318740 gccatagcgagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 12318703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18163863 - 18164099
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18163863 agagtgctacgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 18163962  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18163963 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18164062  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  18164063 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 18164099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Original strand, 16406492 - 16406703
Alignment:
Q  8 tgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttaga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16406492 tgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttaga 16406591  T
Q  107 aaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttta 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16406592 aaagttttggaattaggtcaaaccctaaaaattgatgatcgaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgttta 16406691  T
Q  207 ggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||    
T  16406692 ggatgaattctg 16406703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1348413 - 1348201
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1348413 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttgggattg 1348314  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  1348313 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttaggttgatgtagagaccatcctttaaccttagaa 1348214  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  1348213 catgtttaggatg 1348201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13685378 - 13685142
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13685378 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 13685279  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13685278 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattcatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 13685179  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  13685178 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 13685142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15162010 - 15162246
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15162010 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 15162109  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15162110 atttataaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 15162209  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| || |||  |||||||||||    
T  15162210 catgtttaggatggattatgggatcaaaattaggctt 15162246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 44785677 - 44785901
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagt 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44785677 tttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagt 44785776  T
Q  112 tttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggat 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44785777 tttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaatatgtttaggat 44785876  T
Q  211 gaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||    
T  44785877 gaattctggaatcaaaattaggctt 44785901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 44792318 - 44792542
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagt 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44792318 tttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagt 44792417  T
Q  112 tttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggat 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44792418 tttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaatatgtttaggat 44792517  T
Q  211 gaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||    
T  44792518 gaattctggaatcaaaattaggctt 44792542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22131597 - 22131381
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22131597 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 22131499  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  22131498 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 22131400  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22131399 atgtttaggatgaattctg 22131381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 40522554 - 40522770
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40522554 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 40522652  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  40522653 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 40522751  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40522752 atgtttaggatgaattctg 40522770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22597 - 22361
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22597 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 22499  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22498 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 22399  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  22398 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8201265 - 8201501
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8201265 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 8201363  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8201364 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 8201463  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  8201464 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 8201501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 14654581 - 14654778
Alignment:
Q  24 caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14654581 caaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaattactgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattggtttagagaagttttggaattag 14654680  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654681 gtcaaaaccctaaaaattggtgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 14654778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 11238161 - 11238397
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11238161 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 11238260  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11238261 atttagaaaagtttgaaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcgaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 11238360  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  11238361 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 11238397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13691993 - 13691757
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13691993 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 13691894  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13691893 atttagaaaagttttggaattaggacaaaaccctaaaaattcatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 13691794  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  13691793 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 13691757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 11231474 - 11231710
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11231474 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataaagttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 11231573  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11231574 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctgaaaattgatgatcgaacggtaaaacttgttttgattgatgtagaaatcgtcctttaaccttagaa 11231673  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  11231674 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 11231710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7536981 - 7536761
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggta-aaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattct 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7536981 taggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacgatataatgatg-ttagattgatgtagaaaccatcctacaaccttagaatatgtttaggatgaattct 7536883  T
Q  218 gagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||    
T  7536882 gagattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcctgaattcatcgctcgccatggcgagctatg 7536783  T
Q  318 aacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  7536782 aatctcgcctcgcgagtgatga 7536761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9510201 - 9510437
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9510201 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 9510299  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  9510300 gatttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtt-agattgatgaaagaaccgtcctttaaccttag 9510398  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||    
T  9510399 aatatgtttaggatgaattatggaatcaaaattaggctt 9510437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1245212 - 1245447
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1245212 agagggttgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 1245310  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  1245311 gatttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 1245409  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  1245410 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 1245447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12702578 - 12702813
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12702578 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 12702676  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  |||||||||  | |||||||    
T  12702677 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtccttaacccttaga 12702775  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  12702776 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 12702813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 13634673 - 13634897
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  13634673 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataatttagtaatattgattagtatagttttgatgattaattgacatagttaggattggattagaaaagtt 13634772  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |  | || ||||||||||||||||||||    
T  13634773 ttgaaattaggtcaaatcccaaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgttccctgacattagaatatgtttaggatga 13634872  T
Q  213 attctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||  || || |||||||||||    
T  13634873 attctggaatggagattaggcttag 13634897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11313557 - 11313345
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11313557 gctgcgattttcatcaattatggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattatgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 11313458  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||    
T  11313457 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatatgtt 11313359  T
Q  205 taggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||    
T  11313358 taggatgaattctg 11313345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8720326 - 8720108
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8720326 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 8720228  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  8720227 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 8720128  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  8720127 tatgtttaggaagaattctg 8720108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18584491 - 18584709
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18584491 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 18584589  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  18584590 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 18584689  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  18584690 tatgtttaggaagaattctg 18584709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8706910 - 8706692
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8706910 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 8706812  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  8706811 gatttagagaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 8706712  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  8706711 tatgtttaggaagaattctg 8706692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 20568792 - 20569126
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||    
T  20568792 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaatt 20568891  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
     || || |     || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  20568892 ggagaaatcgaa-aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacgatagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgt 20568990  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcg 302  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||  | |||  |   |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20568991 ttaggatgaattctggaactgaaattaggcttagaaccatgagattagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcg 20569089  T
Q  303 ccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  20569090 ccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 20569126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11366942 - 11366795
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11366942 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 11366843  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11366842 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatc 11366795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18552723 - 18552941
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18552723 agagggctacgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 18552821  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt-gatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |    
T  18552822 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgacaat-aaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttata 18552920  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  18552921 atatgtttaggaagaattctg 18552941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33851 - 33681
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33851 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 33752  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33751 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 33681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Original strand, 16906562 - 16906732
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16906562 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 16906661  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16906662 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 16906732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42205907 - 42205794
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42205907 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtc--ttgaccttagaatatgtttaggatgaattctga 42205810  T
Q  220 gattgaaattaggctt 235  Q
     || ||||||||||||    
T  42205809 aatcgaaattaggctt 42205794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15581547 - 15581234
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  || |  ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  15581547 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgatccttatgattctgatgattaataaacaaagttaggattgaattagaaaggttttgaaattagg 15581448  T
Q  124 -tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
     | || |   |||  || ||||||  | | | | |||||||| |||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||  |    
T  15581447 gttaataagataat-ttaatgatccgatgatgataagttgtt-agattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgtttagaatgaattctggaa 15581350  T
Q  222 ttgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
    ||||||||||||||||  | |||| | || ||| ||||   ||| ||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15581349 ttgaaattaggcttagaaccatgtgaaatcatgtatttttcgtaaaaattgcattctacccgagcctacattcatcgctcgccatagtgagcaatgaacc 15581250  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgat 337  Q
    ||||||||||||||||    
T  15581249 tcgcctcgcgagtgat 15581234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26293138 - 26292968
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26293138 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 26293039  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26293038 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgcttgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 26292968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12724275 - 12724110
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12724275 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 12724176  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtg 335  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  12724175 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtg 12724110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12715609 - 12715439
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12715609 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttataaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 12715510  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  12715509 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatgat 12715439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18280148 - 18279978
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18280148 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 18280049  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  18280048 gtgcataatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctacgatcctcgcctcgcgagggatgat 18279978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12719413 - 12719243
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12719413 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 12719314  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||  || ||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  12719313 gtgcatcatgtccgagcctagattcattgctcgccacggcgagctatgatcctcgccttgcaagtgatgat 12719243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14430701 - 14430581
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  14430701 aattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattc 14430602  T
Q  217 tgagattgaaattaggcttag 237  Q
    |   |||||||||||||||||    
T  14430601 tagaattgaaattaggcttag 14430581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2761067 - 2760944
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||  || || |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  2761067 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgatttagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 2760968  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    | ||||||||||| || |||||||    
T  2760967 aattagaaaagttatgaaattagg 2760944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 9445497 - 9445612
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||     
T  9445497 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctatgaccttagattatgaatatgatgaattctgg 9445596  T
Q  220 gattgaaattaggctt 235  Q
     || |||| |||||||    
T  9445597 aatcgaaactaggctt 9445612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 14144584 - 14144685
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  14144584 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattagtatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattataaaagttttgaaatta 14144683  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  14144684 gg 14144685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16114936 - 16114801
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16114936 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattagacttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 16114837  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcca 305  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  16114836 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgcca 16114801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16118089 - 16117954
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16118089 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattagacttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 16117990  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcca 305  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  16117989 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgcca 16117954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 32768591 - 32768506
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32768591 agagggctgcgattttctgcaaacttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 32768506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9704184 - 9703951
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||  |||||||  | |||||  ||||| |||||||  | || |||||||||||||||||    
T  9704184 agagagctgcgattttcatcaactaaggtaagggtgagactaacgattcagttttattaatccttgtaattctgatagtcaaattgacaagttaggattg 9704085  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||  ||| || || |||||||   ||    | |||||||||||| || | | | |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||     
T  9704084 aattaagaaatttatgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgatgataagttgtt-agattgatgtataaaccgtcctttgaccttagat 9703986  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggc 233  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9703985 tatgattaggatgaattctggaattgaaattaggc 9703951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3272655 - 3272554
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || || |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  3272655 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttatgaaatta 3272556  T
Q  122 gg 123  Q
    ||    
T  3272555 gg 3272554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11263216 - 11263036
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  11263216 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 11263118  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  11263117 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctataattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 11263036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Original strand, 20702206 - 20702265
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20702206 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 20702265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 339
Target Start/End: Original strand, 10861 - 10919
Alignment:
Q  281 ccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10861 ccgagccaaagttcatcgctcgccatcgcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26420894 - 26420813
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26420894 agagagctgcgatttt-ttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 26420813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12693362 - 12693182
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  12693362 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaaaggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 12693264  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  12693263 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 12693182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 15604755 - 15604823
Alignment:
Q  273 cattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatg 341  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  15604755 cattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgatggatgatg 15604823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14149488 - 14149405
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  14149488 agagagctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgattgtaattctgatgatta 14149405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12686826 - 12686745
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12686826 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaaaggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 12686745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 12321193 - 12321261
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  12321193 tgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccatcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12321261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 24055407 - 24055367
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24055407 agggctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaa 24055367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 44407575 - 44407728
Alignment:
Q  28 gtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt--agaaaagttttggaattag 122  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||  ||||||   |   || |||    
T  44407575 gtaagggtgagaataataactcagtaatgttaattaattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggattgaattggagaaaa---tgaaaactag 44407671  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||    
T  44407672 gtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaagaattggttaaattgatatagaaa 44407728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14331703 - 14331641
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14331703 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 14331641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14338287 - 14338225
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14338287 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 14338225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 7537088 - 7537007
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  7537088 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgaatgtaattctgatgatta 7537007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9410837 - 9410706
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt--agaaaagttttggaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||  ||||||       ||     
T  9410837 aaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtaattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattggagaaaa---cgaaaac 9410741  T
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggta 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9410740 taggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggta 9410706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10870312 - 10870258
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcat-acaaggtaagggtgagactaataattcagtaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10870312 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaa 10870258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10876442 - 10876388
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcat-acaaggtaagggtgagactaataattcagtaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10876442 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaa 10876388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 11547470 - 11547551
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11547470 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaactcagtaatattaattgattgtaattctgatgatta 11547551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 11554066 - 11554147
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11554066 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaactcagtaatattaattgattgtaattctgatgatta 11554147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Original strand, 17137433 - 17137582
Alignment:
Q  190 accttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt-cgtgtagaaagtgcattctgtccgagcca 288  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||    | |||| ||||| || |||| |||| | ||| ||||||||| |||||||     
T  17137433 accttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaa-aaactgcattctgcccgagcct 17137531  T
Q  289 aaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  17137532 atattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17137582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18284015 - 18283941
Alignment:
Q  266 gaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  18284015 gaaagtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctacgatcctcgcctcgcgagtgatgat 18283941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 25354052 - 25354094
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25354052 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaa 25354094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 42205756 - 42205690
Alignment:
Q  273 cattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  42205756 cattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 42205690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 6016653 - 6016702
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6016653 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 6016702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11313281 - 11313224
Alignment:
Q  282 cgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11313281 cgagccaacattcatcgctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 11313224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 12320926 - 12321030
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatt 102  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |  ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  12320926 ggctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatctttatgattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaat 12321024  T
Q  103 tagaaa 108  Q
    ||||||    
T  12321025 tagaaa 12321030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 19648827 - 19648900
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||| |||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19648827 ttagattgatgtataaaccgtccttagaccctagattatgaatatgatgaattctgggattgaaattaggctta 19648900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9410569 - 9410521
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9410569 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatga 9410521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 11768341 - 11768405
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  11768341 ttctgcccgagccagaattcatcgctcgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 11768405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14337995 - 14337947
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14337995 attcatcgctcgccacagcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 14337947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 232
Target Start/End: Original strand, 2831675 - 2831766
Alignment:
Q  141 atgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattagg 232  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||  || |||||||||    
T  2831675 atgattaaacggtgaagattgattaaattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattttggaatcgaaattagg 2831766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 339
Target Start/End: Original strand, 10508534 - 10508601
Alignment:
Q  272 gcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  10508534 gcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10508601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Original strand, 27847030 - 27847065
Alignment:
Q  8 tgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27847030 tgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagactaa 27847065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 14430818 - 14430777
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14430818 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaa 14430777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18532154 - 18532073
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatt-gttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||  |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||    
T  18532154 aaggtaagggtgagactaataactcagtagtgttaattaattgtgattctgatgattagttagcaagttttaggattgattt 18532073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 19684 - 19741
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  19684 aaggtaagggtgagactaataacttagtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 19741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 4317758 - 4317815
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttg-tagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| || ||||||||||||    
T  4317758 aaggtaagggtgagactaataactcagtaacattagttgttgttaattctgatgatta 4317815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 6016385 - 6016442
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  6016385 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 6016442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8706619 - 8706571
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8706619 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 8706571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8720035 - 8719987
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8720035 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 8719987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Original strand, 9750866 - 9750910
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaac 180  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9750866 aattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaac 9750910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10876151 - 10876103
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10876151 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10876103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Original strand, 11029347 - 11029391
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaac 180  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11029347 aattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaac 11029391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 11525047 - 11525115
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | || ||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  11525047 tgcattctgcccgagcctgaattcatcgctcgccctggcgagggatgatccttgcctcgcgagtgatga 11525115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14331411 - 14331363
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14331411 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 14331363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18006308 - 18006244
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  18006308 ttctgcccgagccaacattcattgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18006244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 19648939 - 19649003
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  19648939 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 19649003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 20702472 - 20702520
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20702472 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 20702520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26420602 - 26420554
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  26420602 attcatcgctcgccacagcgagctatgagtctcgcctcgcgagtgatga 26420554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26420770 - 26420714
Alignment:
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  26420770 gtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 26420714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 27847160 - 27847242
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccg-tcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  27847160 aattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaactgttccta-gaccttagataatgtgtaggatgaattctg 27847242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 27847299 - 27847363
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  27847299 ttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 27847363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 32768299 - 32768251
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32768299 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 32768251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34185071 - 34185007
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  34185071 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 34185007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34201449 - 34201385
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  34201449 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 34201385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 108)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 22460382 - 22460721
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22460382 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattg 22460481  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22460482 atttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 22460581  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22460582 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatttgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaagttcatcgc 22460681  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22460682 tcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22460721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 61707 - 61383
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61707 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaagtgacaaggttaggattgatttagagaagttttggaattagg 61608  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  61607 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggat 61509  T
Q  222 ttgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  61508 ttgaaactaggcttagaactatgttagatgatgattttcgtgtagaaactgcattatgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcc 61409  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||    
T  61408 tcgcctcgcgatggatgatgttcatc 61383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23187986 - 23187652
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23187986 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtgttaattgttatgcttctgatgattaattgacagagttaggattgattta 23187887  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23187886 gaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatttagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 23187787  T
Q  205 taggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgc 303  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||   ||||||  ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23187786 taggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagatgatgataatcgtgtgaaaactgcaatctgcccgagccaaagttcatcgctcgc 23187688  T
Q  304 catagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23187687 catagcgagcgatgaacctcgcctcgcgagtgatga 23187652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23599249 - 23598915
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23599249 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtgttaattgttatgcttctgatgattaattgacagagttaggattgattta 23599150  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599149 gaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatatagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 23599050  T
Q  205 taggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgc 303  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||   ||||||  ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23599049 taggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagatgatgataatcgtgtgaaaactgcaatctgcccgagccaaagttcatcgctcgc 23598951  T
Q  304 catagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23598950 catagcgagcgatgaacctcgcctcgcgagtgatga 23598915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 19927707 - 19928033
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19927707 tttcttcatacaaggtaagggtgagacgattaattcagtattgttaattgatataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 19927806  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19927807 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatatgtttaggatga 19927906  T
Q  213 attctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaag 312  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||  | ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19927907 attctggaattgaaattaggcttagagccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgcccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgag 19928006  T
Q  313 caatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  19928007 ctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 19928033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41667821 - 41667505
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41667821 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaggttaggattgatttagagaagttttggaattagg 41667722  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  41667721 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacgataaaattatgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggatt 41667622  T
Q  223 tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacct 322  Q
    | ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||    
T  41667621 taaaactaggcttagaactatgttagatgatgattttcgtgtagaaactgcattctgtccgagccgaaattcattgctcgctatagcgagctatgaatct 41667522  T
Q  323 cgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||||    
T  41667521 cgcctcgcgagtgatga 41667505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27264143 - 27263827
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27264143 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaatgttatgattgatttagagaagttttggaattacg 27264044  T
Q  124 tcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaga 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  27264043 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttcgaatatgtttaggatgaattctggat 27263945  T
Q  222 ttgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacc 321  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  |    
T  27263944 ttgaaactaggcttagaactatgttagatgatgattttcgtgtacaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcactcgccatagcgagctatgattc 27263845  T
Q  322 tcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  27263844 tcgcctcacgagtgatga 27263827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 95 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26126024 - 26125780
Alignment:
Q  95 gattgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataacct 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26126024 gattgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa-ttgtgttagattgatgtagaaaccatcctataacct 26125926  T
Q  194 tagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaatt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26125925 tagaatatgtttaggatgaattctgaaattgaaactaggcttagaactatgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaaat 26125826  T
Q  294 catcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  26125825 catcgctcgccatagcgagctatgattctcgcctcgcgagtgatga 26125780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27603734 - 27603501
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27603734 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 27603635  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27603634 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttggaa 27603535  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattagg 232  Q
     |||||||||||| ||| || |||  ||||||||    
T  27603534 catgtttaggatggattatgggatcaaaattagg 27603501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 24913154 - 24913365
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24913154 agagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 24913252  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24913253 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 24913352  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  24913353 catgtttaggatg 24913365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27216981 - 27216745
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27216981 agagtgctgcgattttcttaattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 27216882  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27216881 atttagagaagttttggaattaggtcagaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 27216782  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  27216781 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 27216745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1844000 - 1843763
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1844000 agagtgcttcgattttcttcatataaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 1843901  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1843900 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 1843801  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||| ||| || |||  |||||||||||    
T  1843800 acatgtttaggatggattatgggatcaaaattaggctt 1843763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16997966 - 16997729
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16997966 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16997867  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16997866 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 16997767  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  16997766 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 16997729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 27386195 - 27386408
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27386195 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattgattgataaagttaggattggtttagaaaagttttgtaattagg 27386294  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  27386295 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattcaggaatt 27386394  T
Q  224 gaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||    
T  27386395 gaaattaggcttag 27386408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 19489114 - 19489326
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19489114 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 19489213  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19489214 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 19489313  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  19489314 catgtttaggatg 19489326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22320176 - 22320412
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22320176 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 22320275  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22320276 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactcgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22320375  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  22320376 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 22320412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22326329 - 22326565
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22326329 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 22326428  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22326429 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactcgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22326528  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  22326529 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 22326565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26876759 - 26876994
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26876759 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 26876858  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  26876859 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 26876957  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  26876958 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 26876994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16929371 - 16929135
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16929371 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16929273  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16929272 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 16929173  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  16929172 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 16929135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16981118 - 16980882
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16981118 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16981020  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16981019 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 16980920  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  16980919 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 16980882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16986859 - 16986623
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16986859 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16986761  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16986760 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 16986661  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  16986660 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 16986623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17004599 - 17004362
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17004599 agagtgctgcaattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattttgatgattaattgacaaagttaggatt 17004500  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17004499 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 17004400  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  17004399 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 17004362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23171999 - 23171790
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23171999 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaaattaggattgattta 23171900  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccct---aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23171899 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgacgtagaaaccgtcctttaaccttagaacat 23171800  T
Q  202 gtttaggatg 211  Q
    ||||||||||    
T  23171799 gtttaggatg 23171790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23583256 - 23583047
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23583256 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaaattaggattgattta 23583157  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccct---aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23583156 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgacgtagaaaccgtcctttaaccttagaacat 23583057  T
Q  202 gtttaggatg 211  Q
    ||||||||||    
T  23583056 gtttaggatg 23583047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27618213 - 27617976
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27618213 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 27618115  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  27618114 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctttaaccttag 27618015  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  27618014 aatatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 27617976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9341198 - 9340962
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9341198 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 9341100  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9341099 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 9341000  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  9340999 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 9340962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9489832 - 9489596
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9489832 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 9489734  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9489733 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 9489634  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  9489633 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 9489596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9609093 - 9608857
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9609093 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 9608995  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9608994 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 9608895  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  9608894 atatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 9608857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 28431103 - 28431339
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28431103 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 28431201  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28431202 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 28431301  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  28431302 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 28431339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 339
Target Start/End: Original strand, 19687963 - 19688286
Alignment:
Q  16 tcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagtttt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  19687963 tcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattattataattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtttt 19688061  T
Q  115 ggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaat 214  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  19688062 gaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttcaccttagaatatgtttaggatgaat 19688161  T
Q  215 tctgagattgaaattaggcttagtgctatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaa 311  Q
    ||||  ||||||||||| |||||  | |||   |||||||||   ||||||  | ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | || |    
T  19688162 tctggaattgaaattagacttagaaccatgtgattagatgat--ttttcgtaga-aaactgcattctgccagagccaacattcatcgctcgccctggcga 19688258  T
Q  312 gcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     | |||| |||||||||||||| |||||    
T  19688259 acgatgatcctcgcctcgcgagggatga 19688286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10327765 - 10327554
Alignment:
Q  8 tgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttaga 106  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10327765 tgcgattttcatcaattaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagtgaggattgaattaga 10327666  T
Q  107 aaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttta 206  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10327665 aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacgataaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgttta 10327566  T
Q  207 ggatgaattctg 218  Q
    |||||| |||||    
T  10327565 ggatgagttctg 10327554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 18854652 - 18854889
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18854652 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgatactattaattaagtattgataattgatatagtgctgatgaataattgacaaagttaggattg 18854751  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18854752 atttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttaaattgatgtagaaaccgtcttataaccttaaaat 18854851  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18854852 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaggcttag 18854889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13305780 - 13306016
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13305780 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 13305878  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13305879 gatttagaaaagttttggaattaggttaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 13305978  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  13305979 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 13306016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24736312 - 24736100
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24736312 gctgcgattttcatcaattaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 24736213  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||    
T  24736212 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatatgtt 24736114  T
Q  205 taggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||    
T  24736113 taggatgaattctg 24736100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10867289 - 10867070
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10867289 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggatt 10867190  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  10867189 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 10867091  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10867090 atatgtttaggatgaattctg 10867070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 29281927 - 29282106
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29281927 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatta 29282026  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||    
T  29282027 gtttagagaagttttggaattaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaa 29282106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27370217 - 27369999
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   || | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27370217 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgcaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 27370119  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||    
T  27370118 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 27370019  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27370018 tatgtttaggatgaattctg 27369999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27376700 - 27376482
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   || | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27376700 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgcaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 27376602  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||    
T  27376601 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 27376502  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27376501 tatgtttaggatgaattctg 27376482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25936533 - 25936396
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25936533 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 25936434  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25936433 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa 25936396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24175721 - 24175387
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||    
T  24175721 gctgcgattttcatctaacgaggtaagggtgagactaataattcagtaattttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaatt 24175622  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
     || || |     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24175621 ggagaaatcgaa-aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgt 24175523  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcg 302  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||    | |||      |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24175522 ttaggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcg 24175424  T
Q  303 ccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  24175423 ccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 24175387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24870793 - 24870467
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||  ||||  |||||||||| || ||  |      
T  24870793 tttcttcatacaaggaaagggtgagactaacgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggaggaac 24870694  T
Q  112 tttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
         || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| |||    
T  24870693 caaa-aactaggtcaaatccctaaaattgatgatctaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactatcccttgaccttagaatatgtttagaatg 24870595  T
Q  212 aattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagca 310  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |  | |||  |   |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||     
T  24870594 aattctgggactgaaattaggcttggaaccatgagattagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcg 24870496  T
Q  311 agcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  24870495 aacaatgatcctcgcctcgcgagggatga 24870467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 25962897 - 25963236
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  25962897 agagagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgataaaattaacaagttaggattg 25962996  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||||||  || || |||||||   ||    | |||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||     
T  25962997 aattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagttgtt-agattgatgcataaaacgtcctttgaccttagat 25963095  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||   | | ||| ||||||||| |||||||   ||||||||    
T  25963096 tatgtttagaatgaattttggaatcgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgcaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcg 25963195  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| |||| | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  25963196 ctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 25963236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40429378 - 40429052
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || |  |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  40429378 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgattcttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaatttt 40429279  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
    ||| |||||||   ||      || |||||||||  | | | | ||| |||| |||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||| |||    
T  40429278 ttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccgatgatgataagctgtt-agattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgtttagaatg 40429180  T
Q  212 aattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaa 311  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||| ||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |    
T  40429179 aattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgtatttttcgtaaaaattgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcga 40429080  T
Q  312 gcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||    
T  40429079 tcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 40429052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24650101 - 24649931
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24650101 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattatggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 24650002  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24650001 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 24649931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37525553 - 37525248
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | || ||||||| || || ||||||||||||||    
T  37525553 agagagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattatgatgatcaaattaacaagttaggattg 37525454  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||||||  || || |||||||   ||    | |||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||     
T  37525453 aattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctgtt-agattgatgcataaaacgtcctttgaccttagat 37525355  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||  |  | ||| ||||||||| |||||||   ||||||||    
T  37525354 tatgtttagaatgaattctgggattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaattttttagaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcg 37525255  T
Q  299 ctcgcca 305  Q
    |||||||    
T  37525254 ctcgcca 37525248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 24654553 - 24654764
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  ||||  |||||||||| || || ||       || |||    
T  24654553 aaggtaagggtgagactaacgattcagtaatgttaattcttataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagaaaccgaa-aactag 24654651  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagat 222  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||  ||    
T  24654652 gtcaaatctctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtactatgaccttagattatgaataggatgaattctggaat 24654751  T
Q  223 tgaaattaggctt 235  Q
     ||||||||||||    
T  24654752 cgaaattaggctt 24654764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 337
Target Start/End: Original strand, 22811231 - 22811451
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    |||||||||||| || || |||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22811231 aattaggtcaaatccttagaattgatgattaatcggtgaaaattgattagattgatggaaaaaccgtcctttgaccttagattatgtttaggatgaattc 22811330  T
Q  217 tgagattgaaattaggcttagtgctatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagc 313  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||| |   ||||||||  | ||||||  | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | |    
T  22811331 tggaattgaaattaggcttagaactaagagattagatga--attttcgtaga-aaattgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaac 22811427  T
Q  314 aatgaacctcgcctcgcgagtgat 337  Q
     |||| ||||||||||||||||||    
T  22811428 gatgatcctcgcctcgcgagtgat 22811451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27602543 - 27602373
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  ||||| |||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27602543 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgatttctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 27602444  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27602443 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 27602373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Original strand, 27378832 - 27378964
Alignment:
Q  208 gatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccata 307  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||      
T  27378832 gatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgatttttgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcccagattcatcgctcgccacg 27378931  T
Q  308 gcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27378932 gcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 27378964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26121135 - 26121061
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26121135 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 26121061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Original strand, 27382840 - 27383010
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  27382840 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagataatgatttttgtgtagaaa 27382939  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27382940 gtgcatcatgtccgagcccagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 27383010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 24627891 - 24628010
Alignment:
Q  221 attgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaac 320  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |    
T  24627891 attgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgttcgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatc 24627990  T
Q  321 ctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24627991 ctcgcctcgcgagtgatgat 24628010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26126597 - 26126523
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26126597 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 26126523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10867817 - 10867694
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10867817 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggatt 10867718  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  10867717 gatttagagaagttttggaattag 10867694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Original strand, 22798442 - 22798645
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22798442 aattgatgattaaacggtgaaaattggttaaattaatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattgaaattaggctt 22798541  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    |   |  ||| || || |||| ||||||| | ||| | ||||||| |||||||   |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||||    
T  22798542 aaaaccttgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaactacattctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 22798640  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  22798641 gatga 22798645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 45677340 - 45677447
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  45677340 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta 45677439  T
Q  105 gaaaagttt 113  Q
     ||||||||    
T  45677440 -aaaagttt 45677447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21917497 - 21917731
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||  |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  21917497 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaattcatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattg 21917595  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    | |||||||  || || |||||||   ||    | |  ||||||||| || | |   || |  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |    
T  21917596 aattagaaagtttatgaaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttgttagattgatgtagaaaccgtcctttgaccctagatt 21917695  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21917696 atgaataggatgaattctggaattgaaattaggctt 21917731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 44369750 - 44369826
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44369750 tgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 44369826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 12829987 - 12829902
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  12829987 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 12829902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24506338 - 24506257
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24506338 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 24506257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24674309 - 24674176
Alignment:
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||   ||| ||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||||    
T  24674309 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatgatgaattt-tcgtaaaaactgcattctgccctagcctatattcatcgctcgcc 24674211  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     | || | | |||| | ||||||||||||||||||    
T  24674210 ctcgcgaacgatgatcttcgcctcgcgagtgatga 24674176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 29234494 - 29234409
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  29234494 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 29234409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 29347793 - 29347708
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  29347793 agagggctgcgattttctgcaaatttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 29347708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 115
Target Start/End: Original strand, 24703126 - 24703219
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttg 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || || || ||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24703126 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattatgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttg 24703219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25586621 - 25586441
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  25586621 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcggtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagatttagga 25586523  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  25586522 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 25586441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11679853 - 11679763
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag 90  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |||||    
T  11679853 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgattgtaattctgatgattagttaacaag 11679763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 21138484 - 21138641
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| || || ||       || ||    
T  21138484 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtgattctgatgattagttagcaagctttaggattgaattggagaaaaacgaaaacta 21138583  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||| ||||    
T  21138584 ggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgttgaaa 21138641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 21146551 - 21146708
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||  ||||  |||||||||| || || ||       || ||    
T  21146551 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtgattctgctgattagttagcaagctttaggattgaattggagaaaaacgaaaacta 21146650  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  21146651 ggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 21146708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 13969558 - 13969620
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13969558 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 13969620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24708982 - 24708920
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24708982 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 24708920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24715629 - 24715567
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24715629 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 24715567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 41603920 - 41603982
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41603920 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 41603982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 41609839 - 41609901
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41609839 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 41609901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 45056614 - 45056676
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45056614 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattg 45056676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 339
Target Start/End: Original strand, 23019143 - 23019225
Alignment:
Q  257 tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||| | |||| |||| |||||||||||||||    
T  23019143 tttcgtgaaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcaaacgatgatcctcacctcgcgagtgatga 23019225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 44380384 - 44380438
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcat-acaaggtaagggtgagactaataattcagtaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  44380384 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaa 44380438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 44387054 - 44387108
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcat-acaaggtaagggtgagactaataattcagtaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  44387054 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaa 44387108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 21138753 - 21138802
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21138753 attcatcgctcgccatggcgagctataaacctcgcctcgcgagtgatgat 21138802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 24879783 - 24879832
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24879783 attcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 24879832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 30970461 - 30970510
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30970461 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 30970510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 41530492 - 41530541
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41530492 attcatcgctcgccacagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 41530541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 37319139 - 37319058
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  37319139 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 37319058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 10101127 - 10101176
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10101127 attcatcgctcgccacggcgagttatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 10101176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 19645201 - 19645258
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  19645201 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 19645258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 19645469 - 19645518
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19645469 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 19645518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 22740303 - 22740376
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   ||  |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22740303 ttagattgatgcataaaccgtccttggactctagattatgaataggatgaattctgggattgaaattaggctta 22740376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 22758058 - 22758131
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   ||  |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22758058 ttagattgatgcataaaccgtccttggactctagattatgaataggatgaattctgggattgaaattaggctta 22758131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 43
Target Start/End: Original strand, 22811126 - 22811155
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22811126 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 22811155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Original strand, 24654802 - 24654867
Alignment:
Q  274 attctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  24654802 attctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 24654867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 24871680 - 24871737
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  24871680 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 24871737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 24879515 - 24879572
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  24879515 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 24879572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 30970193 - 30970250
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30970193 aaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 30970250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Original strand, 40621413 - 40621501
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||   |||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  40621413 aaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaaattaggattgaatta-aaaagttt 40621501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10327501 - 10327433
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | || |   |||| ||||||||||||||||||||    
T  10327501 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctccccctggcgaatgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10327433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10866997 - 10866949
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10866997 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10866949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10874164 - 10874116
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10874164 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10874116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 13969850 - 13969898
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13969850 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 13969898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21115791 - 21115723
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||| || | |||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  21115791 tgcattttgtccgagcctgaattcatcgctctccctggcaagtgatgatcttcgcctcgcgagtgatga 21115723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 23067916 - 23067998
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccg-tcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  23067916 aattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaactgttccta-gaccttagataatgtgtaggatgaattctg 23067998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 23100685 - 23100749
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  23100685 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23100749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 24703272 - 24703308
Alignment:
Q  168 ttgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24703272 ttgatgtagaaaccgtcctttgaccttagaatatgtt 24703308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24708690 - 24708642
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24708690 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 24708642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24715337 - 24715289
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24715337 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 24715289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25586329 - 25586281
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25586329 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 25586281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29234201 - 29234153
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29234201 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 29234153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 29282218 - 29282266
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29282218 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 29282266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29347500 - 29347452
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29347500 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 29347452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 44387345 - 44387393
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44387345 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 44387393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1266 - 922
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1266 agggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttttagttctgatgattaattgacaaagttaggattgat 1168  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaacccta-aaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| || |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1167 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctacaaattgatgaccaat-ggtacaactgagttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaata 1069  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1068 catttaggatgaattctgggattgaaattaggcttagaactatgttagataatgattttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 969  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  968 cgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10817 - 10478
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10817 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattg 10718  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10717 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 10618  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| |||||||  | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10617 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 10518  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10517 tcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2790 - 2452
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2790 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 2691  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2690 ttagaaaagttttttaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccctcctataaccttagaata 2591  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||    
T  2590 tgtttaggatgaattctgagatcgaaactaggcttagaacttagttggatgatgattttcgtgtagaaagtgcctcctgtccgaggcgaaattcatcgct 2491  T
Q  301 cgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2490 cgccatagcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 2452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14121 - 13964
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14121 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 14022  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14021 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaa 13964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 29925 - 30037
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || || |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  29925 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 30024  T
Q  100 atttagaaaagtt 112  Q
    | |||||||||||    
T  30025 aattagaaaagtt 30037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 5)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 63124 - 62821
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  63124 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatcgat 63025  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63024 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 62925  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  62924 gtttaggatgaattctgagattgaaactaggcttagaacttagttagatgatgattttcgtgtagaaagtgccttctatccgagccgaaattcatcgctc 62825  T
Q  302 gcca 305  Q
    ||||    
T  62824 gcca 62821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20056 - 19775
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20056 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgatcaattgacaaagttaggattgaattagaaaagttttgtaattagg 19957  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19956 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 19857  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcca 305  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||  |||| ||| |||||| || ||||||| |  ||||||||||||||    
T  19856 gaaattaggcttagatccatgtgagatcatgaagtttttgtaaaaactgcattatgcccgagcctatgttcatcgctcgcca 19775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13719 - 13484
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  13719 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaaattttgtaattagg 13620  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  13619 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatatgtttaggatgaattctagaatt 13520  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt 259  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||    
T  13519 gaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaattt 13484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 72089 - 72307
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  72089 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 72188  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  72189 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 72287  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  72288 tatgtttaggatgaattctg 72307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31440 - 31224
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31440 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 31342  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  31341 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 31243  T
Q  200 atgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31242 atgtttaggatgaattctg 31224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16256 - 15912
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgattt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16256 ggctgcgatttccttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttacaattctgatgattaattgacaaagtaaggattgattt 16157  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagt-tgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16156 agaaaagttttgtaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtgaaactgtgttt-gattgatgtagagatcgtcctataaccttagaatat 16058  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16057 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagaaccttggtagatgatgattttcatgtagaaagtacattctgcccgagccgaaattcatcgctc 15958  T
Q  302 gccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15957 gccatagcgagctatgatcctcgcctcgctagtgatgatgttcatc 15912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19271 - 18931
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19271 agagggctgcgattt-cttcactttaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 19173  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19172 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgacgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 19073  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||| |||||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcg 18973  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaa-cctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18972 ctcgccatagcgagctatgaatcctcgcctcgcgagggatga 18931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10335 - 9997
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattga 100  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10335 gagggctgcgatttctttaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgactgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 10236  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10235 tttagaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattgttgataaaacggtaaatgttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 10136  T
Q  201 tgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||   ||||||  ||| |||||| || | |||||||| ||||||||    
T  10135 tgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaaccatgttagatgatgataatcgtgtgaaaactgcattttgcctgagccaaagttcatcgc 10037  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10036 tcgccatagcgagcaatgatcctcgcttcgcgagtgatga 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 506
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  821 aaggtaagggtgagactaataattcagtagcattgattgttataattctgatgattaattgacaaagttatgattgatttagaaaagttttgaaattagg 722  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  721 tcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatc 622  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctc 323  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  621 gaaattaggcttagaactatgttagttgatgaaatttttgtataaattgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctc 522  T
Q  324 gcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  521 gcctcgcgagtgatga 506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24112 - 23793
Alignment:
Q  21 atacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24112 atacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgaataattgataaagttaggattgatttagaaaagttttgaaat 24013  T
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24012 taggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattcttg 23913  T
Q  220 gattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaa 319  Q
      ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  23912 atttgaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaaatttttgtaggaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcaatgat 23813  T
Q  320 cctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  23812 cctcgcctcgcgagggatga 23793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 242974 - 242794
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  242974 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 242876  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  242875 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 242794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 8887 - 9221
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8887 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 8986  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8987 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccataaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttataatatgtt 9086  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||  ||||| || ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  9087 taggatgaatttagaaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaaatttttgtaggaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgctcgcc 9186  T
Q  305 atagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||| || | |||||||||||||| |||||    
T  9187 atagcgagccatcatcctcgcctcgcgagcgatga 9221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 17548 - 17887
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17548 agagggctacgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagttatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggatt 17646  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17647 gatttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 17746  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||  | |||| |||| ||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  17747 tatatttatgatgaattatgtaattgagattaggcttagaaccatgtgagatcatgaaatttgtgtagaaactacattccgtccgagccaaagttcatcg 17846  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  17847 ctcgccgtagcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatga 17887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Original strand, 2353 - 2647
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2353 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagt 2452  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2453 tcaaatccctaaaattgatgatcaaagggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 2552  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatga 318  Q
    ||||||| ||||||  | ||||||| ||||||| ||  || | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2553 gaaattaagcttagaaccatgttagttgatgaaatttttgcaaaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcaccatagcgagcaatga 2647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 64770 - 64430
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  64770 agagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgactaattgacaaagttaggatt 64672  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt-gatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64671 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaatttgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaacttaga 64572  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||  | ||||| | |||||||  | ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  64571 atatgtttaggatgaattctg-gatgcgaaattaagcttagaaccatgtttgttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgtgccaaaattcat 64473  T
Q  297 cgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  64472 cgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 64430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 80015 - 79675
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  80015 agagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgactaattgacaaagttaggatt 79917  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt-gatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  79916 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaatttgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaacttaga 79817  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||  | ||||| | |||||||  | ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  79816 atatgtttaggatgaattctg-gatgcgaaattaagcttagaaccatgtttgttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgtgccaaaattcat 79718  T
Q  297 cgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  79717 cgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 79675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 76652 - 76314
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||    
T  76652 gagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaacggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattttgataactaattgacaaagttaggattg 76554  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt-gatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  76553 atttagaaaa-ttttgaaattaggtcaaatccctaaaatttgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccatcctataaccttagaa 76455  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatc 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  76454 tatgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaagcttagaactatgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtcagagccaaaattcatc 76356  T
Q  298 gctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  76355 gctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 76314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 332
Target Start/End: Original strand, 34180 - 34394
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34180 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacagtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 34279  T
Q  219 agattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaat 316  Q
      ||||||||||||||||   | |||| || || |||| ||||||| | ||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | ||    
T  34280 gaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgat 34378  T
Q  317 gaacctcgcctcgcga 332  Q
    || |||||||||||||    
T  34379 gatcctcgcctcgcga 34394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 339
Target Start/End: Original strand, 40852 - 41073
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||||| |||   ||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  40852 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaccggtgaaaattggttagattgatgtaggaactaccctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 40951  T
Q  219 agattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaat 316  Q
      ||||||||||||||||   | |||| || || |||| ||||||| | ||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| || | || | | ||    
T  40952 taattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctctccctcgcgaacgat 41050  T
Q  317 gaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  41051 gatcctcgcctcgcgagtgatga 41073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 1876 - 2202
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  1876 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctatgattatgatgattaattgacaaagttaggattgaattagagaagtt 1975  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1976 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaaatgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 2075  T
Q  213 attctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaag 312  Q
    ||||||   ||||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||| ||    
T  2076 attctggacttgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaaatttttgtaaaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgcttgccatagcgag 2175  T
Q  313 caatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2176 caatgatcctcgcctcgcgattgatga 2202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 61 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10196 - 9916
Alignment:
Q  61 ttgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaag 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10196 ttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa- 10098  T
Q  159 ttgt-ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaat 257  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |    
T  10097 tggtgttagattgatgtagaaaccgtcccacaaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgatt 9998  T
Q  258 ttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  9997 ttcgtgtagaaaatgcatcaggtccgagcctaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgattgatga 9916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 131577 - 131790
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  131577 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 131676  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131677 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacgataaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 131776  T
Q  205 taggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||    
T  131777 taggatgaattctg 131790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 7)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Original strand, 105104 - 105439
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  105104 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaatggacaaagttaggattgattta 105203  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105204 gaaaagtttttgaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 105303  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgc 303  Q
    ||||||| ||| ||  ||  ||||||||||| |  | |||||||  ||| || ||||| | | ||  || |||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  105304 taggatggattatggaatcaaaattaggctttgaaccatgttagtcgatggattttcgag-aaaacctgtattctgcccgagcctatgttcatcgctcgc 105402  T
Q  304 catagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    | | || ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  105403 cttggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 105439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 125308 - 125641
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  125308 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtacttctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 125407  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125408 gaaaagttttagaattaggtcaaaaacctaaaattgatgatcaaaag-taaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 125506  T
Q  205 taggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgc 303  Q
    ||||||| ||| ||  ||  ||||||||||| |  | ||||||| |||| || ||||| | | ||   | |||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  125507 taggatggattatggaatcaaaattaggctttgaaccatgttagttgatggattttcgag-aaaacccgtattctgcccgagcctatgttcatcgctcgc 125605  T
Q  304 catagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | | |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  125606 cttggcaagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 125641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 81221 - 81051
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  81221 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaacattgttagatgatgattttcgtgtagaaa 81122  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    | ||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  81121 gcgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 81051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 13648 - 13564
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13648 aaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaattcatgtagttctgatgatcaaattaacaagttaggattgaattagaaa 13564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Original strand, 64888 - 64947
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||    
T  64888 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaagaattgattaaattggtgtagaaa 64947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 334
Target Start/End: Original strand, 65059 - 65102
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  65059 attcatcgctcgccatggcgagctatgaacctcgcctcgcgagt 65102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 340
Target Start/End: Original strand, 61095 - 61143
Alignment:
Q  292 ttcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  61095 ttcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcaagtgatgat 61143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 174206 - 173867
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  174206 agagggccgcggttttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattattatgattctgatgattaattgacaaagttaggatta 174107  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174106 aattagaaaagatttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaaaaaataagtagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 174007  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||   ||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  174006 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaaattttggtaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgc 173907  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  173906 ttgccatagcgagcaatgattctcgcctcacgagtgatga 173867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 421734 - 422060
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||  ||||  |||||||||| || || ||      
T  421734 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcttataattatgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagaaac 421833  T
Q  112 tttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
         || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||  || ||||    
T  421834 cgaa-aactaggtcaaatccctaaaattgatgatgaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcatatgaccttatattatgaatatgatg 421932  T
Q  212 aattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagca 310  Q
    |||||||  || ||||||||||||    |  ||  |   |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||     
T  421933 aattctggaatcgaaattaggctttaaaccttgagattagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccttggcg 422031  T
Q  311 agcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  422032 aacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 422060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11065 - 10753
Alignment:
Q  28 gtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattaggtca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11065 gtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattatgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgga-ttaggtca 10967  T
Q  127 aaacccta-aaattgatgatcaaacggtaaaa-gttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattg 224  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966 aaaacctagaaattgatgatcaaacggtataatgatgtt-agattgatgtagaaaccatcctacaaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattg 10868  T
Q  225 aaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcg 324  Q
    |||||||||||||  |   |||||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | ||| || ||| ||||| ||||    
T  10867 aaattaggcttagaacctggttagatgacaattttcgtgtagaaagtgcatcaagtccgagcctaaattcatcgcttgtcatggcgagctatgaatctcg 10768  T
Q  325 cctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||    
T  10767 cctcgcgagtgatga 10753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 305
Target Start/End: Original strand, 11065 - 11346
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11065 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattgattgaaaaaattaggattgatttagaaaagttttgtaattagg 11164  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11165 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 11264  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcca 305  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  11265 gaaattaggcttagaaccatgtaagatcatgaaatttttgtaaaaactgcattctggccgagcctatgttcatcgctcgcca 11346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 58650 - 58886
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  58650 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 58749  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  58750 atttagaaaagtttcggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 58849  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  58850 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 58886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 139983 - 139747
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  139983 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 139884  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  139883 atttagaaaagtttcggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 139784  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  139783 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 139747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 117 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 56895 - 56665
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  56895 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaattgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatta 56796  T
Q  217 tgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaat 316  Q
    ||  |||||||||||||||||  |  |||||| || ||||  | ||||  ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  56795 tggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttggtgaagattgtgtgaaaactgcattttgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcaagctat 56696  T
Q  317 gaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56695 gatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 56665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 14517 - 14843
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || |  |||||||||| | || || ||||||||||||| |||||||  ||    
T  14517 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgattcttatgattctgatgatcagttaacaaagttaggattgaattagaaatttt 14616  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
    ||| |||||||   ||      || ||||||||| || | | | ||| || |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||| |||    
T  14617 ttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccaatgatgataagctg-ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgtttagaatg 14715  T
Q  212 aattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatg-aatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagca 310  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  | |||| | || ||| |||||  | || ||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||     
T  14716 aattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgaaatcatgtaattttcttta-aaactgctttctgcccgagccgacattcatcgctcgccctggcg 14814  T
Q  311 agcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  14815 aacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 190598 - 190695
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggct 234  Q
    |||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  190598 aattgatgattaagtggtaaaa-ttggttagattgacgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaattgaaattaggct 190695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 192301 - 192398
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggct 234  Q
    |||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  192301 aattgatgattaagtggtaaaa-ttggttagattgacgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaattgaaattaggct 192398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 17886 - 18207
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |  |||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  17886 tttctacatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctatgattctgatgattaattgacgaagcaaggattgaattagaaaagtt 17985  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17986 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 18085  T
Q  213 attctgagattgaaattaggcttagtgctatg---ttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagc 309  Q
    ||||||  |||||||||||||||||  | |||   |||||||  || ||| | | | ||| ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  18086 attctggaattgaaattaggcttagaaccatgagattagatg--gatttttgag-aaaaactgcattctgcccgagcttacattcatcgctcgccatagc 18182  T
Q  310 aagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
     |||||||| ||| |||||||||||    
T  18183 gagcaatgatccttgcctcgcgagt 18207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12668 - 12431
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12668 agagggctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggatt 12570  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12569 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 12470  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  12469 tatgtttaggatgaattatggaattgaaagtaggcttag 12431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 65715 - 65934
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  65715 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagtgtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 65814  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  65815 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 65914  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  65915 tatgtttaggatgaattctg 65934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Original strand, 24183 - 24497
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24183 aaggtaagggtgagactaataattcaataatattgattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 24282  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  24283 tcaaatccctaaaattgaagatcaaacggtaaaatttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttagggatgaattctggaatt 24382  T
Q  224 gaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctc 323  Q
    | ||||||||| ||  | ||||||| ||||||| ||  | |  | | ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24383 g-aattaggctcagaaccatgttagttgatgaaatttttatgaagactgcattctgcctgatcctaaattcatcgctcgccatagcgagccatgatcctc 24481  T
Q  324 gcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||||    
T  24482 gcctcacgagtgatga 24497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9006 - 9242
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9006 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 9105  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9106 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 9205  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
     |||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||    
T  9206 catgtttaggatggattatggaatcaaaattaggctt 9242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 2
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  201 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 102  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  101 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 61612 - 61419
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  61612 acaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagagaagttttgaaatta 61513  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61512 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 61419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 68425 - 68212
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  68425 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 68326  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  68325 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 68226  T
Q  198 atatgtttaggatg 211  Q
    | ||||||||||||    
T  68225 acatgtttaggatg 68212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42478 - 42285
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  42478 acaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattcggatgattaattgacaaagttaggattgatttagagaagtttagaaatta 42379  T
Q  122 ggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaatt 215  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42378 ggtcaaatctctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataacgttagaatatgtttaggatgaatt 42285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Original strand, 58080 - 58250
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  58080 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaa 58179  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  58180 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgtcacggcgagctatgatcctcgcctcgcgaatgatgat 58250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 7826 - 7749
Alignment:
Q  6 gctgcgattttct-tcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7826 gctgcgattttctgtaattcaaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 7749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23637 - 23588
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23637 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 23588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7628 - 7579
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7628 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgggtgatgat 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 133271 - 133207
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  133271 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccgtcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 133207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37220 - 36983
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  37220 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggcgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggatta 37121  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37120 atttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcttataaccttagaat 37021  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagat-tgaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37020 atgtttaggatgaattctg-gatgtgaaattaggcttag 36983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6283 - 6070
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6283 agagggttgcgattt-cttcatacaaggtaagagtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 6185  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa---ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6184 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccatcctataaccttag 6085  T
Q  197 aatatgtttaggatg 211  Q
    || ||||||||||||    
T  6084 aagatgtttaggatg 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Original strand, 199 - 455
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag-ttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  199 gctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattctataacgttaattgctgtaattctgatgattaattgacaaggttaggattgattta 298  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  299 gagaagttttggaattaggtcaaaacactaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtaggaaccgtcctataaccttagaacatgt 398  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttc 260  Q
    |||||||| ||| ||  ||  ||||||||||| |  | ||||||| || ||||||||    
T  399 ttaggatggattatggaatcaaaattaggctttgaaccatgttagttggtgaatttc 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 57696 - 57460
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  57696 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 57598  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  57597 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 57498  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  57497 acatgtttaggatgaattctggaatcaaaattaggctt 57460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11274 - 11055
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11274 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 11176  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11175 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 11076  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  11075 acatgtttaggatgaattctg 11055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6964 - 6752
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6964 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 6865  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6864 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 6765  T
Q  199 tatgtttaggatg 211  Q
     ||||||||||||    
T  6764 catgtttaggatg 6752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Original strand, 94705 - 94861
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  94705 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 94804  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  94805 tttagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa 94861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 1
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttagg 95  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  91 gctgcgattttcttcaaacaaagtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattttgatgatcaattgacgaagttagg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 52503 - 52468
Alignment:
Q  8 tgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52503 tgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagactaa 52468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39617 - 39400
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39617 gagggctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 39519  T
Q  101 tttagaaaagttttggaattaggtc-aaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39518 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 39420  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39419 tatgtttaggatgaattctg 39400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 61721 - 61502
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  61721 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 61623  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  61622 gatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 61523  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctg 218  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  61522 acatgtttaggatgaattctg 61502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 211
Target Start/End: Original strand, 155802 - 155989
Alignment:
Q  26 aggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattaggt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  155802 aggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattaagt 155901  T
Q  125 caaaaccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  155902 caaaaccctaaaaattgatgattaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaacatgtttaggatg 155989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Original strand, 5436 - 5606
Alignment:
Q  177 aaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcatt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5436 aaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgggattgaaactaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatt 5535  T
Q  277 ctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5536 ctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgaacctcggctcgcgagtgatgatgttcatc 5606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 5331 - 5438
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5331 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagaataataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaaagttaggattgat 5430  T
Q  102 ttagaaaa 109  Q
    ||| ||||    
T  5431 ttaaaaaa 5438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 4396 - 4604
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4396 aaggtaagggtgagactaataattcattaatgttaatttctgtgattctgatgattaattggcaaagttaggattgaattagaaaagttttgtaattagg 4495  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  4496 tcatatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattaattagattgatgtagaaactgtcctgtgaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatc 4595  T
Q  224 gaaattagg 232  Q
    |||||||||    
T  4596 gaaattagg 4604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 29914 - 30069
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgat 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  29914 agggctacgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaatagacaaagttaggattgat 30013  T
Q  102 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30014 ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggcaaaa 30069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 54474 - 54262
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  54474 gctgcgattttcatcaattaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 54375  T
Q  105 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||    
T  54374 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatatgtt 54276  T
Q  205 taggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||    
T  54275 taggatgaattctg 54262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 54205 - 54141
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  54205 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 54141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 19742 - 19824
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccg-tcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  19742 aattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaactgctccta-gaccttagataatgtttatgatgaattctg 19824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 65248 - 65312
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  65248 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 65312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 9805 - 10040
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9805 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattagtataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 9903  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||    
T  9904 aattagaaa-gttttgaaactaggtcaaatccctaaaattgatgaacaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactatcccttgaccttagaat 10002  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  10003 atgtttaggatgaattctggaatcgaaattaggcttag 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 79108 - 79051
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  79108 aaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtaattctgatgatta 79051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 31502 - 31721
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31502 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 31601  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  31602 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctataaccttagaa 31701  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31702 tatgtttaggatgaattctg 31721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 31794 - 31842
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31794 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 31842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 9)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 140623 - 140387
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||||  |||    
T  140623 agagggctgcgattt-cttcaatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaatgattgacaaagtta--att 140527  T
Q  99 gatttagaaaag-ttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    ||| |||    | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140526 gatatagttctgattttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 140427  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttag 237  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  140426 atatgtttaggatgaattttggaattgaaattaggcttag 140387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 57890 - 57671
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  57890 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 57791  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  57790 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 57691  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  57690 tatgtttaggatgaattctg 57671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 97497 - 97285
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  97497 aaggtaaggctgagactaataattctgtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 97399  T
Q  124 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagatt 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||    
T  97398 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaacatgtctaggatgaactctggaatt 97299  T
Q  224 gaaattaggcttag 237  Q
    ||||||||||||||    
T  97298 gaaattaggcttag 97285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Original strand, 413347 - 413408
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  413347 acaaggtaagggtgagactaatgatttagtaatgttaattattataattctgatgattaatt 413408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 430081 - 429912
Alignment:
Q  13 ttttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt--aga 106  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||  ||||  |||||||||| ||  |||    
T  430081 ttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgattgtaattctgatgagtagttagcaagaattaggattgaattggaga 429982  T
Q  107 aaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||   |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||    
T  429981 aaa---tgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaa 429912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 429800 - 429752
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  429800 attcatcgctcgccacagcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 429752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 339
Target Start/End: Original strand, 413545 - 413611
Alignment:
Q  273 cattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  413545 cattctgcccgagccaacattcatcgctcaccttggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 413611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 57598 - 57550
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  57598 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 57550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Original strand, 413445 - 413497
Alignment:
Q  120 taggtcaaaa-ccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattga 171  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  413445 taggtcaaaatcccaaaaattgatgatcaaacggtataaattgattagattga 413497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23120 - 22901
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23120 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 23021  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  23020 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 22921  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  22920 tatgtttaggaagaattctg 22901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 3269 - 3487
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggatt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3269 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 3367  T
Q  99 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  3368 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 3467  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3468 tatgtttaggatgaattctg 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3608
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3560 attcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 3608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19157 - 19011
Alignment:
Q  23 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttggaatta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19157 acaaggtaagggtgagactaataattcaatattgtttattgttgttattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaatta 19058  T
Q  122 ggtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttaga 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19057 ggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttaga 19011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 65607 - 65821
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  65607 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagtttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattg 65705  T
Q  100 at-ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||| | | || ||| ||    
T  65706 aaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcgtttgactttaaaa 65804  T
Q  199 tatgtttaggatgaatt 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  65805 tatgtttaggatgaatt 65821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 70748 - 70962
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  70748 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagtttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattg 70846  T
Q  100 at-ttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||| | | || ||| ||    
T  70847 aaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcgtttgactttaaaa 70945  T
Q  199 tatgtttaggatgaatt 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  70946 tatgtttaggatgaatt 70962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 75074 - 74919
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||||  ||||  |||||||||| || ||  | |     || |||    
T  75074 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttgattagtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggaggaatcgaa-aactag 74976  T
Q  123 gtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  74975 gtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaa 74919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 65877 - 65945
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  65877 tgcattctgcccgagctaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagagatga 65945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38960 - 38740
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggat 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38960 agagggctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggat 38861  T
Q  98 tgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaa-aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||    
T  38860 tgatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaagaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttag 38762  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38761 aatatgtttaggatgaattctg 38740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 75852 - 76072
Alignment:
Q  1 agagggctgcgatttt-cttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgaca-agttaggat 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  75852 agagggctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggat 75951  T
Q  98 tgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaa-aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttag 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||    
T  75952 tgatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaagaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttag 76050  T
Q  197 aatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  76051 aatatgtttaggatgaattctg 76072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 191520 - 191846
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgatttagaaaagt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||  ||||  |||||||||| || ||  |      
T  191520 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattagtatgattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggaggaac 191619  T
Q  112 tttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
         || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||    
T  191620 cgaa-aactaggccaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattatattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtttagaatg 191718  T
Q  212 aattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagca 310  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  | |||  |   | |||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  191719 aattctggaattgaaattaggcttagaaccatgaaattagttgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctagcg 191817  T
Q  311 agcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  191818 aacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 191846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3553 - 3375
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattg 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3553 gagggctgcgattt-cttcataaccagataagagtgagactaataattcaataatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 3455  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  3454 atttagaaaagttttgaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 3375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Original strand, 19242 - 19357
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19242 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 19341  T
Q  113 ttggaattaggtcaaa 128  Q
    ||| ||||||||||||    
T  19342 ttgaaattaggtcaaa 19357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 212
Target Start/End: Original strand, 19353 - 19420
Alignment:
Q  145 tcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 212  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19353 tcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagatactgtcctataactttagaatatgtttaggatga 19420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 334
Target Start/End: Original strand, 18536 - 18866
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||    
T  18536 ggctgcgattttcttcaattaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatt 18635  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
    |||||||||||| |||||||   ||      || ||||||||| || | | | || |  ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  18636 agaaaagttttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccaatgatgataggttgttaaattgatgtagaaaccatcctttgaccttagattatgt 18735  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgc 303  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  18736 ttagaatgaattctgaaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccaagcctgtattcatcgctcgc 18835  T
Q  304 catagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    | | |  | | |||| |||||||||||||||    
T  18836 cctggtgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 18866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 5597 - 5935
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  5597 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatattgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaagttaggattg 5695  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||||||  || || |||||||   ||    | |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| | ||| | |||| | ||||||||     
T  5696 aattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaacgataataagttgtt-agattgatgcataaaacatcctttgaccttagat 5794  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||    ||||||||    
T  5795 tatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcttgtattcatcg 5894  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  5895 ctcgccatagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 5935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 1631 - 1841
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||    
T  1631 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaattcttatagttctgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 1730  T
Q  104 --agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
      ||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||  |  | |||||||||    
T  1731 ggagaaaacgaa---aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtaaaaactgtcccttgccattagaatat 1827  T
Q  202 gtttaggatgaatt 215  Q
    ||||||||||||||    
T  1828 gtttaggatgaatt 1841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 9491 - 9701
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||    
T  9491 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaattcttatagttctgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 9590  T
Q  104 --agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
      ||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||  |  | |||||||||    
T  9591 ggagaaaacgaa---aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtaaaaactgtcccttgccattagaatat 9687  T
Q  202 gtttaggatgaatt 215  Q
    ||||||||||||||    
T  9688 gtttaggatgaatt 9701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 1897 - 1965
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||| |||| |||||    
T  1897 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcacgagggatga 1965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 9757 - 9825
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||| |||| |||||    
T  9757 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcacgagggatga 9825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 204181 - 204411
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt 103  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | || |||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||    
T  204181 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattagtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 204280  T
Q  104 aga--aaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 201  Q
     ||  |||       || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  204281 ggaggaaacgaa---aactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgtggtagaaaacgtcccttgaccttagaatat 204377  T
Q  202 gtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  204378 gtttaggatgaattctggaatcgaaattaggctt 204411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 204447 - 204515
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | || | | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  204447 tgcattctgcccgagccaacattcatcgcttgccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 204515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1329 - 1092
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaag--ttaggat 97  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||| |||||||||| |||||  ||||  |||||||    
T  1329 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaatctatgtaattctgatgatctaattagcaagaattaggat 1231  T
Q  98 tgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 197  Q
    ||| || || || |     |||||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  1230 tgaattggagaaatcgaa-aattaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttaga 1132  T
Q  198 atatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttag 237  Q
     |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1131 ttatgattaggatgaattttggtattgaaattaggcttag 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2347 - 2117
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt 103  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||    
T  2347 gctgcaattttcatctaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattcgtatagttctgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 2248  T
Q  104 agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 203  Q
     || ||       || ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  2247 ggagaaaccgaa-aagtaggtcaaatccataaaattgatgatcaaactgtgaaaattgattagattgaggtagaaactgtcccttgaccttagaatatgt 2149  T
Q  204 ttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  2148 ttaggatgaattctggaatcgaaattaggctt 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2081 - 2013
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  2081 tgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4522 - 4319
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4522 aattgatgattaaacggtgaaaattggtttgattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaattgaaattaggctt 4423  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    ||  | |||  |||||||| ||||   ||| ||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||||    
T  4422 agaaccatgggagatgatggattt-tcgtaaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 4324  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  4323 gatga 4319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8953 - 8750
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8953 aattgatgattaaacggtgaaaattggtttgattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaattgaaattaggctt 8854  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgca-ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    ||  | |||  |||||||| ||||   ||| ||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||||    
T  8853 agaaccatgggagatgatggattt-tcgtaaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 8755  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  8754 gatga 8750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 339
Target Start/End: Original strand, 63962 - 64182
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  63962 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 64061  T
Q  219 agattgaaattaggcttagtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatg 317  Q
      || ||||||||||||    | |||| ||||| | || ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||    
T  64062 gaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcgtg-aaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatg 64160  T
Q  318 aacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  64161 atcctcgcctcgcgagggatga 64182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1584
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattgatttagaaaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  1293 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaattagaaagttt 1392  T
Q  113 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 211  Q
     || |||||||   ||    | | |||||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  1393 atgaaattagggttaataggtgacattgatgatccaatgataataagctgtt-agattgatgcataaaacgtcctttgaccttagattatgtttagaatg 1491  T
Q  212 aattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  1492 aattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgaattcatcgctcgcc 1584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Original strand, 3276 - 3408
Alignment:
Q  208 gatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccata 307  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |      
T  3276 gatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgtagaaagtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgctacg 3375  T
Q  308 gcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3376 gcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 3408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2644 - 2425
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| || || |||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  2644 taggtcaaatccttataattgaagattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaagtgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaaatctgg 2545  T
Q  220 gattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaa 319  Q
     |||||||||||||||||  | |||| |||| ||| ||||   ||| ||| ||||||||| |||||||   |||||| ||||||| | || | | ||||     
T  2544 aattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatggatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatggctcgccctcgcgaacgatgat 2445  T
Q  320 cctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2444 cctcgcctcgcgagtgatga 2425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10106
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| || || |||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | |||||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  10325 taggtcaaatccttataattgaagattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaagtgtccattgaccttagattatgtttagaatgaaatctgg 10226  T
Q  220 gattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaa 319  Q
     |||||||||||||||||  | |||| |||| ||| ||||   ||| ||| ||||||||| |||||||   |||||| ||||||| | || | | ||||     
T  10225 aattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatggatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatggctcgccctcgcgaacgatgat 10126  T
Q  320 cctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10125 cctcgcctcgcgagtgatga 10106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 36148 - 36099
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattca 50  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36148 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattca 36099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13167 - 12998
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaa 269  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||  ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13167 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgatttagatgaattatggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgattttcgtgcagaaa 13068  T
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13067 gtgcatcatgtccgagcctagattcatcgctcgccacggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10007 - 9911
Alignment:
Q  243 tgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  10007 tgttagatgatgattttcgtgttgaaagtgcattcagtccgagccgaaattcatccctcgccatagcgagctatgattctcgcctcgcgagtgatga 9911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 16301 - 16410
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  16301 agagagctgcgattttcttcatacaaggtaacagtgagactaatgattcagtagtattaattgatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattg 16400  T
Q  100 atttagaaaa 109  Q
    | ||||||||    
T  16401 aattagaaaa 16410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Original strand, 273466 - 273567
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  273466 aattgaagattaaacggtgaaaattggttagattaatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggctt 273565  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  273566 ag 273567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 308014 - 307929
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac--aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  308014 agagggctgcgattttctgcaaacttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatattggttgttgtaattctgatgattaatt 307929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 307722 - 307674
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  307722 attcatcgctcgccacggcgagcaatgaatctcgcctcgcgagtgatga 307674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 339
Target Start/End: Original strand, 6581 - 6800
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctga 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||     
T  6581 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaaaggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttaaaatatgattaggatgaattctgg 6680  T
Q  220 gattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtag-aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatga 318  Q
     || ||||||||||||    | |||      |||||||||  || || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | | ||||    
T  6681 aatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaattt-ttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatga 6779  T
Q  319 acctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6780 tcctcgcctcgcgagtgatga 6800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Original strand, 6485 - 6544
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||||    
T  6485 aaggtaagagtgagactaatgattcagtaatgttgattagtataattctgatgattaatt 6544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Original strand, 4249 - 4452
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4249 aattgatgatcaaacggtgaaaattggttagattgatgtggaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaattgaaattaggctt 4348  T
Q  236 agtgctatgttagatgatgaa-tttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagt 334  Q
    |   | |||| || || |||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||| | || | | |||| ||| |||||| ||||    
T  4349 aaaaccatgtgagttgttgaattttcgtg-aaaaattgcattctgcccgagcctacatccatcgctcgccctcgcgaacgatgatccttgcctcgtgagt 4447  T
Q  335 gatga 339  Q
    |||||    
T  4448 gatga 4452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3583 - 3467
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  3583 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 3484  T
Q  219 agattgaaattaggctt 235  Q
      || ||||||||||||    
T  3483 gaatcgaaattaggctt 3467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7249 - 7133
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  7249 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 7150  T
Q  219 agattgaaattaggctt 235  Q
      || ||||||||||||    
T  7149 gaatcgaaattaggctt 7133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 79783 - 79859
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgtccatc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  79783 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatgatgttcatc 79859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2209 - 2090
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattc 216  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  2209 aattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatatagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattc 2110  T
Q  217 tgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  2109 tggaattgaaattaggctta 2090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 2314 - 2285
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2314 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 866
Alignment:
Q  2 gagggctgcgattttcttcataca-aggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa-ttgacaagttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||   |||  ||||||||||||| || |||||||||||||     
T  1204 gagggctgcgattttctgcaaatttaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccatgtgattctgatgattaaattaacaagttaggattc 1105  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 199  Q
    | || || || ||    ||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  1104 aattggagaaattgaa-aattaagtcaaaaccatagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaaatgtcctttgaccttagaat 1006  T
Q  200 atgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgc 299  Q
    |||  || ||||||||  |  || |||||||||||||   |||||  |   ||||| |||     | ||| ||||||||| |||||||   |||||||||    
T  1005 atgaataagatgaattaaggaatcgaaattaggcttaaaactatgagattagatgactttttgagaaaaactgcattctgcccgagcctgcattcatcgc 906  T
Q  300 tcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  905 tcgccatagcgagccatgatcctcgcctcgcgagggatga 866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 933 - 757
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgt 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  | |||| |||||||| ||||  |    
T  933 ttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttaggatatgattaggatgaactctgaaattgaaattaggcttggaaccatgtgagatgatggattt-tt 835  T
Q  263 gt-agaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    || | ||| ||||||||| || |||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  834 gtaaaaaactgcattctgcccaagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1072 - 988
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgatttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||   ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1072 aaggtaagggtgagactaatgattcaatattattaatccatgtagttttgatgatcaaattaacaagttaggattgaattagaaa 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Original strand, 17780 - 17869
Alignment:
Q  147 aaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17780 aaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaattgaaattaggctta 17869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 17647 - 17687
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17647 agggctgcgattttctacaaacaaggtaagggtgagactaa 17687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15491 - 15374
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  15491 ttaggtcaaatccttagaattgatgattatacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 15392  T
Q  219 agattgaaattaggctta 236  Q
      ||||||||||||||||    
T  15391 gaattgaaattaggctta 15374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24509 - 24392
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  24509 ttaggtcaaatccttagaattgatgattatacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 24410  T
Q  219 agattgaaattaggctta 236  Q
      |||| |||||||||||    
T  24409 gaattggaattaggctta 24392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39933 - 39816
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  39933 ttaggtcaaatccttagaattcatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 39834  T
Q  219 agattgaaattaggctta 236  Q
      |||| |||||||||||    
T  39833 gaattggaattaggctta 39816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 221090 - 221009
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaa 82  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||    
T  221090 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaa 221009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1991 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1991
Description:

Target: scaffold1991; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 339
Target Start/End: Original strand, 830 - 902
Alignment:
Q  267 aaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  830 aaagtgcattctgtccgagccaaagttcatcgctcgccatagtgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7716 - 7593
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgatt-aattgacaagttaggattg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||   |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  7716 agagggctgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccatgtaattctgatggttaaattaacaagttaggattg 7617  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    | ||||| || || || |||||||    
T  7616 aattagagaatttatgaaattagg 7593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6230 - 6182
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6230 attcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 6182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7425 - 7377
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7425 attcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 7377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 108
Target Start/End: Original strand, 47451 - 47546
Alignment:
Q  14 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || || |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||    
T  47451 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaatacttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaa 47546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6923 - 6806
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  6923 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggttaaaattggttagattgatgtagaaactatcctttgaccttagattatgaataggatgaattatg 6824  T
Q  219 agattgaaattaggctta 236  Q
      ||||||||||||||||    
T  6823 gaattgaaattaggctta 6806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 339
Target Start/End: Original strand, 206967 - 207036
Alignment:
Q  270 gtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  206967 gtgcattctgtccgagcaaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgattctcgcctcgcgagtgatga 207036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44966 - 44628
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgatt-aattgacaagttaggattg 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||   |  | ||||||||||  |||| |||||||||||||     
T  44966 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcgaattaacaagttaggattt 44868  T
Q  100 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaa-aagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 198  Q
    | |||||||  || |  |||||||   ||    | |||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||||| | | ||||||     
T  44867 aattagaaagtttgtaaaattagggttaataagtgaaattgatgatccaatgataataaggtgtt-agattgatgcataaaacgtcctttgaacttagat 44769  T
Q  199 tatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcg 298  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  | || | |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||| |||||||   ||||||||    
T  44768 tatgtttagaatgcattctggaattgaaattaggcttagaaccatttgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcg 44669  T
Q  299 ctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||| | |  | | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  44668 ctcgccctcgtgaacgatgatcctcgccccgcgagtgatga 44628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 1954 - 1907
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagt 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1954 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagt 1907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Original strand, 5493 - 5611
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgatt-aattgacaagttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||   |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  5493 gctgcgattttcatcaattaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccatgtaattctgatgattaaattaacaagttaggattgaatta 5592  T
Q  105 gaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  5593 gaaagtttttggaattagg 5611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5361 - 5243
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  5361 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagattaatgattcagtagtattgattgatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta 5262  T
Q  105 gaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||  ||||| |||||||    
T  5261 gaaagtttttgaaattagg 5243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Original strand, 6368 - 6486
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattgattta 104  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||| || |||    
T  6368 gctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtattattgattgatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggatagaatta 6467  T
Q  105 gaaaagttttggaattagg 123  Q
    ||||  ||||| |||||||    
T  6468 gaaagtttttgaaattagg 6486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 29396 - 29477
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29396 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 29477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 41392 - 41473
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41392 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataaatcagtaatgttaattgattgtaattctgatgatta 41473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16177 - 16104
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16177 ttagattgatgtataaaccgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattgaaattaggctta 16104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 66 - 2
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  66 ttctgcccaagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 19345 - 19535
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattgattt--agaaaagttttggaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||  ||||||       ||     
T  19345 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattggagaaaa---cgaaaaa 19441  T
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaa 213  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||  ||||    ||||||||  ||||||||||||||    
T  19442 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgtccctagaccttagataatgtttaggatgaa 19535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 24188 - 24245
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  24188 aaggtaagggtgagactaataactcaataatgttaaatgattgtaattctgatgatta 24245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 19613 - 19661
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||    
T  19613 attcatcgctcgccatagcgagcaatgagtcttgccttgcgagtgatga 19661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24504
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||    
T  24456 attcatcgctcgccatagcgagcaatgagtcttgccttgcgagtgatga 24504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 13729 - 13909
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  13729 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 13827  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  13828 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 74911 - 74828
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  74911 agagggctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataatt 74828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 74621 - 74573
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  74621 attcatcgctcgccacggcgagctatgaatctcgcctcgcgagtgatga 74573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Original strand, 1984 - 2083
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| || || |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1984 aaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaatgttttgaaattagg 2083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 29
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  88 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgattaatt 29  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 380 - 274
Alignment:
Q  18 ttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaa-gttaggattgatttagaaaagttttgg 116  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  || || |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  380 ttcattcaaggtaaaggttagactaatgattcagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttga 281  T
Q  117 aattagg 123  Q
    |||||||    
T  280 aattagg 274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 339
Target Start/End: Original strand, 169111 - 169280
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaattt-cgtgtagaa 268  Q
    |||||| |||| ||||| | || ||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||   | |||| |||||||| |||| |||| | ||    
T  169111 gatgtaaaaactgtcctttgacattagattatgaataagatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgatggattttcgtgaa-aa 169209  T
Q  269 agtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  169210 actgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 169280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13876 - 13766
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttca-tacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgatt-aattgacaagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||   |||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  13876 agagagctgcgattttcttcactttaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccatgtaattctgatgattaaattaacaagttagaatt 13777  T
Q  99 gatttagaaaa 109  Q
    || ||||||||    
T  13776 gaattagaaaa 13766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 37951 - 38019
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  37951 tgcattctgcccgagtctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 38019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 280 - 163
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    ||||||||||  | || |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  280 ttaggtcaaattcttagaattgatgattaaatggtgaaaattgtttagattgatgtagaaaccgttctctgaccttagataatgattatgatgaattctg 181  T
Q  219 agattgaaattaggctta 236  Q
      || || ||||||||||    
T  180 gaatcgagattaggctta 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12034 - 11839
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaatt--gacaagttaggattgatttagaaaagttttggaattag 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||   | || |||||||||| |  ||  |  |    || |||    
T  12034 aaggtaagggtgagactgataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaaaaattaggattgaatatgagga-atcgaaaactag 11936  T
Q  123 gtcaaaaccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  |||||||| |||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11935 gtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtagaaattaattagatttttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgcttaggatgaattctg 11839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2803 - 2702
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2803 aattaatgattaaacggtgaaaattgattaaattgatgtagaaactgtcctttgaccttagatcatgtttagaatgaattctggaatttaaattaggctt 2704  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  2703 ag 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Original strand, 838 - 938
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctt 235  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||  || |||||||||||  || ||||||||||||    
T  838 aattaatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaatacgatgaattctggaatcgaaattaggctt 937  T
Q  236 a 236  Q
    |    
T  938 a 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26371 - 26203
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattga--tttagaa 107  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||||||  |||||||    
T  26371 tttcttcataaccaggtaagggttagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggattgaattttagaa 26272  T
Q  108 aagttttggaat--taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||      ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  26271 aa-----cgaatactaggtcaaatccctagtattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20197 - 20029
Alignment:
Q  14 tttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgattaattgacaag--ttaggattga--tttagaa 107  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||||||  |||||||    
T  20197 tttcttcataaccaggtaagggttagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggattgaattttagaa 20098  T
Q  108 aagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    ||       || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  20097 aa---cgaaaactaggtcaaatccctagcattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 111
Target Start/End: Original strand, 34725 - 34812
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgac-aagttaggattgatttagaaaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  | || |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  34725 aaggtaagggtgagactaatgattcaggaatgttgattagtataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagt 34812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1675 - 1506
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaa 268  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||   | |||| ||||| | || ||||||| | ||    
T  1675 gatgtagaaactgtcctttgacattagattatgaataggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgttggattttcgtg-aaaa 1577  T
Q  269 agtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | ||||||||| ||||||| | || ||||||||||| | || | | |||| |||||||| |||||||||||    
T  1576 actgcattctgcccgagcctatatacatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgccttgcgagtgatga 1506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 38114 - 38002
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  38114 agagagctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatttatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggatt 38016  T
Q  99 gatttagaaaagttt 113  Q
    || ||| ||||||||    
T  38015 gaatta-aaaagttt 38002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 17835 - 17948
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatac-aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggatt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||    
T  17835 agagagctgcgattt-cttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatctatgtaattctgatgatcaaattaacaagttagaatt 17933  T
Q  99 gatttagaaaagttt 113  Q
    || ||| ||||||||    
T  17934 gaattaaaaaagttt 17948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 5280 - 5329
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5280 attcatcgctcgccacagcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 5012 - 5049
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatt 62  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5012 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaatt 5049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 245 - 285
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  245 agggctgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagactaa 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 379 - 461
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccg-tcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  379 aattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaactgttccta-gaccttagataatgtgtaggatgaattctg 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 16921 - 17101
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttg-tagttctgatgattaattgacaag--ttagga 96  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||  ||||  ||||||    
T  16921 agagagctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgatgataattctgatgattagttagcaagaattagga 17019  T
Q  97 ttgattt--agaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||| ||  ||||||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  17020 ttgaattggagaaaa---cgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattgatgtagaaa 17101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 43
Target Start/End: Original strand, 4325 - 4364
Alignment:
Q  4 gggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4325 gggctgcgattttcatcatacaaggtaagggtgagactaa 4364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 337
Target Start/End: Original strand, 4597 - 4659
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgat 337  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4597 ttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcaaacgatgaacctcgcctcgcgagtgat 4659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 372 - 231
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgat-gaatttcg 261  Q
    |||||||||||   |||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||    | |||| ||||| | || |||||    
T  372 ttagattgatgcttaaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcg 273  T
Q  262 tgtagaaagtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgcc 304  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  272 tg-aaaaactgcattctgcccgagcctaaattcatcgctcgcc 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3626 - 3545
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  3626 agagtgctgcgattt-cttcataaccaggtaagggtgaggctaataactcagtaatgttaattgatcgtaattctgatgatta 3545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3334 - 3286
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  3334 attcatcgctcgccacagcgagctatgagtctcgcctcgcgagtgatga 3286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4242 - 4073
Alignment:
Q  170 gatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgat-gaatttcgtgtagaa 268  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||   | |||| ||||| | || ||||||| || |    
T  4242 gatgtagaaactgtcctttgacattagagtatgaataggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaag-a 4144  T
Q  269 agtgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    | ||||||||| |||| || | |||||||||||||| | || | | |||| ||| |||||||||| |||||    
T  4143 actgcattctgcccgaccctatattcatcgctcgcccttgcgaacgatgatccttgcctcgcgagggatga 4073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Original strand, 13375 - 13493
Alignment:
Q  119 ttaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaa-ttct 217  Q
    |||||||||| || |  |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||   ||||||||| ||||    
T  13375 ttaggtcaaatccttggaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattattaataggatgaatttct 13474  T
Q  218 gagattgaaattaggctta 236  Q
       ||||||||||||||||    
T  13475 agaattgaaattaggctta 13493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 16394 - 16434
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16394 agggctgcgattttcatcttataaggtaagggtgagactaa 16434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13068 - 13019
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13068 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 13019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 37037 - 36996
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagacta 42  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37037 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagacta 36996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 691
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  739 attcatcgctcaccatggcgagcaatgaatctcgcctcgcgagtgatga 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1694 - 1531
Alignment:
Q  176 gaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggcttagtgctatgttagatgatgaatttcgtgtagaaagt-gca 274  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | | |  |   |||||||||  |||||||| | |||    
T  1694 gaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattttggaattgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaattt-ttgtagaaaatagca 1596  T
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  1595 ttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 1531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 27736 - 27660
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||   |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  27736 aaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattga 27660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 20989 - 21085
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattga 100  Q
    ||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  20989 ggctgcgattttcatcaactaagttaagggtgagactaatgattcagtaatattaatccttatgattctgatgatcaaattaacaagttaggattga 21085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 28881 - 28977
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattga 100  Q
    ||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  28881 ggctgcgattttcatcaactaagttaagggtgagactaatgattcagtaatattaatccttatgattctgatgatcaaattaacaagttaggattga 28977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7958 - 7890
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  7958 tgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgatcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 8079 - 8006
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat 79  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||   |||| ||||||||||    
T  8079 gctgcgattttcatctaataaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccatgtaattctgatgat 8006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 17277 - 17238
Alignment:
Q  4 gggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17277 gggctgcgattttcatcatacaaggtaagggtgtgactaa 17238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 342
Target Start/End: Original strand, 15134 - 15201
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgatgt 342  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15134 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgt 15201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 10178 - 10251
Alignment:
Q  163 ttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||  |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10178 ttagattgatgcataaaccgtcctttgaccctagataatgaataggatgaattctggaattgaaattaggctta 10251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 236
Target Start/End: Original strand, 12130 - 12225
Alignment:
Q  141 atgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgagattgaaattaggctta 236  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||  || || ||||||||||    
T  12130 atgattaaacggtgaagattgattaaattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattttggaatcgagattaggctta 12225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 2214 - 2176
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2214 ggctgcgattttaatcatacaaggtaagggtgagactaa 2176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 8191 - 8153
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8191 ggctgcgattttaatcatacaaggtaagggtgagactaa 8153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 37572 - 37491
Alignment:
Q  1 agagggctgcgattttcttcata-caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattg-ttgtagttctgatgatta 81  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  37572 agagagctgcgattt-cttcataactaggtaagggtgagactaataactcaataatggtaattgaatgtaattctgatgatta 37491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Original strand, 266 - 315
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatgat 340  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  266 attcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgagcgatgat 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 177
Target Start/End: Original strand, 92 - 152
Alignment:
Q  117 aattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtaga 177  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||    
T  92 aattaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattgatttaattgatgtaga 152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 175703 - 175666
Alignment:
Q  6 gctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  175703 gctgcgattttcttcaaataaggtaagggtgagactaa 175666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2073 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 1012
Alignment:
Q  24 caaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1048 caaggtaagggtgagactaataattcaatagtgttaa 1012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 732
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | || | | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  796 ttctgtccgagccaaccttcatcgctcgccctcgcgaacgatgaacctcgccttgcgagggatga 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 60 - 1
Alignment:
Q  120 taggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaa 179  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  60 taggtcaaaacattagaattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4342 - 4274
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | || ||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  4342 tgcattctgcccgagcctgaattcatcgctcgccctcgcgagtgatgatcctcgcctcgcgagggatga 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7204 - 7140
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  7204 ttctgcccgagccaacattaatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 7140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 194 - 234
Alignment:
Q  3 agggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaa 43  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  194 agggctgcgattttcatcctataaggtaagggtgagactaa 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9728 - 9680
Alignment:
Q  291 attcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9728 attcatcgctcgccttcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 9680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Original strand, 9753 - 9831
Alignment:
Q  136 aattgatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccg-tcctataaccttagaatatgtttaggatgaat 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  9753 aattgatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaactgttccta-aaccttagataatgtgtaggatgaat 9831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Original strand, 5801 - 5879
Alignment:
Q  140 gatgatcaaacggt-aaaagttgtttagattgatgtagaaaccg-tcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 218  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  5801 gatgattaaacggtgaaaagttgtt-agattgatgtagaaaccgttccta-gaccttagataatgtgtaggatgaattctg 5879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 10727 - 10791
Alignment:
Q  275 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| | || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  10727 ttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 6529 - 6597
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||   || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  6529 tgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgcccccgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 6597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 27315 - 27239
Alignment:
Q  25 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||  |||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  27315 aaggtaagggtgagactaatgattcagttttattaattcatgtaattctgataatcaaattaacaagttaggattga 27239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 8141 - 8237
Alignment:
Q  5 ggctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgat-taattgacaagttaggattga 100  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||  |||||||  | |||||  ||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  8141 ggctgcgattttcatcaactaaggtaagggtgagactaacgattcagttttattaatccttgtaattctgatggtcaaattaacaagttaggattga 8237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 60714 - 60646
Alignment:
Q  271 tgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 339  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| || | |   ||||||||||||||||||||    
T  60714 tgcattctgtccgagctgacattcatcgctcgccttagcgagtagttgtcctcgcctcgcgagtgatga 60646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University