View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1709-Insertion-19 (Length: 611)

Name: NF1709-Insertion-19
Description: NF1709
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1709-Insertion-19
NF1709-Insertion-19
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (319-611)||(38550035-38550327)
chr7 (8-250)||(38550396-38550639)
chr7 (327-611)||(48851062-48851345)
chr7 (323-611)||(47384798-47385086)
chr7 (333-610)||(22155156-22155432)
chr7 (333-610)||(22211071-22211347)
chr7 (327-610)||(45360586-45360868)
chr7 (336-611)||(6604699-6604972)
chr7 (323-583)||(34775581-34775841)
chr7 (8-250)||(45360092-45360335)
chr7 (9-250)||(37792160-37792402)
chr7 (327-607)||(35691945-35692224)
chr7 (8-250)||(6604280-6604523)
chr7 (327-587)||(77307-77567)
chr7 (8-250)||(37114654-37114897)
chr7 (8-250)||(39858368-39858611)
chr7 (8-244)||(47385347-47385579)
chr7 (11-250)||(48851450-48851689)
chr7 (8-250)||(22154655-22154898)
chr7 (8-250)||(22210570-22210813)
chr7 (8-250)||(23905378-23905621)
chr7 (8-250)||(38473250-38473492)
chr7 (8-250)||(35692476-35692719)
chr7 (8-250)||(13168838-13169081)
chr7 (8-250)||(27665172-27665415)
chr7 (401-587)||(20479044-20479230)
chr7 (8-250)||(34776087-34776330)
chr7 (8-250)||(46438636-46438879)
chr7 (8-216)||(29995676-29995885)
chr7 (8-250)||(24227547-24227790)
chr7 (468-610)||(38472767-38472908)
chr7 (468-610)||(46438151-46438292)
chr7 (470-611)||(37114444-37114584)
chr7 (327-533)||(48311199-48311399)
chr7 (471-571)||(24227101-24227201)
chr7 (18-173)||(35402563-35402719)
chr7 (323-419)||(38472907-38473003)
chr7 (41-201)||(48310751-48310914)
chr7 (417-533)||(34692157-34692273)
chr7 (417-533)||(11683970-11684086)
chr7 (327-419)||(46438291-46438383)
chr7 (327-421)||(24227201-24227295)
chr7 (442-533)||(38614265-38614356)
chr7 (88-174)||(69036-69123)
chr7 (18-86)||(66845-66913)
chr7 (531-611)||(13169160-13169239)
chr7 (438-526)||(23954728-23954816)
chr7 (531-611)||(39858194-39858273)
chr7 (408-521)||(32840800-32840911)
chr7 (429-530)||(46995235-46995336)
chr7 (429-533)||(2168268-2168372)
chr7 (327-466)||(7403164-7403303)
chr7 (61-139)||(13035620-13035698)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (323-610)||(6902205-6902491)
chr6 (8-250)||(7050514-7050757)
chr6 (327-599)||(11356445-11356716)
chr6 (323-611)||(9399363-9399651)
chr6 (8-250)||(10569157-10569398)
chr6 (325-556)||(7050816-7051047)
chr6 (325-556)||(10569457-10569687)
chr6 (8-250)||(20524142-20524385)
chr6 (327-587)||(32437696-32437956)
chr6 (373-611)||(33267534-33267776)
chr6 (11-250)||(18644031-18644271)
chr6 (8-250)||(32438206-32438449)
chr6 (10-250)||(11355966-11356198)
chr6 (8-250)||(7372109-7372351)
chr6 (102-250)||(6901999-6902148)
chr6 (54-250)||(32517672-32517869)
chr6 (401-587)||(32454826-32455012)
chr6 (468-611)||(20524768-20524910)
chr6 (468-611)||(7371625-7371767)
chr6 (8-109)||(6900241-6900342)
chr6 (93-250)||(33268004-33268155)
chr6 (327-419)||(20524677-20524769)
chr6 (323-419)||(7371766-7371862)
chr6 (327-426)||(18644531-18644630)
chr6 (513-587)||(18644657-18644731)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (323-610)||(51685666-51685952)
chr3 (327-611)||(27897706-27897989)
chr3 (8-250)||(42280262-42280506)
chr3 (327-611)||(42281792-42282075)
chr3 (8-250)||(48829950-48830193)
chr3 (8-250)||(51685366-51685609)
chr3 (8-250)||(610369-610612)
chr3 (327-587)||(53188314-53188574)
chr3 (8-250)||(46113242-46113485)
chr3 (327-586)||(35904364-35904623)
chr3 (8-250)||(27898240-27898483)
chr3 (8-250)||(23292295-23292538)
chr3 (8-250)||(43765896-43766139)
chr3 (8-250)||(30599334-30599576)
chr3 (8-233)||(2377771-2377997)
chr3 (382-611)||(24845922-24846149)
chr3 (362-607)||(41978678-41978922)
chr3 (8-250)||(17516085-17516327)
chr3 (8-250)||(44794974-44795217)
chr3 (21-250)||(35904851-35905081)
chr3 (11-250)||(2225298-2225538)
chr3 (420-611)||(2378326-2378516)
chr3 (8-250)||(2660989-2661232)
chr3 (8-250)||(21349469-21349712)
chr3 (8-174)||(41978503-41978670)
chr3 (8-250)||(46198495-46198737)
chr3 (394-587)||(7883863-7884056)
chr3 (325-556)||(48829679-48829891)
chr3 (8-250)||(44275344-44275585)
chr3 (8-174)||(7884095-7884262)
chr3 (52-250)||(54899252-54899451)
chr3 (41-250)||(24845669-24845882)
chr3 (470-611)||(23292085-23292225)
chr3 (468-596)||(44274874-44275001)
chr3 (468-611)||(21350055-21350197)
chr3 (468-611)||(30598851-30598992)
chr3 (468-611)||(43766482-43766624)
chr3 (18-174)||(46609740-46609897)
chr3 (20-174)||(38192475-38192630)
chr3 (18-174)||(46309776-46309933)
chr3 (18-174)||(53093215-53093372)
chr3 (327-419)||(21349964-21350056)
chr3 (417-561)||(2975967-2976111)
chr3 (327-419)||(46198989-46199081)
chr3 (327-419)||(30598991-30599082)
chr3 (327-419)||(44275000-44275092)
chr3 (468-560)||(46199080-46199172)
chr3 (8-115)||(53190121-53190231)
chr3 (417-563)||(22218713-22218859)
chr3 (327-419)||(43766391-43766483)
chr3 (417-611)||(35862035-35862228)
chr3 (323-391)||(2378254-2378323)
chr3 (417-533)||(1847067-1847183)
chr3 (327-435)||(13466455-13466563)
chr3 (401-512)||(32843021-32843132)
chr3 (117-250)||(53188826-53188960)
chr3 (417-533)||(33112412-33112528)
chr3 (456-561)||(23775095-23775200)
chr3 (441-530)||(48634800-48634889)
chr3 (477-583)||(45897561-45897667)
chr3 (523-610)||(13466621-13466707)
chr3 (61-138)||(35862699-35862776)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (323-611)||(52642418-52642705)
chr1 (327-600)||(50554705-50554977)
chr1 (336-611)||(6817393-6817666)
chr1 (10-250)||(15105203-15105444)
chr1 (327-587)||(33599757-33600017)
chr1 (8-250)||(52642762-52643003)
chr1 (8-250)||(51895291-51895534)
chr1 (8-250)||(3012579-3012822)
chr1 (8-250)||(6817842-6818085)
chr1 (8-250)||(31237632-31237875)
chr1 (327-560)||(26224186-26224419)
chr1 (8-250)||(26224679-26224922)
chr1 (327-587)||(27088536-27088796)
chr1 (8-250)||(50555228-50555472)
chr1 (387-610)||(31237334-31237556)
chr1 (8-250)||(2870354-2870597)
chr1 (362-560)||(34777133-34777331)
chr1 (8-250)||(46582714-46582957)
chr1 (401-587)||(1443523-1443709)
chr1 (401-587)||(9120617-9120803)
chr1 (54-250)||(25277501-25277698)
chr1 (8-174)||(34777339-34777506)
chr1 (18-250)||(33600278-33600511)
chr1 (8-250)||(27088042-27088284)
chr1 (8-174)||(4855168-4855335)
chr1 (54-250)||(37345137-37345334)
chr1 (54-250)||(45045629-45045826)
chr1 (401-560)||(47012044-47012203)
chr1 (362-607)||(4854916-4855160)
chr1 (468-611)||(37087570-37087712)
chr1 (481-611)||(15105797-15105926)
chr1 (470-611)||(51895081-51895221)
chr1 (470-610)||(3012370-3012509)
chr1 (327-422)||(15105696-15105791)
chr1 (18-174)||(8168533-8168690)
chr1 (323-419)||(37087474-37087571)
chr1 (401-611)||(42558440-42558649)
chr1 (417-530)||(46637339-46637452)
chr1 (417-533)||(18183176-18183292)
chr1 (429-530)||(31803115-31803216)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (323-611)||(26239224-26239511)
chr8 (8-250)||(26239568-26239811)
chr8 (323-610)||(41824455-41824740)
chr8 (8-250)||(7744257-7744500)
chr8 (8-250)||(41824797-41825040)
chr8 (21-250)||(9672301-9672531)
chr8 (327-587)||(15307542-15307802)
chr8 (327-587)||(15487911-15488171)
chr8 (323-525)||(7743998-7744200)
chr8 (327-587)||(27404758-27405018)
chr8 (8-250)||(42942549-42942792)
chr8 (8-250)||(27691921-27692164)
chr8 (8-250)||(40338806-40339049)
chr8 (362-587)||(13283321-13283546)
chr8 (327-587)||(29238444-29238704)
chr8 (8-250)||(22273014-22273257)
chr8 (327-611)||(11719941-11720224)
chr8 (8-250)||(41041711-41041953)
chr8 (362-587)||(13107342-13107567)
chr8 (8-174)||(8609009-8609176)
chr8 (8-174)||(38547982-38548149)
chr8 (52-250)||(5037235-5037434)
chr8 (8-250)||(33707936-33708179)
chr8 (362-560)||(38548157-38548355)
chr8 (362-587)||(8608776-8609001)
chr8 (8-174)||(13107575-13107742)
chr8 (53-250)||(3152665-3152863)
chr8 (468-611)||(41041226-41041368)
chr8 (8-174)||(13283151-13283313)
chr8 (473-611)||(22273338-22273475)
chr8 (18-250)||(29237959-29238192)
chr8 (470-610)||(42942862-42943000)
chr8 (468-571)||(40338353-40338456)
chr8 (18-174)||(35510181-35510338)
chr8 (18-174)||(33761661-33761818)
chr8 (323-419)||(41041367-41041464)
chr8 (18-174)||(600827-600984)
chr8 (327-407)||(9672095-9672175)
chr8 (18-250)||(15307058-15307290)
chr8 (18-250)||(15487427-15487659)
chr8 (18-250)||(27405269-27405501)
chr8 (327-419)||(40338455-40338547)
chr8 (8-139)||(13485351-13485477)
chr8 (417-533)||(33369333-33369449)
chr8 (57-250)||(11720502-11720697)
chr8 (438-533)||(25705666-25705761)
chr8 (518-611)||(29693813-29693903)
chr8 (533-611)||(13485028-13485105)
chr8 (429-530)||(31822900-31823001)
chr8 (429-533)||(25370893-25370997)
chr8 (429-530)||(33748909-33749010)
chr8 (485-533)||(25371590-25371638)
chr8 (495-587)||(11790308-11790400)
chr8 (61-139)||(9186178-9186256)
chr8 (477-530)||(42895333-42895386)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (327-611)||(39663656-39663939)
chr2 (328-556)||(19581735-19581963)
chr2 (327-560)||(6783929-6784162)
chr2 (8-250)||(14388228-14388471)
chr2 (8-250)||(6798280-6798523)
chr2 (8-250)||(19907405-19907648)
chr2 (8-250)||(2767688-2767931)
chr2 (8-250)||(40560999-40561242)
chr2 (327-560)||(24206174-24206405)
chr2 (8-250)||(16763720-16763963)
chr2 (8-250)||(17696981-17697224)
chr2 (8-163)||(39663994-39664150)
chr2 (8-250)||(39455934-39456176)
chr2 (401-587)||(37021511-37021697)
chr2 (468-610)||(17697567-17697708)
chr2 (327-480)||(44708543-44708696)
chr2 (468-611)||(2768274-2768416)
chr2 (468-611)||(34400824-34400966)
chr2 (468-610)||(42518072-42518213)
chr2 (468-611)||(6798866-6799008)
chr2 (8-138)||(44708996-44709126)
chr2 (470-587)||(40561312-40561429)
chr2 (327-419)||(2768183-2768275)
chr2 (323-419)||(6798770-6798867)
chr2 (18-250)||(24206665-24206900)
chr2 (8-89)||(42518521-42518602)
chr2 (327-419)||(42518212-42518302)
chr2 (18-250)||(6784414-6784648)
chr2 (327-419)||(34400965-34401057)
chr2 (395-485)||(31471007-31471097)
chr2 (327-419)||(17697476-17697568)
chr2 (429-530)||(10715665-10715766)
chr2 (531-611)||(19907231-19907310)
chr2 (187-250)||(44708948-44709010)
chr2 (38-114)||(37646219-37646296)
chr2 (187-250)||(34401309-34401372)
chr2 (327-372)||(14387923-14387968)
chr2 (477-530)||(37418230-37418283)
chr2 (61-139)||(161215-161293)
chr2 (489-530)||(35855-35896)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (323-611)||(54387196-54387477)
chr4 (8-250)||(48645873-48646114)
chr4 (8-250)||(54386896-54387139)
chr4 (8-250)||(2692412-2692655)
chr4 (327-611)||(35402262-35402542)
chr4 (325-554)||(48645578-48645814)
chr4 (8-250)||(35402794-35403037)
chr4 (8-250)||(49523887-49524130)
chr4 (327-587)||(51013177-51013437)
chr4 (327-587)||(833771-834034)
chr4 (327-611)||(2691878-2692160)
chr4 (8-250)||(41760853-41761096)
chr4 (8-250)||(42981375-42981618)
chr4 (8-250)||(11255056-11255299)
chr4 (327-587)||(5438925-5439188)
chr4 (8-250)||(43520193-43520436)
chr4 (41-250)||(11640838-11641053)
chr4 (327-587)||(11641339-11641602)
chr4 (8-250)||(51012682-51012925)
chr4 (468-610)||(11254573-11254714)
chr4 (8-138)||(11602432-11602562)
chr4 (8-174)||(41782277-41782444)
chr4 (468-611)||(42981936-42982078)
chr4 (18-174)||(319864-320021)
chr4 (18-174)||(4172704-4172861)
chr4 (18-174)||(33265350-33265507)
chr4 (468-583)||(41760268-41760383)
chr4 (18-174)||(43507993-43508150)
chr4 (327-419)||(41760382-41760474)
chr4 (327-419)||(11254713-11254805)
chr4 (327-562)||(28101121-28101356)
chr4 (42-129)||(52867416-52867503)
chr4 (327-419)||(42981845-42981937)
chr4 (401-516)||(10544380-10544495)
chr4 (22-250)||(834181-834409)
chr4 (405-533)||(27385841-27385969)
chr4 (429-521)||(4519884-4519976)
chr4 (22-250)||(5438554-5438778)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (327-599)||(806-1077)
scaffold0345 (11-250)||(320-551)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (327-611)||(107178-107461)
scaffold0004 (8-250)||(107712-107954)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (327-585)||(2181021-2181279)
chr5 (327-560)||(21842252-21842485)
chr5 (8-250)||(2180530-2180772)
chr5 (323-560)||(42472124-42472362)
chr5 (8-250)||(8540426-8540669)
chr5 (8-250)||(30464763-30465006)
chr5 (12-250)||(32134960-32135199)
chr5 (327-585)||(17575186-17575443)
chr5 (323-557)||(17575902-17576135)
chr5 (327-585)||(17577217-17577474)
chr5 (8-250)||(12800683-12800926)
chr5 (8-250)||(12737860-12738103)
chr5 (387-611)||(30464456-30464679)
chr5 (8-250)||(21841756-21841999)
chr5 (8-174)||(7268600-7268767)
chr5 (8-242)||(2853402-2853637)
chr5 (401-587)||(29620716-29620902)
chr5 (401-587)||(40781553-40781739)
chr5 (8-174)||(28821135-28821302)
chr5 (362-587)||(7268782-7269006)
chr5 (78-250)||(41494568-41494741)
chr5 (8-139)||(24540429-24540560)
chr5 (468-611)||(34328264-34328406)
chr5 (464-611)||(41494348-41494494)
chr5 (327-422)||(18624094-18624189)
chr5 (470-611)||(8540739-8540877)
chr5 (482-611)||(18623959-18624087)
chr5 (475-610)||(32134751-32134885)
chr5 (323-419)||(34328168-34328265)
chr5 (327-419)||(28821644-28821736)
chr5 (18-250)||(42472609-42472841)
chr5 (429-530)||(18727138-18727239)
chr5 (455-533)||(40329955-40330033)
chr5 (506-611)||(27076959-27077063)
chr5 (531-610)||(12738198-12738276)
chr5 (531-610)||(12801021-12801099)
chr5 (429-530)||(32089343-32089437)
chr5 (455-530)||(32836450-32836525)
chr5 (429-530)||(33257187-33257288)
chr5 (417-533)||(35291615-35291729)
chr5 (440-516)||(35400145-35400221)
chr5 (405-521)||(18341494-18341610)
chr5 (493-533)||(43317300-43317340)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (8-250)||(9024-9267)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (8-216)||(4059-4268)
scaffold0058 (8-216)||(5231-5440)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (139-233)||(1658-1752)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 319 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 38550327 - 38550035
Alignment:
Q  319 aataacacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38550327 aataacacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcacacatcacataaccattgt 38550228  T
Q  419 taaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattga 518  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550227 taaacaaacatttggcagtgggcaaacatagaaaggccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattga 38550128  T
Q  519 agctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38550127 agctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagataaagaccgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccacccatcatttc 38550035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38550639 - 38550396
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38550639 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttattttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 38550540  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  38550539 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggactaatttgattgaat 38550440  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550439 tttttttacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 38550396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 327 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 48851345 - 48851062
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48851345 aaaaatttacaattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaccaaa 48851246  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48851245 catttggcagagggcaagcatagaaaggccttcctaggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctatgacaccaacattgaagctctct 48851146  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  48851145 cacatcatcattgtgcatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagctgtttttg-cccatacgtccaccacccatcatttc 48851062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 323 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 47385086 - 47384798
Alignment:
Q  323 acacaaaa-atttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaa 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47385086 acacaaaagatttacaattttcaccattatcctgtacaatcaaaagacaaaatcagtaccatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaa 47384987  T
Q  422 acaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagc 521  Q
    |||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47384986 acaaaactttggaagagggcaaacatagaaaggccttcctgggttattgacaatgttggtttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaatc 47384887  T
Q  522 tctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  47384886 tctctcacatcatcattgaacagagagcttgaagatgaagactgtctgttgtagctgttttt-tcccatacgtccaccacccatcatttc 47384798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 333 - 610
Target Start/End: Original strand, 22155156 - 22155432
Alignment:
Q  333 ttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22155156 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaggacaaattcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaacaaaactttg 22155255  T
Q  433 gcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatc 532  Q
    |||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  22155256 gcagaggacagacatagaaaggccttcctaggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagttatctcacctc 22155355  T
Q  533 atcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  22155356 atcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccagacgtccaccacccatcattt 22155432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 333 - 610
Target Start/End: Original strand, 22211071 - 22211347
Alignment:
Q  333 ttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22211071 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaggacaaattcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaacaaaactttg 22211170  T
Q  433 gcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatc 532  Q
    |||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  22211171 gcagaggacagacatagaaaggccttcctaggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagttatctcacctc 22211270  T
Q  533 atcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  22211271 atcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccagacgtccaccacccatcattt 22211347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 327 - 610
Target Start/End: Original strand, 45360586 - 45360868
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45360586 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacagaccattcgcacatcacataaccattgttaaacaaa 45360685  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45360686 cctttggaagagggcagacatagaaaggccttcttgggttattgacagtgttgacttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 45360785  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  45360786 cacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaggacctactattgtagttgtttttg-cccatacgtccaccactcatcattt 45360868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 336 - 611
Target Start/End: Original strand, 6604699 - 6604972
Alignment:
Q  336 caattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggca 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6604699 caattttcaccatcatcctatacaatcaaaagataaaataagtactatttaaacaaactattcacacatcacataaccattgttaaacaaacctttggca 6604798  T
Q  436 gtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatc 535  Q
    | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6604799 gagggcaggcatagaaaggccttcctgggttattgacatagttgacttttcttacaacataaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctca-c 6604897  T
Q  536 atcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6604898 attgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccatacacccaccacccatcatttc 6604972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 323 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 34775841 - 34775581
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34775841 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaaccaaaagacaaaatcaatactatttaaacaaaccattcgcacatcatataaccattgttaaa 34775742  T
Q  423 caaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 522  Q
    ||||  ||||| || ||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34775741 caaacctttggtagagggtatgcatagaaaggccttcctggattattgacactgttgacttttcttacaacacaaattctaggccaccaacattgaagct 34775642  T
Q  523 ctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgttttt 583  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  34775641 ctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagacctactgttgtagttgttttt 34775581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 45360092 - 45360335
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45360092 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttatcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 45360191  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  45360192 tatgttgtgaaaattcaaagacctatttgatggtattttcactaattttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 45360291  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  45360292 ttttttgacataagggtttgattcattcattgacaacctctttt 45360335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37792402 - 37792160
Alignment:
Q  9 tatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatat 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37792402 tatgatggtaagcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtctttgacttttactttttactttgtacaacaaatgtatgcaccaatgatcacagtgatat 37792303  T
Q  109 atgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaat 207  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  37792302 atggtgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcaatatgatggatagacatgcaatagaaggaccaatttgatggaaat 37792203  T
Q  208 tttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37792202 attttgacagaagggttgaattcattcattgacaacctctttt 37792160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 327 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 35692224 - 35691945
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692224 aaaaatttacaattttcacaatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcaatataatttaaagaaaacattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 35692125  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  35692124 ccttatgcagagggcaggaatagaaaggccttcctaggttattgacagtgtttgcttttcttacaacgcaaattcttggacaccaacattgaagctttct 35692025  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatca 607  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  35692024 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccggctgttgtagttgtttttg-cccatatgcccaccacccatca 35691945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 6604280 - 6604523
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6604280 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagtaaatgtatgcaccaatgatcacagtgata 6604379  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  6604380 tatgttgtgaaaagtcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 6604479  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6604480 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 6604523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Original strand, 77307 - 77567
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  77307 aaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacattaaataaccattgttaaacaaa 77406  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||  | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77407 ccttatgcatagtgcaagcatagaaaagccttcctgggttattgacagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 77506  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  77507 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 77567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37114897 - 37114654
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  37114897 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatttcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggattacaatgata 37114798  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  37114797 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 37114698  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  37114697 ttttttgacaaaaagatttgattcattcattgacaacctctttt 37114654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39858611 - 39858368
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39858611 ttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaatgatcacagtgata 39858512  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  39858511 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggtattttcactcatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 39858412  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  39858411 ttttttgacagaatggtttgattcattcattgacaacctctttt 39858368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47385579 - 47385347
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||| ||||     
T  47385579 ttatgatggtatgtaaatgtctgtctttttacaatcaatgtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcat----gatcaca-tgatg 47385485  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||     
T  47385484 tatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtaatttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatataatagaaggaccaatttgattgaat 47385385  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacc 244  Q
    |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  47385384 ttttttgacagaaaggttgaattcattcattgacaacc 47385347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48851689 - 48851450
Alignment:
Q  11 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatat 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  48851689 tgatggtatgcaaatgtatgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttggtcagcaaatgtatgccccaaggatcacaatgatatat 48851590  T
Q  111 gttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattt 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| ||||  |    
T  48851589 gttgtgaaaattcaaggacttatttgatgagattttcactaattt-tggatcaatatgatgggtagacatacaatagagggaccaatttgatggaaagat 48851491  T
Q  210 tttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  48851490 tttgacagaatggttgaattcattcattgacaacctctttt 48851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 22154655 - 22154898
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  22154655 ttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagagtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatatatgcaccatggatcacagtgata 22154754  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  22154755 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 22154854  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22154855 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 22154898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 22210570 - 22210813
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  22210570 ttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagagtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatatatgcaccatggatcacagtgata 22210669  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  22210670 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 22210769  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22210770 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 22210813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23905621 - 23905378
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23905621 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttttcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacaatgata 23905522  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || | |||  || ||| ||||||||| |||    
T  23905521 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgattgatatgcatataattcaatgaccaatttgatttaaa 23905422  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  23905421 ttttttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctctttt 23905378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38473492 - 38473250
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38473492 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgt-ttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 38473394  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  38473393 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgagtatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 38473294  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  38473293 ttttttgacaaaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 38473250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35692719 - 35692476
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35692719 ttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttgctttttacttcgttcggcaaatatatgcaccaaggatcacagtgata 35692620  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  35692619 tctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 35692520  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  35692519 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 35692476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 13168838 - 13169081
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13168838 ttataatgatatgcaaatgtctgtatttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttattttgttcagcgaatgtatgcaccaaggatcacattgata 13168937  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  13168938 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatgttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 13169037  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13169038 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 13169081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27665415 - 27665172
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27665415 ttatgatggtatgaaaatgtctgcctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 27665316  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| ||||||||| |||    
T  27665315 tctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattaaaa 27665216  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | |||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  27665215 tattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctctttt 27665172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 587
Target Start/End: Original strand, 20479044 - 20479230
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20479044 acatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaatt 20479143  T
Q  501 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  20479144 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 20479230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34776330 - 34776087
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34776330 ttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatctgagtgtctgtcttttagtttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 34776231  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| ||||||||| |||    
T  34776230 tctgttgtgaaaattcaaagatctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattaaaa 34776131  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
       ||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  34776130 aaatttgacagaagagtttgattcattcattgacaacctctttt 34776087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46438879 - 46438636
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  46438879 ttatgatggtatgcaaatgtccgtctttctataatcaaagtgtttgtcttctactttttactctattcagcaaatgtatccaccaaggatcaaagtgata 46438780  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  46438779 tctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcacttatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 46438680  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  46438679 ttttttgacatataggtttgattcattcgttgacaacctctttt 46438636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29995885 - 29995676
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29995885 ttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 29995786  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||  |||||||||||||    
T  29995785 tttgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataatttaaggatcaatttgattgaaa 29995686  T
Q  207 ttttttgaca 216  Q
    | ||||||||    
T  29995685 tattttgaca 29995676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24227790 - 24227547
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  24227790 ttatgatggtatacaaatgtctgtctttttgtaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgtaccaatgatcacagtgata 24227691  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    | | |||  ||||||  ||||||||||||    
T  24227690 tctgttgtgaaaattaaatgtcctatttgatggtattttcactaatttgaggattgatatgatggatgtgtatataatttaaggacatatttgattgaaa 24227591  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24227590 ttttttgacaacaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 24227547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 468 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 38472908 - 38472767
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  38472908 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaagacaccaacattgaagctctctcatctcataattgtacatagagcttgaagatgaagaccgac 38472809  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  38472808 tgttgtagttgtttttg-tccatacgcccaccacccatcattt 38472767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 468 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 46438292 - 46438151
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  46438292 ttgacagtgttggctttttttacaacacaaattataggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagagcgac 46438193  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    |||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46438192 tgttgtagttctttttg-cccatacgcccaccacccatcattt 46438151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 37114584 - 37114444
Alignment:
Q  470 gacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactg 569  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||     
T  37114584 gacaatgttggtttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacatagagtttgaagatgaagactcacta 37114485  T
Q  570 ttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    || ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37114484 ttgtagttgtttttg-cccatatgcccaccatccatcatttc 37114444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 327 - 533
Target Start/End: Original strand, 48311199 - 48311399
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||||   ||||||||||| |||| ||||| |||||||||       ||||||||||| ||||||    
T  48311199 aaaaattgacaattttcaccatcatcttatacaaagaaaatttaaaatcagtacaatttaaacaaaccattcaca-------taaccattgttgaacaaa 48311291  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagac-cttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctc 525  Q
      |||| ||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||    
T  48311292 actttgacagagggcaagcatagaaaaagtcttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaaatctattacaccaacattcaagcactc 48311391  T
Q  526 tcacatca 533  Q
    ||||||||    
T  48311392 tcacatca 48311399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 471 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 24227201 - 24227101
Alignment:
Q  471 acagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgt 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24227201 acagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacactaacattgaagctctctcatctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgt 24227102  T
Q  571 t 571  Q
    |    
T  24227101 t 24227101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 35402719 - 35402563
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| |||||| |||| | |    
T  35402719 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttatcttttacattttactttgttcagcaaatatatgctcaaaggatcacattgatatctgttatga 35402620  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggat 173  Q
     |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35402619 taattcaaggaccaatttgatgatattttcactaatttgaggatcgaaatgatggat 35402563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 323 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 38473003 - 38472907
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38473003 acacaaaaaattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtattgtttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 38472907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 201
Target Start/End: Original strand, 48310751 - 48310914
Alignment:
Q  41 atcaaagtgtatgtctttt-attttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg 139  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  | ||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  48310751 atcaaagtgtctgtctttttattttctactttgttcagcaaatatatgtagcaaagatcatattgatatatgttgtgataattcaatgacttatttgatg 48310850  T
Q  140 -ta-ttttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgat 201  Q
     || ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  48310851 atatttttcactaatttaggaatcgatttgatgcatagacaaacaatagaatgaccaatttgat 48310914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Original strand, 34692157 - 34692273
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  34692157 gttaaacaaacctttggcagagggcaagcatagaaagacctttctgggtttttgagagtgttggcttttcttacagcacaaattctaccacaccaacatt 34692256  T
Q  517 gaagctctctcacatca 533  Q
     ||||  ||||||||||    
T  34692257 caagcattctcacatca 34692273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Original strand, 11683970 - 11684086
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11683970 gttaaacaaacctttggcagagggcaagcatagaaagaccttcttggatttttaagagtattggtttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 11684069  T
Q  517 gaagctctctcacatca 533  Q
     |||  |||||||||||    
T  11684070 caagtactctcacatca 11684086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 46438383 - 46438291
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46438383 aaaaaattacaattttcaccatcatccaatgcaatcaaaagacaaattcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 46438291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 327 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24227295 - 24227201
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaa 421  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24227295 aaaaattcacaatttccaccgtcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtaatatttaaacaaatcattcacacatcacataatcattgttaa 24227201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 533
Target Start/End: Original strand, 38614265 - 38614356
Alignment:
Q  442 aaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatca 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38614265 aaacatagaatgaccttcctgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattctaggacaccaacatttaagcactctcacatca 38614356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 174
Target Start/End: Original strand, 69036 - 69123
Alignment:
Q  88 caccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  69036 caccaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 69123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 66845 - 66913
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtat 86  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  66845 atgcaaatgcctttctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtat 66913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 531 - 611
Target Start/End: Original strand, 13169160 - 13169239
Alignment:
Q  531 tcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  13169160 tcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccactcatcatttc 13169239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 526
Target Start/End: Original strand, 23954728 - 23954816
Alignment:
Q  438 gggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23954728 gggcaagcatagaatggccttcctgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattctaggacaccaacattcaagcactct 23954816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 39858273 - 39858194
Alignment:
Q  531 tcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  39858273 tcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgaagttgtttttg-cccatacgcccaccactcatcatttc 39858194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 408 - 521
Target Start/End: Original strand, 32840800 - 32840911
Alignment:
Q  408 ataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggac 507  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||||||||| || || ||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  32840800 ataaccatttttaaacaaacctttggcaaagtgcaaacatagaaaggccatcttggtttttt-agagtattggcttttcttacaacacaaattat-ggac 32840897  T
Q  508 accaacattgaagc 521  Q
    ||||||||| ||||    
T  32840898 accaacattcaagc 32840911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 46995336 - 46995235
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| | ||||| |||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  46995336 tttggcagatggcaagcatagaatggccttcatgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattgtaggacaccaacattcaagcactctca 46995237  T
Q  529 ca 530  Q
    ||    
T  46995236 ca 46995235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 533
Target Start/End: Original strand, 2168268 - 2168372
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||| ||   ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |    
T  2168268 tttggcagagggcaagcatagaatggccttcctaggttttttgaagtattggattttctatcaacacaaattctaggacaccaacatttgagcactctga 2168367  T
Q  529 catca 533  Q
    |||||    
T  2168368 catca 2168372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 466
Target Start/End: Original strand, 7403164 - 7403303
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | || || |||||  || ||||||||  | || ||||| ||||||  |||||||| ||  || ||||||||||    
T  7403164 aaaaattcacaattttcaacatcatcttgtacaaacaaaattcagaatcagtagaagttaaacaaaccattcggacatcacacaattatggttaaacaaa 7403263  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggtt 466  Q
      |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  7403264 cctttggcagagggcaaccatagaaaggtcttcctgggtt 7403303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Original strand, 13035620 - 13035698
Alignment:
Q  61 ttttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg 139  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  13035620 ttttttactttgttttgcacatatatgcaccaaggatcacattgacatctgtttaaataattcaaggacttatttgatg 13035698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 323 - 610
Target Start/End: Original strand, 6902205 - 6902491
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6902205 acacaaaaatttacaaatttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagttctattttaacaaaccattcacacatcacataaccaatgttaaa 6902304  T
Q  423 caaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 522  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902305 caaacatttggcagagggcagacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttactacacaaattctaggacaccaacattgaagct 6902404  T
Q  523 ctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6902405 ctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccacccatcattt 6902491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 7050514 - 7050757
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7050514 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 7050613  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  7050614 tatgttgtgaaaattcaatgacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaat 7050713  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7050714 ttttttgacaaaagggttaaattcatccattgacaacctctttt 7050757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 327 - 599
Target Start/End: Original strand, 11356445 - 11356716
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11356445 aaaaatttacaattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataacctttgttaaacaaa 11356544  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11356545 cctttggcagagggcagacatagaaaggctttcttgggttattgatagtgttggcttttcttacaacacaaattctatgacaccaacattgaagctctct 11356644  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccacc 599  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11356645 cacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaacaccgactgttgtagttgtttttg-cccatacgcccacc 11356716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 323 - 611
Target Start/End: Original strand, 9399363 - 9399651
Alignment:
Q  323 acacaaaa-atttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaa 421  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9399363 acacaaaagatttataattttcaccatcgtcctatacaatcaaaagacaaaattagtactatttaaacaaaccattcacacattacataaccattgttaa 9399462  T
Q  422 acaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagc 521  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9399463 acaaatctttggcaaagggcaagcatagaaaggccttcctggattattggcagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagc 9399562  T
Q  522 tctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  9399563 tctctcacatcatcattgaacagagagcttgaagatgaagaccgactactgtagttgttttt-tcccatacgtccaccacccatcatttc 9399651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 10569157 - 10569398
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10569157 ttatgatgatatgcaaatgtctatctttttacaatcaaagtgtctgttttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgata 10569256  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10569257 tatgttg--aaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggatcaatttgattgaaa 10569354  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10569355 ttttttgatagaagggttaaattcattcattgacaacctctttt 10569398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 325 - 556
Target Start/End: Original strand, 7050816 - 7051047
Alignment:
Q  325 acaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7050816 acaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcaatactattttaacaaaccattcacacatcgcataaccattgttaaaca 7050915  T
Q  425 aatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctct 524  Q
    ||  | |||||  | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7050916 aacctatggcaaagagcagacatagaaaggccttcctgggctattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattataggacaccaacattgaagctct 7051015  T
Q  525 ctcacatcatcatcgtacatagaacttgaaga 556  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  7051016 ctcacatcatcattttacatagagcttgaaga 7051047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 325 - 556
Target Start/End: Original strand, 10569457 - 10569687
Alignment:
Q  325 acaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10569457 acaaaaatttacaattttcaccatcatcctgtacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcacacatcgcataaccattgttaaaca 10569556  T
Q  425 aatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctct 524  Q
    ||  ||||||||  |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10569557 aacctttggcagatggcagacatag-aaggctttcctgggttattgatagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctcg 10569655  T
Q  525 ctcacatcatcatcgtacatagaacttgaaga 556  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10569656 ctcacatcatcattgtacatagagcttgaaga 10569687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 20524142 - 20524385
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20524142 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcatagtgata 20524241  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | | |||  |||||| ||||||||||||     
T  20524242 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatacatatataattcaaggaccaatttgattgaat 20524341  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  20524342 tttttttacataaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 20524385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 32437956 - 32437696
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32437956 aaaaatttacaattttcaaaattatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 32437857  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  32437856 ccttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaacaacattgaagctttct 32437757  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  32437756 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 32437696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 373 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 33267776 - 33267534
Alignment:
Q  373 atcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgac 472  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33267776 atcaatactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaacaaacctttgacatagagcaagcataaaaagaccttcctaggttattgac 33267677  T
Q  473 agtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttg----aagatgaagactgact 568  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    ||||| ||||| ||||    
T  33267676 aatgttgacttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgcacatagagcttgaagaaagattaagaccgact 33267577  T
Q  569 gttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33267576 gttgtagctggtttttgcccatacgcccaccacccatcatttc 33267534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 18644031 - 18644271
Alignment:
Q  11 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatat 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18644031 tgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 18644130  T
Q  111 gttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattt 209  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||  || | |||  |||||| ||| |||||||| |||    
T  18644131 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgatgatcgaaataatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttt 18644230  T
Q  210 tttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||| || ||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  18644231 tttgacagaaaggtttgattcattcattgacaatctctttt 18644271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32438449 - 32438206
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  32438449 ttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatggaccaaggatcatagtgata 32438350  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || | |||  |||||| ||| ||||||||     
T  32438349 tctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattaaaggaccaatatgattgaat 32438250  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  32438249 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaatctctttt 32438206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 11355966 - 11356198
Alignment:
Q  10 atgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  11355966 atgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatc 11356065  T
Q  110 tgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaatt 208  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||         || | |||  |||||| ||||||||||||| |    
T  11356066 tgttgtgaaaattcaaggacctgtttgatggtatttttactaatttgaggatcgatatg---------catataattcaaggaccaatttgattgaaact 11356156  T
Q  209 ttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  11356157 ttttgacataagggtttgattcattcattgaccacctctttt 11356198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7372351 - 7372109
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7372351 ttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacagtgat- 7372253  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |   |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | | |||  |||||| ||||||||||| |    
T  7372252 tcgattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgata 7372153  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  7372152 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 7372109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 250
Target Start/End: Original strand, 6901999 - 6902148
Alignment:
Q  102 gtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6901999 gtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggattgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttga 6902098  T
Q  201 ttgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6902099 ttgaatttttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctctttt 6902148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 32517672 - 32517869
Alignment:
Q  54 tcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  32517672 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggaactatttgatggtattttcactaat 32517771  T
Q  153 ttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||| |||||| |||||||||||  || | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||    
T  32517772 ttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctctttt 32517869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 32455012 - 32454826
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32455012 acatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcataaaaaggtcttcctgggttattgacggtgtttgctcttcttacaacacaaatt 32454913  T
Q  501 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  32454912 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 32454826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Original strand, 20524768 - 20524910
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20524768 ttgacagtgttgccttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctaacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgac 20524867  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20524868 tgttgtagttgtttttg-cccatacacccaccacccatcatttc 20524910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 7371767 - 7371625
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||    
T  7371767 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccagcattgaagctctctcacctcatcattgtacatatagcttgaagatgaaaaccgac 7371668  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    | || ||| | |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  7371667 tattgtaggtatttttg-cccacacgcctaccacccatcatttc 7371625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Original strand, 6900241 - 6900342
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6900241 ttataatggtatgcaaatgtctgtccttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgaaccaaggatcacagtgata 6900340  T
Q  108 ta 109  Q
    ||    
T  6900341 ta 6900342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33268155 - 33268004
Alignment:
Q  93 aggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaagga 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||       |||    
T  33268155 aggatcacattgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcaataatttagggatcgatatgatggatagacatac-------gga 33268063  T
Q  192 ctaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | ||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33268062 ccaattcaattgaaattttttgagagaagggttgaattcattcattgacaacctctttt 33268004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Original strand, 20524677 - 20524769
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20524677 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaagcagaagacaaaatttgtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 20524769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 323 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7371862 - 7371766
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  7371862 acacaaaatattacaattttcaccatcattctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacatgtcacataactattgtt 7371766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 426
Target Start/End: Original strand, 18644531 - 18644630
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  18644531 aaaaaattacaattttcacaattatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatatatcaaataacaattgttaaacaaa 18644630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 587
Target Start/End: Original strand, 18644657 - 18644731
Alignment:
Q  513 cattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||  | |||| ||| |||||||||||    
T  18644657 cattgaagctctctcacatcatcattgtacatggagcttgaagatgaataccaattgttgtagttgtttttgccc 18644731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 323 - 610
Target Start/End: Original strand, 51685666 - 51685952
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51685666 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcggtactattttaacaaaccattcacacgtcacataaccattgttaaa 51685765  T
Q  423 caaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 522  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51685766 caaacctttggcagagggcagacatagaaaggccttcctggattattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 51685865  T
Q  523 ctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  51685866 ctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagctgtttttg-cccatacgcccaccacccatcattt 51685952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 327 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 27897989 - 27897706
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27897989 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttacacaaaccattcgcacatcacataaccattgctaaacaaa 27897890  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27897889 cctttggcagagggcaggcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 27897790  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  27897789 cacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccggctgttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccactcatcatttc 27897706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 42280262 - 42280506
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtctttta-ttttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42280262 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttacttttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgat 42280361  T
Q  107 atatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaa 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42280362 atatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggattgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaa 42280461  T
Q  206 attttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42280462 attttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctctttt 42280506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 327 - 611
Target Start/End: Original strand, 42281792 - 42282075
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  42281792 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcgcacatcaaataatcatcgttaaacaaa 42281891  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
     ||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42281892 catttggcagaggtcagacatagaaaggccttcttgggttattggcagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 42281991  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  42281992 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtctttg-cccatacgcccaccacctatcatttc 42282075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48830193 - 48829950
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  48830193 ttatgatgatatacaaatgtctgtctttttacaatcaaagtatatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcactaaggatcacagtgata 48830094  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  48830093 tatgttgtgaaaattcaaggacttgtttgatggtattttcactaatttggagatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaat 48829994  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  48829993 ttttttgacataagggttaaattcattcattgacaaccactttt 48829950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 51685366 - 51685609
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  51685366 ttatgatggtttgcaaatgtccgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaacgatcacagtgata 51685465  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51685466 tatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggattgatatgatcgatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaaa 51685565  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51685566 ttttttgacagaaaggttaaattcattcattgacaacctctttt 51685609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 610369 - 610612
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  610369 ttatgattatatgcaaatgtctgcttttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcatagtgatt 610468  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  610469 tatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatgcgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaat 610568  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  610569 ttttttgacagaagggttgaattcattcattgacaacctctttt 610612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 53188574 - 53188314
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  53188574 aaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 53188475  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53188474 ccttatgcagagggcaaacattaaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 53188375  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||    
T  53188374 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccgattgttgtagttgtttttgccc 53188314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 46113242 - 46113485
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  46113242 ttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatt 46113341  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  46113342 tatgttgtgaaaattcaaggacttgtttgatggtatcttcactaatttagggattgatgtgatggataaacatacaatagaaggaccaatttgattgaaa 46113441  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  46113442 ttttttgacagaagggttggattcattccttgacaacctctttt 46113485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 327 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 35904623 - 35904364
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  35904623 aaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaataaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 35904524  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904523 ccttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 35904424  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgcc 586  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  35904423 cacatcatcattgtacatggagcttgaagatgaataccgattgttgtagttgtttttgcc 35904364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27898483 - 27898240
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27898483 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccagggatcacagtgata 27898384  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| || |||||||||     
T  27898383 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaacttgattgaat 27898284  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27898283 ttttttgacaaaagggtttgattcattcattgacaacctctttt 27898240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23292538 - 23292295
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  23292538 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatttatgcaccaaggatcacaatgata 23292439  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||  |||||||||||||    
T  23292438 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaatttgattgaaa 23292339  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  23292338 ttttttgacagaaaagtttgattcattcattgacaacctatttt 23292295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 43765896 - 43766139
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43765896 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcatagtgata 43765995  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  43765996 tctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatagtattttcactaatttgatgatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 43766095  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||| | || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  43766096 ttttttgatagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 43766139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30599576 - 30599334
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30599576 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttctgcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 30599477  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  30599476 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 30599377  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
     ||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  30599376 -tttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 30599334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Original strand, 2377771 - 2377997
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2377771 ttatgatgatatgcaaatatttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 2377870  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  2377871 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgttatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 2377970  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatt 233  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||    
T  2377971 ttttttaacataagggtttgattcatt 2377997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 382 - 611
Target Start/End: Original strand, 24845922 - 24846149
Alignment:
Q  382 attttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggc 481  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  24845922 atttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaacaaacatttggcagaga-cagacatagaaaggcattcatgtgttatcgacagtgttggc 24846020  T
Q  482 ttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgttt 581  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  24846021 ttttcttacaacacaaattctatgacaccaacattgaagcactctcatatcaccattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactattgtagctgttt 24846120  T
Q  582 ttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  24846121 ttg-cccatacgtccaccacccatcatttc 24846149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 362 - 607
Target Start/End: Original strand, 41978678 - 41978922
Alignment:
Q  362 caaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcct 461  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||||||||   |||||    
T  41978678 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggtattcct 41978777  T
Q  462 gggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaag 561  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  41978778 gggttattgacagtgtttgctattcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaat 41978877  T
Q  562 actgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatca 607  Q
    || |  |||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  41978878 accggttgttgtagttgtttttg-cccattcgcgcaccatccatca 41978922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 17516085 - 17516327
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17516085 ttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtatctgtcttttactttttactttgttaagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgata 17516184  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  17516185 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttttactaatttgagtatcgatatgatggata-tgatataattcaaggaccaatttgattgaaa 17516283  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  17516284 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 17516327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 44794974 - 44795217
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44794974 ttatgatggtatgaaaatgtccgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 44795073  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  ||| || |||||||||||||    
T  44795074 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatggatataattcaagaaccaatttgattgaaa 44795173  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | ||||||||||| ||||   |||||| || |||||||||||||    
T  44795174 tattttgacataatggtttggttcattcatcgacaacctctttt 44795217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35905081 - 35904851
Alignment:
Q  21 caaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35905081 caaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaa 35904982  T
Q  121 ttcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataa 219  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || | |||  |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||    
T  35904981 ttcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaa 35904882  T
Q  220 gggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
     ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  35904881 aggtttgattcattcattgacaacctctttt 35904851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2225538 - 2225298
Alignment:
Q  11 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatat 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2225538 tgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 2225439  T
Q  111 gttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattt 209  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   | | |||  |||||| |||  || |||| |||    
T  2225438 gttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgtatataattcaaggaccaatgcgaatgaatttt 2225339  T
Q  210 tttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2225338 tttgacagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttt 2225298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 420 - 611
Target Start/End: Original strand, 2378326 - 2378516
Alignment:
Q  420 aaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaa 519  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378326 aaacaaatctttggcagagggcaggcatataaaggccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaa 2378425  T
Q  520 gctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||    
T  2378426 gctctctcacctcattattttacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccaaacgcccaccactcatcatttc 2378516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 2660989 - 2661232
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2660989 ttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 2661088  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||| |||   | | |||  |||||| ||||||||| |||    
T  2661089 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaaccaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattaaaa 2661188  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | |||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  2661189 tattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctctttt 2661232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 21349469 - 21349712
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21349469 ttatgatagtatgcaaatgtctatctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggaccacagtgata 21349568  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  || ||| |||||||||||      
T  21349569 attgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaatttgattgatt 21349668  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21349669 tttttttacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 21349712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 41978503 - 41978670
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41978503 ttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 41978602  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41978603 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 41978670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 46198495 - 46198737
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  46198495 ttatgatggtatgcaaatgtctgtttttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaagatcacaatgata 46198594  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  46198595 tctgttgtaaaaa-tccaggacctatttgatggtatttttactaatttgaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 46198693  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  46198694 ttttttgacataaatgtttgattcattcattgacaacctctttt 46198737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 394 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 7884056 - 7883863
Alignment:
Q  394 cattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaac 493  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7884056 cattcatacatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaagaccttcctgagttattgacagtgtttgcttttcttgcaac 7883957  T
Q  494 acaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  7883956 acaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcaacattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 7883863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 325 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 48829891 - 48829679
Alignment:
Q  325 acaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||    
T  48829891 acaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttgg-------------------cataaccattgttaaaca 48829811  T
Q  425 aatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctct 524  Q
    ||  |||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48829810 aacctttggcagagggcagatatagaaaggccttcttgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaagacaccaacattgaagctct 48829711  T
Q  525 ctcacatcatcatcgtacatagaacttgaaga 556  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  48829710 ttcacatcatcattgtacatagagcttgaaga 48829679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44275585 - 44275344
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  44275585 ttatgatggtatgcaaatgactgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttaatttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaggatcacaatgata 44275486  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | | |||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     | |||  |||||| |||||||||||||    
T  44275485 tctattgtgaaaattcaagaacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtgtataattcaaggaccaatttgattgaaa 44275386  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||  || || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  44275385 tttttt--cagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 44275344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7884262 - 7884095
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7884262 ttatgatggtaggcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 7884163  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  7884162 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggattgaaatgatggata 7884095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 250
Target Start/End: Original strand, 54899252 - 54899451
Alignment:
Q  52 tgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcacta 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54899252 tgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcacta 54899351  T
Q  151 atttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  || | |||  ||||||  || |||||||| |||||||||  || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  54899352 atttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccgatgtgattgaatttttttgacggaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 54899451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Original strand, 24845669 - 24845882
Alignment:
Q  41 atcaaagtgtatgtcttttat--tttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat 138  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24845669 atcaaagtgtatgtcttttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacattgatatatgttgtgataattcaaagacttatttgat 24845768  T
Q  139 -gta-ttttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttat 236  Q
     ||| |||| |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| | ||||||| |||||||| ||    
T  24845769 ggtatttttaactaatttagggaacgatttgatgcatagacaaacaatagaaggaccaatttgatggaaagattttgatagaagggttgaattcattcat 24845868  T
Q  237 tgacaacctctttt 250  Q
    | ||||||||||||    
T  24845869 ttacaacctctttt 24845882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 23292225 - 23292085
Alignment:
Q  470 gacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactg 569  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23292225 gacagtgttggtttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctttctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactg 23292126  T
Q  570 ttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
     |  || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  23292125 atggagttgtttttg-cccatacgcccaccacctatcatttc 23292085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 468 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 44275001 - 44274874
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||    
T  44275001 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctttctcacctcatcattgtacatagagattgaagatgaagatcgac 44274902  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgccc 596  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  44274901 tgttgtagttgtttttg-cccatacgccc 44274874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Original strand, 21350055 - 21350197
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  21350055 ttgacagtgttggtttttcttagtacacaaattttaggacaccaacattgaagctctctcaccttatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgag 21350154  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21350155 tgttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccacccatcatttc 21350197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 30598992 - 30598851
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  30598992 ttgacagtgttagcttttcttacaacacaaattctaggtcaccaacattgaag-tctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgac 30598894  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  30598893 tgttgtagttgttttag-ctcatacgcccaccacccatcatttc 30598851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Original strand, 43766482 - 43766624
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  43766482 ttgacagtgttgccttttcttacaacacaaattttaggacaccaacattgaacttctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgac 43766581  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||    
T  43766582 tgttgtagttgtttatg-cccatacgcccatcacccatcatttc 43766624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 46609897 - 46609740
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | |    
T  46609897 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 46609798  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46609797 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 46609740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38192630 - 38192475
Alignment:
Q  20 gcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | | |    
T  38192630 gcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgata 38192531  T
Q  120 attcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38192530 attcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 38192475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 46309776 - 46309933
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||| | |    
T  46309776 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaatgatcacattgatatctgttatga 46309875  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46309876 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 46309933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53093372 - 53093215
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | |    
T  53093372 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtatttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 53093273  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  53093272 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 53093215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Original strand, 21349964 - 21350056
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21349964 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatctgtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 21350056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 2976111 - 2975967
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2976111 gttaaacaaacatttggcagagggcaagcatagaatgaccttcctgggttttgtacagtattggcttttctaacaacacaaattctaggacaacaacatt 2976012  T
Q  517 gaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaag 561  Q
     ||||  |||||||||| |||   || | ||||||||||||||||    
T  2976011 caagcaatctcacatcaccattaaacttggaacttgaagatgaag 2975967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Original strand, 46198989 - 46199081
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46198989 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaattaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacatagccattgtt 46199081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 30599082 - 30598991
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30599082 aaaaatttacaattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaataagtactatttaaacaaatcattcacacat-acataaccattgtt 30598991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 44275092 - 44275000
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  44275092 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatatgtactatttaaacaaattattcacacatcacataactattgtt 44275000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 560
Target Start/End: Original strand, 46199080 - 46199172
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaa 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  46199080 ttgacagtgttggcttttcttacaatacaaattatagggcaccaacattgaagctctcttacctcatcattgtatatagagcttgaagatgaa 46199172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 53190231 - 53190121
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttact---ttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtg 104  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53190231 ttatgatggtatgcaaatatgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttaataatttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtg 53190132  T
Q  105 atatatgttgt 115  Q
    |||| ||||||    
T  53190131 atatctgttgt 53190121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 417 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 22218859 - 22218713
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||  |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  22218859 gttaaacaaacctttggcagatggcaagaatagaaagacattcttgggtttttgatagtgttgcattttcttacaacgcatattataggacaccaacatt 22218760  T
Q  517 gaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagac 563  Q
     |||  ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  22218759 caagtactctcacatcaccattagacatagaacttgaagatgaagac 22218713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Original strand, 43766391 - 43766483
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  43766391 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaataaaaagacaaaatttgtactacttaaacaaatcattcacacatcacataactattgtt 43766483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 417 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 35862228 - 35862035
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    ||||||||||  ||||||   |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |    
T  35862228 gttaaacaaacctttggcttagggcaagcatagaaaggccttcctgagtttttgacagtattgacttttcttaaaacacaaattatgggacaccaacact 35862129  T
Q  517 gaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
     || | ||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||| |   ||| | |||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  35862128 caaacactctcacatcaccattaaacatagagcttgaagatgaaaatcaactttgataattgtttttg-cccatacgtccaccacccatcatttc 35862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 323 - 391
Target Start/End: Original strand, 2378254 - 2378323
Alignment:
Q  323 acacaaaaattt-acaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaa 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2378254 acacaaaaattttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaa 2378323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Original strand, 1847067 - 1847183
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1847067 gttaaacaaacctttggcagagggcaaacatagaatggccttcccgagtttttattagtattggattttctaacaacacaaattataggacaccaacatt 1847166  T
Q  517 gaagctctctcacatca 533  Q
     ||||||||||||||||    
T  1847167 caagctctctcacatca 1847183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 435
Target Start/End: Original strand, 13466455 - 13466563
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13466455 aaaaatttatagttttcaccatcatcctatacaaagaaaattcaaaatcagtaaaagtttaacaaaccattcccacatcacataaccattgttaaataaa 13466554  T
Q  427 tatttggca 435  Q
      |||||||    
T  13466555 cctttggca 13466563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 401 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32843132 - 32843021
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||| |||||||| ||  |||||||    
T  32843132 acatcacataaccattgttaaacaaacctttagcaaagggcaaacatagaaaggccttcctgggttttagagagtattgtcttttcttgcagtacaaatt 32843033  T
Q  501 ctaggacaccaa 512  Q
    || | |||||||    
T  32843032 ctggaacaccaa 32843021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53188960 - 53188826
Alignment:
Q  117 aaaattcaaggacttatttgatgt-attttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgac 215  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || | |||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  53188960 aaaattcaatgacctatttgatgacattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgac 53188861  T
Q  216 ataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | || ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  53188860 agaaaggtttcattcattcattgacaacctatttt 53188826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 33112528 - 33112412
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| | ||||| | |  | || ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112528 gttaaacaaacctttggcagagggcaagcatagaatggccttcatagaatttttacaatattggattttctaacaacacaaattctaggacaccaacatt 33112429  T
Q  517 gaagctctctcacatca 533  Q
     |||| |||||||||||    
T  33112428 caagcactctcacatca 33112412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 561
Target Start/End: Original strand, 23775095 - 23775200
Alignment:
Q  456 cttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaag 555  Q
    ||||||||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||| | || |||| || ||||    
T  23775095 cttcctgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattctagaacaccaacattcaagcactctcacaacaccattgaacttagagctcgaag 23775194  T
Q  556 atgaag 561  Q
    ||||||    
T  23775195 atgaag 23775200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 530
Target Start/End: Original strand, 48634800 - 48634889
Alignment:
Q  441 caaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcaca 530  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  48634800 caaacatataatgaccttcctgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattctagaacaccagcattcaagcactctcaca 48634889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 45897667 - 45897561
Alignment:
Q  477 ttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagc 576  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||   || | || |||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  45897667 ttggattttctaacaacacaaattgtaggacaccaacattcaagcactctcacaacaccattaaacttggagcttgaagatgaagcttgacttttataac 45897568  T
Q  577 tgttttt 583  Q
     ||||||    
T  45897567 cgttttt 45897561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 610
Target Start/End: Original strand, 13466621 - 13466707
Alignment:
Q  523 ctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    ||||||||||| |||   ||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  13466621 ctctcacatcaccattaaacatagagcttcaagatgaaggccgactattatagctgtttttg-cccatgcgcccacaacccatcattt 13466707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35862776 - 35862699
Alignment:
Q  61 ttttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat 138  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||||| ||| || ||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  35862776 ttttttactttgttctgcacatatatgcaacaaggatcacattgacatctgtttaaataattcaaggacttatctgat 35862699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 323 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 52642705 - 52642418
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52642705 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattgacacatcacataaccattgttaaa 52642606  T
Q  423 caaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 522  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52642605 caaacctttggcagagggcagacatagaaaggccttcctgggttattgacggtgttggctttttttacaacataaattctaggacaccaacattgaagct 52642506  T
Q  523 ctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  52642505 ctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagctgtttttg-cccatacgcccaccacccatcatttc 52642418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 327 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 50554977 - 50554705
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  50554977 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcgcacatcacataactattgttaaacaaa 50554878  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50554877 cctttggcagagggcagacatagaaaggtcttcttgggttattgacagtgttgacttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 50554778  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccacca 600  Q
    |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50554777 caccacatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccatacgcccacca 50554705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 336 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 6817666 - 6817393
Alignment:
Q  336 caattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggca 435  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6817666 caattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaattagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataatcattgttaaacaaacatttggca 6817567  T
Q  436 gtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatc 535  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  6817566 gagggcagacatagaaaggccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctcacacctca-c 6817468  T
Q  536 atcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    || ||| ||||| ||| ||||||||||| |||| || ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6817467 attgtagatagagcttaaagatgaagaccgactattgtagttatttttg-cccatacgcccaccacccatcatttc 6817393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 15105203 - 15105444
Alignment:
Q  10 atgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatata 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  15105203 atgatggtatgcgaatgtctgtctttttgcaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacaatgattta 15105302  T
Q  110 tgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaatt 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15105303 tgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaaatt 15105402  T
Q  209 ttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | || ||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  15105403 tcttaacagaatggttggattcattcattgacaacctctttt 15105444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 33600017 - 33599757
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33600017 aaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 33599918  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33599917 ccttatgctgagggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgatagtgtttgcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 33599818  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||    
T  33599817 cacatcatcattgtacatagagtttgaagatgaagaccggttgttgtagttgtttttgccc 33599757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 52643003 - 52642762
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  52643003 ttatgatggtttgcaaatattcgtctttttacaatcaaagtgt--gtcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaggatcacagtgata 52642906  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  52642905 tatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttagggatcgatatgatggatagacatgcaatagaaagaccaatttgattgaaa 52642806  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  52642805 ttttttgacagaagggttaaattcattcattggcaacctctttt 52642762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 51895534 - 51895291
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  51895534 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatttcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgata 51895435  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||| | ||||||||||||     
T  51895434 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagggccaatttgattgaat 51895335  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  51895334 ttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 51895291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3012822 - 3012579
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3012822 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgata 3012723  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  3012722 tctgttgtgaaaatccaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 3012623  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3012622 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctatttt 3012579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6818085 - 6817842
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6818085 ttatgatggtatgcacatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtctttcactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 6817986  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| ||||||||||||     
T  6817985 tatgttgtgaaaaaccaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaat 6817886  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6817885 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 6817842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31237875 - 31237632
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31237875 ttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttatagtcaaagtgaatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 31237776  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  31237775 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaatttgaggatcgatataatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 31237676  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  31237675 ttttttgatagaagggtttgattcattcattgacaacctctttt 31237632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 327 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 26224419 - 26224186
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26224419 aaaaatttacaattttcataattatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 26224320  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224319 ccttatgcagagggcaagcatagaaaggtcttcctgggttattgacattgtttgtttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 26224220  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaa 560  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  26224219 cacatcatcattgtacatagagctcgaagatgaa 26224186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26224922 - 26224679
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26224922 ttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 26224823  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || | |||  |||||| ||| ||||||||     
T  26224822 tttgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtcttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaat 26224723  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  26224722 ttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 26224679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Original strand, 27088536 - 27088796
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  27088536 aaaaatttacaattttcacaattatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataactattgttaaacaaa 27088635  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088636 ccttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacggtgtttgttgttctcacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 27088735  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  27088736 cacatcatcattgaacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 27088796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50555472 - 50555228
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtctttta-ttttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgat 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50555472 ttatgatggcatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagttttttaccttgttcagtaaatgtatgcaccaaggatcacaatgat 50555373  T
Q  107 atatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaa 205  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| ||||||||||||    
T  50555372 atctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa 50555273  T
Q  206 attttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||| || | ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  50555272 attttttgacagaatgatttgattcattcattgacaacctctttt 50555228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 31237556 - 31237334
Alignment:
Q  387 aacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttc 486  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  31237556 aacaaaccatttacacatcacatagccattgttaaacaaacctttggcagagggcagacatagaaaggccttcctggattattgacagtcttgacttttc 31237457  T
Q  487 ttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgcc 586  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||      
T  31237456 ttacaacacaaattctaggacagcaacattgaagctctctcaccttatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-t 31237358  T
Q  587 ccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    |||||||||||| | |||||||||    
T  31237357 ccatacgcccactacccatcattt 31237334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 2870354 - 2870597
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2870354 ttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgata 2870453  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  2870454 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 2870553  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | |||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  2870554 tattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctctttt 2870597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 362 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 34777331 - 34777133
Alignment:
Q  362 caaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcct 461  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  34777331 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcct 34777232  T
Q  462 gggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaa 560  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34777231 gggttattgatagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaa 34777133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46582957 - 46582714
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  46582957 ttatgatggtatgaaaatatcagtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgata 46582858  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  46582857 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 46582758  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | |||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  46582757 tattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctctttt 46582714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 587
Target Start/End: Original strand, 1443523 - 1443709
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1443523 acatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaatt 1443622  T
Q  501 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  1443623 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 1443709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 9120803 - 9120617
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9120803 acatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaatt 9120704  T
Q  501 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  9120703 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 9120617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25277698 - 25277501
Alignment:
Q  54 tcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25277698 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 25277599  T
Q  153 ttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||| ||||||||||||||||||  || | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||    
T  25277598 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctctttt 25277501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34777506 - 34777339
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34777506 ttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 34777407  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34777406 tctgttatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 34777339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33600511 - 33600278
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  33600511 atgcaaatgtctgtctttttacaatcaaattgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacattgatatctgttgtga 33600412  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaa-attttttgac 215  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  || | |||  ||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  33600411 aaattcaaggacatatttgatagtattttcactaatttgaggatcgaaaggatggatatgcatataattcaaggaccgatttgattgaattttttttgac 33600312  T
Q  216 ataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  33600311 agaaaggtt-gattcattcattgacaacctctttt 33600278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 27088042 - 27088284
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtcttttt-accatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgat 106  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27088042 ttatgatgatatgcaaatatgtgtcttttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgat 27088141  T
Q  107 atatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaa 205  Q
    || |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || | |||  |||||| ||| ||||||||    
T  27088142 atctgttgtgaaaagtcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaa 27088241  T
Q  206 attttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
      ||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27088242 --tttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 27088284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4855335 - 4855168
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4855335 ttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaattgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggattacagtgata 4855236  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4855235 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 4855168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 37345137 - 37345334
Alignment:
Q  54 tcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  37345137 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggaactatttgatggtattttcactaat 37345236  T
Q  153 ttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||| |||||| |||||||||||  || | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||    
T  37345237 ttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctctttt 37345334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45045826 - 45045629
Alignment:
Q  54 tcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45045826 tcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 45045727  T
Q  153 ttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||  |||||||||||||||||  || | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||    
T  45045726 ttgaagatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcattcattgacaacttctttt 45045629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 47012203 - 47012044
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  47012203 acatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggtcttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaattt 47012104  T
Q  501 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaa 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47012103 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaa 47012044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 362 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 4855160 - 4854916
Alignment:
Q  362 caaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcct 461  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||||||||   || ||    
T  4855160 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatatatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggtattact 4855061  T
Q  462 gggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaag 561  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  4855060 gggttattgacagtgtttggtattcttacaacacaaattttaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaat 4854961  T
Q  562 actgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatca 607  Q
    || |  |||| ||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||    
T  4854960 accggttgttgtagttgtttttg-ctcattcgcgcaccatccatca 4854916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Original strand, 37087570 - 37087712
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  37087570 ttgacagtgttggcttttcttacaatacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacacagagcttgaagatgaagaccgac 37087669  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37087670 tgttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccacccatcatttc 37087712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 481 - 611
Target Start/End: Original strand, 15105797 - 15105926
Alignment:
Q  481 cttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtt 580  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15105797 cttttcttacaacacaaattataggacaccaacattgaagctctctcacatcttcattgtacatagggcttgaagatgaagaccgactgttgtagctgtt 15105896  T
Q  581 tttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15105897 tttg-cccatacgtccaccatccatcatttc 15105926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 51895221 - 51895081
Alignment:
Q  470 gacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactg 569  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  51895221 gacagtgttggtttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctaacctcatcattgtatatatagcttgaagatgaagaccgactg 51895122  T
Q  570 ttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    || ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  51895121 ttgtagttgtttttg-cccatacgtccaccacccatcatttc 51895081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 470 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 3012509 - 3012370
Alignment:
Q  470 gacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactg 569  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3012509 gacaatgttggtttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcactgtacatagagcttgaagatgaagaccgactg 3012410  T
Q  570 ttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    || ||| |||||||  |||||||||| | || |||||||||    
T  3012409 ttgtagttgttttt-tcccatacgcctaacacccatcattt 3012370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 327 - 422
Target Start/End: Original strand, 15105696 - 15105791
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15105696 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagaaaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaa 15105791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8168690 - 8168533
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | |    
T  8168690 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgtttagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 8168591  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8168590 taattcaatgaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 8168533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 323 - 419
Target Start/End: Original strand, 37087474 - 37087571
Alignment:
Q  323 acacaaaa-atttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37087474 acacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaagcattcacacatcacataaccattgtt 37087571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 42558649 - 42558440
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||| |||| || |||| |||| ||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  42558649 acatcacataaccattgttaaacaaacctttggcaaagggcaagcatagaaaggcctttctcggtttttgatagtattggattttcttgcaccacaaatt 42558550  T
Q  501 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccacca 600  Q
     | ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||   |||| || |||||||||||||    | | | ||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  42558549 atcggacaccaacattcaagcactctcacatcaccattaaacatggagcttgaagatgaagctcaaatttgataactgattttg-cccatacgcccacca 42558451  T
Q  601 tccatcatttc 611  Q
     ||||||||||    
T  42558450 cccatcatttc 42558440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 417 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 46637452 - 46637339
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  46637452 gttaaaccaacatttggcagagggcaagcatagaatgaccttcctgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattgtaggacaccaacatt 46637353  T
Q  517 gaagctctctcaca 530  Q
     |||| ||||||||    
T  46637352 caagcactctcaca 46637339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 18183292 - 18183176
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||   |||| | || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18183292 gttaaacaaacatttggcagagagcaagcatagaatgacctcgatgggatttttacagtattggattttctaacgacacaaattctaggacaccaacatt 18183193  T
Q  517 gaagctctctcacatca 533  Q
     ||||| ||||||||||    
T  18183192 caagctttctcacatca 18183176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 530
Target Start/End: Original strand, 31803115 - 31803216
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31803115 tttggcagagggcaaccatagaatgtccttcatgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattgtaggacaccaacattcaagcactctca 31803214  T
Q  529 ca 530  Q
    ||    
T  31803215 ca 31803216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 323 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 26239511 - 26239224
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239511 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtattactttaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaa 26239412  T
Q  423 caaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 522  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239411 caaacatttggtagagggcagacatagaaatgcctttctgtgttattgacagtgttggcttttcttactacacaaattctaggacaccaacattgaagct 26239312  T
Q  523 ctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26239311 ctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagctgtttttg-cccatacgcccaccacccatcatttc 26239224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26239811 - 26239568
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26239811 ttatgatggtatgcaaatgtctttctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttgagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 26239712  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26239711 tatgttgtgaaaattcaatgacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaattggattgaaa 26239612  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26239611 ttttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctctttt 26239568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 323 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 41824740 - 41824455
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41824740 acacaaaaacttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcacacatcacataaccattgttata 41824641  T
Q  423 caaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 522  Q
    ||||  |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  41824640 caaacctttggcagagggcagatatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtt-acttttcttacaacacaaattttaggacaccaacattgaaact 41824542  T
Q  523 ctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  41824541 ctctcacatcatcattgtagatagagcttgaagatgaagaccgactgctgtagctgtttttg-cccatatgctcaccacccatcattt 41824455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7744500 - 7744257
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |    
T  7744500 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagaataaaagtgaaa 7744401  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  7744400 tatgatgtgaaaattcaaggacttatttgatggtgttttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaagaaccaatttgattgaaa 7744301  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7744300 ttttttgacagaagggttaaattcattcattgacagcctctttt 7744257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41825040 - 41824797
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41825040 ttatgatggtatgcaaatgtctggctttttacaatcacagtgtatatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagcatcacggtgata 41824941  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||     
T  41824940 tatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggatcaatatgatggatagacatacaatagaatgaccaatttgattgaat 41824841  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41824840 ttttttgacagaagggttaaattcattcattggcaacctctttt 41824797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9672531 - 9672301
Alignment:
Q  21 caaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9672531 caaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttagtttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaa 9672432  T
Q  121 ttcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataa 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  9672431 ttcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatacgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaattttttcgacagaa 9672332  T
Q  220 gggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  9672331 gggttggattcattcattgacaacatctttt 9672301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Original strand, 15307542 - 15307802
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15307542 aaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 15307641  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307642 ccttatgcagagggcaaacatagaaaagccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacataaattctaggacaccaacattgaagctctct 15307741  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  15307742 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 15307802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Original strand, 15487911 - 15488171
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15487911 aaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 15488010  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15488011 ccttatgcagagggcaaacatagaaaagccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacataaattctaggacaccaacattgaagctctct 15488110  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  15488111 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 15488171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 323 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 7744200 - 7743998
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7744200 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtattattttaacaaatcattcacacatcacataatcattgttaaa 7744101  T
Q  423 caaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 522  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7744100 caaacatttggcagagggcagacatagaaagacattcatgggttattgaaaatgttggcttttcttacaacacaaattctaagacaccaacaatgaagct 7744001  T
Q  523 ctc 525  Q
    |||    
T  7744000 ctc 7743998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 27405018 - 27404758
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27405018 aaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 27404919  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27404918 ccttatgcagagggcaagcatagaaaagccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 27404819  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  27404818 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 27404758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 42942549 - 42942792
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42942549 ttatgatggtatgcaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacaatgata 42942648  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  42942649 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcaataatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 42942748  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  42942749 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 42942792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 27691921 - 27692164
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27691921 ttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 27692020  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  27692021 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 27692120  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | |||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  27692121 tattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctctttt 27692164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40339049 - 40338806
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40339049 ttatgatggtatgcaaatgtatgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaacaaggatcacagtgata 40338950  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttga-tgtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  40338949 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgattgtattttcactaatttgaggatcgatacgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 40338850  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  40338849 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 40338806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 362 - 587
Target Start/End: Original strand, 13283321 - 13283546
Alignment:
Q  362 caaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcct 461  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13283321 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaaacatagaaagaccttcct 13283420  T
Q  462 gggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaag 561  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  13283421 gggttattgacagtgtttgttgttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaat 13283520  T
Q  562 actgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    || |  |||| ||| |||||||||||    
T  13283521 accggttgttgtagttgtttttgccc 13283546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Original strand, 29238444 - 29238704
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29238444 aaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 29238543  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| | | |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29238544 ccttatgcagagggcaagcatagaaaagccttcctgggttactaagagtgtttgctcttcttgcaacacatattctaggacaccaacattgaagctctct 29238643  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  29238644 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 29238704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 22273014 - 22273257
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  22273014 ttatgatggtatgcaattgcctgtctctttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacaatgata 22273113  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  22273114 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgatgatcgatacgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 22273213  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22273214 ttttttgatagaaaggtttgattcatttattgacaacctctttt 22273257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 327 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 11720224 - 11719941
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | || ||  ||||  |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11720224 aaaaattcacaattttcaccatcatcttgtacaaagaaaattcaaaatcagtagaacttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 11720125  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||  ||||    
T  11720124 actttggcagagggcagacatagaaaaaccttcccgggttttttaaagtgttggcttttcttacagcacaaattatgggacaccaacattcaagtactct 11720025  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||| |||    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11720024 cacatcaccattaagcatagagcttgaagatgaagacagactattatagctgatttt-acccatacgcccaccacccatcatttc 11719941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41041953 - 41041711
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  41041953 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatggta 41041854  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | | |||  |||||| |||||||||| ||    
T  41041853 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattg-aa 41041755  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||| |||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  41041754 tttttggacagaaatgtttgattcattcattgacaacctctttt 41041711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 362 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 13107567 - 13107342
Alignment:
Q  362 caaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcct 461  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||   ||||| ||||||||| |||||||    
T  13107567 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcaaaaggcaagcatagaaaggccttcct 13107468  T
Q  462 gggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaag 561  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  13107467 gggttattgacagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaat 13107368  T
Q  562 actgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    || |  |||| ||| |||||||||||    
T  13107367 accggttgttgtagttgtttttgccc 13107342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8609176 - 8609009
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8609176 ttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 8609077  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8609076 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 8609009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 38547982 - 38548149
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38547982 ttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 38548081  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  38548082 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaaaatgatggata 38548149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 250
Target Start/End: Original strand, 5037235 - 5037434
Alignment:
Q  52 tgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcacta 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5037235 tgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcacta 5037334  T
Q  151 atttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  5037335 atttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaatttctttgacataagggtttgattcattcattgacaacctctttt 5037434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33708179 - 33707936
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33708179 ttatgatgatatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggaacacagtgata 33708080  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  || ||| |||||||||||||    
T  33708079 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaatttgattgaaa 33707980  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | |||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  33707979 tattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctctttt 33707936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 362 - 560
Target Start/End: Original strand, 38548157 - 38548355
Alignment:
Q  362 caaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcct 461  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||  | || |||||| |||||||||  ||||||    
T  38548157 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgtagagggcaagcatagaaaggtcttcct 38548256  T
Q  462 gggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaa 560  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38548257 ggattattgacagtgtttgctattcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaa 38548355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 362 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 8609001 - 8608776
Alignment:
Q  362 caaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcct 461  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  8609001 caaaaggcaaaatcaatataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcct 8608902  T
Q  462 gggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaag 561  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  8608901 gggttattgacagtgtttgttgttcttacaacacaaattctaggacaccaacgctgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaat 8608802  T
Q  562 actgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    || |  |||| ||| |||||||||||    
T  8608801 accggttgttgtagttgtttttgccc 8608776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13107742 - 13107575
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13107742 ttatgatggtaggcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 13107643  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13107642 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgagaatcgaaatgatggata 13107575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3152863 - 3152665
Alignment:
Q  53 gtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaa 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  3152863 gtcttttactttttactttgttcagtagatgtatgcaccaaggatcacattgatttatgttgtgaaaattcaagaactgatttgatggtaatttcactaa 3152764  T
Q  152 tttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  3152763 tttggggatgaatgtgatggatagacatacaatagaagaaccaatttgattgaatttttttgacagaagggttgaattcattcattgacaacttctttt 3152665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 41041368 - 41041226
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  41041368 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacataaagcttgaagatgaagaccgac 41041269  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  41041268 tgttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccacccgtcatttc 41041226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 13283151 - 13283313
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13283151 ttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttgagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 13283250  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13283251 tgtg-----aaaattcaaggacctatttgatcgtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 13283313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 473 - 611
Target Start/End: Original strand, 22273338 - 22273475
Alignment:
Q  473 agtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgtta 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  22273338 agtgttggtttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttg 22273437  T
Q  573 tagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  22273438 tagttgtttttg-cccatccgcccaccacccaccatttc 22273475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 29237959 - 29238192
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||| | |||| | |    
T  29237959 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacaaatgatcaaattgatttctgttatga 29238058  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgaca 216  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||   | | |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  29238059 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgacggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgaca 29238158  T
Q  217 taagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
     || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  29238159 gaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 29238192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 470 - 610
Target Start/End: Original strand, 42942862 - 42943000
Alignment:
Q  470 gacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactg 569  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42942862 gacattgttggtttttcttacaacacaaattataggacaccaacattgaagctctctcacctcattattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactg 42942961  T
Q  570 ttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    || ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  42942962 ttgtagttgtttttg-cacatacgcccacca-ccatcattt 42943000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 468 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 40338456 - 40338353
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40338456 ttgacagtgttgacttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaaactctctcagctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagactgac 40338357  T
Q  568 tgtt 571  Q
    ||||    
T  40338356 tgtt 40338353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 35510181 - 35510338
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||| | |    
T  35510181 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggaccacattgatatctgttatga 35510280  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35510281 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 35510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33761818 - 33761661
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | |    
T  33761818 atgcaaatgtttgtccttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgtttagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 33761719  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33761718 taattcaatgaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 33761661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 323 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41041464 - 41041367
Alignment:
Q  323 acacaaaaattt-acaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41041464 acacaaaaattttacaattttcaccgtcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 41041367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 600984 - 600827
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | |||| | |||| | |    
T  600984 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttctcttttactttttactttattcagcaaatgtatgcacaaaggatcaaattgatttctgttatga 600885  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  600884 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgacggata 600827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 327 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9672175 - 9672095
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcac 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9672175 aaaaatttacaattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcac 9672095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 15307058 - 15307290
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  || || ||||| | |||| | |||| | |    
T  15307058 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttt-actttgttcagcaaatatatgtacaaatgatcaaattgatttctgttatga 15307156  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgaca 216  Q
     |||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   | | |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  15307157 taattcaaggaccaatttgatggtttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgaca 15307256  T
Q  217 taagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
     || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  15307257 gaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 15307290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 15487427 - 15487659
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  || || ||||| | |||| | |||| | |    
T  15487427 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttt-actttgttcagcaaatatatgtacaaatgatcaaattgatttctgttatga 15487525  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgaca 216  Q
     |||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   | | |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  15487526 taattcaaggaccaatttgatggtttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgaca 15487625  T
Q  217 taagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
     || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  15487626 gaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 15487659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27405501 - 27405269
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||| | |||| | |||| | |    
T  27405501 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatga 27405403  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgaca 216  Q
     |||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   | | |||  |||||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  27405402 taattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgaca 27405303  T
Q  217 taagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
     || ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  27405302 gaaaggtttgattcattcattgacaacctttttt 27405269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 40338547 - 40338455
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  40338547 aaaaaattacaatttttaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacgcatcacataatcattgtt 40338455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13485477 - 13485351
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||    |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  13485477 ttatgatggtatgcaaatgtctgt-tttttataatcaaagtgtttgtcttctactttttactt----cagcaaatgtatgcctcaaggatcacagtgata 13485383  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg 139  Q
    | |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  13485382 tctgttgtgaaaattgaaggacctatttgatg 13485351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 33369449 - 33369333
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369449 gttaaacaaacatttgtcatagggcaagcatagaatgaccttcctggtttttttacagtattggttttactaacaacacaaattctaggacaccaacatt 33369350  T
Q  517 gaagctctctcacatca 533  Q
     |||| |||||||||||    
T  33369349 caagcgctctcacatca 33369333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11720697 - 11720502
Alignment:
Q  57 tttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-ta-ttttcactaattt 154  Q
    |||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||  |||| ||  |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  11720697 tttactttttactttgttcaacacatatatgcaccaaggatcacattgtcatatttttaaaaacttcaaggacttatttgatgatatttttcactaatgt 11720598  T
Q  155 ggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
     || |||||| ||||  |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||  ||||||| |||  |||||||||||    
T  11720597 aggaatcgatttgatatatagacaaacaatttaaggaccaatttgatggaaagattttgacaaaatggttgcattcattcattttcaacctctttt 11720502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 438 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 25705761 - 25705666
Alignment:
Q  438 gggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatca 533  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  25705761 gggcaagcatagaaaggccttcctgggtttttcacagtattggcttttcttacaacacaaaatctaggacaccaacagtcaagtactctcacatca 25705666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 611
Target Start/End: Original strand, 29693813 - 29693903
Alignment:
Q  518 aagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  29693813 aagcactctcacatcaccattgtacatagagcttgaagatgaagactgactgttgtagctgttttt--cccatacgtccacca-ccatcatttc 29693903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 533 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 13485105 - 13485028
Alignment:
Q  533 atcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13485105 atcattgtacgtagagcttgaagatgaagactgactgttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccacccatcatttc 13485028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 530
Target Start/End: Original strand, 31822900 - 31823001
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31822900 tttggcagagggcaagcatagaatggccttcctgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattgtaggacaccaacattcaagcactctca 31822999  T
Q  529 ca 530  Q
    ||    
T  31823000 ca 31823001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 25370997 - 25370893
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||    
T  25370997 tttggcatagggcaagcatagaaaggccttcctgagtttttcactgtattgacttttcttacaacacaaattctagaacaccaacagtcaagtactctca 25370898  T
Q  529 catca 533  Q
    |||||    
T  25370897 catca 25370893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 33749010 - 33748909
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | ||||| || ||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33749010 tttggcagagggcaagcatagaatggccttcatgagttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattgtaggacaccaacattcaagcactctca 33748911  T
Q  529 ca 530  Q
    ||    
T  33748910 ca 33748909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 533
Target Start/End: Original strand, 25371590 - 25371638
Alignment:
Q  485 tcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatca 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  25371590 tcttacaacacaaattctaggacaccaatattcaagcactctcacatca 25371638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 495 - 587
Target Start/End: Original strand, 11790308 - 11790400
Alignment:
Q  495 caaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||   | ||||| |||||||||||| || |||| | ||| | ||||||||||    
T  11790308 caaattctaggacaccaacattcaagtactctcacatcaccattcaagatagagcttgaagatgaataccgactttgataaccgtttttgccc 11790400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Original strand, 9186178 - 9186256
Alignment:
Q  61 ttttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg 139  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| |  ||||||||| | ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  9186178 ttttttactttgttctgcacatatatgcttcaaggatcaaattgatatatgattaaataattcaaggacttatttgatg 9186256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 42895386 - 42895333
Alignment:
Q  477 ttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcaca 530  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  42895386 ttggattttctaacaacccaaattctagaacaccaacattcaagcactctcaca 42895333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 327 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 39663939 - 39663656
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39663939 aaaaatttacaattttcactatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcgcacatcacataaccattgttaaacaaa 39663840  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39663839 cttttggcagagggcagacatagaaaggccttcctagattattgacggtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 39663740  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  39663739 cacctcatcgttgtacatagagcttgaagatgaagactgactgttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccactcatcatttc 39663656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 328 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19581963 - 19581735
Alignment:
Q  328 aaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaat 427  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19581963 aaaaattataattttcaccatcatcctacacaattaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccattcacacatcgcataaccattgttaaacaaac 19581864  T
Q  428 atttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctc 527  Q
     |||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19581863 ctttggcagagggaagacatagaaaggtcttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaatacaaattctaggacgccaacattgaagctctctc 19581764  T
Q  528 acatcatcatcgtacatagaacttgaaga 556  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19581763 acatcatcattgtacatagagcttgaaga 19581735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 327 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 6784162 - 6783929
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6784162 aaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 6784063  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6784062 ccttatgcagagggcaaacatagaaaagccttcctgagttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 6783963  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaa 560  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6783962 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaa 6783929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14388471 - 14388228
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14388471 ttatgatggtatgcaaatgtctgtttttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 14388372  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| ||||||||||||     
T  14388371 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatagtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaag 14388272  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  14388271 tttttttacataaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 14388228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 6798280 - 6798523
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6798280 ttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcatcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 6798379  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||   | ||||| ||||||| ||||||||||||     
T  6798380 tctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatttgatgaatatgtatacaattgaaggaccaatttgattgaat 6798479  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  6798480 ttttttgacagaaaggtttgactcattcattgacaacctctttt 6798523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19907648 - 19907405
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19907648 ttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaatgatcacagtgata 19907549  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  19907548 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggtattttcactcatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 19907449  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  19907448 ttttttgacagaatggtttgattcattcattgataacctctttt 19907405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 2767688 - 2767931
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2767688 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagagtttgtcttttactttttactttgttcagaaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 2767787  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | | |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| ||||||||||||     
T  2767788 tctattgtgaaaattcaaggaccaatttgatggtattttcactaaattgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaat 2767887  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2767888 ttttttgacataaaggttttattcattcattgacaacctctttt 2767931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 40560999 - 40561242
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40560999 ttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatggcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacattgata 40561098  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || | |||  |||||| ||||| |||||||    
T  40561099 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatgtgcatataatttaaggaccaatttaattgaaa 40561198  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  40561199 ttttttaacaaaaaggtttgattcattcattgacaacatctttt 40561242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 327 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 24206405 - 24206174
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24206405 aaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaataaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 24206306  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| ||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24206305 ccttatgcagagggcaagtatagaaaagccttcctgagttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaattctagg--accaacattgaagctctct 24206208  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaa 560  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24206207 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaa 24206174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 16763720 - 16763963
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16763720 ttatgatagtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctatcttttactttttactctgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 16763819  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | ||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || | |||  |||||| ||| ||||||||     
T  16763820 tctgttgtgtaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaat 16763919  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  16763920 ttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 16763963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 17696981 - 17697224
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  17696981 ttatgatggtatgcaaatatctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttctactttttactttgttcaacaaatgtatccaccaaggatcatagtgatg 17697080  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| | |||||||||||    
T  17697081 tatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcaccaattttaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccagtttgattgaaa 17697180  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  17697181 ttttttgacagaaaggtttgattcattcgttgacaacctctttt 17697224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39664150 - 39663994
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39664150 ttatgatggtatgcagatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 39664051  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcga 163  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39664050 tatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcga 39663994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 39455934 - 39456176
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39455934 ttatgatggtatacaaatgtctgtctttttataatcaaagt-tctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcatagtgata 39456032  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||  || | |||  || ||| ||||||||||||     
T  39456033 tctgttgtgaaaatttaaggacctatttgatgatattttcactcatttgagaatcaatatgatgaatatgcatataattcaatgaccaatttgattgaat 39456132  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  39456133 ttttttgacaaaagggtttgattcattcattgacaacctctttt 39456176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 401 - 587
Target Start/End: Original strand, 37021511 - 37021697
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37021511 acatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaatt 37021610  T
Q  501 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  37021611 ctaggacaccaacattgaagctctcccacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 37021697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 468 - 610
Target Start/End: Original strand, 17697567 - 17697708
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  17697567 ttgacagtgttggcttttctgacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagatcgac 17697666  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  17697667 tgttgtagttgtttttg-cccatacgtccaccacccatcattt 17697708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 327 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 44708696 - 44708543
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44708696 aaaaatttacaattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 44708597  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttgg 480  Q
      |||| ||| ||| | |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44708596 cctttgacagagggtagacatagaaatgccttcctggattattgacaatgttgg 44708543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Original strand, 2768274 - 2768416
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  2768274 ttgatagtgttggctttttttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgac 2768373  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  2768374 tgttgtagttgtttttg-cccatacgtccaccactcatcatttc 2768416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 34400966 - 34400824
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  34400966 ttgacagtgttggcttttcttaaaacacgaattctaagacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgac 34400867  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  34400866 tgttgtagttgtttttg-cctatacgctcaccacccatcatttc 34400824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 468 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 42518213 - 42518072
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  42518213 ttgacagtgttggcttttcttacaacaaaaattttaggacaccaacattaaagctctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaaggccgac 42518114  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  42518113 tgttgtagttgtttttg-cccatatgcccaccacccatcattt 42518072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Original strand, 6798866 - 6799008
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||    
T  6798866 ttgatagtgttgtcttttcttacaacacaaattttaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacacagagcttaaagatgaagaccgac 6798965  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6798966 tgttgtaattgtttttg-cccatacgcccaccacccatcatttc 6799008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44709126 - 44708996
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44709126 ttatgatggtatgcaaatgtctgcatttttataatcaaagtgtctgtctttgactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 44709027  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat 138  Q
    | |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  44709026 tctgttgtgaaaattcaaggaccaatttgat 44708996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 470 - 587
Target Start/End: Original strand, 40561312 - 40561429
Alignment:
Q  470 gacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactg 569  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || || ||    
T  40561312 gacaatgttggtttttcttacaacacaaattataggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagctcgaagatgaataccgattg 40561411  T
Q  570 ttatagctgtttttgccc 587  Q
    || ||| |||||||||||    
T  40561412 ttgtagttgtttttgccc 40561429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Original strand, 2768183 - 2768275
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2768183 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatataatcaaaagacaaaaccagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 2768275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 323 - 419
Target Start/End: Original strand, 6798770 - 6798867
Alignment:
Q  323 acacaaaa-atttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  6798770 acacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccgttgtt 6798867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24206900 - 24206665
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||| | |||| | |||| |||    
T  24206900 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaattgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttataa 24206801  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgatg---tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttga 214  Q
     |||||||||||  ||||||||   | |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   | | |||  |||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  24206800 taattcaaggaccaatttgatgatttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttga 24206701  T
Q  215 cataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    || || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24206700 cagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 24206665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 42518602 - 42518521
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtataca 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42518602 ttatgatggtatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtataca 42518521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 42518302 - 42518212
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42518302 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagac--aatcagtactatttaaacaaatcattcacgcatcacataaccattgtt 42518212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6784648 - 6784414
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   | |||||||  | |||| | |||| | |    
T  6784648 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacttttgactttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatccaattgatttctgttatga 6784549  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgatg--tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgac 215  Q
     |||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||   |||||| ||||||||||   | | |||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  6784548 taattcaaggaccaatttgatgtttttttttactaatttaaagatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgac 6784449  T
Q  216 ataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6784448 agaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 6784414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34401057 - 34400965
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  34401057 aaaaatttacaactttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatatgtactatttaaacaaattattcacacatcacataactattgtt 34400965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 395 - 485
Target Start/End: Original strand, 31471007 - 31471097
Alignment:
Q  395 attcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggctttt 485  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31471007 attcaaacatcacataaccattgttaaacaaacctttggcagagggcagacatagaaaggcattcctgtgttattgatagtgttggctttt 31471097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Original strand, 17697476 - 17697568
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17697476 aaaaatctacaattttcacaaatatattatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 17697568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 10715766 - 10715665
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    |||| ||| |||||| |||| ||||||||| || |||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  10715766 tttgccagagggcaagcatataaagacctttctaggttgtggagagtgttggcttttcttgcagcacaaattctacgacaccaacattcaagcactctca 10715667  T
Q  529 ca 530  Q
    ||    
T  10715666 ca 10715665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 19907310 - 19907231
Alignment:
Q  531 tcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  19907310 tcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgaagttgtttttg-cccatacgcccaccactcatcatttc 19907231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44709010 - 44708948
Alignment:
Q  187 aaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  44709010 aaggaccaatttgattgaaatttttt-acataagggtttgattcattcattgacaacctctttt 44708948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 114
Target Start/End: Original strand, 37646219 - 37646296
Alignment:
Q  38 accatcaaagtgtatgtctttt-attttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttg 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | | ||||||||    
T  37646219 accatcaaagtgcatgtctttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaagatcacattaagatatgttg 37646296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34401372 - 34401309
Alignment:
Q  187 aaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  34401372 aaggaccaatttgattgaaattttttaacaaaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 34401309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14387968 - 14387923
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaa 372  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  14387968 aaaaatttacaattttcacaatcatcctgtacaatcaaaagacaaa 14387923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 477 - 530
Target Start/End: Original strand, 37418230 - 37418283
Alignment:
Q  477 ttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcaca 530  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  37418230 ttggattttctaacaacacaaattctagaacaccaacattcaagcactctcaca 37418283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Original strand, 161215 - 161293
Alignment:
Q  61 ttttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg 139  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||  ||| || ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  161215 ttttttactttgttatgcacatatatgcaccaaggatcacgttgacatctgtttaaataattcaaggacttatttgatg 161293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 35896 - 35855
Alignment:
Q  489 acaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcaca 530  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35896 acaacacaaattgtaggacaccaacattcaagcactctcaca 35855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 323 - 611
Target Start/End: Original strand, 54387196 - 54387477
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||| ||||||    
T  54387196 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaaaccat------atcacataaccatcgttaaa 54387289  T
Q  423 caaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 522  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54387290 caaacatttggcatagggcagacatagaaaggtcttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 54387389  T
Q  523 ctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54387390 ctctcacatcattattatacatagagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccacccatcatttc 54387477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48646114 - 48645873
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48646114 ttatgatggtatgcaaatgtct--ctttttacaatcaaagtatttgtcttttactttttactttattcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 48646017  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  48646016 tatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaaa 48645917  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48645916 ttttttgacagaagggttaaattcatttattgacaacctctttt 48645873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 54386896 - 54387139
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  54386896 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagaattgcagtgata 54386995  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54386996 tatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatttggggatcgatatgatggagagacatacaatcgaaggaccaatttgattgaaa 54387095  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54387096 ttttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctctttt 54387139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2692655 - 2692412
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  2692655 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgaaccaaggatcacaatgata 2692556  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2692555 tatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgatggaaa 2692456  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  2692455 ttttttgacagaaggattgaattcattcgttgacaacctctttt 2692412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 327 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 35402542 - 35402262
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35402542 aaaaatttacaattttcaccatcatcctata---tcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattgacacatcacatgaccattgttaaacaaa 35402446  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| |||||  |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  35402445 cctttggcagagggcaggcatagaaaggtcttcctaggttattgatagtgttgacttttcttacaacacaaattcttggacaccaacatcgaagctcttt 35402346  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  35402345 cacctcatcattgtacatagaacttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccatacgtccaccacccatcatttc 35402262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 325 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 48645814 - 48645578
Alignment:
Q  325 acaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgt------ 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||          
T  48645814 acaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaaggcaaaatcagtactattttaacaaatcattcacacatcgcataaccattgtccattg 48645715  T
Q  419 -taaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattg 517  Q
     ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48645714 ttaaacaaacttttggcagagggcagacatagaaagaccttcctgggttattggcagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattg 48645615  T
Q  518 aagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48645614 aagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaa 48645578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35403037 - 35402794
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35403037 ttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtctgtcgtttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 35402938  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  ||| || |||||||||||||    
T  35402937 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagaaccaatttgattgaaa 35402838  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  35402837 ttttttgacataagggtttgattcattcattgacaacctctttt 35402794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 49523887 - 49524130
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  49523887 ttatgatggtatgcaaatgtctgtgtttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagttata 49523986  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  || ||| |||||||||||||    
T  49523987 tttgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaatgaccaatttgattgaaa 49524086  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  49524087 tattttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctctttt 49524130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Original strand, 51013177 - 51013437
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  51013177 aaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataatcattgttaaacaaa 51013276  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      ||  |||| ||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013277 ccttatgcagagggcaagtatagaaaggcctttatgggttattgacagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 51013376  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  51013377 tacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 51013437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 834034 - 833771
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatca---aaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaac 423  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  834034 aaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaac 833935  T
Q  424 aaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctc 523  Q
    |||  ||  |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  833934 aaaccttatgcagagggcaagcatagaaaagccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctc 833835  T
Q  524 tctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  833834 tctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 833771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 327 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 2692160 - 2691878
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||  ||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2692160 aaaaattgacaattttcaccgtcgtcctatacaaagaaaattcaaaatcagtacaatttaaacaaaccattcacacatcacataatcattgttaaacaaa 2692061  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  2692060 cctttggcagagggaagacataaaaaggccttcctggattattaacaatgttggcttttcttacaacacaaattctatgacaccaacattgaagc-atct 2691962  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2691961 cacatcacgattgtacatagagcttgaagatgaagatggactgttgtagttatttttg-cccatacgcccaccacccatcatttc 2691878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41761096 - 41760853
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41761096 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 41760997  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | || | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  41760996 tctggtatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 41760897  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||| || || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  41760896 ttttttgccagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 41760853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 42981375 - 42981618
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42981375 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 42981474  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  42981475 cctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttaaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 42981574  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  42981575 ttttttgacagaaaggtttgattcattcatcgacaacctctttt 42981618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11255299 - 11255056
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  11255299 ttatgatggtatgcaaatatctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgctcagcaaatgtatgcactaatgatcacagtgata 11255200  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  || ||  |||||||||||||    
T  11255199 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaacgatcaatttgattgaaa 11255100  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  11255099 ttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 11255056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Original strand, 5438925 - 5439188
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatca---aaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaac 423  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  |||| |||||   ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  5438925 aaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaatatttatacatcaaataaccattgttaaac 5439024  T
Q  424 aaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctc 523  Q
    |||  ||  |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5439025 aaaccttatgcagagggcaagcatagaaaagccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctc 5439124  T
Q  524 tctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  5439125 tctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 5439188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 43520193 - 43520436
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43520193 ttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 43520292  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  43520293 tctgttgtgaaaattcaaggatctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 43520392  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    | |||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  43520393 tattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctctttt 43520436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Original strand, 11640838 - 11641053
Alignment:
Q  41 atcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttga-tg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  11640838 atcaaagtgtatgttttttactttttactttgttcagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattgaacgacttatttgattg 11640937  T
Q  140 tattttcactaatttggggatc-----gatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcattt 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||     
T  11640938 tattttcactaatttggagatcgatatgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgatggaaatattttgacagaatggttgaattcattc 11641037  T
Q  235 attgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||| ||||||    
T  11641038 attgacaacatctttt 11641053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 327 - 587
Target Start/End: Original strand, 11641339 - 11641602
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11641339 aaaaattgacaattttcaccatcatcctatacaaagaaaattcaaaatcagtacaatttaaaaaaaccattcacacatcacataaccattgttaaataaa 11641438  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||| ||| ||| | ||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  11641439 cctttgacagagggaagacatagaaaggtcttcttggattattgatagtgttggcttttcttacaacacaaattctatgacaccaacattgaagtactct 11641538  T
Q  527 cac---atcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    |||   |||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  11641539 cacatgatcaccattgtacatagagcttgaagaagaagactgactgtcgtagttgttcttgccc 11641602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 51012682 - 51012925
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  51012682 ttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcgcagtaata 51012781  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  || | |||  |||||| ||| ||||||||     
T  51012782 tctgttgtgaaaatttaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggattgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaat 51012881  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||| | || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  51012882 ttttttgatagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 51012925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 468 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 11254714 - 11254573
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  11254714 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacatagagcctgaagatgaagaccgac 11254615  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    |||| ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  11254614 tgttgtagttgtttctg-cccatacgcccaccacccatcattt 11254573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Original strand, 11602432 - 11602562
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11602432 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtttagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgata 11602531  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat 138  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  11602532 tatgttgtgaaaattgaacgacttatttgat 11602562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 41782277 - 41782444
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41782277 ttatgatagtgtgcatatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacggtgata 41782376  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41782377 tctgttgtgaaaaatcaaggaccaatttgatgatattttcactaatttgaggattgatatgatggata 41782444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Original strand, 42981936 - 42982078
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  42981936 ttgacagtgttggctttccttacaaaacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaagaccgac 42982035  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||||||||| || |||||||    
T  42982036 tgttgtagttgtttttg-ctcatacgcccaccacccgtcatttc 42982078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 320021 - 319864
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | |    
T  320021 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 319922  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  319921 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 319864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4172861 - 4172704
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | |    
T  4172861 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 4172762  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4172761 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 4172704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 33265350 - 33265507
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | |    
T  33265350 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatga 33265449  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33265450 taattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 33265507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 468 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41760383 - 41760268
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||    
T  41760383 ttgacagtgttggattttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacatagaggttgaagatgaagaccgac 41760284  T
Q  568 tgttatagctgttttt 583  Q
    || | ||| |||||||    
T  41760283 tgctgtagttgttttt 41760268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 43507993 - 43508150
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | |    
T  43507993 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatttgttatga 43508092  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
     |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43508093 taattcaaggaccaatttgatggtatcttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 43508150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41760474 - 41760382
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41760474 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 41760382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 11254805 - 11254713
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  11254805 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataatcattgtt 11254713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 327 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28101356 - 28101121
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | || ||  ||||  || ||||||||  | || ||||| ||||||  |||||||| ||  || ||||||||||    
T  28101356 aaaaattcacaattttcaacatcatcttgtacaaagaaaattcagaatcagtagaagttaaacaaaccattctgacatcacacaataatggttaaacaaa 28101257  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||    
T  28101256 cttttggcagagggcaaacatagaaataccttcctggatttttgatagtagtggctttttttacatcacaaattctgggacaccaatattcaagcaccct 28101157  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaaga 562  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  28101156 cacatcaccattatacatagagcttgaagatgaaga 28101121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 52867503 - 52867416
Alignment:
Q  42 tcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggac 129  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  52867503 tcaaagtgtctgtcttctactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggac 52867416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Original strand, 42981845 - 42981937
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42981845 aaaaatttacaatttttaccttcatcctgtacaatcaaaaggcaaaatcagtactatttaaataaatcattcacacatcacataaccattgtt 42981937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 401 - 516
Target Start/End: Original strand, 10544380 - 10544495
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  10544380 acatctcataaccattgttaaataaatatttggcaaatggtaagcatagaaagaccttcctggatttttgagagtattgacttttcttaccacacaaatt 10544479  T
Q  501 ctaggacaccaacatt 516  Q
     | |||||||||||||    
T  10544480 atgggacaccaacatt 10544495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 834409 - 834181
Alignment:
Q  22 aaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaat 121  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||| | |||| | |||| | | |||    
T  834409 aaatgtttgtctttttatattcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataat 834311  T
Q  122 tcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataag 220  Q
    ||||||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   | | |||  |||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||     
T  834310 tcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaa 834211  T
Q  221 ggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  834210 ggtttgattcattcattgacaacctttttt 834181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 533
Target Start/End: Original strand, 27385841 - 27385969
Alignment:
Q  405 cacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctag 504  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||| | || ||||| | |    
T  27385841 cacataaccattattaaacaaacctttgatagagggcaaacatagaaagaccttcttaggtttttgacattattggcttttcttagagcataaattatgg 27385940  T
Q  505 gacaccaacattgaagctctctcacatca 533  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  27385941 gacaccaacattcaagtactctcacatca 27385969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 521
Target Start/End: Original strand, 4519884 - 4519976
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagc 521  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4519884 tttggcagagggcaagcatagaatgaccttcctgggttttttgaagtattggatcttctaacaacacaaattctaggacaccaacattcaagc 4519976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Original strand, 5438554 - 5438778
Alignment:
Q  22 aaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaat 121  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||| | |||| | |||| | | |||    
T  5438554 aaatgtttgtctttttatattcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataat 5438652  T
Q  122 tcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataag 220  Q
    ||||||    |||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   | | |||  |||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||     
T  5438653 tcaagg----atttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaa 5438748  T
Q  221 ggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5438749 ggtttgattcattcattgacaacctttttt 5438778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 327 - 599
Target Start/End: Original strand, 806 - 1077
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  806 aaaaatttacaattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataacctttgttaaacaaa 905  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  906 cctttggcagagggcagacatagaaaggctttcttgggttattgatagtgttggcttttcttacaacacaaattctatgacaccaacattgaagctctct 1005  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccacc 599  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1006 cacctcatcattgtacatagagcttgaagatgaacaccgactgttgtagttgtttttg-cccatacgcccacc 1077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 320 - 551
Alignment:
Q  11 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  320 tgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgttcggcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatct 419  T
Q  111 gttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattt 209  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||         || | |||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  420 gttgtgaaaattcaaggacctgtttgatggtatttttactaatttgaggatcgatatg---------catataattcaaggaccaatttgattgaaactt 510  T
Q  210 tttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  511 tttgacataagggtttgattcattcattgaccacctctttt 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 327 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 107461 - 107178
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  107461 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccactgttaaacaaa 107362  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  107361 cctttggcagagggcatgcatagaaaggccttcctgggttattgacaatgttgaattttcttacaacacaaattttaggacaccaacattgaagctctct 107262  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||  ||||||| || ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||    
T  107261 cacatcatcattgtacattgagtttgaagatgaagatcgactgttgtaactgtttttg-cacgtacgcccaccacccatcatttc 107178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 107954 - 107712
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  107954 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaatgatcacagtgatt 107855  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  107854 tatattgtgaaaatttaaggacttatttgatggtattttcactaatttagggatcgatatgatggatagacatacaatagaatgaccaatttgattgaaa 107755  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  107754 ttttttgacagaagggtt-gattcattcattgacaacctttttt 107712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 327 - 585
Target Start/End: Original strand, 2181021 - 2181279
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2181021 aaaaatttacaattttcaccatcatcttatgcaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaataaaccattcggacatcacataaccattgttaaacaaa 2181120  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      |||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181121 cctttggcagagggcaggcatagaaaggccttcctgcgttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 2181220  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgc 585  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  2181221 cacctcatcattgtacatagatcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttgc 2181279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 327 - 560
Target Start/End: Original strand, 21842252 - 21842485
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21842252 aaaaatttacaattttcacagttatcctatacaatcaaaagataaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaa 21842351  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
    | ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21842352 tcttatgcagagggcaagcatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttagctattcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 21842451  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaa 560  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21842452 cacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaa 21842485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 2180530 - 2180772
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2180530 ttatgatggtatgcaaa-gtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaggatcacagtgata 2180628  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  2180629 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 2180728  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2180729 ttttttgacacaagggtttgattcattcattgacaacctctttt 2180772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 323 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 42472362 - 42472124
Alignment:
Q  323 acacaaaaat-ttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaa 421  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  42472362 acacaaaaatattacagttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaa 42472263  T
Q  422 acaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagc 521  Q
    |||||  ||  |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472262 acaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaagccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagc 42472163  T
Q  522 tctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaa 560  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42472162 tctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaa 42472124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 8540426 - 8540669
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  8540426 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatttatgcaccaaggatcacaatgata 8540525  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||  |||||||||||||    
T  8540526 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaatttgattgaaa 8540625  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  8540626 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctatttt 8540669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30465006 - 30464763
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30465006 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttatagtcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaggatcacagtgata 30464907  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  30464906 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaattttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 30464807  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  30464806 ttttttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctctttt 30464763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32135199 - 32134960
Alignment:
Q  12 gatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatg 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |    
T  32135199 gatgttatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatctccg 32135100  T
Q  112 ttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaatttt 210  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  32135099 ttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaatttt 32135000  T
Q  211 ttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  32134999 ttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 32134960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 327 - 585
Target Start/End: Original strand, 17575186 - 17575443
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  17575186 aaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaatcattcatacatcaaataaccattgttaaacaac 17575285  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      | || ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17575286 cttatg-cagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaccaacatggaagctctct 17575384  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgc 585  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || || |||| ||| |||||||||    
T  17575385 cacatcatcattgtacatagagcttgaagataaataccgattgttgtagttgtttttgc 17575443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 323 - 557
Target Start/End: Original strand, 17575902 - 17576135
Alignment:
Q  323 acacaaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17575902 acacaaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaatcattcatacatcaaataaccattgttaaa 17576001  T
Q  423 caaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagct 522  Q
    |||   | || ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17576002 caaccttatg-cagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaccaacatggaagct 17576100  T
Q  523 ctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagat 557  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17576101 ctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagat 17576135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 327 - 585
Target Start/End: Original strand, 17577217 - 17577474
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  17577217 aaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataatttaaacaaatcattcatacatcaaataaccattgttaaacaac 17577316  T
Q  427 tatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctct 526  Q
      | || ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17577317 cttatg-cagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctgttcttacaacacaaattctaggacaccaacatggaagctctct 17577415  T
Q  527 cacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgc 585  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || || |||| ||| |||||||||    
T  17577416 cacatcatcattgtacatagagcttgaagataaataccgattgttgtagttgtttttgc 17577474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 12800683 - 12800926
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12800683 ttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataattaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 12800782  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  12800783 tctgttgtgaaaattcaatgacctatttggtggtattttcactaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 12800882  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  12800883 ttttttgacagaatggtttgattcattcattgacaacctctttt 12800926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 12737860 - 12738103
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12737860 ttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataattaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 12737959  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  || | |||  |||||| |||||||||||||    
T  12737960 tctgttgtgaaaattcaatgacctatttggtggtattttcactaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaa 12738059  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  12738060 ttttttgacagaatggtttgattcattcatcgacaacctctttt 12738103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 387 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 30464679 - 30464456
Alignment:
Q  387 aacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttc 486  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30464679 aacaaaccatttacacatcacataaccattgttaaacaaacctttggcagagggaagatatagaaaggccttccttggttattgacagtgttggcttctc 30464580  T
Q  487 ttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgcc 586  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||| |    
T  30464579 ttacaacacaaattctaggtcagcaacattgaagctctctcaccttatcattgtacatagagcttgaagatgaagactgactattgtagttttttttg-c 30464481  T
Q  587 ccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  30464480 ccatacgcccactacccatcatttc 30464456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 21841756 - 21841999
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  21841756 ttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttcttcagcaaatgtatgcactaagaatcacagtgata 21841855  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || | |||  |||||| ||| ||||||||     
T  21841856 tctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaat 21841955  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21841956 ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 21841999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 7268600 - 7268767
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7268600 ttatgatggtatgtaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 7268699  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7268700 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgttattttcactaatttgaggatcgaaatgatggata 7268767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2853637 - 2853402
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2853637 ttatgataatatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 2853538  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   | | |||  |||||| ||||| |||||||    
T  2853537 tctgttgtgaaaattcaaagacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttcattgaaa 2853438  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaa 242  Q
    | ||||||||||| ||||   |||||| ||||||||    
T  2853437 tattttgacataaaggtttggttcattcattgacaa 2853402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 29620902 - 29620716
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29620902 acatcaaataacctttgttaaacaaaacttatgcagagggcaagcatagaaaggccttcctgggttattgacagtgtttgctcttcttacaacacaaatt 29620803  T
Q  501 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  29620802 ctaggacaccaacattgaaactctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 29620716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 587
Target Start/End: Original strand, 40781553 - 40781739
Alignment:
Q  401 acatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaatt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  40781553 acatcaaataaccattgttaaacaaaccttatgcagagggcaagcatagaaaggtcttcctgggttattgacaatgtttgctcttcttacaacacaaatt 40781652  T
Q  501 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||    
T  40781653 ctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaataccggttgttgtagttgtttttgccc 40781739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 28821135 - 28821302
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  28821135 ttatgatgatatgcaaatatctgtctttttataatcaaaatgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaagatcacagtgata 28821234  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggata 174  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28821235 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgttattttcactaatttgaggatcgatatgatggata 28821302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 362 - 587
Target Start/End: Original strand, 7268782 - 7269006
Alignment:
Q  362 caaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcct 461  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||| | |||||||    
T  7268782 caaaaggcaaaatcagtataatttaaacaaaacattcatacatcaaataaccattgttaaacaaaccttaagcagagggcaagcatagaagggccttcct 7268881  T
Q  462 gggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaag 561  Q
     |||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  7268882 aggttattgacagtgtttgttgttcttacaac-caaattataggacatcaacattgaagctctctcacatcatcattgtacatagagcttgaagatgaat 7268980  T
Q  562 actgactgttatagctgtttttgccc 587  Q
    || |  |||| ||| |||||||||||    
T  7268981 accggttgttgtagttgtttttgccc 7269006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41494741 - 41494568
Alignment:
Q  78 caaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggataga 176  Q
    ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41494741 caaatatatgcactaaggattacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggaattatttgatggtattttcacaaatttggggatcaatatgatggataga 41494642  T
Q  177 caaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41494641 catacaatagaaggaccaatttgatggaaagattttgataaaagggttgaattcattcattgacaacctctttt 41494568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24540560 - 24540429
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24540560 ttatgatggtatgaaaatgtatgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 24540461  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg 139  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24540460 tatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatg 24540429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Original strand, 34328264 - 34328406
Alignment:
Q  468 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||    
T  34328264 ttgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacacaaagcttgaagatgaagaccgac 34328363  T
Q  568 tgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  34328364 tgttgtagttgtttttg-tccatacgcccaccacccatcatttc 34328406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 464 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 41494494 - 41494348
Alignment:
Q  464 gttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagac 563  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41494494 gttattgacagtgttggtttttcttacaacacaaattctatgacaccaacattgaagcactctcacatcaccattgtacatagaacttgaagatgaagac 41494395  T
Q  564 tgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
      |||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  41494394 ccactgttgtagctgttttt-acccatacgtccaccacccatcatttc 41494348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 327 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18624189 - 18624094
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgttaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18624189 aaaaatttacaattttcactatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtactatttaaacaaaccattcacacatcacataaccattgttaaa 18624094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Original strand, 8540739 - 8540877
Alignment:
Q  470 gacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactg 569  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  8540739 gacagtgttggtttttcgtacaacaca--ttctatgacaccaacattgaagctctctcacctcatcattgtacataaagcttgaagatgaagactaactg 8540836  T
Q  570 ttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8540837 ttgtagttgtttttg-cccatacgcccaccgcccatcatttc 8540877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 482 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 18624087 - 18623959
Alignment:
Q  482 ttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgttt 581  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  18624087 ttttcttacaacacaaattataggacaccaacattgaagctctctcacatcttcattatacatagggcttgaagatgaagaccgactattgtagttgttt 18623988  T
Q  582 ttgccccatacgcccaccatccatcatttc 611  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  18623987 ttg-cccatacgcccactacccatcatttc 18623959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 475 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 32134885 - 32134751
Alignment:
Q  475 tgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttata 574  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||    
T  32134885 tgttgacttttcttacaacacaaattctaggacaccattgttgaagctctctcacctcatcattgtacgtagagcttgaagatgaagaccgactattgta 32134786  T
Q  575 gctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  32134785 gttgtttttg-gccatacgcccaccacccatcattt 32134751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 323 - 419
Target Start/End: Original strand, 34328168 - 34328265
Alignment:
Q  323 acacaaaa-atttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34328168 acacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtattatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 34328265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 419
Target Start/End: Original strand, 28821644 - 28821736
Alignment:
Q  327 aaaaatttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagtactattttaacaacccattcacacatcacataaccattgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28821644 aaaaatttacaattttcaccatcatcctatgcaatcaatagacaaaatcagtactatttaaacaaatcattcacacatcacataaccattgtt 28821736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42472841 - 42472609
Alignment:
Q  18 atgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgatatatgttgtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||| | |||| | |||| | |    
T  42472841 atgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttatttttt-ctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatga 42472743  T
Q  118 aaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgaca 216  Q
     |||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   | | |||  |||||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  42472742 taattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgaca 42472643  T
Q  217 taagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
     || ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  42472642 gaaaggtttgattcattcattgacaacctttttt 42472609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 18727239 - 18727138
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||   ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18727239 tttggcagagggcaagcatagaacggccttcctggattttttgaagtattggattttctaacaacacaaattgtaggacaccaacattcaagcactctca 18727140  T
Q  529 ca 530  Q
    ||    
T  18727139 ca 18727138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 455 - 533
Target Start/End: Original strand, 40329955 - 40330033
Alignment:
Q  455 ccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatca 533  Q
    |||||||||||| ||   ||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40329955 ccttcctgggttttttgaagtattggattttttaacaacacaaattctaggacaccaacattcaagcactctcacatca 40330033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 611
Target Start/End: Original strand, 27076959 - 27077063
Alignment:
Q  506 acaccaacattgaagctctctcacatcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccat 605  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  27076959 acaccaacattcaagtactctcacatcaccattaaaaatagagcttgaagatgaagaccgactattatagttatttttg-cacatacgcccaccacccat 27077057  T
Q  606 catttc 611  Q
    ||||||    
T  27077058 catttc 27077063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 610
Target Start/End: Original strand, 12738198 - 12738276
Alignment:
Q  531 tcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||    
T  12738198 tcatcattgtacatatagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccatgcgcccaccactcatcattt 12738276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 610
Target Start/End: Original strand, 12801021 - 12801099
Alignment:
Q  531 tcatcatcgtacatagaacttgaagatgaagactgactgttatagctgtttttgccccatacgcccaccatccatcattt 610  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||    
T  12801021 tcatcattgtacatatagcttgaagatgaagaccgactgttgtagttgtttttg-cccatgcgcccaccactcatcattt 12801099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 429 - 530
Target Start/End: Original strand, 32089343 - 32089437
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||       |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32089343 tttggcagagggcaagcatagaatgaccttcctaggttttt-------ttggattttctaacaacacaaattgtaggacaccaacattcaagcactctca 32089435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 455 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 32836525 - 32836450
Alignment:
Q  455 ccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcaca 530  Q
    |||||||||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  32836525 ccttcctgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattctagaacaccaacattcaagcactctcaca 32836450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 429 - 530
Target Start/End: Original strand, 33257187 - 33257288
Alignment:
Q  429 tttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacattgaagctctctca 528  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | ||||||| | || ||   ||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33257187 tttggcagagggcaagcatagaatggccttcctagattttttgaagtattggattttctaataacacaaattgtaggacaccaacattcaagcactctca 33257286  T
Q  529 ca 530  Q
    ||    
T  33257287 ca 33257288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 35291729 - 35291615
Alignment:
Q  417 gttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||| ||||||| | ||||| |||| | || ||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35291729 gttaaacaaacctttgg-agagggcaagcatagaatggccttcatgggatttttacagtattga-ttttctaacgacacaaattctaggacaccaacatt 35291632  T
Q  517 gaagctctctcacatca 533  Q
     |||| || ||||||||    
T  35291631 caagcactatcacatca 35291615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 440 - 516
Target Start/End: Original strand, 35400145 - 35400221
Alignment:
Q  440 gcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctaggacaccaacatt 516  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  35400145 gcaagcatagaatggccttcctgggttttttgaagtattggattttctaacaacacaaattgtaggacaccaacatt 35400221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 521
Target Start/End: Original strand, 18341494 - 18341610
Alignment:
Q  405 cacataaccattgttaaacaaatatttggcagtgggcaaacatagaaagaccttcctgggttattgacagtgttggcttttcttacaacacaaattctag 504  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||| |  | |||| |||| |||| ||||| |||||| |||| |||  | | ||||||||||||| ||||| | |    
T  18341494 cacataaccattgttaaaaaaacctctggtaaagagcaagcatataaaggccttcttgggttcttgagagtactagattttcttacaacaaaaattatgg 18341593  T
Q  505 gacaccaacattgaagc 521  Q
    |||||||||||| ||||    
T  18341594 gacaccaacattcaagc 18341610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 43317340 - 43317300
Alignment:
Q  493 cacaaattctaggacaccaacattgaagctctctcacatca 533  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43317340 cacatattctaggacaccaacattcaagcactctcacatca 43317300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 9024 - 9267
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9024 ttatgatagtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcggcagatgtatgcaccaaggatcacagtgata 9123  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgat-gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||  |||||||||||||||||||     
T  9124 tctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggactaatttgattgaat 9223  T
Q  207 ttttttgacataagggttaaattcatttattgacaacctctttt 250  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  9224 ttttttgacataagggtttgattcattcattgacaacctctttt 9267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 4059 - 4268
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4059 ttatgatggtataaaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 4158  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  4159 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 4258  T
Q  207 ttttttgaca 216  Q
    | ||||||||    
T  4259 tattttgaca 4268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 5231 - 5440
Alignment:
Q  8 ttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttaccatcaaagtgtatgtcttttattttttactttgttcagcaaatgtatacaccaaggatcacagtgata 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5231 ttatgatggtataaaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgata 5330  T
Q  108 tatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatg-tattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaa 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||   | | |||  |||||| |||||||||||||    
T  5331 tctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaa 5430  T
Q  207 ttttttgaca 216  Q
    | ||||||||    
T  5431 tattttgaca 5440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1752 - 1658
Alignment:
Q  139 gtattttcactaatttggggatcgatatgatggatagacaaacaatagaaggactaatttgattgaaattttttgacataagggttaaattcatt 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | || |||| ||||||||    
T  1752 gtattttcactaatttggagatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgatggaaatattttgatagaatggttgaattcatt 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University