View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17092_high_21 (Length: 386)

Name: NF17092_high_21
Description: NF17092
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17092_high_21
NF17092_high_21
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (8-386)||(43745013-43745389)
chr8 (105-307)||(12528747-12528949)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (8-386)||(28220115-28220493)
chr5 (12-197)||(42555574-42555759)
chr5 (221-292)||(42555759-42555830)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (8-386)||(3147428-3147814)
chr7 (8-386)||(8585332-8585710)
chr7 (17-386)||(8667583-8667952)
chr7 (21-307)||(8628775-8629061)
chr7 (17-386)||(10494009-10494378)
chr7 (20-386)||(17268103-17268469)
chr7 (8-386)||(8647041-8647416)
chr7 (68-321)||(7877419-7877672)
chr7 (8-386)||(6789676-6790054)
chr7 (68-382)||(8602142-8602456)
chr7 (71-386)||(13333145-13333460)
chr7 (12-386)||(8659527-8659901)
chr7 (68-386)||(27830561-27830879)
chr7 (12-386)||(1301624-1302002)
chr7 (68-386)||(8382562-8382880)
chr7 (108-386)||(29581567-29581845)
chr7 (187-386)||(17260405-17260604)
chr7 (105-386)||(8570475-8570756)
chr7 (48-386)||(8654614-8654952)
chr7 (105-386)||(8576490-8576771)
chr7 (108-320)||(8636069-8636281)
chr7 (17-321)||(8671265-8671569)
chr7 (105-386)||(8581864-8582145)
chr7 (68-289)||(8590899-8591120)
chr7 (8-253)||(8640175-8640418)
chr7 (101-382)||(8559501-8559782)
chr7 (189-386)||(8610081-8610278)
chr7 (17-386)||(8545797-8546165)
chr7 (108-307)||(29577395-29577594)
chr7 (105-382)||(8538204-8538481)
chr7 (338-386)||(8590802-8590850)
chr7 (338-386)||(8628696-8628744)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (48-386)||(34466459-34466797)
chr1 (8-386)||(15595198-15595578)
chr1 (169-386)||(4678345-4678562)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (17-382)||(28910750-28911115)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (48-386)||(12234853-12235191)
chr2 (18-386)||(16657153-16657521)
chr2 (17-386)||(16661627-16661996)
chr2 (21-320)||(12245045-12245344)
chr2 (48-386)||(11999558-11999896)
chr2 (49-386)||(14703572-14703909)
chr2 (108-386)||(43625576-43625855)
chr2 (48-386)||(7542390-7542728)
chr2 (48-386)||(12258247-12258585)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (17-386)||(9335526-9335895)
chr4 (17-320)||(30775482-30775785)
chr4 (21-382)||(35132616-35132975)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43745389 - 43745013
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43745389 tgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 43745290  T
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43745289 gaaatctcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaattgcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 43745190  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43745189 atgattatcagcggaaagccac--tagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 43745092  T
Q  308 tctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43745091 tctggaaaagagaactaactctgtgcgaggaagaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 43745013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12528949 - 12528747
Alignment:
Q  105 gaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||| |  | |  ||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||    
T  12528949 gaagaaatatcctctatgattctatcacagatgcgagagattgcagatgcatttcttgagtcacctgttaagaatgcagtgattacggtgccagcgtatt 12528850  T
Q  205 tcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcata 304  Q
    |||||||||  |||||   ||||||    |||||||||| ||||||||| ||  |||| ||   ||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||    
T  12528849 tcaatgattcgcagcgacgagccaccaaggatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatacggataatcaacgaaccaactgcagctgctcttgcata 12528750  T
Q  305 tgg 307  Q
    |||    
T  12528749 tgg 12528747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28220493 - 28220115
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220493 tgatataaagttgtggccattcaaggtcatttccggaacgaacgacaaacccatgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 28220394  T
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28220393 gaaatctcatctatggttctaacaaagatgcgtgagattgcagaggcctttttggaatttcctgtcaagaatgcagttattactgtgcctgcttatttca 28220294  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28220293 atgattatcagcggaaagccaccatagatgcaggtaccattgctggtctaaatgttctaaggatagtcaatgaacccactgctgctgctattgcatatgg 28220194  T
Q  308 tctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
      |||| || ||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220193 attggacaaaagaactaactgcatgggagaacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 28220115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Original strand, 42555574 - 42555759
Alignment:
Q  12 atgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42555574 atgaagttgtggccattcaaggtcatttccggaataaatggcaagcccatgatttatgtaacgtacgagggacaggagaaacacctatgcgccgaagaaa 42555673  T
Q  112 tatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccg 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42555674 tctcatctatgattctaacaaagatgcgcaagattgcagaggcatttttggaaatgcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccg 42555759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 292
Target Start/End: Original strand, 42555759 - 42555830
Alignment:
Q  221 gaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgc 292  Q
    |||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42555759 gaaagccacaatagatgcaggtactattgctggtctgaatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgc 42555830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3147814 - 3147428
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 107  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3147814 tgatatgatgttgtggccattcaaggtcatttgcggagtgaatgacaaacccatgatttcggttaagtgcaagggacaggagaagcacctatgtgctgaa 3147715  T
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||   |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  3147714 gaaatctcatctatggttctaacaaagatgcgcaagactgcagaggagtttttagaattgcctgtcaagaatgcagttgttaccgtacctgcttatttca 3147615  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    |||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3147614 atgatgctcagcggaaagcgacaatagatgctggtgttattgctggccttaatattatgcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcgtatgg 3147515  T
Q  308 tctggaaaagagaactaactctgt-------gcgagga-cgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
     ||||| ||||||||||| | |||         ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3147514 actggacaagagaactaattgtgtaattgtgtagaggagcgtaatatttttatctttgacttgggtggtgggacttttgatgtgtct 3147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 8585332 - 8585710
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 107  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||| || || ||  | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||     
T  8585332 tgatataatgttgtggccattcaaggttatctctggtgttaatgacaaacctatgattactgttaagtacaagggtcaagaaaagaacctatgtgctgag 8585431  T
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||    ||||||||||||||| |||| |||  |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8585432 gaaatatcatctatcatcctcacaaacatgaagaagattgcagagacatatttgaaatcacctgttcaaaatgcagttgtgactgtgcctgcttatttca 8585531  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8585532 atgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 8585631  T
Q  308 tctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
     || || || | |  ||||| ||   | | ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8585632 ccttgacaacaaaggtaactgtgatggtgaacgaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtct 8585710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8667952 - 8667583
Alignment:
Q  17 gttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatca 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||     
T  8667952 gttgtggccattcaaggttatttctggtgttaatgacaaacctatgattactgttaagtacaagggtcaagagaagcacttttgtgctgaggaaatatct 8667853  T
Q  117 tctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatc 216  Q
    |||||| | || ||||||||||| ||| |||| ||| ||| | ||   |  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  8667852 tctatggtgcttacaaagatgcgagaggttgcggaggcatatctggggtcgccggtcaagaatgccgttgttactgtgccagcttacttcaatgattctc 8667753  T
Q  217 agcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaa 316  Q
    |||| || |||||  ||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  8667752 agcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgcggcagctattgcatatggccttgacaa 8667653  T
Q  317 gagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||||| | ||| ||   |  | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8667652 gagaaatgactgtgatggtagccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcgggacttttgatgtgtct 8667583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8629061 - 8628775
Alignment:
Q  21 tggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatcta 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  8629061 tggccattcaaggttatttctggtcttaatgacaagcctatgattgctgttaagtacaagggtcaagagaagaacctatgtgctgaggaaatatcatcta 8628962  T
Q  121 tgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcg 220  Q
    | || ||  |||| |||    ||||||||||| | | |||| |||  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8628961 ttatccttgcaaatatgaagaagattgcagaggcttatttgaaatcacctgtaaaaaatgcagttgtcaccgtgcctgcttatttcaatgattctcagcg 8628862  T
Q  221 gaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
     ||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8628861 aaaagccaccatgaatgctggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatcaatgaccccactgctgcagctattgcatatgg 8628775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 386
Target Start/End: Original strand, 10494009 - 10494378
Alignment:
Q  17 gttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatca 116  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||  | |||||||||||  ||||| | | |||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10494009 gttgtggccattcaaggttacttcaggtgtcaatgacaaacctatgattaccgctaagtacaagggtcaagagaagcacttttgtgccgaggaaatatca 10494108  T
Q  117 tctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatc 216  Q
    |||||| | || | ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||   |  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  10494109 tctatggtccttataaagatgcgagaggttgcagaggcatatttggggtcaccagtcaagaatgctgttgttactgtgccggcttacttcaacgattctc 10494208  T
Q  217 agcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaa 316  Q
    | || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  10494209 aacgaaaggctactattgatgctggtgctattgctggccttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaa 10494308  T
Q  317 gagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||||| | | | || | |    |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10494309 gagaagtgattgtgagggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtacttttgatgtgtct 10494378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17268469 - 17268103
Alignment:
Q  20 gtggccgttcaaggtcatttccggat-tgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatc 118  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || ||||| || ||    
T  17268469 gtggccattcaaggtcattgc-ggatatgaatgacaaaccaatgatttccctcaagtacaagggacgggagaaacacttttgtgcagaggaaatttcgtc 17268371  T
Q  119 tatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcag 218  Q
    |||| | || ||||||||||| |||||||| |||  || | |  |||   | || | |||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||    
T  17268370 tatggtactcacaaagatgcgggagattgctgaggaatatctagaatcatcggttatgaatgctgtcattactgtcccggcttacttcaacgattctcag 17268271  T
Q  219 cggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaaga 318  Q
    || ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||    
T  17268270 cgaaaagccaccatagatgctggtgtcattgctggccttaatgtattgaaggtaatcaatgaaccaactgctgcagctattgcatatggccttggcaaga 17268171  T
Q  319 gaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||||||||| |||   || ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17268170 gaactaactgtgttgaagaacggaatatttttgtctttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtct 17268103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8647416 - 8647041
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||  |||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||  | |||||||     ||||| ||     
T  8647416 tgataagaagttgtggccattcaaggtcatt---ggggtgaatgacaaacccatgattattgttaaatacaagggtgaagagaagcgttattgtgctgag 8647320  T
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| || |||    |  ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  8647319 gaaatatcatcgatgatcctcacaaagatgcgagaggttgcagagaaatatttaatgtcccctgtaaagaatgcagttgttactgtgcctgcatacttca 8647220  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || | ||   ||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  8647219 atgattatcagcgaaaagccactatagatgccggggccattgctggccttaatatcatccggataatcaatgaaccaacagctgctgctctcgcatatgg 8647120  T
Q  308 tctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
     || || |||||||| || | ||    || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8647119 ccttgacaagagaacaaattgtgctgaagaacgaaatatattcatcttcgaccttggtggtggaacttttgatgtgtct 8647041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 321
Target Start/End: Original strand, 7877419 - 7877672
Alignment:
Q  68 tgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaattt 167  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||| | |      
T  7877419 tgttaagtataagggcgaggaaaagcacttttgtgccgaggaaatatcatccatgatccttacaaagatgcgcgagattgcagagaagtttttggagtca 7877518  T
Q  168 cctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||   ||||||||||||  |||| || ||  ||||||||     
T  7877519 cctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattctcaacgaaaagccacaaaagatgctggtgcagttgccggcctcaatgttatgc 7877618  T
Q  268 agataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaa 321  Q
     |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||    
T  7877619 ggataattaatgaaccaactgctgctgcccttgcatatggccttcaaaagagaa 7877672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6790054 - 6789676
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 107  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||  | |||||||| ||| |||||  |||| |||| |||||  |||||||||| |||||||  ||     
T  6790054 tgatatgatgttttggccattcaaggtcattgctggcgtcaatgacaagcccatgattgttgttgagtataagggtgaggagaagcaactatgtgttgag 6789955  T
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    ||| | || |||||||| || || |||||||| |||||||| |||| || |||||| |      | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6789954 gaagtttcgtctatgatcctcaccaagatgcgggagattgctgagaaatatttgcagtcagagataaaaaatgcagttattactgtgcctgcttatttca 6789855  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  6789854 atgattctcaacggaaagccactttagatgctggtgccattgctggtcttaatgttatacgaataatcaatgaaccaacagctgctgctcttgcatatgg 6789755  T
Q  308 tctggaaaagagaactaact-ctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
     || || ||||||||||| | | ||| ||| |  |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  6789754 ccttgataagagaactaattacggtg-gagaaaaaaatattttcgtcttcgaccttggtggtggcactttcgatgtgtct 6789676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8602456 - 8602142
Alignment:
Q  68 tgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaattt 167  Q
    ||||||||| |||||   ||| |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |      
T  8602456 tgttaagtataagggtggggaaaagcacttctgtgctgaggaaatctcatcaatggtccttacaaagatgcgtgaaattgcagagaagtttctggagtca 8602357  T
Q  168 cctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||     
T  8602356 cctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttattttaatgattctcagcgaaaagccacaaaagatgctggtgccattgctggtctcaatgtaatgc 8602257  T
Q  268 agataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtgg 367  Q
     |||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||  |||||||| |||| | |||   ||   ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  8602256 ggataatcaatgagccaactgcagctgctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaatattttcatatttgatcttggtgg 8602157  T
Q  368 tgggacttttgatgt 382  Q
    ||| |||||||||||    
T  8602156 tggaacttttgatgt 8602142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 386
Target Start/End: Original strand, 13333145 - 13333460
Alignment:
Q  71 taagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcct 170  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||   |  ||     
T  13333145 taagtgcaagggtcaagagaagcacttttgtgccgaggaaatatcatctatggtccttacaaagatgcgagaggttgcagaggcatatatggggtcacca 13333244  T
Q  171 gtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaaga 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||| || | ||    |    
T  13333245 gtcaagaatgccgttgttactgtgccggcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtgctattgctggccttaatatcattcgaa 13333344  T
Q  271 taatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctg-tgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtg 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||  | | | || ||  | | |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  13333345 taatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagacgtgattgtgatggtaag-cgaaatatttttgtctttgatctgggtggtg 13333443  T
Q  370 ggacttttgatgtgtct 386  Q
    | |||||||||||||||    
T  13333444 gtacttttgatgtgtct 13333460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8659901 - 8659527
Alignment:
Q  12 atgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaa 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||  | ||  |||| ||||||| | |||||  |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||    
T  8659901 atgatgttgtggccattcaaggttatcgctggtgtgaacgacaaactcatgattaatgttcagtacaagggtcaggagaagcacttttgtgcggaggaaa 8659802  T
Q  112 tatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatga 211  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||| ||  |||||||||||| | |    |  ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  8659801 tatcatctatggtacttacaaaaatgcgagaagttgcagagacatatctaatgtcacctgtgaagaatgctgttgttacagtgcctgcatagttcaatga 8659702  T
Q  212 ttatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctg 311  Q
    || |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  8659701 ttctcagcgaaaagccaccatagattccggtgccattgctggccttaatgtcattcagataattaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtttt 8659602  T
Q  312 gaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    || ||||||  | ||| ||   |   || |||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8659601 gacaagagaggtgactgtgatggtaaacaaaatattttggtctttgatcttggtggtggtacttttgatgtgtct 8659527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 386
Target Start/End: Original strand, 27830561 - 27830879
Alignment:
Q  68 tgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaattt 167  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||      
T  27830561 tgttaagtacaagagtcaggagaaacacttatgtgcggaggaaatttcatcaatggtccttacaaagatgcgagagatcgcggaggcatatttgcaatca 27830660  T
Q  168 cctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatga 267  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||     
T  27830661 ccggttaagaatgcagtaataaccgtgccagcttatttcaatgactctcaacgaaaagccactgtagattccggtgccattgctggccttaatgttatgc 27830760  T
Q  268 agataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtgg 367  Q
     |||||| |  || || ||||||||||||||||||||||| || || | | |||| || | |    ||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||    
T  27830761 ggataataagcgagcctactgctgcagctattgcatatggccttgacacgggaacaaaatatactggagaacggaatatttttgtgtttgaccttggtgg 27830860  T
Q  368 tgggacttttgatgtgtct 386  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27830861 tgggacttttgatgtgtct 27830879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1302002 - 1301624
Alignment:
Q  12 atgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaa 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | || |  || ||||    
T  1302002 atgatgttgtggccattcaaggtcatcgccggtgtgaatgacaaacccgtgattgttgttaagtacaagggtcaggagaagcacttttgcgtggaggaaa 1301903  T
Q  112 tatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatga 211  Q
    ||||||||||| | || || |||||||| || ||||||||||||| | |    |  || || |  ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  1301902 tatcatctatggtccttacgaagatgcgagaaattgcagagacatatctaatgtcaccagtgacaaatgctgttgttactgtgcctgcacatttcaatga 1301803  T
Q  212 ttatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaac----ccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    || |||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||    | ||||||||||||||||| |||||    
T  1301802 ttctcagcgaaaagccaccatagatgccggtgcaattgctggccttaatgtcattcagataattaatgaacctagctactgctgcagctattgcgtatgg 1301703  T
Q  308 tctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    | | || ||||||| | ||| ||   |   ||| ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  1301702 ttttgacaagagaagtgactgtgatggtaaacggaatattttggtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtct 1301624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 386
Target Start/End: Original strand, 8382562 - 8382880
Alignment:
Q  68 tgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaattt 167  Q
    ||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||| | || | |||||||||||||||||||||||  |||||| | |      
T  8382562 tgttaagtataagggtgaggaaaaacacctttgtgccgaggaaatctcctctatggtcctcaaaaagatgcgtgagattgcagagaattttttggagtca 8382661  T
Q  168 cctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatga 267  Q
    ||| || |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||  |||| |||     
T  8382662 cctatcgagaatgtagttgttaccgtgcctgcatatttcaatgattctcaacggaaagccacaaaagatgctggtgcgattgctggcctcaatgtaatgc 8382761  T
Q  268 agataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtgg 367  Q
     |||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||  | |||||| |||| | | |   ||   ||||||||||||||||||| || |||||    
T  8382762 ggataatcaatgagccaactgccgctgctcttgcatatggccttcagaagagagctaattgtcttgaagagagaaatattttcatctttgatcttggtgg 8382861  T
Q  368 tgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  8382862 tggaacttttgatgtgtct 8382880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 386
Target Start/End: Original strand, 29581567 - 29581845
Alignment:
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  29581567 gaaatatcatctatgatcctctcaaagatgcatgatattgcagagaaatttttggaattgcctgtaaagaatgcagtgattaccgtgcctgcttatttca 29581666  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||   |||||||||    || ||||| ||  |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  29581667 atgattctcagcgaaaagccaccaaagatgctggcattatagctggcctcaatgtaatgaggataatcaacgaaccaactgctgctgcacttgcatatgg 29581766  T
Q  308 tctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    | |  ||||| ||  ||| | |||  ||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  29581767 tattcaaaagggaggtaattttgttggaaaacgaaatatattcatctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtct 29581845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17260604 - 17260405
Alignment:
Q  187 ttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccac 286  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||| |     
T  17260604 ttactgttcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgttattgctggcctttatgttttgaagttaattaatgaacctat 17260505  T
Q  287 tgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| | |||   || ||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17260504 tgctgcagctattgcatatggccttgtcaagagaactaattgtgtttaagtacggaatatttttgtctttgaccttggtggggggacttttgatgtgtct 17260405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8570756 - 8570475
Alignment:
Q  105 gaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  8570756 gaagaaatatcatctgtgattctctcaaagatgcgagagattgcagaagcatttttggagtctcctgttaagaatgcagtgattactgtacctgcttatt 8570657  T
Q  205 tcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcata 304  Q
    | |||||||  || || | |||||||  |||||| ||||  |||||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  8570656 ttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgctggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcata 8570557  T
Q  305 tggtctggaaaagagaactaactctg-tgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||| ||  |||||||| |||| | || ||  | || |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  8570556 tggccttcaaaagagagctaattttgttgataaga-gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtct 8570475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8654952 - 8654614
Alignment:
Q  48 aatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattg 147  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||||||||  | ||||| || ||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||    
T  8654952 aatgacaaacccatgattactgttaagtacaaaggtcaagagaagcaattttgtgctgaggaaatatcatctgcggttcttacaaagatgcgagagattg 8654853  T
Q  148 cagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccat 247  Q
    ||||| |||   |   ||  || ||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  8654852 cagaggcataccttggatcacccgtcaaaaatgtcgttgttactgtgccggcatacttcaatgactctcagcgaaaagcaaccatagatgctggtgccat 8654753  T
Q  248 tgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatatt 347  Q
    |||||| ||| | || ||   |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||| ||||| ||   |   ||| ||||||    
T  8654752 tgctggacttaacgtcattcggatactcaatgaacctactgccgcagctattgcatatggccttgacaagcgaagtaactatgatggtaaacggaatatt 8654653  T
Q  348 ttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8654652 ttggtatttgatcttggtggtggtacttttgatgtgtct 8654614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8576771 - 8576490
Alignment:
Q  105 gaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  8576771 gaagaaatatcatctgtgattctctcaaagatgcgagagattgcagaggcttttctgcagacacctgttaagaatgcagtgatttctgtgcctgcttatt 8576672  T
Q  205 tcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcata 304  Q
    | |||||||  || || | |||||||  |||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  8576671 ttaatgattcccaacgaagagccactaaagatgcaggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcgta 8576572  T
Q  305 tggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||| ||  |||||||| |||| | |||      | |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  8576571 tggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaaagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtct 8576490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 8636069 - 8636281
Alignment:
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| ||| | || |||   ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  8636069 gaaatatcgtctatggtcctgacaaagatgcgagagattgctgaggcatatctggaatcatctgtcaagaatgcagtcattactgtgcccgcttatttca 8636168  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    |||||| |||||| ||| ||||   |||||||||||||||||| || ||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  8636169 atgattctcagcgtaaatccaccaaagatgctggtgccattgccggccttaatgtaattcggataatcaatgaaccaactgctgcagcttttgcgtatgg 8636268  T
Q  308 tctggaaaagaga 320  Q
     ||  ||||||||    
T  8636269 acttcaaaagaga 8636281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Original strand, 8671265 - 8671569
Alignment:
Q  17 gttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatca 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||  ||||| |||| |||||| | || |  ||||||||  | ||||| || ||||||||     
T  8671265 gttgtggccattcaaggttatttctggtgttaatgacaaacctatgattactgtcaagtacgaaggtctagagaagcaattttgtgctgaggaaatatct 8671364  T
Q  117 tctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatc 216  Q
    |||||| | || ||||||||||| ||| |||| ||| ||| | || | |  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  8671365 tctatggtgcttacaaagatgcgagaggttgcggaggcatatctggagtcaccggtcaagaatgccgttgttaccgtgccagcttacttcaatgattctc 8671464  T
Q  217 agcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaa 316  Q
    |||| |  |||||  | ||||||||| | |||||||| ||| |||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  8671465 agcgaacggccaccattgatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaa 8671564  T
Q  317 gagaa 321  Q
    |||||    
T  8671565 gagaa 8671569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8582145 - 8581864
Alignment:
Q  105 gaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatt 204  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |  ||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  8582145 gaagaaatatcatctgttattctgacacagatgcgagagattgcagaggcatttttggagtcacctgttaagaatgcagtgattactgtacctgcttatt 8582046  T
Q  205 tcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcata 304  Q
    | |||||||  || || | |||||||  |||||| ||||  ||||| || ||  |||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  8582045 ttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgcaggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcata 8581946  T
Q  305 tggtctggaaaagagaactaactctg-tgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||| ||  |||||||| |||| | || ||  | || |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  8581945 tggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga-gaaatatttttatctttgaccttggaggtggaacttttgatgtgtct 8581864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8591120 - 8590899
Alignment:
Q  68 tgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaattt 167  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||  || ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||| | |      
T  8591120 tgttaagtacaagggtgaggaaaagcgtctttgtgcggaggaaatctcatccatggttctcacaaagatgcgagagattgctgaaaagtttttggagtca 8591021  T
Q  168 cctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttg-atgttatg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||    
T  8591020 cctgtcaagaatgcagttgttactgtgccagcttattttaatgattctcagaggaaagctaccaaagatgctggtgtcattgct-ggcttgaatgtaatg 8590922  T
Q  267 aagataatcaatgaacccactgc 289  Q
      |||||| |||||||| |||||    
T  8590921 cggataattaatgaaccaactgc 8590899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Original strand, 8640175 - 8640418
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||  ||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||  | |||||||   | ||||||||     
T  8640175 tgatatgaagttgtggccattcaaggtcatt---ggggtgaatgacaaacccacgattattgttaaatacaagggtgaagagaagcgtttttgtgccgag 8640271  T
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaattt---cctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatt 204  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||| || |||  ||| |   || || |||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  8640272 gaaatatcatctatgatcctttcgaagatgcgagaggttgcagagaaatattt--aatgtccccccgtaaagaatgcagttgttactatgcctgcttact 8640369  T
Q  205 tcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgg 253  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  8640370 tcaatgattatcagcaaaaagccaccatagatgccggggccattgctgg 8640418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8559782 - 8559501
Alignment:
Q  101 tgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggct 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | |   | ||  ||||||| ||  |||| || || |||    
T  8559782 tgccgaagaaatatcagctatgattctcacacagatgcgagagattgcagaagcatttttggagtcgacggttgagaatgctgtgattaccgtacctgct 8559683  T
Q  201 tatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattg 300  Q
    ||||| ||||||| |||  | | ||||||   |||||| ||||  |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  8559682 tattttaatgattctcaaagaagagccaccaaagatgcaggtgaaattgctggtcttaatgtaatgcagataatcaatgaaccaactgcagctgctcttg 8559583  T
Q  301 catatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgt 382  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||| | |||   ||   ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  8559582 catatggacttcaaaagagatctaattgtgttaaagagagaaatattttcatctttgatctcggtggtggaacttttgatgt 8559501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8610278 - 8610081
Alignment:
Q  189 actgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactg 288  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||   ||| ||||||||||| || |    
T  8610278 actgtgcctgcttattttaatgattctcagcggaaagccacaaaagatgctggtgtcatttctggccttaatgtaatccggattatcaatgaaccaacgg 8610179  T
Q  289 ctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    |||| ||| |||||||||||||  | |||||| |||| | ||||  |    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  8610178 ctgcggctcttgcatatggtcttcagaagagagctaattgtgtggaaaatagaaatatttttatctttgatcttggtggtgggactttcgatgtgtct 8610081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8546165 - 8545797
Alignment:
Q  17 gttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatca 116  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||    |||  ||| || ||||||||  |||| |||||| |   ||| ||||||||||||    
T  8546165 gttgtggccctttaaggtcatttccggtgttaatgacaaaccgacaattcttgtgaactacaagggtgaggaaaagcactttgttgctgaagaaatatca 8546066  T
Q  117 tctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatc 216  Q
    ||| |||| ||  || ||||||| |||||||||||| |||||||| | |  ||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||  |    
T  8546065 tctgtgatcctctcacagatgcgagagattgcagaggcatttttggagtcacctgttaagaatgcagtgattactgtacctgcttattttaatgattcac 8545966  T
Q  217 agcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaa 316  Q
    | |  | | ||||   |||||| ||||  ||||| || ||  |||| |||  ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| ||  ||||    
T  8545965 aacaaagatccacaaaagatgcaggtgaaattgccggtctaaatgtcatgcggataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcatatggccttcaaaa 8545866  T
Q  317 gagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    |||| |||| |   ||  | || |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  8545865 gagagctaattggttgataaga-gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtct 8545797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 307
Target Start/End: Original strand, 29577395 - 29577594
Alignment:
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||| | || || || |||||||||||  | || ||||| ||||||||||    
T  29577395 gaaatatcgtctatgatcctctcaaagatgcaggagattgcagagaaatttttggagttacccgtaaagaatgcagtgatcacagtgccagcttatttca 29577494  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatgg 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||   |||||| ||    |||||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  29577495 atgattctcagcgaaaagccaccaaagatgccggcattattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccaactgctgctgcacttgcatatgg 29577594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8538481 - 8538204
Alignment:
Q  105 gaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatt 204  Q
    |||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | || ||   ||||||| | |  |||||||| ||||||||  |||| || || |||||||    
T  8538481 gaagaaatatcagctatggtcctcacaaagatgcgggagttcgctgaagtatttttggagtcacctgtcaaaaatgcagtgattacagtacctgcttatt 8538382  T
Q  205 tcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcata 304  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||   ||||||||||| ||||||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  8538381 tcaatgattcacagcgaagagccaccaaagatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaacctacagctgctgctcttgcata 8538282  T
Q  305 tggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgt 382  Q
     || ||  |||||||| |||| | |||   ||   ||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  8538281 cggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaaagttttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgt 8538204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8590850 - 8590802
Alignment:
Q  338 acgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8590850 acgaaatgtgttcatctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtct 8590802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8628744 - 8628696
Alignment:
Q  338 acgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8628744 acgaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtct 8628696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 386
Target Start/End: Original strand, 34466459 - 34466797
Alignment:
Q  48 aatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattg 147  Q
    |||||||| ||  |||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| || | ||    
T  34466459 aatgacaagccaatgatttcccttaagtataagggtcaggagaagcacctatgtgctgaggaaatctcatctatgatcctttcaaagatgcgggatactg 34466558  T
Q  148 cagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccat 247  Q
    |||||  || |||| |||  ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  34466559 cagaggaatatttggaatcaccaattaagaatgcagttatcaccgtgcctgcttattttaatgattctcagcgaaaagctactgtggatgctggtactat 34466658  T
Q  248 tgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatatt 347  Q
    |||||| ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || ||| ||||  || | ||||||||    
T  34466659 tgctggccttaatgttttgcaaataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggacttgacaagagagctgactttgtggaagaaggaaatatt 34466758  T
Q  348 ttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34466759 ttcgtctttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtct 34466797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15595578 - 15595198
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaa 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||  |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||| | | ||||| ||     
T  15595578 tgatataaagttgtggccattcaaggtcatt---ggtgtgaatgacaaacccatgattattgttaaatacaagggtcaagaaaagcgcttttgtgctgag 15595482  T
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttca 207  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  | | ||| || || |||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  15595481 gaaatatcgtctatgattctcaaaaagatgcgagaggttgcagagaaattttt--agtctcccgtaaacaatgcagttgttaccgtgcctgcttatctca 15595384  T
Q  208 atgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacc-------cactgctgcagctattg 300  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||   | |||||||||||||        || |||||||||||||    
T  15595383 atgattctcaacgaaaagccactatagatgcaggtgccattgctggccttaatgttatacgggtaatcaatgaaccgacagctgacagctgcagctattg 15595284  T
Q  301 catatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||||||| || || ||||| | ||||| |||  ||| | ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  15595283 catatggccttgacaagaggattaactgtgttggagaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtct 15595198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 386
Target Start/End: Original strand, 4678345 - 4678562
Alignment:
Q  169 ctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaa 268  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |    
T  4678345 ctgtgaagaatgtcgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcaacgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 4678444  T
Q  269 gataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggt 368  Q
     |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| | |   ||   |   ||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  4678445 aataatcaacgaacctactgttgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgattgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggt 4678544  T
Q  369 gggacttttgatgtgtct 386  Q
    || |||||||||||||||    
T  4678545 ggtacttttgatgtgtct 4678562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28911115 - 28910750
Alignment:
Q  17 gttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatca 116  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |  ||||||| || ||||| |||    
T  28911115 gttgtcgccgttcaaggtcattgccggtgtcaatgacaaccccatgatatctgtcaagtacaaggatcaggagaagaaattatgtgctgaggaaatctca 28911016  T
Q  117 tctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatc 216  Q
    ||| || ||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||||| |     
T  28911015 tctgtggttctctcaaagattcgcgagattgcagtgacatttttggaattgcccgtcaagaatgcaattgttactttgactggttatttcaatgattctt 28910916  T
Q  217 agcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaa 316  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| || || ||    
T  28910915 agaggaaagccaccatagatgctggtgccattgtcaggcttaatgttatgcggataatcaatgagctcactgctgtagctatttcatatggcctcgacaa 28910816  T
Q  317 gagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgt 382  Q
    |||| || | | ||   ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28910815 gagagctgagtgtgctggagaacgaaatactttcatcttcgacctgggtagtgggacttttgatgt 28910750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12235191 - 12234853
Alignment:
Q  48 aatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattg 147  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| || || |    
T  12235191 aatgacaaacccatgattattgtcaagtacaagggtcgagagaagcagctatgtcccgaagaagtatcatctatggtactcacaaagatgcgagaaatcg 12235092  T
Q  148 cagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccat 247  Q
    | ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  12235091 ctgaggcatatttacaatttccagttaagaatgcagttgttaccgtgcctgcttatttcaatgattctcaacgaaaagcaactatagatgctggtgtcat 12234992  T
Q  248 tgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatatt 347  Q
    |||||| ||  ||||||||| | |||| || |||||||  || || ||| ||||||||||||| || ||||||||| | | |||  ||| ||||||||||    
T  12234991 tgctggcctcaatgttatgagggtaatgaacgaacccatggcagccgctgttgcatatggtcttgacaagagaactgattgtgttggagaacgaaatatt 12234892  T
Q  348 ttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  12234891 tttgtttttgatctcggcggtggcacttttgatgtgtct 12234853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 16657153 - 16657521
Alignment:
Q  18 ttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcat 117  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || || |||| ||||| || ||||  ||  | ||||| || ||||||||||    
T  16657153 ttgtggccattcaaggtcattgccggagtgaatgacaaaccaatgattactcttcagtataagggtcaagagagccaattttgtgctgaggaaatatcat 16657252  T
Q  118 ctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatca 217  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||  |||| ||| ||||| || | |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||    
T  16657253 ctatgatccttacaaagatgcgagaagttgctgaggcatttatggagtcgcctgtcaagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgca 16657352  T
Q  218 gcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaag 317  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16657353 gcgaaaagccaccatagatgctggtgccatcgctggccttaatgtcattcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtcttgacaag 16657452  T
Q  318 agaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    |||| | | | ||   |   ||| ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  16657453 agaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtct 16657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 386
Target Start/End: Original strand, 16661627 - 16661996
Alignment:
Q  17 gttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatca 116  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||  | |||||||||||   ||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||    
T  16661627 gttgtggccgttcaaggttattgctggtgttaatgacaaacctacgattagtgttaagtacaagggtcaggagaagctcctttgtgccgaggaaatctca 16661726  T
Q  117 tctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatc 216  Q
    |||||  | || ||||| |||   ||| |||||||| | | |||| |||  || || || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||| ||    
T  16661727 tctattgtcctcacaaacatgaaggaggttgcagaggcttatttggaatcaccggttaaaaatgcagttgtcactgttcctgcttattttaacgattctc 16661826  T
Q  217 agcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaa 316  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  16661827 agcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgctggccttaacgttgtgaggataatcaatgaacccactgcagcagctattgcatatggccttgacaa 16661926  T
Q  317 gagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
     |||| ||| | ||   | | | ||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16661927 aagaagtaattgtgatggtgaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtct 16661996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 320
Target Start/End: Original strand, 12245045 - 12245344
Alignment:
Q  21 tggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatcta 120  Q
    |||||||||||||||| | | ||  | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  12245045 tggccgttcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaaccaataattactgttaactacaaaggccaggagaagcagctatgtgctgaagaagtatcatcta 12245144  T
Q  121 tgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcg 220  Q
    || | |||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||  |||  || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||    
T  12245145 tggtactaacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcaccggtaaagaatgctgttgttactgtacctgcttattttagtgattctcagcg 12245244  T
Q  221 gaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagaga 320  Q
     ||||| ||  ||||||||||  | |||||||| ||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  12245245 aaaagcaacgatagatgctggctcaattgctggtctcaatgttatgagggtaatgaatgaacccactgctgcagctgttgcatatggccttgaaaagaga 12245344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11999896 - 11999558
Alignment:
Q  48 aatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattg 147  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||    
T  11999896 aatgacaaaccaataattactgttaagtacaaaggccaggagaagcagctatgtgctgaagaagtatcatctatggtactaacgaagatgcgagaaattg 11999797  T
Q  148 cagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccat 247  Q
    | ||| ||| |||  |||  || || |||||||  ||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  11999796 ctgaggcatatttagaatcaccggtaaagaatgttgttgttactgtaccagcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgccggtgcaat 11999697  T
Q  248 tgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatatt 347  Q
    ||||||  |  ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| || || |||||| || | | |||  ||| | |||| |||    
T  11999696 tgctggcatcaatgttataagggtaatgaatgaacccactgctgcaactgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttggagaaagaaacatt 11999597  T
Q  348 ttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||  ||||||| || || ||||| ||||||||| |||||    
T  11999596 ttagtctttgatcttggcggtggcacttttgatttgtct 11999558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14703909 - 14703572
Alignment:
Q  49 atgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgc 148  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||| | || | |||||||||| ||||||||||| | ||    |||||||| || |||||    
T  14703909 atgacaaacccatgattacggttaagtacaaggatcaggagaagaagctctatgccgaagaagtatcatctatggtactggtgaagatgcgagaaattgc 14703810  T
Q  149 agagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccatt 248  Q
     ||||||| |||  | |   |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||  | ||||||||| | ||||||||||  |||    
T  14703809 tgagacatatttagagtcaactgttaagaatgcagttgttacggtgcctgcttattttagtgattctcaaagaaaagccactatggatgctggtgttatt 14703710  T
Q  249 gctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattt 348  Q
    || || ||  ||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||| | | ||   ||| ||| ||||| |    
T  14703709 gccggcctcaatgttatgagggtaatgaatgaacctacagctgcagctattgcatatggccttgacaagagaactgattatggtggagaacgtaatatat 14703610  T
Q  349 tcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    |  ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||    
T  14703609 ttgtctttgatcttggtggtggtacttttgacgtgtct 14703572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43625855 - 43625576
Alignment:
Q  108 gaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcct---gtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatt 204  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||| |||    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  43625855 gaaatatcgtctatgatcctcacaaagatgcgagaggttgcagagaaattttt--aatgtccccccgtaaagaatgcagttgttaccgtgcctgcttact 43625758  T
Q  205 tcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaaga-taatcaatgaacccactgctgcagctattgcat 303  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||  || ||| ||||| | | || ||||||||||||| || ||||| ||| | ||||    
T  43625757 tcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgttggtgtcattgtcggccttaatgtttt-acgagtaatcaatgaaccaacagctgctgctctagcat 43625659  T
Q  304 atggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    | || ||  | ||||||| ||| | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43625658 acggccttaacaagagaattaattgtgttggagaacgaaatattttcatctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtct 43625576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7542728 - 7542390
Alignment:
Q  48 aatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattg 147  Q
    ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||  |||||||| || ||   ||| |||||  ||||||||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  7542728 aatgacagacccatgattaccgttaagtacaaggatcaggagaaacaactccatgctgaagaggtatcatctatggtactcacaaagatgcgagaaattg 7542629  T
Q  148 cagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccat 247  Q
    | ||| | | |||  ||    |||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7542628 ctgagtcgtatttagaaacaactgtgacgaatgcagttgttactgtacctgcttattttaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcgggtgccat 7542529  T
Q  248 tgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatatt 347  Q
    |||||| ||  ||||||||| |  ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||| | | ||   |||  |||||||||    
T  7542528 tgctggcctcaatgttatgagggcaatgaatgaacctactgccgcagctgttgcatatggccttgacaagagaactgattatgatggagagcgaaatatt 7542429  T
Q  348 ttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  7542428 tttgtttttgatcttggcggtggcacttttgatgtgtct 7542390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 386
Target Start/End: Original strand, 12258247 - 12258585
Alignment:
Q  48 aatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattg 147  Q
    |||| ||||||| ||||| | || |||||||||   || |||||||| || |||||||| ||| |||||||| || |  | ||||||||||| || ||||    
T  12258247 aatggcaaacccatgattacggtaaagtacaagaatcaagagaagcagctttgtgccgaggaagtatcatctgtggtattgacaaagatgcgagaaattg 12258346  T
Q  148 cagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccactgtagatgctggtgccat 247  Q
    | ||| ||| |||  |||  || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||  ||  ||||||||||| ||||||  |||   ||    
T  12258347 ctgaggcatatttagaatcacccgttaagaatgcagttgttactgtgcctgcatattttagtgattcacaaaggaaagccactatagatgtgggtaatat 12258446  T
Q  248 tgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggacgaaatatt 347  Q
    || ||| ||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| || || || |||| ||| | |||   |  ||| ||||||    
T  12258447 tgttggcctgaatgttatgaagatattaaatgaacctactgctgcagcttttgcatatggccttgacaaaagaattaattgtgtcgaaaaacggaatatt 12258546  T
Q  348 ttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  12258547 tttgtctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtct 12258585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 386
Target Start/End: Original strand, 9335526 - 9335895
Alignment:
Q  17 gttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatca 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||     
T  9335526 gttgtggccattcaaggttatttctggtgttaatgacaaacctatgattactgttaactacaagggtcaagagaagcacttttgtgctgaggaaatatct 9335625  T
Q  117 tctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatc 216  Q
    |||||| | || ||||||||| | ||| |||| ||| ||| ||||   |  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  9335626 tctatgttgcttacaaagatgagagaggttgcggaggcatatttggggtcgccggtcaagaatgccgttgttaccgtgccagcttacttcaatgattctc 9335725  T
Q  217 agcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaa 316  Q
    |||| || |||||  ||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  9335726 agcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggccttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgataa 9335825  T
Q  317 gagaactaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 386  Q
    ||||| | ||| ||   |    |||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  9335826 gagaaatgactgtgatggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcggtacttttgatgtgtct 9335895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30775785 - 30775482
Alignment:
Q  17 gttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatca 116  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||  | |||||||||||| |||||||  |||||| |||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||    
T  30775785 gttgtggccattcaaggttgtttctggtgttaatgacaaacccatgatttcccttaagttcaagggccaggagaaactcctctgtgccgaggaaatttca 30775686  T
Q  117 tctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatc 216  Q
    || ||  | || ||||| ||| | |||||||||||||  | |||| |||  || || || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||   |    
T  30775685 tcaatagtcctcacaaatatgagagagattgcagagatgtatttggaatccccagttaaaaatgcagttatcactgtgcctgcttatttcaatgatgcac 30775586  T
Q  217 agcggaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaa 316  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  30775585 agcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaa 30775486  T
Q  317 gaga 320  Q
    ||||    
T  30775485 gaga 30775482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35132975 - 35132616
Alignment:
Q  21 tggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaaacccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatatcatcta 120  Q
    ||||| |||||||||| | ||||  | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||   |||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |    
T  35132975 tggccattcaaggtcactgccggtgtaaatgacaaacccatgattacggttaagtacaaggatgaggaaaagcaactctatgcggaagaagtatcatcca 35132876  T
Q  121 tgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagacatttttgcaatttcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcg 220  Q
    || | || ||||||||||| || |||||||   ||| |||  |||   |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||    
T  35132875 tggtactcacaaagatgcgagaaattgcagg--catatttagaatcaactgttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttattttagtgattctcaacg 35132778  T
Q  221 gaaagccactgtagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagaga 320  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| || || ||||||    
T  35132777 aaaagccactatagatgctggtgctattgctggtcccaatgttatgagagtaatgaatgaacctactgccgcagcggttgcatatggccttgacaagaga 35132678  T
Q  321 actaactctgtgcgaggacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgt 382  Q
     || | | ||   ||| || |||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||    
T  35132677 tctgattgtgctggagaacaaaatatttttgtcttcgatcttggtggtggcacttttgatgt 35132616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University