View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17092_low_28 (Length: 365)

Name: NF17092_low_28
Description: NF17092
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17092_low_28
NF17092_low_28
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (1-278)||(39572958-39573235)
chr5 (1-280)||(38527986-38528273)
chr5 (1-278)||(12910494-12910779)
chr5 (1-278)||(31786397-31786682)
chr5 (1-279)||(22980932-22981218)
chr5 (2-282)||(5830032-5830320)
chr5 (4-281)||(40133527-40133812)
chr5 (1-281)||(35511230-35511513)
chr5 (1-282)||(19119998-19120287)
chr5 (4-286)||(36866904-36867194)
chr5 (9-284)||(27330451-27330734)
chr5 (1-267)||(699289-699563)
chr5 (1-281)||(35934034-35934323)
chr5 (2-277)||(5837695-5837978)
chr5 (1-279)||(31705362-31705648)
chr5 (1-279)||(23115980-23116258)
chr5 (1-281)||(22255321-22255609)
chr5 (2-262)||(35504505-35504773)
chr5 (2-268)||(8741646-8741921)
chr5 (1-279)||(25500676-25500962)
chr5 (1-279)||(33908372-33908657)
chr5 (13-280)||(2888194-2888469)
chr5 (1-267)||(15992302-15992576)
chr5 (1-279)||(17157781-17158067)
chr5 (2-281)||(22019772-22020050)
chr5 (9-275)||(25669733-25669997)
chr5 (1-287)||(32563288-32563573)
chr5 (1-279)||(42342870-42343146)
chr5 (4-273)||(22973838-22974115)
chr5 (4-275)||(36860565-36860845)
chr5 (1-265)||(7208628-7208900)
chr5 (2-279)||(27318238-27318522)
chr5 (17-279)||(8437120-8437390)
chr5 (2-278)||(9200373-9200648)
chr5 (1-281)||(28416299-28416563)
chr5 (1-239)||(30969114-30969360)
chr5 (1-261)||(7693369-7693628)
chr5 (103-281)||(24886336-24886514)
chr5 (2-279)||(15724628-15724913)
chr5 (2-281)||(23954550-23954824)
chr5 (1-239)||(35826276-35826520)
chr5 (3-280)||(43308409-43308686)
chr5 (103-282)||(14409088-14409267)
chr5 (103-281)||(25889619-25889797)
chr5 (1-277)||(13956116-13956398)
chr5 (153-279)||(43254154-43254280)
chr5 (4-222)||(21088576-21088799)
chr5 (116-279)||(8466988-8467151)
chr5 (103-281)||(1428921-1429088)
chr5 (1-181)||(6824329-6824515)
chr5 (119-280)||(26269074-26269235)
chr5 (2-256)||(14919312-14919563)
chr5 (1-95)||(26268213-26268307)
chr5 (2-56)||(1429126-1429180)
chr5 (2-104)||(5112247-5112348)
chr5 (229-281)||(34853843-34853895)
chr5 (1-54)||(14409310-14409363)
chr5 (2-47)||(8466884-8466929)
chr5 (2-40)||(24886244-24886282)
chr5 (232-272)||(12080405-12080445)
chr5 (236-279)||(11898197-11898240)
chr5 (232-275)||(22616827-22616870)
chr5 (232-277)||(21321087-21321132)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (6-281)||(26587851-26588126)
chr7 (1-247)||(22687353-22687599)
chr7 (1-276)||(9355590-9355873)
chr7 (1-279)||(37109986-37110274)
chr7 (1-281)||(30055641-30055929)
chr7 (1-279)||(17842345-17842633)
chr7 (1-279)||(6546633-6546919)
chr7 (1-279)||(15612520-15612806)
chr7 (1-282)||(18797441-18797730)
chr7 (1-278)||(27283858-27284145)
chr7 (1-273)||(31578831-31579111)
chr7 (1-280)||(37703258-37703545)
chr7 (1-280)||(8861399-8861686)
chr7 (3-277)||(24211857-24212140)
chr7 (3-279)||(7334910-7335193)
chr7 (4-280)||(4583036-4583320)
chr7 (4-278)||(32432569-32432851)
chr7 (1-280)||(21991750-21992028)
chr7 (4-267)||(15672532-15672806)
chr7 (35-279)||(35353256-35353508)
chr7 (5-279)||(10358975-10359258)
chr7 (1-264)||(46480905-46481176)
chr7 (1-279)||(41764839-41765125)
chr7 (1-276)||(23111304-23111589)
chr7 (2-239)||(25691345-25691590)
chr7 (2-279)||(5657241-5657527)
chr7 (1-234)||(11071320-11071558)
chr7 (1-270)||(10481719-10481996)
chr7 (103-282)||(31520499-31520678)
chr7 (1-264)||(32820830-32821100)
chr7 (2-257)||(37347137-37347399)
chr7 (1-282)||(44598780-44599069)
chr7 (103-281)||(37704406-37704584)
chr7 (1-279)||(48928058-48928344)
chr7 (103-279)||(12390410-12390586)
chr7 (103-276)||(44411304-44411477)
chr7 (1-210)||(12165866-12166074)
chr7 (2-280)||(26980438-26980707)
chr7 (115-279)||(29173758-29173922)
chr7 (1-185)||(33688117-33688309)
chr7 (4-239)||(43925218-43925455)
chr7 (4-169)||(43686157-43686330)
chr7 (103-251)||(32592996-32593143)
chr7 (167-279)||(38258867-38258979)
chr7 (103-249)||(34361967-34362115)
chr7 (1-150)||(38258659-38258816)
chr7 (1-106)||(27421322-27421427)
chr7 (1-106)||(37704271-37704376)
chr7 (2-74)||(44413353-44413425)
chr7 (4-51)||(29173657-29173704)
chr7 (2-56)||(31520716-31520770)
chr7 (1-95)||(48928517-48928611)
chr7 (1-56)||(12390622-12390677)
chr7 (122-186)||(27421219-27421283)
chr7 (2-56)||(38053593-38053647)
chr7 (103-169)||(38053685-38053751)
chr7 (307-349)||(45936575-45936617)
chr7 (18-56)||(32593181-32593219)
chr7 (232-275)||(4902657-4902700)
chr7 (214-281)||(33688051-33688118)
chr7 (205-279)||(12166215-12166289)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (1-285)||(1547414-1547698)
chr1 (1-279)||(27532737-27533021)
chr1 (1-279)||(10181762-10182049)
chr1 (3-285)||(23999484-23999775)
chr1 (1-280)||(32267169-32267456)
chr1 (1-279)||(2959883-2960169)
chr1 (2-279)||(8222264-8222549)
chr1 (1-281)||(15383068-15383357)
chr1 (1-284)||(4330416-4330707)
chr1 (1-279)||(34012137-34012418)
chr1 (3-279)||(19899523-19899808)
chr1 (1-246)||(27227273-27227526)
chr1 (1-273)||(27563666-27563946)
chr1 (2-286)||(37451421-37451713)
chr1 (2-285)||(7078812-7079103)
chr1 (1-280)||(32216190-32216477)
chr1 (2-256)||(51128995-51129255)
chr1 (2-276)||(9902812-9903094)
chr1 (1-279)||(16415781-16416067)
chr1 (3-279)||(46931548-46931831)
chr1 (1-282)||(47279324-47279614)
chr1 (1-277)||(15168231-15168515)
chr1 (1-281)||(27266954-27267240)
chr1 (1-285)||(30254558-30254850)
chr1 (1-273)||(38823349-38823629)
chr1 (1-281)||(10922862-10923150)
chr1 (1-278)||(39393518-39393804)
chr1 (1-279)||(47682249-47682535)
chr1 (2-258)||(28564559-28564821)
chr1 (1-235)||(25160767-25161010)
chr1 (1-281)||(14758176-14758455)
chr1 (4-247)||(238300-238551)
chr1 (3-273)||(27763071-27763350)
chr1 (13-279)||(22170858-22171132)
chr1 (1-282)||(11742120-11742392)
chr1 (1-281)||(3535067-3535346)
chr1 (1-279)||(15752164-15752450)
chr1 (2-258)||(28769788-28770053)
chr1 (1-271)||(42721174-42721448)
chr1 (1-234)||(30326751-30326993)
chr1 (58-280)||(48353735-48353964)
chr1 (1-220)||(3309282-3309515)
chr1 (1-239)||(41926298-41926537)
chr1 (1-256)||(31621326-31621594)
chr1 (1-220)||(18422786-18423006)
chr1 (105-275)||(21289847-21290017)
chr1 (1-274)||(40884948-40885230)
chr1 (2-281)||(33725364-33725640)
chr1 (103-280)||(31962861-31963039)
chr1 (103-281)||(1359689-1359866)
chr1 (1-234)||(37618705-37618933)
chr1 (1-76)||(48620772-48620847)
chr1 (13-171)||(38759680-38759846)
chr1 (185-281)||(48620916-48621012)
chr1 (305-349)||(10562283-10562327)
chr1 (214-280)||(38759846-38759912)
chr1 (232-274)||(42663232-42663274)
chr1 (232-280)||(47555092-47555140)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (1-282)||(22622475-22622764)
chr3 (1-278)||(39282782-39283067)
chr3 (3-280)||(3362385-3362672)
chr3 (1-277)||(42505837-42506121)
chr3 (1-280)||(37157837-37158125)
chr3 (1-282)||(52040679-52040968)
chr3 (1-279)||(26941020-26941306)
chr3 (2-279)||(4015591-4015875)
chr3 (1-281)||(37203197-37203486)
chr3 (1-283)||(46297518-46297808)
chr3 (1-282)||(53228909-53229198)
chr3 (1-265)||(44891627-44891899)
chr3 (1-276)||(33698283-33698566)
chr3 (1-279)||(33378545-33378831)
chr3 (1-279)||(48355071-48355357)
chr3 (1-264)||(24707890-24708163)
chr3 (2-279)||(32373601-32373885)
chr3 (1-273)||(7327246-7327528)
chr3 (20-272)||(1089842-1090102)
chr3 (8-278)||(22445826-22446103)
chr3 (1-282)||(40552016-40552305)
chr3 (5-281)||(36012271-36012558)
chr3 (1-279)||(2008063-2008355)
chr3 (3-277)||(47481654-47481937)
chr3 (1-282)||(14586437-14586716)
chr3 (3-279)||(21009561-21009846)
chr3 (1-279)||(21193736-21194023)
chr3 (3-273)||(54505939-54506218)
chr3 (8-216)||(34133072-34133288)
chr3 (1-280)||(25579869-25580156)
chr3 (2-280)||(29099486-29099764)
chr3 (103-275)||(11357145-11357317)
chr3 (2-245)||(22451099-22451350)
chr3 (1-247)||(3654991-3655248)
chr3 (1-275)||(4761412-4761695)
chr3 (1-210)||(46994490-46994707)
chr3 (1-280)||(11466954-11467227)
chr3 (4-279)||(24488721-24489005)
chr3 (1-279)||(43975652-43975934)
chr3 (2-261)||(44186295-44186546)
chr3 (1-239)||(29163948-29164178)
chr3 (1-283)||(38591828-38592105)
chr3 (103-280)||(40936213-40936390)
chr3 (5-194)||(54828546-54828743)
chr3 (1-169)||(43348387-43348563)
chr3 (28-277)||(20373025-20373263)
chr3 (103-279)||(51212537-51212707)
chr3 (2-178)||(11835494-11835673)
chr3 (1-178)||(45174635-45174821)
chr3 (57-281)||(11356916-11357140)
chr3 (105-244)||(50475053-50475199)
chr3 (103-270)||(27480127-27480298)
chr3 (1-95)||(35844456-35844550)
chr3 (1-73)||(51212955-51213027)
chr3 (1-95)||(53176184-53176278)
chr3 (193-279)||(35844577-35844663)
chr3 (103-176)||(53811597-53811670)
chr3 (2-58)||(27480368-27480424)
chr3 (1-56)||(11357355-11357410)
chr3 (2-43)||(20373300-20373341)
chr3 (229-278)||(34133324-34133373)
chr3 (232-274)||(23165291-23165333)
chr3 (232-273)||(18271873-18271914)
chr3 (1-34)||(40936121-40936154)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (1-281)||(5299710-5299998)
chr8 (1-280)||(16446640-16446927)
chr8 (1-279)||(38644116-38644402)
chr8 (1-280)||(1149397-1149684)
chr8 (1-280)||(37970284-37970571)
chr8 (2-281)||(11727163-11727451)
chr8 (1-281)||(34895105-34895388)
chr8 (2-284)||(4132447-4132736)
chr8 (1-282)||(43643358-43643647)
chr8 (3-267)||(8803594-8803867)
chr8 (2-279)||(1205066-1205351)
chr8 (8-281)||(36694730-36695011)
chr8 (1-279)||(7890723-7891009)
chr8 (44-239)||(24823200-24823395)
chr8 (1-247)||(6098311-6098570)
chr8 (1-279)||(16223001-16223290)
chr8 (4-259)||(40862560-40862824)
chr8 (2-247)||(27082636-27082889)
chr8 (1-277)||(23854200-23854483)
chr8 (1-265)||(44869635-44869907)
chr8 (1-279)||(33906350-33906634)
chr8 (13-282)||(1953751-1954029)
chr8 (1-260)||(12876247-12876515)
chr8 (1-276)||(465980-466253)
chr8 (1-273)||(39098891-39099171)
chr8 (103-281)||(35859182-35859360)
chr8 (3-280)||(30654348-30654633)
chr8 (9-274)||(18259229-18259498)
chr8 (1-265)||(35459491-35459763)
chr8 (1-278)||(31933653-31933938)
chr8 (8-216)||(9864293-9864509)
chr8 (103-276)||(34951826-34951999)
chr8 (103-273)||(12587830-12588000)
chr8 (110-280)||(33198057-33198227)
chr8 (1-279)||(10554970-10555254)
chr8 (1-169)||(13307761-13307936)
chr8 (156-278)||(41362723-41362845)
chr8 (103-209)||(1149756-1149862)
chr8 (1-106)||(41910935-41911040)
chr8 (155-280)||(43025974-43026100)
chr8 (8-104)||(43025847-43025943)
chr8 (1-68)||(1150090-1150157)
chr8 (1-56)||(7998432-7998488)
chr8 (207-281)||(13307931-13308005)
chr8 (2-56)||(34952028-34952082)
chr8 (103-176)||(34463722-34463792)
chr8 (232-282)||(30650896-30650946)
chr8 (208-281)||(41910822-41910895)
chr8 (1-55)||(41362653-41362707)
chr8 (229-278)||(9864545-9864594)
chr8 (232-274)||(5018564-5018606)
chr8 (232-277)||(34686112-34686156)
chr8 (44-88)||(12585297-12585341)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (1-279)||(41960979-41961265)
chr2 (1-278)||(43648024-43648309)
chr2 (4-280)||(4167064-4167348)
chr2 (1-274)||(33709015-33709296)
chr2 (2-281)||(2325154-2325441)
chr2 (1-285)||(33660149-33660432)
chr2 (2-280)||(26357717-26358003)
chr2 (8-277)||(3177085-3177362)
chr2 (1-281)||(4763770-4764059)
chr2 (9-286)||(18494052-18494336)
chr2 (1-279)||(29241923-29242202)
chr2 (1-265)||(31570526-31570798)
chr2 (3-282)||(11366155-11366443)
chr2 (2-279)||(35959037-35959317)
chr2 (1-279)||(19424420-19424692)
chr2 (4-277)||(44913805-44914090)
chr2 (1-279)||(19289101-19289387)
chr2 (16-282)||(41465655-41465929)
chr2 (1-280)||(31861991-31862278)
chr2 (1-255)||(37905847-37906112)
chr2 (1-280)||(27349730-27350003)
chr2 (4-276)||(39167150-39167424)
chr2 (2-256)||(5881679-5881931)
chr2 (2-207)||(4263926-4264140)
chr2 (1-281)||(7006715-7006985)
chr2 (1-256)||(43770649-43770903)
chr2 (103-281)||(19500693-19500869)
chr2 (1-239)||(33550801-33551050)
chr2 (1-273)||(13711603-13711878)
chr2 (1-206)||(4478508-4478717)
chr2 (1-190)||(44286088-44286285)
chr2 (1-193)||(19313990-19314186)
chr2 (2-159)||(36642126-36642293)
chr2 (1-159)||(45327859-45328025)
chr2 (119-277)||(41051083-41051238)
chr2 (1-148)||(17071646-17071801)
chr2 (3-95)||(18258257-18258349)
chr2 (1-95)||(17054066-17054160)
chr2 (157-278)||(33902317-33902439)
chr2 (142-251)||(18257344-18257453)
chr2 (192-281)||(45328028-45328116)
chr2 (2-128)||(41463779-41463913)
chr2 (135-239)||(41463408-41463512)
chr2 (1-95)||(33902205-33902299)
chr2 (214-282)||(36642296-36642364)
chr2 (183-227)||(17053961-17054005)
chr2 (183-227)||(17071602-17071646)
chr2 (236-284)||(27138682-27138730)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-282)||(8026-8315)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (4-281)||(3879696-3879981)
chr6 (1-279)||(6090941-6091228)
chr6 (16-279)||(20768236-20768507)
chr6 (3-278)||(1945975-1946260)
chr6 (1-280)||(4318574-4318868)
chr6 (3-280)||(5627532-5627818)
chr6 (1-274)||(33892776-33893048)
chr6 (1-279)||(7234791-7235080)
chr6 (1-266)||(29182302-29182573)
chr6 (4-239)||(21016917-21017154)
chr6 (2-267)||(8513373-8513634)
chr6 (115-277)||(7054533-7054696)
chr6 (104-258)||(33619080-33619237)
chr6 (1-244)||(6089047-6089286)
chr6 (5-140)||(30353256-30353399)
chr6 (1-106)||(15491754-15491859)
chr6 (3-95)||(7055166-7055258)
chr6 (180-235)||(33724062-33724117)
chr6 (232-281)||(6613655-6613704)
chr6 (232-279)||(21016726-21016773)
chr6 (1-38)||(33618973-33619010)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (1-276)||(7703648-7703931)
chr4 (1-280)||(47253879-47254166)
chr4 (1-279)||(19089239-19089525)
chr4 (1-281)||(37663525-37663813)
chr4 (1-279)||(28002772-28003058)
chr4 (2-278)||(3042759-3043043)
chr4 (1-264)||(33341537-33341808)
chr4 (1-281)||(25184252-25184540)
chr4 (3-281)||(34361275-34361562)
chr4 (2-281)||(36493473-36493759)
chr4 (1-279)||(30002427-30002704)
chr4 (3-280)||(32912364-32912650)
chr4 (8-281)||(17167859-17168140)
chr4 (8-281)||(17173436-17173717)
chr4 (1-278)||(37775806-37776082)
chr4 (9-281)||(17272111-17272391)
chr4 (1-277)||(46887946-46888229)
chr4 (9-280)||(29583985-29584264)
chr4 (8-279)||(55240891-55241170)
chr4 (1-279)||(6864174-6864460)
chr4 (2-264)||(1815441-1815710)
chr4 (1-279)||(19440434-19440720)
chr4 (2-237)||(34947923-34948168)
chr4 (1-281)||(35020815-35021107)
chr4 (1-279)||(49376106-49376392)
chr4 (1-239)||(55477717-55477963)
chr4 (1-282)||(23761211-23761499)
chr4 (1-281)||(37287865-37288156)
chr4 (1-279)||(879334-879620)
chr4 (1-281)||(33816300-33816605)
chr4 (1-256)||(50697380-50697644)
chr4 (1-277)||(50764869-50765143)
chr4 (16-279)||(32579600-32579871)
chr4 (1-278)||(9139384-9139653)
chr4 (1-273)||(32592232-32592503)
chr4 (1-279)||(25700842-25701129)
chr4 (2-279)||(4598132-4598407)
chr4 (1-280)||(42199868-42200156)
chr4 (1-279)||(5047752-5048037)
chr4 (1-277)||(27396755-27397037)
chr4 (103-280)||(4205233-4205410)
chr4 (114-282)||(26896346-26896516)
chr4 (125-281)||(23431826-23431982)
chr4 (116-251)||(35025381-35025515)
chr4 (103-286)||(39400257-39400440)
chr4 (103-251)||(7152018-7152166)
chr4 (4-273)||(46883905-46884177)
chr4 (1-276)||(4934001-4934274)
chr4 (1-169)||(38011993-38012169)
chr4 (160-280)||(38012568-38012688)
chr4 (2-68)||(39398049-39398115)
chr4 (2-93)||(54499217-54499309)
chr4 (1-95)||(35025574-35025668)
chr4 (103-158)||(56050179-56050234)
chr4 (232-281)||(47073059-47073108)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (1-278)||(12048-12332)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (1-279)||(408191-408475)
scaffold0002 (4-239)||(276-513)
scaffold0002 (103-267)||(93873-94036)
scaffold0002 (1-100)||(94330-94429)
scaffold0002 (229-284)||(692-747)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (3-281)||(145773-146060)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-281)||(44096-44383)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-281)||(154404-154691)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-279)||(267423-267701)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (132-199)||(100993-101058)
scaffold0009 (6-47)||(100894-100935)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (236-273)||(11378-11415)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 39572958 - 39573235
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
39572958 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaac 39573057  T
101 tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39573058 tctgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 39573157  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||    
39573158 ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaagctcc 39573235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38528273 - 38527986
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
38528273 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 38528174  T
101 tct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |||        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38528173 tctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 38528074  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
38528073 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaagctccct 38527986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 12910494 - 12910779
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||     
12910494 gattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaac 12910593  T
101 tctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||        ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
12910594 tctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcagcaa 12910693  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
12910694 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctcc 12910779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31786682 - 31786397
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||     
31786682 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaac 31786583  T
101 tctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||        ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
31786582 tctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaa 31786483  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
31786482 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgattgcaccatagaatctcc 31786397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 22980932 - 22981218
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||  ||     
22980932 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcataaac 22981031  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
22981032 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaatcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaa 22981131  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
22981132 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctccc 22981218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 282
Target Start/End: Original strand, 5830032 - 5830320
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |    
5830032 attaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaact 5830131  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5830132 ctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 5830231  T
194 caacaatttaaaaatg-aatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
5830232 caacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttcc-aaaatgtcaattttctgactgcaccgtagaagcttcctta 5830320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 281
Target Start/End: Original strand, 40133527 - 40133812
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |    
40133527 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactat 40133626  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
40133627 gtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatca 40133726  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
40133727 acaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagctccctt 40133812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35511513 - 35511230
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||| |||||| |||     
35511513 gattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaa 35511419  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
35511418 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaa 35511319  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
35511318 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccctt 35511230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 19119998 - 19120287
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
19119998 gattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 19120097  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
19120098 tccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtga 19120197  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
19120198 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccttagaagctccctta 19120287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 36866904 - 36867194
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |    
36866904 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactat 36867003  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
36867004 gtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatca 36867103  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttattaa 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
36867104 acaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagctccctaattaa 36867194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Original strand, 27330451 - 27330734
Alignment:
9 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct----- 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| |||         
27330451 agaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttg 27330550  T
104 ---gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
       ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
27330551 catgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgat 27330650  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
27330651 ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctcccttatt 27330734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 699289 - 699563
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||     
699289 gattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaac 699388  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
699389 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaa 699488  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcacc 267  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
699489 ttaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttcctgactgcacc 699563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 35934034 - 35934323
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
35934034 gattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaa 35934133  T
100 ------ttc--tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
          |||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
35934134 ctttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcattactagttgaattattattgatcattaatcagta 35934233  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||| ||||| |||||||    
35934234 atcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcataactgcaccgtagaaactccctt 35934323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 5837695 - 5837978
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |    
5837695 attaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 5837794  T
102 ct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    ||        |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
5837795 ctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatcaataat 5837894  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||    
5837895 caacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtcagtttgatgactgcaccagagaagctc 5837978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31705648 - 31705362
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||| || || ||||||| |||||| |||     
31705648 gattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcacaaaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaac 31705549  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31705548 tctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 31705449  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
31705448 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaatctccc 31705362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23116258 - 23115980
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
23116258 gattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 23116159  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
23116158 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactg--------actattgatcattaatcagtaa 23116067  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
23116066 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcattttcctgacttcaccgtagaaactccc 23115980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 22255321 - 22255609
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||     
22255321 gattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacaccacacaaagtgtaacacttaaaactattacataatatcatcaac 22255420  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22255421 tatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagccttactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 22255520  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
22255521 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagtcagtttcctgactgtaccgtagaagctccctt 22255609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Original strand, 35504505 - 35504773
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||| |    
35504505 attaacaagactacacttaatataattttatcctaccatattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaat 35504604  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
35504605 ctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgattattaatcagtaat 35504704  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgact 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
35504705 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattgactttttcaaaaaagtcaatttcttgact 35504773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8741921 - 8741646
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgat-atcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||     
8741921 attaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaac 8741822  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
8741821 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttgcaagcatcactagatgaaatactattgatcattaatcagtaa 8741722  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcacca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||    
8741721 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtctgtttcatgactgcacca 8741646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25500962 - 25500676
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa- 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||     
25500962 gattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaac 25500863  T
100 -ttct------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
     ||||      |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
25500862 tttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaaatactgttgatcattaatcagtaa 25500763  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||    
25500762 ttaacaatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 25500676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 33908372 - 33908657
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc---aac 97  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||   |||    
33908372 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcgtcaac 33908471  T
98 aat-----tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
     ||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
33908472 tatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat-aattactattgatcattaatcagcaa 33908570  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||    
33908571 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaactgcaccgtagatgctccc 33908657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2888469 - 2888194
Alignment:
13 tacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt------ 106  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||| | ||||          
2888469 tacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgcatg 2888370  T
107 --aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 204  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2888369 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 2888270  T
205 aaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
2888269 aaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagccccct 2888194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15992576 - 15992302
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||  ||     
15992576 gattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgatttgagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaac 15992477  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15992476 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 15992377  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcacc 267  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
15992376 ttaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcacc 15992302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17158067 - 17157781
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| | |||     
17158067 gattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagaccatcacataatattatcaac 17157968  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17157967 tctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaa 17157868  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
17157867 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgtaccgtagaagctccc 17157781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 281
Target Start/End: Original strand, 22019772 - 22020050
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||||| ||| |    
22019772 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtataacactca---------catgatatcagcaact 22019862  T
102 ct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    ||        |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22019863 ctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 22019962  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
22019963 caacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagttccctt 22020050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 275
Target Start/End: Original strand, 25669733 - 25669997
Alignment:
9 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt-- 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||         |||||||||| ||| ||||||      
25669733 agaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa-gtgtaacactca---------catgatatcatcaactctgtttg 25669822  T
107 ------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25669823 catgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 25669922  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
25669923 ttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagc 25669997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 32563288 - 32563573
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||||||||| |||     
32563288 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaacactca---------catgatatcagcaac 32563378  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
32563379 tctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagaattactagataaattattattgatcattaatcagcaa 32563478  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttattaac 287  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||    
32563479 ttaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaagctctcttcttaac 32563573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 42342870 - 42343146
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         |||||||||| |||     
42342870 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcttac-ttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacactca---------catgatatcatcaac 42342959  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
42342960 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaa 42343059  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
42343060 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 42343146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22974115 - 22973838
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||| |||| | ||| |||    
22974115 taacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactct 22974016  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22974015 gtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 22973916  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
22973915 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaaatcagttttctgactgcaccatagaa 22973838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 36860565 - 36860845
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |     
36860565 taacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaacta 36860664  T
103 tgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 194  Q
    ||||        ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
36860665 tgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaattactattaatcatgaattagtaatc 36860764  T
195 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagc 275  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
36860765 aacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagc 36860845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7208900 - 7208628
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||   |||     
7208900 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattttcaac 7208801  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
7208800 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaa 7208701  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||    
7208700 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttaaaaaaagtcagtttcttaactgca 7208628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27318522 - 27318238
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |    
27318522 attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 27318423  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        |||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
27318422 ctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacat--aagtttaagatgttgcaaacattactatatgaattactattgatcattaatcaaaaat 27318325  T
194 caacaattt-aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
27318324 caacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgcaccatagaaactccc 27318238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 8437120 - 8437390
Alignment:
17 cttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||| | ||| ||||||        ||    
8437120 cttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaa 8437219  T
109 agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8437220 agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat 8437319  T
209 gaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||    
8437320 gaattaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcatcgtagatgctccc 8437390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 9200373 - 9200648
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         |||||||||| ||| |    
9200373 attaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattccacaaagtgtaacactca---------catgatatcagcaact 9200463  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9200464 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 9200563  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
9200564 caacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaattttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagctcc 9200648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 28416563 - 28416299
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||     
28416563 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatcagcaac 28416473  T
101 tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
    ||       |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
28416472 tc-------gatgccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaat 28416380  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||    
28416379 ttaaaaaagaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagcttcatgactgcaccgtagaagctccctt 28416299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30969360 - 30969114
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
30969360 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 30969261  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        |||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
30969260 tttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaagtattactagatgagttactattaatcattaatcagtaa 30969161  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
30969160 tccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 30969114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 7693369 - 7693628
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| | |||     
7693369 gattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatattagcaac 7693459  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
7693460 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaa 7693559  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgac 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||| |||| ||||    
7693560 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttagaaaagtcagtttcatgac 7693628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 281
Target Start/End: Original strand, 24886336 - 24886514
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24886336 tgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaattt 24886435  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
24886436 aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccataaaagctccctt 24886514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 15724628 - 15724913
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||| |    
15724628 attaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgccccaaagtgtatcaattaagactatcatatgatatcaacaact 15724727  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
15724728 ttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaagcattactagatgaattactattaatcattaatcaataat 15724827  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| | | |||| ||||| |||| || ||||||||    
15724828 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagttaaaattaactttttcaaaaaaattagtttcatgacttcaccttaaaagctccc 15724913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23954824 - 23954550
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |    
23954824 attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 23954725  T
102 ctgtta-------aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 194  Q
    |||||        || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||          
23954724 ctgtttgcatgttaaaatgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagatg-----aacattacttgatgaattactattgatcattaatca------ 23954636  T
195 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
23954635 -acaatttaaaaatgaattaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctccctt 23954550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35826520 - 35826276
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || | ||||| |  |||||| |||     
35826520 gattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactccacaaagtgtaacccttaagattatcata--atatcatcaac 35826423  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
35826422 tctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataa 35826323  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
35826322 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 35826276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43308686 - 43308409
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||  ||| |  ||  |         
43308686 ttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgtaacacttaagactatatcatcaactcttcttgca 43308587  T
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
43308586 tgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaattt 43308487  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
43308486 aaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccattgaagctccct 43308409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14409267 - 14409088
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
14409267 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattattcagcaatcaacaattt 14409168  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
14409167 aaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaatttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaagctccctta 14409088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 281
Target Start/End: Original strand, 25889619 - 25889797
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25889619 tgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 25889718  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
25889719 aaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttccagaaaagtcagtttcctgactgcatcgtagaagctccctt 25889797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13956398 - 13956116
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| || |||||| |||     
13956398 gattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactatcatataatatcatcaaa 13956299  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13956298 tttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 13956199  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    ||||||||||  || |   |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||    
13956198 tcaacaattt--aactttttcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaaaatcagctttctgactgcaccgtagaagctc 13956116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 279
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254280
Alignment:
153 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaa 43254253  T
253 tttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
43254254 tttcctgactgcaccatagaagctccc 43254280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21088799 - 21088576
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa---- 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||        
21088799 taacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactat 21088700  T
100 ----ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
         | ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||      
21088699 gtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattaatcatgaataaataat-- 21088602  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaa 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
21088601 -caatttaaaaatgaatcaaacattaa 21088576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 279
Target Start/End: Original strand, 8466988 - 8467151
Alignment:
116 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 215  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
8466988 aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaatcaa 8467087  T
216 acattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||  | |||||||||||  |||||| ||| |||  ||| |||||||||||| |||||    
8467088 acattaaaaataaaattaactttttaaaaaaaatcagtttaatgattgcaccatagaaactccc 8467151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1429088 - 1428921
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa---tcaacaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
1429088 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatattcaacaa 1428989  T
200 tttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||              | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
1428988 tttaaa--------------tgatatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcatgagtgcaccatagaagctccctt 1428921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6824515 - 6824329
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||     
6824515 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaac 6824417  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 181  Q
    ||        ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
6824416 tctgtttgcatgttaaagatgtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgagatactattgatca 6824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 280
Target Start/End: Original strand, 26269074 - 26269235
Alignment:
119 gataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 218  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
26269074 gataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaccaatca 26269173  T
219 ttaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||| || | ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||    
26269174 ttaagattaaaattaactttttcataaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaaactccct 26269235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14919563 - 14919312
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| |    
14919563 attaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacctcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaact 14919464  T
102 c--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        ||||||||||  |||| ||||||| |||    |||||||||||| |||||| |      ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
14919463 ctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgta----taagtccaagatattgcaatc------agatgaattac-attgatcattaatcagaaat 14919375  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttc 256  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||    
14919374 ctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttc 14919312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 26268213 - 26268307
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 95  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
26268213 gattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatca 26268307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 1429180 - 1429126
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 56  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1429180 attaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 1429126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5112348 - 5112247
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||| |||||| |||||| ||| |    
5112348 attaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-accccacaaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaact 5112250  T
102 ctg 104  Q
    |||    
5112249 ctg 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34853895 - 34853843
Alignment:
229 aattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
34853895 aattaacttttccaaaaaagtcagtttcccgactgcaccatagaagctccctt 34853843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 14409363 - 14409310
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 54  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
14409363 gattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac 14409310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Original strand, 8466884 - 8466929
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 47  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
8466884 attaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaa 8466929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Original strand, 24886244 - 24886282
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctacctt 40  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
24886244 attaacaagactacacttaatctaattttatcctacctt 24886282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12080445 - 12080405
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccataga 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
12080445 taactttttcaaaaaagtcaatttcctgactacaccataga 12080405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 279
Target Start/End: Original strand, 11898197 - 11898240
Alignment:
236 ttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
11898197 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 11898240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 275
Target Start/End: Original strand, 22616827 - 22616870
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagc 275  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
22616827 taacttttccaaaaaaatcagttttctgactgcaccatagaagc 22616870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 277
Target Start/End: Original strand, 21321087 - 21321132
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
21321087 taactttttcaaaaaagtcagttttctggctgcaccatagaagctc 21321132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26587851
Alignment:
6 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgt 26588027  T
106 taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaa 205  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26588026 taaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaa 26587927  T
206 aatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||    
26587926 aataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgattgcgccgtagaagctccctt 26587851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 22687353 - 22687599
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
22687353 gattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatctcatgatatcaacaac 22687452  T
101 tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22687453 tctgttaaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaatagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 22687552  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaa 247  Q
    |||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||    
22687553 ttaaaaatgaatcatacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 22687599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9355873 - 9355590
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||     
9355873 gattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaac 9355774  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
9355773 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcaataa 9355674  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
9355673 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgcctgcaccatagaagct 9355590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 37109986 - 37110274
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatccta--ccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaaca 98  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||    
37109986 gattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatca 37110085  T
99 attctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 190  Q
    | ||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37110086 actctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 37110185  T
191 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
37110186 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaaaaaatcaatttcttgactgcaccgtagaagctccc 37110274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 30055641 - 30055929
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa- 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
30055641 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 30055740  T
100 ----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
        |||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30055741 gttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 30055840  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
30055841 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccctt 30055929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17842633 - 17842345
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatccta--ccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaaca 98  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||    
17842633 gattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatca 17842534  T
99 attctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 190  Q
    | ||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17842533 actctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagt 17842434  T
191 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
17842433 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaagctccc 17842345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 6546633 - 6546919
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||     
6546633 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaatattatcacatgatatcagcaac 6546732  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6546733 tctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 6546832  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
6546833 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 6546919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15612806 - 15612520
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
15612806 gattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 15612707  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
15612706 tctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcattaatcagtaa 15612607  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
15612606 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttaaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 15612520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 18797441 - 18797730
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
18797441 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 18797540  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18797541 tctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 18797640  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||    
18797641 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgcatcataaaagctccctta 18797730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 27283858 - 27284145
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||     
27283858 gattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaac 27283957  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27283958 tatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 27284057  T
193 tcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaaaatcataattaa-cttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27284058 tcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaatcttttcaaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 27284145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31579111 - 31578831
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
31579111 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 31579012  T
101 tct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | |        |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
31579011 tttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataa 31578912  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
31578911 tcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaa 31578831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37703545 - 37703258
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| |||     
37703545 gattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatcatcaac 37703446  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
37703445 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataa 37703346  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
37703345 tcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttactgactgcaccatagaagctccct 37703258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 8861399 - 8861686
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||     
8861399 gattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccgcaaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaac 8861498  T
101 tct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |||        |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
8861499 tctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcatgcattactagatgaaatactattgatcattaatcagtaa 8861598  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
8861599 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatcactgcaccgttgaagctccct 8861686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 24211857 - 24212140
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||| |     
24211857 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactt 24211956  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
24211957 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 24212056  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
24212057 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctc 24212140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 7334910 - 7335193
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| || |||||| ||| |     
7334910 ttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacagagtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaacta 7335009  T
103 -------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
           ||||||||||  | || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
7335010 gtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagaaatca 7335109  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7335110 ataatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 7335193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 280
Target Start/End: Original strand, 4583036 - 4583320
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |    
4583036 taacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactat 4583135  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
4583136 gtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtcatca 4583235  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
4583236 acaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctggctgcaccgtagaagctccct 4583320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 32432569 - 32432851
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||  ||    
32432569 taacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacact 32432668  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
32432669 gtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaattattattaatcatgaatcaataatca 32432768  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
32432769 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 32432851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 21991750 - 21992028
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
21991750 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 21991849  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    || |||    
21991850 tttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca-----agatgaattactattgatcat----cattaa 21991940  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| | |||| ||||||||||||    
21991941 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaccttttcaaaaaagtcagtttcatgattacaccgtagaagctccct 21992028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15672806 - 15672532
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||    
15672806 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactct 15672707  T
104 --------gttaaagatgtcaacgataaaata---gtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
            |||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
15672706 atttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatgcatcaataa 15672607  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcacc 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
15672606 tcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcacc 15672532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 279
Target Start/End: Original strand, 35353256 - 35353508
Alignment:
35 taccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | |        |||||||||||||||||||||||    
35353256 taccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaat 35353355  T
127 agtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatc 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
35353356 agtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatc 35353455  T
227 ataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
35353456 aaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccttagaagctccc 35353508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10359258 - 10358975
Alignment:
5 aacaagaatacacttaa-tctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | || ||| |||    
10359258 aacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactct 10359159  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
10359158 gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactaaatgatttactattgatcattaatcaataatca 10359059  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||||||    
10359058 acaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaattaactttttcaaaaaagttagtttcttaactgcaccgtagaagctccc 10358975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46481176 - 46480905
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||     
46481176 gattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcattaac 46481077  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46481076 tttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 46480977  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgc 264  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
46480976 tcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgc 46480905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41765125 - 41764839
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
41765125 gattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 41765026  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
41765025 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgcaagcattactggatgaattattattgatcattaatcagcaa 41764926  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||    
41764925 tcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatttcccgactccaccgtagaaactccc 41764839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 23111304 - 23111589
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttat--cctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaaca 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||    
23111304 gattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 23111403  T
99 attctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 190  Q
    | ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
23111404 actctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaagcattactagaagaattactattgatcataaatcagt 23111503  T
191 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
23111504 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgtaccgtagaagct 23111589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25691590 - 25691345
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |    
25691590 attaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaact 25691491  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25691490 ctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 25691391  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
25691390 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaatttt 25691345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5657527 - 5657241
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||| |    
5657527 attaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaact 5657428  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5657427 atgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgagtaat 5657328  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaa-atcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||   |||||||||||    
5657327 caaaaatttaaaaatgaataaatcattaaagattaaaattaactttttcaaaaatgtcagtttcataactgcattgtagaagctccc 5657241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 11071320 - 11071558
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa- 99  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||     
11071320 gattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaac 11071419  T
100 ----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
        |||   |||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
11071420 tttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcattaa 11071516  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11071517 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 11071558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 10481719 - 10481996
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
10481719 gattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 10481818  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||| ||        ||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
10481819 tctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgatcgttaatcagtaa 10481918  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccata 270  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
10481919 ttaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccata 10481996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 103 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31520678 - 31520499
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
31520678 tgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaattt 31520579  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
31520578 aaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccatagaagctccctta 31520499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32821100 - 32820830
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||     
32821100 gattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaac 32821001  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
32821000 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattcatcaataa 32820901  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||    
32820900 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt-taaaaaaattaattttctgactgc 32820830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 37347137 - 37347399
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||| |    
37347137 attaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaact 37347235  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
37347236 ctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaat 37347335  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcc 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
37347336 taacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcc 37347399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 44598780 - 44599069
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||     
44598780 gattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaac 44598879  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc---ag 189  Q
    ||        ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |     
44598880 tctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgttacaagcattactagatgaa--actattgatcattaatcaataa 44598977  T
190 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||| || | |||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||    
44598978 taatcaacaattt-aaaatgaatcaatcgttaagattaaaattaattttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaaactccctta 44599069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 103 - 281
Target Start/End: Original strand, 37704406 - 37704584
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
37704406 tgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaattt 37704505  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
37704506 acaaatgaatcaaacattaaaatcaagattagtttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccataaaagctccctt 37704584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 48928344 - 48928058
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  || || |||||| ||| |||||| |||     
48928344 gattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaac 48928245  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
48928244 tatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaa 48928145  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
48928144 tcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaatttttttaaaaaagtcaattttctaactgcaccgtagaagctccc 48928058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12390586 - 12390410
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
12390586 tgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaccattactagatgaattactatttatcattaatcagtaattgacaattt 12390487  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
12390486 aaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgacttcaccgtagaagctccc 12390410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44411477 - 44411304
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
44411477 tgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgaccattaatcagtaatcaacaattt 44411378  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
44411377 aaaaatgaatgaaacattaagatcataattaacctttccaaaaaagttagtttcctgactgcaccatataagct 44411304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 12165866 - 12166074
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| |||     
12165866 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------cataatatcagcaac 12165956  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12165957 tctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 12166056  T
193 tcaacaatttaaaaatga 210  Q
    ||||||||||||||||||    
12166057 tcaacaatttaaaaatga 12166074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 26980438 - 26980707
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                 | || ||||||||||||||||| ||| |    
26980438 attaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacatgatatcagcaact 26980520  T
102 ct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    ||        |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
26980521 ctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattattgttgatcattaatcggtaat 26980620  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
26980621 caacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccttagaagctccct 26980707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 29173758 - 29173922
Alignment:
115 caacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatca 214  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
29173758 caacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatca 29173857  T
215 aacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
29173858 aacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcatcgtagaagctccc 29173922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33688309 - 33688117
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||     
33688309 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaac 33688210  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 185  Q
    ||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
33688209 tctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaa 33688117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 43925218 - 43925455
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| || || ||||||| |||||| ||| |||    
43925218 taacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcacaacgtttaatacttaatacaatcacataatatcatcaactct 43925317  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||||||| ||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
43925318 gtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcactaatca 43925411  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
43925412 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 43925455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 43686157 - 43686330
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa---- 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||        
43686157 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactat 43686256  T
100 ----ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 169  Q
         | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
43686257 gtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaat 43686330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32593143 - 32592996
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
32593143 tgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaatattactagataaattactatggatcattaatcagcaatcaacaattt 32593044  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtca 251  Q
     |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
32593043 -aaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 32592996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 279
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258979
Alignment:
167 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcac 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||    
38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctgactgcac 38258966  T
267 catagaagctccc 279  Q
    | |||||||||||    
38258967 cgtagaagctccc 38258979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34362115 - 34361967
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
34362115 tgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtcattaacaattt 34362016  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaa--tcataattaacttttccaaaaaagt 249  Q
    |||||||||||||||||||||   | | ||||||||||| |||||||||    
34362015 aaaaatgaatcaaacattaaagatttaaaattaactttttcaaaaaagt 34361967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 38258659 - 38258816
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
38258659 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 38258758  T
101 t--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 150  Q
    |         ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
38258759 tttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27421427 - 27421322
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||     
27421427 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaac 27421328  T
101 tctgtt 106  Q
    ||||||    
27421327 tctgtt 27421322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 37704271 - 37704376
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||| |||     
37704271 gattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaac 37704370  T
101 tctgtt 106  Q
    ||||||    
37704371 tctgtt 37704376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 44413425 - 44413353
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 74  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44413425 attaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 44413353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 29173657 - 29173704
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29173657 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgt 29173704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 31520770 - 31520716
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 56  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
31520770 attaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 31520716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 48928611 - 48928517
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 95  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||  || || |||||| ||| ||||||    
48928611 gattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatca 48928517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 12390677 - 12390622
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 56  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
12390677 gattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacac 12390622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421219
Alignment:
122 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||    
27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaataatattgatcattaat 27421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Original strand, 38053593 - 38053647
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 56  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
38053593 attaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataagtgtaacac 38053647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Original strand, 38053685 - 38053751
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 169  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
38053685 tgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattatttgatgaat 38053751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 349
Target Start/End: Original strand, 45936575 - 45936617
Alignment:
307 ttgttaacttcaggcagatatgagcaagaattttccagtacct 349  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45936575 ttgttaatttcaggcagatatgagcaagaattttccagtacct 45936617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 32593219 - 32593181
Alignment:
18 ttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 56  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
32593219 ttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 32593181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 275
Target Start/End: Original strand, 4902657 - 4902700
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagc 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
4902657 taactttttcaaaaaagtcaattttctgacttcaccatagaagc 4902700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33688118 - 33688051
Alignment:
214 aaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||    
33688118 aaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcacgactgcactgtagaagctccctt 33688051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Original strand, 12166215 - 12166289
Alignment:
205 aaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||   |||||||||||    
12166215 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagtttcatgactgcagtgtagaagctccc 12166289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 1547414 - 1547698
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
1547414 gattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaac 1547513  T
101 tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
1547514 tctgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatcaacaat 1547613  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatta 285  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||| |||| | | || ||| ||||| |||||| ||||    
1547614 ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcataattgtaccgtagaaactccctaatta 1547698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27533021 - 27532737
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
27533021 gattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcagcaat 27532923  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27532922 tctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 27532823  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||    
27532822 tcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 27532737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10182049 - 10181762
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
10182049 gattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 10181950  T
101 tctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacat-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
    ||||        ||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
10181949 tctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcaaca 10181850  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
10181849 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagttagtttcctgactgcaccatagaagctccc 10181762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 285
Target Start/End: Original strand, 23999484 - 23999775
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
23999484 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 23999583  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
23999584 tatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 23999683  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23999684 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaggtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatta 23999775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 32267169 - 32267456
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||     
32267169 gattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactccacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaac 32267268  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
32267269 tttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcagtaa 32267368  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32267369 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccct 32267456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 2959883 - 2960169
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
2959883 gattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 2959982  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2959983 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 2960082  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
2960083 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaagatccc 2960169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 8222264 - 8222549
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |    
8222264 attaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaact 8222363  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
8222364 ctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta-tattgatcattaatcagtaat 8222462  T
194 caacaatttaaaaatg-aatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||    
8222463 caacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgtaccgtagaagctccc 8222549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 15383068 - 15383357
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||     
15383068 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaac 15383167  T
101 tctgt--------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | |||        |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
15383168 tatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagcaa 15383267  T
193 tcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
15383268 tcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgaaccgtagaagctccctt 15383357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 4330416 - 4330707
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
4330416 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 4330515  T
101 tct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |||        |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
4330516 tctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattacaattgatcattaatcagtaa 4330615  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatt 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
4330616 tcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttccaaaaaaatcagttgtctgactgcaccgtagaagcttccttatt 4330707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34012418 - 34012137
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||| |||||| |||     
34012418 gattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaa 34012324  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
34012323 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaa 34012224  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
34012223 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 34012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19899808 - 19899523
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
19899808 ttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactc 19899709  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
19899708 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 19899609  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
19899608 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttcctaactgcactgtagaagctccc 19899523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27227526 - 27227273
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||     
27227526 gattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaac 27227427  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27227426 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 27227327  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaa 246  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
27227326 tcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaattaacttttccaaaaa 27227273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27563946 - 27563666
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| || || ||| |||     
27563946 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaac 27563847  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27563846 tctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaa 27563747  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
27563746 tcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaaatcagtttcctgactgcaccatagaa 27563666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 286
Target Start/End: Original strand, 37451421 - 37451713
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |    
37451421 attaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 37451520  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37451521 ctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 37451620  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttattaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||    
37451621 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttcactgcaccgtagaatctcccttcttaa 37451713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7079103 - 7078812
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| |    
7079103 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaact 7079004  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
7079003 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatattgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataat 7078904  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatta 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||| || || ||||| |||||    
7078903 caacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgtaccgtaaaaactcccatatta 7078812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 32216190 - 32216477
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||     
32216190 gattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaac 32216289  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
32216290 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaa 32216389  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
32216390 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctccct 32216477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 51128995 - 51129255
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |    
51128995 attaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataatatcatcaact 51129094  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51129095 ctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 51129194  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
51129195 caacaatttaaaaatgaatcaagtattaaaat--aaattaactttttcaaaaaagtcaatttc 51129255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9903094 - 9902812
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |    
9903094 attaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaat 9902995  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9902994 ttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 9902895  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
9902894 caacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaaattcttgactgcaccgtagaagct 9902812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 16415781 - 16416067
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| || |||||||||| |||||| |||     
16415781 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaac 16415880  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16415881 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaa 16415980  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| | ||   ||||||| || |||||||||||    
16415981 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaaagttagttatttgactgcgccgtagaagctccc 16416067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 46931548 - 46931831
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
46931548 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 46931645  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
46931646 tatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatattattgatcattaatcagtaat 46931745  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
46931746 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttccttactgcaccgtagaagctccc 46931831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 47279324 - 47279614
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
47279324 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaac 47279423  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
47279424 tatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattattagatgaattactattgatcattaattagtaa 47279523  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaac-ttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
47279524 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaaatcagttttatgactgcaccgtagaagctccctta 47279614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 15168231 - 15168515
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| |||     
15168231 gattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaac 15168330  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
15168331 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagcaa 15168430  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
15168431 tcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctaactgcaccgtagaagctc 15168515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27267240 - 27266954
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| |||     
27267240 gattaacaagactacacttaatctaatttaatc-taccttgttttgagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaac 27267142  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
27267141 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgataattaatcaataa 27267042  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
27267041 tcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttcca-aaaagtcagtttcctgaatgcaccatagaagcttcctt 27266954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 30254558 - 30254850
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||| || ||| |||||| ||| || |||     
30254558 gattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacaccctataaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaac 30254657  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
30254658 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcaataa 30254757  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
30254758 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaaactcctttatta 30254850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 38823349 - 38823629
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
38823349 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 38823448  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38823449 tctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 38823548  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||    
38823549 tcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaa 38823629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 10922862 - 10923150
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||     
10922862 gattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactgtcacataatatcatcaac 10922961  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||    || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10922962 tctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 10923061  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
10923062 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaagagtcagttttctgactgcaccatagaagctccctt 10923150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 39393518 - 39393804
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||    
39393518 gattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaa 39393617  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     ||||||        ||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39393618 ctctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagta 39393717  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||    
39393718 atcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcatgactgccgcgtagaagctcc 39393804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47682535 - 47682249
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||||| |||     
47682535 gattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaac 47682436  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
47682435 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaa 47682336  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
47682335 ttaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaacttgttcaaaaaagtcagtttactgactgcaccatagaagctccc 47682249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28564821 - 28564559
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||| |    
28564821 attaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaacacttaa--ctatcacataatatcatcaact 28564724  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
28564723 ctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataat 28564624  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
28564623 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcct 28564559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 25160767 - 25161010
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||     
25160767 gattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaac 25160866  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
25160867 tttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaa 25160966  T
193 tcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaaaatcataattaac 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
25160967 tcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaac 25161010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 14758176 - 14758455
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |         || |||||| ||| |||||| |||     
14758176 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaatt---------aagactatcgcataatatcatcaac 14758266  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
14758267 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaacaa 14758366  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
14758367 tcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcgtgactgcaccgtagaagctccctt 14758455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 238551 - 238300
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| | |    
238551 taacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactat 238452  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
238451 gtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcc 238352  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||    
238351 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatcaactttttcaaaaaa 238300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27763350 - 27763071
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||| | ||| ||    
27763350 ttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatataatcaactc 27763251  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
27763250 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagataaatatactattgatcattaatcagtaat 27763151  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
27763150 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaatgtcaatttcctgactgtaccgtagaa 27763071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 279
Target Start/End: Original strand, 22170858 - 22171132
Alignment:
13 tacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt------ 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||||          
22170858 tacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatg 22170957  T
107 --aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 204  Q
      ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22170958 ttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgcaaacattattagataaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaa 22171057  T
205 aaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| || | |||||| |||||||||||    
22171058 aaataaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctaattgcaccgtagaagctccc 22171132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11742392 - 11742120
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                  | || ||||||||||||||||| |||     
11742392 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaa-----------------ttaagactatcacatgatatcagcaac 11742310  T
101 tct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11742309 tctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 11742210  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
11742209 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcgccatagaaactccctta 11742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 3535067 - 3535346
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||| |||     
3535067 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta---------catgatatcagcaac 3535157  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
3535158 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaacaa 3535257  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||  |||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||    
3535258 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaactaactttttaaaaaaaatcagtttcatgactacaccgtagaagctccctt 3535346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 15752164 - 15752450
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||||  ||     
15752164 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaac 15752263  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15752264 tctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaagttgcaatttttactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 15752363  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
15752364 tcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttttaaaaaatcaattttctgactgcaccgtagaagctccc 15752450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 28769788 - 28770053
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||      
28769788 attaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccacaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacc 28769887  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
28769888 tctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattgctagatgaattactattgatcattaattaataa 28769987  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
28769988 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcct 28770053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 42721174 - 42721448
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||||| | |||||| |||     
42721174 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaac 42721273  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        |||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
42721274 tttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttgcaattattactagattaattactattgatcattaatgagtaa 42721370  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatag 271  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
42721371 tcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttttaaaaaa-tcaattttctgacttcactatag 42721448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30326993 - 30326751
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||     
30326993 gattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaac 30326894  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
30326893 tatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatcaatcagtaa 30326794  T
193 tcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaaaatcataattaa 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
30326793 tcaacaatttaaaaatgaaatcaaatattaaaatcaaaattaa 30326751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 280
Target Start/End: Original strand, 48353735 - 48353964
Alignment:
58 ccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 149  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
48353735 ccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatatt 48353833  T
150 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagt 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| |    
48353834 gcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaat 48353933  T
250 caatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||    
48353934 cagtttcatgactgcaccgtagaagctccct 48353964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 3309282 - 3309515
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa-----agtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |     ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
3309282 gattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacacctcactacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatc 3309381  T
95 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 186  Q
    | ||| ||||||        ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3309382 agcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 3309481  T
187 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3309482 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 3309515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 41926298 - 41926537
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||| | || |||||| |||     
41926298 gattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacact------tattaaataatatcatcaac 41926391  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
41926392 tctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagcattactagatgaattactattgatcattaattaataa 41926490  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
41926491 tcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataattaattttt 41926537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31621594 - 31621326
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||     
31621594 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaataccccagaa-gtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaac 31621496  T
101 tctgtt-------------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 187  Q
    | ||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
31621495 tatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgttgcaagcattagtagatgaactactattgatcattaatc 31621396  T
188 agtaatcaacaattta-aaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttc 256  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
31621395 atcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttc 31621326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 18422786 - 18423006
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||      
18422786 gattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacc 18422885  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||        ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||    
18422886 tccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgcaagcattgctagatgaattactattgatcat-------taa 18422978  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
18422979 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 18423006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 21289847 - 21290017
Alignment:
105 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
21289847 ttaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 21289946  T
205 aaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagc 275  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||  | ||||||||||| ||||    
21289947 aaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaaagtcagttttttaactgcaccatataagc 21290017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 40884948 - 40885230
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||     
40884948 gattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaac 40885047  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
40885048 tatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaattagcaa 40885147  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataa-ttaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaag 274  Q
    |||| |||| ||||||||||| || |||||  | | || ||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||    
40885148 tcaataattcaaaaatgaatcgaatattaaggttaaaagttaacatttttaaaaaagtcaattttctaattgcaccatagaag 40885230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33725640 - 33725364
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||| |||||| ||| |    
33725640 attaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaact 33725541  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||            ||||||||||||||| |||    
33725540 atgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaaacattacta------------ttgatcattaatcagcaat 33725453  T
194 caacaatttaaaaa-tgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||||    
33725452 caacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaataaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaacgtataagctccctt 33725364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 280
Target Start/End: Original strand, 31962861 - 31963039
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa-tt 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
31962861 tgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaatcaacaattt 31962960  T
202 taaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||    
31962961 taaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaagctccct 31963039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1359866 - 1359689
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
1359866 tgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgttgcaagcattactggatgaattactatcgatcattaatcagtaatcaacaattt 1359767  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||   || |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
1359766 aaaaatgaatcaaacattaagatca-aattttttttttttaacaagtcagttttctgactgcaccgtagaagatccctt 1359689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37618933 - 37618705
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |         | |||||| |||     
37618933 gattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacatcccataaagtgtaacactcata---------taatatcatcaac 37618843  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
37618842 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgaccattaatcaataa 37618743  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 234  Q
    |||||||||||||    | |||||||||||||||| ||||||    
37618742 tcaacaatttaaa----attcaaacattaaaatcaaaattaa 37618705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 48620772 - 48620847
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48620772 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca 48620847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 38759680 - 38759846
Alignment:
13 tacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt------ 106  Q
    |||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||| ||| | ||||          
38759680 tacatttaatttaattttatcatatcttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatg 38759779  T
107 --aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 171  Q
      |||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
38759780 ttaaaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaagcattactagattaatta 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 281
Target Start/End: Original strand, 48620916 - 48621012
Alignment:
185 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
48620916 atcattaatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccctt 48621012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 349
Target Start/End: Original strand, 10562283 - 10562327
Alignment:
305 tgttgttaacttcaggcagatatgagcaagaattttccagtacct 349  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10562283 tgttgttaacctcaggcagatatgagcaagaattttccagtacct 10562327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 280
Target Start/End: Original strand, 38759846 - 38759912
Alignment:
214 aaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
38759846 aaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttaattgactgcaccatagaagctccct 38759912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42663274 - 42663232
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaag 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
42663274 taactttttcaaaaaagtcaatttcgtgactgcaccatagaag 42663232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 280
Target Start/End: Original strand, 47555092 - 47555140
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
47555092 taactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccgtagaagccccct 47555140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22622764 - 22622475
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| |||     
22622764 gattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 22622665  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22622664 tctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 22622565  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
22622564 tcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtaaaagctccctta 22622475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 39282782 - 39283067
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
39282782 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 39282881  T
101 t--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |        ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
39282882 tatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaa 39282981  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
39282982 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 39283067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 3362385 - 3362672
Alignment:
3 ttaacaagaatacact--taatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||     
3362385 ttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaac 3362484  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
3362485 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaagcattactggatgaattactattgatcattaatcagtaa 3362584  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3362585 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 3362672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42506121 - 42505837
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa- 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
42506121 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 42506022  T
100 ----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
        |||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42506021 gttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 42505922  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
42505921 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctc 42505837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 37157837 - 37158125
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
37157837 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 37157936  T
101 tct---------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
    | |         |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
37157937 tattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatatgtcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatgagta 37158036  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
37158037 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccct 37158125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 52040968 - 52040679
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
52040968 gattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 52040869  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
52040868 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaatgattattgatcattaatgagtaa 52040769  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| | ||||||||||||||    
52040768 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgtatgactgcagcgtagaagctccctta 52040679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26941306 - 26941020
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||     
26941306 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctcataaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaac 26941207  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26941206 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 26941107  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
26941106 tcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctccc 26941020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 4015591 - 4015875
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||  ||||||||| |    
4015591 attaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact 4015690  T
102 c-------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 194  Q
            ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4015691 tgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 4015790  T
195 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
4015791 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 4015875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 37203197 - 37203486
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
37203197 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 37203296  T
101 tct---------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
    | |         |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
37203297 tattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatatatcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatgagta 37203396  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
37203397 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccctt 37203486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 46297808 - 46297518
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
46297808 gattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 46297709  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
46297708 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaa 46297609  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
46297608 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactgcaccgtagaagctcccttat 46297518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 53229198 - 53228909
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||     
53229198 gattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatagtatcatcaac 53229099  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
53229098 tttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcaataa 53228999  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
53228998 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaaatcagttgcctgactgcaccgtagaagctccctta 53228909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 44891627 - 44891899
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
44891627 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 44891726  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
44891727 tctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatcagtaa 44891826  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||    
44891827 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttgatgactgca 44891899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 33698283 - 33698566
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||     
33698283 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcatgatatcggcaac 33698382  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
33698383 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaa 33698482  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| ||||||||    
33698483 tcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataaatgcaccgtagaagct 33698566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33378831 - 33378545
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||| ||| || ||| |||     
33378831 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaac 33378732  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
33378731 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataa 33378632  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
33378631 tcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 33378545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 48355071 - 48355357
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
48355071 gattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacataccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 48355170  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
48355171 tctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaa 48355270  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
48355271 gcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctaactgcaccatagaagctccc 48355357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24708163 - 24707890
Alignment:
1 gattaacaagaatacactta--atctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaaca 98  Q
    ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||    
24708163 gattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatca 24708064  T
99 attctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 190  Q
    | | ||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
24708063 aatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgcaagcattattagataaattactattaatcattaatcagt 24707964  T
191 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
24707963 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaattttctgactgc 24707890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 32373601 - 32373885
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |    
32373601 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcagcaact 32373700  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
32373701 ctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaat 32373800  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||| |||||||||  | || ||| || | ||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||| |||||||||||    
32373801 caacaattt-aaaatgaattcatcaataagattaaaattaactttttcaaaaaattcagtttcacgactgtaccgtagaagctccc 32373885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7327528 - 7327246
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
7327528 gattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaac 7327429  T
101 tct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |||        |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
7327428 tctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaa 7327329  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaac--ttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||||  ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
7327328 tcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaaaaagtcaatttcataactgcaccgtagaa 7327246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 1089842 - 1090102
Alignment:
20 aatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |||        |||||||    
1089842 aatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaacaactctatttgcatgttaaag 1089941  T
111 atgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
1089942 atgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 1090040  T
211 atcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccataga 272  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||    
1090041 atcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactacaccgtaga 1090102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22446103 - 22445826
Alignment:
8 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa----ttct 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||| || |||||| |||    || |    
22446103 aagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacactc-acaatgtataacactcaagactatcatataatatcatcaactattttt 22446005  T
104 g----ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 199  Q
    |    ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22446004 gcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaagtattactggatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 22445905  T
200 tttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
22445904 tttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcctgactgcactatagaagctcc 22445826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40552305 - 40552016
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |  | | |||||| |||||| |||     
40552305 gattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatcccacaacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaac 40552206  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
40552205 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaa 40552106  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
40552105 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttccagactgcaccgtagaagctccctta 40552016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 281
Target Start/End: Original strand, 36012271 - 36012558
Alignment:
5 aacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| |||    
36012271 aacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactct 36012370  T
104 ---------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 194  Q
             |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36012371 tgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 36012470  T
195 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataa-ttaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
36012471 aacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatttaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccctt 36012558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 2008063 - 2008355
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
2008063 gattaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgta-cactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 2008161  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag--- 189  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||       
2008162 tctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattaatcagtaa 2008261  T
190 ----taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||||    
2008262 tcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgattgcaccgtaaaagctccc 2008355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 47481654 - 47481937
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  || ||    
47481654 ttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactc 47481753  T
103 tgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    | ||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
47481754 tatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 47481853  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
47481854 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgtaccgtagaagctc 47481937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14586716 - 14586437
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |         ||||||||||||     
14586716 gattaacaagaatacacttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcgta---------tgatatcaacaac 14586626  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
14586625 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacg-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactactgatcattaatcagtaa 14586527  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
14586526 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcacgagtgcaccatagaagctccctta 14586437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21009846 - 21009561
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--- 99  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||       
21009846 ttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaa 21009747  T
100 ----ttc-tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
        | | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
21009746 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 21009647  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
21009646 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaaactccc 21009561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 21193736 - 21194023
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatatcaacaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||    
21193736 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagcaa 21193835  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     ||||||        ||||||    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
21193836 ctctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttgcaaccattactaaatgaattactattgattattaatcagta 21193935  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
21193936 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 21194023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 54505939 - 54506218
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | | |     
54505939 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatctactt 54506038  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
54506039 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 54506138  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
54506139 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgcaccgtagaa 54506218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 34133072 - 34133288
Alignment:
8 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt- 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||     
34133072 aagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgttt 34133171  T
107 -------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 199  Q
           ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||    
34133172 gcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactagtaatcatgaatcggtaatcaacaa 34133271  T
200 tttaaaaatgaatcaaa 216  Q
    |||||||||||||||||    
34133272 tttaaaaatgaatcaaa 34133288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 25579869 - 25580156
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||     
25579869 gattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaac 25579968  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||||||||||  |||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
25579969 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatccgcaa 25580068  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| || |  ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||    
25580069 tcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagattaagattaacttttttaaaaaagtcaatttcaagactgcactgtagaaactccct 25580156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 29099486 - 29099764
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||||||||||| ||| |    
29099486 attaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac---------tttcacatgatatcagcaact 29099576  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
29099577 ctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagcaat 29099676  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaac-ttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
29099677 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttcaaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccct 29099764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 103 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11357317 - 11357145
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11357317 tgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 11357218  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagc 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||    
11357217 aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgtctgactgcatcgtagaagc 11357145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 245
Target Start/End: Original strand, 22451099 - 22451350
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||  || |||||| ||| |    
22451099 attaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacaccccagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaact 22451198  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
22451199 atgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagcaat 22451298  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaa 245  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
22451299 caaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaa 22451350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3655248 - 3654991
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||      
3655248 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccacaaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagc 3655149  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat--gaattactattgatcattaatcagt 190  Q
    ||||||        ||||||  || ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
3655148 tctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatatgaattactattgattattaatcagt 3655049  T
191 aatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaa 247  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
3655048 aatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaaa 3654991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4761695 - 4761412
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||    
4761695 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacccccacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaa 4761596  T
100 ttct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     | |        |||||||||  | || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
4761595 ctatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgttgcaaacattaccagatgaattactattaatcattaatcagaa 4761496  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagc 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||    
4761495 atcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagtaactttcttgaatgcactatagaagc 4761412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46994707 - 46994490
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
46994707 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaat 46994608  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
46994607 tatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaa 46994508  T
193 tcaacaatttaaaaatga 210  Q
    ||||||||||||||||||    
46994507 tcaacaatttaaaaatga 46994490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 11466954 - 11467227
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
11466954 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaac 11467053  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||        |||| |||||  |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||       |||    
11467054 tctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatgttgcaa-------tagatgaattactattgatcat-------taa 11467139  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||    
11467140 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagaataaaattaactttttcaaaaaagtcagtttgatgactgcaccgtagaagctccct 11467227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24489005 - 24488721
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||  |||||| ||| |||    
24489005 taacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagactatcacacaatatcatcaactct 24488906  T
104 --------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
            |||||||||| |||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
24488905 atttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgcattactattaatcatgaatcaataatca 24488806  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaa-aaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  || ||||||||||||||| | | || | |||||||||||    
24488805 ataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttaaataaaagtcaatttcctcattacatcgtagaagctccc 24488721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43975934 - 43975652
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||| ||| |||||| |||     
43975934 gattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacact-------atcgcataatatcatcaac 43975842  T
101 tctgtt-----------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 189  Q
    | ||||           ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
43975841 tatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcag 43975742  T
190 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
43975741 caatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaattttttcaaaagagtcagttttctgactgcaccgtagaaactccc 43975652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44186546 - 44186295
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                |||||||||||||||||||| |    
44186546 attaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaa----------------ctatcacatgatatcaacaact 44186463  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
44186462 ctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgcaagcattactagataaattactattgatcattaatcagtaat 44186363  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgac 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||    
44186362 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttcgaaaaaatcaatttcatgac 44186295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 29163948 - 29164178
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||     
29163948 gattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaac 29164038  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||        |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||    
29164039 tctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcat-------taa 29164131  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
29164132 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttt 29164178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 38591828 - 38592105
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||||||| |||||| |||     
38591828 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaaa 38591927  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||| ||        ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||    
38591928 tctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcattattaaacaaattactattgatcattaatcagtaa 38592027  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||             ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
38592028 tcaacaatttaaaaatgaatcaa-------------aattaactttttcaaaaaagtcaatttcttaactgcaccgttgaagctcccttat 38592105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 280
Target Start/End: Original strand, 40936213 - 40936390
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
40936213 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagataaattactattgatcattaatcggtaatcaacaattt 40936312  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||    
40936313 aaaaataaatcaatcattaagattgaaattaactttttcaaaaaagtcaatttgatgtccgcaccgtagaagctccct 40936390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 54828743 - 54828546
Alignment:
5 aacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| | ||    
54828743 aacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatg 54828644  T
105 tt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 194  Q
    ||        ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
54828643 tttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactattgatcattaatcagtaatc 54828546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 43348387 - 43348563
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||     
43348387 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaac 43348486  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 169  Q
    ||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
43348487 tctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373025
Alignment:
28 tttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacg 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||        ||||||  |||||    
20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacg 20373164  T
120 ataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20373163 ataaaatagtacatataagtccaagatg-------------------aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 20373083  T
220 taaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
20373082 taaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctc 20373025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 51212707 - 51212537
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
51212707 tgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattaaaaatcaacaattt 51212608  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||      ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
51212607 aaaaatgaa------attaagatcaaaattaactttttcaaaaatgtcagttttctgactgcaccatagaagctccc 51212537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11835673 - 11835494
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaat-tttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||     
11835673 attaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaacaattaagactatcacatgatatcatcaac 11835574  T
101 tctgtta--aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 178  Q
    ||| ||   | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
11835573 tctatttgcatgatgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattga 11835494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 45174635 - 45174821
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| |||    
45174635 gattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactctacaaagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaa 45174734  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 178  Q
     ||||||        ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45174735 ctctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 45174821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11356916
Alignment:
57 cccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||        ||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgt 11357041  T
149 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaag 248  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
11357040 tgcaagcatta--------attactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 11356949  T
249 tcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||    
11356948 tcagttgtctgactgcaccgtagatgctccctt 11356916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Original strand, 50475053 - 50475199
Alignment:
105 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg-------atcattaatcagtaatcaac 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||     
50475053 ttaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcattaatcagtaatcaat 50475152  T
198 aatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
50475153 aatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaaatttttcaaa 50475199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27480298 - 27480127
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg----caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaca 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
27480298 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttaattacaaacattactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaaca 27480199  T
199 atttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccata 270  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || |||||  ||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||    
27480198 atttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaaattatatttttaaaaaaaatcaatttcctccctgcaccata 27480127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 35844456 - 35844550
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
35844456 gattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatca 35844550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 51213027 - 51212955
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 73  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
51213027 gattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 53176184 - 53176278
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 95  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
53176184 gattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatca 53176278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Original strand, 35844577 - 35844663
Alignment:
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||    
35844577 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcataactgcaccgtaaaagctccc 35844663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53811670 - 53811597
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 176  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
53811670 tgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatgaattactatt 53811597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27480424 - 27480368
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 58  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27480424 attaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccc 27480368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 11357410 - 11357355
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 56  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
11357410 gattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 11357355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 20373341 - 20373300
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 43  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
20373341 attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 278
Target Start/End: Original strand, 34133324 - 34133373
Alignment:
229 aattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
34133324 aattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccttagaagctcc 34133373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23165333 - 23165291
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaag 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
23165333 taactttttcaaaaaagtcaatttcatgactgcaccgtagaag 23165291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18271914 - 18271873
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
18271914 taacttttttaaaaaagtcaatttcttgactgcaccatagaa 18271873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 40936121 - 40936154
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcc 34  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
40936121 gattaacaagaatacacttaatataattttatcc 40936154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5299998 - 5299710
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||    
5299998 gattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaat 5299899  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
5299898 tttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaa 5299799  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
5299798 tcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccatagaagctccctt 5299710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16446927 - 16446640
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| |||     
16446927 gattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 16446828  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16446827 tctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 16446728  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
16446727 tcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccct 16446640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 38644116 - 38644402
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||     
38644116 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaac 38644215  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38644216 tctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 38644315  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||    
38644316 tcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtaaaagctccc 38644402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1149684 - 1149397
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||     
1149684 gattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaac 1149585  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1149584 tttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaa 1149485  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
1149484 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccct 1149397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37970571 - 37970284
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
37970571 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 37970472  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
37970471 tctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatcagaaa 37970372  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
37970371 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcactttcctgactgcaccatagaagctccct 37970284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 281
Target Start/End: Original strand, 11727163 - 11727451
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
11727163 attaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaact 11727262  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11727263 ttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 11727362  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaa-gtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
11727363 caacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaaatgtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccctt 11727451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 34895105 - 34895388
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||| |||||| |||     
34895105 gattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaa 34895199  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
34895200 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaa 34895299  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
34895300 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcctaactgcaccgtagaagctccctt 34895388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4132736 - 4132447
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||| |    
4132736 attaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcacataatatcatcaact 4132638  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
4132637 atgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatttgtaat 4132538  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatt 284  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
4132537 caacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttgctgactgcaccatagaagctcccctatt 4132447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43643647 - 43643358
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||     
43643647 gattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaac 43643548  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43643547 tctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 43643448  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
43643447 tcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccatagaagctccctta 43643358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8803867 - 8803594
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
8803867 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatcacataatatcatcaactc 8803768  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
8803767 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 8803668  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcacc 267  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
8803667 gaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcacc 8803594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 1205066 - 1205351
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| |    
1205066 attaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaact 1205165  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1205166 ctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgatcattaatcactaat 1205265  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    || ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
1205266 cagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactacaccgtagaagctccc 1205351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36695011 - 36694730
Alignment:
8 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||||     
36695011 aagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgttt 36694912  T
107 -------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 199  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
36694911 gcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataa 36694812  T
200 tttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||| ||| |||| | |||||| | |||||||||||||    
36694811 tttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaaatcagtttcttcactgcatcgtagaagctccctt 36694730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7891009 - 7890723
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| |||     
7891009 gattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaac 7890910  T
101 tctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||        ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7890909 tctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 7890810  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||    
7890809 tcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgaccgcaccgtagaagctccc 7890723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24823395 - 24823200
Alignment:
44 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
24823395 ttaagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactctgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaa 24823296  T
144 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
24823295 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttt 24823200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6098570 - 6098311
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
6098570 gattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 6098471  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaata-----gtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 187  Q
    ||||||        ||||||| |||||||| ||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
6098470 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatt 6098371  T
188 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
6098370 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcatgattaactttcccaaaaaa 6098311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 16223001 - 16223290
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||     
16223001 gattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaac 16223100  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16223101 tttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 16223200  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa---cttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||   ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
16223201 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttttttcaaaaagtcagttttctgactggaccatagaagctccc 16223290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 259
Target Start/End: Original strand, 40862560 - 40862824
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat---caacaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||   |||| ||    
40862560 taacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactat 40862659  T
101 -----tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||     
40862660 gtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatttgtcataaatcagtaatcg 40862759  T
196 acaattt-aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctg 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||||||    
40862760 acaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaactttttcaaaaaagtcaatttcctg 40862824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27082889 - 27082636
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||  || |    
27082889 attaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccgcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaact 27082790  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
27082789 atgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactacttatcattaatcaataat 27082690  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaa 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
27082689 caacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 27082636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23854483 - 23854200
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || || ||||||| |||||| |||     
23854483 gattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcataaagtgtaacacttaagacaatcacataatatcatcaac 23854384  T
101 tctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||        ||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
23854383 tctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaa 23854284  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
23854283 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa-tcaatttcctgactacaccataaaagctc 23854200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 44869635 - 44869907
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
44869635 gattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgt-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaa 44869733  T
100 ------ttc--tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44869734 ctttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 44869833  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgca 265  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||    
44869834 accaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataactgca 44869907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 33906350 - 33906634
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||     
33906350 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaac 33906449  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
33906450 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaa 33906549  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||  |||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
33906550 tca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcactgtagaagctccc 33906634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1954029 - 1953751
Alignment:
13 tacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt----- 106  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||| ||||||         
1954029 tacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcat 1953930  T
107 ---aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattta 203  Q
       |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
1953929 gttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttt 1953830  T
204 aaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
1953829 aaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaaactctctta 1953751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 12876247 - 12876515
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatatcaacaa 99  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||    
12876247 gattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaa 12876346  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
12876347 ctctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaggcattactagatgaattactatttatcatgaataagta 12876446  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctga 260  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||| ||||||||    
12876447 atcaacagtttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttttaaaaaagtcagtttcctga 12876515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 465980 - 466253
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| |||     
465980 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------cat-atatcagcaac 466069  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
466070 tctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 466169  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||    
466170 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttattcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagct 466253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39099171 - 39098891
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||| |||     
39099171 gattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaac 39099072  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
39099071 tctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattaataa 39098972  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||| ||| |||| ||| |||||| |||||    
39098971 tcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaattaatttttttaaaaaaatcagtttcatgattgcaccgtagaa 39098891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 281
Target Start/End: Original strand, 35859182 - 35859360
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35859182 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaattt 35859281  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
35859282 aaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaaactccctt 35859360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30654633 - 30654348
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  || ||    
30654633 ttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactc 30654534  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
30654533 tatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaatatattattgatcattaatcagtaat 30654434  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
30654433 taacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaaactccct 30654348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 18259229 - 18259498
Alignment:
9 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc------ 102  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||     ||||| ||||||| |||||           
18259229 agaatacatttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag----tcacaagatatcagcaatttaatttg 18259324  T
103 --tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||    
18259325 catgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatcaacaat 18259424  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaag 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
18259425 ttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatttcatgactgcaccatagaag 18259498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35459763 - 35459491
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| | | ||||||| || ||||| |||| |||||| ||||    
35459763 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccacagattataacacttaagactattacataatatcatcaat 35459664  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        |||||| || || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
35459663 tctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagaaa 35459564  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgca 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||    
35459563 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaactgca 35459491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31933938 - 31933653
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||     
31933938 gattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaag 31933839  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        || |||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
31933838 tctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcagacattactagatgaattattattgatcattaatcagtaa 31933739  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
31933738 tcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcccaactgcaccatagaagctcc 31933653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 9864293 - 9864509
Alignment:
8 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt- 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||     
9864293 aagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgttt 9864392  T
107 -------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 199  Q
           ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||    
9864393 gcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaataactagtaatcatgaatcggtaatcaacaa 9864492  T
200 tttaaaaatgaatcaaa 216  Q
    |||||||||||||||||    
9864493 tttaaaaatgaatcaaa 9864509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34951999 - 34951826
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34951999 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 34951900  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||    
34951899 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgattgcaccgtagaagct 34951826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 273
Target Start/End: Original strand, 12587830 - 12588000
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12587830 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaattt 12587929  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||  || |||| |||||||||    
12587930 aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttctctaactgaaccatagaa 12588000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 280
Target Start/End: Original strand, 33198057 - 33198227
Alignment:
110 gatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
33198057 gatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg 33198156  T
210 aatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||| |||||| || |  |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
33198157 aatcaatcattaagattaagattaactttttcaaaaaagtcaatttcatgattgcaccgtagaagctccct 33198227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10555254 - 10554970
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||  |  ||||||||| |||||| |||     
10555254 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcacaaaacgtaacacttga--ctatcacataatatcatcaac 10555157  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt--actattgatcattaatcagt 190  Q
    | ||||        ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||    
10555156 tttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattacactattgatcatta---agt 10555060  T
191 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa-cttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
10555059 aataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttttcaaaaaagtcaattttctgaccgcaccatagaagctccc 10554970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 13307761 - 13307936
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
13307761 gattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaac 13307860  T
101 tctgt-------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 169  Q
    |||||       | || |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
13307861 tctgtttgcatgttaaaatgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttgcaagcattacaagatgaat 13307936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 278
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362845
Alignment:
156 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||    
41362723 attactagatgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 41362822  T
256 cctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||    
41362823 cctgactgcaccatagaagctcc 41362845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1149862 - 1149756
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1149862 tgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 1149763  T
203 aaaaatg 209  Q
    |||||||    
1149762 aaaaatg 1149756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 41911040 - 41910935
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
41911040 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaatactatcacatgatatcaccaac 41910941  T
101 tctgtt 106  Q
    ||||||    
41910940 tctgtt 41910935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 280
Target Start/End: Original strand, 43025974 - 43026100
Alignment:
155 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaac-ttttccaaaaaagtcaat 253  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||    
43025974 cattattagataaattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttcaaaaaaatcaat 43026073  T
254 ttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||| || |||   ||||||||||||    
43026074 ttcctaaccgcagtttagaagctccct 43026100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Original strand, 43025847 - 43025943
Alignment:
8 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
43025847 aagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctg 43025943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1150157 - 1150090
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgt 68  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
1150157 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 7998432 - 7998488
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
7998432 gattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 281
Target Start/End: Original strand, 13307931 - 13308005
Alignment:
207 atgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
13307931 atgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaatagtcaatttcatgattgcaccatagaagctccctt 13308005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 34952082 - 34952028
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 56  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
34952082 attaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Original strand, 34463722 - 34463792
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
34463722 tgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtcc---atgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30650946 - 30650896
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
30650946 taactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaagctccctta 30650896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41910895 - 41910822
Alignment:
208 tgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||| | || | |||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
41910895 tgaatcaaacattcagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaaattaatgactgcaccatagaagctccctt 41910822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 41362653 - 41362707
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 55  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
41362653 gattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 278
Target Start/End: Original strand, 9864545 - 9864594
Alignment:
229 aattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
9864545 aattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccttagaagctcc 9864594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 274
Target Start/End: Original strand, 5018564 - 5018606
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaag 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
5018564 taactttttcaaaaaagtcaatttcgtgattgcaccatagaag 5018606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 277
Target Start/End: Original strand, 34686112 - 34686156
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
34686112 taacttttccaaaaaagtc-agttcctgactgcaccgtagaagctc 34686156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 12585297 - 12585341
Alignment:
44 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacat 88  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||    
12585297 ttaagtgtaacaccccacaaaatctaacacttaatactatcacat 12585341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 41960979 - 41961265
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||     
41960979 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaa 41961078  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||        ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
41961079 tcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataa 41961178  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
41961179 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaattcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 41961265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43648309 - 43648024
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa- 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||     
43648309 gattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaac 43648210  T
100 -----ttc--tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
         |||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43648209 tttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 43648110  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
43648109 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 43648024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 280
Target Start/End: Original strand, 4167064 - 4167348
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |    
4167064 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactat 4167163  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
4167164 gtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatca 4167263  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
4167264 acaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagctccct 4167348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33709296 - 33709015
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||     
33709296 gattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaac 33709197  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
33709196 tctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcattaa 33709097  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaag 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||| ||||||    
33709096 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaattcagtatcatgactgcaccgtagaag 33709015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2325441 - 2325154
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |    
2325441 attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaat 2325342  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
2325341 ttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaat 2325242  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
2325241 caacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaaatcaattttctgactgcaccgtagaagctccctt 2325154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33660432 - 33660149
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||||||| |||     
33660432 gattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacaccca---------catgatatcagcaac 33660342  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33660341 tttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 33660242  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
33660241 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctcccttatta 33660149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 26357717 - 26358003
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |    
26357717 attaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaat 26357816  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26357817 gtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 26357916  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||    
26357917 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctaactgcaatgtagaagctccct 26358003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 3177085 - 3177362
Alignment:
8 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| | ||||     
3177085 aagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgttt 3177184  T
107 -------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 199  Q
           |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
3177185 gcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatattacaagcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacaa 3177284  T
200 tttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
3177285 tttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctc 3177362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 4763770 - 4764059
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
4763770 gattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaat 4763869  T
101 tct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |||        ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
4763870 tctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagttgaattactattgatcattaatcagtaa 4763969  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaac-ttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
4763970 tcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttttaaaaagtcagtttccttactgcaccgtagaagctccctt 4764059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18494336 - 18494052
Alignment:
9 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt-- 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||      
18494336 agaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acctcacaaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttg 18494238  T
107 ------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18494237 catgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaat 18494138  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttattaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||||||    
18494137 ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactacaccgtataagctcccttattaa 18494052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29242202 - 29241923
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||     
29242202 gattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaac 29242103  T
101 tctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||        |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
29242102 tctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagatga-------attactagatgaattactattgaacattaatcagcaa 29242010  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
29242009 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaagttcagtttcctgactgcaccatagaagctccc 29241923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31570798 - 31570526
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||     
31570798 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaac 31570699  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
31570698 tctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattgctagatgaattactattgatcattaatcagtaa 31570599  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgca 265  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
31570598 tcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaattaactttttaaaaaaagtcagtttcatgactgca 31570526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11366443 - 11366155
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
11366443 ttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 11366344  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
11366343 tatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 11366244  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
11366243 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaattttctgactgcaccgtagatgctccctta 11366155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 35959037 - 35959317
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||| |    
35959037 attaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcacataatatcatcaact 35959135  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35959136 atgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 35959231  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||    
35959232 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttttgagtgcaccgtagaagctccc 35959317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19424692 - 19424420
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||     
19424692 gattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaac 19424593  T
101 tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
    ||||||    |||| || ||||     |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19424592 tctgtttgc-atgttaaagata-----gtacctgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 19424499  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
19424498 ttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttgatgactgcaccgtagaagctccc 19424420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 277
Target Start/End: Original strand, 44913805 - 44914090
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
44913805 taacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 44913904  T
103 tgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga---tgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
    ||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||| ||||||||    
44913905 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagaaaatgaattactattaatcatgaatcagta 44914004  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||    
44914005 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaaccagtttgctgactgcaccgtagaagctc 44914090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19289387 - 19289101
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
19289387 gattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 19289288  T
101 tctgt--------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |||||        |||||||  | || |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
19289287 tctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaa 19289188  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
19289187 ttaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccatagaagctccc 19289101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 282
Target Start/End: Original strand, 41465655 - 41465929
Alignment:
16 acttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------a 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||||| ||||        |    
41465655 acttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgtta 41465754  T
108 aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
41465755 aagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactatatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaat 41465854  T
208 tgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||    
41465855 tgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaactgcaccatataaactccctta 41465929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 31861991 - 31862278
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||     
31861991 gattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaag 31862090  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        || |||  | || |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31862091 tctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgtagacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 31862190  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
31862191 tcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcccgactgcaccatagaagctccct 31862278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 37905847 - 37906112
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc--acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaaca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |    
37905847 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactatcgcataatatcatta 37905946  T
99 attctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 190  Q
    | ||||||        ||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
37905947 actctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgcaagaattactggatgaattactattgatcattaatcagt 37906046  T
191 aatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaattt 255  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
37906047 aattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaattt 37906112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27350003 - 27349730
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||  ||     
27350003 gattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatcaggaac 27349913  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27349912 tctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 27349813  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||     ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
27349812 tcaacaatttaaaaatgaatcaaatatttaa-----aattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcactgtagaagctccct 27349730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39167424 - 39167150
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||| |||||| ||| |||    
39167424 taacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaaca------actatcacataatatcatcaactct 39167331  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
39167330 gtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttgctagcattactagatgaattactattaattatgaatcagtaatca 39167231  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||    
39167230 acaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgattgcacagtagaagct 39167150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 5881679 - 5881931
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
5881679 attaacaagaatacatttaatctaattt-atcataccttgttttaagtgtaatacctcacaaagtgtaacactca---------catgatatcaacaatt 5881768  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
5881769 ttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattattcagtaat 5881868  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||| ||| ||||    
5881869 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcataaaaatcagtttc 5881931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4264140 - 4263926
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatca-catgatatcaacaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||     
4264140 attaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaac 4264041  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
4264040 tctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattgatcagtaa 4263941  T
193 tcaacaatttaaaaa 207  Q
    |||||||||||||||    
4263940 tcaacaatttaaaaa 4263926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7006985 - 7006715
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                 || || | ||||||||||||||| |||     
7006985 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagaatatcacatgatatcagcaac 7006903  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
7006902 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaa 7006803  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||    
7006802 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgattaaaattaactttttcaaaaaagtcattttcatgattgcaccgtag-agctccctt 7006715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43770903 - 43770649
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||| |||     
43770903 gattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactca---------catgatatcagcaac 43770813  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
43770812 tctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaattagaaa 43770713  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
43770712 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttc 43770649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19500869 - 19500693
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19500869 tgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 19500770  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
19500769 aaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatt-attttttcaaaaaagt-aattttttgactgcaccatagaagatccctt 19500693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33551050 - 33550801
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  || |||||| |||     
33551050 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaac 33550952  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga----tcattaatca 188  Q
    | ||||        |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | ||||| ||    
33550951 tatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaataactattgattatttattaacca 33550852  T
189 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
33550851 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 33550801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 13711603 - 13711878
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | || ||||| ||||||||||| |||     
13711603 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcat-----gttttaagtgtaacaccccataaagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaac 13711697  T
101 tctgt--------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |||||        |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13711698 tctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaaacaatactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 13711797  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| |||||||| ||||||  | |||||||| |||||    
13711798 tcaacgatttaaaaatgaatcaatcatttaaattaaaattaattttttcaaaaaagacaattttataactgcaccgtagaa 13711878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 4478508 - 4478717
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||    
4478508 gattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac-----aaagtgtaacacttaagtctatcacatgatatcaccaa 4478602  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     ||||||        ||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
4478603 ctctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcagta 4478702  T
192 atcaacaatttaaaa 206  Q
    |||||||||||||||    
4478703 atcaacaatttaaaa 4478717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 44286088 - 44286285
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
44286088 gattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaac 44286187  T
101 t--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 190  Q
    |         ||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
44286188 tttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatcagt 44286285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19313990 - 19314186
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||     
19313990 gattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact-------atcacatgatatcagcaac 19314082  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgt---aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 189  Q
    | ||||        |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19314083 tatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 19314182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 36642126 - 36642293
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaatttt--atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||    
36642126 attaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaa 36642225  T
100 ttc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 159  Q
     ||        ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
36642226 ctctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgttgcaagcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 45327859 - 45328025
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||| ||| ||||||  ||     
45327859 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaac 45327958  T
101 t--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 159  Q
    |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45327959 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41051238 - 41051083
Alignment:
119 gataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 218  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
41051238 gataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatcaacaattcaaaaatgaatcaaaca 41051139  T
219 ttaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    ||||||| | |||||| |||| |||||   ||| |||| |||||||||| |||||||||    
41051138 ttaaaattaaaattaattttttcaaaa---tcattttcatgactgcaccgtagaagctc 41051083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17071801 - 17071646
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
17071801 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 17071702  T
101 t--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 148  Q
    |         ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
17071701 tttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258257
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatca 18258257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17054160 - 17054066
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 95  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
17054160 gattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaanactatcacataatatca 17054066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Original strand, 33902317 - 33902439
Alignment:
157 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaac-ttttccaaaaaagtcaattt 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||| | |||    
33902317 ttactagatgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaaagttagttt 33902416  T
256 cctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
     |||| |||||| ||||||||||    
33902417 tctgattgcaccgtagaagctcc 33902439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257344
Alignment:
142 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttcc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| || | ||||||||||| |    
18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaataaattattaatattaaaattaactttttc 18257354  T
242 aaaaaagtca 251  Q
    | ||||||||    
18257353 acaaaagtca 18257344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 281
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328116
Alignment:
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt-ctgactgcaccgtagaagctccctt 45328116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41463913 - 41463779
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |    
41463913 attaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaaaatgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaact 41463814  T
102 c--------tgttaaagatgtcaacgataaaatag 128  Q
    |        ||||||||||||||||||||||||||    
41463813 ctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41463512 - 41463408
Alignment:
135 taagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 234  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| || | ||||||    
41463512 taagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaa 41463413  T
235 ctttt 239  Q
    |||||    
41463412 ctttt 41463408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 33902205 - 33902299
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 95  Q
    ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||    
33902205 gattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccacaaagtgtaacacttaatagtatcacataatatca 33902299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 282
Target Start/End: Original strand, 36642296 - 36642364
Alignment:
214 aaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
36642296 aaacattaaaattaaaattagctttttcaaaaaagtcaatttcatgaatgcaccatagaagctccctta 36642364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053961
Alignment:
183 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatca 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatca 17053961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071602
Alignment:
183 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatca 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatca 17071602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27138730 - 27138682
Alignment:
236 ttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatt 284  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
27138730 ttttctaaaaaaatcaattttctgactgcaccatagaagcccctttatt 27138682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 8026 - 8315
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa- 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
8026 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 8125  T
100 ----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
        |||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8126 gttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 8225  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
8226 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccctta 8315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3879981 - 3879696
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||    
3879981 taacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactct 3879882  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3879881 gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatca 3879782  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
3879781 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaaggtccctt 3879696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6091228 - 6090941
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatatcaacaa 99  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||    
6091228 gattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaa 6091129  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     ||||||        ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6091128 ctctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 6091029  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
6091028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtaagttttctgactgcaccgtagaagctccc 6090941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 20768236 - 20768507
Alignment:
16 acttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------a 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |  ||| ||| |||||| ||||| ||||        |    
20768236 acttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgtta 20768335  T
108 aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20768336 aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 20768435  T
208 tgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
20768436 tgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgcaccgtagaagctccc 20768507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 1945975 - 1946260
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
1945975 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 1946074  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
1946075 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaagcattattagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 1946174  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaac-ttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
1946175 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 1946260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4318868 - 4318574
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
4318868 gattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaa 4318769  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     ||||||        ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
4318768 ctctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcatta 4318669  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacatta------aaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||      |||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||||||    
4318668 atcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcataactgcaccgtagaagctccct 4318574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 5627532 - 5627818
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
5627532 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactc 5627631  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
5627632 tatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaggtgaatatactattgatcattaatcagtaat 5627731  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
5627732 caacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaagctccct 5627818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33893048 - 33892776
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||     
33893048 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatcagcaac 33892958  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||        ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
33892957 tcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattaatcaataa 33892858  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaag 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
33892857 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataattgcaccgtagaag 33892776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7235080 - 7234791
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||     
7235080 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaac 7234981  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat---cag 189  Q
    | ||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||     
7234980 tatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaa 7234881  T
190 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||    
7234880 caatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatcattttcctgactacaccgtaaaagctccc 7234791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 29182302 - 29182573
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
29182302 gattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaa 29182401  T
100 ttct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     |||        |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||  |    
29182402 ctctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattac---tgatcattaatcaaca 29182498  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcac 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||    
29182499 atcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaattaactttttcaaaaaagttagtttcatgcctgcac 29182573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21017154 - 21016917
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc- 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||     
21017154 taacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactct 21017055  T
103 -------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
           ||||||| |||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
21017054 gtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatca 21016961  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
21016960 acaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttt 21016917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 267
Target Start/End: Original strand, 8513373 - 8513634
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
8513373 attaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------caccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 8513466  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||    
8513467 tctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatcttgcaagcattactagatgaattactattgatcat-------taa 8513559  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcacc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
8513560 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcacc 8513634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 115 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7054696 - 7054533
Alignment:
115 caacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatc 213  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
7054696 caacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaagatgaatc 7054597  T
214 aaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||    
7054596 aaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtaaaagctc 7054533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 258
Target Start/End: Original strand, 33619080 - 33619237
Alignment:
104 gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta---atcagtaatcaacaat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
33619080 gttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgatcagcaatcaacaat 33619179  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcct 258  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||||||    
33619180 ttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaagtcaatttcct 33619237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 6089047 - 6089286
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||      ||| | |||| || ||||||| || ||||||||||||||||| |||    
6089047 gattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cactctacaaggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaa 6089140  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     ||||||        ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||    
6089141 ctctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcat-------ta 6089233  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
6089234 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaattttttcaaa 6089286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30353399 - 30353256
Alignment:
5 aacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc-- 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||      
30353399 aacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctg 30353300  T
103 ------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 140  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
30353299 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 30353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 15491754 - 15491859
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
15491754 gattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatgatatcagcaat 15491853  T
101 tctgtt 106  Q
    ||||||    
15491854 tctgtt 15491859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7055258 - 7055166
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 95  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
7055258 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatca 7055166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724062
Alignment:
180 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaac 235  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33724062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6613704 - 6613655
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
6613704 taactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtacaagctccctt 6613655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21016773 - 21016726
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
21016773 taactttttcaaaaaagacaattttctgactgcaccgtagaagctccc 21016726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 33618973 - 33619010
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctacc 38  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
33618973 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc 33619010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 7703648 - 7703931
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||     
7703648 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaac 7703747  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
7703748 tctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactatttatcattaatcagtaa 7703847  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
7703848 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagct 7703931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 47253879 - 47254166
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
47253879 gattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 47253978  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47253979 tctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 47254078  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||||    
47254079 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttgatgactccaccgtagaagctccct 47254166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19089525 - 19089239
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa- 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
19089525 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 19089426  T
100 ----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
        |||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19089425 gttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 19089326  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
19089325 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccc 19089239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37663813 - 37663525
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa- 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
37663813 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 37663714  T
100 ----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
        |||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37663713 gttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 37663614  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
37663613 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttattaaaaaagtcaatttcctgactgtaccgtagaagctccctt 37663525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28003058 - 28002772
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||     
28003058 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaac 28002959  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
28002958 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgctaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaa 28002859  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
28002858 tcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcagtgtagaagctccc 28002772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 3042759 - 3043043
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |    
3042759 attaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 3042858  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
     ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
3042859 ttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaagcattactagatgaattagtattgattattaatcagtaat 3042958  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
3042959 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaagctcc 3043043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 33341537 - 33341808
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
33341537 gattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 33341636  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33341637 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 33341736  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||  |||||||||| | || |||||||    
33341737 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttttaaaaaagtcagtatcatgactgc 33341808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 25184252 - 25184540
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||     
25184252 gattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaac 25184351  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25184352 tctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 25184451  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
25184452 tcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccatagaagctccctt 25184540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34361562 - 34361275
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||    
34361562 ttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactc 34361463  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
34361462 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 34361363  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
34361362 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccctt 34361275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36493759 - 36493473
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||| |    
36493759 attaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaact 36493661  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
36493660 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaat 36493561  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36493560 taacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 36493473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30002704 - 30002427
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||     
30002704 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatcagcaac 30002614  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30002613 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 30002514  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
30002513 taaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcaatttcataactgcaccgtagaagctccc 30002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32912650 - 32912364
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
32912650 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 32912551  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
32912550 tatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 32912451  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
32912450 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtaaaagctccct 32912364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Original strand, 17167859 - 17168140
Alignment:
8 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct---- 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||        
17167859 aagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctattt 17167958  T
104 ----gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 199  Q
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
17167959 gcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcattaattagtaatcaataa 17168058  T
200 tttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||    
17168059 tttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtcagtttctttactgcaccgtagaaactccctt 17168140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Original strand, 17173436 - 17173717
Alignment:
8 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||||     
17173436 aagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgttt 17173535  T
107 -------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 199  Q
           ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
17173536 gcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataa 17173635  T
200 tttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||    
17173636 tttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtagaaactccctt 17173717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 37775806 - 37776082
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||     
37775806 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatcagcaac 37775896  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37775897 tttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 37775996  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
37775997 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctcc 37776082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Original strand, 17272111 - 17272391
Alignment:
9 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt-- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||| ||      
17272111 agaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttg 17272210  T
107 ------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
          |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
17272211 catattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatgaacgat 17272310  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
17272311 ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaataagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccctt 17272391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 46888229 - 46887946
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||| |||||| |||     
46888229 gattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacacttaga-ctatcacataatatcatcaaa 46888131  T
101 tc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
46888130 tcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 46888031  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
46888030 tcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgattgcaccgtagaagctc 46887946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29584264 - 29583985
Alignment:
9 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct----- 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| |||         
29584264 agaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttg 29584165  T
104 ---gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
       ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
29584164 catgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgat 29584065  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
29584064 ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccct 29583985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 55241170 - 55240891
Alignment:
8 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||     
55241170 aagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgttt 55241071  T
107 -------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 199  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
55241070 gcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagataaattactattaatcattaatcaataatcaacaa 55240971  T
200 tttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||    
55240970 tttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaatttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaagttccc 55240891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 6864174 - 6864460
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||     
6864174 gattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaac 6864273  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6864274 tttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataa 6864373  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
6864374 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctccc 6864460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 264
Target Start/End: Original strand, 1815441 - 1815710
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |    
1815441 attaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 1815540  T
102 ct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    ||        |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
1815541 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattactagatgaattacaattgatcattaatcagtaat 1815640  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
1815641 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt-ttaaaaagtcaattttctgactgc 1815710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19440720 - 19440434
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || ||   ||| |||| |||||| |||     
19440720 gattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaacccttaagtttataacataatatcatcaac 19440621  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19440620 tctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 19440521  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
19440520 tcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 19440434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34948168 - 34947923
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac--actcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
34948168 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccccacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaa 34948069  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     ||||||        ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
34948068 ctctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaatactattgatcgttaatcagta 34947969  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
34947968 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 34947923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35021107 - 35020815
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
35021107 gattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 35021008  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat----tgatcattaatca 188  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||     
35021007 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcg 35020908  T
189 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||    
35020907 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaagagtcagttttctgactacaccgtagaagctccctt 35020815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 49376106 - 49376392
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| |||     
49376106 gattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaac 49376205  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
49376206 tttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgaaagcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaa 49376305  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
49376306 tcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 49376392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 55477963 - 55477717
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
55477963 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaacaccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaac 55477864  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
55477863 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaa 55477764  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
55477763 ttaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 55477717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 23761211 - 23761499
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | || |||||| |||||||||| |||     
23761211 gattaacaagaatacacttaatctaattttatc-taccttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaagactatcgcatgatatcagcaac 23761309  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
23761310 tctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaa 23761409  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||  | |||||||||||    
23761410 tcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactacaccgaataagctccctta 23761499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 37287865 - 37288156
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaaca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||    
37287865 gattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgcccccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagca 37287964  T
99 attctgtta--------aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 190  Q
    | | ||||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
37287965 actttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgagcattaatcagt 37288064  T
191 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa-aatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
37288065 aatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatttaaaattaactttttcaaaaaagtcactttcatgactgcaccgtggaagctccctt 37288156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 879620 - 879334
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||     
879620 gattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacatttaagactatcacataatatcatcaac 879521  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
879520 tttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaataagtaa 879421  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
879420 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaagtcagttttctgactacaccatagaagctccc 879334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33816605 - 33816300
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca-----------------caaagtgtaacactcaaaactat 83  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||| || |||||    
33816605 gattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactat 33816506  T
84 cacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat 175  Q
    | ||| |||||| ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
33816505 cgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactat 33816406  T
176 tgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagc 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
33816405 tgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcatcgtagaagc 33816306  T
276 tccctt 281  Q
    ||||||    
33816305 tccctt 33816300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 50697380 - 50697644
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| |||     
50697380 gattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaac 50697479  T
101 tctgtt---------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
    ||||||         ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
50697480 tctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaattagta 50697579  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||    
50697580 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttc 50697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 50764869 - 50765143
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||     
50764869 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac----------gtgtaacaccccacaaagtgaaacactcaatattatcacatgatatcagcaac 50764958  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50764959 tatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 50765058  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||   |||| ||| |||||| |||||||||    
50765059 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtttgtttcatgattgcaccgtagaagctc 50765143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 32579600 - 32579871
Alignment:
16 acttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------a 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || || ||||||  || |||||| ||| | ||||        |    
32579600 acttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactcttaagactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgtta 32579699  T
108 aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
32579700 aaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaa 32579799  T
208 tgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
32579800 taaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttttctaactgcaccgtagaaactccc 32579871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 9139384 - 9139653
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |  | | | || |  ||         
9139384 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagataaactc-tgtttgca----- 9139477  T
101 tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 200  Q
      ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||    
9139478 --tgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagacgaattactattgatcattaatcaataatc--taat 9139573  T
201 ttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactg--caccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||    
9139574 ttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcctcactgcacaccatagaagctcc 9139653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 32592232 - 32592503
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||| ||| |||     
32592232 gattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcata---------tgatttcagcaac 32592322  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
32592323 tttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagcattactaaatgaattactattgatcgttaatcaataa 32592422  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||    
32592423 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttatgactgcaccgtagaa 32592503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25701129 - 25700842
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 99  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||| |||    
25701129 gattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaa 25701030  T
100 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     | ||||        ||||| ||||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
25701029 ctttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagattttgcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatcaata 25700930  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
25700929 atgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctaactgcaccgtagaaactccc 25700842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 4598132 - 4598407
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| ||| |    
4598132 attaacaagaatacacttaatttaattttatcctgc-ttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatcagcaact 4598221  T
102 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |||||        ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
4598222 ctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaagcattattagattaattactattgatcattaatcagcaat 4598321  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||   ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
4598322 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttacaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 4598407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 42199868 - 42200156
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||     
42199868 gattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaac 42199967  T
101 tct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacat-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagt 190  Q
    |||        |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
42199968 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactactgttcattaatcagt 42200067  T
191 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
42200068 aatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaaaatca-aattaactttttcaaaaaggtcaatttcctgattgcaccgtagaagctccct 42200156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5048037 - 5047752
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||     
5048037 gattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccg-caaaatgtaacacttaagactatcacatgatatcataaac 5047939  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||    
5047938 tatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagttttactagataaattattattgatcagtaatcaacaa 5047839  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||    
5047838 taaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtctgtttcctgactgcaccgtaaaagctccc 5047752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 27396755 - 27397037
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || || ||| |||||||||| |||     
27396755 gattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaac 27396854  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
     |||||        |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
27396855 gctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat--gtaa 27396952  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||   ||||| ||| |||| ||| |||||| || ||||||    
27396953 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttttaaaaaatcagtttcatgattgcaccgtaaaagctc 27397037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 280
Target Start/End: Original strand, 4205233 - 4205410
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
4205233 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataattt 4205332  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
4205333 aaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtagaagctccct 4205410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 282
Target Start/End: Original strand, 26896346 - 26896516
Alignment:
114 tcaacgataaaatagtacatgtaagtcc-aagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26896346 tcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttgcaaacattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 26896445  T
212 tcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctta 282  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
26896446 tcgaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagttccctta 26896516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 125 - 281
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431982
Alignment:
125 atagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaaaa 23431925  T
225 tcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||    
23431926 ttaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcactgtagaagctccctt 23431982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025381
Alignment:
116 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
216 acattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtca 251  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
35025415 acatt-aaatcaaaattaactttttcataaaagtca 35025381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Original strand, 39400257 - 39400440
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39400257 tgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattgatcattaatcagcaatcaacaattt 39400356  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttattaa 286  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| || |||| ||||    
39400357 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactggaccgtagaaacttcctttttaa 39400440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7152166 - 7152018
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
7152166 tgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattt 7152067  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtca 251  Q
    |||||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||||||    
7152066 aaaaatgaatcaaacattaagatgaaaaataactttttcaaaaaagtca 7152018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46883905
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||| |    
46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaaa-ctatcacataatatcataaatttt 46884080  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||| ||  ||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46884079 gtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 46883984  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa-cttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||    
46883983 acaatttaaaaataaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaaaatcaattttttgactgcaccgtagaa 46883905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4934274 - 4934001
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||||| |||     
4934274 gattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaac 4934175  T
101 t--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    |         ||||||||||| ||||||||||||||||| |           |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
4934174 tatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct-----------atgttgcacgcattaatagatgaatttctattaatcattaatcagtaa 4934086  T
193 tcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagct 276  Q
    |||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||  ||||| || |||| |||||    
4934085 tcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaattaacttgttcaaaaaagtcagtttattgactacatcatataagct 4934001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 38011993 - 38012169
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || || |||||||||| |||||| |||     
38011993 gattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaac 38012092  T
101 tct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 169  Q
    | |        |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
38012093 tatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatattactagatgaat 38012169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Original strand, 38012568 - 38012688
Alignment:
160 ctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||    
38012568 ctagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaattagtttcctg 38012667  T
260 actgcaccatagaagctccct 280  Q
    |||||||  || |||||||||    
38012668 actgcactgtaaaagctccct 38012688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 39398049 - 39398115
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
39398049 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgt 39398115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 54499309 - 54499217
Alignment:
2 attaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||    
54499309 attaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatcacatgatat 54499217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 35025668 - 35025574
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 95  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
35025668 gattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatca 35025574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 158
Target Start/End: Original strand, 56050179 - 56050234
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 158  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
56050179 tgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 47073108 - 47073059
Alignment:
232 taacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
47073108 taactttttcaaaatagtcaatttactgactacaccatagaagcaccctt 47073059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 12048 - 12332
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||     
12048 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaac 12147  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12148 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 12247  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||  |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||    
12248 tcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtaagtttcatgactgcaccgtagaagctcc 12332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 408475 - 408191
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||  |||||| |||     
408475 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaac 408376  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
408375 tctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 408276  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  |||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||    
408275 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttc--aaaagttaattttttgactgcaccgtagaatctccc 408191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 276 - 513
Alignment:
4 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||    
276 taacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactct 375  T
104 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 195  Q
    |||        ||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
376 gtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatca 469  T
196 acaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
470 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 94036 - 93873
Alignment:
103 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
94036 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcactaatcaacaattt 93937  T
203 aaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcacc 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||  |||||| ||||||||    
93936 -aaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaggtccgtttccttactgcacc 93873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 94429 - 94330
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||    
94429 gattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacataatatcatcaat 94330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 284
Target Start/End: Original strand, 692 - 747
Alignment:
229 aattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccttatt 284  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
692 aattaactttttcaaaaaaatcaatttcttgactgcaccgtagaagctcccatatt 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 146060 - 145773
Alignment:
3 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
146060 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 145961  T
103 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 193  Q
    |        |||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
145960 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaatatacaattgatcattaatcagtaat 145861  T
194 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
145860 aaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccctt 145773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 44096 - 44383
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||     
44096 gattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaac 44194  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
44195 tttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaatcagtaa 44294  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||    
44295 tcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtcagtttgttgactgcatcgtagaagctccctt 44383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 154691 - 154404
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 100  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||     
154691 gattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaac 154593  T
101 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 192  Q
    | ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
154592 tttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaatcagtaa 154493  T
193 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccctt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||    
154492 tcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtcagtttgttgactgcatcgtagaagctccctt 154404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 267423 - 267701
Alignment:
1 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatatcaacaa 99  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||    
267423 gattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaa 267522  T
100 tt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 191  Q
     |         ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||         |  ||||||||    
267523 ctttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgctgcaagaattactagatgaatta---------accaatcagta 267613  T
192 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
267614 atcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccatagaatctccc 267701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Original strand, 100993 - 101058
Alignment:
132 atgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
100993 atgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta--gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Original strand, 100894 - 100935
Alignment:
6 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 47  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
100894 acaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaa 100935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11415 - 11378
Alignment:
236 ttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaa 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
11415 ttttccaaaaaagtcaatttactgactgcaccgtagaa 11378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University