View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17095_low_10 (Length: 366)

Name: NF17095_low_10
Description: NF17095
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17095_low_10
NF17095_low_10
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (18-355)||(40794427-40794764)
chr2 (18-346)||(26620630-26620961)
chr2 (18-346)||(27687342-27687674)
chr2 (18-346)||(32236930-32237246)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (18-355)||(15196494-15196831)
chr4 (18-355)||(34271279-34271616)
chr4 (18-347)||(6557618-6557947)
chr4 (18-355)||(40464405-40464744)
chr4 (18-279)||(4865135-4865397)
chr4 (271-355)||(22728169-22728253)
chr4 (271-347)||(1642494-1642570)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (18-355)||(21645627-21645964)
chr1 (18-346)||(18597586-18597914)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (18-355)||(9521-9859)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (18-355)||(18429425-18429763)
chr7 (18-355)||(14225832-14226169)
chr7 (18-355)||(39150359-39150696)
chr7 (18-355)||(39862516-39862853)
chr7 (18-345)||(6223161-6223489)
chr7 (18-354)||(6178352-6178690)
chr7 (18-346)||(15919034-15919347)
chr7 (271-355)||(4054664-4054748)
chr7 (271-355)||(15478885-15478969)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (18-355)||(26826409-26826747)
chr3 (18-355)||(16419691-16420028)
chr3 (18-356)||(35566705-35567044)
chr3 (18-355)||(37185028-37185368)
chr3 (18-355)||(1733387-1733724)
chr3 (175-355)||(8105970-8106150)
chr3 (96-264)||(4801660-4801817)
chr3 (96-264)||(4786822-4786979)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (18-354)||(22480609-22480945)
chr6 (74-355)||(26502249-26502530)
chr6 (18-346)||(7584638-7584968)
chr6 (96-354)||(20216508-20216756)
chr6 (96-354)||(22110530-22110778)
chr6 (256-354)||(27365921-27366019)
chr6 (256-354)||(27456268-27456366)
chr6 (96-354)||(18939941-18940177)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (18-356)||(34497275-34497612)
chr5 (18-342)||(30913349-30913660)
chr5 (271-355)||(23901678-23901762)
chr5 (271-355)||(23887036-23887119)
chr5 (271-347)||(22269542-22269618)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (18-355)||(32266-32603)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (18-355)||(24461642-24461980)
chr8 (18-355)||(16263871-16264207)
chr8 (18-349)||(30367494-30367826)
chr8 (25-355)||(22142882-22143214)
chr8 (18-346)||(19650732-19651060)
chr8 (18-346)||(19661777-19662105)
chr8 (18-349)||(29036344-29036674)
chr8 (18-264)||(18800661-18800892)
chr8 (18-202)||(16272614-16272793)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (18-355)||(166188-166525)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (200-349)||(14438-14587)
[»] scaffold1665 (1 HSPs)
scaffold1665 (174-252)||(442-520)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40794764 - 40794427
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40794764 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatga 40794665  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40794664 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 40794565  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||     
T  40794564 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 40794465  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40794464 gccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 40794427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 26620630 - 26620961
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaa---atataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaa 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26620630 gctatgggatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaa 26620729  T
Q  115 tgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaa 214  Q
    | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26620730 taaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaa 26620829  T
Q  215 tcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||    
T  26620830 tcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaat 26620929  T
Q  315 tatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 346  Q
    || | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26620930 taggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 26620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27687674 - 27687342
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27687674 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaata 27687575  T
Q  117 aaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687574 aaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagatatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 27687475  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatga--agaaaaatatggtatgagattcac-aaaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | || |||||| ||||    
T  27687474 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaaaatatggcaagaaattcacaaaaa 27687375  T
Q  314 ttatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 346  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27687374 ttaggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 27687342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 32236930 - 32237246
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||            
T  32236930 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaacacaagatgaaaaatataacatgagtgatag-agaaagtaatcaat---aca-------- 32237017  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaag-aaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32237018 -atggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaaggaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 32237116  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaatta 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||    
T  32237117 ataaaatcaacatcacatctatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaatta 32237216  T
Q  317 tgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 346  Q
     | | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  32237217 ggtcgaaaagaacaaattaaacaagaaaat 32237246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 15196494 - 15196831
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15196494 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatga 15196593  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196594 aatggtaaagaaatgatgagaataaccacgacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 15196693  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||     
T  15196694 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgtacataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 15196793  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15196794 tccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 15196831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34271616 - 34271279
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34271616 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatga 34271517  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271516 aatggtaaagaaatgatgagaataatcaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 34271417  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||     
T  34271416 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatacggcaagaaattcacaaaattag 34271317  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271316 gccaaaaagaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 34271279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 347
Target Start/End: Original strand, 6557618 - 6557947
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6557618 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaagacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgcatatgaaatga 6557717  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6557718 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaaaacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 6557817  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||     
T  6557818 taaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 6557917  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 347  Q
     |||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  6557918 accaaaaagaacaatctaatcaagaaaata 6557947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 40464405 - 40464744
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  40464405 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatgg 40464504  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40464505 aatggtaaagaaatgatgagaaataccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacacatcataccaaaacagtagcacaatca 40464604  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaa--tt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||  ||    
T  40464605 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaaaatt 40464704  T
Q  316 atgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    | |  ||||  || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  40464705 aggtaaaaaaaaaaaaattaatcaagaaaataacacctat 40464744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4865397 - 4865135
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4865397 gctatgagatgagtgaaaaatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatgtaacatgagtgataggataaagcaatcaattgaatatgaaatga 4865298  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaag-aaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865297 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaaagttgcttgaaatgcaaaaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 4865198  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4865197 ataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaat 4865135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Original strand, 22728169 - 22728253
Alignment:
Q  271 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22728169 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 22728253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1642570 - 1642494
Alignment:
Q  271 tgccaaaattt-atgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 347  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1642570 tgccaaaattttatgaagaaaa-tatggcaagaaattcacaaaattagacaaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 1642494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 21645627 - 21645964
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21645627 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatttaacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatga 21645726  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645727 aatggtatagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 21645826  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||     
T  21645827 taaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaa 21645926  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21645927 gccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 21645964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18597914 - 18597586
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18597914 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaagaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatga 18597815  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18597814 aatggtaaagaaatgatgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgacatgcaagaaacacacaaatcgtaccaaaacagtagcacaatca 18597715  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||     
T  18597714 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 18597615  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 346  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18597614 gtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 18597586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9859 - 9521
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9859 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatga 9760  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9759 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcgtaccaaaacagtagcacaatca 9660  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgcc-aaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaatta 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  9659 taaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaatta 9560  T
Q  317 tgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9559 agccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 9521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18429763 - 18429425
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18429763 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatagaaaaaagtaatcaattgaatatgaaatga 18429664  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18429663 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 18429564  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcac-aaaatta 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  18429563 taaaatcaacatcacatttatcatgaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaaatta 18429464  T
Q  317 tgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
     | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18429463 ggtcaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 18429425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 14225832 - 14226169
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14225832 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatga 14225931  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14225932 aataacaaagaaatgataagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 14226031  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||     
T  14226032 taaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaagtttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaa 14226131  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14226132 gccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 14226169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 39150696 - 39150359
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  39150696 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaaccatcaattgaatatggaatga 39150597  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39150596 aatggtagagaaatgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 39150497  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||     
T  39150496 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaataaattcacaaaattag 39150397  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39150396 gtcaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 39150359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 39862516 - 39862853
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  39862516 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacatgatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaaccatcaattgaatatggaatga 39862615  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39862616 aatggtaaagaaatgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcatacaaaaacagtagcacaatca 39862715  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||     
T  39862716 taaaatcaacatcacacttaacataaaattgcgtactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaaggaattcacaaaattag 39862815  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39862816 gtcaaaaggaacaaattaatcaagaaaataacacctat 39862853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 345
Target Start/End: Original strand, 6223161 - 6223489
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaa-atataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  6223161 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaata 6223260  T
Q  117 aaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6223261 aaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 6223360  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaatta 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  6223361 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaaaaaaaatatggcaagaaattcacaaaatta 6223460  T
Q  317 tgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaa 345  Q
      | |||| ||||||||||| ||| ||||    
T  6223461 gtctaaaaagaacaaattaatcaaaaaaa 6223489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6178690 - 6178352
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6178690 gctataagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagataaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaaatgaaatg 6178591  T
Q  117 aaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178590 aaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgctaaaaatacaagaaaaacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 6178491  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaatta 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| ||||    
T  6178490 ataaaaacaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaaattatgaagaaaaatatagcaagaaattcacaacatta 6178391  T
Q  317 tgccaaaaggaa-caaattaaccaagaaaataacgccta 354  Q
      | |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6178390 gcctaaaaagaagcaaattaaccaagaaaataacaccta 6178352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 15919034 - 15919347
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||            
T  15919034 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaataagatgaaaaatataacatgagtgatag-agaaagtaatcaat---aca-------- 15919121  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15919122 -atggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacac--aaatcataccaaaacagtagcacaatca 15919218  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||     
T  15919219 taaaatcaacatcaaatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 15919318  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 346  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15919319 gtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 15919347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4054748 - 4054664
Alignment:
Q  271 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4054748 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 4054664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15478969 - 15478885
Alignment:
Q  271 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  15478969 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaagaacaaattactcaagaaaataacacctat 15478885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 26826409 - 26826747
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26826409 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatgtaacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatga 26826508  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26826509 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcgtaccaaaacagtagcacaatca 26826608  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgcc-aaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaatta 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  26826609 taaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaatta 26826708  T
Q  317 tgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26826709 agccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 26826747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 16419691 - 16420028
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16419691 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatgcaacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatga 16419790  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16419791 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaaggaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaataa 16419890  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||     
T  16419891 taaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaa 16419990  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16419991 gccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 16420028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 35566705 - 35567044
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35566705 gctatgagatgggggaaacatgagtcaacaatgttagtaaaacaagatgaaaaatataatatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatga 35566804  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataat-gagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35566805 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacatatttgagaagaaaagttgtttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 35566904  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaatta 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  35566905 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatattaattgttcataacatgtgcaaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaatta 35567004  T
Q  317 tgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctatg 356  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35567005 ggccaaaaagaacaaattaaccaagaaaataacgcctatg 35567044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 37185028 - 37185368
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaa-atataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37185028 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatg 37185127  T
Q  117 aaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37185128 aaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaaaacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 37185227  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaag-aaaaatatggtatgagattcac-aaaat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||||    
T  37185228 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaaat 37185327  T
Q  315 tatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||  || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37185328 tagtccgaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 37185368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 1733387 - 1733724
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||      
T  1733387 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatatagcatgagtgatag-aaaaagtaatcaattgaatatgaaatac 1733485  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733486 aatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaacatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 1733585  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaag-aaaaatatggtatgagattcacaaaatta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  1733586 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaacttatgaagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaatta 1733685  T
Q  317 tgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1733686 ggccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 1733724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 175 - 355
Target Start/End: Original strand, 8105970 - 8106150
Alignment:
Q  175 atgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgcc 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8105970 atgcaagaaacacacaaattataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgcc 8106069  T
Q  275 aaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8106070 aaaacttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 8106150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 264
Target Start/End: Original strand, 4801660 - 4801817
Alignment:
Q  96 caatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  4801660 caatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatg-----------gaaataatgagaatgaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaacca 4801748  T
Q  196 taccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcat 264  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||  |||| || || |||| |||| |||||| |||||||||    
T  4801749 tacccaaacagcaacacaatcataaaatcagtatcatatataccatagaattacatactaattgttcat 4801817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 264
Target Start/End: Original strand, 4786822 - 4786979
Alignment:
Q  96 caatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatca 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  4786822 caatcaattgaacatgaaataaaatggtaaagaaatgatg-----------gaaataatgagaatgaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaacca 4786910  T
Q  196 taccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcat 264  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||  |||| || || |||| |||| |||||| |||||||||    
T  4786911 tacccaaacagcaacacaatcataaaatcagtatcatatataccatagaattacatactaattgttcat 4786979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Original strand, 22480609 - 22480945
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22480609 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaagacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatga 22480708  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22480709 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgctcaaaatacaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 22480808  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||     
T  22480809 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcataataattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 22480908  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 354  Q
     | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22480909 tctaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacaccta 22480945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 74 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26502530 - 26502249
Alignment:
Q  74 taacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26502530 taacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaa 26502431  T
Q  174 aatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26502430 aatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgc 26502331  T
Q  274 caaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26502330 caaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattatgccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 26502249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7584968 - 7584638
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  7584968 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaata 7584869  T
Q  117 aaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7584868 aaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagatatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 7584769  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcac-aaaatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||    
T  7584768 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgtcaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaaatt 7584669  T
Q  316 atgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 346  Q
    | | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7584668 aggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 7584638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20216756 - 20216508
Alignment:
Q  96 caatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  20216756 caatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgaaaataa-----------tgagaataaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaacca 20216668  T
Q  196 taccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatat 295  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||  || |||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20216667 tacccaaacagcaacacaatcataaaatcagtatgacatataccatagaattgcatactaattgttcataacatgtgtctaaatttatgaagaaagatat 20216568  T
Q  296 ggtatgagattcacaaaattatgcc--aaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 354  Q
    || | || | |||||| |||| |||  ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||    
T  20216567 ggcaagaaaatcacaatatta-gcctaaaaagaaacacatcaaccaagaaaataacaccta 20216508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22110778 - 22110530
Alignment:
Q  96 caatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  22110778 caatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgaaaataa-----------tgagaataaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaacca 22110690  T
Q  196 taccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatat 295  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||  || |||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  22110689 tacccaaacagcaacacaatcataaaatcagtatgacatataccatagaattgcatactaattgttcataacatgtgtctaaatttatgaagaaagatat 22110590  T
Q  296 ggtatgagattcacaaaattatgcc--aaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 354  Q
    || | || | |||||| |||| |||  ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||    
T  22110589 ggcaagaaaatcacaatatta-gcctaaaaagaaacacatcaaccaagaaaataacaccta 22110530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 354
Target Start/End: Original strand, 27365921 - 27366019
Alignment:
Q  256 attgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  27365921 attgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaacatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaagaaccaattaatcaagaaaataacaccta 27366019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 354
Target Start/End: Original strand, 27456268 - 27456366
Alignment:
Q  256 attgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  27456268 attgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaacatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaagaaccaattaatcaagaaaataacaccta 27456366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18940177 - 18939941
Alignment:
Q  96 caatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |    
T  18940177 caatcaattgaacatgaaatgaaatggtgaagaaatgatga-----------aaataatgagaataaaagttgcttaaaatgcaagaaa----------a 18940099  T
Q  196 taccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatat 295  Q
     ||| ||||  || |||||||||||| |||  ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| | |  || | ||| |||||||||| || ||    
T  18940098 cacctaaaccata-cacaatcataaattcagtatcacatataccatagaattgcatactaattgttcatgatacatgtctaaacttatgaagaacaacat 18940000  T
Q  296 ggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 354  Q
    || | || | |||||| ||||  | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18939999 ggcaagaaaatcacaatattagcctaaaagagacaaattaaccaagaaaataacaccta 18939941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 34497275 - 34497612
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  34497275 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaataatgttagcaaaacaagatgaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataa 34497373  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34497374 aatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagaacaatca 34497473  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34497474 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagagattcacaaaattat 34497573  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctatg 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34497574 gccaaaaagaacaaattaaccaagaaaataacgtctatg 34497612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 30913349 - 30913660
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||            
T  30913349 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatag-agaaagtaatcaat---aca-------- 30913436  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30913437 -atggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaaggaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 30913535  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||     
T  30913536 taaaatcaacatcacatctatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 30913635  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaaga 342  Q
    | | ||| ||||||||||| |||||    
T  30913636 gtccaaaagaacaaattaaacaaga 30913660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23901762 - 23901678
Alignment:
Q  271 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23901762 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 23901678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23887119 - 23887036
Alignment:
Q  271 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23887119 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaat-cacaaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 23887036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 22269542 - 22269618
Alignment:
Q  271 tgccaaaattt-atgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 347  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22269542 tgccaaaattttatgaagaaaa-tatggcaagaaattcacaaaattagaccaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 22269618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 32266 - 32603
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32266 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatga 32365  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366 aatggtaaagaaatgatgagaaataccaagacataatgagaagaaaagttgtttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 32465  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||     
T  32466 taaaatcaacatcacatttattataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaaggaattcacaaaattag 32565  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32566 gtcaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 32603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 24461642 - 24461980
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24461642 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagataaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatga 24461741  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24461742 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaaggaacacacaaatcatatcaaaacagtagcacaatca 24461841  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcac-aaaatta 316  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  24461842 taaaatcagcatcacatttaacataaaattgcatgctaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaaatta 24461941  T
Q  317 tgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24461942 gtccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 24461980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16264207 - 16263871
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||      
T  16264207 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatag-aaaaagtaatcaattgaatatgaaatac 16264109  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264108 aatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 16264009  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||     
T  16264008 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 16263909  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16263908 gccaaaaagaacaaattaaacaagaaaataacacctat 16263871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 349
Target Start/End: Original strand, 30367494 - 30367826
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaat-aagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  30367494 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaacaatcaattgaatatggaatg 30367593  T
Q  117 aaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30367594 aaatggtaaagaaatgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 30367693  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaatta 316  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  30367694 ataaaatcaacatcaaacttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaaggaattcacaaaatta 30367793  T
Q  317 tgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataac 349  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30367794 ggtcaaaaggaacaaattaatcaagaaaataac 30367826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22143214 - 22142882
Alignment:
Q  25 gatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagca--atcaattgaacatgaaatgaaatgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  22143214 gatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacatgatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaaaaccatcaattgaatatggaatgaaatgg 22143115  T
Q  123 taaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaa 222  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143114 tagagaaatgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaa 22143015  T
Q  223 tcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattatgccaa 322  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | |||    
T  22143014 tcaacatcacacttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagggattcacaaaattaggtcaa 22142915  T
Q  323 aaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22142914 aaggaacaaattaatcaagaaaataacacctat 22142882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 19650732 - 19651060
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  19650732 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataa 19650831  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19650832 aatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 19650931  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||     
T  19650932 taaaatcaacatcacatctatcataaagttgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 19651031  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 346  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19651032 gtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 19651060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 19661777 - 19662105
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  19661777 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataa 19661876  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661877 aatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 19661976  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||     
T  19661977 taaaatcaacatcacatctatcataaagttgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 19662076  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 346  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19662077 gtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 19662105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29036674 - 29036344
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  29036674 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatag-agaaagtaatcaattgaatatgaaatga 29036576  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29036575 aatggtaaagaaatgatgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgagatacaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 29036476  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||     
T  29036475 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatgctaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaattag 29036376  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataac 349  Q
    | ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  29036375 gtcaaaaaggacaaattaaacaagaaaataac 29036344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18800892 - 18800661
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaa-tgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatg 116  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||  ||  |||||||||||     || |||||||||||||||||||||    
T  18800892 gctatgagatgagtgaagaataagtcaacaaatgttagcaaaacaagataagaacaatgccatgagtgata-----aaacaatcaattgaacatgaaatg 18800798  T
Q  117 aaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatc 216  Q
    ||||||||| |||||||||           || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |  ||||||    
T  18800797 aaatggtaacgaaatgatg-----------gaaataatgagaatgaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaacagcaatacaatc 18800709  T
Q  217 ataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcat 264  Q
    |||||||||  ||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||    
T  18800708 ataaaatcagtatcacatataccatagaattacatactaattgttcat 18800661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16272793 - 16272614
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||      
T  16272793 gctatgaaatgagtgaaacatgagttcacaatgtttgcaaaacaagatgaaaaatataacttgagtgata-gaaaaagtaatcaattgaatattaaatac 16272695  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaa 202  Q
    || ||| ||||| || ||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  16272694 aagggtgaagaattggtgaaattaacc-agacattttgagaagaaaa-ttgcttaaaatg-aagaaac-ccccaatcataccaaa 16272614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 166525 - 166188
Alignment:
Q  18 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaataagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  166525 gctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatga 166426  T
Q  118 aatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166425 aatggtaaagaaatgatgagaaataccaagacataatgagaagaaaagttgttttaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatca 166326  T
Q  218 taaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggtatgagattcacaaaattat 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||     
T  166325 taaaatcaacatcacatttattataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaaggaattcacaaaattag 166226  T
Q  318 gccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 355  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  166225 gtcaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 166188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 349
Target Start/End: Original strand, 14438 - 14587
Alignment:
Q  200 aaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactgattgttcataacatgtgccaaaatttatgaag-aaaaatatggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  14438 aaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcacactaattgtccataacatgtaccaaaatttatgaagaaaaaatatggc 14537  T
Q  299 atgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataac 349  Q
    | || ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14538 aagaaattcacaaaattaggtcaaaa-gaacaaattaatcaagaaaataac 14587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1665 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1665
Description:

Target: scaffold1665; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 252
Target Start/End: Original strand, 442 - 520
Alignment:
Q  174 aatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcata 252  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||    
T  442 aatgcaagaaaccaacaattcatatcaaaacagtagcacaattataaaatcatcatcacattcaacatgaaattgcata 520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University