View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17095_low_17 (Length: 278)

Name: NF17095_low_17
Description: NF17095
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17095_low_17
NF17095_low_17
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (16-206)||(15073776-15073966)
chr7 (16-206)||(42507575-42507765)
chr7 (16-206)||(10517315-10517506)
chr7 (16-206)||(17835411-17835602)
chr7 (16-206)||(47776669-47776860)
chr7 (16-206)||(27453166-27453357)
chr7 (16-206)||(39460863-39461054)
chr7 (21-206)||(47672632-47672818)
chr7 (16-206)||(34738701-34738892)
chr7 (16-204)||(37340639-37340828)
chr7 (16-206)||(36977933-36978124)
chr7 (19-206)||(9494343-9494530)
chr7 (16-206)||(14689605-14689796)
chr7 (67-184)||(41880876-41880993)
chr7 (67-184)||(35609986-35610103)
chr7 (67-184)||(48403743-48403860)
chr7 (67-183)||(556217-556333)
chr7 (67-184)||(45257374-45257490)
chr7 (67-184)||(46740117-46740234)
chr7 (67-197)||(5541096-5541227)
chr7 (81-197)||(16675186-16675303)
chr7 (81-197)||(17649554-17649671)
chr7 (67-183)||(17741019-17741135)
chr7 (67-184)||(9370960-9371073)
chr7 (67-147)||(17465328-17465408)
chr7 (67-147)||(17587806-17587886)
chr7 (149-184)||(17462864-17462899)
chr7 (149-184)||(17590315-17590350)
chr7 (77-128)||(41734559-41734610)
chr7 (16-49)||(17741163-17741196)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (16-206)||(30726289-30726479)
chr4 (16-206)||(1089132-1089322)
chr4 (16-206)||(21022436-21022626)
chr4 (16-206)||(1308662-1308852)
chr4 (26-206)||(40357828-40358008)
chr4 (16-206)||(48256118-48256309)
chr4 (16-206)||(50275069-50275260)
chr4 (19-206)||(51683540-51683728)
chr4 (16-206)||(37021630-37021821)
chr4 (16-206)||(55407334-55407525)
chr4 (16-206)||(50901815-50902005)
chr4 (16-184)||(67926-68094)
chr4 (16-184)||(46436579-46436747)
chr4 (16-197)||(21538008-21538200)
chr4 (67-197)||(50023099-50023230)
chr4 (16-206)||(14315709-14315910)
chr4 (67-181)||(41798568-41798682)
chr4 (67-184)||(9892838-9892955)
chr4 (67-197)||(11050079-11050210)
chr4 (16-203)||(14297460-14297658)
chr4 (16-197)||(10752983-10753175)
chr4 (16-197)||(10966752-10966944)
chr4 (67-197)||(50030217-50030348)
chr4 (67-184)||(6181360-6181477)
chr4 (67-184)||(49090806-49090923)
chr4 (67-184)||(49165419-49165536)
chr4 (77-184)||(30704419-30704526)
chr4 (67-184)||(31422083-31422201)
chr4 (16-197)||(11083562-11083754)
chr4 (67-184)||(44679645-44679762)
chr4 (67-184)||(50193864-50193982)
chr4 (69-197)||(41933179-41933308)
chr4 (67-182)||(3184342-3184457)
chr4 (67-182)||(3185456-3185571)
chr4 (67-182)||(3185664-3185779)
chr4 (77-183)||(4719949-4720055)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (16-206)||(42485086-42485276)
chr8 (26-203)||(15036279-15036456)
chr8 (16-206)||(489177-489367)
chr8 (16-206)||(39602050-39602241)
chr8 (16-206)||(39846533-39846724)
chr8 (15-206)||(39938763-39938955)
chr8 (16-206)||(5303768-5303959)
chr8 (16-206)||(43211840-43212031)
chr8 (16-197)||(39252346-39252528)
chr8 (16-206)||(43188384-43188575)
chr8 (16-184)||(40076820-40076988)
chr8 (16-206)||(34822564-34822755)
chr8 (26-206)||(45064586-45064756)
chr8 (61-184)||(37327163-37327286)
chr8 (16-206)||(41249636-41249811)
chr8 (67-197)||(35552051-35552182)
chr8 (67-206)||(2984508-2984648)
chr8 (67-197)||(20857671-20857802)
chr8 (16-197)||(24249818-24249999)
chr8 (67-184)||(25097-25214)
chr8 (67-184)||(1052910-1053027)
chr8 (67-184)||(23021891-23022008)
chr8 (67-184)||(26659832-26659949)
chr8 (95-197)||(34371450-34371553)
chr8 (67-192)||(45128135-45128261)
chr8 (20-85)||(25864609-25864674)
chr8 (67-197)||(5677456-5677587)
chr8 (69-183)||(22495305-22495419)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (16-206)||(28241347-28241537)
chr5 (26-206)||(8580053-8580233)
chr5 (16-206)||(7757659-7757850)
chr5 (26-206)||(28876988-28877168)
chr5 (16-206)||(8701771-8701962)
chr5 (16-206)||(17658657-17658848)
chr5 (16-206)||(19228219-19228410)
chr5 (16-206)||(42537484-42537675)
chr5 (16-197)||(14246-14427)
chr5 (16-206)||(38968432-38968624)
chr5 (16-206)||(42942034-42942224)
chr5 (16-206)||(512319-512510)
chr5 (67-184)||(19040687-19040804)
chr5 (19-184)||(40624484-40624659)
chr5 (67-197)||(5197359-5197490)
chr5 (67-183)||(27673224-27673340)
chr5 (67-184)||(30705522-30705639)
chr5 (16-194)||(20422274-20422463)
chr5 (110-173)||(16505787-16505850)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (16-206)||(19925077-19925267)
chr1 (16-206)||(30890396-30890586)
chr1 (16-206)||(31783275-31783466)
chr1 (16-206)||(35258420-35258611)
chr1 (16-206)||(45825211-45825403)
chr1 (16-206)||(51321049-51321240)
chr1 (26-179)||(47502660-47502813)
chr1 (19-206)||(19527090-19527278)
chr1 (16-206)||(23275650-23275842)
chr1 (16-206)||(49857493-49857681)
chr1 (16-206)||(52802466-52802657)
chr1 (67-197)||(47656256-47656386)
chr1 (67-184)||(2365622-2365739)
chr1 (67-184)||(19156401-19156518)
chr1 (67-197)||(21141413-21141544)
chr1 (67-197)||(50343525-50343656)
chr1 (67-184)||(3731951-3732068)
chr1 (67-184)||(13639593-13639710)
chr1 (67-184)||(26876043-26876160)
chr1 (67-184)||(22524521-22524636)
chr1 (67-197)||(2424924-2425053)
chr1 (67-197)||(97504-97635)
chr1 (67-183)||(17514267-17514383)
chr1 (77-184)||(38127052-38127160)
chr1 (67-155)||(8474171-8474259)
chr1 (26-73)||(29622105-29622152)
chr1 (69-138)||(23935581-23935650)
chr1 (108-182)||(25166976-25167050)
chr1 (77-145)||(25147698-25147766)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (26-206)||(45428936-45429116)
chr2 (26-206)||(28468986-28469166)
chr2 (26-206)||(21998535-21998715)
chr2 (16-206)||(39947935-39948126)
chr2 (26-206)||(17420912-17421092)
chr2 (16-206)||(32955905-32956092)
chr2 (16-169)||(25965155-25965308)
chr2 (26-133)||(7185374-7185481)
chr2 (67-197)||(29401160-29401291)
chr2 (67-184)||(20938282-20938399)
chr2 (67-184)||(45284558-45284675)
chr2 (67-184)||(45291921-45292038)
chr2 (67-197)||(10828581-10828712)
chr2 (67-197)||(36655906-36656037)
chr2 (67-184)||(3940299-3940416)
chr2 (67-184)||(5352351-5352468)
chr2 (67-184)||(15831514-15831631)
chr2 (67-184)||(30496517-30496634)
chr2 (67-184)||(43978906-43979023)
chr2 (67-197)||(25515366-25515496)
chr2 (67-184)||(43539308-43539425)
chr2 (90-165)||(45136881-45136956)
chr2 (16-83)||(45137103-45137170)
chr2 (150-206)||(22686849-22686904)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (26-206)||(276-456)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (16-198)||(4007878-4008061)
chr3 (16-206)||(42165497-42165688)
chr3 (16-206)||(47073754-47073945)
chr3 (35-198)||(3976060-3976224)
chr3 (15-206)||(20917564-20917756)
chr3 (15-206)||(20926526-20926718)
chr3 (16-206)||(44230048-44230239)
chr3 (15-206)||(42805809-42806001)
chr3 (16-206)||(49195994-49196185)
chr3 (16-206)||(50963289-50963480)
chr3 (26-206)||(50216425-50216606)
chr3 (16-206)||(42756488-42756677)
chr3 (16-206)||(30255549-30255740)
chr3 (16-197)||(48889078-48889260)
chr3 (16-184)||(597093-597261)
chr3 (26-169)||(3501477-3501620)
chr3 (58-206)||(48563304-48563453)
chr3 (67-197)||(16611463-16611594)
chr3 (67-197)||(22047659-22047790)
chr3 (67-184)||(52390966-52391083)
chr3 (67-198)||(17567619-17567751)
chr3 (67-186)||(41612753-41612872)
chr3 (26-125)||(51807314-51807413)
chr3 (67-184)||(2274484-2274601)
chr3 (67-184)||(29009245-29009362)
chr3 (67-184)||(36127822-36127939)
chr3 (67-184)||(42903760-42903877)
chr3 (67-184)||(46389347-46389464)
chr3 (67-184)||(50480354-50480471)
chr3 (67-184)||(54386509-54386626)
chr3 (67-197)||(20351030-20351161)
chr3 (67-184)||(49144033-49144149)
chr3 (67-184)||(34045762-34045878)
chr3 (67-184)||(46701595-46701712)
chr3 (77-183)||(4178199-4178305)
chr3 (69-183)||(31045165-31045279)
chr3 (77-183)||(4172201-4172307)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (26-206)||(15170-15351)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (16-206)||(6320110-6320301)
chr6 (16-206)||(24088329-24088520)
chr6 (26-206)||(31769050-31769231)
chr6 (67-184)||(6201534-6201651)
chr6 (67-184)||(11688501-11688618)
chr6 (67-184)||(22301566-22301683)
chr6 (67-184)||(30829222-30829339)
chr6 (67-183)||(21600990-21601106)
chr6 (67-197)||(24722314-24722445)
chr6 (68-197)||(26423384-26423514)
chr6 (67-184)||(27617101-27617218)
chr6 (67-197)||(3501555-3501686)
chr6 (79-155)||(3381182-3381258)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (16-184)||(7753-7921)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (68-197)||(18489-18619)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (88-184)||(10761-10857)
scaffold0155 (15-64)||(8537-8586)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (67-184)||(4224-4341)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (16-182)||(251048-251213)
scaffold0007 (107-155)||(246180-246228)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15073966 - 15073776
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073966 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 15073867  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073866 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 15073776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42507765 - 42507575
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507765 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 42507666  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507665 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 42507575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 10517315 - 10517506
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517315 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 10517414  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10517415 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgat 10517506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 17835411 - 17835602
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835411 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 17835510  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17835511 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgat 17835602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 47776669 - 47776860
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47776669 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgtttt 47776768  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47776769 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 47776860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27453357 - 27453166
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27453357 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 27453258  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27453257 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcattgacaattttattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 27453166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 39460863 - 39461054
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39460863 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctattttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 39460962  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  39460963 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggatatggtagaaatgat 39461054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47672818 - 47672632
Alignment:
Q  21 tatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatact 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672818 tatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatact 47672719  T
Q  121 ttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47672718 ttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 47672632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 34738701 - 34738892
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34738701 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 34738800  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34738801 atgctttgctcacaaagtgtttgataaaatgtctcgatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 34738892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 37340639 - 37340828
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340639 tagtttatgaattgaaaaatgaatgtacttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 37340738  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37340739 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatg 37340828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 36977933 - 36978124
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36977933 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgtttt 36978032  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36978033 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 36978124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9494530 - 9494343
Alignment:
Q  19 tttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttata 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494530 tttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttata 9494431  T
Q  119 ctttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9494430 ctttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcgtcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgg-aatgatagaaatgat 9494343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14689796 - 14689605
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14689796 tagtttatttattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtagctttgaatagtggcaaataaacacaatttgaatatctttt 14689697  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14689696 atactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttatgttatggaaatgataaaaatgat 14689605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 41880876 - 41880993
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41880876 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 41880975  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41880976 attatttagttagtttag 41880993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35610103 - 35609986
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35610103 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 35610004  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35610003 attatttagttagtttag 35609986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 48403743 - 48403860
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48403743 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgataattttattg 48403842  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48403843 attatttagttagtttag 48403860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 556333 - 556217
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  556333 ataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacatattttgagtatgtttgatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattt 556234  T
Q  167 attatttagttagttta 183  Q
    |||||||||||||||||    
T  556233 attatttagttagttta 556217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 45257374 - 45257490
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45257374 ataatgtggttttgaatggtggtaaaa-aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 45257472  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45257473 attatttagttagtttag 45257490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 46740234 - 46740117
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46740234 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgattgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46740135  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    |||||||| |||||||||    
T  46740134 attatttaattagtttag 46740117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5541227 - 5541096
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5541227 ataacgtggttttgaatggtggcaaaagatcatattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5541128  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5541127 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5541096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 197
Target Start/End: Original strand, 16675186 - 16675303
Alignment:
Q  81 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagt 180  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16675186 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 16675285  T
Q  181 tta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  16675286 ttaggttatggatatgat 16675303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 197
Target Start/End: Original strand, 17649554 - 17649671
Alignment:
Q  81 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagt 180  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17649554 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 17649653  T
Q  181 tta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  17649654 ttaggttatggatatgat 17649671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17741135 - 17741019
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| |||||    
T  17741135 ataatgtggttttgaatggtgccatatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaattcccaaatgagaattatattg 17741036  T
Q  167 attatttagttagttta 183  Q
    |||||||||||||||||    
T  17741035 attatttagttagttta 17741019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9371073 - 9370960
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9371073 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatg----atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9370978  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9370977 attatttagttagtttag 9370960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17465408 - 17465328
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17465408 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 17465328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 17587806 - 17587886
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587806 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 17587886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17462899 - 17462864
Alignment:
Q  149 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462899 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 17462864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 184
Target Start/End: Original strand, 17590315 - 17590350
Alignment:
Q  149 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590315 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 17590350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 128
Target Start/End: Original strand, 41734559 - 41734610
Alignment:
Q  77 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacac 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41734559 tttgaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacac 41734610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 17741196 - 17741163
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttg 49  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17741196 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttg 17741163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30726479 - 30726289
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726479 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 30726380  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726379 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 30726289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1089322 - 1089132
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089322 tagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcatatgtagtttaaataataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 1089223  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089222 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 1089132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21022626 - 21022436
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022626 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 21022527  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022526 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 21022436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1308852 - 1308662
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308852 tagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcatatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 1308753  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308752 atactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 1308662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40358008 - 40357828
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40358008 attgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggatttgaatggtggcaaatgaacacagtttgaatatgttttatactttgca 40357909  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357908 caccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 40357828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48256309 - 48256118
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48256309 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaaaacaatttgaatatgtttt 48256210  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48256209 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgat 48256118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 50275069 - 50275260
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275069 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 50275168  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50275169 atgctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 50275260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 51683540 - 51683728
Alignment:
Q  19 tttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttata 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683540 tttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttata 51683639  T
Q  119 ctttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51683640 ctttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 51683728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37021821 - 37021630
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37021821 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatctttt 37021722  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37021721 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcttcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgat 37021630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 55407525 - 55407334
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407525 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 55407426  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55407425 atactttgcacacaaaatgtttgatcgaatgcctcattgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 55407334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 50901815 - 50902005
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  50901815 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaattcataatgtggctttgaatggtgttaaatgaacacaatttgaatatgtttt 50901914  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50901915 atattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgacaattttattgatt-tttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgat 50902005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 67926 - 68094
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  67926 tagtttatgaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 68025  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  68026 atactttgcacataaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttag 68094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 46436579 - 46436747
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436579 tagtttatgaattaataaacgaatgtagttgttgcttatgctgtttaaatgatattgtggttctgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 46436678  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436679 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatggcaattttattgattatttagttagtttag 46436747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21538200 - 21538008
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||          ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  21538200 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatgatgccaaatgaacacaatttg 21538101  T
Q  106 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21538100 aatctgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgat 21538008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50023230 - 50023099
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50023230 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50023131  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50023130 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50023099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 14315709 - 14315910
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||          ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14315709 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttg 14315808  T
Q  106 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatg 204  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14315809 agtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaatg 14315908  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  14315909 at 14315910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41798682 - 41798568
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  41798682 ataatgtgggtttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaacgacaaatttattg 41798583  T
Q  167 attatttagttagtt 181  Q
    |||||||||||||||    
T  41798582 attatttagttagtt 41798568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9892955 - 9892838
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9892955 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9892856  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9892855 attatttagttagtttag 9892838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11050210 - 11050079
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  11050210 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcatcaatgaaaattatattg 11050111  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11050110 attatttagttagtttaggttatggaaatgat 11050079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 14297460 - 14297658
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||          ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14297460 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttg 14297559  T
Q  106 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaat 203  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14297560 agtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaat 14297658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10753175 - 10752983
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||          ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||     
T  10753175 tagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatggtggcaaatggacactcttta 10753076  T
Q  106 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10753075 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattgattatttaattagtttaggttattgaaatgat 10752983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10966944 - 10966752
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||          ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||     
T  10966944 tagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatggtggcaaatggacactcttta 10966845  T
Q  106 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10966844 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattgattatttaattagtttaggttattgaaatgat 10966752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50030348 - 50030217
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  50030348 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcatcaatgacaattttactg 50030249  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50030248 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50030217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6181477 - 6181360
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6181477 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6181378  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6181377 attatttagttagtttag 6181360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 49090806 - 49090923
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49090806 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49090905  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49090906 attatttagttagtttag 49090923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 49165419 - 49165536
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49165419 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatagtttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49165518  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49165519 attatttagttagtttag 49165536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 184
Target Start/End: Original strand, 30704419 - 30704526
Alignment:
Q  77 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 176  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30704419 tttgaatggtgggaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatatctcaatgacaattttattgattatttagt 30704518  T
Q  177 tagtttag 184  Q
    ||||||||    
T  30704519 tagtttag 30704526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 31422083 - 31422201
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg-ataaaatgtctcaatgacaattttatt 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31422083 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgaataaaatgtgtcaatgacaattttatt 31422182  T
Q  166 gattatttagttagtttag 184  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31422183 gattatttagttagtttag 31422201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11083754 - 11083562
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||          ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11083754 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgctgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgtcaaatgaacacattttg 11083655  T
Q  106 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  11083654 agtatgtttgatgctttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgtactgattattgagttagtttaggttatgaaaatgat 11083562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44679762 - 44679645
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44679762 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgaccatttcattg 44679663  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44679662 attatttagttagtttag 44679645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 50193864 - 50193982
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 165  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50193864 ataatgtggttttgaatagtggcaaaaaaaacacattttgagtatgtttgatactttgcacataaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 50193963  T
Q  166 gattatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  50193964 gattatttacttagtttag 50193982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41933308 - 41933179
Alignment:
Q  69 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgat 168  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||    
T  41933308 aatgtggttttgaatggtgtcaaatgaagattatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaaagccccaatgaaaattatattgat 41933209  T
Q  169 tatttagttagtttag-ttatggaaatgat 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41933208 tattgagttagtttagattatggaaatgat 41933179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 182
Target Start/End: Original strand, 3184342 - 3184457
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  3184342 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3184441  T
Q  167 attatttagttagttt 182  Q
     |||||||||||||||    
T  3184442 tttatttagttagttt 3184457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3185571 - 3185456
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  3185571 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185472  T
Q  167 attatttagttagttt 182  Q
     |||||||||||||||    
T  3185471 tttatttagttagttt 3185456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3185779 - 3185664
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  3185779 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185680  T
Q  167 attatttagttagttt 182  Q
     |||||||||||||||    
T  3185679 tttatttagttagttt 3185664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4720055 - 4719949
Alignment:
Q  77 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 176  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||  |||||||||||| |    
T  4720055 tttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgcattgattatttact 4719956  T
Q  177 tagttta 183  Q
    |||||||    
T  4719955 tagttta 4719949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42485276 - 42485086
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42485276 tagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 42485177  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42485176 atactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 42485086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15036456 - 15036279
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036456 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 15036357  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036356 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaat 15036279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 489367 - 489177
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  489367 tagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggttgcaaatgaacacaatttaaatatgtttt 489268  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  489267 atactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 489177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 39602050 - 39602241
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602050 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 39602149  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39602150 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 39602241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39846724 - 39846533
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846724 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 39846625  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39846624 atactttgtacacaaagtgtttgataaactgtctccatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 39846533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39938955 - 39938763
Alignment:
Q  15 atagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 114  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39938955 atagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatggggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaataagttt 39938856  T
Q  115 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39938855 tatactttgcacacaaagtatttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 39938763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5303959 - 5303768
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303959 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 5303860  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5303859 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 5303768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 43211840 - 43212031
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43211840 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgggaaatgaacacaatttgaatatgtttt 43211939  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  43211940 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttaaggaaatgatataaatgat 43212031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 39252346 - 39252528
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39252346 tagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaatacaatttgaatatgtttt 39252445  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39252446 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgat 39252528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 43188384 - 43188575
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43188384 tagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacgatttgaatatgtttt 43188483  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43188484 atactttgcatacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgacaattttattgattatttagttagtttatgttatggaaatgatataaatgat 43188575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40076988 - 40076820
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076988 tagtttatgaattgataaatgaatgtagctgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 40076889  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 184  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40076888 ataatttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttag 40076820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34822755 - 34822564
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34822755 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttggttaaatcataatgtggctttgaatgactgcaaatgaacacaatttaaatatgtttt 34822656  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34822655 atactctgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 34822564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 45064586 - 45064756
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||    
T  45064586 attgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcttaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaattt----------ttgca 45064675  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45064676 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 45064756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 37327163 - 37327286
Alignment:
Q  61 taaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaatt 160  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37327163 taaatgataatgtgattttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaatt 37327262  T
Q  161 ttattgattatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37327263 ttattgattatttagttagtttag 37327286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41249811 - 41249636
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41249811 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgcttt 41249712  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||                | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41249711 atactttgcac----------------attgccgcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 41249636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 35552051 - 35552182
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35552051 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 35552150  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35552151 attatttagttagtttaggttatggatatgat 35552182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 206
Target Start/End: Original strand, 2984508 - 2984648
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  2984508 ataatgtggttttgaatgatgccaaataaacacaatttgaataagtttcatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaacgacaattatattg 2984607  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  2984608 attatttagttagtttaggttatggaaatgatgaaaatgat 2984648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 20857671 - 20857802
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20857671 ataatgtggttttgaatggttgcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 20857770  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20857771 attatttagttagtttaggttatggatatgat 20857802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 24249818 - 24249999
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||  |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  24249818 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattgatgtttaagt-ataatgtggttttgaatggtgtcaaatgagcacattttgaatatgtttg 24249916  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24249917 atactttgcacataaagtatttgataaaatgccccaatgagaattatattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgat 24249999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25214 - 25097
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25214 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 25115  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25114 attatttagttagtttag 25097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 1052910 - 1053027
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1052910 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtatcaatgacaattttattg 1053009  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1053010 attatttagttagtttag 1053027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23022008 - 23021891
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23022008 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 23021909  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23021908 attatttagttagtttag 23021891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 26659832 - 26659949
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26659832 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26659931  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26659932 attatttagttagtttag 26659949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34371553 - 34371450
Alignment:
Q  95 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaa 193  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34371553 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaatttttttgattatttagttagtttaggttatggata 34371454  T
Q  194 tgat 197  Q
    ||||    
T  34371453 tgat 34371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 192
Target Start/End: Original strand, 45128135 - 45128261
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||    
T  45128135 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacgttttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgtgaattgtattg 45128234  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaa 192  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||    
T  45128235 attattgagttagtttaggttatggaa 45128261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 25864674 - 25864609
Alignment:
Q  20 ttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatgg 85  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25864674 ttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg 25864609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 5677456 - 5677587
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  5677456 ataatgtggttttgaatggtagcaaaagaatacattttgagtatgtttgatgttttgcacagaaagtgtttgataaaatgccccaatgaaaattatattg 5677555  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    |||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  5677556 attatcgagtaagtttaggttatggaaatgat 5677587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 183
Target Start/End: Original strand, 22495305 - 22495419
Alignment:
Q  69 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgat 168  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |   | |||||||||||| |  ||||| ||||  ||||||    
T  22495305 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacaaatgttttttgataaaatgcccaaatgaaaattgcattgat 22495404  T
Q  169 tatttagttagttta 183  Q
    |||||| ||||||||    
T  22495405 tatttacttagttta 22495419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28241537 - 28241347
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241537 tagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 28241438  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241437 atactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 28241347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8580233 - 8580053
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580233 attgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtagctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 8580134  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580133 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 8580053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 7757659 - 7757850
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7757659 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaacatgtttt 7757758  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7757759 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 7757850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 28876988 - 28877168
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28876988 attgataattaaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 28877087  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28877088 caccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttggttatggaaatgatagaaatgat 28877168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8701962 - 8701771
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701962 tagtttatgaattgataaatgaatgtagtagttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 8701863  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8701862 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtttgtttaggttatggaaatgatagaaatgat 8701771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 17658657 - 17658848
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658657 tagtttatttattgataaatgaatgtagttgtggcctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 17658756  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17658757 atactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 17658848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19228410 - 19228219
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19228410 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgtttt 19228311  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  19228310 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgataaaaatgat 19228219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 42537484 - 42537675
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42537484 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgtttt 42537583  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42537584 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaatttatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 42537675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14427 - 14246
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14427 tagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 14328  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  14327 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagtttatgtatagaaatgat 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 38968432 - 38968624
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968432 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 38968531  T
Q  115 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38968532 tatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 38968624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42942224 - 42942034
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42942224 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgctgtttaaatcataatatggctttgaattgtggcaaatgaacataatttgaatatgtttt 42942125  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42942124 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgatt-tttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 42942034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 512510 - 512319
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512510 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 512411  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  512410 atactttgcacccaaagtgtttgatcaaatacctcaatgaaaattatattgcttatttagttagtttaggttatgaaaattatagaaatgat 512319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19040804 - 19040687
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19040804 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 19040705  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19040704 attatttagttagtttag 19040687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40624659 - 40624484
Alignment:
Q  19 tttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaat 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40624659 tttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgctgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaat 40624560  T
Q  109 atgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40624559 atgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccttaataacaattttattgattatttagttagtttag 40624484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 5197359 - 5197490
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5197359 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5197458  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5197459 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5197490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27673340 - 27673224
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27673340 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 27673241  T
Q  167 attatttagttagttta 183  Q
    |||||||||||||||||    
T  27673240 attatttagttagttta 27673224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 30705522 - 30705639
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30705522 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30705621  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30705622 attatttagttagtttag 30705639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 20422274 - 20422463
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttg 105  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||          ||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  20422274 tagtgtatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttatttaaatgatgttctagtataatgtagttttaaatggtgccaaatgaacacattttg 20422373  T
Q  106 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaat 194  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20422374 aatatgtttgatacttttcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgacaattattttgattatttagttagtttaggttatggaaat 20422463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Original strand, 16505787 - 16505850
Alignment:
Q  110 tgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattattt 173  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  16505787 tgttttatcttttgcactcatagtgtttgataaaatgtctaaatgaatatttcattgattattt 16505850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 19925077 - 19925267
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19925077 tagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 19925176  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19925177 atactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 19925267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 30890396 - 30890586
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890396 tagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 30890495  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890496 atactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 30890586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31783466 - 31783275
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783466 tagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttctttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 31783367  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag-ttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31783366 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagattatggaaatgatataaatgat 31783275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35258611 - 35258420
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258611 tagtttatgaattgataaatgaatttagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 35258512  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35258511 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatagaaatgatagaaatgat 35258420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 45825211 - 45825403
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825211 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 45825310  T
Q  116 atac-tttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45825311 atacttttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttaatttaggttatggaaatgatagaaatgat 45825403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 51321049 - 51321240
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321049 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtgactttgaatagtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 51321148  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51321149 atattttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 51321240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Original strand, 47502660 - 47502813
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502660 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 47502759  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttag 179  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502760 cacaaagtgtttggtaaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttag 47502813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19527278 - 19527090
Alignment:
Q  19 tttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttata 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19527278 tttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatggacacaatttgaatatgttttatg 19527179  T
Q  119 ctttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19527178 ttttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattgattatgtagttaatttaggttatgaaaatgatagaaatgat 19527090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23275842 - 23275650
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatgg-tggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23275842 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatgggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttt 23275743  T
Q  115 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23275742 tatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtcagtttaagttatggaaatgatagaaatgat 23275650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 49857681 - 49857493
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857681 tagtttatgttttgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 49857582  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49857581 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctca---aaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 49857493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 52802466 - 52802657
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  52802466 tagtttaagaattgataaatgaatgtagttgttgcttatgttgtttaagtcataatgtgattttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatctttt 52802565  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  52802566 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattgtttagttagtttaggctatggaaatgatagaaatgat 52802657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 47656256 - 47656386
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47656256 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 47656355  T
Q  167 attatttagttagtttagttatggaaatgat 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47656356 attatttagttagtttggttatggatatgat 47656386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 2365622 - 2365739
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2365622 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2365721  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2365722 attatttagttagtttag 2365739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 19156401 - 19156518
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19156401 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 19156500  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19156501 attatttagttagtttag 19156518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 21141413 - 21141544
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21141413 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 21141512  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21141513 attatttagttagtttaggttatggatatgat 21141544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50343656 - 50343525
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50343656 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50343557  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50343556 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50343525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3732068 - 3731951
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3732068 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3731969  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3731968 attatttagttagtttag 3731951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13639710 - 13639593
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13639710 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 13639611  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13639610 attatttagttagtttag 13639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 26876043 - 26876160
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26876043 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26876142  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26876143 attatttagttagtttag 26876160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 22524521 - 22524636
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22524521 ataatgtggtttggaatggagccaaataaacataatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 22524618  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22524619 attatttagttagtttag 22524636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2425053 - 2424924
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2425053 ataatgtggtttggaatggagccaaataaacacaatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattg 2424956  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  2424955 attatttatttagtttaggttatggatatgat 2424924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 97635 - 97504
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  97635 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgtacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgataattttattg 97536  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  97535 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 97504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17514383 - 17514267
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||| |||||    
T  17514383 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgattctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaataaaaattatattg 17514284  T
Q  167 attatttagttagttta 183  Q
    |||||||||||| ||||    
T  17514283 attatttagttaattta 17514267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38127160 - 38127052
Alignment:
Q  77 tttgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 175  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38127160 tttgaatggtggcaaaaaaaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaaaattttattgattacttag 38127061  T
Q  176 ttagtttag 184  Q
    |||||||||    
T  38127060 ttagtttag 38127052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 8474171 - 8474259
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 155  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8474171 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatga 8474259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29622152 - 29622105
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgt 73  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29622152 attgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgt 29622105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23935650 - 23935581
Alignment:
Q  69 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg 138  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23935650 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaatggtaataagtttcatactttgcactcaaagtgtttg 23935581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 25166976 - 25167050
Alignment:
Q  108 tatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt 182  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||  |||  ||||||| ||| ||||||||    
T  25166976 tatgtttcatactttgcactcaaagtgtttgataaaattcctaaatgaggattacattgatttttttgttagttt 25167050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Original strand, 25147698 - 25147766
Alignment:
Q  77 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaat 145  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25147698 tttgaatggtgtccaattaacacaatgccaataagtttcatactttgcactcaaagtgtttgttaaaat 25147766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 45428936 - 45429116
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45428936 attgataattgaatgtagttgttgcctacgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 45429035  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429036 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 45429116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 28468986 - 28469166
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468986 attgataattgaatgtaattgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 28469085  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469086 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 28469166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 21998535 - 21998715
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998535 attgataattgaatttatttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 21998634  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998635 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 21998715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 39947935 - 39948126
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39947935 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgtttt 39948034  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39948035 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgat 39948126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 17420912 - 17421092
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17420912 attgatcattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 17421011  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421012 catcaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 17421092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32956092 - 32955905
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32956092 tagtttaggaattgataaatgaatgtacttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 32955993  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32955992 atactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat----ttgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 32955905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 25965155 - 25965308
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25965155 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgtttcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgttggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 25965254  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgatt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25965255 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgataattttattgatt 25965308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 7185374 - 7185481
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7185374 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 7185473  T
Q  126 cacaaagt 133  Q
    ||||||||    
T  7185474 cacaaagt 7185481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29401291 - 29401160
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29401291 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 29401192  T
Q  167 attatttagttagtttag-ttatggaaatgat 197  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29401191 attatttagttagtttagcttatggatatgat 29401160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 20938282 - 20938399
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20938282 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 20938381  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20938382 attatttagttagtttag 20938399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 45284558 - 45284675
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45284558 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45284657  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45284658 attatttagttagtttag 45284675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 45291921 - 45292038
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45291921 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45292020  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45292021 attatttagttagtttag 45292038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10828712 - 10828581
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10828712 ataatgtggttttgaattgtggcaaaagaacgcattttgagtatgtttgatactttggacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 10828613  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10828612 attatttagttagtttaggttatggatatgat 10828581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36656037 - 36655906
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36656037 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaacattttattg 36655938  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36655937 attatttagttagtttaggttatggatatgat 36655906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3940416 - 3940299
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3940416 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3940317  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3940316 attatttagttagtttag 3940299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 5352351 - 5352468
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5352351 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 5352450  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5352451 attatttagttagtttag 5352468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 15831514 - 15831631
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15831514 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtctttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 15831613  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15831614 attatttagttagtttag 15831631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30496634 - 30496517
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30496634 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30496535  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30496534 attatttagttagtttag 30496517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 43978906 - 43979023
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43978906 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43979005  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43979006 attatttagttagtttag 43979023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25515496 - 25515366
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  25515496 ataatgtggttttgaatggtggcaaa-gagcacgatttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgagaattatattg 25515398  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25515397 attattgagttagtttaggttatggaaatgat 25515366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43539425 - 43539308
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43539425 ataatatggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaatgtttttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43539326  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43539325 attatttagttagtttag 43539308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45136956 - 45136881
Alignment:
Q  90 aaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 165  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45136956 aaatgaacacaatttaaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttatt 45136881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 45137170 - 45137103
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaat 83  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  45137170 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttcttgcctatgttatttaaatcataatgtggccttgaat 45137103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Original strand, 22686849 - 22686904
Alignment:
Q  150 caatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22686849 caatgacaattt-agtgattatttagttagtttagttatggaaatggtagaaatgat 22686904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 456 - 276
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456 attgataattgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 357  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  356 cacaacgtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattaattatttagttagtttagttatgaaaatgatagaaatgat 276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4008061 - 4007878
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4008061 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 4007962  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4007961 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgata 4007878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 42165497 - 42165688
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42165497 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatatttt 42165596  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42165597 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgat 42165688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47073945 - 47073754
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47073945 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatatttt 47073846  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47073845 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 47073754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 3976060 - 3976224
Alignment:
Q  35 tgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976060 tgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtg 3976159  T
Q  135 tttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3976160 tttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgata 3976224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20917756 - 20917564
Alignment:
Q  15 atagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917756 atagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 20917657  T
Q  115 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20917656 tatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgat 20917564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20926718 - 20926526
Alignment:
Q  15 atagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926718 atagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 20926619  T
Q  115 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20926618 tatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgat 20926526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 44230048 - 44230239
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44230048 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaaacataatgtggctttgaacggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 44230147  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44230148 atactttgcacacaatgtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttggtttaggttatggaaatgatagaaatgat 44230239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42806001 - 42805809
Alignment:
Q  15 atagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42806001 atagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 42805902  T
Q  115 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42805901 tatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 42805809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 49196185 - 49195994
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49196185 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 49196086  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49196085 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcttcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgat 49195994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 50963289 - 50963480
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963289 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 50963388  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  50963389 atactttacacacaaagtgtttgataaaatgcctcagtgacaattttataaattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgat 50963480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50216606 - 50216425
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50216606 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgca 50216507  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50216506 cacaaagtgtttgataaaatgcttcaatgacaattttattgattatgtggttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 50216425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 42756488 - 42756677
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756488 tagtttatgaattgataaatggatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtcgctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 42756587  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42756588 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaa--ttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 42756677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30255740 - 30255549
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255740 tagtttgtgaattgctaaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 30255641  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  30255640 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaatttatattgattatttagttagttcaggttaaggaaatgatagaaatgat 30255549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 48889078 - 48889260
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  48889078 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgtttt 48889177  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48889178 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaaggcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgat 48889260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 597093 - 597261
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||     
T  597093 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcccatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacattttgattatgtttg 597192  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  597193 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagcttag 597261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3501620 - 3501477
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501620 attgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 3501521  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501520 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgatt 3501477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 206
Target Start/End: Original strand, 48563304 - 48563453
Alignment:
Q  58 gtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  48563304 gtttaaatcataatgtgtctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 48563403  T
Q  158 attttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48563404 attatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 48563453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 16611463 - 16611594
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16611463 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 16611562  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16611563 attatttagttagtttaggttatggatatgat 16611594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22047790 - 22047659
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22047790 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 22047691  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22047690 attatttagttagtttaggttatggatatgat 22047659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 52391083 - 52390966
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52391083 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 52390984  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52390983 attatttagttagtttag 52390966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17567751 - 17567619
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17567751 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 17567652  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgata 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17567651 attatttagttagtttaggttatggatatgata 17567619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 186
Target Start/End: Original strand, 41612753 - 41612872
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41612753 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 41612852  T
Q  167 attatttagttagtttagtt 186  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  41612853 attatctagttagtttagtt 41612872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Original strand, 51807314 - 51807413
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807314 attgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 51807413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2274601 - 2274484
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2274601 ataatgtggttttgaatggtgggaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2274502  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2274501 attatttagttagtttag 2274484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 29009245 - 29009362
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29009245 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 29009344  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29009345 attatttagttagtttag 29009362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 36127822 - 36127939
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36127822 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttcttg 36127921  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  36127922 attatttggttagtttag 36127939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42903877 - 42903760
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42903877 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 42903778  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42903777 attatttagttagtttag 42903760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 46389347 - 46389464
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46389347 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46389446  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46389447 attatttagttagtttag 46389464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 50480471 - 50480354
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50480471 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 50480372  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50480371 attatttagttagtttag 50480354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 54386509 - 54386626
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54386509 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 54386608  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54386609 attatttagttagtttag 54386626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 20351030 - 20351161
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgat-aaaatgtctcaatgacaattttatt 165  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20351030 ataatttggttttgaatggtggcaaaagaacaca-tttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgattaaaatgtctcaatgacaattttatt 20351128  T
Q  166 gattatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20351129 gattatttagttagtttaggttatggatatgat 20351161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 49144149 - 49144033
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49144149 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgaatat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49144051  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49144050 attatttagttagtttag 49144033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 34045762 - 34045878
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34045762 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 34045860  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34045861 attatttagttagtttag 34045878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 46701712 - 46701595
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46701712 ataatgtggttttgattggtggcaaaataagacattttgagcatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46701613  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46701612 attatttagttagtttag 46701595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 4178199 - 4178305
Alignment:
Q  77 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 176  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4178199 tttgaatggtgtcaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattttattgattatttagt 4178298  T
Q  177 tagttta 183  Q
    |||||||    
T  4178299 tagttta 4178305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31045279 - 31045165
Alignment:
Q  69 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgat 168  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||  ||| ||    
T  31045279 aatgtggttttgaatggtgtcaaaataacacaatgtgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgccaaaatgagaattgcatttat 31045180  T
Q  169 tatttagttagttta 183  Q
    |||||||||||||||    
T  31045179 tatttagttagttta 31045165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 4172201 - 4172307
Alignment:
Q  77 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 176  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4172201 tttgaatggtgttaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacaaaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgagaattttattgattatttagt 4172300  T
Q  177 tagttta 183  Q
    |||||||    
T  4172301 tagttta 4172307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15351 - 15170
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351 attgataaatgaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 15252  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15251 cacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgat 15170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6320301 - 6320110
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320301 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 6320202  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6320201 atactttgcacacaaagcgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 6320110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24088520 - 24088329
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24088520 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 24088421  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24088420 atactttgtacacaaagtgtttgatcaaatgtctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 24088329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 31769050 - 31769231
Alignment:
Q  26 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769050 attgacaaatgaatgtagttgttgcttatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgca 31769149  T
Q  126 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31769150 cacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 31769231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 6201534 - 6201651
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6201534 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6201633  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6201634 attatttagttagtttag 6201651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 11688501 - 11688618
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11688501 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 11688600  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11688601 attatttagttagtttag 11688618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 22301566 - 22301683
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22301566 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 22301665  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22301666 attatttagttagtttag 22301683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30829339 - 30829222
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30829339 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30829240  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30829239 attatttagttagtttag 30829222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Original strand, 21600990 - 21601106
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||    
T  21600990 ataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaatgagaattatattg 21601089  T
Q  167 attatttagttagttta 183  Q
    |||||||||||||||||    
T  21601090 attatttagttagttta 21601106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 24722314 - 24722445
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24722314 ataatgtgtttttgaatggtgtcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcgtcaatgacaattttattg 24722413  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24722414 attatttagttagtttaggttatggatatgat 24722445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 26423384 - 26423514
Alignment:
Q  68 taatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 167  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26423384 taatatggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgt 26423483  T
Q  168 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26423484 ttatttagttagtttatgttatggatatgat 26423514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 27617101 - 27617218
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27617101 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 27617200  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27617201 attatttagttagtttag 27617218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 3501555 - 3501686
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3501555 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaaggacaattttattg 3501654  T
Q  167 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3501655 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 3501686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 3381182 - 3381258
Alignment:
Q  79 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3381182 tgaatggtgtcaaatgaacacaatttgaatatgttttatatattgcacacaaagtggttgataaaatgcctcaatga 3381258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 7753 - 7921
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7753 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgatggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 7852  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7853 atactttgcacacaaagtatttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattttttagttagtttag 7921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18619 - 18489
Alignment:
Q  68 taatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18619 taatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattga 18520  T
Q  168 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18519 ttatttagttagtttaggttatggatatgat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Original strand, 10761 - 10857
Alignment:
Q  88 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10761 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgaaaaaatgtctcaatgacaattatattgattatttagttagtttag 10857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 8537 - 8586
Alignment:
Q  15 atagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaa 64  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8537 atagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaa 8586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4341 - 4224
Alignment:
Q  67 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 166  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||    
T  4341 ataatgtggtttttaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatgttttgcacacaaagtgtttgataaagtgccccaatgagaattatattg 4242  T
Q  167 attatttagttagtttag 184  Q
    |||||| |||||||||||    
T  4241 attattgagttagtttag 4224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 251213 - 251048
Alignment:
Q  16 tagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||   | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||     
T  251213 tagtttatgaattgataaatgaatgtagttgatgtaattgatgtttaaga-agaatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaataagaatatgtttg 251115  T
Q  116 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc-aatgacaattttattgattatttagttagttt 182  Q
    ||| ||| |||| |||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  251114 atattttacacataaagtgattgacaaaatg-ctcaaatgaaaattgcattgattatttacttagttt 251048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Original strand, 246180 - 246228
Alignment:
Q  107 atatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  246180 atatgttttatactttgcacccaaagtgtttgataaaatgcctaaatga 246228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University