View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1709_high_12 (Length: 405)

Name: NF1709_high_12
Description: NF1709
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1709_high_12
NF1709_high_12
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (1-385)||(321308-321692)
chr7 (1-360)||(15153928-15154287)
chr7 (1-347)||(11771512-11771858)
chr7 (1-335)||(9596722-9597056)
chr7 (3-336)||(14040360-14040692)
chr7 (3-336)||(14350390-14350722)
chr7 (1-332)||(11236484-11236815)
chr7 (1-332)||(13686732-13687063)
chr7 (1-347)||(15625205-15625551)
chr7 (1-336)||(16589-16922)
chr7 (1-335)||(8708270-8708604)
chr7 (1-335)||(18551029-18551363)
chr7 (1-335)||(14333062-14333395)
chr7 (1-332)||(8199296-8199627)
chr7 (1-332)||(10871663-10871994)
chr7 (1-332)||(11552373-11552704)
chr7 (1-332)||(12688169-12688500)
chr7 (1-332)||(15160328-15160659)
chr7 (1-332)||(18178410-18178741)
chr7 (1-332)||(44790622-44790953)
chr7 (1-332)||(23202884-23203215)
chr7 (1-332)||(23509011-23509342)
chr7 (28-347)||(21662614-21662933)
chr7 (1-286)||(14955272-14955553)
chr7 (7-335)||(19147877-19148205)
chr7 (7-335)||(20747276-20747604)
chr7 (1-213)||(15204406-15204618)
chr7 (10-335)||(14263502-14263827)
chr7 (10-331)||(16071552-16071873)
chr7 (7-335)||(12206055-12206383)
chr7 (7-333)||(19613343-19613669)
chr7 (22-331)||(15101873-15102182)
chr7 (10-317)||(23505128-23505435)
chr7 (10-331)||(18053211-18053532)
chr7 (7-331)||(662-986)
chr7 (1-331)||(11305512-11305842)
chr7 (22-335)||(11387698-11388011)
chr7 (22-317)||(14130557-14130852)
chr7 (22-317)||(14434375-14434670)
chr7 (1-331)||(49152971-49153301)
chr7 (22-242)||(15341190-15341410)
chr7 (22-331)||(13666207-13666516)
chr7 (22-331)||(13967938-13968247)
chr7 (1-254)||(26117854-26118107)
chr7 (22-305)||(8211398-8211681)
chr7 (1-92)||(14212582-14212673)
chr7 (7-331)||(16949727-16950050)
chr7 (14-93)||(4440835-4440914)
chr7 (22-242)||(14285646-14285866)
chr7 (14-93)||(13354057-13354136)
chr7 (1-241)||(13022117-13022357)
chr7 (14-93)||(27107058-27107137)
chr7 (1-331)||(12457310-12457640)
chr7 (15-93)||(13455654-13455732)
chr7 (14-87)||(14937260-14937333)
chr7 (14-87)||(15364853-15364926)
chr7 (14-93)||(7824807-7824886)
chr7 (7-242)||(12456461-12456696)
chr7 (29-93)||(17924558-17924622)
chr7 (29-93)||(23642353-23642417)
chr7 (29-93)||(21673832-21673896)
chr7 (29-93)||(45147459-45147523)
chr7 (190-360)||(6414152-6414322)
chr7 (29-164)||(17144560-17144695)
chr7 (272-323)||(45147229-45147280)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-360)||(21749607-21749966)
chr1 (1-359)||(20139497-20139855)
chr1 (1-336)||(22361578-22361913)
chr1 (1-360)||(50619578-50619937)
chr1 (1-360)||(20250468-20250826)
chr1 (1-329)||(16349933-16350261)
chr1 (1-332)||(21830997-21831328)
chr1 (1-332)||(21837644-21837975)
chr1 (1-332)||(41352996-41353327)
chr1 (1-334)||(16077990-16078323)
chr1 (1-336)||(17044349-17044684)
chr1 (1-334)||(19760207-19760533)
chr1 (1-332)||(51332827-51333158)
chr1 (1-332)||(33390363-33390694)
chr1 (1-360)||(19107033-19107393)
chr1 (187-360)||(16369963-16370136)
chr1 (97-291)||(20937649-20937843)
chr1 (1-170)||(16373385-16373554)
chr1 (7-311)||(24098943-24099247)
chr1 (1-170)||(22109878-22110047)
chr1 (1-170)||(22113727-22113896)
chr1 (22-331)||(31539352-31539661)
chr1 (1-131)||(21025068-21025198)
chr1 (1-331)||(37677775-37678105)
chr1 (22-331)||(20835243-20835552)
chr1 (24-254)||(19855077-19855307)
chr1 (1-331)||(20295107-20295437)
chr1 (4-254)||(21951681-21951931)
chr1 (7-331)||(20856100-20856425)
chr1 (7-248)||(20939403-20939644)
chr1 (14-93)||(20830739-20830818)
chr1 (22-170)||(19662492-19662640)
chr1 (14-93)||(22134904-22134983)
chr1 (198-242)||(22432647-22432691)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-360)||(112753-113111)
scaffold0040 (1-347)||(15572-15918)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-360)||(229725-230084)
scaffold0012 (1-347)||(218682-219028)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (1-360)||(22761862-22762221)
chr6 (1-347)||(20636708-20637054)
chr6 (1-343)||(18407349-18407691)
chr6 (1-347)||(22078097-22078443)
chr6 (1-334)||(19865228-19865561)
chr6 (1-361)||(25609268-25609628)
chr6 (1-347)||(27391580-27391926)
chr6 (13-360)||(5838638-5838985)
chr6 (1-347)||(27330840-27331186)
chr6 (1-336)||(22434408-22434743)
chr6 (1-336)||(22442806-22443141)
chr6 (1-332)||(2874210-2874541)
chr6 (1-347)||(15896622-15896968)
chr6 (1-335)||(24312575-24312909)
chr6 (1-336)||(16927047-16927382)
chr6 (1-301)||(16962852-16963152)
chr6 (1-360)||(23078984-23079343)
chr6 (1-332)||(25113095-25113426)
chr6 (1-332)||(29591327-29591658)
chr6 (1-335)||(16626124-16626458)
chr6 (1-331)||(27566387-27566717)
chr6 (1-332)||(1542491-1542822)
chr6 (1-332)||(27187979-27188310)
chr6 (1-332)||(27260930-27261261)
chr6 (1-359)||(18197132-18197493)
chr6 (1-332)||(28262604-28262935)
chr6 (1-332)||(28341353-28341684)
chr6 (1-347)||(18966699-18967039)
chr6 (45-332)||(28291823-28292110)
chr6 (7-335)||(25768731-25769059)
chr6 (7-335)||(21472141-21472469)
chr6 (7-222)||(19488685-19488900)
chr6 (1-336)||(18436144-18436483)
chr6 (10-331)||(28282229-28282550)
chr6 (7-331)||(15459880-15460204)
chr6 (7-335)||(34644999-34645327)
chr6 (22-331)||(14380895-14381204)
chr6 (7-238)||(18795327-18795558)
chr6 (1-278)||(24365009-24365286)
chr6 (22-335)||(19879838-19880151)
chr6 (22-305)||(5296634-5296917)
chr6 (22-331)||(19453964-19454273)
chr6 (22-170)||(19435707-19435855)
chr6 (34-331)||(21563572-21563869)
chr6 (34-331)||(21569431-21569728)
chr6 (11-170)||(8762350-8762509)
chr6 (97-331)||(22796135-22796369)
chr6 (14-87)||(16098838-16098911)
chr6 (14-93)||(14624777-14624856)
chr6 (14-93)||(16381793-16381872)
chr6 (14-93)||(18572433-18572512)
chr6 (127-317)||(27560150-27560340)
chr6 (18-87)||(15077790-15077859)
chr6 (1-305)||(10468256-10468560)
chr6 (14-93)||(1648234-1648313)
chr6 (14-93)||(18837328-18837407)
chr6 (14-93)||(23997030-23997109)
chr6 (14-93)||(16233810-16233889)
chr6 (21-93)||(23027143-23027215)
chr6 (14-87)||(35275506-35275579)
chr6 (29-93)||(21927987-21928051)
chr6 (1-35)||(28288080-28288114)
chr6 (272-317)||(21927763-21927808)
chr6 (114-166)||(15077886-15077938)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (1-344)||(25423788-25424130)
chr5 (1-332)||(23440821-23441152)
chr5 (1-344)||(26738171-26738514)
chr5 (1-332)||(29475517-29475848)
chr5 (1-347)||(20467541-20467886)
chr5 (1-332)||(14999183-14999514)
chr5 (1-336)||(18776377-18776712)
chr5 (1-332)||(27684844-27685175)
chr5 (1-302)||(21338741-21339042)
chr5 (1-336)||(23517133-23517468)
chr5 (5-335)||(23574350-23574675)
chr5 (1-332)||(19770571-19770902)
chr5 (1-332)||(37290940-37291271)
chr5 (1-332)||(41771453-41771784)
chr5 (1-336)||(20800055-20800390)
chr5 (1-332)||(22332331-22332662)
chr5 (1-332)||(22349034-22349365)
chr5 (1-332)||(27667934-27668265)
chr5 (1-332)||(22135279-22135610)
chr5 (1-332)||(27610965-27611296)
chr5 (1-347)||(23471825-23472171)
chr5 (1-332)||(16357113-16357444)
chr5 (1-332)||(27519018-27519349)
chr5 (1-332)||(34567105-34567436)
chr5 (1-329)||(40709394-40709722)
chr5 (7-335)||(21563423-21563751)
chr5 (1-347)||(21407734-21408080)
chr5 (7-335)||(21831211-21831539)
chr5 (1-195)||(21881697-21881891)
chr5 (7-335)||(21890209-21890537)
chr5 (22-317)||(17268799-17269094)
chr5 (7-331)||(20822047-20822371)
chr5 (7-206)||(21496792-21496991)
chr5 (1-331)||(14886435-14886765)
chr5 (1-331)||(22503273-22503603)
chr5 (1-331)||(24797841-24798171)
chr5 (1-331)||(37542825-37543155)
chr5 (7-331)||(22462546-22462870)
chr5 (27-331)||(28894412-28894716)
chr5 (27-331)||(28915883-28916187)
chr5 (27-331)||(28923238-28923542)
chr5 (265-360)||(21497745-21497840)
chr5 (1-331)||(25848669-25848999)
chr5 (7-331)||(24749004-24749328)
chr5 (7-216)||(21680228-21680437)
chr5 (7-331)||(24619745-24620069)
chr5 (7-331)||(24715976-24716300)
chr5 (22-331)||(22235385-22235694)
chr5 (1-311)||(23079533-23079843)
chr5 (14-93)||(23504274-23504353)
chr5 (1-278)||(20342929-20343206)
chr5 (14-93)||(27011916-27011995)
chr5 (43-252)||(20774432-20774641)
chr5 (14-87)||(24582048-24582121)
chr5 (14-93)||(21936645-21936724)
chr5 (29-93)||(25243822-25243886)
chr5 (29-93)||(25307974-25308038)
chr5 (22-87)||(19566154-19566219)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-360)||(378-737)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-336)||(180905-181240)
scaffold0020 (43-334)||(100859-101150)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (1-360)||(9522989-9523348)
chr3 (1-360)||(15248417-15248776)
chr3 (1-334)||(16371709-16372041)
chr3 (1-347)||(17490133-17490479)
chr3 (1-360)||(15209161-15209520)
chr3 (16-347)||(16491697-16492028)
chr3 (1-332)||(15339567-15339898)
chr3 (1-332)||(15724435-15724766)
chr3 (1-336)||(16806427-16806762)
chr3 (1-336)||(12498542-12498877)
chr3 (1-332)||(26791900-26792231)
chr3 (1-332)||(13252988-13253319)
chr3 (1-332)||(14126095-14126426)
chr3 (1-332)||(16411783-16412114)
chr3 (1-336)||(14875999-14876335)
chr3 (1-332)||(5424431-5424762)
chr3 (1-332)||(15347746-15348077)
chr3 (1-336)||(16692458-16692793)
chr3 (1-332)||(10906508-10906839)
chr3 (1-332)||(20061555-20061886)
chr3 (1-336)||(15062050-15062373)
chr3 (1-332)||(10005898-10006229)
chr3 (1-332)||(15588893-15589224)
chr3 (1-332)||(16636071-16636402)
chr3 (1-332)||(43163395-43163726)
chr3 (1-332)||(48425745-48426076)
chr3 (1-328)||(15402018-15402338)
chr3 (1-332)||(16756086-16756417)
chr3 (1-332)||(6601034-6601365)
chr3 (1-332)||(53384519-53384850)
chr3 (7-360)||(15015263-15015616)
chr3 (1-305)||(14574258-14574562)
chr3 (7-334)||(15227955-15228282)
chr3 (21-331)||(16827713-16828022)
chr3 (7-335)||(14086978-14087306)
chr3 (10-317)||(4678761-4679068)
chr3 (10-317)||(13942347-13942654)
chr3 (10-317)||(44777570-44777877)
chr3 (10-331)||(8758581-8758902)
chr3 (10-331)||(41177831-41178152)
chr3 (7-251)||(10419541-10419785)
chr3 (7-335)||(13971616-13971944)
chr3 (1-331)||(47124253-47124583)
chr3 (22-242)||(16836021-16836241)
chr3 (1-305)||(10384303-10384607)
chr3 (22-326)||(17492944-17493248)
chr3 (1-331)||(28754627-28754957)
chr3 (7-331)||(18133842-18134166)
chr3 (22-331)||(11303284-11303593)
chr3 (1-93)||(14580443-14580535)
chr3 (22-170)||(31694697-31694845)
chr3 (246-360)||(11564427-11564541)
chr3 (1-331)||(16338002-16338332)
chr3 (1-242)||(11960659-11960900)
chr3 (22-254)||(12360053-12360285)
chr3 (22-317)||(16380439-16380734)
chr3 (23-164)||(31939379-31939520)
chr3 (14-93)||(8273913-8273992)
chr3 (14-93)||(13966854-13966933)
chr3 (14-93)||(30138353-30138432)
chr3 (14-93)||(30147904-30147983)
chr3 (14-87)||(16742217-16742290)
chr3 (1-161)||(16329150-16329310)
chr3 (14-93)||(16257691-16257770)
chr3 (22-92)||(13320013-13320083)
chr3 (29-233)||(17193501-17193705)
chr3 (14-81)||(15610662-15610729)
chr3 (14-93)||(18749212-18749291)
chr3 (14-71)||(12792710-12792767)
chr3 (14-93)||(6152366-6152444)
chr3 (7-93)||(6711916-6712002)
chr3 (274-317)||(6712183-6712226)
chr3 (220-327)||(15952677-15952784)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (1-360)||(21890520-21890879)
chr2 (1-347)||(23107532-23107878)
chr2 (1-336)||(24675795-24676130)
chr2 (1-336)||(21325068-21325403)
chr2 (1-336)||(22756267-22756602)
chr2 (1-332)||(24262680-24263011)
chr2 (1-332)||(21144843-21145174)
chr2 (1-360)||(22324658-22325017)
chr2 (1-332)||(41608187-41608518)
chr2 (2-332)||(24707285-24707615)
chr2 (1-335)||(27371576-27371910)
chr2 (1-332)||(9610446-9610777)
chr2 (1-332)||(10869160-10869491)
chr2 (1-332)||(16923199-16923530)
chr2 (1-332)||(16982462-16982793)
chr2 (1-332)||(17064027-17064358)
chr2 (1-332)||(17067685-17068016)
chr2 (1-332)||(27218326-27218657)
chr2 (1-332)||(16925670-16926001)
chr2 (1-332)||(16999310-16999641)
chr2 (3-346)||(24819490-24819833)
chr2 (1-332)||(24876551-24876882)
chr2 (1-332)||(24710343-24710675)
chr2 (1-332)||(44385371-44385702)
chr2 (1-360)||(45529793-45530152)
chr2 (1-236)||(23066797-23067032)
chr2 (1-347)||(30210719-30211065)
chr2 (10-335)||(23111042-23111368)
chr2 (232-344)||(23064375-23064487)
chr2 (1-326)||(11357676-11358001)
chr2 (7-335)||(27364887-27365215)
chr2 (10-331)||(27788052-27788373)
chr2 (10-331)||(12574664-12574985)
chr2 (1-331)||(31830969-31831299)
chr2 (7-331)||(19651860-19652184)
chr2 (1-331)||(20828570-20828900)
chr2 (1-331)||(20833296-20833626)
chr2 (1-305)||(1064088-1064392)
chr2 (7-254)||(27209980-27210227)
chr2 (43-335)||(21125003-21125295)
chr2 (22-331)||(23277087-23277396)
chr2 (97-331)||(24642053-24642287)
chr2 (22-331)||(24948900-24949209)
chr2 (14-93)||(12640048-12640127)
chr2 (1-242)||(23294335-23294576)
chr2 (18-87)||(22276833-22276902)
chr2 (14-93)||(23816858-23816937)
chr2 (14-93)||(24569483-24569562)
chr2 (14-93)||(24831003-24831081)
chr2 (16-93)||(22761386-22761463)
chr2 (31-85)||(21906001-21906055)
chr2 (272-323)||(22276597-22276648)
chr2 (272-317)||(24569741-24569786)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-347)||(6744-7090)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-332)||(6724-7055)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-360)||(8352-8711)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (5-347)||(7091096-7091438)
chr4 (1-360)||(14160121-14160480)
chr4 (1-332)||(14302980-14303311)
chr4 (1-336)||(18226448-18226783)
chr4 (1-335)||(1639427-1639761)
chr4 (1-339)||(15146887-15147224)
chr4 (1-359)||(12524328-12524686)
chr4 (1-336)||(16354447-16354782)
chr4 (1-347)||(14850368-14850714)
chr4 (1-332)||(40473719-40474050)
chr4 (1-360)||(8052625-8052984)
chr4 (1-332)||(8387091-8387422)
chr4 (1-332)||(14681246-14681577)
chr4 (1-332)||(19777795-19778126)
chr4 (1-332)||(23956426-23956757)
chr4 (1-332)||(12477279-12477610)
chr4 (1-332)||(29038406-29038737)
chr4 (1-332)||(27712015-27712346)
chr4 (1-332)||(18297884-18298215)
chr4 (7-335)||(8706594-8706922)
chr4 (103-336)||(14691577-14691810)
chr4 (1-335)||(15078311-15078645)
chr4 (7-333)||(15414294-15414620)
chr4 (152-336)||(16251598-16251782)
chr4 (1-331)||(15002626-15002956)
chr4 (1-360)||(15246575-15246934)
chr4 (8-335)||(15319827-15320153)
chr4 (7-331)||(27901066-27901390)
chr4 (1-331)||(1648539-1648869)
chr4 (1-331)||(3264056-3264386)
chr4 (1-331)||(11206493-11206823)
chr4 (1-305)||(20891688-20891992)
chr4 (1-311)||(29452799-29453109)
chr4 (1-278)||(44661128-44661405)
chr4 (1-254)||(33223680-33223933)
chr4 (14-93)||(15292433-15292512)
chr4 (1-73)||(14695051-14695123)
chr4 (22-146)||(15358403-15358527)
chr4 (25-89)||(16148633-16148697)
chr4 (25-89)||(16152779-16152843)
chr4 (14-85)||(13248571-13248642)
chr4 (14-93)||(9291753-9291832)
chr4 (190-331)||(15358541-15358682)
chr4 (17-93)||(14998234-14998310)
chr4 (31-87)||(16029035-16029091)
chr4 (272-329)||(7826959-7827016)
chr4 (43-101)||(18614853-18614911)
chr4 (272-317)||(14998010-14998055)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (1-344)||(3072-3415)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-360)||(16337-16696)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (1-344)||(21393570-21393913)
chr8 (1-344)||(21788064-21788407)
chr8 (1-336)||(19978708-19979043)
chr8 (1-344)||(21921441-21921783)
chr8 (1-344)||(21251674-21252020)
chr8 (1-344)||(23650774-23651117)
chr8 (1-360)||(22987913-22988272)
chr8 (1-336)||(30312849-30313184)
chr8 (1-336)||(22040600-22040935)
chr8 (1-336)||(21166243-21166578)
chr8 (1-332)||(18857322-18857653)
chr8 (1-347)||(23949649-23949995)
chr8 (1-329)||(19113438-19113766)
chr8 (1-347)||(22377159-22377505)
chr8 (1-347)||(22383334-22383680)
chr8 (1-332)||(17673728-17674059)
chr8 (1-332)||(19483769-19484100)
chr8 (1-336)||(32600885-32601220)
chr8 (1-295)||(21043227-21043521)
chr8 (1-336)||(16407750-16408086)
chr8 (1-336)||(22132746-22133081)
chr8 (1-347)||(20395837-20396176)
chr8 (1-333)||(15534124-15534459)
chr8 (1-329)||(22119879-22120207)
chr8 (1-267)||(22248122-22248388)
chr8 (116-336)||(22164012-22164232)
chr8 (7-335)||(20388841-20389169)
chr8 (7-335)||(21841159-21841487)
chr8 (1-329)||(22128663-22128973)
chr8 (7-335)||(19852153-19852481)
chr8 (7-335)||(19858189-19858517)
chr8 (7-335)||(22371682-22372010)
chr8 (7-312)||(20009631-20009935)
chr8 (1-331)||(14565888-14566218)
chr8 (7-331)||(31416185-31416509)
chr8 (52-221)||(12274445-12274614)
chr8 (10-331)||(31570556-31570877)
chr8 (1-331)||(16270929-16271259)
chr8 (1-331)||(23655673-23656003)
chr8 (1-331)||(6679857-6680187)
chr8 (1-303)||(27355322-27355624)
chr8 (1-305)||(6604430-6604734)
chr8 (7-242)||(1267073-1267308)
chr8 (22-331)||(803399-803708)
chr8 (1-331)||(12305504-12305834)
chr8 (22-236)||(20975377-20975591)
chr8 (14-93)||(21196220-21196299)
chr8 (14-93)||(22316175-22316254)
chr8 (22-242)||(22051698-22051918)
chr8 (14-93)||(16876813-16876892)
chr8 (14-93)||(20652051-20652130)
chr8 (7-92)||(20985258-20985343)
chr8 (7-87)||(25283120-25283200)
chr8 (14-93)||(21850055-21850134)
chr8 (272-334)||(22049237-22049299)
chr8 (22-93)||(23156738-23156809)
chr8 (1-331)||(29303131-29303461)
chr8 (22-87)||(25283346-25283411)
chr8 (1-69)||(22623569-22623637)
chr8 (114-233)||(22983277-22983396)
chr8 (49-87)||(22283994-22284032)
chr8 (272-317)||(22283764-22283809)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (18-360)||(2149-2491)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-347)||(32018-32364)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (1-347)||(6718-7061)
scaffold0120 (1-263)||(12837-13099)
scaffold0120 (14-93)||(23125-23204)
scaffold0120 (10-72)||(825-887)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-347)||(1371-1717)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (1-347)||(7067-7413)
scaffold0403 (1-331)||(3502-3832)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (1-347)||(19267-19613)
scaffold0324 (1-104)||(14476-14579)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-341)||(7596-7936)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (43-347)||(1-305)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-347)||(4726-5072)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-347)||(5916-6262)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (25-347)||(390489-390811)
scaffold0001 (7-92)||(89716-89801)
scaffold0001 (7-92)||(90394-90479)
scaffold0001 (190-331)||(114896-115037)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (17-344)||(1963-2290)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-360)||(39085-39444)
scaffold0042 (1-336)||(66111-66446)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-360)||(63296-63655)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (1-336)||(25798-26133)
scaffold0011 (1-331)||(149281-149611)
scaffold0011 (22-326)||(194990-195294)
scaffold0011 (14-87)||(180879-180952)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-360)||(29626-29986)
scaffold0026 (7-335)||(28764-29092)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (1-335)||(3722-4053)
scaffold0023 (1-360)||(28637-29004)
scaffold0023 (1-193)||(130956-131148)
scaffold0023 (7-360)||(59436-59790)
scaffold0023 (233-347)||(130843-130957)
scaffold0023 (49-93)||(55213-55257)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (1-336)||(25680-26015)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-336)||(278095-278430)
scaffold0005 (22-242)||(261108-261328)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-335)||(7156-7490)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (47-347)||(14734-15034)
scaffold0106 (103-347)||(18221-18466)
scaffold0106 (1-304)||(32148-32452)
scaffold0106 (272-336)||(18147-18211)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (5-336)||(24204-24535)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-334)||(32838-33171)
scaffold0109 (1-336)||(9302-9637)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-360)||(8472-8831)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (1-336)||(19308-19643)
scaffold0081 (1-336)||(34732-35067)
scaffold0081 (1-236)||(50238-50473)
scaffold0081 (305-360)||(50175-50230)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (1-360)||(9156-9515)
scaffold0028 (1-360)||(15618-15977)
scaffold0028 (1-332)||(43864-44195)
scaffold0028 (7-335)||(49785-50113)
scaffold0028 (1-86)||(881-966)
scaffold0028 (14-93)||(105851-105930)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (1-334)||(3079-3412)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (79-347)||(39354-39622)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-336)||(3670-4005)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-332)||(7649-7980)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-336)||(22573-22908)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-336)||(79759-80094)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-347)||(9665-10011)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-359)||(4554-4912)
scaffold0270 (1-359)||(11684-12042)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-347)||(2616-2955)
scaffold0010 (1-331)||(41598-41928)
scaffold0010 (7-326)||(46670-46989)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-332)||(8076-8407)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-332)||(109076-109407)
scaffold0029 (7-251)||(95273-95517)
scaffold0029 (7-333)||(113268-113594)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-336)||(196743-197078)
scaffold0017 (1-165)||(56894-57058)
scaffold0017 (1-149)||(19332-19480)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-347)||(17242-17588)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-347)||(14344-14690)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-311)||(116170-116480)
scaffold0037 (272-332)||(37787-37847)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-336)||(88-423)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (3-346)||(11464-11807)
scaffold0018 (3-346)||(17656-17999)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-347)||(1603-1949)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (51-347)||(15738-16027)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (7-347)||(3835-4175)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (1-332)||(1124-1455)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (1-263)||(13247-13509)
scaffold0293 (296-336)||(13193-13233)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-334)||(8105-8438)
scaffold0080 (1-134)||(49091-49224)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-269)||(17454-17722)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-347)||(24984-25330)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (8-275)||(1660-1927)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (1-234)||(19606-19839)
scaffold0114 (7-242)||(45317-45552)
scaffold0114 (7-170)||(20772-20935)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (104-332)||(1330-1558)
scaffold0044 (104-336)||(15066-15298)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (1-236)||(3000-3235)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (5-236)||(1336-1567)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (19-335)||(40042-40358)
scaffold0064 (58-335)||(28090-28367)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (7-360)||(202739-203092)
scaffold0004 (191-259)||(115056-115124)
scaffold0004 (22-89)||(323657-323724)
scaffold0004 (289-347)||(112716-112774)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (7-335)||(27231-27559)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (167-360)||(4530-4723)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (7-335)||(1243-1571)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (7-333)||(24343-24668)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (1-334)||(4857-5189)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (103-336)||(12200-12433)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-347)||(18480-18816)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (19-335)||(5137-5453)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-335)||(51134-51462)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (7-311)||(333-636)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (7-334)||(420-747)
scaffold0139 (22-86)||(28173-28237)
scaffold0139 (22-86)||(34426-34490)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (7-347)||(85790-86129)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-181)||(102094-102274)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (7-335)||(10079-10407)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (7-335)||(48305-48633)
scaffold0053 (22-242)||(57133-57353)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-335)||(10500-10834)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (22-331)||(2299-2608)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (7-331)||(40449-40773)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (9-335)||(576-902)
[»] scaffold0243 (3 HSPs)
scaffold0243 (1-145)||(26209-26353)
scaffold0243 (14-93)||(436-515)
scaffold0243 (272-317)||(215-260)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (7-331)||(13172-13496)
scaffold0034 (7-331)||(68081-68405)
scaffold0034 (22-331)||(4239-4548)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (19-335)||(6319-6635)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (7-335)||(32948-33276)
scaffold0076 (7-331)||(56171-56495)
scaffold0076 (14-93)||(41207-41286)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-331)||(5461-5791)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (10-331)||(22650-22971)
scaffold0261 (10-331)||(14471-14792)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-331)||(27936-28266)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (22-331)||(3462-3771)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (77-220)||(10139-10282)
scaffold0476 (247-360)||(10025-10138)
scaffold0476 (7-89)||(2601-2683)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (28-254)||(6972-7198)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (7-242)||(51451-51686)
scaffold0067 (7-242)||(60485-60720)
scaffold0067 (7-242)||(66873-67108)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (38-331)||(17839-18132)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (22-331)||(20694-21003)
scaffold0298 (22-242)||(11343-11563)
scaffold0298 (22-242)||(15113-15333)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (7-236)||(2626-2855)
scaffold0222 (22-331)||(7771-8080)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-125)||(4618-4742)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (7-237)||(4581-4811)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-331)||(20105-20435)
scaffold0104 (1-331)||(22925-23255)
[»] scaffold0751 (2 HSPs)
scaffold0751 (1-170)||(3048-3217)
scaffold0751 (135-331)||(2505-2701)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (22-335)||(19556-19869)
scaffold0090 (22-335)||(23718-24031)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (7-254)||(671-918)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (10-331)||(6510-6832)
scaffold0149 (10-331)||(10941-11263)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (1-242)||(7410-7651)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (22-331)||(25151-25460)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (1-125)||(199-323)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (22-266)||(19896-20140)
scaffold0058 (29-93)||(75507-75571)
[»] scaffold0232 (2 HSPs)
scaffold0232 (1-164)||(951-1114)
scaffold0232 (223-326)||(2364-2467)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (22-331)||(6524-6833)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-254)||(15978-16231)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (7-331)||(505-829)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (1-305)||(26998-27302)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (7-242)||(4723-4958)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (22-233)||(20727-20938)
scaffold0077 (14-92)||(27544-27622)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (1-254)||(18136-18390)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (22-242)||(6013-6233)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-81)||(10281-10361)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (14-93)||(26755-26834)
scaffold0235 (22-236)||(10743-10957)
scaffold0235 (22-236)||(20957-21171)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (22-248)||(658-884)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-323)||(13564-13886)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (22-331)||(249324-249633)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (22-331)||(41628-41937)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (71-331)||(47835-48095)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (7-242)||(124-359)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (14-93)||(3222-3301)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (7-85)||(11690-11768)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (7-216)||(34014-34223)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (14-93)||(3491-3570)
scaffold0876 (272-323)||(3261-3312)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (14-93)||(18996-19075)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (14-93)||(13857-13936)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (14-93)||(3153-3232)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (14-93)||(9935-10014)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (14-93)||(10243-10322)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (14-93)||(14015-14094)
scaffold0310 (272-323)||(14273-14324)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (14-93)||(6124-6202)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (14-93)||(24343-24422)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (14-93)||(7086-7165)
scaffold0124 (22-242)||(12998-13220)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (22-92)||(2771-2841)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (22-88)||(12072-12138)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (14-87)||(702-775)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (14-87)||(32691-32764)
scaffold0021 (14-81)||(24923-24990)
scaffold0021 (29-93)||(72138-72202)
scaffold0021 (114-233)||(24772-24891)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (14-93)||(411-490)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (14-93)||(8118-8197)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (14-93)||(9139-9218)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (14-93)||(15605-15684)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (14-93)||(47103-47182)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (14-87)||(15031-15104)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (1-242)||(81097-81338)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (14-93)||(4107-4186)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (22-93)||(8214-8285)
scaffold0160 (272-317)||(7990-8035)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (10-89)||(48480-48559)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (14-87)||(8168-8241)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-242)||(32584-32825)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (7-242)||(5607-5841)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (15-82)||(9346-9413)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-331)||(43494-43824)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-51)||(39168-39218)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (4-49)||(29822-29867)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (53-93)||(598-638)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (53-93)||(24829-24869)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 321308 - 321692
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  321308 attcttgaagaaagtgatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 321407  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  321408 gcgatgtggcacggtttgtatatttttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatgacatctttagatgtgctaga 321507  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  321508 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 321607  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttatgatgactatttctccactgccgtct 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  321608 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttatgatgactatttctccactgccgtct 321692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 15153928 - 15154287
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15153928 attcttgaagagagtcataggagtagcttgagtatccatccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaatttgttttggtggtctggattgaaac 15154027  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15154028 gtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaatctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 15154127  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15154128 gtggaaatgggatagtatatccatggattttttaacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgactcgatttgggtaattgttgatagattgacgaag 15154227  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  15154228 tcggctcattttcttccgattaatatcaattttcctgtttctcagttggcagagatttat 15154287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 11771512 - 11771858
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11771512 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 11771611  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||| | |||    
T  11771612 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcattagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccaga 11771711  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11771712 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 11771811  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||    
T  11771812 tcggctcatttcattccgataaatatcagttttcttgtgtctcagtt 11771858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9597056 - 9596722
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  9597056 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttatggtggtctggtttgaaac 9596957  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9596956 gtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcattagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 9596857  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9596856 atggaaatgggatagtatatccatggactttgtgacaagtttgccgaatactcctagagggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 9596757  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9596756 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcc 9596722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14040692 - 14040360
Alignment:
Q  3 tcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgc 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  14040692 tcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgt 14040593  T
Q  103 gatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagt 202  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| | |||||    
T  14040592 gatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgatcattagaaaccttctgggatgatggtatctttaaatgtaccagagt 14040493  T
Q  203 ggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14040492 ggaaatgggatagtatatccatggatgttgtgacgagtttgccgaatattcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattg-tgatagattgacgaagtc 14040394  T
Q  303 ggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14040393 ggctcactttattccgattaatatcagttttcct 14040360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14350722 - 14350390
Alignment:
Q  3 tcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgc 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  14350722 tcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgt 14350623  T
Q  103 gatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagt 202  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| | |||||    
T  14350622 gatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgatcattagaaaccttctgggatgatggtatctttaaatgtaccagagt 14350523  T
Q  203 ggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14350522 ggaaatgggatagtatatccatggatgttgtgacgagtttgccgaatattcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattg-tgatagattgacgaagtc 14350424  T
Q  303 ggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14350423 ggctcactttattccgattaatatcagttttcct 14350390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 11236484 - 11236815
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  11236484 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 11236583  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  11236584 gagatgtggcacagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 11236683  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11236684 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcaaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgtggatagattgacgaag 11236783  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11236784 tcggctcattttctgccgattaatattagttt 11236815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13687063 - 13686732
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  13687063 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 13686964  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  13686963 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 13686864  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13686863 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 13686764  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13686763 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 13686732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15625551 - 15625205
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  15625551 attcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaat 15625452  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |  ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||  |||| |||    
T  15625451 gtaatgtggcacagtttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagtagagcatcagaaacctgctgggttgatgacacctttaggcgtgccaga 15625352  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15625351 gtggaaatgggatactatatccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaaaagggaatgactctatttgggtgattgtggatagattgacgaag 15625252  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  15625251 tcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagtt 15625205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 16589 - 16922
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16589 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa--tgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16686  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||    
T  16687 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtataatggtatctttagatgggccaga 16786  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  16787 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactcctagagggaacgacacaatttgggtcatcgttgatagattgtcgaag 16886  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16887 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 16922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8708604 - 8708270
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  8708604 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 8708505  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  8708504 gagatgtggcacagtttgtttattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 8708405  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8708404 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacaaag 8708305  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    ||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8708304 tcaactcattttctacctattaatattagttttcc 8708270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 18551029 - 18551363
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  18551029 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcataatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 18551128  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  18551129 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 18551228  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18551229 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 18551328  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    ||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18551329 tcaactcattttctacctattaatattagttttcc 18551363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14333395 - 14333062
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||| || ||||    
T  14333395 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcttg-tggtctggtttgaaac 14333297  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  14333296 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 14333197  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14333196 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcttagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 14333097  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    ||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14333096 tcaactcattttctacctattaatattagttttcc 14333062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8199627 - 8199296
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  8199627 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 8199528  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  8199527 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 8199428  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8199427 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 8199328  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  8199327 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 8199296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10871994 - 10871663
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  10871994 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 10871895  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  10871894 gagatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 10871795  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10871794 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 10871695  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  10871694 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 10871663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 11552373 - 11552704
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||| |||| || ||||    
T  11552373 attcttgaggagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgattgaaagaagattttctggtggcctggtttgaaac 11552472  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  11552473 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcataagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 11552572  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11552573 atggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 11552672  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11552673 tcggctcattttctaccgatcaatattagttt 11552704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12688500 - 12688169
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || | || ||||    
T  12688500 attcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggcctagtttgaaac 12688401  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||| |||    
T  12688400 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggagtgatggtacctttagatgtgccaga 12688301  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12688300 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagggggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 12688201  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12688200 tcggctcattttctaccgatcaatattagttt 12688169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 15160328 - 15160659
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  15160328 attcttgaagagagtcataggagtatatttagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 15160427  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  15160428 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 15160527  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15160528 atggaaatgggatagtatatccatggattttttgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 15160627  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15160628 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 15160659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18178741 - 18178410
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  18178741 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 18178642  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||| ||| |||    
T  18178641 gagatgtggcacaatttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatctgccaga 18178542  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18178541 atggaaatgggatagtatatctatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 18178442  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18178441 tcggctcattttctacctattaatattagttt 18178410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 44790622 - 44790953
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  44790622 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 44790721  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  44790722 gagatgtagcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 44790821  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44790822 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 44790921  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  44790922 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 44790953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 23202884 - 23203215
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||    
T  23202884 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaac 23202983  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  23202984 gagatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 23203083  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23203084 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactacgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 23203183  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23203184 tcagctcattttctacctattaatattagttt 23203215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 23509011 - 23509342
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||    
T  23509011 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaac 23509110  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  23509111 gagatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 23509210  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23509211 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactacgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 23509310  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23509311 tcagctcattttctacctattaatattagttt 23509342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21662933 - 21662614
Alignment:
Q  28 ttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattctt 127  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||  ||||| ||| | |    
T  21662933 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatatatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgt 21662834  T
Q  128 gtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatgga 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  || || || |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21662833 gtttaatttgtcaaaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgttgggttgttgacacctttagatgttccagagtggacgtgggatagtatatccatgga 21662734  T
Q  228 ttttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatatt 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  21662733 ttttgtgacgagtttgccgaatactccaaaaggacatgatgcgatttgggtaattgtggatagactgacgaagtcggctcattttattccgattaacatc 21662634  T
Q  328 agttttcctatttctcagtt 347  Q
    | ||||||| | ||||||||    
T  21662633 aattttcctgtatctcagtt 21662614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14955553 - 14955272
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| |||| || ||||    
T  14955553 attcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcat----gagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaac 14955458  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
      |||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| |||    
T  14955457 aagatgtggcacagtttgtgaattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccaga 14955358  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttg 286  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  14955357 atggaaatgggatagtatatcgatggactttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttg 14955272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19148205 - 19147877
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19148205 gaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 19148106  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||||| ||| |||||    
T  19148105 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccagaatggaa 19148006  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||     
T  19148005 gtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactcctagagggtatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggca 19147906  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19147905 cactttattccgatcaatattagttttcc 19147877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20747604 - 20747276
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  20747604 gaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 20747505  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||||| ||| |||||    
T  20747504 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccagaatggaa 20747405  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||     
T  20747404 gtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggtatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggca 20747305  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20747304 cactttattccgatcaatattagttttcc 20747276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15204618 - 15204406
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  15204618 attcttgaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccggaagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaac 15204519  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| | |||    
T  15204518 gtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggttgatggtatccttagatgtaccaga 15204419  T
Q  201 gtggaaatgggat 213  Q
     || |||||||||    
T  15204418 atgaaaatgggat 15204406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 14263502 - 14263827
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  14263502 gaaagtcacagaaatagcctaagtattcatccaggaactacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 14263601  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc-tggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaat 208  Q
    | | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || || || | |||||||||| ||||||||| |    
T  14263602 ctcagtttgtttatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcgtggt-tgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagt 14263700  T
Q  209 gggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctca 308  Q
    |||| |  || |||||| |||||||||| |||||  |||||||||| | |||| |||| ||  |||| ||  |||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  14263701 gggacaacatttccatgaattttgtgacgagtttatcgaatactccgagagggcatgatgccatttgcgttgttgtcgataggttaacgaagtcggcaca 14263800  T
Q  309 ttttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14263801 ctttattccgatcaatattagttttcc 14263827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 16071552 - 16071873
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||| ||||| |    
T  16071552 gaaagccatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatataccatgatttgaagaaattattttggtggtctaggttgaaacgtgatgttg 16071651  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
      | |||||| ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||||||||||||| ||    
T  16071652 gtcagtttgtttatgcatgtttgactcgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgctagagtggaagtg 16071751  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    ||| |  || ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||  | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  16071752 ggacaacatttccatggattttgtgacgagtttatcgaacactcaaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcacac 16071851  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  16071852 tttcttccgatcaatattagtt 16071873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 12206055 - 12206383
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||    
T  12206055 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtttcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatg 12206154  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| | ||||| | |||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  || || || | |||||||| | ||| |||||    
T  12206155 ttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgttccagaatggaa 12206254  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  | |||| |||| |   | ||| || ||||||||||||||| |||||| ||     
T  12206255 atgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttaccaaatactctgagagggcatgatgtcatatggatggttgttgatagattgaagaagtcagca 12206354  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  12206355 cactttattccaattaatattagttttcc 12206383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19613669 - 19613343
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||    
T  19613669 gaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatg 19613570  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  19613569 ttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaa 19613470  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||  ||||  |  | |||||  | |||||||||||||||||||||||     
T  19613469 atgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggttgatagattgacgaagtcggcg 19613370  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtttt 333  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  19613369 cactttattccgataaatatcagtttt 19613343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 15101873 - 15102182
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||  |   |||||| |    
T  15101873 agtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtttcttagtttgtct 15101972  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| ||||| |  || ||    
T  15101973 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttc 15102072  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | | | || |||| ||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  15102073 tatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagacggcatgatgccatttgggtggttgtcgacagattgacgaagtcggcacactttattccgatc 15102172  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||||||||    
T  15102173 aatattagtt 15102182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 317
Target Start/End: Original strand, 23505128 - 23505435
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  23505128 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 23505227  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  || || |  | || ||||| |  |||||||||||    
T  23505228 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacgccattggatgtaccggagtggaaatg 23505327  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  23505328 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacat 23505427  T
Q  310 tttcttcc 317  Q
    ||| ||||    
T  23505428 tttattcc 23505435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 18053211 - 18053532
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  18053211 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 18053310  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||||||    
T  18053311 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatg 18053410  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| | ||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18053411 ggatagcatttctatggattttgtgacgaatttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacat 18053510  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||| |||| || || |||||||    
T  18053511 tttattcctatcaacattagtt 18053532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 662 - 986
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || || || ||||    
T  662 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatg 761  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || |||| ||||||||||  ||||||||    
T  762 ttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcgttagatgtgccggagtggaa 861  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| | ||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||     
T  862 gtgggacaatatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtcattgtcgacaggttgacgaagtcagca 961  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    |||||  ||||||| ||||| ||||    
T  962 catttcattccgatcaatatcagtt 986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 11305512 - 11305842
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  || |||     
T  11305512 attcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaaaa 11305611  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  11305612 gggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 11305711  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  11305712 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 11305811  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  11305812 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 11305842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Original strand, 11387698 - 11388011
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| |    
T  11387698 agtaacttaagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgttt 11387797  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| ||||||||| ||||| |  || ||    
T  11387798 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttc 11387897  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     | ||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||     
T  11387898 tacggattttatgacgagtttaccgaatactccgatagggcatgatgctatttgggtttttgtggataggttgacgaagtcagcgcactttattccgata 11387997  T
Q  322 aatattagttttcc 335  Q
    ||||| ||||||||    
T  11387998 aatatcagttttcc 11388011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14130852 - 14130557
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || || || ||||| || |  |||||||    
T  14130852 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtat 14130753  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | || || | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  14130752 atgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggatagcatttc 14130653  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| | |||  ||||  |  |||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  14130652 tatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggttgataggttgacaaagtcggcacattttattcc 14130557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14434670 - 14434375
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || || || ||||| || |  |||||||    
T  14434670 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtat 14434571  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | || || | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  14434570 atgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggatagcatttc 14434471  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| | |||  ||||  |  |||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  14434470 tatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggttgataggttgacaaagtcggcacattttattcc 14434375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 49153301 - 49152971
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  49153301 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 49153202  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
      ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  49153201 aagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaaatccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 49153102  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  49153101 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 49153002  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  49153001 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 49152971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15341410 - 15341190
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || | |||||| |    
T  15341410 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagctcagtttgtgt 15341311  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  15341310 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttc 15341211  T
Q  222 catggattttgtgacaagttt 242  Q
     ||||||||| |||| |||||    
T  15341210 tatggattttatgacgagttt 15341190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13666516 - 13666207
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || |  ||||| |    
T  13666516 agtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgt 13666417  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  || || || |  | |||||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  13666416 atgcatgtttgacttgtcagaagtcgaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgatggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttc 13666317  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | || || || ||||| |||||||| || ||| |||||||     
T  13666316 tatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacaaagtcggcgcactttattccgatc 13666217  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  13666216 aatatcagtt 13666207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 13967938 - 13968247
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||| | ||||| || | |||||| |    
T  13967938 agtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgttt 13968037  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  || ||||| ||||| ||||| ||    
T  13968038 atgcctgtttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggactggaagtgggacagtatctc 13968137  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||| |||    
T  13968138 tatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacactttattcctatt 13968237  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  13968238 aatataagtt 13968247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 26117854 - 26118107
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  26117854 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 26117953  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | ||| || ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  26117954 gagatgttgctcagttcgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttagatgtaccgga 26118053  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26118054 gtggaagtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactcc 26118107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 8211398 - 8211681
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||| | ||||| || | |||||| |    
T  8211398 agtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttaaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgttt 8211497  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc-tggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatat 220  Q
    || | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || || || | |||||||| |  |||||||| || || ||||| |    
T  8211498 atgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcatggt-tgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgagacagtatct 8211596  T
Q  221 ccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggc 305  Q
    | |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | ||||||||||||||    
T  8211597 ctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggtagttgtcgaccggttgacgaagtcggc 8211681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14212673 - 14212582
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 92  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||    
T  14212673 attcttgaagagagtcatcgaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctgg 14212582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 16949727 - 16950050
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| || || || || ||||    
T  16949727 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccacgatttg-agaaactgttttggtggtccggtttcaagcgtgatg 16949825  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || |  || | |||||||| |  ||||||||    
T  16949826 ttgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttaacaccgttagatgtaccggagtggaa 16949925  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||  ||||| | |||| |||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||||||     
T  16949926 gtgggacagtatttctatggatttcgtgacgagtctaccgagcactccgagagggcatgatgccatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggca 16950025  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  16950026 cacttcattccgattaatatcagtt 16950050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4440914 - 4440835
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4440914 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgacgaagatgtatcaggatttaaagaggttgttttggtggtctgga 4440835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 14285646 - 14285866
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |  |||||||    
T  14285646 agtagcttgagtattcatcctggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcattttgtat 14285745  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    |  | |  || | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  14285746 acgcatacttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 14285845  T
Q  222 catggattttgtgacaagttt 242  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  14285846 tatggattttgtaacaagttt 14285866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13354136 - 13354057
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  13354136 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtggactgga 13354057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13022357 - 13022117
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |  || ||      
T  13022357 attcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgttttgaagt 13022258  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| ||||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  13022257 gtgatgttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgtcagaagtctaatgttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 13022158  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtt 241  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||    
T  13022157 gtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacgagtt 13022117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 27107058 - 27107137
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  27107058 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 27107137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12457640 - 12457310
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |  || ||      
T  12457640 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaagt 12457541  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| ||||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  12457540 gagatgttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 12457441  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| | |||| |||| ||  ||| |||  |||| ||  | |||||||||    
T  12457440 gtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtttacggaacactccgagagggcatgatgctatttaggttgttgtagaccggttgacgaag 12457341  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  12457340 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 12457310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13455732 - 13455654
Alignment:
Q  15 tcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  13455732 tcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgacgaagatgtattaggatttgaagaggttgttatggtggcctgga 13455654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14937333 - 14937260
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  14937333 gtcatagaagtagtttgagtattcatctaggagcgacgaagatgtattaggatttgaagaggttgttttggtgg 14937260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15364926 - 15364853
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  15364926 gtcatagaagtagtttgagtattcatctaggagcgacgaagatgtattaggatttgaagaggttgttttggtgg 15364853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 7824886 - 7824807
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  7824886 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtattaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 7824807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12456696 - 12456461
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||| || |    
T  12456696 gaagaaagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaaacgtgacg 12456597  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc-tggtatgatggcatctttagatgtgctagagtgga 205  Q
    | || |  ||||| ||| | || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || || || | || ||||| |  |||||||    
T  12456596 tagctcattttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcatggt-tgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 12456498  T
Q  206 aatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    | ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  12456497 agtgggacaatatttctatggattttgtgacgagttt 12456461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17924622 - 17924558
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17924622 tgagtattcatccaggagcgacgaagatgtattaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 17924558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23642417 - 23642353
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23642417 tgagtattcatccaggagcgacaaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 23642353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Original strand, 21673832 - 21673896
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21673832 tgagtattcatccagaagcgactaagatgtatcaggatttgaagatgttgttttggtggcctgga 21673896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 45147523 - 45147459
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45147523 tgagtattcatccaggagcgaataagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 45147459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6414322 - 6414152
Alignment:
Q  190 gatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgata 289  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||| ||||  |  | |||||  | || || |    
T  6414322 gatgtgccggagtggaagtgggatagtatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgaca 6414223  T
Q  290 gattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    | |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||| ||| ||  ||||||||| ||| ||||||    
T  6414222 ggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatatcagttatccgatagctcagttagcagagatttat 6414152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Original strand, 17144560 - 17144695
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttg 128  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||| || | ||| | ||  | ||   |||||| ||| ||||    
T  17144560 tgagtattcatccatgagcgacgaagatgtatcaagatttgaagagattgcttaggtggtctagaatgaaaagggaaatagcggagtttgtgtatgcttg 17144659  T
Q  129 tttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaa 164  Q
    ||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||    
T  17144660 tttgatttgtcaaaagtctaagatttaacatcagaa 17144695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45147280 - 45147229
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaa 323  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  45147280 tttgggtgattgttgatcgattgacgaagtcggtacattttgttcctattaa 45147229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21749966 - 21749607
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21749966 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctggattgaaac 21749867  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||    
T  21749866 gtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctctagatgtgccaga 21749767  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749766 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 21749667  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  21749666 tcggctcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 21749607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20139855 - 20139497
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20139855 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 20139756  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20139755 gtgatgttgcacagtttgtctattcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcattagaaacctgctggtatgatggtatcattagatgtgctaga 20139656  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139655 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaatgacacaatttgggtgattgttgatagattgacgaag 20139556  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaattta 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||    
T  20139555 tcagctcattttcttccgattaatattagtttccctgtttctcggttggcagaaattta 20139497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 22361578 - 22361913
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22361578 attcttgaagagagtcatagaagaaacttgagtattcatccgggagctacgaagatctatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 22361677  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  22361678 gcgacgttgcatagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 22361777  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22361778 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaacgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 22361877  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22361878 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 22361913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 50619578 - 50619937
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50619578 attcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaac 50619677  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||    
T  50619678 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggattatggtatctttagatgtaccaga 50619777  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50619778 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggaaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 50619877  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    | |||||||||  | ||||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||| ||||||    
T  50619878 ttggctcatttcatcccgattaatatcagttttcttgtttctcagttggcagagatttat 50619937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20250826 - 20250468
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  20250826 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggt-tggactgaaac 20250728  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  20250727 gtgatgttgcacagtttgtgtattcttatttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 20250628  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250627 gtggaaatgggatagtatatacatggattttgtgacgagttttccgaatactcctaaagggaattacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 20250528  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  20250527 tcggctcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 20250468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 16349933 - 16350261
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16349933 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16350032  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  16350033 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 16350132  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16350133 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 16350232  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattag 329  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16350233 tcggctcattttctaccgattaatattag 16350261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21831328 - 21830997
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  21831328 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 21831229  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  21831228 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 21831129  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21831128 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttttccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 21831029  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21831028 tcggctcattttctacagattaatattagttt 21830997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21837975 - 21837644
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  21837975 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 21837876  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  21837875 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 21837776  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21837775 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcccagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 21837676  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21837675 tcagctcattttctacctattaatattagttt 21837644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 41352996 - 41353327
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  41352996 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 41353095  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  41353096 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 41353195  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  41353196 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaa 41353295  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41353296 tcagctcattttctgcctattaatattagttt 41353327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 16077990 - 16078323
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || | ||||||||| || |||     
T  16077990 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaat 16078089  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16078090 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtctgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 16078189  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||| || |||||||||||||  |||    
T  16078190 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgagtaag 16078289  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16078290 tcggctcattttctaccgattaatattagttttc 16078323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 17044349 - 17044684
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  17044349 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 17044448  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
      |||||||||  |||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17044449 aagatgtggcaaagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 17044548  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17044549 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcagagagggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 17044648  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17044649 ttggctcattttctaccgattaatattagttttcct 17044684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 19760207 - 19760533
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19760207 attcttgaagagagtcacataagtagcttgagtatccatccaggagctataaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 19760306  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||       ||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  19760307 gtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtcaaaagt-------tgagcatcagaaatctgttgggttgatggtatctttagatgtgccaga 19760399  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19760400 gtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgagtactccgaaaggaaatgacgctatttgggtgattgttgatagattgacaaag 19760499  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    |||||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  19760500 tcggctcatttaatttcgattaatatcagttttc 19760533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 51332827 - 51333158
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  51332827 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 51332926  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  51332927 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 51333026  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  51333027 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 51333126  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  51333127 tcagctcatttcctaccgattaatattagttt 51333158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 33390363 - 33390694
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  33390363 attctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 33390462  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | |||| |||    
T  33390463 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgccagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttaaacgtgccaga 33390562  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33390563 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgtcgaatactcctagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 33390662  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33390663 tcagctcattttctacctattaatattagttt 33390694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19107393 - 19107033
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| ||| || || |    
T  19107393 attcttgaagagagccacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaagc 19107294  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  19107293 gagatgtggcacagtttgtgtattcatgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 19107194  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatgga-ttttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaa 299  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  19107193 attgaaatgggatagtatatcaatggatttttgtgatgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaa 19107094  T
Q  300 gtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    ||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||    
T  19107093 gtcagttcattttctaccaattaatattagttttcctgttgcccagttagcagagatttat 19107033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16370136 - 16369963
Alignment:
Q  187 ttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  16370136 ttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgaggttgtcgaatactcctaaagggaatgacgctttttgggtgattgttt 16370037  T
Q  287 atagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  16370036 atagattgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatagctcagttggcagagatttat 16369963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20937843 - 20937649
Alignment:
Q  97 aaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgc 196  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  20937843 aaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtctgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgc 20937744  T
Q  197 tagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgataga 291  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  20937743 cagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataga 20937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16373554 - 16373385
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16373554 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctgcgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 16373455  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
    | || ||| |||  ||||| |||||||| || |||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16373454 gtgacgtgacacaatttgtgtattcttgcttgatttttaagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 16373385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Original strand, 24098943 - 24099247
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |  ||||    
T  24098943 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcatgatg 24099042  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| |||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||||||||    
T  24099043 ttgctcattttgtttatgcttgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaa 24099142  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | |||| |||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||||||     
T  24099143 atgggacagtatttctatggattttgtgacaagtttaccgaacactacgagagggcatgatgctatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggca 24099242  T
Q  307 cattt 311  Q
    |||||    
T  24099243 cattt 24099247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22110047 - 22109878
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22110047 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 22109948  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
      |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22109947 atgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgttagaagttgaaagttgagcatcaaaaacctgc 22109878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22113896 - 22113727
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22113896 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 22113797  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
      |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22113796 atgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgttagaagttgaaagttgagcatcaaaaacctgc 22113727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 31539352 - 31539661
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||| | ||||| || | |||||| |    
T  31539352 agtaggttgagtattcacccaggggctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 31539451  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  31539452 atgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctc 31539551  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||||||| |||||  |||| |||    
T  31539552 tatggattttgtgacgagtttgccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacatttcattcctatt 31539651  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  31539652 aatatcagtt 31539661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21025198 - 21025068
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  21025198 attcttgaaaagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaac 21025099  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgttt 131  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21025098 gcgatgtggcacagtttgtgtattcttgttt 21025068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37678105 - 37677775
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  37678105 attcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 37678006  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| ||   |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  37678005 gggatgttgcttagtttgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 37677906  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  37677905 gtggaagtgggatagtatctctatggattttgtaactagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 37677806  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  37677805 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 37677775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 20835243 - 20835552
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || | |||||| |    
T  20835243 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgt 20835342  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  20835343 atgcatgtttgacttgtcagatgtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttc 20835442  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | || || |  ||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  20835443 tatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacatgttgacaaagtcgacgcattttattccgatt 20835542  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  20835543 aatatcagtt 20835552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19855307 - 19855077
Alignment:
Q  24 tagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatat 123  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||| | || |   |||| |||    
T  19855307 tagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagacgctgttttggtggtctgggttgaaacgggatattgctcaaattgtgtat 19855208  T
Q  124 tcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatcca 223  Q
     | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||||| ||||||||| |||||||| || || |    
T  19855207 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttggatgtgccagagtggaagtgggatagcatttcta 19855108  T
Q  224 tggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19855107 tggattttgtgacgagtttaccgaacactcc 19855077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20295437 - 20295107
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  20295437 attcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 20295338  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  20295337 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 20295238  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  ||||||| ||||| ||  | |||||||||    
T  20295237 ctggaagtgggacattatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttattgtcgaccggttgacgaag 20295138  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  20295137 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 20295107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21951931 - 21951681
Alignment:
Q  4 cttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcg 103  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||| | |    
T  21951931 cttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaatatgtttcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaaggg 21951832  T
Q  104 atgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtg 203  Q
    |||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||    
T  21951831 atgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtg 21951732  T
Q  204 gaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21951731 gaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttgccgaacactcc 21951681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 20856100 - 20856425
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg-attaaaacgcgat 105  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||    |||    
T  20856100 gaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggttttaaagaaggat 20856199  T
Q  106 gtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtgga 205  Q
    || || |||||||| ||| | ||||| | |||| | ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| || || || | || || || | ||||||||    
T  20856200 gtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttcacttgttagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaggtaccagagtgga 20856299  T
Q  206 aatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggc 305  Q
    |||||||||  || || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||  || | |||||  | || || || ||||||||||||||    
T  20856300 aatgggatatcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggc 20856399  T
Q  306 tcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
     || ||  ||| ||||||||| ||||    
T  20856400 gcacttcattctgattaatatcagtt 20856425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 248
Target Start/End: Original strand, 20939403 - 20939644
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || || || || |    
T  20939403 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtgacg 20939502  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  ||||||||    
T  20939503 tcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaa 20939602  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaa 248  Q
     ||||||  ||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  20939603 gtgggattttatttctatggattttgtgacgagtttaccgaa 20939644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 20830739 - 20830818
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  20830739 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 20830818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 170
Target Start/End: Original strand, 19662492 - 19662640
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| |    
T  19662492 agtagcttaagtattcgtccggaagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcaatttgtgt 19662591  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
    || | ||||| | |||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19662592 atgcatgtttgacttgtctgaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 19662640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 22134904 - 22134983
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  22134904 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagtgactaagatgtatcaggatttgaagagcttgttttggtggcctgga 22134983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 242
Target Start/End: Original strand, 22432647 - 22432691
Alignment:
Q  198 agagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  22432647 agagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 22432691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 112753 - 113111
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  112753 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 112852  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  112853 gtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtgccaga 112952  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  112953 -tggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtggttgttgatagattgacgaag 113051  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  113052 tcggctcatttccttccaattaatattagttttcctgtttctcagttggaagaaatttat 113111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15918 - 15572
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15918 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctactaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 15819  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | || ||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||| | | |    
T  15818 gagacgtggcacagtttgtgtattactgtttgatttgtcagaagtcaaaagttcagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccata 15719  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15718 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactacgagagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatggattgatgaag 15619  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||    
T  15618 tcggctcattttattccgattaacattggttctcctgtgtctcagtt 15572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 230084 - 229725
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  230084 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttggtttggtggtctggattgaaac 229985  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  229984 gtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttggtttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 229885  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  229884 gtggaattgtgatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 229785  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  229784 tcggctcattttattccgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 229725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 218682 - 219028
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  218682 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 218781  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||| || | |||||| | | |||    
T  218782 gtgatgtggcacagtttgtgaattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacaccattagatataccaga 218881  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  218882 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagcttgtcgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 218981  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  218982 tcggctcattttattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagtt 219028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 22761862 - 22762221
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22761862 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 22761961  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  22761962 gcgatgttgcacagtttatgtattcttgtttgatttttcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 22762061  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22762062 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgactaag 22762161  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  22762162 tcggctcattttcttatgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 22762221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 20636708 - 20637054
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20636708 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaac 20636807  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  20636808 gcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 20636907  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20636908 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 20637007  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20637008 tcggctcattttcttccgattaatattagttatcctgtttctcagtt 20637054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 18407349 - 18407691
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  18407349 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttgctagtctggattgaaac 18407448  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  18407449 gcgatgttgcacagtttttgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 18407548  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18407549 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgattttggtgattgttgatagattgacgaag 18407648  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctc 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18407649 tcgactcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctc 18407691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 22078097 - 22078443
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||| ||||    
T  22078097 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaaattattttggtggtctggattgaaac 22078196  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  22078197 gtgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 22078296  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078297 gtggaagtgggatagtatatccgtggattttgtgatgagtttgccgaatactcctaaagggaacgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 22078396  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22078397 tcggcgcattttcttccggttaatatcagttttcctgtttctcagtt 22078443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19865561 - 19865228
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  19865561 attcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcattatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaac 19865462  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19865461 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 19865362  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19865361 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaag 19865262  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19865261 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttc 19865228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 25609268 - 25609628
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25609268 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaat 25609367  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25609368 gtgatgttgcaccgtttgtgtattcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 25609467  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25609468 ttggaaatgggatagtatatccatggatttcgtgacgagtttgccgattactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgacagattgacgaag 25609567  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttatg 361  Q
    || || ||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||    
T  25609568 tcagcacattttctggcgattagtatcagttttcctgtttctcaattggcagagatttatg 25609628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 27391580 - 27391926
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  27391580 attctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatctaaagaagttattttggtggtctgggttgaaac 27391679  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    || |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  27391680 gcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 27391779  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27391780 gtagaaatgggatagcatatccatggattttgtgacaagcttgccaaatactccttaagggaatgacgtgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 27391879  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27391880 tcggctcattttcttccgattaatataagttttcctgtttctcagtt 27391926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 360
Target Start/End: Original strand, 5838638 - 5838985
Alignment:
Q  13 agtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  5838638 agtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtttggattgaaacgtgatgttgcac 5838737  T
Q  113 ggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatggga 212  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  5838738 agtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccggaatggaaatggga 5838837  T
Q  213 tagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  5838838 tagtatatccatggattttgtgactagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggctcatttt 5838937  T
Q  313 cttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  5838938 ctaccgataaatattagttttcctgtttctcagttggtagagatttat 5838985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 27330840 - 27331186
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  27330840 attctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatctaaagaagttattttggtggtctgggttgaaac 27330939  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    || |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  27330940 gcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 27331039  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331040 gtagaaatgggatagcatatccatggattttgtgacaagcttgccctatactccttaagggaatgacgtgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 27331139  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27331140 tcggctcattttcttccgattaatataagttttcctgtttctcagtt 27331186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22434743 - 22434408
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||    
T  22434743 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaac 22434644  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||  |||    
T  22434643 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctactggtatgatggtatcgttagacgtggcaga 22434544  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22434543 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgatttgggtgattgtcgatatattgacgaag 22434444  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  22434443 tcggctcattttctactgattaatatcagttttcct 22434408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22443141 - 22442806
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||    
T  22443141 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaac 22443042  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||  |||    
T  22443041 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctactggtatgatggtatcgttagacgtggcaga 22442942  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22442941 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgatttgggtgattgtcgatatattgacgaag 22442842  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  22442841 tcggctcattttctactgattaatatcagttttcct 22442806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 2874210 - 2874541
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||    
T  2874210 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggtctggtttgaaac 2874309  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||| |||    
T  2874310 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtgcctttagacgtgccaga 2874409  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2874410 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgtggatagattgacgaag 2874509  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2874510 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 2874541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15896968 - 15896622
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  15896968 attcttaaagagagtcacacaagtatcttgagtatccatccaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaggttattttggtggtctgggttgaaac 15896869  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| | | |    
T  15896868 gtgatgtggcacagtttgtatattcatgtctaatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggttgatggtatctatagatgtaccaaa 15896769  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15896768 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccgaaagggaatggcgttatttgggtgattgttgataggttgacgaag 15896669  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  15896668 tcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtatctcagtt 15896622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 24312575 - 24312909
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||    
T  24312575 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaac 24312674  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  24312675 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 24312774  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24312775 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 24312874  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24312875 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttcc 24312909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 16927047 - 16927382
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||   ||||||||||||||||| || |    
T  16927047 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagagattttggtggtctggattgaagc 16927146  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| || |||| ||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  16927147 gcgatgtggcacagtttgtgtactcttatttgatttgttagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 16927246  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16927247 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgacagattgacgaag 16927346  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    || || |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  16927347 tcagcacattttctaccgattaacatcagttttcct 16927382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16962852 - 16963152
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||  | ||||||||||||||||| || |    
T  16962852 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaatatattttggtggtctggattgaagc 16962951  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  16962952 gcgatgtggcacagtttgtgtactcttgtttgatttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccaga 16963051  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16963052 atcgaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgacagattgacgaag 16963151  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  16963152 t 16963152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23079343 - 23078984
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  23079343 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaac 23079244  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||   ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||    
T  23079243 gtgatgtagcataatttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgttgggatgatggtatctttagatgtaccaga 23079144  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23079143 gtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttttagaatactcctaaagtgaatgacgcgatttgggtgattgtagatagattgacgaag 23079044  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    | |||||||||  ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |  |||||||||    
T  23079043 ttggctcatttcattccgattaatatcagttttcatgtgtctcagttggcggaaatttat 23078984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25113426 - 25113095
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  25113426 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 25113327  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||    
T  25113326 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtaccaga 25113227  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25113226 atggaaatgggatagtatatcgatggatttcgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 25113127  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25113126 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 25113095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 29591327 - 29591658
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  29591327 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 29591426  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  29591427 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 29591526  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  29591527 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaag 29591626  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  29591627 tcagctcatttcctaccgattaatattagttt 29591658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 16626124 - 16626458
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16626124 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16626223  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  16626224 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 16626323  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16626324 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactctgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 16626423  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    ||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16626424 tcaactcattttctacctattaatattagttttcc 16626458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 27566387 - 27566717
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  27566387 attcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaac 27566486  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27566487 gtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 27566586  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||  ||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  27566587 atggaagtgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcagaatactcctatagggaacgatgcaatttgggtaatctttgatagattaacgaag 27566686  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27566687 tcagctcattttctaccgattaatattagtt 27566717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 1542491 - 1542822
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  1542491 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 1542590  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  1542591 gagatgtggcatagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 1542690  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  | ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1542691 atggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcccagagggaaatatgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 1542790  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1542791 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 1542822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27188310 - 27187979
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  27188310 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 27188211  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  27188210 gagatgtggctcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgttgggatgatggtacctttagacgtgccaga 27188111  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27188110 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatacacctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaa 27188011  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27188010 tcagctcattttctacctattaatattagttt 27187979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 27260930 - 27261261
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  27260930 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 27261029  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  27261030 gagatgtggctcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgttgggatgatggtacctttagacgtgccaga 27261129  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27261130 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatacacctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaa 27261229  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27261230 tcagctcattttctacctattaatattagttt 27261261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 18197132 - 18197493
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggatta---a 97  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |    
T  18197132 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctaccaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttggtggtcgggattattga 18197231  T
Q  98 aacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgct 197  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||| | |     
T  18197232 aacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgattttctagaagtcaaaggttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatatacc 18197331  T
Q  198 agagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacg 297  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  18197332 agagtggaaatgggatagcatatgcatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaacgacgctatttgggtgattgtggataaattgacg 18197431  T
Q  298 aagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaattta 359  Q
    ||||| | ||||||  |||||||||| || ||||||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  18197432 aagtcagatcatttcattccgattaacatcagtttttttgtatctcagttagcagagattta 18197493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 28262604 - 28262935
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || |||     
T  28262604 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaag 28262703  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||  ||    
T  28262704 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccgga 28262803  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || ||  ||||||| || |||||||||||||| |||    
T  28262804 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgatgcaatttgggttatagttgatagattgacaaag 28262903  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  28262904 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 28262935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 28341353 - 28341684
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || |||     
T  28341353 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaag 28341452  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||  ||    
T  28341453 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccgga 28341552  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || ||  ||||||| || |||||||||||||| |||    
T  28341553 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgatgcaatttgggttatagttgatagattgacaaag 28341652  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  28341653 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 28341684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 18966699 - 18967039
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | || ||      
T  18966699 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttgctggtctaggttgaata 18966798  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||| |||  ||||| || |||||||||||| |||    
T  18966799 gtgatgtgccacaatttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaaggtgagcatcataaacctggtgggttgatgacacctttagatgtgccaga 18966898  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||      |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18966899 gtggaaat------gtatatccatggattttgtgatgagttttctgaatactccaaaagggaatgacgttatttgggtgattgtggatagattgacgacg 18966992  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  |||||||||| || ||||||| | | ||||||||    
T  18966993 tcggctcatttcattccgattaacatcagttttcttgtatctcagtt 18967039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 332
Target Start/End: Original strand, 28291823 - 28292110
Alignment:
Q  45 agctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaag 144  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  28291823 agctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaag 28291922  T
Q  145 tcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgc 244  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28291923 tcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgc 28292022  T
Q  245 cgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||| | |||||  || ||  ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  28292023 cgaatactccgagagggagcgatgcaatttgggttatagttgatagattgacaaagtcagctcatttcctacctattaatattagttt 28292110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25769059 - 25768731
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||    
T  25769059 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgattttaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatg 25768960  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||||||    
T  25768959 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaa 25768860  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |  ||  |||| ||  |||||||  | || ||||  ||||||||||||||     
T  25768859 gtgggacagtatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatacttcgaggggacatgatgccatttgggttgtcgtcgatacgttgacgaagtcggcg 25768760  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25768759 cattttatttcgatcaatattagttttcc 25768731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21472469 - 21472141
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| | ||||    
T  21472469 gaagaaagtcacagaagcagcttaagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatg 21472370  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||||||||    
T  21472369 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaa 21472270  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || ||||||||||||||     
T  21472269 gtgggacagtatctccatgaattttgcgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggcg 21472170  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  21472169 cattttatcccgatcaatattagttttcc 21472141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Original strand, 19488685 - 19488900
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  19488685 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatg 19488784  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||  || || || | ||||||||||  ||||||||    
T  19488785 ttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgatcattagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaa 19488884  T
Q  207 atgggatagtatatcc 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  19488885 atgggatagtatatcc 19488900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18436483 - 18436144
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggat----ta 96  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    |     
T  18436483 attctggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtctgggtgggttg 18436384  T
Q  97 aaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgc 196  Q
    ||  | ||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||| |  || || || |||| ||| | |    
T  18436383 aagtgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgttagaagtctaaagttgaacatcagaaacctgcttggttgttgacaccttttgatattc 18436284  T
Q  197 tagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgac 296  Q
     | ||| ||| | ||||||||||| |||||||||| | || | |||| |||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  18436283 caaagtcgaagtaggatagtatattcatggattttttcactactttgtcgaatactccaaaaggacatgatgcgatttgggtaattgtggatagactgac 18436184  T
Q  297 gaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  18436183 gaagtcggcccattttattccgattaacataagttttcct 18436144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 28282229 - 28282550
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  28282229 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 28282328  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||||||    
T  28282329 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatg 28282428  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28282429 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacat 28282528  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||| |||| || || |||||||    
T  28282529 tttattcctatcaacattagtt 28282550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15460204 - 15459880
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||    
T  15460204 gaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggattgaagaaggatg 15460105  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||| | |  ||||||||    
T  15460104 tcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagattgaacatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttggatataccggagtggaa 15460005  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||  | ||  |  | |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  15460004 atgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacacgattctatatgggttgttgttgacaggttgacgaagtcggca 15459905  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  15459904 cacttcattccgattaatataagtt 15459880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 34644999 - 34645327
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||||  ||| || || || ||||    
T  34644999 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtaccacgacttgaaaaagctgttttggtgggttggtttgaagcgtgatg 34645098  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  34645099 ttgctcagtttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtcaaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaa 34645198  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||  ||||  |  | |||||  | || ||||||||||||||||||||     
T  34645199 atgggatagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatatgggttgtagtcgatagattgacgaagtcggcg 34645298  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  34645299 cactttattccgataaatatcagttttcc 34645327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 14380895 - 14381204
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| |    
T  14380895 agtagcttgagtgttcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtgt 14380994  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| || ||||| || ||    
T  14380995 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgagatagcatttc 14381094  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| ||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||  |||| |||    
T  14381095 tatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggcacacttcattcctatt 14381194  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||||||||    
T  14381195 aatattagtt 14381204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18795558 - 18795327
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || || || ||||    
T  18795558 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatg 18795459  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  || ||  | | |||||||| | |||||||||    
T  18795458 ttgctcaatttgtgtatgcgtgtttgacttgccagaagtctaaggtcgagcatcagaagcctgcagggttgttgataccattagatgttccagagtggaa 18795359  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaa 238  Q
     ||||| |  || || ||||||||||||||||    
T  18795358 gtgggacaacatttctatggattttgtgacaa 18795327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24365286 - 24365009
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||     
T  24365286 attcttgaggagagtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaa 24365187  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | ||| || ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  24365186 gagatgttgctcagttcgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 24365087  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggt 278  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||    
T  24365086 gtggaagtgggacagtatatctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggt 24365009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19880151 - 19879838
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| || || || ||||| || |  ||||| |    
T  19880151 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgt 19880052  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||    
T  19880051 atgcctgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttc 19879952  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||| ||||| ||| | || || ||||| |  ||  ||||  |  | |||||  | || |||||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  19879951 tatggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgaggggatatgattcaatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcgcactttattccgata 19879852  T
Q  322 aatattagttttcc 335  Q
    ||||| ||||||||    
T  19879851 aatatcagttttcc 19879838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 5296634 - 5296917
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||| || || || | |||||| |    
T  5296634 agtagcttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgt 5296733  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | || || | || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  5296734 atgcatgcttgacttatcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttc 5296833  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggc 305  Q
     |||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||| | ||||||||||||||    
T  5296834 tatggattttgtgactagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaagtcggc 5296917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19454273 - 19453964
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || |  ||||| |    
T  19454273 agtaacttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtaacatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttgtgt 19454174  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||| | ||||| |||||||| ||||||||  |||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| |||||||  || ||    
T  19454173 atgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgaacatcagaagtctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaattgggatatcatttc 19454074  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  | ||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||    
T  19454073 tatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggttgacaggttgacaaagtcagcgcactttattccgatt 19453974  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  19453973 aatatcagtt 19453964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19435855 - 19435707
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || || || ||||| || | |||| | |    
T  19435855 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttatgt 19435756  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19435755 atgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 19435707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Original strand, 21563572 - 21563869
Alignment:
Q  34 atccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaa 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| ||| | | ||| |    
T  21563572 atccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttga 21563671  T
Q  134 tttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgt 233  Q
     ||| || ||||| ||||| || |||||||| | ||| ||  || || |||| || |||||||  ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  21563672 cttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcttgcagggttgttgacatcgttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgt 21563771  T
Q  234 gacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||||||| || || ||||| | |||  ||||  |  | |||||  | || ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||    
T  21563772 gacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacgaagtcggcgcactttattccgatcaatatcagtt 21563869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Original strand, 21569431 - 21569728
Alignment:
Q  34 atccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaa 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| ||| | | ||| |    
T  21569431 atccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttga 21569530  T
Q  134 tttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgt 233  Q
     ||| || ||||| ||||| || |||||||| | ||| ||  || || |||| || |||||||  ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  21569531 cttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcttgcagggttgttgacatcgttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgt 21569630  T
Q  234 gacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||||||| || || ||||| | |||  ||||  |  | |||||  | || ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||    
T  21569631 gacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacgaagtcggcgcactttattccgatcaatatcagtt 21569728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 8762350 - 8762509
Alignment:
Q  11 aaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggc 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || || ||    
T  8762350 aaagtcacaaaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgc 8762449  T
Q  111 acggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
     |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8762450 tcattttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgc 8762509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 331
Target Start/End: Original strand, 22796135 - 22796369
Alignment:
Q  97 aaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgc 196  Q
    ||||| ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||    
T  22796135 aaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgc 22796234  T
Q  197 tagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgac 296  Q
     | ||||||| ||| | |  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||| |||||    
T  22796235 caaagtggaagtggaacaacatatacatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgac 22796334  T
Q  297 gaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
     |||||| | || ||| ||||||| | ||||||||    
T  22796335 aaagtcgacacactttattccgatcattattagtt 22796369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16098911 - 16098838
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16098911 gtcataggagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtgg 16098838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 14624777 - 14624856
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  14624777 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgttctgga 14624856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 16381793 - 16381872
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  16381793 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 16381872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18572512 - 18572433
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  18572512 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgtttttgtggcctgga 18572433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 317
Target Start/End: Original strand, 27560150 - 27560340
Alignment:
Q  127 tgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatgg 226  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || |  | || ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  27560150 tgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaggattgttgacgccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 27560249  T
Q  227 attttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  27560250 attttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtggtggttgataggttgacgaagtcggcacattttattcc 27560340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Original strand, 15077790 - 15077859
Alignment:
Q  18 tagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15077790 tagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 15077859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 10468256 - 10468560
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |    
T  10468256 attctagaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagc 10468355  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
      ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  10468356 atgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 10468455  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  10468456 gtggaagtgggacagtatctctatagatttcgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgaagcaatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 10468555  T
Q  301 tcggc 305  Q
    |||||    
T  10468556 tcggc 10468560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 1648234 - 1648313
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  1648234 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaagagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 1648313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 18837328 - 18837407
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  18837328 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttaaagagattgttttggtggcctgga 18837407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23997109 - 23997030
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  23997109 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagattttaaaaggttgttttggtggcctgga 23997030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16233889 - 16233810
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  16233889 gtcatagaagtattttgtgtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 16233810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 23027143 - 23027215
Alignment:
Q  21 aagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23027143 aagtagtttaagtattcatccaggagcgactaagatatatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 23027215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 35275506 - 35275579
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  35275506 gtcaaagaagtagtctgagtattcattcaggagcaagtaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 35275579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21928051 - 21927987
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  21928051 tgagtattcatccaggagcgactaagatgtatgaggatttgaagaggtcgttttggtggcctgga 21927987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 28288080 - 28288114
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtat 35  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28288080 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 28288114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21927808 - 21927763
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  21927808 tttgggtgattgttgatcggttgacgaagtcggcacattttgttcc 21927763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 166
Target Start/End: Original strand, 15077886 - 15077938
Alignment:
Q  114 gtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaac 166  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  15077886 gtttgtatatgcttgtttggtttgtcaaaagtcgaagattgaacaccagaaac 15077938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25424130 - 25423788
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25424130 attcttgaagagagtcatagaagtaa-ttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 25424032  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  25424031 gcgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgtcaga 25423932  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423931 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 25423832  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctca 344  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25423831 ttggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctca 25423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23441152 - 23440821
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  23441152 attcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatattctggtggtctggattgaaac 23441053  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23441052 gcgatgtagcacaatttgtgtattcttgtttagtttgtcataagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 23440953  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440952 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaag 23440853  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23440852 tcagctcattttctaccgataaatattagttt 23440821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 26738171 - 26738514
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26738171 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 26738270  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||    
T  26738271 gtgatgttgcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtaccaga 26738370  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738371 gtggaaatgtgatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 26738470  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctca 344  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||||    
T  26738471 tcggctcatttccttctaattaatatcaattttcctgtttctca 26738514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 29475517 - 29475848
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||| || ||||    
T  29475517 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcctggtggtctggtttgaaac 29475616  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  29475617 gagatgtggcacagtttgtgtattcatgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 29475716  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29475717 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 29475816  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29475817 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 29475848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 20467541 - 20467886
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||    
T  20467541 attcttgaagagagtaacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttggtttggtggtcggggttgaaac 20467640  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||    
T  20467641 gtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgttaaaagtcaaaagttgagcattagaaacctgctgggttgatgacatctttagaagtgccaga 20467740  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20467741 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccaaaagggaatgacactatttgggtgattgtggatagattgacgaag 20467840  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||    
T  20467841 tcggctca-ttcattccgattaatatcagttgtcctgtatctcagtt 20467886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 14999183 - 14999514
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  14999183 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 14999282  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  14999283 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 14999382  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14999383 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgatgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 14999482  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14999483 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 14999514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18776712 - 18776377
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||| ||| || ||||    
T  18776712 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaac 18776613  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |    
T  18776612 gagatgtggcacagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccgaa 18776513  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  18776512 atggatatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgaagaag 18776413  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18776412 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 18776377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 27684844 - 27685175
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  27684844 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 27684943  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  27684944 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtctaaaattgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 27685043  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27685044 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 27685143  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27685144 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 27685175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 21338741 - 21339042
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  21338741 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttcgtggtctgggttgaaac 21338840  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| |||    
T  21338841 gtgatgtggcacagttcgtgtattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctacggggatgatggtatctttagatgtgccaga 21338940  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21338941 ttggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcttaaagggaatgacgcaatttgggtgatcgttgatagattgacgaag 21339040  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  21339041 tc 21339042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23517468 - 23517133
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||   ||||||| |||| |||     
T  23517468 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaaaattttccagtggtcttgattgaaat 23517369  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||  |||||| || || |||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23517368 gcgatgtggcatagtttgtgtaatcctgtttagtttgtcagaagttgaagattgaacatcagaaacctgctggtacgatggtatctttagatgtgctaga 23517269  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23517268 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcaatttgggtgactgctgatagattgacgaag 23517169  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23517168 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttcct 23517133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23574675 - 23574350
Alignment:
Q  5 ttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcga 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||| ||    
T  23574675 ttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtga 23574576  T
Q  105 tgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtgg 204  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23574575 tgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtgg 23574476  T
Q  205 aaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||     ||||||||||||    
T  23574475 aaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacacaaattgggtgattgttga-----tgacgaagtcgg 23574381  T
Q  305 ctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23574380 ctcattttctaccgattaatattagttttcc 23574350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19770902 - 19770571
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  19770902 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 19770803  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  19770802 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 19770703  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19770702 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccaaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 19770603  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19770602 tcagctcattttctacctattaatattagttt 19770571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 37290940 - 37291271
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | || ||||    
T  37290940 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagccacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctagtttgaaac 37291039  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  37291040 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtctgtcagaagtagaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 37291139  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37291140 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaacactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 37291239  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37291240 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 37291271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41771784 - 41771453
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  41771784 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 41771685  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  41771684 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 41771585  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41771584 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 41771485  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  41771484 tcagctcattttctacctattagtattagttt 41771453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20800390 - 20800055
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  20800390 attcttgaagagagtcatagaagtaacctgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaac 20800291  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  20800290 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaggtcgaagattaaacattagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 20800191  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  20800190 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgcgtttaccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggttattattgatagattgacaaag 20800091  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20800090 tcggctcattttctaccgattaatattaggtttcct 20800055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 22332331 - 22332662
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| || ||||    
T  22332331 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaataagattttctggtggtctggtttgaaac 22332430  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||    
T  22332431 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgccagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccgga 22332530  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22332531 atggaagtgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 22332630  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22332631 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 22332662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22349365 - 22349034
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  22349365 attcttgaagagagtcacgggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 22349266  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22349265 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccaga 22349166  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  22349165 atggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaattagggttattgttgataggttgacgaag 22349066  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22349065 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 22349034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 27667934 - 27668265
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  27667934 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 27668033  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| | |    
T  27668034 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaaa 27668133  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27668134 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 27668233  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27668234 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 27668265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22135610 - 22135279
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  22135610 attctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 22135511  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | |||||||||||| |||    
T  22135510 gaggtgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaaaaacctactggagtgatggtacctttagatgtgccaga 22135411  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22135410 atggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaa 22135311  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22135310 tcggctcattttctaccgatcaatattagttt 22135279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27611296 - 27610965
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  27611296 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 27611197  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27611196 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 27611097  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  27611096 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacaaag 27610997  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27610996 tcagctcattttctacctattaatattagttt 27610965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23472171 - 23471825
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23472171 attcttgaagagatttatagaagtagcttaagtattcatccgggagctagaacgatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 23472072  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |  ||||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||  || |||||||| | | | |    
T  23472071 gttatgtggcatagttggtatattcctgtttgatatgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgataacacctttagatataccata 23471972  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  23471971 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgtgtaattgttgatagattgacgaag 23471872  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23471871 tcggctcattttattccgattaatatcagttttcctgtatctcagtt 23471825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16357444 - 16357113
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16357444 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16357345  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  16357344 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 16357245  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16357244 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 16357145  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16357144 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 16357113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27519349 - 27519018
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  27519349 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 27519250  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  27519249 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 27519150  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  27519149 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaag 27519050  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27519049 tcagctcattttctacctattaatattagttt 27519018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34567436 - 34567105
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  34567436 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 34567337  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  34567336 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 34567237  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34567236 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 34567137  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  34567136 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 34567105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40709722 - 40709394
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  40709722 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 40709623  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  40709622 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 40709523  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  40709522 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaag 40709423  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattag 329  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40709422 tcagctcattttctaccgattaatattag 40709394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 21563423 - 21563751
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21563423 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatg 21563522  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| | ||||| ||||| || || || || ||||| |||||||||| || |||  || || || | || |||||||  ||||||||    
T  21563523 ttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgccataaatctaaagttgaacatcagaaacttgttgggttgttgacaccattggatgtgccggagtggaa 21563622  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | || ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  21563623 atgggatagcatatccatggattttgtgacaagtttaccgaatactccaagagggcacgatgccatttgggtagttgttgatagattgacgaagtcggcg 21563722  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21563723 cattttattccgattaatattagttttcc 21563751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21408080 - 21407734
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || |    
T  21408080 attctagaacaaagtcacagaagtaatttgagtattcatgcaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaatttattttggtggtccgggttgaagc 21407981  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||| |||| || || || |||||||| | | |||    
T  21407980 gagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcaaaagttgaacaccagaaacctgttggtttgttgacacctttagatattccaga 21407881  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  || | ||| ||||||| ||||| |||| | | ||||||    
T  21407880 gtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactccaaaaggacattatgcgatttgggtaattgtggatacactaacgaag 21407781  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  21407780 tcggcccattttattccgattaacatcagttttcctgtatctcagtt 21407734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 21831211 - 21831539
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  21831211 gaagaaagtcacaaaagtagtttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaagcgtgatg 21831310  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||  || || || | ||||||||||  ||||| ||    
T  21831311 ttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcaaaaatctaaagttgaacatcagaagcctactgggttgttgacaccgttagatgtgccggagtgaaa 21831410  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  21831411 atgagatagcatatgcatggattttgtaacaagattaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgttgatagattgtcgaagtcggcg 21831510  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| |||| || ||||||||||||||    
T  21831511 cactttattccaatcaatattagttttcc 21831539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21881891 - 21881697
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  21881891 attcttgaatagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgagagctacgaagatgtatcataatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaac 21881792  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtg 195  Q
     |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21881791 acgatgtcgcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcaaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtg 21881697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 21890209 - 21890537
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||| || | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||    
T  21890209 gaagaaagccacaaaagtagctttagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacatgatg 21890308  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  || || || | |||||||||| |||||||||    
T  21890309 ttgctcagtttgtttatgcatgttcgacttgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgaagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaa 21890408  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| | |||| |||| ||  |||||||  ||||  |||| |||||||||||| |     
T  21890409 gtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttacaaaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtctataggttgacgaagtcgaca 21890508  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21890509 cactttattccgatcaatattagttttcc 21890537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 17268799 - 17269094
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| || |  ||||| |    
T  17268799 agtagcttgagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgtcgctcattttgtgt 17268898  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  || || || | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||    
T  17268899 atgcatgtttaacttgccagaagtctaaggttgaccatcagaaacctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttc 17268998  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  17268999 tatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttattcc 17269094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20822371 - 20822047
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    ||||    
T  20822371 gaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtccggattgaagaaggatg 20822272  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | ||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  20822271 tcgcacggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcgggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 20822172  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||  ||||  |  | |||||  | ||||| || ||||||||||||||     
T  20822171 atgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtagttgacaggttgacgaagtcggcg 20822072  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  20822071 cacttcattccgattaatataagtt 20822047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21496991 - 21496792
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  21496991 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacctgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 21496892  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||||||    
T  21496891 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaa 21496792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 14886435 - 14886765
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  14886435 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 14886534  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  14886535 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 14886634  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | |||||  |||| ||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  14886635 gtggaagtgggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatgatgccatttgggtagttgtcgaccggttgacgaag 14886734  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  14886735 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 14886765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22503603 - 22503273
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||| |||||| || || |||     
T  22503603 attcttgaggagagtcataagagtaggttgagtattcagcccggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttagtggtccggtttgaaaa 22503504  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || |||||    ||    
T  22503503 gagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttaatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgtcaccgttggatgtatcgga 22503404  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  22503403 gtggaagtgggacagtatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgaaagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 22503304  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  22503303 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 22503273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 24797841 - 24798171
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  24797841 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 24797940  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  24797941 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 24798040  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | |||||  |||| ||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  24798041 gtggaagtgggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatgatgccatttgggtagttgtcgaccggttgacgaag 24798140  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  24798141 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 24798171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 37542825 - 37543155
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||     
T  37542825 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtatgaaaa 37542924  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| | |||    
T  37542925 gggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccaga 37543024  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | ||||| |||    
T  37543025 gtggaagtgggacattatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacaaag 37543124  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  37543125 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 37543155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22462870 - 22462546
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||    | ||    
T  22462870 gaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagaaggctg 22462771  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| || || || | || || || | |||||||||    
T  22462770 tcgctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaggtaccagagtggaa 22462671  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||||||||  || || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||  || | |||||  | || || || ||||||||||||||     
T  22462670 atgggatatcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcg 22462571  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  22462570 cacttcattccgattaatatcagtt 22462546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Original strand, 28894412 - 28894716
Alignment:
Q  27 cttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattct 126  Q
    ||||||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||| || |||||||| ||| |     
T  28894412 cttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgca 28894511  T
Q  127 tgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatgg 226  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||| |||||||  || || ||| || || || | || ||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||    
T  28894512 tgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatgg 28894611  T
Q  227 attttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatat 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||  || | |||||  | |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  28894612 attttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatgattcgatatgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatat 28894711  T
Q  327 tagtt 331  Q
     ||||    
T  28894712 cagtt 28894716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Original strand, 28915883 - 28916187
Alignment:
Q  27 cttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattct 126  Q
    ||||||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||| || |||||||| ||| |     
T  28915883 cttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgca 28915982  T
Q  127 tgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatgg 226  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||| |||||||  || || ||| || || || | || ||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||    
T  28915983 tgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatgg 28916082  T
Q  227 attttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatat 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||  || | |||||  | |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  28916083 attttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatgattcgatatgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatat 28916182  T
Q  327 tagtt 331  Q
     ||||    
T  28916183 cagtt 28916187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Original strand, 28923238 - 28923542
Alignment:
Q  27 cttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattct 126  Q
    ||||||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||| || |||||||| ||| |     
T  28923238 cttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgca 28923337  T
Q  127 tgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatgg 226  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||| |||||||  || || ||| || || || | || ||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||    
T  28923338 tgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatgg 28923437  T
Q  227 attttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatat 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||  || | |||||  | |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  28923438 attttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatgattcgatatgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatat 28923537  T
Q  327 tagtt 331  Q
     ||||    
T  28923538 cagtt 28923542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 265 - 360
Target Start/End: Original strand, 21497745 - 21497840
Alignment:
Q  265 gacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  21497745 gacgcgatttgggtgatagttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 21497840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25848999 - 25848669
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||     
T  25848999 attcttgatgatagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaa 25848900  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  25848899 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgaattgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 25848800  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | || | |||||||  |||||||  |||| ||  | |||| ||||    
T  25848799 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagagcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgatgaag 25848700  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||| |||| || ||||| ||||    
T  25848699 tcggcacactttattcctatcaatatcagtt 25848669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 24749004 - 24749328
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| || |    
T  24749004 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacg 24749103  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | || || | ||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||  || || || | || ||||| || ||||||||    
T  24749104 ttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtactggagtggaa 24749203  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||||  | || ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||| | ||||||||||||||     
T  24749204 atgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaagtcggca 24749303  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    |||||  |||| || ||||||||||    
T  24749304 catttcattccaataaatattagtt 24749328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 21680228 - 21680437
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| || || || ||||    
T  21680228 gaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatg 21680327  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  21680328 ttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaa 21680427  T
Q  207 atgggatagt 216  Q
    ||||||||||    
T  21680428 atgggatagt 21680437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 24619745 - 24620069
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| || |    
T  24619745 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacg 24619844  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | || || | ||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  24619845 ttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 24619944  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||||  | || ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||| | ||||||||||||||     
T  24619945 atgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaagtcggca 24620044  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    |||||  |||| || ||||||||||    
T  24620045 catttcattccaataaatattagtt 24620069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 24715976 - 24716300
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| || |    
T  24715976 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacg 24716075  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | || || | ||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  24716076 ttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 24716175  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||||  | || ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||| | ||||||||||||||     
T  24716176 atgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaagtcggca 24716275  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    |||||  |||| || ||||||||||    
T  24716276 catttcattccaataaatattagtt 24716300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 22235385 - 22235694
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || || || || || || |  ||||| |    
T  22235385 agtagcttaagtattcatctgggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgt 22235484  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  || || || | || |||||||  |||||||| || ||||| || ||    
T  22235485 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgagatagcatttc 22235584  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  | | |||  | || || || |||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  22235585 tatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatattggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccgatt 22235684  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||||||||    
T  22235685 aatattagtt 22235694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 23079533 - 23079843
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||    
T  23079533 attcttgaagagagtcacaaaagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 23079632  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || || | |||||| ||| | || || | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  ||    
T  23079633 gcgacgtagctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccgga 23079732  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| | ||| | ||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  23079733 gtggaagtcggacaatatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 23079832  T
Q  301 tcggctcattt 311  Q
    ||||| |||||    
T  23079833 tcggcacattt 23079843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23504353 - 23504274
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23504353 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 23504274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20343206 - 20342929
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||||||||||||  |||||||||||||  | || |||     
T  20343206 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatataccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaaa 20343107  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || || || |  ||    
T  20343106 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggacgtaccgga 20343007  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggt 278  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||    
T  20343006 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggt 20342929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 27011995 - 27011916
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27011995 gtcatagaagtagttttagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggtctgga 27011916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20774641 - 20774432
Alignment:
Q  43 ggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaa 142  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||| || |||||||| ||| | ||||| | ||| || |    
T  20774641 ggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccaga 20774542  T
Q  143 agtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    |||| || ||||| |||||||  || || ||| || || || | || ||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  20774541 agtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgtcaagttt 20774442  T
Q  243 gccgaatact 252  Q
     || ||||||    
T  20774441 acctaatact 20774432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24582121 - 24582048
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  24582121 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 24582048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 21936645 - 21936724
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  21936645 gtcatagaagtagtttgagtattcacccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 21936724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Original strand, 25243822 - 25243886
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  25243822 tgagtattcatctaggagcgacgaagatgtatcaagatttaaagatgttgttttggcggcctgga 25243886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Original strand, 25307974 - 25308038
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  25307974 tgagtattcatctaggagcgacgaagatgtatcaagatttaaagatgttgttttggcggcctgga 25308038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 19566154 - 19566219
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  19566154 agtagtttgagtatttatcctagagcaacgaagatgtatcaagatcttaagaagttgttttggtgg 19566219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 737 - 378
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  737 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgattattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 638  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
     |||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  637 acgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacccgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 538  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  537 gtggaaatgggatagtatacccatgaattttgtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 438  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  437 tcggctcattttcttctgattaatatcagtcttcctgtttctcagttggcagagatttat 378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 181240 - 180905
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  181240 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaac 181141  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  181140 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagatcgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 181041  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  181040 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 180941  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  180940 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttcct 180905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Original strand, 100859 - 101150
Alignment:
Q  43 ggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaa 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || || || ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| |    
T  100859 ggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgatttgaagcgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgatttgtcaga 100958  T
Q  143 agtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  100959 agtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacaatatttctatggattttgtgacgagttt 101058  T
Q  243 gccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    ||| || ||||| | |||| |||| ||  |||||||  | || ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  101059 gccaaacactccaagagggcatgatgccatttgggtcgtggtagataggttgacgaagtcggcacattttatcccgataaatattagttttc 101150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9523348 - 9522989
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  9523348 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctagactcaaac 9523249  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||    
T  9523248 gtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatgataccattagatgtgccaga 9523149  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9523148 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacccgatttgggtaattgttgatagattgacgaag 9523049  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  9523048 tcggctcattttcttccgattaatatcagttttcctatttcttagttggcagagatttat 9522989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15248776 - 15248417
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15248776 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 15248677  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15248676 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaaaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtactaga 15248577  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15248576 gtggaaatgggacagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgtatactcctaaagggaataacgcgatttgggtgattgttgatagattgacaaag 15248477  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  15248476 tcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagttggcggaaatttat 15248417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16372041 - 16371709
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16372041 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctgg-ttgaaac 16371943  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16371942 gcgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 16371843  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371842 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgtgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 16371743  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16371742 tcagctcattttctaccgattaatattagttttc 16371709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17490479 - 17490133
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17490479 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaac 17490380  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || ||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  17490379 gcgacgttgcttagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 17490280  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17490279 gtggaaatgagatagcatatccatggattttgtgtcgagtttgccgaatactcttaaagggaatgacgcaatttgggtgattattgatagattgacgaag 17490180  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17490179 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagtt 17490133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15209520 - 15209161
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15209520 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggtgctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 15209421  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||    
T  15209420 gtgatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtaccaga 15209321  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15209320 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttggatgattgttgatagattgacaaag 15209221  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| | ||||||||||    
T  15209220 tcggcttatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtcttagttggcagaaatttat 15209161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Original strand, 16491697 - 16492028
Alignment:
Q  16 catagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggt 115  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||| || |||| ||    
T  16491697 cataaaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaatttgttttggtggtccagattgtaacgcgacgttgcacagt 16491796  T
Q  116 ttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatag 215  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  16491797 ttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggataa 16491896  T
Q  216 tatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16491897 tatatccatggattttgtgacgatttttccgcatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctt 16491996  T
Q  316 ccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16491997 ccgattaatattagttttcctgtttctcagtt 16492028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15339898 - 15339567
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  15339898 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 15339799  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  15339798 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 15339699  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15339698 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 15339599  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15339598 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 15339567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 15724435 - 15724766
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  15724435 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 15724534  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  15724535 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 15724634  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15724635 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 15724734  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15724735 tcggctcattttctaccgattattattagttt 15724766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 16806427 - 16806762
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16806427 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16806526  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16806527 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 16806626  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  16806627 atggaaatgggatagtatatccatggactttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacacaatttaggtaatcgttgatagattgacgaag 16806726  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16806727 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 16806762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12498877 - 12498542
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| |||     
T  12498877 attcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaat 12498778  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  12498777 gcgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattaaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccaga 12498678  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12498677 atggaaatgggatagtatatctatggattttgtgacgagttttccgaatactcctagagggaatgacacaatttgggttattgttgatagattgatgaag 12498578  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12498577 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 12498542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 26791900 - 26792231
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  26791900 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 26791999  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  26792000 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 26792099  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26792100 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 26792199  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    | |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  26792200 ttggctcattttataccaattaatattagttt 26792231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13253319 - 13252988
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  13253319 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 13253220  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  13253219 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 13253120  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  13253119 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaag 13253020  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13253019 tcagctcattttctaccgattaacattagttt 13252988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 14126095 - 14126426
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  14126095 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagcattcaaccgggagctacgaagatgtatcaagatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaac 14126194  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||| ||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14126195 gtgatgtgacacagtttgtgtattcccgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 14126294  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  14126295 atggaattgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgatgaag 14126394  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14126395 tcggctcattttctaccgtttaatattagttt 14126426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 16411783 - 16412114
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16411783 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16411882  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |    
T  16411883 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaaa 16411982  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16411983 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttttccaaatactcctagagggaacgatgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 16412082  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16412083 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 16412114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 14875999 - 14876335
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||| || ||||    
T  14875999 attcttgaaaagagttatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaattttctggtggtctggtttgaaac 14876098  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14876099 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttatcagaagttgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 14876198  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14876199 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcagaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 14876298  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaata-ttagttttcct 336  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14876299 ccggctcattttctaccgattaatatttagttttcct 14876335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 5424431 - 5424762
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  5424431 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 5424530  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  5424531 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 5424630  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5424631 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacaagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 5424730  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5424731 tcagctcattttctacctattaatattagttt 5424762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 15347746 - 15348077
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  15347746 attctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 15347845  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  15347846 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 15347945  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15347946 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 15348045  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15348046 tcagctcattttctacctattaatattagttt 15348077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16692793 - 16692458
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || || |||||| | || ||||||||||| || || |    
T  16692793 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcaggacttaaagaagattttctggtggtctggtttgaagc 16692694  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  16692693 gagatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatatgccaga 16692594  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  16692593 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagcctgccgaatactcctaaagggaatgacgtaatttgggtaatcgttggtagattgacgaag 16692494  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16692493 tcggctcatttcctaccgattaatattagttttcct 16692458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10906839 - 10906508
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  10906839 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 10906740  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  10906739 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 10906640  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10906639 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 10906540  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  10906539 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 10906508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 20061555 - 20061886
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  20061555 attcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 20061654  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  20061655 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 20061754  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20061755 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 20061854  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20061855 tcagctcattttctacctattaatattagttt 20061886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15062373 - 15062050
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  15062373 attcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaac 15062274  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
      |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      
T  15062273 ttgatgtggcatagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgcca-- 15062176  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
              |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15062175 ----------gatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 15062086  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15062085 tcagctcattttctaccgattaatattagttttcct 15062050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10006229 - 10005898
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  10006229 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 10006130  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | || |||    
T  10006129 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgcgccaga 10006030  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10006029 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 10005930  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  10005929 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 10005898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 15588893 - 15589224
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  15588893 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 15588992  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  15588993 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 15589092  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  15589093 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaag 15589192  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15589193 tcagctcattttctacctattaatattagttt 15589224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16636402 - 16636071
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16636402 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16636303  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  16636302 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 16636203  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16636202 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 16636103  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16636102 tcagctcatttcctgcctattaatattagttt 16636071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43163726 - 43163395
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  43163726 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 43163627  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  43163626 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 43163527  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43163526 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 43163427  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43163426 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 43163395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48426076 - 48425745
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  48426076 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 48425977  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| || || |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  48425976 gagatgtggcacagtttgtgtaatcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 48425877  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  48425876 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctaaagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaag 48425777  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  48425776 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 48425745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 15402018 - 15402338
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||| || ||||    
T  15402018 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaatattttctggtggtctggtttgaaac 15402117  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  15402118 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcgaaagt-------tgagcatcagaaacccgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 15402210  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15402211 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtatgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 15402310  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatatta 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15402311 tcggctcattttctaccgattaatatta 15402338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 16756086 - 16756417
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| ||||||| || ||||    
T  16756086 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagattttctgggggtctggtttgaaac 16756185  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||    
T  16756186 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcaggagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgctgga 16756285  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16756286 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 16756385  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16756386 tcagctcattttctacctattaatattagttt 16756417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6601365 - 6601034
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| | || ||||    
T  6601365 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttttggtggtctagtttgaaac 6601266  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
      |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||  ||    
T  6601265 aagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccgga 6601166  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6601165 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacaagttttccgaatactccgagagggagcgacacaatttgggttattgttgatagattgacgaag 6601066  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  6601065 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 6601034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 53384519 - 53384850
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  53384519 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 53384618  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||   ||    
T  53384619 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgtcgga 53384718  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || ||  ||||||| || |||||||||||||| |||    
T  53384719 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgatgcaatttgggttatagttgatagattgacaaag 53384818  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  53384819 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 53384850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 15015263 - 15015616
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | || || || ||||    
T  15015263 gaagaaattcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggttcaggttgaagcgagatg 15015362  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    ||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |  ||||||||    
T  15015363 tggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacaccagaaacctgttgggatgttgacatctttagatattcccgagtggaa 15015462  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||  |||| ||| ||||| | ||||| |||||| | |||||||| |||    
T  15015463 gtgggatagtatatccatggattttgtgaagagtttgtcgaatactccaaaaggacatgatgcgatttggataattgtggatagactaacgaagtcagct 15015562  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  15015563 catttggttccgattaatatcagttttcctgtatctcagttggcggaaatttat 15015616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14574562 - 14574258
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  14574562 attctagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaac 14574463  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || |||||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || |||| |||||||||| |||    
T  14574462 gagatgttgctcggtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcgttagatgtgccaga 14574363  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || |||||||||    
T  14574362 gtggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaag 14574263  T
Q  301 tcggc 305  Q
    |||||    
T  14574262 tcggc 14574258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15228282 - 15227955
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  15228282 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatg 15228183  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| | ||||| | |||||| || || || ||||| |||||||| | || |||  || || ||   ||||| || | |||  ||||    
T  15228182 ttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcttgttgggttgttgacactattagaagtaccagaaaggaa 15228083  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  | |||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  15228082 atgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatatgggtagttgttgatagattgacgaagtcagca 15227983  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  15227982 cactttattccgattaatattagttttc 15227955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 331
Target Start/End: Original strand, 16827713 - 16828022
Alignment:
Q  21 aagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgta 120  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || | ||||||     
T  16827713 aagtagcttaagtattcatcagggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtt 16827812  T
Q  121 tattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatat 220  Q
    ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| ||||||||| ||||| |  || |    
T  16827813 tatgcatgtttgacttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacattt 16827912  T
Q  221 ccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgat 320  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  | |||| |||| ||  |||||||   ||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16827913 ccatggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatgatgccatttgggt-tgtgtggataggttgacgaagtcggcacactttattccgat 16828011  T
Q  321 taatattagtt 331  Q
     ||||||||||    
T  16828012 caatattagtt 16828022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14087306 - 14086978
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| || || || ||||    
T  14087306 gaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatg 14087207  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  14087206 ttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaa 14087107  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||  ||||  |  | |||||  | || ||||||||||||||||||||     
T  14087106 atgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcg 14087007  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  14087006 cactttattccgataaatatcagttttcc 14086978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4679068 - 4678761
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  4679068 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 4678969  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||||||    
T  4678968 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatg 4678869  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  4678868 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtggtggttgataggttgacgaagtcggcacat 4678769  T
Q  310 tttcttcc 317  Q
    ||| ||||    
T  4678768 tttattcc 4678761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13942654 - 13942347
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  13942654 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 13942555  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  || || ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  || || |||| || ||||| |  |||||||||||    
T  13942554 ctcatttcgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacatcattggatgtaccggagtggaaatg 13942455  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  13942454 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacat 13942355  T
Q  310 tttcttcc 317  Q
    ||| ||||    
T  13942354 tttattcc 13942347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44777877 - 44777570
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  44777877 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 44777778  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||  || || || | || ||||| | ||||||||||||    
T  44777777 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcccgcaggattgttgacaccattggatgtaccagagtggaaatg 44777678  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  ||||  || |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  44777677 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaagggacatgattcgatttgggtggtggttgataggttgacgaagtcggcacat 44777578  T
Q  310 tttcttcc 317  Q
    ||| ||||    
T  44777577 tttattcc 44777570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 8758581 - 8758902
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  8758581 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 8758680  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||||||    
T  8758681 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatg 8758780  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  8758781 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacat 8758880  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||| |||| || || |||||||    
T  8758881 tttattcctatcaacattagtt 8758902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41178152 - 41177831
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  41178152 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 41178053  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||||||    
T  41178052 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatg 41177953  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  41177952 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacat 41177853  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||| |||| || || |||||||    
T  41177852 tttattcctatcaacattagtt 41177831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Original strand, 10419541 - 10419785
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    ||||    
T  10419541 gaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctagattgaagaaggatg 10419640  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||| | |  ||||||||    
T  10419641 tcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcgggattgttgacaccgttggatataccggagtggaa 10419740  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatac 251  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  10419741 atgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacccaatac 10419785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 13971616 - 13971944
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||    
T  13971616 gaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatg 13971715  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||| | |  ||||||||    
T  13971716 ttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccggagtggaa 13971815  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||  ||||  |  | |||||  | || ||||||||||||||||||||     
T  13971816 atgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcg 13971915  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  13971916 cactttattccgataaatatcagttttcc 13971944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47124583 - 47124253
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||     
T  47124583 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaa 47124484  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  47124483 gggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 47124384  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |   || |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  47124383 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacaagtttaccgaacactccgaggaggcatgacgctatttgggtagttgtcgaccggttgacgaag 47124284  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  47124283 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 47124253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 16836021 - 16836241
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| |    
T  16836021 agtagcttgagtattcatcccggagctacgaagatgtatcatgagttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgt 16836120  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  16836121 atgcgtgcttcacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggatagcatttc 16836220  T
Q  222 catggattttgtgacaagttt 242  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  16836221 tatggattttgtgacgagttt 16836241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10384607 - 10384303
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||     
T  10384607 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaa 10384508  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  10384507 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 10384408  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  10384407 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 10384308  T
Q  301 tcggc 305  Q
    |||||    
T  10384307 tcggc 10384303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17493248 - 17492944
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || |  ||| | |    
T  17493248 agtagcttaagtattcattctggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttttgt 17493149  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| | ||||| ||| |||||||| || ||    
T  17493148 atgcatgtttgacttgtcagaaatctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccagagttgaagtgggatagcatttc 17493049  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  17493048 tatggattttgtgacgagtttaccgaacactccaagagggcatgatgccatatgggttattgtcgatagattgacgaagtcggcgcattttattccaatt 17492949  T
Q  322 aatat 326  Q
    |||||    
T  17492948 aatat 17492944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28754957 - 28754627
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  28754957 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 28754858  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  28754857 gggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 28754758  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || || | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  28754757 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacaccccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 28754658  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  28754657 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 28754627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 18133842 - 18134166
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || |    
T  18133842 gaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacg 18133941  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||  || || || | || |||||||  ||||||||    
T  18133942 tcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacattagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaa 18134041  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | || || || |||||||| |||||     
T  18134042 gtgggatagcatttcaatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaattcggcg 18134141  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||    
T  18134142 cactttattccgattaatatcagtt 18134166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 11303284 - 11303593
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||| | ||||| || | |||||| |    
T  11303284 agtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccgggttgaaatgtgatgttgctcagtttgtgt 11303383  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||  || || || | || |||||||  |||||||| ||||| |  || ||    
T  11303384 atgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcttgtagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttc 11303483  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  | || || || |||||||||||||| || ||| |||||||     
T  11303484 tatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtcgtcgtcgacaggttgacgaagtcggcacactttattccgatc 11303583  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||||||||    
T  11303584 aatattagtt 11303593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 14580443 - 14580535
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14580443 attcttgaggagagtcacagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtatgga 14580535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 170
Target Start/End: Original strand, 31694697 - 31694845
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| || || || |  ||||| |    
T  31694697 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaagaagttgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtcgctcattttgtgt 31694796  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  31694797 atgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 31694845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 11564427 - 11564541
Alignment:
Q  246 gaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcag 345  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | || | |||    
T  11564427 gaatactcctagagagaatgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgatcaatatgagttttcatgttgcccag 11564526  T
Q  346 ttagtagaaatttat 360  Q
    |||| ||| ||||||    
T  11564527 ttagcagagatttat 11564541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 16338002 - 16338332
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| |||||||| || |  || ||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || || ||||    
T  16338002 attcttgaggagagtcataagagtaggttgagtattcacctgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 16338101  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| ||||||| | |||| | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||  || |  || | || ||||| |  ||    
T  16338102 gagatgttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgttagaagtctaaagttgagcatcagaagcctgcagggttgttcacaccgttggatgtaccgga 16338201  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  16338202 gtggaagtgggacaatatctctatggatttcgtgacgagtttaccgaacactccaagagggcatgacgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 16338301  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  16338302 tcggcacacttcattcctattaatatcagtt 16338332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 11960659 - 11960900
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||    ||||| |||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||    
T  11960659 attcttgaagagagtcacgatagtagtttgagtattcacccaggggctataaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 11960758  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  11960759 gagatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccgga 11960858  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  11960859 gtggaaatgagacagtatttctatggattttgtgacgagttt 11960900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 254
Target Start/End: Original strand, 12360053 - 12360285
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || |  ||||| |    
T  12360053 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgt 12360152  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| |||||  |||||||  || |||| ||||| ||  || || ||   || |||||||  |||||||| |||||||  || ||    
T  12360153 atgcatgtttgacttgtcagaagtctcaggttgaatattagaagcctgcagggttgttgacacagttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttc 12360252  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12360253 tatggattttgtgacgagtttaccgaacactcc 12360285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 16380439 - 16380734
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  || || ||  | ||||| || |  ||||| |    
T  16380439 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtacgggttgaattgagatgtcgctcattttgtgt 16380538  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | || || | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  || || |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||    
T  16380539 atgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcaggattgttgacgccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttc 16380638  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
     |||||||| |||||||| || || || ||||| | |||  ||||  |  |||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  16380639 tatggatttcgtgacaagcttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggttgatagattgtcaaagtcggcacattttattcc 16380734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31939520 - 31939379
Alignment:
Q  23 gtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtata 122  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |  ||||| ||    
T  31939520 gtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtcgctcattttgtgta 31939421  T
Q  123 ttcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaa 164  Q
    | | ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31939420 tgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaa 31939379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 8273913 - 8273992
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  8273913 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 8273992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 13966854 - 13966933
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  13966854 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 13966933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 30138432 - 30138353
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  30138432 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 30138353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 30147983 - 30147904
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  30147983 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 30147904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 16742217 - 16742290
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  16742217 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtgg 16742290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 16329150 - 16329310
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||     
T  16329150 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggggtctacaaagatgtaccatgatctgaagaaattattttggtggtccggtttgaaaa 16329249  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatca 161  Q
    | ||||| || | |||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16329250 gagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttgatttgtcaaaagtccaaggttgagcatca 16329310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16257770 - 16257691
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  16257770 gtcatataagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 16257691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Original strand, 13320013 - 13320083
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 92  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13320013 agtagattgagtattcacccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtctgg 13320083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17193705 - 17193501
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttg 128  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||| | ||    ||  | |||  |||||| ||| ||||    
T  17193705 tgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcagaatttgaagaggttgttttggtggcttggaatgaacaaggaaattgcagagtttgtttatgcttg 17193606  T
Q  129 tttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggat 228  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | ||| |||||  |   ||   ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  17193605 tttgatttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaaccatcgggtttgatgcaaatgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagtatctctatggat 17193506  T
Q  229 tttgt 233  Q
    |||||    
T  17193505 tttgt 17193501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15610729 - 15610662
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttt 81  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  15610729 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttt 15610662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18749291 - 18749212
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  18749291 gtcatagaagtagtttgagtattcatctaggagtgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttagtggcctgga 18749212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12792767 - 12792710
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaa 71  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12792767 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaa 12792710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 6152366 - 6152444
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6152366 gtcataggagtagtttg-gtattcatccaggagaaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 6152444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 6711916 - 6712002
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||| |||| || |||||  ||||||| |||||| || | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6711916 gaagaaggtcacaggagtagtctgagtattcatccaagaacaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 6712002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 317
Target Start/End: Original strand, 6712183 - 6712226
Alignment:
Q  274 tgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6712183 tgggtgattgttgatcggttgacgaagtcggcacattttcttcc 6712226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Original strand, 15952677 - 15952784
Alignment:
Q  220 tccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccga 319  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||| |||| || ||  ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  15952677 tccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgacaggctgacgaagtcggcacactttattccga 15952776  T
Q  320 ttaatatt 327  Q
    | ||||||    
T  15952777 tcaatatt 15952784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 21890520 - 21890879
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21890520 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaagc 21890619  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  21890620 gcgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgaacattagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 21890719  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890720 gtggaaaagggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaataatcctaaagggaatgatgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 21890819  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  21890820 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 21890879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 23107532 - 23107878
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||| |||||| || |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||| |||||||||| ||||    
T  23107532 attcctgaagagagccatagaagtaacttgagtattaatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggcggtctggattgaaac 23107631  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23107632 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 23107731  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23107732 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactcctaaaggaaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 23107831  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23107832 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgttcctcagtt 23107878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24676130 - 24675795
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  24676130 attcttgaagagagtcatagaagtagcctgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaac 24676031  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24676030 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtctaaagtcgaagattgagcattagaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 24675931  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675930 gtggaaatggaatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 24675831  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24675830 tcggcccattttctaccgattaatatcagttttcct 24675795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21325068 - 21325403
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  21325068 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaac 21325167  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| ||||  || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21325168 gtgatgttgcacaattcgtatattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 21325267  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21325268 gtggaaatgggatagtatatccatggatttcgtgacgagttttccgaatactcctagaggatatgacgagatttgggtgattgttgacagattgacgaag 21325367  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21325368 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 21325403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 22756267 - 22756602
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  22756267 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaac 22756366  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22756367 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtaagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctagtatgatggtatctttagatgtgccaga 22756466  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22756467 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgcgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgacttgggtgatttttgatagattgacaaag 22756566  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22756567 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttcct 22756602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24263011 - 24262680
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  24263011 attcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 24262912  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  24262911 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 24262812  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24262811 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 24262712  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24262711 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 24262680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 21144843 - 21145174
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  21144843 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 21144942  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  21144943 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 21145042  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  21145043 atggaaatgggatagtatatcgatggatttcgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaa 21145142  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21145143 tcggctcattttctaccgatcaatattagttt 21145174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 22324658 - 22325017
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  22324658 attcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 22324757  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  22324758 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 22324857  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22324858 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 22324957  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||| | ||| ||||||    
T  22324958 tcagctcattttctacctattaatattagtttccctattgcccagttggcagagatttat 22325017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 41608187 - 41608518
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  41608187 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 41608286  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  41608287 gagatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 41608386  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41608387 atgaaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 41608486  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41608487 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 41608518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 332
Target Start/End: Original strand, 24707285 - 24707615
Alignment:
Q  2 ttcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacg 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  24707285 ttcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtccggattgaaacg 24707384  T
Q  102 cgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagag 201  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |     
T  24707385 cgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacattagaaacctgctggtacgatggtatctttagatgtgccataa 24707484  T
Q  202 tggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  24707485 tggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgacagattgacgaagt 24707584  T
Q  302 cggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24707585 cggctcattttctagcgattaatattagttt 24707615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27371910 - 27371576
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  27371910 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 27371811  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  27371810 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 27371711  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27371710 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 27371611  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    ||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27371610 tcaactcattttctacctattaatattagttttcc 27371576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9610777 - 9610446
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  9610777 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 9610678  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  9610677 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 9610578  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9610577 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 9610478  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  9610477 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 9610446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10869491 - 10869160
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  10869491 attcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 10869392  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  10869391 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 10869292  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10869291 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgagtactccgagagggagcgacgcgatttgggttattgttgataggttgacgaag 10869192  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10869191 tcagctcattttctacctattaatattagttt 10869160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16923530 - 16923199
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16923530 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16923431  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  16923430 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 16923331  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  16923330 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaag 16923231  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16923230 tcagctcattttctacctattaatattagttt 16923199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16982793 - 16982462
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16982793 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16982694  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  16982693 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 16982594  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  16982593 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaag 16982494  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16982493 tcagctcattttctacctattaatattagttt 16982462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17064358 - 17064027
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  17064358 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 17064259  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  17064258 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 17064159  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  17064158 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaag 17064059  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17064058 tcagctcattttctacctattaatattagttt 17064027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17068016 - 17067685
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  17068016 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 17067917  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  17067916 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 17067817  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  17067816 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaag 17067717  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17067716 tcagctcattttctacctattaatattagttt 17067685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27218657 - 27218326
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  27218657 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttaaaac 27218558  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | |||| |||    
T  27218557 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttacacgtgccaga 27218458  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27218457 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 27218358  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  27218357 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 27218326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16926001 - 16925670
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16926001 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16925902  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  16925901 gagatgtagcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 16925802  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16925801 atggaaatgggatagtataacgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 16925702  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16925701 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 16925670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16999641 - 16999310
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  16999641 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 16999542  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  16999541 gagatgtagcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 16999442  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16999441 atggaaatgggatagtataacgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 16999342  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16999341 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 16999310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 346
Target Start/End: Original strand, 24819490 - 24819833
Alignment:
Q  3 tcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgc 102  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | || ||| |     
T  24819490 tcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagt 24819589  T
Q  103 gatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagt 202  Q
     |||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||| |||||    
T  24819590 aatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagt 24819689  T
Q  203 ggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtc 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  24819690 ggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaagggaatgacactattggggtgattgttcatatattgacgaactc 24819789  T
Q  303 ggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagt 346  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24819790 ggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatctcagt 24819833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 24876551 - 24876882
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| ||| || ||||    
T  24876551 attcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaac 24876650  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| |||    
T  24876651 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccaga 24876750  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||     
T  24876751 atggaaatgggatagtatatcgatggatttcgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttgttgttgatagattgacgaaa 24876850  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24876851 tcggctcatttcctaccgatcaatattagttt 24876882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24710675 - 24710343
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  24710675 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 24710576  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  24710575 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 24710476  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagat-tgacgaa 299  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| |||||  |  | | |||||||    
T  24710475 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgtgtaggggtgtgacgaa 24710376  T
Q  300 gtcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24710375 gtcagctcattttctacctattaatattagttt 24710343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 44385371 - 44385702
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  44385371 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 44385470  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  44385471 gagatgtggcatagtttatgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgggcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 44385570  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||  ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44385571 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagatggagcgacacaatttgggtgattgttgataggttgacgaag 44385670  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44385671 tcagctcattttctacctattaatattagttt 44385702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 45530152 - 45529793
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |    
T  45530152 attctagaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagc 45530053  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  || || || |||||||||| |||||    
T  45530052 gagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacacctttagatgttctaga 45529953  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  45529952 gtggaagtgggatagtatgtccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaaggacatgatgcgatttgggtaattgtggatagactgacgaag 45529853  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||    
T  45529852 tcggctcattttattctaattaacatcagttttcctgtgtctcagttgatagagatttat 45529793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23067032 - 23066797
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23067032 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 23066933  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||| | |||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  23066932 gcgatattgcacagtttgtgtattattgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctactggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 23066833  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgac 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23066832 gtgaaaatgggatagtatatccatggattttgtgac 23066797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 30210719 - 30211065
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |    
T  30210719 attctagaagaaagtcacaaaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttg-tttggtggtccgggttgaagc 30210817  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  || || ||  ||||||| | | |||    
T  30210818 gagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacacatttagatattccaga 30210917  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcg-gtttgggtgattgttgatagattgacgaa 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| | |  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30210918 gtggatatgggatagtatatccatagattttgtgtcgagtttgccgaatactccaaaaggacatgatgtgattttgggtaattgtggatagattgacgaa 30211017  T
Q  300 gtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||| || ||||| |||| ||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  30211018 gtcgactaattttattccaattaacatcagttttcctgtatctcagtt 30211065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23111368 - 23111042
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttga-gtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtg 108  Q
    |||||||| | ||||||||| | |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||  | |||||     
T  23111368 gaaagtcacataagtagctttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggatttaagtgtgatgtt 23111269  T
Q  109 gcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaat 208  Q
    |||| |||||||||| | | ||| | ||| || || || || ||||| |||||||| ||||||||  || || || | |||||||||| |||||||||||    
T  23111268 gcacagtttgtatatgcatatttgacttgccagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaat 23111169  T
Q  209 gggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctca 308  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||||||||||||||  || ||    
T  23111168 gggataacatatccatggattttgtaacaagtttacccaatactccaagagggcatgatgctatttgggtagttgtcgatagattgacgaagttagcgca 23111069  T
Q  309 ttttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||    
T  23111068 ttttatcccgattaatattagttttcc 23111042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 232 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23064487 - 23064375
Alignment:
Q  232 gtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064487 gtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 23064388  T
Q  332 ttcctatttctca 344  Q
    ||||| |||||||    
T  23064387 ttcctgtttctca 23064375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 11357676 - 11358001
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  11357676 attcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 11357775  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||| | |||||||| |  ||    
T  11357776 gggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttggcaccgttagatgtaccgga 11357875  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  11357876 gtggaagtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggtagttgtcgaccggttgacgaag 11357975  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatat 326  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||    
T  11357976 tcggcacatttcattcctattaatat 11358001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 27364887 - 27365215
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||    
T  27364887 gaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatg 27364986  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||| | |  ||||||||    
T  27364987 ttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccggagtggaa 27365086  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||  ||||  |  | |||||  | || ||||||||||||||||||||     
T  27365087 atgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcg 27365186  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  27365187 cactttattccgataaatatcagttttcc 27365215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27788373 - 27788052
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  27788373 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 27788274  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||||||    
T  27788273 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatg 27788174  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  27788173 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtcgtggttgataggttgacgaagtcggcacat 27788074  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||| |||| || || |||||||    
T  27788073 tttattcctatcaacattagtt 27788052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12574985 - 12574664
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  12574985 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaagagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 12574886  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||||||    
T  12574885 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatg 12574786  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  12574785 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtagtggttgataggttgacgaagtcggcacat 12574686  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||| |||| || || |||||||    
T  12574685 tttattcctatcaacattagtt 12574664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31831299 - 31830969
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||     
T  31831299 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtatgaaaa 31831200  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  31831199 gagatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 31831100  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  31831099 gtggaagtgggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 31831000  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  31830999 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 31830969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 19651860 - 19652184
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || || || || ||||    
T  19651860 gaagaaagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgatttggtggtccggtttgaagcgtgatg 19651959  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||| ||  || || || | || |||||||  ||||||||    
T  19651960 ttgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaacgttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaa 19652059  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| | |||| |||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||||||     
T  19652060 gtgggacagtatttctatggatttagtgacaagtataccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttattgtagacaggttgacgaagtcggca 19652159  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  19652160 cacttcattccgattaatatcagtt 19652184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20828900 - 20828570
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||     
T  20828900 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaa 20828801  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  20828800 gggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 20828701  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |  ||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  20828700 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 20828601  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  20828600 tcggcacacttcattcctattaatatcagtt 20828570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20833626 - 20833296
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||     
T  20833626 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaa 20833527  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  20833526 gggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 20833427  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |  ||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  20833426 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 20833327  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  20833326 tcggcacacttcattcctattaatatcagtt 20833296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1064392 - 1064088
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  1064392 attcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 1064293  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  1064292 gggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 1064193  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  1064192 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 1064093  T
Q  301 tcggc 305  Q
    |||||    
T  1064092 tcggc 1064088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Original strand, 27209980 - 27210227
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||    
T  27209980 gaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatg 27210079  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || || ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  27210080 tcgctcgttttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 27210179  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
    ||||||||| || |  ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  27210180 atgggatagcatttatatggattttgtgataagtttacctaatactcc 27210227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Original strand, 21125003 - 21125295
Alignment:
Q  43 ggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaa 142  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  ||||| ||| | |||||   |||||| |    
T  21125003 ggagctacagagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatcttgctcaatttgtttatgcatgtttggcttgtcaga 21125102  T
Q  143 agtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || | ||  || || || | |||||||||| ||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |||||    
T  21125103 agtctaaggttgagcatcacaagtctacagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagttt 21125202  T
Q  243 gccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
     ||||||||||| | |||  |||  ||  |||||||  || | ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21125203 accgaatactccgagaggacatggtgccatttgggttgttttcgataggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttcc 21125295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23277396 - 23277087
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || || |  || || || |  |||||||    
T  23277396 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcatgacgtcgctcaatttgtat 23277297  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | || || | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || ||   ||||||||||  || ||||| |||||||| || ||    
T  23277296 atgcgtgcttgagttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacactgttagatgtgccggaatggaagtgggatagcatttc 23277197  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | || || || |||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  23277196 tatggattttgtgacgattttaccgaacactccaagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccgatt 23277097  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  23277096 aatatcagtt 23277087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24642287 - 24642053
Alignment:
Q  97 aaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgc 196  Q
    ||||| ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||| | || |||||||    
T  24642287 aaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttggcaccgttggatgtgc 24642188  T
Q  197 tagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgac 296  Q
      |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||| |||| || || |||||    
T  24642187 cggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgacaggttgac 24642088  T
Q  297 gaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||    
T  24642087 gaagtcggcacactttattccaattaatatcagtt 24642053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24949209 - 24948900
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || || || || || || |  ||||| |    
T  24949209 agtagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgttgctcattttgtgt 24949110  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | || ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || ||  ||| || |||||||  |||| |||||||||||| || ||    
T  24949109 atgcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgatatcgttggatgtgccggagttgaaatgggataggatttc 24949010  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | || || || |||| ||||| ||| || ||| ||||||||    
T  24949009 tatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgatgaagttggcgcactttattccgatt 24948910  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  24948909 aatatcagtt 24948900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 12640048 - 12640127
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12640048 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 12640127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23294576 - 23294335
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||      
T  23294576 attctagaggaaagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagcaacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagt 23294477  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | || || || |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  ||    
T  23294476 gtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccgga 23294377  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  23294376 gtgaaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 23294335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22276902 - 22276833
Alignment:
Q  18 tagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22276902 tagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtgg 22276833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 23816858 - 23816937
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  23816858 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcagtatttgaagaggttgttttagtggcctgga 23816937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 24569483 - 24569562
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24569483 gtcatagaagtagtttaagtattcatctaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 24569562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 24831003 - 24831081
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  24831003 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatca-gatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 24831081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Original strand, 22761386 - 22761463
Alignment:
Q  16 catagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22761386 catagaagtagtctaagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 22761463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Original strand, 21906001 - 21906055
Alignment:
Q  31 agtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggt 85  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  21906001 agtattcatccaggagcgacgaagatgtatcaggatttaaagaggttgttttggt 21906055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22276648 - 22276597
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaa 323  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  22276648 tttgggtgattgttgatcggttgacgaagtcggcacattttgttcctattaa 22276597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 24569741 - 24569786
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  24569741 tttgggtgattgttgatcggttgacgaagtcggcgcattttgttcc 24569786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7090 - 6744
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||     
T  7090 attcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttgttttggtggtccggattgaaat 6991  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || |||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||    
T  6990 gcgacgttgcacagtttgtgtattcttgcttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgcctga 6891  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6890 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 6791  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6790 tcggcttattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagtt 6744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7055 - 6724
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  7055 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaac 6956  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6955 gcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcataagtcgaaggttgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 6856  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6855 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgtcgattactcctatagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 6756  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6755 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 6724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 8352 - 8711
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  8352 attcttgaagagaatcatagaagtggcttaagtatccatccgggagctacgcagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaac 8451  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||    
T  8452 gtgatgtggcacagttcgtgtattcatgtttgatttgttagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcgggaatgatggtatctttagatgtaccaga 8551  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8552 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgattttggtgattgttgatagattgacgaag 8651  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  8652 tcggctcattttattccgattaatatcagttttcctgtttctcagttggtagagatttat 8711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7091438 - 7091096
Alignment:
Q  5 ttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcga 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7091438 ttgaagagagccatagaagtaacttaagtatttatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaggttgttttggtggtctggattgaaacgtga 7091339  T
Q  105 tgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtgg 204  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  7091338 tgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttatcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtgg 7091239  T
Q  205 aaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7091238 aaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgtcgaatactcctaaagggaatgacgcgattagggtgattgttgatagattgacgaagtcgg 7091139  T
Q  305 ctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7091138 ctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagtt 7091096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14160480 - 14160121
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14160480 attcttgaagagagccatcggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 14160381  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | | |||    
T  14160380 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtgtctttagatataccaga 14160281  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||| |||    
T  14160280 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgattttgccgaatactcctaaagggaatgacacgatttgggtgattgtctatagactgactaag 14160181  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  14160180 tcggctcatttccttccaattaatattagttttcctgtgtctcagttggcagaaatttat 14160121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 14302980 - 14303311
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  14302980 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 14303079  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  14303080 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 14303179  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14303180 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 14303279  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14303280 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 14303311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 18226448 - 18226783
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  18226448 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacaatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 18226547  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18226548 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 18226647  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18226648 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 18226747  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18226748 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttcct 18226783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 1639427 - 1639761
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1639427 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgagagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaac 1639526  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||   ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | | |||    
T  1639527 gtgatgttgcatattttgtgtattcttgtttggtttgtcaaaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatataccaga 1639626  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1639627 gtggaagtgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtcgatagattgacgaag 1639726  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1639727 acggctcattttcttccgattaatatcagttttcc 1639761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 15146887 - 15147224
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| ||||||||| |||     
T  15146887 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtcgtctggattgaaat 15146986  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| | |||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15146987 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctatttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctagtatgatggtatctttagatgtgccaga 15147086  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15147087 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgtcgaatactcctagagggaatgacgcgatttgggtgatagttgatagattgacgaag 15147186  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatt 339  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  15147187 tcggctcattttc-tacgattaatatcagttttcctatt 15147224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12524686 - 12524328
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  12524686 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccggaagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 12524587  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||    
T  12524586 gagatgtggcacggtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaaagatggtacctttagatgtgccaga 12524487  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12524486 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 12524387  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaattta 359  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||    
T  12524386 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttagcagagattta 12524328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 16354447 - 16354782
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||||| ||||    
T  16354447 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttctggtggtctggattgaaac 16354546  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  16354547 gagatgtggcacagtttgtgtattcctatttagtttgtcacaagtcgaagattgaacatcagaaacctgcttgtatgatggtatcgttagatgtgccaga 16354646  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16354647 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcatggagggaatgacacaatttgggttattgttgatagattgacgaag 16354746  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16354747 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 16354782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 14850368 - 14850714
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14850368 attcttgaagagattcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 14850467  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||| | |||    
T  14850468 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccaga 14850567  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14850568 gtggaaatgggataacatatccatgtattttgtgatgagttttccgaatactcagaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtagatagattgacgaag 14850667  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14850668 tcggctcatttcattccgattaatatgagttttcctgtttctcagtt 14850714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40474050 - 40473719
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  40474050 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 40473951  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  40473950 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 40473851  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40473850 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgatgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 40473751  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40473750 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 40473719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 8052625 - 8052984
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  8052625 attcttgaagagattcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 8052724  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  8052725 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 8052824  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||    
T  8052825 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgacaggttgacgaag 8052924  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| || | ||||||| ||| ||||||    
T  8052925 tcagctcattttctacctattaatattagtttccctgttgcccagttagcagagatttat 8052984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8387422 - 8387091
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  8387422 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 8387323  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  8387322 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 8387223  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8387222 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 8387123  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8387122 tcagctcattttctacctattaatattagttt 8387091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14681577 - 14681246
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| |||| || ||||    
T  14681577 attcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaac 14681478  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  14681477 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 14681378  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14681377 atggaaaagggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 14681278  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14681277 tcggctcattttctaccgatcaatattagttt 14681246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 19777795 - 19778126
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  19777795 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 19777894  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  19777895 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 19777994  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19777995 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 19778094  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19778095 tcagctcattttctacctattaatattagttt 19778126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23956757 - 23956426
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  23956757 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 23956658  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  23956657 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 23956558  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23956557 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 23956458  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    ||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  23956457 tcaactcattttctacctattaatattagttt 23956426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12477610 - 12477279
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  12477610 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 12477511  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  12477510 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 12477411  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12477410 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 12477311  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  12477310 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 12477279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 29038406 - 29038737
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  29038406 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 29038505  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  29038506 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 29038605  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29038606 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 29038705  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  29038706 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 29038737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27712346 - 27712015
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  27712346 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 27712247  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  27712246 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctactaggatgatggtacctttagacgtgccaga 27712147  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27712146 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacacaatttgggttattgttgataggttgacgaag 27712047  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27712046 tcagctcattttctacctattaatattagttt 27712015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18298215 - 18297884
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  18298215 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 18298116  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  18298115 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcggaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 18298016  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18298015 atggaaatgggatagtatatccatgaattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 18297916  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  18297915 tcagctcatttcctacctattaatattagttt 18297884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8706922 - 8706594
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8706922 gaagaaagtcacaaaagtaacttaagtattcatccgagagctacaaagatgtatcatgacttaaagaaattgttttggtggtctggattgaaacgtgatg 8706823  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  || || || | ||||||||||  ||||||||    
T  8706822 ttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaa 8706723  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  8706722 atgagatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggtggttgttgatagattgacgaagtcggcg 8706623  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| |||| || ||||||||||||||    
T  8706622 cactttattccaatcaatattagttttcc 8706594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14691810 - 14691577
Alignment:
Q  103 gatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagt 202  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||| || | |||||||| | |||||    
T  14691810 gatgtggcacagttggtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtaccagagt 14691711  T
Q  203 ggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtc 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14691710 ggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatacttcgaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtagatggattgacgaagtc 14691611  T
Q  303 ggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||  || ||| |||||| |||||||||    
T  14691610 ggctcatttcatttcgagtaatatcagttttcct 14691577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15078645 - 15078311
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  ||||| ||||    
T  15078645 attctggaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggttcggattgaaac 15078546  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | ||| || | |||||||||| |||    
T  15078545 gtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttaatgacaccattagatgtgccaga 15078446  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| | |||| ||||  |  |||||||  ||||||| || |||| ||||    
T  15078445 gtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttatcgaatactccgagagggcatgataccatttgggttgttgttgaaaggttgatgaag 15078346  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15078345 tcggcgcattttattccgatcaatattagttttcc 15078311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 15414294 - 15414620
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  15414294 gaagaaagtcacagaagtagtttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggttttaaacgtgatg 15414393  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| | ||||| | |||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  || ||  | | |||||||||| |||||||||    
T  15414394 ttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgctgaaaccattagatgtgccagagtggaa 15414493  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| | | |||| |||| ||  | ||| || ||||||||||||| |||||||| ||     
T  15414494 atgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttactgaatacttcgagagggcatgatgccatatggctggttgttgatagattaacgaagtcagca 15414593  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtttt 333  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||    
T  15414594 cactttattccgattaatattagtttt 15414620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 16251598 - 16251782
Alignment:
Q  152 ttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatac 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16251598 ttgagcatcaaaaacctgctggtatgatggtatctctagatgtgccagaatggaaatgggatagtatattcatggattttgtgacgagtttgccgaatac 16251697  T
Q  252 tcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||  ||||| || ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16251698 tcctagggggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 16251782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 15002626 - 15002956
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  15002626 attctagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaac 15002725  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   || || || | |||||||||| |||    
T  15002726 gtgatgttgctcattttgtctatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgttagatgtgccaga 15002825  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    | |||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || |||||||||    
T  15002826 gcggaagtgggagatcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaag 15002925  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| ||||||    
T  15002926 tcggcacactttattccgatcaatgttagtt 15002956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15246934 - 15246575
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||    
T  15246934 attctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgagctgaaac 15246835  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||    
T  15246834 gtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccgga 15246735  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || |||||||||    
T  15246734 gtggaagtgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaag 15246635  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    ||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||| | ||| ||||||    
T  15246634 tcggcgcactttattccgatcaatattagttatccaatagctcagttggcagagatttat 15246575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15320153 - 15319827
Alignment:
Q  8 aagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgt 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  15320153 aagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggacctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgt 15320054  T
Q  108 ggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaa 207  Q
     |||  |||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||  ||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||||||     
T  15320053 tgcatagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttga-aatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgcgagagtggaag 15319955  T
Q  208 tgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctc 307  Q
    ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||  |  |||||||  |||||||||| |||||||| ||||  |    
T  15319954 tgggacaacatctccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgataccatttgggttgttgttgataggttgacgaactcggggc 15319855  T
Q  308 attttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  15319854 attttatcccgatcaatattagttttcc 15319827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27901390 - 27901066
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||    
T  27901390 gaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagagggatg 27901291  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  27901290 tcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 27901191  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||  |  | |||||  | || || || ||||||||||||||     
T  27901190 atgggacagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcg 27901091  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  27901090 cacttcattccgattaatatcagtt 27901066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 1648539 - 1648869
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      
T  1648539 attctagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaaga 1648638  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || || || | || ||| | || ||    
T  1648639 gggatgtcgcacagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatatactgga 1648738  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| | |||| || |  |  | |||||  | || ||||| ||||| |||    
T  1648739 gtggaaatgggacagcatttctatggattttgtaacgagtttacctaatactccgagagggcataattctatatgggttgtggtcgataggttgactaag 1648838  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  1648839 tcggcacatttcattcctattaatattagtt 1648869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 3264056 - 3264386
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  3264056 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 3264155  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  3264156 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 3264255  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  3264256 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 3264355  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  3264356 tcggcacacttcattcctattaatatcagtt 3264386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 11206493 - 11206823
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  11206493 attcttgaggagagtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 11206592  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  11206593 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 11206692  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  |||||||||||    
T  11206693 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccgattgacgaag 11206792  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  11206793 tcggcacacttcattcctattaatatcagtt 11206823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20891992 - 20891688
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  20891992 attcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 20891893  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||  ||||| || | || ||||| |  ||    
T  20891892 gagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgttggatgtaccgga 20891793  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  20891792 gtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 20891693  T
Q  301 tcggc 305  Q
    |||||    
T  20891692 tcggc 20891688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 29452799 - 29453109
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||     
T  29452799 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaa 29452898  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| ||   ||| || ||| | |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  29452899 gagatgttgctaagttcgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggtggagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 29452998  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  29452999 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 29453098  T
Q  301 tcggctcattt 311  Q
    ||||| |||||    
T  29453099 tcggcacattt 29453109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 44661128 - 44661405
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  44661128 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 44661227  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||  | ||| | ||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  44661228 gggatgttgctcagttcttttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggctgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttagatgtaccgga 44661327  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggt 278  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||    
T  44661328 gtggaagtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggt 44661405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33223933 - 33223680
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  | || ||||    
T  33223933 attctagaagagagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaac 33223834  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  33223833 gagatgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 33223734  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  33223733 atggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactcc 33223680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 15292433 - 15292512
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15292433 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggtctgga 15292512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 14695123 - 14695051
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaaga 73  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14695123 attcttgaagagagtcatataagtagcttgagtactcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaga 14695051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Original strand, 15358403 - 15358527
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || | |||||| |    
T  15358403 agtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactattttggtggtctggtttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgt 15358502  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtc 146  Q
    || | ||||| | |||||| |||||    
T  15358503 atgcgtgtttgacttgtcagaagtc 15358527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16148697 - 16148633
Alignment:
Q  25 agcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 89  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16148697 agcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtc 16148633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16152843 - 16152779
Alignment:
Q  25 agcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 89  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16152843 agcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtc 16152779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13248642 - 13248571
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggt 85  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13248642 gtcatagaagtagtttgagtatgcattcaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggt 13248571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 9291832 - 9291753
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  9291832 gtcatagaagtagtttgagtattcatctaggagcgattaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 9291753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 331
Target Start/End: Original strand, 15358541 - 15358682
Alignment:
Q  190 gatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgata 289  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || |    
T  15358541 gatgtgccggagtggaaatgggacagtatttctatggattttctgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgaca 15358640  T
Q  290 gattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    | |||||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  15358641 ggttgacgaagtcggcacacttcattccaattaatatcagtt 15358682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14998310 - 14998234
Alignment:
Q  17 atagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  14998310 atagaagtagtttgagtattcattcaggagcgactaaaatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 14998234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16029091 - 16029035
Alignment:
Q  31 agtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  16029091 agtattcatccaggagcgacgaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 16029035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7827016 - 7826959
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattag 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||    
T  7827016 tttgggtggttgttgatagattgacgaagtcggcgcactttattccaatcaatattag 7826959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 101
Target Start/End: Original strand, 18614853 - 18614911
Alignment:
Q  43 ggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || |||||    
T  18614853 ggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacg 18614911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14998055 - 14998010
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14998055 tttgggtgattgttgatcggttgacgaagtcggcacattttgttcc 14998010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3415 - 3072
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3415 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttctggtggtctggattgaaac 3316  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  3315 gtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaattgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 3216  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3215 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaat 3116  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctca 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  3115 tcggctcattttcttccgattaatattaattttcttgtttctca 3072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16696 - 16337
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16696 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttattttggtggtctggattgaaac 16597  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  16596 gtgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 16497  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496 gtggaaatgcgatagtatatccatcgattttgtgacgagttttccaaatactcctaatgggaatgatgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaag 16397  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  16396 tcggctcattttcttctgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 16337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 21393570 - 21393913
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  21393570 attcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaac 21393669  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |    
T  21393670 gcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttgccagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatggttagatgtgccata 21393769  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21393770 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 21393869  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctca 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21393870 tcggctcattttcttccgattaatattaattttcctgtttctca 21393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 21788064 - 21788407
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  21788064 attcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaac 21788163  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |    
T  21788164 gcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttgccagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatggttagatgtgccata 21788263  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788264 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 21788363  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctca 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21788364 tcggctcattttcttccgattaatattaattttcctgtttctca 21788407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19979043 - 19978708
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||    
T  19979043 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattaaaac 19978944  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19978943 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 19978844  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19978843 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgatgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgactgttgatagattgacgaag 19978744  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19978743 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttcct 19978708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 21921441 - 21921783
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21921441 attcttgaagagagtcataggagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 21921540  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21921541 gtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcaaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 21921640  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21921641 gtggaaatgggataatatatccatggattttgtgacgagtttgccgaa-actcctaaacggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgtcgaag 21921739  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctca 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21921740 tcggctcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctca 21921783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21252020 - 21251674
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacga---agatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaa 97  Q
    ||||||||||| || || ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21252020 attcttgaagagagccacagaagtaacctgagtattcatccgggagctacgacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattga 21251921  T
Q  98 aacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgct 197  Q
    ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||     
T  21251920 aacgcgacgttacacagtttgtatattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtgtgatggtatcgttagatgtgcc 21251821  T
Q  198 agagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacg 297  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21251820 agattggaaatgggatcgtatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacg 21251721  T
Q  298 aagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctca 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21251720 aagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctca 21251674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23651117 - 23650774
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23651117 attcttgaagagagtcatagaagtatcttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaac 23651018  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23651017 gtgatgttgcacagtttgtgtattcttgttggatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 23650918  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23650917 gtggaaatgggatagtatatcccaggattttgtgacgagtttgccaaatactcctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaat 23650818  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctca 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  23650817 tcggctcattttcttctgattaatattatttttcttgtttctca 23650774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22988272 - 22987913
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22988272 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 22988173  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  22988172 gtgatatggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatcttaagacgtgccaga 22988073  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22988072 gtagaaatgggataacatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacaaag 22987973  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  22987972 tcggatcattttataccgattaatatcagttttcctgtgtctcagttggcggaaatttat 22987913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 30312849 - 30313184
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || |||     
T  30312849 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaa 30312948  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  30312949 gagatgtggcacagtttgtctattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgtcaga 30313048  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30313049 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 30313148  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30313149 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 30313184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22040935 - 22040600
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  22040935 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaac 22040836  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22040835 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaatctgctggtatgatggtatctttagatgtgccgga 22040736  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22040735 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 22040636  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22040635 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 22040600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21166243 - 21166578
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  21166243 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaac 21166342  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21166343 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttatcagaagtcgaagattgaacatcagaaatccgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 21166442  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166443 gtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaag 21166542  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21166543 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttcct 21166578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18857653 - 18857322
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  18857653 attctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 18857554  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  18857553 gagatgtggcacagtttgtgtactcctgtttagtttgtcaaaagtcgaaagttgagcattagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 18857454  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18857453 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgtggatagattgacgaag 18857354  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  18857353 tcggctcattttctacctattaacattagttt 18857322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23949995 - 23949649
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  23949995 attcttgaagagagtcacataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaaa 23949896  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||| | |    
T  23949895 gtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagtcgagcatcagaaacttgctgggttgatgatatctttagatgtgccaaa 23949796  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23949795 gtggaaatgggataatatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccaagagggaatgacgctatttgggtgattgtagatagattgacgaag 23949696  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    | |||||||||  |||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  23949695 ttggctcatttcattccgattaacatcagttttcctgtatctcagtt 23949649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19113766 - 19113438
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  19113766 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 19113667  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  19113666 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 19113567  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19113566 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 19113467  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattag 329  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19113466 tcggctcattttctaccgattaatattag 19113438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 22377159 - 22377505
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22377159 attcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 22377258  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||| | |||    
T  22377259 acgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcataaatcaatagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccaga 22377358  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377359 gtgggaatgggatagcatatccatgaattttgtgacgagtttgctgaatacttctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 22377458  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  22377459 tcggctcattctattctgattaatatcagttttcctgtatctcagtt 22377505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 22383334 - 22383680
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22383334 attcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 22383433  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||| | |||    
T  22383434 acgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcataaatcaatagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccaga 22383533  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383534 gtgggaatgggatagcatatccatgaattttgtgacgagtttgctgaatacttctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 22383633  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  22383634 tcggctcattctattctgattaatatcagttttcctgtatctcagtt 22383680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 17673728 - 17674059
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  17673728 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 17673827  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  17673828 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccaga 17673927  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17673928 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 17674027  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17674028 tcagctcattttctacctattaatattagttt 17674059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 19483769 - 19484100
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  19483769 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 19483868  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||    
T  19483869 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaga 19483968  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19483969 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaa 19484068  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19484069 tcagctcattttctgcctattaatattagttt 19484100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32601220 - 32600885
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| || ||||    
T  32601220 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatataaataagattttctggtggtctggtttgaaac 32601121  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32601120 gagatgtggcaaagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 32601021  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32601020 atggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 32600921  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32600920 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 32600885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21043521 - 21043227
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  21043521 attcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtccggattgaaat 21043422  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || ||||  ||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  21043421 gcgacgttgcacaatttgtgtattcttgtttggtttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgacggtgtctttagatgtgccaga 21043322  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattga 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21043321 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattga 21043227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 16407750 - 16408086
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggatta-aaa 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||| |||||||||  |||    
T  16407750 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtagtctggatttgaaa 16407849  T
Q  100 cgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctag 199  Q
    || |||| ||||| |||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||    
T  16407850 cgagatgcggcacagtttgtgtattcctatttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagacgtgccag 16407949  T
Q  200 agtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16407950 agtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaattacgcaatttgggttataattgatagattgacgaa 16408049  T
Q  300 gtcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16408050 gtcggctcattttctaccgataaatattagttttcct 16408086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 22132746 - 22133081
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  22132746 attcttgaggagagtcattgaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 22132845  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| ||||||  |||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22132846 gagatgtggcacagtttgtgaattcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 22132945  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22132946 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgatgagttttccgaatactcctagagggaacgacacaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 22133045  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22133046 tcggctcatttcctaccgattaatattagttttcct 22133081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 20395837 - 20396176
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  20395837 attcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaac 20395936  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||||  || || || | |||||||||| |||    
T  20395937 gtgatgtggcacagtttgtttattcatgtttgatttgtcaaaagt-------tgagcatcagaaacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccaga 20396029  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20396030 gtgaaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagagggcatgccgctatttgggtgattgtggatagattaacgaag 20396129  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    || ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  20396130 tcagctcatttcattccggttaatatcagttttcctctatctcagtt 20396176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15534459 - 15534124
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttg---aagaagttgttttggtggtctggattaa 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    || ||| | || ||||||||||| || |    
T  15534459 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttagaaaaaaagattttctggtggtctggtttga 15534360  T
Q  98 aacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgct 197  Q
    |||| |||||||||   || || ||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  15534359 aacgagatgtggcataattcgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctctagatgtgcc 15534260  T
Q  198 agagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacg 297  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||| || |||| ||||||||||    
T  15534259 agaatggaaatgcgatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgatgcaattttggtaatcgttggtagattgacg 15534160  T
Q  298 aagtcggctcattttcttccgattaatattagtttt 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15534159 aagtcggctcattttctaccgattaatattagtttt 15534124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 22119879 - 22120207
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||    
T  22119879 attcttgaatagagtcatagaagttgcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaac 22119978  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
      |||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22119979 aagatgtggcacagttcgtgtattcctgtttagtttgtcagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgttggaatgatggtacctttagatgtgccaga 22120078  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22120079 atggaaatgggacagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgatgcaatttgggttattgttgatagattgacaaag 22120178  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattag 329  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22120179 tcggctcattttctaccgattaatattag 22120207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 22248122 - 22248388
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22248122 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgtgtattcatccgggagctacgaggatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 22248221  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||  || |||||||||| | |||    
T  22248222 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgataacacctttagatgtaccaga 22248321  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgac 267  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22248322 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgattttgccgtatactccgaaagggaatgac 22248388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 116 - 336
Target Start/End: Original strand, 22164012 - 22164232
Alignment:
Q  116 ttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatag 215  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22164012 ttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaatctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatag 22164111  T
Q  216 tatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  22164112 tatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcaattccta 22164211  T
Q  316 ccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22164212 ccgattaatattagttttcct 22164232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20389169 - 20388841
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||    
T  20389169 gaagaaagtcacatacgtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttagtggtccggattgaagcgtgatg 20389070  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | | || |||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  || || || | ||||||||||  ||||||||    
T  20389069 ttgtacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaa 20388970  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  20388969 atgggatagcatatccatggattgtgtgacaagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggtagttgttgatagattgacgaagtcggca 20388870  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| |||| || ||||||||||||||    
T  20388869 cactttattccaatcaatattagttttcc 20388841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21841487 - 21841159
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  21841487 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 21841388  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | ||   |||||| ||| | ||||| | |||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||||||    
T  21841387 ttgctatgtttgtttatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaa 21841288  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||| | || ||||| ||||||||||||||     
T  21841287 gtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggtggtggtcgataggttgacgaagtcggca 21841188  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21841187 cactttattccgatcaatattagttttcc 21841159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 22128663 - 22128973
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  22128663 attcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 22128762  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||| |||    
T  22128763 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaaatcaaaagttgagcatcagaagcctgctggaaggatggtacctttagatgtgccaga 22128862  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||                    |||||||| |||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22128863 atggaaatgggatagtatatccatggat------------------ggtactcctagagggaacgatgcaatttgggttattgttgatagattgacaaag 22128944  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattag 329  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22128945 tcggctcattttctaccgattaatattag 22128973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19852481 - 19852153
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  19852481 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatg 19852382  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||| | ||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  || || || | || ||||||| |||||||||    
T  19852381 ttgctcagtttttttatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttcgatgtgccagagtggaa 19852282  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || |||||||||||||      
T  19852281 gtgggacagcatttccatggattttgagacgagtttgccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggta 19852182  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  19852181 cattttatttcgatcaatattagttttcc 19852153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19858517 - 19858189
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  19858517 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatg 19858418  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||| | ||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  || || || | || ||||||| |||||||||    
T  19858417 ttgctcagtttttttatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttcgatgtgccagagtggaa 19858318  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || |||||||||||||      
T  19858317 gtgggacagcatttccatggattttgagacgagtttgccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggta 19858218  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  19858217 cattttatttcgatcaatattagttttcc 19858189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22372010 - 22371682
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  |||| ||||  ||||    
T  22372010 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcacctgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggtccagattgaaacatgatg 22371911  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||||||||    
T  22371910 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgcctgagtggaa 22371811  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  22371810 gtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggtagttgttgataggttgacgaagtcggcg 22371711  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22371710 cattttattccgatcaatattagttttcc 22371682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 312
Target Start/End: Original strand, 20009631 - 20009935
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| ||||    
T  20009631 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaatatgtatcatgatttgaagaaattattttggtggtc-cgtttgaaacgtgatg 20009729  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||||||    
T  20009730 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaa 20009829  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||  |||| ||| | |||||||| ||| |     
T  20009830 gtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagagggaatgatgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaattcgacg 20009929  T
Q  307 catttt 312  Q
    ||||||    
T  20009930 catttt 20009935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14566218 - 14565888
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  14566218 attcttgaggagagtcacaaaagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 14566119  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  14566118 gggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttaatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 14566019  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||| | |||||||||    
T  14566018 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggtagttgtcgatcggttgacgaag 14565919  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  14565918 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 14565888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 31416185 - 31416509
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || ||||    
T  31416185 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatg 31416284  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||||||||    
T  31416285 ttgctcattttgtttatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaa 31416384  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | |||| |||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||||||     
T  31416385 gtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgagcactccgagagggcatgatgccatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggca 31416484  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  31416485 cacttcattccgattaatatcagtt 31416509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 12274445 - 12274614
Alignment:
Q  52 aagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaagg 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  12274445 aagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaag 12274544  T
Q  152 ttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12274545 tcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 12274614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 31570556 - 31570877
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  31570556 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 31570655  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||||||    
T  31570656 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatg 31570755  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||  ||||  || |||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  31570756 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacat 31570855  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||| |||| || || |||||||    
T  31570856 tttattcctatcaacattagtt 31570877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 16270929 - 16271259
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||     
T  16270929 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaa 16271028  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |  || || || | |||||||| |  ||    
T  16271029 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgttagatgtaccgga 16271128  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  16271129 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 16271228  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  ||||||||||||| ||||    
T  16271229 tcggcacacttcattccgattaatatcagtt 16271259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23656003 - 23655673
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| |||||| |||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  23656003 attctggaagaaggtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaac 23655904  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | || || || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |  |  || | ||||||||||  ||    
T  23655903 gtgacgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttattaacaccgttagatgtgccgga 23655804  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| |  || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || |||||||||    
T  23655803 gtggaagtgggacaacatttccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtagttgtcgacaggttgacgaag 23655704  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  ||  ||||||||||||||    
T  23655703 tcggcacacttcattttgattaatattagtt 23655673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6680187 - 6679857
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || | |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||     
T  6680187 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaa 6680088  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  6680087 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 6679988  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  6679987 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 6679888  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  6679887 tcggcacacttcattcctattaatatcagtt 6679857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27355624 - 27355322
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  27355624 attcttgaagatagtcacaagagtagattgagtatacacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 27355525  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |  || || | |||||||| || ||    
T  27355524 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggtttttgacaccgttagatgtactgga 27355425  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  27355424 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgaatttaccgaacactccgagagggcatgacgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 27355325  T
Q  301 tcg 303  Q
    |||    
T  27355324 tcg 27355322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6604734 - 6604430
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || | |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||     
T  6604734 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaa 6604635  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  6604634 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 6604535  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  6604534 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 6604435  T
Q  301 tcggc 305  Q
    |||||    
T  6604434 tcggc 6604430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1267308 - 1267073
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| || |    
T  1267308 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacg 1267209  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | ||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  ||||||||    
T  1267208 ttgcccattttgtgtatgcatgtttgactttccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaa 1267109  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  1267108 atgggatagcatttctatggatttcgtgacgagttt 1267073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 803399 - 803708
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| | ||||| ||   ||| || |    
T  803399 agtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagagatgttgctaagttcgttt 803498  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  803499 atgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctc 803598  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||||||| || ||  |||| |||    
T  803599 tacggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacacttcattcctatt 803698  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  803699 aatatcagtt 803708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12305834 - 12305504
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||      
T  12305834 attcttgaagagagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaatt 12305735  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||| | ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  12305734 gtgatgttgctcagtttttttatgcttgttttatttgtcagaagtctaaggttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 12305635  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || ||||| ||||| | |||| ||||| |  |||| ||  |||| ||  | |||||||||    
T  12305634 gtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgaccttaccgaacactccgagagggtatgacactatttgagttgttgtcgaccggttgacgaag 12305535  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  12305534 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 12305504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 20975377 - 20975591
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || || || || || || || |  |||||||    
T  20975377 agtagcttgagtattcatacgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaggaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtat 20975476  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||  | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |   || || || | || |||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  20975477 atgcatgtttgacttgctagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggatagcatttc 20975576  T
Q  222 catggattttgtgac 236  Q
     ||||||||||||||    
T  20975577 tatggattttgtgac 20975591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 21196220 - 21196299
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21196220 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagatgttgttttggtggcctgga 21196299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22316254 - 22316175
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  22316254 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtggcctgga 22316175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22051918 - 22051698
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||| | |    
T  22051918 agtaggttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttatgt 22051819  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||  | ||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  || || |  | || ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  22051818 atgcatgtttgacttgctagaagtctaacattgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttc 22051719  T
Q  222 catggattttgtgacaagttt 242  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  22051718 tatggattttgtgacaagttt 22051698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 16876813 - 16876892
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  16876813 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 16876892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 20652051 - 20652130
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20652051 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgaatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 20652130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 20985258 - 20985343
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 92  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20985258 gaagaaagtcacagaagtatcttaagtattcacccgagagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgg 20985343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25283200 - 25283120
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    |||||| |||| || ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25283200 gaagaaggtcacaggagtagtttaagtattcatctaggagcgacgaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtgg 25283120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 21850055 - 21850134
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  21850055 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgtttcggtggcctgga 21850134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22049299 - 22049237
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22049299 tttgggtaatcgttgatagatcgacgaagttggctcattttctaccgattaatattagttttc 22049237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 23156738 - 23156809
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  23156738 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgtttttgtggcctgga 23156809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 29303131 - 29303461
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||    
T  29303131 attcttgtagagagtcacaagagtaggttgagcattcacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaaggaactgttttggtggtccggtttgaaac 29303230  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | ||  || ||||| || || || |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  29303231 gagatgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgactttccagaagtctaaagtggaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 29303330  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || || ||| | | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  29303331 gtggaagtgggatagtatctctatggatttcgtgacgaatttaccaaacacttcgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 29303430  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  29303431 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 29303461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25283411 - 25283346
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25283411 agtagtttaagtattcatctaggagtgacgaagatgtatcaggatttgaagaaattgttttggtgg 25283346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 22623569 - 22623637
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttg 69  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  22623569 attctggaaaaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttg 22623637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22983396 - 22983277
Alignment:
Q  114 gtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggat 213  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    ||| |||||  | | ||   ||||| ||||||||| ||||||    
T  22983396 gtttgtatatgcttgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaaccgcagggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaattgggat 22983297  T
Q  214 agtatatccatggattttgt 233  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  22983296 agtatctctatggattttgt 22983277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22284032 - 22283994
Alignment:
Q  49 acgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22284032 acgaagatgtatcaggatctgaagaagttgttttggtgg 22283994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22283809 - 22283764
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  22283809 tttggatgattgttgatcgtttgacgaagtcggcacattttcttcc 22283764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2491 - 2149
Alignment:
Q  18 tagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggttt 117  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2491 tagaagtagcttaagtattgatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaactattttggtggtctggattaaaacgggatgtggcacagttt 2392  T
Q  118 gtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagta 217  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  2391 gtgtattcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagaagtgccagagtggaaatgggatagca 2292  T
Q  218 tatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2291 tatccatggattttgtaacgagtttgtcgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgactcattttcttcc 2192  T
Q  318 gattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  2191 gcttaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 2149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 32018 - 32364
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  32018 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatgtgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaac 32117  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||    
T  32118 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctatttaatttgtgagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtatctttagatgtaccaga 32217  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32218 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 32317  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  32318 tcgactcatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagtt 32364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7061 - 6718
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7061 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccaggagctacgaagatgtaccacgatct---aaagttgttttggtggtctggattgaaac 6965  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  6964 gcgatgttgcacagtttgtgtatacttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagtatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 6865  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6864 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtaacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatatgggtgattgttgatagattgacgaag 6765  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6764 tcggctcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctcagtt 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13099 - 12837
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  13099 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcaccctggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggttgtctggactgaaac 13000  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  12999 gagatgttgcacagttcgtgtattcttgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 12900  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaa 263  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12899 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaa 12837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23204 - 23125
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  23204 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgatgaagttgttttagtggcctgga 23125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 825 - 887
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaag 72  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  825 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaag 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1717 - 1371
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |    
T  1717 attcttgaagagagtcattgaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgcaccatgatttgaagatgttgttttgatggtctggattgaagc 1618  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  1617 gtgatgttgcacggtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatatttagatgtgccaga 1518  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1517 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgactttgccgaatactcctaaagggaatgatgcgatttgggtgattgttgatagattgacaaag 1418  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | ||||||||    
T  1417 tcggctcattttcttccgattagtatcagtttttctgtgtctcagtt 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7413 - 7067
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| ||||    
T  7413 attcttgaagagatccatagaagtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaggttgttttggtggtccgaattgaaac 7314  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | || || ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  7313 gtgacgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcaaaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccaga 7214  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7213 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgtctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 7114  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7113 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagtt 7067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3832 - 3502
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3832 attctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 3733  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||  ||  || || || | ||||||||||  ||    
T  3732 gtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagactaaggttgagcatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttagatgtgccgga 3633  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||  ||| ||  |||||||| |||| ||||| ||||| |||    
T  3632 gtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactcccagagggcgtgatgccatttgggtggttgtcgataggttgacaaag 3533  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || || || ||| ||||||| ||||||||||    
T  3532 tccgcgcactttattccgatcaatattagtt 3502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 19267 - 19613
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19267 attcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaac 19366  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| | |||    
T  19367 gcgacgttgcacggtttgtgtatgcttgtttgatttgccagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctgatatgttggtatcgttagatgttccaga 19466  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19467 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtatgacaaatactcctaaagggaataacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 19566  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19567 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagtt 19613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 14476 - 14579
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14476 attcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaac 14575  T
Q  101 gcga 104  Q
    ||||    
T  14576 gcga 14579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 7596 - 7936
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7596 attcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaac 7695  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |    
T  7696 gcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgttagaagtcgaaggttgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcattagatgtgccaaa 7795  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7796 atggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaaagacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 7895  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttc 341  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7896 tcgactcattttcttctgattaatattagttttcctgtttc 7936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 43 - 347
Target Start/End: Original strand, 1 - 305
Alignment:
Q  43 ggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  1 ggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttatttgatttgtcaga 100  T
Q  143 agtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  101 aatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcattagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttt 200  T
Q  243 gccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttct 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 gccaaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttct 300  T
Q  343 cagtt 347  Q
    |||||    
T  301 cagtt 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5072 - 4726
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  5072 attcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtaatcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaat 4973  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  4972 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcaggtttgatgacacctttatatgttctaga 4873  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4872 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactcataaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaag 4773  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  4772 tcggctcattttattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagtt 4726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6262 - 5916
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  6262 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagctatgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttagtggtctagattgaaac 6163  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  6162 gcgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgacttgttagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtaggatggtatctttatatgtgctaga 6063  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  6062 gtggaaatgggatagtatacccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcaatttgggtgattatgggtagattgacgaag 5963  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5962 tcggttcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctaagtt 5916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Original strand, 390489 - 390811
Alignment:
Q  25 agcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatatt 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  390489 agcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtagcacagtttgtgtatt 390588  T
Q  125 cttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccat 224  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  390589 cttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctagaatgatggtatctttagatatgccagagtggaaatgggatagtatatccat 390688  T
Q  225 ggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaat 324  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  390689 ggattttgtgacgagtttgctgaatactcctaaaggggatgacgcgatttgggtggttgttgatagattgacgaagttgactcattttattccgattaat 390788  T
Q  325 attagttttcctatttctcagtt 347  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  390789 atcagttttcctatttctcagtt 390811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 89716 - 89801
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 92  Q
    ||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89716 gaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 89801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 90394 - 90479
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 92  Q
    ||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90394 gaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 90479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 115037 - 114896
Alignment:
Q  190 gatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgata 289  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | ||||| |    
T  115037 gatgtgctggagtggaagtggaatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggttgaca 114938  T
Q  290 gattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  114937 gattgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagtt 114896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2290 - 1963
Alignment:
Q  17 atagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtt 116  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  2290 atagaagtaacttgagtattcatccgggagctccgaagatgtagcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgcgacgttgcacagtt 2191  T
Q  117 tgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagt 216  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2190 tgtgtattcttgttttatttgtcagaagtcgaaggatgagcgtcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagt 2091  T
Q  217 atatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttc 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2090 atatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcttaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttggcatattgacgtagtcggctcattttcttc 1991  T
Q  317 cgattaatattagttttcctatttctca 344  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  1990 agattaatattagttttcctatttctca 1963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 39085 - 39444
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||| ||||    
T  39085 attcttgaagagactcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcatgatctgaagaaaattttatggtggtctggattgaaac 39184  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  39185 gcgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacccgctggtttgatggtatccttagatgtgccaga 39284  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgctgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaag 39384  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  39385 tcggctcattttctaccaattaatatcagttttcctattgcccagttagtagagatttat 39444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 66446 - 66111
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  66446 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagctacgaaaatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 66347  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| || || |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  66346 gtgatgtggcacagtttgtgtactcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcaaaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccata 66247  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  66246 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagcttgccgaatactcctaaagggagcgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 66147  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66146 tcggctcattttctaccgattaataatagttttcct 66111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 63296 - 63655
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| | |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  63296 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaac 63395  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| ||||   ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  63396 gcgatgtggcgcagtttgtgtattcctgttaggtttgtcagaagtcgaagattgaacataagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 63495  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  63496 gtggaaatgggatagtatatgcatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgacg 63595  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  63596 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttcctgttgctcagttggcagagatttat 63655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 25798 - 26133
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25798 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 25897  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||  ||||| || |||||||||| | |||    
T  25898 acgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacttgcagggttgatgacacctttagatgtaccaga 25997  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25998 gtggaaatggcatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgaaagggaatgacgcgatttgggtgattattgatagattgacgaag 26097  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26098 tcggctcattttattccgattaatatcagttttcct 26133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 149611 - 149281
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  149611 attctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaac 149512  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||| ||    
T  149511 gtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaatgttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgctgga 149412  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||| || ||||| || || || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||| ||||  |  | |||||  | || || || |||||||||    
T  149411 gtgtaattgggacagcatttctatggattttgtgacgagtttactgaacactccgagagggcatgattccatatgggttgtggtcgacaggttgacgaag 149312  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  149311 tcggcacatttcattccgattaatatcagtt 149281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Original strand, 194990 - 195294
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || |  ||||| |    
T  194990 agtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgt 195089  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||  || || || | || |||||||  |||||||| | |||||| || ||    
T  195090 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctacagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagttggatagcatttc 195189  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  | |||| |||| ||  | |||||  | || || || ||||| |||||||| || ||| ||||||||    
T  195190 tatggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacaaagtcggcgcactttattccgatt 195289  T
Q  322 aatat 326  Q
    |||||    
T  195290 aatat 195294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 180952 - 180879
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  180952 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcatgattttaatatgttgttttggtgg 180879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29986 - 29626
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||| || ||||||||| ||||    
T  29986 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaggttgtttttgtcgtctggattgaaac 29887  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  29886 gcgatgttgcagagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgaccatcagaaacctactggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 29787  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatgga-ttttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29786 gtggaaatgggatagtatatccatggatttttgtgacgagtttgcatgatactcctaaagggaatgacgcaatttgggtgattgttgaaagattgacgaa 29687  T
Q  300 gtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  29686 gtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 29626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29092 - 28764
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  29092 gaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 28993  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | ||   |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||| ||  || |  ||   |||||||||| |||||||||    
T  28992 ttgcttagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagaattagaagcctgcagggttgttaacactgttagatgtgccagagtggaa 28893  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  ||||  |||| ||||||||||||||     
T  28892 gtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtctataggttgacgaagtcggca 28793  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28792 cattttattccgatcaatattagttttcc 28764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 3722 - 4053
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3722 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 3821  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||    
T  3822 gtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgttgggatgatggtatctttagatgttccaga 3921  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  3922 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacacgatttg---gattgttgatagattgacgaag 4018  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4019 tcagcttagtttattccgattaatatcagttttcc 4053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 28637 - 29004
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||   |||||| | || | || ||||| ||| ||||    
T  28637 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatccaaagaagattttatagttgtctgtattgaaac 28736  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28737 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacccgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 28836  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcg--------gtttgggtgattgttgatagat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||          || |||||||||||||||||    
T  28837 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgaatactcctgttaggtgattgttgatagat 28936  T
Q  293 tgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    ||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| || | ||||||| ||| ||||||    
T  28937 tgatgaagtcggctcattttctatcaattaatatcagttttcctgttgcccagttagcagagatttat 29004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 131148 - 130956
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  131148 attcttgaagagagccatagaagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagaggtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaac 131049  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatg 193  Q
    |||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  131048 gcgacgttgcaaagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgatggttaagcatcagaaacctgctgttatgatggtatcgttagatg 130956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 59790 - 59436
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||    
T  59790 gaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcaagattttaagaagttattttggtggtccgggttgaagcgacatg 59691  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    ||||||  ||||  ||| | |||||||||||||| ||||  || | ||| || ||||||||| ||||  || || || |||||||| | | |||||||||    
T  59690 tggcacaatttgggtatgcgtgtttaatttgtcagaagttaaaagatgaacaccagaaacctactgggttgttgacacctttagatattcgagagtggaa 59591  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||  |||| ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  59590 gtgggatagtatatccatggattttgtgacgattttgccaaatactccaaaaggacatgatgcgatttgggtaattgtggatagactaacgaagtcggct 59491  T
Q  307 ca-ttttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
     | |||| ||||||||| ||| |  |||||| | ||| |||| | ||||||||||    
T  59490 aattttttttccgattattatcatctttcctgtatcttagttggcagaaatttat 59436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 130957 - 130843
Alignment:
Q  233 tgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  130957 tgacaagtttgcctaatactcctaaaaggaatgacgcgatttgggttattgttgatagattgatgaagtcggctcattttcttccaattaatattagttt 130858  T
Q  333 tcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||||||    
T  130857 tcctatttctcagtt 130843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Original strand, 55213 - 55257
Alignment:
Q  49 acgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  55213 acgaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 55257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26015 - 25680
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||||| ||||    
T  26015 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttctggtggtctggattgaaac 25916  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  25915 gagatgtggcacagtttgtgtattcctatttagtttgtcacaagtcgaagattgaacatcagaaacctgcttgtatgatggtatcgttagatgtgccaga 25816  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25815 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcatggagggaatgacacaatttgggttattgttgatagattgacgaag 25716  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25715 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 25680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 278095 - 278430
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  278095 attcttgaagagagtcatagaagtaggttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaac 278194  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||    
T  278195 gcgatgtggcacaatttgtgtattcatgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctgatatgatggtatcattagatgtgccaga 278294  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  278295 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgatttggatgattgttgatagattgacgaag 278394  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  278395 tcggctcattttccaccgattaatatcagttttcct 278430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 261328 - 261108
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| || || || | |||||| |    
T  261328 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgt 261229  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || |  | || ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  261228 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttc 261129  T
Q  222 catggattttgtgacaagttt 242  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  261128 tatggattttgtgacgagttt 261108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 7156 - 7490
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  7156 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctcggttgaaac 7255  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  7256 gtgatgtggcatagtttgtatattcatgtttggtttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctgttgggttgatggtatctttagatgtgccaga 7355  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7356 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcccaaagggaatgacgctatttgggtgattgttgataggttgacgaag 7455  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  7456 tcgactcatttcattccgattaatatcagttttcc 7490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14734
Alignment:
Q  47 ctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtc 146  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||    
T  15034 ctacgaagatctatcatgatctaaagaagtttttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttgttagaagtc 14935  T
Q  147 gaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  14934 gaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgaagagtttgcct 14835  T
Q  247 aatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagt 346  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14834 aatactcctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgataggttgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagt 14735  T
Q  347 t 347  Q
    |    
T  14734 t 14734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 347
Target Start/End: Original strand, 18221 - 18466
Alignment:
Q  103 gatgtggcacggttt-gtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagag 201  Q
    |||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||     
T  18221 gatgtggcacagttttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagctgagcatcagaaatctgctgggatgattgtatctttagatgtgccagaa 18320  T
Q  202 tggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18321 tggaaatgggatagtatatccatgtattttgtgacgagtttaacgaatactcctaaagggaatgccgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagt 18420  T
Q  302 cggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18421 cggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtttctcagtt 18466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32452 - 32148
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgtttt-ggtggtctggattaaaa 99  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| || |||    
T  32452 attctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaactgtttttggtggtctgggttgaaa 32353  T
Q  100 cgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctag 199  Q
    || ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  || || || | || |||||||  |    
T  32352 cgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcatcagaatcctgtagggctgttgacaccgttggatgtgcagg 32253  T
Q  200 agtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaa 299  Q
    ||||||| ||||| |  || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  || ||||||| || || ||    
T  32252 agtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtttttgataggttaacaaa 32153  T
Q  300 gtcgg 304  Q
    |||||    
T  32152 gtcgg 32148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18211 - 18147
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18211 tttgggtaatcgttgataaattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24535 - 24204
Alignment:
Q  5 ttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcga 104  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  ||| ||||||||    
T  24535 ttgaagagagtcgtagaagtagcttgagaattcatcgaggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctaaattgaaacgcga 24436  T
Q  105 tgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtgg 204  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24435 tgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgatgattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtgg 24336  T
Q  205 aaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24335 aaatgggatagtatatccatggattttgtgatgagtttgtcgaatacttctatagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgg 24236  T
Q  305 ctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  24235 ctcatttcctaccgattaatatcagttttcct 24204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 32838 - 33171
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  32838 attcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 32937  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32938 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaggtcaaagattgagcatcagaaacccgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 33037  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33038 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctacagggaatgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 33137  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33138 tcggctcattttctaccgattaatattagttttc 33171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9637 - 9302
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  9637 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 9538  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  9537 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacccgctggtaagatggtatctttagatgtgccaga 9438  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9437 acggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctacagggaatgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 9338  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9337 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 9302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8831 - 8472
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  8831 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatgacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 8732  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  8731 gagatgtggcaaagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 8632  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || ||  ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  8631 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcagagagggaacgatgcaatttgggcaatcgttgatagattgacgaag 8532  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||    
T  8531 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcctattgcccagttggcagagatttat 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19643 - 19308
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || | |||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||| |||| ||||    
T  19643 attcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaatattctggtggtctagattgaaac 19544  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    || ||||| ||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  19543 gcaatgtgacacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatccttagatgtgccaga 19444  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19443 gtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaag 19344  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19343 tcggctcattttctgccgattaatatcagttttcct 19308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35067 - 34732
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || | |||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||| |||| ||||    
T  35067 attcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaatattctggtggtctagattgaaac 34968  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    || ||||| ||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  34967 gcaatgtgacacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatccttagatgtgccaga 34868  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867 gtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaag 34768  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34767 tcggctcattttctgccgattaatatcagttttcct 34732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 50473 - 50238
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  50473 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatctaaagaagttattttgctggtctggattgaaac 50374  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  50373 gtgatgtggcacagtttgcgtattcttgtttgatttgccagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 50274  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50273 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgac 50238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50230 - 50175
Alignment:
Q  305 ctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  50230 ctcatttccttccgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttat 50175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9515 - 9156
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  9515 attcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 9416  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| |||    
T  9415 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtctagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccaga 9316  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9315 atggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaa 9216  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||| ||||||    
T  9215 tcggctcattttctaccgattaatattagtttccctattgcccagttggcagagatttat 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15977 - 15618
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  15977 attcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 15878  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||  || ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| | |    
T  15877 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgactagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccaaa 15778  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15777 atggaaatgtgatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctatagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaa 15678  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  15677 tcggctcattttctaccgattaatattagtttccctatttcccagttggcagagatttat 15618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44195 - 43864
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  44195 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcactcgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 44096  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  44095 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 43996  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43995 atggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcccagagggaacgatgcaatttgggttattgttgataggttgacgaag 43896  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43895 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 43864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 49785 - 50113
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| || || || ||||    
T  49785 gaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatg 49884  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  49885 ttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaa 49984  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||| | |||  ||||  |  | |||||  | || ||||||||||||||||||||     
T  49985 atgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacataatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcg 50084  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  50085 cactttattccgataaatatcagttttcc 50113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 881 - 966
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtg 86  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  881 attctggaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtg 966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 105851 - 105930
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  105851 gtcatagaagtagtttaagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttcttttggtggcctgga 105930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 3079 - 3412
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||  ||||    
T  3079 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaaaattttctggtggtctggatcgaaac 3178  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  3179 gcgatgtggcacagtttgtgtgttcttgtttggtttgtcagaagtcgaagactgaacgtcagaaacccgctggtatgatggtatccttagatgtgccaga 3278  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3279 gtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgggatttgggtgattgttgatagattgacaaag 3378  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3379 tcggctcattttctaccgattaatatcagttttc 3412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 79 - 347
Target Start/End: Original strand, 39354 - 39622
Alignment:
Q  79 ttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatga 178  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39354 ttttggtggtctggattgaaacacgatgttgcacggtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatga 39453  T
Q  179 tggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggt 278  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39454 tggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggt 39553  T
Q  279 gattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  39554 gattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctttcgattagtatcagttttcctgtttctcagtt 39622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 3670 - 4005
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  3670 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 3769  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  3770 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacccgctggtaagatggtatctttagatgtgccaga 3869  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3870 acggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctacagggaatgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 3969  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3970 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 4005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7980 - 7649
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  7980 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 7881  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  7880 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaga 7781  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7780 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttttccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 7681  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7680 tcggctcattttctacagattaatattagttt 7649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22908 - 22573
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||    
T  22908 attcttgaagagagtcatataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaaaattttttggtggtctggtttgaaac 22809  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||    
T  22808 gagatgtggcacagtttgtatattcctgtttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctctagatgtgtctga 22709  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22708 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggggacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaag 22609  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22608 tctgcttattttctaccgattaatattagttttcct 22573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 79759 - 80094
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  79759 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaac 79858  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  79859 gagatgtggcacagtttgtgtatttgtgtttattttgtcataagtcgaagatcgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccaga 79958  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  79959 atggaaatgggatagtatatccacggattttgtgacgagtttgtcgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggttattgataatagattgatgaag 80058  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  80059 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 80094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10011 - 9665
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10011 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagcattcatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggactgaaac 9912  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||| || | |||||||||| |||    
T  9911 gtgatgtggcatagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcaaaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtgccaga 9812  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||     
T  9811 gtggaaataggatagtatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactacgaaagggaatgatgtgatttgggtaattgttgatagattaacgaaa 9712  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  9711 tcagctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagtt 9665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4912 - 4554
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  4912 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaac 4813  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||   ||  ||||| || ||||| |||| | |||    
T  4812 gtgatgtggcatagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctatagggttgatgacacctttatatgtaccaga 4713  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4712 gtggaaatagaatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtttatagattgacgaag 4613  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaattta 359  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||  ||||||||    
T  4612 tcggctcatttcattccgattaatatcagttttcttgtatctcagttagcggaaattta 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11684
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  12042 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaac 11943  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||   ||  ||||| || ||||| |||| | |||    
T  11942 gtgatgtggcatagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctatagggttgatgacacctttatatgtaccaga 11843  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11842 gtggaaatagaatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtttatagattgacgaag 11743  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaattta 359  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||  ||||||||    
T  11742 tcggctcatttcattccgattaatatcagttttcttgtatctcagttagcggaaattta 11684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2955 - 2616
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2955 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 2856  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||| | |||    
T  2855 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagt-------tgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccaga 2763  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2762 atggaaatgggatagcatatccgtggattttgtgacgagtttgtcgaatactcctaaagggaatggcgcaatttggctgattgttgatagattgacgaag 2663  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  2662 tcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagtt 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 41598 - 41928
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  41598 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 41697  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  41698 gagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 41797  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||  |||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  41798 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 41897  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  41898 tcggcacatttcattcctattaatatcagtt 41928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 46670 - 46989
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || |    
T  46670 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacaaaaatgaatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacg 46769  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  || || || | || |||||||  ||||||||    
T  46770 tcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgaagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaa 46869  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     |||||||  || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | ||  | || ||||||||||||||     
T  46870 gtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcaacaggttgacgaagtcggcg 46969  T
Q  307 cattttcttccgattaatat 326  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  46970 cattttattccgattaatat 46989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8407 - 8076
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  8407 attcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 8308  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8307 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtctagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccaga 8208  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8207 atggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaa 8108  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8107 tcggctcattttctaccgattaatattagttt 8076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 109076 - 109407
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  109076 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 109175  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||    
T  109176 gagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtgcctttagatgtgccaga 109275  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109276 atggaaatgggatagtatatcgatggaatttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaag 109375  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  109376 tcggctcattttctacctattaatattagttt 109407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Original strand, 95273 - 95517
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  || |  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||    
T  95273 gaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatg 95372  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| || ||||| |||||||  || || ||| || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  95373 tcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 95472  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatac 251  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  95473 atgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttacccaatac 95517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 113594 - 113268
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| | || || || ||||    
T  113594 gaagaaagtcacaagaatagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaagaagctattttggtggtctagtttgaagcgtgatg 113495  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | ||   |||||| ||| | ||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  113494 ttgcttagtttgtgtatgcatgtttaacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaa 113395  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||| | || || ||||| | |||  ||||  |  | |||||  | || ||||||||||||||||||||     
T  113394 atgggatagtatttctatggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgagaggacatgattcaatatgggttgtagtcgatagattgacgaagtcggcg 113295  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtttt 333  Q
    || ||| |||| || ||||| ||||||    
T  113294 cactttattccaataaatatcagtttt 113268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 196743 - 197078
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  196743 attcttgaggagagccatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttatggtggtctggattgaaac 196842  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||| |||    
T  196843 gagatgtggcatagtttgtgtattcttgtttggtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacccactgatatgatggtatctttagatatgccaga 196942  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  196943 gtcgaaatgggataatatatccatggattttgtgacgagttagccgaatactcctagagggaatgacgcgatttggatgattgttgatagattgacgaag 197042  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  197043 tcagcacattttctaccgattaatattagttttcct 197078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 57058 - 56894
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  57058 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 56959  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaa 165  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  56958 gtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaaa 56894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 19332 - 19480
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  19332 attcttgaatagagtcatataagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatggtttaaagaagatcttctggtggtctggattgaaac 19431  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaa 149  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19432 gtgatgtagcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaa 19480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 17242 - 17588
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17242 attcttgaagagagtcacaaaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 17341  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||  |||||  |||||||||||||| |||    
T  17342 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaaaaacctgttgggttgatgctatctttagatgtgccaga 17441  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17442 gtggaaatgcaatagtatatccatgaattttgtgacgagtttgttgaatactccaaaagggaatgacgatatttgggtgattgtagatagattgacgaag 17541  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  17542 tcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatcttagtt 17588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 14344 - 14690
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14344 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 14443  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
      |||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || |||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||| |||    
T  14444 atgatgtgacacagtttgtgtattcatgtttgatttgttagaagtcaaaagttgagtatcagaaacctgttgggttgatgacacctttagatgtgccaga 14543  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14544 gtggaaatgagatagtatatccatggaatttgtgacgagtttgccgaatactccgaatgggaatgacgctatttgggtgattgtagatagattaacgaag 14643  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  14644 tcggctcatttcattccgattaacatcagttttcctgtatctcagtt 14690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 116170 - 116480
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  116170 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaac 116269  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||| |||| |||    
T  116270 gtgatgtggcgcagtttgtgtattcatgtttgatttctcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctaggttgatgacacctttagaagtgccaga 116369  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  116370 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaagggaatgacgctatttgggtgattgtggagagattgacgaag 116469  T
Q  301 tcggctcattt 311  Q
    ||| |||||||    
T  116470 tcgactcattt 116480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37847 - 37787
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37847 tttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctactgattaatattagttt 37787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 88 - 423
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||||  | || | ||||||||| || ||||    
T  88 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtttcatgatctgaagaaaattttctagtggtctggtttgaaac 187  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    ||||| ||||||  ||| | ||||| |||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  188 gcgatatggcacaatttttgtattcctgtttagtttgtcagaaatcgaagattgaacatcacaaacctgctagtatgatggtatccttagatgtgccaga 287  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  288 gtggaaatgggacagtatatccatggagtttgtgacgagtttgccgaatactcctagagagaatgacgcgatttgggtgatagttgatagattgatgaag 387  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  388 tcggctcattttctaccgattaatattagttttcct 423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 346
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11807
Alignment:
Q  3 tcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgc 102  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | || ||| |     
T  11464 tcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagt 11563  T
Q  103 gatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagt 202  Q
     |||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||| |||||    
T  11564 aatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagt 11663  T
Q  203 ggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtc 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  11664 ggaaatgggatagaatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaagggaatgacactattggggtgattgttcatatattgacgaactc 11763  T
Q  303 ggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagt 346  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11764 ggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatctcagt 11807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 346
Target Start/End: Original strand, 17656 - 17999
Alignment:
Q  3 tcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgc 102  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | || ||| |     
T  17656 tcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagt 17755  T
Q  103 gatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagt 202  Q
     |||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||| |||||    
T  17756 aatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagt 17855  T
Q  203 ggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtc 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  17856 ggaaatgggatagaatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaagggaatgacactattggggtgattgttcatatattgacgaactc 17955  T
Q  303 ggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagt 346  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17956 ggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatctcagt 17999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1949 - 1603
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  1949 attctcgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctataaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctaggttgaaac 1850  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  || || || | ||||||||||||||    
T  1849 gtgatgtgacacagtttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgctaga 1750  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1749 atggaaatgggatagtatatacatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagaggacatgacgctatttgggtgattgtggatagattgacgaag 1650  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  ||| |||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  1649 tcggctcatttcattctgattaacatcagttttcctgtatctcagtt 1603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 347
Target Start/End: Original strand, 15738 - 16027
Alignment:
Q  51 gaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaag 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||         
T  15738 gaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagt----- 15832  T
Q  151 gttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaata 250  Q
      |||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15833 --tgagcatcagaaacctgcagcgatgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgcctaata 15930  T
Q  251 ctcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  15931 ctcctaaaggaaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgactcattttattccgattaatatcagttttcctatgtctaagtt 16027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4175 - 3835
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4175 gaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatttgggatctaccaagatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 4076  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    ||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  4075 tggcacaatttatttattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggctgatgacacctttagatgtgccagagtggaa 3976  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||   |||||||||    
T  3975 atgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttttcgaacactccgaaagggaatgacgcgatttaggtgattgtagatagattgcacaagtcggct 3876  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  3875 catttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagtt 3835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1455 - 1124
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  1455 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 1356  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||  |||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  1355 gagatgtggcatagtttatgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgggcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccaga 1256  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||  ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1255 atggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagatggagcgacacaatttgggtgattgttgataggttgacgaag 1156  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1155 tcagctcattttctacctattaatattagttt 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13509 - 13247
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || |||     
T  13509 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaat 13410  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13409 gtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 13310  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaa 263  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13309 atggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13193
Alignment:
Q  296 cgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13233 cgaagttggctcattttctactgattaatattagttttcct 13193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8438 - 8105
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || |||     
T  8438 attcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttcaaaa 8339  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |  ||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||| ||     
T  8338 gaaatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacatgctaaaatgatggtacctttagatgtgccagt 8239  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||  |||||||||| |||| ||||    
T  8238 atggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacaagttttccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttgttgttgataggttgatgaag 8139  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8138 tcggctcattttctaccgattaatattagttttc 8105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 49224 - 49091
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||| ||| |||| ||||    
T  49224 attcttgaagagagccataaaagtaacttgagtattcatccggcagatacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtgttctagattgaaac 49125  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaat 134  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  49124 gcgatgtggcacagtttgtgtatttctgtttaat 49091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17722 - 17454
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||     
T  17722 attcttgaagagagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaat 17623  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||| | |||    
T  17622 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgttccaga 17523  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgc 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17522 gtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaacactccgaaagggaatgacgc 17454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 24984 - 25330
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24984 attcttgaagaaagtaacagacgtagcttgagtattcattagggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 25083  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||  || || || | ||||||||||   |    
T  25084 gtgatgtggcacaatttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgttgggttgttgacaccgttagatgtgccgta 25183  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25184 gtggaaatgggatagtgtatccatggattttgtcacgagtttgccgaatactccaagagggcatgacgctatttgggtgattgtggatagattgacgaag 25283  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || ||||||| | | ||||||||    
T  25284 tcggctcatttcattccaattaacatcagttttcttgtatctcagtt 25330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1927 - 1660
Alignment:
Q  8 aagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| |||||    
T  1927 aagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtgatctaggttgaaacgtgatgt 1828  T
Q  108 ggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaa 207  Q
    |||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  1827 ggcacaatttgtgtattctggtttgatttgtcagaagtcgaaagttgaggatcaaaaacctactggaatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaag 1728  T
Q  208 tgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1727 tgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctaaagggaatgacgcgatttg 1660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 19606 - 19839
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19606 attcttgaagagagccatagatgtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaac 19705  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||| || |||| ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  19706 gcgacgttgcacagttcgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccaga 19805  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19806 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtg 19839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45552 - 45317
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || || |||||||| |    
T  45552 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgtttcggtggtccggtttgaaacgcgacg 45453  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||| | ||| | ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  45452 ttgctcagtttttgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaatttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 45353  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  45352 atgggatagcatttctatggattttgtaacgagttt 45317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20935 - 20772
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  20935 gaagaaagtcacaagagtagcatgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgatg 20836  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
    | || |  ||| | ||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20835 tagctcaatttatttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaaacctgc 20772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 104 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1558 - 1330
Alignment:
Q  104 atgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtg 203  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  1558 atgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatg 1459  T
Q  204 gaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1458 gaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccaaatacttctagagggaacgacacaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcg 1359  T
Q  304 gctcattttcttccgattaatattagttt 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1358 gctcattttctaccgattaatattagttt 1330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15298 - 15066
Alignment:
Q  104 atgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtg 203  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||    
T  15298 atgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtaggatggtatctttagatgtaccagaatg 15199  T
Q  204 gaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  15198 gaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgatgcaatttggctaatcgttgatagattgacgaagtcg 15099  T
Q  304 gctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15098 gctcattttctaccgattaatattagttttcct 15066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3235 - 3000
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  3235 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaac 3136  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3135 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgacgattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccaga 3036  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgac 3000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 236
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1567
Alignment:
Q  5 ttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcga 104  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  1336 ttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatatatcatgatctgaaaaagttgttttggtgatctgggttgaaacgtga 1435  T
Q  105 tgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtgg 204  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  1436 tgtggcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcgggaatgatggtatctttagatgtgccagaatgg 1535  T
Q  205 aaatgggatagtatatccatggattttgtgac 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1536 aaatgggataatatatccatggattttgtgac 1567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 40042 - 40358
Alignment:
Q  19 agaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttg 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  40042 agaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatttatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttg 40141  T
Q  119 tatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtat 218  Q
    ||||| | ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||  || || || | |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  40142 tatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaaacttgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcat 40241  T
Q  219 atccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaaggga-atgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40242 atccatggattttgtaacaagtttaccgaatactcc-aaggggacatgataccatttgggtagttgttgatagattgacgaagtcggcgcattttattcc 40340  T
Q  318 gattaatattagttttcc 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40341 gattaatattagttttcc 40358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 58 - 335
Target Start/End: Original strand, 28090 - 28367
Alignment:
Q  58 tatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagc 157  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||||| |    
T  28090 tatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaac 28189  T
Q  158 atcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaa 257  Q
    ||||||||| ||||||  || || || | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  28190 atcagaaacttgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactcc-aa 28288  T
Q  258 aggga-atgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
     |||| ||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28289 ggggacatgataccatttgggtagttgttgatagattgacgaagtcggcgcattttattccgattaatattagttttcc 28367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 202739 - 203092
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||  |||    
T  202739 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccgcattcaaacgtaatg 202838  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| ||||||||||   ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  || || |||| ||||||||||  ||||||||    
T  202839 ttgcacagtttgtatatgaatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacatcgttagatgtgccggagtggaa 202938  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  202939 ataggatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccgagagggcatgataccatttgggtggttgttgatagattgacgaagtcggca 203038  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    || ||| |||| || ||||||||||||||  |  ||||||| | ||||||||||    
T  203039 cactttattccaatcaatattagttttccagtggctcagttggcagaaatttat 203092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 115124 - 115056
Alignment:
Q  191 atgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaag 259  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  115124 atgtgccagagtggaactgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaag 115056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 323724 - 323657
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 89  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  323724 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtc 323657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 112774 - 112716
Alignment:
Q  289 agattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  112774 agattgacgaagtgggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatctcagtt 112716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27559 - 27231
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27559 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatg 27460  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || ||   |||||||||| |||||||||    
T  27459 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacactgttagatgtgccagagtggaa 27360  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||     
T  27359 gtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcagcg 27260  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27259 cattttattccgatcaatattagttttcc 27231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 360
Target Start/End: Original strand, 4530 - 4723
Alignment:
Q  167 ctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatga 266  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  4530 ctgctggtatgatggtatccttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagcttgccgaatactcctagagggaatga 4629  T
Q  267 cgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagttagtagaaatttat 360  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||||    
T  4630 cgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcagctcattttctaccgattaatattagtttccctgtttcccagttggcagagatttat 4723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 1243 - 1571
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1243 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 1342  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||||||    
T  1343 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaa 1442  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     |||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||   ||| ||||| |||||||||| |||     
T  1443 gtgggatagcatttccatggattttatgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgctgtcgataggttgacgaagtaggca 1542  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1543 cattttattccgatcaatattagttttcc 1571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 24343 - 24668
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24343 gaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtataatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatg 24442  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  || || || | ||||||||||   |||||||    
T  24443 ttgcacagtttgtatatgcttgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccgaagtggaa 24542  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||||  |  |||||||| |||| |||||||||||||||||| |     
T  24543 atgggatagtat-tccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccaagagggcatgataccatttgggtggttgtagatagattgacgaagtcgacg 24641  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtttt 333  Q
    || ||| |||| || ||||||||||||    
T  24642 caatttattccaatcaatattagtttt 24668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 4857 - 5189
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  4857 attctggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgatttgaagaagttattttggtggtccgggttaaagc 4956  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| ||||  ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||  || || || |||||||| | | |||    
T  4957 gagatgttgcacaatttgtgtatgcatgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgaacatcacaaaacttctgggttgttgacacctttagatattccaga 5056  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||  |||| ||| ||||||| ||| | |||||| |||||||     
T  5057 gtggaagtgggatagtatat-catggattttgtgacgagtttgccgaatactcaaagaggacatgatgcgatttgggtaattatggatagactgacgaat 5155  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  5156 tcggctcattttattctgattaacattagttttc 5189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12433 - 12200
Alignment:
Q  103 gatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagt 202  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||| || | |||||||| | |||||    
T  12433 gatgtggcacagttggtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtaccagagt 12334  T
Q  203 ggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtc 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12333 ggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatacttcgaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtagatggattgacgaagtc 12234  T
Q  303 ggctcattttcttccgattaatattagttttcct 336  Q
    |||||||||  || ||| |||||| |||||||||    
T  12233 ggctcatttcatttcgagtaatatcagttttcct 12200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 18480 - 18816
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||         
T  18480 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtcttggtt---tt 18576  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |   ||||| || |||||||| | |||||    
T  18577 gcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtccaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagcgttgatgacacctttagatatactaga 18676  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaag-tttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaa 299  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||    ||         |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18677 gtgaaaatgggatagcatatccatggattttgtgatgagctttgggtgat--------tgttgatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaa 18768  T
Q  300 gtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||    
T  18769 gtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcttgtatctcagtt 18816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5453 - 5137
Alignment:
Q  19 agaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttg 118  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||| || | |||||    
T  5453 agaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttg 5354  T
Q  119 tatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtat 218  Q
    | ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| | ||||||| ||||| |  ||    
T  5353 tttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccatagtggaagtgggacaacat 5254  T
Q  219 atccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccg 318  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  5253 ctccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcacattttattccg 5154  T
Q  319 attaatattagttttcc 335  Q
    || ||||||||||||||    
T  5153 atcaatattagttttcc 5137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 51134 - 51462
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  51134 gaagaaagtcacagaagtaacttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 51233  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||||||    
T  51234 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaa 51333  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | || |||| ||  |||||||  |||| ||||| |||||||||||| |     
T  51334 gtgggacagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagaaggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcgtca 51433  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  51434 cactttattccgatcaatattagttttcc 51462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Original strand, 333 - 636
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| || |    
T  333 gaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggtccggtttgaaacgtgacg 432  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||| || || || | |||||||| |  ||||||||    
T  433 ttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcatgcaggt-tgttgacaccgttagatgtacctgagtggaa 531  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |  || ||||  |||| ||||| ||||||||||| ||     
T  532 gtgggatagcatttccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccgagagggcatgacaccattagggttgttgtcgataggttgacgaagtcagcg 631  T
Q  307 cattt 311  Q
    |||||    
T  632 cattt 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 420 - 747
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||| || ||||  ||||    
T  420 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatttaggagctacaaagatgtattatgacctgaagagattgttttggtggtctgggttgaaacatgatg 519  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||| ||    
T  520 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtgaaa 619  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||     
T  620 gtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttactgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggca 719  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttc 334  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  720 cattttattccgatcaatattagttttc 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28237 - 28173
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtg 86  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28237 agtagcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 28173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 34490 - 34426
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtg 86  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34490 agtagcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 34426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 85790 - 86129
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| | ||| |  ||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||||    
T  85790 gaagaaagtcacataagcaatttgagtatttatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattt-ggtggtccgggttgaagcgagatg 85888  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    ||||||  |||||  || | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  || || || |||||||||| | | |||||||    
T  85889 tggcacaatttgtgcatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacacctttagatgttccaaagtggaa 85988  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  || | ||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||     
T  85989 gtgggataatatatccatggattttgtgacgagttgtccgaatactccaaaaggacataatgcgatttgggtaattgtggatagactgatgaagtcggcc 86088  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagtt 347  Q
    |||||| |||| ||||| || | ||||||| | ||||||||    
T  86089 cattttattccaattaacatcaattttcctctatctcagtt 86129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 102274 - 102094
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  102274 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaac 102175  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatgg 181  Q
      |||||| ||| |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  102174 atgatgtgtcacagtttgtgtattcctatttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatgg 102094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 10079 - 10407
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  10079 gaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctaaaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatg 10178  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | |||| |||||||||| | ||||| | |||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  || || || | |||||||||| ||| |||||    
T  10179 ttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccagaatggaa 10278  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | | |||| |||| ||    |||||| | |||||||||||||||||||| ||     
T  10279 atgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttaccaaatacctcgagagggcatgatgccacatgggtggtggttgatagattgacgaagtcagca 10378  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| |||  |||||||||||||||||    
T  10379 cactttattctaattaatattagttttcc 10407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 48305 - 48633
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||    
T  48305 gaagaaagccataggagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacctgatg 48404  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||| ||| |||||||||    
T  48405 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtataaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatatgccagagtggaa 48504  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  ||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||     
T  48505 gtgggacaacatttccattgattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttggattgttgtcgataggttgacgaagtcggca 48604  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48605 aactttcttccgatcaatattagttttcc 48633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 57133 - 57353
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| |    
T  57133 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgt 57232  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | || || | ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  57233 atgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttc 57332  T
Q  222 catggattttgtgacaagttt 242  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  57333 tatggattttgtgacgagttt 57353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10834 - 10500
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | || ||||    
T  10834 attctagaagaaagtcacagaagtagcctaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctaggttgaaac 10735  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||| ||| |||    
T  10734 gtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatatgccaga 10635  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||| |||| |   |||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  10634 gtggaagtgggatagcattttcatggattttgtgacgagtttaccgaatagtccgagagggcatgatgtcatttgggttgttgtcgataggttgacgaag 10535  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    ||||| || ||| |||| || ||||||||||||||    
T  10534 tcggcacactttattccaatcaatattagttttcc 10500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2608 - 2299
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||| || | |||||| |    
T  2608 agtagcttaattattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaaaagtgatgttgctcagtttgtgt 2509  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |  || || | || |||||||  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  2508 atgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgttgggtttttgacaccgtttgatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 2409  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  2408 tatggattttgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcacactttattccgatt 2309  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  2308 aatatcagtt 2299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40773 - 40449
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  40773 gaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaatttttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 40674  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||||||    
T  40673 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaa 40574  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || ||||||||||||||     
T  40573 gtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggca 40474  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||    
T  40473 cactttattccgatcaatattagtt 40449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 902 - 576
Alignment:
Q  9 agaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtg 108  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||     
T  902 agaaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtttgggttgaaacgtgatgtt 803  T
Q  109 gcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaat 208  Q
    || | ||| || ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||| ||| | ||||||| |    
T  802 gctcagttcgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatttgccaaagtggaagt 703  T
Q  209 gggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctca 308  Q
    |||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| |||| ||  ||||||   |||| ||||| |||||||||||| | ||    
T  702 gggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactctgagagggcatgatgccatttgggattttgtcgataggttgacgaagtcgacaca 603  T
Q  309 ttttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  602 ctttattccgatcaatattagttttcc 576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 26209 - 26353
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  26209 attcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctgggttgaaac 26308  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagt 145  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26309 gtgatgtggcacagtttgtatattcttgtttgatttgtcagaagt 26353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 515 - 436
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||  || | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  515 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaagagtgactatgatgtatcaggatttaaagaggttgttttggtggcctgga 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 260 - 215
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  260 tttgggtgattgttgatcggttgacgaagtcggcacattttgttcc 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 13172 - 13496
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || || || ||||    
T  13172 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatg 13271  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || |  | ||||||||||  ||||||||    
T  13272 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcacaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttagatgtgccggagtggaa 13371  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     ||||| | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||     
T  13372 gtgggacaatatttctatggattttgtaacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttattgttgacaggttgacgaagtcggca 13471  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  13472 cacttcattccgattaatatcagtt 13496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 68405 - 68081
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  | ||||    
T  68405 gaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgtttttgtggtctggtttgaagagggatg 68306  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||  || || || | || ||||| || ||||||||    
T  68305 tcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctacagggttgttgacaccgttggatgtactggagtggaa 68206  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||| |  || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||  |  | |||||  | || || || ||||||||||||||     
T  68205 atgggacaacatttctatggactttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcg 68106  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  68105 cacttcattccgattaatatcagtt 68081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 4239 - 4548
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || || || || || || |  ||||| |    
T  4239 agtagcttaagtattcattcgggagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttgtgt 4338  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  4339 atgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttc 4438  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | || || |  ||||| |||||||| || ||| ||||||||    
T  4439 tatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaagttgacaaagtcggcgcactttattccgatt 4538  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||||||||    
T  4539 aatattagtt 4548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 6319 - 6635
Alignment:
Q  19 agaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttg 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||  |||     
T  6319 agaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacaatttc 6418  T
Q  119 tatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtat 218  Q
    ||||  | ||||| | |||||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||||| ||  || || || | |||||| | | ||||||||| ||||| || ||    
T  6419 tataggcatgtttgacttgtcagaagtctaagattgaacatgagaagcctgcaggattgttgacaccgttagattttccagagtggaagtgggacagcat 6518  T
Q  219 atccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccg 318  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||  |  |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||    
T  6519 ctccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgataccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcgcattttatcccg 6618  T
Q  319 attaatattagttttcc 335  Q
    || ||||||||||||||    
T  6619 atcaatattagttttcc 6635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 32948 - 33276
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| || || || ||||    
T  32948 gaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatg 33047  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  33048 ttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaa 33147  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||  ||||  |  | |||||  | || ||||||||||||||||||||     
T  33148 atgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcg 33247  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagttttcc 335  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  33248 cactttattccgataaatatcagttttcc 33276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 56171 - 56495
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || |    
T  56171 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgaag 56270  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  ||||||||    
T  56271 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaa 56370  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
     || ||||| || || |||||||| | | ||||||| || || ||| | | |||| |||| ||  | |||||  | || || || ||||||||||||||     
T  56371 gtgagatagcatttctatggatttggagccaagtttaccaaacacttcgagagggtatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcg 56470  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  |||| |||||||||||||    
T  56471 cacttcattcctattaatattagtt 56495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41286 - 41207
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  41286 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 41207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5791 - 5461
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  5791 attctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaac 5692  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| |||    
T  5691 gtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccaga 5592  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
     ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || |||||||||    
T  5591 ctggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaataatacgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaag 5492  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    | ||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  5491 ttggcacacttcattcctattaatatcagtt 5461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 22650 - 22971
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    |||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  22650 gaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 22749  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||  || || || | || |||||||  |||||||| ||    
T  22750 ctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgctgggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 22849  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    ||| |  || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||| |||| || || |||||||||||||| ||     
T  22850 ggacaacatttctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgacaggttgacgaagtcggcacaa 22949  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||    
T  22950 tttattccgatcaatcttagtt 22971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 14471 - 14792
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    |||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||      
T  14471 gaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtta 14570  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    |   |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| ||    
T  14571 ctaagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 14670  T
Q  210 ggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcat 309  Q
    ||| |  || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||| |||| || || |||||||||||||| ||     
T  14671 ggacaacatttctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgacaggttgacgaagtcggcacaa 14770  T
Q  310 tttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||    
T  14771 tttattccgatcaatcttagtt 14792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28266 - 27936
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  28266 attctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaac 28167  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |  || || || | || |||||||  ||    
T  28166 gtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcacggttgttgacaccgttggatgtgccgga 28067  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||  |||| ||  |||||||| |||| || || |||||||||    
T  28066 gtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagaggacatgatgccatttgggtggttgtcgacaggttgacgaag 27967  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  27966 tcggcgcactttattccgattaatatcagtt 27936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3771 - 3462
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||| || | |||||| |    
T  3771 agtagcttaagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttagtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgt 3672  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||  || || || | || ||||||   || ||||| ||||| || || ||    
T  3671 atgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgcagggttgttgacaccgttggatgtggcggaatggaagtgggacagcatttc 3572  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  | |||| |||| ||  |||||||  |||| || || |||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  3571 tatggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggcacattttattccaatt 3472  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  3471 aatatcagtt 3462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10282 - 10139
Alignment:
Q  77 tgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtat 176  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10282 tgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacattttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcctcagaaacctgctggtat 10183  T
Q  177 gatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatat 220  Q
    |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10182 gatggtgtccttagatgtgccagagtggaaatgggatagcatat 10139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10138 - 10025
Alignment:
Q  247 aatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttctcagt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  10138 aatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgactcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctgagt 10039  T
Q  347 tagtagaaatttat 360  Q
    | | ||| ||||||    
T  10038 tgggagagatttat 10025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 89
Target Start/End: Original strand, 2601 - 2683
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 89  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  2601 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttcgtggtc 2683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7198 - 6972
Alignment:
Q  28 ttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattctt 127  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||| || |||||||||||| | |    
T  7198 ttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtatatgcat 7099  T
Q  128 gtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatgga 227  Q
    |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| || | | || || | || ||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||    
T  7098 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggaaagttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 6999  T
Q  228 ttttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  6998 ttttgtgacaagtttacctaatactcc 6972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 51451 - 51686
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| || |    
T  51451 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacg 51550  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || || ||||||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  51551 tcgctcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 51650  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  51651 atgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 51686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 60485 - 60720
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| || |    
T  60485 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacg 60584  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || || ||||||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  60585 tcgctcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 60684  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  60685 atgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 60720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 66873 - 67108
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| || |    
T  66873 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacg 66972  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || || ||||||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  66973 tcgctcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 67072  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  67073 atgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 67108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 331
Target Start/End: Original strand, 17839 - 18132
Alignment:
Q  38 atccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttg 137  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||    
T  17839 atccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagatgttgttttggtggtctgggttaaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttg 17938  T
Q  138 tcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgaca 237  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||  |||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  17939 ttagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttagatgtggcagagtgaaagtgggacagcatttccatggatttcgtaacg 18038  T
Q  238 agtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  |||| || |  ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  18039 agtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaagttgacaaagtcggcacactttattccgatcaatattagtt 18132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21003 - 20694
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||||| || | ||| || |    
T  21003 agtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggttgtctgggttgaaacgtgatgttgctcagttggtgt 20904  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||  ||||| || | || |||||||  |||||||| ||||| |  || ||    
T  20903 atgcgtgttagacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttc 20804  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||| ||||  |  |||||||  ||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  20803 tatggattttatgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgattccatttgggttgttgttgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccgatt 20704  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  20703 aatatcagtt 20694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 11343 - 11563
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| |    
T  11343 agtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgt 11442  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  11443 atgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttc 11542  T
Q  222 catggattttgtgacaagttt 242  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  11543 tatggattttgtgacgagttt 11563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 15113 - 15333
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| |    
T  15113 agtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgt 15212  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  15213 atgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttc 15312  T
Q  222 catggattttgtgacaagttt 242  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  15313 tatggattttgtgacgagttt 15333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 2626 - 2855
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||    
T  2626 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatg 2725  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  || || ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||||||||    
T  2726 tcgctcatttcgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacataagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaa 2825  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgac 236  Q
     ||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  2826 gtgggatagtatttctatgaattttgtgac 2855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8080 - 7771
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || || || || || || |  ||||| |    
T  8080 agtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaataagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgt 7981  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | || ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  7980 atgcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttc 7881  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
      ||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | || || |  |||| ||||||||| || ||| ||||||||    
T  7880 tctggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaagttgatgaagtcggcgcactttattccgatt 7781  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  7780 aatatcagtt 7771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 4618 - 4742
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  4618 attcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaac 4717  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattc 125  Q
    |||||||||||| |||||| |||||    
T  4718 gcgatgtggcacagtttgtgtattc 4742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4811 - 4581
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||     
T  4811 gaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccgggagctaaaaagatgattcatgacttgaagaaattgttttggtggtcttggttgaaacgtgata 4712  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||| | ||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| |||||||||    
T  4711 ttgctcagtttttttatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaa 4612  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgaca 237  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4611 gtggtatagcatatccatggattttgtgaca 4581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20435 - 20105
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |    
T  20435 attctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagc 20336  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||    
T  20335 gtgatgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccgga 20236  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||| |   ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  20235 gtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgacatttgggttattgtcgacaggttgacgaaa 20136  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  20135 tcggcacacttcattcctattaatatcagtt 20105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23255 - 22925
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |    
T  23255 attctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagc 23156  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | ||||||||||  ||    
T  23155 gtgatgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccgga 23056  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||| |   ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  23055 gtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgacatttgggttattgtcgacaggttgacgaaa 22956  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    ||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  22955 tcggcacacttcattcctattaatatcagtt 22925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3217 - 3048
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| |||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  3217 attctggaagaatgtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaac 3118  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3117 gtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgc 3048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2701 - 2505
Alignment:
Q  135 ttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtg 234  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||||| ||||| ||| ||||| |  || |||||||||||||||    
T  2701 ttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtagaagtgggacaacatttccatggattttgtg 2602  T
Q  235 acaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||||| ||||| ||||| | |||| | || ||  |||||||| |||| || || |||||||||||  | || ||| ||||||| |||| |||||    
T  2601 acgagtttaccgaacactccgagagggcacgatgccatttgggtggttgtcgacaggttgacgaagtcaacacactttattccgatcaataatagtt 2505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19869 - 19556
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||    ||||| |    
T  19869 agtagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggatgttgcttaatttgtgt 19770  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | ||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  || || || |||||||||||| ||| ||||| ||||| |  || ||    
T  19769 atgcatgtttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacacctttagatgtgccagaatggaagtgggacaacatttc 19670  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||| |||| ||  |||||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||     
T  19669 tatggattttgtgacgagtttacccaatactccgagagggcatgatgctatttgggttgtggtggataggttgacgaagtcagcgcactttattccgatc 19570  T
Q  322 aatattagttttcc 335  Q
    ||||| ||||||||    
T  19569 aatataagttttcc 19556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24031 - 23718
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||    ||||| |    
T  24031 agtagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggatgttgcttaatttgtgt 23932  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | ||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  || || || |||||||||||| ||| ||||| ||||| |  || ||    
T  23931 atgcatgtttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacacctttagatgtgccagaatggaagtgggacaacatttc 23832  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||| |||| ||  |||||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||     
T  23831 tatggattttgtgacgagtttacccaatactccgagagggcatgatgctatttgggttgtggtggataggttgacgaagtcagcgcactttattccgatc 23732  T
Q  322 aatattagttttcc 335  Q
    ||||| ||||||||    
T  23731 aatataagttttcc 23718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 918 - 671
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||    
T  918 gaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatg 819  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||| ||  || || |  | || ||||| |  ||||||||    
T  818 tcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtataaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacgccgttggatgtaccggagtggaa 719  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
    |||||| |  || || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  718 atgggacaacatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactcc 671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 6510 - 6832
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  6510 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 6609  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||| |  || | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |  || || || | ||||||||||  |||||||| ||    
T  6610 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 6709  T
Q  210 ggatagtatatccatgga-ttttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctca 308  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  | || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  6710 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcgca 6809  T
Q  309 ttttcttccgattaatattagtt 331  Q
     ||| ||| ||| ||| ||||||    
T  6810 ctttattctgatcaatgttagtt 6832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 10941 - 11263
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtgg 109  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  10941 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 11040  T
Q  110 cacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatg 209  Q
    | |  ||| |  || | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |  || || || | ||||||||||  |||||||| ||    
T  11041 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 11140  T
Q  210 ggatagtatatccatgga-ttttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctca 308  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  | || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  11141 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcgca 11240  T
Q  309 ttttcttccgattaatattagtt 331  Q
     ||| ||| ||| ||| ||||||    
T  11241 ctttattctgatcaatgttagtt 11263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 7410 - 7651
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  7410 attcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgagggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 7509  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| ||| |||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| || ||    
T  7510 gagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttgagttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtactgga 7609  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  7610 gtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 7651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 25151 - 25460
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || | |||||| |    
T  25151 agtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcctgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgt 25250  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| ||  |  || || | || |||||||  |||||||| ||||| |  || ||    
T  25251 atgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagtctgcagggtttttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggaaaacatttc 25350  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||| ||  |||||||  | ||||| || ||||||||||| || || ||| |||| |||    
T  25351 tatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggttgacaggttgacgaagtcagcgcactttattccaatt 25450  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    | ||| ||||    
T  25451 attatcagtt 25460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 199 - 323
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||    
T  199 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 298  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattc 125  Q
    | |||||||||| |||||| |||||    
T  299 gagatgtggcacagtttgtgtattc 323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20140 - 19896
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || | |||||| |    
T  20140 agtagcttgagtattcatcctggagctactaatttgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcagtttgtgt 20041  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  |||||||| |||||||| || ||    
T  20040 atgcatgtttgacttgtcagaagtcaaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggatagcatttc 19941  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatga 266  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||    
T  19940 tatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaaagggcatga 19896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 75571 - 75507
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  75571 tgagtatccctccaggagcgacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggcctgga 75507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 951 - 1114
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||| || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  951 attctagaagaaagtcacaagagtagctagagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaac 1050  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaa 164  Q
    | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1051 gtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 1114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 326
Target Start/End: Original strand, 2364 - 2467
Alignment:
Q  223 atggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatta 322  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| ||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  2364 atggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgataggttaacgaagtcggcacactttattccaatta 2463  T
Q  323 atat 326  Q
    ||||    
T  2464 atat 2467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 6524 - 6833
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || |  ||||| |    
T  6524 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaagtgcatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgt 6623  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || |  | ||||| |  |||||||| |||||||| || ||    
T  6624 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgctggatgtaccggagtggaagtgggatagcatttc 6723  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||  | |||||  | || || || |||||||||||||| || ||| ||| ||||    
T  6724 tatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattctgatt 6823  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  6824 aatatcagtt 6833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15978 - 16231
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  15978 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 16077  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | ||||| || | |||||| |||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | |||||||| |  ||    
T  16078 gagatgttgctcagtttgtttatggctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccgga 16177  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16178 gtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactcc 16231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 505 - 829
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || ||    ||||    
T  505 gaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttagtggtctggtttgaagaaggatg 604  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| | || ||  ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| || || || | || || || | |||||||||    
T  605 tcgctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttatcggaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaagtaccagagtggaa 704  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggct 306  Q
    ||||||||  || || |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||  || | |||||  | || || || ||||||||||||||     
T  705 atgggataacatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcg 804  T
Q  307 cattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||    
T  805 cacttcattccgattaatatcagtt 829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27302 - 26998
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||     
T  27302 attcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaa 27203  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    |  |||| || |  ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |   |    
T  27202 gatatgttgctcattttgtttatgcttgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtttgatgtaccgta 27103  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||  |||| ||  | |||||||||    
T  27102 gtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctgtttgggttgttgtcgaccggttgacgaag 27003  T
Q  301 tcggc 305  Q
    |||||    
T  27002 tcggc 26998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 4723 - 4958
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || |    
T  4723 gaagaaagtcataagagtagcttgagtattcatccggaagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacg 4822  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||    ||||||||    
T  4823 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtatcggagtggaa 4922  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  4923 atgggataacatttctatggattttgtgacgagttt 4958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 20727 - 20938
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || || || ||||| || | |||||| |    
T  20727 agtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatctatcttgatttgaagaagcttttttggtggtctgggttgaagcgtgatgttgctcagtttgtct 20826  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||||||||| || || ||    
T  20827 atgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggacagcatttc 20926  T
Q  222 catggattttgt 233  Q
     |||||||||||    
T  20927 tatggattttgt 20938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Original strand, 27544 - 27622
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 92  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27544 gtcatataagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgg 27622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18390 - 18136
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttgg-tggtctggattaaaa 99  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||| || |||    
T  18390 attctggaagaaagtaacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatcatttgaagaaattgtttttgatggtttgggttgaaa 18291  T
Q  100 cgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctag 199  Q
     | ||||| || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| | ||  || || |  | |||||||||| ||    
T  18290 tgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtttaaggttgagcatcagaagccttcagggttgttgactccgttagatgtgccag 18191  T
Q  200 agtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 254  Q
    ||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18190 agtggaagtgggacatcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactcc 18136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6233 - 6013
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||  | || || || ||||| || |  ||||| |    
T  6233 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctattttggtggtccagtttgaagcgagatgtcgctcattttgtgt 6134  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | || || | ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || || || | || ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  6133 atgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttc 6034  T
Q  222 catggattttgtgacaagttt 242  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  6033 tatggattttgtgacgagttt 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 10281 - 10361
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttt 81  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10281 attcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatacatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttt 10361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26834 - 26755
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26834 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcatgatttgaagaggttgttttggtggcctgga 26755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 10743 - 10957
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || || || || || || |  || || |    
T  10743 agtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtcgctcatttcgtgt 10842  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  10843 atgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttc 10942  T
Q  222 catggattttgtgac 236  Q
     ||||||||||||||    
T  10943 tatggattttgtgac 10957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 20957 - 21171
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || || || || || || |  || || |    
T  20957 agtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtcgctcatttcgtgt 21056  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  21057 atgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttc 21156  T
Q  222 catggattttgtgac 236  Q
     ||||||||||||||    
T  21157 tatggattttgtgac 21171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 884 - 658
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || || || || || || |  ||||| |    
T  884 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgt 785  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||   ||||||| |||||||  || ||    
T  784 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgtcaccgttggatgtgccgaagtggaagtgggataacatttc 685  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaa 248  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    
T  684 tatggattttgtgacgagtttaccgaa 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 13564 - 13886
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || |    
T  13564 attctagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagc 13663  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | || || || |  ||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||  |  || || || | || ||||| | |||    
T  13664 gtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgttggatgtaccaga 13763  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaag 300  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| ||  | |||||  | || || || |||||||||    
T  13764 gtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaag 13863  T
Q  301 tcggctcattttcttccgattaa 323  Q
    ||||| || ||| ||||||||||    
T  13864 tcggcgcactttattccgattaa 13886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 249633 - 249324
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |  |||||||    
T  249633 agtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagctcattttgtat 249534  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc-tggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatat 220  Q
    || | || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || || || | || ||||| |  |||| ||| ||||| ||||| |    
T  249533 atgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcatggt-tgttgacaccgttggatgtaccggagtcgaagtgggacagtattt 249435  T
Q  221 ccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgat 320  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| ||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||  |||| ||    
T  249434 ctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgcaatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggcacatttcattccaat 249335  T
Q  321 taatattagtt 331  Q
    |||||| ||||    
T  249334 taatatcagtt 249324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41937 - 41628
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || |  ||||| |    
T  41937 agtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgt 41838  T
Q  122 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 221  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||| |||  |||||||| |||||||| || ||    
T  41837 atgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatatgccggagtggaagtgggatagcatttc 41738  T
Q  222 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgatt 321  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||| ||||  |  | |||||  | || || || |||| ||||||||| || ||| ||||||||    
T  41737 tatggatttcgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaggttgatgaagtcggcgcactttattccgatt 41638  T
Q  322 aatattagtt 331  Q
    ||||| ||||    
T  41637 aatatcagtt 41628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48095 - 47835
Alignment:
Q  71 agaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 170  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |  ||||| ||| | ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  48095 agaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcaatttgtttatgcatgttagacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctac 47996  T
Q  171 tggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcg 270  Q
     ||  || || |  | |||||||||| ||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||   ||| ||     
T  47995 agggttgttgaccccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagaggccctgatgcc 47896  T
Q  271 gtttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
     |||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  47895 atttgggttgttgtcgataggttgactaagtcggcacactttattccgatcaatattagtt 47835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 359 - 124
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||  || |    
T  359 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacatgacg 260  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||  ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  259 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 160  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  159 atgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 3222 - 3301
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3222 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11768 - 11690
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggt 85  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11768 gaagaaagtcataagagtagcttaagtattcatccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggt 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34223 - 34014
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| || || || ||||    
T  34223 gaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagcttttttggtggtctggtttgaagcgtgatg 34124  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || |  ||| | ||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  34123 ttgctcaatttttttatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaatcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaa 34024  T
Q  207 atgggatagt 216  Q
    ||||||||||    
T  34023 atgggatagt 34014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3570 - 3491
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3570 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 3491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3312 - 3261
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaa 323  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  3312 tttgggtgattgttgatcggttgacgaagtcggcacattttgttcctattaa 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19075 - 18996
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19075 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 18996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13936 - 13857
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13936 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 13857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 3153 - 3232
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  3153 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 3232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 10014 - 9935
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10014 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactacgatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 9935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 10322 - 10243
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10322 gtcataggagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 10243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 14015 - 14094
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14015 gtcatagaagtagtctgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 14094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Original strand, 14273 - 14324
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaa 323  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  14273 tttgggtgattgttgatcggttgacgaagtcggcacattttgttcctattaa 14324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6202 - 6124
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6202 gtcatagaagtagtttgagtatc-atccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 6124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24422 - 24343
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  24422 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 24343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 7086 - 7165
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  7086 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgga 7165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13220 - 12998
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccagga-gctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttgg-tggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgt 119  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| || |  |||||    
T  13220 agtagcttaagtattcatccgggaagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggttggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcaatttgt 13121  T
Q  120 atattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtata 219  Q
     ||| | ||||| | |||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || |||||||  |||||||| |||||||| ||     
T  13120 gtatgcatgtttgacttgtctgaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 13021  T
Q  220 tccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  13020 tctatggattttgtgacgagttt 12998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Original strand, 2771 - 2841
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 92  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2771 agtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgg 2841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Original strand, 12072 - 12138
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 88  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12072 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggt 12138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 702 - 775
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  702 gtcatagaaatagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 32691 - 32764
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32691 gtcataaaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 32764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24990 - 24923
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttt 81  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24990 gtcatagaactagtttgagtattcacccaggagctactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttt 24923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 72202 - 72138
Alignment:
Q  29 tgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  72202 tgagtattcatccaggagcaaataagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 72138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24891 - 24772
Alignment:
Q  114 gtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaaatgggat 213  Q
    |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||| |||||  | | ||   ||||| ||||||||| ||||||    
T  24891 gtttgtatatgcttgattggtttgtcaaaagtcgaagattgaacatcagaaaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggat 24792  T
Q  214 agtatatccatggattttgt 233  Q
    ||||| || || ||||||||    
T  24791 agtatctctatcgattttgt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 490 - 411
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  490 gtcatataagtagtttgagtattcatctaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8197 - 8118
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8197 gtcatagaagcagtttgactattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 8118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 9139 - 9218
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9139 gtcatcgaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtattaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 9218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15684 - 15605
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15684 gtcacagaagtagtttaagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 15605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 47182 - 47103
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  47182 gtcatagaagtagtttgagtattcatcctggagcggctaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgga 47103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15104 - 15031
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||| ||||||| |||||    
T  15104 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtaccaggatttgaagaggttgtttgggtgg 15031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 81097 - 81338
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| || || |||     
T  81097 attcttgaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggcggtccggtttgaaat 81196  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | || || || | |||||| ||| | ||||| | |||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  81197 gtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtgagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 81296  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  81297 gtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 81338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4186 - 4107
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  4186 gtcatagaagtagtttgagtattcacccaagagcgactaagatgtatcatgatttgaagagattgttttgatggcctgga 4107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8285 - 8214
Alignment:
Q  22 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  8285 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggctgttttggtggcctgga 8214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8035 - 7990
Alignment:
Q  272 tttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttcc 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  8035 tttgggtgattgttgatcgattgacgaagtcagcacattttgttcc 7990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 48480 - 48559
Alignment:
Q  10 gaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 89  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  48480 gaaagtcataagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaaaaagctgttttggtggtc 48559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 8168 - 8241
Alignment:
Q  14 gtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtgg 87  Q
    ||||||||||||  |||||||| || | |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8168 gtcatagaagtattttgagtattcacctaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 8241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 32584 - 32825
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||| |||||||  ||||||||||||| || || ||||    
T  32584 attctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccgtgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 32683  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctaga 200  Q
    | || || || | |||||| ||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  || || || | || ||||| |  ||    
T  32684 gtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 32783  T
Q  201 gtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  32784 gtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacaagttt 32825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 5607 - 5841
Alignment:
Q  7 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatg 106  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||| | |||||||||||  | || ||||| || |    
T  5607 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaa-aagctattttggtggtccagtttgaaacgtgacg 5705  T
Q  107 tggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggcatctttagatgtgctagagtggaa 206  Q
    | || | |||||| ||| | |||||   |||| | ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||  || || || | || ||||| |  ||||||||    
T  5706 tagctcagtttgtgtatgcatgtttgtcttgttagaagtctaaagttgaatatcagaagcctacagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 5805  T
Q  207 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 242  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  5806 atgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 5841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Original strand, 9346 - 9413
Alignment:
Q  15 tcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgtttt 82  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9346 tcataggagtagtctgagtattcatctaggagccacaaagatgtatcaggatttgaagaggttgtttt 9413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43824 - 43494
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaac 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  |||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||    
T  43824 attctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtacaatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 43725  T
Q  101 gcgatgtggcacggtttgtatattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc-tggtatgatggcatctttagatgtgctag 199  Q
      || || || | |||||| ||| | || || | |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| || || || | || ||||| |  |    
T  43724 ttgacgtagctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcatggt-tgttgacaccgttggatgtaccgg 43626  T
Q  200 agtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcggtttgggtgattgttgatagattgacgaa 299  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| |   |||||||  |||| ||  | ||||||||    
T  43625 agtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgtcatttgggttgttgtcgaccggttgacgaa 43526  T
Q  300 gtcggctcattttcttccgattaatattagtt 331  Q
    |||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  43525 gtcggcacacttcattcctattaatatcagtt 43494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 39168 - 39218
Alignment:
Q  1 attcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacg 51  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  39168 attcttgaagagagtcataggagtaacttgagtattcatccgggagctacg 39218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Original strand, 29822 - 29867
Alignment:
Q  4 cttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatccaggagcta 49  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  29822 cttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagcta 29867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 638 - 598
Alignment:
Q  53 agatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  638 agatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24869 - 24829
Alignment:
Q  53 agatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgga 93  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24869 agatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgga 24829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University