View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1709_low_16 (Length: 394)

Name: NF1709_low_16
Description: NF1709
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1709_low_16
NF1709_low_16
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (15-362)||(20293252-20293598)
chr7 (149-346)||(20300397-20300590)
chr7 (179-378)||(20302438-20302636)
chr7 (155-324)||(20230330-20230499)
chr7 (154-328)||(20282801-20282975)
chr7 (156-357)||(20169288-20169488)
chr7 (101-326)||(20287919-20288141)
chr7 (155-362)||(20242243-20242449)
chr7 (182-328)||(20278222-20278368)
chr7 (178-362)||(20262861-20263044)
chr7 (133-357)||(20272450-20272673)
chr7 (154-324)||(20063760-20063930)
chr7 (248-378)||(20090388-20090517)
chr7 (159-362)||(20090313-20090501)
chr7 (215-291)||(19937728-19937804)
chr7 (215-291)||(19968867-19968943)
chr7 (16-81)||(20169152-20169217)
chr7 (215-279)||(47601851-47601915)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (124-378)||(40820352-40820605)
chr4 (143-260)||(40825038-40825156)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20293598 - 20293252
Alignment:
Q  15 agttccaattattactgtacttataatgatggacgtcttgattcgccttctatctgtatataggaaagatataaatctaaaatgtaagaatcaagttaac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20293598 agttccaattattactgtacttataatgatggacgtcttgattcgccctctatctgtatataggaaagatataaatctaaaatgtaagaatcaagttaac 20293499  T
Q  115 gagcaatgcttcaaatggtttaacaaataacaactagaacataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttga 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20293498 gagctatgcttcaaatgatttaacaaataacagctagaacataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagtcctccactttggagttga 20293399  T
Q  215 tgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcata 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20293398 tgtatgtcaagtagatttccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaatgcaggagcaattatgcaaacataagcttctgcata 20293299  T
Q  315 tgtctggtgtaacaagctacaccttctgcaaaatctgaaacttcaacc 362  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20293298 tttctggtgtaac-agctacaccttctgcaaaatctggaactttaacc 20293252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20300590 - 20300397
Alignment:
Q  149 tagaacataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatac 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||   ||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20300590 tagagcataccaggttctgcatgggctactcgaacatatagatcaagtcctccactttctagttg---tatatcaattagattcctagtccaagacatac 20300494  T
Q  249 agccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaacaagctacaccttctgcaaa 346  Q
    | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20300493 aaccaattccagcatcatgagaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaac-agctacaccttctgcaaa 20300397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20302636 - 20302438
Alignment:
Q  179 cgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaa 278  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || || |||     
T  20302636 cgaaaatatagatcaagtcctccactttcgagttgttgtatgtcaagtaaattcccagtccaagacatgcagccaatcccagcatcgttggagtatgcag 20302537  T
Q  279 cgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaacaagctacaccttctgcaaaatctgaaacttcaaccgcatgcaatttcaaaa 378  Q
     ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||   |||||||||||||    
T  20302536 tgcaagagcaattctccaagcataagcttctgcatatatctggtgtaac-agctacaccttctgcaaaatcgggaactttaaccatctgcaatttcaaaa 20302438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20230499 - 20230330
Alignment:
Q  155 ataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaa 254  Q
    ||||||||||||   |||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20230499 ataccaagttctaaataggatacgcgaacatataggtcaagtcctccactttggaattgttgtatgtcaagtagattgccggtccaagacatacagccaa 20230400  T
Q  255 tcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgt 324  Q
    |||||  |||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  20230399 tcccatcatcatgagaatacgcaacacaagagcaattctccaaacataagattctgcatctgtcaggtgt 20230330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20282975 - 20282801
Alignment:
Q  154 cataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagcca 253  Q
    ||||||||||||||| || |||   || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  20282975 cataccaagttctgcatacgctgtgcggacatatagatcaagtcctccactttggagttgttgtatgtcaagtagtttccctgtccacgacatacagcca 20282876  T
Q  254 atcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaaca 328  Q
    ||| | |||||||| ||||| |||| ||| || ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20282875 atcacggaatcatgggaatatgcaaggcaagaacaattctccaagcataggcttctgcaaatgtctggtgtaaca 20282801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 357
Target Start/End: Original strand, 20169288 - 20169488
Alignment:
Q  156 taccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaat 255  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  20169288 taccaagttctccattggctacgcgaacatatagatcaagtcctcctctttgaaattgttgtatgtcacgtagattgccggtccaagacatacaaccaat 20169387  T
Q  256 cccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaacaagctacaccttctgcaaaatctgaaac 355  Q
    ||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||| |||||||||| |||    
T  20169388 cccatcatcatgagaatatgcaaggcaagagcaattctccaagcataggcttctgcatatgtctgatgtaac-agtcaaaccttcagcaaaatctggaac 20169486  T
Q  356 tt 357  Q
    ||    
T  20169487 tt 20169488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20288141 - 20287919
Alignment:
Q  101 agaatcaagttaacgagcaatgcttcaaatggtttaacaaataacaactagaacataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctc 200  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||   | | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20288141 agaatcaagttaaagaactatgtttcaaatgattcaacaaa---cgattagagcataccaagttctgcataggctacacgaacatataaatcaagccctc 20288045  T
Q  201 cactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaaca 300  Q
    || ||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||| |||| ||| |||||||| |  || ||    
T  20288044 catttttgaattgttgtatatcaattagattcccagtccaagacatacaaccaatcccagcggtgtgagaatatgcaatgcaagagcaattctctaagca 20287945  T
Q  301 taagcttctgcatatgtctggtgtaa 326  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||    
T  20287944 tcggcttctacatatgtctggtgtaa 20287919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20242449 - 20242243
Alignment:
Q  155 ataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaa 254  Q
    ||||||||||||   |||| ||| ||||||||||| || || |||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20242449 ataccaagttctaaataggatacgcgaacatataggtcaagtcctccaatttcgaattgttctatgtcaagtagattgccggtccaagacatacagccaa 20242350  T
Q  255 tcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaacaagctacaccttctgcaaaatctgaaa 354  Q
    || ||  || ||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||    
T  20242349 tcacatcatgatgagaatacgcaacacaagagcaattctctaaacataagattctgcatgtgtcaggtgtaac-tgctaaaccttcagcaaaatctggaa 20242251  T
Q  355 cttcaacc 362  Q
    ||| ||||    
T  20242250 ctttaacc 20242243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 182 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20278368 - 20278222
Alignment:
Q  182 acatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgc 281  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||    
T  20278368 acatatagatcaagtcctccactttcgagttgttgtatgtcaagtagtttccctgtccacgacatacagccaatcacggaatcatgggaatatgcaaggc 20278269  T
Q  282 aggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaaca 328  Q
    | || ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20278268 aagaacaattctccaagcataggcttctgcaaatgtctggtgtaaca 20278222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20263044 - 20262861
Alignment:
Q  178 acgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgca 277  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  20263044 acgaatatataggtcaagtcctccactttggaattgttgtatgtcaagtagatttcgggtccaagacatacagccaatcacatcatgatgagaatacgca 20262945  T
Q  278 acgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaacaagctacaccttctgcaaaatctgaaacttcaacc 362  Q
    || || |||||||| | |||||||||| || ||||| |||| |||| |||  |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20262944 acacaagagcaattctccaaacataagattttgcatttgtcaggtgcaac-tgctaaaccttcagcaaaatctggaactttaacc 20262861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20272673 - 20272450
Alignment:
Q  133 tttaacaaataacaactagaacataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattc 232  Q
    ||||||||| || | ||||| ||||||| ||| | | | ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||  || || |||||||||||||||||     
T  20272673 tttaacaaacaaaacctagagcataccaggtttttcatgggctatacgaacatatagatcgagtcctcccatttcaagctgttgtatgtcaagtagattt 20272574  T
Q  233 ccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaacaagct 332  Q
     |||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  20272573 gcagtccacagcatacagccaatcccatcatcatgagaatatgcaaggcaagagcaattctccaagcataggcttctgcatatgtcaggtgtaacga-tt 20272475  T
Q  333 acaccttctgcaaaatctgaaactt 357  Q
    | |||||| |||||||||| |||||    
T  20272474 aaaccttcagcaaaatctggaactt 20272450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 324
Target Start/End: Original strand, 20063760 - 20063930
Alignment:
Q  154 cataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagcca 253  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||    
T  20063760 cataccaagctctgcatgggctacgcgaaaatatagatcaagtcctcccatttggagttgttgtatgtcaagtaagttcccagtccaagtcatacaacca 20063859  T
Q  254 atcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgt 324  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||  ||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  20063860 atcccagcatcgttagagtacgcagtgcaagagcaattctccaagcataaccttctgcatatgtccggtgt 20063930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 248 - 378
Target Start/End: Original strand, 20090388 - 20090517
Alignment:
Q  248 cagccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaacaagctacaccttctgcaaaa 347  Q
    ||||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20090388 cagccaatctcagtgtcgtgacaatacgcaacgcaggagcaattatgcaaacataagctgctgcatatttctggtgcaaca-gctacaccttctgcaaaa 20090486  T
Q  348 tctgaaacttcaaccgcatgcaatttcaaaa 378  Q
    |||| ||||| ||||   | |||||||||||    
T  20090487 tctggaactttaaccatcttcaatttcaaaa 20090517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 362
Target Start/End: Original strand, 20090313 - 20090501
Alignment:
Q  159 caagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatccc 258  Q
    |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| || |||              | ||||||||| |    
T  20090313 caagctctgtgtgggctacacgaaaatatagatcaagtcctccactttcgagttgttctatgtcaaataaatt--------------tccagccaatctc 20090398  T
Q  259 agaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtgtaacaagctacaccttctgcaaaatctgaaacttc 358  Q
    ||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20090399 agtgtcgtgacaatacgcaacgcaggagcaattatgcaaacataagctgctgcatatttctggtgcaac-agctacaccttctgcaaaatctggaacttt 20090497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19937804 - 19937728
Alignment:
Q  215 tgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaatt 291  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  19937804 tgtatgtcaactaggttcccagtccaagacatacaaccaatgtcagcatcataagaatatgcaacacaagagcaatt 19937728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19968943 - 19968867
Alignment:
Q  215 tgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaatt 291  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  19968943 tgtatgtcaactaggttcccagtccaagacatacaaccaatgtcagcatcataagaatatgcaacacaagagcaatt 19968867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 20169152 - 20169217
Alignment:
Q  16 gttccaattattactgtacttataatgatggacgtcttgattcgccttctatctgtatataggaaa 81  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  20169152 gttccaattattgttgtacctataatgatgatcgtcttgtttctccctctatctgtatatatgaaa 20169217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 279
Target Start/End: Original strand, 47601851 - 47601915
Alignment:
Q  215 tgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaac 279  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||| |||||| |||||    
T  47601851 tgtatgtcaacttgattcccagtccaggacatacaaccaatgtcaggatcataagaatatgcaac 47601915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 124 - 378
Target Start/End: Original strand, 40820352 - 40820605
Alignment:
Q  124 ttcaaatggtttaacaaataacaactagaacataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccactttggagttgatgtatgtca 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40820352 ttcaaattgtttaacaaataacacctagagcataccaagttttgtgcaggctacacgaacatatagatcgagtcctccactttggagttgatgtatgtca 40820451  T
Q  224 agtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcaaacataagcttctgcatatgtctggtg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40820452 agtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaacgcaggagcaattgtgcagacataagcttctgcatatgtctggtg 40820551  T
Q  324 taacaagctacaccttctgcaaaatctgaaacttcaaccgcatgcaatttcaaaa 378  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40820552 taac-agctacaccttctgcaaattctgaaacttcaaccgcatgcaatttcaaaa 40820605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Original strand, 40825038 - 40825156
Alignment:
Q  143 aacaactagaacataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagccctccacttt-ggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaa 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | | ||| ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  40825038 aacaactagagcataccaagttctgcataggctacacgaacatatagatcaagtcctccattttagaatttgttgtatatcaattagattgccagtccaa 40825137  T
Q  242 gacatacagccaatcccag 260  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  40825138 gacatacaaccaatcccag 40825156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University